View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4122_high_8 (Length: 302)

Name: NF4122_high_8
Description: NF4122
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4122_high_8
NF4122_high_8
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (59-302)||(12951-13194)
scaffold0138 (77-233)||(18121-18277)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (59-299)||(6520383-6520622)
chr8 (62-299)||(38855121-38855357)
chr8 (59-299)||(21285612-21285852)
chr8 (59-302)||(23760707-23760953)
chr8 (59-300)||(983268-983513)
chr8 (91-299)||(21673719-21673927)
chr8 (59-300)||(20498576-20498818)
chr8 (59-295)||(5866143-5866376)
chr8 (59-298)||(21491011-21491247)
chr8 (59-298)||(17140932-17141168)
chr8 (77-300)||(37116361-37116586)
chr8 (59-299)||(26355566-26355804)
chr8 (77-300)||(17266876-17267101)
chr8 (59-300)||(24353034-24353279)
chr8 (146-298)||(21249400-21249550)
chr8 (146-298)||(21255238-21255388)
chr8 (136-296)||(13508027-13508188)
chr8 (136-296)||(13597559-13597720)
chr8 (146-300)||(17439458-17439614)
chr8 (146-296)||(17612062-17612213)
chr8 (79-233)||(22364744-22364897)
chr8 (191-299)||(22626751-22626858)
chr8 (196-299)||(28649047-28649150)
chr8 (196-298)||(31971273-31971374)
chr8 (196-299)||(16092345-16092448)
chr8 (191-299)||(7372793-7372901)
chr8 (191-299)||(20536223-20536331)
chr8 (204-299)||(6759273-6759368)
chr8 (196-295)||(21395985-21396082)
chr8 (196-295)||(21790478-21790575)
chr8 (191-298)||(21918998-21919105)
chr8 (204-299)||(23406394-23406489)
chr8 (216-295)||(16199668-16199746)
chr8 (196-299)||(22875080-22875182)
chr8 (237-299)||(18818454-18818515)
chr8 (237-299)||(18879276-18879337)
chr8 (191-299)||(21923926-21924034)
chr8 (196-295)||(21389455-21389552)
chr8 (196-295)||(21778781-21778878)
chr8 (199-299)||(14409495-14409594)
chr8 (199-299)||(16413367-16413466)
chr8 (134-300)||(19154826-19154994)
chr8 (146-238)||(18862430-18862521)
chr8 (146-238)||(21383887-21383978)
chr8 (146-238)||(21387307-21387398)
chr8 (146-238)||(21411180-21411271)
chr8 (146-238)||(21805672-21805763)
chr8 (146-238)||(21827799-21827890)
chr8 (243-295)||(45131047-45131098)
chr8 (196-299)||(26219729-26219830)
chr8 (199-299)||(1484414-1484513)
chr8 (199-299)||(5853343-5853442)
chr8 (199-299)||(20046246-20046345)
chr8 (199-299)||(20403239-20403338)
chr8 (199-299)||(22001765-22001864)
chr8 (252-299)||(4542477-4542523)
chr8 (252-299)||(19896277-19896323)
chr8 (261-299)||(26225359-26225397)
chr8 (261-299)||(45290807-45290845)
chr8 (261-298)||(15070571-15070608)
chr8 (176-233)||(40492834-40492891)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (60-299)||(5990-6229)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (75-299)||(811013-811237)
chr7 (60-302)||(16219584-16219826)
chr7 (59-299)||(47831822-47832062)
chr7 (59-299)||(67760-67999)
chr7 (59-299)||(18005661-18005901)
chr7 (59-300)||(16056342-16056582)
chr7 (91-299)||(44014193-44014398)
chr7 (80-299)||(22072928-22073149)
chr7 (78-300)||(12901337-12901560)
chr7 (59-298)||(15754755-15754992)
chr7 (59-298)||(34200802-34201038)
chr7 (146-295)||(16495421-16495567)
chr7 (146-298)||(11995983-11996132)
chr7 (146-295)||(28505254-28505400)
chr7 (77-300)||(20220073-20220295)
chr7 (59-147)||(16324172-16324260)
chr7 (134-300)||(14044760-14044928)
chr7 (134-300)||(14354790-14354958)
chr7 (196-300)||(2280122-2280226)
chr7 (136-300)||(1867937-1868102)
chr7 (59-185)||(9389563-9389689)
chr7 (136-292)||(12255733-12255892)
chr7 (191-296)||(38227499-38227603)
chr7 (191-299)||(18456411-18456518)
chr7 (199-295)||(13647344-13647440)
chr7 (136-302)||(15008441-15008608)
chr7 (196-299)||(3564367-3564470)
chr7 (191-299)||(12698846-12698955)
chr7 (191-299)||(9509204-9509312)
chr7 (136-296)||(19486686-19486847)
chr7 (196-296)||(10063821-10063921)
chr7 (196-299)||(48273404-48273507)
chr7 (59-229)||(15113028-15113198)
chr7 (237-298)||(16386292-16386353)
chr7 (199-299)||(17061966-17062065)
chr7 (146-238)||(18426070-18426161)
chr7 (191-298)||(26212012-26212119)
chr7 (196-295)||(40443410-40443508)
chr7 (199-299)||(24275183-24275282)
chr7 (196-299)||(18430724-18430826)
chr7 (244-295)||(27847881-27847932)
chr7 (199-299)||(456333-456432)
chr7 (237-298)||(10589055-10589115)
chr7 (199-299)||(11393338-11393437)
chr7 (199-299)||(11972508-11972607)
chr7 (199-299)||(14949173-14949272)
chr7 (199-299)||(15376764-15376863)
chr7 (199-299)||(16213696-16213795)
chr7 (199-299)||(16232532-16232631)
chr7 (196-229)||(16324135-16324168)
chr7 (199-299)||(16410071-16410170)
chr7 (199-299)||(18640284-18640383)
chr7 (199-299)||(20385174-20385273)
chr7 (199-299)||(21189646-21189745)
chr7 (199-299)||(24702250-24702349)
chr7 (199-299)||(32125503-32125602)
chr7 (199-299)||(41522929-41523028)
chr7 (199-299)||(41525391-41525490)
chr7 (199-299)||(44116521-44116620)
chr7 (251-299)||(15144096-15144143)
chr7 (146-238)||(39267600-39267691)
chr7 (146-238)||(45169791-45169882)
chr7 (252-299)||(3386345-3386391)
chr7 (252-299)||(24704700-24704746)
chr7 (261-299)||(13869358-13869396)
chr7 (261-299)||(20110568-20110606)
chr7 (146-214)||(9751504-9751572)
chr7 (162-238)||(18425668-18425743)
chr7 (162-238)||(18425870-18425945)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (59-299)||(21329363-21329603)
chr5 (79-299)||(21502041-21502262)
chr5 (59-300)||(26011901-26012142)
chr5 (59-299)||(21565557-21565797)
chr5 (59-300)||(20026806-20027048)
chr5 (147-299)||(22959489-22959638)
chr5 (59-299)||(19668913-19669152)
chr5 (59-298)||(19660704-19660940)
chr5 (59-300)||(22178085-22178328)
chr5 (147-300)||(22144063-22144217)
chr5 (213-295)||(36314596-36314678)
chr5 (191-298)||(21729062-21729169)
chr5 (191-298)||(21808387-21808494)
chr5 (191-299)||(24493584-24493691)
chr5 (191-299)||(8286840-8286949)
chr5 (206-299)||(21997547-21997640)
chr5 (191-299)||(23390494-23390602)
chr5 (159-261)||(29448055-29448159)
chr5 (136-296)||(40725871-40726032)
chr5 (191-299)||(13025326-13025433)
chr5 (191-299)||(13095510-13095617)
chr5 (196-299)||(24529235-24529338)
chr5 (196-299)||(22412199-22412301)
chr5 (59-140)||(21741411-21741492)
chr5 (191-299)||(25421547-25421655)
chr5 (196-299)||(1096482-1096585)
chr5 (196-299)||(9077967-9078070)
chr5 (191-298)||(22075035-22075142)
chr5 (191-294)||(25431414-25431517)
chr5 (242-295)||(37723922-37723975)
chr5 (146-238)||(10753594-10753685)
chr5 (146-238)||(21871525-21871616)
chr5 (146-238)||(21875805-21875896)
chr5 (199-300)||(20902060-20902160)
chr5 (199-299)||(264819-264918)
chr5 (199-299)||(10732991-10733090)
chr5 (199-299)||(20909024-20909123)
chr5 (199-299)||(29329946-29330045)
chr5 (199-299)||(39363396-39363495)
chr5 (204-299)||(11581255-11581349)
chr5 (243-295)||(21293020-21293071)
chr5 (145-185)||(21741485-21741525)
chr5 (146-238)||(22120149-22120240)
chr5 (204-299)||(39245148-39245242)
chr5 (252-299)||(20918052-20918098)
chr5 (261-299)||(2154726-2154764)
chr5 (261-299)||(23064523-23064561)
chr5 (261-299)||(36154892-36154930)
chr5 (261-299)||(38619446-38619484)
chr5 (263-299)||(10775790-10775826)
chr5 (204-299)||(18319090-18319184)
chr5 (146-214)||(24767291-24767359)
chr5 (146-174)||(36314688-36314716)
[»] chr3 (89 HSPs)
chr3 (60-299)||(14234502-14234743)
chr3 (63-302)||(15470936-15471174)
chr3 (59-299)||(16097343-16097583)
chr3 (75-299)||(16103795-16104018)
chr3 (83-299)||(12174152-12174365)
chr3 (146-298)||(13210283-13210432)
chr3 (59-295)||(37251033-37251270)
chr3 (159-299)||(32307692-32307830)
chr3 (77-301)||(22110235-22110460)
chr3 (208-295)||(49668091-49668178)
chr3 (136-295)||(52523669-52523831)
chr3 (208-295)||(9512939-9513026)
chr3 (208-295)||(9520914-9521001)
chr3 (200-299)||(27165262-27165361)
chr3 (59-185)||(1465277-1465403)
chr3 (203-299)||(53301561-53301657)
chr3 (136-296)||(24340665-24340826)
chr3 (153-300)||(43925972-43926121)
chr3 (136-296)||(23274705-23274866)
chr3 (212-299)||(1644693-1644779)
chr3 (191-298)||(12399225-12399332)
chr3 (196-299)||(18438549-18438652)
chr3 (136-296)||(37642207-37642368)
chr3 (196-296)||(42386428-42386528)
chr3 (191-299)||(24153207-24153314)
chr3 (61-189)||(49389498-49389626)
chr3 (216-299)||(11424783-11424865)
chr3 (191-299)||(13442289-13442397)
chr3 (136-252)||(2051141-2051260)
chr3 (191-299)||(14572604-14572711)
chr3 (196-299)||(14972869-14972972)
chr3 (196-299)||(20698438-20698541)
chr3 (191-302)||(26686899-26687010)
chr3 (160-300)||(606293-606433)
chr3 (196-299)||(36166610-36166711)
chr3 (249-299)||(28194705-28194755)
chr3 (191-299)||(17487871-17487979)
chr3 (191-299)||(17499353-17499461)
chr3 (191-299)||(23083359-23083467)
chr3 (146-238)||(16749779-16749870)
chr3 (153-295)||(43550482-43550625)
chr3 (187-295)||(12377940-12378050)
chr3 (196-299)||(21618461-21618562)
chr3 (59-125)||(43927322-43927388)
chr3 (199-299)||(12567572-12567671)
chr3 (199-299)||(13544037-13544136)
chr3 (136-296)||(22147467-22147628)
chr3 (199-299)||(29172634-29172733)
chr3 (191-299)||(14576831-14576938)
chr3 (146-238)||(19775998-19776089)
chr3 (196-299)||(25476388-25476491)
chr3 (146-238)||(37439421-37439512)
chr3 (196-299)||(40213724-40213826)
chr3 (197-299)||(55500954-55501055)
chr3 (199-299)||(6469185-6469284)
chr3 (199-299)||(9707658-9707757)
chr3 (199-299)||(16282862-16282961)
chr3 (199-299)||(17463190-17463289)
chr3 (199-299)||(17672638-17672737)
chr3 (199-299)||(28848662-28848761)
chr3 (199-299)||(34159338-34159437)
chr3 (199-299)||(38961942-38962041)
chr3 (191-299)||(43840947-43841055)
chr3 (199-299)||(45606958-45607057)
chr3 (199-299)||(55476503-55476602)
chr3 (146-238)||(4107182-4107273)
chr3 (146-238)||(4111034-4111125)
chr3 (146-238)||(15965202-15965293)
chr3 (146-238)||(15969126-15969217)
chr3 (146-238)||(15973050-15973141)
chr3 (59-122)||(1644550-1644613)
chr3 (252-299)||(7781451-7781497)
chr3 (146-238)||(12852318-12852413)
chr3 (59-122)||(12934178-12934241)
chr3 (252-299)||(15977527-15977573)
chr3 (163-238)||(16750192-16750266)
chr3 (163-238)||(16750390-16750464)
chr3 (252-299)||(17737248-17737294)
chr3 (59-122)||(49667951-49668014)
chr3 (252-299)||(50242834-50242880)
chr3 (250-301)||(53070755-53070805)
chr3 (261-299)||(8499530-8499568)
chr3 (261-299)||(10556997-10557035)
chr3 (261-299)||(15412441-15412479)
chr3 (261-299)||(41123902-41123940)
chr3 (261-299)||(45577950-45577988)
chr3 (146-238)||(8489250-8489341)
chr3 (204-299)||(12119781-12119875)
chr3 (59-103)||(13210195-13210239)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (60-299)||(902-1140)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (59-299)||(39706155-39706394)
chr4 (59-300)||(12288075-12288317)
chr4 (59-300)||(13716-13958)
chr4 (71-299)||(8846371-8846615)
chr4 (59-299)||(12774022-12774252)
chr4 (136-300)||(52243136-52243303)
chr4 (146-298)||(15551833-15551982)
chr4 (77-300)||(53082035-53082259)
chr4 (136-300)||(43198495-43198662)
chr4 (59-273)||(16596689-16596900)
chr4 (59-185)||(15099477-15099603)
chr4 (59-185)||(15190444-15190570)
chr4 (77-300)||(46640339-46640563)
chr4 (196-299)||(16377526-16377627)
chr4 (191-299)||(7798789-7798897)
chr4 (196-299)||(7088892-7088995)
chr4 (191-299)||(44052844-44052952)
chr4 (191-299)||(52873365-52873473)
chr4 (191-299)||(6899906-6900013)
chr4 (191-298)||(12902773-12902880)
chr4 (191-299)||(16270234-16270341)
chr4 (237-298)||(3096309-3096369)
chr4 (242-295)||(17046506-17046559)
chr4 (199-299)||(19618223-19618322)
chr4 (196-299)||(14280328-14280430)
chr4 (146-238)||(15225308-15225399)
chr4 (191-299)||(16239968-16240075)
chr4 (191-298)||(23374357-23374464)
chr4 (196-299)||(54798757-54798860)
chr4 (191-299)||(7893718-7893826)
chr4 (199-299)||(18215325-18215424)
chr4 (191-299)||(22636450-22636558)
chr4 (199-299)||(44615300-44615399)
chr4 (136-299)||(44928866-44929030)
chr4 (146-238)||(630728-630819)
chr4 (146-238)||(3331961-3332052)
chr4 (146-238)||(13812763-13812854)
chr4 (196-299)||(14038663-14038766)
chr4 (146-238)||(14953915-14954006)
chr4 (146-238)||(25690137-25690228)
chr4 (245-295)||(6190481-6190531)
chr4 (199-299)||(12358-12457)
chr4 (199-299)||(15118403-15118502)
chr4 (199-299)||(44773138-44773237)
chr4 (199-299)||(52312522-52312621)
chr4 (146-238)||(10713083-10713174)
chr4 (146-238)||(10926853-10926944)
chr4 (146-238)||(12487941-12488032)
chr4 (80-124)||(14158034-14158078)
chr4 (80-124)||(14164739-14164783)
chr4 (204-299)||(15355381-15355475)
chr4 (252-299)||(1837613-1837659)
chr4 (252-299)||(7641286-7641332)
chr4 (252-299)||(12610962-12611008)
chr4 (252-299)||(23803369-23803415)
chr4 (252-299)||(50222443-50222489)
chr4 (252-299)||(51463972-51464018)
chr4 (197-295)||(14053306-14053403)
chr4 (261-299)||(18239531-18239569)
chr4 (261-299)||(19242711-19242749)
chr4 (261-299)||(44102226-44102264)
chr4 (199-299)||(3515019-3515118)
chr4 (196-297)||(8574872-8574971)
chr4 (153-232)||(15464890-15464970)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (59-299)||(12781-13021)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (59-300)||(10541-10782)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (59-299)||(6626-6866)
scaffold0333 (59-299)||(14006-14246)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (59-300)||(23019420-23019661)
chr6 (59-300)||(19668385-19668627)
chr6 (59-299)||(19652210-19652448)
chr6 (59-297)||(28496340-28496575)
chr6 (59-297)||(29808751-29808986)
chr6 (59-298)||(1561319-1561556)
chr6 (146-300)||(9098466-9098621)
chr6 (213-299)||(27333238-27333324)
chr6 (213-299)||(27393978-27394064)
chr6 (59-300)||(20109152-20109396)
chr6 (59-255)||(22080605-22080800)
chr6 (193-299)||(4185821-4185927)
chr6 (148-300)||(25644334-25644488)
chr6 (193-299)||(4186382-4186488)
chr6 (193-259)||(4668211-4668277)
chr6 (193-259)||(4675058-4675124)
chr6 (196-299)||(18409830-18409933)
chr6 (59-295)||(23076749-23076987)
chr6 (59-144)||(27333151-27333236)
chr6 (59-144)||(27393891-27393976)
chr6 (95-287)||(31155301-31155491)
chr6 (191-298)||(16496260-16496367)
chr6 (196-295)||(29060559-29060658)
chr6 (136-298)||(8227453-8227616)
chr6 (208-299)||(20076715-20076805)
chr6 (59-295)||(35008167-35008405)
chr6 (196-299)||(20593788-20593891)
chr6 (196-295)||(19303544-19303642)
chr6 (191-299)||(17287794-17287902)
chr6 (136-262)||(18706356-18706483)
chr6 (191-299)||(20360958-20361066)
chr6 (199-299)||(30676761-30676860)
chr6 (196-291)||(16920635-16920728)
chr6 (153-299)||(22782239-22782385)
chr6 (196-299)||(25629358-25629461)
chr6 (196-295)||(35245605-35245702)
chr6 (246-293)||(22831524-22831571)
chr6 (206-299)||(25656641-25656733)
chr6 (91-172)||(28103796-28103877)
chr6 (146-214)||(16624583-16624651)
chr6 (196-299)||(20638286-20638389)
chr6 (146-238)||(22949375-22949466)
chr6 (146-238)||(22953331-22953422)
chr6 (146-238)||(23871819-23871910)
chr6 (146-238)||(23875775-23875866)
chr6 (146-238)||(27325388-27325479)
chr6 (59-125)||(9098391-9098457)
chr6 (199-299)||(2291231-2291330)
chr6 (199-299)||(12742329-12742428)
chr6 (199-299)||(18334643-18334742)
chr6 (199-299)||(19005058-19005157)
chr6 (199-299)||(19858970-19859069)
chr6 (199-299)||(24422559-24422658)
chr6 (199-299)||(33861806-33861905)
chr6 (199-299)||(33864290-33864389)
chr6 (251-295)||(11185524-11185568)
chr6 (146-238)||(16760525-16760616)
chr6 (252-299)||(8055041-8055087)
chr6 (134-233)||(18696569-18696667)
chr6 (252-299)||(25714432-25714478)
chr6 (252-299)||(25754821-25754867)
chr6 (252-299)||(26924744-26924790)
chr6 (250-299)||(1595561-1595609)
chr6 (252-301)||(18456729-18456777)
chr6 (252-301)||(18461889-18461937)
chr6 (252-301)||(18821904-18821952)
chr6 (250-299)||(25688514-25688562)
chr6 (204-299)||(16448583-16448677)
chr6 (146-238)||(31477595-31477686)
chr6 (216-293)||(33443068-33443146)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (59-295)||(22921735-22921971)
chr1 (59-302)||(33681019-33681262)
chr1 (59-302)||(22237639-22237883)
chr1 (59-300)||(21861435-21861677)
chr1 (77-301)||(21896142-21896364)
chr1 (62-299)||(20248294-20248527)
chr1 (59-302)||(52927848-52928079)
chr1 (146-298)||(20918620-20918769)
chr1 (77-300)||(16368170-16368393)
chr1 (159-299)||(21754060-21754198)
chr1 (59-300)||(50686625-50686868)
chr1 (146-294)||(14295507-14295652)
chr1 (59-185)||(35981554-35981680)
chr1 (136-302)||(35261023-35261187)
chr1 (59-187)||(20636975-20637103)
chr1 (77-301)||(50613999-50614225)
chr1 (77-301)||(50621827-50622053)
chr1 (137-300)||(16758663-16758828)
chr1 (59-185)||(49261468-49261594)
chr1 (91-301)||(41049933-41050144)
chr1 (95-299)||(21161731-21161932)
chr1 (196-299)||(50210216-50210319)
chr1 (146-261)||(22130863-22130975)
chr1 (196-299)||(34509795-34509898)
chr1 (146-295)||(16093836-16093987)
chr1 (199-295)||(45574893-45574989)
chr1 (191-298)||(27250727-27250834)
chr1 (199-299)||(21840779-21840878)
chr1 (146-238)||(41387833-41387924)
chr1 (243-298)||(20847205-20847259)
chr1 (245-299)||(20454606-20454659)
chr1 (238-288)||(38801433-38801483)
chr1 (146-246)||(51130632-51130729)
chr1 (237-298)||(21026696-21026756)
chr1 (136-299)||(433024-433185)
chr1 (146-238)||(1924914-1925005)
chr1 (146-238)||(20923928-20924019)
chr1 (199-299)||(13988878-13988977)
chr1 (199-299)||(21923342-21923441)
chr1 (191-299)||(22532284-22532392)
chr1 (199-299)||(23593786-23593885)
chr1 (252-296)||(22123171-22123215)
chr1 (196-299)||(31612325-31612427)
chr1 (252-299)||(29298149-29298195)
chr1 (252-299)||(29776700-29776746)
chr1 (59-117)||(12271744-12271802)
chr1 (261-299)||(13212974-13213012)
chr1 (261-299)||(21342108-21342146)
chr1 (261-299)||(21346973-21347011)
chr1 (261-299)||(21707179-21707217)
chr1 (261-299)||(21711721-21711759)
chr1 (196-229)||(12271639-12271672)
chr1 (263-299)||(16361929-16361965)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (59-302)||(10407-10650)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (59-299)||(6550-6789)
scaffold0621 (77-300)||(8480-8706)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (59-299)||(19279-19519)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (59-300)||(32550-32790)
[»] chr2 (55 HSPs)
chr2 (60-299)||(25175865-25176104)
chr2 (148-299)||(7679600-7679750)
chr2 (59-300)||(7598-7840)
chr2 (59-299)||(28405991-28406232)
chr2 (59-300)||(18786768-18787010)
chr2 (59-300)||(23207291-23207533)
chr2 (59-300)||(23791287-23791530)
chr2 (136-300)||(23708561-23708726)
chr2 (146-298)||(23071905-23072054)
chr2 (60-300)||(25108901-25109143)
chr2 (146-296)||(19671848-19671998)
chr2 (208-293)||(22134222-22134306)
chr2 (191-299)||(298812-298921)
chr2 (146-300)||(20520145-20520300)
chr2 (199-299)||(22105424-22105524)
chr2 (136-300)||(22413078-22413245)
chr2 (191-299)||(23060528-23060636)
chr2 (216-298)||(38138-38219)
chr2 (196-295)||(20309127-20309224)
chr2 (191-298)||(23654384-23654491)
chr2 (191-296)||(23076460-23076565)
chr2 (237-299)||(23285880-23285941)
chr2 (77-229)||(22459445-22459598)
chr2 (197-299)||(22731238-22731340)
chr2 (196-295)||(23103400-23103497)
chr2 (136-300)||(24697548-24697714)
chr2 (146-238)||(1283657-1283748)
chr2 (196-299)||(22337130-22337233)
chr2 (191-299)||(23660038-23660145)
chr2 (146-238)||(30344776-30344867)
chr2 (237-299)||(8946672-8946733)
chr2 (199-299)||(571409-571508)
chr2 (199-299)||(18808955-18809054)
chr2 (250-299)||(23040247-23040295)
chr2 (199-299)||(23130874-23130973)
chr2 (199-299)||(23133341-23133440)
chr2 (199-299)||(23135602-23135701)
chr2 (199-299)||(23709583-23709682)
chr2 (199-299)||(23712064-23712163)
chr2 (199-299)||(24367786-24367885)
chr2 (199-299)||(26505391-26505490)
chr2 (199-299)||(26507869-26507968)
chr2 (199-299)||(32214972-32215071)
chr2 (199-299)||(34402573-34402672)
chr2 (199-299)||(39682325-39682424)
chr2 (252-299)||(6726007-6726053)
chr2 (252-299)||(21155164-21155210)
chr2 (148-300)||(23004762-23004916)
chr2 (252-299)||(24643054-24643100)
chr2 (252-299)||(43137311-43137357)
chr2 (261-299)||(22738247-22738285)
chr2 (261-299)||(28577111-28577149)
chr2 (245-295)||(32451981-32452031)
chr2 (261-299)||(38967386-38967424)
chr2 (261-299)||(45029966-45030004)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (75-299)||(100389-100613)
scaffold0023 (59-299)||(40040-40280)
scaffold0023 (241-298)||(119891-119948)
scaffold0023 (237-299)||(101514-101576)
scaffold0023 (196-299)||(44466-44569)
scaffold0023 (199-299)||(17491-17590)
scaffold0023 (199-299)||(94423-94522)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (59-299)||(129920-130160)
scaffold0010 (148-300)||(60669-60823)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (59-299)||(5658-5897)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (59-299)||(1097-1337)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (59-301)||(22540-22778)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (59-299)||(2511-2751)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (59-295)||(6831-7064)
scaffold0556 (59-232)||(8097-8270)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (59-302)||(62210-62450)
scaffold0028 (59-295)||(132677-132906)
scaffold0028 (199-299)||(136692-136791)
scaffold0028 (199-299)||(139161-139260)
scaffold0028 (199-299)||(144099-144198)
scaffold0028 (199-299)||(134223-134322)
scaffold0028 (199-299)||(141630-141729)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (59-299)||(14563-14803)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (59-299)||(45658-45898)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (59-299)||(160699-160938)
scaffold0001 (199-299)||(501096-501195)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (59-300)||(7942-8181)
scaffold0218 (148-267)||(29238-29354)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (136-299)||(144-307)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (59-300)||(136233-136476)
scaffold0021 (59-300)||(144941-145184)
scaffold0021 (242-295)||(174785-174838)
scaffold0021 (244-299)||(121781-121835)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (176-299)||(15760-15883)
scaffold0020 (59-125)||(15698-15764)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (59-256)||(2084-2281)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (59-295)||(2670-2908)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (79-300)||(12582-12803)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (59-300)||(103504-103738)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (77-300)||(6166-6391)
scaffold0420 (248-300)||(13793-13845)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (59-299)||(15676-15913)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (59-300)||(53414-53656)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (77-300)||(128853-129077)
scaffold0022 (59-300)||(78336-78577)
scaffold0022 (196-299)||(116442-116543)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (208-302)||(23898-23992)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (146-298)||(11308-11457)
scaffold0046 (75-298)||(2013-2233)
scaffold0046 (196-299)||(28429-28532)
scaffold0046 (258-298)||(4568-4608)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (77-291)||(38339-38555)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (146-295)||(1025-1171)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (59-300)||(19750-19992)
scaffold0080 (191-299)||(39928-40035)
scaffold0080 (146-238)||(48939-49030)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (78-293)||(7943-8161)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (77-300)||(97019-97244)
scaffold0006 (77-300)||(106297-106522)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (146-300)||(25120-25275)
scaffold0123 (136-233)||(619-715)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (196-300)||(1046-1150)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (146-300)||(27701-27856)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (200-299)||(38709-38808)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (146-301)||(13141-13298)
scaffold0357 (146-300)||(16052-16207)
scaffold0357 (243-300)||(2675-2732)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (59-298)||(34139-34375)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (59-264)||(54-261)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (77-300)||(564-787)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (196-299)||(3154-3256)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (77-300)||(267674-267898)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (136-296)||(11482-11643)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (136-296)||(17969-18130)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (136-296)||(38198-38359)
scaffold0124 (146-238)||(21846-21937)
scaffold0124 (146-238)||(24605-24699)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (196-299)||(39492-39594)
scaffold0141 (146-238)||(13872-13963)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (196-299)||(75218-75320)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (193-259)||(9133-9199)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (60-295)||(32117-32345)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (77-301)||(1681-1906)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (196-299)||(3189-3292)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (196-295)||(1308-1405)
scaffold0106 (196-295)||(7285-7382)
scaffold0106 (245-299)||(15291-15344)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (196-299)||(17218-17323)
scaffold0056 (252-301)||(79388-79436)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (196-295)||(51601-51698)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (196-298)||(4865-4967)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (196-299)||(25911-26013)
scaffold0026 (196-299)||(39873-39975)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (230-299)||(28806-28876)
scaffold0211 (59-122)||(28677-28740)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (191-299)||(13226-13334)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (191-299)||(1866-1974)
scaffold0016 (146-214)||(207473-207541)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (191-299)||(32957-33064)
scaffold0145 (191-299)||(38776-38883)
scaffold0145 (252-299)||(9761-9807)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (196-299)||(44710-44813)
scaffold0122 (237-299)||(26110-26171)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (191-299)||(32955-33062)
scaffold0120 (191-299)||(45943-46050)
scaffold0120 (237-299)||(16128-16189)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (191-296)||(24300-24406)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (196-299)||(339953-340053)
scaffold0003 (199-299)||(158501-158600)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (197-295)||(16301-16397)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (196-298)||(13513-13614)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (196-298)||(15467-15568)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (196-298)||(32083-32183)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (199-299)||(10785-10884)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (191-299)||(3485-3593)
scaffold0292 (191-296)||(361-465)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (191-299)||(51928-52036)
scaffold0011 (191-298)||(167976-168083)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (191-298)||(1046-1153)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (196-295)||(5133-5230)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (242-298)||(10472-10528)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (191-299)||(8531-8635)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (208-300)||(2689-2783)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (199-301)||(20430-20530)
scaffold0031 (146-238)||(35871-35962)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (199-299)||(4706-4805)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (237-298)||(4728-4788)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (191-299)||(22898-23005)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (136-256)||(225465-225585)
scaffold0012 (146-238)||(189162-189253)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (191-299)||(6119-6230)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (188-299)||(8494-8605)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (196-295)||(1054-1151)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (196-299)||(4523-4625)
scaffold0228 (196-299)||(12105-12207)
scaffold0228 (196-299)||(22057-22159)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (244-295)||(47014-47065)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (146-228)||(6-88)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (191-295)||(1971-2075)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (199-299)||(13404-13503)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (199-299)||(9254-9353)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (199-299)||(20759-20858)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (199-299)||(16796-16895)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (199-299)||(37833-37932)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (196-296)||(20928-21029)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (146-238)||(627-718)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (146-238)||(11286-11377)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (204-299)||(16611-16706)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (146-238)||(32445-32536)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (252-299)||(4309-4355)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (197-298)||(11447-11548)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (252-301)||(11976-12024)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (252-297)||(29946-29990)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (199-299)||(11300-11399)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (247-299)||(4888-4939)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (146-214)||(12762-12830)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (146-214)||(9788-9856)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (196-298)||(161137-161239)


Alignment Details
Target: scaffold0138 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 59 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13194 - 12951
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13194 gagttgatcatggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgctaatgttatataa 13095  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  13094 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgtt 12995  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12994 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 12951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 233
