View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4118_high_9 (Length: 315)

Name: NF4118_high_9
Description: NF4118
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4118_high_9
NF4118_high_9
[»] chr2 (82 HSPs)
chr2 (118-314)||(27395001-27395197)
chr2 (118-306)||(27779673-27779861)
chr2 (118-306)||(27819430-27819618)
chr2 (118-306)||(39893508-39893696)
chr2 (118-306)||(9346603-9346791)
chr2 (118-306)||(13933164-13933352)
chr2 (118-306)||(21673792-21673980)
chr2 (118-304)||(27119963-27120149)
chr2 (118-306)||(11631801-11631989)
chr2 (118-314)||(27827899-27828095)
chr2 (118-306)||(40236947-40237135)
chr2 (7-120)||(27394789-27394902)
chr2 (118-306)||(257270-257458)
chr2 (118-306)||(12590247-12590435)
chr2 (118-306)||(19413118-19413306)
chr2 (118-306)||(31879725-31879913)
chr2 (118-306)||(32053242-32053430)
chr2 (118-306)||(34294593-34294781)
chr2 (118-306)||(37682512-37682700)
chr2 (118-306)||(37697777-37697965)
chr2 (118-306)||(37928808-37928996)
chr2 (118-306)||(3785932-3786120)
chr2 (118-306)||(16825955-16826143)
chr2 (118-306)||(16895337-16895525)
chr2 (118-306)||(31890108-31890296)
chr2 (118-306)||(34865123-34865311)
chr2 (125-306)||(22924765-22924946)
chr2 (141-306)||(34158306-34158471)
chr2 (118-306)||(27807142-27807330)
chr2 (118-306)||(20841352-20841540)
chr2 (118-306)||(21699788-21699976)
chr2 (118-306)||(39048436-39048624)
chr2 (118-306)||(12658975-12659163)
chr2 (118-306)||(12713218-12713406)
chr2 (118-303)||(19453043-19453228)
chr2 (118-306)||(23125185-23125373)
chr2 (118-306)||(27431058-27431246)
chr2 (118-306)||(37381116-37381304)
chr2 (118-280)||(28885646-28885808)
chr2 (5-120)||(23125472-23125587)
chr2 (118-306)||(37948479-37948667)
chr2 (5-107)||(37948779-37948881)
chr2 (118-306)||(16164919-16165107)
chr2 (5-120)||(20841138-20841253)
chr2 (5-120)||(34294379-34294494)
chr2 (5-107)||(27806928-27807030)
chr2 (13-120)||(27431345-27431452)
chr2 (5-120)||(28885432-28885547)
chr2 (10-120)||(12658766-12658876)
chr2 (5-107)||(39048736-39048838)
chr2 (5-120)||(12590033-12590148)
chr2 (5-95)||(257582-257672)
chr2 (5-107)||(13933464-13933566)
chr2 (5-116)||(11632092-11632203)
chr2 (13-116)||(19453331-19453434)
chr2 (5-120)||(39893294-39893409)
chr2 (5-107)||(40236733-40236835)
chr2 (10-107)||(31879516-31879613)
chr2 (5-120)||(9346890-9347005)
chr2 (5-120)||(12713505-12713620)
chr2 (5-120)||(19413405-19413520)
chr2 (5-120)||(34864909-34865024)
chr2 (5-120)||(37682799-37682914)
chr2 (5-120)||(37698064-37698179)
chr2 (5-120)||(37928594-37928709)
chr2 (10-120)||(16826242-16826352)
chr2 (10-120)||(16895128-16895238)
chr2 (10-120)||(32053033-32053143)
chr2 (32-116)||(21700079-21700163)
chr2 (5-120)||(21674079-21674194)
chr2 (5-116)||(37380902-37381013)
chr2 (119-294)||(34534072-34534247)
chr2 (125-297)||(42393981-42394153)
chr2 (119-294)||(26723905-26724080)
chr2 (155-297)||(34701552-34701694)
chr2 (214-306)||(34271537-34271629)
chr2 (125-303)||(12384106-12384284)
chr2 (155-313)||(21760225-21760383)
chr2 (125-303)||(22949839-22950017)
chr2 (221-306)||(28885821-28885906)
chr2 (52-114)||(12383932-12383994)
chr2 (52-114)||(22949665-22949727)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (118-314)||(15387998-15388194)
chr4 (118-306)||(39854090-39854278)
chr4 (118-306)||(5009328-5009516)
chr4 (118-306)||(36341145-36341333)
chr4 (7-120)||(15388293-15388406)
chr4 (118-306)||(6573311-6573499)
chr4 (118-306)||(18797242-18797430)
chr4 (118-306)||(31123140-31123328)
chr4 (118-306)||(54836844-54837032)
chr4 (118-306)||(1903707-1903895)
chr4 (118-306)||(14101996-14102184)
chr4 (118-306)||(21973154-21973342)
chr4 (118-306)||(27159945-27160133)
chr4 (118-306)||(30757213-30757401)
chr4 (118-306)||(40102265-40102453)
chr4 (118-306)||(15281565-15281753)
chr4 (118-306)||(20335049-20335237)
chr4 (118-306)||(33670428-33670616)
chr4 (125-306)||(15231332-15231513)
chr4 (118-291)||(34185603-34185776)
chr4 (118-306)||(14759934-14760122)
chr4 (118-306)||(17016499-17016687)
chr4 (118-306)||(18313806-18313994)
chr4 (118-306)||(24116115-24116303)
chr4 (118-306)||(24588989-24589177)
chr4 (118-291)||(14668469-14668642)
chr4 (5-120)||(14760221-14760336)
chr4 (5-120)||(14668255-14668370)
chr4 (5-120)||(17016285-17016400)
chr4 (5-120)||(24115901-24116016)
chr4 (5-120)||(24589276-24589391)
chr4 (10-120)||(34185875-34185985)
chr4 (5-120)||(6573097-6573212)
chr4 (5-116)||(15231111-15231222)
chr4 (5-120)||(20335336-20335451)
chr4 (5-107)||(18314106-18314208)
chr4 (5-107)||(18797542-18797644)
chr4 (5-107)||(27160245-27160347)
chr4 (12-116)||(1903500-1903604)
chr4 (5-116)||(5009114-5009225)
chr4 (5-120)||(36341432-36341547)
chr4 (5-120)||(54836630-54836745)
chr4 (5-107)||(39853876-39853978)
chr4 (5-120)||(14101782-14101897)
chr4 (13-116)||(15281856-15281959)
chr4 (5-107)||(40102565-40102667)
chr4 (5-120)||(30756999-30757114)
chr4 (5-120)||(31123427-31123542)
chr4 (5-120)||(33670715-33670830)
chr4 (10-120)||(21972945-21973055)
chr4 (118-276)||(22146227-22146385)
chr4 (119-294)||(1881739-1881914)
chr4 (155-297)||(14725436-14725578)
chr4 (155-297)||(19767829-19767971)
chr4 (131-297)||(12515698-12515864)
chr4 (219-313)||(55784686-55784780)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (118-291)||(22077515-22077688)
chr8 (118-306)||(33262173-33262361)
chr8 (118-314)||(18712923-18713119)
chr8 (118-306)||(28358541-28358729)
chr8 (118-306)||(9358064-9358252)
chr8 (118-314)||(12089304-12089500)
chr8 (118-306)||(19204951-19205139)
chr8 (118-306)||(31357967-31358155)
chr8 (7-120)||(22077787-22077900)
chr8 (118-306)||(29832765-29832953)
chr8 (118-306)||(44564423-44564611)
chr8 (118-306)||(15771013-15771201)
chr8 (118-306)||(19677886-19678074)
chr8 (118-306)||(27605494-27605682)
chr8 (118-280)||(19691537-19691699)
chr8 (118-280)||(21344786-21344948)
chr8 (118-306)||(2133849-2134037)
chr8 (118-306)||(14561063-14561251)
chr8 (118-306)||(18794143-18794331)
chr8 (118-306)||(31486460-31486648)
chr8 (5-120)||(27605781-27605896)
chr8 (5-120)||(14560849-14560964)
chr8 (5-120)||(18793929-18794044)
chr8 (5-120)||(2134136-2134251)
chr8 (10-120)||(19691328-19691438)
chr8 (5-120)||(29832551-29832666)
chr8 (10-120)||(9357855-9357965)
chr8 (5-120)||(18712709-18712824)
chr8 (5-120)||(28358828-28358943)
chr8 (10-120)||(33261964-33262074)
chr8 (5-120)||(19677672-19677787)
chr8 (5-107)||(31357753-31357855)
chr8 (5-107)||(31486760-31486862)
chr8 (5-120)||(12089599-12089714)
chr8 (5-116)||(19205242-19205353)
chr8 (208-314)||(19657922-19658028)
chr8 (125-298)||(19844613-19844786)
chr8 (125-297)||(14212485-14212657)
chr8 (119-294)||(16768763-16768938)
chr8 (155-297)||(22412414-22412556)
chr8 (208-306)||(33245898-33245996)
chr8 (5-72)||(16286626-16286694)
chr8 (22-113)||(19844409-19844500)
[»] chr5 (112 HSPs)
chr5 (118-306)||(43081702-43081890)
chr5 (118-306)||(3792988-3793176)
chr5 (118-306)||(9320923-9321111)
chr5 (118-306)||(12135622-12135810)
chr5 (118-306)||(40470075-40470263)
chr5 (118-306)||(26483841-26484029)
chr5 (118-306)||(28652689-28652877)
chr5 (118-306)||(31434911-31435099)
chr5 (118-306)||(31822932-31823120)
chr5 (118-306)||(8662000-8662188)
chr5 (118-306)||(13321355-13321543)
chr5 (118-306)||(18497250-18497438)
chr5 (118-306)||(29887722-29887910)
chr5 (118-306)||(30155478-30155666)
chr5 (118-306)||(33519827-33520015)
chr5 (118-314)||(37355160-37355356)
chr5 (118-306)||(37668011-37668199)
chr5 (118-306)||(2514509-2514697)
chr5 (118-314)||(22891910-22892106)
chr5 (118-306)||(30032875-30033063)
chr5 (118-306)||(33878577-33878765)
chr5 (118-306)||(34619965-34620153)
chr5 (118-306)||(37767516-37767704)
chr5 (118-306)||(18372059-18372247)
chr5 (118-306)||(23629417-23629605)
chr5 (118-306)||(24586821-24587009)
chr5 (118-306)||(25203725-25203913)
chr5 (118-306)||(25267880-25268068)
chr5 (118-306)||(32592799-32592987)
chr5 (118-306)||(24727416-24727604)
chr5 (118-306)||(30938082-30938270)
chr5 (118-306)||(33295975-33296163)
chr5 (118-306)||(33780936-33781124)
chr5 (118-306)||(41678152-41678340)
chr5 (118-303)||(15655286-15655471)
chr5 (118-306)||(11552802-11552990)
chr5 (118-306)||(13183318-13183506)
chr5 (118-306)||(13439208-13439396)
chr5 (118-279)||(18124968-18125129)
chr5 (118-279)||(24684697-24684858)
chr5 (118-306)||(6877752-6877940)
chr5 (118-306)||(11327084-11327272)
chr5 (118-306)||(15755377-15755565)
chr5 (118-306)||(22995642-22995830)
chr5 (118-306)||(24973353-24973541)
chr5 (118-306)||(28956310-28956498)
chr5 (118-306)||(5641235-5641423)
chr5 (118-306)||(9547234-9547422)
chr5 (118-306)||(30171916-30172104)
chr5 (118-306)||(37758430-37758618)
chr5 (5-120)||(33780722-33780837)
chr5 (5-120)||(11552588-11552703)
chr5 (5-120)||(15655570-15655685)
chr5 (5-120)||(22995929-22996044)
chr5 (5-120)||(33295761-33295876)
chr5 (5-120)||(41677938-41678053)
chr5 (5-107)||(40470375-40470477)
chr5 (5-120)||(23629203-23629318)
chr5 (5-120)||(24684957-24685072)
chr5 (5-120)||(34619751-34619866)
chr5 (5-120)||(37355455-37355570)
chr5 (5-107)||(30937868-30937970)
chr5 (5-120)||(3792774-3792889)
chr5 (5-120)||(28652475-28652590)
chr5 (5-120)||(31434697-31434812)
chr5 (5-120)||(32593086-32593201)
chr5 (5-120)||(43081488-43081603)
chr5 (5-107)||(18497550-18497652)
chr5 (5-120)||(2514295-2514410)
chr5 (5-120)||(6877538-6877653)
chr5 (5-120)||(13321642-13321757)
chr5 (5-120)||(18372346-18372461)
chr5 (13-120)||(23895447-23895554)
chr5 (5-120)||(24973139-24973254)
chr5 (5-120)||(37767803-37767918)
chr5 (5-107)||(28956610-28956712)
chr5 (5-107)||(30171702-30171804)
chr5 (5-98)||(30032661-30032754)
chr5 (5-120)||(5641021-5641136)
chr5 (5-120)||(8662287-8662402)
chr5 (5-120)||(24586607-24586722)
chr5 (5-120)||(24727202-24727317)
chr5 (13-116)||(25203519-25203622)
chr5 (13-116)||(25267674-25267777)
chr5 (5-120)||(30155264-30155379)
chr5 (5-120)||(31823219-31823334)
chr5 (5-120)||(33519613-33519728)
chr5 (5-120)||(37668298-37668413)
chr5 (5-120)||(37758216-37758331)
chr5 (16-116)||(22891707-22891807)
chr5 (5-116)||(9320709-9320820)
chr5 (5-116)||(12135408-12135519)
chr5 (5-120)||(15755664-15755779)
chr5 (5-116)||(26483627-26483738)
chr5 (118-276)||(351770-351928)
chr5 (125-297)||(3483737-3483909)
chr5 (119-267)||(20388553-20388701)
chr5 (125-303)||(11943950-11944128)
chr5 (125-303)||(15784253-15784431)
chr5 (125-297)||(31520761-31520933)
chr5 (125-297)||(5439759-5439931)
chr5 (155-298)||(34469106-34469249)
chr5 (155-297)||(17957581-17957723)
chr5 (52-114)||(5440043-5440105)
chr5 (52-114)||(11944240-11944302)
chr5 (52-114)||(15784543-15784605)
chr5 (52-114)||(17957376-17957438)
chr5 (125-303)||(36375490-36375668)
chr5 (52-114)||(36375780-36375842)
chr5 (125-303)||(37000144-37000322)
chr5 (52-114)||(37000434-37000496)
chr5 (50-98)||(34468900-34468948)
[»] scaffold0143 (5 HSPs)
scaffold0143 (118-306)||(7400-7588)
scaffold0143 (118-306)||(19510-19698)
scaffold0143 (118-306)||(30733-30921)
scaffold0143 (5-120)||(30519-30634)
scaffold0143 (13-116)||(19304-19407)
[»] chr6 (87 HSPs)
chr6 (118-306)||(4761200-4761388)
chr6 (118-314)||(4528722-4528918)
chr6 (118-306)||(27358681-27358869)
chr6 (118-306)||(27449024-27449212)
chr6 (118-306)||(27626282-27626470)
chr6 (118-306)||(33373002-33373190)
chr6 (118-306)||(4776317-4776505)
chr6 (118-306)||(14141965-14142153)
chr6 (118-306)||(22455685-22455873)
chr6 (118-314)||(26112975-26113171)
chr6 (118-306)||(27011168-27011356)
chr6 (118-314)||(27286927-27287123)
chr6 (118-314)||(28210891-28211087)
chr6 (118-306)||(29504853-29505041)
chr6 (118-306)||(29576451-29576639)
chr6 (118-306)||(30554587-30554775)
chr6 (125-306)||(28163935-28164116)
chr6 (118-306)||(13520763-13520951)
chr6 (118-314)||(16677577-16677773)
chr6 (118-306)||(17089014-17089202)
chr6 (118-306)||(26789253-26789441)
chr6 (118-306)||(34461077-34461265)
chr6 (118-314)||(4542337-4542533)
chr6 (118-314)||(4720698-4720894)
chr6 (118-306)||(27060943-27061131)
chr6 (118-306)||(27197622-27197810)
chr6 (118-306)||(27251425-27251613)
chr6 (118-306)||(27488570-27488758)
chr6 (118-306)||(3699520-3699708)
chr6 (126-306)||(16753266-16753446)
chr6 (118-280)||(22931481-22931643)
chr6 (118-280)||(23853926-23854088)
chr6 (118-306)||(24867153-24867341)
chr6 (126-306)||(26921822-26922002)
chr6 (118-282)||(27179893-27180057)
chr6 (118-282)||(27269182-27269346)
chr6 (118-306)||(13295522-13295710)
chr6 (118-306)||(15420891-15421079)
chr6 (118-306)||(26775198-26775386)
chr6 (118-306)||(27022573-27022761)
chr6 (118-306)||(29552994-29553182)
chr6 (125-306)||(16940598-16940779)
chr6 (118-306)||(20171984-20172172)
chr6 (118-306)||(22163819-22164007)
chr6 (118-282)||(26992232-26992396)
chr6 (5-119)||(27287223-27287337)
chr6 (5-120)||(22931742-22931857)
chr6 (5-120)||(23854187-23854302)
chr6 (5-120)||(27179679-27179794)
chr6 (5-120)||(27269445-27269560)
chr6 (5-120)||(13295809-13295924)
chr6 (5-120)||(15421178-15421293)
chr6 (5-120)||(24866939-24867054)
chr6 (5-120)||(26921600-26921715)
chr6 (5-120)||(27022359-27022474)
chr6 (5-120)||(29552780-29552895)
chr6 (5-107)||(34461377-34461479)
chr6 (118-306)||(8902274-8902462)
chr6 (5-120)||(27626569-27626684)
chr6 (10-116)||(17089305-17089411)
chr6 (5-120)||(4760986-4761101)
chr6 (5-120)||(16677363-16677478)
chr6 (5-120)||(16753044-16753159)
chr6 (5-120)||(27010954-27011069)
chr6 (5-107)||(3699306-3699408)
chr6 (5-120)||(4528508-4528623)
chr6 (5-120)||(27060729-27060844)
chr6 (5-120)||(29576237-29576352)
chr6 (5-107)||(29504639-29504741)
chr6 (32-116)||(20171797-20171881)
chr6 (32-116)||(22164110-22164194)
chr6 (5-120)||(4542632-4542747)
chr6 (5-120)||(4720993-4721108)
chr6 (5-120)||(16940885-16941000)
chr6 (5-120)||(27488356-27488471)
chr6 (5-120)||(30554874-30554989)
chr6 (5-120)||(4776103-4776218)
chr6 (5-120)||(26113270-26113385)
chr6 (5-120)||(28210677-28210792)
chr6 (208-306)||(24302328-24302426)
chr6 (125-297)||(23971350-23971522)
chr6 (119-294)||(27545340-27545515)
chr6 (125-297)||(18119913-18120085)
chr6 (155-297)||(18212249-18212391)
chr6 (118-234)||(25707448-25707564)
chr6 (125-303)||(9135927-9136105)
chr6 (52-114)||(9136217-9136279)
[»] chr3 (125 HSPs)
chr3 (118-306)||(28112625-28112813)
chr3 (118-314)||(6539405-6539601)
chr3 (118-306)||(18246142-18246330)
chr3 (118-314)||(4420316-4420512)
chr3 (118-306)||(4627186-4627374)
chr3 (118-306)||(21678104-21678292)
chr3 (118-314)||(24331564-24331760)
chr3 (118-314)||(31961118-31961314)
chr3 (118-306)||(5017115-5017303)
chr3 (118-306)||(5593028-5593216)
chr3 (118-306)||(5605985-5606173)
chr3 (118-306)||(5714474-5714662)
chr3 (118-306)||(5725384-5725572)
chr3 (118-306)||(5766796-5766984)
chr3 (118-314)||(7999961-8000157)
chr3 (118-306)||(17992602-17992790)
chr3 (118-306)||(18228597-18228785)
chr3 (118-306)||(47026854-47027042)
chr3 (118-306)||(5470389-5470577)
chr3 (118-306)||(6205304-6205492)
chr3 (118-314)||(10646474-10646670)
chr3 (118-306)||(28024683-28024871)
chr3 (118-314)||(28342578-28342774)
chr3 (118-306)||(32294029-32294217)
chr3 (118-306)||(8215136-8215324)
chr3 (118-306)||(19697891-19698079)
chr3 (118-306)||(20573514-20573702)
chr3 (118-306)||(22867519-22867707)
chr3 (118-306)||(22882578-22882766)
chr3 (118-306)||(29661641-29661829)
chr3 (118-306)||(4687056-4687244)
chr3 (118-306)||(4725032-4725220)
chr3 (118-306)||(7076607-7076795)
chr3 (118-306)||(8286141-8286329)
chr3 (118-282)||(16621185-16621349)
chr3 (118-306)||(51785424-51785612)
chr3 (118-306)||(10399545-10399733)
chr3 (118-306)||(15737765-15737953)
chr3 (118-306)||(18334031-18334219)
chr3 (118-306)||(20069441-20069629)
chr3 (118-306)||(22384249-22384437)
chr3 (118-306)||(29145427-29145615)
chr3 (118-306)||(32442552-32442740)
chr3 (118-306)||(35884167-35884355)
chr3 (118-306)||(48469328-48469516)
chr3 (118-291)||(15889391-15889564)
chr3 (118-306)||(4343347-4343535)
chr3 (118-306)||(4793306-4793494)
chr3 (118-306)||(8299372-8299560)
chr3 (118-306)||(18304325-18304513)
chr3 (118-306)||(17981620-17981808)
chr3 (118-282)||(18054663-18054827)
chr3 (118-306)||(18273723-18273911)
chr3 (118-306)||(18289024-18289212)
chr3 (118-306)||(31032907-31033095)
chr3 (5-120)||(18054449-18054564)
chr3 (5-120)||(18333817-18333932)
chr3 (5-120)||(5593315-5593430)
chr3 (5-120)||(15738052-15738167)
chr3 (5-120)||(18274010-18274125)
chr3 (5-120)||(18289311-18289426)
chr3 (5-120)||(18304612-18304727)
chr3 (5-120)||(21677890-21678005)
chr3 (5-120)||(35883953-35884068)
chr3 (118-280)||(11107056-11107218)
chr3 (12-120)||(4793593-4793701)
chr3 (5-120)||(4686842-4686957)
chr3 (5-120)||(4724818-4724933)
chr3 (5-120)||(6205090-6205205)
chr3 (13-120)||(8286428-8286535)
chr3 (5-120)||(8299158-8299273)
chr3 (5-120)||(29145714-29145829)
chr3 (5-107)||(29661941-29662043)
chr3 (5-120)||(15889663-15889778)
chr3 (5-120)||(20069227-20069342)
chr3 (5-120)||(22384536-22384651)
chr3 (5-120)||(28024469-28024584)
chr3 (10-120)||(11107310-11107420)
chr3 (5-107)||(20573814-20573916)
chr3 (5-120)||(10399331-10399446)
chr3 (5-120)||(32442338-32442453)
chr3 (5-107)||(48469114-48469216)
chr3 (5-120)||(5606272-5606387)
chr3 (5-120)||(7076393-7076508)
chr3 (13-116)||(16621452-16621555)
chr3 (5-120)||(28112912-28113027)
chr3 (10-107)||(5016906-5017003)
chr3 (5-120)||(4343634-4343749)
chr3 (5-120)||(4420102-4420217)
chr3 (5-120)||(5470175-5470290)
chr3 (5-120)||(6539700-6539815)
chr3 (5-120)||(7999747-7999862)
chr3 (5-120)||(10646260-10646375)
chr3 (5-120)||(17981907-17982022)
chr3 (5-120)||(18228383-18228498)
chr3 (5-120)||(18245928-18246043)
chr3 (5-120)||(22867806-22867921)
chr3 (5-120)||(22882865-22882980)
chr3 (5-120)||(24331350-24331465)
chr3 (5-120)||(28342364-28342479)
chr3 (5-120)||(31961413-31961528)
chr3 (5-116)||(47026640-47026751)
chr3 (5-120)||(51785210-51785325)
chr3 (5-107)||(8214922-8215024)
chr3 (15-107)||(19697687-19697779)
chr3 (118-276)||(6963134-6963292)
chr3 (155-294)||(20443555-20443694)
chr3 (155-297)||(11925038-11925180)
chr3 (126-303)||(15592585-15592762)
chr3 (155-297)||(7088707-7088849)
chr3 (155-297)||(16431843-16431985)
chr3 (155-297)||(22959891-22960033)
chr3 (125-234)||(4446843-4446952)
chr3 (158-303)||(15918958-15919103)
chr3 (125-297)||(46380742-46380914)
chr3 (208-291)||(5653576-5653659)
chr3 (125-303)||(5950476-5950654)
chr3 (155-231)||(6571792-6571868)
chr3 (50-114)||(15592875-15592939)
chr3 (155-297)||(15704911-15705053)
chr3 (50-114)||(15918749-15918813)
chr3 (52-114)||(5950766-5950828)
chr3 (50-108)||(20443349-20443407)
chr3 (257-303)||(37260383-37260429)
chr3 (50-108)||(41440475-41440533)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (118-306)||(3644577-3644766)
chr1 (118-306)||(10966107-10966295)
chr1 (118-314)||(41789930-41790126)
chr1 (118-306)||(28588427-28588615)
chr1 (118-306)||(10948519-10948707)
chr1 (118-306)||(28153178-28153366)
chr1 (118-306)||(51641660-51641848)
chr1 (118-306)||(16204662-16204850)
chr1 (128-306)||(20464428-20464606)
chr1 (5-107)||(3644360-3644462)
chr1 (118-291)||(21894391-21894565)
chr1 (16-116)||(20339220-20339320)
chr1 (22-120)||(21894664-21894762)
chr1 (10-107)||(28588218-28588315)
chr1 (5-120)||(51641446-51641561)
chr1 (5-120)||(10948305-10948420)
chr1 (5-116)||(10965893-10966004)
chr1 (13-116)||(20464212-20464315)
chr1 (14-116)||(16204953-16205055)
chr1 (208-306)||(20337044-20337142)
chr1 (22-120)||(41790225-41790323)
chr1 (118-211)||(20339024-20339117)
chr1 (155-297)||(22489500-22489642)
chr1 (125-297)||(5628635-5628807)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (118-306)||(16748030-16748218)
chr7 (118-306)||(26271599-26271787)
chr7 (118-306)||(26316361-26316549)
chr7 (118-306)||(4202826-4203014)
chr7 (118-306)||(5143853-5144041)
chr7 (118-306)||(26512209-26512397)
chr7 (118-306)||(26666427-26666615)
chr7 (118-306)||(26681619-26681807)
chr7 (118-306)||(31560903-31561091)
chr7 (118-306)||(39209652-39209840)
chr7 (118-306)||(45390657-45390845)
chr7 (118-291)||(16446534-16446707)
chr7 (118-306)||(2776691-2776879)
chr7 (118-306)||(10845057-10845245)
chr7 (118-306)||(31127344-31127532)
chr7 (118-306)||(4141759-4141947)
chr7 (118-306)||(10842507-10842695)
chr7 (118-306)||(16514943-16515131)
chr7 (125-306)||(11421292-11421473)
chr7 (118-306)||(10913382-10913570)
chr7 (118-306)||(11444324-11444512)
chr7 (118-306)||(26516229-26516417)
chr7 (119-282)||(5131434-5131597)
chr7 (118-306)||(3448743-3448931)
chr7 (118-306)||(22145632-22145820)
chr7 (118-306)||(26438694-26438882)
chr7 (125-306)||(16044762-16044940)
chr7 (125-306)||(2106676-2106857)
chr7 (118-306)||(2158011-2158199)
chr7 (118-306)||(24589047-24589235)
chr7 (118-306)||(31087135-31087323)
chr7 (125-306)||(45734757-45734938)
chr7 (118-306)||(26534386-26534574)
chr7 (5-120)||(10913669-10913784)
chr7 (5-120)||(11421579-11421694)
chr7 (5-107)||(2157797-2157899)
chr7 (5-107)||(26438480-26438582)
chr7 (5-120)||(2106963-2107078)
chr7 (5-120)||(5131219-5131334)
chr7 (5-120)||(5144140-5144255)
chr7 (5-120)||(26271886-26272001)
chr7 (5-120)||(26534673-26534788)
chr7 (5-120)||(45390443-45390558)
chr7 (5-107)||(26516015-26516117)
chr7 (13-116)||(16044550-16044653)
chr7 (13-120)||(16515230-16515337)
chr7 (13-116)||(10844851-10844954)
chr7 (5-120)||(22145418-22145533)
chr7 (5-120)||(3448529-3448644)
chr7 (5-120)||(4142046-4142161)
chr7 (5-120)||(11444110-11444225)
chr7 (5-120)||(24589334-24589449)
chr7 (5-120)||(26666714-26666829)
chr7 (5-120)||(31561190-31561305)
chr7 (5-120)||(4202612-4202727)
chr7 (5-116)||(9621873-9621984)
chr7 (13-116)||(10842798-10842901)
chr7 (5-116)||(26316652-26316763)
chr7 (118-231)||(25726934-25727047)
chr7 (125-297)||(2556979-2557151)
chr7 (32-116)||(16446810-16446894)
chr7 (208-306)||(5161910-5162008)
chr7 (22-116)||(16748321-16748415)
chr7 (155-297)||(16127340-16127482)
chr7 (155-297)||(29089990-29090132)
chr7 (119-294)||(1893100-1893275)
chr7 (155-313)||(798029-798187)
chr7 (155-313)||(16286885-16287043)
chr7 (125-303)||(30369462-30369640)
chr7 (125-296)||(9469764-9469935)
chr7 (155-297)||(15193557-15193699)
chr7 (125-303)||(16392950-16393128)
chr7 (175-293)||(16237975-16238093)
chr7 (52-114)||(9469590-9469652)
chr7 (52-114)||(16393240-16393302)
chr7 (52-114)||(30369752-30369814)
chr7 (50-98)||(16287201-16287249)
[»] scaffold0418 (2 HSPs)
scaffold0418 (118-314)||(9476-9672)
scaffold0418 (5-120)||(9262-9377)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (118-306)||(9462-9650)
scaffold0415 (5-120)||(9248-9363)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (118-306)||(22819-23007)
scaffold0144 (5-116)||(23110-23221)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (118-314)||(11389-11585)
scaffold0038 (5-120)||(11175-11290)
[»] scaffold0748 (2 HSPs)
scaffold0748 (141-303)||(5302-5464)
scaffold0748 (13-116)||(5590-5693)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (118-306)||(9485-9673)
scaffold0322 (13-114)||(9279-9380)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (118-291)||(16021-16194)
scaffold0254 (5-120)||(15807-15922)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (118-306)||(11556-11744)
scaffold0237 (5-120)||(11843-11958)
[»] scaffold0089 (4 HSPs)
scaffold0089 (118-306)||(3507-3695)
scaffold0089 (5-120)||(43906-44021)
scaffold0089 (13-120)||(3301-3408)
scaffold0089 (13-84)||(32096-32167)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (118-291)||(13011-13184)
scaffold0336 (5-119)||(12797-12911)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (118-306)||(5807-5995)
scaffold0159 (5-120)||(6094-6209)
scaffold0159 (5-83)||(23105-23183)
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (16-116)||(1543-1643)
scaffold0260 (118-211)||(1347-1440)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (5-120)||(1149-1264)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (129-275)||(43384-43533)
scaffold0099 (21-107)||(43666-43754)
[»] scaffold0094 (2 HSPs)
scaffold0094 (126-303)||(34871-35048)
scaffold0094 (50-114)||(35161-35225)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (125-297)||(10665-10837)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (125-276)||(4573-4724)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (131-297)||(5047-5213)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (125-303)||(29617-29795)
scaffold0029 (52-114)||(29443-29505)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (25-86)||(33706-33770)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 82)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 27395001 - 27395197
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27395001 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgctatctactat 27395100  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27395101 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccactatt 27395197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 27779673 - 27779861
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27779673 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 27779772  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27779773 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 27779861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 27819430 - 27819618
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27819430 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 27819529  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27819530 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 27819618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 39893508 - 39893696
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39893508 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 39893607  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39893608 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 39893696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9346791 - 9346603
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||     
T  9346791 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactac 9346692  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9346691 ctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 9346603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13933352 - 13933164
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13933352 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 13933253  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13933252 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 13933164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21673980 - 21673792
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21673980 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 21673881  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21673880 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 21673792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 118 - 304
Target Start/End: Original strand, 27119963 - 27120149
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27119963 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 27120062  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctg 304  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27120063 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctg 27120149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11631989 - 11631801
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11631989 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtttacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactat 11631890  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11631889 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 11631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 27827899 - 27828095
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  27827899 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactat 27827998  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  27827999 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatt 27828095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 40236947 - 40237135
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40236947 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaacgggaaagaaagaacatgctatctactat 40237046  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40237047 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 40237135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 27394789 - 27394902
Alignment:
Q  7 gcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394789 gcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttca 27394888  T
Q  107 aattactcagaaag 120  Q
    ||||||||||||||    
T  27394889 aattactcagaaag 27394902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 257458 - 257270
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  257458 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcagcaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 257359  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  257358 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 257270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 12590247 - 12590435
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12590247 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 12590346  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  12590347 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgctaaacgcctgcg 12590435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19413306 - 19413118
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19413306 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 19413207  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19413206 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 19413118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 31879725 - 31879913
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31879725 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 31879824  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31879825 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 31879913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 32053242 - 32053430
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32053242 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 32053341  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32053342 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 32053430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 34294593 - 34294781
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  34294593 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactac 34294692  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
     | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34294693 ttaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 34294781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37682700 - 37682512
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37682700 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 37682601  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37682600 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 37682512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37697965 - 37697777
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37697965 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 37697866  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37697865 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 37697777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 37928808 - 37928996
