View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4121_high_3 (Length: 382)

Name: NF4121_high_3
Description: NF4121
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4121_high_3
NF4121_high_3
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (2-369)||(7715-8083)
[»] chr1 (94 HSPs)
chr1 (3-369)||(32785639-32786005)
chr1 (1-369)||(22599868-22600252)
chr1 (3-368)||(22427046-22427425)
chr1 (3-369)||(2267101-2267448)
chr1 (1-369)||(36134200-36134567)
chr1 (1-369)||(39200712-39201062)
chr1 (2-369)||(16234998-16235365)
chr1 (2-246)||(28492228-28492473)
chr1 (1-369)||(2834700-2835083)
chr1 (2-337)||(33256071-33256420)
chr1 (2-337)||(33276243-33276592)
chr1 (1-226)||(1900355-1900581)
chr1 (2-369)||(10757432-10757797)
chr1 (1-226)||(38282577-38282802)
chr1 (1-305)||(35040176-35040479)
chr1 (2-226)||(20954317-20954542)
chr1 (1-369)||(2268541-2268921)
chr1 (1-214)||(22153867-22154081)
chr1 (1-226)||(29215807-29216031)
chr1 (3-226)||(35401821-35402043)
chr1 (1-236)||(22464644-22464879)
chr1 (2-369)||(1577878-1578226)
chr1 (7-226)||(19717540-19717758)
chr1 (1-360)||(7309829-7310185)
chr1 (2-226)||(48704215-48704438)
chr1 (2-192)||(22201614-22201805)
chr1 (5-230)||(12284437-12284661)
chr1 (1-369)||(44821229-44821615)
chr1 (2-305)||(21028804-21029107)
chr1 (3-226)||(23036373-23036595)
chr1 (3-226)||(30893104-30893327)
chr1 (1-175)||(25448461-25448636)
chr1 (3-303)||(26701897-26702197)
chr1 (1-241)||(2327270-2327510)
chr1 (1-234)||(48570070-48570301)
chr1 (1-241)||(21702824-21703062)
chr1 (6-345)||(17024693-17025029)
chr1 (1-173)||(21191763-21191935)
chr1 (256-369)||(25448220-25448333)
chr1 (266-369)||(2327094-2327198)
chr1 (266-369)||(29216073-29216176)
chr1 (1-150)||(14263371-14263521)
chr1 (1-173)||(12613713-12613884)
chr1 (1-175)||(30572207-30572381)
chr1 (267-369)||(22154165-22154267)
chr1 (256-345)||(1900613-1900702)
chr1 (1-234)||(10250996-10251218)
chr1 (259-360)||(22464486-22464588)
chr1 (1-241)||(46088999-46089229)
chr1 (1-166)||(7744994-7745160)
chr1 (267-369)||(21703121-21703225)
chr1 (267-371)||(10251283-10251388)
chr1 (198-319)||(12284663-12284782)
chr1 (267-345)||(19717796-19717874)
chr1 (216-346)||(21191590-21191719)
chr1 (268-345)||(20954165-20954242)
chr1 (267-369)||(30572457-30572561)
chr1 (309-369)||(35402152-35402212)
chr1 (266-337)||(38282873-38282944)
chr1 (256-369)||(48569897-48570016)
chr1 (271-345)||(28492146-28492220)
chr1 (1-78)||(21204916-21204993)
chr1 (1-78)||(21984606-21984683)
chr1 (5-78)||(42284642-42284715)
chr1 (216-303)||(21204684-21204772)
chr1 (315-359)||(25448066-25448110)
chr1 (314-369)||(35040474-35040528)
chr1 (214-303)||(21984809-21984899)
chr1 (267-369)||(48704491-48704593)
chr1 (1-78)||(21121057-21121134)
chr1 (1-78)||(21135153-21135230)
chr1 (216-345)||(19170055-19170191)
chr1 (267-303)||(23025053-23025089)
chr1 (309-369)||(23036204-23036264)
chr1 (198-277)||(37642445-37642525)
chr1 (1-64)||(37642258-37642321)
chr1 (279-345)||(18896299-18896365)
chr1 (3-109)||(18896559-18896665)
chr1 (280-345)||(26547955-26548021)
chr1 (312-345)||(675915-675948)
chr1 (1-78)||(19215622-19215699)
chr1 (312-345)||(20799409-20799442)
chr1 (180-277)||(21120867-21120964)
chr1 (312-345)||(22609696-22609729)
chr1 (1-78)||(23024798-23024875)
chr1 (214-275)||(23024982-23025043)
chr1 (313-345)||(20867013-20867045)
chr1 (267-303)||(21120823-21120859)
chr1 (267-303)||(21134919-21134955)
chr1 (309-345)||(22019682-22019718)
chr1 (309-345)||(22655824-22655860)
chr1 (309-345)||(23065280-23065316)
chr1 (214-246)||(42284840-42284872)
chr1 (309-345)||(52350418-52350454)
[»] chr4 (90 HSPs)
chr4 (5-369)||(19884711-19885078)
chr4 (3-367)||(10072942-10073308)
chr4 (2-369)||(56034580-56034946)
chr4 (1-369)||(45833399-45833783)
chr4 (1-369)||(13575869-13576220)
chr4 (2-337)||(29680314-29680649)
chr4 (2-369)||(22675275-22675625)
chr4 (1-276)||(413007-413281)
chr4 (1-369)||(54679935-54680284)
chr4 (1-369)||(14604631-14605013)
chr4 (3-369)||(37435245-37435639)
chr4 (1-369)||(10692856-10693241)
chr4 (1-369)||(10906622-10907007)
chr4 (1-241)||(17247249-17247487)
chr4 (14-236)||(3483739-3483962)
chr4 (2-214)||(12811070-12811280)
chr4 (2-241)||(3395596-3395836)
chr4 (7-372)||(16632451-16632829)
chr4 (5-369)||(19620816-19621163)
chr4 (2-185)||(37985533-37985717)
chr4 (2-185)||(12601107-12601291)
chr4 (2-187)||(19666378-19666564)
chr4 (2-180)||(9140918-9141097)
chr4 (1-369)||(6517490-6517877)
chr4 (60-339)||(14833460-14833750)
chr4 (2-226)||(19911760-19911986)
chr4 (2-226)||(55380296-55380519)
chr4 (2-226)||(14904236-14904461)
chr4 (1-175)||(29121375-29121550)
chr4 (1-345)||(6641689-6642044)
chr4 (2-226)||(40846105-40846330)
chr4 (216-369)||(29121608-29121761)
chr4 (1-369)||(3105174-3105525)
chr4 (97-226)||(23123532-23123662)
chr4 (1-149)||(56533018-56533168)
chr4 (1-175)||(8105642-8105819)
chr4 (201-371)||(16940181-16940357)
chr4 (1-263)||(17398529-17398780)
chr4 (282-369)||(3497934-3498020)
chr4 (267-369)||(3793376-3793477)
chr4 (216-345)||(9141096-9141226)
chr4 (256-369)||(55732069-55732181)
chr4 (6-152)||(16940026-16940172)
chr4 (97-223)||(15139328-15139456)
chr4 (1-164)||(25651046-25651210)
chr4 (1-95)||(16853508-16853602)
chr4 (267-369)||(16853765-16853866)
chr4 (256-345)||(3395900-3395989)
chr4 (2-226)||(23750528-23750751)
chr4 (255-365)||(17247533-17247644)
chr4 (256-359)||(8105945-8106044)
chr4 (154-277)||(14571183-14571304)
chr4 (268-369)||(25650863-25650966)
chr4 (1-130)||(11915705-11915835)
chr4 (296-369)||(12810918-12810991)
chr4 (54-193)||(55731838-55731975)
chr4 (216-345)||(12601334-12601464)
chr4 (211-289)||(14904139-14904217)
chr4 (1-106)||(1672394-1672499)
chr4 (1-106)||(1674869-1674974)
chr4 (161-250)||(3793289-3793376)
chr4 (267-333)||(55380528-55380594)
chr4 (1-78)||(38513883-38513960)
chr4 (1-78)||(40860672-40860749)
chr4 (309-369)||(413337-413395)
chr4 (1-41)||(8685509-8685549)
chr4 (1-170)||(17787990-17788153)
chr4 (198-237)||(14153873-14153912)
chr4 (282-345)||(14904067-14904130)
chr4 (1-64)||(22190851-22190914)
chr4 (214-277)||(22191055-22191118)
chr4 (1-51)||(17540400-17540450)
chr4 (279-345)||(17540716-17540782)
chr4 (207-277)||(20977639-20977709)
chr4 (140-226)||(22089733-22089818)
chr4 (267-369)||(14571312-14571416)
chr4 (267-303)||(22191126-22191162)
chr4 (267-303)||(40860961-40860997)
chr4 (1-64)||(3499695-3499758)
chr4 (217-276)||(8105889-8105948)
chr4 (207-277)||(27188497-27188567)
chr4 (267-317)||(40846368-40846418)
chr4 (1-85)||(14154015-14154100)
chr4 (1-78)||(20977462-20977539)
chr4 (312-345)||(31266480-31266513)
chr4 (312-345)||(49001662-49001695)
chr4 (312-345)||(55651867-55651900)
chr4 (309-345)||(17993511-17993547)
chr4 (200-276)||(25650975-25651051)
chr4 (309-345)||(33378763-33378799)
[»] chr3 (112 HSPs)
chr3 (1-369)||(2561198-2561573)
chr3 (5-369)||(14969341-14969707)
chr3 (2-369)||(28582117-28582500)
chr3 (1-369)||(11223573-11223939)
chr3 (1-369)||(47207716-47208102)
chr3 (1-369)||(18121387-18121771)
chr3 (3-356)||(47405230-47405568)
chr3 (2-369)||(31303397-31303782)
chr3 (4-369)||(52920419-52920798)
chr3 (1-369)||(6090742-6091125)
chr3 (2-345)||(13948347-13948705)
chr3 (2-345)||(12962891-12963233)
chr3 (2-226)||(49642685-49642910)
chr3 (2-369)||(15903209-15903592)
chr3 (3-369)||(14392772-14393151)
chr3 (1-226)||(38177566-38177792)
chr3 (2-337)||(20646165-20646516)
chr3 (4-226)||(37467346-37467567)
chr3 (1-226)||(40799884-40800108)
chr3 (1-369)||(49553254-49553638)
chr3 (3-336)||(17238753-17239069)
chr3 (1-369)||(53056494-53056876)
chr3 (14-184)||(13824092-13824263)
chr3 (1-299)||(18142619-18142901)
chr3 (2-170)||(41495010-41495179)
chr3 (3-241)||(46349754-46349991)
chr3 (2-158)||(13780575-13780732)
chr3 (3-226)||(16658541-16658765)
chr3 (2-224)||(29951363-29951586)
chr3 (2-224)||(30000517-30000740)
chr3 (1-193)||(12726186-12726379)
chr3 (3-226)||(20627356-20627578)
chr3 (1-241)||(2785074-2785314)
chr3 (1-241)||(14955437-14955676)
chr3 (54-264)||(11869131-11869340)
chr3 (7-246)||(19888849-19889088)
chr3 (1-193)||(24775492-24775683)
chr3 (1-241)||(29855419-29855659)
chr3 (1-177)||(16032535-16032711)
chr3 (1-241)||(33583239-33583480)
chr3 (1-184)||(25398238-25398404)
chr3 (3-277)||(46796251-46796514)
chr3 (266-369)||(50300508-50300610)
chr3 (1-177)||(12388845-12389021)
chr3 (266-369)||(11869376-11869478)
chr3 (4-177)||(19249385-19249558)
chr3 (1-193)||(22140774-22140965)
chr3 (2-112)||(22804061-22804171)
chr3 (267-369)||(40800117-40800218)
chr3 (1-202)||(5213587-5213786)
chr3 (267-356)||(20627258-20627347)
chr3 (1-173)||(20725097-20725269)
chr3 (216-345)||(41495214-41495343)
chr3 (256-357)||(29855706-29855808)
chr3 (216-369)||(13824272-13824426)
chr3 (1-234)||(21640877-21641108)
chr3 (266-369)||(33583552-33583655)
chr3 (266-369)||(33598172-33598275)
chr3 (14-139)||(50300246-50300372)
chr3 (256-369)||(14955738-14955851)
chr3 (256-369)||(5216267-5216382)
chr3 (1-241)||(49666325-49666554)
chr3 (256-365)||(24775268-24775380)
chr3 (256-369)||(2785376-2785490)
chr3 (267-369)||(22141034-22141136)
chr3 (4-170)||(23538146-23538312)
chr3 (1-170)||(12968316-12968485)
chr3 (3-95)||(11909079-11909171)
chr3 (87-277)||(30054100-30054288)
chr3 (1-60)||(11868279-11868338)
chr3 (279-356)||(46349606-46349684)
chr3 (267-345)||(49642569-49642647)
chr3 (216-345)||(16199602-16199730)
chr3 (1-78)||(21605726-21605803)
chr3 (161-277)||(40851130-40851244)
chr3 (267-369)||(2028576-2028680)
chr3 (267-369)||(21605408-21605514)
chr3 (267-369)||(21636424-21636530)
chr3 (216-303)||(1727858-1727945)
chr3 (268-369)||(49666162-49666265)
chr3 (267-365)||(12726033-12726131)
chr3 (280-348)||(11908752-11908821)
chr3 (1-78)||(21636742-21636819)
chr3 (216-277)||(49666274-49666335)
chr3 (267-365)||(21606325-21606425)
chr3 (266-369)||(38177455-38177558)
chr3 (39-95)||(45858804-45858860)
chr3 (267-338)||(16032771-16032842)
chr3 (267-345)||(37467593-37467671)
chr3 (312-345)||(8739787-8739820)
chr3 (312-345)||(9092025-9092058)
chr3 (280-348)||(12752388-12752457)
chr3 (216-337)||(22803899-22804019)
chr3 (1-95)||(51341021-51341107)
chr3 (267-369)||(40851252-40851355)
chr3 (216-276)||(50300441-50300501)
chr3 (266-305)||(16658476-16658515)
chr3 (278-337)||(26417489-26417548)
chr3 (198-236)||(512501-512539)
chr3 (207-277)||(9699938-9700008)
chr3 (37-95)||(12752683-12752741)
chr3 (280-345)||(13148582-13148648)
chr3 (312-345)||(2246908-2246941)
chr3 (312-345)||(13198902-13198935)
chr3 (312-345)||(14581672-14581705)
chr3 (216-277)||(21605522-21605583)
chr3 (216-277)||(21636538-21636599)
chr3 (312-345)||(23680076-23680109)
chr3 (312-345)||(24052313-24052346)
chr3 (1-29)||(13557781-13557809)
chr3 (267-303)||(46796208-46796244)
chr3 (309-345)||(51988797-51988833)
[»] chr7 (111 HSPs)
chr7 (1-369)||(33691494-33691863)
chr7 (1-369)||(44467071-44467440)
chr7 (2-369)||(30025913-30026281)
chr7 (2-379)||(15088528-15088889)
chr7 (2-369)||(2500046-2500415)
chr7 (2-369)||(2913389-2913758)
chr7 (1-369)||(28622135-28622507)
chr7 (3-369)||(48236703-48237051)
chr7 (2-369)||(13880112-13880494)
chr7 (1-369)||(9709602-9709953)
chr7 (2-345)||(10882965-10883323)
chr7 (1-369)||(14426554-14426903)
chr7 (1-365)||(22577792-22578172)
chr7 (3-369)||(30945159-30945505)
chr7 (2-236)||(9069570-9069805)
chr7 (20-369)||(16542806-16543152)
chr7 (20-369)||(16622510-16622856)
chr7 (2-345)||(13137716-13138045)
chr7 (1-369)||(30944126-30944474)
chr7 (1-369)||(28409046-28409424)
chr7 (2-345)||(11319413-11319771)
chr7 (2-216)||(13302818-13303033)
chr7 (1-235)||(23279875-23280109)
chr7 (2-263)||(21695409-21695671)
chr7 (1-291)||(15467923-15468228)
chr7 (3-369)||(33605694-33606076)
chr7 (2-369)||(13648737-13649089)
chr7 (1-226)||(21283300-21283524)
chr7 (1-226)||(24788148-24788372)
chr7 (7-226)||(11792920-11793140)
chr7 (2-187)||(13730639-13730825)
chr7 (1-359)||(16111660-16112035)
chr7 (2-193)||(21692295-21692487)
chr7 (3-345)||(29935170-29935507)
chr7 (2-226)||(16316484-16316707)
chr7 (5-369)||(12366518-12366895)
chr7 (2-184)||(5000788-5000972)
chr7 (1-173)||(19237022-19237194)
chr7 (2-246)||(39284470-39284714)
chr7 (15-345)||(13692372-13692707)
chr7 (1-241)||(35952599-35952839)
chr7 (4-277)||(331655-331930)
chr7 (2-369)||(13018292-13018655)
chr7 (1-242)||(4821481-4821720)
chr7 (14-241)||(12174252-12174479)
chr7 (121-369)||(4494634-4494863)
chr7 (1-184)||(13893966-13894149)
chr7 (1-226)||(2265446-2265670)
chr7 (1-112)||(14193121-14193232)
chr7 (1-369)||(14425454-14425813)
chr7 (160-369)||(14193241-14193469)
chr7 (1-241)||(8182937-8183175)
chr7 (14-173)||(13880608-13880768)
chr7 (266-359)||(35952449-35952542)
chr7 (266-369)||(12174092-12174195)
chr7 (39-175)||(15704475-15704612)
chr7 (2-95)||(16309964-16310057)
chr7 (1-106)||(19711059-19711164)
chr7 (2-213)||(41842212-41842423)
chr7 (4-213)||(13260561-13260763)
chr7 (69-175)||(13472555-13472663)
chr7 (14-112)||(9098286-9098384)
chr7 (256-369)||(7339652-7339764)
chr7 (11-177)||(13032046-13032213)
chr7 (309-369)||(15469797-15469857)
chr7 (256-369)||(2265299-2265414)
chr7 (154-369)||(27871871-27872087)
chr7 (256-369)||(48800409-48800522)
chr7 (1-81)||(1293037-1293117)
chr7 (256-369)||(9069857-9069963)
chr7 (216-347)||(13880828-13880958)
chr7 (298-369)||(23279808-23279879)
chr7 (1-277)||(19339135-19339401)
chr7 (181-303)||(21381287-21381409)
chr7 (1-303)||(27871725-27872019)
chr7 (132-282)||(7339755-7339893)
chr7 (216-303)||(48062663-48062751)
chr7 (39-125)||(16556664-16556751)
chr7 (39-125)||(16608911-16608998)
chr7 (267-369)||(13031855-13031956)
chr7 (267-345)||(13303109-13303187)
chr7 (267-369)||(16316344-16316446)
chr7 (1-81)||(48062891-48062971)
chr7 (310-365)||(4821807-4821862)
chr7 (283-369)||(331955-332040)
chr7 (267-369)||(11793195-11793297)
chr7 (267-345)||(13730502-13730579)
chr7 (256-365)||(4821766-4821862)
chr7 (267-369)||(5826254-5826357)
chr7 (214-277)||(1293183-1293246)
chr7 (267-305)||(16556581-16556619)
chr7 (267-305)||(16609043-16609081)
chr7 (1-45)||(4494584-4494628)
chr7 (267-369)||(8183234-8183338)
chr7 (214-277)||(5826183-5826246)
chr7 (216-339)||(9098043-9098165)
chr7 (204-250)||(16556619-16556665)
chr7 (204-250)||(16608997-16609043)
chr7 (116-277)||(32264602-32264761)
chr7 (312-345)||(3476081-3476114)
chr7 (312-345)||(8934030-8934063)
chr7 (312-345)||(12733924-12733957)
chr7 (312-345)||(13682830-13682863)
chr7 (267-336)||(24788381-24788450)
chr7 (312-345)||(26209306-26209339)
chr7 (309-345)||(8998670-8998706)
chr7 (309-345)||(11086796-11086832)
chr7 (1-29)||(14745750-14745778)
chr7 (267-303)||(19339091-19339127)
chr7 (267-303)||(32264558-32264594)
chr7 (154-241)||(48062741-48062826)
[»] chr5 (73 HSPs)
chr5 (3-369)||(33022673-33023037)
chr5 (2-321)||(41566243-41566563)
chr5 (1-369)||(31117884-31118249)
chr5 (2-345)||(17814976-17815333)
chr5 (2-337)||(26784362-26784699)
chr5 (1-350)||(4887029-4887378)
chr5 (2-337)||(21910564-21910884)
chr5 (2-369)||(23412754-23413103)
chr5 (2-246)||(6512317-6512557)
chr5 (2-369)||(21072004-21072369)
chr5 (1-378)||(20550902-20551261)
chr5 (1-369)||(14086301-14086669)
chr5 (1-206)||(13545444-13545642)
chr5 (2-187)||(7745636-7745822)
chr5 (2-369)||(89200-89551)
chr5 (102-360)||(5429991-5430249)
chr5 (3-193)||(19536237-19536429)
chr5 (1-241)||(11993895-11994134)
chr5 (1-369)||(15516976-15517362)
chr5 (1-360)||(29138163-29138536)
chr5 (1-193)||(30742987-30743178)
chr5 (1-242)||(42243687-42243928)
chr5 (1-246)||(3245328-3245571)
chr5 (1-241)||(26759156-26759395)
chr5 (1-345)||(642479-642837)
chr5 (154-366)||(30115639-30115852)
chr5 (1-177)||(25096777-25096956)
chr5 (1-177)||(25154747-25154926)
chr5 (3-226)||(23881076-23881299)
chr5 (1-241)||(33933274-33933517)
chr5 (259-354)||(33933582-33933678)
chr5 (217-369)||(28139809-28139963)
chr5 (1-277)||(28464204-28464469)
chr5 (2-317)||(9398559-9398863)
chr5 (2-246)||(21198891-21199132)
chr5 (2-226)||(6499247-6499470)
chr5 (2-345)||(21099476-21099833)
chr5 (267-360)||(11994202-11994296)
chr5 (256-369)||(42243974-42244087)
chr5 (1-129)||(26765505-26765634)
chr5 (267-369)||(9089199-9089303)
chr5 (1-124)||(28139614-28139738)
chr5 (1-105)||(30115863-30115967)
chr5 (256-354)||(26759457-26759556)
chr5 (271-369)||(7745410-7745508)
chr5 (1-277)||(10848780-10849046)
chr5 (256-369)||(30743288-30743402)
chr5 (2-162)||(12352763-12352924)
chr5 (1-241)||(32160773-32161013)
chr5 (267-366)||(3245188-3245289)
chr5 (1-82)||(9088976-9089057)
chr5 (1-210)||(25930087-25930286)
chr5 (279-348)||(23478673-23478743)
chr5 (1-106)||(11208011-11208115)
chr5 (216-325)||(19536093-19536202)
chr5 (267-365)||(10849054-10849154)
chr5 (267-367)||(23881353-23881453)
chr5 (267-337)||(6512243-6512313)
chr5 (1-78)||(35932059-35932136)
chr5 (267-369)||(25929924-25930027)
chr5 (1-60)||(21660219-21660278)
chr5 (267-339)||(12352611-12352684)
chr5 (312-345)||(13534258-13534291)
chr5 (216-277)||(23391469-23391530)
chr5 (312-345)||(32754395-32754428)
chr5 (270-303)||(35986044-35986077)
chr5 (309-345)||(1915742-1915778)
chr5 (1-29)||(16607519-16607547)
chr5 (312-344)||(20416700-20416732)
chr5 (216-264)||(25096661-25096709)
chr5 (216-264)||(25154631-25154679)
chr5 (1-29)||(37406769-37406797)
chr5 (309-345)||(40229001-40229037)
[»] chr8 (102 HSPs)
chr8 (1-369)||(23185008-23185374)
chr8 (2-369)||(17441588-17441954)
chr8 (2-337)||(19156200-19156536)
chr8 (2-369)||(21932887-21933287)
chr8 (22-369)||(18120889-18121236)
chr8 (2-246)||(12757665-12757910)
chr8 (2-369)||(602500-602867)
chr8 (2-345)||(17914463-17914821)
chr8 (1-226)||(16207309-16207535)
chr8 (10-345)||(16681095-16681442)
chr8 (14-345)||(33082873-33083219)
chr8 (2-369)||(39693539-39693921)
chr8 (1-369)||(45538220-45538587)
chr8 (1-369)||(17797425-17797808)
chr8 (2-337)||(29693319-29693671)
chr8 (2-365)||(24646342-24646719)
chr8 (2-325)||(18679819-18680140)
chr8 (2-193)||(16188988-16189180)
chr8 (5-369)||(20382161-20382538)
chr8 (1-226)||(19943238-19943466)
chr8 (1-242)||(15335996-15336236)
chr8 (1-242)||(15425061-15425301)
chr8 (1-242)||(15516365-15516605)
chr8 (2-263)||(18321045-18321306)
chr8 (1-226)||(30421352-30421577)
chr8 (4-305)||(23263440-23263757)
chr8 (2-345)||(17267478-17267833)
chr8 (2-226)||(17525652-17525876)
chr8 (60-345)||(20255357-20255654)
chr8 (3-241)||(24551279-24551516)
chr8 (116-369)||(22745606-22745856)
chr8 (2-223)||(17701749-17701971)
chr8 (1-369)||(24832820-24833205)
chr8 (1-242)||(40845296-40845535)
chr8 (1-241)||(1237640-1237879)
chr8 (2-226)||(18719005-18719228)
chr8 (1-241)||(36105198-36105437)
chr8 (3-241)||(22673783-22674020)
chr8 (1-241)||(9320571-9320812)
chr8 (1-241)||(22663119-22663358)
chr8 (1-184)||(18722610-18722794)
chr8 (1-184)||(18730955-18731139)
chr8 (256-369)||(30421208-30421320)
chr8 (1-178)||(18685367-18685545)
chr8 (256-369)||(1237941-1238055)
chr8 (1-277)||(6407729-6407994)
chr8 (2-171)||(43644900-43645069)
chr8 (1-282)||(14989328-14989599)
chr8 (14-345)||(19707522-19707864)
chr8 (256-369)||(9320859-9320973)
chr8 (267-369)||(15335807-15335909)
chr8 (267-369)||(15424872-15424974)
chr8 (267-369)||(15516176-15516278)
chr8 (267-367)||(16189283-16189383)
chr8 (273-369)||(19927335-19927432)
chr8 (266-369)||(40845135-40845240)
chr8 (256-369)||(36105499-36105614)
chr8 (1-107)||(45567943-45568049)
chr8 (4-170)||(22461617-22461783)
chr8 (119-234)||(3598262-3598375)
chr8 (283-359)||(16207555-16207631)
chr8 (1-282)||(18151533-18151794)
chr8 (266-369)||(3598094-3598198)
chr8 (279-369)||(6408013-6408105)
chr8 (214-277)||(21288609-21288672)
chr8 (180-277)||(13430509-13430606)
chr8 (255-369)||(18151427-18151543)
chr8 (280-348)||(21541285-21541354)
chr8 (2-43)||(25164074-25164115)
chr8 (216-277)||(43640006-43640067)
chr8 (8-112)||(19956378-19956482)
chr8 (267-369)||(19943520-19943623)
chr8 (279-345)||(22461419-22461485)
chr8 (267-369)||(22674078-22674185)
chr8 (1-78)||(13430699-13430776)
chr8 (216-276)||(1237884-1237944)
chr8 (214-277)||(1745366-1745429)
chr8 (216-369)||(2811053-2811206)
chr8 (267-303)||(13430465-13430501)
chr8 (279-369)||(14989222-14989313)
chr8 (216-276)||(36105442-36105502)
chr8 (214-277)||(21301228-21301291)
chr8 (279-345)||(28903777-28903844)
chr8 (267-369)||(18320956-18321058)
chr8 (267-369)||(22663431-22663538)
chr8 (280-345)||(40003504-40003570)
chr8 (312-345)||(3833278-3833311)
chr8 (312-345)||(3844058-3844091)
chr8 (312-345)||(3844349-3844382)
chr8 (216-336)||(17525528-17525648)
chr8 (312-345)||(20259329-20259362)
chr8 (312-345)||(21045959-21045992)
chr8 (1-95)||(21540955-21541041)
chr8 (312-345)||(22211099-22211132)
chr8 (1-30)||(43639786-43639815)
chr8 (309-345)||(8032357-8032393)
chr8 (309-345)||(17518834-17518870)
chr8 (309-345)||(18534839-18534875)
chr8 (313-345)||(22135569-22135601)
chr8 (313-345)||(22166718-22166750)
chr8 (216-276)||(24551521-24551581)
chr8 (267-303)||(45292894-45292930)
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (1-369)||(29918028-29918397)
chr6 (1-369)||(32544276-32544662)
chr6 (1-369)||(22802152-22802518)
chr6 (1-369)||(20730476-20730842)
chr6 (1-369)||(16264922-16265288)
chr6 (1-337)||(9717854-9718205)
chr6 (1-369)||(21235136-21235490)
chr6 (1-365)||(15954714-15955078)
chr6 (2-239)||(26972127-26972363)
chr6 (1-369)||(13435543-13435926)
chr6 (2-339)||(12715220-12715557)
chr6 (20-369)||(34451439-34451787)
chr6 (8-237)||(18435574-18435804)
chr6 (2-369)||(20112469-20112837)
chr6 (1-365)||(15531382-15531762)
chr6 (3-369)||(21625114-21625492)
chr6 (2-337)||(15302212-15302533)
chr6 (2-345)||(19623991-19624332)
chr6 (2-226)||(13602184-13602409)
chr6 (2-226)||(23284576-23284801)
chr6 (1-369)||(21618255-21618631)
chr6 (1-369)||(14100228-14100578)
chr6 (1-369)||(16877224-16877608)
chr6 (2-345)||(24116840-24117198)
chr6 (14-369)||(19688790-19689110)
chr6 (2-345)||(19086170-19086520)
chr6 (2-177)||(15987245-15987422)
chr6 (1-242)||(22076305-22076545)
chr6 (1-365)||(33351702-33352064)
chr6 (3-342)||(10640219-10640555)
chr6 (2-171)||(18378326-18378496)
chr6 (1-230)||(16336138-16336366)
chr6 (68-226)||(25597557-25597716)
chr6 (1-236)||(20487821-20488056)
chr6 (1-234)||(19832938-19833171)
chr6 (1-193)||(12349004-12349194)
chr6 (1-157)||(12423272-12423428)
chr6 (256-369)||(18435855-18435968)
chr6 (255-359)||(20487666-20487770)
chr6 (257-367)||(26971967-26972077)
chr6 (266-369)||(139122-139225)
chr6 (266-369)||(147143-147246)
chr6 (256-365)||(17381711-17381821)
chr6 (3-170)||(19470683-19470850)
chr6 (256-369)||(19832756-19832869)
chr6 (1-155)||(26943587-26943741)
chr6 (267-371)||(12349254-12349360)
chr6 (267-369)||(12423514-12423618)
chr6 (267-367)||(22058337-22058439)
chr6 (261-369)||(16336440-16336549)
chr6 (267-345)||(13602447-13602525)
chr6 (267-345)||(18378545-18378623)
chr6 (1-277)||(19065890-19066156)
chr6 (177-277)||(17608186-17608286)
chr6 (5-68)||(17381536-17381599)
chr6 (2-77)||(25594080-25594155)
chr6 (198-264)||(12423428-12423494)
chr6 (269-333)||(15987488-15987552)
chr6 (279-348)||(17608095-17608165)
chr6 (267-337)||(25597754-25597824)
chr6 (216-277)||(19482994-19483055)
chr6 (279-343)||(3680780-3680844)
chr6 (312-345)||(9933359-9933392)
chr6 (312-345)||(17741373-17741406)
chr6 (292-345)||(18383955-18384008)
chr6 (312-345)||(18499095-18499128)
chr6 (1-78)||(19482763-19482840)
chr6 (216-277)||(26589848-26589909)
chr6 (312-340)||(18555745-18555773)
chr6 (197-241)||(19482930-19482974)
chr6 (309-345)||(21128566-21128602)
chr6 (267-339)||(23284855-23284927)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-369)||(89789-90155)
[»] chr2 (103 HSPs)
chr2 (14-369)||(20151763-20152117)
chr2 (1-358)||(6573861-6574219)
chr2 (2-369)||(23235013-23235395)
chr2 (2-345)||(25829140-25829468)
chr2 (2-337)||(20568493-20568844)
chr2 (2-369)||(30666995-30667377)
chr2 (2-369)||(13963722-13964072)
chr2 (2-345)||(19540422-19540762)
chr2 (5-369)||(22317602-22318000)
chr2 (1-369)||(28711425-28711793)
chr2 (2-369)||(9015083-9015462)
chr2 (2-345)||(18376673-18377000)
chr2 (2-226)||(25037128-25037353)
chr2 (2-226)||(25041235-25041460)
chr2 (2-345)||(30621222-30621551)
chr2 (2-345)||(30623843-30624172)
chr2 (2-226)||(22187971-22188196)
chr2 (1-369)||(38781404-38781768)
chr2 (2-263)||(24377107-24377369)
chr2 (2-226)||(21537117-21537342)
chr2 (2-345)||(39037392-39037736)
chr2 (22-337)||(22260432-22260761)
chr2 (3-213)||(24576042-24576254)
chr2 (2-337)||(24850410-24850760)
chr2 (2-325)||(28140391-28140713)
chr2 (1-369)||(31800597-31800982)
chr2 (2-213)||(10009631-10009844)
chr2 (3-319)||(40782484-40782808)
chr2 (2-177)||(24779349-24779525)
chr2 (1-276)||(6392638-6392914)
chr2 (1-241)||(34321792-34322031)
chr2 (14-241)||(45087038-45087266)
chr2 (1-241)||(33074231-33074470)
chr2 (1-241)||(30557175-30557416)
chr2 (1-241)||(31327821-31328061)
chr2 (1-241)||(31334542-31334782)
chr2 (1-193)||(22802465-22802656)
chr2 (1-277)||(1586862-1587128)
chr2 (256-369)||(28700924-28701037)
chr2 (72-226)||(7609037-7609191)
chr2 (2-265)||(23595403-23595661)
chr2 (2-226)||(25189404-25189629)
chr2 (2-241)||(35743858-35744094)
chr2 (3-175)||(28701149-28701322)
chr2 (1-173)||(41121642-41121814)
chr2 (2-226)||(22454859-22455084)
chr2 (1-170)||(26619027-26619196)
chr2 (3-369)||(3277037-3277378)
chr2 (1-277)||(28550748-28551013)
chr2 (271-371)||(45086845-45086945)
chr2 (1-277)||(44840439-44840701)
chr2 (261-369)||(22802754-22802862)
chr2 (1-277)||(31967873-31968138)
chr2 (3-166)||(22272139-22272303)
chr2 (267-369)||(31327668-31327770)
chr2 (267-369)||(31334389-31334491)
chr2 (256-365)||(34321619-34321730)
chr2 (256-369)||(33074517-33074631)
chr2 (1-345)||(44881172-44881512)
chr2 (266-323)||(30557046-30557103)
chr2 (1-81)||(14581520-14581600)
chr2 (1-81)||(22776303-22776383)
chr2 (1-81)||(22781681-22781761)
chr2 (214-275)||(22776137-22776198)
chr2 (214-275)||(22781515-22781576)
chr2 (1-81)||(22785670-22785750)
chr2 (1-81)||(40332092-40332172)
chr2 (284-369)||(1586751-1586838)
chr2 (37-95)||(1084047-1084105)
chr2 (275-348)||(1084355-1084429)
chr2 (1-170)||(18702743-18702912)
chr2 (1-51)||(19115088-19115138)
chr2 (267-345)||(22187855-22187933)
chr2 (215-369)||(24576283-24576437)
chr2 (267-345)||(25037004-25037082)
chr2 (267-345)||(25041111-25041189)
chr2 (180-277)||(40332261-40332358)
chr2 (268-369)||(14581740-14581843)
chr2 (266-345)||(38631239-38631318)
chr2 (279-325)||(6392934-6392980)
chr2 (1-178)||(18430858-18431035)
chr2 (279-345)||(19115422-19115488)
chr2 (267-369)||(21536961-21537063)
chr2 (2-52)||(23184348-23184398)
chr2 (216-277)||(22785470-22785531)
chr2 (267-303)||(22776091-22776127)
chr2 (267-303)||(22781469-22781505)
chr2 (279-339)||(26618849-26618909)
chr2 (216-276)||(35743808-35743868)
chr2 (267-369)||(40332366-40332470)
chr2 (267-325)||(10009524-10009582)
chr2 (279-325)||(18703070-18703116)
chr2 (161-234)||(22785528-22785599)
chr2 (267-317)||(23184111-23184161)
chr2 (267-317)||(23595368-23595418)
chr2 (267-345)||(24814296-24814374)
chr2 (312-345)||(17968886-17968919)
chr2 (312-345)||(19497686-19497719)
chr2 (312-345)||(24275541-24275574)
chr2 (280-345)||(24793721-24793786)
chr2 (267-315)||(22454757-22454805)
chr2 (216-276)||(30557110-30557170)
chr2 (279-369)||(44840721-44840813)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (2-337)||(32497-32834)
scaffold0084 (2-339)||(49344-49681)
scaffold0084 (1-107)||(339-445)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (1-356)||(27175-27529)
[»] scaffold0217 (5 HSPs)
scaffold0217 (2-367)||(19043-19426)
scaffold0217 (1-277)||(9571-9845)
scaffold0217 (1-241)||(21992-22231)
scaffold0217 (216-369)||(21832-21987)
scaffold0217 (279-365)||(9865-9953)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (8-346)||(4687-5040)
[»] scaffold0227 (2 HSPs)
scaffold0227 (1-236)||(22687-22923)
scaffold0227 (267-369)||(22952-23054)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (2-367)||(18340-18720)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-365)||(20692-21071)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (2-369)||(12221-12604)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (1-369)||(406-755)
scaffold1359 (1-369)||(1496-1855)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (54-345)||(39489-39781)
scaffold0022 (54-345)||(137549-137841)
scaffold0022 (3-177)||(159068-159242)
scaffold0022 (1-51)||(37413-37463)
scaffold0022 (1-51)||(135473-135523)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (32-369)||(143130-143484)
scaffold0007 (312-345)||(59008-59041)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (2-369)||(5408-5789)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (2-345)||(487-845)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (1-369)||(212365-212747)
scaffold0005 (60-339)||(5949-6239)
scaffold0005 (154-277)||(246072-246193)
scaffold0005 (267-303)||(246028-246064)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-369)||(36493-36875)
scaffold0120 (1-369)||(42130-42512)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (10-369)||(60036-60409)
scaffold0026 (4-345)||(7940-8266)
scaffold0026 (63-177)||(151794-151908)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (2-226)||(25849-26074)
scaffold0083 (23-152)||(44652-44782)
scaffold0083 (267-345)||(25733-25811)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (3-369)||(103585-103950)
[»] scaffold0004 (8 HSPs)
scaffold0004 (2-369)||(377293-377658)
scaffold0004 (2-226)||(220250-220474)
scaffold0004 (1-174)||(211409-211583)
scaffold0004 (1-166)||(244219-244384)
scaffold0004 (267-345)||(30612-30689)
scaffold0004 (216-326)||(220478-220587)
scaffold0004 (221-345)||(243995-244118)
scaffold0004 (228-276)||(211648-211696)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (3-365)||(1673-2020)
[»] scaffold0161 (3 HSPs)
scaffold0161 (1-226)||(9981-10208)
scaffold0161 (267-367)||(9857-9956)
scaffold0161 (1-57)||(14816-14872)
[»] scaffold0337 (2 HSPs)
scaffold0337 (2-226)||(14660-14883)
scaffold0337 (215-345)||(14901-15031)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (3-336)||(15130-15446)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (2-369)||(19191-19571)
scaffold0035 (1-241)||(99069-99305)
scaffold0035 (271-365)||(98896-98992)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (3-192)||(1703-1893)
scaffold0065 (215-339)||(1943-2067)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (1-365)||(9980-10326)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (3-369)||(78082-78464)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-241)||(215358-215597)
scaffold0012 (261-369)||(215198-215306)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (60-320)||(553-827)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (1-241)||(6601-6840)
scaffold0439 (267-369)||(6425-6528)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (60-339)||(30294-30584)
scaffold0047 (3-175)||(9916-10088)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-369)||(60814-61200)
[»] scaffold0426 (2 HSPs)
scaffold0426 (2-157)||(13583-13739)
scaffold0426 (198-345)||(13835-13981)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (1-337)||(6018-6351)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (20-369)||(9825-10187)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (2-326)||(15805-16130)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (3-242)||(5459-5700)
scaffold0028 (256-369)||(5303-5416)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (3-276)||(9168-9439)
scaffold0176 (329-369)||(9537-9577)
[»] scaffold0471 (3 HSPs)
scaffold0471 (1-241)||(3315-3554)
scaffold0471 (256-369)||(3616-3731)
scaffold0471 (216-276)||(3559-3619)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (118-367)||(5673-5922)
[»] scaffold1331 (3 HSPs)
scaffold1331 (1-193)||(1608-1799)
scaffold1331 (257-369)||(328-439)
scaffold1331 (198-250)||(463-515)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (113-221)||(4872-4980)
scaffold0243 (267-337)||(4759-4829)
[»] scaffold0414 (2 HSPs)
scaffold0414 (1-236)||(7022-7256)
scaffold0414 (267-369)||(6853-6958)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (1-277)||(17600-17865)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (2-177)||(9968-10144)
scaffold0324 (267-305)||(10229-10267)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (116-303)||(23362-23546)
scaffold0247 (1-116)||(25384-25499)
scaffold0247 (1-29)||(15811-15839)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (44-277)||(65254-65485)
scaffold0011 (44-242)||(144334-144530)
scaffold0011 (1-107)||(164940-165046)
scaffold0011 (279-369)||(65142-65234)
scaffold0011 (267-369)||(135109-135213)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (3-170)||(1452-1619)
[»] scaffold0527 (4 HSPs)
scaffold0527 (21-277)||(7963-8217)
scaffold0527 (267-369)||(162-265)
scaffold0527 (279-369)||(8237-8328)
scaffold0527 (121-277)||(1-154)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (256-369)||(1585-1698)
[»] scaffold0056 (5 HSPs)
scaffold0056 (1-277)||(34638-34904)
scaffold0056 (4-170)||(36115-36281)
scaffold0056 (216-277)||(25484-25545)
scaffold0056 (1-78)||(25688-25765)
scaffold0056 (267-303)||(25440-25476)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-177)||(43843-44019)
scaffold0064 (216-339)||(43652-43775)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (1-170)||(40648-40817)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (1-106)||(15617-15722)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (267-365)||(9098-9195)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (177-348)||(35403-35578)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-106)||(38080-38185)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (3-91)||(74594-74682)
scaffold0025 (267-345)||(74855-74933)
scaffold0025 (140-173)||(74718-74751)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (256-369)||(7195-7310)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (1-83)||(1328-1410)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (1-83)||(1-83)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (6-67)||(2029-2090)
[»] scaffold0473 (2 HSPs)
scaffold0473 (89-369)||(2443-2723)
scaffold0473 (1-52)||(2740-2791)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (1-129)||(2702-2830)
scaffold0280 (279-345)||(17526-17593)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (3-95)||(1803-1895)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (170-369)||(60602-60799)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (2-130)||(5639-5767)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (309-369)||(11321-11380)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (1-60)||(7392-7451)
[»] scaffold0275 (2 HSPs)
scaffold0275 (219-277)||(8511-8569)
scaffold0275 (256-303)||(8565-8612)
[»] scaffold0908 (2 HSPs)
scaffold0908 (280-348)||(3608-3677)
scaffold0908 (1-59)||(3937-3995)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (280-348)||(7613-7682)
[»] scaffold0352 (2 HSPs)
scaffold0352 (214-246)||(686-718)
scaffold0352 (1-64)||(858-921)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (267-303)||(87384-87420)
scaffold0045 (1-64)||(87637-87700)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (279-345)||(9620-9687)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (309-348)||(481510-481549)
scaffold0002 (280-345)||(156354-156420)
scaffold0002 (312-345)||(117621-117654)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (267-345)||(6240-6318)
[»] scaffold0774 (1 HSPs)
scaffold0774 (312-345)||(6064-6097)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (312-345)||(269-302)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (177-277)||(11931-12031)
scaffold0422 (279-338)||(12052-12112)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (280-348)||(20945-21014)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (312-345)||(36060-36093)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (216-277)||(938-999)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (309-345)||(5464-5500)


Alignment Details
Target: scaffold0251 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 7715 - 8083
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||    
T  7715 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaaaatagtc 7814  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    || |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7815 gtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagc 7914  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7915 ttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttttaatgacgtcaccacctcgggagcactttgtcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 8014  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8015 ttctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccagaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 8083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 94)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32786005 - 32785639
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32786005 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 32785906  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||    
T  32785905 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccat-gaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaactacaact 32785807  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt 301  Q
    | | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32785806 tctagtgattttcagcttctaatgaacttgcttctaatgacgttaccacttcaggggcactttgccttcaggagcagttttcttcagacgctttaagctt 32785707  T
Q  302 ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32785706 cctttttgttgattcatttgctttctattgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 32785639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22600252 - 22599868
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22600252 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 22600153  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22600152 cgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 22600053  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatg--------------aacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttct 284  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||              ||||||||||| |||| |||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||  || |||    
T  22600052 cttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcgcttctct 22599953  T
Q  285 tcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22599952 tcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 22599868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22427425 - 22427046
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22427425 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 22427326  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| | |||||    
T  22427325 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactggagct 22427228  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatga---------------acttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    | ||||||| |||||||||||||||               |||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  22427227 tctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctggtagacttgcttctgatgacatcaccacttcaggagcacttggtcttcgggagcagttttcttc 22427128  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtc 368  Q
    |||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22427127 agacactttaagctttctttttgttgattcctttgctctctattgttctttcaagacctttttaagatgtcaaatttttgtc 22427046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Original strand, 2267101 - 2267448
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2267101 agtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattctttcaaactagttg 2267200  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||            
T  2267201 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaa-------- 2267290  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt 301  Q
             ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  2267291 ---------ctgtagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcactacttcaggagcactatgtcttcagaagcagttttcttcatatgctttaagctt 2267381  T
Q  302 ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2267382 cctttttgttgatttctttactctctattgttcttccaagacctttttaaaatgtcaaa-ttttgtct 2267448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 36134200 - 36134567
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36134200 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc-ttcaaatcctttcaaaatagt 36134298  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||| | ||      
T  36134299 tgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatcttctgatgagacag-- 36134396  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaag 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||| |||   | ||  |||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||| |||    
T  36134397 cttctggtgatcttcagcttctggtggagatgcttctgatgacatcattgcttcaggagcacttttgtcttcaggagcgcttctcttcagatgcttcaag 36134496  T
Q  299 cttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36134497 cttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 36134567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39201062 - 39200712
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  39201062 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaactagc 39200963  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |  ||    
T  39200962 cgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaactgcag 39200865  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattt-tcttcagacgctttaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||                 ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  39200864 cttttggtgattttcagcttttgatgaacttgcttttgatgacgtcacca-----------------cttcaggagcactttgtcttcatacgctttaag 39200782  T
Q  299 cttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39200781 cttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 39200712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16235365 - 16234998
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16235365 gagtagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 16235266  T
Q  102 gttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||  | | | |    
T  16235265 gttgcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatcttatgatg--agacaac 16235168  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt-tttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||  |||||||| | |||||||||||| || | |||||| |||| ||||    
T  16235167 ttctggtgatcttcagcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttgtgtcttcaggagcacttcttttcagatgcttcaagc 16235068  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  16235067 ttcctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaacctttttaatatgacaaatttttgtct 16234998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28492473 - 28492228
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  28492473 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 28492374  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  28492373 gttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 28492274  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 246  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28492273 ttctgaagatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 28492228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 2834700 - 2835083
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  2834700 agagtagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagc 2834799  T
Q  101 cgttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||  ||||| |  ||    
T  2834800 cgttgcttcactttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaag--ttgcatctcccgatgaactgcag 2834897  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagca-----------------ctttttcttcaggagcaatttt 282  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||                 |||| |||||||||||||||||    
T  2834898 cttctggtgattttcagcttctaatg-acttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttgtcttcaggagcaatttt 2834996  T
Q  283 cttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2834997 cttcaaacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 2835083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33256420 - 33256071
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33256420 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtc 33256321  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||    
T  33256320 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgttgaactttagc 33256221  T
Q  201 ttttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttca 287  Q
    || ||||||||||              ||||||||||||||||||||| || | |||| ||| ||  |||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  33256220 ttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaagagcacttctcttca 33256121  T
Q  288 gacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
     |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33256120 aacgccttaagcttcatttttgttgattcctttgctctcttctgttcttc 33256071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33276592 - 33276243
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33276592 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtc 33276493  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||    
T  33276492 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctggtgaactttagc 33276393  T
Q  201 ttttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttca 287  Q
    || ||||||||||              ||||||||||||||||||||| || | |||| ||| ||  |||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  33276392 ttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaagagcacttctcttca 33276293  T
Q  288 gacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
     |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33276292 aacgccttaagcttcatttttgttgattcctttgctctcttctgttcttc 33276243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 1900355 - 1900581
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1900355 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagt 1900454  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  1900455 cgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagat 1900554  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  1900555 cttctggcgatctttagcttctgatga 1900581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 10757432 - 10757797
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  10757432 gagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtt 10757531  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  10757532 gttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 10757631  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |   |||||| |   ||||| ||||| || |||||| |||||| ||||    
T  10757632 cttttgatgatctt--gcttctgatgaacttgctcctgatgacgtcatcactttaggagcac-taaacttcaagagcacttctcttcaaacgcttcaagc 10757728  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  10757729 ttcctt-ttgttgattccttagctctcttttgttctttcagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 10757797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 38282577 - 38282802
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||      
T  38282577 agagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatacc 38282675  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  38282676 cgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 38282775  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38282776 cttttggtgatctttagcatctgatga 38282802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 35040176 - 35040479
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  35040176 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagt 35040275  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||| | | ||||| |  ||    
T  35040276 cgttgctttacttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaattgcag 35040373  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35040374 cttctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgacgtcaccacttcatgagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 35040473  T
Q  300 ttcctt 305  Q
    ||||||    
T  35040474 ttcctt 35040479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20954542 - 20954317
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || | || ||||| |||||||||||||||| | | |    
T  20954542 gagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaatcctttcaaaatggcc 20954443  T
Q  102 gttgcttcacttttca-gtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
     |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20954442 attgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 20954343  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  20954342 ttctggtgatcttcagcttctgatga 20954317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 2268541 - 2268921
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2268541 agagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaaatcatttcaaaatagt 2268640  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
       ||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  2268641 ---tgcttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatctcctaatgaactttag 2268737  T
Q  200 cttttggtgat-----cttc--------agcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttctt 285  Q
    ||| | |||||     ||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||  || ||||    
T  2268738 cttctagtgattgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcgcttctctt 2268837  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| |||  || ||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2268838 cagatgctacaaacttcctttttgatgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 2268921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22153867 - 22154081
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22153867 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaattagt 22153966  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  22153967 tgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 22154066  T
Q  200 cttttggtgatcttc 214  Q
    ||| |||||||||||    
T  22154067 cttctggtgatcttc 22154081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 29215807 - 29216031
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  29215807 agagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagc 29215906  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |  |     
T  29215907 cgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaattgcaa 29216004  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29216005 cttctggtgattttcagcttctgatga 29216031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Original strand, 35401821 - 35402043
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35401821 agtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 35401920  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||  | | ||||    
T  35401921 ttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatg--agacagct 35402018  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  35402019 tctggtgatcttcagcttctgatga 35402043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22464879 - 22464644
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22464879 agagtagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaattagt 22464780  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |  |    
T  22464779 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagcttta--tgttacatctcctgatgaactgta 22464682  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttct 236  Q
    || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22464681 gcatctggtgattttcagcttcttatgaacttgcttct 22464644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 1577878 - 1578226
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1577878 gagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaattctttcaaaatagtc 1577977  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |  |||    
T  1577978 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatctcctgataaactttagc 1578077  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || | ||||||||  |||||||| | |  || |||| ||||||||| ||                 ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  1578078 ttcttgtgatctt--gcttctgacg-agatgtttctgatgacgtcatca-----------------cttcaggagcacttctcttcagatgctttaagct 1578157  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  1578158 tcctttttgttgattcctttgctctcttttgttctttcagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 1578226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 19717540 - 19717758
Alignment:
Q  7 gtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgc 106  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19717540 gtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgc 19717639  T
Q  107 ttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttg 205  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||| ||    
T  19717640 ttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccatatgaactttagcttctg 19717739  T
Q  206 gtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  19717740 gtgatctt--gcttctgatga 19717758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 7309829 - 7310185
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||| | |||||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||| |       
T  7309829 agagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgct-tttgaagaacgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaatgac 7309927  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||    
T  7309928 cgttgcttcactcttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctttag 7310027  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaag 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||| ||| ||   ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  7310028 cttatggtgatcttcagcttctgatg-agatgtttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagatgctataag 7310126  T
Q  299 cttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaa 360  Q
    |||||   |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7310127 cttcc---tagttgattctttagctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaa 7310185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 48704215 - 48704438
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||     
T  48704215 gagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatcctttcaaaatagtt 48704314  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||    
T  48704315 gttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactttagc 48704414  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || |||||||||  ||||||||||||    
T  48704415 ttctggtgatct--agcttctgatga 48704438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22201805 - 22201614
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  22201805 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 22201706  T
Q  102 gttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatga 192  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22201705 gttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatctcctgatga 22201614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 12284437 - 12284661
Alignment:
Q  5 tagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgtt 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12284437 tagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 12284536  T
Q  105 gcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttt 203  Q
    ||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |  |||||     
T  12284537 gcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttc 12284636  T
Q  204 tggtgatcttcagcttctgatgaactt 230  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||    
T  12284637 tggtgatctt--gcttctgatgaactt 12284661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44821615 - 44821229
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||||| || |||  || |||||||||||||| |||| ||||    
T  44821615 agagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatacaaagccttcaaatccttccaaaatagt 44821516  T
Q  101 cgttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  || ||||||||||||| |||  |||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  44821515 cgttgctatactttttcagtcttctacaaaccttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacag 44821418  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagca-----------------ctttttcttcaggagcaatttt 282  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||                 |||| |||||||||||| ||||    
T  44821417 cttatggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtgttcaggagcgctttatcttcaggagcagtttt 44821318  T
Q  283 cttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44821317 cttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatttttgtct 44821229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 305
Target Start/End: Original strand, 21028804 - 21029107
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || | ||| |||| ||||||||||| | | ||  || |||||    
T  21028804 gagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtc 21028903  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||| | || |||| ||  |||    
T  21028904 gttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtctctcatattctaatgatattcagc 21029003  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  |||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  21029004 ttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcac-ttgacttgaggagcacttttcttcatatgctttaagct 21029102  T
Q  301 tcctt 305  Q
    |||||    
T  21029103 tcctt 21029107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23036595 - 23036373
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  23036595 agtagaggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttg 23036496  T
Q  103 ttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||  | | ||||    
T  23036495 ttgtttcacttttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatg--agacagct 23036398  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  23036397 tctggtgatcttcagcttctgatga 23036373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Original strand, 30893104 - 30893327
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||  |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |     
T  30893104 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcctttcaaaatagcct 30893203  T
Q  103 ttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||  || | |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  30893204 ttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactttagc 30893303  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    |||||||||||||  |||||||||||    
T  30893304 ttttggtgatctt--gcttctgatga 30893327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25448636 - 25448461
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25448636 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 25448537  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagt 175  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  25448536 cgctgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt 25448461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26702197 - 26701897
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||  || | |||  ||| ||||||||||| | | ||  || || | |    
T  26702197 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttcatttgaattaattg 26702098  T
Q  103 ttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||||||| | | | |||||||||||||| | |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |  ||||    
T  26702097 ttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatcttctgatgaactttagct 26701998  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt 301  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||  |||||| ||  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  26701997 tctggtgatcttcagtttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcatgagcac-ttgacttcaggagcacttttcttcatacgcttcaagctt 26701899  T
Q  302 cc 303  Q
    ||    
T  26701898 cc 26701897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2327510 - 2327270
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatc-tttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | || ||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| |||    
T  2327510 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcgaatcctttcaaaatag 2327411  T
Q  100 tcgttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    |  ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |  |    
T  2327410 tttttgcttcactttttcagtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgca 2327313  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2327312 gcttctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 2327270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48570301 - 48570070
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  48570301 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttttaatccttccaaaatagt 48570202  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||| | |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  48570201 cgttgttatacttttctagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaattacag 48570105  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgctt 234  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  48570104 cttctggtgattctcagcttctgataaaattgctt 48570070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21702824 - 21703062
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||  |||||| |  |||||||||||| |||     
T  21702824 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgcccttcaatcctttcaaaatagc 21702923  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |  ||    
T  21702924 cgttgctatacttttcaagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaaattttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcag 21703020  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| |||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21703021 cttctggtgattcacagcttctgatgtacttgcttctgatga 21703062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17025029 - 17024693
Alignment:
Q  6 agtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  17025029 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttg 17024930  T
Q  106 cttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagctttt 204  Q
    ||||||| ||   ||||| ||||||| |||  || |||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||  || || || ||||  |  ||||| |    
T  17024929 cttcactcttatggtcttttgcaatg-ttatgcgtgattaaatcctttgaacagacattgaagctttaattctctcagcttctgatgatcttcagcttct 17024831  T
Q  205 ggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcct 304  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||   ||||| ||  ||| || | |  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  17024830 ggtgatgtt--gcttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttcagaagcac-ttaactttagaacctcttttcttcagatgcttcaagcttcct 17024734  T
Q  305 tatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    | | ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  17024733 tcttgttgattccattgatctcatttgttcttccagaacct 17024693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21191935 - 21191763
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||     
T  21191935 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagc 21191836  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaa 173  Q
     ||||||||||| |||  ||||||||||||| || |  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21191835 tgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggtgtgattaaatactttgaacaacctttgaagctttaa 21191763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25448333 - 25448220
