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Alignment Overview

Query: NF4086_low_3 (Length: 582)

Name: NF4086_low_3
Description: NF4086
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4086_low_3
NF4086_low_3
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (222-424)||(13750548-13750752)
chr7 (222-421)||(27072569-27072770)
chr7 (222-421)||(27205543-27205744)
chr7 (222-421)||(43113676-43113877)
chr7 (222-421)||(19217629-19217830)
chr7 (223-419)||(3537429-3537627)
chr7 (222-421)||(18788475-18788676)
chr7 (222-421)||(7011635-7011837)
chr7 (222-421)||(7026993-7027195)
chr7 (222-421)||(9391521-9391722)
chr7 (222-421)||(29186666-29186867)
chr7 (222-421)||(29187945-29188146)
chr7 (222-421)||(43962484-43962685)
chr7 (222-421)||(44417459-44417660)
chr7 (222-421)||(44420438-44420638)
chr7 (222-421)||(18787150-18787351)
chr7 (222-421)||(48793431-48793632)
chr7 (225-419)||(32519666-32519862)
chr7 (222-421)||(48792445-48792646)
chr7 (223-421)||(44746729-44746929)
chr7 (216-421)||(9392730-9392937)
chr7 (225-421)||(32518426-32518615)
chr7 (223-421)||(45399925-45400125)
chr7 (222-421)||(37237143-37237341)
chr7 (217-421)||(13597141-13597346)
chr7 (217-416)||(44230424-44230625)
chr7 (222-421)||(43960947-43961136)
chr7 (298-421)||(44748478-44748603)
chr7 (222-421)||(3538488-3538679)
chr7 (241-421)||(12630584-12630767)
chr7 (222-313)||(45688869-45688960)
chr7 (222-348)||(37235815-37235941)
chr7 (298-421)||(26005429-26005554)
chr7 (222-310)||(19016725-19016813)
chr7 (224-327)||(12630507-12630610)
chr7 (217-308)||(26006773-26006864)
chr7 (301-421)||(43115002-43115124)
chr7 (222-310)||(19008933-19009021)
chr7 (303-421)||(13599172-13599293)
chr7 (222-288)||(44231892-44231958)
chr7 (222-297)||(42611437-42611512)
chr7 (222-308)||(7057359-7057445)
chr7 (217-308)||(27071017-27071108)
chr7 (217-308)||(27207205-27207296)
chr7 (298-421)||(13749081-13749205)
chr7 (222-268)||(26005413-26005459)
chr7 (523-576)||(13750380-13750432)
chr7 (223-288)||(45398545-45398610)
chr7 (222-265)||(44748576-44748619)
chr7 (298-332)||(7057395-7057429)
chr7 (298-332)||(44231908-44231942)
chr7 (217-270)||(13749060-13749113)
chr7 (531-576)||(40739077-40739121)
chr7 (298-327)||(45688885-45688914)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (222-421)||(3000708-3000909)
chr6 (216-421)||(32348952-32349159)
chr6 (222-421)||(11801257-11801458)
chr6 (222-421)||(34996676-34996877)
chr6 (222-421)||(32347810-32348011)
chr6 (222-421)||(34995354-34995554)
chr6 (217-421)||(18572882-18573087)
chr6 (216-421)||(32713798-32714005)
chr6 (223-421)||(32712358-32712558)
chr6 (222-356)||(29479176-29479310)
chr6 (223-421)||(19383070-19383262)
chr6 (222-332)||(18574299-18574409)
chr6 (330-421)||(27719846-27719938)
chr6 (321-421)||(21094506-21094608)
chr6 (222-300)||(19788249-19788327)
chr6 (222-288)||(29477761-29477827)
chr6 (222-300)||(19761944-19762022)
chr6 (367-421)||(21095294-21095348)
chr6 (298-327)||(29477777-29477806)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (222-421)||(19228840-19229041)
chr5 (222-421)||(19229988-19230189)
chr5 (222-416)||(9083216-9083412)
chr5 (217-421)||(18654293-18654500)
chr5 (222-421)||(12372316-12372517)
chr5 (223-421)||(13278146-13278346)
chr5 (222-421)||(18655567-18655768)
chr5 (222-419)||(39350562-39350761)
chr5 (222-421)||(6803540-6803740)
chr5 (222-420)||(9081981-9082181)
chr5 (222-421)||(39349482-39349683)
chr5 (222-421)||(12373632-12373837)
chr5 (222-361)||(13276821-13276960)
chr5 (255-421)||(39164091-39164257)
chr5 (222-327)||(8447079-8447184)
chr5 (302-423)||(4031903-4032026)
chr5 (223-321)||(6801977-6802075)
chr5 (303-421)||(4032940-4033060)
chr5 (222-310)||(35952464-35952552)
chr5 (222-308)||(25001644-25001730)
chr5 (222-267)||(4031883-4031928)
chr5 (313-361)||(6802358-6802406)
chr5 (298-332)||(8447095-8447129)
chr5 (377-423)||(39051589-39051635)
chr5 (236-284)||(1010845-1010893)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (222-421)||(7261458-7261659)
chr4 (222-421)||(38031170-38031371)
chr4 (222-421)||(38032335-38032536)
chr4 (216-415)||(17356357-17356558)
chr4 (222-421)||(56234936-56235136)
chr4 (222-421)||(22621869-22622070)
chr4 (222-421)||(34095574-34095775)
chr4 (222-421)||(8814137-8814337)
chr4 (222-421)||(8815272-8815473)
chr4 (222-421)||(10802891-10803092)
chr4 (223-421)||(17357778-17357978)
chr4 (222-421)||(23757885-23758087)
chr4 (222-421)||(10804110-10804311)
chr4 (222-421)||(18091582-18091783)
chr4 (251-421)||(22623058-22623230)
chr4 (222-361)||(56233726-56233865)
chr4 (222-402)||(35191819-35192001)
chr4 (223-419)||(48499367-48499565)
chr4 (217-392)||(35193140-35193317)
chr4 (243-421)||(5433322-5433502)
chr4 (224-421)||(48501239-48501437)
chr4 (248-421)||(36074709-36074884)
chr4 (223-327)||(48081601-48081705)
chr4 (222-313)||(34122827-34122918)
chr4 (222-326)||(48080272-48080376)
chr4 (217-308)||(34121296-34121387)
chr4 (238-316)||(48081552-48081630)
chr4 (222-308)||(48463014-48463100)
chr4 (321-421)||(35927031-35927133)
chr4 (333-421)||(35925804-35925894)
chr4 (524-576)||(56234789-56234840)
chr4 (222-273)||(48081392-48081443)
chr4 (298-332)||(34122868-34122902)
chr4 (222-259)||(22624389-22624426)
chr4 (298-327)||(48463055-48463084)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (222-421)||(28777602-28777803)
chr3 (222-419)||(31938224-31938423)
chr3 (217-419)||(31937032-31937236)
chr3 (223-421)||(46902334-46902534)
chr3 (222-421)||(28776450-28776651)
chr3 (222-421)||(35759146-35759347)
chr3 (222-421)||(46903539-46903740)
chr3 (223-421)||(47431102-47431302)
chr3 (217-421)||(43393968-43394175)
chr3 (222-421)||(50881031-50881225)
chr3 (222-420)||(2233221-2233421)
chr3 (222-416)||(54353025-54353221)
chr3 (223-421)||(52521930-52522129)
chr3 (222-419)||(52525276-52525475)
chr3 (222-421)||(2232604-2232805)
chr3 (223-421)||(55209785-55209984)
chr3 (233-421)||(21729103-21729293)
chr3 (222-421)||(21727912-21728113)
chr3 (222-421)||(37609323-37609524)
chr3 (222-421)||(53180719-53180919)
chr3 (223-417)||(5691014-5691209)
chr3 (222-421)||(17116204-17116404)
chr3 (222-419)||(54354308-54354507)
chr3 (230-417)||(17742211-17742401)
chr3 (230-417)||(19043531-19043721)
chr3 (217-421)||(23073289-23073495)
chr3 (222-421)||(11346814-11347015)
chr3 (223-421)||(15290405-15290604)
chr3 (222-421)||(47429629-47429825)
chr3 (223-361)||(53764432-53764569)
chr3 (222-360)||(53765944-53766082)
chr3 (222-421)||(5689727-5689922)
chr3 (222-418)||(11348390-11348587)
chr3 (222-421)||(10979090-10979291)
chr3 (222-351)||(23091193-23091322)
chr3 (217-387)||(46986042-46986211)
chr3 (222-353)||(53178703-53178834)
chr3 (224-332)||(43392630-43392738)
chr3 (217-352)||(17117387-17117520)
chr3 (279-421)||(17740889-17741033)
chr3 (279-421)||(19042209-19042353)
chr3 (242-421)||(47917528-47917708)
chr3 (303-421)||(37610678-37610798)
chr3 (223-332)||(23072063-23072171)
chr3 (298-421)||(35758082-35758207)
chr3 (222-350)||(33113306-33113426)
chr3 (308-419)||(10978093-10978206)
chr3 (216-308)||(34014504-34014596)
chr3 (239-320)||(50879513-50879594)
chr3 (315-419)||(50879782-50879888)
chr3 (301-421)||(55210823-55210945)
chr3 (222-308)||(34015798-34015884)
chr3 (217-308)||(24376458-24376549)
chr3 (225-308)||(27750461-27750544)
chr3 (222-284)||(53101827-53101889)
chr3 (222-313)||(27749108-27749199)
chr3 (233-279)||(21729380-21729426)
chr3 (223-267)||(37610797-37610841)
chr3 (366-419)||(53764898-53764951)
chr3 (216-268)||(35758060-35758112)
chr3 (298-332)||(21729387-21729421)
chr3 (298-332)||(34014526-34014560)
chr3 (298-328)||(37610796-37610826)
chr3 (222-268)||(53101545-53101590)
chr3 (299-332)||(50879513-50879546)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (222-419)||(52086629-52086826)
chr1 (216-421)||(7110222-7110429)
chr1 (222-421)||(51693149-51693350)
chr1 (222-419)||(5488503-5488702)
chr1 (236-421)||(7111390-7111577)
chr1 (222-421)||(51468341-51468542)
chr1 (226-419)||(50484913-50485108)
chr1 (222-421)||(5488782-5488983)
chr1 (223-421)||(45229518-45229718)
chr1 (217-421)||(51468816-51469022)
chr1 (236-421)||(38235065-38235251)
chr1 (222-421)||(17244177-17244378)
chr1 (222-416)||(18819264-18819460)
chr1 (222-421)||(52759365-52759566)
chr1 (222-416)||(40187605-40187800)
chr1 (230-421)||(1821918-1822112)
chr1 (216-417)||(1823215-1823414)
chr1 (224-412)||(47532961-47533150)
chr1 (237-421)||(52087689-52087875)
chr1 (217-361)||(17245642-17245785)
chr1 (219-421)||(47533769-47533973)
chr1 (222-421)||(50483513-50483713)
chr1 (228-405)||(45228283-45228462)
chr1 (301-421)||(52761511-52761633)
chr1 (222-315)||(25181503-25181596)
chr1 (333-421)||(21203124-21203214)
chr1 (217-288)||(18820806-18820877)
chr1 (298-332)||(25181519-25181553)
chr1 (222-268)||(52761606-52761652)
chr1 (298-327)||(18820827-18820856)
chr1 (529-569)||(45228698-45228737)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (222-419)||(35202-35401)
scaffold0141 (222-419)||(31035-31234)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (222-419)||(79411-79610)
scaffold0049 (222-419)||(83578-83777)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (222-421)||(16602727-16602928)
chr2 (222-421)||(27892251-27892452)
chr2 (222-421)||(38243870-38244071)
chr2 (222-416)||(23832970-23833165)
chr2 (222-421)||(27891108-27891309)
chr2 (217-395)||(26388215-26388395)
chr2 (222-310)||(23833898-23833986)
chr2 (222-332)||(16604195-16604305)
chr2 (222-327)||(43814523-43814628)
chr2 (281-421)||(38242944-38243083)
chr2 (222-308)||(5033480-5033566)
chr2 (222-305)||(19577359-19577442)
chr2 (222-308)||(5034846-5034932)
chr2 (258-308)||(15496083-15496133)
chr2 (223-283)||(43814636-43814696)
chr2 (238-283)||(43814599-43814644)
chr2 (523-576)||(27948846-27948903)
chr2 (298-327)||(23833941-23833970)
chr2 (331-363)||(44800983-44801015)
[»] scaffold0878 (2 HSPs)
scaffold0878 (222-421)||(2941-3143)
scaffold0878 (298-421)||(1847-1971)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (223-421)||(30644620-30644819)
chr8 (222-421)||(9244067-9244268)
chr8 (216-421)||(34642661-34642867)
chr8 (222-421)||(522012-522213)
chr8 (222-421)||(26364743-26364944)
chr8 (222-421)||(9245346-9245548)
chr8 (222-419)||(41638070-41638268)
chr8 (222-405)||(43584410-43584595)
chr8 (222-421)||(20308925-20309126)
chr8 (222-421)||(21095558-21095759)
chr8 (222-421)||(41636833-41637034)
chr8 (223-421)||(30640801-30641000)
chr8 (223-421)||(43585860-43586059)
chr8 (238-421)||(20309966-20310152)
chr8 (238-421)||(21096599-21096785)
chr8 (222-421)||(34643880-34644075)
chr8 (222-421)||(26366109-26366310)
chr8 (222-322)||(31202968-31203068)
chr8 (222-308)||(3714550-3714636)
chr8 (222-308)||(43134079-43134165)
chr8 (222-308)||(3713065-3713149)
chr8 (529-576)||(26365844-26365890)
chr8 (222-288)||(22012159-22012225)
[»] scaffold1425 (2 HSPs)
scaffold1425 (222-419)||(136-335)
scaffold1425 (222-419)||(1518-1717)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (222-421)||(25259-25461)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (222-326)||(104303-104407)
scaffold0026 (371-421)||(104404-104454)
scaffold0026 (298-332)||(104319-104353)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (330-421)||(9268-9360)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 222 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 13750752 - 13750548
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13750752 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 13750653  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13750652 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcatcaactaattt 13750553  T
Q  420 atata 424  Q
    |||||    
T  13750552 atata 13750548  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27072770 - 27072569
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27072770 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttatt 27072671  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga--cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27072670 caatttggtcaaattttgataattttaatccactaaaaaaaaaaaccgttggattacagaggtctataagattttatagtttatcaccaacacctaattt 27072571  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  27072570 at 27072569  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 27205543 - 27205744
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27205543 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttatt 27205642  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga--cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27205643 caatttggtcaaattttgataattttaatccactaaaaaaaaaaaccgttggattacagaggtctataagattttatagtctatcaccaacacctaattt 27205742  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  27205743 at 27205744  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 43113676 - 43113877
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43113676 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 43113775  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43113776 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccagcacctaattt 43113875  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  43113876 at 43113877  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 19217629 - 19217830
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19217629 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccattaacttatttcttttatt 19217728  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19217729 caatttggtacaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcggattttatagtgtatcaccaacacctaattt 19217828  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  19217829 at 19217830  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 223 - 419
Target Start/End: Original strand, 3537429 - 3537627
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537429 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 3537528  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga---cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  3537529 aatttagtctaattttaataattttaatcccctaaaaaa-agaaaccgttggattacgaaggtctataaaattttatagtatatcaccatcacctaattt 3537627  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18788676 - 18788475
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18788676 cttaattgatatgccggtcccttaatttatttcttttattcaatatggtcctataaatcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttatt 18788577  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18788576 caatttggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaatagaccgttggattacgaaggtctatcagattttataatgtatcaccaacacctaattt 18788477  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  18788476 at 18788475  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 7011635 - 7011837
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7011635 cttaattgatctgtcagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacatgtcccttagcttatttcttttatt 7011734  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga---cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatt 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |   ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7011735 caatttggtccaattttgataattttaatccattaaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 7011834  T
Q  419 tat 421  Q
    |||    
T  7011835 tat 7011837  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 7026993 - 7027195
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7026993 cttaattgatctgtcagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacatgtcccttagcttatttcttttatt 7027092  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga---cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatt 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |   ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7027093 caatttggtccaattttgataattttaatccattaaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 7027192  T
Q  419 tat 421  Q
    |||    
T  7027193 tat 7027195  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 9391521 - 9391722
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9391521 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataaatcttaattttctcaaacacgtcccttcacttatttcttttatt 9391620  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9391621 caatttggtacaattttgataattttaatcctttaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacaccaaattt 9391720  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  9391721 at 9391722  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 29186666 - 29186867
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29186666 cttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttattttatt 29186765  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa-caga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29186766 caatttggttcaattttgataattttaatcccttaaaaaatgagaccgtaggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 29186865  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  29186866 at 29186867  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29188146 - 29187945
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29188146 cttaaatgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttattttatt 29188047  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaac-agac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |  |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29188046 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattgcagaggtctatcagattttatagtgcatcaccaacacctaattt 29187947  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  29187946 at 29187945  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 43962685 - 43962484
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43962685 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttagctttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttatt 43962586  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  43962585 caatttgatccaattttgataattttaatcatctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtatatcactaacacctaattt 43962486  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  43962485 at 43962484  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 44417459 - 44417660