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37928808 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 37928907  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37928908 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 37928996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 3785932 - 3786120
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3785932 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 3786031  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3786032 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtggtctagcttgggctgccaaacgcctgcg 3786120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16826143 - 16825955
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16826143 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccataggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactat 16826044  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16826043 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 16825955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 16895337 - 16895525
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16895337 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccataggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactat 16895436  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16895437 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 16895525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31890296 - 31890108
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31890296 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 31890197  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31890196 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgttctagcttgggctgccaaacgcctgcg 31890108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 34865123 - 34865311
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34865123 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 34865222  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34865223 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 34865311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22924946 - 22924765
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22924946 ttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagca 22924847  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22924846 agaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtggtctagcttgggctgccaaacgcctgcg 22924765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Original strand, 34158306 - 34158471
Alignment:
Q  141 cagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactg 240  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34158306 cagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactg 34158405  T
Q  241 cgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
     ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34158406 tgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 34158471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 27807142 - 27807330
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27807142 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 27807241  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  27807242 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgctaaacgcctgcg 27807330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 20841352 - 20841540
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20841352 aaggcctttgattatgtacttggcagtatttgatgagtccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 20841451  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  20841452 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 20841540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21699976 - 21699788
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21699976 aaggcctttgattatgtatttgtcagtatttgatgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 21699877  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || || |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  21699876 ctaagtaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcg 21699788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39048624 - 39048436
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  39048624 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactac 39048525  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || || |||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39048524 ctaagtaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggccgccaaacgcctgcg 39048436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 12658975 - 12659163
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12658975 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgagtccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 12659074  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  12659075 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 12659163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12713406 - 12713218
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12713406 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 12713307  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  12713306 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcttgggctgccaaacgcctgcg 12713218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19453228 - 19453043
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  19453228 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtacttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctattat 19453129  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||    
T  19453128 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctccggcctgggccgccaaacgcct 19453043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23125373 - 23125185
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23125373 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 23125274  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  23125273 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 23125185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27431246 - 27431058
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27431246 aaggcctttgattatgtatttggtagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaaggcgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 27431147  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  27431146 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 27431058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 37381116 - 37381304
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37381116 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatcaatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 37381215  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  37381216 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 37381304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 118 - 280
Target Start/End: Original strand, 28885646 - 28885808
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28885646 aaggcccttggttatgtatttggcagtatttgatgagtccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 28885745  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgct 280  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28885746 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgct 28885808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23125587 - 23125472
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23125587 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 23125488  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  23125487 caagctactcagaaag 23125472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37948667 - 37948479
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37948667 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaacttgaaagaaagagcatgctatctactat 37948568  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  37948567 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 37948479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 37948881 - 37948779
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37948881 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatttt 37948782  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  37948781 caa 37948779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 16164919 - 16165107
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16164919 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 16165018  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  16165019 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 16165107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 20841138 - 20841253
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  20841138 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 20841237  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  20841238 caagctactcagaaag 20841253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 34294379 - 34294494
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  34294379 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 34294478  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  34294479 caagctactcagaaag 34294494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 27806928 - 27807030
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27806928 cagctccacggacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatttt 27807027  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  27807028 caa 27807030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27431452 - 27431345
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  27431452 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 27431353  T
Q  113 tcagaaag 120  Q
    ||||||||    
T  27431352 tcagaaag 27431345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 28885432 - 28885547
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  28885432 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccggtctt 28885531  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  28885532 caagctactcagaaag 28885547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 12658766 - 12658876
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||      
T  12658766 ccacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 12658865  T
Q  110 tactcagaaag 120  Q
    |||||||||||    
T  12658866 tactcagaaag 12658876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 39048838 - 39048736
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  39048838 cagctccacagactgagaagcaagtaagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 39048739  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  39048738 caa 39048736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 12590033 - 12590148
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  12590033 cagctccacggacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 12590132  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  12590133 caagctactcagaaag 12590148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 257672 - 257582
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgg 95  Q
    |||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257672 cagctccacaaacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgg 257582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 13933566 - 13933464
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  13933566 cagctccacaaacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 13933467  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  13933466 caa 13933464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11632203 - 11632092
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  11632203 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 11632104  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  11632103 caagctactcag 11632092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19453434 - 19453331
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  19453434 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 19453335  T
Q  113 tcag 116  Q
    ||||    
T  19453334 tcag 19453331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 39893294 - 39893409
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||    
T  39893294 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatctt 39893393  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  39893394 caagctacttagaaag 39893409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 40236733 - 40236835
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  40236733 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatctt 40236832  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  40236833 caa 40236835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 31879516 - 31879613
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaa 107  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31879516 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaa 31879613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 9347005 - 9346890
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  9347005 cagctccacaaacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 9346906  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  9346905 caagctacttagaaag 9346890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12713620 - 12713505
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  12713620 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 12713521  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  12713520 caagctacttagaaag 12713505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 19413520 - 19413405
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  19413520 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 19413421  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  19413420 caagctacttagaaag 19413405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 34864909 - 34865024
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  34864909 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 34865008  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  34865009 caagctacttagaaag 34865024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 37682914 - 37682799
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  37682914 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 37682815  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  37682814 caagctacttagaaag 37682799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 37698179 - 37698064
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  37698179 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 37698080  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  37698079 caagctacttagaaag 37698064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 37928594 - 37928709
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  37928594 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 37928693  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  37928694 caagctacttagaaag 37928709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16826352 - 16826242
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||      
T  16826352 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 16826253  T
Q  110 tactcagaaag 120  Q
    |||| ||||||    
T  16826252 tacttagaaag 16826242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 16895128 - 16895238
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||      
T  16895128 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 16895227  T
Q  110 tactcagaaag 120  Q
    |||| ||||||    
T  16895228 tacttagaaag 16895238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 32053033 - 32053143
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||      
T  32053033 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 32053132  T
Q  110 tactcagaaag 120  Q
    |||| ||||||    
T  32053133 tacttagaaag 32053143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 21700163 - 21700079
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcag 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  21700163 gaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcag 21700079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21674194 - 21674079
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  21674194 cagctccacggacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 21674095  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  21674094 caagctacttagaaag 21674079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 37380902 - 37381013
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  37380902 cagctccacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacacttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 37381001  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  37381002 caagctactcag 37381013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34534247 - 34534072
Alignment:
Q  119 aggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatc 218  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||      
T  34534247 aggcctttgatcatgtatttgactgtgttagaagattctatgggttgtgtgttgggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactact 34534148  T
Q  219 tgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgc 294  Q
    |||| |||||||||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||    
T  34534147 tgagtaagaagtttaccgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacctgttgcgctttggcatgggctgc 34534072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Original strand, 42393981 - 42394153
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| ||||| || |||||  |||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |    
T  42393981 ttgatcatgtatttaacagtactagaagattccatgggctgtgttttgggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagta 42394080  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    ||||||| || || || ||  |||| ||| |  | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  42394081 agaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaacttgttgtgctttaacttgggctgccaa 42394153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26724080 - 26723905
Alignment:
Q  119 aggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatc 218  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||      
T  26724080 aggcctttgatcatgtatttgactgtgttagaagattctatgggctgtgtgttgggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactact 26723981  T
Q  219 tgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgc 294  Q
    |||| ||||||||||| || || ||  |||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||    
T  26723980 tgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacctgttgcgctttggcatgggctgc 26723905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 34701552 - 34701694
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| |||     
T  34701552 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 34701651  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34701652 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcttgggctgccaa 34701694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34271629 - 34271537
Alignment:
Q  214 ctatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  34271629 ctatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 34271537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 303
Target Start/End: Original strand, 12384106 - 12384284
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  12384106 ttgatcatgtacctaacagtgttagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 12384205  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12384206 agaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 12384284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21760383 - 21760225
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||  || || ||| |||||||||||||||| || || ||| | || |||     
T  21760383 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagacgaaactggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgattgtgaatctcgctatt 21760284  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactat 313  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||    
T  21760283 ccatgctcgagaagacctgttgcgcactagcctgggccgccaaacgcctccgtcactat 21760225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 303
Target Start/End: Original strand, 22949839 - 22950017
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||| ||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  22949839 ttgatcatgtacctaacagtgctagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 22949938  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    | |||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22949939 aaaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 22950017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 306
Target Start/End: Original strand, 28885821 - 28885906
Alignment:
Q  221 agcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  28885821 agcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaaacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 28885906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Original strand, 12383932 - 12383994
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  12383932 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 12383994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Original strand, 22949665 - 22949727
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  22949665 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 22949727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15388194 - 15387998
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15388194 aaggcccttgattatgtacttgatagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacaagactggaaagaaagagcatgctatctactat 15388095  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15388094 ttgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccgatatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccactatt 15387998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 39854090 - 39854278
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39854090 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 39854189  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39854190 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 39854278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 5009328 - 5009516
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5009328 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 5009427  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5009428 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcttgggctgccaaacgcctgcg 5009516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36341333 - 36341145
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36341333 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtactgggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacacgctatctactat 36341234  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36341233 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 36341145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15388406 - 15388293
Alignment:
Q  7 gcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388406 gcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttca 15388307  T
Q  107 aattactcagaaag 120  Q
    ||||||||||||||    
T  15388306 aattactcagaaag 15388293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 6573311 - 6573499
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6573311 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggttgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 6573410  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  6573411 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagtttgggctgccaaacgcctgcg 6573499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18797430 - 18797242
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18797430 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggacaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 18797331  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18797330 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 18797242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31123328 - 31123140
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31123328 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactat 31123229  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31123228 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 31123140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 54836844 - 54837032
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  54836844 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 54836943  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  54836944 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 54837032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 1903707 - 1903895
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1903707 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 1903806  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  1903807 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatatgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcg 1903895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 14101996 - 14102184
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14101996 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 14102095  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14102096 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 14102184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 21973154 - 21973342
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21973154 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactat 21973253  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21973254 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 21973342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27160133 - 27159945
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27160133 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 27160034  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27160033 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 27159945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 30757213 - 30757401
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30757213 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagaacatgctatctactat 30757312  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30757313 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 30757401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40102453 - 40102265
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40102453 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 40102354  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  40102353 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 40102265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15281753 - 15281565
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15281753 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttgatgaattcgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 15281654  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |||||| |||||||    
T  15281653 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgctctctggcctgggccgccaaaagcctgcg 15281565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20335237 - 20335049
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20335237 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 20335138  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||  ||||| |||||||    
T  20335137 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggcctccaaacgcctgcg 20335049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33670616 - 33670428
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||     
T  33670616 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgttatctactac 33670517  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  33670516 ctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 33670428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 125 - 306
Target Start/End: Original strand, 15231332 - 15231513
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15231332 ttgattatgtatttgtcagtgtttaatgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctgagca 15231431  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    ||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||    
T  15231432 agaagttcaccgactgtgaaactcgttatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccaccaaacgcctgcg 15231513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34185776 - 34185603
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34185776 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 34185677  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggc 291  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34185676 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggc 34185603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14760122 - 14759934
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14760122 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 14760023  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  14760022 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 14759934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 17016499 - 17016687
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17016499 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 17016598  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  17016599 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 17016687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18313994 - 18313806
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18313994 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 18313895  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  18313894 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 18313806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 24116115 - 24116303
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24116115 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 24116214  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  24116215 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 24116303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24589177 - 24588989
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24589177 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgataactactat 24589078  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  24589077 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 24588989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 291
Target Start/End: Original strand, 14668469 - 14668642
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14668469 aaggcctttgattatgtatttggaagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 14668568  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggc 291  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14668569 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggc 14668642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14760336 - 14760221
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14760336 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatctt 14760237  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  14760236 caagctactcagaaag 14760221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 14668255 - 14668370