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25448333 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccaagacctttttaagat 25448234  T
Q  355 gtcaaagttttgtct 369  Q
     ||||| ||||||||    
T  25448233 atcaaa-ttttgtct 25448220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2327198 - 2327094
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  2327198 tcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaattttt 2327099  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  2327098 tgtct 2327094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Original strand, 29216073 - 29216176
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  29216073 tcttcaggaacagttttcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcttttgatctctattgttcttccaagacctttttaggatgtcaaattttt 29216172  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  29216173 gtct 29216176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14263521 - 14263371
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14263521 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctttgaggaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 14263422  T
Q  101 cgttgcttcactt-ttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca 150  Q
    ||||| ||  ||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14263421 cgttgttttgcttctccagtcttctgcaatccttagacgggatttaatcca 14263371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12613884 - 12613713
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || | ||||| ||||||| ||||  || |||     
T  12613884 agagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaat-cttttgaattagc 12613786  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaa 173  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12613785 cgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaa 12613713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 30572207 - 30572381
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||     
T  30572207 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttctaagaataaacatccaatgcttttcaatcctttcaaaatagc 30572306  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagt 175  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||| |  |||| |  ||||||||||||||    
T  30572307 cgttgctatacttttccagtcttctgcaat-ctcagacgagtttgaatccttgaaacagctattgaagctttaagt 30572381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 22154165 - 22154267
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22154165 cttcaggagcacttctcttcagacgcttcaagcttcatttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttg 22154264  T
Q  367 tct 369  Q
    |||    
T  22154265 tct 22154267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 345
Target Start/End: Original strand, 1900613 - 1900702
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1900613 gagcactttgtcttcaggagcagttctcttcagacgttttaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 1900702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 10250996 - 10251218
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||||||   ||||||||||| || |||| |||||||||         |||| |||     
T  10250996 agagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactctttgaagaataagcatccaatgccttc---------caaattagc 10251086  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |  ||    
T  10251087 cgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcag 10251183  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgctt 234  Q
    ||| |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  10251184 cttctggtgattcatagcttctgatgaacttgctt 10251218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22464588 - 22464486
Alignment:
Q  259 cactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaac-ctttttaagatgtc 357  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  22464588 cactttgtcttcaggagcagttttcttcatatactttaagcttcctttttgttgattcctttgctctatattgttcttccaagactttttttaagatgtc 22464489  T
Q  358 aaa 360  Q
    |||    
T  22464488 aaa 22464486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 46088999 - 46089229
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||         ||||||||| ||||    
T  46088999 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cctttcaaaatagt 46089089  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||   |||||| ||||||||||||||  |||| |||| || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |  ||    
T  46089090 cgttgccatacttttccagtcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcatgatgaactgcag 46089187  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| |||||||   || ||| |||||||||||||||| ||||    
T  46089188 cttctggtgatacacaacttatgatgaacttgcttctgatga 46089229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7745160 - 7744994
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||| |||||||||||||||| ||      
T  7745160 agagtagtggaggtagtggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaattaac 7745061  T
Q  101 cgttgcttcactt-ttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaa 166  Q
     |||||| | ||| ||||||||| |||| |  ||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  7745060 tgttgctactcttcttcagtcttatgcactctttagatgagtttgaatccattaaacaacttttgaa 7744994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 21703121 - 21703225
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  21703121 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttctcttttggttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagaccattttaagatgtcaaatttt 21703220  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  21703221 tgtct 21703225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 371
Target Start/End: Original strand, 10251283 - 10251388
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  10251283 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccatttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcata-ttt 10251381  T
Q  365 tgtctgt 371  Q
    |||||||    
T  10251382 tgtctgt 10251388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 319
Target Start/End: Original strand, 12284663 - 12284782
Alignment:
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaa 297  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||||||  ||||||||||| || |||||||| | || ||    
T  12284663 agcttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgtttcaa 12284760  T
Q  298 gcttccttatagttgattcctt 319  Q
    |||||||| | |||||||||||    
T  12284761 gcttcctttttgttgattcctt 12284782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Original strand, 19717796 - 19717874
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  19717796 cttcaggagcacttctcttcagacgctttaagcttcctttttattgattcctttgccctcttttgttcttccagaacct 19717874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21191719 - 21191590
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgatt 315  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  21191719 gcttcagatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggaggacttga-cttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagcttccttcttgttgatt 21191621  T
Q  316 cctttgctctctattgttcttccaaaacctt 346  Q
    ||  |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  21191620 ccaatgctctcgtttgttcttccagaacctt 21191590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20954242 - 20954165
Alignment:
Q  268 ttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20954242 ttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttctaaaacct 20954165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 30572457 - 30572561
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||   |||||||| || || ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  30572457 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaaacttccctttttgttgatgtatttgctctttatttattcttccaagaccattttaagatgtcaaatttt 30572556  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  30572557 tgtct 30572561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Original strand, 35402152 - 35402212
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35402152 gttgattccattgctctcttttgttcttccataacctttttaagatgacaaatttttgtct 35402212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 337
Target Start/End: Original strand, 38282873 - 38282944
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| | |||||||||    
T  38282873 tcttcaggagcagttctcttcagacgctttaagcttcctttttattgattcatttgctctattttgttcttc 38282944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48570016 - 48569897
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-----ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaaccttttt 349  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||      || | ||||||   |||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  48570016 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgatttaagcttcactttttttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagaccttttt 48569917  T
Q  350 aagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  48569916 aagatgtcaaatttttgtct 48569897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28492220 - 28492146
Alignment:
Q  271 aggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||    
T  28492220 aggagcacttctcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcatttgttctcttttattcttccagaacct 28492146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21204993 - 21204916
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  21204993 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatgc 21204916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 21984606 - 21984683
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  21984606 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 78
Target Start/End: Original strand, 42284642 - 42284715
Alignment:
Q  5 tagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  42284642 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatccaatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21204772 - 21204684
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||   ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21204772 gcttctgacgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacgttgtcttcaggagcacttttctttagacgctttaagcttcc 21204684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25448110 - 25448066
Alignment:
Q  315 tcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaa 359  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25448110 tcctttgctttctattgttcttccaagacctttttaagatgtcaa 25448066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 35040474 - 35040528
Alignment:
Q  314 ttcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35040474 ttcctttgctctttattgttcttctaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 35040528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 21984809 - 21984899
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt-tttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||| ||    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21984809 cagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcaattcaaacttcaggagcagttttcttcagacgcttaaagcttcc 21984899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 48704491 - 48704593
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||| ||||||| || | ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||    
T  48704491 cttcaggagcacttctctttagatgcttcaagcttcatttttgttgatttcattgctctcttttgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttg 48704590  T
Q  367 tct 369  Q
    |||    
T  48704591 tct 48704593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21121134 - 21121057
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  21121134 agagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21135230 - 21135153
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||||| || |||| |||||    
T  21135230 agagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19170191 - 19170055
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaactt--gcttctaatgacgtcaccacctcgagag-cactttttcttcaggagcaatttt---cttcagacgctttaag-cttc-cttat 307  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||| ||     ||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  19170191 gcttctgatgaacttttgcttctgatgacgtcatcacttc-agaggcactttgtcttcaggagcacttcaaaacttcagatgctttaaggcttctctttt 19170093  T
Q  308 agttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19170092 tgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 19170055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Original strand, 23025053 - 23025089
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23025053 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcc 23025089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23036264 - 23036204
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  23036264 gttgattccattgctcttttttgttcttccagaacgtttttaagatgacaaatttttgtct 23036204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 277
Target Start/End: Original strand, 37642445 - 37642525
Alignment:
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaactt-gcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||||    
T  37642445 agcttctggtgatatatagcttctgatgaactttgcttctaatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagca 37642525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 37642258 - 37642321
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaa 64  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37642258 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 37642321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18896365 - 18896299
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  18896365 ttttcttcagatgcttcatgcttccttcttgttgattccattgctctcatttgttcttccagaacct 18896299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18896665 - 18896559
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||| |||   ||||  || |||| ||||||||||||| ||||  || ||| ||    
T  18896665 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatccaatgccttcaaattcttttgaattagccg 18896566  T
Q  103 ttgcttc 109  Q
    |||||||    
T  18896565 ttgcttc 18896559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26548021 - 26547955
Alignment:
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||| |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26548021 tttcttcagatgctttaggtttctcttcttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 26547955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 675915 - 675948
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  675915 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 675948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 19215622 - 19215699
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||| || |||| ||| || |||| |||||    
T  19215622 agagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgctccttgaggaataagcatcaaatgc 19215699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 20799409 - 20799442
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20799409 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 20799442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21120964 - 21120867
Alignment:
Q  180 catctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||| |||||| |||||    
T  21120964 catctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaatttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaagagca 21120867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22609729 - 22609696
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22609729 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 22609696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 23024798 - 23024875
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||| || |||| ||| || |||| |||||    
T  23024798 agagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 23024875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 275
Target Start/End: Original strand, 23024982 - 23025043
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggag 275  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||    
T  23024982 cagcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggag 23025043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20867045 - 20867013
Alignment:
Q  313 attcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20867045 attcctttgctctctattgttcttccaagacct 20867013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21120859 - 21120823
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21120859 cttcaggagcagttttcttcagacgcttaaagcttcc 21120823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21134955 - 21134919
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21134955 cttcaggagcagttttcttcagacgcttaaagcttcc 21134919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Original strand, 22019682 - 22019718
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22019682 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 22019718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Original strand, 22655824 - 22655860
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22655824 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 22655860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Original strand, 23065280 - 23065316
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23065280 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 23065316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 246
Target Start/End: Original strand, 42284840 - 42284872
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42284840 cagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 42284872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 52350454 - 52350418
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  52350454 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 52350418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 90)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Original strand, 19884711 - 19885078
Alignment:
Q  5 tagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19884711 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgtt 19884810  T
Q  105 gcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  19884811 gcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttc 19884909  T
Q  204 tggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccac-ctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttc 302  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19884910 tggtgattgtcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgccactttcaagagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttc 19885009  T
Q  303 ctt--atagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||   | ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19885010 cttggtttgttgattccattgctctctattattcttccaagaccattttaagatgtcaaatttttgtct 19885078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 367
Target Start/End: Original strand, 10072942 - 10073308
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10072942 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaactagcag 10073041  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||    
T  10073042 ttgcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatccat-gaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactactgct 10073140  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaactt--gcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    | |||| || ||||||||||| |||  ||  |||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10073141 tctggtaattttcagcttctggtgattttcagcttctgatgacatcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcacttttcttcagacgctttaagc 10073240  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgt 367  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10073241 ttcctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccataacctttttaagatgtcaaatttttgt 10073308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 56034580 - 56034946
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  56034580 gagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattatttcaaaatagtc 56034679  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||    
T  56034680 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaacttcagc 56034779  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  56034780 ttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgattacgtcatcacttcagaagcacttttacttcaggatcacttttcttcagacgcttcaagct 56034877  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    | ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56034878 ttctttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 56034946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 45833399 - 45833783
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |||     
T  45833399 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaatactttcaaaataga 45833498  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45833499 agttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 45833598  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatg--------------aacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttct 284  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||              ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||  || | |    
T  45833599 cttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttatgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcacttttgtcttcaggagcgcttcttt 45833698  T
Q  285 tcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45833699 tcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcgtttgctctcttttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 45833783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13576220 - 13575869
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13576220 agagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactagg 13576121  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |  ||    
T  13576120 cgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcag 13576023  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| |||||||||||               ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13576022 cttctggtgattttcagcttctg---------------atgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 13575938  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13575937 ttcctttttgttgattcatttgctctctattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 13575869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29680649 - 29680314
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29680649 gagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 29680550  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||    
T  29680549 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatctcctggtaaactagagc 29680450  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  |||||||| || || ||||||||  ||| |||||    
T  29680449 ttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggaacacttctcttcagatacttcaagct 29680351  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29680350 tcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttc 29680314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22675625 - 22675275
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22675625 gagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 22675526  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |  |||    
T  22675525 gttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaactgcagc 22675428  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || ||| ||| ||               |||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  22675427 ttctggggatttt---------------ttgcttctgatgacgtcactacttcaggagcactttgtctttaggagaagttttcttcagacgctttaagat 22675343  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22675342 tcaattttgttgattcctttgctctctattgttcttccaagacctctttaagatgtcaaa-ttttgtct 22675275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 413007 - 413281
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||     
T  413007 agagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagc 413106  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |  ||    
T  413107 cgttgcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaactgcag 413204  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  || |||||| |||||||||||    
T  413205 cttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcactacttcatgaacactttgtcttcaggagc 413281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 54679935 - 54680284
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  54679935 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 54680034  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |  ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |  ||    
T  54680035 tgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcag 54680130  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| |||||||||||               ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54680131 cttctggtgattttcagcttctg---------------atgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 54680215  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  54680216 ttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgacaaa-ttttgtct 54680284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14605013 - 14604631
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcc-tttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||    
T  14605013 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaaatag 14604914  T
Q  100 tcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |    
T  14604913 ttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaagttta 14604814  T
Q  199 gcttttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    |||| || |||||||              ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||  |||||||||  ||||||||||| || |||||    
T  14604813 gcttctgatgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttc 14604714  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| || |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14604713 agacgtttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 14604631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37435639 - 37435245
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37435639 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 37435540  T
Q  103 ttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  37435539 ttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 37435440  T
Q  202 tttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaat---------------gacgtcaccacctcgagagcactttttcttcagga 274  Q
    | ||||||||||              ||||||||||||||||||||| ||               ||||||| ||| ||  ||||||| || ||||||||    
T  37435439 tctggtgatcttgcctctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactattacttcagga 37435340  T
Q  275 gcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||| || |||||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37435339 gcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 37435245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 10692856 - 10693241
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10692856 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 10692955  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  10692956 tgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacag 10693053  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcag-----------------gagcaatttt 282  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||                 ||||  ||||    
T  10693054 cttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagcagcgctatatcttcatgagctgtttt 10693153  T
Q  283 cttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacc-tttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10693154 cttcaaacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgtttttccaagaccttttttaagatgtcaaa-ttttgtct 10693241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 10906622 - 10907007
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10906622 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 10906721  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  10906722 tgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacag 10906819  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcag-----------------gagcaatttt 282  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||                 ||||  ||||    
T  10906820 cttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagcagcgctatatcttcatgagctgtttt 10906919  T
Q  283 cttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacc-tttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10906920 cttcaaacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgtttttccaagaccttttttaagatgtcaaa-ttttgtct 10907007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 17247249 - 17247487
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17247249 agagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagt 17247348  T
Q  101 cgttgcttcacttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||| ||||| |  |||    
T  17247349 cgttgcttcactttccaatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--attcatctcctgatgaactgcagc 17247446  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17247447 ttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatga 17247487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 3483739 - 3483962
Alignment:
Q  14 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactt 113  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3483739 tagtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 3483838  T
Q  114 ttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatct 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||| |||||||||    
T  3483839 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtgatct 3483938  T
Q  213 tcagcttctgatgaacttgcttct 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3483939 tcagcttctgatgaacttgcttct 3483962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12811280 - 12811070
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||   ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12811280 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatt---agaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 12811184  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12811183 gttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaactagagc 12811084  T
Q  201 ttttggtgatcttc 214  Q
    || |||||||||||    
T  12811083 ttctggtgatcttc 12811070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Original strand, 3395596 - 3395836
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3395596 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 3395695  T
Q  102 gttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  3395696 gttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatctcctgatgaactatagc 3395795  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    || | |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  3395796 ttctagtgatcttcaacttctgataaacttgcttctgatga 3395836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 372
Target Start/End: Original strand, 16632451 - 16632829
Alignment:
Q  7 gtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgc 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  16632451 gtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttga 16632550  T
Q  107 ttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttg 205  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |     
T  16632551 ttcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttcta 16632650  T
Q  206 gtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgct 293  Q
    ||||||||              |||| |||||| ||||||||| |||  |||| ||| ||   ||||||||  ||| ||||||| || |||||||| |||    
T  16632651 gtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaccttgcttctgatggtgtcatcacttcagaagcactttgactttaggagcacttctcttcagatgct 16632750  T
Q  294 ttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtctgtg 372  Q
    | |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||||    
T  16632751 tcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgtttttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtctgtg 16632829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19621163 - 19620816
Alignment:
Q  5 tagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19621163 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 19621064  T
Q  105 gcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttt 203  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||              
T  19621063 gcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatctcctgatgaa---------- 19620974  T
Q  204 tggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
           ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| ||  || ||||||  |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  19620973 -------cttcagcttctgatg-agatgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcactttgacttcaggagcacgtctcttcagatgctttaagcttcc 19620882  T
Q  304 ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  19620881 tttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 19620816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37985717 - 37985533
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  37985717 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 37985618  T
Q  102 gttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37985617 gttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 37985533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 12601107 - 12601291
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12601107 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 12601206  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 185  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12601207 gttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctc 12601291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 19666378 - 19666564
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19666378 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 19666477  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 187  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19666478 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatctcct 19666564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 180
Target Start/End: Original strand, 9140918 - 9141097
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9140918 gagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 9141017  T
Q  102 gttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgc 180  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9141018 gttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtcttgc 9141097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 6517490 - 6517877
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||    
T  6517490 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatctcatgctttccaatccttccaaaatagt 6517589  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |     
T  6517590 cgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaataacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaa 6517687  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagca-----------------ctttttcttcaggagca-attt 281  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||                 |||| ||||||||||||  |||    
T  6517688 cttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactatatcttcaggagcgctttatcttcaggagcagtttt 6517787  T
Q  282 tcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6517788 tcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatttttgtct 6517877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 339
Target Start/End: Original strand, 14833460 - 14833750
Alignment:
Q  60 aagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaa 158  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  14833460 aagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatctattgaacat 14833559  T
Q  159 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctg---------atgaacttgcttctaatgacgtcacca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||| |||||||||||||||         |||||| ||||||| ||||| | | ||    
T  14833560 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatgcttcttatgaacctgcttctgatgactttatca 14833659  T
Q  250 cctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttcca 339  Q
    | ||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||| ||| || ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14833660 cttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttcgcttcagatgcttcaagttttctttttgttgatttctttgctctcttttgttcttcca 14833750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19911986 - 19911760
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaa-gaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19911986 gagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagt 19911887  T
Q  101 cgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||||  || | |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |     
T  19911886 cgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 19911787  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  19911786 cttctgatgatcttcagcttctgatga 19911760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 55380296 - 55380519
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  55380296 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtt 55380395  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  55380396 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcag 55380494  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| || |||||||  |||||||||||    
T  55380495 cttctgatgatctt--gcttctgatga 55380519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14904461 - 14904236
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| | | |    
T  14904461 gagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatggac 14904362  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | |    
T  14904361 gttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatctcctgatgaactacaac 14904262  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || ||||||||||||| || ||||||    
T  14904261 ttctggtgatcttcagattttgatga 14904236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 29121375 - 29121550
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  29121375 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgccttcaaatcctttcaaaatagt 29121474  T
Q  101 cgttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagt 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  29121475 cgttgcttcactttttcagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 29121550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 6641689 - 6642044
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||  || |||     
T  6641689 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaatccttttgaattagc 6641788  T
Q  101 cgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |||||| ||| | |||||| |||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||  ||    
T  6641789 cgttgtttcactcttctgatcttctacaatgc-taggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatcttctgatgaaattcag 6641887  T
Q  200 cttttggtgat----cttc--------agcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttca 287  Q
    ||| |||||||    ||||         ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  |||||| ||  |||||| ||||  ||||||||    
T  6641888 cttctggtgatattgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcac-ttgacttcagaagcacatttcttca 6641986  T
Q  288 gacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    || |||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  6641987 gatgcttcaagcttccttcttgttgactccattgctctcatttgttcttccagaacct 6642044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 40846105 - 40846330
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || | ||| |||| ||||| ||||| | | ||  || |||||    
T  40846105 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaacttcatttgaattagtc 40846204  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| || ||||| |  ||    
T  40846205 gttgcttcactttcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttcag 40846303  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  40846304 cttccggtgatcttcagcttctgatga 40846330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 216 - 369
Target Start/End: Original strand, 29121608 - 29121761
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgat 314  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| || ||| || |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  29121608 gcttctgatgaacttgctactgatgacgccatcacttcaagagcactttgtcttcaggtgcagttttcttcagacgttttaagcttccctttttgttgat 29121707  T
Q  315 tcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29121708 tcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 29121761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3105525 - 3105174
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||| | ||  |||||||||||| |||     
T  3105525 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataaccatccaatacttttcaatcctttcaaaatagc 3105426  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||          
T  3105425 cgttggaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaa------ 3105335  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
               || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  |||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3105334 -----------ctgcagcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcaccttgtcttcaggagcagttttcttcagacactttaagc 3105246  T
Q  300 ttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| || | ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  3105245 ttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttcttccaaaaccaatttaagatgtcaaatttttgtct 3105174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 23123532 - 23123662
Alignment:
Q  97 tagtcgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaat 195  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23123532 tagtcattgcttcactctttcagtcttctacaatacttagacgagattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 23123631  T
Q  196 agagcttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
      ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23123632 tcagcttctggtgatcttctgcttctgatga 23123662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 56533168 - 56533018
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatcttt-gaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  56533168 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacatctaatgcattcaaatcctttcaaaatag 56533069  T
Q  100 tcgttgcttca-cttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcc 149  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  56533068 ccgttgcttcattttttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcc 56533018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 8105642 - 8105819
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatc-tttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  8105642 agagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatag 8105741  T
Q  100 tcgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaat-ccattgaacaacctttgaagctttaagt 175  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  8105742 ccgttgcttcaattttccagtcttctgcaatccttagacgaagttgaatcccattaaacaacttttgaagccttaagt 8105819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 371
Target Start/End: Original strand, 16940181 - 16940357
Alignment:
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16940181 ttttggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgattacgtcatcacttcaagagcactttaacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagct 16940280  T
Q  301 tcc-----ttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtctgt 371  Q
    |||     || | ||||||   |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16940281 tccttttttttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatatttgtctgt 16940357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17398780 - 17398529
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||         ||||| ||||    
T  17398780 agagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt---------tcaaaatagt 17398690  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||  |||| |||| || ||||| |  |||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||    ||    
T  17398689 cgttgctatacttttccagtcttctgcaatt-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaaccgcag 17398593  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt 263  Q
    ||| |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||    
T  17398592 cttctggtgattcatagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactt 17398529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 282 - 369
Target Start/End: Original strand, 3497934 - 3498020
Alignment:
Q  282 tcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3497934 tcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctatattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 3498020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 3793376 - 3793477
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3793376 cttcaggagcagttttcttcagacactttaagctttctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttg 3793474  T
Q  367 tct 369  Q
    |||    
T  3793475 tct 3793477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 345
Target Start/End: Original strand, 9141096 - 9141226
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgat 314  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  9141096 gcttctgaagaacttgcatctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgccttaagcttcctttttgttgat 9141195  T
Q  315 tcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9141196 tcctttgctctcttttgttcttccataacct 9141226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 55732069 - 55732181
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatg 355  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  55732069 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcccttttgttgatttctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagata 55732168  T
Q  356 tcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| ||||||||    
T  55732169 tcaaa-ttttgtct 55732181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 152
Target Start/End: Original strand, 16940026 - 16940172
Alignment:
Q  6 agtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| || |||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16940026 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctccttgaagaataagcattcaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttg 16940125  T
Q  106 cttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatt 152  Q
    ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  16940126 ctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccatt 16940172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 223
Target Start/End: Original strand, 15139328 - 15139456
Alignment:
Q  97 tagtcgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa-a 194  Q
    |||||||||||||||| | | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||      
T  15139328 tagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaact 15139427  T
Q  195 tagagcttttggtgatcttcagcttctga 223  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15139428 tttagcttctggtgatcttcagcttctga 15139456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25651210 - 25651046
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| |||| |||     
T  25651210 agagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatccttccaaaatagc 25651111  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttg 164  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||    
T  25651110 cgttgcttcacttttcaagtcttctgcgatctttagacaagtttgaatccgttaaacaacttttg 25651046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 16853508 - 16853602
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaa 95  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  16853508 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgctttcaaatcccttcaaa 16853602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 16853765 - 16853866
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  16853765 cttcaggagcagatttcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctcttaattgttcttcaaagacctttttaagatatcaaa-ttttg 16853863  T
Q  367 tct 369  Q
    |||    
T  16853864 tct 16853866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 345
Target Start/End: Original strand, 3395900 - 3395989
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3395900 gagcactttgacttcaggagcagttctcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 3395989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 23750528 - 23750751
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttg-aagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |||   || ||||| |||| |||||||| || | | ||  ||  |||    
T  23750528 gagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaacttcatttgaagcagt 23750624  T
Q  101 cgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttt-gaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    |||||||||||| | | | ||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  23750625 cgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgct-aggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttca 23750723  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  23750724 gcttctggttatctttaacttctgatga 23750751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 365
Target Start/End: Original strand, 17247533 - 17247644
Alignment:
Q  255 agagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaaga 353  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||    
T  17247533 agagcgctttgtcttcaggagcagttttctggagacactttaagctttcctttttgttgattcctttgctctttgttgttcttccaagacctttttagga 17247632  T
Q  354 tgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||| ||||    
T  17247633 tgtcaaaatttt 17247644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 359
Target Start/End: Original strand, 8105945 - 8106044
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||     || |||||||||||||    
T  8105945 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgtt-----aagacctttttaagat 8106039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 14571183 - 14571304
Alignment:
Q  154 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctc 253  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  | ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  14571183 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 14571280  T
Q  254 gagagcactttttcttcaggagca 277  Q
      ||||||||| ||||||||||||    
T  14571281 aggagcactttgtcttcaggagca 14571304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25650966 - 25650863
Alignment:
Q  268 ttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  25650966 ttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaataccttcttaagatgtcaaattttt 25650867  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  25650866 gtct 25650863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 11915705 - 11915835
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||| ||  || ||||    
T  11915705 agagtagtggaggcggtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaaatagt 11915804  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatg 130  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11915805 cgttgcttcactcttttagtcttctgcaatg 11915835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 296 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12810991 - 12810918
Alignment:
Q  296 aagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12810991 aagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 12810918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 193
Target Start/End: Original strand, 55731838 - 55731975
Alignment:
Q  54 tctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttca-cttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatt 152  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | || | ||||||| ||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  55731838 tctttgaagaataagcatccaat-ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatttacctctccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatccatt 55731936  T
Q  153 gaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa 193  Q
     |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||    
T  55731937 aaacaacttttgaagttttaag--ttgcatctcctgatgaa 55731975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 345
Target Start/End: Original strand, 12601334 - 12601464
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgat 314  Q
    |||||| |||||  ||||| | ||||| ||| ||| ||  |||||||||| |||| |||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||||    
T  12601334 gcttcttatgaaaatgcttttgatgacatcatcacttcaggagcacttttgtcttaaggaacacttctcttcagatgccttaagcttcctttttgttgat 12601433  T
Q  315 tcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12601434 tcctttgctctcttttgttcttccagaacct 12601464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14904217 - 14904139
Alignment:
Q  211 cttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcaga 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  14904217 cttcagcttctgatgaacttgcttctgaagacgtcatcacttcaatagcactttgtcttcaggagcacttctcttcaga 14904139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 1672394 - 1672499
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||| | ||||| | || || || || |||||||||| |||     
T  1672394 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttctttgaaggataaacacccaaagcttttaagtcctttcaaattagc 1672493  T
Q  101 cgttgc 106  Q
    ||||||    
T  1672494 cgttgc 1672499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 1674869 - 1674974
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||| | ||||| | || || || || |||||||||| |||     
T  1674869 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttctttgaaggataaacacccaaagcttttaagtcctttcaaattagc 1674968  T
Q  101 cgttgc 106  Q
    ||||||    
T  1674969 cgttgc 1674974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Original strand, 3793289 - 3793376
Alignment:
Q  161 tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccac 250  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  3793289 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctagtgattttcagcttctggtgaacttgcttttgatgacgtcaccac 3793376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 333
Target Start/End: Original strand, 55380528 - 55380594
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgtt 333  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  55380528 cttcaggagcacttctcttcagacgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgtt 55380594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 38513883 - 38513960
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  38513883 agagtagtgaaagtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatgc 38513960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 40860672 - 40860749
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  40860672 agagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40860749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Original strand, 413337 - 413395
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  413337 gttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaa-atgtcaaa-ttttgtct 413395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 8685549 - 8685509
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgta 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8685549 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 8685509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17788153 - 17787990
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgt-caacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaa-tcctttcaaacta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| | ||||| |||   ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||    
T  17788153 agagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattgtcctttttccaacgttctccaaagaataagcatctaatgcctttaaattcctttgaaa-ta 17788055  T
Q  99 gtcgttgcttcacttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 170  Q
    ||| |||||||       |||||||||||||| | || || |||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  17788054 gtcattgcttc------tagtcttctgcaatgataag-cgtgattaaatcatttgaacagcctttgaagctt 17787990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14153912 - 14153873
Alignment:
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttcta 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14153912 agcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttcta 14153873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14904130 - 14904067
Alignment:
Q  282 tcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14904130 tcttcagacgctttaagcttcttttttgtttattcatttgctctcttttgttcttccagaacct 14904067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 22190851 - 22190914
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaa 64  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22190851 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 22190914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Original strand, 22191055 - 22191118
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||| |||||||    
T  22191055 cagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgtctttaggagca 22191118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 17540400 - 17540450
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaac 51  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  17540400 agagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaac 17540450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 345
Target Start/End: Original strand, 17540716 - 17540782
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  17540716 ttttcttcagatgcttcaagcttccttcttgttgattccattgctctcatttgttcttccagaacct 17540782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 277
Target Start/End: Original strand, 20977639 - 20977709
Alignment:
Q  207 tgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||||    
T  20977639 tgatctgcagcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagca 20977709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 226
Target Start/End: Original strand, 22089733 - 22089818
Alignment:
Q  140 gattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||  |  ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22089733 gattaaatcctttgaacaacctttgaagc-ttaattctttcatcttctgatgatctttagcttctggtgatcttcaacttctgatga 22089818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 14571312 - 14571416
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    ||||||| |||| |||||||||| |||  |||| || |||||| |||    
T  14571312 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttcttccaagaccaatttaggacgtcaaatttt 14571411  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  14571412 tgtct 14571416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Original strand, 22191126 - 22191162
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22191126 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcc 22191162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Original strand, 40860961 - 40860997
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40860961 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcc 40860997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 3499758 - 3499695
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaa 64  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  3499758 agagtagtagaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctcattgaagaa 3499695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 276
Target Start/End: Original strand, 8105889 - 8105948
Alignment:
Q  217 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  8105889 cttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagc 8105948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27188567 - 27188497
Alignment:
Q  207 tgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||| ||||    
T  27188567 tgatctgcagcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcaacacttcagaagcactttgtcttcagaagca 27188497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Original strand, 40846368 - 40846418
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcc 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||    
T  40846368 cttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcc 40846418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14154100 - 14154015
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaa-ttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaa 85  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||| ||||||||| | || |||| ||||| ||||||    
T  14154100 agagtagtggagaaggtggttgtacacttcgtacaagttgtacaatatcaacgttctttgaagtataagcatccaatgctttcaaa 14154015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 20977462 - 20977539
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||| || |||| ||| || |||| |||||    
T  20977462 agagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 20977539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31266513 - 31266480
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31266513 gattcctttgctctccattgttcttccaaaacct 31266480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 49001695 - 49001662
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49001695 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 49001662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 55651867 - 55651900
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55651867 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 55651900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17993547 - 17993511
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17993547 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 17993511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25651051 - 25650975
Alignment:
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||  || |||||| |||||||||||    
T  25651051 cttttggtgattcttagcttctgatgaacttgcttatgatgatgtcatcacttcaggaacactttatcttcaggagc 25650975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Original strand, 33378763 - 33378799
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33378763 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 33378799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 112)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 2561198 - 2561573
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  2561198 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaatcctttcaaaatagt 2561297  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2561298 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 2561397  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2561398 cttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcaccacttcaagagcactttgtcttcaggagcagttctcttcagacgctttaagc 2561497  T
Q  300 ttccttatagttgatt------cctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | |||||||      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2561498 ttcctttttgttgattcatttgcatttgctctctattgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 2561573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969707
Alignment:
Q  5 tagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgtt 14969440  T
Q  105 gcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttt 203  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  14969441 gctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagcttc 14969540  T