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  44417459 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaacattctcaaacacgtcccttaacttatttattttctt 44417558  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaac-agac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44417559 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagattgttggattacggaggtctatcagattttatagtctatcaccaacacctaattt 44417658  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  44417659 at 44417660  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 44420638 - 44420438
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| || || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44420638 cttaattgatatgccgatcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 44420539  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga---cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44420538 caatttagtccaattttgataattttaatgccctaaaaaa-agataccgttggattacgaaggtctatcaga-tttatagtgtatcaccaacatctaatt 44420441  T
Q  419 tat 421  Q
    |||    
T  44420440 tat 44420438  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 18787150 - 18787351
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18787150 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttgtttaatttggtcccataaatcttaactttttcaaatatgtcccttaacttatttcttttatt 18787249  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  18787250 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaatagaccgttggattacggaggtttatcagattttatggtgtatcaccaacacttaattt 18787349  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  18787350 at 18787351  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 48793632 - 48793431
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48793632 cttaattgatttgccggtcccttaacttatttcttttattcattttggtcccataagtcttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 48793533  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  48793532 caatttgatccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacaaaggtgtataagattttatagtgtatcaccaacaccaaattt 48793433  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  48793432 at 48793431  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 225 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 32519862 - 32519666
Alignment:
Q  225 aattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaa 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  32519862 aattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacatcccttaaattatttcttttattcaa 32519763  T
Q  325 tttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  32519762 tttggttcaattttaataattttaatcccttaaaaaaagagaccgttgaattacgaaggtctaccagattgtatagtgtgtcaccaacacctaattt 32519666  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 48792445 - 48792646
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48792445 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttttcaaacatgtcccttaacttatttcttttatt 48792544  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  48792545 caatttgatctaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacaagggtgtataagattttatagtgtatcaccaacaccaaattt 48792644  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  48792645 at 48792646  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Original strand, 44746729 - 44746929
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  44746729 ttaattgatctgtcggtctcttaacttattttttttattcaatttgatcttataagtcttaattttctcaaacatgttcgttaacttatttcttttattc 44746828  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44746829 aatttggtcaaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcatattttatagtgtattatcaacacctaattta 44746928  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  44746929 t 44746929  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 216 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9392937 - 9392730
Alignment:
Q  216 taaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 315  Q
    ||||| ||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9392937 taaaggcttaattgatcttccgttcctttaacttatttcttttatttaatttattcctataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttct 9392838  T
Q  316 tttattcaatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacc 413  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||    
T  9392837 tttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctagaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccggcacc 9392738  T
Q  414 taatttat 421  Q
    ||||||||    
T  9392737 taatttat 9392730  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 225 - 421
Target Start/End: Original strand, 32518426 - 32518615
Alignment:
Q  225 aattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaa 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32518426 aattgatctatcggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaaattatttcttttattcaa 32518525  T
Q  325 tttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||| || |         |||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32518526 tttggttc---------aattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 32518615  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 45400125 - 45399925
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||  ||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45400125 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttgtttattttgatttggtctcataactcttaacttttgcaaacacgtcccttaacttatttcttttattt 45400026  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45400025 actttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacctaattta 45399926  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  45399925 t 45399925  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 37237341 - 37237143
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  37237341 cttaattgatctgcccgtcccttaatttatttcttttatttaatttggtctcataagtcttaactctctcaaacacatcccttaacttatt--ttttatt 37237244  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37237243 aaatttggtccaattttgataa-tttaatcctctaaaaaaagagatcgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatgaccaacacctaattt 37237145  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 217 - 421
Target Start/End: Original strand, 13597141 - 13597346
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||| ||||||||| ||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13597141 aaaggcttaattgaactgccgatcctttaacgtatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtccctgaacttatttctt 13597240  T
Q  317 ttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga---cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacc 413  Q
    ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13597241 ttattaaattt-gatcaattttgataattttaatcctctaaaaaa-agatatcgttggattagggaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacc 13597338  T
Q  414 taatttat 421  Q
    ||||||||    
T  13597339 taatttat 13597346  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 217 - 416
Target Start/End: Original strand, 44230424 - 44230625
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44230424 aaaggcttaattgatctgccgatcccttagattatttcttttattcaatttagttccataagttttaactttctcaatcacgtcctttaacttatttctt 44230523  T
Q  317 ttattcaatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacct 414  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44230524 ttattcaatttggtccaattttaataatttcaatcccctacgaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttacagtgtatcatcaacacct 44230623  T
Q  415 aa 416  Q
    ||    
T  44230624 aa 44230625  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 43960947 - 43961136
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43960947 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttg---------gtct---cgttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttatt 43961034  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43961035 caatttgatccaattttgataattttaatcctctacaaaaacagaccgttggattacaaaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacctaattt 43961134  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 298 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 44748603 - 44748478
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagatttta 395  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44748603 gtcccttaatttatttcttttattcaatatggtccaattttgataattttaatcccctagaaaaggagactgttggattacgaaggtctatcagatttta 44748504  T
Q  396 tagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  44748503 tagtgtatcaccaacacctaatttat 44748478  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3538679 - 3538488
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  3538679 cttaattgatccgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcttttcacttatttcttttatt 3538580  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||          ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||| || ||||| | ||||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  3538579 ca----------attttgataattttagtcccctaaaaaaagagaccgttggattacggagatctatcaaattttacggtgtatcaccaacatctaattt 3538490  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 241 - 421
Target Start/End: Original strand, 12630584 - 12630767
Alignment:
Q  241 ccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaa-cttatttcttttattcaatttagtccaattttg 339  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12630584 ccttaacttatgtcttttcttcaatttggtctcaaaagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacctttttttttttattcaatttggtctaattttg 12630683  T
Q  340 ataattttaatccccta-aaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||  |||| ||| |||||||||  || ||||  ||||||||||||||    
T  12630684 ataattttaatcccctagaaaaagagactgttggattacagaggtatatcagattttattatggatcactaacacctaatttat 12630767  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 313
Target Start/End: Original strand, 45688869 - 45688960
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  45688869 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacatcccttaactcattt 45688960  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 348
Target Start/End: Original strand, 37235815 - 37235941
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  37235815 cttaattggcctgccggtcccttaacttatttcttttatttaatttggttccataaatcccaactttctcaaacgcgtcccttaacttatttctttgatt 37235914  T
Q  322 caatttagtccaattttgataatttta 348  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  37235915 caatttggtccaattttgagaatttta 37235941  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 298 - 421
Target Start/End: Original strand, 26005429 - 26005554
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagatttta 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  26005429 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggttcaattttgataattttactccactaaaaaaagagaccgttggattacaaaggtctataagatttta 26005528  T
Q  396 tagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||    
T  26005529 tagtgtatcaccaacacgtaatttat 26005554  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19016813 - 19016725
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactta 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  19016813 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttctttttttcaatttggtcccataagtattaaatttgtcaaccacgtcccttaactta 19016725  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 327
Target Start/End: Original strand, 12630507 - 12630610
Alignment:
Q  224 taattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattca 323  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  12630507 taattgatatgtcggtcctttaacttatgtcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacatgttccttaacttatgtcttttcttca 12630606  T
Q  324 attt 327  Q
    ||||    
T  12630607 attt 12630610  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26006864 - 26006773
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  26006864 aaaggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttgttcaatttggtcccataagttttaactatcacaaacacatcccttaact 26006773  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 301 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 43115124 - 43115002
Alignment:
Q  301 ccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa-caga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatag 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||  | |||||| |||||||||||    
T  43115124 ccttaacttatttcttttattcaatttgatccaattttgataattttaatcccttaaaaaagaagaccgttggattactgaagtctatcagattttatag 43115025  T
Q  399 tgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    || |||||||  |||||||||||    
T  43115024 tgcatcatcataacctaatttat 43115002  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 310
Target Start/End: Original strand, 19008933 - 19009021
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactta 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  19008933 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttctttttttcaatttggtcccataagtattaaatttgtcaatcgcgtcccttaactta 19009021  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13599293 - 13599172
Alignment:
Q  303 ttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga---cgttgaattacgaaggtctattagattttatagt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||| | |    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13599293 ttaacttatttcttttattcaatttgctccaattttgataattttaatatcttaaaaaaaaaaaattgttggattacggaggtctatcagattttatagt 13599194  T
Q  400 gtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  13599193 gtatcagtaacacctaatttat 13599172  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44231958 - 44231892
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaacttt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44231958 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaacttt 44231892  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 297
Target Start/End: Original strand, 42611437 - 42611512
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacac 297  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  42611437 cttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggttccataagttttaactttctcaaacac 42611512  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7057445 - 7057359
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||| ||||| ||||    
T  7057445 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaaccgtcacaaacacatccctcaact 7057359  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Original strand, 27071017 - 27071108
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||| ||||||||||    
T  27071017 aaaggcttaattgatctgccggtcatttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaacagtcacaaacacatcccttaact 27071108  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27207296 - 27207205
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||| ||||||||||    
T  27207296 aaaggcttaattgatctgccggtcatttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaacagtcacaaacacatcccttaact 27207205  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 421
Target Start/End: Original strand, 13749081 - 13749205
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa-caga-cgttgaattacgaaggtctattagatttta 395  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| || | |||     
T  13749081 gtcccataacttatttcttatatttaatttgatttaattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccgttgaattacgtaggtcta-taaaatttc 13749179  T
Q  396 tagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  13749180 tagtgtatcaccaacacctaatttat 13749205  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Original strand, 26005413 - 26005459
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttg 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26005413 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttg 26005459  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 13750432 - 13750380
Alignment:
Q  523 catcttcatcaaattatgctttttaaaaccctaatcttcatgtcttcttctctc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13750432 catcttcatcaaattatgctttt-aaaaccccaatattcatgtcttcttctctc 13750380  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 288
Target Start/End: Original strand, 45398545 - 45398610
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaacttt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  45398545 ttaattgatctgtcggtcccttaacttacttctttatttcgatttggtcccatagctcttaacttt 45398610  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44748619 - 44748576
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaat 265  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748619 cttaatcgatctgccagtcccttaatttatttcttttattcaat 44748576  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7057429 - 7057395
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7057429 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 7057395  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44231942 - 44231908
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44231942 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 44231908  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 270
Target Start/End: Original strand, 13749060 - 13749113
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgat 270  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  13749060 aaaggcttaattgatctggcggtcccataacttatttcttatatttaatttgat 13749113  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 576
Target Start/End: Original strand, 40739077 - 40739121
Alignment:
Q  531 tcaaattatgctttttaaaaccctaatcttcatgtcttcttctctc 576  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40739077 tcaaattatgtttttaaaaaccc-aatcttcatgtcttcttctctc 40739121  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 327
Target Start/End: Original strand, 45688885 - 45688914
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaattt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45688885 gtcccttaacttatttcttttattcaattt 45688914  T