Target Start/End: Original strand, 18121 - 18277
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  18121 agaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatg 18220  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 233  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  18221 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6520622 - 6520383
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6520622 gagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataa 6520523  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520522 ttgtatatacattacatgaattatg-ttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 6520424  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6520423 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6520383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 62 - 299
Target Start/End: Original strand, 38855121 - 38855357
Alignment:
Q  62 ttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattg 161  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855121 ttgatcttggacattaggaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattg 38855220  T
Q  162 tatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt 261  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855221 tatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt 38855319  T
Q  262 tgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38855320 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 38855357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21285852 - 21285612
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||||||    
T  21285852 gagttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatattgttgttaatgatatataa 21285753  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  21285752 ttgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgtt 21285653  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  21285652 gtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttga 21285612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 302
Target Start/End: Original strand, 23760707 - 23760953
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtt---tcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttat 154  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||| |||    
T  23760707 gagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtat 23760806  T
Q  155 ataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 254  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||  ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23760807 ataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgcctatgt 23760905  T
Q  255 tgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23760906 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaga 23760953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 983268 - 983513
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatc---ttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttata 155  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||||||| ||||||||||    
T  983268 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattgaatgttgttgataatgttata 983367  T
Q  156 taattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatg 253  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  983368 tagctgtatatacattacatgaattatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatg 983466  T
Q  254 ttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  983467 ttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 983513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21673927 - 21673719
Alignment:
Q  91 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgat 189  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||    
T  21673927 ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaattatatt-gat 21673829  T
Q  190 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
     |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  21673828 atttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcgg 21673729  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  21673728 tctaagttga 21673719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20498818 - 20498576
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||  | |||  | | ||||||||  |||||| ||||||    
T  20498818 gagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataa 20498719  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  20498718 ttgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgc 20498619  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  20498618 tgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 20498576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Original strand, 5866143 - 5866376
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    |||    |||||||| |  |||||||||||||    
T  5866143 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 5866242  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5866243 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgct 5866339  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5866340 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5866376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21491247 - 21491011
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    |||    |||||||| |  |||||||||||||    
T  21491247 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcctatgaattaatgttgcttataatgttatataa 21491148  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21491147 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgct 21491051  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21491050 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21491011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17141168 - 17140932
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    |||    |||||||| |  |||||||||||||    
T  17141168 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 17141069  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  || |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17141068 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataatt--ga-gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgct 17140972  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17140971 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37116586 - 37116361
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||  | | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| |    
T  37116586 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatg 37116487  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  37116486 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaacta 37116387  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37116386 agctgcatgagtcggtctaagatgaa 37116361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Original strand, 26355566 - 26355804
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||  |||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||||||||    
T  26355566 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataa 26355665  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||| | | | |||||| ||||  |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26355666 ttgtatatacattaaatggaatatgtt-gatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcctatgttgtt 26355763  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26355764 gtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26355804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Original strand, 17266876 - 17267101
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  | | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  17266876 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaag 17266975  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||   | |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||     
T  17266976 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaacta 17267075  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17267076 agctgcatgagtcggtctaagatgaa 17267101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24353279 - 24353034
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtt---tcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttata 155  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||| | |||    
T  24353279 gagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgata 24353180  T
Q  156 taattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatg 253  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||| | |  |||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||    
T  24353179 taaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 24353081  T
Q  254 ttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24353080 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 24353034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21249550 - 21249400
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21249550 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatac 21249454  T
Q  246 tgcctatgttgct-gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||| |||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21249453 tgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21249400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21255388 - 21255238
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21255388 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatac 21255292  T
Q  246 tgcctatgttgct-gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||| |||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21255291 tgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Original strand, 13508027 - 13508188
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||  ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13508027 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 13508126  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  13508127 gttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Original strand, 13597559 - 13597720
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||  ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13597559 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 13597658  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  13597659 gttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 300
Target Start/End: Original strand, 17439458 - 17439614
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 243  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |    
T  17439458 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 17439557  T
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  17439558 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatgaa 17439614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Original strand, 17612062 - 17612213
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatg-tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcata 244  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||  |||  ||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17612062 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcata 17612161  T
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  17612162 ctgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22364897 - 22364744
Alignment:
Q  79 aaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaa 178  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  ||| || |||||| ||||||| ||||||| |||    
T  22364897 aaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaa 22364798  T
Q  179 ttatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 233  Q
    |||| | ||||||||  ||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||    
T  22364797 ttatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22626858 - 22626751
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22626858 tttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 22626760  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  22626759 ctaagttga 22626751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 28649047 - 28649150
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28649047 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28649145  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  28649146 gttga 28649150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31971374 - 31971273
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31971374 gatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 31971276  T
Q  296 ttg 298  Q
    |||    
T  31971275 ttg 31971273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 16092345 - 16092448
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16092345 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16092443  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  16092444 gttga 16092448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7372901 - 7372793
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| |||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7372901 tttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 7372803  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  7372802 tctaagttga 7372793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20536331 - 20536223
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20536331 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 20536233  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  20536232 tctaagttga 20536223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6759368 - 6759273
Alignment:
Q  204 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6759368 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6759273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Original strand, 21395985 - 21396082
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21395985 gatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21396082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Original strand, 21790478 - 21790575
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21790478 gatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21790575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 21918998 - 21919105
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21918998 tttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 21919096  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  21919097 tctaagttg 21919105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23406489 - 23406394
Alignment:
Q  204 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23406489 tgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23406394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 295
Target Start/End: Original strand, 16199668 - 16199746
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16199668 gatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16199746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22875182 - 22875080
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  22875182 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctg-ctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaa 22875084  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  22875083 ttga 22875080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 18818454 - 18818515
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18818454 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18818515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879337
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18879337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 21923926 - 21924034
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21923926 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 21924024  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  21924025 tctaagttga 21924034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Original strand, 21389455 - 21389552
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21389455 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21389552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Original strand, 21778781 - 21778878
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21778781 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21778878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 14409495 - 14409594
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14409495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14409592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 16413367 - 16413466
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16413367 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16413464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Original strand, 19154826 - 19154994
Alignment:
Q  134 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 233  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| |  |||||||| | ||||| ||| | ||| | |||||| |||||||  ||    
T  19154826 taatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatattattatatctgga 19154925  T
Q  234 t--gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |  | |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  19154926 tatgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaa 19154994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 18862430 - 18862521
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18862430 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18862521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21383978 - 21383887
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21383978 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21387398 - 21387307
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21387398 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21387307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21411271 - 21411180
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21411271 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21411180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21805763 - 21805672
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21805763 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21805672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 21827799 - 21827890
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21827799 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21827890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131098
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26219830 - 26219729
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26219830 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 26219733  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  26219732 ttga 26219729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1484513 - 1484414
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1484513 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1484416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 5853343 - 5853442
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5853343 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 5853440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 20046246 - 20046345
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20046246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20046343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20403338 - 20403239
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20403338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20403241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22001864 - 22001765
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22001864 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22001767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542523
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 4542523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896277
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19896277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225397
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26225397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290845
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 45290845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070571
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Original strand, 40492834 - 40492891
Alignment:
Q  176 gaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 233  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40492834 gaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 60 - 299
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6229
Alignment:
Q  60 agttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataat 159  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5990 agttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataat 6089  T
Q  160 tgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 259  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6090 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactg 6189  T
Q  260 tttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6190 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 811013 - 811237
Alignment:
Q  75 ttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattaca 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811013 ttagaaactaagttatttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattaca 811112  T
Q  175 cgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  811113 tgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaacta 811212  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  811213 agctgcatgagtcggtctaagttga 811237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 60 - 302
Target Start/End: Original strand, 16219584 - 16219826
Alignment:
Q  60 agttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataat 159  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16219584 agttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataat 16219683  T
Q  160 tgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16219684 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 16219783  T
Q  260 tttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  16219784 tttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaaga 16219826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 47832062 - 47831822
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47832062 gagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgctaatgttatataa 47831963  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  47831962 ttgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgtt 47831863  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  47831862 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 47831822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 67999 - 67760
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  67999 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatata 67900  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67899 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatattga-gatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 67802  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  67801 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 67760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18005901 - 18005661
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18005901 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 18005802  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18005801 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttgc 18005703  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18005702 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18005661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16056582 - 16056342
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16056582 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttatataa 16056483  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  16056482 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataatgtctatgttgct 16056384  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  16056383 gtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttgaa 16056342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 91 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44014398 - 44014193
Alignment:
Q  91 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  44014398 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaattatgtt-gat 44014300  T
Q  190 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
     |||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44014299 atttgagatgttgat---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 44014203  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  44014202 tctaagttga 44014193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 80 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22073149 - 22072928
Alignment:
Q  80 aactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacga-a 178  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||      
T  22073149 aactaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattacatgagt 22073050  T
Q  179 ttatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagc 277  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22073049 ttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 22072950  T
Q  278 agcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     ||||| ||| |||||||||||    
T  22072949 tgcatgggtcagtctaagttga 22072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12901560 - 12901337
Alignment:
Q  78 gaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacga 177  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  12901560 gaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga 12901461  T
Q  178 attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactga 275  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |    
T  12901460 attatgtatgatg-ttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaa 12901362  T
Q  276 gcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    || |||||||||||| |||||||||    
T  12901361 gctgcatgagtcggtttaagttgaa 12901337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Original strand, 15754755 - 15754992
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-actctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||| ||||    ||| | | |||||||| |  ||||||||||||    
T  15754755 gagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatata 15754854  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||     
T  15754855 attgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgt 15754951  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  15754952 tatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15754992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34201038 - 34200802
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||  ||||||| ||||    |||    |||||||| |  |||||||||||||    
T  34201038 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 34200939  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34200938 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgct 34200842  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  34200841 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 34200802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495421
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16495471  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16495421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Original strand, 11995983 - 11996132
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||  | |||||||   || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11995983 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgagttgttgat---ttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatac 11996079  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  11996080 tgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 11996132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 295
Target Start/End: Original strand, 28505254 - 28505400
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  || |||| ||| ||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28505254 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt--ga-gttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatac 28505350  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28505351 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 28505400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Original strand, 20220073 - 20220295
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||  | | ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  20220073 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatg 20220172  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||     
T  20220173 aattatatatgatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaacta 20220269  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  20220270 agctgtatgagtcggtctaagatgaa 20220295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16324260 - 16324172
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgcta 147  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16324260 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgcta 16324172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14044928 - 14044760
Alignment:
Q  134 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttga-tgacttgcattcgatattgttatatcatg 232  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |    
T  14044928 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcagg 14044830  T
Q  233 a--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |  || |||   |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14044829 agctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 14044760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14354958 - 14354790
Alignment:
Q  134 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttga-tgacttgcattcgatattgttatatcatg 232  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |    
T  14354958 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcagg 14354860  T