Q  204 tggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttc 302  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||| |||    
T  14969541 tggtgatcttcagcatctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttaaggagcgattctcttcagatgcttcaagattc 14969640  T
Q  303 cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14969641 ctttttgttgattcatttgctctcgtttgttcttccataacctttttaagatgtcaaatttttgtct 14969707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 28582117 - 28582500
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||    
T  28582117 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatcctttcaaaatagtc 28582216  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28582217 gttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagc 28582316  T
Q  201 ttttggtgatcttca---------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    || ||||||| ||||               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  28582317 ttctggtgattttcagcttctaatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttctctt 28582416  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28582417 cagacgttttaagcttcctttttgttgatttctttactctctattgttcttccagaacctttttaagatttcaaatttttgtct 28582500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 11223573 - 11223939
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11223573 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 11223672  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||  ||||  || ||||||| ||||| |   |    
T  11223673 cgttgcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctcaaagt--tgtatctcctgatgaactgctg 11223770  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |    
T  11223771 cttctggtgattttcagattctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttctcttcagatgctttaaac 11223870  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11223871 ttcctttttgttgattcctttgctctttattattcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 11223939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 47207716 - 47208102
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  47207716 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaactagc 47207815  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgc-ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||| |  |    
T  47207816 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcatctcctgatgaactgca 47207913  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaactt--gcttctaatgacgtcaccacctcga-----------------gagcactttttcttcaggagcaat 279  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| || |                 ||||||||| |||||||||||| |    
T  47207914 gcttctggtgattttcagcttctgatgaagttcagcttctgatgacgtcaccacttcaagagcaccttgtcttcaggagcactttgtcttcaggagcagt 47208013  T
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47208014 tttcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcatttgctctctattgttcttccaatacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 47208102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18121771 - 18121387
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18121771 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagt 18121672  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  18121671 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagag 18121572  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaactt---------------gcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttct 284  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||               |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| || |||    
T  18121571 cttctggtgatctttagcttatgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatgatgtcaccacgtcaggagcactttgtcttcaggagcagttctct 18121472  T
Q  285 tcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18121471 tcagacgctttaagcttcatttttgttgcttcatttgctctctattgttcttccagaacctttttaagatgtcaaacttttgtct 18121387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47405568 - 47405230
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47405568 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaatcctttcaaactagttg 47405469  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| | ||||| |  ||||    
T  47405468 ttgcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcgtgatgaactgcagct 47405371  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    | ||||||| |||||||||||               |||||||||  || ||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47405370 tctggtgattttcagcttctg---------------atgacgtcattacttcaggagcacttttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagct 47405286  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgt 356  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  47405285 tcctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccaagacgtttttaagatgt 47405230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 31303397 - 31303782
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  31303397 gagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaatcctttcaaaatagtt 31303496  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  || ||||||    
T  31303497 gttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatctcctgagtaactagagc 31303596  T
Q  201 ttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttc---taatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttc 283  Q
    || ||||||||||||              ||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || ||    
T  31303597 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctc 31303696  T
Q  284 ttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  31303697 ttcagatgctttaagcttcctttttgttgattcttttgctctcttttgttcttccagaaactatttaagatgtcaaatttttgtct 31303782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 369
Target Start/End: Original strand, 52920419 - 52920798
Alignment:
Q  4 gtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgt 103  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| |||| ||    
T  52920419 gtagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatacttt-aaattagttgt 52920517  T
Q  104 tgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagctt 202  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||    
T  52920518 tgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagctt 52920617  T
Q  203 ttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcag 288  Q
     ||||||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  52920618 ctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcacttctcttcag 52920717  T
Q  289 acgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    | |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52920718 atgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 52920798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 6090742 - 6091125
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||     
T  6090742 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaattaga 6090841  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  6090842 tgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 6090941  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttc--------------tgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    ||| ||||||||||| |||||              |||||||||||||||| |||||||||  || ||  |||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  6090942 cttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcataacttcatgagcactttaacttcaggagcacttctctt 6091041  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| |||| ||||||| || | ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6091042 cagatgcttcaagcttcatttttgttgatttcattgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 6091125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 13948347 - 13948705
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13948347 gagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 13948446  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |  |||    
T  13948447 gttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagc 13948546  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatg--------------aacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || ||||||||||||||||||||||              ||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||  ||||| ||||| || |||||    
T  13948547 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcattttgacttcaagagcacttctcttc 13948646  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13948647 agatgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgtttttccagaacct 13948705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12963233 - 12962891
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||  |||||||| |||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||     
T  12963233 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccttctaaaatagtt 12963134  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  12963133 gttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 12963034  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||  |||||  |||| || ||||||||||||| |||||    
T  12963033 ttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttgacttcaatagcacttctcttcagacgcttcaagct 12962936  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||| | ||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||    
T  12962935 tcctttttgttgattccttagtcctcttttgttcttccagaacct 12962891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 49642910 - 49642685
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  49642910 gagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 49642811  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  49642810 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 49642711  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || |||||||||||||||||| ||||    
T  49642710 ttctggtgatcttcagcttctaatga 49642685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 15903209 - 15903592
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaa-catctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15903209 gagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatcctttcaaaatagt 15903308  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  15903309 cgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcctgataaattacag 15903408  T
Q  200 cttttggtgatcttcagc--------------ttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    ||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||||||  ||| ||||||| || ||||    
T  15903409 cttttggtgatcttcagcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgacttaaggagcacttctctt 15903508  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  15903509 cagatgcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 15903592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14393151 - 14392772
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14393151 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcg 14393052  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||    
T  14393051 ttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatctcctaatgaacttcagct 14392952  T
Q  202 tttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcaga 289  Q
    | | ||||||||              |||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  14392951 tctagtgatcttgcttttgatgagatgcttatgatgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttaacttcaggagcacttctcttcaga 14392852  T
Q  290 cgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
     |||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  14392851 tgcttcaagcttcctttctgttgattccttagctctcttttgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 14392772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38177792 - 38177566
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38177792 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 38177693  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  38177692 tgttgcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaataaactagag 38177593  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||    
T  38177592 cttctgatgatcttctgcttctgatga 38177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 20646165 - 20646516
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  20646165 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagac 20646264  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |     
T  20646265 gttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 20646364  T
Q  200 cttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    ||| ||||||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  || ||||||  ||||||||||| || ||||    
T  20646365 cttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgaacactttgacttcaggagcacttctctt 20646464  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20646465 caaacgctttaagcttccattttgttgattcctttgctctcttttgttcttc 20646516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 37467346 - 37467567
Alignment:
Q  4 gtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37467346 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgt 37467445  T
Q  104 tgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagctt 202  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  37467446 tgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatctcctgatgaactactgctt 37467545  T
Q  203 ttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
     ||||||||||  |||||||||||    
T  37467546 ctggtgatctt--gcttctgatga 37467567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 40799884 - 40800108
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40799884 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaatactttcaaactagt 40799983  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||||| |  ||    
T  40799984 cgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgatgcatctcttgatgaactgcag 40800081  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40800082 cttctggtgattttcagcttctgatga 40800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 49553638 - 49553254
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  49553638 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 49553539  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |   |    
T  49553538 cactgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcgg 49553439  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt----------------tcttcaggagcaatt-tt 282  Q
    ||| ||||||||||   ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||                |||||||||||| || |     
T  49553438 cttctggtgatctt--acttctgatg-agatgcttctaatgacgtcatcacttaaggagcacttttacctcaggagcacttatcttcaggagcacttcta 49553342  T
Q  283 cttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctct-ctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  49553341 cttcagacgcttcaagcttcctttttgttgattcatttgctctcctgttgttcttccagaacttatttaagatgtcaaatttttgtct 49553254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17239069 - 17238753
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17239069 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcg 17238970  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
     ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |            
T  17238969 atgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgca-------- 17238878  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt 301  Q
             ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17238877 ---------cttcatcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac-ttgacttcaggagcacttctcttcagacgctttaagctt 17238788  T
Q  302 ccttatagttgattcctttgctctctattgttctt 336  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17238787 cctttttgttgattccttagctctcttttgttctt 17238753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 53056876 - 53056494
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  53056876 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 53056777  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  || |||||||| |||| | |||||| | |||||  ||||||| | | ||||| |  ||    
T  53056776 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgatgttgaatccattaaacagcttttgaaaccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcag 53056679  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttg---------------cttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttct 284  Q
    ||| | ||||| ||  ||||||||| ||||||               ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  53056678 cttctagtgatttttggcttctgataaacttgtttttgatgaactaacttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttct 53056579  T
Q  285 tcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53056578 tcaaacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctttttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 53056494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Original strand, 13824092 - 13824263
Alignment:
Q  14 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcact- 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||     
T  13824092 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagttgttgcttcactc 13824191  T
Q  113 tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 184  Q
    || ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13824192 ttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13824263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18142901 - 18142619
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18142901 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagt 18142802  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||      
T  18142801 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactag-- 18142704  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
                   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18142703 ---------------agcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggaacactttgtcttcaggagcagttttcttcaaacgctttaagc 18142619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Original strand, 41495010 - 41495179
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41495010 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 41495109  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 170  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41495110 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46349991 - 46349754
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46349991 agtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcg 46349892  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||  |||||  |||| |||||| ||||| |  | ||    
T  46349891 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaag--ttgcttctcctgatgaactgcaact 46349794  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  46349793 tctggtgattttcagcttctaatgaacttgcttctgatga 46349754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13780732 - 13780575
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13780732 gagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 13780633  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaa 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13780632 gttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaa 13780575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16658765 - 16658541
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||  ||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16658765 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcg 16658666  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||||||||||  ||  ||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| || | ||    
T  16658665 ttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatctcctgatgaactacaact 16658566  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16658565 tctggtgatcttcagcttctgatga 16658541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29951586 - 29951363
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  29951586 gagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 29951487  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| || ||||| |  |||    
T  29951486 gttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctgatgaacttcagc 29951387  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgat 224  Q
    || | |||||||||||||||||||    
T  29951386 ttctagtgatcttcagcttctgat 29951363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30000740 - 30000517
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  30000740 gagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 30000641  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| || ||||| |  |||    
T  30000640 gttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctgatgaacttcagc 30000541  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgat 224  Q
    || | |||||||||||||||||||    
T  30000540 ttctagtgatcttcagcttctgat 30000517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12726379 - 12726186
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||| ||||  || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12726379 agagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagt 12726280  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa 193  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12726279 cgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatctcctgatgaa 12726186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20627578 - 20627356
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  20627578 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaatccattcaaaatagttg 20627479  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |  | ||    
T  20627478 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaact 20627381  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  20627380 tctggtgattttcagcttctgatga 20627356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 2785074 - 2785314
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatcttt-gaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  2785074 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatag 2785173  T
Q  100 tcgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  2785174 ttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactaca 2785271  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
     ||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  2785272 acttctggtgattctcagcttctaataaacttgcttctgatga 2785314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14955437 - 14955676
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14955437 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatactttcaaaatagt 14955536  T
Q  101 cgttgcttca-cttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| | ||||||||||| ||  || |||||||| ||||| |  |     
T  14955537 tgttgctttacctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttacatctcctgatgaactgcaa 14955634  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14955635 cttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatga 14955676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 264
Target Start/End: Original strand, 11869131 - 11869340
Alignment:
Q  54 tctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatt 152  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||| ||||    
T  11869131 tctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattcatt 11869230  T
Q  153 gaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacct 252  Q
     |||||  |||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |    
T  11869231 aaacaaattttgaagccttaag--ttgcatcccctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaaattgcttctgatgacatcaccactt 11869328  T
Q  253 cgagagcacttt 264  Q
    |  |||||||||    
T  11869329 caggagcacttt 11869340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19889088 - 19888849
Alignment:
Q  7 gtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||   | ||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19889088 gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgc 19888989  T
Q  107 ttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca-acctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagctttt 204  Q
    ||||||  ||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |    
T  19888988 ttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactttagcttct 19888889  T
Q  205 ggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 246  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19888888 agtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtca 19888849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24775683 - 24775492
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24775683 agagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 24775584  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa 193  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  24775583 tgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaa 24775492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 29855419 - 29855659
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  29855419 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaactagc 29855518  T
Q  101 cgttgcttcac--ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| | |||||||  |||||  ||||||| | | ||||| |  |    
T  29855519 cgttgcttcactttttttagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagtcttaag--ttgcatcccatgatgaactgca 29855616  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    | |||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  29855617 ggttttggtgatttttggcttccgataaacttgcttctgatga 29855659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 16032535 - 16032711
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16032535 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 16032634  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 177  Q
    ||||| | |||| | |  |||||||||| ||  ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16032635 cgttgatacactctcctggtcttctgcagtg-ataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 16032711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 33583239 - 33583480
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatcttt-gaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  33583239 agagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatag 33583338  T
Q  100 tcgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaat-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatag 197  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| || || ||| ||||  |||||| |||||||| |||||  |||||||  || ||||| ||     
T  33583339 ccgttgcttcacttttccagtcttctacaatccttagacaaggttgaatcccataaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactac 33583436  T
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  33583437 aacttttggtgatttttagcttctgatagacttgcttctgatga 33583480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25398404 - 25398238
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25398404 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctttgaagagcaaatatgcaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 25398305  T
Q  101 cgttgcttcacttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 184  Q
    ||||||||                 || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398304 cgttgctt-----------------cattgtttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25398238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 46796514 - 46796251
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||         ||||| ||| ||    
T  46796514 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagtatctaatgcctt---------tcaaattagccg 46796424  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||    
T  46796423 ttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagct 46796327  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    | | |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||| | ||||||||||||    
T  46796326 tcttgtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactctgtcttcaggagca 46796251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Original strand, 50300508 - 50300610
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50300508 tcttcaggagtagttttcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaa-tttt 50300606  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  50300607 gtct 50300610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12389021 - 12388845
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || |||| |||||||| |||| ||||  || ||||    
T  12389021 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaattcttttgaattagt 12388922  T
Q  101 cgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 177  Q
    ||| |||||||| ||| | ||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12388921 cgtagcttcactgttctgatcttctgcaattc-tagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 12388845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Original strand, 11869376 - 11869478
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11869376 tcttcaggagcagttttctttagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-tttt 11869474  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  11869475 gtct 11869478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19249558 - 19249385
Alignment:
Q  4 gtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgt 103  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || | ||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||    
T  19249558 gtagtggagtaagtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgt 19249459  T
Q  104 tgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 177  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||| ||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19249458 tgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtct 19249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 22140774 - 22140965
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||| || |||||| ||||    
T  22140774 agagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgttttcaaaacccttcaaaatagt 22140873  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa 193  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  22140874 cgttggttcacttatctagtcttctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaa 22140965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22804171 - 22804061
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  22804171 gagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgccttcaagtcctttcaaaatagcc 22804072  T
Q  102 gttgcttcact 112  Q
    |||||||||||    
T  22804071 gttgcttcact 22804061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 40800117 - 40800218
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  40800117 cttcaggagcacttttcttcagacgctttaagcttcctttttgttgatttctttgctctctattattcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttg 40800215  T
Q  367 tct 369  Q
    |||    
T  40800216 tct 40800218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 5213587 - 5213786
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5213587 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgct-tttgaataataagcatctaatgccttcaaatccttccaaaatagt 5213685  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||  |||||| ||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  5213686 tgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacag 5213783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 267 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20627347 - 20627258
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgt 356  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20627347 cttcagaagcagttttgttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccaagacctttttaagatgt 20627258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 20725097 - 20725269
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  |  ||||| |||| |||| |||||||||||||  || ||||    
T  20725097 agagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattagt 20725196  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaa 173  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  20725197 cgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaa 20725269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 345
Target Start/End: Original strand, 41495214 - 41495343
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||  |||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  41495214 gcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcatgagcactttgacttcagaagcacttctcttcagatgctttaagcttcctttttgttgatt 41495313  T
Q  316 cctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41495314 cctttgctctcttttgttcttccagaacct 41495343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 357
Target Start/End: Original strand, 29855706 - 29855808
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29855706 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgttctttattgttcttccaagacctttttaagat 29855805  T
Q  355 gtc 357  Q
    |||    
T  29855806 gtc 29855808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 369
Target Start/End: Original strand, 13824272 - 13824426
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcag--acgctttaagcttccttatagttga 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||   | ||| |||||||||| | |||||    
T  13824272 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcacttctcttcaggagcacttcaagcttcctttttgttga 13824371  T
Q  314 ttcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  13824372 ttccattgctctcttttgttcttccagaacc-ttttaagataacaaatttttgtct 13824426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 21640877 - 21641108
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||||| |||||||| || || |||| ||||| ||  ||||||| |||| |||     
T  21640877 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcttttcaatccttccaaaatagc 21640976  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| || ||||| |  |||| | ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |  |     
T  21640977 cgttgctatacttttccagtcttctacaat-cttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaa 21641073  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgctt 234  Q
    ||| |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  21641074 cttctggtgattcacagcttctgatgaacttgctt 21641108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Original strand, 33583552 - 33583655
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  33583552 tcttcaggagcagttttcttcatatgttttaaacttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaatttttt 33583651  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  33583652 gtct 33583655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Original strand, 33598172 - 33598275
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  33598172 tcttcaggagcagttttcttcatatgttttaaacttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaatttttt 33598271  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  33598272 gtct 33598275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 50300246 - 50300372
Alignment:
Q  14 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatc-tttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcact 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  50300246 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacatacatccaatgcgttcaaatcccttcaaa-tagcagttgcttcact 50300344  T
Q  113 ttt-cagtcttctgcaatgcttagacga 139  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  50300345 tttccagtcttctgcaatccttagacga 50300372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 14955738 - 14955851
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14955738 gagcgctttatctgcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttaatttctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagat 14955837  T
Q  355 gtcaaagttttgtct 369  Q
     ||||| ||||||||    
T  14955838 atcaaa-ttttgtct 14955851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 5216267 - 5216382
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaaga 353  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5216267 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagaagctttaagctttcctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaaga 5216366  T
Q  354 tgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| ||||||||    
T  5216367 tgtcaaatttttgtct 5216382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49666554 - 49666325
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||| | ||||||||||| |         || |||  |||||||||||| ||||    
T  49666554 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaatgctctttgaagaata---------tgtctttcaatcctttcaaaatagt 49666464  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |  ||    
T  49666463 cgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcag 49666367  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| |||||||   || ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  49666366 cttctggtgattcacaacttatgatgaaattgcttctgatga 49666325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24775380 - 24775268
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctct--ctattgttcttccaaaacctttttaag 352  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||    
T  24775380 gagcgctttatcttcaggagcatttttcttcaaacgctttaagcttccatttttgttgattcctttgctcttacttttgttcttccagtacctttttaag 24775281  T
Q  353 atgtcaaagtttt 365  Q
    || ||||| ||||    
T  24775280 atatcaaattttt 24775268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 2785376 - 2785490
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaaga 353  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  2785376 gagcgctttatcttcaggaacagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaaga 2785475  T
Q  354 tgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| ||||||||    
T  2785476 tgtcaaa-ttttgtct 2785490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 22141034 - 22141136
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||    
T  22141034 cttcaggagcagttttcttcagacactttaagcttccctttttgttgattcctttgctcttaattgttcttccaagactttttcaagatatcaaa-tttt 22141132  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  22141133 gtct 22141136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23538312 - 23538146
Alignment:
Q  4 gtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||  ||||||||||||| ||||  || ||  |||    
T  23538312 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaataaccgt 23538213  T
Q  104 tgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 170  Q
    || |||| | || |||||||||||||||  ||| || ||||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  23538212 tgtttcattcttccagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaaacatttgaacaaactttgaagctt 23538146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 12968316 - 12968485
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||| ||||  ||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||  || ||||    
T  12968316 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatccaatgccttcaaattcttttgaattagt 12968415  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 170  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||  |||| | ||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  12968416 cgttacttcatgcttctagtcttctgcaatg-atagatgtgattaaaacatttaaacaacctttgaagctt 12968485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 11909171 - 11909079
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaa 95  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| || |   |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11909171 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30054288 - 30054100
Alignment:
Q  87 cctttcaaactagtcgttgcttcacttttca-gtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 185  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||  |||| |||| || ||| | |  |||| | ||||||||||| | |  ||||||||    
T  30054288 cctttcaaagtagtcgttgctatacttttcaagtcttctgcaatt-ttaggcgagtttgaattcttgaaacagcttttgaagctttgaat--tgcatctc 30054192  T
Q  186 ctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    || ||||| |  || || |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  30054191 ctgatgaactgaagtttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgtcttcaggagca 30054100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 11868279 - 11868338
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttga 60  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11868279 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttga 11868338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 46349684 - 46349606
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgt 356  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  46349684 ttttcttcatatgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaggatgt 46349606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 49642647 - 49642569
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  49642647 cttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaacct 49642569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16199730 - 16199602
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgatt 315  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||    
T  16199730 gcttcttatgaacttgcttctgatgacgtcatcagttcaggagcacttga-cttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagcttctttcttgttgatt 16199632  T
Q  316 cctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    || ||||||||  |||||| |||| |||||    
T  16199631 ccattgctctcatttgttcctccagaacct 16199602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21605803 - 21605726
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  21605803 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21605726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 277
Target Start/End: Original strand, 40851130 - 40851244
Alignment:
Q  161 tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagca 260  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| ||||| |  ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||    
T  40851130 tttgaagctttaagt--tccatctcctgatgaactgtagcttctggtgatacacaacttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 40851227  T
Q  261 ctttttcttcaggagca 277  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40851228 ctttgtcttcaggagca 40851244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 2028576 - 2028680
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    ||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||||| |||    
T  2028576 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttcttccaagaccaatttaagatgtcaaatttt 2028675  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  2028676 tgtct 2028680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21605514 - 21605408
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc---ttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagt 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   || | ||||||   |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21605514 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagctttcctttttttgttgatgtatttgctctttatttgttcatccaagacctttttaagatgtcaaatt 21605415  T
Q  363 tttgtct 369  Q
    |||||||    
T  21605414 tttgtct 21605408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21636530 - 21636424
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc---ttatagttgattcctttgctctctat-tgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagt 362  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || | ||||||   |||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  21636530 cttcacgagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttttgttgatgtatttgctctttatatgttcttctaagacctttttaagatgtcaaatt 21636431  T
Q  363 tttgtct 369  Q
    |||||||    
T  21636430 tttgtct 21636424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1727945 - 1727858
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| |    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1727945 gcttttgatgaactagcttctgatgacgtcatcactttagaagcactttgtcttcaggagcacttttcttcagacactttaagcttcc 1727858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 49666265 - 49666162
Alignment:
Q  268 ttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  49666265 ttcaagagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtaattgctctttatttgttcttccaagaccattttaagatgtcaaattttt 49666166  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  49666165 gtct 49666162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12726131 - 12726033
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||| |  ||||||| || | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12726131 cttcaggagcaattctctttagatccttcaagcttcctttttattgattctttagatctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaattttt 12726033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11908821 - 11908752
Alignment:
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttt 348  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11908821 tttcttcagatgctttaggcttctctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacctttt 11908752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21636819 - 21636742
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  21636819 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21636742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 49666335 - 49666274
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  49666335 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 49666274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 365
Target Start/End: Original strand, 21606325 - 21606425
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    ||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  21606325 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttattccaagaccattttaagatgtcaaatttt 21606424  T
Q  365 t 365  Q
    |    
T  21606425 t 21606425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38177558 - 38177455
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttc-ttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    |||||||||||| || || |||||| | || |||||||||| | |||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  38177558 tcttcaggagcacttctcattcagatgtttcaagcttcctttttgttgattcatttgctctttttt-ttcttccagaacctttttaagatgtcaaattat 38177460  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  38177459 tgtct 38177455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 45858860 - 45858804
Alignment:
Q  39 gtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaa 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  45858860 gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 45858804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 338
Target Start/End: Original strand, 16032771 - 16032842
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttcc 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  16032771 cttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagcttcatttttgttgattccaatgctctcttttgttcttcc 16032842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Original strand, 37467593 - 37467671
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||    
T  37467593 cttcaggagcacttatcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccattgttctcttttgttctttcagaacct 37467671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8739820 - 8739787
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739820 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 8739787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9092058 - 9092025
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9092058 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 9092025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12752457 - 12752388
Alignment:
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttt 348  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12752457 tttcttcagatgctttaggcttctctttttgttgattcttttgctctcttttgttcttccaagacctttt 12752388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22804019 - 22803899
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgatt 315  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| |   ||||||||   ||||||||||| || |||||| | | || |||||||||| | |||||||    
T  22804019 gcttctgaggaacttgcttttgatgacgtcatcactttaggagcacttaa-cttcaggagcacttctcttcaaatgtttcaagcttcctttttgttgatt 22803921  T
Q  316 cctttgctctctattgttcttc 337  Q
    || ||||||||| |||||||||    
T  22803920 ccattgctctcttttgttcttc 22803899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 51341021 - 51341107
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaa 95  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||        |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51341021 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttc--------gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaattcctttcaaa 51341107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 40851252 - 40851355
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    ||||||| |||| |||||| ||| |||  |||||||||||||| |||    
T  40851252 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttctttcaagaccaatttaagatgtcaaa-ttt 40851350  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  40851351 tgtct 40851355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Original strand, 50300441 - 50300501
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||  ||||||||| |||||||||||    
T  50300441 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgtcttcaggagc 50300501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16658515 - 16658476
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcctt 305  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16658515 tcttcaggagcacttctcttcagacgctttaagcttcctt 16658476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26417548 - 26417489
Alignment:
Q  278 attttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  26417548 attttcttcagatgcttcaagcttccttcttgttgattccattgctctcatttgttcttc 26417489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 236
Target Start/End: Original strand, 512501 - 512539
Alignment:
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttct 236  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  512501 agcttctggtgatcttcagcttatgatgaacttgcttct 512539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9700008 - 9699938
Alignment:
Q  207 tgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||| ||||    
T  9700008 tgatctgcagcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcaacacttcagaagcactttgtcttcagaagca 9699938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 12752741 - 12752683
Alignment:
Q  37 ttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaa 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12752741 ttgtactttgtcaacgctctttgaaggataagtatccaatgccttcaattcctttcaaa 12752683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 345
Target Start/End: Original strand, 13148582 - 13148648
Alignment:
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||| |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13148582 tttcttcagatgctttaggtttctcttcttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 13148648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 2246908 - 2246941
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2246908 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 2246941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13198935 - 13198902
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13198935 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 13198902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 14581672 - 14581705
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14581672 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 14581705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21605583 - 21605522
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  21605583 gcttatgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcctgagcactttgtcttcaggagca 21605522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21636599 - 21636538
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||| |||||    
T  21636599 gcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcacgagca 21636538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23680109 - 23680076
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23680109 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 23680076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24052346 - 24052313
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24052346 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 24052313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 13557781 - 13557809
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacactt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557781 agagtagtggagatagtggttgtacactt 13557809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 46796244 - 46796208
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  46796244 cttcaggagcagttttcttcagacactttaagcttcc 46796208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 51988833 - 51988797
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  51988833 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 51988797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 111)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33691863 - 33691494
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  33691863 agagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaattctttcaaaatagt 33691764  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  33691763 cgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatctcctgatgaactagag 33691664  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  33691663 cttctggtgattttcaacttctaatgaacttgcttctgataacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttctcttcagacgctttaaac 33691564  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33691563 ttcctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 33691494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 44467071 - 44467440
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44467071 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 44467170  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  44467171 cgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttca 44467270  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||  |||||| | | ||||||||||| || |||||||| |||| ||     
T  44467271 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatggcgtcatcacttcaggagcac-tatacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaaa 44467369  T
Q  299 cttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  44467370 cttcctttttgttgattccattgctctattttgttcttccagaacctatttatgatgtcaaatttttgtct 44467440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 30025913 - 30026281
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  30025913 gagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaattcttttcaaaatagcc 30026012  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  30026013 gttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagc 30026112  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||| |||||    
T  30026113 ttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcagaagcacttctcttcagatgcttcaagct 30026212  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30026213 tcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccataacctatttaagatgtcaaatttttgtct 30026281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 379
Target Start/End: Original strand, 15088528 - 15088889
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15088528 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagtc 15088627  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15088628 gttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctcctgatgaattagagc 15088727  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||                 ||||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  15088728 ttctggtgatcttcagcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatca-----------------cttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagct 15088810  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtctgtgctcctcc 379  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  15088811 tcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtaaaatttttgtctatggtcctcc 15088889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 2500046 - 2500415
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  ||| | || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  2500046 gagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtt 2500145  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||    
T  2500146 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgaaaaacaagagc 2500245  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  2500246 ttctggtgatcctcagcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcatgagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 2500345  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2500346 ttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccataacctatttaagatgtcaaatttttgtct 2500415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2913758 - 2913389
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2913758 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 2913659  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||     
T  2913658 gttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatctcctgatgaactacagt 2913559  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  || ||  |||||||||| |||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  2913558 ttctggtgatcttcatcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcattacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcatatgctttaagc 2913459  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  2913458 ttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctactaaagatatcaaatttttgtct 2913389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28622507 - 28622135
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  28622507 agagaagtagaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaattagc 28622408  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |  ||    
T  28622407 cgttgcttcacttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcag 28622310  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcacca------cctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgct 293  Q
    ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||      | ||  ||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  28622309 cttctggtgatttttagcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcaccactttgtcttcaggagcactttgtcttcatgagcagtattcttcatacgct 28622210  T
Q  294 ttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28622209 ttaagcttcatttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 28622135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48237051 - 48236703
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48237051 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaatcctttcaaacttgtcg 48236952  T
Q  103 ttgcttca-cttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  48236951 ttgcttcaccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagct 48236854  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattt-tcttcagacgctttaagct 300  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                 ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  48236853 tctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcacca-----------------cttcaggagtactttgtcttcagacgctttaagct 48236771  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48236770 tcctttttgttgattcctttactctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 48236703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 13880112 - 13880494
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13880112 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 13880211  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  13880212 gttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaattcctgatgaactagagc 13880311  T
Q  201 ttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || |  |||||||||              ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||  |||||||||  |||||| |||| || |||||    
T  13880312 ttctcatgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgacttcagaagcacttctcttc 13880411  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  13880412 agacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttatgtct 13880494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9709953 - 9709602
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9709953 agagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactagg 9709854  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |  ||    
T  9709853 cgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcag 9709756  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| |||||||||||               ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9709755 cttctggtgattttcagcttctg---------------atgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 9709671  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9709670 ttcctttttgttgattcatttgctctctattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 9709602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10883323 - 10882965
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10883323 gagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 10883224  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  10883223 gttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactacagc 10883124  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttct--------------gatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || ||||||||||||||||||              ||||||||||||||| | ||||||  ||| ||  |||||||||  |||||| |||| || |||||    
T  10883123 ttctggtgatcttcagcttctgatgggatgcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcgtcacttcaggagcactttgacttcagtagcacttctcttc 10883024  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10883023 agacgctttaagcttcatttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 10882965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 14426554 - 14426903
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14426554 agagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 14426653  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||| |||| | | |||||||||||||  |||||||||| |||||          
T  14426654 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaa------ 14426745  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
               || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14426746 -----------ctgcaccttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 14426834  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14426835 ttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 14426903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22578172 - 22577792
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22578172 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 22578073  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  22578072 tgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 22577973  T
Q  200 cttttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttca 287  Q
    ||| ||||||||||              ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||| || |||||     
T  22577972 cttctggtgatcttgcctctgatgagatgcttctgatgaccttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcacttctcttct 22577873  T