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Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3000909 - 3000708
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3000909 cttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacctcccttaacttatttcttttatt 3000810  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaa-acaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3000809 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaacacagatcgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcactaacacctaattt 3000710  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  3000709 at 3000708  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 216 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 32349159 - 32348952
Alignment:
Q  216 taaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 315  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32349159 taaaggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcttataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttct 32349060  T
Q  316 tttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacc 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32349059 tttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacc 32348960  T
Q  414 taatttat 421  Q
    ||||||||    
T  32348959 taatttat 32348952  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11801458 - 11801257
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11801458 cttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttcttttatt 11801359  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11801358 caatttggtccaattttgataattttaatcccctcaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcattaacacctaattt 11801259  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  11801258 at 11801257  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 34996877 - 34996676
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34996877 cttaattgatttgtcggtccctgaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaatacgtcccttaacttatttcttttatt 34996778  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34996777 caatttggtccaattttgataattttaatctcctaaaaaaacagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 34996678  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  34996677 at 34996676  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 32347810 - 32348011
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32347810 cttaattgatctgctggttccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaagtgatttcttttatt 32347909  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacag-acgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32347910 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaacgttggattacgggggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 32348009  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  32348010 at 32348011  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 34995354 - 34995554
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34995354 cttaattgatctgtcggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgt-ctttaacttatttcttttatt 34995452  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34995453 caatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacatctaattt 34995552  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  34995553 at 34995554  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 217 - 421
Target Start/End: Original strand, 18572882 - 18573087
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18572882 aaaggcttaattgatctgccggtccgttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttcttaaaaacgtcccttaacttatttctt 18572981  T
Q  317 ttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacaccta 415  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||    
T  18572982 ttattcaaattgggccaattttgataattttaatcccctaaaaaagacactgttggattacggaggtctatcaaattttacagtgtatcaccaacacata 18573081  T
Q  416 atttat 421  Q
    ||||||    
T  18573082 atttat 18573087  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 216 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 32714005 - 32713798
Alignment:
Q  216 taaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 315  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32714005 taaaggcttaattgatctgctggtcctgtaacttatttcttttattcagtttggttccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 32713906  T
Q  316 tttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaca-gac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacc 413  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  32713905 tttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagtgaccgttggattacggaggtctataagattttacagtgtatcaccaacacc 32713806  T
Q  414 taatttat 421  Q
    ||||||||    
T  32713805 taatttat 32713798  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Original strand, 32712358 - 32712558
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32712358 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcagtttggtcctataaatcttacatttctcaaatacgtctcttaacttatttcttttattc 32712457  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  32712458 aatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtaccaccaacacctaactta 32712557  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  32712558 t 32712558  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 222 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29479310 - 29479176
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29479310 cttaattgatctgccgatcccttaaattatttcttttattcaatctggtcccataagttttaactttctcaatcacgtcctttaacttatttcttttatt 29479211  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta 356  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29479210 caatttggtccaattttaataatttcaatccccta 29479176  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19383262 - 19383070
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactta--tttcttttat 320  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  19383262 ttaattgatccgccggtcccttaacttatttcttttattcaatt-------ataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattttttttttat 19383170  T
Q  321 tcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19383169 tcaatttgatctaattttgataattttaatgccct-aaaaagagaccgttggattacgatggtctatcagattttatagtgtatca-caacatctaattt 19383072  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 222 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18574409 - 18574299
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18574409 cttaattgatctgccggtcccttgacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaagcacgtccctgaacttatttcttttatt 18574310  T
Q  322 caatttagtcc 332  Q
    |||||| ||||    
T  18574309 caatttggtcc 18574299  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 421
Target Start/End: Original strand, 27719846 - 27719938
Alignment:
Q  330 tccaattttgataattttaatcccctaaaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27719846 tccaattttgatgattttaatcccctaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 27719938  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 321 - 421
Target Start/End: Original strand, 21094506 - 21094608
Alignment:
Q  321 tcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaac-agac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatt 418  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21094506 tcaatttgatccaattttgataactttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctactagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 21094605  T
Q  419 tat 421  Q
    |||    
T  21094606 tat 21094608  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Original strand, 19788249 - 19788327
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtc 300  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  19788249 cttaattcatctgtcgatcccttaacttgtttcttttattcaatttgatctcataagttttaactttcataaacacgtc 19788327  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 288
Target Start/End: Original strand, 29477761 - 29477827
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaacttt 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  29477761 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaacttt 29477827  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Original strand, 19761944 - 19762022
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtc 300  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||  |||||||||    
T  19761944 cttaattcatctgtcgatcccttaacttgtttcttttattcaatttgatcttataagttttaattttcataaacacgtc 19762022  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21095348 - 21095294
Alignment:
Q  367 gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21095348 gttggattacggaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 21095294  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 327
Target Start/End: Original strand, 29477777 - 29477806
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaattt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29477777 gtcccttaacttatttcttttattcaattt 29477806  T