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  14668255 cagctccacagaccgagaagcaagtcagagatttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 14668354  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  14668355 caagctactcagaaag 14668370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 17016285 - 17016400
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  17016285 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 17016384  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  17016385 caagctactcagaaag 17016400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 24115901 - 24116016
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  24115901 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 24116000  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  24116001 caagctactcagaaag 24116016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 24589391 - 24589276
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  24589391 cagctccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 24589292  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  24589291 caagctactcagaaag 24589276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 34185985 - 34185875
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||      
T  34185985 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcggaccgatcttcaagc 34185886  T
Q  110 tactcagaaag 120  Q
    |||||||||||    
T  34185885 tactcagaaag 34185875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 6573097 - 6573212
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  6573097 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 6573196  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  6573197 caagctacttagaaag 6573212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 15231111 - 15231222
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15231111 cagctccacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 15231210  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  15231211 caagctactcag 15231222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20335451 - 20335336
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  20335451 cagctccacggaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 20335352  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  20335351 caagctactcagaaag 20335336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18314208 - 18314106
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  18314208 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 18314109  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  18314108 caa 18314106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18797644 - 18797542
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18797644 cagctccacggacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 18797545  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  18797544 caa 18797542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27160347 - 27160245
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  27160347 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 27160248  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  27160247 caa 27160245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 116
Target Start/End: Original strand, 1903500 - 1903604
Alignment:
Q  12 acagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatta 111  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||    
T  1903500 acagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcagcctgcgggccgatcttcaagtta 1903599  T
Q  112 ctcag 116  Q
    |||||    
T  1903600 ctcag 1903604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 5009114 - 5009225
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  5009114 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 5009213  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  5009214 caagctactcag 5009225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 36341547 - 36341432
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  36341547 cagctccacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 36341448  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  36341447 caagctactcagaaag 36341432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 54836630 - 54836745
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  54836630 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 54836729  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  54836730 caagctactcagaaag 54836745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 39853876 - 39853978
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  39853876 cagctccacaaacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccacaacctgcgggcctatctt 39853975  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  39853976 caa 39853978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 14101782 - 14101897
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14101782 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatctt 14101881  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  14101882 caagctactcagaaag 14101897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15281959 - 15281856
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  15281959 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 15281860  T
Q  113 tcag 116  Q
    ||||    
T  15281859 tcag 15281856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 40102667 - 40102565
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  40102667 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 40102568  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  40102567 caa 40102565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 30756999 - 30757114
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  30756999 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 30757098  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  30757099 caagctacttagaaag 30757114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 31123542 - 31123427
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  31123542 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 31123443  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  31123442 caagctacttagaaag 31123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 33670830 - 33670715
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||    
T  33670830 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatcgcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 33670731  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  33670730 caagctactcagaaag 33670715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 21972945 - 21973055
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||      
T  21972945 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 21973044  T
Q  110 tactcagaaag 120  Q
    |||| ||||||    
T  21973045 tacttagaaag 21973055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22146385 - 22146227
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||     
T  22146385 aaggcctttgatcatgtacttgactgtgttggatgattctatgggctgcgtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactac 22146286  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttg 276  Q
     |||| ||||||||||| || || ||  |||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  22146285 ttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacttgttg 22146227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1881914 - 1881739
Alignment:
Q  119 aggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatc 218  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||      
T  1881914 aggcctttgatcatgtatttgactgtgttagaagattctatgggttgtgtgttgggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactact 1881815  T
Q  219 tgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgc 294  Q
    |||| |||||||||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||    
T  1881814 tgagtaagaagtttaccgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacctgttgcgctttggcatgggctgc 1881739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14725578 - 14725436
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| |||     
T  14725578 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 14725479  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14725478 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcttgggctgccaa 14725436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 19767829 - 19767971
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| |||     
T  19767829 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 19767928  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19767929 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcttgggctgccaa 19767971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 297
Target Start/End: Original strand, 12515698 - 12515864
Alignment:
Q  131 atgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagt 230  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  12515698 atgtatttgaccgtgctagaagattctatgggttgtgtgctcgggcagcaagaagaaactggaaggaaagaacatgttatttactatttgagcaagaagt 12515797  T
Q  231 ttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |||| ||  | ||  | ||||||   || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  12515798 ttacagatagtgagtctcggtatttcatacttgagaagacttgatgtgctttagcctgggctgccaa 12515864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 313
Target Start/End: Original strand, 55784686 - 55784780
Alignment:
Q  219 tgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactat 313  Q
    |||||||||||||||| || || ||| | || ||| | ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||| || ||||||    
T  55784686 tgagcaagaagtttactgattgtgaatctcgctattccatgctcgagaagacctgttgcgcactagcctgggctgccaaacgcctccgtcactat 55784780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 118 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22077688 - 22077515
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22077688 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgctatctactat 22077589  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggc 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077588 ctgagcaagaactttaccgactgcgaagcccaatatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggc 22077515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 33262173 - 33262361
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33262173 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 33262272  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33262273 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 33262361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 18712923 - 18713119
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  18712923 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactat 18713022  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  18713023 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatt 18713119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28358729 - 28358541
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||||    
T  28358729 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccgggaagaaagagcatgctatctactat 28358630  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28358629 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 28358541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 9358064 - 9358252
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9358064 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 9358163  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9358164 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 9358252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12089500 - 12089304
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12089500 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 12089401  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12089400 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatt 12089304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19205139 - 19204951
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19205139 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactat 19205040  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19205039 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 19204951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 31357967 - 31358155
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31357967 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 31358066  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31358067 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 31358155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22077900 - 22077787
Alignment:
Q  7 gcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077900 gcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctgatatgaccgcaacctgcgggccaattttca 22077801  T
Q  107 aattactcagaaag 120  Q
    ||||||||||||||    
T  22077800 aattactcagaaag 22077787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 29832765 - 29832953
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29832765 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 29832864  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29832865 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 29832953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 44564423 - 44564611
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44564423 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 44564522  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  44564523 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtggtctagcttgggctgccaaacgcctgcg 44564611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 15771013 - 15771201
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15771013 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 15771112  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15771113 ctaagcaagaagtttaccgattgtgaaactcggtatacaatgtttgagaggacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 15771201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 19677886 - 19678074
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||     
T  19677886 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactac 19677985  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  19677986 ctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 19678074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27605682 - 27605494
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27605682 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 27605583  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  27605582 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 27605494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 280
Target Start/End: Original strand, 19691537 - 19691699
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19691537 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 19691636  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgct 280  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19691637 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgct 19691699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21344948 - 21344786
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| | |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21344948 aaggccttcgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 21344849  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgct 280  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21344848 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgct 21344786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2134037 - 2133849
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  2134037 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaggaaagaacatgctatctactat 2133938  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| | ||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  2133937 ctaagcaagaagttcatcgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 2133849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 14561063 - 14561251
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14561063 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 14561162  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || |||||||| || ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  14561163 ctaagcaagaaattcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 14561251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 18794143 - 18794331
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18794143 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 18794242  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  18794243 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 18794331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31486648 - 31486460
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31486648 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactat 31486549  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  31486548 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 31486460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27605896 - 27605781
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27605896 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 27605797  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  27605796 caagctactcagaaag 27605781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 14560849 - 14560964
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  14560849 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 14560948  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  14560949 caagctactcagaaag 14560964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 18793929 - 18794044
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  18793929 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 18794028  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  18794029 caagctactcagaaag 18794044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2134251 - 2134136
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  2134251 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatctt 2134152  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  2134151 caagctactcagaaag 2134136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 19691328 - 19691438
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||      
T  19691328 ccacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 19691427  T
Q  110 tactcagaaag 120  Q
    |||||||||||    
T  19691428 tactcagaaag 19691438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 29832551 - 29832666
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  29832551 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 29832650  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  29832651 caagctactcagaaag 29832666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 9357855 - 9357965
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||      
T  9357855 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagc 9357954  T
Q  110 tactcagaaag 120  Q
    |||||||||||    
T  9357955 tactcagaaag 9357965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 18712709 - 18712824
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||    
T  18712709 cagctccacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatctt 18712808  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  18712809 caagctactcagaaag 18712824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 28358943 - 28358828
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  28358943 cagctccacggacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 28358844  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  28358843 caagctactcagaaag 28358828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 33261964 - 33262074
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||      
T  33261964 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagc 33262063  T
Q  110 tactcagaaag 120  Q
    |||| ||||||    
T  33262064 tacttagaaag 33262074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 19677672 - 19677787
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||    
T  19677672 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatcgcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 19677771  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  19677772 caagctactcagaaag 19677787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 31357753 - 31357855
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  31357753 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 31357852  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  31357853 caa 31357855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31486862 - 31486760
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||    
T  31486862 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatctt 31486763  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  31486762 caa 31486760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12089714 - 12089599
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  12089714 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatctt 12089615  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  12089614 caagctacttagaaag 12089599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19205353 - 19205242
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  19205353 cagctccacggacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatctt 19205254  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  19205253 caagctactcag 19205242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19658028 - 19657922
Alignment:
Q  208 tatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgc 307  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  19658028 tatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgc 19657929  T
Q  308 cactatt 314  Q
    || ||||    
T  19657928 cattatt 19657922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 298
Target Start/End: Original strand, 19844613 - 19844786
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |    
T  19844613 ttgatcatgtatttaacagtattggaagattccatgggctgtgtgttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcaagctatctactatttgagta 19844712  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaa 298  Q
    ||||||| ||||| || ||  |||| ||| || | |||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  19844713 agaagttcaccgattgtgagtcccgatattcggtacttgagaaaacttgttgtgatttagcctgggctgccaaa 19844786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Original strand, 14212485 - 14212657
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| ||||| || |||||  |||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |    
T  14212485 ttgatcatgtatttaacagtactagaagattccatgggctgtgttttgggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagta 14212584  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    ||||||| || || || ||  |||| ||| |  | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  14212585 agaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaacttgttgtgctttaacttgggctgccaa 14212657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Original strand, 16768763 - 16768938
Alignment:
Q  119 aggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatc 218  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||      
T  16768763 aggcctttgatcatgtatttgactgtgttagaagattctatgggctgtgtgttgggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactact 16768862  T
Q  219 tgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgc 294  Q
    |||| ||||||||||| || || ||  |||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||    
T  16768863 tgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacctgttgcgctttggcatgggctgc 16768938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 22412414 - 22412556
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| |||     
T  22412414 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 22412513  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22412514 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcttgggctgccaa 22412556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 306
Target Start/End: Original strand, 33245898 - 33245996
Alignment:
Q  208 tatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  33245898 tatctactatctaagtaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 33245996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 16286626 - 16286694
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcg-ggcgtttgaattacatctcccgattcata 72  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  16286626 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgagacgattgaattacatctcccgattcata 16286694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Original strand, 19844409 - 19844500
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattact 113  Q
    ||||||||| ||||||| || ||  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  19844409 aagcaagtcagaggttttcttggtagattgaactacatctccagatttatatctcatatgactgccacatgtggaccaattttcaagttact 19844500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 112)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 43081702 - 43081890
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43081702 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactat 43081801  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43081802 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 43081890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 3792988 - 3793176
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3792988 aaggcctttgattatgtatttggcggtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 3793087  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3793088 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 3793176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 9320923 - 9321111
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9320923 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactat 9321022  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9321023 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 9321111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 12135622 - 12135810
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12135622 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactat 12135721  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12135722 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 12135810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40470263 - 40470075
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40470263 aaggcctttgattatgtatttggcggtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 40470164  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40470163 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 40470075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 26483841 - 26484029
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26483841 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaggatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactat 26483940  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26483941 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 26484029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 28652689 - 28652877
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28652689 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactat 28652788  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28652789 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 28652877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 31434911 - 31435099
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31434911 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 31435010  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31435011 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 31435099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31823120 - 31822932
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31823120 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttgggcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 31823021  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31823020 ctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 31822932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8662188 - 8662000
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8662188 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 8662089  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8662088 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 8662000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13321543 - 13321355
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13321543 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgttatctattat 13321444  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13321443 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 13321355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18497438 - 18497250
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18497438 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 18497339  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18497338 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 18497250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29887910 - 29887722
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29887910 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaataagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 29887811  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  29887810 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctgcg 29887722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 30155478 - 30155666
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30155478 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 30155577  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30155578 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 30155666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 33519827 - 33520015
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33519827 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactat 33519926  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33519927 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 33520015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 37355356 - 37355160
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37355356 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 37355257  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37355256 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatt 37355160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37668199 - 37668011
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37668199 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 37668100  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37668099 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcg 37668011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 2514509 - 2514697
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2514509 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 2514608  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  2514609 ctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 2514697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 22891910 - 22892106