Q  233 a--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |  || |||   |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14354859 agctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 14354790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 300
Target Start/End: Original strand, 2280122 - 2280226
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2280122 gatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2280221  T
Q  296 ttgaa 300  Q
    |||||    
T  2280222 ttgaa 2280226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 300
Target Start/End: Original strand, 1867937 - 1868102
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga-- 233  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||      
T  1867937 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgagc 1868035  T
Q  234 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    || |||  ||||||||||||||| |||| |||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1868036 tgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 1868102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 185
Target Start/End: Original strand, 9389563 - 9389689
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||    
T  9389563 gagttgatcttggaggttagaaactaagttatcgaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatattgatgataatgttatataa 9389662  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtt 185  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||    
T  9389663 ttgtatatacattgtatgaattatgtt 9389689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 292
Target Start/End: Original strand, 12255733 - 12255892
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga- 233  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||| | ||| |||||  |||||||  || || |||| ||||||||||||||||||     
T  12255733 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaa 12255832  T
Q  234 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtct 292  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  12255833 ttgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38227603 - 38227499
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38227603 tttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggt 38227505  T
Q  291 ctaagt 296  Q
    ||||||    
T  38227504 ctaagt 38227499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 18456411 - 18456518
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18456411 tttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggt 18456509  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  18456510 ctaagttga 18456518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13647440 - 13647344
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13647440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 302
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008608
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga-- 233  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaac 15008539  T
Q  234 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    || |||  ||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  15008540 tgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatgaaga 15008608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 3564367 - 3564470
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3564367 gatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 3564465  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  3564466 gttga 3564470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12698955 - 12698846
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcg 288  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12698955 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 12698857  T
Q  289 gtctaagttga 299  Q
    |||||||||||    
T  12698856 gtctaagttga 12698846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9509312 - 9509204
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9509312 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 9509214  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  9509213 tctaagttga 9509204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486847
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatg-tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||| | ||||  |||  ||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 19486785  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  19486786 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 296
Target Start/End: Original strand, 10063821 - 10063921
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  10063821 gatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 10063920  T
Q  296 t 296  Q
    |    
T  10063921 t 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 48273507 - 48273404
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  48273507 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  48273408 gttga 48273404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15113198 - 15113028
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || |||    | |||||  |  |||||| ||||||    
T  15113198 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattataatgtgatataa 15113099  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 229  Q
    ||||||||| |||||  || |||| | |||   ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15113098 ttgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Original strand, 16386292 - 16386353
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16386292 tttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16386353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 17061966 - 17062065
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17061966 gttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17062064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18426161 - 18426070
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18426161 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18426070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26212119 - 26212012
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||    
T  26212119 tttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcgg 26212021  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  26212020 tctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40443508 - 40443410
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  40443508 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 40443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275183
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24275185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18430826 - 18430724
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18430826 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 18430729  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  18430728 gttga 18430724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847932
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 27847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 456432 - 456333
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  456432 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 456335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10589115 - 10589055
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  10589115 tttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 11393338 - 11393437
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11393338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11393435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11972607 - 11972508
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11972607 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11972510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 14949173 - 14949272
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14949173 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14949270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 15376764 - 15376863
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15376764 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15376861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16213795 - 16213696
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16213795 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16213698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16232631 - 16232532
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16232631 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16232534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16324168 - 16324135
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324168 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 16324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16410170 - 16410071
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16410170 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16410073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18640383 - 18640284
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18640383 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18640286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 20385174 - 20385273
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20385174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20385271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 21189646 - 21189745
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21189646 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21189743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24702349 - 24702250
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24702349 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24702252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32125602 - 32125503
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32125602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32125505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41523028 - 41522929
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41523028 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41522931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41525490 - 41525391
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41525490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41525393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116521
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 299
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144143
Alignment:
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 39267600 - 39267691
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  39267600 taattttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 39267691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 45169791 - 45169882
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  45169791 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 45169882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386345
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 3386345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24704746 - 24704700
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24704746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 24704700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869358
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 13869358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110568
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20110568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Original strand, 9751504 - 9751572
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcatt 214  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||    
T  9751504 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 9751572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18425743 - 18425668
Alignment:
Q  162 tatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18425743 tatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18425668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18425945 - 18425870
Alignment:
Q  162 tatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18425945 tatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18425870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Original strand, 21329363 - 21329603
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21329363 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataa 21329462  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329463 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgct 21329562  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21329563 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21329603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 79 - 299
Target Start/End: Original strand, 21502041 - 21502262
Alignment:
Q  79 aaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacga 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21502041 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga 21502140  T
Q  178 attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagc 277  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  21502141 attatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 21502240  T
Q  278 agcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  21502241 tgcatgagtcggtctaagttga 21502262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 26011901 - 26012142
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  26011901 gagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttatataa 26012000  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26012001 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgct 26012100  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26012101 gtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 26012142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21565797 - 21565557
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||||||||    
T  21565797 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataa 21565698  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21565697 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgct 21565598  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21565597 atttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21565557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 20026806 - 20027048
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||| ||||||     
T  20026806 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctatatag 20026905  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  20026906 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttg 20027004  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20027005 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 20027048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 147 - 299
Target Start/End: Original strand, 22959489 - 22959638
Alignment:
Q  147 aatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959489 aatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatact 22959585  T
Q  247 gcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22959586 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22959638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19669152 - 19668913
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat--actctaatgttgttgctaatgttatat 156  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    |||  |   | ||||||||  |||||||||||    
T  19669152 gagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatattgatgttgtttataatgttatat 19669053  T
Q  157 aattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19669052 aattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgtctatgttg 19668956  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19668955 ttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttga 19668913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Original strand, 19660704 - 19660940
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    |||    |||||||| |  |||||||||||||    
T  19660704 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 19660803  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   ||  |||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660804 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatactgcctatgttgct 19660900  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19660901 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19660940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 22178085 - 22178328
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||| | | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||  |   ||||||||  |||||| ||||||    
T  22178085 gagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggatgttgttaataatgtgatataa 22178184  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  |||||||||||||||    
T  22178185 atgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttg 22178284  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
     ||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  22178285 ttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 22178328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22144217 - 22144063
Alignment:
Q  147 aatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22144217 aatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatac 22144118  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22144117 tacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 22144063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314596
Alignment:
Q  213 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36314596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 21729062 - 21729169
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21729062 tttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 21729160  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  21729161 tctaagttg 21729169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 21808387 - 21808494
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21808387 tttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 21808485  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  21808486 tctaagttg 21808494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24493691 - 24493584
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  24493691 tttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgcatgagtcggt 24493593  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  24493592 ctaagttga 24493584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 8286840 - 8286949
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcg 288  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8286840 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 8286938  T
Q  289 gtctaagttga 299  Q
    |||||||||||    
T  8286939 gtctaagttga 8286949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997640
Alignment:
Q  206 acttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21997640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 23390494 - 23390602
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23390494 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 23390592  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  23390593 tctaagttga 23390602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448055
Alignment:
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttg 29448060  T
Q  257 ctgtt 261  Q
    |||||    
T  29448059 ctgtt 29448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725871
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatg-tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||  |||  ||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 40725933  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  40725932 gctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13025433 - 13025326
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  13025433 tttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggt 13025335  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  13025334 ctaagttga 13025326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13095617 - 13095510
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  13095617 tttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggt 13095519  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  13095518 ctaagttga 13095510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24529338 - 24529235
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24529338 gatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24529240  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  24529239 gttga 24529235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22412301 - 22412199
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  22412301 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg-ttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 22412203  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  22412202 ttga 22412199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 140
Target Start/End: Original strand, 21741411 - 21741492
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgtt 140  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21741411 gagttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgtt 21741492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25421655 - 25421547
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| |||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25421655 tttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 25421557  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  25421556 tctaagttga 25421547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1096585 - 1096482
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| | ||| || ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1096585 gatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1096487  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  1096486 gttga 1096482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9078070 - 9077967
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  9078070 gatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaa 9077972  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  9077971 gttga 9077967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22075142 - 22075035
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  22075142 tttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcgg 22075044  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  22075043 tctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25431517 - 25431414
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  25431517 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcgg 25431419  T
Q  290 tctaa 294  Q
    |||||    
T  25431418 tctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723922
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10753685 - 10753594
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  10753685 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 10753594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 21871525 - 21871616
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21871525 taatgttatataattcgatatatattgcatgaattatgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21871616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 21875805 - 21875896
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21875805 taatgttatataattcgatatatattgcatgaattatgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21875896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 300
Target Start/End: Original strand, 20902060 - 20902160
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20902060 gttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20902157  T
Q  298 gaa 300  Q
    |||    
T  20902158 gaa 20902160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 264819 - 264918
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  264819 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 264916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 10732991 - 10733090
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10732991 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10733088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20909123 - 20909024
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20909123 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20909026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29330045 - 29329946
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29330045 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29329948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39363495 - 39363396
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39363495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39363398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Original strand, 11581255 - 11581349
Alignment:
Q  204 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11581255 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 11581349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293071
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 21293071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Original strand, 21741485 - 21741525
Alignment:
Q  145 ctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21741485 ctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt 21741525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 22120149 - 22120240
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| | |||| |  |||||||||| |||||||||    
T  22120149 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgttcatttgtaattgttatat-atgatgatt 22120240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39245242 - 39245148
Alignment:
Q  204 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  39245242 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 39245148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918098
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20918098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154764
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2154764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064523
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23064523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Original strand, 36154892 - 36154930
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36154892 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 36154930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619446
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 38619446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775826
Alignment:
Q  263 gttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 10775826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Original strand, 18319090 - 18319184
Alignment:
Q  204 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  18319090 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 18319184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Original strand, 24767291 - 24767359
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcatt 214  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||    
T  24767291 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 24767359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36314716 - 36314688
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattaca 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314716 taatgttatataattgtatatacattaca 36314688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 89)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 60 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14234743 - 14234502
Alignment:
Q  60 agttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtt--tcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14234743 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtttaatctaatgttgttgctaatgttatata 14234644  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234643 attgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 14234544  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  14234543 tgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttga 14234502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 63 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15471174 - 15470936
Alignment:
Q  63 tgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgt 162  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15471174 tgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgt 15471076  T
Q  163 atatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15471075 atatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtct 15470976  T
Q  263 gttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15470975 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaga 15470936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16097583 - 16097343
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||||||||    
T  16097583 gagttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataa 16097484  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16097483 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgttgtt 16097384  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16097383 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16097343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16104018 - 16103795
Alignment:
Q  75 ttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattaca 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |    |||    | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16104018 ttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaatccatatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaa 16103919  T
Q  175 cgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
     |||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  16103918 tgaattatgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaacta 16103820  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  16103819 agctgcatgagtcggtctaagttga 16103795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 83 - 299
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174365
Alignment:
Q  83 taagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-actctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaatta 181  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatc-aatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgactta 12174250  T
