View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4123_low_10 (Length: 398)

Name: NF4123_low_10
Description: NF4123
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4123_low_10
NF4123_low_10
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (16-391)||(5845-6221)
[»] chr7 (90 HSPs)
chr7 (15-391)||(26071753-26072131)
chr7 (15-391)||(26095540-26095918)
chr7 (15-391)||(3893381-3893772)
chr7 (15-391)||(12753172-12753558)
chr7 (126-391)||(15824105-15824371)
chr7 (125-391)||(44863443-44863711)
chr7 (125-391)||(141869-142136)
chr7 (15-391)||(112784-113168)
chr7 (125-391)||(47287976-47288244)
chr7 (15-289)||(45453745-45454016)
chr7 (15-291)||(1938257-1938532)
chr7 (199-391)||(7286328-7286522)
chr7 (199-391)||(12545607-12545802)
chr7 (200-391)||(18305642-18305831)
chr7 (200-391)||(13867887-13868080)
chr7 (15-168)||(15913921-15914075)
chr7 (198-391)||(7290908-7291102)
chr7 (199-391)||(2192606-2192799)
chr7 (199-391)||(369143-369336)
chr7 (199-391)||(14253071-14253263)
chr7 (199-391)||(16480836-16481029)
chr7 (199-391)||(15952859-15953050)
chr7 (15-164)||(13388493-13388643)
chr7 (34-199)||(9058141-9058311)
chr7 (125-391)||(49049452-49049723)
chr7 (35-219)||(15761867-15762051)
chr7 (35-221)||(32496053-32496242)
chr7 (39-164)||(13376200-13376324)
chr7 (146-391)||(15629004-15629254)
chr7 (55-169)||(20587140-20587254)
chr7 (125-221)||(13867688-13867784)
chr7 (203-376)||(15762262-15762429)
chr7 (126-391)||(13272976-13273246)
chr7 (55-159)||(8565108-8565212)
chr7 (39-218)||(18255324-18255505)
chr7 (35-164)||(3058585-3058713)
chr7 (55-164)||(9322594-9322703)
chr7 (125-221)||(11285619-11285715)
chr7 (322-391)||(16571983-16572053)
chr7 (322-391)||(16593609-16593679)
chr7 (55-169)||(28718977-28719091)
chr7 (35-135)||(125391-125492)
chr7 (199-296)||(2024757-2024858)
chr7 (125-221)||(11582535-11582631)
chr7 (116-255)||(15952673-15952813)
chr7 (125-292)||(16571751-16571921)
chr7 (125-292)||(16593741-16593911)
chr7 (35-159)||(2027097-2027222)
chr7 (124-221)||(13038808-13038905)
chr7 (125-291)||(10862515-10862683)
chr7 (125-260)||(12249771-12249908)
chr7 (199-273)||(12545553-12545627)
chr7 (125-221)||(12545404-12545501)
chr7 (141-213)||(36051075-36051147)
chr7 (116-221)||(369364-369471)
chr7 (174-228)||(18305492-18305546)
chr7 (149-213)||(122987-123052)
chr7 (327-391)||(2024692-2024757)
chr7 (41-219)||(10988092-10988271)
chr7 (141-221)||(16210183-16210263)
chr7 (207-391)||(16416509-16416684)
chr7 (201-273)||(16480710-16480782)
chr7 (41-218)||(26010695-26010874)
chr7 (316-391)||(45455505-45455581)
chr7 (161-255)||(2024904-2024998)
chr7 (55-101)||(4483318-4483364)
chr7 (146-218)||(2192380-2192453)
chr7 (201-273)||(2192480-2192552)
chr7 (116-218)||(15518435-15518539)
chr7 (39-218)||(2436110-2436285)
chr7 (199-391)||(11582659-11582840)
chr7 (141-199)||(7291277-7291335)
chr7 (125-218)||(7821406-7821500)
chr7 (125-218)||(7828717-7828811)
chr7 (125-218)||(16416949-16417043)
chr7 (141-218)||(16480605-16480683)
chr7 (125-218)||(27103134-27103228)
chr7 (125-218)||(27110482-27110576)
chr7 (125-218)||(27175098-27175192)
chr7 (125-218)||(38785226-38785320)
chr7 (174-221)||(3055193-3055241)
chr7 (117-169)||(4483268-4483320)
chr7 (199-303)||(122854-122951)
chr7 (262-391)||(13038989-13039114)
chr7 (55-218)||(13757060-13757225)
chr7 (75-120)||(3193586-3193630)
chr7 (320-391)||(16209975-16210045)
chr7 (42-111)||(19066193-19066262)
chr7 (76-120)||(13460914-13460958)
chr7 (116-218)||(25293856-25293960)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (15-391)||(138296-138673)
scaffold0021 (125-391)||(76589-76853)
scaffold0021 (146-287)||(10003-10147)
[»] chr6 (90 HSPs)
chr6 (15-391)||(31626739-31627117)
chr6 (19-391)||(18775506-18775886)
chr6 (19-391)||(22428473-22428850)
chr6 (15-391)||(16104850-16105237)
chr6 (125-391)||(25646518-25646786)
chr6 (19-391)||(25745792-25746160)
chr6 (199-391)||(35017451-35017645)
chr6 (200-391)||(35011124-35011316)
chr6 (199-391)||(18128340-18128532)
chr6 (199-391)||(18578834-18579027)
chr6 (205-391)||(13622937-13623121)
chr6 (15-140)||(16083970-16084095)
chr6 (200-391)||(19627498-19627690)
chr6 (199-376)||(14628368-14628545)
chr6 (199-391)||(18004857-18005050)
chr6 (199-391)||(23975708-23975902)
chr6 (199-391)||(18843708-18843900)
chr6 (15-198)||(18128776-18128964)
chr6 (125-391)||(13016436-13016702)
chr6 (15-164)||(18383173-18383323)
chr6 (35-221)||(19984699-19984887)
chr6 (208-368)||(33316422-33316582)
chr6 (15-164)||(33323342-33323492)
chr6 (35-219)||(1554324-1554508)
chr6 (125-246)||(18422182-18422303)
chr6 (34-159)||(17790652-17790776)
chr6 (15-158)||(16889236-16889379)
chr6 (15-109)||(23151845-23151939)
chr6 (259-391)||(23151706-23151839)
chr6 (174-391)||(32896282-32896492)
chr6 (199-325)||(18825647-18825774)
chr6 (15-140)||(35137439-35137565)
chr6 (39-219)||(16238848-16239028)
chr6 (55-169)||(34965470-34965584)
chr6 (125-292)||(25369014-25369184)
chr6 (56-199)||(22846615-22846767)
chr6 (39-218)||(11214623-11214803)
chr6 (125-391)||(18397163-18397434)
chr6 (203-376)||(1553946-1554113)
chr6 (55-159)||(16134814-16134918)
chr6 (39-220)||(4989379-4989561)
chr6 (125-209)||(35017303-35017387)
chr6 (262-391)||(16827873-16828003)
chr6 (55-169)||(19852795-19852909)
chr6 (141-213)||(18740863-18740935)
chr6 (39-218)||(1659212-1659387)
chr6 (141-219)||(13622800-13622878)
chr6 (55-169)||(23220222-23220336)
chr6 (311-391)||(17787746-17787827)
chr6 (41-218)||(14628111-14628289)
chr6 (41-218)||(23976053-23976231)
chr6 (41-218)||(26088319-26088497)
chr6 (206-273)||(23975956-23976023)
chr6 (117-218)||(33316158-33316260)
chr6 (201-273)||(14628316-14628388)
chr6 (320-391)||(25173518-25173590)
chr6 (199-376)||(4989004-4989171)
chr6 (205-259)||(16238711-16238765)
chr6 (199-391)||(18740645-18740828)
chr6 (125-221)||(16827462-16827559)
chr6 (125-221)||(18004635-18004732)
chr6 (56-198)||(1651466-1651605)
chr6 (41-194)||(16650745-16650899)
chr6 (125-220)||(18825420-18825515)
chr6 (199-273)||(4989201-4989275)
chr6 (125-290)||(15738590-15738757)
chr6 (141-218)||(17343864-17343942)
chr6 (322-391)||(18422115-18422185)
chr6 (125-218)||(25174040-25174134)
chr6 (125-218)||(27655670-27655764)
chr6 (208-269)||(33316292-33316353)
chr6 (56-193)||(15861243-15861375)
chr6 (125-229)||(28196439-28196546)
chr6 (41-194)||(16557515-16557669)
chr6 (125-220)||(18843481-18843576)
chr6 (125-218)||(10487364-10487458)
chr6 (125-218)||(16377869-16377963)
chr6 (125-218)||(16385193-16385287)
chr6 (199-269)||(16827663-16827733)
chr6 (141-218)||(22227278-22227356)
chr6 (75-120)||(16374954-16374999)
chr6 (41-218)||(29870975-29871153)
chr6 (215-273)||(18004770-18004827)
chr6 (199-391)||(19984915-19985096)
chr6 (199-273)||(25173731-25173805)
chr6 (320-391)||(18835474-18835544)
chr6 (75-120)||(31162441-31162486)
chr6 (116-218)||(16230065-16230169)
chr6 (116-218)||(23993645-23993749)
chr6 (153-197)||(32896494-32896538)
[»] chr8 (94 HSPs)
chr8 (15-391)||(37605283-37605668)
chr8 (49-391)||(41243948-41244277)
chr8 (125-391)||(25120745-25121012)
chr8 (125-391)||(19994802-19995078)
chr8 (125-391)||(20479893-20480166)
chr8 (200-391)||(18610428-18610620)
chr8 (199-391)||(41508927-41509122)
chr8 (125-391)||(16416537-16416810)
chr8 (35-307)||(16203832-16204098)
chr8 (204-391)||(24719328-24719513)
chr8 (199-391)||(13664550-13664743)
chr8 (199-391)||(13723825-13724018)
chr8 (15-164)||(21192234-21192384)
chr8 (15-164)||(21696086-21696236)
chr8 (210-391)||(22008366-22008548)
chr8 (199-391)||(22909342-22909535)
chr8 (15-143)||(41245210-41245338)
chr8 (199-391)||(24108465-24108657)
chr8 (15-164)||(21199661-21199811)
chr8 (137-391)||(20655677-20655943)
chr8 (15-164)||(23835746-23835895)
chr8 (15-164)||(39448310-39448460)
chr8 (199-391)||(23509068-23509261)
chr8 (15-159)||(31195772-31195917)
chr8 (199-376)||(22323225-22323398)
chr8 (200-391)||(269950-270138)
chr8 (200-391)||(645782-645970)
chr8 (200-391)||(831517-831705)
chr8 (15-199)||(37655134-37655324)
chr8 (35-221)||(29758768-29758956)
chr8 (200-391)||(16043054-16043245)
chr8 (238-391)||(17343480-17343632)
chr8 (200-391)||(16041378-16041569)
chr8 (15-101)||(37609956-37610042)
chr8 (35-212)||(270226-270401)
chr8 (35-212)||(645519-645694)
chr8 (35-212)||(831254-831429)
chr8 (125-290)||(17731117-17731286)
chr8 (125-213)||(24719077-24719165)
chr8 (55-170)||(22498832-22498947)
chr8 (39-211)||(24930614-24930789)
chr8 (35-213)||(24387203-24387383)
chr8 (55-164)||(23116349-23116458)
chr8 (125-391)||(38531882-38532152)
chr8 (273-391)||(6776303-6776422)
chr8 (55-169)||(22312190-22312304)
chr8 (199-391)||(43375310-43375493)
chr8 (55-169)||(45560747-45560861)
chr8 (109-199)||(25294490-25294582)
chr8 (109-199)||(25756479-25756571)
chr8 (64-169)||(33170785-33170890)
chr8 (34-159)||(33612569-33612694)
chr8 (125-292)||(28543270-28543440)
chr8 (15-169)||(23153297-23153452)
chr8 (125-391)||(18768422-18768691)
chr8 (125-221)||(22008139-22008236)
chr8 (199-391)||(3433535-3433718)
chr8 (125-221)||(22323102-22323197)
chr8 (125-248)||(24108245-24108368)
chr8 (141-213)||(43375202-43375274)
chr8 (329-391)||(28543151-28543213)
chr8 (201-273)||(13664424-13664496)
chr8 (201-273)||(13723699-13723771)
chr8 (41-194)||(22089943-22090097)
chr8 (210-273)||(23509315-23509378)
chr8 (262-391)||(23631046-23631173)
chr8 (55-169)||(24238065-24238177)
chr8 (125-218)||(23509397-23509491)
chr8 (55-116)||(11543088-11543149)
chr8 (125-221)||(13664296-13664393)
chr8 (125-221)||(13723571-13723668)
chr8 (41-218)||(3433076-3433254)
chr8 (41-218)||(21853396-21853574)
chr8 (125-221)||(22909146-22909242)
chr8 (56-198)||(24547724-24547863)
chr8 (15-74)||(25294581-25294641)
chr8 (15-74)||(25756570-25756630)
chr8 (207-391)||(28835980-28836155)
chr8 (206-273)||(3433285-3433352)
chr8 (41-194)||(15320559-15320713)
chr8 (41-194)||(15500928-15501082)
chr8 (319-391)||(39448573-39448646)
chr8 (336-391)||(17731331-17731387)
chr8 (116-218)||(21846065-21846169)
chr8 (15-101)||(23148481-23148568)
chr8 (125-218)||(272786-272880)
chr8 (125-218)||(642969-643063)
chr8 (125-218)||(828775-828869)
chr8 (125-218)||(5236674-5236768)
chr8 (199-303)||(29758643-29758740)
chr8 (41-218)||(16874439-16874617)
chr8 (350-391)||(21695899-21695941)
chr8 (208-273)||(3433390-3433455)
chr8 (55-95)||(18043091-18043131)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (52-391)||(37760-38101)
[»] chr3 (124 HSPs)
chr3 (15-391)||(50113612-50113991)
chr3 (16-391)||(319099-319486)
chr3 (17-391)||(12351332-12351709)
chr3 (35-391)||(51159973-51160335)
chr3 (125-391)||(17098913-17099181)
chr3 (15-391)||(47786356-47786735)
chr3 (125-391)||(6148457-6148723)
chr3 (125-391)||(30204696-30204961)
chr3 (15-273)||(7852223-7852482)
chr3 (199-391)||(11812801-11812994)
chr3 (125-391)||(16183665-16183945)
chr3 (15-221)||(8630315-8630521)
chr3 (125-391)||(19572430-19572693)
chr3 (125-391)||(22145882-22146145)
chr3 (199-391)||(38166213-38166407)
chr3 (199-391)||(18737974-18738167)
chr3 (199-391)||(19944805-19944998)
chr3 (199-391)||(7851683-7851877)
chr3 (15-267)||(14060726-14060980)
chr3 (199-391)||(30140984-30141177)
chr3 (208-386)||(12796728-12796908)
chr3 (37-168)||(18008645-18008776)
chr3 (34-164)||(15874690-15874820)
chr3 (199-391)||(17936455-17936649)
chr3 (34-164)||(48420197-48420327)
chr3 (41-164)||(12490249-12490372)
chr3 (199-391)||(16819043-16819234)
chr3 (15-200)||(38812481-38812671)
chr3 (15-213)||(19230535-19230734)
chr3 (15-164)||(11330493-11330643)
chr3 (15-164)||(55442252-55442404)
chr3 (125-391)||(14287323-14287596)
chr3 (35-221)||(2048535-2048723)
chr3 (125-391)||(11199144-11199415)
chr3 (55-169)||(5229607-5229721)
chr3 (35-221)||(33340317-33340506)
chr3 (35-221)||(23490980-23491169)
chr3 (203-334)||(8630101-8630232)
chr3 (125-292)||(11062691-11062861)
chr3 (125-391)||(35121921-35122189)
chr3 (57-169)||(47983418-47983531)
chr3 (57-169)||(47992705-47992818)
chr3 (57-169)||(48001992-48002105)
chr3 (57-169)||(48011278-48011391)
chr3 (35-227)||(19945098-19945289)
chr3 (35-221)||(10737033-10737219)
chr3 (125-391)||(14296730-14297000)
chr3 (125-391)||(14302357-14302627)
chr3 (283-391)||(54045594-54045703)
chr3 (39-218)||(14846160-14846339)
chr3 (35-212)||(5227201-5227378)
chr3 (199-296)||(13815973-13816070)
chr3 (125-221)||(11813307-11813403)
chr3 (258-391)||(17958169-17958303)
chr3 (15-169)||(9592239-9592394)
chr3 (203-364)||(54686551-54686707)
chr3 (125-391)||(14523006-14523278)
chr3 (316-391)||(11062944-11063020)
chr3 (41-255)||(49230655-49230869)
chr3 (39-218)||(15939959-15940140)
chr3 (41-221)||(17913751-17913933)
chr3 (55-169)||(41660135-41660249)
chr3 (203-364)||(9304664-9304819)
chr3 (125-221)||(17957996-17958093)
chr3 (258-391)||(25057035-25057166)
chr3 (41-219)||(44227903-44228083)
chr3 (41-218)||(16819386-16819565)
chr3 (305-391)||(13815856-13815943)
chr3 (199-391)||(19230318-19230499)
chr3 (199-273)||(11813179-11813253)
chr3 (56-255)||(16259487-16259683)
chr3 (125-289)||(15516035-15516197)
chr3 (316-391)||(17536847-17536923)
chr3 (207-391)||(18908679-18908854)
chr3 (126-221)||(19262602-19262698)
chr3 (207-391)||(22273034-22273209)
chr3 (149-221)||(45581310-45581382)
chr3 (199-266)||(7851968-7852035)
chr3 (125-267)||(12563136-12563281)
chr3 (199-273)||(18908892-18908966)
chr3 (199-376)||(49230262-49230429)
chr3 (125-221)||(25057247-25057344)
chr3 (75-164)||(33370914-33371002)
chr3 (201-273)||(11813048-11813120)
chr3 (259-391)||(23490768-23490898)
chr3 (41-218)||(27839184-27839362)
chr3 (206-269)||(16819292-16819355)
chr3 (75-121)||(11517010-11517056)
chr3 (141-219)||(15860824-15860902)
chr3 (141-218)||(18905356-18905434)
chr3 (39-198)||(15613564-15613720)
chr3 (125-267)||(17137827-17137969)
chr3 (56-198)||(23081682-23081821)
chr3 (316-391)||(53900388-53900463)
chr3 (125-220)||(30141361-30141456)
chr3 (125-218)||(2450910-2451004)
chr3 (199-273)||(7851857-7851931)
chr3 (125-199)||(12951476-12951555)
chr3 (125-218)||(18909169-18909263)
chr3 (125-218)||(22273524-22273618)
chr3 (269-391)||(33340038-33340155)
chr3 (123-273)||(40938085-40938236)
chr3 (56-218)||(12266007-12266167)
chr3 (125-198)||(15574545-15574618)
chr3 (41-218)||(16745670-16745848)
chr3 (206-391)||(19262733-19262907)
chr3 (329-391)||(12563334-12563397)
chr3 (125-218)||(1469236-1469330)
chr3 (125-290)||(17536606-17536774)
chr3 (319-391)||(39654163-39654237)
chr3 (126-218)||(15470048-15470141)
chr3 (321-391)||(14061039-14061110)
chr3 (41-218)||(30151813-30151991)
chr3 (39-86)||(18905296-18905343)
chr3 (199-273)||(2451155-2451229)
chr3 (199-273)||(22273247-22273321)
chr3 (199-273)||(49230509-49230583)
chr3 (206-255)||(2451035-2451084)
chr3 (258-307)||(10736904-10736953)
chr3 (258-307)||(45581181-45581230)
chr3 (116-218)||(8269976-8270080)
chr3 (116-218)||(8277087-8277191)
chr3 (116-218)||(8305896-8306000)
chr3 (116-218)||(53769137-53769241)
[»] chr5 (94 HSPs)
chr5 (15-391)||(4863551-4863943)
chr5 (15-391)||(27185318-27185699)
chr5 (75-391)||(21661268-21661593)
chr5 (125-391)||(21392432-21392698)
chr5 (199-391)||(34937571-34937764)
chr5 (15-168)||(32967661-32967815)
chr5 (199-391)||(10307-10500)
chr5 (199-391)||(10780112-10780305)
chr5 (199-391)||(43445708-43445901)
chr5 (34-164)||(23492532-23492662)
chr5 (34-199)||(24226976-24227146)
chr5 (199-391)||(28257781-28257970)
chr5 (15-159)||(7727112-7727257)
chr5 (199-391)||(22885041-22885234)
chr5 (205-391)||(25211796-25211982)
chr5 (205-391)||(25275948-25276134)
chr5 (15-168)||(28888441-28888598)
chr5 (202-391)||(17473704-17473892)
chr5 (208-376)||(19497952-19498120)
chr5 (34-170)||(21615535-21615671)
chr5 (15-164)||(13793659-13793809)
chr5 (34-164)||(37189637-37189767)
chr5 (15-170)||(19860756-19860912)
chr5 (199-391)||(11579922-11580113)
chr5 (125-273)||(11582266-11582414)
chr5 (125-271)||(1170321-1170467)
chr5 (200-391)||(23986165-23986359)
chr5 (125-391)||(23453184-23453454)
chr5 (125-391)||(23460428-23460698)
chr5 (125-391)||(23464689-23464959)
chr5 (41-273)||(1221351-1221584)
chr5 (249-391)||(1171320-1171464)
chr5 (199-391)||(9732592-9732782)
chr5 (199-391)||(1221638-1221826)
chr5 (55-169)||(11964472-11964586)
chr5 (125-391)||(24184869-24185137)
chr5 (125-391)||(24470555-24470804)
chr5 (125-221)||(21653052-21653148)
chr5 (41-221)||(11213222-11213404)
chr5 (41-221)||(110604-110785)
chr5 (199-391)||(29192671-29192857)
chr5 (203-384)||(17907853-17908030)
chr5 (55-169)||(20455627-20455741)
chr5 (125-255)||(22884887-22885017)
chr5 (141-221)||(17473568-17473648)
chr5 (141-307)||(23510313-23510473)
chr5 (55-255)||(35792767-35792964)
chr5 (199-391)||(35793162-35793345)
chr5 (125-255)||(16534750-16534881)
chr5 (199-273)||(10554-10628)
chr5 (125-221)||(28257998-28258093)
chr5 (206-273)||(9732495-9732562)
chr5 (187-391)||(11338584-11338802)
chr5 (199-391)||(25944566-25944750)
chr5 (141-255)||(18779790-18779904)
chr5 (125-221)||(22368188-22368285)
chr5 (199-391)||(11340599-11340782)
chr5 (199-391)||(18780052-18780235)
chr5 (41-218)||(19498280-19498458)
chr5 (41-221)||(10779799-10779980)
chr5 (206-273)||(11341018-11341085)
chr5 (199-376)||(110990-111157)
chr5 (207-273)||(19498182-19498248)
chr5 (41-218)||(11341116-11341294)
chr5 (199-391)||(16534391-16534574)
chr5 (152-248)||(25211623-25211719)
chr5 (152-248)||(25275775-25275871)
chr5 (320-376)||(25424680-25424736)
chr5 (116-218)||(25425102-25425206)
chr5 (209-273)||(25944472-25944536)
chr5 (201-273)||(43445582-43445654)
chr5 (125-218)||(10831-10925)
chr5 (125-199)||(5452432-5452511)
chr5 (199-273)||(22368337-22368411)
chr5 (55-218)||(43445390-43445555)
chr5 (41-218)||(4201586-4201764)
chr5 (116-218)||(9732360-9732464)
chr5 (201-273)||(10780011-10780082)
chr5 (320-391)||(22368602-22368674)
chr5 (125-218)||(21075192-21075286)
chr5 (125-218)||(21933863-21933957)
chr5 (125-218)||(21940033-21940127)
chr5 (125-218)||(29192321-29192415)
chr5 (125-218)||(35580735-35580829)
chr5 (125-218)||(37010867-37010961)
chr5 (125-199)||(3672421-3672497)
chr5 (41-218)||(24594981-24595159)
chr5 (199-269)||(110888-110957)
chr5 (319-391)||(7726919-7726993)
chr5 (215-273)||(29192583-29192641)
chr5 (259-296)||(21653228-21653265)
chr5 (55-194)||(23327458-23327598)
chr5 (35-67)||(21649463-21649495)
chr5 (116-218)||(27008492-27008596)
[»] chr4 (94 HSPs)
chr4 (15-391)||(21961053-21961440)
chr4 (103-391)||(12837900-12838192)
chr4 (27-391)||(12901269-12901631)
chr4 (125-391)||(44345057-44345333)
chr4 (15-199)||(8873978-8874162)
chr4 (199-391)||(18166874-18167067)
chr4 (124-391)||(33738477-33738732)
chr4 (199-391)||(34393385-34393580)
chr4 (199-391)||(53909555-53909750)
chr4 (15-168)||(34197658-34197812)
chr4 (200-391)||(19699414-19699606)
chr4 (200-391)||(19709999-19710191)
chr4 (125-391)||(16366361-16366624)
chr4 (199-391)||(7134310-7134503)
chr4 (199-391)||(8372607-8372800)
chr4 (34-219)||(14899948-14900136)
chr4 (15-168)||(37958550-37958704)
chr4 (15-159)||(27959563-27959708)
chr4 (199-391)||(15274470-15274663)
chr4 (15-164)||(12245745-12245895)
chr4 (125-391)||(44054168-44054427)
chr4 (199-391)||(26678179-26678370)
chr4 (35-221)||(109957-110143)
chr4 (34-164)||(15852829-15852959)
chr4 (34-156)||(41167447-41167569)
chr4 (125-391)||(45460611-45460894)
chr4 (35-273)||(15211762-15212004)
chr4 (197-391)||(53706635-53706828)
chr4 (125-391)||(13244606-13244861)
chr4 (125-391)||(13811287-13811558)
chr4 (199-391)||(22356424-22356616)
chr4 (125-391)||(30236147-30236411)
chr4 (218-391)||(20813715-20813890)
chr4 (210-391)||(47355509-47355688)
chr4 (246-391)||(18294600-18294746)
chr4 (125-213)||(53909431-53909519)
chr4 (15-199)||(41257842-41258031)
chr4 (55-169)||(5372228-5372342)
chr4 (55-169)||(10238967-10239081)
chr4 (55-164)||(47469867-47469976)
chr4 (39-191)||(16521294-16521447)
chr4 (41-221)||(5684404-5684586)
chr4 (199-391)||(15211515-15211698)
chr4 (59-169)||(50223696-50223806)
chr4 (311-391)||(8874265-8874346)
chr4 (217-273)||(34393610-34393666)
chr4 (125-217)||(43283043-43283138)
chr4 (155-231)||(53706515-53706591)
chr4 (207-309)||(55378542-55378646)
chr4 (206-273)||(8372854-8372921)
chr4 (206-273)||(18167097-18167164)
chr4 (152-273)||(7134088-7134208)
chr4 (258-391)||(9293712-9293843)
chr4 (258-391)||(10642374-10642505)
chr4 (125-221)||(10642586-10642683)
chr4 (199-391)||(19998517-19998700)
chr4 (41-218)||(19999005-19999183)
chr4 (125-194)||(52267125-52267196)
chr4 (206-269)||(26678428-26678491)
chr4 (125-391)||(18496065-18496334)
chr4 (207-273)||(19998907-19998973)
chr4 (35-81)||(25120617-25120663)
chr4 (141-211)||(54119906-54119976)
chr4 (125-221)||(9293924-9294021)
chr4 (208-273)||(19998780-19998845)
chr4 (41-220)||(22356065-22356244)
chr4 (206-274)||(13751910-13751978)
chr4 (116-218)||(15138134-15138238)
chr4 (320-391)||(18246178-18246250)
chr4 (116-218)||(26678522-26678626)
chr4 (209-273)||(47355705-47355769)
chr4 (116-218)||(47355803-47355907)
chr4 (199-391)||(16520801-16520985)
chr4 (146-271)||(7848776-7848901)
chr4 (141-218)||(8372951-8373029)
chr4 (125-218)||(14994678-14994772)
chr4 (141-218)||(18167195-18167273)
chr4 (125-218)||(18246668-18246762)
chr4 (258-391)||(54120066-54120195)
chr4 (318-384)||(55378691-55378757)
chr4 (141-221)||(15274361-15274442)
chr4 (15-52)||(34393690-34393727)
chr4 (206-307)||(109828-109922)
chr4 (208-273)||(16521015-16521080)
chr4 (116-218)||(14950498-14950602)
chr4 (125-185)||(15043381-15043443)
chr4 (125-185)||(15110981-15111043)
chr4 (161-255)||(16521168-16521263)
chr4 (56-98)||(17213378-17213420)
chr4 (199-273)||(18246391-18246465)
chr4 (55-101)||(24237479-24237525)
chr4 (247-291)||(43283140-43283185)
chr4 (327-386)||(5684742-5684802)
chr4 (125-181)||(53706465-53706521)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (15-391)||(59865-60250)
[»] scaffold0011 (9 HSPs)
scaffold0011 (125-391)||(256560-256827)
scaffold0011 (141-221)||(125009-125089)
scaffold0011 (141-219)||(72028-72106)
scaffold0011 (141-219)||(76409-76487)
scaffold0011 (141-213)||(192985-193057)
scaffold0011 (261-391)||(72191-72317)
scaffold0011 (261-391)||(76572-76698)
scaffold0011 (262-391)||(125173-125298)
scaffold0011 (258-391)||(192768-192897)
[»] chr1 (70 HSPs)
chr1 (15-391)||(35053141-35053515)
chr1 (125-391)||(22407894-22408162)
chr1 (125-391)||(2422733-2422997)
chr1 (15-273)||(5676091-5676355)
chr1 (199-391)||(41217544-41217739)
chr1 (207-391)||(5676350-5676535)
chr1 (15-196)||(41217945-41218126)
chr1 (15-221)||(20444214-20444420)
chr1 (200-391)||(20252342-20252534)
chr1 (15-221)||(37845956-37846162)
chr1 (15-221)||(20529978-20530185)
chr1 (34-164)||(38035130-38035260)
chr1 (15-159)||(13378250-13378395)
chr1 (125-263)||(49966013-49966151)
chr1 (199-391)||(9786123-9786315)
chr1 (36-159)||(19601713-19601836)
chr1 (15-164)||(36357826-36357976)
chr1 (125-391)||(35524082-35524350)
chr1 (34-164)||(37235470-37235600)
chr1 (39-213)||(20929955-20930131)
chr1 (15-164)||(21193694-21193844)
chr1 (199-328)||(22250776-22250905)
chr1 (39-218)||(22226459-22226638)
chr1 (125-291)||(22836911-22837078)
chr1 (56-150)||(8539490-8539584)
chr1 (56-150)||(8604729-8604823)
chr1 (39-221)||(22352601-22352785)
chr1 (35-213)||(44036401-44036582)
chr1 (125-391)||(51657986-51658255)
chr1 (55-164)||(5769744-5769853)
chr1 (219-391)||(18505646-18505817)
chr1 (125-221)||(20895390-20895486)
chr1 (125-273)||(20956627-20956776)
chr1 (39-255)||(15862938-15863149)
chr1 (206-391)||(21716430-21716624)
chr1 (55-169)||(20821476-20821590)
chr1 (15-169)||(5471872-5472028)
chr1 (125-221)||(9785899-9785995)
chr1 (15-81)||(20526725-20526791)
chr1 (199-365)||(20895514-20895660)
chr1 (55-169)||(41213197-41213311)
chr1 (199-273)||(41217793-41217867)
chr1 (56-169)||(22144923-22145036)
chr1 (199-391)||(15863325-15863508)
chr1 (199-391)||(21857753-21857934)
chr1 (199-391)||(17146820-17147003)
chr1 (125-255)||(22250622-22250752)
chr1 (201-273)||(22352498-22352570)
chr1 (125-221)||(27673257-27673355)
chr1 (199-273)||(15863221-15863295)
chr1 (199-391)||(22352285-22352468)
chr1 (125-221)||(22365155-22365252)
chr1 (116-218)||(17147258-17147362)
chr1 (141-210)||(21857966-21858035)
chr1 (258-391)||(22364943-22365074)
chr1 (125-198)||(35935166-35935239)
chr1 (246-359)||(20589963-20590078)
chr1 (55-218)||(7642105-7642270)
chr1 (125-218)||(17003302-17003396)
chr1 (342-391)||(22080190-22080240)
chr1 (41-218)||(22034325-22034503)
chr1 (56-198)||(45050185-45050324)
chr1 (269-307)||(20444085-20444123)
chr1 (269-307)||(20529825-20529863)
chr1 (125-218)||(41392929-41393023)
chr1 (125-218)||(51451090-51451184)
chr1 (141-194)||(21651619-21651672)
chr1 (262-307)||(37846241-37846286)
chr1 (116-218)||(20826805-20826909)
chr1 (246-289)||(27673216-27673260)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (15-391)||(12488-12874)
[»] chr2 (91 HSPs)
chr2 (15-309)||(6877821-6878117)
chr2 (125-391)||(36892360-36892628)
chr2 (125-391)||(25877618-25877882)
chr2 (16-391)||(8886450-8886814)
chr2 (19-254)||(22861923-22862158)
chr2 (15-219)||(25600431-25600635)
chr2 (34-273)||(24088880-24089120)
chr2 (200-391)||(42180210-42180402)
chr2 (15-199)||(19434958-19435144)
chr2 (15-221)||(15631864-15632071)
chr2 (199-391)||(21276342-21276535)
chr2 (35-252)||(43644471-43644688)
chr2 (15-169)||(19658470-19658625)
chr2 (34-164)||(4795-4925)
chr2 (15-164)||(25304094-25304244)
chr2 (205-391)||(24966425-24966609)
chr2 (34-164)||(23823027-23823157)
chr2 (34-164)||(23824971-23825101)
chr2 (34-164)||(23832106-23832236)
chr2 (208-376)||(12638003-12638171)
chr2 (15-170)||(43641346-43641502)
chr2 (15-142)||(27260130-27260257)
chr2 (15-164)||(19670629-19670778)
chr2 (206-391)||(21140139-21140325)
chr2 (15-164)||(24296071-24296221)
chr2 (125-391)||(7319718-7319989)
chr2 (35-213)||(22282601-22282782)
chr2 (125-391)||(28972272-28972543)
chr2 (199-391)||(12643812-12644000)
chr2 (125-391)||(31832-32102)
chr2 (37-213)||(22273368-22273547)
chr2 (199-291)||(25600309-25600401)
chr2 (116-273)||(12643600-12643758)
chr2 (123-391)||(269422-269693)
chr2 (126-391)||(24573051-24573320)
chr2 (199-309)||(15631702-15631812)
chr2 (305-391)||(4450084-4450171)
chr2 (39-218)||(22692768-22692949)
chr2 (39-218)||(22697415-22697596)
chr2 (125-391)||(22581588-22581858)
chr2 (55-169)||(18534350-18534464)
chr2 (59-169)||(24272579-24272689)
chr2 (199-391)||(3801123-3801306)
chr2 (41-169)||(22137341-22137469)
chr2 (199-391)||(38706810-38706993)
chr2 (141-221)||(461139-461219)
chr2 (199-391)||(34822315-34822498)
chr2 (141-213)||(9654507-9654579)
chr2 (41-218)||(12637665-12637843)
chr2 (141-221)||(20629034-20629114)
chr2 (41-218)||(21140355-21140533)
chr2 (206-273)||(12637873-12637940)
chr2 (305-391)||(22691823-22691910)
chr2 (305-391)||(22696470-22696557)
chr2 (305-391)||(25600173-25600260)
chr2 (141-219)||(24966692-24966770)
chr2 (125-274)||(22691607-22691758)
chr2 (125-274)||(22696254-22696405)
chr2 (320-391)||(8941712-8941784)
chr2 (320-391)||(19888848-19888920)
chr2 (41-218)||(21276027-21276205)
chr2 (199-376)||(25210909-25211076)
chr2 (206-273)||(34822578-34822645)
chr2 (322-391)||(6877721-6877791)
chr2 (199-307)||(20629142-20629243)
chr2 (34-194)||(24687161-24687322)
chr2 (199-307)||(43644713-43644814)
chr2 (41-218)||(3800613-3800791)
chr2 (199-271)||(25211108-25211180)
chr2 (41-218)||(34822676-34822854)
chr2 (206-273)||(3800822-3800889)
chr2 (199-391)||(9654615-9654792)
chr2 (125-218)||(19888362-19888456)
chr2 (319-391)||(22654339-22654412)
chr2 (41-218)||(12726531-12726709)
chr2 (125-218)||(5889880-5889974)
chr2 (125-218)||(11232835-11232929)
chr2 (125-218)||(14908022-14908116)
chr2 (125-218)||(22514682-22514776)
chr2 (125-218)||(28777283-28777377)
chr2 (141-198)||(24828161-24828218)
chr2 (141-198)||(24832613-24832670)
chr2 (141-221)||(720835-720918)
chr2 (116-218)||(8942124-8942228)
chr2 (41-218)||(23773015-23773193)
chr2 (199-273)||(3800969-3801043)
chr2 (322-391)||(22273164-22273233)
chr2 (199-273)||(24089074-24089146)
chr2 (148-198)||(25211379-25211429)
chr2 (200-253)||(461007-461060)
chr2 (262-307)||(23806359-23806404)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (15-391)||(4425-4805)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (15-391)||(13964-14354)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (125-391)||(31038-31304)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (125-391)||(20860-21128)
scaffold0008 (124-391)||(28450-28719)
scaffold0008 (39-213)||(129700-129877)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (15-307)||(249025-249313)
[»] scaffold0447 (6 HSPs)
scaffold0447 (15-221)||(3095-3301)
scaffold0447 (199-273)||(2737-2811)
scaffold0447 (199-273)||(2865-2939)
scaffold0447 (199-266)||(2616-2683)
scaffold0447 (199-273)||(2993-3067)
scaffold0447 (305-391)||(2475-2561)
[»] scaffold0383 (7 HSPs)
scaffold0383 (15-221)||(5703-5909)
scaffold0383 (125-255)||(813-943)
scaffold0383 (199-266)||(5480-5547)
scaffold0383 (199-273)||(5601-5675)
scaffold0383 (199-391)||(328-511)
scaffold0383 (305-391)||(5339-5425)
scaffold0383 (199-273)||(641-715)
[»] scaffold0622 (3 HSPs)
scaffold0622 (15-273)||(7842-8108)
scaffold0622 (199-375)||(7453-7631)
scaffold0622 (199-276)||(7682-7759)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (124-391)||(7012-7287)
[»] scaffold0396 (4 HSPs)
scaffold0396 (15-219)||(13680-13884)
scaffold0396 (39-218)||(15922-16103)
scaffold0396 (199-292)||(13914-14007)
scaffold0396 (316-391)||(14078-14154)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (125-391)||(535-802)
[»] scaffold0434 (2 HSPs)
scaffold0434 (15-221)||(3129-3335)
scaffold0434 (199-391)||(2907-3101)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (15-273)||(3784-4044)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (15-198)||(27067-27250)
scaffold0120 (311-376)||(26889-26954)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (125-391)||(1046-1307)
[»] scaffold0195 (8 HSPs)
scaffold0195 (15-274)||(19799-20067)
scaffold0195 (15-220)||(17776-17983)
scaffold0195 (15-168)||(8140-8293)
scaffold0195 (15-168)||(13529-13682)
scaffold0195 (199-391)||(17526-17716)
scaffold0195 (199-391)||(19556-19746)
scaffold0195 (319-391)||(8466-8539)
scaffold0195 (319-391)||(13855-13928)
[»] scaffold0009 (5 HSPs)
scaffold0009 (207-391)||(236412-236597)
scaffold0009 (15-220)||(236652-236857)
scaffold0009 (35-273)||(270545-270785)
scaffold0009 (199-391)||(270329-270515)
scaffold0009 (75-119)||(255963-256007)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (199-391)||(27950-28145)
scaffold0116 (125-273)||(28179-28327)
scaffold0116 (199-273)||(28125-28199)
[»] scaffold0269 (4 HSPs)
scaffold0269 (200-391)||(3055-3248)
scaffold0269 (199-391)||(281-477)
scaffold0269 (39-199)||(577-739)
scaffold0269 (125-213)||(3430-3518)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (200-391)||(30650-30843)
scaffold0049 (125-213)||(31002-31090)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (15-254)||(56369-56615)
scaffold0051 (219-391)||(56206-56370)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (199-391)||(13548-13740)
scaffold0359 (125-249)||(13434-13557)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (15-274)||(8493-8754)
scaffold0190 (336-391)||(8387-8443)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (125-391)||(15006-15271)
scaffold0138 (200-391)||(26451-26642)
scaffold0138 (15-164)||(23915-24058)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (199-391)||(4638-4831)
scaffold0483 (39-221)||(4250-4435)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (199-391)||(49478-49671)
scaffold0109 (39-221)||(49090-49275)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (125-309)||(3707-3893)
scaffold0673 (305-391)||(3927-4014)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (199-391)||(21633-21827)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (199-391)||(156183-156376)
scaffold0023 (199-391)||(85966-86149)
scaffold0023 (43-219)||(34811-34989)
scaffold0023 (206-273)||(156062-156129)
scaffold0023 (125-218)||(155937-156031)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (125-284)||(26416-26575)
scaffold0037 (131-391)||(66322-66592)
scaffold0037 (15-135)||(70883-71003)
scaffold0037 (322-391)||(26590-26660)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (208-391)||(2474-2658)
scaffold0342 (125-391)||(4078-4346)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (15-165)||(2112-2262)
scaffold0610 (319-391)||(2438-2511)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (15-168)||(71768-71922)
scaffold0058 (319-391)||(72093-72166)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (199-389)||(77600-77793)
scaffold0034 (246-293)||(35999-36047)
scaffold0034 (141-199)||(77919-77977)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (15-164)||(106409-106559)
scaffold0022 (146-391)||(113903-114150)
