View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4117_low_5 (Length: 358)

Name: NF4117_low_5
Description: NF4117
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4117_low_5
NF4117_low_5
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (19-341)||(48911929-48912251)
chr4 (87-338)||(48958420-48958671)
chr4 (53-332)||(48965608-48965887)
chr4 (71-278)||(48962627-48962834)
chr4 (118-289)||(48951556-48951727)
[»] scaffold0536 (3 HSPs)
scaffold0536 (28-338)||(6104-6414)
scaffold0536 (49-333)||(10109-10391)
scaffold0536 (134-289)||(1164-1319)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (53-332)||(12589787-12590066)
chr6 (134-320)||(12483163-12483349)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (74-334)||(28385611-28385871)
chr5 (74-329)||(12540967-12541222)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (86-291)||(13440520-13440725)
chr2 (87-245)||(13448729-13448887)
chr2 (87-291)||(13455154-13455358)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (76-192)||(12641122-12641238)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 48911929 - 48912251
Alignment:
Q  19 agtaaattgttggaagcgcttcttgagacagttttcaaaagtaacggaatccttgtcaacaattttgctgaacttgacggtgaagagtatatcgaacact 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48911929 agtaaattattggaagcgcttcttgagacagttttcaaaagtaacggaatccttgtcaacaattttgctgaacttgacggtgaagagtatatcgaacact 48912028  T
Q  119 acgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcgcacaactattcaagagaaagcacagagaggagaagagagtgttgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  48912029 acgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcgcagaactattcaagagaaggctgagagaggagaagagagtgttgt 48912128  T
Q  219 gagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48912129 gagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtggtgtacatatgctttggaagccaatgtcatttttcggataaacaactt 48912228  T
Q  319 tatgagattgcgtgcgggattga 341  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  48912229 tatgagattgcgtgcgggattga 48912251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48958671 - 48958420
Alignment:
Q  87 tgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcgcacaactattcaa 186  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||    
T  48958671 tgaacttgatggtgaagagtgcatcgaacactacaagaaaatcacgggtcacaaggtttggcatcttggtcctgcttctcttattcgccaaaccattcaa 48958572  T
Q  187 gagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtggtgtacatatgctttg 286  Q
    |||||| || |||| ||| | |||| |||||| |||||||| |  ||| |||||||||| |||| |||   | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  48958571 gagaaatcagagaggggaaatgagaatgttgttagtgtgcatggttgtctgagttggctcaacttgaagagacataactcagtgttgtacatatgctttg 48958472  T
Q  287 gaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggat 338  Q
    |||||  |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48958471 gaagcatatgttatttatctgataaacaactttatgagattgcgtgtgggat 48958420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48965887 - 48965608
Alignment:
Q  53 tcaaaagtaacggaatccttgtcaacaattttgctgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatct 152  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  || | || | ||  |  ||  |||| || |||||||||||    
T  48965887 tcaaaagtaatggactcattgtcaacaatttcgctgagcttgacggggaagagtacattaaatattatgtgagtagcacgggtcataaggcttggcatct 48965788  T
Q  153 tggtccagcttctcttattcgcacaactattcaagagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaactcg 252  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||     
T  48965787 tggtccagcttctcttattcgtaaaactgttcaagagaaagcagagaggggacaagagagtgcagtgagcgtgcaagagtgtttgagttggctcaattcc 48965688  T
Q  253 aaacaagataactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtg 332  Q
    || | | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  48965687 aagcgacataactcagtgttgtacataagctttggaagcctctgtcgttatcaggataaacagctttatgagattgcgtg 48965608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 48962834 - 48962627
Alignment:
Q  71 ttgtcaacaattttgctgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttat 170  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48962834 ttgtcaacaacttcgctgaacttgacggtgaagagtgcatcgaacactacgagaaaaccacgggtcacaaggcttggcatctcggtccagtttctcttat 48962735  T
Q  171 tcgcacaactattcaagagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtg 270  Q
    ||||| | |  |||||||||||||| | || ||| | |||||||||||| | || || |||||| || | |||||||| || || | | ||||||| |||    
T  48962734 tcgcaaatccgttcaagagaaagcagaaaggggacatgagagtgttgtgggcgtacaagagtgtctgtggtggcttaattcaaagcgacataactcagtg 48962635  T
Q  271 gtgtacat 278  Q
     |||||||    
T  48962634 ttgtacat 48962627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 48951727 - 48951556
Alignment:
Q  118 tacgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcgcacaactattcaagagaaagcacagagaggagaagagagtgttg 217  Q
    ||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||  || || |       
T  48951727 tacgagaaaaccatcggtcacaaggcttggcatcttggtccggcctctcttgttcgcaaaactactcaagagaaggcaaatagaggaggggaaagcgaaa 48951628  T