Q  182 tgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagca 281  Q
    |||||||| |||  | ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12174251 tgtttgatatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 12174347  T
Q  282 tgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12174348 tgagtcggtctaagttga 12174365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Original strand, 13210283 - 13210432
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13210283 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 13210379  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13210380 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13210432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Original strand, 37251033 - 37251270
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||  | | ||||||||  |||||| ||||||    
T  37251033 gagttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataa 37251132  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||    
T  37251133 atgtatatgcattacatgaattatttatgatgttga-gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttg 37251231  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  37251232 ctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32307830 - 32307692
Alignment:
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||  ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307830 ttgtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 32307733  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  32307732 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 32307692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 301
Target Start/End: Original strand, 22110235 - 22110460
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||  |||||| |||||| ||||||  ||||||| |    
T  22110235 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatg 22110334  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||| | | ||||||| | |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  22110335 aattctatatgatgttga-gatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaacta 22110433  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22110434 agctgcatgagtcggtctaagatgaag 22110460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 208 - 295
Target Start/End: Original strand, 49668091 - 49668178
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  49668091 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 49668178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523831
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga- 233  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaa 52523768  T
Q  234 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  52523769 ctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512939
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9512939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520914
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9520914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27165361 - 27165262
Alignment:
Q  200 ttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27165361 ttgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27165262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 185
Target Start/End: Original strand, 1465277 - 1465403
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||| ||    
T  1465277 gagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgctgtcattccagtaagcctggattgtttattctaatgttgatgataatgttatacaa 1465376  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtt 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1465377 ttgtatatacattacatgaattatgtt 1465403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 299
Target Start/End: Original strand, 53301561 - 53301657
Alignment:
Q  203 atgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  53301561 atgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttga 53301657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340826
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||  ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 24340764  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  24340765 gttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925972
Alignment:
Q  153 atataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcct 250  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||||||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcct 43926022  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43926021 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 43925972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23274866 - 23274705
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||| | ||||  ||||||| | ||| | |||  ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23274866 atgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 23274767  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  23274766 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 299
Target Start/End: Original strand, 1644693 - 1644779
Alignment:
Q  212 attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  1644693 attcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttga 1644779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12399332 - 12399225
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12399332 tttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 12399234  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  12399233 tctaagttg 12399225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18438652 - 18438549
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  18438652 gatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 18438554  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  18438553 gttga 18438549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642368
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatg-tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||  |||  ||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 37642306  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  37642307 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 42386528 - 42386428
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  42386528 gatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaa 42386430  T
Q  295 gt 296  Q
    ||    
T  42386429 gt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 24153207 - 24153314
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24153207 tttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggt 24153305  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  24153306 ctaagttga 24153314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 49389498 - 49389626
Alignment:
Q  61 gttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataatt 160  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||||||||||    
T  49389498 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataatt 49389597  T
Q  161 gtatatacattacacgaattatgtttgat 189  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  49389598 gtatatacattaaatgaattatgtttgat 49389626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 299
Target Start/End: Original strand, 11424783 - 11424865
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  11424783 gatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 11424865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13442397 - 13442289
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13442397 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 13442299  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  13442298 tctaagttga 13442289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 252
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga- 233  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaa 2051240  T
Q  234 -tgatttgcatactgcctat 252  Q
     || ||||||||||||||||    
T  2051241 ctgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14572711 - 14572604
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| |||||  || | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14572711 tttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 14572613  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  14572612 ctaagttga 14572604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14972972 - 14972869
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14972972 gatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14972874  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  14972873 gttga 14972869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 20698438 - 20698541
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||  ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20698438 gatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20698536  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  20698537 gttga 20698541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26687010 - 26686899
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| |||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26687010 tttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 26686912  T
Q  290 tctaagttgaaga 302  Q
    |||||||||||||    
T  26686911 tctaagttgaaga 26686899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 300
Target Start/End: Original strand, 606293 - 606433
Alignment:
Q  160 tgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    |||||| |||||||| ||||| | | ||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   | |||||||||||||    
T  606293 tgtatacacattacatgaattctatatgatgttga-gatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgc 606390  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  606391 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatgaa 606433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36166711 - 36166610
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36166711 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36166614  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  36166613 ttga 36166610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194705
Alignment:
Q  249 ctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 28194705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17487979 - 17487871
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17487979 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 17487881  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  17487880 tctaagttga 17487871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17499461 - 17499353
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17499461 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 17499363  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  17499362 tctaagttga 17499353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 23083359 - 23083467
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23083359 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 23083457  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  23083458 tctaagttga 23083467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 16749779 - 16749870
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16749779 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16749870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550625
Alignment:
Q  153 atataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcat 43550581  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43550582 atgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12378050 - 12377940
Alignment:
Q  187 gatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatga 284  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||||||   |||||| ||| | ||||    
T  12378050 gatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatga 12377951  T
Q  285 gtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||    
T  12377950 gtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21618562 - 21618461
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21618562 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21618465  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  21618464 ttga 21618461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 43927388 - 43927322
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 125  Q
    ||||||||| ||| | | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43927388 gagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt 43927322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12567671 - 12567572
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12567671 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12567574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13544136 - 13544037
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13544136 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13544039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147628
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatg-tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||  |||  ||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||| |  |||  ||||| ||| |||||| |||||| ||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagt 22147628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 29172634 - 29172733
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29172634 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29172731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 14576831 - 14576938
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  14576831 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggt 14576929  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  14576930 ctaagttga 14576938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19776089 - 19775998
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  19776089 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 19775998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 25476388 - 25476491
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||    
T  25476388 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaa 25476486  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  25476487 gttga 25476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 37439421 - 37439512
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  37439421 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 37439512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 40213724 - 40213826
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  40213724 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 40213821  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  40213822 gttga 40213826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500954
Alignment:
Q  197 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  55500957 ttga 55500954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 6469185 - 6469284
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6469185 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6469282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 9707658 - 9707757
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9707658 gttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 9707755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 16282862 - 16282961
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16282862 gttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16282959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17463289 - 17463190
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17463289 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17463192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672638
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 28848662 - 28848761
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28848662 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28848759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34159437 - 34159338
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34159437 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34159340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 38961942 - 38962041
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38961942 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 38962039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43841055 - 43840947
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| |||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43841055 tttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 43840957  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    | ||||||||    
T  43840956 tttaagttga 43840947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 45606958 - 45607057
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45606958 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 45607055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 55476602 - 55476503
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  55476602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 55476505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 4107182 - 4107273
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  4107182 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 4107273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 4111034 - 4111125
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  4111034 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 4111125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15965293 - 15965202
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15965293 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15965202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15969217 - 15969126
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15969217 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15969126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15973141 - 15973050
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15973141 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15973050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 1644550 - 1644613
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 122  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  1644550 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactga 1644613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 7781451 - 7781497
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7781451 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 7781497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 12852318 - 12852413
Alignment:
Q  146 taatgttatataattg----tatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    ||||||||||||||||    |||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  12852318 taatgttatataattggatatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 12852413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 12934178 - 12934241
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 122  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  12934178 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga 12934241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15977573 - 15977527
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15977573 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15977527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 16750192 - 16750266
Alignment:
Q  163 atatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16750192 atatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16750266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 16750390 - 16750464
Alignment:
Q  163 atatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16750390 atatacattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16750464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737248
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 17737248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 49667951 - 49668014
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 122  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  49667951 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga 49668014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 50242880 - 50242834
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  50242880 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 50242834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 301
Target Start/End: Original strand, 53070755 - 53070805
Alignment:
Q  250 tatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53070755 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 53070805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499530
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8499530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556997
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 10556997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412441
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15412441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123902
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 41123902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45577988
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 45577988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 8489250 - 8489341
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||| |  |||||||||| |||||||||    
T  8489250 taatgttatatatttagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgtatttgtaattgttatat-atgatgatt 8489341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Original strand, 12119781 - 12119875
Alignment:
Q  204 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  12119781 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttga 12119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 103
Target Start/End: Original strand, 13210195 - 13210239
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13210195 gagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtt 13210239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 299
Target Start/End: Original strand, 902 - 1140
Alignment:
Q  60 agttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataat 159  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  902 agttgatcttggaagttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtaaa-tctaatgttgttgctaatgttatataat 1000  T
Q  160 tgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  1001 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgttg 1100  T
Q  260 tttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1101 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Original strand, 39706155 - 39706394
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39706155 gagttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttatataa 39706254  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39706255 ttgtatatacattacatgaattatgtt-gatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgtt 39706353  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  39706354 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 39706394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 12288075 - 12288317
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||||||     
T  12288075 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttatatag 12288174  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  12288175 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttg 12288273  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12288274 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 12288317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 13716 - 13958
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||  | |||  | | ||||||||  |||||| ||||||    
T  13716 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataa 13815  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13816 ttgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgc 13915  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13916 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8846615 - 8846371
Alignment:
Q  71 gagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacat 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8846615 gagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacat 8846516  T
Q  171 tacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgtta----------------tatcatgatgatttgcatactgcctatgt 254  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||                | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8846515 tacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgt 8846416  T
Q  255 tgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  8846415 tgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttga 8846371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12774252 - 12774022
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||          
T  12774252 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt------ 12774159  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
      |||||||||||| | | |||||||| |||  ||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774158 --gtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 12774063  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12774062 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12774022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 300
Target Start/End: Original strand, 52243136 - 52243303
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga- 233  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||| | ||| |||||  ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||     
T  52243136 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaa 52243235  T
Q  234 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  52243236 ctgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 52243303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15551982 - 15551833
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15551982 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatac 15551886  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15551885 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15551833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Original strand, 53082035 - 53082259
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  53082035 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatg 53082134  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||  || |||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||     
T  53082135 aattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaacta 53082233  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  53082234 agctgcatgagtcggtctaagatgaa 53082259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 300
Target Start/End: Original strand, 43198495 - 43198662
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga- 233  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| | |||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  43198495 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaa 43198594  T
Q  234 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
     || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43198595 ttgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 43198662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16596900 - 16596689
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||||| ||||    ||||   |||||||| |  |||||||||||||    
T  16596900 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactgatgcttataaattaatgttgcttataatgttatataa 16596801  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16596800 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataatt--ga-gttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgct 16596704  T
Q  259 gtttgttatttaact 273  Q
    |||||||||||||||    
T  16596703 gtttgttatttaact 16596689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15099603 - 15099477
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  15099603 gagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataa 15099504  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtt 185  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15099503 ttgtatatacattatatgaattatgtt 15099477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15190570 - 15190444
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  15190570 gagttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataa 15190471  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtt 185  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15190470 ttgtatatacattatatgaattatgtt 15190444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Original strand, 46640339 - 46640563
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||  | | ||||||||  | |||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  46640339 agaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatg 46640438  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||| | ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  46640439 aattatatatgatgttga-gatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaacta 46640537  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  46640538 agctgcatgagtcggtctaagatgaa 46640563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 16377526 - 16377627
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16377526 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16377623  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  16377624 ttga 16377627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7798897 - 7798789
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7798897 tttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 7798799  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  7798798 tctaagttga 7798789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7088995 - 7088892
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7088995 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7088897  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  7088896 gttga 7088892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44052952 - 44052844
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44052952 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcgg 44052854  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
     |||||||||    