scaffold0022 (39-218)||(6649-6830)
scaffold0022 (56-169)||(130409-130522)
scaffold0022 (39-218)||(58936-59117)
scaffold0022 (125-221)||(108058-108156)
[»] scaffold0253 (1 HSPs)
scaffold0253 (208-391)||(14849-15032)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (200-391)||(17735-17928)
scaffold0292 (125-221)||(18055-18151)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (205-391)||(499-683)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (199-376)||(29653-29830)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (15-164)||(4842-4991)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (199-391)||(33395-33580)
scaffold0184 (35-213)||(32688-32869)
scaffold0184 (125-248)||(33725-33848)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (199-391)||(39264-39449)
scaffold0078 (35-213)||(39975-40156)
scaffold0078 (125-248)||(38996-39119)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (54-231)||(68785-68964)
scaffold0031 (215-388)||(68597-68773)
scaffold0031 (15-62)||(69394-69441)
scaffold0031 (174-391)||(30314-30531)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (199-388)||(6984-7175)
scaffold0338 (125-209)||(7214-7298)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (242-391)||(23040-23190)
scaffold0158 (323-391)||(16376-16445)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (15-164)||(7153-7303)
scaffold0095 (319-391)||(7416-7489)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (34-164)||(78342-78472)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (15-164)||(118094-118244)
scaffold0016 (125-209)||(163817-163901)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (201-360)||(94335-94495)
scaffold0044 (174-221)||(94695-94742)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (35-273)||(2627-2869)
scaffold0597 (199-391)||(2899-3083)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (148-391)||(19255-19489)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (125-273)||(90600-90748)
scaffold0028 (34-143)||(78228-78337)
scaffold0028 (199-391)||(90802-91018)
scaffold0028 (57-218)||(128867-129026)
scaffold0028 (199-273)||(128730-128804)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (35-213)||(145016-145195)
scaffold0025 (35-213)||(147275-147454)
scaffold0025 (199-253)||(144926-144980)
scaffold0025 (199-253)||(147185-147239)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (34-156)||(34006-34128)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (199-334)||(16826-16961)
scaffold0315 (141-199)||(17070-17128)
[»] scaffold0032 (5 HSPs)
scaffold0032 (37-219)||(54118-54300)
scaffold0032 (39-255)||(109582-109799)
scaffold0032 (199-273)||(109897-109971)
scaffold0032 (199-307)||(54011-54112)
scaffold0032 (200-253)||(110002-110055)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (35-213)||(197600-197778)
scaffold0004 (55-169)||(84942-85056)
scaffold0004 (55-169)||(26080-26194)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (122-391)||(1652-1925)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (15-185)||(25101-25274)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (35-213)||(217246-217426)
scaffold0003 (207-391)||(5221-5396)
scaffold0003 (125-218)||(5661-5755)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (199-391)||(9930-10122)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (55-199)||(3244-3393)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (35-221)||(11532-11716)
scaffold0467 (258-307)||(11796-11845)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (39-218)||(4320-4501)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (125-384)||(6123-6386)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (42-213)||(5102-5274)
scaffold0266 (125-213)||(12788-12876)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (199-334)||(21158-21288)
scaffold0039 (125-221)||(20906-21002)
scaffold0039 (199-273)||(21030-21104)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (34-153)||(4568-4686)
[»] scaffold0346 (3 HSPs)
scaffold0346 (15-163)||(14101-14250)
scaffold0346 (199-275)||(15935-16011)
scaffold0346 (147-221)||(15833-15907)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (199-391)||(6410-6583)
scaffold0407 (295-391)||(22-119)
scaffold0407 (125-221)||(6310-6406)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (39-218)||(51511-51690)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (125-391)||(3125-3395)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (207-391)||(75550-75727)
scaffold0001 (125-196)||(72106-72177)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (39-218)||(14779-14958)
scaffold0225 (39-218)||(28300-28479)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (210-333)||(25594-25718)
scaffold0134 (209-273)||(25735-25799)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (34-169)||(211-346)
scaffold0786 (34-169)||(5266-5401)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (34-169)||(3799-3934)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (35-159)||(1-126)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (203-364)||(44288-44443)
scaffold0066 (218-364)||(52457-52597)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (39-218)||(106479-106660)
scaffold0026 (199-391)||(27169-27352)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (125-290)||(31925-32093)
scaffold0103 (316-391)||(31776-31850)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (39-220)||(1292-1469)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (39-218)||(35-215)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (125-213)||(40010-40098)
scaffold0106 (320-391)||(37627-37697)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (55-159)||(55922-56026)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (35-213)||(41190-41371)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (146-273)||(145283-145412)
scaffold0014 (319-391)||(144987-145060)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (39-218)||(9426-9607)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (269-364)||(12989-13085)
scaffold0130 (320-391)||(31120-31192)
scaffold0130 (215-273)||(31333-31391)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (39-213)||(7465-7641)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (35-101)||(52771-52837)
scaffold0018 (35-101)||(56723-56789)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (199-391)||(804-987)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (141-219)||(1509-1587)
scaffold1140 (258-391)||(1298-1427)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (320-391)||(15167-15239)
[»] scaffold0450 (2 HSPs)
scaffold0450 (305-391)||(4639-4725)
scaffold0450 (206-274)||(4528-4596)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (126-218)||(1-94)
scaffold0384 (199-391)||(264-448)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (141-213)||(6826-6898)
scaffold0218 (199-391)||(6934-7115)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (41-194)||(29855-30009)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (34-218)||(17586-17771)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (125-218)||(37768-37862)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (55-101)||(4532-4578)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (125-274)||(2839-2989)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (125-274)||(26542-26692)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (75-119)||(12285-12329)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (350-391)||(7299-7341)


Alignment Details
Target: scaffold0240 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 16 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6221 - 5845
Alignment:
Q  16 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6221 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgtt 6122  T
Q  116 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgat 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6121 gcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgattgat 6022  T
Q  216 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatga 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6021 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttaatgtaactatatgtatga 5922  T
Q  316 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  5921 gaatgttattattgatcaaatacatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 5845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 90)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Original strand, 26071753 - 26072131
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26071753 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 26071852  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26071853 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 26071952  T
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26071953 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 26072052  T
Q  314 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26072053 gagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26072131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Original strand, 26095540 - 26095918
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26095540 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 26095639  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26095640 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 26095739  T
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26095740 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 26095839  T
Q  314 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26095840 gagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26095918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3893772 - 3893381
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3893772 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 3893673  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  3893672 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 3893573  T
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaag- 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||     
T  3893572 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggttttgatgtaagt 3893473  T
Q  305 -----tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
         ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3893472 atatatatatttatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 3893381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12753558 - 12753172
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12753558 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttaaatacgatgtttttgt 12753459  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc---ttattgatatat----- 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   || |||| || |         
T  12753458 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttttgaaatgtgattg 12753359  T
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg-gggtttgatgtaag 304  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||   ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||| ||||    
T  12753358 gtgattggtgactgtgtatgaataactgcaaattgatgatttttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagaatgtgatataag 12753259  T
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12753258 tat-tatttgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgt 12753172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 126 - 391
Target Start/End: Original strand, 15824105 - 15824371
Alignment:
Q  126 tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtat 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  15824105 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgtttggtgattatgtat 15824204  T
Q  226 gaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 325  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15824205 gaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 15824304  T
Q  326 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15824305 attgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 15824371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44863711 - 44863443
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44863711 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgta 44863612  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44863611 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgcgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtataagtatgagaatatta 44863512  T
Q  324 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  44863511 ttattgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 44863443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 142136 - 141869
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  142136 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgttgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggttattgtgta 142037  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142036 tgaataattgtgaattgatattcgttcatgacacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 141937  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  141936 tattgatcaagtgcatgatgattaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 141869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Original strand, 112784 - 113168
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  112784 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaaggattgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 112883  T
Q  115 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-------tgatat 204  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||       ||  ||    
T  112884 tgcatcgaaggtgacgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgttaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgat 112983  T
Q  205 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 304  Q
      ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  112984 tggtgattgataattgcgtatgaataaatgtgaattgttgtttgttcatgacacatgtgattggttattattgatgtgagatattgagttttgatgtaag 113083  T
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||   |||| |   | || |||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  113084 tattgatatgtg---actactattgatcaagtgcataatgtttattttgaaatattcatgctaaatgttatttggattatgatgatgt 113168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 47288244 - 47287976
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  47288244 gtgacaaccttgggatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtaattggtgattgtgta 47288145  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47288144 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgggtttttgatgtaagtatatgtacgagaatatta 47288045  T
Q  324 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47288044 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 47287976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 289
Target Start/End: Original strand, 45453745 - 45454016
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||    
T  45453745 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacga---ttttgt 45453841  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||     
T  45453842 tgcatcgaaggtgatgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaat-tgtgattgg 45453940  T
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatatt 289  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45453941 tgattgtgtatgaatagctgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatatt 45454016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 291
Target Start/End: Original strand, 1938257 - 1938532
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||      
T  1938257 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagagttgaactcttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttta 1938356  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    | |||| || |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||     
T  1938357 t-catcaaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaacgtgattgg 1938455  T
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg 291  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1938456 tgattacgtatgcataattgtgtattgatatttgtccatgacacatgtgattggtggttattgatgtgagatattgg 1938532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 7286328 - 7286522
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  7286328 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttg 7286427  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  7286428 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgttgattatgatgatgt 7286522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 12545607 - 12545802
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||    
T  12545607 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattgttgatgtgagatattggggttttt 12545706  T
Q  297 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  12545707 gatgtaagtatatgtataagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgtaatgtggactatgatgatgt 12545802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Original strand, 18305642 - 18305831
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18305642 gatatatgtgattgacgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttggt 18305741  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18305742 gtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18305831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Original strand, 13867887 - 13868080
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tga 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || |||    
T  13867887 gatatatgtgattggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattgagattatga 13867986  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13867987 tataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 13868080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 15913921 - 15914075
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15913921 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 15914020  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtc 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15914021 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 15914075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 198 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7291102 - 7290908
Alignment:
Q  198 ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttg 297  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  7291102 ttgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttg 7291003  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7291002 atgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 7290908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 2192606 - 2192799
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2192606 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 2192705  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  2192706 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatttggattatgataatgt 2192799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 369336 - 369143
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  369336 tgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattggtgatgattgatgtgagatattggggtttga 369237  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  369236 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 369143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 14253071 - 14253263
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14253071 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgt-catgacacatgtgattggttattattgatgtgagatattggggtttga 14253169  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14253170 tgtaagtattgatttgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 14253263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 16480836 - 16481029
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16480836 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 16480935  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  16480936 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcatgtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 16481029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 15952859 - 15953050
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15952859 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttga 15952958  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  15952959 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgt 15953050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13388643 - 13388493
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13388643 catcatagtcatgttgagtcttatagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaatacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttctg 13388544  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13388543 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 13388493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Original strand, 9058141 - 9058311
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9058141 ttgtagctttaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 9058240  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9058241 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 9058311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 49049452 - 49049723
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||    
T  49049452 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattgatgaaatgtgaatgattagtgt 49049551  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||| |||| | ||    
T  49049552 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatg--gtatgaatatatatgtggat 49049649  T
Q  320 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49049650 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 49049723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 219
Target Start/End: Original strand, 15761867 - 15762051
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  15761867 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 15761965  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    |  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  15761966 tttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 15762051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 32496053 - 32496242
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  32496053 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaacgcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 32496152  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32496153 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 32496242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13376324 - 13376200
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13376324 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgg-tgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgag 13376226  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  13376225 gtgattcggtaccatatgcatttatg 13376200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15629254 - 15629004
Alignment:
Q  146 ggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattga 242  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||    
T  15629254 ggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtgcatgaataaatgtgagttga 15629155  T
Q  243 tatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattatta-ttgatcaagtaca 339  Q
    |  |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||| |||  | ||||||| | ||||| |||||||    
T  15629154 tgattgttcataacacatctgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatg--gtatgaatatatatatggatattatgatttgattaagtaca 15629057  T
Q  340 tgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15629056 tgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 15629004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Original strand, 20587140 - 20587254
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20587140 actcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 20587239  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20587240 tgcatatatgtgtcg 20587254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 13867688 - 13867784
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13867688 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgt 13867784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 376
Target Start/End: Original strand, 15762262 - 15762429
Alignment:
Q  203 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 301  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15762262 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 15762354  T
Q  302 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15762355 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 15762429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13273246 - 13272976
Alignment:
Q  126 tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 222  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  13273246 tgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtg 13273147  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 320  Q
     ||| |||| ||||  |||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||  ||| | || | |||| | |||    
T  13273146 catggataaatgtgatttgatgattgttccagacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatatcgggattatg--gtatgaatgtatatgtggata 13273049  T
Q  321 ttatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||    
T  13273048 ttattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcttgtcaactgttatgtgaattatgatgatgt 13272976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Original strand, 8565108 - 8565212
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8565108 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttattgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 8565207  T
Q  155 tgcat 159  Q
    |||||    
T  8565208 tgcat 8565212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 18255324 - 18255505
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  18255324 gttgtaaaagggctaagcgcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 18255422  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18255423 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18255505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3058713 - 3058585
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  3058713 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatataaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 3058615  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |  || |||| |||||||||||||| ||||    
T  3058614 tttggagatttggtaccacatgcatttatg 3058585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 164
Target Start/End: Original strand, 9322594 - 9322703
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9322594 actcttttacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccaca 9322693  T
Q  155 tgcatgtatg 164  Q
    ||||| ||||    
T  9322694 tgcatatatg 9322703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11285715 - 11285619
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11285715 gtgacgaccttgagttaatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattaatgattgt 11285619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 391
Target Start/End: Original strand, 16571983 - 16572053
Alignment:
Q  322 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16571983 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 16572053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16593679 - 16593609
Alignment:
Q  322 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16593679 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 16593609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28719091 - 28718977
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28719091 actcgtttacttcggtgataatgtaagacaggtgtgaaatcttacatgtgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgacttggtaccaca 28718992  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  28718991 tgcatatatgtgtcg 28718977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 125492 - 125391
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  125492 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtaaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 125393  T
Q  134 tt 135  Q
    ||    
T  125392 tt 125391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2024858 - 2024757
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatg----tgattggtgattattgatgtaagatattggggt 294  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2024858 tgatgtatatgattgatgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattgattggtgattattgatgtgagatattgcggt 2024759  T
Q  295 tt 296  Q
    ||    
T  2024758 tt 2024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 11582535 - 11582631
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11582535 gtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 11582631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 255
Target Start/End: Original strand, 15952673 - 15952813
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | || | |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  15952673 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagacttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgattgg 15952772  T
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 255  Q
     ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15952773 agattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 15952813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Original strand, 16571751 - 16571921
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 222  Q
    |||| |||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| | |||||||| |||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  16571751 gtgatgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 16571850  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 292  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16571851 tatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16571921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16593911 - 16593741
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 222  Q
    |||| |||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| | |||||||| |||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  16593911 gtgatgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 16593812  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 292  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16593811 tatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16593741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2027222 - 2027097
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||| | |||||||||    
T  2027222 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagtcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcggaggtgacgacc 2027123  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcat 159  Q
    ||   | |||| ||||||||||||||    
T  2027122 ttttcgagatttggtaccacatgcat 2027097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 221
Target Start/End: Original strand, 13038808 - 13038905
Alignment:
Q  124 agtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13038808 agtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagttttattgatatatgtgattggtgattgt 13038905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 291
Target Start/End: Original strand, 10862515 - 10862683
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||  ||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10862515 gtgacgaccttgaagtgatttgctactgcatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacataagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 10862614  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgg 291  Q
      ||| |||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  10862615 tcatg-ataaatgtg-gttgatgattgttcatgacacatgtgattggtggttacttaatgtaagatattgg 10862683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Original strand, 12249771 - 12249908
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 222  Q
    |||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||  ||| ||||    
T  12249771 gtgacgactttgaagtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatttcgaaatgtgattagtgaatgtg 12249870  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacat 260  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||    
T  12249871 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacat 12249908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 12545553 - 12545627
