View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4110_high_1 (Length: 373)

Name: NF4110_high_1
Description: NF4110
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4110_high_1
NF4110_high_1
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (23-373)||(27284234-27284586)
chr6 (23-373)||(27491107-27491459)
chr6 (28-373)||(26110283-26110629)
chr6 (23-373)||(13518066-13518418)
chr6 (28-373)||(27355983-27356330)
chr6 (51-373)||(16755822-16756147)
chr6 (28-373)||(4539630-4539978)
chr6 (28-369)||(26772505-26772847)
chr6 (28-373)||(34458380-34458725)
chr6 (28-373)||(16680118-16680466)
chr6 (29-369)||(27623583-27623927)
chr6 (28-373)||(28213433-28213781)
chr6 (28-373)||(28166473-28166821)
chr6 (52-365)||(13292831-13293140)
chr6 (23-373)||(29555532-29555884)
chr6 (23-369)||(8899575-8899923)
chr6 (80-373)||(27063513-27063807)
chr6 (28-373)||(27200165-27200513)
chr6 (28-373)||(27248720-27249068)
chr6 (35-369)||(29579001-29579336)
chr6 (51-369)||(4778882-4779203)
chr6 (80-373)||(29507447-29507744)
chr6 (80-373)||(4763794-4764089)
chr6 (35-369)||(30551876-30552212)
chr6 (80-369)||(4531319-4531609)
chr6 (28-373)||(33370303-33370650)
chr6 (51-369)||(26791818-26792138)
chr6 (80-373)||(16937897-16938191)
chr6 (80-373)||(27013764-27014052)
chr6 (80-373)||(14139272-14139561)
chr6 (51-369)||(22928757-22929079)
chr6 (51-353)||(26926770-26927073)
chr6 (130-369)||(26666534-26666774)
chr6 (28-369)||(27031002-27031342)
chr6 (85-369)||(24869746-24870026)
chr6 (51-373)||(27208906-27209226)
chr6 (51-373)||(27240002-27240322)
chr6 (28-366)||(27025124-27025460)
chr6 (85-369)||(15406409-15406691)
chr6 (85-369)||(15418196-15418478)
chr6 (28-369)||(24299636-24299974)
chr6 (31-369)||(20174530-20174881)
chr6 (31-369)||(22161110-22161461)
chr6 (51-125)||(23851450-23851524)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (52-373)||(11555367-11555689)
chr5 (23-373)||(33881110-33881462)
chr5 (49-373)||(3795548-3795875)
chr5 (28-373)||(18369357-18369704)
chr5 (28-369)||(24729959-24730302)
chr5 (80-373)||(13318653-13318947)
chr5 (28-369)||(31820239-31820580)
chr5 (51-373)||(30174477-30174802)
chr5 (51-373)||(40467378-40467702)
chr5 (80-369)||(6880345-6880636)
chr5 (52-369)||(23631982-23632303)
chr5 (51-373)||(15752683-15753001)
chr5 (51-373)||(28655254-28655579)
chr5 (45-370)||(30158040-30158367)
chr5 (80-369)||(37665315-37665606)
chr5 (80-373)||(9323519-9323812)
chr5 (80-373)||(12138218-12138511)
chr5 (51-373)||(13436499-13436829)
chr5 (51-373)||(30035438-30035761)
chr5 (80-373)||(37746153-37746448)
chr5 (51-373)||(9544532-9544857)
chr5 (85-373)||(5643846-5644134)
chr5 (23-369)||(22894400-22894747)
chr5 (35-369)||(33522378-33522715)
chr5 (28-373)||(37352469-37352816)
chr5 (80-373)||(2517106-2517402)
chr5 (28-369)||(41680693-41681037)
chr5 (51-373)||(18494593-18494916)
chr5 (23-369)||(33298517-33298869)
chr5 (51-373)||(34622530-34622855)
chr5 (80-369)||(18122245-18122536)
chr5 (28-373)||(11329626-11329975)
chr5 (51-373)||(13180618-13180938)
chr5 (28-373)||(32590101-32590447)
chr5 (80-373)||(31437505-31437793)
chr5 (80-373)||(37761023-37761319)
chr5 (51-373)||(43084270-43084594)
chr5 (85-373)||(8659297-8659587)
chr5 (80-373)||(26486438-26486721)
chr5 (51-369)||(22992953-22993265)
chr5 (28-369)||(28953609-28953952)
chr5 (85-369)||(15652589-15652873)
chr5 (85-369)||(25206323-25206616)
chr5 (85-369)||(25270479-25270772)
chr5 (51-369)||(23897886-23898200)
chr5 (51-369)||(33783499-33783814)
chr5 (23-369)||(24975833-24976175)
chr5 (85-366)||(24608291-24608570)
chr5 (28-369)||(30940625-30940962)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (51-373)||(9567-9890)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (52-373)||(12661543-12661865)
chr2 (80-373)||(39896101-39896395)
chr2 (51-373)||(37383680-37384004)
chr2 (51-373)||(254567-254891)
chr2 (28-373)||(34867663-34868009)
chr2 (28-369)||(12710520-12710863)
chr2 (51-373)||(9343902-9344226)
chr2 (80-373)||(22922058-22922355)
chr2 (51-373)||(39045737-39046061)
chr2 (51-370)||(31882290-31882610)
chr2 (51-365)||(37945788-37946105)
chr2 (51-373)||(32055805-32056128)
chr2 (51-373)||(27809704-27810030)
chr2 (80-373)||(34160876-34161173)
chr2 (51-373)||(13930459-13930785)
chr2 (80-373)||(19410399-19410696)
chr2 (80-373)||(27122557-27122850)
chr2 (35-369)||(16823256-16823592)
chr2 (35-369)||(16897888-16898224)
chr2 (51-365)||(16167481-16167797)
chr2 (80-373)||(34297188-34297476)
chr2 (51-373)||(37931375-37931706)
chr2 (28-369)||(40239489-40239831)
chr2 (80-373)||(3788526-3788820)
chr2 (51-373)||(12592813-12593141)
chr2 (23-369)||(11629104-11629451)
chr2 (28-369)||(27782212-27782555)
chr2 (23-373)||(37679806-37680160)
chr2 (23-373)||(37695071-37695425)
chr2 (23-373)||(21671085-21671440)
chr2 (98-372)||(31868702-31868977)
chr2 (51-369)||(21697092-21697415)
chr2 (51-369)||(27396326-27396656)
chr2 (23-365)||(19450341-19450694)
chr2 (28-369)||(23122497-23122835)
chr2 (85-369)||(34268845-34269126)
chr2 (85-369)||(28888316-28888597)
chr2 (85-369)||(27428372-27428651)
chr2 (85-369)||(20843949-20844235)
chr2 (244-373)||(23116993-23117123)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (28-369)||(33248348-33248690)
chr8 (51-373)||(18796711-18797036)
chr8 (28-373)||(12086610-12086958)
chr8 (23-373)||(31483757-31484111)
chr8 (80-373)||(19680483-19680776)
chr8 (23-373)||(29835300-29835651)
chr8 (80-373)||(9360656-9360950)
chr8 (80-373)||(28355837-28356134)
chr8 (80-373)||(33264765-33265059)
chr8 (80-373)||(15773608-15773903)
chr8 (28-373)||(44566962-44567312)
chr8 (51-373)||(31360533-31360857)
chr8 (85-373)||(18715519-18715811)
chr8 (52-373)||(21342057-21342381)
chr8 (80-373)||(19202262-19202545)
chr8 (80-369)||(19911053-19911346)
chr8 (51-369)||(22074820-22075141)
chr8 (28-303)||(16260205-16260480)
chr8 (23-369)||(27602805-27603146)
chr8 (28-369)||(2131159-2131496)
chr8 (51-369)||(19655238-19655555)
chr8 (85-369)||(22138945-22139225)
chr8 (28-369)||(19694077-19694416)
chr8 (85-369)||(14569195-14569479)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (28-373)||(4790601-4790949)
chr3 (28-373)||(29658936-29659283)
chr3 (51-369)||(22381553-22381872)
chr3 (51-373)||(5727946-5728271)
chr3 (51-373)||(47029421-47029746)
chr3 (28-373)||(32296574-32296922)
chr3 (28-373)||(18248683-18249030)
chr3 (80-373)||(31958423-31958720)
chr3 (51-373)||(5717036-5717361)
chr3 (51-373)||(5764097-5764422)
chr3 (51-373)||(48471895-48472223)
chr3 (80-373)||(5603281-5603578)
chr3 (80-373)||(22864816-22865109)
chr3 (80-373)||(22879875-22880168)
chr3 (80-373)||(24334170-24334467)
chr3 (51-373)||(10402117-10402440)
chr3 (80-373)||(5590329-5590624)
chr3 (28-373)||(28027236-28027581)
chr3 (80-373)||(5472985-5473279)
chr3 (51-373)||(4422886-4423210)
chr3 (85-373)||(17970834-17971122)
chr3 (51-373)||(5019681-5020004)
chr3 (80-369)||(28345168-28345458)
chr3 (80-373)||(28109919-28110218)
chr3 (35-373)||(4340644-4340984)
chr3 (23-369)||(4629725-4630072)
chr3 (51-373)||(10649039-10649363)
chr3 (80-369)||(18286327-18286617)
chr3 (80-369)||(18301628-18301918)
chr3 (85-373)||(20072035-20072327)
chr3 (28-369)||(21680646-21680988)
chr3 (23-369)||(29142726-29143077)
chr3 (80-373)||(6536711-6537006)
chr3 (51-373)||(7079190-7079519)
chr3 (35-369)||(17978922-17979259)
chr3 (51-373)||(8217600-8217926)
chr3 (85-373)||(11104329-11104620)
chr3 (80-369)||(31030217-31030501)
chr3 (23-369)||(16618461-16618813)
chr3 (28-369)||(18336573-18336910)
chr3 (51-373)||(51787990-51788314)
chr3 (51-369)||(18231161-18231481)
chr3 (28-366)||(20570821-20571161)
chr3 (51-369)||(16422151-16422471)
chr3 (80-369)||(32445151-32445433)
chr3 (51-369)||(19700454-19700786)
chr3 (80-369)||(4727630-4727915)
chr3 (28-369)||(18057205-18057551)
chr3 (52-369)||(6207869-6208184)
chr3 (51-369)||(15735072-15735387)
chr3 (52-369)||(35886733-35887048)
chr3 (28-369)||(4689596-4689933)
chr3 (85-369)||(5658136-5658419)
chr3 (85-369)||(8283430-8283727)
chr3 (183-369)||(15886713-15886895)
chr3 (51-154)||(15886894-15886999)
chr3 (51-130)||(8002528-8002607)
chr3 (111-194)||(27561018-27561101)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (23-373)||(3647125-3647477)
chr1 (28-373)||(28591067-28591413)
chr1 (28-373)||(10951075-10951423)
chr1 (80-373)||(10968701-10968997)
chr1 (28-373)||(41787234-41787583)
chr1 (80-373)||(51644256-51644553)
chr1 (85-373)||(28155767-28156059)
chr1 (51-369)||(20334344-20334666)
chr1 (51-369)||(16201956-16202284)
chr1 (23-369)||(20466756-20467112)
chr1 (23-369)||(21891691-21892025)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (52-373)||(5164387-5164710)
chr7 (28-373)||(26518772-26519117)
chr7 (51-373)||(5154086-5154409)
chr7 (80-373)||(24586346-24586640)
chr7 (28-369)||(11446867-11447210)
chr7 (80-373)||(4139056-4139353)
chr7 (53-373)||(45393223-45393545)
chr7 (85-369)||(26509510-26509798)
chr7 (80-373)||(4205421-4205715)
chr7 (80-373)||(26313660-26313953)
chr7 (34-372)||(26441238-26441579)
chr7 (23-373)||(31084433-31084786)
chr7 (52-373)||(11418590-11418913)
chr7 (23-369)||(5141149-5141498)
chr7 (85-373)||(45737337-45737629)
chr7 (28-369)||(3451297-3451641)
chr7 (80-373)||(26268896-26269195)
chr7 (51-373)||(26663723-26664048)
chr7 (51-373)||(26678915-26679240)
chr7 (51-373)||(31558205-31558529)
chr7 (51-373)||(39206950-39207274)
chr7 (23-369)||(2160544-2160894)
chr7 (80-373)||(16745331-16745627)
chr7 (80-373)||(2779283-2779572)
chr7 (80-373)||(31129936-31130225)
chr7 (23-369)||(16047289-16047634)
chr7 (51-369)||(16443818-16444139)
chr7 (23-365)||(10847557-10847905)
chr7 (131-373)||(26595750-26595996)
chr7 (28-369)||(10910741-10911078)
chr7 (51-369)||(16512255-16512569)
chr7 (51-130)||(26531926-26532005)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (23-373)||(14104531-14104882)
chr4 (28-373)||(39856630-39856975)
chr4 (28-373)||(30759757-30760102)
chr4 (28-373)||(33667728-33668073)
chr4 (80-369)||(34182893-34183182)
chr4 (51-373)||(20332347-20332672)
chr4 (51-373)||(40099561-40099886)
chr4 (28-373)||(27157237-27157586)
chr4 (51-373)||(54839407-54839730)
chr4 (80-373)||(5700585-5700880)
chr4 (80-369)||(36338455-36338738)
chr4 (28-373)||(18794542-18794889)
chr4 (28-373)||(24586286-24586634)
chr4 (80-369)||(14753423-14753713)
chr4 (35-369)||(21975704-21976040)
chr4 (80-369)||(24118708-24118998)
chr4 (85-369)||(31120439-31120726)
chr4 (28-373)||(5011870-5012218)
chr4 (80-369)||(6575907-6576190)
chr4 (51-369)||(1906268-1906593)
chr4 (125-369)||(36324246-36324484)
chr4 (23-365)||(15276562-15276909)
chr4 (52-369)||(1673877-1674199)
chr4 (51-369)||(15380167-15380487)
chr4 (51-369)||(15233832-15234156)
chr4 (28-369)||(17019045-17019384)
chr4 (28-369)||(14671009-14671349)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (51-373)||(12041-12364)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (23-373)||(3104-3458)
scaffold0159 (192-373)||(17952-18137)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (28-373)||(13931-14279)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (28-373)||(18567-18916)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (80-373)||(8854-9148)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (51-369)||(4532-4855)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (51-373)||(9919-10242)
scaffold0143 (85-369)||(33336-33619)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (50-373)||(1661-1986)
scaffold0322 (23-369)||(12023-12382)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (28-373)||(15551-15905)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (23-369)||(25092-25448)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (28-369)||(6048-6388)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (87-369)||(24835-25115)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (28-209)||(359-540)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (23-188)||(26245-26410)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (259-366)||(1-109)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (93-184)||(40759-40855)
scaffold0099 (323-369)||(40559-40606)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27284586 - 27284234
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| ||||| |||||||||   || ||||||||||| |||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27284586 catcttcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27284487  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctat-ttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27284486 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttct 27284387  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27284386 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 27284287  T
Q  321 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284286 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 27284234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Original strand, 27491107 - 27491459
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27491107 catcttcatcaaaagctcctatacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27491206  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491207 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 27491306  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaa 320  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27491307 ctttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaa 27491406  T
Q  321 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491407 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 27491459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26110629 - 26110283
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110629 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26110530  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||    
T  26110529 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 26110430  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26110429 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaa 26110330  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110329 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 26110283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13518418 - 13518066
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13518418 catcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 13518319  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  13518318 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttcc 13518219  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13518218 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 13518119  T
Q  321 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518118 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 13518066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27356330 - 27355983
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356330 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27356231  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356230 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 27356131  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27356130 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 27356031  T
Q  326 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356030 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 27355983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 16755822 - 16756147
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16755822 gaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 16755921  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755922 ccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 16756021  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac--attttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756022 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 16756121  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16756122 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 16756147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4539978 - 4539630
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4539978 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4539879  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttc-ttctactt 225  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4539878 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttctttttactt 4539779  T
Q  226 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4539778 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagca 4539679  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539678 aacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 4539630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26772847 - 26772505
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772847 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26772748  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26772747 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 26772649  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  26772648 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaa 26772549  T
Q  326 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26772548 acctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 26772505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34458725 - 34458380
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458725 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 34458626  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  34458625 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctatttt 34458527  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458526 ctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaa 34458427  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34458426 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagta 34458380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 16680118 - 16680466
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680118 tcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16680217  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactcta-tttttcttctacttt 226  Q
    |||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16680218 ctttgaaaatccgtggagtcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctacttt 16680317  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16680318 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 16680417  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680418 aacctgagcgacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 16680466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 29 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27623927 - 27623583
Alignment:
Q  29 catcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagc 128  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623927 catcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 27623828  T
Q  129 tttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctacttt 226  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27623827 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctacttt 27623728  T
Q  227 caaagctatatacaaaaca-ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27623727 caaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 27623628  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623627 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 27623583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 28213433 - 28213781
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28213433 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 28213532  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213533 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 28213632  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28213633 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagca 28213732  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213733 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 28213781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 28166473 - 28166821
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166473 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28166572  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166573 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 28166672  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28166673 aaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 28166772  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166773 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 28166821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 52 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13293140 - 13292831
Alignment:
Q  52 aattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgc 151  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13293140 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 13293041  T
Q  152 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293040 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 13292941  T
Q  252 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaat 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292940 ttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa----agttttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaat 13292845  T
Q  352 gaaacatgcatgag 365  Q
    ||||||||||||||    
T  13292844 gaaacatgcatgag 13292831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Original strand, 29555532 - 29555884
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||| ||||   || ||||||||||| |||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29555532 catcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29555631  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||    
T  29555632 ccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttcttttta 29555731  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29555732 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaa 29555831  T
Q  321 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555832 agcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 29555884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8899923 - 8899575
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8899923 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 8899824  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8899823 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttct 8899725  T
Q  222 actttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8899724 actttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 8899625  T
Q  320 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899624 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 8899575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 27063513 - 27063807
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063513 ttactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 27063612  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063613 aatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaa 27063711  T
Q  280 acaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063712 acaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 27063807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 27200165 - 27200513
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27200165 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27200264  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  27200265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctacttt 27200363  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagc 323  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27200364 caaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 27200463  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27200464 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagta 27200513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27249068 - 27248720
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27249068 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27248969  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  27248968 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctacttt 27248870  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagc 323  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27248869 caaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 27248770  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27248769 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagta 27248720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 35 - 369
Target Start/End: Original strand, 29579001 - 29579336
Alignment:
Q  35 aagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 134  Q
    ||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579001 aagctcctacacttgcaaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 29579100  T
Q  135 aatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcta 234  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29579101 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttctattttcaaagcta 29579199  T
Q  235 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 332  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579200 tatacaaatcattttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 29579299  T
Q  333 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29579300 caacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 29579336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Original strand, 4778882 - 4779203