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Target: chr5 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 19228840 - 19229041
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19228840 cttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgttccttaactgatttcttttatt 19228939  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228940 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 19229039  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  19229040 at 19229041  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19230189 - 19229988
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19230189 cttaattgatctgccgatcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttcttttatt 19230090  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19230089 caatttggtccaattttgataattttaatcccctcaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcatcaacacttaattt 19229990  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  19229989 at 19229988  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 222 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9083412 - 9083216
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9083412 cttaattgatctgccggtttcttaattcatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttttttattttatt 9083313  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa-caga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaa 416  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9083312 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaggagaccgttggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaa 9083216  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 217 - 421
Target Start/End: Original strand, 18654293 - 18654500
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654293 aaaggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 18654392  T
Q  317 ttatt-caatttagtccaattttgataattttaatccc-ctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacc 413  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  18654393 ttattaaaatttggtccaattttgatcattttaatcccattaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacc 18654492  T
Q  414 taatttat 421  Q
    ||||||||    
T  18654493 taatttat 18654500  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 12372316 - 12372517
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12372316 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttgttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtctcttaacttatttgttttatt 12372415  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12372416 caatttgatccaattttgataattttaataccctaaaaaaacataccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 12372515  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  12372516 at 12372517  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13278346 - 13278146
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  13278346 ttaattgatctgtcggtcccttaatttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttttttacttc 13278247  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13278246 aatttgatccaattttgataattttaatcccatagaaaaagagaccgttggattagggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattta 13278147  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  13278146 t 13278146  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18655768 - 18655567
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18655768 cttaattgatctgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttatt 18655669  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||| |||||  ||||||    
T  18655668 caatttggtccaactttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttgaattacgaaagtctatcagattttacggtgtatcaccaacaattaattt 18655569  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  18655568 at 18655567  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 39350761 - 39350562
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39350761 cttaattgatatgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttact 39350662  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39350661 taatttggtccaatttttataattttaatcctctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaattt 39350562  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 6803740 - 6803540
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  6803740 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcacataagtcttaattttctcaaacatgtttcttaacttatttcttttatt 6803641  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6803640 caatttggtccaattttgataattttaatcctttaaaaaaacagaccgttagattac-aaagtctatcagattttatagtgtatcaccaacatctaattt 6803542  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  6803541 at 6803540  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 420
Target Start/End: Original strand, 9081981 - 9082181
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9081981 cttaattgatctaccggttccttaactcatttcttttattcaatttgattccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 9082080  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  9082081 caatttggtccaattttgataattttaatcccctagaaaatgagaccgttggatcacggatgtctatcagattttatagtatatcgctaacacctaattt 9082180  T
Q  420 a 420  Q
    |    
T  9082181 a 9082181  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 39349482 - 39349683
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  39349482 cttaattgatctgacggtcctttaacttatttcttttattcaatttggttccataactcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttact 39349581  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaca-gac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  39349582 caatttggttcaatttttataattttaatcccctaaaaaaagtgaccgtttgattacggaggtctattagattttatcgtggatcaccaacacctaattt 39349681  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  39349682 at 39349683  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12373837 - 12373632
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12373837 cttaattgatccgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttattttatt 12373738  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatc-----ccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacaccta 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  12373737 caatttggtccaattttgataattttaatcaaaaaaaaaaaaaaacagaccgttggattacgaatgtctatcagattttacactgtatcaccaacaccta 12373638  T
Q  416 atttat 421  Q
    ||||||    
T  12373637 atttat 12373632  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 222 - 361
Target Start/End: Original strand, 13276821 - 13276960
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13276821 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataaatcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 13276920  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa 361  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13276921 caatttggtcaaattttgataattttaatcccttaaaaaa 13276960  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 255 - 421
Target Start/End: Original strand, 39164091 - 39164257
Alignment:
Q  255 ttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccc 354  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  39164091 ttttattcaatttagtctcataagtcttaactttatcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttggtccaattttgat-attttaatccct 39164189  T
Q  355 taaaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39164190 taaaaaaaagactgttgaattacggaggcctatcaaattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 39164257  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 222 - 327
Target Start/End: Original strand, 8447079 - 8447184
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8447079 cttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 8447178  T
Q  322 caattt 327  Q
    ||||||    
T  8447179 caattt 8447184  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 302 - 423
Target Start/End: Original strand, 4031903 - 4032026
Alignment:
Q  302 cttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  4031903 cttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatccactaaaaaaagagaccgttgaattacggaagtctaccagattttatagt 4032002  T
Q  400 gtatcatcaacacctaatttatat 423  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  4032003 gtatcaccaacacctaatttatat 4032026  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 321
Target Start/End: Original strand, 6801977 - 6802075
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6801977 ttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttttttaatttggtctcataagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 6802075  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 303 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4033060 - 4032940
Alignment:
Q  303 ttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtg 400  Q
    ||||||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  4033060 ttaacttattttttttatttaacttggtccaattttaataattttaatccactaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatg 4032961  T
Q  401 tatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  4032960 tatcattaacacctagtttat 4032940  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35952552 - 35952464
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactta 310  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35952552 cttaactgatctgtcagtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaactttgtcaaacgcgtcccttaactta 35952464  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Original strand, 25001644 - 25001730
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  25001644 cttaattgatatgtcggtcctttaacttatttcttttattcaatttgatttcataagtcttaactttcgcaaactggtccctcaact 25001730  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 267
Target Start/End: Original strand, 4031883 - 4031928
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaattt 267  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4031883 cttaattgatctgccggtcacttaacttatttcttttattcaattt 4031928  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 361
Target Start/End: Original strand, 6802358 - 6802406
Alignment:
Q  313 tcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa 361  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6802358 tcttttatttaattcggtccaattttgataagtttaatcccctaaaaaa 6802406  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 332
Target Start/End: Original strand, 8447095 - 8447129
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8447095 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 8447129  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 377 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 39051635 - 39051589
Alignment:
Q  377 gaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttatat 423  Q
    ||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39051635 gaaggtccatcagatctaatagtgtatcatcaacacctaatttatat 39051589  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Original strand, 1010845 - 1010893
Alignment:
Q  236 cggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaa 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||    
T  1010845 cggtcccttaatttaattcttttattcaaattggtcccaaaagtattaa 1010893  T

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Target: chr4 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7261659 - 7261458
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7261659 cttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 7261560  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaac-agacg-ttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7261559 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaatagaccattggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 7261460  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  7261459 at 7261458  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 38031170 - 38031371
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38031170 cttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttcttttatt 38031269  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38031270 caatttggtccaattttgataattttaatcccataaaaaaaaagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 38031369  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  38031370 at 38031371  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 38032536 - 38032335
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38032536 cttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttcttttatt 38032437  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38032436 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 38032337  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  38032336 at 38032335  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 216 - 415
Target Start/End: Original strand, 17356357 - 17356558
Alignment:
Q  216 taaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17356357 taaaggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatgccagaaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 17356456  T
Q  316 tttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacc 413  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17356457 tttattcaatttgttccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 17356556  T
Q  414 ta 415  Q
    ||    
T  17356557 ta 17356558  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 56235136 - 56234936
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  56235136 cttaattgatctgtcagtcccttaatttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttatcaaacacaccccttaacttatttcttttatt 56235037  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    |||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  56235036 caattcggtctaattttgatacttttaatcctctaaaaaacagaccaatgaattacgaaggtctatcagattttataatgtatcaccaacacctaattta 56234937  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  56234936 t 56234936  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 22621869 - 22622070
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22621869 cttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctttacttatttcttttatt 22621968  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  22621969 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccgacaccgaattt 22622068  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  22622069 at 22622070  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 34095775 - 34095574
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34095775 cttaattgatctattagtcccttaacttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttgtt 34095676  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa-caga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34095675 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaggagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtgtatcacccacacctaattt 34095576  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  34095575 at 34095574  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 8814137 - 8814337
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8814137 cttaattgatctatcggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataaatcttatctttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttatt 8814236  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8814237 caatttggtcgaattttgataattttaataccctaaaaaatagactgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtaacaccaacacctaattta 8814336  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  8814337 t 8814337  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8815473 - 8815272
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8815473 cttaattgatttgccggtccgttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttctatt 8815374  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga--cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8815373 caaattggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaaaaaaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacaccaaattt 8815274  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  8815273 at 8815272  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 10802891 - 10803092
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10802891 cttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaattttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 10802990  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  10802991 caatttggtccaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtttatcagattttatattgtatcaccaacaccgaattt 10803090  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  10803091 at 10803092  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17357978 - 17357778
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17357978 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 17357879  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  17357878 aatatgatccaattttgataattttaatctcctgaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctaccagattttataatgtatcagcaatacttaattta 17357779  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  17357778 t 17357778  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23758087 - 23757885
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23758087 cttaattgatctgccggttctttaatttatttcttttattcaatttagtctcataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 23757988  T
Q  322 caatttag-tccaattttgataattttaatcc-cctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatt 418  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23757987 aaattttgatccaattttgataattttaatcctccaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatggtgtatcaccaacacctaatt 23757888  T
Q  419 tat 421  Q
    |||    
T  23757887 tat 23757885  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 10804311 - 10804110
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  10804311 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagttttaactttcttaaataagttccttaacttatttcttttatt 10804212  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10804211 caatttggttcaattttgataattttaatccactaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcatcaacgcctaattt 10804112  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  10804111 at 10804110  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 18091582 - 18091783
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  18091582 cttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaaaacgtccattaacttatctattttatt 18091681  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa-caga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18091682 caatttagtccaattttgataattttaatctcttaaaaaatgagaccgttgaattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 18091781  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  18091782 at 18091783  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 251 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22623230 - 22623058
Alignment:
Q  251 tttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaat 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22623230 tttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaagcacgtccctttacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaat 22623131  T
Q  351 ccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  22623130 cccctacaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcaccaacatctaatttat 22623058  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 222 - 361
Target Start/End: Original strand, 56233726 - 56233865
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56233726 cttaatagatctatcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcgcataagtctcaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttatt 56233825  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56233826 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa 56233865  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 222 - 402
Target Start/End: Original strand, 35191819 - 35192001
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35191819 cttaattgattcgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtttcataagtcttaactttctcaaacacgttcattaacttatttcttttatt 35191918  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacag-acgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgta 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||    
T  35191919 caatttagttcaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaacgttggattacggaagtctatcaaattttatagtgta 35192001  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 223 - 419
Target Start/End: Original strand, 48499367 - 48499565
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48499367 ttaattgatctgccgccaccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataattcttaactttttcaaacatgtcccttaacttatttattttattc 48499466  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  48499467 aatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagatcgttggattacagaggtctatcagattttacggtgtatcaccaacatctaattt 48499565  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 217 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35193317 - 35193140
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35193317 aaagacttaattgacctgccagtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataaaacttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttctt 35193218  T
Q  317 ttattcaatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagatt 392  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  35193217 ttattcaatttggtccatttttgataattttaatcccctagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagatt 35193140  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 5433502 - 5433322
Alignment:
Q  243 ttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgata 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5433502 ttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagttttaactttctcaaacatgtgccttaacttatttattttattcaatttactccaattttgata 5433403  T
Q  343 attttaatcccctaaaaaac-agac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||| |||||||||   |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  5433402 attttaataccctaaaaattgagactgttgtattacggaggtctatcagattttataatgtatcacaaacacctaatttat 5433322  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 224 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 48501437 - 48501239
Alignment:
Q  224 taattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattca 323  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  48501437 taattgatctgtcggttctttaacttatttcttttattcaattaggtttcataattcttaactttctcaaacatgtcctttaacttatttcttttattca 48501338  T
Q  324 atttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaac-agac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| |||  |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48501337 atttggtctaattttaata-ttttaatcccctaaaaaaagagaccgttagattacggaggtctgtcagattttattgtgtatcatcaacacctaatttat 48501239  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 248 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 36074884 - 36074709
Alignment:
Q  248 ttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaact-ttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttg-ataatt 345  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||    
T  36074884 ttatttattttattcaatttagtcccataaattttaactcttctcaagcacgttccttaacttattttttttattcaatttggtctaattttttatattt 36074785  T
Q  346 ttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36074784 ttaatctcataaaaaa-agatcgttggattacgaaggtctatcatattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 36074709  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 48081705 - 48081601
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  48081705 ttaattgatgtgtcggtcccttaacttattccttttattcaatttggttccataagtcttaactttttcaaatatgtcccttaacttatttcttttattc 48081606  T
Q  323 aattt 327  Q
    |||||    
T  48081605 aattt 48081601  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34122918 - 34122827
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34122918 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacatcccttaactcattt 34122827  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 222 - 326
Target Start/End: Original strand, 48080272 - 48080376
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  48080272 cttaattgatctgtcggtcacttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaacttgtcctttaacttatttcttttatt 48080371  T
Q  322 caatt 326  Q
    |||||    
T  48080372 caatt 48080376  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Original strand, 34121296 - 34121387
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34121296 aaaggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacatcacttaact 34121387  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 238 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48081630 - 48081552
Alignment:
Q  238 gtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48081630 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaagttatttctt 48081552  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48463100 - 48463014
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48463100 cttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttctcaaacacatcccttaact 48463014  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 321 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 35927133 - 35927031
Alignment:
Q  321 tcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaca-ga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatt 418  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35927133 tcaatttgatccaattttgataattttaatctcctaaaaaaaaagatcgttggattacgaaggtctaccagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 35927034  T
Q  419 tat 421  Q
    |||    
T  35927033 tat 35927031  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 421
Target Start/End: Original strand, 35925804 - 35925894
Alignment:
Q  333 aattttgataattttaatcccctaaaaaaca-gac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35925804 aattttgataattttaatcttctaaaaaaaaagactgttggattacggagatctatcagattttatagtgtatcgtcaacacctaatttat 35925894  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 524 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 56234840 - 56234789
Alignment:
Q  524 atcttcatcaaattatgctttttaaaaccctaatcttcatgtcttcttctctc 576  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  56234840 atcttcatcaaattatgctttt-aaaaccccaatcttcatgtcttctactctc 56234789  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48081443 - 48081392
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatccc 273  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  48081443 cttaattgatttgccggtcccttaacttattccttttattcaatttggtccc 48081392  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34122902 - 34122868
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34122902 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 34122868  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22624426 - 22624389
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttctttta 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22624426 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttctttta 22624389  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 48463084 - 48463055
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaattt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48463084 gtcccttaacttatttcttttattcaattt 48463055  T