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12545553 tgatatatgggattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtgattggtgatt 12545627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 12545404 - 12545501
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattc-ggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  12545404 gtgacgaccttgaggtgattttggtaccacatgcatatatgtgtcaattggtgcatatcatgacataagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 12545501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36051147 - 36051075
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051147 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataacataacatgagtcttattgatatatgtgattg 36051075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 369471 - 369364
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  369471 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattg 369372  T
Q  214 atgattgt 221  Q
     |||||||    
T  369371 gtgattgt 369364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 228
Target Start/End: Original strand, 18305492 - 18305546
Alignment:
Q  174 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  18305492 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgtttatgaa 18305546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 123052 - 122987
Alignment:
Q  149 accacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  123052 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 122987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2024757 - 2024692
Alignment:
Q  327 ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2024757 ttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 2024692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10988271 - 10988092
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  10988271 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 10988174  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  10988173 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 10988092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16210263 - 16210183
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  16210263 gatttggtaccacgtgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgatttgtgattgt 16210183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16416684 - 16416509
Alignment:
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 306  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  16416684 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 16416592  T
Q  307 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  16416591 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 16416509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 16480710 - 16480782
Alignment:
Q  201 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16480710 atatttgtgattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 16480782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 26010695 - 26010874
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatta-tgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaa-gtgacgaccttgag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||||||||      
T  26010695 tgtaaaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 26010793  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| || ||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  26010794 gagatttggcaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 26010874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 391
Target Start/End: Original strand, 45455505 - 45455581
Alignment:
Q  316 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45455505 gaatatcattattgatcaagtatatgatttttgaattaaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 45455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2024998 - 2024904
Alignment:
Q  161 tatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 255  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  2024998 tatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 2024904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 4483364 - 4483318
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 101  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4483364 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 4483318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Original strand, 2192380 - 2192453
Alignment:
Q  146 ggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 218  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  2192380 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 2192453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 2192480 - 2192552
Alignment:
Q  201 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2192480 atatttgttattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 2192552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 15518435 - 15518539
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15518435 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 15518534  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  15518535 gtgat 15518539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2436285 - 2436110
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||| ||||| |||  | |||| || |||||||||||       
T  2436285 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgtgatgtgttttat-catcaaaggtgacgaccttttt 2436191  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  2436190 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 2436110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 11582659 - 11582840
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||       |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  11582659 tgataaatgtggttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtccatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtga 11582751  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  |||| ||     ||||||||| ||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  11582752 tgtaagtattaatgtgtg-----attattattaatcaaatgcatgatgtt--aattgaactattcatgataactgttatttggattatgataatgt 11582840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7291335 - 7291277
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 199  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7291335 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 7291277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7821500 - 7821406
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7821500 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7821406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7828811 - 7828717
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7828811 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16417043 - 16416949
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  16417043 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 16416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 218
Target Start/End: Original strand, 16480605 - 16480683
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 218  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  16480605 gatttggtaccacatgcatttatgtatcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 16480683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 27103134 - 27103228
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27103134 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27103228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 27110482 - 27110576
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27110482 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27110576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27175192 - 27175098
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27175192 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27175098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 38785226 - 38785320
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  38785226 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 38785320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3055241 - 3055193
Alignment:
Q  174 gtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  3055241 gtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgt 3055193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4483320 - 4483268
Alignment:
Q  117 catcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  4483320 catcgaaggtgacgaccttgacgtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 4483268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 122951 - 122854
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  122951 tgataaatgtaattggtgattgtgaattaatagttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtga 122859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 391
Target Start/End: Original strand, 13038989 - 13039114
Alignment:
Q  262 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattat 359  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     |||||||| |||||| | |||||||||   |||||| |||    
T  13038989 tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattatggatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatat 13039081  T
Q  360 tcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13039082 tcatgataactgttatttggattatgttgatgt 13039114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13757225 - 13757060
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtacca 152  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||     
T  13757225 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 13757127  T
Q  153 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  13757126 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 13757060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 120
Target Start/End: Original strand, 3193586 - 3193630
Alignment:
Q  75 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  3193586 atgtaagacgggtgtgaaatgttacat-tgatgtttttgttgcatc 3193630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16210045 - 16209975
Alignment:
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16210045 attattattgatcaaatgcatgatgttaata--gaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 16209975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 19066262 - 19066193
Alignment:
Q  42 gtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttt 111  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  19066262 gtaaaaggggtgtgctcttttacttcggcgaaaatgtaagacggacgtgaaatcttacataggatgtttt 19066193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13460958 - 13460914
Alignment:
Q  76 tgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13460958 tgtaatacgggagtgaaatcttacatttgatgtttttgttgcatc 13460914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 25293856 - 25293960
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  25293856 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 25293955  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  25293956 gtgat 25293960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Original strand, 138296 - 138673
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  138296 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgt 138395  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  138396 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 138495  T
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatg 314  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  138496 tgattgtgtataaataattttgaattgatatttgttcatgaaacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtataagtatg 138595  T
Q  315 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  138596 aaaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgatgatgt 138673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 76853 - 76589
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  76853 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgca 76754  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||    
T  76753 tgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatatgaatattat 76654  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  76653 ta---atcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 76589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10147 - 10003
Alignment:
Q  146 ggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattga 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  10147 ggtaccacatgcatgtatgtgtcgggctaggtacacatcatg-catgagtcttattgctgaaatgtgaatgatgattgtgtatgaataaatgtgatttga 10049  T
Q  243 tatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagata 287  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10048 tgattgttcatggcacatgtgattgatgattaattgatgtgagata 10003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 90)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31627117 - 31626739
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31627117 catcatagtcgtgttgagaatgtagtcgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgt 31627018  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31627017 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 31626918  T
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31626917 tgattgtgtatgaataattgtgaattaatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 31626818  T
Q  314 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  31626817 gagaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattaagatgatgt 31626739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18775886 - 18775506
Alignment:
Q  19 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  18775886 atagttgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtctttgttgta 18775787  T
Q  119 tcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-------gtgat 211  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||   | ||       |||||    
T  18775786 tcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacataagtcttatttgaaaatgtgaatggtgat 18775687  T
Q  212 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgt 311  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18775686 tggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatttttgtttatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattttt 18775587  T
Q  312 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18775586 ttttgaattttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 18775506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22428850 - 22428473
Alignment:
Q  19 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22428850 atagtcgtgttgagtttgtagttgtaaaagggttcaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcgtacatacgatgtttttgttgca 22428751  T
Q  119 tcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||| ||||    
T  22428750 tcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgat 22428651  T
Q  219 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtat--atgtatg 314  Q
    ||||||||||||| | || ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||  || |||     
T  22428650 tgtgtatgaataactatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgatgtaagtattgatatatt 22428551  T
Q  315 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22428550 tgagtattattgttgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 22428473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16105237 - 16104850
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16105237 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 16105138  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||   || || |         
T  16105137 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggttatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtacatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgatta 16105038  T
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt-ggggtttgatgtaag 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16105037 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgataggtgattaattgatgtgagatattgggggtatgatgtaag 16104938  T
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16104937 tattgttatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttataacgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16104850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 25646518 - 25646786
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  25646518 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatttgattggtgattgtgtg 25646617  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 323  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25646618 tgaatagttgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaaatattggggttttgatgtaagtatatgtatgtgaatatta 25646717  T
Q  324 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25646718 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgt 25646786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 391
Target Start/End: Original strand, 25745792 - 25746160
Alignment:
Q  19 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25745792 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgca 25745891  T
Q  119 tcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----gtgat 211  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||  || || |     |||||    
T  25745892 tcgagggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataactgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgat 25745991  T
Q  212 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatg 310  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||  ||              
T  25745992 tggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacacgtgattggggatttattaatgtgagatattggggttt--tg---------- 25746079  T
Q  311 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25746080 -atgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 25746160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 35017451 - 35017645
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35017451 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggttttg 35017550  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35017551 atgtaagtatatctatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgatatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35017645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Original strand, 35011124 - 35011316
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35011124 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgat 35011223  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35011224 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35011316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18128532 - 18128340
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18128532 tgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatatgattggagattattgatgtgagatattggggtttga 18128433  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18128432 tgtaagtatatgtatgggaatgtaattattgatcaagtgcatgatgtttaga-tgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18128340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18579027 - 18578834
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18579027 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttga 18578928  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18578927 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcatatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatcatgt 18578834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 205 - 391
Target Start/End: Original strand, 13622937 - 13623121
Alignment:
Q  205 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 304  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13622937 atgtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaag 13623036  T
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13623037 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 13623121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16084095 - 16083970
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16084095 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 16083996  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16083995 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggt 16083970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19627690 - 19627498
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19627690 gatatatatgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19627591  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19627590 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataataatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19627498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 376
Target Start/End: Original strand, 14628368 - 14628545
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14628368 tgatacatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 14628467  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
    |||||||||   | || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  14628468 tgtaagtattgatgtgggaatattattaatgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatt 14628545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 18004857 - 18005050
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18004857 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 18004956  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  18004957 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatgttcatgttaactattatttggattatgataatgt 18005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23975902 - 23975708
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23975902 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 23975803  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  ||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  23975802 tgtaagtattgatgtggga-aattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 23975708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 18843708 - 18843900
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18843708 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggttttg 18843807  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18843808 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattaaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18843900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18128964 - 18128776
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  18128964 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcgaagattatgtaagacaggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagt 18128865  T
Q  115 tgc-----atcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
     ||     |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18128864 ggcatcgaatcgaaggtgacgaactggaggtgatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 18128776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 13016436 - 13016702
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgat--atgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | || |||| |  || | || |||||| |||||||||||| |||  | |||||  | |||||||    
T  13016436 gtgacgaccttgagatgatatggtaccacatgcatatttgtgtcggtctatatacacatcatg-catgagtcttatcgattgaatgtgacaggtgattgt 13016534  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatat 321  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||    
T  13016535 gtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatattttttagaatat 13016633  T
Q  322 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||| | | ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  13016634 tattattgatcaaatgcttgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactgtatttggattatgatgatgt 13016702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 18383173 - 18383323
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18383173 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggtttagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttg 18383272  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18383273 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 18383323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 19984699 - 19984887
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  19984699 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 19984798  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||  ||  ||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19984799 ttttggatatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 19984887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 208 - 368
Target Start/End: Original strand, 33316422 - 33316582
Alignment:
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33316422 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 33316521  T
Q  308 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaa 368  Q
       | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  33316522 tgatgtgggaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaa 33316582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33323492 - 33323342
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33323492 catcatagtcatgttgagttttgcaattgtaaaagggttgagcttttttactacggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 33323393  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33323392 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccaaatgcatttatg 33323342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1554508 - 1554324
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  1554508 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 1554410  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    |  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  1554409 tttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 1554324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18422303 - 18422182
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18422303 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgta 18422204  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatt 246  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18422203 tgaataattgtgaattgatatt 18422182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Original strand, 17790652 - 17790776
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  17790652 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttatatacgatg-tgttgatgcatcgaaggtgacgacc 17790750  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcat 159  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  17790751 tagaggtgattcggtaccacatgcat 17790776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 16889236 - 16889379
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  16889236 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagcgattttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatg-tgttg 16889334  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgca 158  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16889335 atgcatcgaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgca 16889379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23151939 - 23151845
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23151939 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtt 23151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 259 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23151839 - 23151706
Alignment:
Q  259 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  23151839 atgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaaata 23151740  T
Q  359 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23151739 tccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 23151706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 32896492 - 32896282
Alignment:
Q  174 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-t 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32896492 gtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatt 32896393  T
Q  273 tattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattg 371  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||          |||||  ||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||    
T  32896392 tattgatatgagttattggggttatgatgtaagtat----------atatttatatcgatcaagtacataatgtttgaattaaattattcatggtaactg 32896303  T
Q  372 tta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  32896302 ttatttggattatgatgatgt 32896282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 325
Target Start/End: Original strand, 18825647 - 18825774
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 297  Q
    |||| ||| |||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18825647 tgatgtatatgattggtgattgttcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 18825746  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattatt 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18825747 atgtaagtatatatatgagaatattatt 18825774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 140
Target Start/End: Original strand, 35137439 - 35137565
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35137439 catcatagtcatgttgagttttgcagttgtaaaagggttgagctcttttactacgaagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 35137538  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35137539 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggt 35137565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16239028 - 16238848
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttga- 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||       
T  16239028 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttt 16238930  T
Q  138 ggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    || ||||  ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16238929 ggagattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 16238848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34965584 - 34965470
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34965584 actcttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 34965485  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  34965484 tgcatatatgtgtcg 34965470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Original strand, 25369014 - 25369184
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  25369014 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 25369113  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggg 292  Q
    | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25369114 gcatgaataaatgtg-attgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattacttaatgtaagatattggg 25369184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22846767 - 22846615
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat----gcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtacc 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||     
T  22846767 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatcgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgcggtgatttggtact 22846668  T
Q  152 acatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 199  Q
    |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22846667 acatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 22846615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11214803 - 11214623
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc-ttga 137  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | ||||||||| ||      
T  11214803 gttgtaaaatggttgagctcttttacttcggagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttt 11214705  T
Q  138 ggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11214704 ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattgatgat 11214623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18397434 - 18397163
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatg--tgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | | || | |   | || |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  18397434 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatataagtgccggtctagatacacatcatg-catgagtcttattggtgatttgtgattgatgatttt 18397336  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | |||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||| | |  |||| || |||||| |||| ||||    
T  18397335 gcatgaataaatgtgattggatacttgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagttgttgagatcgtgatatatgtatatatatgtgaat 18397236  T
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  18397235 attattattgaccaagtacacgaagtttaaattgaaatattcatgttaaacgttatgtggattatgatgatgt 18397163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1554113 - 1553946
Alignment:
Q  203 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 301  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1554113 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 1554021  T