Q  288 g--acgctttaagcttccttatagttgattcctttgctct-ctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |   | ||| |||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22577872 ggagcacttcaagcttcctttttgttgattcatttgctctccttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaattttt 22577792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30945505 - 30945159
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  30945505 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 30945406  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||            
T  30945405 ttgcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaa-------- 30945316  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt 301  Q
             || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30945315 ---------ctgcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagacgttttaagctt 30945225  T
Q  302 ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| | ||||| || |||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  30945224 cctttttgttgactcatttgctcttttttgttcttcaaagacc-ttttaagatatcaaa-ttttgtct 30945159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 9069570 - 9069805
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9069570 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaatcctttcaaaatagtc 9069669  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9069670 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctgatgaaatagagc 9069769  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttct 236  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9069770 ttctggtgattttcagcttctgatgaacttgtttct 9069805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16543152 - 16542806
Alignment:
Q  20 ttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-ag 118  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16543152 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16543053  T
Q  119 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagct 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||| | |||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| |  ||||| ||||||| ||||| |    
T  16543052 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcattatgt--tgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagtt 16542955  T
Q  219 tctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcct 318  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16542954 tctgatgaactttcttctgatgacgtcaccacttcaagagcactttgtcttcagaagcagttttcttcagacgc-ttaagcttcctttttgttgattcct 16542856  T
Q  319 ttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16542855 ttgctctttattgttcttccaacacctttttaagatgacaaa-ttttgtct 16542806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 16622510 - 16622856
Alignment:
Q  20 ttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-ag 118  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16622510 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16622609  T
Q  119 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagct 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||| | |||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| |  ||||| ||||||| ||||| |    
T  16622610 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcattatgt--tgcatctcctgatgaactgcagcttatggtgattttcagtt 16622707  T
Q  219 tctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcct 318  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16622708 tctgatgaactttcttctgatgacgtcaccacttcaagagcactttgtcttcagaagcagttttcttcagacgc-ttaagcttcctttttgttgattcct 16622806  T
Q  319 ttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16622807 ttgctctttattgttcttccaacacctttttaagatgacaaa-ttttgtct 16622856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13138045 - 13137716
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||     
T  13138045 gagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtt 13137946  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13137945 gttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgaactagagc 13137846  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || |||||||||||||||| ||               | ||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  13137845 ttctggtgatcttcagcttttg---------------aagacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagct 13137761  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||| | |||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  13137760 tcctttttgttgattccttacctctcttttgttcttccagaacct 13137716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30944474 - 30944126
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30944474 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 30944375  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||          
T  30944374 tgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaa------ 30944283  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
               || ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30944282 -----------ctgcagcttctgatgaacgtgcttctgatggcttcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcaaacgctttaagc 30944194  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  30944193 ttcctttttgttgattcatttgctctttattgttcttcaaagacc-ttttaagatatcaaa-ttttgtct 30944126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 28409046 - 28409424
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  28409046 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaataat 28409145  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |  ||    
T  28409146 tgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctcttgatgaactttag 28409245  T
Q  200 cttttggtga-----tcttc--------agcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    ||| ||||||      ||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||    ||||  |||| || |||||    
T  28409246 cttctggtgactgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt----ttcaatagcacttctcttc 28409341  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||| || ||||||| | || ||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28409342 agacgcttcaaacttcctttttgtcgattcatttgctctcttttgttcttacagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 28409424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 11319413 - 11319771
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||  || ||||  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  11319413 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcctttcaaaatagtt 11319512  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||  || | |    
T  11319513 gttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctcttgatgacctacaac 11319612  T
Q  201 ttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || ||||||||||||              ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || |||||    
T  11319613 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttaatgacgtcatcacttcaggagcactttggcttcaggagcacttctcttc 11319712  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11319713 agacgctttaagcttcctttttgttgatttcattgctctcttttgttcttccagaacct 11319771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 13302818 - 13303033
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13302818 gagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 13302917  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  13302918 gttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaactacagc 13303017  T
Q  201 ttttggtgatcttcag 216  Q
    || |||||||||||||    
T  13303018 ttctggtgatcttcag 13303033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23280109 - 23279875
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  23280109 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagc 23280010  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |     
T  23280009 cgttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 23279911  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttc 235  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  23279910 cttctggtgattttcaccttctgacgaacttgcttc 23279875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 21695409 - 21695671
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||| |||  || |||||    
T  21695409 gagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcattttgaaatagtc 21695508  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||    
T  21695509 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagc 21695608  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||    
T  21695609 ttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaagagcactt 21695671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 15467923 - 15468228
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15467923 agagtagtggaggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagt 15468022  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15468023 cgttgattcactcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 15468122  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttc--------------tgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    ||| |||| ||||||||| ||              |||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15468123 cttctggtaatcttcagcatctgatgagatgcatatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttgtcttcaagagcagttttctt 15468222  T
Q  286 cagacg 291  Q
    ||||||    
T  15468223 cagacg 15468228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Original strand, 33605694 - 33606076
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  33605694 agtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtca 33605793  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |  |||    
T  33605794 ttgcttcaattttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagc 33605891  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcac-----------------tttttcttcaggagcaattttc 283  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   ||||||                 ||| ||||||||| || |||||    
T  33605892 ttctggtgattttcagcttctgatgaattcgattctgatgacgtcaccactttaggagcactttgtcttcatgagcgatttgtcttcaggaacagttttc 33605991  T
Q  284 ttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33605992 ttcagatgttttaagcttccttattgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 33606076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 13648737 - 13649089
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  13648737 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaatcctttcaaaatagcc 13648836  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||      ||||    
T  13648837 gttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatctcctgat------gagc 13648930  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    |||           |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| |    
T  13648931 ttt-----------agcttctgttgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgccttaaac 13649019  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  13649020 ttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttctagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 13649089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21283524 - 21283300
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |     
T  21283524 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatgga 21283425  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |     
T  21283424 cgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctgatgaacttcaa 21283325  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  21283324 cttctggtgatctt--gcttctgatga 21283300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 24788148 - 24788372
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |    
T  24788148 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcctttcaaaatatt 24788247  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  24788248 cgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcag 24788347  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  24788348 cttctggtgatctt--gcttctgatga 24788372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 11792920 - 11793140
Alignment:
Q  7 gtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11792920 gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaatgctttcaaaatagtcgttgc 11793019  T
Q  107 ttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttg 205  Q
    |||||| ||   |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||    
T  11793020 ttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 11793119  T
Q  206 gtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  11793120 gtgatctttagcttctgatga 11793140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13730825 - 13730639
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |    
T  13730825 gagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatcttttcaaaatagcc 13730726  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 187  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13730725 gttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagccttgcatctcct 13730639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16112035 - 16111660
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||  |||    
T  16112035 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaatttcttccaaaaaagt 16111936  T
Q  101 cgttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||| || |||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||  || || || |  ||    
T  16111935 cgttgcttcactttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcctctgatcaactgcag 16111838  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcact-----------------ttttcttcaggagcaatttt 282  Q
    ||| ||||||| || | ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||                 || |||||||||||| ||||    
T  16111837 cttctggtgatttttatcttctaataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcacgagcactttgtctttagaagcgccttatcttcaggagcattttt 16111738  T
Q  283 cttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacc-tttttaagatgtcaa 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16111737 cttcagacgctttaagcttcctttttgttgattccttttctctttattgttcttccaagaccttttttaagatgtcaa 16111660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 21692295 - 21692487
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21692295 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaacagtc 21692394  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa 193  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21692395 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaa 21692487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29935507 - 29935170
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29935507 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcg 29935408  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||   | ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  29935407 ttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatctcctgatgaactttagct 29935309  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt 301  Q
    | ||||||||||  |||||||||| |  ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||| ||  ||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||    
T  29935308 tctggtgatctt--gcttctgatg-agatgcttctgatgacatcatcacttcaggagcac-ttgacttca-gaaaacttctcttgagacgatttaagctt 29935214  T
Q  302 ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  29935213 cctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaacct 29935170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16316707 - 16316484
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||      
T  16316707 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaatcctttcaaaatagct 16316608  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  | |    
T  16316607 gttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcccctgatgaacttcaac 16316508  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || ||||||||||  |||||||||||    
T  16316507 ttctggtgatctt--gcttctgatga 16316484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12366895 - 12366518
Alignment:
Q  5 tagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgtt 104  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  12366895 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 12366796  T
Q  105 gcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttt 203  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||     
T  12366795 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 12366696  T
Q  204 tggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacg 291  Q
    |||||| |||              |||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||  |||||||||   |||||||||| || |||| ||| |    
T  12366695 tggtgaccttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtcatcacttcaggagcactttaaattcaggagcacttctctttagatg 12366596  T
Q  292 ctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  12366595 cttcaagcttcctttttgttgattccattgctctctttttttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 12366518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5000972 - 5000788
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5000972 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 5000873  T
Q  102 gttgcttcacttttc--agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 184  Q
    |||||||||||| ||   ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5000872 gttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5000788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19237194 - 19237022
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  19237194 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaagtagc 19237095  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaa 173  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19237094 cgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 19237022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39284714 - 39284470
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||  || |||||    
T  39284714 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattcatttgaattagtc 39284615  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||| |||||| |||  |||||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||  ||||| || ||||  |  |||    
T  39284614 gttgtttcactcttctggtcttcagcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttctgatgatcttcagc 39284516  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 246  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39284515 ttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 39284470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692707
Alignment:
Q  15 agtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttt 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||| |||| |||| |||         ||||| |||| ||||||||||| |    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgtctt---------tcaaaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  115 tc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatctt 213  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |  ||||| ||||||||||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatgagctttagcttctggtgatctt 13692562  T
Q  214 ------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
                  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  13692563 gcttctgaagagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgccttaagct 13692662  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13692663 tcctttttcctgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 13692707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35952839 - 35952599
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35952839 agagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgatgaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 35952740  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaat-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||  || ||||| |  |    
T  35952739 cgttgcttcacttttccagtcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgca 35952642  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
     ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35952641 acttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatga 35952599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 277
Target Start/End: Original strand, 331655 - 331930
Alignment:
Q  4 gtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttc-aaactagtcg 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||  || || |||| |||||||||| |||||||| ||| |||  |    
T  331655 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgct-tttgagcaataagcatccaatgccttcagatcctttcaaaaatagctg 331753  T
Q  103 ttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  || |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |  ||||    
T  331754 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtc-cgcatctcctgatggacttcagct 331852  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaac--ttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |   ||||| ||| ||||||||||||    
T  331853 tctggtgatcttcagcttctgatgaacttttgcttctgatgacgtcatcactttaggagcagtttgtcttcaggagca 331930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13018655 - 13018292
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || | | | |||| ||||||||||| | | || ||| |||||    
T  13018655 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaacttcatttaaaatagtc 13018556  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||| | | | || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||| |  ||||| |  ||    
T  13018555 gttgcttcactctcctagtcttctgcaatac-tgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtct--cgtcttcatatgaacttcag 13018459  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||| ||| ||  |||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13018458 cttctggtgatcttctgcttctgatg-aggtgcttctgaagacgtcatcacttcaggagcac-taaacttcaggagcacttttcttcagacgcttgaagc 13018361  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||| |  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  13018360 ttcatccttgttgattccattgctctct-ttgttcttcccgaacctaataaagatatcaaatttttgtct 13018292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 4821481 - 4821720
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||     
T  4821481 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaat-ctttcaaaatagc 4821579  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||| || |||   || |||| | ||||||||||||||  ||| ||||||  ||||| |  ||    
T  4821580 cgttgctccacttttctagtcttctgtaatctttagacgagtttgaatttgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgtatctccggatgaactgcag 4821677  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgac 242  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4821678 cttctggtgattttcagcttctgacgaacttgcttctgatgac 4821720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12174479 - 12174252
Alignment:
Q  14 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatcttt-gaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcact 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12174479 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 12174380  T
Q  113 ttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaat-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgat 210  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||  |||| | |||||||| |||||  |||||||  || ||||| |  ||||| |||||||    
T  12174379 tttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagc-ttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgat 12174283  T
Q  211 cttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
     || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12174282 ttttagcttctgataaacttgcttctgatga 12174252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494863
Alignment:
Q  121 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                 ||||||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa-----------------cttcagcttc 4494716  T
Q  221 tgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattccttt 320  Q
    |||||    ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||| | | ||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||||| | ||||||| | ||    
T  4494717 tgatg-cgatgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tatacttcaggagcacttctctttagatgcttcaagcttcctttttgttgatttcatt 4494814  T
Q  321 gctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4494815 gctctctttcgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 4494863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13894149 - 13893966
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||| | | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  || |||     
T  13894149 agagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaatccttttgaattagc 13894050  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 184  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13894049 cgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatct 13893966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2265670 - 2265446
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||| |||| |||     
T  2265670 agagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattaaataccttcaaatccttccaaaatagc 2265571  T
Q  101 cgttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||  || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || |     
T  2265570 cgttgctatactttttcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaa 2265473  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2265472 cttctggtgattctcagcttctgatga 2265446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 14193121 - 14193232
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14193121 agagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 14193220  T
Q  101 cgttgcttcact 112  Q
    ||||||||||||    
T  14193221 cgttgcttcact 14193232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 14425454 - 14425813
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||         ||||| |||     
T  14425454 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcatt---------tcaaaatagc 14425544  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||   |||| || |||||||||||||| |||| |||| || ||||| |  |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||    
T  14425545 cgttgccatacttntccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactntag 14425641  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||    || ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  14425642 cttctggtgaaacacancttttgntgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcngtagcagttttcttcagacactttaagc 14425741  T
Q  300 ttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| || | ||||||    ||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  14425742 ttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttcttccaagaccaatttaagatatcaaaattttgtct 14425813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 369
Target Start/End: Original strand, 14193241 - 14193469
Alignment:
Q  160 ctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttc--------------tgatgaacttgcttctaatgacgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||              |||||||||||||||| ||||||||    
T  14193241 ctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttatggtgatcttctgcttctgataagatgcttatgatgaacttgcttctgatgacgtc 14193340  T
Q  246 accacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattc----ctttgctctctattgttcttccaa 340  Q
    | ||| ||  |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||     || ||||||| |||||||||||     
T  14193341 atcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcgcttctcttcagacgcttcaagcttcatttttgttgattctttaattagctctcttttgttcttccag 14193440  T
Q  341 aacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14193441 aacctttttaagatgtcaaatttttgtct 14193469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 8182937 - 8183175
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | |||||||| ||||||||||| || |||| | || |||  |||||||||||| ||||    
T  8182937 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaagtgtctttcaatcctttcaaaatagt 8183036  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| || || |  ||  ||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||| |  ||    
T  8183037 tgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaaacttttatacaactttttaagctttgag--ttgcatctcctgatgaactgcag 8183133  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8183134 cttctggtgattcacagcttttgatgaacttgcttctaatga 8183175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 173
Target Start/End: Original strand, 13880608 - 13880768
Alignment:
Q  14 tagtggttgtac-acttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcact 112  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13880608 tagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcact 13880707  T
Q  113 tttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaa 173  Q
     ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13880708 cttctagtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaa 13880768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35952542 - 35952449
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaa 359  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35952542 tcttcaagagcagttttcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaaggcctttttaagatgtcaa 35952449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12174195 - 12174092
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  12174195 tcttcaggagtagttttcttcagacgttttaagcttcttttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaatttttt 12174096  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  12174095 gtct 12174092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15704612 - 15704475
Alignment:
Q  39 gtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagac 137  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  15704612 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagac 15704513  T
Q  138 gagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagt 175  Q
    ||| || ||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  15704512 gagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt 15704475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16310057 - 16309964
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaa 95  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16310057 gagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 16309964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 19711164 - 19711059
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19711164 agagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagt 19711065  T
Q  101 cgttgc 106  Q
    ||||||    
T  19711064 cgttgc 19711059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41842423 - 41842212
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| || |||||  ||| |||| |||||| | | ||  || |||||    
T  41842423 gagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaacttcatttgaattagtc 41842324  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| | | | |||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||| |  |||    
T  41842323 gttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagc-ttaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 41842225  T
Q  201 ttttggtgatctt 213  Q
    || ||||||||||    
T  41842224 ttctggtgatctt 41842212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13260763 - 13260561
Alignment:
Q  4 gtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||  |||||||| |||| ||||| |||| |       | | |||| ||    
T  13260763 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgctttcata-------agaatagttgt 13260671  T
Q  104 tgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagctt 202  Q
    ||||| |||  || | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||    
T  13260670 tgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatccatt-aacagtctttggagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagctt 13260572  T
Q  203 ttggtgatctt 213  Q
     ||||||||||    
T  13260571 ctggtgatctt 13260561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13472663 - 13472555
Alignment:
Q  69 catctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaa 166  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13472663 catcaaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttatgatcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttaaa 13472564  T
Q  167 gctttaagt 175  Q
    |||||||||    
T  13472563 gctttaagt 13472555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9098384 - 9098286
Alignment:
Q  14 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcact 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  9098384 tagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatctaatgcattcaaatccttttgaattagccgttgcttcact 9098286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7339764 - 7339652
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatg 355  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  7339764 gagcactttttcttcatgaacacttttcttcagacgctttaagcatcctttttttttattcatttgctctttattgttcttccaagacatttttaagatg 7339665  T
Q  356 tcaaagttttgtct 369  Q
     |||| ||||||||    
T  7339664 acaaa-ttttgtct 7339652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13032213 - 13032046
Alignment:
Q  11 agatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  || | | | ||||||||| |||||| | | ||  || |||| |||||||||    
T  13032213 agatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctcttcaaaaagccagcatctaatgtcttcaacttcatttgaaatagttgttgcttca 13032114  T
Q  111 cttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtct 177  Q
    || | |  |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13032113 ctctcctggtcttctgcaatac-taggcgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagtct 13032046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Original strand, 15469797 - 15469857
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15469797 gttgattcctttgctctctattgttcttccataacctttttaagatgtcaaatttttgtct 15469857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2265414 - 2265299
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaaga 353  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  2265414 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtattagctctttatttgttcttccaagacctttttaaga 2265315  T
Q  354 tgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| ||||||||    
T  2265314 tgtcaaatttttgtct 2265299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 369
Target Start/End: Original strand, 27871871 - 27872087
Alignment:
Q  154 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctc 253  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||    
T  27871871 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatttcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttc 27871968  T
Q  254 gagagcacttttt-cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaaccttttta 350  Q
      ||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    ||||||| |||| |||||||||| |||  ||||    
T  27871969 aggagcacttcacacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttcttccaagaccaattta 27872068  T
Q  351 agatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| || || ||||||||    
T  27872069 agatatcgaatttttgtct 27872087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48800522 - 48800409
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatg 355  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||     
T  48800522 gagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaacctaataaagata 48800423  T
Q  356 tcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| ||||||||    
T  48800422 tcaaatttttgtct 48800409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 1293037 - 1293117
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgcctt 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  1293037 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 1293117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 9069857 - 9069963
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatg 355  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||| |||||||||||||||       ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9069857 gagcactttgacttcaggagcagttctctttagacgctttaagctt-------gttgatttcattgctctctattgttcatccagaacctttttaagatg 9069949  T
Q  356 tcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| ||||||||    
T  9069950 tcaaatttttgtct 9069963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 347
Target Start/End: Original strand, 13880828 - 13880958
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||   |||||  | || ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  13880828 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttga-cttcataaccacttttcttcagatgcttcaagcttccttcttgttgatt 13880926  T
Q  316 cctttgctctctattgttcttccaaaaccttt 347  Q
    || ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  13880927 ccattgctctcatttgttcttccagaaccttt 13880958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23279879 - 23279808
Alignment:
Q  298 gcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23279879 gcttcctttttgttgattcttttgctctctattgttcttccagaacctttttatgatgtcaaatttttgtct 23279808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19339401 - 19339135
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||         | ||||||| ||||    
T  19339401 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catttcaaaatagt 19339311  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |  | ||| |  ||||   |||||| |||||||  ||  ||||||| ||||| |  ||    
T  19339310 cgttgccacacttttccagtcttctgcaatctttaggcgagttagagtccttgaaacaggttttgaaactttaag--ttcaatctcctgatgaactgcag 19339213  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||||    
T  19339212 cttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgaggacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagca 19339135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21381409 - 21381287
Alignment:
Q  181 atctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaatt 280  Q
    ||||||| ||||| |  ||||| |||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||   ||||||||  ||| ||||||| ||    
T  21381409 atctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgactttaggagcactt 21381310  T
Q  281 ttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21381309 ttcttcagacgctttaagcttcc 21381287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 27871725 - 27872019
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacg-atctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||  ||||||||||| || |||| ||||         | ||||||| |||    
T  27871725 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataagcatccaatg---------catttcaaaatag 27871815  T
Q  100 tcgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
     ||||||   ||| || ||| ||||||||||   |||  ||  || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||| |  |    
T  27871816 ccgttgccatactattccagacttctgcaatttctaggtgaatttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatttcctgatgaactgca 27871913  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt-tttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaa 297  Q
    |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||  ||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27871914 gcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcacttcacacttcaggagcagttttcttcagacgctttaa 27872013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7339893 - 7339755
Alignment:
Q  132 ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttg 231  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||| |||          |||||||||||||||    
T  7339893 ttagacgagtttaaatccattaaacaatttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctgg----------cttctgatgaacttg 7339806  T
Q  232 cttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaatttt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7339805 cttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcactttt 7339755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48062751 - 48062663
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcacttttt-cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||  ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48062751 gcttctgatgaacttgcttctgatggcgtcatcacttcaggagcacttcacacttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 48062663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16556751 - 16556664
Alignment:
Q  39 gtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactttt-cagtcttctg 125  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16556751 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16556664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Original strand, 16608911 - 16608998
Alignment:
Q  39 gtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactttt-cagtcttctg 125  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16608911 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16608998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13031956 - 13031855
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||    
T  13031956 cttcaggagcacttttcttcagacgcttcaagcttcatccttgttgattccattgctctct-ttgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttg 13031858  T
Q  367 tct 369  Q
    |||    
T  13031857 tct 13031855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Original strand, 13303109 - 13303187
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13303109 cttcaggagcacttctcttcagacgctttaaacttcttttttgttgatttctttgctctcttttgttcttccataacct 13303187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16316446 - 16316344
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||| |||||    
T  16316446 cttcaggagcacttctctttagacgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttctttcagaacctaataaagatatcaaatttttg 16316347  T
Q  367 tct 369  Q
    |||    
T  16316346 tct 16316344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 48062971 - 48062891
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgcctt 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  48062971 agagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 48062891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 365
Target Start/End: Original strand, 4821807 - 4821862
Alignment:
Q  310 ttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  4821807 ttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctatttaagatgtcaaattttt 4821862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 369
Target Start/End: Original strand, 331955 - 332040
Alignment:
Q  283 cttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||    
T  331955 cttcagatgctttaagcttcctttt-gttgtttccttagctctcttttgttcttccagaaccaatataagatgtcaaatttttgtct 332040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 11793195 - 11793297
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  | ||||| ||||| |||||    
T  11793195 cttcaggagcacttcttttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccttcgctctcttttgttcttcctgaacctaataaagatatcaaatttttg 11793294  T
Q  367 tct 369  Q
    |||    
T  11793295 tct 11793297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13730579 - 13730502
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13730579 cttcaggagcacttctcttc-gacgccttaagtttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 13730502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 365
Target Start/End: Original strand, 4821766 - 4821862
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatg 355  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||             |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4821766 gagcgctttgtcttcaggagcagttttcttcagacgcttta-------------ttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctatttaagatg 4821852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 5826254 - 5826357
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  5826254 cttcaggagcagttttcttcatatgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagaccattttaagatgtcaaa-ttt 5826352  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  5826353 tgtct 5826357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Original strand, 1293183 - 1293246
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  1293183 cagcttctgatgaacttgcttctgataacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 1293246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16556619 - 16556581
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcctt 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16556619 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcctt 16556581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 305
Target Start/End: Original strand, 16609043 - 16609081
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcctt 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16609043 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcctt 16609081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 4494584 - 4494628
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtacttt 45  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4494584 agagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaattgtacttt 4494628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 8183234 - 8183338
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||| | || |||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||    
T  8183234 cttcaggagcagttttattcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctatttatttgttcttccaagaccaatttaagatgtcaaatatt 8183333  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  8183334 tgtct 8183338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Original strand, 5826183 - 5826246
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  5826183 cagcttctgatgaacttgcttctgatgacttcattacttcaggagcactttgtcttcaggagca 5826246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9098165 - 9098043
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgatt 315  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||  ||||||||   |||||| | |  ||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||    
T  9098165 gcttctaatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcacttga-cttcagaacctcttttcttcagatgcttcaagcttccatcttgttgatt 9098067  T
Q  316 cctttgctctctattgttcttcca 339  Q
    || ||||||||  |||||||||||    
T  9098066 ccattgctctcatttgttcttcca 9098043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16556665 - 16556619
Alignment:
Q  204 tggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccac 250  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16556665 tggtgattttcagcttcggatgtacttgcttctgatgacgtcaccac 16556619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Original strand, 16608997 - 16609043
Alignment:
Q  204 tggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccac 250  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16608997 tggtgattttcagcttcggatgtacttgcttctgatgacgtcaccac 16609043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32264761 - 32264602
Alignment:
Q  116 cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttca 215  Q
    ||||||||||||||   ||| |||| || ||||| |  || ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |  ||||| |||||||   ||    
T  32264761 cagtcttctgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaataacttttgaagctttaagtc--gcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacaca 32264664  T
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
     ||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||| |||||    
T  32264663 acttttgatgatctttcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcatgagca 32264602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3476114 - 3476081
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3476114 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 3476081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 8934030 - 8934063
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8934030 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 8934063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12733957 - 12733924
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12733957 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 12733924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 13682830 - 13682863
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13682830 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 13682863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 336
Target Start/End: Original strand, 24788381 - 24788450
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttctt 336  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| | | |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  24788381 cttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttccattttgttgattcatttgctctcttttggtctt 24788450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26209339 - 26209306
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26209339 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 26209306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8998706 - 8998670
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8998706 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 8998670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11086832 - 11086796
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11086832 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 11086796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 14745778 - 14745750
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacactt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745778 agagtagtggagatagtggttgtacactt 14745750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19339127 - 19339091
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19339127 cttcaggagcagttttcttcagacgcttgaagcttcc 19339091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32264594 - 32264558
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32264594 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaaacttcc 32264558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48062826 - 48062741
Alignment:
Q  154 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||| |  ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48062826 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcttgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatggacttgcttctgatga 48062741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 73)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Original strand, 33022673 - 33023037
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33022673 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 33022772  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |  |  |    
T  33022773 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttatgt--tgcatctcctgatgaactgcaaat 33022870  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt 301  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  33022871 tctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaaaagcactttgtcttcaggagcagtttttttcagacgttttaagctt 33022970  T
Q  302 ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33022971 cctttttgttgattcctttgctctcgattgttcttccaagacctttttaagatgtc-aagttttgtct 33023037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41566563 - 41566243
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  41566563 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagac 41566464  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  41566463 gttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 41566364  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||  || |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||    
T  41566363 ttctgatgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgacatcacttcaggaacactttgtcttcaggagcagttctcttcagacgttttaacct 41566264  T
Q  301 tccttatagttgattcctttg 321  Q
    || || | |||||||||||||    
T  41566263 tcatttttgttgattcctttg 41566243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 31117884 - 31118249
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31117884 agagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaattagt 31117983  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttt-gaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||| |  |    
T  31117984 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagctttatgt--tgcatctcctgatgaactgca 31118081  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaag 298  Q
    |||| || ||| |||  ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  31118082 gcttctgatgaactt--gcttctagtggacttgcttatgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcatgagtagttttcttcagacgctttaag 31118179  T
Q  299 cttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31118180 cttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 31118249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17814976 - 17815333
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  17814976 gagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcctttcagaatagtc 17815075  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||    
T  17815076 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaaatttagc 17815175  T
Q  201 ttttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttca 287  Q
    || ||||||||||              |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  17815176 ttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctactgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttca 17815275  T
Q  288 gacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    || | ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  17815276 gatgttttaagcttcctttttgttgattcctttactctcttttgttcttccagaacct 17815333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 26784362 - 26784699
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||| || |||| | | | | |||||||||||||| |||||    
T  26784362 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaatcctttcaaaatagtc 26784461  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||||  || | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || |||    
T  26784462 gttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatctcctgctgaactacagc 26784561  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26784562 ttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatgacttcatgagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgctttaagc 26784661  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26784662 ttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttc 26784699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 4887029 - 4887378
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4887029 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagt 4887128  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  |||||| ||||||| ||||||  | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || | ||||| |  ||    
T  4887129 cgttgctatacttttccagtcttttgcaatcttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatatcttgatgaactgcag 4887226  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  4887227 cttctggtgattctcagcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttatctttaggaacagttttcttcagacgctttaagc 4887326  T
Q  300 tt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaaccttttta 350  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4887327 ttccctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccaagatcttttta 4887378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 21910564 - 21910884
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  21910564 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaataatc 21910663  T
Q  102 gttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||           
T  21910664 gttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgaa------- 21910756  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
              ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21910757 ----------ctttagcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgctttaagc 21910846  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21910847 ttcctttttgttgattcatttgctctcttttgttcttc 21910884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23413103 - 23412754
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||    
T  23413103 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaataatc 23413004  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  23413003 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 23412904  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||                 ||||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  23412903 ttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca-----------------cttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagct 23412823  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  23412822 tcctttttgttgattccattgctctcttttgctcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 23412754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6512557 - 6512317
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6512557 gagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcc---aatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 6512461  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  6512460 gttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 6512361  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 246  Q
    || | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6512360 ttctagtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 6512317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21072369 - 21072004
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  21072369 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtt 21072270  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  21072269 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtga-gtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 21072171  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||   | |||| ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  21072170 ttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgacctcatcacttcaggagcactaaat-ttcatgagcacttctcttcagacgcttcaagct 21072073  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||| || |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  21072072 tcctttttgttgattccttagctcttttttgttctttcagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 21072004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 20550902 - 20551261
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20550902 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagt 20551000  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  20551001 cgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttca 20551100  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaag 298  Q
    |||| || |||  |   |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||                 ||||||||||| || |||||||| |||| |||    
T  20551101 gcttctgatgagat---gcttctaatgagcttgcttctgatgacgtcatca-----------------cttcaggagcacttctcttcagatgcttcaag 20551180  T
Q  299 cttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtctgtgctcctc 378  Q
    ||||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  20551181 cttccttttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttgtctatggtcctc 20551261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14086669 - 14086301
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatcttt-gaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||  |||||| |||    
T  14086669 agagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcattcaaatcacttcaaaatag 14086570  T
Q  100 tcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcc-attgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatag 197  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||| | |||||||| ||||||  ||||||  || ||||| |      
T  14086569 ccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaagt--tgcatcctctgatgaactgc 14086472  T
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaa 297  Q
    ||||| |||| || || ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14086471 agcttctggtaatttttagcttttgataaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcatacgctttaa 14086372  T
Q  298 gcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14086371 gcttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttcgaaggcctttttaagatatcaaa-ttttgtct 14086301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13545642 - 13545444
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13545642 agagtagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaagtagt 13545543  T
Q  101 cgttgcttcacttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
     |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13545542 tgttgcttcact-------cttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 13545450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7745822 - 7745636
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  7745822 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 7745723  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 187  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7745722 gttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatctcct 7745636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 89551 - 89200
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||  |||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  89551 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaattctttcaaaatagtc 89452  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||           
T  89451 gttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatctcctgatgaa------- 89359  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
              || || |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||||||  |||||| |||| || ||||||||| ||| |||||    
T  89358 ----------ctacaacttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagtagcactttgacttcagaagcacttctcttcagacacttcaagct 89269  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  89268 tcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 89200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 360
Target Start/End: Original strand, 5429991 - 5430249
Alignment:
Q  102 gttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcc-attgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||  |||| | |||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |  ||    
T  5429991 gttgcttcactttttcagtcttctgcaatccttaaacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaagt--tgcatctcctgatgaactgcag 5430088  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5430089 cttctggtgatttttaccttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcagaagcactttgtcttcaggagcacttttcttcggacgctttaagc 5430188  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaa 360  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5430189 ttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa 5430249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19536429 - 19536237
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  19536429 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatccattcaaaaaagtcg 19536330  T
Q  103 ttgcttcact--tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa 193  Q
    ||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19536329 ttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 19536237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 11993895 - 11994134
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| |||     