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22891910 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttgacgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 22892009  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  22892010 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatatgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcactatt 22892106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 30032875 - 30033063
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30032875 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 30032974  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  30032975 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctaccaaacgcctgcg 30033063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 33878577 - 33878765
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33878577 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 33878676  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33878677 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 33878765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 34619965 - 34620153
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34619965 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttaatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 34620064  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34620065 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 34620153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37767704 - 37767516
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37767704 aaggcctttgattatgtatctggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 37767605  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37767604 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 37767516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18372247 - 18372059
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18372247 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 18372148  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18372147 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 18372059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 23629417 - 23629605
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23629417 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 23629516  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  23629517 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 23629605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 24586821 - 24587009
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24586821 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 24586920  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24586921 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 24587009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 25203725 - 25203913
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  25203725 aaggcctttgattatgtacttgtcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagacgggaaagaaagaacatgctatatactat 25203824  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  25203825 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 25203913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 25267880 - 25268068
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  25267880 aaggcctttgattatgtacttgtcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagacgggaaagaaagaacatgctatatactat 25267979  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  25267980 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 25268068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32592987 - 32592799
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||     
T  32592987 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagaccggaaagaaagaacatgctatctactac 32592888  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||| | || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32592887 ctaagcaagaagttcaccaattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 32592799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 24727416 - 24727604
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24727416 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 24727515  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24727516 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 24727604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 30938082 - 30938270
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30938082 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactat 30938181  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  30938182 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 30938270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 33295975 - 33296163
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33295975 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 33296074  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  33296075 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 33296163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 33780936 - 33781124
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33780936 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 33781035  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  33781036 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 33781124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 41678152 - 41678340
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  41678152 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactac 41678251  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  41678252 ctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 41678340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15655471 - 15655286
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15655471 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 15655372  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  15655371 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggctgctaaacgcct 15655286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 11552802 - 11552990
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11552802 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 11552901  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
     | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  11552902 ttaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 11552990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13183506 - 13183318
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13183506 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccgtgggatgtgtaattggtcaacaagatgaaactggaaagaaagatcatgctatctactat 13183407  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  13183406 ctaagcaagaagttcaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 13183318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13439396 - 13439208
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13439396 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 13439297  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  13439296 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 13439208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18125129 - 18124968
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18125129 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 18125030  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgc 279  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18125029 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgc 18124968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24684858 - 24684697
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24684858 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 24684759  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgc 279  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24684758 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgc 24684697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 6877752 - 6877940
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6877752 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaggatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 6877851  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  6877852 ctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 6877940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 11327084 - 11327272
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  11327084 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaacctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactac 11327183  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11327184 ctaagcaagaagttcaccgatggtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 11327272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15755565 - 15755377
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15755565 aaggcctttgatcatgtatttagcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 15755466  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
     | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15755465 ttaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 15755377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22995830 - 22995642
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22995830 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 22995731  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || |||||||| || ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  22995730 ctaagcaagaaattcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 22995642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 24973353 - 24973541
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24973353 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 24973452  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||| || ||| |||||||    
T  24973453 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtcctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 24973541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28956498 - 28956310
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28956498 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 28956399  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  28956398 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgcgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 28956310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 5641235 - 5641423
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5641235 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtactgggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactat 5641334  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  5641335 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 5641423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9547422 - 9547234
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9547422 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 9547323  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  9547322 ctaagcaagaagttcaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 9547234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 30171916 - 30172104
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30171916 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 30172015  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  30172016 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 30172104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 37758430 - 37758618
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37758430 aaggcctttgattatgtatttggcggtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 37758529  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  37758530 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 37758618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 33780722 - 33780837
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  33780722 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 33780821  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  33780822 caagctactcagaaag 33780837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 11552588 - 11552703
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  11552588 cagctccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 11552687  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  11552688 caagctactcagaaag 11552703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15655685 - 15655570
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  15655685 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 15655586  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  15655585 caagctactcagaaag 15655570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22996044 - 22995929
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  22996044 cagctccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 22995945  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  22995944 caagctactcagaaag 22995929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 33295761 - 33295876
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  33295761 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 33295860  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  33295861 caagctactcagaaag 33295876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 41677938 - 41678053
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  41677938 cagctccacagaccgagaagcaagttagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 41678037  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    ||| ||||||||||||    
T  41678038 caagttactcagaaag 41678053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 40470477 - 40470375
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40470477 cagctccacggacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatttt 40470378  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  40470377 caa 40470375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 23629203 - 23629318
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||    
T  23629203 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatctt 23629302  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  23629303 caagctactcagaaag 23629318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 24685072 - 24684957
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  24685072 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 24684973  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
     ||  |||||||||||    
T  24684972 taagctactcagaaag 24684957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 34619751 - 34619866
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  34619751 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 34619850  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  34619851 caagctactcagaaag 34619866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 37355570 - 37355455
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37355570 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatctt 37355471  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  37355470 caagctactcagaaag 37355455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 30937868 - 30937970
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  30937868 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 30937967  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  30937968 caa 30937970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 3792774 - 3792889
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||    
T  3792774 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatctt 3792873  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  3792874 caagctactcagaaag 3792889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 28652475 - 28652590
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  28652475 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 28652574  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  28652575 caagctacttagaaag 28652590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 31434697 - 31434812
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  31434697 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatctt 31434796  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  31434797 caagctactcagaaag 31434812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 32593201 - 32593086
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  32593201 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctctcggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 32593102  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  32593101 caagctactcagaaag 32593086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 43081488 - 43081603
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  43081488 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 43081587  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  43081588 caagctacttagaaag 43081603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18497652 - 18497550
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  18497652 cagctccacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 18497553  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  18497552 caa 18497550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 2514295 - 2514410
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  2514295 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 2514394  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  2514395 caagctactcagaaag 2514410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 6877538 - 6877653
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  6877538 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 6877637  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  6877638 caagttacttagaaag 6877653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13321757 - 13321642
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  13321757 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 13321658  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  13321657 caagttacttagaaag 13321642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18372461 - 18372346
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18372461 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatctt 18372362  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  18372361 caagctactcagaaag 18372346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 23895447 - 23895554
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  23895447 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 23895546  T
Q  113 tcagaaag 120  Q
    ||||||||    
T  23895547 tcagaaag 23895554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 24973139 - 24973254
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  24973139 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgcttaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 24973238  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  24973239 caagctacttagaaag 24973254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 37767918 - 37767803
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  37767918 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 37767819  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||| |||| ||||||    
T  37767818 caaactacttagaaag 37767803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28956712 - 28956610
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||    
T  28956712 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatctt 28956613  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  28956612 caa 28956610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 30171702 - 30171804
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||    
T  30171702 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatctt 30171801  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  30171802 caa 30171804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Original strand, 30032661 - 30032754
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggcc 98  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30032661 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggcc 30032754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 5641021 - 5641136
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  5641021 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 5641120  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  5641121 caagctacttagaaag 5641136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 8662402 - 8662287
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  8662402 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 8662303  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  8662302 caagctacttagaaag 8662287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 24586607 - 24586722
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  24586607 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 24586706  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  24586707 caagctacttagaaag 24586722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 24727202 - 24727317
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  24727202 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 24727301  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  24727302 caagctacttagaaag 24727317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 25203519 - 25203622
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  25203519 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagctac 25203618  T
Q  113 tcag 116  Q
    ||||    
T  25203619 tcag 25203622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 25267674 - 25267777
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  25267674 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagctac 25267773  T
Q  113 tcag 116  Q
    ||||    
T  25267774 tcag 25267777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 30155264 - 30155379
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  30155264 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 30155363  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  30155364 caagctacttagaaag 30155379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 31823334 - 31823219
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  31823334 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 31823235  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  31823234 caagctacttagaaag 31823219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 33519613 - 33519728
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  33519613 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 33519712  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  33519713 caagctacttagaaag 33519728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 37668413 - 37668298
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  37668413 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 37668314  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  37668313 caagctacttagaaag 37668298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 37758216 - 37758331
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  37758216 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 37758315  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  37758316 caagctacttagaaag 37758331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 116
Target Start/End: Original strand, 22891707 - 22891807
Alignment:
Q  16 accgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactca 115  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||    
T  22891707 accgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacctgcggcccgatcttcaagctactca 22891806  T
Q  116 g 116  Q
    |    
T  22891807 g 22891807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 9320709 - 9320820
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  9320709 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatctt 9320808  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  9320809 caagctactcag 9320820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 12135408 - 12135519
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  12135408 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatctt 12135507  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  12135508 caagctactcag 12135519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15755779 - 15755664
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  15755779 cagctccacggacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 15755680  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  15755679 caagctacttagaaag 15755664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 26483627 - 26483738
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  26483627 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatctt 26483726  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  26483727 caagctactcag 26483738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 351928 - 351770
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||     
T  351928 aaggcctttgatcatgtatttgactgtgttggatgattctatgggctgcgtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactac 351829  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttg 276  Q
     |||| ||||||||||| || || ||  |||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  351828 ttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacttgttg 351770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3483909 - 3483737
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| ||||| || |||||  |||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |    
T  3483909 ttgatcatgtatttaacagtactagaagattccatgggctgtgttttgggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagta 3483810  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    ||||||| || || || ||  |||| ||| |  | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  3483809 agaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaacttgttgtgctttaacttgggctgccaa 3483737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20388701 - 20388553
Alignment:
Q  119 aggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatc 218  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||      
T  20388701 aggcctttgatcatgtacttgaccgtgttagaaaattctatgggctgtgtgttgggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgccatttactact 20388602  T
Q  219 tgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaa 267  Q
    |||| ||||||||||| || || ||  |||| ||| | |||||||||||    
T  20388601 tgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaa 20388553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11944128 - 11943950
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  11944128 ttgatcatgtacctaacagtgttagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 11944029  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11944028 agaagtttactgaatgtgaatctcgatactccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 11943950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15784431 - 15784253
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  15784431 ttgatcatgtacctaacagtgttagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 15784332  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15784331 agaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 15784253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Original strand, 31520761 - 31520933
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  31520761 ttgatcatgtacctaacagtgttagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 31520860  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31520861 agaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaa 31520933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5439931 - 5439759
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  5439931 ttgatcatgtacctaacggtgttagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 5439832  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5439831 agaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaa 5439759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 298
Target Start/End: Original strand, 34469106 - 34469249
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  || |||||||  || || ||| |||||||||||||||| ||||| ||| | || |||     
T  34469106 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgactgtgaatctcgctatt 34469205  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaa 298  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||    
T  34469206 ccatgctcgagaagacctgttgcgcactagtctgggctgccaaa 34469249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 17957581 - 17957723
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | |||||||||||||| || || ||| | || ||      
T  17957581 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 17957680  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17957681 ccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaa 17957723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5440105 - 5440043
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  5440105 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 5440043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11944302 - 11944240
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  11944302 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 11944240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15784605 - 15784543
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  15784605 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 15784543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Original strand, 17957376 - 17957438
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  17957376 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 17957438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36375668 - 36375490
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  ||||| || |  || || ||| | ||||    
T  36375668 ttgatcatgtacctaacagtgttagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagaacacgccatttattatttaagca 36375569  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    | |||||||| || || ||| | || ||  | || || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  36375568 aaaagtttactgaatgtgaatctcgatactccatactcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 36375490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 36375842 - 36375780
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  36375842 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 36375780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37000322 - 37000144
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  ||||| || |  || || ||| | ||||    
T  37000322 ttgatcatgtacctaacagtgttagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagaacacgccatttattatttaagca 37000223  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    | |||||||| || || ||| | || ||  | || || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37000222 aaaagtttactgaatgtgaatctcgatactccatactcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 37000144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 37000496 - 37000434