Q  302 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  1554020 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 1553946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16134918 - 16134814
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16134918 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgaagaccttgaggtgatttggtaccaca 16134819  T
Q  155 tgcat 159  Q
    |||||    
T  16134818 tgcat 16134814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4989561 - 4989379
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||    
T  4989561 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttg 4989464  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattg 220  Q
      | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  4989463 ttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattg 4989379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 209
Target Start/End: Original strand, 35017303 - 35017387
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 209  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35017303 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 35017387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 391
Target Start/End: Original strand, 16827873 - 16828003
Alignment:
Q  262 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattc 361  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  16827873 tgattgatgattattgatgtgagataatggggtttgatgtaagtattgacgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcc 16827972  T
Q  362 atgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    || |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16827973 atattaactgttatttggattatgataatgt 16828003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19852909 - 19852795
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19852909 actcttttatttcgatgataatgtaagacgagtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 19852810  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19852809 tgcatatatgtgtcg 19852795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18740935 - 18740863
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18740935 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 18740863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 1659212 - 1659387
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  1659212 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 1659306  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1659307 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaaatatgtgattggtgat 1659387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 219
Target Start/End: Original strand, 13622800 - 13622878
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13622800 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 13622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23220336 - 23220222
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||     | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23220336 actcttttacttcagtgataatataagacggatgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatggataacgaccttgaggtgatttggtaccaca 23220237  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23220236 tgcatatatgtgtcg 23220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17787827 - 17787746
Alignment:
Q  311 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  17787827 tatgataatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattattattttgattatgatgatgt 17787746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 14628111 - 14628289
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  14628111 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 14628208  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  14628209 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 14628289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23976231 - 23976053
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  23976231 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 23976134  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  23976133 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23976053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26088497 - 26088319
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  26088497 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 26088400  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26088399 gagatttggtaccacatgcatttatgcgtccataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 26088319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23976023 - 23975956
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23976023 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 23975956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 33316158 - 33316260
Alignment:
Q  117 catcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  33316158 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 33316257  T
Q  216 gat 218  Q
    |||    
T  33316258 gat 33316260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 14628316 - 14628388
Alignment:
Q  201 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14628316 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 14628388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25173590 - 25173518
Alignment:
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25173590 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25173518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4989171 - 4989004
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  4989171 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 4989079  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
    |||||||||  |||| |     |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  4989078 tgtaagtattaatgtgt-----tattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttatttgttatt 4989004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16238765 - 16238711
Alignment:
Q  205 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacaca 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16238765 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacaca 16238711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18740828 - 18740645
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || || ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||    
T  18740828 tgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttttgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatatctggatgtga 18740736  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18740735 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattcaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18740645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 16827462 - 16827559
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  16827462 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcttgacatgagtcttaaatgatgtatgtgatttatgattgt 16827559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 18004635 - 18004732
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  18004635 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgagaaatgtgattggtgattgt 18004732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Original strand, 1651466 - 1651605
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||| ||||||||    
T  1651466 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 1651560  T
Q  154 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1651561 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 1651605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 16650745 - 16650899
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  16650745 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16650843  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 194  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16650844 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16650899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 220
Target Start/End: Original strand, 18825420 - 18825515
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 220  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  18825420 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18825515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4989275 - 4989201
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  4989275 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttattcatgatacatgtaattggtgatt 4989201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15738757 - 15738590
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||| |  ||| | | |||||||| ||||||||    
T  15738757 gtgacgacgttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatgatgacatgagtttatttggtgaaatgtgattaatgattgt 15738658  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 290  Q
      ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||  || |||||||||||||    
T  15738657 tcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacgtgtgaacggtgattgtttaatgtaagatattg 15738590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 218
Target Start/End: Original strand, 17343864 - 17343942
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17343864 gattcggtaccacatgcatttacgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatataagtgattggtgat 17343942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18422185 - 18422115
Alignment:
Q  322 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  18422185 tattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 18422115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25174134 - 25174040
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  25174134 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 25174040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 27655670 - 27655764
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27655670 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 27655764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 269
Target Start/End: Original strand, 33316292 - 33316353
Alignment:
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 269  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  33316292 tgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgtttctgatacatgtgattggt 33316353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15861375 - 15861243
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  15861375 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 15861281  T
Q  156 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagt 193  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  15861280 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 15861243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 229
Target Start/End: Original strand, 28196439 - 28196546
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| || | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  28196439 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatataagtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattat 28196538  T
Q  222 gtatgaat 229  Q
    | ||||||    
T  28196539 gcatgaat 28196546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 16557515 - 16557669
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatta-tgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaa-gtgacgaccttgag 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||||||||      
T  16557515 tgtaaaagagttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16557613  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 194  Q
    | |||| |||||| ||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16557614 gagatttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16557669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 220
Target Start/End: Original strand, 18843481 - 18843576
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 220  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  18843481 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgcgtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18843576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10487458 - 10487364
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10487458 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 10487364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 16377869 - 16377963
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16377869 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16377963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 16385193 - 16385287
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16385193 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16385287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 269
Target Start/End: Original strand, 16827663 - 16827733
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 269  Q
    |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16827663 tgatttatatgattggtgattatgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattggt 16827733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 218
Target Start/End: Original strand, 22227278 - 22227356
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22227278 gattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22227356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16374999 - 16374954
Alignment:
Q  75 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  16374999 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttacatc 16374954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 29870975 - 29871153
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  29870975 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 29871072  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  29871073 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 29871153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Original strand, 18004770 - 18004827
Alignment:
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  18004770 tgattgtgaatgaatagttgtgaattgatatt-gttcctgatacatgtgattggtgatt 18004827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 19984915 - 19985096
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||     ||||  |||| |||  |||||||| |||||||| ||| |||    
T  19984915 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaatcgataattgttca-----catg--attgatgacgattgatgtgagatattgaggtgtga 19985007  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    | |||||||  |||| |||     |||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19985008 tataagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 19985096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25173805 - 25173731
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  25173805 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 25173731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Original strand, 18835474 - 18835544
Alignment:
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18835474 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18835544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 120
Target Start/End: Original strand, 31162441 - 31162486
Alignment:
Q  75 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 120  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31162441 atgtaagacggatgtcaaatcttacatatgatgtttttgttgcatc 31162486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16230169 - 16230065
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  16230169 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 16230070  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  16230069 gtgat 16230065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23993749 - 23993645
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  23993749 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 23993650  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  23993649 gtgat 23993645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32896538 - 32896494
Alignment:
Q  153 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta 197  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32896538 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta 32896494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 94)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37605668 - 37605283
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  37605668 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgt 37605569  T
Q  115 tgcatcgaaagtgac-gaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||    
T  37605568 tgcatcgaaggtgacagaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattg 37605469  T
Q  214 a-------tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 306  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37605468 atgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgaaatattggggtttgatgtaagta 37605369  T
Q  307 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  37605368 tatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttagattatgatgatgt 37605283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 41244277 - 41243948
Alignment:
Q  49 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41244277 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggt 41244178  T
Q  149 accacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 248  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |              ||||||||||||||||||    
T  41244177 accacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgaatcttattgatatatgtgattgagg--------------attgtgtattgatatttg 41244092  T
Q  249 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41244091 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttta 41243992  T
Q  349 tattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41243991 aattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgt 41243948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25121012 - 25120745
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25121012 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttgataattgtgta 25120913  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120912 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatttatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 25120813  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25120812 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgt 25120745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 19994802 - 19995078
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  19994802 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgtg 19994901  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatg--------taagtatatgtatga 315  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||        ||  ||||| |||||    
T  19994902 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagttattggggttttgatgtatatatatatatatatatatga 19995001  T
Q  316 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  19995002 gaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactattattttgattatgatgatgt 19995078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20480166 - 20479893
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||     
T  20480166 gtgacgacattgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgctcggtgattatgtg 20480067  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagata-ttggggtttgatgtaagta------tatgtatgaga 317  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||      ||| |||||||    
T  20480066 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatatttgggttttgatgtaagtatatatgtatatatgaga 20479967  T
Q  318 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20479966 atatcatt-ttgatcaaatgcatgatgtttatattgaactatccatgttaagtgttattttgattatgatgatgt 20479893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18610620 - 18610428
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18610620 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 18610521  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18610520 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 18610428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 41508927 - 41509122
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41508927 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgagtggtgattattgatgtgagatattggggttttt 41509026  T
Q  297 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41509027 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcctgatgtttgaattgaaatatccatattaactgttatttggattatgatgatgt 41509122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16416810 - 16416537
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||     
T  16416810 gtgatgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattcatatatgtgttcggtgattgtgtg 16416711  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta------tatgtatgaga 317  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||      ||| |||  ||    
T  16416710 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattattgattattgatgtgagatattggggttttgatgtgagtatatatgtatatatttga 16416611  T
Q  318 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  16416610 atatcattattgatcaa-tgtatgatgtttatattgaactatccatgttaattattattttgattatgatgatgt 16416537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 307
Target Start/End: Original strand, 16203832 - 16204098
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||   ||| | ||||||| |||||||||    
T  16203832 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgaattgatccatcgaaggtgacgacc 16203931  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataatt 233  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  16203932 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatattt 16204031  T
Q  234 gtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    ||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||    
T  16204032 gtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgtgagatattggagtgtgatgcaagtat 16204098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 204 - 391
Target Start/End: Original strand, 24719328 - 24719513
Alignment:
Q  204 tatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaa 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  24719328 tatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgcaa 24719427  T
Q  304 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24719428 gtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 24719513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 13664550 - 13664743
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13664550 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttga 13664649  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13664650 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 13664743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 13723825 - 13724018
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13723825 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttga 13723924  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13723925 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 13724018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 21192234 - 21192384
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21192234 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21192333  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21192334 ttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgattcggtaccacatgcatttatg 21192384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21696236 - 21696086
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21696236 catcatagtcatgttgagttttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttg 21696137  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21696136 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatg 21696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 210 - 391
Target Start/End: Original strand, 22008366 - 22008548
Alignment:
Q  210 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatat 309  Q
    |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  22008366 attgatgattgtgtatgaataactatgaaatgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattg 22008465  T
Q  310 gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22008466 atgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttaactgttatttggattatgataatgt 22008548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 22909342 - 22909535
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||    
T  22909342 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatttgagatattgggatttga 22909441  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  22909442 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgt 22909535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41245338 - 41245210
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41245338 catcatagtcgtgttgaaattgtagttgtaaaatggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 41245239  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgat 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41245238 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgat 41245210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 24108465 - 24108657
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  24108465 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgacatattggagttttg 24108564  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  24108565 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 24108657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 21199661 - 21199811
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21199661 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21199760  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21199761 ttgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 21199811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 391
Target Start/End: Original strand, 20655677 - 20655943
Alignment:
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatatg-----tgattgatgattgtgtatga 227  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||  || || ||     |||||| |||||||||||||    
T  20655677 aggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatga 20655776  T
Q  228 ataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 325  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||  |||| | ||||||||    
T  20655777 ataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggatcatgatataagtatacatatgtggatattatt 20655876  T
Q  326 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20655877 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 20655943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23835895 - 23835746
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23835895 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttg 23835796  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23835795 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtg-ttcggtaccacatgcatttatg 23835746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 39448310 - 39448460
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattg-tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39448310 catcatagtcatgttgagtctggtagtcgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttg 39448409  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39448410 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 39448460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23509261 - 23509068
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  23509261 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgatgattgatgtgcgatattggggtttga 23509162  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |  | ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23509161 tgtaagtattgatgcgggaatattattattgaccaaatgtaggatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 23509068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 159
Target Start/End: Original strand, 31195772 - 31195917
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  31195772 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacgatatttttg 31195871  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31195872 ttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcat 31195917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 376
Target Start/End: Original strand, 22323225 - 22323398
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  22323225 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattgatgaatattgatgtgagatattggggtgtga 22323324  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
    |||||| ||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22323325 tgtaagcattgttatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcatgttaactgttatt 22323398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 270138 - 269950
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  270138 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 270039  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  270038 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 269950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Original strand, 645782 - 645970
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  645782 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 645881  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  645882 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 645970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Original strand, 831517 - 831705
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  831517 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 831616  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  831617 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 831705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Original strand, 37655134 - 37655324
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37655134 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagaggggtgctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 37655233  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37655234 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggcaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 37655324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29758956 - 29758768
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| | ||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  29758956 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 29758857  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29758856 ttttggagatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 29758768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Original strand, 16043054 - 16043245
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 298  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  16043054 gatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttttga 16043153  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16043154 tgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16043245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 238 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17343632 - 17343480
Alignment:
Q  238 attgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagta 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||   | || |||||||||||||||||||||     
T  17343632 attgatatttgttcatgacacatgtgattggcgattattgatgtgggatattggggtttgatg--agtattgatgtgggaatattattattgatcaagtg 17343535  T
Q  338 catgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17343534 catgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17343480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Original strand, 16041378 - 16041569
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 298  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  16041378 gatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttttga 16041477  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16041478 tgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 16041569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37610042 - 37609956
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37610042 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 37609956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 270401 - 270226
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  270401 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 270304  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 212  Q
    |  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  270303 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 270226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 645519 - 645694