Q  218 tgagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtggtgtacatatgctttggaa 289  Q
    |||| |||||  ||| ||||| |||| | |||||||| ||||||||||| ||| | |||||  |||||||||    
T  48951627 tgagcgtgcaaaagtatttgaattggttgaactcgaagcaagataactcagtgctttacattagctttggaa 48951556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0536 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0536
Description:

Target: scaffold0536; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 338
Target Start/End: Original strand, 6104 - 6414
Alignment:
Q  28 ttggaagcgcttcttgagacagttttcaaaagtaacggaatccttgtcaacaattttgctgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaa 127  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6104 ttggaagcgcttttggagacggttttcaaaagcaacggaatcattgttaacaatttttctgaacttgacggtgaagagtacatcgaacactacgagaaaa 6203  T
Q  128 ctacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcgcacaactattcaagagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgca 227  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||    
T  6204 ctacaggtcacaaagcttggcatcttggtccggcttctcttattcgtagaactgttcaagaaaaagcacagaggggacaacaaagtgttgtgagtgtgca 6303  T
Q  228 cgagtgtttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagatt 327  Q
     |||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  6304 tgagtgtctgagttggctagactcgaagccagataactcagtgttgtacatatgctttggaagcttatgccttttcccggataaacaactttacgagatt 6403  T
Q  328 gcgtgcgggat 338  Q
    || || |||||    
T  6404 gcatgtgggat 6414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0536; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 333
Target Start/End: Original strand, 10109 - 10391
Alignment:
Q  49 gttttcaaaagtaacggaatccttgtcaacaattttgctgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaactacttgtcacaaagcttggc 148  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||  |||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  10109 gttttcaaaagtcaagggatccttgtcaataattttgtagaacttgacggtaaatagcacatcgaacactacaagaaaactacgggtcagaaagcttggc 10208  T
Q  149 atcttggtccagcttctcttattcgcacaactattcaagagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaa 248  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10209 atcttagtccagcttatcttgttcgtagaactgttcaagagaaaacagagagaggagaacagagtgttgtgagtgtgcatgagtgtctgagttggcttaa 10308  T
Q  249 ctcgaaacaagataactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgc 333  Q
    || ||| | |||||  || ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10309 cttgaagcgagata--tcagtgttgtacatttgctttggaagcctatgttatttttcagataaacaactttatgagattgcgtgc 10391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0536; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Original strand, 1164 - 1319
Alignment:
Q  134 gtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcgcacaactattcaagagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtg 233  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||| | || |||||| ||||     ||||||||||  |||     
T  1164 gtcacaaggcttggcttcttggcccagcatctcttgttcgcaaaaccactcaagagaaagcaaataggggagaaaagagcacgttgagtgtgcaaaagtt 1263  T
Q  234 tttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtggtgtacatatgctttggaa 289  Q
     || | |||||| ||||| || | ||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  1264 cttaacttggctcaactcaaagcgagataactcagtactctacatatgctttggaa 1319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 332
Target Start/End: Original strand, 12589787 - 12590066
Alignment:
Q  53 tcaaaagtaacggaatccttgtcaacaattttgctgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatct 152  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||  |||||| | || ||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  12589787 tcaaaagtaatggactcattgttaacaacttcgctgaacttgatggccaagagtgtgtcaaacactatgagaaaaccacaggtcacaaggcttggcatct 12589886  T
Q  153 tggtccagcttctcttattcgcacaactattcaagagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaactcg 252  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  12589887 tggtccagcttctcttattcacaaaactgttcaagagaaagcagataggggaaatgagagtgttgtgaacgtgcaagagtgtctgagttggctaaactcg 12589986  T
Q  253 aaacaagataactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtg 332  Q
    || | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12589987 aagcgagataactctgtgttgtacatatgctttgggagcatatgctatttctcagataaacaactttatgagatttcgtg 12590066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 320
Target Start/End: Original strand, 12483163 - 12483349
Alignment:
Q  134 gtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcgcacaactattcaagagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtg 233  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||  ||| |||||| |   |||| ||||||| || ||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  12483163 gtcacaaggcttggcatttaggtccacattcacttatttgtgaaactgttcaagaaaaggcagagaggggaaacgagagtgttgtgagcgtgcatgagtg 12483262  T
Q  234 tttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaacttta 320  Q
    |   |||||||| ||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||||| |||| |||  |||| || |||||||| |||||    