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  37000496 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 37000434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Original strand, 34468900 - 34468948
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggcc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  34468900 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgactgcaacatgtgggcc 34468948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 5)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 7400 - 7588
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7400 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 7499  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7500 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 7588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 19510 - 19698
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19510 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 19609  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  19610 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcg 19698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 30733 - 30921
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30733 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 30832  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  30833 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 30921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 30519 - 30634
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  30519 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 30618  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  30619 caagctactcagaaag 30634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 19304 - 19407
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  19304 cagaccgagaaacaagttagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 19403  T
Q  113 tcag 116  Q
    ||||    
T  19404 tcag 19407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 87)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 4761200 - 4761388
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4761200 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 4761299  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4761300 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 4761388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 4528722 - 4528918
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4528722 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 4528821  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4528822 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatt 4528918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27358869 - 27358681
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27358869 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 27358770  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27358769 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 27358681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27449212 - 27449024
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27449212 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 27449113  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27449112 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 27449024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27626470 - 27626282
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  27626470 aaggcctttgattatgtacttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactat 27626371  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27626370 ctaagcaagaagttcaccgaccgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 27626282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33373190 - 33373002
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||     
T  33373190 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactac 33373091  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33373090 ctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactcggtatacactgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 33373002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 4776317 - 4776505
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4776317 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 4776416  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4776417 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 4776505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14142153 - 14141965
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14142153 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactat 14142054  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14142053 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 14141965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22455873 - 22455685
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22455873 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttggtgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 22455774  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| | |||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22455773 ctaagcaagaagttcatcgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 22455685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26113171 - 26112975
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26113171 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 26113072  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26113071 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatt 26112975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 27011168 - 27011356
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27011168 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 27011267  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27011268 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 27011356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27287123 - 27286927
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27287123 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 27287024  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27287023 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcatgggctgccaaacgcctgcgccactatt 27286927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 28210891 - 28211087
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28210891 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 28210990  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28210991 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatt 28211087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 29504853 - 29505041
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29504853 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 29504952  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29504953 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 29505041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 29576451 - 29576639
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29576451 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactat 29576550  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29576551 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 29576639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30554775 - 30554587
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30554775 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactat 30554676  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30554675 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 30554587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 125 - 306
Target Start/End: Original strand, 28163935 - 28164116
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28163935 ttgattatgtatttggcagtatttgatgagtccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagca 28164034  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    ||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28164035 agaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 28164116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13520951 - 13520763
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13520951 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 13520852  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13520851 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 13520763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 16677577 - 16677773
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16677577 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactac 16677676  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    |||||||||||||| || || || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  16677677 ctgagcaagaagttcactgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatt 16677773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17089202 - 17089014
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17089202 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgttcgatgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgggactggaaagaaagagcatgctatctactat 17089103  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  17089102 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcg 17089014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 26789253 - 26789441
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26789253 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 26789352  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26789353 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaaagcctgcg 26789441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34461265 - 34461077
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34461265 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 34461166  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34461165 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaggacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 34461077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4542533 - 4542337
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542533 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 4542434  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || || |||||||| ||||| || ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4542433 ctaagtaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatt 4542337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4720894 - 4720698
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4720894 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 4720795  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || || |||||||| ||||| || ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4720794 ctaagtaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatt 4720698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 27060943 - 27061131
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27060943 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 27061042  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  27061043 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 27061131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 27197622 - 27197810
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27197622 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 27197721  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27197722 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgagctgccaaacgcctgcg 27197810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27251613 - 27251425
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27251613 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 27251514  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27251513 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgagctgccaaacgcctgcg 27251425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 27488570 - 27488758
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27488570 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 27488669  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  27488670 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 27488758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 3699520 - 3699708
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3699520 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 3699619  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  3699620 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 3699708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Original strand, 16753266 - 16753446
Alignment:
Q  126 tgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaa 225  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  16753266 tgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctaagcaa 16753365  T
Q  226 gaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  16753366 gaagttcaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 16753446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22931643 - 22931481
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22931643 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgatatctactat 22931544  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgct 280  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22931543 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgct 22931481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23854088 - 23853926
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23854088 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgatatctactat 23853989  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgct 280  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23853988 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgct 23853926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 24867153 - 24867341
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24867153 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtactttgtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 24867252  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  24867253 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 24867341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Original strand, 26921822 - 26922002
Alignment:
Q  126 tgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaa 225  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  26921822 tgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaa 26921921  T
Q  226 gaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  26921922 gaagttcaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacctgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 26922002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 282
Target Start/End: Original strand, 27179893 - 27180057
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27179893 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 27179992  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctct 282  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27179993 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctct 27180057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27269346 - 27269182
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27269346 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 27269247  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctct 282  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27269246 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctct 27269182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13295710 - 13295522
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13295710 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 13295611  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  13295610 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 13295522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15421079 - 15420891
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15421079 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 15420980  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  15420979 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgcgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 15420891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26775386 - 26775198
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26775386 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactat 26775287  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  26775286 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 26775198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 27022573 - 27022761
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27022573 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 27022672  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  27022673 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 27022761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 29552994 - 29553182
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29552994 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggctgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 29553093  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  29553094 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 29553182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16940779 - 16940598
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16940779 ttgattatgtatttagcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagca 16940680  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    ||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  16940679 agaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 16940598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 20171984 - 20172172
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||| | | ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20171984 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgacgaattcgtaggatgtgtaattggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 20172083  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||    
T  20172084 ctgagcaagaagttcaccgactgtgagactcggtatactatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggttgctaaacgcctgcg 20172172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22164007 - 22163819
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||| | | ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22164007 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgacgaattcgtaggatgtgtaattggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 22163908  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||    
T  22163907 ctgagcaagaagttcaccgactgtgagactcggtatactatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggttgctaaacgcctgcg 22163819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 282
Target Start/End: Original strand, 26992232 - 26992396
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26992232 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 26992331  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctct 282  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26992332 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctct 26992396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27287337 - 27287223
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27287337 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatttt 27287238  T
Q  105 caaattactcagaaa 119  Q
    |||  ||||||||||    
T  27287237 caagctactcagaaa 27287223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22931857 - 22931742
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  22931857 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 22931758  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  22931757 caagctactcagaaag 22931742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23854302 - 23854187
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  23854302 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 23854203  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  23854202 caagctactcagaaag 23854187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 27179679 - 27179794
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  27179679 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 27179778  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  27179779 caagctactcagaaag 27179794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27269560 - 27269445
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  27269560 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 27269461  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  27269460 caagctactcagaaag 27269445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13295924 - 13295809
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  13295924 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 13295825  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  13295824 caagctactcagaaag 13295809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15421293 - 15421178
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  15421293 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 15421194  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  15421193 caagctactcagaaag 15421178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 24866939 - 24867054
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24866939 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 24867038  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
     ||  |||||||||||    
T  24867039 taagctactcagaaag 24867054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 26921600 - 26921715
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  26921600 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 26921699  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  26921700 caagctactcagaaag 26921715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 27022359 - 27022474
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  27022359 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgatttatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 27022458  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  27022459 caagctactcagaaag 27022474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 29552780 - 29552895
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  29552780 cagctccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 29552879  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  29552880 caagctactcagaaag 29552895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 34461479 - 34461377
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  34461479 cagctccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 34461380  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  34461379 caa 34461377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8902462 - 8902274
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| |||| |||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8902462 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgcatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 8902363  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  8902362 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaaaacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 8902274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27626684 - 27626569
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  27626684 cagctccacggaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 27626585  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  27626584 caagctactcagaaag 27626569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 17089411 - 17089305
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaat 109  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||      
T  17089411 ccacggaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgctacctgcgggccaatcttcaagc 17089312  T
Q  110 tactcag 116  Q
    |||||||    
T  17089311 tactcag 17089305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 4760986 - 4761101
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4760986 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatctt 4761085  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  4761086 caagctactcagaaag 4761101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 16677363 - 16677478
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  16677363 cagctccacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaatctgcgggccgatctt 16677462  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  16677463 caagctactcagaaag 16677478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 16753044 - 16753159
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16753044 cagctccacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 16753143  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  16753144 caagctactcagaaag 16753159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 27010954 - 27011069
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27010954 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatctt 27011053  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  27011054 caagctactcagaaag 27011069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 3699306 - 3699408
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  3699306 cagctccacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 3699405  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  3699406 caa 3699408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 4528508 - 4528623
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  4528508 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 4528607  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||| |||| ||||||    
T  4528608 caaactacttagaaag 4528623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 27060729 - 27060844
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  27060729 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 27060828  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  27060829 caagctactcagaaag 27060844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 29576237 - 29576352
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  29576237 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 29576336  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  29576337 caagctacttagaaag 29576352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 29504639 - 29504741
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  29504639 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 29504738  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  29504739 caa 29504741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Original strand, 20171797 - 20171881
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcag 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20171797 gaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgaccgcgacctgcgggccaattttcaagctactcag 20171881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22164194 - 22164110
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcag 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22164194 gaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgaccgcgacctgcgggccaattttcaagctactcag 22164110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4542747 - 4542632
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4542747 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatttt 4542648  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  4542647 caagctacttagaaag 4542632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4721108 - 4720993
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4721108 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatttt 4721009  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  4721008 caagctacttagaaag 4720993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16941000 - 16940885
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  16941000 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 16940901  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  16940900 caagctacttagaaag 16940885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 27488356 - 27488471
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  27488356 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 27488455  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  27488456 caagctacttagaaag 27488471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 30554989 - 30554874
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  30554989 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 30554890  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  30554889 caagctacttagaaag 30554874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 4776103 - 4776218
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  4776103 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgtgggccgatctt 4776202  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  4776203 caagctacttagaaag 4776218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 26113385 - 26113270
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  26113385 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatctt 26113286  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  26113285 caagctacttagaaag 26113270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 28210677 - 28210792
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  28210677 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatctt 28210776  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  28210777 caagctacttagaaag 28210792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24302426 - 24302328
Alignment:
Q  208 tatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  24302426 tatctactatctgagcaagaagttcaccgaccgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcg 24302328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23971522 - 23971350
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||||| |||||  | || || |||||||| |||||  | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  23971522 ttgatcatgtacttaacagtactggaagattccatgggctgtgtgttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgatatctactatttgagta 23971423  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    ||||||| || || || ||  |||| ||| |  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23971422 agaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcctgggctgccaa 23971350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Original strand, 27545340 - 27545515
Alignment:
Q  119 aggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatc 218  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||      
T  27545340 aggcctttgatcatgtatttgactgtgttagaagattctatgggctgtgtgttgggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactact 27545439  T
Q  219 tgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgc 294  Q
    |||| |||||||||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||    
T  27545440 tgagtaagaagtttaccgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacctgttgcgctttggcatgggctgc 27545515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Original strand, 18119913 - 18120085
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| ||||| || |||||  |||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |    