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Target: chr3 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28777803 - 28777602
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28777803 cttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttcttttatt 28777704  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28777703 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 28777604  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  28777603 at 28777602  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31938423 - 31938224
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31938423 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 31938324  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31938323 caatttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctataagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 31938224  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 217 - 419
Target Start/End: Original strand, 31937032 - 31937236
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31937032 aaaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttcacttatttatt 31937131  T
Q  317 ttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacct 414  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31937132 ttattcattttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacct 31937231  T
Q  415 aattt 419  Q
    |||||    
T  31937232 aattt 31937236  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Original strand, 46902334 - 46902534
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46902334 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 46902433  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaa-aacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  46902434 aatttggtgcaattttgataattttaatcccctaaaagaagagattgttagattacggaggtctatcagattttatagtgtatcactaacaccaaattta 46902533  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  46902534 t 46902534  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 28776450 - 28776651
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28776450 cttaattgatctatcagtcctttaatttattttttttattcaatttgatcctataaatcttaattttctcaaacaagtcccttaactgatttcttttatt 28776549  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaa-acaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28776550 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaacagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcatcaacacctaattt 28776649  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  28776650 at 28776651  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 35759347 - 35759146
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35759347 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttatt 35759248  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatc-ccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35759247 caatttggtccaattttgataattttaatctaaaaaaaaaacagaccgttggattacgaatgtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaattt 35759148  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  35759147 at 35759146  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 46903740 - 46903539
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46903740 cttaattgatctttcagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaagtttttcaaacacgtcctttaacttatttcttttatt 46903641  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46903640 caatttggtacaattttgatgattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 46903541  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  46903540 at 46903539  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 47431302 - 47431102
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  47431302 ttaattgatttgtcagtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaactttttcaaacacgttccttaacttatttcttttgttc 47431203  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47431202 aatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattatggaggtctattagattttatagtgtatcacccacacctaattta 47431103  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  47431102 t 47431102  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 217 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 43394175 - 43393968
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactta-tttct 315  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43394175 aaagacttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaagacgtcccttaacttattttct 43394076  T
Q  316 tttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacc 413  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  43394075 tttattcaaattggtccaattttgataattttaaccccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacc 43393976  T
Q  414 taatttat 421  Q
    ||||||||    
T  43393975 taatttat 43393968  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 50881225 - 50881031
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50881225 cttaattgatgtgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttgaccacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttatt 50881126  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacagacgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||| |||||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50881125 caatttagttcaattttgataattttaatcccctaaaaaa-----attggattatgaaggtctaccatattttatagtgtaccaccaacacctaatttat 50881031  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 222 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2233421 - 2233221
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2233421 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaattcggtctcataagtcttaactttgtcaaacatgtcccttaacttatttcttttatt 2233322  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||| | || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2233321 caatttggtccaattttgataattttaatcctctaaaaaaagagatcgttggattatggagatctataagattttatagcgtatcaccaacacctaattt 2233222  T
Q  420 a 420  Q
    |    
T  2233221 a 2233221  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 222 - 416
Target Start/End: Original strand, 54353025 - 54353221
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  54353025 cttaattgatctgacggtcctttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttatcaaacatgtcccttaacttatttcttttact 54353124  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccc-taaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaa 416  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  54353125 caatttggtccaatttttataattttaatccccgaaaaaaagagaccgttggattacgaaggtctatcagattttatcgtgtatcactaacacctaa 54353221  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Original strand, 52521930 - 52522129
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  52521930 ttaattgatctgctggtcccttaacttatttctttaattcaatttggtctcatagatcttaactttctcaaacacgtcctttcacttatttattttattc 52522029  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52522030 aatttggtccaattttgataactttaatcccctaaaaaaaagacagttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 52522129  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 52525475 - 52525276
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52525475 cttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacatcccttaacttatttcttttatt 52525376  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||  || |||||||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  52525375 caatttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattatgaaggttaataagattttataatgtgtcaccaacatctaattt 52525276  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 2232604 - 2232805
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2232604 cttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaatacgtcccttaatttatttcttttatt 2232703  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  2232704 caatttaatccaattttaataattttaatcccctagaaaaaaagaccattggattacggaggtctatgagattttacggtgtatcagcaacacctaattt 2232803  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  2232804 at 2232805  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Original strand, 55209785 - 55209984
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  55209785 ttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttattt 55209884  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  55209885 aatttggtccaattttgataattttaatccacgaaaaaagagaccattggattacggaggtctatcagaatttatagtgtattaccaacacctaatttat 55209984  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21729293 - 21729103
Alignment:
Q  233 tgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  21729293 tgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttagtcccataagttctaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttgattc 21729194  T
Q  333 aattttgataattttaatcccctaaaaaac-agacg-ttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729193 aattttgataattttaatcctctaaaaaatgagaccattggattatgaaggtctaccatattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 21729103  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 21727912 - 21728113
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21727912 cttaattgatctgccggtcccataacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttatt 21728011  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaac-agac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21728012 caatttgattcaattttgataattttaatctcctaaaaaagtagactgttagattacgaaggtctatctcattttataatgtatcaccaacacctaattt 21728111  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  21728112 at 21728113  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 37609323 - 37609524
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37609323 cttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttatttaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttcttttatt 37609422  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  37609423 caatttgatccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattagggaggtctataagatttaatagtgtctcatcaacacctaattt 37609522  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  37609523 at 37609524  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 53180919 - 53180719
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  53180919 cttaattgatttgccggtcccttaacttattt-ttttattcaatttgatctcataagtcgtaactttctcaaacacgttctttaacttattttttttatt 53180821  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa-caga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  53180820 caatttagtccaattttaataattttaatcctctaaaaaaggagaccgttggattacggaggtctatcagattgtatagtgtatcaccaacacctaattt 53180721  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  53180720 at 53180719  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 223 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5691209 - 5691014
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5691209 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcacataagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatta 5691110  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaat 417  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5691109 aactt-gtccaattttgataatttaaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaat 5691014  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 17116204 - 17116404
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17116204 cttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtgttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 17116303  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||  | | ||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17116304 caatttggttcaattttgataattttaatccctaaaaaatgacaccgttggattacggaggtccatcagagtttatagtgtatcaccaacacctaattta 17116403  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  17116404 t 17116404  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 54354507 - 54354308
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54354507 cttaattgatctgccggtcccttaacctatttcttttatttaatttggtcccttaagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttgatt 54354408  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||| ||||   |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  54354407 caatttggtccaattttgataattttaattccctataaaaagagaccattggattatagaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaattt 54354308  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 230 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17742401 - 17742211
Alignment:
Q  230 atctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttag 329  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  17742401 atctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattaaatttga 17742302  T
Q  330 tccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattt-tatagtgtatcatcaacacctaat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  17742301 tccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagatttatacagtgtatcaacaacacctaat 17742211  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 230 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19043721 - 19043531
Alignment:
Q  230 atctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttag 329  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  19043721 atctgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattaaatttga 19043622  T
Q  330 tccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattt-tatagtgtatcatcaacacctaat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  19043621 tccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagatttatacagtgtatcaacaacacctaat 19043531  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 217 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23073495 - 23073289
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23073495 aaaggcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttctcaaagatgtcccttaacttatttctt 23073396  T
Q  317 ttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacct 414  Q
    ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||  |||||||| ||||||||    
T  23073395 ttattcaaactggttcaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtgtatcaaattttacggtgtatcaccaacacct 23073296  T
Q  415 aatttat 421  Q
    |||||||    
T  23073295 aatttat 23073289  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 11346814 - 11347015
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11346814 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcatataaatcttaactttatcaaacacgtgccttaatttatttcttttatt 11346913  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||| |||| |||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11346914 caatttgttccaattttgataattttaatcccctgaaaagagagaccattggattatgaaggtctaccatattgtatagtgtatcaccaacacctaattt 11347013  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  11347014 at 11347015  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15290604 - 15290405
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||    
T  15290604 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttatttaatttgatcacataagtcttaattttctcaaacatgtctattaaattatttcatttattc 15290505  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15290504 aatttgatccaattttaataattttaatcatttaaaaaaaagaccattgaattatgaaggtctaccatattttatagtgtatcatcaatacctaatttat 15290405  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 47429629 - 47429825
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||| ||    
T  47429629 cttaattgatctgcatgtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccttta-------tcttttgtt 47429721  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaca---gac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaat 417  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47429722 caatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaaaaaagactgttggattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacatctaat 47429821  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 223 - 361
Target Start/End: Original strand, 53764432 - 53764569
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53764432 ttaattgatctaccggtcctttaacttattt-ttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttattc 53764530  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53764531 aatttagtcaaattttgataattttaatcccctaaaaaa 53764569  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 222 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 53766082 - 53765944
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53766082 cttaattgatctgcgggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccgtaagtcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 53765983  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaa 360  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53765982 caatttgatccaattttaataattttaatcccctaaaaa 53765944  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 5689727 - 5689922
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5689727 cttaattgatctgtcgctcccttagcttatttcttttattaaatttggtcccataaga------tttcccaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 5689820  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaa-aacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5689821 aaatttggtccaattttgataattttaatcctttaaaacaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacttaattt 5689920  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 222 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11348587 - 11348390
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  11348587 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtattaactttatcatacatgttccttaactaatttcttttatt 11348488  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatt 418  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  11348487 taatttgatccaattttgataattttaattccttagaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcagattttatagtatatca-ccacacctaatt 11348390  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 10979291 - 10979090
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  10979291 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaaatttctcaaacacgtcatttcacttatttcttttatt 10979192  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccc-ctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| | ||| |||||| |||| ||| | ||||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  10979191 caatttgattcaattttgataattttagtccctttaaaaaagagaccattggattacggaggtttatcaaattttacggtgtatcaccaacatctaattt 10979092  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  10979091 at 10979090  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 222 - 351
Target Start/End: Original strand, 23091193 - 23091322
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23091193 cttaattgatctgccggtcttttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtctcttaacttaattcttttatt 23091292  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatc 351  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23091293 caatttggtccaactttgataattttaatc 23091322  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 217 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 46986211 - 46986042
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  46986211 aaaggcttaattgatttgccggccccttaatttatttcttttattcaatttggtccaataagtcttaactctctcaaacacgtcccttaacttattt-tc 46986113  T
Q  317 ttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctatt 387  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||    
T  46986112 ttattaaatttggtcaaattttgataattttaatcctttaaaaaa-agaccgttggattacggaggtctatt 46986042  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 222 - 353
Target Start/End: Original strand, 53178703 - 53178834
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53178703 cttaattgatctgccgatcccttaacttattttttttattcaatttgatttcataagccttaactttctcaaacacgttccttaacttatttcttttatt 53178802  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccc 353  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  53178803 caatttgatccaattttgatcattttaatccc 53178834  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 224 - 332
Target Start/End: Original strand, 43392630 - 43392738
Alignment:
Q  224 taattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattca 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43392630 taattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaagcacgtccctgaacttatttcttttattca 43392729  T
Q  324 atttagtcc 332  Q
    |||| ||||    
T  43392730 atttggtcc 43392738  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17117520 - 17117387
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||    
T  17117520 aaaggcttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaa--tttttttt 17117423  T
Q  317 ttattcaatttagtccaattttgataattttaatcc 352  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||    
T  17117422 ttattcaatttgggcaaattttgatgattttaatcc 17117387  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 279 - 421
Target Start/End: Original strand, 17740889 - 17741033
Alignment:
Q  279 tcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaa-acaga-cgttgaattac 376  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||| | |||||    
T  17740889 tcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttattaaatttgatccaattttgataattttaatcctttaaaaatagagaccgtcggattac 17740988  T
Q  377 gaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17740989 ggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 17741033  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 279 - 421
Target Start/End: Original strand, 19042209 - 19042353
Alignment:
Q  279 tcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaa-acaga-cgttgaattac 376  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||| | |||||    
T  19042209 tcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttcttttattaaatttgatccaattttgataattttaatcctttaaaaatagagaccgtcggattac 19042308  T
Q  377 gaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19042309 ggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 19042353  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 47917708 - 47917528
Alignment:
Q  242 cttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgat 341  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||    
T  47917708 cttaacttatttcttttatttaatttggtctcataaatcttagttttctcaaacacgtccct-aacttatttcttttattcaatttgatctaattttaat 47917610  T
Q  342 aattttaatcccctaaaaa-acagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  47917609 aattttaatcccctaaaaataaagattgttggattacggaggtttatcagattttatagtgtattaccaacaccgaatttat 47917528  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 303 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 37610798 - 37610678
Alignment:
Q  303 ttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtg 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37610798 ttaacttattttttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtg 37610699  T
Q  401 tatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  37610698 tatcaccaacacctaatttat 37610678  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 332
Target Start/End: Original strand, 23072063 - 23072171
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23072063 ttaattgatctgctggtcccttaattcatttcatttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaagacgt-ccttaacttatttcttttattc 23072161  T
Q  323 aatttagtcc 332  Q
    ||||| ||||    
T  23072162 aatttggtcc 23072171  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 298 - 421
Target Start/End: Original strand, 35758082 - 35758207
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcc-cctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagatttta 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  35758082 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatccaaaaaaaaaacaaaccgttggattacgaatgtctatcagatttta 35758181  T
Q  396 tagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
     ||||||||| |||||||||||||||    
T  35758182 cagtgtatcaccaacacctaatttat 35758207  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 222 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33113426 - 33113306
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttc-ttttat 320  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||         || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33113426 cttaattgatctaccgatcccttaatttatttcttttattcaatttg---------gttttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttctttttat 33113336  T
Q  321 tcaatttagtccaattttgataattttaat 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33113335 tcaatttggtccaattttgataattttaat 33113306  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 308 - 419
Target Start/End: Original strand, 10978093 - 10978206
Alignment:
Q  308 ttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga---cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatc 404  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10978093 ttatttcttttattcaacttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaa-agaaaccgttggattacgaaggtctataaaattttatagtgtatc 10978191  T
Q  405 atcaacacctaattt 419  Q
    | || ||||||||||    
T  10978192 accatcacctaattt 10978206  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 308
Target Start/End: Original strand, 34014504 - 34014596
Alignment:
Q  216 taaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  34014504 taaaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactgtcgcaaacacatcccttaact 34014596  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 320
Target Start/End: Original strand, 50879513 - 50879594
Alignment:
Q  239 tcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  50879513 tcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataaatcttaactttcttaaacacgtcccttaaattattttttttat 50879594  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 419
Target Start/End: Original strand, 50879782 - 50879888
Alignment:
Q  315 ttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga--cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacac 412  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |  ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  50879782 ttttattcaattttgtccaattttgataattttaatcccatagaaaaaaaaatcgttagattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacac 50879881  T
Q  413 ctaattt 419  Q
    |||||||    
T  50879882 ctaattt 50879888  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 55210945 - 55210823
Alignment:
Q  301 ccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaac-agac-gttgaattacgaaggtctattagattttatag 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| || ||||| ||||||||||     
T  55210945 ccttaacttatttcttttattaaatttggatcaattttgataattttaatccactaaaaaaagatactgttgaattacggagatctatcagattttataa 55210846  T
Q  399 tgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||||||| |||||| ||||||||    
T  55210845 tgtatcaccaacacataatttat 55210823  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34015884 - 34015798
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||| ||| ||||||    
T  34015884 cttaattgatttgtcggtcccttaagttatttcttttattcaatttggtcccataagtcataaatgtcgcaaacacatcctttaact 34015798  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24376549 - 24376458
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  || ||||||| ||||||||||    
T  24376549 aaaggcttaattgatctgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaacagtcacaaacacatcccttaact 24376458  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27750544 - 27750461
Alignment:
Q  225 aattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  27750544 aattgatctgccagtcctttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagttttaattttttcaaacacatcccttaact 27750461  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 53101889 - 53101827
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaa 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  53101889 cttaattgatctgccggtcccttaagttatttcttttattcaatttggtcctataattcttaa 53101827  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 313
Target Start/End: Original strand, 27749108 - 27749199
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttattt 313  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||    
T  27749108 cttaattgatctaccggttccttaacttatgtcttttattcaatttagtcacataagtcttaactttcttaaacgtatcccttaactcattt 27749199  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21729426 - 21729380
Alignment:
Q  233 tgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21729426 tgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttagtcccataagt 21729380  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37610841 - 37610797
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaattt 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37610841 ttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattt 37610797  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 419
Target Start/End: Original strand, 53764898 - 53764951
Alignment:
Q  366 cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  53764898 cgttgaattacggaggtctatcagattttatggtgtatcaccaacacttaattt 53764951  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 268
Target Start/End: Original strand, 35758060 - 35758112
Alignment:
Q  216 taaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttg 268  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35758060 taaaggcttaatcaatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttg 35758112  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21729421 - 21729387
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcc 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21729421 gtcccttaatttatttcttttattcaatttagtcc 21729387  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 332
Target Start/End: Original strand, 34014526 - 34014560
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34014526 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 34014560  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37610826 - 37610796
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaattta 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37610826 gtcccttaacttatttcttttattcaattta 37610796  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Original strand, 53101545 - 53101590
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttg 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  53101545 cttaattgatctgccggtcctttaattta-ttcttttattcaatttg 53101590  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 332
Target Start/End: Original strand, 50879513 - 50879546
Alignment:
Q  299 tcccttaacttatttcttttattcaatttagtcc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50879513 tcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 50879546  T