T  44052853 cctaagttga 44052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 52873365 - 52873473
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| |||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52873365 tttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 52873463  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  52873464 tctaagttga 52873473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6900013 - 6899906
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||   ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  6900013 tttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagatgcatgagtcggt 6899915  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  6899914 ctaagttga 6899906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12902880 - 12902773
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12902880 tttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 12902782  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  12902781 tctaagttg 12902773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 16270234 - 16270341
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  16270234 tttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggt 16270332  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||| ||||    
T  16270333 ctaacttga 16270341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096309
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3096309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046506
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17046506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 19618223 - 19618322
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19618223 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19618320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14280430 - 14280328
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14280430 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14280333  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  14280332 gttga 14280328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15225399 - 15225308
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15225399 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15225308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 16239968 - 16240075
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||  |||||||| |||    
T  16239968 tttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagttggt 16240066  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  16240067 ctaagttga 16240075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 23374357 - 23374464
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||     
T  23374357 tttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgt 23374455  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  23374456 tctaagttg 23374464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 54798757 - 54798860
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  54798757 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaa 54798855  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  54798856 gttga 54798860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7893826 - 7893718
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| |||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  7893826 tttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcgg 7893728  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  7893727 tctaagttga 7893718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 18215325 - 18215424
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18215325 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18215422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22636558 - 22636450
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22636558 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 22636460  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  22636459 tctaagttga 22636450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44615399 - 44615300
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44615399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44615302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 299
Target Start/End: Original strand, 44928866 - 44929030
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| |  ||  ||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||| |    
T  44928866 atgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgct 44928965  T
Q  235 gattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    | ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44928966 gtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44929030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 630728 - 630819
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  630728 taatgttatataattggatatatattgcatgcattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 630819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3332052 - 3331961
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  3332052 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacatgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 3331961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 13812763 - 13812854
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  13812763 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 13812854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14038766 - 14038663
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  14038766 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 14038668  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  14038667 gttga 14038663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 14953915 - 14954006
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  14953915 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 14954006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25690228 - 25690137
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  25690228 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 25690137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190481
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12457
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12358 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 15118403 - 15118502
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15118403 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15118500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 44773138 - 44773237
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44773138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44773235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52312621 - 52312522
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  52312621 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 52312524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10713174 - 10713083
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  10713174 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 10713083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10926944 - 10926853
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  10926944 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 10926853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12488032 - 12487941
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  12488032 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 12487941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14158078 - 14158034
Alignment:
Q  80 aactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaat 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14158078 aactaagttttttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaat 14158034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14164783 - 14164739
Alignment:
Q  80 aactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaat 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14164783 aactaagttgtttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaat 14164739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Original strand, 15355381 - 15355475
Alignment:
Q  204 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15355381 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15355475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 1837613 - 1837659
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1837613 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1837659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641332
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 7641332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610962
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12610962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 23803369 - 23803415
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23803369 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23803415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 50222443 - 50222489
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  50222443 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 50222489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 51463972 - 51464018
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  51463972 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 51464018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053403
Alignment:
Q  197 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 14053403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Original strand, 18239531 - 18239569
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18239531 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18239569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19242749 - 19242711
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19242749 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19242711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102226
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44102226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3515118 - 3515019
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3515118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3515021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 297
Target Start/End: Original strand, 8574872 - 8574971
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8574872 gatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8574969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Original strand, 15464890 - 15464970
Alignment:
Q  153 atataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 232  Q
    |||||||||||||| || |||  ||||||| | ||| |||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15464890 atataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13021 - 12781
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  13021 gagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttatataa 12922  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12921 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgtt 12822  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  12821 gtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttga 12781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10782 - 10541
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10782 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcatataa 10683  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10682 ttgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgtt 10583  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10582 gtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6866 - 6626
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6866 gagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataa 6767  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  6766 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgtt 6667  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6666 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14246 - 14006
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14246 gagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataa 14147  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14146 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgtt 14047  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14046 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23019661 - 23019420
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  23019661 gagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttatataa 23019562  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  23019561 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgct 23019462  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||    
T  23019461 gtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatgaa 23019420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19668627 - 19668385
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||  | || |||||||| ||||||||||||     
T  19668627 gagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatatag 19668528  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||    
T  19668527 ttgtatatacattacatgaattacgtatgatgttg-tgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttg 19668429  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19668428 ctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 19668385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19652448 - 19652210
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||||||||    
T  19652448 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataa 19652349  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19652348 ttgtatatactttaaatggattatgtt-gatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgtt 19652251  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19652250 gtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Original strand, 28496340 - 28496575
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    |||    |||||||| |  |||||||||||||    
T  28496340 gagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataa 28496439  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28496440 ttgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgct 28496536  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
      ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28496537 aattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Original strand, 29808751 - 29808986
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    |||    |||||||| |  |||||||||||||    
T  29808751 gagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataa 29808850  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29808851 ttgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgct 29808947  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
      ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29808948 aattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1561556 - 1561319
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-actctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||| ||||    ||| | | |||||||| |  ||||||||||||    
T  1561556 gagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatata 1561457  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||     
T  1561456 attgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgt 1561360  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  1561359 tatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 1561319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 300
Target Start/End: Original strand, 9098466 - 9098621
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||    
T  9098466 taatgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgttg-tgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcat 9098564  T
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9098565 actgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 9098621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 213 - 299
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333324
Alignment:
Q  213 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27333324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 213 - 299
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394064
Alignment:
Q  213 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27394064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20109396 - 20109152
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||  ||  |||||| ||||  | |||    | ||||||||  |||||| ||||||    
T  20109396 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgtatatcaattgatgttgtttataatgtgatataa 20109297  T
Q  159 t--tgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 255  Q
    |  ||||||||||||||  ||||||| | ||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  20109296 tattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgtt 20109197  T
Q  256 gctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20109196 gctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 20109152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 255
Target Start/End: Original strand, 22080605 - 22080800
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22080605 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgttatata 22080704  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgact-tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 255  Q
    | ||||||||||||| |  |||||||   |||||||  ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22080705 aatgtatatacattatattaattatg-acgatgtttgagatgttgtt--ctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 299
Target Start/End: Original strand, 4185821 - 4185927
Alignment:
Q  193 tatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtct 292  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  || |||||||||||||     
T  4185821 tatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtcc 4185920  T
Q  293 aagttga 299  Q
    |||||||    
T  4185921 aagttga 4185927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25644488 - 25644334
Alignment:
Q  148 atgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatac 245  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||  ||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||    
T  25644488 atgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatac 25644389  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25644388 tgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 25644334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4186488 - 4186382
Alignment:
Q  193 tatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtct 292  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||  || |||||||||||||     
T  4186488 tatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtcc 4186389  T
Q  293 aagttga 299  Q
    |||||||    
T  4186388 aagttga 4186382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 4668211 - 4668277
Alignment:
Q  193 tatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 259  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4668211 tatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 4675058 - 4675124
Alignment:
Q  193 tatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 259  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4675058 tatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 18409830 - 18409933
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18409830 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaa 18409928  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  18409929 gttga 18409933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23076987 - 23076749
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||| | | ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||  | | ||||||||  |||||| |||||     
T  23076987 gagttgatcatgggggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatat 23076888  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat--gatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||| ||| |  || | |||||| |||||||  |||  | |||   ||||||||||||||    
T  23076887 ttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttg 23076788  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
     ||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23076787 ttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 27333151 - 27333236
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttg 144  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27333151 gagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatccaatgttgttg 27333236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 27393891 - 27393976
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttg 144  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27393891 gagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatccaatgttgttg 27393976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 287
Target Start/End: Original strand, 31155301 - 31155491
Alignment:
Q  95 cttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgttta 194  Q
    |||||||||| |||| |||| || || |||| | || ||  ||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||| || || ||||||| |||| | |    
T  31155301 cttgctgttgatgttccagtgagtctaaattttttaatccgatgatgttgttgatgttatataaatgtataaacattgcatgatttatgtt-gatgat-a 31155398  T
Q  195 tgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg-tttgttatttaactgagcagcatgagtc 287  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  31155399 tgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtc 31155491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16496367 - 16496260
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16496367 tttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 16496269  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  16496268 tctaagttg 16496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29060658 - 29060559
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29060658 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 29060560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 298
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227616
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatg-tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||  |||  ||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 8227552  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  8227553 gttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttg 8227616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20076805 - 20076715
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20076805 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20076715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35008405 - 35008167
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||| | | ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |  ||  | | ||||||||  |||||| |||||     
T  35008405 gagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatat 35008306  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat--gatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||  ||| |  || | |||||| |||||||  |||  | |||   ||||||||||||||    
T  35008305 ttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttg 35008206  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
     ||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35008205 ttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20593891 - 20593788
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20593891 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaa 20593793  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  20593792 gttga 20593788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Original strand, 19303544 - 19303642
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19303544 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 19303642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 17287794 - 17287902
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| |||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17287794 tttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 17287892  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  17287893 tctaagttga 17287902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18706483 - 18706356
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga-- 233  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||      
T  18706483 atgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgcttt-gatattgttatatcatgaac 18706385  T
Q  234 tgatttgcatactgcctatgttgctgttt 262  Q
    || |||  ||| |||||||||||||||||    
T  18706384 tgttttatatattgcctatgttgctgttt 18706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 20360958 - 20361066
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||     
T  20360958 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcga 20361056  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  20361057 tctaagttga 20361066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 30676761 - 30676860
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30676761 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 30676858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 291
Target Start/End: Original strand, 16920635 - 16920728
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtc 291  Q
    ||||||||||| | | ||| |||||  |||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16920635 gatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782239
Alignment:
Q  153 atataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 22782287  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22782286 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22782239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 25629358 - 25629461
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25629358 gatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 25629456  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  25629457 gttga 25629461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35245702 - 35245605
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35245702 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35245605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831524
Alignment:
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25656733 - 25656641
Alignment:
Q  206 acttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25656733 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25656641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 172
Target Start/End: Original strand, 28103796 - 28103877
Alignment:
Q  91 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacatta 172  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  28103796 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 28103877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16624651 - 16624583
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcatt 214  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  16624651 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatt 16624583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 20638286 - 20638389
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||||| | ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  20638286 gatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 20638384  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  20638385 gttga 20638389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22949466 - 22949375
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  22949466 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 22949375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22953422 - 22953331
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  22953422 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 22953331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23871910 - 23871819
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  23871910 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 23871819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23875866 - 23875775
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  23875866 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 23875775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 27325388 - 27325479
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  27325388 taatgttatataattatatatatattgcattaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 27325479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 125
Target Start/End: Original strand, 9098391 - 9098457
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 125  Q
    ||||||||| | ||| | ||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9098391 gagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcctgaatt 9098457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 2291231 - 2291330
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2291231 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2291328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12742428 - 12742329
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12742428 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12742331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 18334643 - 18334742
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18334643 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18334740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19005157 - 19005058
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19005157 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19005060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 19858970 - 19859069
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19858970 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19859067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24422658 - 24422559
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24422658 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24422561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33861905 - 33861806
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33861905 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33861808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33864389 - 33864290
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33864389 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33864292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185524