T  18119913 ttgatcatgtatttaacagtactagaagattccatgggctgtgttttgggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagta 18120012  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    ||||||| || || || ||  |||| ||| |  | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  18120013 agaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaacttgttgtgctttaacttgggctgccaa 18120085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18212391 - 18212249
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| ||      
T  18212391 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgttatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatact 18212292  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18212291 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcttgggctgccaa 18212249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Original strand, 25707448 - 25707564
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||     
T  25707448 aaggcctttgatcatgtacttgaccgggttagaagattctatgggctgtgtgttggatcaacaagacgagactggaaaaaaagagcatgccatttactac 25707547  T
Q  218 ctgagcaagaagtttac 234  Q
     |||| |||||||||||    
T  25707548 ttgagtaagaagtttac 25707564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9136105 - 9135927
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||| ||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  9136105 ttgatcatgtacctaacagtgctagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 9136006  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9136005 agaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 9135927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9136279 - 9136217
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  9136279 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 9136217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 125)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28112813 - 28112625
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28112813 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 28112714  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28112713 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 28112625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6539601 - 6539405
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6539601 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 6539502  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  6539501 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatt 6539405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 18246142 - 18246330
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18246142 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 18246241  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18246242 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 18246330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 4420316 - 4420512
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4420316 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctattat 4420415  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  4420416 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatt 4420512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 4627186 - 4627374
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4627186 aaggcctttgattatgtatttggcagtattcgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 4627285  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  4627286 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggccgctaaacgcctgcg 4627374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 21678104 - 21678292
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21678104 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaacgggaaagaaagaacatgctatctactat 21678203  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21678204 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 21678292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 24331564 - 24331760
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24331564 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 24331663  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  24331664 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatt 24331760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31961314 - 31961118
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31961314 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 31961215  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  31961214 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatt 31961118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 5017115 - 5017303
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5017115 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 5017214  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5017215 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctaccaaacgcctgcg 5017303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5593216 - 5593028
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5593216 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 5593117  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5593116 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 5593028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5606173 - 5605985
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5606173 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 5606074  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5606073 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 5605985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 5714474 - 5714662
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5714474 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 5714573  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5714574 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcg 5714662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 5725384 - 5725572
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5725384 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 5725483  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5725484 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcg 5725572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5766984 - 5766796
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5766984 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 5766885  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5766884 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcg 5766796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 7999961 - 8000157
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7999961 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgacgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 8000060  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  8000061 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatt 8000157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17992790 - 17992602
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17992790 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 17992691  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17992690 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 17992602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 18228597 - 18228785
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18228597 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactat 18228696  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18228697 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 18228785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 47026854 - 47027042
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47026854 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 47026953  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  47026954 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 47027042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 5470389 - 5470577
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5470389 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 5470488  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5470489 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgctagagaagacttgttgtgctctagcgtgggctgccaaacgcctgcg 5470577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 6205304 - 6205492
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6205304 aaggcccttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 6205403  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  6205404 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcttgggccgctaaacgcctgcg 6205492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 10646474 - 10646670
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10646474 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgacgaatccatgagatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 10646573  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  10646574 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatt 10646670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 28024683 - 28024871
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  28024683 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactac 28024782  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||| | || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28024783 ctaagcaagaagttcaccaattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 28024871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 28342578 - 28342774
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28342578 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 28342677  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  28342678 ctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgccattatt 28342774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 32294029 - 32294217
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32294029 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 32294128  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32294129 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 32294217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 8215136 - 8215324
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  8215136 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgagtccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctacctactat 8215235  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8215236 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 8215324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 19697891 - 19698079
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19697891 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgttcgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 19697990  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  19697991 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 19698079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20573702 - 20573514
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20573702 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 20573603  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  20573602 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgctaaacgcctgcg 20573514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22867707 - 22867519
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22867707 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagataaaaccggaaagaaagagcatgttatctactat 22867608  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22867607 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgcactagcttgggctgccaaacgcctgcg 22867519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22882766 - 22882578
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22882766 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagataaaaccggaaagaaagagcatgttatctactat 22882667  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22882666 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgcactagcttgggctgccaaacgcctgcg 22882578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29661829 - 29661641
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||     
T  29661829 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactac 29661730  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29661729 ctaagcaagaagtttaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcg 29661641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 4687056 - 4687244
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4687056 aaggcccttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactat 4687155  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  4687156 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 4687244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 4725032 - 4725220
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4725032 aaggcccttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactat 4725131  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  4725132 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 4725220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 7076607 - 7076795
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7076607 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 7076706  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  7076707 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 7076795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8286329 - 8286141
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8286329 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 8286230  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||    
T  8286229 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcttgggccgctaaacgcctgcg 8286141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16621349 - 16621185
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16621349 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttgatgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 16621250  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctct 282  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16621249 ctgagcaagaagttcactgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctct 16621185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 51785424 - 51785612
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51785424 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 51785523  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  51785524 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 51785612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 10399545 - 10399733
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10399545 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactat 10399644  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  10399645 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 10399733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15737953 - 15737765
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15737953 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 15737854  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  15737853 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 15737765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 18334031 - 18334219
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  18334031 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactac 18334130  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  18334131 ctaagcaagaagtttaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 18334219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 20069441 - 20069629
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20069441 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 20069540  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  20069541 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatgcaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 20069629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22384437 - 22384249
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22384437 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 22384338  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  22384337 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 22384249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29145615 - 29145427
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29145615 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 29145516  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  29145515 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 29145427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 32442552 - 32442740
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32442552 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 32442651  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  32442652 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 32442740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 35884167 - 35884355
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35884167 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 35884266  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  35884267 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 35884355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 48469328 - 48469516
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48469328 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 48469427  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  48469428 ctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 48469516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15889564 - 15889391
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15889564 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 15889465  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggc 291  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15889464 ataagcaagaagttcaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggc 15889391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4343535 - 4343347
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4343535 aaggcctttgattatgtatttggtagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 4343436  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||    
T  4343435 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcctgggccgctaaacgcctgcg 4343347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4793494 - 4793306
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4793494 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 4793395  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  4793394 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 4793306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 8299372 - 8299560
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8299372 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagattggaaagaaagaacatgctatctactat 8299471  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||    
T  8299472 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcttgggccgctaaacgcctgcg 8299560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18304513 - 18304325
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18304513 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 18304414  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  18304413 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaggcttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 18304325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17981808 - 17981620
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17981808 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactat 17981709  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  17981708 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 17981620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 282
Target Start/End: Original strand, 18054663 - 18054827
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18054663 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 18054762  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctct 282  Q
     | || |||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18054763 ttaagtaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctct 18054827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18273911 - 18273723
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  18273911 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaggaacatgctatctactat 18273812  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  18273811 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaggcttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 18273723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18289212 - 18289024
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  18289212 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaggaacatgctatctactat 18289113  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  18289112 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaggcttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 18289024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31033095 - 31032907
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31033095 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 31032996  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||    
T  31032995 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcttgggccgctaaacgcctgcg 31032907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 18054449 - 18054564
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18054449 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 18054548  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  18054549 caagctactcagaaag 18054564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 18333817 - 18333932
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  18333817 cagcaccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 18333916  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  18333917 caagctactcagaaag 18333932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 5593430 - 5593315
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5593430 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatctt 5593331  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  5593330 caagctactcagaaag 5593315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15738167 - 15738052
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  15738167 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 15738068  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  15738067 caagctactcagaaag 15738052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18274125 - 18274010
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18274125 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatctt 18274026  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  18274025 caagctactcagaaag 18274010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18289426 - 18289311
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18289426 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatctt 18289327  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  18289326 caagctactcagaaag 18289311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18304727 - 18304612
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18304727 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatctt 18304628  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  18304627 caagctactcagaaag 18304612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 21677890 - 21678005
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  21677890 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 21677989  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  21677990 caagctactcagaaag 21678005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 35883953 - 35884068
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  35883953 cagcaccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 35884052  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  35884053 caagctactcagaaag 35884068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 118 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11107218 - 11107056
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11107218 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 11107119  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgct 280  Q
    || |||||||| || ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11107118 ctaagcaagaaattcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgct 11107056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4793701 - 4793593
Alignment:
Q  12 acagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatta 111  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  4793701 acagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagcta 4793602  T
Q  112 ctcagaaag 120  Q
    |||||||||    
T  4793601 ctcagaaag 4793593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 4686842 - 4686957
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  4686842 cagctccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 4686941  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  4686942 caagctactcagaaag 4686957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 4724818 - 4724933
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  4724818 cagctccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 4724917  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  4724918 caagctactcagaaag 4724933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 6205090 - 6205205
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  6205090 cagctccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 6205189  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  6205190 caagctactcagaaag 6205205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 8286535 - 8286428
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  8286535 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 8286436  T
Q  113 tcagaaag 120  Q
    ||||||||    
T  8286435 tcagaaag 8286428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 8299158 - 8299273
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  8299158 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 8299257  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  8299258 caagctactcagaaag 8299273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 29145829 - 29145714
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  29145829 cagctccacagaccgagaagcaagttagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 29145730  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  29145729 caagctactcagaaag 29145714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 29662043 - 29661941
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  29662043 cagccccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 29661944  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  29661943 caa 29661941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15889778 - 15889663
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  15889778 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 15889679  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  | |||||||||    
T  15889678 caagctcctcagaaag 15889663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 20069227 - 20069342
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  20069227 cagctccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 20069326  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  20069327 caagctactcagaaag 20069342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22384651 - 22384536
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  22384651 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgaacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 22384552  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  22384551 caagctactcagaaag 22384536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 28024469 - 28024584
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  28024469 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 28024568  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  28024569 caagctactcagaaag 28024584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11107420 - 11107310
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||      
T  11107420 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgtgggccgatcttcaagc 11107321  T
Q  110 tactcagaaag 120  Q
    |||||||||||    
T  11107320 tactcagaaag 11107310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20573916 - 20573814
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20573916 cagctccacggacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcggaccgatttt 20573817  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  20573816 caa 20573814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 10399331 - 10399446
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  10399331 cagctccacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 10399430  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  10399431 caagctactcagaaag 10399446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 32442338 - 32442453
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  32442338 cagctccacggatcgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 32442437  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  32442438 caagctactcagaaag 32442453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 48469114 - 48469216
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  48469114 cagctccacagacagagaaacaagtcataggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 48469213  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  48469214 caa 48469216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 5606387 - 5606272
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  5606387 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 5606288  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  5606287 caagctactcagaaag 5606272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 7076393 - 7076508
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  7076393 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcgcatgaccgcaacctgcggaccgatctt 7076492  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  7076493 caagctactcagaaag 7076508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16621555 - 16621452
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  16621555 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 16621456  T
Q  113 tcag 116  Q
    ||||    
T  16621455 tcag 16621452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 28113027 - 28112912
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  28113027 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgacagcaacctgcgggccgatctt 28112928  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  28112927 caagctactcagaaag 28112912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 5016906 - 5017003
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaa 107  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5016906 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaa 5017003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4343749 - 4343634