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Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Original strand, 52086629 - 52086826
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52086629 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 52086728  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacagacgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  52086729 caatttagtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaaaaccgttggattacgaaggtctataaaattttatagtgtatcaccatcacctaattt 52086826  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 216 - 421
Target Start/End: Original strand, 7110222 - 7110429
Alignment:
Q  216 taaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 315  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7110222 taaaggcttaattgatctgccggtcccttaatttatttcttttatttaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactgatttct 7110321  T
Q  316 tttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacc 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  7110322 tttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagatcgttggattgcggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacgcc 7110421  T
Q  414 taatttat 421  Q
    ||||||||    
T  7110422 taatttat 7110429  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 51693149 - 51693350
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51693149 cttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttatt 51693248  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51693249 caatttggttcaattttgataattttaataccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcggattttatagtgtatcaccaacacctaattt 51693348  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  51693349 at 51693350  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Original strand, 5488503 - 5488702
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5488503 cttaattgatctgttggtcccttaatttatttcttttattcaatttgattccataagacttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttcttttatt 5488602  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5488603 caatttgatccaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacgtaattt 5488702  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7111577 - 7111390
Alignment:
Q  236 cggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaat 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  7111577 cggttccttaatttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtccattaactgatttcttttattcaatttggtccaat 7111478  T
Q  336 tttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7111477 tttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 7111390  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 51468341 - 51468542
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51468341 cttaattgatctgccggtcccttaacttattttttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 51468440  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaca-gac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51468441 caatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaaaagattgatggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacccaattt 51468540  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  51468541 at 51468542  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 50485108 - 50484913
Alignment:
Q  226 attgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaat 325  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50485108 attgatctgccggtcccttaacttatttcatttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaat 50485009  T
Q  326 ttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaac-agacg-ttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50485008 ttggtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaagagaccattggattacataggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaattt 50484913  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 5488983 - 5488782
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5488983 cttaattgatccgccgatcccttaacttatttcttttattcaatttagtcccataagtcttaactttctcaaacacgttcattaacttatttcttttatt 5488884  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5488883 caatttggtccaattttgataattttaatcccttagaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcaccaacacctaattt 5488784  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  5488783 at 5488782  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 45229718 - 45229518
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45229718 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaattttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 45229619  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||  |||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  45229618 aatttgatccaattttgataattttaatcctataaaaaaaaagattgttggattacggaggtctatcagattttataatggatcaccaacacctaattta 45229519  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  45229518 t 45229518  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 217 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 51469022 - 51468816
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51469022 aaaggcttaattgatctgtcagtcccttaacttattttttttattcaatttggtcccataaatcttaactttttcaaacacgtccctaaacttatttctt 51468923  T
Q  317 ttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga--cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacct 414  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | ||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51468922 ctattcaatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaaaaaagcattggattacggagatctattagattttacagtgtatcaccaacacct 51468823  T
Q  415 aatttat 421  Q
    |||||||    
T  51468822 aatttat 51468816  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 38235251 - 38235065
Alignment:
Q  236 cggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaat 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38235251 cggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattaaatttggtccaat 38235152  T
Q  336 tttgataattttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||| |||| |||||||||  |||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38235151 tttaataagtttaatcccaaaaaaaacaaaccgttggattacgaatgtctataagattttacagtgtatcaccaacacctaatttat 38235065  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 17244177 - 17244378
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17244177 cttaattaacctgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtctcaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttgatt 17244276  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  17244277 caatttggtccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttataatgtatcaccgatacctaattt 17244376  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  17244377 at 17244378  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 416
Target Start/End: Original strand, 18819264 - 18819460
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18819264 cttaattgatctgccggttccttaaattattttttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaatcacgtcccttaatttatttcttttatt 18819363  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta--aaaaacagacgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaa 416  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18819364 caatttggcccaattttaataattttaatcccctatgaaaagaaaccgttggattacggaggtatatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 18819460  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 52759365 - 52759566
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  52759365 cttaattgatctgccgatcccttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaactttctcaaaaacgtccattaacttatctattttatt 52759464  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa-caga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52759465 caatttagtccaattttgataattttaatctcttaaaaaatgagaccgttgaattacagaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 52759564  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  52759565 at 52759566  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 222 - 416
Target Start/End: Original strand, 40187605 - 40187800
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  40187605 cttaattgatctgacggtcctttcacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttatcaaacatgt-ccttaacttatttcttttact 40187703  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaa 416  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  40187704 caatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatcgtgtatcaccaacacctaa 40187800  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 230 - 421
Target Start/End: Original strand, 1821918 - 1822112
Alignment:
Q  230 atctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactta-tttcttttattcaattta 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  1821918 atctgtcggttccttaatttattttttttattcaattttgtcctataaattttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttttttttatttaattta 1822017  T
Q  329 gtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1822018 gtctaattttgataattttaatcctttaaaaaaagagaccgttgggttacgaaggtctatctgattttatagtgtatcattaacacctaatttat 1822112  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 216 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1823414 - 1823215
Alignment:
Q  216 taaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 315  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  1823414 taaaggcttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcacataagtcttaa---tctcaaacatgtcgcttaacttattt-t 1823319  T
Q  316 tttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaa-acaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacc 413  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1823318 tttattcaatttgatccaattttgataattttaatcttctaaaaagataaaccgttggattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacc 1823219  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 224 - 412
Target Start/End: Original strand, 47532961 - 47533150
Alignment:
Q  224 taattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattca 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  47532961 taattgatctgccggtcccttaagttattttttttattcaatttggtctcataaatcttaactttatcaaacacgttccttaaattatttcatttattca 47533060  T
Q  324 atttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacac 412  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  47533061 atttgattcaattttgataattttaatcttctaaaaaacagactgttgaattatggaagtctatcagattttataatgtatcaccaacac 47533150  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 52087875 - 52087689
Alignment:
Q  237 ggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaatt 336  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  52087875 ggtctcttaacttatttcttttattcaatttggtctcatatgtcttaactttctcaaacacgtcctttcacttatttcttttattcaatttgattcaatt 52087776  T
Q  337 ttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  52087775 ttgataattttagtcccctaaaaaaagagaccgttgaattacggaggtctatcaaattttacggtgtatcaccaacatctaatttat 52087689  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 217 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17245785 - 17245642
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17245785 aaaggcttaattgatccgccggttccttaatttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactctctcaaacaagtcccttaacttattt-tt 17245687  T
Q  317 ttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa 361  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17245686 ttattaaatttggtccaattttgatcattttaatcctctaaaaaa 17245642  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 47533973 - 47533769
Alignment:
Q  219 agtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctttt 318  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||     
T  47533973 agtcttaattgatctgctggtctcttaaattatttcttttatttaatttagtcccataagttttaactttttcaaatacgtctcttaaattatttcattc 47533874  T
Q  319 attcaatttagtccaattttgataattttaatcc-cctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaa 416  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |||||| || |||||| ||| |||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47533873 attcaatttgattcaattttgataattataatcctccaaaaaaatagaccgttaaattagagagatctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaa 47533774  T
Q  417 tttat 421  Q
    |||||    
T  47533773 tttat 47533769  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 50483513 - 50483713
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  50483513 cttaattgatctgtcggtct-ttaacttatttcttgtattcaatttggtctcataagtcttaattttcttaaaaacgtcatttaatttatttcttttatt 50483611  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacagac---gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatt 418  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||    |||| |||||| | |||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  50483612 caatttggtccaatttttataattttactcccctaaaaaaaagagactgttggattacggaagtctac-agattttatcgtgtataaccaacacctaatt 50483710  T
Q  419 tat 421  Q
    |||    
T  50483711 tat 50483713  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 228 - 405
Target Start/End: Original strand, 45228283 - 45228462
Alignment:
Q  228 tgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaattt 327  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  45228283 tgatctgccggttctttaacttatttcttttatttaattttgtcccataaattttaaccttatcaaacacgttctttaacttatttcttttattcaattt 45228382  T
Q  328 agtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatca 405  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  45228383 ggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggagatctatcaaattttatagtgtatca 45228462  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 301 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 52761633 - 52761511
Alignment:
Q  301 ccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatag 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  52761633 ccttaacttatttcttttattcaatttggtccaattttgataattttaatcccctgaaaaaagagaccgttggattgcggaggtctatcagattttatag 52761534  T
Q  399 tgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  52761533 tgtatcaccaacacctaatttat 52761511  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 222 - 315
Target Start/End: Original strand, 25181503 - 25181596
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25181503 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcctataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 25181596  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 421
Target Start/End: Original strand, 21203124 - 21203214
Alignment:
Q  333 aattttgataattttaatcccctaaaaaac-agac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21203124 aattttcataattctaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacaaaggtctatcagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 21203214  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18820877 - 18820806
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaacttt 288  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18820877 aaaggcttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataaatcttaacttt 18820806  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 332
Target Start/End: Original strand, 25181519 - 25181553
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25181519 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 25181553  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 52761652 - 52761606
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttg 268  Q
    |||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52761652 cttaattgatatgccggttccttaacttatttcttttattcaatttg 52761606  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18820856 - 18820827
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaattt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18820856 gtcccttaacttatttcttttattcaattt 18820827  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 529 - 569
Target Start/End: Original strand, 45228698 - 45228737
Alignment:
Q  529 catcaaattatgctttttaaaaccctaatcttcatgtcttc 569  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45228698 catcaaattatgctttt-aaaaccccaatcttcatgtcttc 45228737  T