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcac 149  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4778882 gaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcac 4778981  T
Q  150 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4778982 gcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaaacattt 4779081  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779082 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 4779181  T
Q  347 caaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  4779182 caaatg-aacatgcatgagcgag 4779203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 29507447 - 29507744
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507447 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 29507546  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactct--atttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29507547 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttg 29507646  T
Q  278 aaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29507647 aaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagta 29507744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 4763794 - 4764089
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763794 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 4763893  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
     |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4763894 tatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttga 4763992  T
Q  279 aacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763993 aacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 4764089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 35 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30552212 - 30551876
Alignment:
Q  35 aagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 134  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552212 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 30552113  T
Q  135 aatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcta 234  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  30552112 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 30552013  T
Q  235 tatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30552012 tatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgag 30551913  T
Q  333 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30551912 caacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 30551876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Original strand, 4531319 - 4531609
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4531319 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatc 4531418  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4531419 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaa 4531518  T
Q  280 acaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4531519 acaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 4531609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33370650 - 33370303
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370650 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33370551  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33370550 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 33370452  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaa-acttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||     
T  33370451 caaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcg 33370352  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33370351 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagta 33370303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Original strand, 26791818 - 26792138
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  26791818 gaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggaatcacg 26791917  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26791918 cctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcatttt 26792016  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26792017 ccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatc 26792116  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26792117 aaatgaaacatgcatgagcgag 26792138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16938191 - 16937897
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16938191 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatc 16938092  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16938091 aaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaa 16937993  T
Q  280 acaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937992 acaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 16937897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 27013764 - 27014052
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013764 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 27013863  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27013864 tatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaa 27013963  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27013964 acaaacattttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagta 27014052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14139561 - 14139272
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139561 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 14139462  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14139461 tatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaa 14139362  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||     || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14139361 acaaacattttgaaaattgaaaa----agttttttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagta 14139272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22929079 - 22928757
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  22929079 gaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacg 22928980  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  22928979 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattt 22928880  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22928879 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaatagggtacaat 22928780  T
Q  347 caaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22928779 caaatgaaacatgcatgagcgag 22928757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 51 - 353
Target Start/End: Original strand, 26926770 - 26927073
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26926770 gaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 26926869  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  26926870 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttc 26926968  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926969 cttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 26927068  T
Q  349 aatga 353  Q
    |||||    
T  26927069 aatga 26927073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 130 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666534
Alignment:
Q  130 ttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaa 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaa 26666676  T
Q  230 agctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaac 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26666675 agctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaac 26666576  T
Q  328 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26666575 ctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 26666534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 27031002 - 27031342
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||  ||  | || | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031002 tcatcaaaagctcctacgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27031101  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  27031102 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttc 27031201  T
Q  228 aaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||   | ||||||||||||    
T  27031202 aaagttatgtacaaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt---ttttttgaaaagca 27031298  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27031299 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 27031342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Original strand, 24869746 - 24870026
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869746 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 24869845  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaac 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||    
T  24869846 gagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaac 24869945  T
Q  282 aaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24869946 aaacatcttgaaaattgaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 24870026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 27208906 - 27209226
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27208906 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 27209005  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  27209006 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttt 27209105  T
Q  250 ctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 345  Q
    | |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27209106 ccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacat 27209199  T
Q  346 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27209200 tcaaatg-aacgtgcatgagcgagagta 27209226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27240322 - 27240002
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27240322 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 27240223  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  27240222 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttt 27240123  T
Q  250 ctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 345  Q
    | |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27240122 ccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacat 27240029  T
Q  346 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27240028 tcaaatg-aacgtgcatgagcgagagta 27240002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 366
Target Start/End: Original strand, 27025124 - 27025460
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| |||| || | ||||||||||| || ||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025124 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27025223  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||    
T  27025224 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 27025323  T
Q  228 aaagctatatac--aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagc 323  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||      |||||||||||    
T  27025324 aaagttatgtacaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt------ttttgaaaagc 27025417  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27025418 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgcatgagc 27025460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15406691 - 15406409
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406691 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 15406592  T
Q  184 tgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaa 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  15406591 tgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaa 15406492  T
Q  281 caaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||| | |||||||| |||   ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15406491 caaacatctggaaaattggaaaaagtt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 15406409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15418478 - 15418196
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418478 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 15418379  T
Q  184 tgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaa 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  15418378 tgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaa 15418279  T
Q  281 caaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||| | |||||||| |||   ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15418278 caaacatctggaaaattggaaaaagtt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 15418196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24299974 - 24299636
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  | ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24299974 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaag 24299875  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||| ||    
T  24299874 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactctc 24299775  T
Q  228 aaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaa 325  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| | |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||     || | |||||||||||||    
T  24299774 aaagttatgtacaaaaacgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaa----agttttttttgaaaagcaa 24299679  T
Q  326 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24299678 acctgagtaacagggtacattcaaatg-aacatgcataagcgag 24299636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 20174530 - 20174881
Alignment:
Q  31 tcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtt-tccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagct 129  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |  |||||| |||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20174530 tcagaagctactacacttgtgaattcaaaatgctaaaggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagct 20174629  T
Q  130 ttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttc--tactttc 227  Q
    |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  20174630 ttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttcc 20174729  T
Q  228 aaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaacattttgaaa------attgaaaacttt--tgtctattttg 317  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||      ||  | || |||  |||||||||||    
T  20174730 aaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttg 20174829  T
Q  318 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20174830 aaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgag 20174881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22161461 - 22161110
Alignment:
Q  31 tcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtt-tccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagct 129  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |  |||||| |||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22161461 tcagaagctactacacttgtgaattcaaaatgctaaaggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagct 22161362  T
Q  130 ttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttc--tactttc 227  Q
    |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |    
T  22161361 ttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttcc 22161262  T
Q  228 aaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaacattttgaaa------attgaaaacttt--tgtctattttg 317  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||      ||  | || |||  |||||||||||    
T  22161261 aaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttg 22161162  T
Q  318 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22161161 aaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgag 22161110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23851524 - 23851450
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttcca 125  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851524 gaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 52 - 373
Target Start/End: Original strand, 11555367 - 11555689
Alignment:
Q  52 aattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgc 151  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11555367 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 11555466  T
Q  152 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555467 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 11555566  T
Q  252 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt-ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555567 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 11555666  T
Q  351 tgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11555667 tgaaacatgcatgagcgagagta 11555689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Original strand, 33881110 - 33881462
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33881110 catcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 33881209  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  33881210 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttcc 33881309  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33881310 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 33881409  T
Q  321 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881410 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 33881462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 49 - 373
Target Start/End: Original strand, 3795548 - 3795875
Alignment:
Q  49 gtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtca 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3795548 gtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtca 3795647  T
Q  149 cgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacat 246  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795648 tgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacat 3795747  T
Q  247 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795748 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 3795847  T
Q  346 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795848 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 3795875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18369704 - 18369357
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369704 tcatcaaaaactcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18369605  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18369604 ctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 18369505  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18369504 caaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 18369405  T
Q  326 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369404 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 18369357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 24729959 - 24730302
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729959 tcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 24730058  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24730059 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 24730157  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24730158 aaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 24730257  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24730258 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 24730302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13318947 - 13318653
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318947 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 13318848  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318847 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 13318748  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318747 acaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 13318653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31820580 - 31820239
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820580 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31820481  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  31820480 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttc 31820382  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31820381 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 31820282  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31820281 cctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 31820239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 30174477 - 30174802
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  30174477 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 30174576  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174577 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 30174676  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174677 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 30174776  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  30174777 aaatgaaacatgcatgagtgagagta 30174802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40467702 - 40467378
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  40467702 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtggagtcacg 40467603  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467602 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 40467503  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467502 tttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 40467403  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40467402 aatgaaacatgcatgagcgagagta 40467378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Original strand, 6880345 - 6880636
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880345 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 6880444  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6880445 aaattgagcctgtgcttttgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaa 6880544  T
Q  280 acaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880545 acaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 6880636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 52 - 369
Target Start/End: Original strand, 23631982 - 23632303
Alignment:
Q  52 aattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgc 151  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23631982 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgc 23632081  T
Q  152 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632082 cttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 23632181  T
Q  252 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---cttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23632182 ttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattc 23632281  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23632282 aaatgaaacatgcatgagcgag 23632303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15753001 - 15752683
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15753001 gaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 15752902  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752901 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 15752803  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 349  Q
    ||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752802 tttc----ttgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 15752707  T
Q  350 atgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15752706 atgaaacatgcatgagcgagagta 15752683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 28655254 - 28655579
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28655254 gaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 28655353  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655354 ccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 28655452  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac--ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655453 tttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 28655552  T
Q  347 caaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28655553 caaatgaaacatgcatgagcgagagta 28655579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 30158040 - 30158367
Alignment:
Q  45 actcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 144  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||  ||| | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30158040 actcgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30158139  T
Q  145 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158140 gtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaac 30158239  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30158240 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggta 30158339  T
Q  343 cattcaaatgaaacatgcatgagcgaga 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgaga 30158367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37665606 - 37665315
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665606 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 37665507  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665506 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 37665407  T
Q  280 acaaaca-ttttgaaaattgaaaa-cttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37665406 acaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 37665315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 9323519 - 9323812
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323519 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 9323618  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323619 aaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaa 9323717  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9323718 acaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagta 9323812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 12138218 - 12138511