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  4343749 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 4343650  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  4343649 caagctacttagaaag 4343634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 4420102 - 4420217
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  4420102 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 4420201  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  4420202 caagctacttagaaag 4420217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 5470175 - 5470290
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  5470175 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatctt 5470274  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  5470275 caagctactcagaaag 5470290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 6539815 - 6539700
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  6539815 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 6539716  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  6539715 caagctacttagaaag 6539700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 7999747 - 7999862
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  7999747 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 7999846  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  7999847 caagctacttagaaag 7999862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 10646260 - 10646375
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  10646260 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 10646359  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  10646360 caagctacttagaaag 10646375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17982022 - 17981907
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  17982022 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 17981923  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  17981922 caagctacttagaaag 17981907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 18228383 - 18228498
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  18228383 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 18228482  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  18228483 caagctacttagaaag 18228498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 18245928 - 18246043
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||  || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  18245928 cagctccacagatagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 18246027  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||| |||| ||||||    
T  18246028 caaactacttagaaag 18246043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22867921 - 22867806
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  22867921 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 22867822  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  22867821 caagctacttagaaag 22867806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22882980 - 22882865
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  22882980 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 22882881  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  22882880 caagctacttagaaag 22882865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 24331350 - 24331465
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  24331350 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 24331449  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  24331450 caagctacttagaaag 24331465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 28342364 - 28342479
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  28342364 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccgatctt 28342463  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  28342464 caagctactcagaaag 28342479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 31961528 - 31961413
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  31961528 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 31961429  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  31961428 caagctacttagaaag 31961413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 47026640 - 47026751
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  47026640 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccaatctt 47026739  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  47026740 caagctactcag 47026751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 51785210 - 51785325
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  51785210 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 51785309  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  51785310 caagctacttagaaag 51785325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 8214922 - 8215024
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  8214922 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 8215021  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  8215022 caa 8215024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Original strand, 19697687 - 19697779
Alignment:
Q  15 gaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaa 107  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  19697687 gaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccaattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaa 19697779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6963292 - 6963134
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||     
T  6963292 aaggcctttgatcatgtacttgactgtgttggatgattctatgggctgcgtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactac 6963193  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttg 276  Q
     |||| ||||||||||| || || ||  |||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  6963192 ttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacttgttg 6963134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 294
Target Start/End: Original strand, 20443555 - 20443694
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||  || || ||| |||||||||||||||| ||||| ||| | || |||     
T  20443555 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagacgaaactggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgactgtgaatctcgctatt 20443654  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgc 294  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  20443655 ccatgctcgagaagacttgttgcgcactagcctgggctgc 20443694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11925180 - 11925038
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| |||     
T  11925180 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 11925081  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11925080 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcttgggctgccaa 11925038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15592762 - 15592585
Alignment:
Q  126 tgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaa 225  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||  || ||||| |  || || ||| | |||||    
T  15592762 tgattatgtacctgactgtgctagaagattctatgggttgtgtactcggacaacaagatgaaactagaagaaaggagcacgccatttattatttaagcaa 15592663  T
Q  226 gaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    ||||||||| ||| | ||| | || ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15592662 gaagtttactgacggtgaatctcgctattccatgcttgagaggacttgttgtgctctagcctgggttgccaaacgcct 15592585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7088849 - 7088707
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| |||     
T  7088849 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 7088750  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7088749 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcctgggctgccaa 7088707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 16431843 - 16431985
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| ||      
T  16431843 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgttatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatact 16431942  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16431943 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcttgggctgccaa 16431985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 22959891 - 22960033
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| |||     
T  22959891 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 22959990  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  22959991 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttaacttgggctgccaa 22960033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 234
Target Start/End: Original strand, 4446843 - 4446952
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||  |||| |    
T  4446843 ttgatcatgtacttgaccgtgttagaagattctatgggctgtgtgttgggtcaacaggacgagacgggaaagaaagagcatgccatttactacttgagta 4446942  T
Q  225 agaagtttac 234  Q
    ||||||||||    
T  4446943 agaagtttac 4446952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 303
Target Start/End: Original strand, 15918958 - 15919103
Alignment:
Q  158 atgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacga 257  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||| ||| ||||| |  || || ||| | ||||| |||||||| ||||| ||| | || ||| | |    
T  15918958 atgggttgtgtactcggacaacaagatgaaattggaaggaaggagcacgccatttattatttaagcaaaaagtttactgactgtgaatctcgctattcca 15919057  T
Q  258 tgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  15919058 tgcttgagaggacttgttgtgctctggcctgggctgccaaacgcct 15919103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Original strand, 46380742 - 46380914
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  46380742 ttgatcatgtacctaacggtgttagaagattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 46380841  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  46380842 agaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaa 46380914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 291
Target Start/End: Original strand, 5653576 - 5653659
Alignment:
Q  208 tatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggc 291  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  5653576 tatctactatctaagcaagaagctcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttatgctctggcctgggc 5653659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5950654 - 5950476
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||| ||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  5950654 ttgatcatgtacctaacagtgctagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 5950555  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5950554 agaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 5950476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Original strand, 6571792 - 6571868
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtt 231  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  6571792 tccatgggctgtgtgttaggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatttgagtaagaagtt 6571868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15592939 - 15592875
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  15592939 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgacagcaacgtgcaggccgatattcaaattactc 15592875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 15704911 - 15705053
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| || || || || ||  |||| ||      
T  15704911 tccatgggctgtgtgttaggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagaacatgctatctactatttgagtaagaaattcactgattgtgagtcccgatact 15705010  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15705011 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcctgggctgccaa 15705053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Original strand, 15918749 - 15918813
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||    
T  15918749 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgacagcaacgtgcggaccgatattcaaactactc 15918813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5950828 - 5950766
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  5950828 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 5950766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 108
Target Start/End: Original strand, 20443349 - 20443407
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaa 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||    
T  20443349 tgaattacatctcccgtttcatctctcatatgactgcaacatgtgggccgatattcaaa 20443407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37260429 - 37260383
Alignment:
Q  257 atgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37260429 atgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 37260383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 108
Target Start/End: Original strand, 41440475 - 41440533
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaa 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||    
T  41440475 tgaattacatctcccgtttcatctctcatatgactgcaacatgtgggccgatattcaaa 41440533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 3644577 - 3644766
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3644577 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 3644676  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcg-aagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3644677 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 3644766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 10966107 - 10966295
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10966107 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactat 10966206  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10966207 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 10966295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41790126 - 41789930
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41790126 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 41790027  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  41790026 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaagcgcctgcgccattatt 41789930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 28588427 - 28588615
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28588427 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 28588526  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28588527 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 28588615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 10948519 - 10948707
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10948519 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 10948618  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10948619 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 10948707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 28153178 - 28153366
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28153178 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 28153277  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28153278 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 28153366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 51641660 - 51641848
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51641660 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactat 51641759  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  51641760 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 51641848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16204850 - 16204662
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16204850 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 16204751  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| |||||||    
T  16204750 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctaggccgccaaacgcctgcg 16204662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 128 - 306
Target Start/End: Original strand, 20464428 - 20464606
Alignment:
Q  128 attatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaaga 227  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20464428 attatgtatttgtcagtgtttgatgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaaga 20464527  T
Q  228 agtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  20464528 agttcaccgactgtgaaactcggtatacgatacttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgcaaaatgcctgcg 20464606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 3644360 - 3644462
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3644360 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 3644459  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  3644460 caa 3644462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21894565 - 21894391
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagca-tgatatctacta 216  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  21894565 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcactgctatctacta 21894466  T
Q  217 tctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggc 291  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  21894465 tctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgtttgagaggacttgttgtgctctggcctgggc 21894391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 20339320 - 20339220
Alignment:
Q  16 accgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||    
T  20339320 accgaaaagcaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactca 20339221  T
Q  116 g 116  Q
    |    
T  20339220 g 20339220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21894762 - 21894664
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaag 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||    
T  21894762 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaaag 21894664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 28588218 - 28588315
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaa 107  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28588218 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtctgaattacatctcccggttcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaa 28588315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 51641446 - 51641561
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  51641446 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatctt 51641545  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  51641546 caagctactcagaaag 51641561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 10948305 - 10948420
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  10948305 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 10948404  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  10948405 caagctacttagaaag 10948420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 10965893 - 10966004
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  10965893 cagctccacaaacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccaatctt 10965992  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  10965993 caagctactcag 10966004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 20464212 - 20464315
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||  |||    
T  20464212 cagaccgagaaacaagtctgaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatcttcaagctac 20464311  T
Q  113 tcag 116  Q
    ||||    
T  20464312 tcag 20464315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16205055 - 16204953
Alignment:
Q  14 agaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattact 113  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||    
T  16205055 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcagacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctact 16204956  T
Q  114 cag 116  Q
    |||    
T  16204955 cag 16204953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20337142 - 20337044
Alignment:
Q  208 tatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  20337142 tatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaaacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcg 20337044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 41790323 - 41790225
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcagaaag 120  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||    
T  41790323 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagctacttagaaag 41790225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20339117 - 20339024
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatc 211  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||||    
T  20339117 aaggcctttgattatgtatttgtcaatgtttgatgaatccgtgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaacttgaaagaaagaacatgctatc 20339024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 22489500 - 22489642
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || || ||  |||| |||     
T  22489500 tccatgggctgtgtgttgggccaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 22489599  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  22489600 cagtacttgagaaaacttgttgtgatttagcctgggctgccaa 22489642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5628807 - 5628635
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  5628807 ttgatcatgtacctaacggtgttagaagattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 5628708  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5628707 agaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaa 5628635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16748218 - 16748030
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16748218 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 16748119  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16748118 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 16748030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26271787 - 26271599
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26271787 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactat 26271688  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26271687 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 26271599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26316549 - 26316361
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26316549 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactat 26316450  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26316449 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 26316361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 4202826 - 4203014
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4202826 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactat 4202925  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4202926 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 4203014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5144041 - 5143853
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5144041 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 5143942  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5143941 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 5143853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26512397 - 26512209
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26512397 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 26512298  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26512297 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 26512209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26666615 - 26666427
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26666615 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 26666516  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26666515 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 26666427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26681807 - 26681619
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26681807 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 26681708  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26681707 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 26681619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31561091 - 31560903
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31561091 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 31560992  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31560991 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 31560903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39209840 - 39209652
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39209840 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 39209741  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39209740 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 39209652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 45390657 - 45390845
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45390657 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 45390756  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45390757 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 45390845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16446707 - 16446534
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16446707 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 16446608  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggc 291  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  16446607 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggc 16446534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 2776691 - 2776879
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2776691 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 2776790  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2776791 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgcgaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 2776879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 10845057 - 10845245
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10845057 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 10845156  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  10845157 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcg 10845245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 31127344 - 31127532
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31127344 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 31127443  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31127444 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 31127532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4141947 - 4141759
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4141947 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 4141848  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  4141847 ctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 4141759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10842695 - 10842507
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||| || ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10842695 aaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtggggtgcgtaataggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 10842596  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  10842595 ctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcg 10842507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16515131 - 16514943
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16515131 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 16515032  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  16515031 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 16514943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 125 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11421473 - 11421292
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  11421473 ttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagca 11421374  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    ||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  11421373 agaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 11421292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10913570 - 10913382
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10913570 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 10913471  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  10913470 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 10913382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 11444324 - 11444512
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11444324 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgttatctactat 11444423  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  11444424 ctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 11444512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 26516229 - 26516417
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26516229 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgctcggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 26516328  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  26516329 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 26516417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 282
Target Start/End: Original strand, 5131434 - 5131597
Alignment:
Q  119 aggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatc 218  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5131434 aggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatc 5131533  T
Q  219 tgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctct 282  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5131534 taagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctct 5131597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 3448743 - 3448931
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3448743 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaggatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 3448842  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  3448843 ctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 3448931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 22145632 - 22145820
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22145632 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactat 22145731  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  22145732 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 22145820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 26438694 - 26438882
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  26438694 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactat 26438793  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  26438794 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 26438882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 306
Target Start/End: Original strand, 16044762 - 16044940
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  16044762 ttgattatgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagca 16044861  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16044862 agaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagac---ttgtgctctggcttgggccgccaaacgcctgcg 16044940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2106857 - 2106676
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  2106857 ttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtaattggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagca 2106758  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    ||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  2106757 agaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 2106676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 2158011 - 2158199