T  11993895 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaatcccttcaaattagc 11993994  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  11993995 cgttgcttcactattccagtcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttgaacatcttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaactacag 11994092  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11994093 cttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatga 11994134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 15516976 - 15517362
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||  ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  15516976 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagc 15517075  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||| || |     
T  15517076 cgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagctttaagt--tgcatcttctgatgaactacaa 15517173  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttctt-----------------caggagcaatttt 282  Q
    ||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||  ||||||||| ||||                 |||||||| ||||    
T  15517174 cttctggtgattctcaacttctgataaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttatcttcaggagcgctttatcttcaggagcagtttt 15517273  T
Q  283 cttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15517274 cttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttctttcaagacctttttaagatgtcaaatttttgtct 15517362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29138536 - 29138163
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  29138536 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaatccttccaaaatagt 29138437  T
Q  101 cgttgcttcacttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
     ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||  || |||| | |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| || | |    
T  29138436 tgttgctatactttccagtcttctgcaat-cttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaactacaac 29138340  T
Q  201 ttttggtgatcttca---------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    || |||||||  |||               ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |  ||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  29138339 ttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactacaggagcactttgtcttcaggaacagttttctt 29138240  T
Q  286 cagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaa 360  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||   |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29138239 cagacgctttaagcttccatttttgttgatgtatttgctctttacttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa 29138163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 30742987 - 30743178
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  30742987 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaataat 30743086  T
Q  101 cgttgc-ttcacttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa 193  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  30743087 cgttgctttgcctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaa 30743178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 42243687 - 42243928
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaag-aacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  42243687 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacatcaaatgtcttcaaatcctttcaaaatag 42243786  T
Q  100 tcgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  42243787 ttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactaca 42243884  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgac 242  Q
    |||| |||||||  |||| || |||| || |||||||| |||||    
T  42243885 gcttctggtgattctcagtttttgataaatttgcttctgatgac 42243928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3245571 - 3245328
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||  ||| |||||||| |||     
T  3245571 agagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcctttcaattctttcaaaatagc 3245472  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  ||||   || |||||||||||  ||||||||||| ||||| |  ||    
T  3245471 cgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcag 3245375  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 246  Q
    ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245374 cttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 3245328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 26759156 - 26759395
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   |||| | ||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26759156 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagt 26759255  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||| |||  || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |     
T  26759256 cgttgttatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaa 26759353  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  26759354 cttctggtgattctcagcttctgataaatttgcttctgatga 26759395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 642837 - 642479
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||| ||||||||||| |   ||  || |||     
T  642837 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaactttatttgaattagc 642738  T
Q  101 cgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |||||| | | | ||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |  |     
T  642737 cgttgtttcactctcctgatcttctgtaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaactgcaa 642639  T
Q  200 cttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
     || ||||||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||| ||  |||||||| || |||||||    
T  642638 tttctggtgatcttcagcatctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac-ttgacttcaggatcacttttctt 642540  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||| |||||||||| | || |||||| | |||||| | |||||||| ||||||||    
T  642539 cagacgcttcaagcttcctttttgtcgattccatagctctcaatttgttctttcaaaacct 642479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30115852 - 30115639
Alignment:
Q  154 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctc 253  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  30115852 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttc 30115755  T
Q  254 gagagcactt-tttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaaccttttta 350  Q
      ||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| |||||    
T  30115754 aggagcacttcaaacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaataccatttta 30115655  T
Q  351 agatgtcaaagttttg 366  Q
    |||||||||| |||||    
T  30115654 agatgtcaaatttttg 30115639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25096956 - 25096777
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgt---caacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaact 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||  || |    
T  25096956 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaatt 25096857  T
Q  98 agtcgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 177  Q
    | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25096856 aatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-aggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25096777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25154926 - 25154747
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgt---caacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaact 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||  || |    
T  25154926 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaatt 25154827  T
Q  98 agtcgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 177  Q
    | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25154826 aatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-aggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25154747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 226
Target Start/End: Original strand, 23881076 - 23881299
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  || | ||| |||| ||||||||||| | | ||  || ||||||    
T  23881076 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcg 23881175  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||| | |  |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||| || ||||| |  |||    
T  23881176 ttgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagcttt-agtctctcatcttctgatgaacttcagc 23881273  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || ||||| |||||||||||||||||    
T  23881274 ttctggtgttcttcagcttctgatga 23881299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 33933274 - 33933517
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatcttt-gaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| | |||||| ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  33933274 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgtttaaatcctttcaaaatag 33933373  T
Q  100 tcgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaat-ccattgaacaac--ctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaat 195  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||  || ||||| |    
T  33933374 ttgttgcttcacttttccagtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaacttttttgaagctttaag--ttgcatcctctgatgaact 33933471  T
Q  196 agagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
      | ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33933472 gcaacttatggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatga 33933517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 354
Target Start/End: Original strand, 33933582 - 33933678
Alignment:
Q  259 cactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33933582 cactttttcttcaggagcagttttcttcagacgatttaagcttctctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccaagacctttttaagat 33933678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 217 - 369
Target Start/End: Original strand, 28139809 - 28139963
Alignment:
Q  217 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgatt 315  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||     
T  28139809 cttctgatgaacttggttctgatgacgtcatcacttcaggagcagtttatcttcaggagcagttttcttcagatgctttaagcttcccttgttgttgatg 28139908  T
Q  316 cctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
      |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28139909 tatttgctctttatttgttcttccaatacctttttaagatgtcaaatttttgtct 28139963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28464469 - 28464204
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||         ||||| |||     
T  28464469 agagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt---------tcaaaatagc 28464379  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |  ||||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||| | |||||||||||||||  || ||||||| ||||| |  ||    
T  28464378 cgttgttatacttttttagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgtatctcctgatgaactgcag 28464282  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  28464281 cttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 28464204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9398863 - 9398559
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |  || |||  ||||||||||| | | ||  || |||||    
T  9398863 gagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagtaagcattcaatgccttcaacttcatttgaattagtc 9398764  T
Q  102 gttgcttcacttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||| ||||       || |||  || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |  | ||    
T  9398763 gttgctccact-------ctcctg--at-cttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaacctttaagtctctcatcttctgatgaacttcaact 9398674  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt 301  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||| ||  |||||| ||  |||||| |||| || |||||| | |||| ||||||    
T  9398673 tctggtgatcttgagcttctgatgaacttgatgttgatgacgtcatcacttcaggagcac-ttgacttcagcagcacttctcttcaaatgcttcaagctt 9398575  T
Q  302 ccttatagttgattcc 317  Q
    |||| | |||||||||    
T  9398574 cctttttgttgattcc 9398559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21199132 - 21198891
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |   |||||| | |||| ||||||||||||| | ||  || ||| |    
T  21199132 gagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaattcatttgaattagcc 21199033  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||| | | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |  |||    
T  21199032 gttgc-tcatttttctggtcttctgcagtac-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 21198935  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 246  Q
    |  ||||||| ||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  21198934 tcctggtgatatt--gcttctgatgagtttgcttctgatgacgtca 21198891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 6499247 - 6499470
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || | ||| ||||  |||||||||| | | ||  || |||      
T  6499247 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccgatgccttcaacttcatttgaaatagat 6499346  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| | |  |||||||||||| | | |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |  ||||| |  ||    
T  6499347 gttgcttcactctcctggtcttctgcaatac-tgggtgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtct--catcttcatatgaacttcag 6499443  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6499444 cttctggtgatcttctgcttctgatga 6499470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21099833 - 21099476
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||   ||| |||| ||||||||||  | | ||  || ||||     
T  21099833 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatccaatgccttcagcttcatttgaattagtt 21099734  T
Q  102 gttgcttcacttt-tcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| | |  ||||| || |||||| || |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| |  |||    
T  21099733 gttgcttcactctcttggtcttttgtaatgct-aggcatgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatcttctgatgaactttagc 21099635  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga--------------acttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || ||||||| |||||||||||||||              |||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||   ||||| ||||| ||||||||    
T  21099634 ttctggtgattttcagcttctgatgaggtgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttga-cttcatgagcacttttcttc 21099536  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||| |||| ||||| | ||||||||| | |||||  | |||||||||||||||||    
T  21099535 agacgcttcaagcctcctttttgttgattccatggctcttaatttgttcttccaaaacct 21099476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 360
Target Start/End: Original strand, 11994202 - 11994296
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaa 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11994202 cttcaggagcagttttcttcagatgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctcttaattgttcttccaagacctttttaagatatcaaa 11994296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 42243974 - 42244087
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  42243974 gagcgctttatcttcaggagctgttttcttcatacgctttaagcttccctttttgttgatttctttgctctttattgttcttccaatacctttttaagat 42244073  T
Q  355 gtcaaagttttgtct 369  Q
     ||||| ||||||||    
T  42244074 atcaaa-ttttgtct 42244087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 26765505 - 26765634
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||| | ||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26765505 agagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagt 26765604  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaat 129  Q
     ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  26765605 tgttgctatacttttccagtcttctgcaat 26765634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 9089199 - 9089303
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  9089199 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatttt 9089298  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  9089299 tgtct 9089303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 28139614 - 28139738
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||| ||| ||||||| || |||| |||| |||  |||||||||||| ||||    
T  28139614 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctatgaagaataagcatccaatgtctttcaatcctttcaaaatagt 28139713  T
Q  101 cgttgcttcac-ttttcagtcttct 124  Q
    |||||||  || |||||||||||||    
T  28139714 cgttgctatactttttcagtcttct 28139738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30115967 - 30115863
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  30115967 agagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcccttcaatcctttcaaaatagt 30115868  T
Q  101 cgttg 105  Q
    |||||    
T  30115867 cgttg 30115863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 354
Target Start/End: Original strand, 26759457 - 26759556
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  26759457 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagat 26759556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7745508 - 7745410
Alignment:
Q  271 aggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||||| | |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7745508 aggagcacttctcttcagacgcttcaagcttcctttttgttgatccatttgctctcttttgttctttcagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 7745410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 10848780 - 10849046
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||||         ||||||||| |||     
T  10848780 agagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatctaatg---------cctttcaaaatagc 10848870  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     | |||   |||||| |||| |||||||||  |||| |||| || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |  ||    
T  10848871 tgatgccatacttttccagttttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcatgatgaactgcag 10848968  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| |||||||   |||||| |||||||||||||| | |||| |||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  10848969 cttctggtgatacacagcttatgatgaacttgcttttgatgatgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 10849046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 30743288 - 30743402
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30743288 gagcgctttatcttcaggagtagttttcttcagacgctttaagctttcctttttgctgagttctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagat 30743387  T
Q  355 gtcaaagttttgtct 369  Q
    | |||  ||||||||    
T  30743388 gacaattttttgtct 30743402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12352924 - 12352763
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||   ||| |||| |||||||| || | | ||  || ||| |    
T  12352924 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagcc 12352825  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctt 162  Q
     |||||||||  | | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||    
T  12352824 attgcttcaccctcctgatcttctgcaatgcttagacaagatcaaatccaatgaacagcctt 12352763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 32160773 - 32161013
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   || ||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  32160773 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagc 32160872  T
Q  101 cgttgcttc-acttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaac-ctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
     |||||| | |   |||||||||  ||  |  ||||||||| || |||||||| ||||||  |||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || |    
T  32160873 tgttgctactatacttcagtctttcgctttctttagacgagtttgaatccattaaacaactatttgaaactttagg--ttgcatcttctgatgaactaca 32160970  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    | || ||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||||    
T  32160971 gtttctggtgatatacagcttctgatagacttgcttctgatga 32161013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3245289 - 3245188
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  3245289 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagaccattttaagatgtcaaatttt 3245190  T
Q  365 tg 366  Q
    ||    
T  3245189 tg 3245188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 9088976 - 9089057
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttc 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  9088976 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc 9089057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25930286 - 25930087
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| |||||||| || || |||| |||||||||          ||| |||     
T  25930286 agagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgccttc---------taaattagc 25930196  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |  |||||| ||||||| ||||||  ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |  ||    
T  25930195 cgttgttatacttttccagtcttatgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaattgcag 25930098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 348
Target Start/End: Original strand, 23478673 - 23478743
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttt 348  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23478673 ttttcttcagatgctttaggcttctctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacctttt 23478743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11208115 - 11208011
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||    | |||| ||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  11208115 agagtagtggaggtagtggttatacacttcgtac-atagtactttgtcaacgctctttgaaggctgagcatccaatgcattcaaatctcttcaaaatagt 11208017  T
Q  101 cgttgc 106  Q
    ||||||    
T  11208016 cgttgc 11208011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19536202 - 19536093
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgatt 315  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| | |||||||| | || |||| ||| |||| |||||| ||| | |||||||    
T  19536202 gcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtgttcaggagaacttctctttagatgcttcaagctttctttttgttgatt 19536103  T
Q  316 cctttgctct 325  Q
    |||| |||||    
T  19536102 ccttagctct 19536093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 365
Target Start/End: Original strand, 10849054 - 10849154
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    ||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||||| |||    
T  10849054 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttcttccaagaccaatttaagatgtcaaatttt 10849153  T
Q  365 t 365  Q
    |    
T  10849154 t 10849154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Original strand, 23881353 - 23881453
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||  | ||||| ||||| |||||    
T  23881353 cttcaagagcacttttcttcagacgcttcaagcttcattcttgttgattccattgctatcttttgttcttctagaacctaataaagatatcaaatttttg 23881452  T
Q  367 t 367  Q
    |    
T  23881453 t 23881453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6512313 - 6512243
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  6512313 cttcaggaacatttctcttcagacgccttaagcttcctttttgttgattcatttgctatcttttgttcttc 6512243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 35932136 - 35932059
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||||| || |||| |||||    
T  35932136 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25930027 - 25929924
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||   |||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||    
T  25930027 cttcaagagcagttttcttcagacgctttaaccttccatttttgttgatgtatttgctctttacttgttctttcaaga-ctttttaagatgtcaaatttt 25929929  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  25929928 tgtct 25929924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 21660219 - 21660278
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttga 60  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||    
T  21660219 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgatctttga 21660278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12352684 - 12352611
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttcca 339  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  12352684 cttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccatagctctcaatttgttcttcca 12352611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 13534258 - 13534291
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13534258 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 13534291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23391530 - 23391469
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||||    
T  23391530 gcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagca 23391469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 32754395 - 32754428
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32754395 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 32754428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35986077 - 35986044
Alignment:
Q  270 caggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35986077 caggagcagttttcttcagacgctttaagcttcc 35986044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Original strand, 1915742 - 1915778
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1915742 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 1915778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 16607519 - 16607547
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacactt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16607519 agagtagtggagatagtggttgtacactt 16607547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20416732 - 20416700
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacc 344  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20416732 gatttctttgctctctattgttcttccaaaacc 20416700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25096709 - 25096661
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcacttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  25096709 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 25096661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25154679 - 25154631
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcacttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  25154679 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 25154631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 37406797 - 37406769
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacactt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37406797 agagtagtggagatagtggttgtacactt 37406769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Original strand, 40229001 - 40229037
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40229001 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 40229037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 102)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23185374 - 23185008
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23185374 agagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagt 23185275  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |  ||    
T  23185274 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttatgt--tgcatctcctgatgaactgcag 23185177  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23185176 cttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacatcactacttcaggagcactttgtcttcaagagcaaatttcttcagacgctttaagc 23185077  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23185076 ttcctttttgttagttcatttgctctctattgttcttccaaaatctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 23185008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17441954 - 17441588
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17441954 gagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgc-ttcaaatcctttcaaaatagtc 17441856  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17441855 gttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 17441756  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || |||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17441755 ttctggtgatcttcagcttctgat-tagatgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacgctttaagct 17441657  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17441656 tccttttcgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 17441588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 19156200 - 19156536
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19156200 gagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtc 19156299  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || | |    
T  19156300 gttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatctcttgatgaactacaac 19156399  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19156400 ttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacgctttaagct 19156499  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19156500 tcctttttgttgatccctttgctctcttttgttcttc 19156536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 21932887 - 21933287
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  21932887 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaatcctttcaaaatagcc 21932986  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21932987 gttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagc 21933086  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaat---------------gacgtcacca-----------------cctcgagagcactttttct 268  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||               ||||||||||                 | || ||||||||||  ||    
T  21933087 ttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgataaacttccttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaagagcactttgact 21933186  T
Q  269 tcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtc 368  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21933187 tcaggagcagttctcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgtc 21933286  T
Q  369 t 369  Q
    |    
T  21933287 t 21933287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18121236 - 18120889
Alignment:
Q  22 gtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtc 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||    
T  18121236 gtacacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtc 18121137  T
Q  121 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  18121136 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttc 18121037  T
Q  221 tgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattccttt 320  Q
    ||||| |  ||||||| ||| ||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  18121036 tgatg-agatgcttctgatggcgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttctcttcaaacgctttaagcttcctttttgttgattcattt 18120938  T
Q  321 gctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||    
T  18120937 gctctcttttgttcttccagaacctattgatgatctcaaatttttgtct 18120889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12757910 - 12757665
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  12757910 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 12757811  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12757810 gttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 12757711  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 246  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12757710 tactggtgatcttcagcttctgatcaacttgcttctgatgacgtca 12757665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 602867 - 602500
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  602867 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 602768  T
Q  102 gttgcttcacttttca-gtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |  |||    
T  602767 attgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatttcctgatgaactttagc 602668  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || | |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||| |   |||||| | |  || |||| |||||||| || ||    
T  602667 ttcttgtgatctttagcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tagacttcagcaacgcttctctttagacgcttcaaact 602569  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  602568 tcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 602500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17914463 - 17914821
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17914463 gagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 17914562  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  || | |    
T  17914563 gttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaactcctaatgagctacaac 17914662  T
Q  201 ttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || | ||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||  ||| ||||||| || |||||    
T  17914663 ttctagtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcattacttcaagagcactttgactttaggagcacttctcttc 17914762  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  17914763 agatgcttcaagcttcctttctgttgattcctttgctctcttttattcttccagaacct 17914821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 16207309 - 16207535
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16207309 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 16207408  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16207409 agttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 16207508  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  16207509 cttctggtgatctttagcttctaatga 16207535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16681442 - 16681095
Alignment:
Q  10 gagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttc 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16681442 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttc 16681343  T
Q  110 act-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtg 208  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| | |||    
T  16681342 actcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctagtg 16681243  T
Q  209 atctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgcttt 295  Q
    |||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16681242 atcttgcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgcttt 16681143  T
Q  296 aagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||| || | |||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  16681142 aagcttcatttttgttgattcatttgctatc--ttgttcttccagaacct 16681095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 345
Target Start/End: Original strand, 33082873 - 33083219
Alignment:
Q  14 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  33082873 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 33082972  T
Q  114 ttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatct 212  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||    
T  33082973 ttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatct 33083072  T
Q  213 t------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    |              ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  33083073 tgcttctgatgagttgcttcagatgaacttgtttctaatgacgtcatcacttcaagagcacttttgacttcaagagcacttctcttcagacgctttaagc 33083172  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacct 345  Q
    ||| || | ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||    
T  33083173 ttcttttttgttgattccatagctctcaattcgttcttccaaaacct 33083219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 39693539 - 39693921
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  39693539 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 39693638  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |    
T  39693639 attgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctacaac 39693738  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttc--------------tgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || |||||||||||||||||              ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  | |||||||  |||||| |||| || |||||    
T  39693739 ttctggtgatcttcagcttctgatgacatgcttttgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggtgcactttgacttcagaagcacttctcttc 39693838  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
     || |||||||||||| || | |||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  39693839 ggatgctttaagcttcttttttgttgattcatttgctctctttcgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 39693921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45538587 - 45538220
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45538587 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagt 45538488  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||| | | ||||| |  ||    
T  45538487 tgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcag 45538390  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| ||  |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45538389 cttctggtgatttttggcttatgataaactcgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 45538290  T
Q  300 tt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    || |||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45538289 ttccctttttgttgatttctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagttgtcaaa-ttttgtct 45538220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 17797425 - 17797808
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  17797425 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaattcctttcaaactagc 17797524  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||  |  ||    
T  17797525 cgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgagctgcag 17797622  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaac---------------ttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttct 284  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||               |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  17797623 cttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgaatttgcttctgatgacgtcaccatttcaggagcactttgtcttcaggagcagtttt-t 17797721  T
Q  285 tcagacgctttaagcttcc---ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17797722 tcagatgctttaagcttccttttttttgttgattcctttgctatttattattcttccaagatctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 17797808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 29693319 - 29693671
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  29693319 gagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaatcctttcaaaatagtg 29693418  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  29693419 gttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatctcctaatgaactacaac 29693518  T
Q  201 ttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt--tcttcaggagcaattttct 284  Q
    || ||||||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||| ||||| || |||    
T  29693519 ttatggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttttgtcttcaagagcacttctct 29693618  T
Q  285 tcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29693619 tcagatgctttaagcttcctttttgttgattcctctgctctcttttgttcttc 29693671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 365
Target Start/End: Original strand, 24646342 - 24646719
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| |||      
T  24646342 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaatcctttcaaaatagct 24646441  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  24646442 gttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatctcttgatgaactagagc 24646541  T
Q  201 ttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || ||||||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||| | | ||||||||||| || |||      
T  24646542 ttctggtgatcttcagcttctgataagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac-tatacttcaggagcacttctctct 24646640  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24646641 agatgcttcaagcttcctttttgttgattccattggtatcttttgttcttccaaaacctatttaagatgtcaaattttt 24646719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 18679819 - 18680140
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  18679819 gagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctatcaaaatagtc 18679918  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||| |||  ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||    
T  18679919 gttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatcttctgatgaaatgaagc 18680018  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  |||||||||| | | |||||||| |||| |||||    
T  18680019 ttctagtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagc-actctcttcagatgcttaaagct 18680115  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctct 325  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||    
T  18680116 tcctttttgttgattccttagctct 18680140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 16188988 - 16189180
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16188988 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtc 16189087  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa 193  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16189088 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaa 16189180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20382538 - 20382161
Alignment:
Q  5 tagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| | | | |||||||||||||| | ||| ||||    
T  20382538 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaatcctttcagaatagccgtt 20382439  T
Q  105 gcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttt 203  Q
    ||||||||  || |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||     
T  20382438 gcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctcctgatgaacttcagcttc 20382339  T
Q  204 tggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacg 291  Q
    ||||||||||              ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  20382338 tggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacg 20382239  T
Q  292 ctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||| || |||||| |||||||| || |||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  20382238 cttcaagcttcctttttgttgattccattactctcttttgttctttcagaacctaataaagatgtcaaatttttgtct 20382161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 19943238 - 19943466
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaa-gaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  19943238 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatag 19943337  T
Q  100 tcgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatag 197  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |      
T  19943338 ttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttc 19943437  T
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  19943438 agcttctagtgatctttagcttctgatga 19943466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15336236 - 15335996
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15336236 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 15336137  T
Q  101 cgttgcttcacttt-tcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  15336136 cgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacag 15336039  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgac 242  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15336038 cttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgac 15335996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15425301 - 15425061
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15425301 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 15425202  T
Q  101 cgttgcttcacttt-tcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  15425201 cgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacag 15425104  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgac 242  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15425103 cttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgac 15425061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15516605 - 15516365
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15516605 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 15516506  T
Q  101 cgttgcttcacttt-tcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  15516505 cgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacag 15516408  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgac 242  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15516407 cttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgac 15516365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18321306 - 18321045
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||      
T  18321306 gagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcctttgaaaatagct 18321207  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  18321206 gttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 18321107  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt 263  Q
    || |||||||||||  ||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  18321106 ttctggtgatcttctacttctgatg-agatgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 18321045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30421577 - 30421352
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaa--gaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaacta 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30421577 agagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccattcaaacta 30421479  T
Q  99 gtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatag 197  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||||| |      
T  30421478 gtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaactgc 30421381  T
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  30421380 agcttctggtgattttgagcttctgatga 30421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23263757 - 23263440
Alignment:
Q  4 gtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgt 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23263757 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcat 23263658  T
Q  104 tgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagct-ttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    || |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  23263657 tgtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagct 23263558  T
Q  202 tttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcaga 289  Q
    | || |||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23263557 tctgatgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcgcttttacttcaggagcacttctcttcaga 23263458  T
Q  290 --cgctttaagcttcctt 305  Q
      | ||||||||||||||    
T  23263457 agcactttaagcttcctt 23263440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 17267478 - 17267833
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||      
T  17267478 gagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcctttcaaaatagct 17267577  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||||  | | ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||    
T  17267578 gttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagc 17267676  T
Q  201 ttttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcag 288  Q
    || ||||||||||              |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||  |||||||  || || |||||||    
T  17267677 ttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctaataacgtcatcacttcagaagcactttgacttcaggcacacttctcttcag 17267776  T
Q  289 acgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17267777 atgcttcaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 17267833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17525876 - 17525652
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  17525876 gagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtt 17525777  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  17525776 gttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcctgatgaactacag 17525677  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
     || ||||||||||  |||||||||||    
T  17525676 tttctggtgatctt--gcttctgatga 17525652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20255654 - 20255357
Alignment:
Q  60 aagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaa 158  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20255654 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccattgaacag 20255555  T
Q  159 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcag--------------cttctgatgaacttgcttctaatgacgt 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   || ||||  |  | ||| |||||||||||||              |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  20255554 cctttgacgctttaagtcttgcat---ctaatgagctttatcttctggtgatcttcagcttctgatgagatacttctgatgaacttccttatgatgacgt 20255458  T
Q  245 caccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacc 344  Q
    || ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20255457 catcacttcaggagcactttgacttcaggagcagttctcttcagacgctttaaacttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttgttccagaacc 20255358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 24551279 - 24551516
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24551279 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcg 24551378  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||| | | ||||| |  ||||    
T  24551379 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagct 24551476  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    | ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24551477 tctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctaatga 24551516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 116 - 369
Target Start/End: Original strand, 22745606 - 22745856
Alignment:
Q  116 cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttca 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22745606 cagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttca 22745705  T
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt--tttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttga 313  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||    ||   ||   ||  || |  |  ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  22745706 gcttctgatg-agatgcttctgatga----acttgcttctgacgacgtcatcacttcatgagcacttctcttcagacactttaagcttcctttttgttga 22745800  T
Q  314 ttcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22745801 ttcctttgctcttttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 22745856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 17701749 - 17701971
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||  | |||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  17701749 gagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 17701848  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |  |||    
T  17701849 gttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 17701948  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctga 223  Q
    || |||||||| || ||||||||    
T  17701949 ttctggtgatcatctgcttctga 17701971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24833205 - 24832820
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatcttt-gaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| |||    
T  24833205 agagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaaagtag 24833106  T
Q  100 tcgttgcttcacttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaat-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||  || ||||| |  |    
T  24833105 ccattgcttcacttttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgca 24833008  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcac-----------------tttttcttcaggagcaattt 281  Q
    |||| ||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||                 ||| |||||||||||| |||    
T  24833007 gcttctggtgatttttagcttctaataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaagagcgttttatcttcaggagcagttt 24832908  T
Q  282 tcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24832907 tcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatttctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatatcaaa-ttttgtct 24832820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40845535 - 40845296
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  40845535 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttccaatccttccaaaatagt 40845436  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||| || ||    
T  40845435 cgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcc-ttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatctcctgatgaactatag 40845339  T
Q  200 cttttggtga-tcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgac 242  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40845338 cttctggtgagtctt-agcttctgataaacttgcttctgatgac 40845296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 1237640 - 1237879
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1237640 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 1237739  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| | |||||||| |||||  ||||||| | | ||||| |  ||    
T  1237740 cgttgcttcacttttccggtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaattgcag 1237837  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| |||| || ||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1237838 cttctggtaatttttggcttctgataaacttgcttctgatga 1237879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 18719005 - 18719228
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  18719005 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctatcaaaatagtc 18719104  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||||  ||  ||||| ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | ||| |  |||    
T  18719105 gttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatcttctgaagaacttaagc 18719204  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || ||||||||||  |||||||||||    
T  18719205 ttctggtgatctt--gcttctgatga 18719228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 36105198 - 36105437
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  36105198 agagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatccttccaaaatagc 36105297  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |  |||||| || |||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  36105298 cgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactatag 36105395  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36105396 cttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatga 36105437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 22673783 - 22674020
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||| ||||||| |||| |||  |    
T  22673783 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatccttccaaaatagatg 22673882  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||    ||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||| || | ||    
T  22673883 ttgctatacttttctagtcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctccggatgaactacaact 22673980  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22673981 tctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 22674020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 9320571 - 9320812
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatc-tttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||     
T  9320571 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaataa 9320670  T
Q  100 tcgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcc-attgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatag 197  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||  || ||||| |      
T  9320671 ttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgc 9320768  T
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9320769 agcttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatga 9320812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 22663119 - 22663358
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||| |||| || |||| ||||    
T  22663119 agagtagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatctttccaaaatagt 22663218  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||  | |||| ||||||||||||||  | ||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |     
T  22663219 tgttgctatatttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctaatgaactacaa 22663316  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22663317 cttctagtgatcttcagcttctaataaacttgcttctgatga 22663358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18722794 - 18722610
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||  || || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18722794 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagt 18722695  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttc-tgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 184  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||| |||||    
T  18722694 cgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatct 18722610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18731139 - 18730955
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||  || || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18731139 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagt 18731040  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttc-tgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 184  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||| |||||    
T  18731039 cgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatct 18730955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30421320 - 30421208
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatg 355  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30421320 gagcagtttgtcttcaggagcagttttgttcagacgctttaagcttcctttttgttaattcctttgctctctattgttcttccaagacctttttaagatg 30421221  T
Q  356 tcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| ||||||||    
T  30421220 tcaaa-ttttgtct 30421208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18685545 - 18685367
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||  || || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18685545 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagt 18685446  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttc-tgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctt 178  Q
     ||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| ||||    
T  18685445 tgttgcttcactcttctggtcttcttgcaatgc-tagacgtgattatatcctttgaacagtctttgaagcattaactctt 18685367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 1237941 - 1238055
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1237941 gagcgctttatcttcatgagcagttttcttcagatgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagat 1238040  T
Q  355 gtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| ||||||||    
T  1238041 gtcaaatttttgtct 1238055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 6407729 - 6407994
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||         |||| |||     
T  6407729 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc---------caaaatagc 6407819  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||    
T  6407820 cgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcag 6407916  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| |||||||   || |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  6407917 cttctggtgattcacaacttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 6407994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Original strand, 43644900 - 43645069
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||| | ||  || ||| |    
T  43644900 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaattcatttgaattagcc 43644999  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 171  Q
    ||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43645000 gtttcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttt 43645069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14989599 - 14989328
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||         |||| |||     
T  14989599 agagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc---------caaattagc 14989509  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |  ||||||| | ||||| |||||  | ||||||| || ||||| || |||  | |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||    
T  14989508 cgttgttatacttttccaatcttcagcaatcttcagacgagtttgaatcctttaaacggcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaattgcag 14989411  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaatttt 282  Q
    ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14989410 cttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactttaggagcactttgtcttcaggagcactttt 14989328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 345
Target Start/End: Original strand, 19707522 - 19707864
Alignment:
Q  14 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||  ||||||||||||| | ||  || ||| ||||||||||||     
T  19707522 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattcatttgaattagccgttgcttcactc 19707621  T
Q  114 ttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatct 212  Q
    |||  ||||||||||||| ||||    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||  |  ||||| ||| |||||    
T  19707622 ttctggtcttctgcaatg-ttaggaatgattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttctgatgatcttcagcttctggcgatct 19707720  T
Q  213 t------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    |              |||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| ||  |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||    
T  19707721 tgcttctaatgaggtgcttctaatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcac-ttaacttcaggagcacttttcttcagattcttcaagct 19707819  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||| | ||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||    
T  19707820 tcctttttgttgattccattgccctcatttgttcttccataacct 19707864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 9320859 - 9320973
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9320859 gagcgctttatcttcaggagtagttttcttcagacgctttaatcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagat 9320958  T
Q  355 gtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||  ||||||||    
T  9320959 gtcaatattttgtct 9320973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15335909 - 15335807
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  15335909 cttcaggagcagttttcttcagacactttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatatcaaa-tttt 15335811  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  15335810 gtct 15335807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15424974 - 15424872
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  15424974 cttcaggagcagttttcttcagacactttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatatcaaa-tttt 15424876  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  15424875 gtct 15424872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15516278 - 15516176
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  15516278 cttcaggagcagttttcttcagacactttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatatcaaa-tttt 15516180  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  15516179 gtct 15516176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Original strand, 16189283 - 16189383
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16189283 cttcaagagcacttctcttcagacgcttcaagcttcctttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttg 16189382  T
Q  367 t 367  Q
    |    
T  16189383 t 16189383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 369
Target Start/End: Original strand, 19927335 - 19927432
Alignment:
Q  273 gagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19927335 gagcagttttctttagacgctttaagcttccctttttgttggttcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatatcaaatttttgtct 19927432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40845240 - 40845135