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Target: scaffold0141 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 35401 - 35202
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  35401 cttaattgatctggcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttcttttact 35302  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35301 caatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaattt 35202  T

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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Original strand, 31035 - 31234
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  31035 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttcttttact 31134  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31135 caatttggtccagtttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 31234  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Original strand, 79411 - 79610
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  79411 cttaattgatctggcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttcttttact 79510  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  79511 caatttggtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaattt 79610  T

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Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 83777 - 83578
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  83777 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacgtccctcaacttatttcttttact 83678  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaa-aaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  83677 caatttggtccagtttttataattttaatcccctaaaaaaacagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 83578  T

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Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 16602727 - 16602928
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16602727 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 16602826  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccc-ctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||| |||||| | |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16602827 taaattggtccaattttgataattttaatccctaaaaaaaaaagaccgttggattacggatgtctatcagattttacagtgtatcaccaacacctaattt 16602926  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  16602927 at 16602928  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27892452 - 27892251
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27892452 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcagacacgtcccttaacttatttcttttatt 27892353  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatc-ccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27892352 caatttgatccaattttgataattttaatcaaaaaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 27892253  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  27892252 at 27892251  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 38244071 - 38243870
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38244071 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcattttggtcccataagtcttaactttttcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 38243972  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||| |||||    
T  38243971 caatttggtccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagatactgttggattacaaaggtgtataagattttacagtgtattaccaacaccaaattt 38243872  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  38243871 at 38243870  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 416
Target Start/End: Original strand, 23832970 - 23833165
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  23832970 cttaattgatttgtcggtcccttaacttatttattttattccatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgt-ccttaacttttttattttatt 23833068  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa-caga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23833069 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaagaagaccgttggattacggaggtctagaagattttatagtgtatcatcaacacctaa 23833165  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 27891108 - 27891309
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27891108 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataggtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 27891207  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaat-cccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||      |||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  27891208 cattttggttcaattttgataattttaataaaaaaaaaaaacagaccgttagattacgaatgtctatcagattttccagtgtatcaccaacacctaattt 27891307  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  27891308 at 27891309  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 217 - 395
Target Start/End: Original strand, 26388215 - 26388395
Alignment:
Q  217 aaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26388215 aaagtcttaattgatctgtcggtctcttaacttattttttttattcaatttgatctcataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaacttatttctt 26388314  T
Q  317 ttattcaatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagatttta 395  Q
    ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  26388315 ttatttaatttgattcaattttgataattttaatcccatataaaaaaagaccgtttgattacggaggtctatcagatttta 26388395  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 222 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23833986 - 23833898
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactta 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23833986 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaactta 23833898  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 222 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16604305 - 16604195
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16604305 cttaattgatctaccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaagtttctcaagcacgtccctgaacttatttcttttatt 16604206  T
Q  322 caatttagtcc 332  Q
    |||||| ||||    
T  16604205 caatttggtcc 16604195  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 222 - 327
Target Start/End: Original strand, 43814523 - 43814628
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  43814523 cttaattgatttgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttcgtctcataagtcttaactttctcaaatacgtcctttaacttatttcttttatt 43814622  T
Q  322 caattt 327  Q
    ||||||    
T  43814623 caattt 43814628  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 421
Target Start/End: Original strand, 38242944 - 38243083
Alignment:
Q  281 ttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacga 378  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||| |    
T  38242944 ttaactttttcaaacatgtctcttaacttatttcttttatttaatttgatccaattttgataattttaatctcctaaaaaaagagaccgttggattacaa 38243043  T
Q  379 aggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||   ||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  38243044 ag---tataagattttataatgtatcaccaacaccaaatttat 38243083  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Original strand, 5033480 - 5033566
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  5033480 cttaatagatctgtcagtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcctataacttttaactttctcaaatacatcccttaact 5033566  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19577442 - 19577359
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtccctta 305  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||| || |||||||    
T  19577442 cttaattgatctcccggtcccttaacttatttcttttagtcaatttggtcccataactcttaactttaacaaagacatccctta 19577359  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5034932 - 5034846
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||||| | | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5034932 cttaattgatttgccggtcctttaacttatttcttttatttaatttggttctataacttttaactttctcaaacacatcccttaact 5034846  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Original strand, 15496083 - 15496133
Alignment:
Q  258 tattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15496083 tattcaatttggtcccataagtcttaactttcacaaacacgtcccttaact 15496133  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43814696 - 43814636
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtctta 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  43814696 ttaattgatctgtcggtcccctaacatatttcttttattcaatttggtctcataagactta 43814636  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 283
Target Start/End: Original strand, 43814599 - 43814644
Alignment:
Q  238 gtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtctta 283  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43814599 gtcctttaacttatttcttttattcaatttgatcacataagtctta 43814644  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 27948903 - 27948846
Alignment:
Q  523 catcttcatcaaattat----gctttttaaaaccctaatcttcatgtcttcttctctc 576  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27948903 catcttcatcaaattatatatgctttttaaaaccccaatctttatgtcttcttctctc 27948846  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23833970 - 23833941
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaattt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23833970 gtcccttaacttatttcttttattcaattt 23833941  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 331 - 363
Target Start/End: Original strand, 44800983 - 44801015
Alignment:
Q  331 ccaattttgataattttaatcccctaaaaaaca 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44800983 ccaattttgataatttcaatcccctaaaaaaca 44801015  T