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138218 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 12138317  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138318 aaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaa 12138416  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12138417 acaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagta 12138511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13436829 - 13436499
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcac 149  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13436829 gaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcac 13436730  T
Q  150 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca-tt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13436729 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 13436630  T
Q  248 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436629 ttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 13436530  T
Q  343 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436529 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 13436499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 30035438 - 30035761
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30035438 gaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 30035537  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035538 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 30035636  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035637 tttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 30035736  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30035737 aatgaaacatgcatgagcgagagta 30035761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37746448 - 37746153
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746448 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 37746349  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37746348 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcga 37746249  T
Q  279 aacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37746248 aacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagta 37746153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9544857 - 9544532
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9544857 gaattcaaagtttc-aggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 9544759  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544758 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 9544660  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 345  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9544659 cttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacat 9544560  T
Q  346 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544559 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 9544532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 85 - 373
Target Start/End: Original strand, 5643846 - 5644134
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643846 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 5643945  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5643946 gagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaa 5644044  T
Q  285 ca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5644045 catttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagagta 5644134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 22894400 - 22894747
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||||||||   || | |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22894400 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 22894499  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22894500 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttcta 22894599  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttttgtctattttgaaa 320  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  22894600 ctttcaaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttg-aa 22894698  T
Q  321 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22894699 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 22894747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 35 - 369
Target Start/End: Original strand, 33522378 - 33522715
Alignment:
Q  35 aagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 134  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522378 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 33522477  T
Q  135 aatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttt-tcttctactttcaaagct 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||    
T  33522478 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttcttttttactttcaaagct 33522577  T
Q  234 atatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctga 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33522578 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 33522677  T
Q  332 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33522678 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 33522715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37352816 - 37352469
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||  |   | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352816 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 37352717  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37352716 ctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 37352618  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37352617 caaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 37352518  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352517 aacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 37352469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 2517106 - 2517402
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2517106 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatc 2517205  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2517206 aatttgagcttgtgcttttgtttgagattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaa 2517304  T
Q  280 acaaaca---ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  2517305 acaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagta 2517402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 41680693 - 41681037
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680693 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 41680792  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41680793 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctacttt 41680892  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtcta-ttttgaaaagc 323  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41680893 caaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagc 41680992  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41680993 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 41681037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18494916 - 18494593
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18494916 gaattcgaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 18494817  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 249  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   | |||    
T  18494816 ccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcca-ttttcttctactttcaaagctatatacaatttacttt 18494718  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494717 cttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 18494618  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18494617 aatgaaacatgcatgagcgagagta 18494593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 33298517 - 33298869
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33298517 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 33298616  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| |||    
T  33298617 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttttttc 33298716  T
Q  221 tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctatttt-- 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  33298717 tactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttg 33298816  T
Q  317 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298817 aaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 33298869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 34622530 - 34622855
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcac 149  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34622530 gaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcac 34622629  T
Q  150 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622630 gcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacatttt 34622729  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622730 ctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 34622829  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34622830 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 34622855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18122536 - 18122245
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122536 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 18122437  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18122436 aatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttga 18122337  T
Q  279 aacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18122336 aacaaacatttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 18122245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 11329626 - 11329975
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329626 tcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11329725  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttg-tttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11329726 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactcta-ttttcttctacttt 11329824  T
Q  227 caaagct--atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaag 322  Q
    |||||||  ||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11329825 caaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 11329924  T
Q  323 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329925 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 11329975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13180938 - 13180618
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcac 149  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13180938 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcac 13180839  T
Q  150 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180838 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 13180739  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180738 tctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa----agttttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 13180643  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13180642 aatgaaacatgcatgagcgagagta 13180618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32590447 - 32590101
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590447 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32590348  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  32590347 ctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ctttcttctactttc 32590249  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaa 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32590248 aaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 32590149  T
Q  326 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590148 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 32590101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 31437505 - 31437793
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437505 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 31437604  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31437605 tatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaa 31437704  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31437705 acaaacattttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagta 31437793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 37761023 - 37761319
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37761023 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatc 37761122  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37761123 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttga 37761221  T
Q  279 aacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761222 aacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 37761319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 43084270 - 43084594
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  43084270 gaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 43084369  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43084370 cctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttcaaagttatatacaaaaatattt 43084468  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084469 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 43084568  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43084569 aaatgaaacatgcatgaacgagagta 43084594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 85 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8659587 - 8659297
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8659587 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagtt 8659488  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 283  Q
    |||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659487 gagcctttgtttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 8659389  T
Q  284 aca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659388 acatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 8659297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 26486438 - 26486721
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486438 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 26486537  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486538 aaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-----------caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaa 26486626  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26486627 acaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagta 26486721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22993265 - 22992953
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||| |||||||  || || || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22993265 gaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 22993166  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993165 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttc 22993066  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 350  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993065 tttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 22992971  T
Q  351 tgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    || ||||||||||||||||    
T  22992970 tg-aacatgcatgagcgag 22992953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28953952 - 28953609
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||    ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953952 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28953853  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28953852 ctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 28953754  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtcta-ttttgaaaagc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28953753 caaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagc 28953654  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28953653 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 28953609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15652873 - 15652589
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652873 gtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 15652774  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15652773 gagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaa 15652674  T
Q  285 cattttgaaaattg-aaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15652673 cattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 15652589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Original strand, 25206323 - 25206616
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206323 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 25206422  T
Q  184 tgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaa 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25206423 tgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaa 25206522  T
Q  281 caaacattttgaaaattgaaaa------cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25206523 caaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 25206616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Original strand, 25270479 - 25270772
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270479 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 25270578  T
Q  184 tgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaa 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25270579 tgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaa 25270678  T
Q  281 caaacattttgaaaattgaaaa------cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25270679 caaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 25270772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Original strand, 23897886 - 23898200
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  23897886 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacg 23897985  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac----aaaacat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||    |||||||    
T  23897986 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacat 23898085  T
Q  247 tttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 345  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||         | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23898086 tttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa---------agttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacat 23898176  T
Q  346 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  23898177 tcaaacgaaacatgcatgagcgag 23898200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Original strand, 33783499 - 33783814
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33783499 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 33783598  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33783599 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttt 33783698  T
Q  250 ctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 346  Q
    | |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33783699 ccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt------ttttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacatt 33783792  T
Q  347 caaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  33783793 caaacg-aacatgcatgagcgag 33783814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 24975833 - 24976175
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||  ||  | ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24975833 catcttcatcaaaagctcctatgctcgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 24975932  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||  || ||    
T  24975933 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 24976032  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaa 319  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  |       |||||||    
T  24976033 ctttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagt-------ttttgaa 24976125  T
Q  320 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24976126 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgcatgagcgag 24976175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 366
Target Start/End: Original strand, 24608291 - 24608570
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24608291 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 24608390  T
Q  184 tgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaa 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  24608391 tgagcatgtgcttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaa 24608490  T
Q  281 caaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24608491 caaacatcttgaaaattgaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagc 24608570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 30940625 - 30940962
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30940625 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 30940724  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||  || ||||||    
T  30940725 gcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttgaaattctgctttctttttacttt 30940824  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagc 323  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |       |||||||||||    
T  30940825 caaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt-------ttttgaaaagc 30940917  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30940918 aaacctgagcaacagggtacattcaaaag-aacatgcatgagcgag 30940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9890 - 9567
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9890 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 9791  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9790 ctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 9691  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9690 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 9591  T
Q  350 atgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9590 atgaaacatgcatgagcgagagta 9567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 52 - 373
Target Start/End: Original strand, 12661543 - 12661865
Alignment:
Q  52 aattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgc 151  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12661543 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 12661642  T
Q  152 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661643 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 12661742  T
Q  252 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661743 ttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 12661842  T
Q  351 tgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12661843 tgaaacatgcatgagcgagagta 12661865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 39896101 - 39896395
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39896101 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatc 39896200  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896201 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 39896300  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896301 acaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 39896395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 37383680 - 37384004
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcac 149  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37383680 gaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcac 37383779  T
Q  150 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383780 gcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 37383879  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37383880 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatcca 37383979  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37383980 aatgaaacatgcatgagcgagagta 37384004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 254891 - 254567
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  254891 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 254792  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254791 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 254692  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254691 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 254592  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  254591 aatgaaacatgcatgagtgagagta 254567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 34867663 - 34868009
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||   |  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867663 tcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 34867762  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  34867763 ctttgtgaatccgtagagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttc 34867861  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34867862 aaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 34867961  T
Q  326 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867962 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 34868009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12710863 - 12710520
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710863 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12710764  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12710763 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 12710665  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12710664 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 12710565  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12710564 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 12710520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9344226 - 9343902