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtt 363  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  40845240 tcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaattt 40845141  T
Q  364 ttgtct 369  Q
    ||||||    
T  40845140 ttgtct 40845135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 36105499 - 36105614
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaaga 353  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||   |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36105499 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacactttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaatacctttttaaga 36105598  T
Q  354 tgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| ||||||||    
T  36105599 tgtcaaatttttgtct 36105614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 45568049 - 45567943
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  45568049 agagtagtgaaggtagtggtcgtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgctctttgaaggataatcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagc 45567950  T
Q  101 cgttgct 107  Q
    |||||||    
T  45567949 cgttgct 45567943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22461783 - 22461617
Alignment:
Q  4 gtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgt 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||  |||   | ||| || |||| ||||||||||||||| ||  || |||||||    
T  22461783 gtagtggagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcgt 22461684  T
Q  104 tgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 170  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||  ||  | ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22461683 tgcttcattcttctagtcttctgcaatg-atatgctagattaaatccttcgaacaacctttgaagctt 22461617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3598375 - 3598262
Alignment:
Q  119 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagct 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||||  || |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||||    
T  3598375 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagct 3598278  T
Q  219 tctgatgaacttgctt 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  3598277 tctgatgaacttgctt 3598262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 359
Target Start/End: Original strand, 16207555 - 16207631
Alignment:
Q  283 cttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaa 359  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16207555 cttcagatgcttcaagattcctttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctttttaagatgtcaa 16207631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18151794 - 18151533
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||         |||| ||||    
T  18151794 agagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgccttc---------caaattagt 18151704  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||||||||  | ||||||| || ||||          | ||||||||||||||  |||||||| || ||||| |  |     
T  18151703 cgttgttatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatc----------cttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaactgcaa 18151616  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaatttt 282  Q
    ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  18151615 cttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaagagcactttt 18151533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3598198 - 3598094
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaa-aacctttttaagatgtcaaagtt 363  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||    
T  3598198 tcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagtttccctctttgttgattcctttgttctgtattgttcttccaagatcttttttaaaatgtcaaa-tt 3598100  T
Q  364 ttgtct 369  Q
    ||||||    
T  3598099 ttgtct 3598094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 369
Target Start/End: Original strand, 6408013 - 6408105
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||   |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6408013 ttttcttcaaacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatttttgtct 6408105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Original strand, 21288609 - 21288672
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  21288609 cagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttttcttcaggagca 21288672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13430606 - 13430509
Alignment:
Q  180 catctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  13430606 catctcctgatgaactgtagcttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgtcttcaggagca 13430509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18151543 - 18151427
Alignment:
Q  255 agagcacttttt-cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaa 351  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||   |||||||| || |||||||| ||| | ||||||||    
T  18151543 agagcacttttaacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccatttttgttgatgtatttgctctttacttgttctttcaaga-ctttttaa 18151445  T
Q  352 gatgtcaaagttttgtct 369  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  18151444 gttgtcaaatttttgtct 18151427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Original strand, 21541285 - 21541354
Alignment:
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttt 348  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21541285 tttcttcagatgctttaggcttctctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacctttt 21541354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Original strand, 25164074 - 25164115
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtact 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25164074 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtact 25164115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 43640006 - 43640067
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  43640006 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgtcttcaggagca 43640067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19956482 - 19956378
Alignment:
Q  8 tggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgct 107  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||| ||||  | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  19956482 tggaggtagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatccaatgccttcaaatcctttagaattagtcgttgct 19956383  T
Q  108 tcact 112  Q
    |||||    
T  19956382 tcact 19956378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 19943520 - 19943623
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatag-ttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| || | | |||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||    
T  19943520 cttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcttttttggttgattccattactctcttttgttcttctagaacctatttaagatgtcaagttttt 19943619  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  19943620 gtct 19943623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22461485 - 22461419
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||    
T  22461485 ttttcttcagacgtttcaagcttccttcttgttgattccattgctctcttttgttcttacagaacct 22461419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 22674078 - 22674185
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttc----cttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaag 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     || | ||||||    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  22674078 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcacttttttttgttgatgtaattgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaat 22674177  T
Q  362 ttttgtct 369  Q
    | ||||||    
T  22674178 tcttgtct 22674185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13430776 - 13430699
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||||| || |||| |||||    
T  13430776 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 13430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Original strand, 1237884 - 1237944
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  1237884 gcttctgatgaacttgtttcagatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagc 1237944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Original strand, 1745366 - 1745429
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctc-gagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  1745366 cagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagag-gcactttgtcttcaggagca 1745429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 369
Target Start/End: Original strand, 2811053 - 2811206
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaactt--gcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttga 313  Q
    ||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||| ||  |||| || | |||||| || || || |||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  2811053 gcttctgatgagcttcagcttctgatgacgtcatcacttcaggagcgctatgtcttcatgaacacttctcttcagatgctttaagcttcctt-ttgttga 2811151  T
Q  314 ttcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    || ||||||||| | || ||| | || ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  2811152 tttctttgctcttttttattcattcataacctatttaagatgt-aaatttttgtct 2811206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13430501 - 13430465
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13430501 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcc 13430465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14989313 - 14989222
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||   |||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14989313 ttttcttcagacgctttaagcttccatttttgttgatgtatttgctctttacttgttctttcaaga-ctttttaagatgtcaaatttttgtct 14989222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Original strand, 36105442 - 36105502
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  36105442 gcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagc 36105502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Original strand, 21301228 - 21301291
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |  | |||||||| ||||||||||||    
T  21301228 cagcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcactttaaaagcactttgtcttcaggagca 21301291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 345
Target Start/End: Original strand, 28903777 - 28903844
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28903777 ttttcttcagatgctttaggtttctcttcttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 28903844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18321058 - 18320956
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| || | ||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||    
T  18321058 cttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcttttttgttgattccatagctatcttttgttcttccagaacgtaataaagatatcaaatttttg 18320959  T
Q  367 tct 369  Q
    |||    
T  18320958 tct 18320956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 22663431 - 22663538
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttc----cttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaag 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     || | ||||||    ||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  22663431 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcatcacttttttttgttgatgtaattgctctttatttgttcttccaagacctttttatgatgtcaaat 22663530  T
Q  362 ttttgtct 369  Q
    ||||||||    
T  22663531 ttttgtct 22663538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 345
Target Start/End: Original strand, 40003504 - 40003570
Alignment:
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||| |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40003504 tttcttcagatgctttaggtttctcttcttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 40003570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 3833278 - 3833311
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3833278 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 3833311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 3844058 - 3844091
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3844058 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 3844091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 3844349 - 3844382
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3844349 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 3844382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17525648 - 17525528
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcac-cacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgat 314  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||| ||  |||||||| | ||||||||||| || | |||||| |||| || |||| || | ||||||    
T  17525648 gcttctgacgaacttgcttctgatgatgtcaatcacttcaggagcacttgt-cttcaggagcacttcttttcagatgcttcaatcttcatttttgttgat 17525550  T
Q  315 tcctttgctctctattgttctt 336  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  17525549 ttctttgctctcttttgttctt 17525528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20259362 - 20259329
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20259362 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 20259329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21045992 - 21045959
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21045992 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 21045959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 21540955 - 21541041
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaa 95  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||        |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  21540955 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttc--------gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttctattcctttcaaa 21541041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22211132 - 22211099
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22211132 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 22211099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 43639786 - 43639815
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttc 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43639786 agagtagtggagatagtggttgtacacttc 43639815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Original strand, 8032357 - 8032393
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8032357 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 8032393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17518870 - 17518834
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17518870 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 17518834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18534875 - 18534839
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18534875 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 18534839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22135601 - 22135569
Alignment:
Q  313 attcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22135601 attcctttgctctctattgttcttccaagacct 22135569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22166750 - 22166718
Alignment:
Q  313 attcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22166750 attcctttgctctctattgttcttccaagacct 22166718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Original strand, 24551521 - 24551581
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  24551521 gcttatgatgaactcgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagc 24551581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Original strand, 45292894 - 45292930
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45292894 cttcaggtgcagttttcttcagacgctttaagcttcc 45292930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 29918028 - 29918397
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29918028 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaatcttttcaaactagt 29918127  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  29918128 cgttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacag 29918226  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccac-ctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaag 298  Q
    ||| || ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  29918227 cttctgatgaactt--gcttctgatggacttgcttctaatgacgtcaccactttcaggagcactttgtcttcagaagcagttttcttcatacgctttaag 29918324  T
Q  299 cttcctt--atagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29918325 cttccttgatttgttgattcctttgctctctattattcttccaagacctttttaagatgtcaaatttttgtct 29918397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 32544276 - 32544662
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||     
T  32544276 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaatcctttcaaaataga 32544375  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32544376 cgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 32544475  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcacca-----------------cctcgagagcactttttcttcaggagcaatttt 282  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||                 | || |||||||||| |||||||||||| || |    
T  32544476 cttatggtgattttcagcttctgatgaacttgcatctgatgacatcaccacttcaggagcactttgtcttcaagagcactttgtcttcaggagcagttct 32544575  T
Q  283 cttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32544576 cttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccataacctttttaagatgtcaaatttttgtct 32544662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 22802152 - 22802518
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  22802152 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaattctttcaaacttgt 22802251  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |     
T  22802252 cgttgtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagctttatgt--tgcatctcctgatgaactacaa 22802349  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||    
T  22802350 cttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcactacttcaggagcactttgtcttcaggagcagtttatttcagacgttttaagc 22802449  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22802450 ttcctttttgttgattcctttcctctctattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 22802518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20730842 - 20730476
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20730842 agagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagt 20730743  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||  | |||||||| ||||| |  ||    
T  20730742 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagctttttgt--tacatctcctgatgaactgcag 20730645  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20730644 cttctagtgattttcagcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcactacttcaggagcactttgtcttcatgagcagttttcttcagacgcttaaagc 20730545  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20730544 ttcctttttgttgatttctttgctctctattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 20730476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16265288 - 16264922
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  16265288 agagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcattcaaaacctttcaatctact 16265189  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| | | ||| |  ||    
T  16265188 cgttgcttcacttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagctttatgt--tgcatctcttgacgaactgcag 16265091  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |     
T  16265090 cttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagatgctttagga 16264991  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16264990 ttcctttttgttgattcctttgctctctattgttctttcaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 16264922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 9717854 - 9718205
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9717854 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatcctttcaaaatagt 9717953  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9717954 tgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagag 9718053  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatg--------------aacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    ||| | |||||||| | |||||||||              ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| | || ||||    
T  9718054 cttctagtgatctttaacttctgatgggatgcttatgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttgtcttcaggagtagttctctt 9718153  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9718154 cagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttc 9718205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 21235136 - 21235490
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    ||    
T  21235136 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgccttcaaatgctttcaa----gt 21235231  T
Q  101 cgttgcttcacttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |       || |   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||| |  |||    
T  21235232 c-------cattgaacagccttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagctttatgt--tgcatctcctgatgaactgcagc 21235322  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21235323 ttctagtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgctacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagct 21235422  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21235423 tcctttttgtagattcctttgctctctattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 21235490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 15954714 - 15955078
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15954714 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaattagt 15954813  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| || ||    
T  15954814 cgttgcttcatttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcttgatgaactacag 15954911  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| |||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15954912 cttctggtaattctcagcttctgataaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttaaggagcagtttttttcagacgctttaagc 15955011  T
Q  300 tt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15955012 ttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaattttt 15955078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26972363 - 26972127
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  26972363 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagtt 26972266  T
Q  102 gttgcttcacttttca-gtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26972265 gttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagc 26972166  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaat 239  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26972165 ttctggtgattttctgcttctgatgaacttgcttctaat 26972127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 13435543 - 13435926
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13435543 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagt 13435642  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  13435643 cgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 13435742  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttc--------------tgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    ||| ||||||||||| |||||              |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||| ||||||| || ||||    
T  13435743 cttatggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttactttaggagcacttctctt 13435842  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13435843 cagatgcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgttctttcagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 13435926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12715557 - 12715220
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |  |||  ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  12715557 gagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcatttcaaaatagtc 12715458  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |     
T  12715457 gttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 12715358  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaag 298  Q
    ||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| |||    
T  12715357 cttctagtgatctt--gcttctgatgaacttccttctgatgacgtcatcacttcg-gaacacttttgtcttcaggagcacttctcttcagatgcttcaag 12715261  T
Q  299 cttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttcca 339  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12715260 cttcctttttgttgatttctttgctctcttttgttcttcca 12715220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451439
Alignment:
Q  20 ttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcact-tttcag 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  119 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagct 218  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||| ||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga---tcaact 34451591  T
Q  219 tctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcc 317  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||| | | |||||||    
T  34451590 tctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttttgtcttcaggagcgcttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgctgattcc 34451491  T
Q  318 tttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34451490 tttgctctcttttgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 34451439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 18435574 - 18435804
Alignment:
Q  8 tggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgct 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18435574 tggaggtagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 18435673  T
Q  108 tcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttgg 206  Q
    ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |    
T  18435674 tcacttttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctag 18435773  T
Q  207 tgatcttcagcttctgatgaacttgcttcta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18435774 tgatcttcagcttctgatgaacttgcttcta 18435804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20112837 - 20112469
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20112837 gagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 20112738  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||    
T  20112737 gttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcag 20112638  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||  || ||| ||  ||| ||||||| || |||| ||| |||| ||||    
T  20112637 cttcaggtgatctttagcttctgaagaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgaacac-ttgactttaggagcacttctctttagatgcttcaagc 20112539  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||| | || |||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  20112538 ttcctttttgttgattccatagccctctcttgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 20112469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15531762 - 15531382
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||      
T  15531762 agagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaataac 15531663  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |     
T  15531662 cgttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactacaa 15531563  T
Q  200 cttttggtgatctt--------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttct 284  Q
    ||| ||||||||||                ||||||||||||||||||||| || | |||| ||| ||  || ||||||| ||| |||||||  || |||    
T  15531562 cttctggtgatcttatgattctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgattatgtcatcacttcaggatcacttttgtctacaggagcgcttctct 15531463  T
Q  285 tcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  15531462 tcagatgctttaagctttctttttgttgattcatttgctcttttttgttattccagaacttttttaagatgtcaaattttt 15531382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Original strand, 21625114 - 21625492
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  21625114 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgctttcaaa-tagccg 21625212  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |   ||    
T  21625213 ttgctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatgagacaa--ct 21625310  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttc--------------tgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    | |||||||||||||||||              |||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||  |||||||||| ||||||| |||  || |||||    
T  21625311 tctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttatgatgaacttgcctctgatg-cgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcagaagcgcttctcttc 21625409  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||| |||| |||||||||  | |||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21625410 agatgcttcaagcttcctatttgttgattcattttctctcttttgttcttcgagaacctttctaagatgtcaaatttttgtct 21625492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 15302212 - 15302533
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  15302212 gagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagcc 15302311  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |  |||    
T  15302312 gttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcctaatgagctttagc 15302411  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt--tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaag 298  Q
    ||||||||||                 ||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  15302412 ttttggtgat-----------------cttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgccttaag 15302494  T
Q  299 cttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
     |||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15302495 tttccattttgttgattcctttgctctctttttttcttc 15302533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 19623991 - 19624332
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactt-tgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||   |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||    
T  19623991 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcagaatagt 19624089  T
Q  101 cgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||||  || | |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||    
T  19624090 cgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatctcctgatgaacttcag 19624189  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||||||  | |||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| |   |||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  19624190 cttctggtgatctt--gtttctgatg-agatgcttctgatgacgtcatcactttaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 19624286  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  19624287 ttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaacct 19624332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 13602184 - 13602409
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||| || |||| ||||||||||| || ||||||| ||||     
T  13602184 gagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaattcatttcaaaatagtg 13602283  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  13602284 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactatagc 13602383  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || | ||||||||| |||| ||||||    
T  13602384 ttcttgtgatcttcggcttttgatga 13602409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 23284576 - 23284801
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23284576 gagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaataggc 23284675  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  23284676 gttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 23284775  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || | | ||||||| |||||||||||    
T  23284776 ttctagcgatcttctgcttctgatga 23284801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 21618255 - 21618631
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21618255 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagt 21618354  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||| ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||    
T  21618355 cgttgctttacttttccagtcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaactacag 21618452  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga-----cgtc--accacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgc 292  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||     | ||  |  || || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21618453 cttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaagagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgc 21618552  T
Q  293 tttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21618553 tttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaacttttgtct 21618631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14100578 - 14100228
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14100578 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 14100479  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||          
T  14100478 tgtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaa------ 14100385  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
               ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| ||   ||||| | | ||||||||| | || ||| |||| |||| ||||    
T  14100384 -----------cttcagcttctgatg-agatgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac-tatacttcaggagtacttctctccagatgcttcaagc 14100298  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  14100297 ttcctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaacctatttaatatatcaaatttttgtct 14100228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 16877224 - 16877608
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  16877224 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaatccttttaagatagt 16877323  T
Q  101 cgttgcttcacttt-tcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |     
T  16877324 cgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaa 16877421  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctc-ga----------------gagcactttttcttcaggagcaatttt 282  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||                |||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  16877422 cttttggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactaagtcttcatgagcgctttaacttcaggagcagtttt 16877521  T
Q  283 cttcagacgctttaag-cttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16877522 cttcagacgctttaagcctccctttttgttaattcctttgctctttattgttcttccaggacctttttaagatatcaaa-ttttgtct 16877608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 24116840 - 24117198
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  24116840 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaataacc 24116939  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttt-gaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    | | |||||||  || | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |  |     
T  24116940 gctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaacttcat 24117039  T
Q  200 cttttggtgatcttca-------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    ||| ||||||||||               |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || |||||    
T  24117040 cttctggtgatcttgcttctaaccgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttc 24117139  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  24117140 agatgctttaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccataacct 24117198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 369
Target Start/End: Original strand, 19688790 - 19689110
Alignment:
Q  14 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcact- 112  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  19688790 tagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcactc 19688889  T
Q  113 tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatct 212  Q
    || |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||                 ||    
T  19688890 ttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc--gcatctcctgatgaa-----------------ct 19688970  T
Q  213 tcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||                 ||||||||||  | ||||||||||||| || ||||||| | ||||    
T  19688971 tcagcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcatcac-----------------ttcaggagcacatctcttcagacgcttcaaacttcctttttgttg 19689053  T
Q  313 attcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19689054 attcatttgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 19689110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 19086170 - 19086520
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| |||||          ||||||| |||||    
T  19086170 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgc----------tttcaaaatagtc 19086259  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaa-caacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  19086260 gttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 19086358  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattt-----------------t 282  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| |||                 |    
T  19086359 cttctggtgatcttcagc-tctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcactttgacttcaggagcacttct 19086457  T
Q  283 cttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  19086458 cttcagacgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaacct 19086520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 15987245 - 15987422
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaat-cctttcaaactagt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15987245 gagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcccttttaaaatagt 15987344  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 177  Q
    | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15987345 cattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtct 15987422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22076545 - 22076305
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||    
T  22076545 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgctttccaatccttccaaaatagt 22076446  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || |     
T  22076445 cgttgctatacttttcgagtcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacat 22076348  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgac 242  Q
    ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22076347 cttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgac 22076305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33352064 - 33351702
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||  |||||||||||| |||     
T  33352064 agagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt-gaagaataaacatccaatgtttttcaatcctttcaaaatagc 33351966  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    | |||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||||  | ||||| |  |||| | ||||| |||||||||  |||||||||  |||||||  ||    
T  33351965 c-ttgctatacttttccagtcttctgcact-cttagacgagtgtgaatccttgaaacagcttttgaggctttaagt--tgcatctcccgatgaaatgcag 33351870  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
     || |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33351869 tttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaagagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 33351770  T
Q  300 ttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||| || | ||||||    |||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  33351769 ttccctttttgttgatgtacttgctctctatttgttcttccaagaccactttaagatgtcaaattttt 33351702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10640555 - 10640219
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgt-caacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  10640555 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtc 10640456  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || || || |||||| |  |     
T  10640455 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctctcagcttctgatgaaaaattgt 10640357  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    ||||| |||  |   ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||| ||  |||||| | |  ||||||||| | |||| |||||    
T  10640356 ttttgatgaggt---gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-ttgacttcagaacctcttttcttcatatgcttcaagct 10640261  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaa 342  Q
    ||||| | ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||    
T  10640260 tccttcttgttgatttcattgctctcatttgttcttccaaaa 10640219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Original strand, 18378326 - 18378496
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  18378326 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 18378425  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 171  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18378426 gttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagcttt 18378496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16336138 - 16336366
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  16336138 agagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttctaatccttccaaaatagt 16336237  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| |||  ||||||||||| ||||  || |     
T  16336238 cgttgctatacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttcaag--ttgcatctcctgatgatctacaa 16336335  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaactt 230  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| |||||    
T  16336336 cttctggtgattctcagcttctgataaactt 16336366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Original strand, 25597557 - 25597716
Alignment:
Q  68 acatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaa 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25597557 acatccaatgccttcaaatcctttcgaaatagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaa 25597656  T
Q  167 gctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25597657 gctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttatgatga 25597716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20488056 - 20487821
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  20488056 agagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagc 20487957  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagatt-aaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||  ||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||  || ||||| |  |    
T  20487956 cgttgcttcacttttacagtcttctgcaatctttagacgaggttgaaccccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgca 20487859  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttct 236  Q
     ||| | ||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  20487858 acttctagtgatttttagcttctgataaacttgcttct 20487821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19833171 - 19832938
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatcttt-gaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  19833171 agagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatag 19833072  T
Q  100 tcgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| || ||||| || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  19833071 tcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactaca 19832974  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgctt 234  Q
     ||| |||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  19832973 tcttctggtgattctcagcttctgataatcttgctt 19832938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 12349004 - 12349194
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  12349004 agagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagt 12349103  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa 193  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  12349104 cgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaag--ttgcatctcctgatgaa 12349194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 12423272 - 12423428
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12423272 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatacaatgccttccaatcctttcaaaatagt 12423371  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca 157  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| || |||||||||| || |||||||| ||||    
T  12423372 cgttgctatacttttccagtcttctgc-attcttagacgagtttgaatccattaaaca 12423428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 18435855 - 18435968
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatg 355  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18435855 gagcactttgtcttcaggagcagttctcttcagatgctttaagcttcctttttgttgattccttttctctctattgttcttccaatacatttttaagatg 18435954  T
Q  356 tcaaagttttgtct 369  Q
     |||| ||||||||    
T  18435955 acaaatttttgtct 18435968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 255 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20487770 - 20487666
Alignment:
Q  255 agagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20487770 agagcaccttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcttttttgttgattcctttgctttttattgttcttccaagacctttttaagat 20487671  T
Q  355 gtcaa 359  Q
    |||||    
T  20487670 gtcaa 20487666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26972077 - 26971967
Alignment:
Q  257 agcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgt 356  Q
    ||||||||  |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26972077 agcactttgacttcagaagcagttctcttcagacgctttaagattcctttttgttgattcctttgctctccattgttcttccagaacctttttaagatgt 26971978  T
Q  357 caaagttttgt 367  Q
    |||| ||||||    
T  26971977 caaatttttgt 26971967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 139225 - 139122
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||||    
T  139225 tcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagctttctttttgttgattcctttgctctttattgttcttctaagacctttttaagatgacaatatttt 139126  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  139125 gtct 139122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 147246 - 147143
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||||    
T  147246 tcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagctttctttttgttgattcctttgctctttattgttcttctaagacctttttaagatgacaatatttt 147147  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  147146 gtct 147143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 365
Target Start/End: Original strand, 17381711 - 17381821
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17381711 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgattcctatgctctttattgttcttccaagacctttttaagat 17381810  T
Q  355 gtcaaagtttt 365  Q
    || ||| ||||    
T  17381811 gtaaaattttt 17381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 170
Target Start/End: Original strand, 19470683 - 19470850
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||| |||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||||    
T  19470683 agtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcg 19470782  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 170  Q
    |||||||| | |||  ||||| |||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19470783 ttgcttcattcttctggtcttgtgcaatgc-taggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagctt 19470850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19832869 - 19832756
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  19832869 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagat 19832770  T
Q  355 gtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| ||||||||    
T  19832769 gtcaaa-ttttgtct 19832756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 26943587 - 26943741
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||| |||||| |  || |||     
T  26943587 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaatcctattgaaatagc 26943686  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaa 155  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  26943687 ggttgcttcactcttctagtcttctgcaatgc-tagacatgattaaatcctttgaa 26943741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 371
Target Start/End: Original strand, 12349254 - 12349360
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||   |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  12349254 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatttt 12349353  T
Q  365 tgtctgt 371  Q
    |||||||    
T  12349354 tgtctgt 12349360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 12423514 - 12423618
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||   |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  12423514 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcactttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatttt 12423613  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  12423614 tgtct 12423618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22058439 - 22058337
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22058439 cttcaggagcaattctcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatttt 22058340  T
Q  365 tgt 367  Q
    |||    
T  22058339 tgt 22058337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 16336440 - 16336549
Alignment:
Q  261 ctttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtca 358  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16336440 ctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcactttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacc-ttttaagatgtca 16336538  T
Q  359 aagttttgtct 369  Q
    || ||||||||    
T  16336539 aatttttgtct 16336549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Original strand, 13602447 - 13602525
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  13602447 cttcaggagcacttctcttcaaacggtttaagcttcctttttgttgattccttttctctcttttgttcttccagaacct 13602525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Original strand, 18378545 - 18378623
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  18378545 cttcaggagcacttctcttaagacgttttaagcttcctttttgttgattcctttactctcttttgttcttccaagacct 18378623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19066156 - 19065890
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||         ||||| |||     
T  19066156 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcatt---------tcaaaatagc 19066066  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||   ||||||| |||||||||||||   ||| |||| |  | ||| |  |||| | ||||||||||||||   | |||||||| ||||| |  ||    
T  19066065 cgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagttagagtccttgaaacagcttttgaagctttaaga--tccatctcctgatgaactgcag 19065968  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||||    
T  19065967 cttctggtgatatacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagca 19065890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17608286 - 17608186
Alignment:
Q  177 ttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctc-gagagcactttttcttcaggag 275  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  17608286 ttgcatcttctgatgaactatagcttctggtgatatacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagag-gcactttgtcttcaggag 17608188  T
Q  276 ca 277  Q
    ||    
T  17608187 ca 17608186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 17381536 - 17381599
Alignment:
Q  5 tagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaa 68  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17381536 tagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaa 17381599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 25594080 - 25594155
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatg 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||| ||||    
T  25594080 gagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatccaatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 264
Target Start/End: Original strand, 12423428 - 12423494
Alignment:
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcacttt 264  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  12423428 agcttttggtgatcctcggcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcacttt 12423494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 333
Target Start/End: Original strand, 15987488 - 15987552
Alignment:
Q  269 tcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgtt 333  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15987488 tcaggagcacttttcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgtt 15987552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17608165 - 17608095
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttt 348  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17608165 ttttcttcagatgctttaggcttctctttttgttgattcatttgctctcttttgttcttccaagacctttt 17608095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 337
Target Start/End: Original strand, 25597754 - 25597824
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  25597754 cttcaggagcacttctcttcagatgcttttagcttcctttttgttgattccattgctctcttttattcttc 25597824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 19482994 - 19483055
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||||    
T  19482994 gcttctgacgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagca 19483055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Original strand, 3680780 - 3680844
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaac 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||||| | ||||||    
T  3680780 ttttcttcagatgctttaagcttccttcttgtagatttctttgctctcttttgttccttcaaaac 3680844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9933392 - 9933359
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9933392 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 9933359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17741406 - 17741373
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17741406 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 17741373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 345
Target Start/End: Original strand, 18383955 - 18384008
Alignment:
Q  292 ctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||| |||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18383955 ctttaaacttcttttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 18384008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 18499095 - 18499128
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18499095 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 18499128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 19482763 - 19482840
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||| || |||| ||| || |||| |||||    
T  19482763 agagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctccttgaggaataagcatccaatgc 19482840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 26589848 - 26589909
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||   |||||||| ||||||||||||    
T  26589848 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactttgtcttcaggagca 26589909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 340
Target Start/End: Original strand, 18555745 - 18555773
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaa 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18555745 gattcctttgctctctattgttcttccaa 18555773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 19482930 - 19482974
Alignment:
Q  197 gagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19482930 gagcttctggtgatctgcagcttctaatgaacttgcttctgatga 19482974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Original strand, 21128566 - 21128602
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21128566 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 21128602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 339
Target Start/End: Original strand, 23284855 - 23284927
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttcca 339  Q
    ||||||||||| || |||||||| | || |||||||||| | ||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  23284855 cttcaggagcacttctcttcagatgtttcaagcttcctttttgttgattccatagttctcttttgttcttcca 23284927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 90155 - 89789
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  90155 agagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagc 90056  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||    
T  90055 cgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcag 89958  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89957 cttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggaacaattttcttcagacgctttaagc 89858  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  89857 ttcctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 89789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 103)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20152117 - 20151763
Alignment:
Q  14 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20152117 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcactt 20152018  T
Q  114 tt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatct 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |  ||||| ||||||| |    
T  20152017 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgattt 20151919  T
Q  213 tcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttg 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  20151918 tcagcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcactatttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcctttttgtta 20151819  T
Q  313 attcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20151818 attactttgctctctattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 20151763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6574219 - 6573861
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaatt-gtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6574219 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactag 6574120  T
Q  100 tcgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgc-ttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatag 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||| |      
T  6574119 tcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaactgc 6574022  T
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaa 297  Q
    | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |   ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | |||||    
T  6574021 aacttctagtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcactactttaggagcactttgtcttcagaagcatttttcttcagatgttttaa 6573922  T
Q  298 gcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtca 358  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6573921 gcttcctttttgttaattcctttgctccctattgttcttccaagatctttttaagatgtca 6573861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 23235013 - 23235395
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23235013 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaattctttcaaaatagtc 23235112  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  23235113 gttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaactagagc 23235212  T
Q  201 ttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || ||||||| ||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  23235213 ttctggtgattttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaagagcacttctcttc 23235312  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23235313 agacgctttaagcttactttttgttgattcaattgctctcttttgttcttctagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 23235395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 25829140 - 25829468
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25829140 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 25829239  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||           
T  25829240 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaa------- 25829332  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
              ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25829333 ----------ctttagcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgctttaagc 25829422  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25829423 ttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 25829468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20568844 - 20568493
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||     
T  20568844 gagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaattgtt 20568745  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  20568744 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagc 20568645  T
Q  201 ttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttctt 285  Q
    || |||||||||| |              |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  20568644 ttctggtgatcttgaacttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttcaaatgacgtcatcacctcatgagcacttttgtcttcaggagcacttatctt 20568545  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20568544 cagacgtcttaagcttcctttttgttgattcctttactctcttttgttcttc 20568493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 30666995 - 30667377
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30666995 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 30667094  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | |    
T  30667095 gttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatctcctgatgaactacaac 30667194  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgat--------------gaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || || |  |||||||||||||||              |||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  |||| |||||| || |||||    
T  30667195 ttctgatattcttcagcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcgggagcacttctcttc 30667294  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||| |||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  30667295 agatgcttcaagcttcctttttgttgattcaattgctctctattgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 30667377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13964072 - 13963722
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13964072 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaaatagtc 13963973  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  13963972 gttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctactgatgaactagagc 13963873  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || | |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||                 ||||||||||| || | |||||| | || || |     
T  13963872 ttctagtgatctttaacttctgaggaacttgcttctgatgacgt-atca-----------------cttcaggagcacttcttttcagatgtttcaaacg 13963791  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13963790 tcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 13963722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 19540422 - 19540762
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||| || ||| |    
T  19540422 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaaacctttcgaaatagcc 19540521  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||    
T  19540522 gttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaacttcagc 19540621  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || ||||||||||  |||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||| |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19540622 ttctggtgatctt--gcttctgatg-aggtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tagacttcaggaacacttttcttcagacgctttaagct 19540717  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    | ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19540718 ttctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccaaaacct 19540762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Original strand, 22317602 - 22318000