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  645519 tgtagttgtaaaagggttgatctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 645616  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 212  Q
    |  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  645617 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 645694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 831254 - 831429
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  831254 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 831351  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 212  Q
    |  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  831352 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 831429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 290
Target Start/End: Original strand, 17731117 - 17731286
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  17731117 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 17731216  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 290  Q
    |||| ||||| ||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17731217 gtataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattaattgatgtgagatattg 17731286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Original strand, 24719077 - 24719165
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24719077 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatatgattg 24719165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Original strand, 22498832 - 22498947
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22498832 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 22498931  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcga 170  Q
    ||||| |||| |||||    
T  22498932 tgcatatatgtgtcga 22498947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 211
Target Start/End: Original strand, 24930614 - 24930789
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  24930614 gttgtaaaagagttgagctcttttacttcagagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 24930713  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgat 211  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24930714 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatacgtgat 24930789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Original strand, 24387203 - 24387383
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||   ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  24387203 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcaggggtgagcccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 24387302  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
    |||   | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24387303 ctt-ttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatatgattg 24387383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 164
Target Start/End: Original strand, 23116349 - 23116458
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23116349 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccaca 23116448  T
Q  155 tgcatgtatg 164  Q
    ||||| ||||    
T  23116449 tgcatatatg 23116458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 38532152 - 38531882
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||| |||||  || ||| | | ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  38532152 gtgacgaccttgaagtgatatggtaccccatgcatatatgtgtcgaactaggtgtacagcatgacatgagtcttatgggtgaaatgtgattgatgattgt 38532053  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || | | ||||||| |||  | ||    
T  38532052 gcat-aataattgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattacttaatgtaagatattgggattatggtatgagtatatatat--ggat 38531957  T
Q  320 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  38531956 attcttatttgattaagtgcatgatatttgaattgaattattcatgtttaactgttatatgaattatgatgatgt 38531882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 273 - 391
Target Start/End: Original strand, 6776303 - 6776422
Alignment:
Q  273 tattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgt 372  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  6776303 tattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgt 6776402  T
Q  373 ta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  6776403 tatttggattatgataatgt 6776422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22312304 - 22312190
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  22312304 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgatgactttgaggtgatttggtaccaca 22312205  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22312204 tgcatatatgtgtcg 22312190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 43375310 - 43375493
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  43375310 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtga 43375402  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  43375403 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 43375493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Original strand, 45560747 - 45560861
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45560747 actcttttaattcggtgataatgtaagacgggtgtaaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttgttaccaca 45560846  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    |||||||||| ||||    
T  45560847 tgcatgtatgtgtcg 45560861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25294582 - 25294490
Alignment:
Q  109 ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25294582 ttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25294490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25756571 - 25756479
Alignment:
Q  109 ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25756571 ttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25756479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33170890 - 33170785
Alignment:
Q  64 cttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtat 163  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33170890 cttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatat 33170791  T
Q  164 gcgtcg 169  Q
    | ||||    
T  33170790 gtgtcg 33170785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Original strand, 33612569 - 33612694
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||| | |||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  33612569 ttgtagctttaaaagggatgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 33612668  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcat 159  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33612669 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 33612694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28543440 - 28543270
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  28543440 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatttgattggtgattgt 28543342  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 292  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28543341 gcatgaataaatgtgatttgataattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattggg 28543270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Original strand, 23153297 - 23153452
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  23153297 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatatactcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttg 23153396  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg 169  Q
    || || |    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  23153397 ttacaccatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 23153452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 18768422 - 18768691
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||| |||| ||||   ||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  18768422 gtgacgactttgaagtgaaatggtaccatatgcatgtatgtgtcgaacttggtgcataacatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattat 18768521  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | |||| ||| | || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || | | ||||||  |||  | ||    
T  18768522 gcatga-taaatatg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattggaattatggtatgagtata--tatttggat 18768617  T
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18768618 attattattgagtaagtacatgatatttgaattgatttattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 18768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 22008139 - 22008236
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22008139 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 22008236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 3433535 - 3433718
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  3433535 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 3433627  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||    ||| | | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  3433628 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 3433718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 22323102 - 22323197
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  22323102 gtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgataaatgtgtttggtgattgt 22323197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 248
Target Start/End: Original strand, 24108245 - 24108368
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| |||     
T  24108245 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtg 24108344  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttg 248  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  24108345 tgaataattgtgaattgatgtttg 24108368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Original strand, 43375202 - 43375274
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43375202 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 43375274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28543213 - 28543151
Alignment:
Q  329 gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28543213 gatcaagtacatgatgttta-attgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 28543151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 13664424 - 13664496
Alignment:
Q  201 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13664424 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 13664496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 13723699 - 13723771
Alignment:
Q  201 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13723699 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 13723771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 22089943 - 22090097
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22089943 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22090041  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 194  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  22090042 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 22090097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23509378 - 23509315
Alignment:
Q  210 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23509378 attgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 23509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 391
Target Start/End: Original strand, 23631046 - 23631173
Alignment:
Q  262 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattc 361  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  23631046 tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcc 23631142  T
Q  362 atgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  23631143 atgttaactgttatttggattatgataatgt 23631173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24238177 - 24238065
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||    |||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24238177 actcttttacttcggcgataatgtaagatgg--acgaaatcgtacatacgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgagctgatttggtaccaca 24238080  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  24238079 tgcatatatgtgtcg 24238065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23509491 - 23509397
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  23509491 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23509397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11543149 - 11543088
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttg 116  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11543149 actcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttg 11543088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 13664296 - 13664393
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||  |  |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  13664296 gtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 13664393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 13723571 - 13723668
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||  |  |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  13723571 gtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 13723668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 3433076 - 3433254
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  3433076 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 3433173  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  3433174 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3433254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 21853396 - 21853574
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  21853396 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 21853493  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21853494 gagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21853574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 22909146 - 22909242
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||   | |||||||||||||||||    
T  22909146 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcagatttgaaaatgtgattgatgattgt 22909242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24547863 - 24547724
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||| ||||||||    
T  24547863 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 24547769  T
Q  154 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24547768 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24547724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25294641 - 25294581
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatt 74  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25294641 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagatt 25294581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25756630 - 25756570
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatt 74  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25756630 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagatt 25756570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28836155 - 28835980
Alignment:
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 306  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  28836155 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 28836063  T
Q  307 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  28836062 tta--atgtgta-attattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcaggttaactgttatttggattatgataatgt 28835980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Original strand, 3433285 - 3433352
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3433285 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcctgatacatgtgaatggtgatt 3433352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 15320559 - 15320713
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  15320559 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 15320657  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 194  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  15320658 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 15320713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 15500928 - 15501082
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  15500928 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 15501026  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 194  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  15501027 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 15501082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 391
Target Start/End: Original strand, 39448573 - 39448646
Alignment:
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39448573 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 39448646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 391
Target Start/End: Original strand, 17731331 - 17731387
Alignment:
Q  336 tacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17731331 tacatgatatttaaattgaatcattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 17731387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 21846065 - 21846169
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21846065 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 21846164  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  21846165 gtgat 21846169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23148568 - 23148481
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 101  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23148568 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatgtgctctttaacttcggtgataatgtaagacgggtgtaaaatcttacat 23148481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 272786 - 272880
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  272786 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 272880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 643063 - 642969
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  643063 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 642969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 828869 - 828775
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  828869 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 828775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5236768 - 5236674
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5236768 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5236674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29758740 - 29758643
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||       |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29758740 tgataaatgtaattggtgattgtgaatgaatagttgtgaattgataattgttaatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 29758648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 16874439 - 16874617
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  16874439 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16874536  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  16874537 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 16874617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21695941 - 21695899
Alignment:
Q  350 attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21695941 attgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 21695899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Original strand, 3433390 - 3433455
Alignment:
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3433390 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 3433455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 95
Target Start/End: Original strand, 18043091 - 18043131
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatc 95  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  18043091 actcttttacttcgatgataatgtaagacgggtgtgaaatc 18043131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 52 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 38101 - 37760
Alignment:
Q  52 tgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtacc 151  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  38101 tgaacttttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtacc 38002  T
Q  152 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttc 251  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38001 acatgcatgtacgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttagtgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttc 37902  T
Q  252 atgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttata 350  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37901 atgacacttgttattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaa 37802  T
Q  351 ttgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37801 ttgaaatatccatggtaactgttatttggattatgatgatgt 37760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 124)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Original strand, 50113612 - 50113991
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  50113612 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgcaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttat 50113711  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50113712 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 50113811  T
Q  214 atgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgt 311  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||     
T  50113812 gtgattgtgtatgaataactgtggattgatgattattcatgatatatgtgattgatgattaattgatgtgagatattggggttctaatgtaagtat-tga 50113910  T
Q  312 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  50113911 atgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 50113991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 391
Target Start/End: Original strand, 319099 - 319486
Alignment:
Q  16 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  319099 atcatagtcgtgttgagattgtagtcgtaaaagggttgaactcttttacttcggaaattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgtt 319198  T
Q  116 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatat---at--gt 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||  ||    
T  319199 gcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgcgattggt 319298  T
Q  209 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaag-- 304  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||      
T  319299 gattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatatgagatattggggttttgatgtaagta 319398  T
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  319399 tatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 319486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 391
Target Start/End: Original strand, 12351332 - 12351709
Alignment:
Q  17 tcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttg 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12351332 tcatagtggtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttg 12351431  T
Q  117 catcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||   | |||||| || ||    
T  12351432 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccagtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacgtgagtcttgttttgaaatgtgactggtg 12351531  T
Q  217 attgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatg 314  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||  |||||||   ||||    
T  12351532 attgtgtatgaataattatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgacataagtattgatatg 12351631  T
Q  315 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     || ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12351632 tgagtattattgttgatcaactgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12351709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 51159973 - 51160335
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatctt----acatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgac 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    |||| ||||||   ||||| ||||||| |||||    
T  51159973 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgac 51160072  T
Q  130 gaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaat 229  Q
    ||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51160073 gaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgattggtgattgtgtatgaat 51160172  T
Q  230 aattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattg 329  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  51160173 aactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggtttgatgtaagtattgatttgagaatattattattg 51160272  T
Q  330 atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  51160273 atcaagtgcatgatgtttaaattgagatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 51160335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17099181 - 17098913
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17099181 gtgacaaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtg 17099082  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17099081 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatttatgagaatatta 17098982  T
Q  324 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17098981 ttattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 17098913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Original strand, 47786356 - 47786735
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47786356 catcatagtcatgttgag-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttactttggagattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 47786454  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgat 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  47786455 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatagtaacacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgat 47786554  T
Q  212 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatat 309  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||| |||||||||    
T  47786555 tggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgagattagtgattaattgatgtgagatattgggattgtgatataagtatat 47786654  T
Q  310 gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||  |||||||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  47786655 atatgtgaaaactattattgatcaagtacatgatgtt--aattgatatattcatgataacagttatttggattatgatgatgt 47786735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 6148457 - 6148723
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||     
T  6148457 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatat--gtgattggtgattgtgtg 6148554  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 323  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6148555 tgaatacttgtgaattgatattcgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatgtgtatgagaatatta 6148654  T
Q  324 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6148655 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 6148723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 30204961 - 30204696
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  30204961 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttgtg--tcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 30204864  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30204863 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaacattat 30204764  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  30204763 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatccatattaacttttatttggattatgatgatgt 30204696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7852482 - 7852223
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7852482 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 7852383  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattg 213  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||   | |||||||||    
T  7852382 tggatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgattg 7852283  T
Q  214 atgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
     ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  7852282 gtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgataaatgtgattggtgatt 7852223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11812994 - 11812801
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11812994 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 11812895  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11812894 tgtaagtataaatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 11812801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 16183665 - 16183945
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |     
T  16183665 gtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtctg 16183764  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-------------gatgtaagtatatgt 311  Q
    ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || ||  ||||| |    
T  16183765 tgaatgattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttttgatatatatatatatatatatatatat 16183864  T
Q  312 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16183865 atgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 16183945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8630521 - 8630315
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  8630521 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagt 8630422  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |    
T  8630421 ggcatcgaaggtgacgacctggaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattaa 8630322  T
Q  215 tgattgt 221  Q
    |||||||    
T  8630321 tgattgt 8630315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 19572430 - 19572693
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  19572430 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgagtggtgattgtgaa 19572529  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 322  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  19572530 tgaatatttgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 19572624  T
Q  323 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19572625 attattgatcaaacacatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 19572693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 22145882 - 22146145
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  22145882 gtgacgaccttgaggtaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatgtgatgacacgagtcttattgatatatgtgattggtgattgcata 22145981  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||   |||| |||   |||    
T  22145982 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattgatgttagatattgggg-tggatgtatgtattgatatgtgaa---tat 22146077  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  22146078 tattgatcaagtgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 22146145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 38166407 - 38166213
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  38166407 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggagttttg 38166308  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38166307 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 38166213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18738167 - 18737974
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18738167 tgatatatgtaattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattgaagattattgatgtgagatattggggtttga 18738068  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18738067 tgtaagtatatgtatgagaatagtactattgatcaagtgcatgatgtttatattggaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18737974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19944998 - 19944805
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19944998 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttga 19944899  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19944898 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 19944805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7851877 - 7851683
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 297  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  7851877 tgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttgtc 7851778  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7851777 atataagtatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatactaactgttatttggattatgatgatgt 7851683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Original strand, 14060726 - 14060980
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14060726 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagatgggggtgaactcttacattcgatatttttg 14060825  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtga 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |    
T  14060826 ttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtaaaatgtaa 14060925  T
Q  211 ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 267  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14060926 ttgatgattgtgcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattg 14060980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 30141177 - 30140984