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9344226 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 9344127  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344126 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 9344027  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344026 tttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 9343927  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9343926 aatgaaacatgcatgagcgagagta 9343902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22922355 - 22922058
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922355 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 22922256  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 276  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922255 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 22922156  T
Q  277 gaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922155 gaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 22922058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39046061 - 39045737
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||  | |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39046061 gaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 39045962  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045961 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 39045862  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045861 tttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 39045762  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39045761 aatgaaacatgcatgagcgagagta 39045737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 370
Target Start/End: Original strand, 31882290 - 31882610
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31882290 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 31882389  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882390 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 31882488  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31882489 tttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggtacattca 31882588  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgaga 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31882589 aatgaaacatgcatgagcgaga 31882610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37946105 - 37945788
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  37946105 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 37946006  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946005 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 37945906  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945905 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 37945806  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgag 365  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37945805 aaatgaaacatgcatgag 37945788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 32055805 - 32056128
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32055805 gaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 32055904  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055905 ccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 32056003  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056004 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 32056103  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32056104 aatgaaacatgcatgagcgagagta 32056128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 27809704 - 27810030
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27809704 gaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 27809803  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta--tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatt 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809804 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatt 27809903  T
Q  248 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27809904 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggttacatt 27810003  T
Q  347 caaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27810004 caaatgaaacatgcatgagtgagagta 27810030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 34160876 - 34161173
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160876 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 34160975  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34160976 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaa 34161075  T
Q  280 acaaaca---ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161076 acaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 34161173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13930785 - 13930459
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  13930785 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtg 13930686  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13930685 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattt 13930586  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930585 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 13930486  T
Q  347 caaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13930485 caaatgaaacatgcatgagcgagagta 13930459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19410696 - 19410399
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410696 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 19410597  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 276  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410596 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 19410497  T
Q  277 gaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410496 gaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 19410399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 27122557 - 27122850
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27122557 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatc 27122656  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122657 aaattgagcctttgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaa 27122755  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122756 acaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 27122850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 35 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16823592 - 16823256
Alignment:
Q  35 aagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 134  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823592 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 16823493  T
Q  135 aatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcta 234  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  16823492 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 16823393  T
Q  235 tatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16823392 tatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgag 16823293  T
Q  333 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16823292 caacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 16823256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 35 - 369
Target Start/End: Original strand, 16897888 - 16898224
Alignment:
Q  35 aagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 134  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897888 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 16897987  T
Q  135 aatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcta 234  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  16897988 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 16898087  T
Q  235 tatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16898088 tatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgag 16898187  T
Q  333 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16898188 caacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 16898224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 51 - 365
Target Start/End: Original strand, 16167481 - 16167797
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16167481 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 16167580  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  16167581 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattt 16167679  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167680 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 16167779  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgag 365  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16167780 aaatgaaacatgcatgag 16167797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 34297188 - 34297476
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297188 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 34297287  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  34297288 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaa 34297387  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297388 acaaacatttcgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 34297476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 37931375 - 37931706
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  37931375 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 37931474  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt------tcttctactttcaaagctatatacaaaa 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931475 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 37931574  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931575 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37931674  T
Q  342 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931675 acaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 37931706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 40239489 - 40239831
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239489 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 40239588  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40239589 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 40239687  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40239688 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 40239787  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40239788 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 40239831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 3788526 - 3788820
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3788526 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatc 3788625  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3788626 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttga 3788724  T
Q  279 aacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3788725 aacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagta 3788820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 12592813 - 12593141
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12592813 gaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 12592912  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592913 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 12593012  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 344  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12593013 ccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaacagggtaca 12593112  T
Q  345 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12593113 ttcaaatgaaacatgcatgagtgagagta 12593141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11629451 - 11629104
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||   |||||  ||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11629451 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 11629352  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  11629351 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttctttta 11629253  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact-tttgtctattttgaa 319  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11629252 ttttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaa 11629153  T
Q  320 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11629152 aaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 11629104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 27782212 - 27782555
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782212 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27782311  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  27782312 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctatttt 27782410  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27782411 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 27782510  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27782511 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 27782555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37680160 - 37679806
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37680160 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 37680061  T
Q  122 tccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37680060 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttct 37679962  T
Q  222 actttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaa-acttttgtctattttg 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  37679961 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttg 37679862  T
Q  318 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679861 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 37679806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37695425 - 37695071
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37695425 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 37695326  T
Q  122 tccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37695325 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttct 37695227  T
Q  222 actttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaa-acttttgtctattttg 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  37695226 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttg 37695127  T
Q  318 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695126 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 37695071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21671440 - 21671085
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21671440 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 21671341  T
Q  122 tccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21671340 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttct 21671242  T
Q  222 actttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaa--acttttgtctatttt 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  21671241 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattttttttgtctatttt 21671142  T
Q  317 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671141 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 21671085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31868977 - 31868702
Alignment:
Q  98 caccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31868977 caccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttt 31868878  T
Q  198 tgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaat 296  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31868877 tgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaat 31868779  T
Q  297 tgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagt 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868778 tgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagt 31868702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21697415 - 21697092
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21697415 gaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 21697316  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  21697315 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatcttcctactttcaaagctatgtacaaaaaacattt 21697216  T
Q  249 tctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21697215 tctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtaca 21697117  T
Q  345 ttcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  21697116 ttcaaacgaaacatgcatgagcgag 21697092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Original strand, 27396326 - 27396656
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27396326 gaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 27396425  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  27396426 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattt 27396525  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----------cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 337  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27396526 tctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgtcctttttg-aaagcaaacctaagcaaca 27396624  T
Q  338 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27396625 aggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 27396656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19450694 - 19450341
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||||||||   || | |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19450694 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 19450595  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  19450594 ccaagctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttgaaactctattttctctcta 19450495  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-------cttttgtc 310  Q
    ||||||||| ||| |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||    
T  19450494 ctttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtc 19450395  T
Q  311 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 365  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  19450394 tgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgag 19450341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23122835 - 23122497
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23122835 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaa 23122736  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  23122735 gctttgcaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttacttt 23122636  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||     ||||||||||||    
T  23122635 caaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagca 23122541  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23122540 aacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 23122497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34269126 - 34268845
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34269126 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaatt 34269027  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaac 281  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  34269026 gagcatgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaac 34268927  T
Q  282 aaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||| || |||||||||||  ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34268926 aaacatcttaaaaattgaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 34268845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Original strand, 28888316 - 28888597
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888316 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 28888415  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaac 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||    
T  28888416 gagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaac 28888515  T
Q  282 aaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28888516 aaacatcttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 28888597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27428651 - 27428372
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27428651 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 27428552  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaac 281  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | |||||    
T  27428551 gagcctgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaac 27428452  T
Q  282 aaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||| |||||||||| |||  |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  27428451 aaacatcttgaaaattgcaaaagt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgag 27428372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Original strand, 20843949 - 20844235
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20843949 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatt 20844048  T
Q  184 tgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagctatat--acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttga 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||| ||| |  | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||    
T  20844049 tgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcga 20844148  T
Q  279 aacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20844149 aacaagcatcttgaaaattgaaaa----agttttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgag 20844235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 373
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117123
Alignment:
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 342  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  343 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 23117123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 33248348 - 33248690
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248348 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33248447  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33248448 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 33248547  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33248548 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 33248647  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248648 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 33248690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 18796711 - 18797036
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcac 149  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  18796711 gaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtggagtcac 18796810  T
Q  150 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18796811 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattt 18796910  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796911 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 18797010  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18797011 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 18797036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12086958 - 12086610
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12086958 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 12086859  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086858 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 12086759  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12086758 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagca 12086659  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086658 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 12086610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31484111 - 31483757
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||   |||||  ||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31484111 catcttcatctgaagcttccacatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 31484012  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttctt 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||    
T  31484011 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 31483912  T
Q  220 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31483911 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttga 31483812  T
Q  319 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483811 aaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 31483757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 19680483 - 19680776
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680483 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 19680582  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680583 aaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaa 19680681  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19680682 acaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagta 19680776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Original strand, 29835300 - 29835651
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| ||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| | |||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29835300 catcttcatctgaagcctctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29835399  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  29835400 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactcca-ttttcttct 29835498  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29835499 actttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 29835598  T
Q  321 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835599 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 29835651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 9360656 - 9360950
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9360656 ttactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatc 9360755  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360756 aagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 9360854  T
Q  279 aacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360855 aacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 9360950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28356134 - 28355837