Alignment:
Q  5 tagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaac-tagtcgt 103  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  22317602 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaaatagtcgt 22317701  T
Q  104 tgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagctt 202  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22317702 tgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaaatagagctt 22317801  T
Q  203 ttggtgatcttcagcttctgat---------------gaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcacttttt-----------------cttc 270  Q
     ||||||| |||||||||||||               |||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| |                 ||||    
T  22317802 ctggtgattttcagcttctgatgtacttgcttatgatgaacttgcttatgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagtagcactttgacttc 22317901  T
Q  271 aggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22317902 aggagcagttctcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctctattgttcttctagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 22318000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28711793 - 28711425
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||| || ||||    
T  28711793 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattcattcgaaatagt 28711694  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | |||||||| ||||||  |||||| | | ||||| |  ||    
T  28711693 cgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt--tgcatcccattatgaactgcag 28711596  T
Q  200 cttttggtgatcttcag-cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaag 298  Q
    ||| ||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28711595 cttctggtgattttttggcttctgataaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcaaacgctttaag 28711496  T
Q  299 cttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28711495 cttccttttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 28711425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9015462 - 9015083
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  9015462 gagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtt 9015365  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||     
T  9015364 gttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagt 9015265  T
Q  201 ttttggtgatcttcagc--------------ttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || ||| ||||||| ||              ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  || ||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  9015264 ttctgg-gatcttctgcttctgatgagttgtttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcacttttacttcaagagcacttctcttc 9015166  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  9015165 agatgcttcaagcttccattttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatttcaaatttttgtct 9015083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18377000 - 18376673
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  18377000 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagta 18376901  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |  ||||| |  | |    
T  18376900 gttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtctctcatcttcaaatgaacttcaac 18376801  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||                 ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  18376800 ttctggtgatcttctgcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatca-----------------cttcaggagcatttttcttcagatgcttcaagct 18376718  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18376717 tcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaacct 18376673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25037353 - 25037128
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25037353 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaattagtc 25037254  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  25037253 gttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 25037154  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  25037153 ttctggtgatcttcagcttctgatga 25037128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25041460 - 25041235
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25041460 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaattagtc 25041361  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  25041360 gttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 25041261  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  25041260 ttctggtgatcttcagcttctgatga 25041235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 30621222 - 30621551
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30621222 gagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 30621321  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | || | |    
T  30621322 gctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctgatgcactacaac 30621421  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || | ||||| |||||||||||               ||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||  ||||| || |||| ||| |||| |||||    
T  30621422 ttctagtgatattcagcttctg---------------atgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcgagagcacttctctttagatgcttgaagct 30621506  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30621507 tcctttttgttgattccattgctctctattgttcttccagaacct 30621551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 30623843 - 30624172
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30623843 gagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 30623942  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | || | |    
T  30623943 gctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctgatgcactacaac 30624042  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    || | ||||| |||||||||||               ||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||  ||||| || |||| ||| |||| |||||    
T  30624043 ttctagtgatattcagcttctg---------------atgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcgagagcacttctctttagatgcttgaagct 30624127  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30624128 tcctttttgttgattccattgctctctattgttcttccagaacct 30624172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22188196 - 22187971
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||||     
T  22188196 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatctattcaaaatagtt 22188097  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  | |    
T  22188096 gttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgtcctgatgaacttcaac 22187997  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  22187996 ttctggtgatcttcagcttctgatga 22187971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 38781404 - 38781768
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38781404 agagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 38781503  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  | | |     
T  38781504 tgttgcttcacttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcctctgatg--agacat 38781601  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt--tttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||    ||   ||   ||  || |  |  ||||||||||  || |||||||| |||| ||    
T  38781602 cttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatga----acttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcgcttctcttcagatgcttcaa 38781696  T
Q  298 gcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38781697 gcttcctttttgttgattcaattgctctcttttgttcttccagaacctttttaagatgacaaatttttgtct 38781768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 24377107 - 24377369
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  24377107 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaaacctttcaaaatagtc 24377206  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||    
T  24377207 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcag 24377305  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt 263  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  24377306 cttctggtgatctttagcttctgatgaactttcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 24377369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21537342 - 21537117
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || | ||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21537342 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaaacctttcaaaatagtc 21537243  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | |    
T  21537242 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcatc 21537143  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || | |||||||| | ||||||||||    
T  21537142 ttctagtgatctttaacttctgatga 21537117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39037736 - 39037392
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || | ||| |||||||||||||||| | | ||  || ||| |    
T  39037736 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaacttcatttgaattagcc 39037637  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||| || || || |  | |    
T  39037636 gttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatcttctgatcaactttaac 39037537  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||| ||  |||||| |||| || |||||||| |||| |||||    
T  39037536 ttccggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac-ttaacttcagtagcacttctcttcagatgcttcaagct 39037438  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||| | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||    
T  39037437 tcctttttgttgattccatagctctcaatttgttcttccagaacct 39037392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260761
Alignment:
Q  22 gtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtc 120  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||  |||||||| |||| | | ||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  121 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttc------ 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |  | ||| |||||||||||          
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatcttccttctg 22260631  T
Q  215 ------agcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttat 307  Q
           |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  22260632 atgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcatttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgccttaaacttcctttt 22260731  T
Q  308 agttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22260732 tgttgattcctttgctctcttttgttcttc 22260761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 24576042 - 24576254
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  24576042 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaatcctttcaaaatagttg 24576141  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgaga-ttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||    
T  24576142 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatctcctaatgaactttagc 24576241  T
Q  201 ttttggtgatctt 213  Q
    || ||||||||||    
T  24576242 ttctggtgatctt 24576254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24850760 - 24850410
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| || ||    
T  24850760 gagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaatcctttcaaaatattc 24850661  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  ||    
T  24850660 gttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgtacttcag 24850561  T
Q  200 cttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    | | |||||||||| |              ||||||||||||||||||||| | |||||||  || ||  |||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  24850560 catctggtgatctttagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgacgacgtcattacttcaggagcac-ttgacttcaggagcacttttctt 24850462  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24850461 cagatgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttc 24850410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28140713 - 28140391
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||     
T  28140713 gagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaatcctttcaaaatagtt 28140614  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||||||||     | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |  |||    
T  28140613 gttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatctcccgatgaacttcagc 28140514  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    || || |||  |   ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| | |||||    
T  28140513 ttctgatgagat---gcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgacttcaggagcacttctcttcagacgttctaagc 28140417  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctct 325  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||    
T  28140416 ttcctttttgttgattccttagctct 28140391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31800982 - 31800597
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31800982 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagt 31800883  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||  ||||| | | || | ||||||||||||||  ||||||| | | ||||| |  ||    
T  31800882 tgttgtttcacttttccagtcttctgcaataaatagacgagtttggatccactaagcagcttttgaagctttaag--ttgcatcccatgatgaactgcag 31800785  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctc--ga---------------gagcactttttcttcaggagcaatttt 282  Q
     || |||||||  |  ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| ||  ||               ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31800784 tttctggtgattatttgcttctgataaacttgcttctgatgacgccatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactttatcttcaggagcagtttt 31800685  T
Q  283 cttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  31800684 cttcagacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgttctttattgttcttccaagacatttttaatatgtcaaatttttgtct 31800597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10009844 - 10009631
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  10009844 gagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtt 10009745  T
Q  102 gttgcttcact--tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||  | |  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  10009744 gttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 10009645  T
Q  200 cttttggtgatctt 213  Q
    ||| ||||||||||    
T  10009644 cttctggtgatctt 10009631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 40782484 - 40782808
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40782484 agtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcg 40782583  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  40782584 ttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaa----attt--agctctaagtcttgcatctcctgatgaaatttagct 40782677  T
Q  202 tttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttc-ttcaggagcaattttcttcag 288  Q
    | ||||||||||              ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  | |||||||||| || |||||||    
T  40782678 tctggtgatcttgcttctgatgaaatgcttctggtgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgactttcaggagcacttctcttcag 40782777  T
Q  289 acgctttaagcttccttatagttgattcctt 319  Q
    | |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  40782778 atgcttcaagcttcctttttgttgattcctt 40782808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 24779349 - 24779525
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  24779349 gagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 24779448  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 177  Q
    |||||||||||  ||  ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24779449 gttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 6392638 - 6392914
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatcttt-gaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  6392638 agagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatag 6392737  T
Q  100 tcgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatc-cattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatag 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||| |||| |||| | |||||||| |||||   ||||||  || ||||| |      
T  6392738 tcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaag--atgcatcctctgatgaactgc 6392835  T
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    | ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  6392836 aacttatggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagc 6392914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34322031 - 34321792
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  34322031 agagtagtgaagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagt 34321932  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  |||||| ||| ||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||| | ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  34321931 cgttgctatacttttccaggcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaattacag 34321834  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34321833 cttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatga 34321792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45087266 - 45087038
Alignment:
Q  14 tagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactt 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45087266 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgagaataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 45087167  T
Q  114 tt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaat-ccattgaacaac-ctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgat 210  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||  || ||||| |  ||||| | |||||    
T  45087166 ttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaactttttgaagctttaag--ttgcatcctctgatgaactgtagcttctagtgat 45087069  T
Q  211 cttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
     || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45087068 atttagcttctgataaacttgcttcttatga 45087038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 33074231 - 33074470
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||  | |||| ||||    
T  33074231 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacgttttttgaagaataagcatctaatgccttccaatctgtccaaaatagt 33074330  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| || |     
T  33074331 cgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatctcctgatgaactacaa 33074428  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33074429 cttctagtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatga 33074470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30557416 - 30557175
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatc-tttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||  ||||||| |||||||| |||    
T  30557416 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgtgttcaaattctttcaaaatag 30557317  T
Q  100 tcgttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaat-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatag 197  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||  |||||||| |||||  |||||||  || ||||| |      
T  30557316 tcgatgcttcactttttcagtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgc 30557219  T
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30557218 agcttctggtgatatttagcttctgatgaacttgcttctgatga 30557175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31328061 - 31327821
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |   ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| || | |||| ||||    
T  31328061 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaatagt 31327962  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaac-ctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  |||| |||| || ||||| |||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |  |    
T  31327961 cgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaactgca 31327864  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31327863 gcttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatga 31327821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31334782 - 31334542
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |   ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| || | |||| ||||    
T  31334782 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaatagt 31334683  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaac-ctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  |||| |||| || ||||| |||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |  |    
T  31334682 cgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaactgca 31334585  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31334584 gcttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatga 31334542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 22802465 - 22802656
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||     
T  22802465 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctttgaagaataagcatcatatgccttcaaatcctttcaaaatagc 22802564  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa 193  Q
    | |||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||| || | | |||||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  22802565 cattgctttacctttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatctttaag--ttgcatctcctgatgaa 22802656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1587128 - 1586862
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||         ||||| |||     
T  1587128 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgcctt---------tcaaaatagc 1587038  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||    |||||| ||||||||||||||  | ||| ||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| |  ||    
T  1587037 cgttgtaatactttttcagtcttctgcaatcttcagatgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagt--tccatctcctgatgaactccag 1586940  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  1586939 cttctggtgattctcagcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttatcttcaggagca 1586862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28701037 - 28700924
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28701037 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagat 28700938  T
Q  355 gtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| ||||||||    
T  28700937 gtcaaa-ttttgtct 28700924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 7609037 - 7609191
Alignment:
Q  72 ctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttca--gtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagct 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||   ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  7609037 ctaatgccttcaaatcctttcaaaataggtgttgcttcactcctcttggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagct 7609136  T
Q  170 ttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  7609137 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatctt--gcttctgatga 7609191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23595661 - 23595403
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||   |||||||  ||| ||||||||||||| | ||  || |||||    
T  23595661 gagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacg--cttcagagaacaagaatccaatgccttcaaattcatttgaattagtc 23595564  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||  |  |||    
T  23595563 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatcttctgatgatcttcagc 23595465  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt 265  Q
    || |||||| |||  |||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  23595464 ttctggtgaactt--gcttctgatg-aggtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttt 23595403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 25189404 - 25189629
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  || | |||  ||| ||||||||||| | | ||  || |||||    
T  25189404 gagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttcatttgaattagtc 25189503  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa-atagag 199  Q
     |||||||||| | |  |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || ||  |  ||    
T  25189504 attgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctaataaacttttag 25189602  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  25189603 cttcaggtgatcttcagcttctgatga 25189629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35744094 - 35743858
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35744094 gagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcattcaatgccttcaaatccttccaaaatagtc 35743995  T
Q  102 gttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||  |||||| || | |||||||||  ||||||  | || | ||  || |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| || |||    
T  35743994 gttgctatacttttccaatattctgcaatctttagac--gtttgagtctgttaaacaacttttgacgctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagc 35743899  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  35743898 ttctggtgattttcagcttccgataaacttgcttctgatga 35743858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28701322 - 28701149
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||   |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||   |    
T  28701322 agtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatatctg 28701223  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagt 175  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||| || |||| ||| |||| | |||||||| ||||||    
T  28701222 ttgctttacttttccagtcttctgcaatcttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagccttaagt 28701149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 41121814 - 41121642
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  || ||||    
T  41121814 agagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaatccttttgaattagt 41121715  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaa 173  Q
    | ||||||||||  | || ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41121714 ctttgcttcactcatccaatcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 41121642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22455084 - 22454859
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  || | ||| |||| ||||||||||| | | ||  || ||       
T  22455084 gagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattaact 22454985  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttt-gaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||| || | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| || | ||| |  ||    
T  22454984 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatcttctgaagaacttcag 22454886  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22454885 cttctggtgatcttcagcttctgatga 22454859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26619196 - 26619027
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||   ||||| || |||  ||||||||||||| ||||  || ||||    
T  26619196 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaatagt 26619097  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 170  Q
     ||||||||| | || |||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26619096 tgttgcttcattcttccagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagctt 26619027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Original strand, 3277037 - 3277378
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||         |||| ||| ||    
T  3277037 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc---------caaattagccg 3277127  T
Q  103 ttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||| |  || ||||||||||||||||||  | |||| || || ||| | || |||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||| |  ||||    
T  3277128 ttgttatactttttcagtcttctgcaatcttcagacaagtttgaattctttaaacaacttttgaagctttaag--ttccatctcctaatgaactccagct 3277225  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt 301  Q
    | | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                 ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  3277226 tctagtgattcccagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatca-----------------cttcaggagcagttttcttcataagctttaagctt 3277308  T
Q  302 -ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
     |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3277309 ccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtaaaatttttgtct 3277378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28551013 - 28550748
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||         ||||||||| ||||    
T  28551013 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cctttcaaaatagt 28550923  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||| ||  |||||| ||||||||||||||  |||| |||| || ||||| |  |||| | ||||| | |||||   ||||||||||| ||||| |  ||    
T  28550922 tgtttctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggttttaa--attgcatctcctgatgaactgcag 28550826  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| |||||||   ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  28550825 cttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 28550748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 271 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 45086945 - 45086845
Alignment:
Q  271 aggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45086945 aggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgacttctttgctctttattgttcttccaaaacctttttaagatatcaaa-ttttgtct 45086847  T
Q  370 gt 371  Q
    ||    
T  45086846 gt 45086845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 44840439 - 44840701
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||         ||||||||| ||||    
T  44840439 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cctttcaaaatagt 44840529  T
Q  101 cgttgcttcac-ttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||   || ||||||||| ||||||||| |||| |||| || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |  ||    
T  44840530 cgttgccatactttttcagtc-tctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcttgatgaactgcag 44840625  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| || |||  ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  44840626 cttctgatgaattt--gcttctgatgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 44840701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Original strand, 22802754 - 22802862
Alignment:
Q  261 ctttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaa 359  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22802754 ctttatcttcatgagcaattttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatttcattactctttattgttcttccaagacctttttaagatatcaa 22802853  T
Q  360 agttttgtct 369  Q
    | ||||||||    
T  22802854 a-ttttgtct 22802862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31968138 - 31967873
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||         | ||||||| ||||    
T  31968138 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catttcaaaatagt 31968048  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||  |||||| ||||||||||||||  |||  |||| || ||||| |  |||||| ||||| ||||||||  |||||||| || ||||| |  ||    
T  31968047 tgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttatgcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaggctttaag--ttgcatcttctgatgaactgcag 31967951  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| |||||||   || ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  31967950 cttctggtgattcacaacttcttatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 31967873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 22272139 - 22272303
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaa-catctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||   | ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||  || |||||    
T  22272139 agtagtggagatagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctctccaacgaaaaaagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtc 22272238  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaa 166  Q
     |||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  22272239 attgcttcattcttccagtcttctgcaatgat-agacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaa 22272303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31327770 - 31327668
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  31327770 cttcaggagcagttttcttcaggcgcgttaagcttctctttttgttgatgcctttgctctttattgttcttccaggacctttttaagatatc-aagtttt 31327672  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  31327671 gtct 31327668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31334491 - 31334389
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  31334491 cttcaggagcagttttcttcaggcgcgttaagcttctctttttgttgatgcctttgctctttattgttcttccaggacctttttaagatatc-aagtttt 31334393  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  31334392 gtct 31334389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34321730 - 34321619
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaaga 353  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  34321730 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaaacttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaaga 34321631  T
Q  354 tgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||| ||||    
T  34321630 tgtcaaattttt 34321619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 33074517 - 33074631
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||   |||||||| ||||  | |||||| |||||| ||||||    
T  33074517 gagcactttatcttcaggagcaattttcttcagacgttttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttttccaagacctttataagat 33074616  T
Q  355 gtcaaagttttgtct 369  Q
    || ||| ||||||||    
T  33074617 gttaaatttttgtct 33074631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 44881172 - 44881512
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||   |  || ||||||| |||||||||||| || ||  || |||     
T  44881172 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatccaatgccttcaaacccatttgaattagc 44881271  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     | ||||||| | || |||||||||||||||  |||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||| || | |  || || || ||||  |  ||    
T  44881272 tgctgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaagtcatttgaacagcctttgaagcttcaattatctcagcttctgatgatcttcag 44881370  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||| ||  |||||  | |  ||||||||||| |||| ||||    
T  44881371 cttttggtgatgtt--gcttctgatg-aggtgcttctgatgacgtcagcacttcaggagcac-ttgacttcaaaatctcttttcttcagatgcttcaagc 44881466  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||| | ||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  44881467 ttccttcttgttgatttcattgctctcatttgttcttccagaacct 44881512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30557103 - 30557046
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgct 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30557103 tcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgct 30557046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 14581520 - 14581600
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgcctt 81  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  14581520 agagaagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14581600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22776383 - 22776303
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgcctt 81  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  22776383 agagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22776303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22781761 - 22781681
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgcctt 81  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  22781761 agagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22781681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22776198 - 22776137
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggag 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  22776198 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggag 22776137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22781576 - 22781515
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggag 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  22781576 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggag 22781515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22785750 - 22785670
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgcctt 81  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  22785750 agagtagtggagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22785670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 40332092 - 40332172
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgcctt 81  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  40332092 agagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 40332172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1586838 - 1586751
Alignment:
Q  284 ttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||   |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1586838 ttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatttttgtct 1586751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 95
Target Start/End: Original strand, 1084047 - 1084105
Alignment:
Q  37 ttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaa 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1084047 ttgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatctaatgccttcaattcctttcaaa 1084105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Original strand, 1084355 - 1084429
Alignment:
Q  275 gcaattttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttt 348  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1084355 gcaattttcttcagatgctttaggcttctcttcttgctgattcctttgctctcttttgttcttccaagacctttt 1084429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 18702743 - 18702912
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||  ||||| |||   ||||  || |||||||||||||||||| ||||  || |||     
T  18702743 agagtagtggagatagttgttgcatacttcgtacaattgtccttttccaacgttctccaaagagtaagcatctaatgccttcaaattcttttgaattagc 18702842  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 170  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||| ||||  |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  18702843 cgttacttcatgcttctagtcttctgtaatg-atagacgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagctt 18702912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 19115088 - 19115138
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaac 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  19115088 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaac 19115138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22187933 - 22187855
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  22187933 cttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgctgattcctttgctctattttgttcttccataacct 22187855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Original strand, 24576283 - 24576437
Alignment:
Q  215 agcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgat 314  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||||||  ||||| || || || |||||| | | || |||||||||| | ||||||    
T  24576283 agcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgacttcatgaacacttatcttcatatgtttcaagcttcctttttgttgat 24576382  T
Q  315 tcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||| |||||| || || |||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  24576383 tccattgctccctttttttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 24576437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25037082 - 25037004
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  25037082 cttcatgagcacttctcttcagatgctttaagcttcgtttttgttgattcctttgctctctttttttcttccagaacct 25037004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25041189 - 25041111
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  25041189 cttcatgagcacttctcttcagatgctttaagcttcgtttttgttgattcctttgctctctttttttcttccagaacct 25041111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Original strand, 40332261 - 40332358
Alignment:
Q  180 catctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  40332261 catctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 40332358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 369
Target Start/End: Original strand, 14581740 - 14581843
Alignment:
Q  268 ttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||||    ||||||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  14581740 ttcaggagcaattttcttgagacactttaagcttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttctcccaaaaccaatttaagatgtcaaattttt 14581839  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  14581840 gtct 14581843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 345
Target Start/End: Original strand, 38631239 - 38631318
Alignment:
Q  266 tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  38631239 tcttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcatttttgttgatttctttgctctcttttgtttttccagaacct 38631318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 325
Target Start/End: Original strand, 6392934 - 6392980
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctct 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6392934 ttttcttcagacgctttaagcttcctttgtgttgattcctttgctct 6392980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18431035 - 18430858
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||  |||  ||||| | |   ||||| || |||  ||||||||||||| ||||  || |||     
T  18431035 agagtagtggaggtcgtggttgtacacttcgtactattgtcgttttccaacgttttccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaattagc 18430936  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctt 178  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||| | || || ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18430935 cgttgcttcatgcttctagtcttctgcaatgat-aggcgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagctttaattctt 18430858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 345
Target Start/End: Original strand, 19115422 - 19115488
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  19115422 ttttcttcagacgcttcaagcttccttcctgttgattccattgctctcatttgttcttccagaacct 19115488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21537063 - 21536961
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||||||||| || ||||||||   |||||| |||||| | ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  21537063 cttcaggagcacttctcttcagatattttaagtttcctttttgttgatttcatagctctcttttgttcttccaaaacctaataaagatatcaaatttttg 21536964  T
Q  367 tct 369  Q
    |||    
T  21536963 tct 21536961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 23184398 - 23184348
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacg 52  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23184398 gagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacg 23184348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22785531 - 22785470
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  22785531 gcttttgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaagagcactttgtcttcaggagca 22785470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22776127 - 22776091
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22776127 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcc 22776091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22781505 - 22781469
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22781505 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcc 22781469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26618909 - 26618849
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttcca 339  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  26618909 ttttcttcagactcttcaagcttccttcttgttgattccattgctctcatttgttcttcca 26618849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35743868 - 35743808
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  35743868 gcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcactttaagagcactttgtcttcaggagc 35743808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 40332366 - 40332470
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    ||||||| |||| |||||||||| | |  |||||||||||||| |||    
T  40332366 cttcaagagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttcttccaagatcaatttaagatgtcaaatttt 40332465  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  40332466 tgtct 40332470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10009582 - 10009524
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctct 325  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  10009582 cttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattccttagctct 10009524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 325
Target Start/End: Original strand, 18703070 - 18703116
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctct 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  18703070 ttttcttcagacgcttcaagcttccttcttgttgattccattgctct 18703116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22785599 - 22785528
Alignment:
Q  161 tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgctt 234  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  22785599 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgtagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgctt 22785528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23184161 - 23184111
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcc 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||    
T  23184161 cttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcc 23184111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23595418 - 23595368
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcc 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||    
T  23595418 cttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcc 23595368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24814374 - 24814296
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||| | |||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24814374 cttcagaagcagatttcttcagatgctttaggtttctcttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 24814296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17968919 - 17968886
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17968919 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 17968886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19497719 - 19497686
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19497719 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 19497686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 24275541 - 24275574
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24275541 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 24275574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24793786 - 24793721
Alignment:
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||| |||||| | |||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24793786 tttcttcagatgctttaggtttctcttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 24793721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22454805 - 22454757
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgatt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  22454805 cttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgatt 22454757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30557170 - 30557110
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||||||    
T  30557170 gcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcaattcaggagcactttgtcttcaggagc 30557110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 369
Target Start/End: Original strand, 44840721 - 44840813
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    ||||||| |||| |||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||    
T  44840721 ttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttcttccaagaccactttaggatgtcaaatttttgtct 44840813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 32497 - 32834
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32497 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaaatagtc 32596  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |      
T  32597 gttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaag 32696  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  32697 ttgtggtgatctttagcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcagaagcacttttcttcagacgccttaagc 32796  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32797 ttcctttttgttgattcctttactctcttttgttcttc 32834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 49344 - 49681
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  49344 gagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagta 49443  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |    
T  49444 gttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatctcctgatgaactacaac 49543  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    || |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||| ||| ||  |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  49544 ttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatgaagtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaagagcacttctcttc-gacgccttaagc 49641  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttcca 339  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49642 ttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttcca 49681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 445 - 339
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  445 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagc 346  T
Q  101 cgttgct 107  Q
    |||||||    
T  345 cgttgct 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27529 - 27175
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||     
T  27529 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaatcctatcaaaatagc 27430  T
Q  101 cgttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  27429 tgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcag 27330  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||  |||||||||  |||||| |||| || |||||||| |||| ||||    
T  27329 catctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgccttcagaagcacttctcttcagatgcttcaagc 27232  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgt 356  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27231 ttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttatttcagaacctatttaagatgt 27175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 5)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 367
Target Start/End: Original strand, 19043 - 19426
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  19043 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatccttccaaaatagcc 19142  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  19143 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatcacctgatgaaatagagc 19242  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcacca-----------------cctcgagagcactttttcttcaggagcaattttc 283  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |                 | || |||||||||| | |||||||||| |||||    
T  19243 ttctggtgatcttcaacttctgataaacttgcttctgatgacgacacaacttcaggagcactttgtcttctagagcactttgtgttcaggagcagttttc 19342  T
Q  284 ttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgt 367  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19343 ttcagatgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctctattgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgt 19426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 9571 - 9845
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| | |||| |||| || |||| |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  9571 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcctttcaaaatagt 9670  T
Q  101 cgttgcttcacttt-tcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |  ||    
T  9671 cgttgctatactttcccagtcttctgcaat-cttagacaagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcag 9767  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| |||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  9768 cttctggtgattcacagcttatgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcatgagcactttgtcttcaggagca 9845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22231 - 21992
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||| || |||||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||  ||||    
T  22231 agagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgccttccaatccttcaaagatagt 22132  T
Q  101 cgttgcttcactt-ttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  |||| | ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||||| |||||| |||||||  |||||||| || ||||| || |     
T  22131 cgttgctatacttctccagtcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaaacaacttttgaacctttaag--ttgcatcttctaatgaactacaa 22034  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22033 cttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatga 21992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21832
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgat 314  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  | ||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||    
T  21987 gcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggtgcactttgtcttcaggagcagtattcttcagacattttaagcttcactttttgttgat 21888  T
Q  315 tcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
       |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21887 gtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatttttgtct 21832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 365
Target Start/End: Original strand, 9865 - 9953
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9865 ttttcttctgacgctttaagcttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaattttt 9953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5040 - 4687
Alignment:
Q  8 tggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgct 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5040 tggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgct 4941  T
Q  108 tcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttgg 206  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  4940 tcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactagagcttctgg 4841  T
Q  207 tgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgc 292  Q
    |||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||    
T  4840 tgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgc 4741  T
Q  293 tttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctt 346  Q
    || || ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4740 ttcaaacttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctt 4687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22687 - 22923
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22687 agagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 22786  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  22787 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacag 22886  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttct 236  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22887 cctctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttct 22923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 22952 - 23054
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22952 cttcaggagtagttctcttcagacgctttaagcttcatttttgttgattcttttgctctctattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatttttg 23051  T
Q  367 tct 369  Q
    |||    
T  23052 tct 23054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18720 - 18340
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18720 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 18621  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |  |||    
T  18620 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcctgatgaactgcagc 18521  T
Q  201 ttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || ||||||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || |||||    
T  18520 ttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcaggagcacttctcttc 18421  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgt 367  Q
    ||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  18420 agatgcttcaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaaaacctaataaagatatcaaatttttgt 18340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21071 - 20692
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |       
T  21071 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatgac 20972  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  |     
T  20971 cgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcaa 20872  T
Q  200 cttttggtgatcttcagc--------------ttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    ||||||||||||||||||              |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  ||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  20871 cttttggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactattacttcaggagcacttctctt 20772  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  20771 cagacgcttcaaacttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaattttt 20692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Original strand, 12221 - 12604
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||     
T  12221 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaattctttcaaaatagtt 12320  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||    
T  12321 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtctcctgatgaactagagc 12420  T
Q  201 ttttggtgatcttca--------------gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttctt 285  Q
    || |||||||| |||              ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  |||||||||| |||||||||| | |||| ||    
T  12421 ttctggtgatcctcaacttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcagctcaggagcacttttatcttcaggagaacttttatt 12520  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    || | |||| |||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12521 caaatgcttcaagcttcctttttgttgattccattactctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 12604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 755 - 406
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  755 agagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 656  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||  |||| | | |||||||||||||  |||||||||| |||||          
T  655 cgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaa------ 564  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
               || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  563 -----------ctgcaccttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 475  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  474 ttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1855 - 1496
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||         ||||| |||     
T  1855 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcatt---------tcaaaatagc 1765  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||   ||||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||| |  |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||    
T  1764 cgttgccatacttttccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgtag 1668  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| ||||||    |||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  1667 cttctggtgaaacacagcttttggtgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttctgtagcagttttcttcagacactttaagc 1568  T
Q  300 ttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| || | ||||||    ||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  1567 ttccctttttgttgatgtacttgctctttatttgttcttccaagaccaatttaagatatcaaaattttgtct 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 345
Target Start/End: Original strand, 39489 - 39781
Alignment:
Q  54 tctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatt 152  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39489 tctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccatt 39588  T
Q  153 gaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacct 252  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  || |    
T  39589 gaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgtcgttatgactt 39688  T
Q  253 cgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39689 caagagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 39781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 345
Target Start/End: Original strand, 137549 - 137841
Alignment:
Q  54 tctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatt 152  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  137549 tctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccatt 137648  T
Q  153 gaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacct 252  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  || |    
T  137649 gaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgtcgttatgactt 137748  T
Q  253 cgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  137749 caagagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 137841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 159068 - 159242
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||||| | ||  || ||| ||    
T  159068 agtagtagaggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaattcatttgaattagccg 159167  T
Q  103 ttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 177  Q
    |||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  159168 ttgcttcactcttctgatcttttgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtct 159242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 37413 - 37463
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaac 51  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37413 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 135473 - 135523
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaac 51  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  135473 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 369
Target Start/End: Original strand, 143130 - 143484
Alignment:
Q  32 tacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatg 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  143130 tacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatccttccaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 143229  T
Q  131 cttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaactt 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  143230 ctttgacgagattaaatccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgcatctcgtgatgaaatagagcttctagtgatcttcagcttctgatgaactt 143329  T
Q  231 gcttctaatgacgtcaccacctc--ga--------------gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgat 314  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||  ||              ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  143330 gcttctgatgatgtcagcacttcaggagcactttgcttcaggagcactttgtcttcaagagcagttttcttcagacgctttaagcttcctttttcttgat 143429  T
Q  315 tcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  143430 tcctttgctctctattgttcttccagaacctttttaatatgtcaaatttttgtct 143484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 59041 - 59008
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  59041 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 59008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5789 - 5408
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||      