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  2158011 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgagtccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactagaaagaaagaacatgctatctactat 2158110  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  2158111 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 2158199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24589235 - 24589047
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24589235 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactat 24589136  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  24589135 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 24589047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31087323 - 31087135
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31087323 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactat 31087224  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  31087223 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 31087135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 125 - 306
Target Start/End: Original strand, 45734757 - 45734938
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||    
T  45734757 ttgattttgtatttgtcagtgtttgatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagca 45734856  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  45734857 agaagtttaccgattgcgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 45734938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26534574 - 26534386
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26534574 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 26534475  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    ||||||||||| || |||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  26534474 ctgagcaagaaattcaccgatggtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 26534386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 10913784 - 10913669
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  10913784 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 10913685  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  10913684 caagctactcagaaag 10913669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11421694 - 11421579
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  11421694 cagctccacagaccgagaagcaagtcagagggttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 11421595  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  11421594 caagctactcagaaag 11421579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 2157797 - 2157899
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  2157797 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 2157896  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  2157897 caa 2157899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 26438480 - 26438582
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26438480 cagctccacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatttt 26438579  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  26438580 caa 26438582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2107078 - 2106963
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  2107078 cagctccacataccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 2106979  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  2106978 caagctactcagaaag 2106963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 5131219 - 5131334
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  5131219 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 5131318  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  5131319 caagctactcagaaag 5131334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 5144255 - 5144140
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  5144255 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaataacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 5144156  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  5144155 caagctactcagaaag 5144140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 26272001 - 26271886
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  26272001 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 26271902  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  26271901 caagctacttagaaag 26271886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 26534788 - 26534673
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  26534788 cagctccacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatttcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 26534689  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  26534688 caagctactcagaaag 26534673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 45390443 - 45390558
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  45390443 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatctt 45390542  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||| |||||||||||    
T  45390543 caaactactcagaaag 45390558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 26516015 - 26516117
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26516015 cagctccacaaacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 26516114  T
Q  105 caa 107  Q
    |||    
T  26516115 caa 26516117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 16044550 - 16044653
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16044550 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagttac 16044649  T
Q  113 tcag 116  Q
    ||||    
T  16044650 tcag 16044653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16515337 - 16515230
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||    
T  16515337 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggctgatcttcaagctac 16515238  T
Q  113 tcagaaag 120  Q
    ||||||||    
T  16515237 tcagaaag 16515230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 10844851 - 10844954
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  10844851 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 10844950  T
Q  113 tcag 116  Q
    ||||    
T  10844951 tcag 10844954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 22145418 - 22145533
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  22145418 cagctccacagaccgagaaacaagttagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 22145517  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  22145518 caagctactcagaaag 22145533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 3448529 - 3448644
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  3448529 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 3448628  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  3448629 caagctacttagaaag 3448644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4142161 - 4142046
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  4142161 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 4142062  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  4142061 caagctacttagaaag 4142046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 11444110 - 11444225
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  11444110 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 11444209  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  11444210 caagctacttagaaag 11444225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 24589449 - 24589334
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  24589449 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 24589350  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  24589349 caagctacttagaaag 24589334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 26666829 - 26666714
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  26666829 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 26666730  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  26666729 caagctacttagaaag 26666714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 31561305 - 31561190
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||| || || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  31561305 cagctccacaaacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 31561206  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||| |||| ||||||    
T  31561205 caaactacttagaaag 31561190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 4202612 - 4202727
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  4202612 cagctccacagacagagaagcaagttagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatctt 4202711  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  4202712 caagctactcagaaag 4202727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 9621873 - 9621984
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  9621873 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatctt 9621972  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  9621973 caagctactcag 9621984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10842901 - 10842798
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  10842901 cagaccgagaaacaagttagaggtttcctcgggcgattgcattacatctcccgatttatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 10842802  T
Q  113 tcag 116  Q
    ||||    
T  10842801 tcag 10842798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26316763 - 26316652
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  26316763 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatctt 26316664  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  26316663 caagctactcag 26316652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Original strand, 25726934 - 25727047
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||     
T  25726934 aaggccgttgatcatgtatttgactgtgttagatgattctatgggctgtgtgcttggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgccatttactac 25727033  T
Q  218 ctgagcaagaagtt 231  Q
     |||| ||||||||    
T  25727034 ttgagtaagaagtt 25727047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Original strand, 2556979 - 2557151
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| ||||| || |||||  |||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |    
T  2556979 ttgatcatgtatttaacagtactagaagattccatgggctgtgttttgggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagta 2557078  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    ||||||| || || || ||  |||| ||| |  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2557079 agaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcttgggctgccaa 2557151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16446894 - 16446810
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcag 116  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||    
T  16446894 gaggtttcctcgggtgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcaggccgatcttcaagctactcag 16446810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 306
Target Start/End: Original strand, 5161910 - 5162008
Alignment:
Q  208 tatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  5161910 tatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 5162008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16748415 - 16748321
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactcag 116  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||  |||||||    
T  16748415 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgtgggccgatcttcaagctactcag 16748321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16127482 - 16127340
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| |||     
T  16127482 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 16127383  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16127382 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcttgggctgccaa 16127340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 29089990 - 29090132
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| |||     
T  29089990 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 29090089  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29090090 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcttgggctgccaa 29090132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1893275 - 1893100
Alignment:
Q  119 aggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatc 218  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||      
T  1893275 aggcctttgatcatgtatttgactgtgttagaagattctatgggctgtgtgttgggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacaccatttactact 1893176  T
Q  219 tgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgc 294  Q
    |||| ||||||||||| || || ||  |||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||    
T  1893175 tgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacctgttgcgctttggcatgggctgc 1893100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 798187 - 798029
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||  || || ||| ||||||||||||||||||| || ||| | || |||     
T  798187 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagacgaaactggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttaccgattgtgaatctcgctatt 798088  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactat 313  Q
    | ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||    
T  798087 ccatggtcgagaagacctgttgcgcactagcctgggccgccaaacgcctccgtcactat 798029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16287043 - 16286885
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  || |||||||  || || ||| |||||||||||||||| ||||| ||| | || |||     
T  16287043 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgactgtgaatctcgctatc 16286944  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactat 313  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||    
T  16286943 ccatgctcgagaaaacctgttgtgcactagcctgggctgcaaaacgcctccgccactat 16286885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30369640 - 30369462
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  30369640 ttgatcatgtacctaacagtgttagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 30369541  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30369540 agaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 30369462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 296
Target Start/End: Original strand, 9469764 - 9469935
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  9469764 ttgatcatgtacctaacagtgttagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 9469863  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgcca 296  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9469864 agaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgcca 9469935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 15193557 - 15193699
Alignment:
Q  155 tccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtata 254  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || || || ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || || || ||  |||| |||     
T  15193557 tccatgggctgtgttttgggtcaacaagatgaaaccgggaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 15193656  T
Q  255 cgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |  |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15193657 ctgtatttgagaaaacttgttgtgctttagcttgggctgccaa 15193699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16393128 - 16392950
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | |||||| ||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  16393128 ttgatcatgtacctaacagtgctagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 16393029  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16393028 agaagtttactgaatgtgaatctcgctactccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 16392950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 293
Target Start/End: Original strand, 16237975 - 16238093
Alignment:
Q  175 tcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgt 274  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| | ||||| |||| |||| |||||||| || || || ||  |||| ||| | || |||||||| ||||||    
T  16237975 tcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctcctatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctatacttgagaaaacttgt 16238074  T
Q  275 tgtgctctagcttgggctg 293  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  16238075 tgtgctttagcctgggctg 16238093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Original strand, 9469590 - 9469652
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  9469590 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 9469652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16393302 - 16393240
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  16393302 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 16393240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 30369814 - 30369752
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  30369814 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 30369752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16287249 - 16287201
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggcc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  16287249 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgactgcaacatgtgggcc 16287201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 9476 - 9672
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  9476 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactat 9575  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  9576 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatt 9672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 9262 - 9377
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9262 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 9361  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  9362 caagctactcagaaag 9377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 9462 - 9650
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9462 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 9561  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9562 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 9650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 9248 - 9363
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  9248 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 9347  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  9348 caagctacttagaaag 9363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23007 - 22819
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23007 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactat 22908  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22907 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcg 22819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 23221 - 23110
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  23221 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccaatctt 23122  T
Q  105 caaattactcag 116  Q
    |||  |||||||    
T  23121 caagctactcag 23110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 11389 - 11585
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11389 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactat 11488  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcgccactatt 314  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11489 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcgatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatt 11585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 11175 - 11290
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  11175 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatctt 11274  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  11275 caagctacttagaaag 11290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5464 - 5302
Alignment:
Q  141 cagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagtttaccgactg 240  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5464 cagtgtttgatgaatctatgggatgtgtattgggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgccatctactatctaagcaagaagtttaccgactg 5365  T
Q  241 cgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5364 cgaaattcggtatacgatgcttgagaagacttgctgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 5302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 5693 - 5590
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||  |||    
T  5693 cagactgagaagcaagtcagaggttttctcgggcgtttgaattatatctcaaggttcatatctcacatgactgccacctgcgggccgatcttcaagctac 5594  T
Q  113 tcag 116  Q
    ||||    
T  5593 tcag 5590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 9485 - 9673
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9485 aaggcctttgattatgtatctgtcagtgtttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 9584  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||| |||||||    
T  9585 ctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggccttggccgccaaacgcctgcg 9673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 9279 - 9380
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  9279 cagaccgagaaacaagtcagaggcttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagttac 9378  T
Q  113 tc 114  Q
    ||    
T  9379 tc 9380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 291
Target Start/End: Original strand, 16021 - 16194
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16021 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 16120  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggc 291  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16121 ctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggc 16194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 15807 - 15922
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||    
T  15807 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatctt 15906  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  15907 caagctacttagaaag 15922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11744 - 11556
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11744 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactat 11645  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11644 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcg 11556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11958 - 11843
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  11958 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatctt 11859  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||| ||||||    
T  11858 caagctacttagaaag 11843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Original strand, 3507 - 3695
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3507 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactat 3606  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||    
T  3607 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcg 3695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 44021 - 43906
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  44021 cagctccacagacccagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctt 43922  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  43921 caagctactcagaaag 43906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 3301 - 3408
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattac 112  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  3301 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 3400  T
Q  113 tcagaaag 120  Q
    ||||||||    
T  3401 tcagaaag 3408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 32167 - 32096
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgacc 84  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32167 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgacc 32096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 291
Target Start/End: Original strand, 13011 - 13184
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13011 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 13110  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggc 291  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13111 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcctgggc 13184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 12797 - 12911
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12797 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatctt 12896  T
Q  105 caaattactcagaaa 119  Q
    |||  ||||||||||    
T  12897 caagctactcagaaa 12911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5995 - 5807
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactat 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5995 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaggatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactat 5896  T
Q  218 ctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcctgcg 306  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||    
T  5895 ctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcg 5807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 6209 - 6094
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  6209 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 6110  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  6109 caagctactcagaaag 6094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Original strand, 23105 - 23183
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgac 83  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23105 cagctccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgac 23183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 1643 - 1543
Alignment:
Q  16 accgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||    
T  1643 accgaaaagcaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactca 1544  T
Q  116 g 116  Q
    |    
T  1543 g 1543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1347
Alignment:
Q  118 aaggcccttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatc 211  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||||    
T  1440 aaggcctttgattatgtatttgtcaatgtttgatgaatccgtgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaacttgaaagaaagaacatgctatc 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 1149 - 1264
Alignment:
Q  5 cagcaccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatttt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  1149 cagctccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgaacgaatgaataacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctt 1248  T
Q  105 caaattactcagaaag 120  Q
    |||  |||||||||||    
T  1249 caagctactcagaaag 1264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43533 - 43384
Alignment:
Q  129 ttatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaag-acgagactgg-aaagaaagagcatgatatctactatctgagcaag 226  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  43533 ttatgtatttggcagtatttgatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagaatgagactggaaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaag 43434  T
Q  227 aagtttaccgactg-cgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgtt 275  Q
    ||||| ||||| ||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43433 aagttcaccgattgtagaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgtt 43384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 43754 - 43666
Alignment:
Q  21 aaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaa-ttacatctcccgattcatatctcatatgaccgc-aacctgcgggccaattttcaa 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||    
T  43754 aaagcaagtcagaggtttcctcggacgcttaaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaaacctgcgggccgatcttcaa 43666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35048 - 34871
Alignment:
Q  126 tgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaa 225  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  || ||||| |  || || ||||| |||||    
T  35048 tgattatgtacctgactgtgctagaagattctatgggttgtgtactcggacaacaagatgaaactggaagaaaggagcacgccatttattatctaagcaa 34949  T
Q  226 gaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    ||||||||| ||||| ||| | || ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34948 gaagtttactgactgtgaatctcgctattccatgcttgagaggacttgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 34871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 35225 - 35161
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  35225 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgacggcaacgtgcgggccgatattcaaattactc 35161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 297
Target Start/End: Original strand, 10665 - 10837
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| ||||| || |||||  |||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| |||| |    
T  10665 ttgatcatgtatttaacagtactagaagattccatgggctgtgttttgggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagta 10764  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    ||||||| || || || ||  |||| ||| |  | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  10765 agaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaacttgttgtgctttaacttgggctgccaa 10837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4724 - 4573
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||  |||| |    
T  4724 ttgatcatgtacttgactgtgttggatgattctatgggttgcgtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagta 4625  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttg 276  Q
    |||||||||| || || ||  |||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  4624 agaagtttactgattgtgagtcccgatactctatgcttgagaaaacttgttg 4573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5213 - 5047
Alignment:
Q  131 atgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagcaagaagt 230  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  5213 atgtatttgaccgtgctagaagattctatgggttgtgtgctcgggcagcaagaagaaactggaaggaaagaacatgttatttactatttgagcaagaagt 5114  T
Q  231 ttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaa 297  Q
    |||| ||  | ||  | ||||||   || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  5113 ttacagatagtgagtctcggtatttcatacttgagaagacttgatgtgctttagcctgggctgccaa 5047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 303
Target Start/End: Original strand, 29617 - 29795
Alignment:
Q  125 ttgattatgtacttgacagtgttagatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgatatctactatctgagca 224  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |  || || ||| | ||||    
T  29617 ttgatcatgtacctaacggtgttagaaaattccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagca 29716  T
Q  225 agaagtttaccgactgcgaagcccggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaatgcct 303  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29717 agaagtttactgaatgtgaatctcgatactccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcct 29795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Original strand, 29443 - 29505
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaattactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  29443 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 29505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 33706 - 33770
Alignment:
Q  25 caagtccgaggtttcctcggg-cgtttgaattacatctcccga-ttc-atatctcatatgaccgc 86  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  33706 caagtcagaggtttcctcggggcgtttgaattacatctcccgacttctatatctcacatgaccgc 33770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University