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28356134 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatc 28356035  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 276  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||   || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356034 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 28355935  T
Q  277 gaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28355934 gaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagta 28355837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 33264765 - 33265059
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33264765 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatc 33264864  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264865 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 33264963  T
Q  280 acaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264964 acgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 33265059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 15773608 - 15773903
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15773608 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtc 15773707  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15773708 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcagagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaa 15773807  T
Q  280 acaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773808 acaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 15773903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 44566962 - 44567312
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttcc-aggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44566962 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 44567061  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44567062 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctacttt 44567160  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44567161 caaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 44567260  T
Q  322 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44567261 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagta 44567312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 31360533 - 31360857
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31360533 gaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 31360632  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  31360633 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattt 31360731  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360732 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 31360831  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  31360832 aaatgaaacatgcatgagtgagagta 31360857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 85 - 373
Target Start/End: Original strand, 18715519 - 18715811
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18715519 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaatt 18715618  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 284  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715619 gagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 18715717  T
Q  285 catttt----gaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715718 catttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 18715811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 52 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21342381 - 21342057
Alignment:
Q  52 aattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21342381 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 21342282  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342281 ccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttc 21342182  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342181 cttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 21342082  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21342081 aatgaaacatgcatgagcgagagta 21342057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19202545 - 19202262
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202545 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 19202446  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202445 aaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-----------caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaa 19202357  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19202356 acaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagta 19202262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19911346 - 19911053
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911346 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 19911247  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg 277  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911246 aaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg 19911147  T
Q  278 aaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911146 aaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 19911053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22075141 - 22074820
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22075141 gaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 22075042  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac---aaaacatt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  22075041 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacatt 22074942  T
Q  248 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22074941 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttg-aaagcaagcatgagcaacaaggtacatt 22074843  T
Q  347 caaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  22074842 caaacgaaacgtgcatgagcgag 22074820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 303
Target Start/End: Original strand, 16260205 - 16260480
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||  ||| | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260205 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16260304  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16260305 ctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 16260403  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260404 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27603146 - 27602805
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27603146 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27603047  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||    
T  27603046 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 27602947  T
Q  223 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaa 319  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||       |||||||    
T  27602946 ctttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtt-------ttttgaa 27602854  T
Q  320 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27602853 aagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 27602805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2131496 - 2131159
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2131496 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 2131397  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||    
T  2131396 ctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttc 2131297  T
Q  228 aaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||    
T  2131296 aaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt------ctttgaaaagca 2131203  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2131202 aacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 2131159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19655555 - 19655238
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa--ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtca 148  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  19655555 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtct 19655456  T
Q  149 cgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  19655455 cgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacatt 19655356  T
Q  248 ttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 345  Q
    ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19655355 ttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtttt-----ttttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacat 19655262  T
Q  346 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||  |||| ||||||||||||    
T  19655261 tcaaacaaaacgtgcatgagcgag 19655238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Original strand, 22138945 - 22139225
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138945 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 22139044  T
Q  184 tgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  22139045 tgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaa 22139144  T
Q  281 caaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||| | ||||||||||||||  |       ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22139145 caaacgtcttgaaaattgaaaaagt-------ttttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgag 22139225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 19694077 - 19694416
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19694077 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 19694176  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||  || ||||||    
T  19694177 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactccgctttctttttacttt 19694276  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagc 323  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||     |||||||||||    
T  19694277 caaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagc 19694371  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19694372 aaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 19694416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Original strand, 14569195 - 14569479
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569195 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 14569294  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttg 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |    
T  14569295 gagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcg 14569394  T
Q  278 aaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||  ||      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14569395 aaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 14569479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4790949 - 4790601
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||  ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4790949 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4790850  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790849 gctttgtaaatccgtggattcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 4790750  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4790749 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 4790650  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790649 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 4790601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29659283 - 29658936
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659283 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29659184  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659183 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 29659084  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaa 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  29659083 aaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 29658984  T
Q  326 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658983 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 29658936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22381872 - 22381553
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22381872 gaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 22381773  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381772 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 22381673  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22381672 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgtacattca 22381573  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  22381572 aatg-aacatgcatgagcgag 22381553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 5727946 - 5728271
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  5727946 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 5728045  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728046 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 5728145  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728146 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 5728245  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  5728246 aaatgaaacatgcatgagtgagagta 5728271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 47029421 - 47029746
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  47029421 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 47029520  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029521 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 47029620  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029621 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 47029720  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  47029721 aaatgaaacatgcatgagtgagagta 47029746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 32296574 - 32296922
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296574 tcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32296673  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  32296674 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactt 32296773  T
Q  226 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32296774 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 32296873  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32296874 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagta 32296922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 18248683 - 18249030
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18248683 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgag 18248782  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18248783 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttggaactctatttttcttctactttc 18248882  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaa 325  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18248883 aaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 18248982  T
Q  326 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248983 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 18249030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31958720 - 31958423
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958720 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 31958621  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 276  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958620 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 31958521  T
Q  277 gaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958520 gaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 31958423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 5717036 - 5717361
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  5717036 gaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 5717135  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 5717235  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717236 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 5717335  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  5717336 aaatgaaacatgcatgagtgagagta 5717361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5764422 - 5764097
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  5764422 gaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 5764323  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764322 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 5764223  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764222 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 5764123  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  5764122 aaatgaaacatgcatgagtgagagta 5764097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 48471895 - 48472223
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  48471895 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacg 48471994  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471995 ccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 48472094  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-----aaaattgaaaacttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472095 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 48472194  T
Q  345 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472195 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 48472223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5603578 - 5603281
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603578 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 5603479  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 276  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603478 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 5603379  T
Q  277 gaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5603378 gaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgcatgagcgagagta 5603281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22865109 - 22864816
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22865109 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatc 22865010  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865009 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactat-gctttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 22864911  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864910 acaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 22864816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22880168 - 22879875
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22880168 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatc 22880069  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880068 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactat-gctttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 22879970  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879969 acaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 22879875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 24334170 - 24334467
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334170 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 24334269  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 276  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334270 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 24334369  T
Q  277 gaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334370 gaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 24334467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 10402117 - 10402440
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  10402117 gaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcaca 10402216  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402217 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaattctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 10402315  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402316 tttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 10402415  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10402416 aatgaaacatgcatgagcgagagta 10402440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5590624 - 5590329
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590624 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 5590525  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590524 aatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 5590425  T
Q  279 aacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5590424 aacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagta 5590329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 28027236 - 28027581
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||| | |||   ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027236 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28027335  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  28027336 ctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttc 28027434  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28027435 aaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 28027534  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027535 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 28027581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 5472985 - 5473279
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5472985 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatc 5473084  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
    || |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5473085 aagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttga 5473183  T
Q  279 aacaaaca-ttttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473184 aacaaacatttttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 5473279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 4422886 - 4423210
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4422886 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 4422985  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4422986 ccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcatttt 4423084  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423085 ccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 4423184  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4423185 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 4423210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 85 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17971122 - 17970834
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17971122 gtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaatt 17971023  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 284  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971022 gagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 17970924  T
Q  285 cattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970923 cattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 17970834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 5019681 - 5020004
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5019681 gaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 5019780  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5019781 cctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactcta-ctttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttc 5019879  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019880 cttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 5019979  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5019980 aatgaaacatgcatgagcgagagta 5020004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Original strand, 28345168 - 28345458
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345168 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 28345267  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345268 aaattgagcctatgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaa 28345366  T
Q  280 acaaacattttg-aaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345367 acaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 28345458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28110218 - 28109919
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28110218 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatc 28110119  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110118 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 28110019  T
Q  279 aacaaac----attttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110018 aacaaacgttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 28109919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 35 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4340984 - 4340644
Alignment:
Q  35 aagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 134  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||  ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340984 aagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 4340885  T
Q  135 aatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4340884 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagct 4340786  T
Q  234 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctga 331  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4340785 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 4340686  T
Q  332 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340685 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 4340644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 4629725 - 4630072
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4629725 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 4629824  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4629825 ccaagctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttct 4629923  T
Q  222 actttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4629924 actttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 4630023  T