Alignment:
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16760616 - 16760525
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16760616 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16760525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8055087 - 8055041
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8055087 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8055041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18696667 - 18696569
Alignment:
Q  134 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 233  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||   ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  18696667 taatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgcttt-gatattgttatatcatga 18696569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714432
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25714432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25754867 - 25754821
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25754867 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25754821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 26924744 - 26924790
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26924744 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26924790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1595609 - 1595561
Alignment:
Q  250 tatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  1595609 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 1595561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18456777 - 18456729
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18456777 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 18456729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18461937 - 18461889
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18461937 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 18461889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 301
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821952
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 18821952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25688562 - 25688514
Alignment:
Q  250 tatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  25688562 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttga 25688514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Original strand, 16448583 - 16448677
Alignment:
Q  204 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  16448583 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 16448677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 31477595 - 31477686
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  31477595 taatgttatataattagatatatattgcataaattttgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 31477686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33443146 - 33443068
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||||||||||| |||  || |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||    
T  33443146 gatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctg-ttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Original strand, 22921735 - 22921971
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22921735 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatata 22921834  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22921835 attgtatatacattatatgaattttgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgt 22921933  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22921934 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22921971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 59 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 33681262 - 33681019
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||||||||    
T  33681262 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataa 33681163  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681162 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 33681063  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33681062 gtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaaga 33681019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 59 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22237883 - 22237639
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctg-ttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||||    |||    | |||||||| |||| ||||||||    
T  22237883 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactgatacatatgaattgatgttgtttctaaagttatata 22237784  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22237783 attgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgc 22237684  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  22237683 tgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaaga 22237639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 21861435 - 21861677
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | | ||||||||  |||||| ||||||    
T  21861435 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataa 21861534  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21861535 ttgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgc 21861634  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21861635 tgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 21861677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 77 - 301
Target Start/End: Original strand, 21896142 - 21896364
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||  | | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  21896142 agaaactaagttgtttatcttg---ttgttgtttcagtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatg 21896238  T
Q  177 aattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactga 275  Q
    |||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  21896239 aattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaa 21896338  T
Q  276 gcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||    
T  21896339 gttgcatgagtcggtctaagatgaag 21896364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20248527 - 20248294
Alignment:
Q  62 ttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-actctaatgttgttgctaatgttatataatt 160  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||    ||| | || | |||||||  ||||| |||||||||    
T  20248527 ttgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgttgtc-cagtaagactgatgcatatgaatcca-tgttgtttataatgatatataatt 20248430  T
Q  161 gtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgt 260  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20248429 gtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgat---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgt 20248333  T
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 20248294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 302
Target Start/End: Original strand, 52927848 - 52928079
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||||||||    
T  52927848 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataa 52927947  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  52927948 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgtt 52928035  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52928036 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaga 52928079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20918769 - 20918620
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20918769 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 20918673  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20918672 tgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Original strand, 16368170 - 16368393
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  16368170 agaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatg 16368269  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    ||||||    |||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  ||||||     
T  16368270 aattataaacgatgttga-gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaacta 16368367  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16368368 agctgcatgagtcggtctaagatgaa 16368393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21754198 - 21754060
Alignment:
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||  ||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21754198 ttgtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgtt 21754101  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21754100 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21754060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 50686868 - 50686625
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||| | | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  |||||| ||||||    
T  50686868 gagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaataatgtgatataa 50686769  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  |  |||    |||||||||||||    
T  50686768 atgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaactattttatgaactgcctatgttg 50686669  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    | |||||||  |||||| | | ||||||||||||||||| ||||    
T  50686668 ccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatgaa 50686625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 294
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295652
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 14295603  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14295604 tacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 185
Target Start/End: Original strand, 35981554 - 35981680
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  35981554 gagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataa 35981653  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtt 185  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  35981654 ttgcatatacattatatgaattatgtt 35981680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 302
Target Start/End: Original strand, 35261023 - 35261187
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||  |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  35261023 atgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgct 35261119  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35261120 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaaga 35261187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20637103 - 20636975
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||    
T  20637103 gagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataatgttatataa 20637004  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttg 187  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20637003 ttgtatatacattatatgaattatgtttg 20636975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 301
Target Start/End: Original strand, 50613999 - 50614225
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    |||||||||||| ||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||  | | |||||| |  |||||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  50613999 agaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatg 50614098  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    ||||||    |||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  50614099 aattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaacta 50614198  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50614199 agctgcatgagtcggtctaagatgaag 50614225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 301
Target Start/End: Original strand, 50621827 - 50622053
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    |||||||||||| ||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||  | | |||||| |  |||||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  50621827 agaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatg 50621926  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    ||||||    |||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  50621927 aattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaacta 50622026  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50622027 agctgcatgagtcggtctaagatgaag 50622053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16758828 - 16758663
Alignment:
Q  137 tgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--t 234  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||   || |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||  |    
T  16758828 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaact 16758729  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  16758728 ggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaa 16758663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 49261594 - 49261468
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  49261594 gagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaattgtatattctaatgttgatgataatgttatataa 49261495  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtt 185  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||    
T  49261494 ttgtatatacattatataaattatgtt 49261468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 301
Target Start/End: Original strand, 41049933 - 41050144
Alignment:
Q  91 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatg 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | | ||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||||    
T  41049933 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg 41050032  T
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcg 288  Q
    || | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||| |||   ||||| ||| ||||||||||    
T  41050033 ttga-gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcg 41050131  T
Q  289 gtctaagttgaag 301  Q
    ||||||| |||||    
T  41050132 gtctaagatgaag 41050144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21161932 - 21161731
Alignment:
Q  95 cttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgttta 194  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| | |||| || || |||| ||| | | ||||||||||| |||||| |||||  | || ||||||| |||| | |    
T  21161932 cttgctgttgatgttccagtgagcctaatttgtttaatccaatgatgtcgttgatgttatataagtgtataaacattgtatgatttatgtt-gatgat-a 21161835  T
Q  195 tgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||    
T  21161834 tgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactg-ttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaa 21161736  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  21161735 gttga 21161731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 50210216 - 50210319
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  50210216 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 50210314  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  50210315 gttga 50210319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 261
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130975
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttggatac 22130959  T
Q  246 tgcctatgttgctgtt 261  Q
    ||||||||||||||||    
T  22130960 tgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34509898 - 34509795
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34509898 gatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 34509800  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  34509799 gttga 34509795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 295
Target Start/End: Original strand, 16093836 - 16093987
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 242  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||  ||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |    
T  16093836 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgttttcta 16093934  T
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||||||||    
T  16093935 tactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 295
Target Start/End: Original strand, 45574893 - 45574989
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45574893 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 27250727 - 27250834
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27250727 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 27250825  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  27250826 tctaagttg 27250834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840779
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21840878 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21840781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 41387833 - 41387924
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  41387833 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 41387924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 298
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847259
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20847259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454659
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20454659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 288
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801483
Alignment:
Q  238 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcg 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 38801483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130632
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 51130633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21026756 - 21026696
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21026756 tttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 433185 - 433024
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| |  ||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||    
T  433185 atgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgat 433086  T
Q  235 g-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |  |||| ||||||||| ||||||     ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  433085 gtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 433024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 1924914 - 1925005
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  1924914 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 1925005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 20923928 - 20924019
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  20923928 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 20924019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13988977 - 13988878
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13988977 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13988880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 21923342 - 21923441
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21923342 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21923439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22532392 - 22532284
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||| ||    
T  22532392 tttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaattgcatgagttgg 22532294  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  22532293 tctaagttga 22532284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 23593786 - 23593885
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23593786 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23593883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 296
Target Start/End: Original strand, 22123171 - 22123215
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22123171 tgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22123215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31612427 - 31612325
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31612427 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31612330  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  31612329 gttga 31612325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298149
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 29298149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29776746 - 29776700
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  29776746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 29776700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12271802 - 12271744
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaag 117  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12271802 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaag 12271744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213012
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 13213012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342108
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21342108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346973
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21346973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707179
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21707179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711721
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21711721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12271672 - 12271639
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12271672 gatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12271639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361929
Alignment:
Q  263 gttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16361929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 59 - 302
Target Start/End: Original strand, 10407 - 10650
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||||||||    
T  10407 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataa 10506  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10507 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 10606  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10607 gtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgaaga 10650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6789 - 6550
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6789 gagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 6691  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6690 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 6592  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6591 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8706 - 8480
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataat--tgtatatacattaca 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  | |||    | ||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||     
T  8706 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattact 8607  T
Q  175 cgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact 273  Q
     ||||||| | ||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8606 tgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaact 8507  T
Q  274 gagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8506 aagctgcatgagtcggtctaagttgaa 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19519 - 19279
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19519 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 19420  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19419 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 19321  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19320 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32790 - 32550
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||     
T  32790 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttatatag 32691  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32690 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgct 32592  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  32591 gtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 32550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25176104 - 25175865
Alignment:
Q  60 agttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25176104 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataa 25176005  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176004 ttatatatacgttatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 25175906  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  25175905 gtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttga 25175865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 148 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679600
Alignment:
Q  148 atgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactg 7679652  T
Q  248 cctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  7679651 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 7679600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 7598 - 7840
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||| ||||||    
T  7598 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgatataa 7697  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7698 ttgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgc 7797  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||  |||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  7798 tgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaagatgaa 7840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28406232 - 28405991
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  28406232 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatata 28406133  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 256  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28406132 attgtatatacattttatgaattaagtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttg 28406034  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  28406033 ctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 28405991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 18786768 - 18787010
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |  |||||| ||| ||||||||||||     
T  18786768 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttatatag 18786867  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||     
T  18786868 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatg-ttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatgtta 18786966  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18786967 ctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 18787010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23207533 - 23207291
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||| | | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||||| ||||||    
T  23207533 gagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataa 23207434  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| | | ||||| | ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||    
T  23207433 atgtatatgcattacatgaattatttataatgttga-gatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttg 23207335  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23207334 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 23207291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23791530 - 23791287
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||||| ||||||    
T  23791530 gagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataa 23791431  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |||   ||||||||||||||    
T  23791430 atgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttg 23791331  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
     |||||| |  |||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  23791330 ttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatgaa 23791287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 300
Target Start/End: Original strand, 23708561 - 23708726
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||  ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |    
T  23708561 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgtt 23708660  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  23708661 gttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttgaa 23708726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072054
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  || |||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt--ga-gttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 23072001  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  23072002 tgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttg 23072054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25109143 - 25108901
Alignment:
Q  60 agttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataat 159  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||| | ||||||     
T  25109143 agttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaa 25109044  T
Q  160 tgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||| ||| ||| ||   || ||||||||||||||||||  |  |||   ||||||||||||||     
T  25109043 tgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgt 25108944  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  25108943 tgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatgaa 25108901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19671998 - 19671848
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||   ||  ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19671998 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatac 19671899  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  19671898 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Original strand, 22134222 - 22134306
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22134222 ttgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctg-ttgatatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22134306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 298812 - 298921
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  298812 tttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 298911  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  298912 tctaagttga 298921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 300
Target Start/End: Original strand, 20520145 - 20520300
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 243  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |    
T  20520145 taatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgt 20520243  T
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20520244 actgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 20520300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22105524 - 22105424