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  30141177 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 30141078  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  30141077 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 30140984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 208 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12796908 - 12796728
Alignment:
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12796908 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 12796809  T
Q  308 --atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgat 386  Q
      ||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12796808 tgatgtggga-aattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgat 12796728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 168
Target Start/End: Original strand, 18008645 - 18008776
Alignment:
Q  37 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18008645 tagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttg 18008744  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtc 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18008745 aggtgattcagtaccacatgcatttatgcgtc 18008776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15874820 - 15874690
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15874820 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 15874721  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15874720 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 15874690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17936649 - 17936455
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17936649 tgatatatatgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatttgagattattgatgtgagatattggggtttga 17936550  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttat-attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17936549 tataagtatatgtatgggaatattataattgatcaagtgcatgatgtttatgatgaaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 17936455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 48420327 - 48420197
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48420327 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgacc 48420228  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48420227 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 48420197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 164
Target Start/End: Original strand, 12490249 - 12490372
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  12490249 tgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgagat 12490348  T
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  12490349 gattcggtaccacatgcatttatg 12490372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16819234 - 16819043
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16819234 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttga 16819135  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16819134 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 16819043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Original strand, 38812481 - 38812671
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  38812481 catcatagtcatgttgagtctagtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacggg-gtgaaatattacatacgatgtttttg 38812579  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttattg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  38812580 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatggtgacatgagtcttattg 38812671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19230734 - 19230535
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| ||||     
T  19230734 catcatagttatgttgaaattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttga 19230635  T
Q  115 tgcatcgaaa-gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    | |||||||| |||||||| ||  || |||| ||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19230634 ttcatcgaaaggtgacgacgttttggagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgataaatgtgattg 19230535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 11330493 - 11330643
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11330493 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 11330592  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11330593 ttgcatcaaaggtgacaaccttgaggtgactcggtaccacatgcatttatg 11330643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 55442252 - 55442404
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55442252 catcatagtcatgttgagtttgtagttgtaaaatggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 55442351  T
Q  115 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    ||||| ||| ||   |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  55442352 tgcattgaaggtgacgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatg 55442404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14287596 - 14287323
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 222  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||    
T  14287596 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattttg 14287497  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggt-ttgatgtaag--tatatgtatgagaa 318  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||  |  || | ||||  ||||| |||| |||    
T  14287496 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgttgattaattgatgtgaggtattggaatcatggtataagtatatatatatgtgaa 14287397  T
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14287396 cgttattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 14287323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2048723 - 2048535
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||    
T  2048723 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgacc 2048624  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||  |  |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2048623 ttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgt 2048535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 11199144 - 11199415
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| | ||   || ||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||    
T  11199144 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtggcgggctaggtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgattggtgattgt 11199242  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | |||||| | ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  |  || | || |||||| |||| ||||    
T  11199243 gcatgaatgaatgtgatttgatgactgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaatattggaatgatggtatatgtatatatatgtgaat 11199342  T
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11199343 attattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattgttcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 11199415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Original strand, 5229607 - 5229721
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5229607 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 5229706  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5229707 tgcatatatgtgtcg 5229721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33340506 - 33340317
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  33340506 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 33340407  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33340406 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 33340317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23491169 - 23490980
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  23491169 tgtagttgtaaaaaggttgtgctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 23491070  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  23491069 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 23490980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 203 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8630232 - 8630101
Alignment:
Q  203 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgta 302  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  8630232 atatgtgattggtaattgtgcatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggagattatgaatgtgagatattggggtttgatgta 8630133  T
Q  303 agtatatgtatgagaatattattattgatcaa 334  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  8630132 agtatatgtatgtggatattgttattgatcaa 8630101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Original strand, 11062691 - 11062861
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 222  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||| |||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  11062691 gtgacgaccttgaagtgaaacggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcaggacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 11062790  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 292  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11062791 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattggg 11062861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35122189 - 35121921
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 222  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||||   || ||||| || |||||||||||||| ||   |   ||||||| ||||||||    
T  35122189 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacattatgacatgagtcttgttttgaatcgtgattggtgattgtg 35122090  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaata 320  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||  |||||| ||||||| | ||||  ||      
T  35122089 tatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaatttgggattttgatataagtatttatatgtaaa-- 35121992  T
Q  321 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35121991 -tattattgatcaagtacacgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35121921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 47983531 - 47983418
Alignment:
Q  57 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47983531 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 47983432  T
Q  156 gcatgtatgcgtcg 169  Q
    |||| |||| ||||    
T  47983431 gcatatatgtgtcg 47983418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 47992818 - 47992705
Alignment:
Q  57 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47992818 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 47992719  T
Q  156 gcatgtatgcgtcg 169  Q
    |||| |||| ||||    
T  47992718 gcatatatgtgtcg 47992705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 48002105 - 48001992
Alignment:
Q  57 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48002105 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 48002006  T
Q  156 gcatgtatgcgtcg 169  Q
    |||| |||| ||||    
T  48002005 gcatatatgtgtcg 48001992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 48011391 - 48011278
Alignment:
Q  57 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48011391 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 48011292  T
Q  156 gcatgtatgcgtcg 169  Q
    |||| |||| ||||    
T  48011291 gcatatatgtgtcg 48011278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19945289 - 19945098
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | ||||||||||    
T  19945289 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggtggttttgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgacct 19945191  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatga 227  Q
    |  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |||||    
T  19945190 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtttatga 19945098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10737219 - 10737033
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||| ||||||    
T  10737219 tgtagttgtaaaagggttgagctcttctacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtggcgacct 10737121  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |  || |||| ||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  10737120 tttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctgatttgatatatgtgattggtgattgt 10737033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14297000 - 14296730
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  14297000 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtggattgtgattggtgattgt 14296902  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | || ||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |  || | ||||||||| |||| ||||    
T  14296901 gcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtatatatatgtgaat 14296802  T
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14296801 attattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 14296730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14302627 - 14302357
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  14302627 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtggattgtgattggtgattgt 14302529  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | || ||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |  || | ||||||||| |||| ||||    
T  14302528 gcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtatatatatgtgaat 14302429  T
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14302428 attattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 14302357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 283 - 391
Target Start/End: Original strand, 54045594 - 54045703
Alignment:
Q  283 agatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggatt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  54045594 agatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactattatttggatt 54045693  T
Q  382 atgatgatgt 391  Q
    ||||||||||    
T  54045694 atgatgatgt 54045703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 14846160 - 14846339
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  14846160 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggggggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 14846258  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  14846259 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtaatatatgtgattggtgat 14846339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5227378 - 5227201
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc- 133  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||| ||| |  ||||||| |||||||||     
T  5227378 tgtagttgtaaaagggttgg-ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgttt-tatcatcgaatgtgacgacct 5227281  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgatt 212  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  5227280 ttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacataacatgagtcttgtttgatatatgtgatt 5227201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13816070 - 13815973
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt 296  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  13816070 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgacgtgagatattggagttt 13815973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11813403 - 11813307
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11813403 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgctgattgt 11813307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 391
Target Start/End: Original strand, 17958169 - 17958303
Alignment:
Q  258 catgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--tttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17958169 catgtgattggtgattattgatgtgagatattgggggatatgatgtaagtattaatatgggagtattattattgatcaagtacatgatgtttactttgaa 17958268  T
Q  356 ttattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 391  Q
     ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  17958269 atatccatgttaactgttatt-gattatgttgatgt 17958303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Original strand, 9592239 - 9592394
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  9592239 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacacatgatgtgtttg 9592338  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg 169  Q
    || ||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  9592339 ttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 9592394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 54686707 - 54686551
Alignment:
Q  203 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt--gatg 300  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  54686707 atatgtgatcggtaattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattggggtttttgatg 54686615  T
Q  301 taagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 364  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  54686614 taagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatg 54686551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 14523006 - 14523278
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||   || |  || |||||| ||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  14523006 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggaacacatcatg-cataagtcttattggtgaaatgtaattgatgattgt 14523104  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtttgatg---taagtatatgtatgaga 317  Q
    | ||| |||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | || || | |  |||||   || |||| | || | ||    
T  14523105 gcatgcataagtgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgaataattgagctga-atctttgagaatgatggtatatgtatttatacgtga 14523203  T
Q  318 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14523204 atattattattgatcaagtacatgatggttaaattggaatattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 14523278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 316 - 391
Target Start/End: Original strand, 11062944 - 11063020
Alignment:
Q  316 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11062944 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 11063020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 49230869 - 49230655
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| ||||||| |||      
T  49230869 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgacgttgtt 49230772  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 238  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |    
T  49230771 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaa 49230672  T
Q  239 ttgatatttgttcatga 255  Q
    |||||| ||||||||||    
T  49230671 ttgataattgttcatga 49230655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 15939959 - 15940140
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| |  |||| | |||||||||||     
T  15939959 gttgtaaaagggctgaacttttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttg-tctatcggaggtgacgaccttt 15940057  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  15940058 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgatttatgtgattggtgat 15940140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 17913751 - 17913933
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||| | ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  17913751 tgtaaaagggttaagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacgtacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 17913849  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17913850 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgatgtatgtgattgatgattgt 17913933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41660249 - 41660135
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41660249 actcttttatttcggtgataatgtaagacaggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccaca 41660150  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  41660149 tgcatatatgtgtcg 41660135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 364
Target Start/End: Original strand, 9304664 - 9304819
Alignment:
Q  203 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 301  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  9304664 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 9304756  T
Q  302 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 364  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  9304757 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 9304819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 17957996 - 17958093
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17957996 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatctcatgacatgagtcttatatgatatatgtgattgatgattgt 17958093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25057166 - 25057035
Alignment:
Q  258 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25057166 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaa 25057072  T
Q  356 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  25057071 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 25057035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44228083 - 44227903
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  44228083 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 44227985  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  44227984 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 44227903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16819565 - 16819386
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||| ||||| |||||||||||      
T  16819565 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgcaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgtt 16819467  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16819466 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 16819386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 305 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13815943 - 13815856
Alignment:
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13815943 tatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 13815856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19230499 - 19230318
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19230499 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgtt-------catatgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 19230407  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  |||| ||      |||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19230406 tgtaagtattaatgtgtg-----gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgt 19230318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11813253 - 11813179
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11813253 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacccatgtgattggtgatt 11813179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16259683 - 16259487
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||| ||||||||    
T  16259683 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 16259589  T
Q  154 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 253  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  16259588 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgggtcttatttggaaatgtgattagagattgtgaatgaatatttgtcaattgataattgttcat 16259489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15516197 - 15516035
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||    |||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15516197 gtgacgaccttgaagtgatttcgtaccacatgcatatat----cgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 15516102  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt 289  Q
      ||| |||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  15516101 tcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgatacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatatt 15516035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 391
Target Start/End: Original strand, 17536847 - 17536923
Alignment:
Q  316 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17536847 gaatattattattgatcaagtgcatgaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgt 17536923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18908854 - 18908679
Alignment:
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 306  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  18908854 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 18908762  T
Q  307 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18908761 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18908679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 221
Target Start/End: Original strand, 19262602 - 19262698
Alignment:
Q  126 tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19262602 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 19262698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22273209 - 22273034
Alignment:
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 306  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  22273209 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 22273117  T
Q  307 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22273116 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 22273034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45581382 - 45581310
Alignment:
Q  149 accacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45581382 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 45581310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7852035 - 7851968
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 266  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7852035 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 7851968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 267
Target Start/End: Original strand, 12563136 - 12563281
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  12563136 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatggcatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 12563235  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 267  Q
    | |||| ||| ||||  |||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  12563236 gcatgattaaatgtgatttgatgatttctcatgacacatgtgattg 12563281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18908966 - 18908892
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18908966 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 18908892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 49230429 - 49230262
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||||||||| |||    
T  49230429 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatattggggtgtga 49230337  T
Q  299 tgtaagta-tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
    |||||||| ||   ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  49230336 tgtaagtacta---atgtgta-attattattgatcaagtccatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatt 49230262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25057344 - 25057247
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  25057344 gtgacgaccttatggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 25057247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 164
Target Start/End: Original strand, 33370914 - 33371002
Alignment:
Q  75 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33370914 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgat-tttttgttgcaccatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 33371002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11813120 - 11813048
Alignment:
Q  201 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11813120 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgaaacatgtaattggtgatt 11813048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23490898 - 23490768
Alignment:
Q  259 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaat 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  23490898 atgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttactattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaa 23490804  T
Q  357 tattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    || ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  23490803 tactcatgttatctgttatttggattatgataatgt 23490768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27839362 - 27839184
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  27839362 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 27839265  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  27839264 gagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattgatgat 27839184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16819355 - 16819292
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16819355 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggt 16819292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 121
Target Start/End: Original strand, 11517010 - 11517056
Alignment:
Q  75 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcg 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517010 atgtaaaacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcg 11517056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 219
Target Start/End: Original strand, 15860824 - 15860902
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    |||| ||||| |||||||  |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15860824 gatttggtacaacatgcacatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 15860902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 218
Target Start/End: Original strand, 18905356 - 18905434
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18905356 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18905434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15613720 - 15613564
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  15613720 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 15613626  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15613625 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15613564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17137969 - 17137827
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgat-atgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgtg 222  Q
    ||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||  || | ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||||    
T  17137969 gtgacaaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtgaattaggtgcacatcatgacatgagtgttattggtgtaatgtggttgatgattgtg 17137870  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 267  Q
     || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17137869 cat-aataaatgtg-attgatgtttgttcatgacacatgtgattg 17137827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Original strand, 23081682 - 23081821
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||| ||||||||    
T  23081682 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 23081776  T
Q  154 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23081777 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 23081821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 391
Target Start/End: Original strand, 53900388 - 53900463
Alignment:
Q  316 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  53900388 gaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattatttatg-taactgttgtttggattatgatgatgt 53900463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30141456 - 30141361
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 220  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  30141456 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 30141361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 2450910 - 2451004
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2450910 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 2451004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7851931 - 7851857
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||    
T  7851931 tgatatatgtggttgatggttgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtggttgatgatt 7851857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12951555 - 12951476
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12951555 gtgacgaccttgaagtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 12951476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18909263 - 18909169
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18909263 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18909169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22273618 - 22273524
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22273618 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 22273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33340155 - 33340038
Alignment:
Q  269 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgtt 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||     ||||||| ||||||| | |||| ||||   ||||||||||||||| |    