Q  320 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4630024 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 4630072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 10649039 - 10649363
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10649039 gaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 10649138  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  10649139 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattt 10649237  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649238 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 10649337  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  10649338 aaatgaaacatgcatgagtgagagta 10649363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18286617 - 18286327
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286617 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 18286518  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286517 aatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 18286419  T
Q  280 acaaaca--ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18286418 acaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 18286327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18301918 - 18301628
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301918 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 18301819  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301818 aatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 18301720  T
Q  280 acaaaca--ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18301719 acaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 18301628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 85 - 373
Target Start/End: Original strand, 20072035 - 20072327
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20072035 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaatt 20072134  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 284  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072135 gagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 20072233  T
Q  285 ca----ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072234 cattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 20072327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 21680646 - 21680988
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680646 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21680745  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21680746 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 21680844  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21680845 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 21680944  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680945 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 21680988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29143077 - 29142726
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29143077 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29142978  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  29142977 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttttct 29142878  T
Q  222 actttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctatttt--g 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  29142877 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttga 29142778  T
Q  318 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142777 aaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 29142726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6537006 - 6536711
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6537006 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 6536907  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6536906 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaa 6536807  T
Q  280 acaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6536806 acaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagta 6536711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 7079190 - 7079519
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7079190 gaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 7079289  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc----tatatacaaaacat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||    ||||||||||||||    
T  7079290 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatatatacaaaacat 7079389  T
Q  247 tttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 343  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079390 tttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 7079489  T
Q  344 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079490 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 7079519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 35 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17979259 - 17978922
Alignment:
Q  35 aagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 134  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979259 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 17979160  T
Q  135 aatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcta 234  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  17979159 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 17979060  T
Q  235 tatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttg-aaaagcaaacctga 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17979059 tatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctga 17978960  T
Q  332 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17978959 gcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgag 17978922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 8217600 - 8217926
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  8217600 gaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtggagtcatg 8217699  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  8217700 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattt 8217798  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217799 tctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 8217898  T
Q  346 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217899 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 8217926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 85 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11104620 - 11104329
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11104620 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgccttcggctgactaccactcttatacatcaattt 11104521  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct--atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaaca 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11104520 gagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaaca 11104421  T
Q  283 aacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104420 aacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 11104329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31030501 - 31030217
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31030501 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtc 31030402  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31030401 aatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaa 31030302  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31030301 acaaacattttgaaaattgaaaa----agttttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 31030217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16618813 - 16618461
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||||||||   || | |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16618813 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16618714  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  16618713 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttcta 16618614  T
Q  223 ctttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----cttttgtctattt 315  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||||||| ||||    
T  16618613 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattt 16618514  T
Q  316 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16618513 tg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 16618461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 18336573 - 18336910
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18336573 tcatcaaaagctcctatacttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 18336672  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336673 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 18336772  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||     || | ||||||||||||||    
T  18336773 caaagctatatacaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa----agttttttttgaaaagcaaa 18336868  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18336869 cctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 18336910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 51787990 - 51788314
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  | || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  51787990 gaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 51788089  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51788090 cctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaatatttt 51788188  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788189 ccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 51788288  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  51788289 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 51788314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Original strand, 18231161 - 18231481
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |    
T  18231161 gaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtggagtcatg 18231260  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231261 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 18231360  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18231361 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacagtca 18231460  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18231461 aatgaaacatgcatgagcgag 18231481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20571161 - 20570821
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571161 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20571062  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  20571061 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctatttt 20570963  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20570962 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 20570863  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 366  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20570862 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagc 20570821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Original strand, 16422151 - 16422471
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16422151 gaattcaaagtttcc-ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 16422249  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  16422250 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattt 16422349  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422350 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacatt 16422448  T
Q  347 caaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16422449 caaatgaaacatgcatgagcgag 16422471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Original strand, 32445151 - 32445433
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445151 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 32445250  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  32445251 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacattttctttctgttttgataatgataatgctcgaa 32445350  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32445351 acaaacattttgaaaattgaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 32445433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Original strand, 19700454 - 19700786
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19700454 gaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 19700553  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac----------- 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||               
T  19700554 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaaaaa 19700653  T
Q  240 aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19700654 aaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 19700752  T
Q  336 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19700753 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 19700786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Original strand, 4727630 - 4727915
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727630 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 4727729  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |    
T  4727730 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttttaataatgacaaatgctcg 4727829  T
Q  278 aaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4727830 aaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 4727915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 18057205 - 18057551
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18057205 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 18057304  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  || ||||||    
T  18057305 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 18057404  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttttgtctattttgaaaag 322  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||  ||||    
T  18057405 caaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaag 18057504  T
Q  323 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057505 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 18057551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 52 - 369
Target Start/End: Original strand, 6207869 - 6208184
Alignment:
Q  52 aattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6207869 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 6207968  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207969 ccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 6208068  T
Q  250 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    | ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208069 ccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 6208163  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  6208164 aaatg-aacatgcatgagcgag 6208184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15735387 - 15735072
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15735387 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 15735288  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  15735287 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttc 15735189  T
Q  250 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735188 ccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa----agttttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 15735093  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  15735092 aaatg-aacatgcatgagcgag 15735072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 369
Target Start/End: Original strand, 35886733 - 35887048
Alignment:
Q  52 aattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35886733 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 35886832  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35886833 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacatttt 35886932  T
Q  250 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||     |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35886933 ccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacattc 35887027  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||| | ||||| ||||||||||    
T  35887028 aaacg-aacatacatgagcgag 35887048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 4689596 - 4689933
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  | || | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4689596 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4689695  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||    
T  4689696 gcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttacttt 4689794  T
Q  227 caaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagc 323  Q
    | ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||      |||||||||||    
T  4689795 ctaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt------ttttgaaaagc 4689888  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4689889 aaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 4689933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Original strand, 5658136 - 5658419
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac--atcaat 182  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  5658136 gtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcatt 5658235  T
Q  183 ttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaa 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  5658236 ttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttccttttactttcaacgttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaa 5658335  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||| || |||||||||||  |||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5658336 acaaacatcttaaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagcaaacctaagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 5658419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8283727 - 8283430
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283727 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 8283628  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaac 281  Q
    |||| |||| |||||||||||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||    
T  8283627 gagcatgtgtttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaac 8283528  T
Q  282 aaacattttgaaaattgaaaa----------cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    || ||| ||||||||||||||           |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8283527 aagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgag 8283430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15886895 - 15886713
Alignment:
Q  183 ttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaa 279  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||    
T  15886895 ttgagcctgtgtttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaa 15886796  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
     ||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15886795 gcaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 15886713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15886999 - 15886894
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgt-gaatctgtggagtca 148  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  15886999 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgtggagtca 15886900  T
Q  149 cgcctt 154  Q
    ||||||    
T  15886899 cgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 130
Target Start/End: Original strand, 8002528 - 8002607
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002528 gaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27561101 - 27561018
Alignment:
Q  111 aattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacca-ctcttatacatcaatttgagcttgtgc 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  27561101 aattaccattttccaaactttgtg-atctgtggtgccaagccttcggctggctaccatctcttttaaatcaatttgagcctgtgc 27561018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Original strand, 3647125 - 3647477
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3647125 catcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 3647224  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3647225 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttct 3647324  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3647325 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 3647424  T
Q  321 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647425 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 3647477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 28591067 - 28591413
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591067 tcatcaaaaactcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28591166  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||    
T  28591167 ctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 28591266  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28591267 aaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 28591366  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591367 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 28591413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 10951075 - 10951423
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951075 tcatcaaaagctcctacacttgcggattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 10951174  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactt 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10951175 ctttgtgaatctgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 10951274  T
Q  226 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  10951275 tcaaagctatatacaaaacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagta 10951374  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10951375 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagta 10951423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 10968701 - 10968997
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10968701 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatc 10968800  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg 277  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968801 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttg 10968900  T
Q  278 aaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968901 aaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 10968997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41787583 - 41787234
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41787583 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 41787484  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41787483 gctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctacttt 41787385  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41787384 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 41787285  T
Q  323 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787284 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 41787234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 51644256 - 51644553
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51644256 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatc 51644355  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg 277  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644356 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg 51644455  T
Q  278 aaacaaacattttgaaaattgaaaac--ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51644456 aaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagta 51644553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 85 - 373
Target Start/End: Original strand, 28155767 - 28156059
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28155767 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaatt 28155866  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 284  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155867 gagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 28155965  T
Q  285 ca----ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155966 cattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 28156059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20334666 - 20334344
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  20334666 gaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagccttgtaaatccatggagtcacg 20334567  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac---aaaacatt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  20334566 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacatt 20334467  T
Q  248 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20334466 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacat 20334368  T
Q  346 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20334367 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 20334344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16202284 - 16201956
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||   |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16202284 gaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 16202185  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-----aaaaca 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||     ||||||    
T  16202184 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagccatgtacaaaaaaaaaca 16202085  T
Q  246 ttttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 339  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16202084 ttttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagg 16201986  T
Q  340 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16201985 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 16201956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 20466756 - 20467112