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22105524 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22105426  T
Q  298 ga 299  Q
    ||    
T  22105425 ga 22105424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 300
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413245
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatat--tgttatatcatga 233  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgttga-gatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatga 22413176  T
Q  234 --tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
      || |||  ||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  22413177 gctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 22413245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23060636 - 23060528
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23060636 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 23060538  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  23060537 tctaagttga 23060528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 298
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38219
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20309224 - 20309127
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20309224 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20309127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 23654384 - 23654491
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23654384 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 23654482  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  23654483 tctaagttg 23654491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23076565 - 23076460
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23076565 tttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 23076467  T
Q  290 tctaagt 296  Q
    |||||||    
T  23076466 tctaagt 23076460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23285941 - 23285880
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23285941 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23285880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 229
Target Start/End: Original strand, 22459445 - 22459598
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatac--tctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattaca 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||    | ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||     
T  22459445 agaaactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactga--tgtatacgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattact 22459542  T
Q  175 cgaattatgtttg-atgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 229  Q
     || |||| | || || |||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22459543 tgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 22731238 - 22731340
Alignment:
Q  197 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  22731238 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaac 22731336  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  22731337 ttga 22731340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Original strand, 23103400 - 23103497
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  | || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23103400 gatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 300
Target Start/End: Original strand, 24697548 - 24697714
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga-- 233  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| | | ||| ||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||      
T  24697548 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaac 24697647  T
Q  234 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    || ||    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||  |  ||||||||||||||||| ||||    
T  24697648 tgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatgaa 24697714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1283748 - 1283657
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  1283748 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 1283657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22337233 - 22337130
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22337233 gatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22337135  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  22337134 gttga 22337130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23660145 - 23660038
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||  || || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  23660145 tttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttgtttaactaagatacatgagtcggt 23660047  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  23660046 ctaagttga 23660038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 30344776 - 30344867
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  30344776 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 30344867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946672
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8946672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 571508 - 571409
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  571508 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 571411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18809054 - 18808955
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18809054 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18808957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 299
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040295
Alignment:
Q  250 tatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23040295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23130973 - 23130874
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23130973 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23130876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23133440 - 23133341
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23133440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23133343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23135701 - 23135602
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23135701 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23135604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 23709583 - 23709682
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23709583 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23709680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 23712064 - 23712163
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23712064 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23712161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24367885 - 24367786
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24367885 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24367788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26505490 - 26505391
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26505490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26505393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26507968 - 26507869
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26507968 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26507871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 32214972 - 32215071
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32214972 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32215069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 34402573 - 34402672
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34402573 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34402670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39682424 - 39682325
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39682424 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39682327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6726053 - 6726007
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6726053 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6726007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 21155164 - 21155210
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21155164 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21155210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23004916 - 23004762
Alignment:
Q  148 atgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatac 245  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||   | ||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||  |  |||   |||    
T  23004916 atgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtac 23004817  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  23004816 tacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaa 23004762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643100
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 24643100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43137357 - 43137311
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43137357 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43137311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Original strand, 22738247 - 22738285
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22738247 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22738285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577111
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 28577111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 295
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452031
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967386
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 38967386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030004
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 45030004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 100613 - 100389
Alignment:
Q  75 ttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattac 173  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  100613 ttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattat 100514  T
Q  174 acgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact 273  Q
    | ||||||||||  || |||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100513 atgaattatgtta-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact 100415  T
Q  274 gagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     ||| |||||||||||||||||||||    
T  100414 aagctgcatgagtcggtctaagttga 100389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Original strand, 40040 - 40280
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  40040 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatata 40139  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40140 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgc 40238  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  40239 tgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 40280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119891
Alignment:
Q  241 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 119891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101514
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttga 101514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44569 - 44466
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||  | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44569 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44472  T
Q  294 agttga 299  Q
    ||||||    
T  44471 agttga 44466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 17491 - 17590
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17491 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 94522 - 94423
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  94522 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 94425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 130160 - 129920
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    |||    | ||||||||   ||||||||||||    
T  130160 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataa 130061  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130060 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 129961  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  129960 gtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttga 129920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 300
Target Start/End: Original strand, 60669 - 60823
Alignment:
Q  148 atgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcata 244  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| |||    
T  60669 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtata 60767  T
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  60768 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatgaa 60823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5897 - 5658
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5897 gagttgatcttagaggttaaaaactaagtt-tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 5799  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5798 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgc 5700  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5699 tgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttga 5658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1337 - 1097
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  | |||  | | ||||||||| ||||||||||||     
T  1337 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatag 1238  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1237 ttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgtt 1138  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1137 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 301
Target Start/End: Original strand, 22540 - 22778
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||  || ||| |   ||||||||  |||||||||||||    
T  22540 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactga--tgcatattg--atgttgtttataatgttatataa 22635  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  22636 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgct 22735  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22736 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaag 22778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Original strand, 2511 - 2751
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2511 gagttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 2610  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  2611 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatgttga 2709  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2710 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7064 - 6831
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    |||    ||||||||||  |||||||||||||    
T  7064 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataa 6965  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6964 ttgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 6868  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6867 gtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaag 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8270 - 8097
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8270 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataa 8171  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8170 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 62450 - 62210
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgt-atactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||    
T  62450 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatata 62351  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||  ||||||| ||   ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  62350 attgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgc 62255  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  62254 tgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaaga 62210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 132906 - 132677
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    |||    | ||||||||  ||||||| ||||     
T  132906 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata- 132808  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgc 257  Q
         ||||||||| | | |||||||| |||  ||  || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  132807 -----tatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgc 132715  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  132714 tgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaag 132677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 136791 - 136692
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  136791 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 136694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 139260 - 139161
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  139260 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 139163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 144198 - 144099
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  144198 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 144101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 134322 - 134223
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  134322 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgtt 134225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 141729 - 141630
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  141729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 141632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Original strand, 14563 - 14803
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  14563 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatata 14662  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    || |||||||||||| | |||||||||| ||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14663 atagtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgc 14761  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14762 tgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Original strand, 45658 - 45898
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||||||||    
T  45658 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataa 45757  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  45758 ttgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatttttct 45857  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45858 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 45898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 160938 - 160699
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    |||    | ||||||||  |||||||||||||    
T  160938 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataa 160839  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160838 ttgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 160740  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  160739 gattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 160699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 501195 - 501096
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  501195 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 501098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 7942 - 8181
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||||||     
T  7942 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgtt---gtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttatatag 8038  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  8039 ttgtatatacattacatgaattatatatgatg-ttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttg 8137  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8138 ctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 8181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 267
Target Start/End: Original strand, 29238 - 29354
Alignment:
Q  148 atgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||  ||  || |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||     
T  29238 atgttatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataatt--ga-gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatacta 29334  T
Q  248 cctatgttgctgtttgttat 267  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29335 cctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 307 - 144
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 235  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  307 atgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg 208  T
Q  236 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  207 atttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttga 144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 136233 - 136476
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-actctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  136233 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatata 136332  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgtt 255  Q
     |||||||||||||||| |||||||||  ||||  | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||     
T  136333 gttgtatatacattacatgaattatgtacgatg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtc 136431  T
Q  256 gctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  136432 gctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 136476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 144941 - 145184
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-actctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  144941 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatata 145040  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgtt 255  Q
     |||||||||||||||| |||||||||  ||||  | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||     
T  145041 gttgtatatacattacatgaattatgtacgatg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtc 145139  T
Q  256 gctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  145140 gctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatgaa 145184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 174838 - 174785
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  174838 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121781
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 121781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 176 - 299
Target Start/End: Original strand, 15760 - 15883
Alignment:
Q  176 gaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactga 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15760 gaattatgtttgatgtatatgatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa 15859  T
Q  276 gcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  15860 gctgcatgagtcggtctaagttga 15883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 125
Target Start/End: Original strand, 15698 - 15764
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15698 gagttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 256
Target Start/End: Original strand, 2084 - 2281
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||| ||||| ||||||    
T  2084 gagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatata 2183  T
Q  158 attgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| | ||| |||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2184 attgtatatacattatatgaattatgct-gatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Original strand, 2670 - 2908
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tatactctaatgttgttgctaatgttatata 157  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||||||| ||||| ||||      
T  2670 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggtata-- 2767  T
Q  158 attgtatata----cattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 253  Q
    ||||||||||    ||||  | |||||| | | ||| |||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2768 attgtatatatatacattttatgaattaagct-gatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 2866  T
Q  254 ttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2867 tagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 2908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12803 - 12582
Alignment:
Q  79 aaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaa 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||  | | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  12803 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaa 12705  T
Q  179 ttatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagc 277  Q
    |||| | | | | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  12704 ttatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagc 12605  T
Q  278 agcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
      |||||||||||||||| ||||    
T  12604 tacatgagtcggtctaagatgaa 12582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 103504 - 103738
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||| ||     
T  103504 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatgtag 103603  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||         |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||| |||||||||    
T  103604 ttgtatatacattacatgaattatg---------tatgatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttg 103694  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||| ||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  103695 ctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttgaa 103738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Original strand, 6166 - 6391
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  6166 agaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatg 6265  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  6266 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaacta 6365  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  6366 agttgcatgagtcggtctaagatgaa 6391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13845
Alignment:
Q  248 cctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 13845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15913 - 15676
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  || | ||||||| |||| |  |||    |||||||| |  |||||||||||||    
T  15913 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactgattcttatgaaataatgttgcttataatgttatataa 15814  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15813 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgct 15717  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  15716 gtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttga 15676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 53414 - 53656
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||  | |||  | | ||||||||  |||||| ||||||    
T  53414 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataa 53513  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  53514 ttgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgc 53613  T
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||  |||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  53614 tgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatgaa 53656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Original strand, 128853 - 129077
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||  | | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| |    
T  128853 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatg 128952  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  128953 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaacta 129051  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  129052 agctgcatgagtcggtctaagatgaa 129077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 78577 - 78336
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||| | | || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||||| ||||||    
T  78577 gagttgatcatgggggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataa 78478  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
     ||||||| ||||||| |||||||    |||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || ||||||||||||    
T  78477 atgtatatgcattacatgaattataaacgatgttga-gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttg 78380  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  78379 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatgaa 78336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 116543 - 116442
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  116543 gatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 116446  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  116445 ttga 116442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 208 - 302
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23992
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaaga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaaga 23992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11457 - 11308
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11457 taatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 11361  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11360 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 11308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2233 - 2013
Alignment:
Q  75 ttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattaca 174  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    |||    |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2233 ttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaca 2134  T
Q  175 cgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
     || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  2133 tgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaacta 2037  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  2036 agctgcatgagtcggtctaagttg 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28532 - 28429
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28532 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28434  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  28433 gttga 28429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4568
Alignment:
Q  258 tgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38555 - 38339
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||    |||||| |||||  ||||||| ||||||| |    
T  38555 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatg 38456  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  38455 aattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaacta 38356  T