T  33340155 tgattattgatgttagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattagtgatcaaatgcatgttgtt--aattgaattattcatgat 33340063  T
Q  367 aattgttattggattatgatgatgt 391  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  33340062 aactgttattggattatgataatgt 33340038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40938236 - 40938085
Alignment:
Q  123 aagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgatt 219  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| | | || ||| |||| |||    
T  40938236 aagtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgagctaggtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatatgaatgataatt 40938138  T
Q  220 gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40938137 gtgtgtgaataaatgtg-attgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgatt 40938085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Original strand, 12266007 - 12266167
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||| ||||||||    
T  12266007 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 12266101  T
Q  154 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  12266102 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgat 12266167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15574618 - 15574545
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15574618 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15574545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 16745670 - 16745848
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||| ||||| |||||||||||      
T  16745670 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgtt 16745767  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16745768 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 16745848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 391
Target Start/End: Original strand, 19262733 - 19262907
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 305  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  19262733 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 19262825  T
Q  306 at--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattg-ttattggattatgatgatgt 391  Q
    ||  |||| ||      |||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||    
T  19262826 attaatgtgtg-----gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgctaattggattatgataatgt 19262907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 391
Target Start/End: Original strand, 12563334 - 12563397
Alignment:
Q  329 gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  12563334 gattaagtacatgatatttaaattgaattattcatgttaagtgttatgtgaattatgatgatgt 12563397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 1469236 - 1469330
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1469236 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 1469330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 290
Target Start/End: Original strand, 17536606 - 17536774
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | |  |||||||| |  | ||    
T  17536606 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtattggt 17536704  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 290  Q
    |  ||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  17536705 gcgtgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacagatgtgatcggtgattaattgatgtgagttattg 17536774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 39654237 - 39654163
Alignment:
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39654237 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 39654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 218
Target Start/End: Original strand, 15470048 - 15470141
Alignment:
Q  126 tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  15470048 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacataagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 15470141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 391
Target Start/End: Original strand, 14061039 - 14061110
Alignment:
Q  321 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14061039 ttatcattgattaagtacatgatgttga-attgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 14061110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30151991 - 30151813
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  30151991 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 30151894  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  30151893 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 30151813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 86
Target Start/End: Original strand, 18905296 - 18905343
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggg 86  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18905296 gttgtaaaagggttgggctcttttactttggagattatgtaaggcggg 18905343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 2451155 - 2451229
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  2451155 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 2451229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22273321 - 22273247
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  22273321 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 22273247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 49230583 - 49230509
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  49230583 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 49230509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 255
Target Start/End: Original strand, 2451035 - 2451084
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 255  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  2451035 tgtgattgatgtttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 2451084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10736953 - 10736904
Alignment:
Q  258 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||    
T  10736953 catgtgattggtgattattaatgtgagatattggagtgtgacgtaagtat 10736904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45581230 - 45581181
Alignment:
Q  258 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45581230 catgagattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 45581181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 8269976 - 8270080
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8269976 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8270075  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  8270076 gtgat 8270080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 8277087 - 8277191
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8277087 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8277186  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  8277187 gtgat 8277191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 8305896 - 8306000
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8305896 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8305995  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  8305996 gtgat 8306000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 53769241 - 53769137
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  53769241 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 53769142  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  53769141 gtgat 53769137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 94)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4863943 - 4863551
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4863943 catcataatcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 4863844  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-------g 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||       |    
T  4863843 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacattcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgg 4863744  T
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4863743 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgctttgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagta 4863644  T
Q  307 ------tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgtt-attggattatgatgatgt 391  Q
          ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||    
T  4863643 tatatgtatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattaaattattcatgattaactgttgttttgattatgatgatgt 4863551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Original strand, 27185318 - 27185699
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27185318 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27185417  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  27185418 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 27185517  T
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27185518 tgattgataattgtgtctgaataaatgtgaattgttgtttgtacatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 27185617  T
Q  308 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 391  Q
       |||| |||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27185618 tgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcataatgtttatattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 27185699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 21661268 - 21661593
Alignment:
Q  75 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatg 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  21661268 atgtaagactggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataag 21661367  T
Q  175 tgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatatg-----tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || || ||     |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21661368 tgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatggtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 21661467  T
Q  268 gtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgtt 366  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  21661468 gtgattattgttgtgagatattggggtcttgatgtaagcatatgtatgagaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgtt 21661567  T
Q  367 aattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    || ||||| |||||||||||||||||    
T  21661568 aactgttatttggattatgatgatgt 21661593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21392698 - 21392432
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21392698 gtgacgaccttgagttgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgta 21392599  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    ||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21392598 tgaataattggaaactgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatatgtatgagaatatttt 21392500  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21392499 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 21392432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34937764 - 34937571
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34937764 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgttagatattggggtttga 34937665  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34937664 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 34937571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 32967661 - 32967815
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32967661 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 32967760  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtc 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32967761 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 32967815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10500 - 10307
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10500 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10401  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10400 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 10780112 - 10780305
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10780112 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10780211  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10780212 tgtaagtattgatgtgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 10780305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 43445708 - 43445901
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43445708 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 43445807  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  43445808 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 43445901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23492662 - 23492532
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23492662 ttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23492563  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23492562 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23492532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Original strand, 24226976 - 24227146
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24226976 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 24227075  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24227076 ttgaggtgattcggtacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 24227146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28257970 - 28257781
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28257970 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 28257871  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28257870 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcattttaactgttattttgattatgatgatgt 28257781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7727257 - 7727112
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7727257 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaggggttgagctattttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 7727158  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 159  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7727157 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 7727112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 22885041 - 22885234
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22885041 tgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggcgatcattgatgtgagatattggggtttga 22885140  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||    
T  22885141 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgatgactgttatttggattatgataatgt 22885234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 391
Target Start/End: Original strand, 25211796 - 25211982
Alignment:
Q  205 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttgatgtaa 303  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25211796 atgtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaa 25211895  T
Q  304 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25211896 gtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25211982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 391
Target Start/End: Original strand, 25275948 - 25276134
Alignment:
Q  205 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttgatgtaa 303  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25275948 atgtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaa 25276047  T
Q  304 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25276048 gtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25276134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28888598 - 28888441
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28888598 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 28888499  T
Q  114 ttgcatcgaa---agtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtc 168  Q
    ||||||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28888498 ttgcatcgaagatgatgatgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 28888441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 202 - 391
Target Start/End: Original strand, 17473704 - 17473892
Alignment:
Q  202 tatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgt 301  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17473704 tatatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacatatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttgatgt 17473803  T
Q  302 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| || ||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17473804 aagtat-tg-atgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17473892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 208 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19498120 - 19497952
Alignment:
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19498120 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 19498021  T
Q  308 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
       | || ||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  19498020 tgatgtgtgaatattattaatgatcatgtacgtaatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatt 19497952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21615671 - 21615535
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21615671 ttgtagctgtaaaagagttgaactcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 21615572  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  21615571 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 21615535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13793809 - 13793659
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  13793809 catcatagtcatgttgagtcttgtggttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgagatcttatatacgatgtttttg 13793710  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13793709 ttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 13793659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 37189637 - 37189767
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37189637 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 37189736  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37189737 ttgaggtgattcggtaccacttgcatttatg 37189767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19860912 - 19860756
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19860912 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagagttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 19860813  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga 170  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  19860812 ttgtatcgaaggtgacgaccttggggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 19860756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11580113 - 11579922
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 297  Q
    |||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||    
T  11580113 tgatgtatatgattggtgactgcgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattactgatgtgagatattggagttttg 11580014  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  11580013 atgtaagtata--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 11579922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 125 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11582414 - 11582266
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  11582414 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgtgta 11582315  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11582314 tgaataactgtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtgatt 11582266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 271
Target Start/End: Original strand, 1170321 - 1170467
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1170321 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtatcaataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaa 1170420  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga 271  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1170421 tgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatgtgatttgtga 1170467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Original strand, 23986165 - 23986359
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatatt-ggggtttg 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||| ||    
T  23986165 gatatatgtgaatgatgattgtgtatgaataactgtgaattaatatttgttcctgacacatatgattggtgattacttgatgtgaaacattgggggtatg 23986264  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23986265 atgtaagtattgatatgagagtattattatttatcaagtgcatgatgtttatatagaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 23986359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23453454 - 23453184
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23453454 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23453355  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23453354 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23453258  T
Q  320 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23453257 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23453184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23460698 - 23460428
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23460698 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23460599  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23460598 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23460502  T
Q  320 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23460501 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23460428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23464959 - 23464689
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23464959 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23464860  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23464859 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23464763  T
Q  320 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23464762 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23464689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Original strand, 1221351 - 1221584
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||| ||||      
T  1221351 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaacttgtt 1221449  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 238  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |    
T  1221450 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaa 1221549  T
Q  239 ttgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1221550 ttgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 1221584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 249 - 391
Target Start/End: Original strand, 1171320 - 1171464
Alignment:
Q  249 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 347  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1171320 ttcatgataaatgtgattgatgtttattaatgtgagatattggggctttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttt 1171419  T
Q  348 atattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  1171420 atattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgatgatgt 1171464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 9732592 - 9732782
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  9732592 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatctttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgcgagatattgggatgtga 9732691  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  9732692 tgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtttatcttgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 9732782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 1221638 - 1221826
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1221638 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttga 1221737  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  1221738 tgtaagtat-tg-atgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgt 1221826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11964586 - 11964472
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11964586 actcttttacttcggtgataatgtaatacgggtttgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttgaggtggtttggtaccaca 11964487  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    |||||||||| ||||    
T  11964486 tgcatgtatgtgtcg 11964472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 24184869 - 24185137
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 222  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  24184869 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaagtgtgattggtgattgtg 24184968  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 320  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||| | || |||| |  |||| | |||| |||      
T  24184969 tatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatggaattggtgattaattgatgtgagaaattgagattatgatatttgtatttatatgtgaa-- 24185066  T
Q  321 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24185067 -tattattgatcaattacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 24185137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24470804 - 24470555
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||            
T  24470804 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgggtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttactgatatatgtgattgctg-------- 24470713  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
          |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||   | || |   |||||    
T  24470712 ------attgtgaattgataattgttcgtgacatatgtgattgattattattgttgtgagatattggggtgtgatgtaaatattattgtgtg---attat 24470622  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24470621 tattgatcaaatgcatgatg-ttaaattgaactattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 24470555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 21653052 - 21653148
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21653052 gtgacgaccttgaggacatttggtaccacatgcatatatgcgtcgataagtgcatatcatgacacgagtcttattgataaatgtgattggtgattgt 21653148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 11213222 - 11213404
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  11213222 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 11213320  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  11213321 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctcatatgatataagtgattgatgattgt 11213404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 110604 - 110785
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  110604 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 110701  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  110702 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattgt 110785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 29192671 - 29192857
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  29192671 tgataaatgtgattggtgattgtgattgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgcgagatatcggggtttga 29192763  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  29192764 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 29192857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17908030 - 17907853
Alignment:
Q  203 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 301  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  17908030 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattggggttttggtgt 17907938  T
Q  302 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgtta-ttggattatg 384  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  17907937 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatgattaactgttatttggattatg 17907853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Original strand, 20455627 - 20455741
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    || |||| |||||||||||| |||||||||    
T  20455627 actcttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtaacgatcttgaggtgatttggtaccaca 20455726  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20455727 tgcatatatgtgtcg 20455741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 255
Target Start/End: Original strand, 22884887 - 22885017
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| |    
T  22884887 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaa 22884986  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 255  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22884987 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 22885017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 221
Target Start/End: Original strand, 17473568 - 17473648
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17473568 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 17473648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23510473 - 23510313
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtat 239  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  23510473 gatttggtacaacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaat 23510374  T
Q  240 tgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    ||||| ||||||   |||    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23510373 tgataattgttc---aca----tgattgatgactattgatgtgagatattggggtatgatgcaagtat 23510313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Original strand, 35792767 - 35792964
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtacca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||| |||||||    
T  35792767 actcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtacca 35792861  T
Q  153 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttca 252  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  35792862 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattagagatcgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttca 35792961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 35793162 - 35793345
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| |||    
T  35793162 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatatcgaggtgtga 35793254  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  35793255 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 35793345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16534881 - 16534750
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgtgt 223  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||  |||||||     
T  16534881 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaactatgtgattggagattgtga 16534782  T
Q  224 atgaataattgtgtattgatatttgttcatga 255  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16534781 atgaataattgtgaattgataattgttcatga 16534750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10628 - 10554
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10628 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattggtgatt 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28258093 - 28257998
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  28258093 gtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttatcgataaatgtggttggtgattgt 28257998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Original strand, 9732495 - 9732562
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9732495 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 9732562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 391
Target Start/End: Original strand, 11338584 - 11338802
Alignment:
Q  187 catgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaaga 285  Q
    |||||||||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  11338584 catgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtg-attgataattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagt 11338682  T
Q  286 tattggggt-------------ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgt 372  Q
    ||||||| |             |  || ||  ||||| |||  |||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11338683 tattgggatcatgatatatatatatatatatatatatatatatgaatgttgttattgatcaagtacatgatcttttaattgaaatattcatgttaattgt 11338782  T
Q  373 tat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  11338783 tatgtggattatgatgatgt 11338802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 25944566 - 25944750
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtaagatattggggtttg 297  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| | ||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  25944566 tgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgattgattattaatgtgagatattagggtgtg 25944658  T
Q  298 atgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25944659 atgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 25944750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Original strand, 18779790 - 18779904
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtatt 240  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||| | ||||| |||    
T  18779790 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattagagattgtgaatgaacatttgtgaatt 18779889  T
Q  241 gatatttgttcatga 255  Q
    |||| ||||||||||    