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Target: scaffold0878 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3143 - 2941
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3143 cttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcagacacgtcccttaacttatttcttttatt 3044  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcc--cctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatt 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3043 caatttggtccaattttgataattttaatccaaaaaaaaaaacagaccgttagattacgaaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 2944  T
Q  419 tat 421  Q
    |||    
T  2943 tat 2941  T

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Target: scaffold0878; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 421
Target Start/End: Original strand, 1847 - 1971
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaa-acaga-cgttgaattacgaaggtctattagatttta 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||| | ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||     
T  1847 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtccaatttt-ataattttaatccaaaaaaaatatagaccgttagattacgaatgtctattagattttc 1945  T
Q  396 tagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
     ||||||||| |||||||||||||||    
T  1946 cagtgtatcaccaacacctaatttat 1971  T

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Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 30644819 - 30644620
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30644819 ttaattgatctgtcggttccttaatttatttcttttatttaatttggtcccataaatcttaactttctcaaacacgtctcttaacttatttcttttattc 30644720  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  30644719 aatttgatccaattttgataattttaatcctctaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttataatggatcaccaacacctaatttat 30644620  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 9244067 - 9244268
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9244067 cttaattgatctgctggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttattttatt 9244166  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaa-caga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9244167 caatttggttcaattttgataattttaatcccttaaaaaatgagaccgtaggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaattt 9244266  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  9244267 at 9244268  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 216 - 421
Target Start/End: Original strand, 34642661 - 34642867
Alignment:
Q  216 taaagtcttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 315  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34642661 taaagacttaattgatctgccggtctcttaacttatttcttttattcaatttggtcatataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttct 34642760  T
Q  316 tttattcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacct 414  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  34642761 tttattcaatttggtttaattttgataattttaatcccctaaaaaaaaaaccgttggattgcggaggtctatcagattttatagtatatcaccaacatct 34642860  T
Q  415 aatttat 421  Q
    |||||||    
T  34642861 aatttat 34642867  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 522213 - 522012
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  522213 cttaattaatctgtcggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacatgtcccttaacttatttattttatt 522114  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  522113 caatttgatctaattttgataattttaatcccctagaaaaagagactgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcaccaacccctaattt 522014  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  522013 at 522012  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 26364743 - 26364944
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26364743 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtctcataagtcttaactttctcaaacacatcctttaacttatttcttttatt 26364842  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26364843 caatttgatccaattttgataattttaatcctctaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttataatgtatcaccaacacctaattt 26364942  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  26364943 at 26364944  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9245548 - 9245346
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtccctt-aatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttat 320  Q
    ||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9245548 cttaaatgatctgccggtccttttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttattttat 9245449  T
Q  321 tcaatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaac-agac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9245448 tcaatttagtccaatttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattgctgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatt 9245349  T
Q  419 tat 421  Q
    |||    
T  9245348 tat 9245346  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41638268 - 41638070
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  41638268 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttattctcataagtcttaactttctcaaacatgtcctttaacttatttcttttatt 41638169  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||  |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41638168 caatttggtccaattttaataattttaatcccctaaaaaagagacaattggattacagaggtctatcatgttttatagtgtatcaccaacacctaattt 41638070  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 405
Target Start/End: Original strand, 43584410 - 43584595
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43584410 cttaattgatctgtcggtccattaacttatttcttttattcaatttgatctcataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 43584509  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatca 405  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||   | |||||| ||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||    
T  43584510 caatttgatccaattttgataattttaatcttttaaaaaaagagaccgttggattacaaaagtctatcagattttataatgtatca 43584595  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 20308925 - 20309126
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  20308925 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattgagtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttattgtttttatt 20309024  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20309025 caatttggtccaattttgataattttgatcccctagaaaaagagaccgttggatcactgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaatacctaattt 20309124  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  20309125 at 20309126  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 21095558 - 21095759
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  21095558 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaattgagtcccataagttttaactttctcaaacacgtcccttaatttattgtttttatt 21095657  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatccccta-aaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21095658 caatttggtccaattttgataattttgatcccctagaaaaagagaccgttggatcactgaggtctatcagattttatagtgtatcaccaatacctaattt 21095757  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  21095758 at 21095759  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 41636833 - 41637034
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| || |||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41636833 cttaattgatttgccggtccttttacttatttctttcattcaatttggtcccataagtcttaactttctaaaacacgtcccttaatttatttcttttatt 41636932  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41636933 caatttggtccaacttttataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaagtctatcagattttatcgtgtatcaccaacacctaattt 41637032  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  41637033 at 41637034  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Original strand, 30640801 - 30641000
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30640801 ttaattgatatgccggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaaccttatcaaacacgtca-ttaacttatttcttttattc 30640899  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30640900 aatttgatccaattttaataattttaatcccctaaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcaaattttatagtgtatcaccaacacctaattta 30640999  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 43586059 - 43585860
Alignment:
Q  223 ttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||    
T  43586059 ttaattgatctgtcggtcccttaacttatttcttttatttaatttgatctcataagtcttaattttctcaaacatgtctattaaattatttcatttattc 43585960  T
Q  323 aatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| | ||| |||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43585959 aatttgatccaattttaataattttaatcctttaaaaaaaagaccattggattatgaaggtctaccatattttatagtgtatcatcaatacctaatttat 43585860  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 238 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20310152 - 20309966
Alignment:
Q  238 gtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattt 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  20310152 gtcccttaacttatttcttttattcattttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcgatttggttcaattt 20310053  T
Q  338 tgataattttaatcccct--aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  20310052 tgataattttaatcccttagaaaaaaaagaccgttggattatgaaggtctgtcagattttatagtgtatcacctacacctaacttat 20309966  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 238 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21096785 - 21096599
Alignment:
Q  238 gtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcaatttagtccaattt 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  21096785 gtcccttaacttatttcttttattcattttggtctcataagtcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttattcgatttggttcaattt 21096686  T
Q  338 tgataattttaatcccct--aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  21096685 tgataattttaatcccttagaaaaaaaagaccgttggattatgaaggtctgtcagattttatagtgtatcacctacacctaacttat 21096599  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 34644075 - 34643880
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  34644075 cttaattgatccgtcggtcccttgacttatttcttttattcaatttg-tcccataaatcttaactttctcaaacacctctattaatttatttcttttatt 34643977  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattta 420  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  34643976 taatttagttcaattttgataattttaatcccctaaaaaa-agaccgttggatt---gaggtctatcagattttatggcgtatcaccaacacctaattta 34643881  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26366310 - 26366109
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  26366310 cttaattgatctgccgatcctttaacttatttcttttatttaatttggtttcataagtcttaaccttatcaaacatgttccataacttatttcttttatt 26366211  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaaaaca-gac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26366210 caatttggtccatttttaataattttaatcccctaaaaaaaaagaccgttagattacggaggtctattagattttatagtgtatcaccaacacataattt 26366111  T
Q  420 at 421  Q
    ||    
T  26366110 at 26366109  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 222 - 322
Target Start/End: Original strand, 31202968 - 31203068
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31202968 cttaattaatctgtcgtttccttaacttatttcttttattcattttggtcccataaatcttaagtttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 31203067  T
Q  322 c 322  Q
    |    
T  31203068 c 31203068  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3714636 - 3714550
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3714636 cttaattgatctgccggttccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaactttctcaaacacatcccttaact 3714550  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43134165 - 43134079
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43134165 cttaattgatatgtcggtcctttaacttatttcttttattcaatttggtcctataacttttaactttcttaaacacatcccttaact 43134079  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Original strand, 3713065 - 3713149
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaact 308  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3713065 cttaattgatctgtcggtctcttaatt-atttcttttatttaatttggttc-ataagttttaactttctcaaacacatcccttaact 3713149  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 529 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 26365890 - 26365844
Alignment:
Q  529 catcaaattatgctttttaaaaccctaatcttcatgtcttcttctctc 576  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26365890 catcaaattatgctttt-aaaaccccaatcttcatgtcttcttctctc 26365844  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 288
Target Start/End: Original strand, 22012159 - 22012225
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaacttt 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  22012159 cttaattgaactgtcggtcccttaacttatttctttatttcagtttggtctcataactcttaacttt 22012225  T

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Target: scaffold1425 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold1425
Description:

Target: scaffold1425; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Original strand, 136 - 335
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  136 cttaattgatctgccagtcccttaacttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaatttatttcctttatt 235  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  236 caatttggtcaaattttgataattttaattccttaaaaaaagagaccgttggattacagaggtctatcagattttacagcgtatcaccaacacctaattt 335  T

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Target: scaffold1425; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 222 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1717 - 1518
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  1717 cttaattgatctgccggtcccttaacttatttcttttattcaatttggttccataagtcttaactttctcaaacacgtcctttaatttatttcctttatt 1618  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccct-aaaaaacaga-cgttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaattt 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||   |||||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  1617 caatttggtccaattttgataattttaatcccttaaaaaaacagaccgttggattatagaggtctatcagattttacggtgtataaccaacacctaattt 1518  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25461 - 25259
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25461 cttaattgatctgccgctcccttaacttatttcttttattcaatttggtcacataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaatttatttcttttatt 25362  T
Q  322 caatttagtccaattttgataattttaatcccctaaaa-aaca-gac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatt 418  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| || | ||| |||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25361 aaatttggtccaattttgataattttaatcatttaaaacaagaggacagttggattacggaggtttatcacattttatagtgtattatcaacacctaatt 25262  T
Q  419 tat 421  Q
    |||    
T  25261 tat 25259  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 222 - 326
Target Start/End: Original strand, 104303 - 104407
Alignment:
Q  222 cttaattgatctgtcggtcccttaatttatttcttttattcaatttgatcccataagtcttaactttctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 321  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104303 cttaattgatttgacggtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcccataagttttaacattctcaaacacgtcccttaacttatttcttttatt 104402  T
Q  322 caatt 326  Q
    |||||    
T  104403 caatt 104407  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 421
Target Start/End: Original strand, 104404 - 104454
Alignment:
Q  371 aattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  104404 aattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacatctaatttat 104454  T

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Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 332
Target Start/End: Original strand, 104319 - 104353
Alignment:
Q  298 gtcccttaacttatttcttttattcaatttagtcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  104319 gtcccttaacttatttcttttattcaatttggtcc 104353  T

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Target: scaffold0349 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 421
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9360
Alignment:
Q  330 tccaattttgataattttaatcccctaaaaaacagac-gttgaattacgaaggtctattagattttatagtgtatcatcaacacctaatttat 421  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9268 tccaattttgatgattttaatcccctaaaaaagagaccgttggattacggaggtctatcagattttatagtgtatcaccaacacctaatttat 9360  T

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