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |  ||||||||||||| ||||||  |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20466756 catcttcatcagaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 20466855  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| |    
T  20466856 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttcca 20466955  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-gaaaa--------cttttgtct 311  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||         |  |||||    
T  20466956 ctttcaaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtct 20467055  T
Q  312 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20467056 attttg-aaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgag 20467112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21892025 - 21891691
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21892025 catcttcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 21891926  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactcta-tttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || |    
T  21891925 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttt 21891826  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaa 319  Q
    |  ||||           ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     || | |||||||    
T  21891825 atgttca-----------aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa---aagttttttttgaa 21891740  T
Q  320 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21891739 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 21891691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 52 - 373
Target Start/End: Original strand, 5164387 - 5164710
Alignment:
Q  52 aattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgc 151  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5164387 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 5164486  T
Q  152 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaag-ctatatacaaaacattttc 250  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5164487 tttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttc 5164586  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 349  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5164587 tttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaa 5164686  T
Q  350 atgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5164687 atgaaacatgcatgagcgagagta 5164710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 26518772 - 26519117
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518772 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26518871  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  26518872 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttc 26518970  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26518971 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 26519070  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26519071 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagta 26519117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 5154086 - 5154409
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5154086 gaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 5154185  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154186 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttc 5154285  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5154286 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaa 5154385  T
Q  350 atgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5154386 atgaaacatgcatgagcgagagta 5154409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24586640 - 24586346
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586640 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 24586541  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24586540 aaattgagcctgtgctttcgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaa 24586441  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24586440 acaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagta 24586346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 11446867 - 11447210
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446867 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11446966  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11446967 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 11447065  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11447066 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 11447165  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11447166 aacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgag 11447210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4139353 - 4139056
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139353 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 4139254  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 276  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139253 aatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 4139154  T
Q  277 gaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4139153 gaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagta 4139056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 53 - 373
Target Start/End: Original strand, 45393223 - 45393545
Alignment:
Q  53 attcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgcc 152  Q
    |||||||||||| | ||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45393223 attcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcc 45393322  T
Q  153 ttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctt 252  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  45393323 tttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatcattttcct 45393422  T
Q  253 tctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 350  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393423 tctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 45393522  T
Q  351 tgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45393523 tgaaacatgcatgagcgagagta 45393545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26509798 - 26509510
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509798 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 26509699  T
Q  184 tgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaaca 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26509698 tgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaaca 26509599  T
Q  283 aacattttgaaaattgaaaac--ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509598 aacattttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 26509510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 4205421 - 4205715
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205421 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 4205520  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205521 aaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaa 4205619  T
Q  280 acaaacattttg-aaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205620 acaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 4205715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26313953 - 26313660
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313953 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 26313854  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313853 aaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaa 26313755  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26313754 acaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagta 26313660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 34 - 372
Target Start/End: Original strand, 26441238 - 26441579
Alignment:
Q  34 gaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 133  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441238 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 26441337  T
Q  134 gaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-gaaactcta-tttttcttctactttcaaag 231  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26441338 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccattttttcttttactttcaaag 26441437  T
Q  232 ctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctg 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26441438 ctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 26441537  T
Q  331 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441538 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagt 26441579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31084786 - 31084433
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||   |||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31084786 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 31084687  T
Q  122 tccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31084686 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttttcttct 31084587  T
Q  222 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaa-acttttgtctattttgaa 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  31084586 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaa 31084487  T
Q  320 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31084486 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagta 31084433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 52 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11418913 - 11418590
Alignment:
Q  52 aattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgc 151  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11418913 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 11418814  T
Q  152 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11418813 cttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttcc 11418714  T
Q  252 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaacttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418713 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 11418614  T
Q  350 atgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  11418613 atgaaacatgcacgagcgagagta 11418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5141498 - 5141149
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5141498 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 5141399  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5141398 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttct 5141300  T
Q  222 actttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttg-a 318  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5141299 actttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 5141200  T
Q  319 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141199 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 5141149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 85 - 373
Target Start/End: Original strand, 45737337 - 45737629
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  45737337 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaatt 45737436  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 284  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737437 gagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaa 45737535  T
Q  285 ca----ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737536 cattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 45737629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 3451297 - 3451641
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451297 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3451396  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3451397 ttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 3451495  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3451496 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 3451595  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3451596 aaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgag 3451641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26269195 - 26268896
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269195 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 26269096  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269095 aatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 26268996  T
Q  279 aacaaaca----ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268995 aacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 26268896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26664048 - 26663723
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26664048 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 26663949  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663948 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 26663849  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26663848 tctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattc 26663749  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  26663748 aaatgaaacatgcatgagtgagagta 26663723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26679240 - 26678915
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26679240 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 26679141  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679140 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 26679041  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26679040 tctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattc 26678941  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  26678940 aaatgaaacatgcatgagtgagagta 26678915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31558529 - 31558205
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31558529 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 31558430  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31558429 ccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcatttt 31558331  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558330 ccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 31558231  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31558230 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 31558205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39207274 - 39206950
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  | || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  39207274 gaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 39207175  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39207174 cctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaatatttt 39207076  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207075 ccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 39206976  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  39206975 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 39206950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 2160544 - 2160894
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||  ||  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160544 catcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 2160643  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||   || ||    
T  2160644 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttccttttta 2160743  T
Q  223 ctttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttttgtctattttga 318  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||      
T  2160744 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttg 2160843  T
Q  319 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160844 aaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 2160894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16745627 - 16745331
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16745627 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatc 16745528  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
    || |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745527 aagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 16745429  T
Q  279 aacaaaca--ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  16745428 aacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagta 16745331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 2779283 - 2779572
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779283 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 2779382  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  2779383 tatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaa 2779482  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2779483 acaaacattttgaaaattgaaaa----agttttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagta 2779572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 31129936 - 31130225
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129936 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 31130035  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31130036 tatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaa 31130135  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31130136 acaaacattttgaaaattgaaaa----agttttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagta 31130225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 16047289 - 16047634
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||||||||   || | |||||||||||||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16047289 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16047388  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  16047389 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttcta 16047488  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaa 321  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  16047489 ctgtcaaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtttttgtctattttg-aaa 16047586  T
Q  322 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16047587 gcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 16047634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16444139 - 16443818
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| | ||||  |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16444139 gaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 16444040  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattt 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  16444039 ccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattt 16443940  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443939 tctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacatt 16443841  T
Q  347 caaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  16443840 caaacgaaacatgcatgagcgag 16443818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 365
Target Start/End: Original strand, 10847557 - 10847905
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||||||||   || | |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10847557 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 10847656  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  10847657 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctgaaactctattttctctcta 10847756  T
Q  223 ctttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----cttttgtctattt 315  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||| |||    
T  10847757 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttt 10847856  T
Q  316 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 365  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  10847857 tg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgag 10847905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 131 - 373
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26595996
Alignment:
Q  131 tgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttca 228  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttca 26595849  T
Q  229 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26595850 aagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 26595949  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26595950 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagta 26595996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10911078 - 10910741
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||| ||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10911078 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaag 10910979  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  10910978 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 10910879  T
Q  228 aaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||      ||||||||||||    
T  10910878 aaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt------ttttgaaaagca 10910785  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10910784 aacctgagcaacatggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 10910741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16512569 - 16512255
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16512569 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 16512470  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16512469 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttt 16512370  T
Q  250 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||  |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16512369 ccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 16512277  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  16512276 aaatgaaatatgcatgagcgag 16512255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26532005 - 26531926
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 130  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532005 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Original strand, 14104531 - 14104882
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14104531 catcttcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 14104630  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||    
T  14104631 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctgttttctttcta 14104730  T
Q  223 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14104731 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 14104830  T
Q  322 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14104831 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagta 14104882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 39856630 - 39856975
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856630 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 39856729  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39856730 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactct-tttttcttctactttc 39856828  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39856829 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 39856928  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856929 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 39856975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 30759757 - 30760102
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759757 tcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 30759856  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  30759857 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttc 30759955  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30759956 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 30760055  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30760056 cctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 30760102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33668073 - 33667728
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668073 tcatcaaaagctcctacacttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33667974  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  33667973 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttc 33667875  T
Q  228 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaa 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33667874 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 33667775  T
Q  327 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667774 cctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 33667728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34183182 - 34182893
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34183182 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatc 34183083  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183082 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 34182983  T
Q  280 acaaaca-ttttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34182982 acaaacatttttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 34182893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20332672 - 20332347
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20332672 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 20332573  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20332572 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattt 20332473  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332472 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 20332373  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  20332372 aaatgaaacatgcatgagtgagagta 20332347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40099886 - 40099561