Q  275 agcagcatgagtcggtc 291  Q
    ||| |||||||||||||    
T  38355 agctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 295
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1171
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1121  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 19750 - 19992
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||| | | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||  | | ||||| ||  |||||| ||||||    
T  19750 gagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgtgatataa 19849  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
     ||||||| ||||||| || |||| | ||||| | | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||    
T  19850 atgtatatgcattacatgagttatttatgatgctga-gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttg 19948  T
Q  257 ctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19949 ctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 19992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39928
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| |||    
T  40035 tttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagttggt 39937  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  39936 ctaagttga 39928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 48939 - 49030
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  48939 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 49030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 293
Target Start/End: Original strand, 7943 - 8161
Alignment:
Q  78 gaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacga 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||||  | |||  | | ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||  ||    
T  7943 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttga 8042  T
Q  178 attatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    ||||| | ||| |||||| ||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |     
T  8043 attatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaatta 8142  T
Q  275 agcagcatgagtcggtcta 293  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  8143 agctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 97244 - 97019
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||  | | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| |    
T  97244 agaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatg 97145  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||     
T  97144 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaacta 97045  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  97044 agctgcatgagtgggtctaagatgaa 97019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 106522 - 106297
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||  | | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| |    
T  106522 agaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatg 106423  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||     
T  106422 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaacta 106323  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  106322 agctgcatgagtgggtctaagatgaa 106297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25275 - 25120
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 243  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  ||    
T  25275 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttatat 25177  T
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25176 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 25120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 619
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 233  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  715 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcttt-gatattgttatatcatga 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 196 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 1046
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1150 gatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T
Q  296 ttgaa 300  Q
     ||||    
T  1050 atgaa 1046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 300
Target Start/End: Original strand, 27701 - 27856
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcata 244  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||  ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27701 taatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcata 27800  T
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    || ||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27801 ctacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 27856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 299
Target Start/End: Original strand, 38709 - 38808
Alignment:
Q  200 ttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  38709 ttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttga 38808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13298 - 13141
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgat--gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcat 243  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||   ||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  13298 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcat 13199  T
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13198 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 300
Target Start/End: Original strand, 16052 - 16207
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcata 244  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |  || |||||  ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16052 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcata 16151  T
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    || ||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16152 ctacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaa 16207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2675
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 2675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34375 - 34139
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||||| ||||    |||    |||||||| |  |||||||||||||    
T  34375 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 34276  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 258  Q
    ||||||||| |||||  || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |    
T  34275 ttgtatatatattacttgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgtt 34179  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  34178 gtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttg 34139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 261 - 54
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataa 158  Q
    ||||||||| ||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||  | | ||||||||  |||||||||||||    
T  261 gagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcatatcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataatgttatataa 162  T
Q  159 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||  || |||   ||||||||||||||    
T  161 atgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttg 62  T
Q  257 ctgtttgt 264  Q
    ||||||||    
T  61 ctgtttgt 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 787 - 564
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | || || |   |||| | |||| | ||||||| ||||||| |    
T  787 agaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgtatatgcattacatg 688  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | |||||||   ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  ||||||     
T  687 aattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaacta 590  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  589 agctgcatgagtcggtctaagatgaa 564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 3154 - 3256
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3154 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 3252  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  3253 ttga 3256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 267898 - 267674
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||  |||  | | ||| ||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  267898 agaaactaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatgatatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatg 267799  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||| | ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||     
T  267798 aattatatatgatgttga-gatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaacta 267700  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  267699 agttgcatgagtcggtctaagatgaa 267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11482
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatg-tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||  |||  ||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 11544  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||    
T  11543 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18130
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||  ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 18068  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  18069 gttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38359
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatg-tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||  |||  ||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 38297  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||    
T  38298 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 38359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 21846 - 21937
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  ||||| |||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21846 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgtagatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 24605 - 24699
Alignment:
Q  146 taatgttatataattg--tatatacattacacgaa-ttatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| || ||| |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  24605 taatgttatataattggatatatatattgcatgaaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 24699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39594 - 39492
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39594 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 39496  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  39495 ttga 39492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 13872 - 13963
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  13872 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgaagtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 13963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 75218 - 75320
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  75218 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 75316  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  75317 ttga 75320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9199 - 9133
Alignment:
Q  193 tatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 259  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9199 tatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32345 - 32117
Alignment:
Q  60 agttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataat 159  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    |||    | ||||||||  ||||||| ||        
T  32345 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta---- 32250  T
Q  160 tgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgct 258  Q
      ||||||||||| | | |||||| |||||  ||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |    
T  32249 --tatatacattaaatggattatg-ttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgtt 32154  T
Q  259 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  32153 gtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaag 32117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 301
Target Start/End: Original strand, 1681 - 1906
Alignment:
Q  77 agaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatactctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacg 176  Q
    ||||||||||||   |||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||  | | | ||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||      
T  1681 agaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacata 1780  T
Q  177 aattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactg 274  Q
    |||||| | ||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  ||||| ||||||||  |||| |||   |||||     
T  1781 aattatatatgatgttga-gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactacctatgttaatgttagtttaataacta 1879  T
Q  275 agcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1880 agctgcatgagtcggtctaagatgaag 1906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 3189 - 3292
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3189 gatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 3287  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  3288 gttga 3292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1405 - 1308
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1405 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7382 - 7285
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7382 gatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15344
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttga 15344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 17218 - 17323
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt---gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtct 292  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17218 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 17316  T
Q  293 aagttga 299  Q
    |||||||    
T  17317 aagttga 17323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 301
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79436
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 79436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51698 - 51601
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| ||| | |||  |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  51698 gatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4967 - 4865
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  4967 gatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaa 4869  T
Q  295 gttg 298  Q
    ||||    
T  4868 gttg 4865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26013 - 25911
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  26013 gatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaag 25915  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  25914 ttga 25911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39975 - 39873
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  39975 gatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagttggtctaag 39877  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  39876 ttga 39873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 299
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28876
Alignment:
Q  230 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgt-ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 28876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 28677 - 28740
Alignment:
Q  59 gagttgatcctggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 122  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  28677 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga 28740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13334 - 13226
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  13334 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 13236  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  13235 tctaagttga 13226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1974 - 1866
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1974 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 1876  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  1875 tctaagttga 1866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Original strand, 207473 - 207541
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcatt 214  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||    
T  207473 taatgttatataattatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 207541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33064 - 32957
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  33064 tttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggt 32966  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||| ||||    
T  32965 ctaacttga 32957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38883 - 38776
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| | | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  38883 tttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgactcggt 38785  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  38784 ctaagttga 38776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9807 - 9761
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9807 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 44710 - 44813
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  44710 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 44808  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  44809 gttga 44813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Original strand, 26110 - 26171
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26110 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 32955 - 33062
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  32955 tttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggt 33053  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  33054 ctaagttga 33062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 46050 - 45943
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  46050 tttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggt 45952  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  45951 ctaagttga 45943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16189 - 16128
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16189 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Original strand, 24300 - 24406
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcg 288  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24300 tttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 24398  T
Q  289 gtctaagt 296  Q
    ||||||||    
T  24399 gtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 339953 - 340053
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  339953 gatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 340049  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  340050 ttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Original strand, 158501 - 158600
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  158501 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 158598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16301
Alignment:
Q  197 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13614 - 13513
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| | | | | |||||| | || ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13614 gatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13516  T
Q  296 ttg 298  Q
    |||    
T  13515 ttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Original strand, 15467 - 15568
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  15467 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 15565  T
Q  296 ttg 298  Q
    |||    
T  15566 ttg 15568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32183 - 32083
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32183 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32086  T
Q  296 ttg 298  Q
    |||    
T  32085 ttg 32083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10785
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10884 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3485
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  3593 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcgg 3495  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  3494 tctaagttga 3485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 465 - 361
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| ||||||| |||||| || | |||||| |||  ||||| |  |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  465 tttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 367  T
Q  291 ctaagt 296  Q
    ||||||    
T  366 ctaagt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52036 - 51928
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| |||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52036 tttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 51938  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  51937 tctaagttga 51928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 167976 - 168083
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  167976 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 168074  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  168075 tctaagttg 168083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 1046 - 1153
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1046 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 1144  T
Q  290 tctaagttg 298  Q
    |||||||||    
T  1145 tctaagttg 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Original strand, 5133 - 5230
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5133 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Original strand, 10472 - 10528
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  10472 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 10528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 8531 - 8635
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggt 290  Q
    |||| |||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||    |||||||| ||| ||||||||||||    
T  8531 tttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggt 8626  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  8627 ctaagttga 8635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2689
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaa 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||   || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2783 ttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatgaa 2689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 301
Target Start/End: Original strand, 20430 - 20530
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  20430 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T
Q  299 aag 301  Q
    |||    
T  20528 aag 20530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 35871 - 35962
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  35871 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 35962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4706
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4805 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 4708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4728
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23005 - 22898
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23005 tttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 22908  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  22907 tctaagttga 22898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 225585 - 225465
Alignment:
Q  136 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||  ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| | |    
T  225585 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgct 225487  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  225486 gttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 189162 - 189253
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  189162 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 189253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 6119 - 6230
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactgagcagcatgagtc 287  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| || ||| | ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  6119 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 6218  T
Q  288 ggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||    
T  6219 ggtctaagttga 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8605 - 8494
Alignment:
Q  188 atgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagt 286  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||    
T  8605 atgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagt 8507  T
Q  287 cggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||    
T  8506 cggtctaagttga 8494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Original strand, 1054 - 1151
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1054 gatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4625 - 4523
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4625 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaa 4528  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  4527 gttga 4523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12207 - 12105
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12207 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaa 12110  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  12109 gttga 12105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22159 - 22057
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22159 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaa 22062  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  22061 gttga 22057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 47014
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 47014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 6
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 228  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  88 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2075 - 1971
Alignment:
Q  191 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  2075 tttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcgg 1977  T
Q  290 tctaag 295  Q
    ||||||    
T  1976 tctaag 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13503 - 13404
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13503 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9353 - 9254
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9353 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 9256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20858 - 20759
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20858 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16895 - 16796
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16895 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37932 - 37833
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37932 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 37835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21029 - 20928
Alignment:
Q  196 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||   ||||||||||||||    
T  21029 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaa 20930  T
Q  295 gt 296  Q
    ||    
T  20929 gt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 627
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  718 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11377
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  11286 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 11377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 299
Target Start/End: Original strand, 16611 - 16706
Alignment:
Q  204 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  16611 tgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattga 16706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 32445 - 32536
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 238  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  32445 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 32536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4355 - 4309
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4355 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 4309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 298
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11548
Alignment:
Q  197 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  296 ttg 298  Q
    |||    
T  11546 ttg 11548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11976
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaag 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaag 11976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29990 - 29946
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29990 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11300
Alignment:
Q  199 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||    
T  11399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaattt 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 299
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4939
Alignment:
Q  247 gcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttga 4939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Original strand, 12762 - 12830
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcatt 214  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||    
T  12762 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 12830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Original strand, 9788 - 9856
Alignment:
Q  146 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcatt 214  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||    
T  9788 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 9856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Original strand, 161137 - 161239
Alignment:
Q  196 gatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||| | ||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  161137 gatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtcta 161234  T
Q  294 agttg 298  Q
    |||||    
T  161235 agttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University