T  5789 gagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcatatcctttcaaaatagat 5690  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    |||||| |||| || || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  5689 gttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 5590  T
Q  201 ttttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcag 288  Q
    ||  |||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  5589 ttcaggtgatcttgcttctagtgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcacttctcttcag 5490  T
Q  289 acgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctc-tattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5489 acgcttcaaggttccttttagttgattcatttgctctcattttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaatttttgtct 5408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 345
Target Start/End: Original strand, 487 - 845
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  487 gagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 586  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |  |||    
T  587 gttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagc 686  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatg--------------aacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    || ||||||||||||||||||||||              ||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||  ||||| ||||| || |||||    
T  687 ttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcattttgacttcaagagcacttctcttc 786  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  787 agatgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgtttttccagaacct 845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 212365 - 212747
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcc-tttcaaactag 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||    
T  212365 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaaatag 212464  T
Q  100 tcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |    
T  212465 ttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaagttta 212564  T
Q  199 gcttttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
    |||| || |||||||              ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||  |||||||||  ||||||||||| || |||||    
T  212565 gcttctgatgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttc 212664  T
Q  287 agacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||| || |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  212665 agacgtttcaagcttcctttttgttgattccttagctctcttttgttcttccagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 212747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6239 - 5949
Alignment:
Q  60 aagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaa 158  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  6239 aagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatctattgaacat 6140  T
Q  159 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctg---------atgaacttgcttctaatgacgtcacca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||| |||||||||||||||         |||||| ||||||| ||||| | | ||    
T  6139 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatgcttcttatgaacctgcttctgatgactttatca 6040  T
Q  250 cctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttcca 339  Q
    | ||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||| ||| || ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6039 cttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttcgcttcagatgcttcaagttttctttttgttgatttctttgctctcttttgttcttcca 5949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 246193 - 246072
Alignment:
Q  154 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctc 253  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  | ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  246193 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 246096  T
Q  254 gagagcactttttcttcaggagca 277  Q
      ||||||||| ||||||||||||    
T  246095 aggagcactttgtcttcaggagca 246072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 246064 - 246028
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  246064 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcc 246028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36875 - 36493
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36875 agagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagt 36776  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||    
T  36775 cgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcag 36676  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctg--------------atgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    ||| | ||||||||| |||||||              |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||| | | ||| |||| || || ||||    
T  36675 cttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tatactttaggatcacttctctt 36577  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| |||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36576 cagatgcttcaagcttccttttatttgattccattgctctcttttgttcttccataacctatttaagatgtcaaatttttgtct 36493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 42130 - 42512
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42130 agagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagt 42229  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||    
T  42230 cgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcag 42329  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctg--------------atgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttctt 285  Q
    ||| | ||||||||| |||||||              |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||| | | ||| |||| || || ||||    
T  42330 cttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tatactttaggatcacttctctt 42428  T
Q  286 cagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||| |||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42429 cagatgcttcaagcttccttttatttgattccattgctctcttttgttcttccataacctatttaagatgtcaaatttttgtct 42512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 369
Target Start/End: Original strand, 60036 - 60409
Alignment:
Q  10 gagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttc 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  60036 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 60135  T
Q  110 actttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtg 208  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||| |||||    
T  60136 acttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactttagcttctggtg 60235  T
Q  209 atctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgcttt 295  Q
    |||||              |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  60236 atcttgcttcttatgagatgcttctaatgaacttgcatctgatgacgtcatcacatcaggagcacttttgtcttcaagagcatttctcttcagacgcctt 60335  T
Q  296 aagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | | ||||||||| ||||||||    
T  60336 aagcttcatttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacctaataatgatgtcaaatttttgtct 60409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 345
Target Start/End: Original strand, 7940 - 8266
Alignment:
Q  4 gtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  7940 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaatcctttcaaaatagtcgt 8039  T
Q  104 tgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagctt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||             
T  8040 tgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctgatgaa--------- 8130  T
Q  203 ttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt 301  Q
            ||| |||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8131 --------ctttagcttctggttatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacgccttaagctt 8222  T
Q  302 ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
     ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8223 actttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 8266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 151908 - 151794
Alignment:
Q  63 aacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacct 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||  || ||| ||||| ||||| |||| | |||||| |||| || ||  | |||||||||| |||||||||||    
T  151908 aacaagcatctaatgccttcaaattcatttgaattagccgttgtttcacgtttctggtcttctacaatact-aggtgtgattaaatcctttgaacaacct 151810  T
Q  162 ttgaagctttaagtct 177  Q
    ||||||||||||||||    
T  151809 ttgaagctttaagtct 151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26074 - 25849
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26074 gagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtc 25975  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |  |||    
T  25974 gttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagc 25875  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  25874 ttctggtgatcttcagcttctgatga 25849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 44782 - 44652
Alignment:
Q  23 tacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactttt-cagtct 121  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44782 tacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttccagtct 44683  T
Q  122 tctgcaatgcttagacgagattaaatccatt 152  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44682 tctacaatacttagacgagattaaatccatt 44652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25811 - 25733
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25811 cttcaggagcacttctcttcagacgccttaatcttcctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 25733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Original strand, 103585 - 103950
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||| ||| ||    
T  103585 agtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttaatatcatttcaaaatagccg 103684  T
Q  103 ttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  103685 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 103784  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
    | |||||  |||  |||||||||| |  | ||||| ||||||||| ||| |    ||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||| |||||    
T  103785 tctggtgtcctt--gcttctgatg-agatacttctgatgacgtcatcactttagtagcacttttgtcttcaggagcgcttctcttcagatgcttcaagct 103881  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||  | |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  103882 tcctatttgttgattcatttgctctcttttgttctttcagaacctttttaagatgtcaaatttttgtct 103950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 8)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 377658 - 377293
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  377658 gagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaatatagtc 377559  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  377558 gttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactataac 377459  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt--tttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaag 298  Q
    || |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||    ||   ||   ||  || |  |  ||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  377458 ttctggtgatcttcagcttctgatg-agatgcttctgatga----acttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactactcttcagacactttaag 377364  T
Q  299 cttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  377363 cttccttttagttgattccttagctctcttttgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 220250 - 220474
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||| ||||| ||||||| | ||  || ||| |    
T  220250 gagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgc-ttcaaattcatttgaattagcc 220348  T
Q  102 gttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |  |||    
T  220349 gttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatctcctgatgaacttcagc 220448  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  220449 ttctggtgatcttcagcttctgatga 220474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 211409 - 211583
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||| || |||||||| |||| ||||    
T  211409 agagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcattaaaatccttacaaaatagt 211508  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaag 174  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  211509 cgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag 211583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 244384 - 244219
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| |||| |||| |||||||||||||  || ||||    
T  244384 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattagt 244285  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaa 166  Q
     ||||||||||| |||  ||||||||||| ||  || || |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  244284 tgttgcttcactcttctggtcttctgcaacgc-caggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaa 244219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30689 - 30612
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30689 cttcaggagcaattt-cttcagacgtcttaagcttccattttgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 30612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 326
Target Start/End: Original strand, 220478 - 220587
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||  ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  220478 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcaggagcacttga-cttcaggagcacttttcttcagacgcttcaaggttcctttttgttgatt 220576  T
Q  316 cctttgctctc 326  Q
    || | ||||||    
T  220577 ccatagctctc 220587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 244118 - 243995
Alignment:
Q  221 tgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattccttt 320  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  ||||||||   |||||| | |  ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||    
T  244118 tgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcatgagcacttga-cttcagaacctcttttcttcagatgcttcaagcttccttcttgttgattccatt 244020  T
Q  321 gctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||   ||||||||||| |||||    
T  244019 gctctaatttgttcttccagaacct 243995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 276
Target Start/End: Original strand, 211648 - 211696
Alignment:
Q  228 cttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  211648 cttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagc 211696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 365
Target Start/End: Original strand, 1673 - 2020
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||  || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1673 agtagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcg 1772  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||            
T  1773 ttgtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa-------- 1864  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcacttt-ttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagct 300  Q
             |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| |||  |||||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  1865 ---------cttcagcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcattttagtcttcaggagcacttctctgcagatgctttaagct 1955  T
Q  301 tccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| || |||| ||||    
T  1956 tcctttttattgattcctttgctctcttttgttcttccaggacctatttaagttgccaaattttt 2020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10208 - 9981
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10208 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 10109  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  10108 cgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttca 10009  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  10008 gcttctggtgattttcagtttctgatga 9981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9956 - 9857
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttg 366  Q
    ||||||||||| || |||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  9956 cttcaggagcacttctcttcatattcttcaagcttcctttttgttgattccattgctctcttttgttcttccagaa-ctatttaagatgtcaaatttttg 9858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 14872 - 14816
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctt 57  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14872 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 14816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 14660 - 14883
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  14660 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 14759  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |  |||    
T  14760 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatttcctaatgatttttagc 14859  T
Q  201 ttttggtgatcttcagcttctgatga 226  Q
    || ||||||||||  |||||||||||    
T  14860 ttctggtgatctt--gcttctgatga 14883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 345
Target Start/End: Original strand, 14901 - 15031
Alignment:
Q  215 agcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgat 314  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||  |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| || | ||||||    
T  14901 agcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcgtcacttcatgagcactttgacttaaggagcacttctcttcagacactttaagcttcatttttgttgat 15000  T
Q  315 tcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  15001 tccttcgctctcttttgttcttccagaacct 15031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 336
Target Start/End: Original strand, 15130 - 15446
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15130 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcg 15229  T
Q  103 ttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
     ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |            
T  15230 atgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgca-------- 15321  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt 301  Q
             ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15322 ---------cttcatcttctggtgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac-ttgacttcaggagcacttctcttcagacgctttaagctt 15411  T
Q  302 ccttatagttgattcctttgctctctattgttctt 336  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15412 cctttttgttgattccttagctctcttttgttctt 15446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19571 - 19191
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||     
T  19571 gagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcctttcaaaatagtt 19472  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagc 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  19471 gttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaactacaac 19372  T
Q  201 ttttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcag 288  Q
    || ||||||||||              ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||  |||||| ||  ||||||||||| || |||||||    
T  19371 ttctggtgatcttgcttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttcaggagcac-ttgacttcaggagcacttctcttcag 19273  T
Q  289 acgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||| |||||||| || | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  19272 acgcttcaagcttccttttttgttgactccttagctctcttttgttcttccataacctaataaagatatcaaatttttgtct 19191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 99305 - 99069
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||  |||||||||| || |||| ||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  99305 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcagcg--ctttgaagaataagcatccaatgccttgtaatccttccaaaatagt 99208  T
Q  101 cgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  ||||||| | || |||||||   ||||||||| || ||||| || |||| | |||||||||||||||  ||||  |||| ||||| || |     
T  99207 cgttgctatacttttccggtcatctgcaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt--tgcacttcctgatgaactacaa 99111  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  99110 cttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatga 99069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 98992 - 98896
Alignment:
Q  271 aggagcaattttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||   |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  98992 aggagcagttttcttcagaagctttaagcttcactttttgtcgatgtatttgctctttacttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaattttt 98896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Original strand, 1703 - 1893
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1703 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 1802  T
Q  103 ttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatga 192  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1803 ttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatttcctaatga 1893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 339
Target Start/End: Original strand, 1943 - 2067
Alignment:
Q  215 agcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgat 314  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || | ||||||    
T  1943 agcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacactttaagcttcatttttgttgat 2042  T
Q  315 tcctttgctctctattgttcttcca 339  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||    
T  2043 tccttcgctctcttttgttcttcca 2067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 9980 - 10326
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||  ||||  || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9980 agagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagt 10079  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |     
T  10080 cgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcaa 10179  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||                 ||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  10180 cttcttgtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatca-----------------cttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 10260  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||| |  ||||||| || | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10261 ttcctttttattgattctttagatctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaattttt 10326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 78464 - 78082
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78464 agtagtgtaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 78365  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||  | || | | ||||||||||||||   |||||||| | ||||| || ||||    
T  78364 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagctttaag--ctgcatctcatgatgaactacagct 78267  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt-----------------tttcttcaggagcaattttct 284  Q
    | |||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||  ||||||||                 | |||||||||||| ||||||    
T  78266 tctggtgattctcagattctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactatatcttcaggagcagttttct 78167  T
Q  285 tcagacgctttaagc-ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  78166 tcagacgctttaatctttcctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagatctttttaagatgtcaaa-ttttgtct 78082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 215597 - 215358
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  215597 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagc 215498  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||||||  ||||||||||| || || |  ||    
T  215497 cgttgcttcacttttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatctcctgataaactgcag 215400  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  215399 cttctggtgattttcggcttctgataaacttgcttctgatga 215358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 261 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 215306 - 215198
Alignment:
Q  261 ctttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaa 359  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  215306 ctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagatctttttaagatgtcaa 215207  T
Q  360 agttttgtct 369  Q
    | ||||||||    
T  215206 a-ttttgtct 215198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 553
Alignment:
Q  60 aagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaa 158  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  827 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacag 728  T
Q  159 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatctt------------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 246  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727 tctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 628  T
Q  247 ccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattccttt 320  Q
     ||| ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  627 tcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttcagacactttaagcttcctttttgttgattccttt 553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6840 - 6601
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6840 agagtactggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagt 6741  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  6740 cggtgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacag 6643  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6642 cttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatga 6601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6528 - 6425
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  6528 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatatcaaattttt 6429  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  6428 gtct 6425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 339
Target Start/End: Original strand, 30294 - 30584
Alignment:
Q  60 aagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaa 158  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  30294 aagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatctattgaacat 30393  T
Q  159 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctg---------atgaacttgcttctaatgacgtcacca 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||| |||||||||||||||         |||||| ||||||| ||||| | | ||    
T  30394 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatgcttcttatgaacctgcttctgatgactttatca 30493  T
Q  250 cctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttcca 339  Q
    | ||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||| ||| || ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30494 cttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttcgcttcagatgcttcaagttttctttttgttgatttctttgctctcttttgttcttcca 30584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 9916 - 10088
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||  || ||||||    
T  9916 agtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaattcatttgaattagtcg 10015  T
Q  103 ttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagt 175  Q
    ||| | |||| ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  10016 ttgttgcactcttctgatcttctgcaatgc-tagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagt 10088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 60814 - 61200
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| |||     
T  60814 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttccaatccttccaaaatagc 60913  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||| || |     
T  60914 cgttgctatacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaagt--tgcatctcctgatgaactacaa 61011  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttctt-----------------caggagcaatttt 282  Q
    ||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||                 |||||||| ||||    
T  61012 cttctggtgattctcaacttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtctttaggagcgctttatcttcaggagcagtttt 61111  T
Q  283 cttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| | ||||||   |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  61112 cttcagatgctttaagctccactttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatttttgtct 61200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Original strand, 13583 - 13739
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  13583 gagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 13682  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca 157  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13683 gttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca 13739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 345
Target Start/End: Original strand, 13835 - 13981
Alignment:
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgcttta 296  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  13835 agcttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatgacatcattacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctcttctgacgcatta 13932  T
Q  297 agcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13933 agcttccttttcgttgattcctttgctctcttttgttcttccagaacct 13981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 6018 - 6351
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||    
T  6018 agagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagt 6117  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
     ||||||||  | |||  |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||  ||||| || ||||| |  |     
T  6118 tgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatcttctgatgaacttcaa 6216  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagc 299  Q
    ||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  6217 cttctagtgatatt--gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggaacac-ttgacttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagc 6313  T
Q  300 ttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  6314 ttccttcttgttgattccattgctctcatttgttcttc 6351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10187
Alignment:
Q  20 ttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcact-tttcag 118  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||  |    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttgg 9924  T
Q  119 tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatctt----- 213  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  ||||| ||||||||||         
T  9925 tcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatcttgctta 10024  T
Q  214 -------cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcctta 306  Q
             ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||  |||||| |||| || |||||||| |||| ||||||||||     
T  10025 tgatgagatgcttctgattaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcagaagcatttctcttcagatgcttcaagcttccttt 10124  T
Q  307 tagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    | ||||||||| || |||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  10125 ttgttgattccattcctctcttttgttctttcagaacctattgaagatatcaaatttttgtct 10187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 15805 - 16130
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaatt-gtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || |    
T  15805 gagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaagtcctttcaaaataat 15904  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaa-cctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaataga 198  Q
     | |||||||||  ||  ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  15905 tggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttta 16004  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttt-tcttcaggagcaattttcttcagacgctttaa 297  Q
    |||| || |||  |   | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||  ||||||||||  |||||||||||  | |||||||| |||| ||    
T  16005 gcttctgatgagat---ggttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcatgagcacttttgacttcaggagcacatctcttcagatgcttcaa 16101  T
Q  298 gcttccttatagttgattcctttgctctc 326  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  16102 gcttcctttttgttgattccttagctctc 16130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5700 - 5459
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  5700 agtagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 5601  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatga--aatag-a 198  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||||| |||||| ||||||   |||||||| || ||||  |  || |    
T  5600 ttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaatctttaa--attgcatcttctgatgaacagcagca 5503  T
Q  199 gcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgac 242  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5502 gcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgac 5459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5416 - 5303
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5416 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcaaacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttccaagacctttttaaaat 5317  T
Q  355 gtcaaagttttgtct 369  Q
     ||||| ||||||||    
T  5316 atcaaa-ttttgtct 5303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 276
Target Start/End: Original strand, 9168 - 9439
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  9168 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaatccttccaaaatagtcg 9267  T
Q  103 ttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagct 201  Q
    |||||  |||||| || ||||||||||| ||| || ||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || | ||    
T  9268 ttgctatacttttccaatcttctgcaat-ctttgatgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaact 9364  T
Q  202 tttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    | |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  || ||  ||||||||| |||||| ||||    
T  9365 tctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatggcgtcattacttcaggagcactttgtcttcatgagc 9439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 369
Target Start/End: Original strand, 9537 - 9577
Alignment:
Q  329 ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9537 ttgttctttcaagacctttttaagatgtcaaatttttgtct 9577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 3315 - 3554
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  3315 agagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatccttccaaaatagc 3414  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||| |  |||||| || |||||||||||  ||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  3415 cgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactatag 3512  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatga 241  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3513 cttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatga 3554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 3616 - 3731
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaaga 353  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||   |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3616 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacactttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaatacctttttaaga 3715  T
Q  354 tgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| ||||||||    
T  3716 tgtcaaatttttgtct 3731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Original strand, 3559 - 3619
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagc 276  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  3559 gcttctgatgaccttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagc 3619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 118 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5922 - 5673
Alignment:
Q  118 gtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttt-gaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcag 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||| ||    
T  5922 gtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctggtgatctttag 5823  T
Q  217 cttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattc 316  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||  || |    ||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||    
T  5822 cttctgatgaacttacttctgaagacgtcattactttagaagcac-ttcacttcatgagcacttttcttcagatgcttcaaacttcctttttgttgattc 5724  T
Q  317 ctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgt 367  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  5723 cttagctctcttttgttcttccagaacctaataaagatatcaaatttttgt 5673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1799 - 1608
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  1799 agagcagtgaaggtagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcatccagtgccttcaaatcctttcaaaatagt 1700  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaa 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  1699 cgttgcttcacttttcaagtcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttgcatctcctgatgaa 1608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 257 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 328
Alignment:
Q  257 agcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgt 356  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  439 agcactttgccttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcctttttattgattcatttgctctttgttgttcttccaaaacctttttaagatgt 340  T
Q  357 caaagttttgtct 369  Q
    |||| ||||||||    
T  339 caaa-ttttgtct 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 515 - 463
Alignment:
Q  198 agcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccac 250  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  515 agcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccac 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4980 - 4872
Alignment:
Q  113 tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||    
T  4980 tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaattaaaacttttggtgatct 4881  T
Q  213 tcagcttct 221  Q
     ||||||||    
T  4880 ccagcttct 4872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4829 - 4759
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttc 337  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||    
T  4829 cttcaggagcacttctcttcagacgctttaagcttcctttttgttgattcctttgctcccttttgttcttc 4759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7256 - 7022
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||| | ||||||||| || |||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||    
T  7256 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgttgtttgaagaataagcatccaatgctttccaatccttccaaaatagt 7157  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||| | || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  7156 cgttgctatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacag 7059  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttct 236  Q
    ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  7058 cttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttct 7022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6958 - 6853
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgcttt-aagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtt 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||   |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  6958 cttcaggagcagttttcttcagacgcttttaagcttccctttttgttgatgtgtttgctctttatttgttcttccaagacctttttaagatgtcaaatat 6859  T
Q  364 ttgtct 369  Q
    ||||||    
T  6858 ttgtct 6853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17865 - 17600
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||         ||||| |||     
T  17865 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgcctt---------tcaaaataga 17775  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||| | |||||||||||||||  || ||||||| ||||| |  ||    
T  17774 cgttgctatacttttgtagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgtatctcctgatgaattgaag 17678  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  || |||||| ||||||||||||    
T  17677 cttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcactttgtcttcaggagca 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 9968 - 10144
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||| | ||  || ||| |    
T  9968 gagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaattcatttgaattagcc 10067  T
Q  102 gttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacc-tttgaagctttaagtct 177  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10068 gttgcttcactcttatggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtct 10144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 305
Target Start/End: Original strand, 10229 - 10267
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcctt 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10229 cttcaggagcacttttcttcagacgcttcaagcttcctt 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23546 - 23362
Alignment:
Q  116 cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttca 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||| |||||||   ||    
T  23546 cagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcaca 23450  T
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23449 gcttctgatgaacttgcttttgatgacgttatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcc 23362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25499 - 25384
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||||| ||  ||| |||||| |  |||||||||||| ||||    
T  25499 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataactatccaatgcccttcaatcctttcaaaatagt 25400  T
Q  101 cgttgcttcacttttc 116  Q
    |||||||  |||||||    
T  25399 cgttgctatacttttc 25384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 15839 - 15811
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacactt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15839 agagtagtggagatagtggttgtacactt 15811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 65485 - 65254
Alignment:
Q  44 ttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagat 142  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  65485 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaatagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 65387  T
Q  143 taaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgac 242  Q
    | ||||| |  || | | |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  65386 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgac 65289  T
Q  243 gtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
     ||| ||| || ||||||| || ||||||||||||    
T  65288 atcatcacttcaagagcacgttgtcttcaggagca 65254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 144530 - 144334
Alignment:
Q  44 ttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagat 142  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |  ||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  144530 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaacagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 144432  T
Q  143 taaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgac 242  Q
    | ||||| |  || | | |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  144431 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgac 144334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 165046 - 164940
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  165046 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagt 164947  T
Q  101 cgttgct 107  Q
     ||||||    
T  164946 tgttgct 164940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 65234 - 65142
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||||    
T  65234 ttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagaccatttcaagatgccaaatttttgtct 65142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 135213 - 135109
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttt 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||   |||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||    
T  135213 cttcaggagcagttttcttcagacgttttaagcttccctttttcttgatgtatttgctctttatttgttcttccaataccatttcaagatgccaaatttt 135114  T
Q  365 tgtct 369  Q
    |||||    
T  135113 tgtct 135109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1619 - 1452
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||  || ||||||    
T  1619 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaaatagtcg 1520  T
Q  103 ttgcttcact-tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 170  Q
    ||||||||||  |  ||||||||||||||  | | || |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1519 ttgcttcactcctatagtcttctgcaatg-atgggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagctt 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8217
Alignment:
Q  21 tgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactttt-cagt 119  Q
    |||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||  |  |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagt 8062  T
Q  120 cttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagctt 219  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||   ||||      
T  8063 cttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttacatcttctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcca 8159  T
Q  220 ctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  8160 ctgatgtacgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 162 - 265
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  162 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcccttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagaccattttaagttgtcaaattttt 261  T
Q  366 gtct 369  Q
    ||||    
T  262 gtct 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 369
Target Start/End: Original strand, 8237 - 8328
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  8237 ttttcttcagacgctttaagcttcccttttgttgatgtatttgctctttatttgttcttccaagaccattttaagttgtcaaatttttgtct 8328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 277
Target Start/End: Original strand, 1 - 154
Alignment:
Q  121 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttc 220  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||| | |||||||||||||||  | ||||| || ||||| |  ||||| |||||||   ||||  |    
T  1 ttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tacatcttctgatgaactgcagcttctggtgattcacagccac 97  T
Q  221 tgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  98 tgatgtacgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1585
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagat 354  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  1698 gagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttccctttttgttgattcctttgctctttattgttcttctaagacctttttaagat 1599  T
Q  355 gtcaaagttttgtct 369  Q
     ||||| ||||||||    
T  1598 atcaaa-ttttgtct 1585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 5)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34904 - 34638
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||         | ||||||| || |    
T  34904 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catttcaaaatatt 34814  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaaatagag 199  Q
    ||||||   |||||| ||||||||||||||   ||| |||| || ||||| |  |||||| |||||| |||||||  ||||||||||| | ||| |  ||    
T  34813 cgttgccatacttttccagtcttctgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaaactttaag--ttgcatctcctgaagaactgcag 34716  T
Q  200 cttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||| | |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  34715 cttctagtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 34638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36281 - 36115
Alignment:
Q  4 gtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||   | ||| || |||| |||||||| ||| || ||  || |||| ||    
T  36281 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccatttgaaatagttgt 36182  T
Q  104 tgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 170  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36181 tgcttcattcttccagtcttctgcaatgat-agacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagctt 36115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25545 - 25484
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  25545 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 25484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 25765 - 25688
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgc 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| | ||||||||| || |||| |||||    
T  25765 agagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctttttgaagaataagcatccaatgc 25688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25476 - 25440
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 25440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44019 - 43843
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||||| ||||  | |||||  |||| |||||||||||||| |||  || |||     
T  44019 agagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaatctttttgaattagc 43920  T
Q  101 cgttgcttcacttttcag-tcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 177  Q
    | |||||||||| ||| | |||||||||||| |||| || |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  43919 ctttgcttcactcttctgatcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtct 43843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 43775 - 43652
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||   |||||| | |  ||||||||||| |||| |||||||||| | | |||||    
T  43775 gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcacttgaacttcagaacctcttttcttcagatgcttcaagcttccttcttgctgatt 43676  T
Q  316 cctttgctctctattgttcttcca 339  Q
    || |||||||   |||||||||||    
T  43675 ccattgctctaatttgttcttcca 43652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 40648 - 40817
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  |||||| | ||||  |||||||||||| ||||  || |||     
T  40648 agagtagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattcttttgaattagc 40747  T
Q  101 cgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 170  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  | |||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  40748 cgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctt 40817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15722 - 15617
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||| | ||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15722 agagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagc 15623  T
Q  101 cgttgc 106  Q
    ||||||    
T  15622 cgttgc 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9195 - 9098
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagtttt 365  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  9195 cttcaggatcacttctcttcagacgcttcaagcttcctttt-gttgattcatttgctctcttttgttcttccagaacctatttaagatgtcaaattttt 9098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 348
Target Start/End: Original strand, 35403 - 35578
Alignment:
Q  177 ttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagag-cactttttcttcaggag 275  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||    
T  35403 ttgcatcttctgatgaattgtagcttctagtgatatacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc-agaggcactttgtcttcaggag 35501  T
Q  276 caatttt---cttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttt 348  Q
    || ||     ||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  35502 cacttcaaaacttcagatgctttaggcttctctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacctttt 35578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 38185 - 38080
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    |||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38185 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagt 38086  T
Q  101 cgttgc 106  Q
    | ||||    
T  38085 cattgc 38080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 74594 - 74682
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatccttt 91  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  74594 agtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaatccttt 74682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Original strand, 74855 - 74933
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||| | |||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||    
T  74855 cttcaggagcacttttcttcagatgcttcaacctttcttcttgttgattccactgctctcgtttgttcttccagaacct 74933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 173
Target Start/End: Original strand, 74718 - 74751
Alignment:
Q  140 gattaaatccattgaacaacctttgaagctttaa 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  74718 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa 74751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 7195 - 7310
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc-ttatagttgattcctttgctctctatt-gttcttccaaaacctttttaaga 353  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||   |||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7195 gagcactttgtcttcagtagcagttttcttcagatgctttaagcttcccttttggttgatgtatttgctccttatttgttcttccaagacctttttaaga 7294  T
Q  354 tgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| ||||||||    
T  7295 tgtcaaatttttgtct 7310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 1328 - 1410
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttca 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||  || || || |||||||||||||||    
T  1328 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 83 - 1
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttca 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||  || || || |||||||||||||||    
T  83 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2090 - 2029
Alignment:
Q  6 agtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaa 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  2090 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaa 2029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2723 - 2443
Alignment:
Q  89 tttcaaactagtcgttgcttcacttttc-agtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 187  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||  |||| |||| || ||||| |  |||| | |||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  2723 tttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatt-ttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaaactttaggt--tgcatttcct 2627  T
Q  188 catgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactt-tttcttcaggagcaattttcttc 286  Q
     ||||| |  || || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||    |||||| |||| ||||||||    
T  2626 gatgaactgcagtttctggtgatttacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttcagacttcagaagcagttttcttc 2527  T
Q  287 agacgctttaagctt-ccttatagttgattcctttgctctcta-ttgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||||||| ||| |||| | ||||||    ||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2526 agacgctttaatcttccctttttgttgatgtacttgctctatatttgttcttccaagaccaatttaagatgtcaaa-ttttgtct 2443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 2791 - 2740
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacg 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  2791 agagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacg 2740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2830 - 2702
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||||| |  |||| ||||| ||| || |||| |||| ||||    
T  2830 agagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaatacgcatccaatgctttccaa-ccttccaaaatagt 2732  T
Q  101 cgttgcttcactttt-cagtcttctgcaat 129  Q
    ||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  2731 cgttgcaatacttttccagtcttctgcaat 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17593 - 17526
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17593 ttttcttcagatgctttaggtttctcttcttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 17526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1803
Alignment:
Q  3 agtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaa 95  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| || |   |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1895 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 60799 - 60602
Alignment:
Q  170 ttaagtcttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttctt 269  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||  ||| ||  |||||||    |||    
T  60799 ttaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttgtggtgatcttcagcttctaatgagat-gcttctgatgacgtcctcacttcaggagcactaaa-ctt 60702  T
Q  270 caggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||  || || ||||| || |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  60701 caggagcacttctcttcagacgcttcaagcttcctttttgttgattccttagcttcctttttttctttcagaacctaataaagatatcaaatttttgtct 60602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 5639 - 5767
Alignment:
Q  2 gagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaacaaacatctaatgccttcaaatcctttcaaactagtc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||   ||||| || |||| ||||||||||||| | ||  || |||||    
T  5639 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-ttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaattcatttgaaatagtc 5737  T
Q  102 gttgcttcacttttc-agtcttctgcaatg 130  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  5738 gttgcttcattcttctagtcttctggaatg 5767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11380 - 11321
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttttaagatgtcaaagttttgtct 369  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11380 gttgatttctttgctctttattgttcttccaagacctttttaagatatcaaa-ttttgtct 11321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 7392 - 7451
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttga 60  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  7392 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttga 7451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 277
Target Start/End: Original strand, 8511 - 8569
Alignment:
Q  219 tctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  8511 tctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 8569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 303
Target Start/End: Original strand, 8565 - 8612
Alignment:
Q  256 gagcactttttcttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8565 gagcactttaacttcaggagcagttttcttcagacactttaagcttcc 8612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3677 - 3608
Alignment:
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttt 348  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3677 tttcttcggatgctttaggcttctctttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacctttt 3608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 3995 - 3937
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttg 59  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  3995 agagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgctctttg 3937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Original strand, 7613 - 7682
Alignment:
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttt 348  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  7613 tttcttcagatgctttaggcttctctttttgttgattcctttgctctctttttttcttccaagacctttt 7682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 686
Alignment:
Q  214 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  718 cagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtca 686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 921 - 858
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaa 64  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||| |||||||||||    
T  921 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaa 858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 87420 - 87384
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  87420 cttcaggagcagttttcttcagacgctttaagcttcc 87384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 87700 - 87637
Alignment:
Q  1 agagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgatctttgaagaa 64  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||| |||||||||||    
T  87700 agagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaagaa 87637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 345
Target Start/End: Original strand, 9620 - 9687
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9620 ttttcttcagatgctttaggtttctcttcttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 9687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 481549 - 481510
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttt 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  481549 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacctttt 481510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 156420 - 156354
Alignment:
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||||||| |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  156420 tttcttcagatgctttaggtttctcttcttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 156354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 117621 - 117654
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  117621 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 117654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6318 - 6240
Alignment:
Q  267 cttcaggagcaattttcttcagacgctttaagcttccttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||| | |||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6318 cttcagaagcagatttcttcagatgctttaggtttctcttttgttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 6240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0774
Description:

Target: scaffold0774; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6097 - 6064
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6097 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 6064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 269 - 302
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  269 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 277
Target Start/End: Original strand, 11931 - 12031
Alignment:
Q  177 ttgcatctcctcatgaaatagagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctc-gagagcactttttcttcaggag 275  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||| ||||||| | || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  11931 ttgcatcttctgatgaactgtagcttctggtgatatacaacttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagag-gcactttgtcttcaggag 12029  T
Q  276 ca 277  Q
    ||    
T  12030 ca 12031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 338
Target Start/End: Original strand, 12052 - 12112
Alignment:
Q  279 ttttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttcc 338  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12052 ttttcttcagatgctttaggcttctctttttgttgattcctttcctctcttttgttcttcc 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Original strand, 20945 - 21014
Alignment:
Q  280 tttcttcagacgctttaagcttc-cttatagttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacctttt 348  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20945 tttcttcagatgctttaggcttctctttttgttgaattatttgctctctattgttcttccaagacctttt 21014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Original strand, 36060 - 36093
Alignment:
Q  312 gattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36060 gattcctttgctctctattgttcttccaagacct 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 938 - 999
Alignment:
Q  216 gcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcaccacctcgagagcactttttcttcaggagca 277  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||||    
T  938 gcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagca 999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Original strand, 5464 - 5500
Alignment:
Q  309 gttgattcctttgctctctattgttcttccaaaacct 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5464 gttgattcctttgctctcttttgttcttccaagacct 5500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University