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  40099886 gaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 40099787  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099786 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 40099687  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099686 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 40099587  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  40099586 aaatgaaacatgcatgagtgagagta 40099561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27157586 - 27157237
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157586 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27157487  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27157486 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 27157387  T
Q  226 tcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagc 323  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27157386 tcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 27157287  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27157286 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagta 27157237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 54839407 - 54839730
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  54839407 gaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 54839506  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54839507 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttc 54839605  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54839606 cttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattca 54839705  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  54839706 aatgaaacatgcatgagcgagagta 54839730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Original strand, 5700585 - 5700880
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacat 178  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5700585 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacat 5700684  T
Q  179 caatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700685 caatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttga 5700783  T
Q  279 aacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700784 aacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 5700880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36338738 - 36338455
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338738 ttactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 36338639  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  36338638 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaa 36338539  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36338538 acaaacattttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 36338455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18794889 - 18794542
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| |  ||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794889 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18794790  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18794789 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 18794691  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18794690 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 18794591  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794590 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 18794542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24586634 - 24586286
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  | ||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24586634 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 24586535  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactt 225  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24586534 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactt 24586435  T
Q  226 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24586434 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 24586335  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586334 aacctgagcaatagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 24586286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14753713 - 14753423
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753713 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 14753614  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753613 aatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 14753515  T
Q  280 acaaaca--ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14753514 acaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 14753423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 35 - 369
Target Start/End: Original strand, 21975704 - 21976040
Alignment:
Q  35 aagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 134  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||  ||  | || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975704 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 21975803  T
Q  135 aatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcta 234  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  21975804 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 21975903  T
Q  235 tatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21975904 tatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgag 21976003  T
Q  333 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21976004 caacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 21976040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Original strand, 24118708 - 24118998
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118708 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 24118807  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118808 aatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 24118907  T
Q  280 acaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24118908 acaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 24118998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31120726 - 31120439
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120726 gtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt 31120627  T
Q  185 gagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 283  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120626 gagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaa 31120527  T
Q  284 acattttgaaaattgaaaa-cttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31120526 acattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgag 31120439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 5011870 - 5012218
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||   |||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5011870 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 5011969  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5011970 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctacttt 5012069  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5012070 caaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagca 5012169  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5012170 aacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagta 5012218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Original strand, 6575907 - 6576190
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575907 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 6576006  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6576007 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaa 6576106  T
Q  280 acaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6576107 acaaacattttgaaaattgaaaaagttt-----ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 6576190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Original strand, 1906268 - 1906593
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1906268 gaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtatatctgtggagtcacg 1906367  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatataca----aaacat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| || ||||    ||||||    
T  1906368 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaagaaacat 1906467  T
Q  247 tttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1906468 tttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 1906566  T
Q  343 cattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1906567 cattcaaacgaaacatgcatgagcgag 1906593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 125 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324246
Alignment:
Q  125 aagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 36324385  T
Q  225 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||     ||||||||||||    
T  36324384 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagca 36324290  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36324289 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 36324246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15276909 - 15276562
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||||||||   || | |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15276909 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 15276810  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  15276809 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctctcta 15276710  T
Q  223 ctttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----cttttgtctatttt 316  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||| ||||    
T  15276709 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgtttt 15276610  T
Q  317 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 365  Q
    | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  15276609 g-aaagtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgag 15276562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 52 - 369
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674199
Alignment:
Q  52 aattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgc 151  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  152 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacatttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| || |||  |||| |||||    
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatatttt 1674076  T
Q  250 ctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1674077 ctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacat 1674175  T
Q  346 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  1674176 tcaaacgaaacatgcatgagcgag 1674199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15380487 - 15380167
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15380487 gaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 15380388  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  15380387 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattt 15380288  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15380287 tctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagcaagcctgagcaacaaggtacattc 15380189  T
Q  348 aaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  15380188 aaacgaaacgtgcatgagcgag 15380167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Original strand, 15233832 - 15234156
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  15233832 gaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtagagtcacg 15233931  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  15233932 ccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaatttc 15234031  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-------cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 343  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||        |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15234032 tttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgggcaacagggtac 15234130  T
Q  344 attcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15234131 attcaaacgaaacatgcatgagcgag 15234156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 17019045 - 17019384
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17019045 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaa 17019144  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||  || ||||||    
T  17019145 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 17019244  T
Q  227 c-aaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagc 323  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||     |||||||||||    
T  17019245 caaaagctatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagc 17019339  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17019340 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 17019384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 14671009 - 14671349
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14671009 tcatcaaaagctcctacgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14671108  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  || ||||||    
T  14671109 gctttgtaaatccgtggagttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 14671208  T
Q  227 caaagctatatacaa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagc 323  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||     |||||||||||    
T  14671209 caaagttatgtacaagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt-----ttttgaaaagc 14671303  T
Q  324 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14671304 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 14671349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 12041 - 12364
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12041 gaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 12140  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12141 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatataaaacatttt 12239  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12240 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 12339  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12340 aatgaaacatgcatgagcgagagta 12364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3458 - 3104
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||| ||||   || ||||||||||| |||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3458 catcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 3359  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttctt 219  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||    
T  3358 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 3259  T
Q  220 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttga 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3258 ctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttga 3159  T
Q  319 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3158 aaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 3104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 192 - 373
Target Start/End: Original strand, 17952 - 18137
Alignment:
Q  192 tgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 288  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17952 tgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18051  T
Q  289 ttgaaaattgaaaa-cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18052 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 18137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 13931 - 14279
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13931 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14030  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14031 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 14130  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagca 324  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  14131 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagca 14230  T
Q  325 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14231 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 14279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 18567 - 18916
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18567 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 18666  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18667 gctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctacttt 18765  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18766 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 18865  T
Q  323 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18866 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 18916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9148 - 8854
Alignment:
Q  80 ttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatc 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9148 ttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatc 9049  T
Q  180 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9048 aatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaa 8950  T
Q  280 acaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    || |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8949 acgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 8854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 51 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4855 - 4532
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtca 148  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  | |||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4855 gaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtca 4756  T
Q  149 cgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4755 cgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacatt 4656  T
Q  248 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4655 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacat 4556  T
Q  346 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4555 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 4532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Original strand, 9919 - 10242
Alignment:
Q  51 gaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  9919 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgaagtcacg 10018  T
Q  151 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10019 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaacattttc 10117  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 348  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10118 cttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 10217  T
Q  349 aatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  10218 aatgaaacatgcataagcgagagta 10242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Original strand, 33336 - 33619
Alignment:
Q  85 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33336 gtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 33435  T
Q  184 tgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaac 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  33436 tgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaac 33535  T
Q  282 aaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||   | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33536 aaacatcttgaaaattgaaaaagttt---tttttgtaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 33619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 50 - 373
Target Start/End: Original strand, 1661 - 1986
Alignment:
Q  50 tgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtca 148  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1661 tgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtca 1760  T
Q  149 cgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1761 cgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattt 1859  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 346  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  1860 tccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgat 1959  T
Q  347 caaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1960 caaatgaaacatgcatgagcgagagta 1986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 12023 - 12382
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12023 catcttcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 12122  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaa-tttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||    
T  12123 ccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttct 12222  T
Q  222 actttcaaagctat-----------atacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--cttttg 308  Q
    ||||||||||||||           | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||    
T  12223 actttcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttg 12322  T
Q  309 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12323 tctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 12382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 15551 - 15905
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15650  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15651 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 15749  T
Q  227 caaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttg- 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15750 caaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 15849  T
Q  318 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15850 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 15905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 25092 - 25448
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||||||||   || |  ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25092 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 25191  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 222  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  25192 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttgaaactctactttctttcta 25291  T
Q  223 ctttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--------cttttgtct 311  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         ||||||||    
T  25292 ctttcaaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtct 25391  T
Q  312 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25392 gttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 25448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 369
Target Start/End: Original strand, 6048 - 6388
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 126  Q
    |||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||  ||  | || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6048 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaa 6147  T
Q  127 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||    
T  6148 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttacttt 6247  T
Q  227 caaagctatat--acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaag 322  Q
    ||||| ||| |  | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||      ||||||||||    
T  6248 caaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt------ttttgaaaag 6341  T
Q  323 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6342 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 6388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 87 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25115 - 24835
Alignment:
Q  87 gttcaatgtatcaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttg 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115 gttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttg 25016  T
Q  186 agcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaaca 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||    
T  25015 agcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaaca 24916  T
Q  283 aacattttgaaaattgaaaacttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 369  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24915 aacatcttgaaaattgaaaattttt-----ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 24835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 209
Target Start/End: Original strand, 359 - 540
Alignment:
Q  28 tcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 127  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  359 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 458  T
Q  128 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactc 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  459 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactc 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26410 - 26245
Alignment:
Q  23 catcatcatcagaagcttctacactcgtgaattcaaagtttccaggaaacatagcggttaccgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 122  Q
    |||| |||||||||||||||   || |  ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  26410 catcttcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttt 26311  T
Q  123 ccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 188  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26310 tcaagctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagc 26245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 259 - 366
Target Start/End: Original strand, 1 - 109
Alignment:
Q  259 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  357 atgcatgagc 366  Q
    ||||||||||    
T  100 atgcatgagc 109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40855 - 40759
Alignment:
Q  93 tgtatcaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatctgt-ggagtcacgccttcggct-gaccaccactcttatacatcaattt 184  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40855 tgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggagtcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40559
Alignment:
Q  323 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgag 40559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University