T  12483263 tcaaagttggctaaactcaaagcaagaaaattcagtgttgtacatatgctttgggagcctatgcaatttctctgataaacagcttta 12483349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28385871 - 28385611
Alignment:
Q  74 tcaacaattttgctgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcg 173  Q
    ||||||| |||| ||||||||| || ||||||| | || |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  28385871 tcaacaactttgttgaacttgatggagaagagtgtgtcaaacactacgagaaaaccacgggtcacaaggcttggcatcttggtccaacttcctttattcg 28385772  T
Q  174 cacaactattcaagagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtggtg 273  Q
     | |||| |||||||||||||| |||  ||| |  |||||| |||||| | |||||||||  |||  ||||| || ||  | | || |||||| || |||    
T  28385771 taaaactgttcaagagaaagcagagaagggaaacaagagtgatgtgagcgagcacgagtgcctgaactggctcaaatcacagcgagttaactcagttgtg 28385672  T
Q  274 tacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcg 334  Q
    |||||||| |||||||||  |   ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28385671 tacatatgttttggaagcataaaccatttctctgataaacaactatatgagattgcatgcg 28385611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12541222 - 12540967
Alignment:
Q  74 tcaacaattttgctgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcg 173  Q
    ||||||| |||| ||||||||| || ||||||| | || |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  12541222 tcaacaactttgttgaacttgatggagaagagtgtgtccaacactacgagaaaaccacgggtcacaaggcttggcatcttggtccaacttcttttattca 12541123  T
Q  174 cacaactattcaagagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtggtg 273  Q
     | ||  |||||||||||||||  ||| ||| | ||| ||| || ||| | ||||||||   | || ||||| |||||  | |||| |||||| ||||||    
T  12541122 gaaaaacattcaagagaaagcagggaggggaaatgagggtgctgcgagcgagcacgagtcccttagctggctcaactcacagcaagttaactcagtggtg 12541023  T
Q  274 tacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgc 329  Q
    |||||||| |||||||||  |  |||||| |  || |||||||| |||||||||||    
T  12541022 tacatatgttttggaagcataaatcatttctttgacaaacaactatatgagattgc 12540967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13440725 - 13440520
Alignment:
Q  86 ctgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcgcacaactattca 185  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||| ||  ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |||||    
T  13440725 ctgaacttgacggagaagagtgcatccaacactatgagaaaaccacgggtcacaaggtttggcatctcggtccaacttctcttattcgtaaaaccattca 13440626  T
Q  186 agagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtggtgtacatatgcttt 285  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||| ||| |||||   ||||||| ||  ||||||||||  ||||  |  ||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  13440625 agagaaagcagagaggggaaaggagggtgatgtgaacatgcacgaatgcatgagttggctcgactcagagaaagttaactcggtgttgtacatatgtttt 13440526  T
Q  286 ggaagc 291  Q
    ||||||    
T  13440525 ggaagc 13440520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13448887 - 13448729
Alignment:
Q  87 tgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcgcacaactattcaa 186  Q
    ||||||||| || |||||||  ||  |||||||||||||| | ||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  13448887 tgaacttgatggagaagagtgcatacaacactacgagaaagccacgggtcacaaggtttggcatcttggtccaacttctcttattcgcaaaactgctcaa 13448788  T
Q  187 gagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtgtttgagttggct 245  Q
    |||||| || |||| ||| | ||| ||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  13448787 gagaaatcagagaggggaaatgagggtgctgtgaatgtgcacgagagcctgagttggct 13448729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13455358 - 13455154
Alignment:
Q  87 tgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcgcacaactattcaa 186  Q
    |||| |||| || |||||||  ||| |||||||||| ||||| ||  ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||    
T  13455358 tgaatttgatggagaagagtgcatccaacactacgaaaaaacaacaggtcacaaggtttggcatattggtccaacttctcttatttgcagaaccgttcaa 13455259  T
Q  187 gagaaagcacagagaggagaagagagtgttgtgagtgtgcacgagtgtttgagttggcttaactcgaaacaagataactcggtggtgtacatatgctttg 286  Q
    || ||| || |||| ||| | |||  | |||||| ||| ||||||||  |||| |||||| |||| ||   || |||||| ||  |||||||||| ||||    
T  13455258 gaaaaatcagagaggggaaacgaggtttttgtgaatgtacacgagtgcctgagctggcttgactcaaagagagttaactcagtattgtacatatgttttg 13455159  T
Q  287 gaagc 291  Q
    |||||    
T  13455158 gaagc 13455154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 192
Target Start/End: Original strand, 12641122 - 12641238
Alignment:
Q  76 aacaattttgctgaacttgacggtgaagagtatatcgaacactacgagaaaactacttgtcacaaagcttggcatcttggtccagcttctcttattcgca 175  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||| |  ||| ||||||| |||||||| |   || |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12641122 aacaactttgttgaacttgatggtgaagattgcatcaaacactatgagaaaaccatgggttacaaggcttggcatcttggtccaacttgtcttattcgca 12641221  T
Q  176 caactattcaagagaaa 192  Q
     |||| || ||||||||    
T  12641222 aaacttttgaagagaaa 12641238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University