T  18779890 gataattgttcatga 18779904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 22368188 - 22368285
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  22368188 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattgt 22368285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11340782 - 11340599
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||        |||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| |||    
T  11340782 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataatcgttcata-------tgattgatgaatatttatgtgagatatcggggtgtga 11340690  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  11340689 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 11340599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 18780052 - 18780235
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| |||    
T  18780052 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatatcgaggtgtga 18780144  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18780145 tgtaagtatta--atgtgta-attattattaatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18780235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19498458 - 19498280
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  19498458 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 19498361  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19498360 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19498280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 10779799 - 10779980
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  10779799 tgtaaaagggttgagctcttttactttg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 10779896  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  10779897 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 10779980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11341085 - 11341018
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  11341085 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgaatggtgatt 11341018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 376
Target Start/End: Original strand, 110990 - 111157
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  110990 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 111082  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  111083 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 111157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19498248 - 19498182
Alignment:
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19498248 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 19498182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11341294 - 11341116
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  11341294 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 11341197  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11341196 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11341116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16534574 - 16534391
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||  | ||||| |||    
T  16534574 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagacttcggggtgtga 16534482  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||    ||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  16534481 tgtaagtatta--atgtgta-attattgttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaattattatctggattatgataatgt 16534391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 248
Target Start/End: Original strand, 25211623 - 25211719
Alignment:
Q  152 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 248  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25211623 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 25211719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 248
Target Start/End: Original strand, 25275775 - 25275871
Alignment:
Q  152 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 248  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25275775 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 25275871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25424736 - 25424680
Alignment:
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  25424736 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatt 25424680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25425206 - 25425102
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25425206 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 25425107  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  25425106 gtgat 25425102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 273
Target Start/End: Original strand, 25944472 - 25944536
Alignment:
Q  209 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25944472 gattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 25944536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 43445582 - 43445654
Alignment:
Q  201 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  43445582 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggcgatt 43445654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10925 - 10831
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10925 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 199
Target Start/End: Original strand, 5452432 - 5452511
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5452432 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 5452511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 22368337 - 22368411
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22368337 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcaggatacatgtaattggtgatt 22368411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 43445390 - 43445555
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtacca 152  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||    
T  43445390 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 43445488  T
Q  153 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  43445489 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgaatcttatgtgaaatatatgattggtgat 43445555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 4201586 - 4201764
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    ||  ||||||||| |||||||||||      
T  4201586 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgacatcgaaaggtgacgaccttgtt 4201683  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  4201684 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 4201764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 9732360 - 9732464
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  9732360 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatctatgtgttaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatctgattg 9732459  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  9732460 gtgat 9732464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 10780011 - 10780082
Alignment:
Q  201 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  10780011 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatt-gttcctgatacatgtgattggtgatt 10780082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Original strand, 22368602 - 22368674
Alignment:
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22368602 attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgataatgt 22368674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 21075192 - 21075286
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21075192 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21075286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 21933863 - 21933957
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21933863 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21933957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 21940033 - 21940127
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21940033 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21940127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 29192321 - 29192415
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  29192321 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaagtatgtgattggtgat 29192415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35580829 - 35580735
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  35580829 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 35580735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 37010867 - 37010961
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37010867 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37010961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3672497 - 3672421
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| |||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  3672497 gtgacgaccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactagatgcatatcaagacatgagtcttatt 3672421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24595159 - 24594981
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  24595159 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 24595062  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24595061 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 24594981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 269
Target Start/End: Original strand, 110888 - 110957
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 269  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  110888 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgata-ttgttcatgatacatgtaattggt 110957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7726993 - 7726919
Alignment:
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7726993 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttagctgttatctggattatgatgatgt 7726919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Original strand, 29192583 - 29192641
Alignment:
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  29192583 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 29192641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 21653228 - 21653265
Alignment:
Q  259 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21653228 atgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggttt 21653265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23327598 - 23327458
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtacca 152  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||     
T  23327598 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 23327500  T
Q  153 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 194  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  23327499 catgcatttatgggtccataagtgcatatcatagcatgagtc 23327458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21649495 - 21649463
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttc 67  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21649495 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttc 21649463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27008596 - 27008492
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  27008596 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacctcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 27008497  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  27008496 gtgat 27008492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 94)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Original strand, 21961053 - 21961440
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21961053 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 21961152  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||   || || |         
T  21961153 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgttta 21961252  T
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaag 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||| ||||    
T  21961253 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgatatatgtgattggtgattaattgatgtgagctattgggagtatgatttaag 21961352  T
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21961353 tattgatatatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 21961440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 103 - 391
Target Start/End: Original strand, 12837900 - 12838192
Alignment:
Q  103 cgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12837900 cgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgatataggtgcatatcatgacatgagtctttttg 12837999  T
Q  201 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgat 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12838000 atatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggttttgat 12838099  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12838100 ataagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12838192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 391
Target Start/End: Original strand, 12901269 - 12901631
Alignment:
Q  27 gttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12901269 gttgaaattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggt 12901368  T
Q  127 gacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatat-----gtgattgatgattg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||| || |     ||||||| ||||||    
T  12901369 gacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgacatgagtcttctttgaaatgtgattggtgattggtgattg 12901468  T
Q  221 tgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaa 318  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||          |    
T  12901469 tgtacgaataactgtgaattgattattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtat----------a 12901558  T
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12901559 tatttatattgatcaagtacatgatgtttgaatt-aattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12901631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44345333 - 44345057
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||     
T  44345333 gtgacgaccttgaggtgatttgttaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatatgtttggtgattgtgtg 44345234  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaa--------gtatatgtatga 315  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||        |||||| |||||    
T  44345233 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatatga 44345134  T
Q  316 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  44345133 gaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttgttttgattatgatgatgt 44345057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Original strand, 8873978 - 8874162
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  8873978 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaatgggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgt 8874077  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8874078 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 8874162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18167067 - 18166874
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18167067 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 18166968  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18166967 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 18166874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 124 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33738732 - 33738477
Alignment:
Q  124 agtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 223  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33738732 agtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatacatgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgt 33738633  T
Q  224 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatt 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||                
T  33738632 atgaataattgtgaattgatatttgctcatggcacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatg------------ 33738545  T
Q  323 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
      |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33738544 --tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 33738477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34393580 - 34393385
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 296  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  34393580 tgatatatgtgattggcgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacagatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttt 34393481  T
Q  297 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34393480 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 34393385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 53909555 - 53909750
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg--gttt 296  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  53909555 tgataaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtgttt 53909654  T
Q  297 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  53909655 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgatgatgt 53909750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 34197658 - 34197812
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34197658 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 34197757  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtc 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34197758 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 34197812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Original strand, 19699414 - 19699606
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19699414 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19699513  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19699514 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19699606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Original strand, 19709999 - 19710191
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19709999 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19710098  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19710099 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19710191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 16366361 - 16366624
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  16366361 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattagtgattgtgaa 16366460  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 322  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  16366461 tgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatttgattgatgattattgatgtgagatattagggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 16366555  T
Q  323 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  16366556 attattgatcaaacgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactattatttggattatgatgatgt 16366624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 7134310 - 7134503
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7134310 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgggatattggggtttga 7134409  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| |||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7134410 tgtaattattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 7134503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8372800 - 8372607
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8372800 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 8372701  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8372700 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcttgttaactgttatttggattatgataatgt 8372607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14900136 - 14899948
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14900136 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggtgattttgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcggaggtgacgacc 14900037  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgatt 219  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  14900036 ttgaggtgatttggtatcacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 14899948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 37958550 - 37958704
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37958550 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 37958649  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtc 168  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37958650 ttgcatcgaaggtgatgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 37958704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27959708 - 27959563
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27959708 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttg 27959609  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 159  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27959608 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 27959563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 15274470 - 15274663
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15274470 tgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 15274569  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15274570 tgtaagtattgatgtgggaattttattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 15274663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 12245745 - 12245895
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12245745 catcatagtcatgttgagtcttgtatttgtaaaagggtttagctcttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 12245844  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12245845 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 12245895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44054427 - 44054168
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  44054427 gtgacggccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 44054328  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatatt 322  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||          |||||    
T  44054327 tgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgactggtgatttattgatatgagatattgggattatgatgtaagtat----------atatt 44054238  T
Q  323 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
      ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44054237 tatatcgatcaagtacatgatgtttgaattaaattaattatgttaactgttatttggattatgatgatgt 44054168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26678370 - 26678179
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  26678370 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgataggtgaatattgatgtgacatattggggtttga 26678271  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  26678270 tgtaagtattgatatgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 26678179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 110143 - 109957
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  110143 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 110045  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  110044 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 109957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 15852829 - 15852959
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15852829 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactttggtgaaatcttacatacgatgttttttttgcatcgaaggtgacgacc 15852928  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15852929 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 15852959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Original strand, 41167447 - 41167569
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41167447 ttgtggttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatctcacatacgatgtttttgttacatcgaaggtgacgacc 41167546  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41167547 ttgaggtgattcggtaccacatg 41167569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 45460611 - 45460894
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttat--tgatatatgtgattgatgatt- 219  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || | |||||  || ||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||| |||||     
T  45460611 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccgcatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaactgtgattggtgattt 45460710  T
Q  220 -------gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatg 310  Q
           |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||     
T  45460711 ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatgaattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatata 45460810  T
Q  311 --tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  45460811 catatgtgaatattatcattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattattatgatgt 45460894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15212004 - 15211762
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | |||||| |    
T  15212004 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgtc 15211905  T
Q  133 cttga-ggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt-gatatatgtgattgatgattgtgtatgaata 230  Q
    |||   ||  ||| |||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||    
T  15211904 ctttttggatatttggtaccacatgcatttatgtctcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgagta 15211805  T
Q  231 attgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
     || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15211804 tttttgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 15211762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 391
Target Start/End: Original strand, 53706635 - 53706828
Alignment:
Q  197 attgatatatgtgatt-gatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt 295  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  53706635 attgatatatgtgatttggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtg 53706734  T
Q  296 tgatgtaagta--tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||   || ||||      ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53706735 tgatgtaagtactaatttatg-----tttactattgatcaaatgcatgatgtttatactgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 53706828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13244861 - 13244606
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13244861 gtgacgaccctgaaatgatttggtcccacatgcatatatgtgtcaataggtggatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaa 13244762  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 322  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  13244761 tgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 13244674  T
Q  323 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13244673 attattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 13244606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 13811287 - 13811558
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || || |||||||    
T  13811287 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgcgaatgttgattgt 13811386  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||  ||| | || | |||  | ||    
T  13811387 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcattacacgtgtgattggtgattaatggatgtaagatattgggattatg--gtatgaatttatatttggat 13811484  T
Q  320 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13811485 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 13811558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 22356424 - 22356616
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttg 297  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22356424 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttg 22356523  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||| ||||||   |||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22356524 atgcaagtattgttatgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattattgttaactgttatttggattatgataatgt 22356616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 30236147 - 30236411
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttat--tgatatatgtgattgatgattg 220  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||| |  || ||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||| ||| ||    
T  30236147 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatccatatatgtgtcaaattaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaattgtgattggtgactg 30236246  T
Q  221 tgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaa 318  Q
    ||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||| ||          
T  30236247 tgtatgaataactgtgaattattgattgttcatgacacatgtaattggtgatttattgatgtgagatattgcagttatgatataagtatatata------ 30236340  T
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
       |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30236341 ---tattattgatcaggtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 30236411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 391
Target Start/End: Original strand, 20813715 - 20813890
Alignment:
Q  218 ttgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatga 315  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||  |||     
T  20813715 ttgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattaatgaattattgatgtgaaatattgggattatgatataagtatatacatgt 20813814  T
Q  316 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20813815 gtgaat-attattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 20813890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 47355688 - 47355509
Alignment:
Q  210 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtata 308  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  47355688 attgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtatt 47355589  T
Q  309 tgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 391  Q
      |||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||    |||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  47355588 gttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatcatgt---aattgaaatgttcgtgataactgttattggattatgataatgt 47355509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 391
Target Start/End: Original strand, 18294600 - 18294746
Alignment:
Q  246 ttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgt 345  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18294600 ttgttcatgatttatgtgatcggtgattattgatgtgagatattgggatttaatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtagatgatat 18294699  T
Q  346 ttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||  |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18294700 ttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 18294746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Original strand, 53909431 - 53909519
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909431 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 53909519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Original strand, 41257842 - 41258031
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaag-ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttttt 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||  ||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  41257842 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagggtg--ctcttctacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatattttt 41257939  T
Q  113 gttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 199  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41257940 gttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 41258031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Original strand, 5372228 - 5372342
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5372228 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaagtcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccaca 5372327  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5372328 tgcatatatgtgtcg 5372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Original strand, 10238967 - 10239081
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10238967 actcttttactttggtgataatgtaagacgggtgtgaaattttacatatgatgtttttgttgcatcatgtgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 10239066  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10239067 tgcatatatgtgtcg 10239081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 164
Target Start/End: Original strand, 47469867 - 47469976
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  47469867 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttggggttatttggtaccaca 47469966  T
Q  155 tgcatgtatg 164  Q
    ||||| ||||    
T  47469967 tgcatatatg 47469976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16521447 - 16521294
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| | ||||| | |||||||||||     
T  16521447 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttggcttg-tccatcggaggtgacgaccttt 16521349  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatga 191  Q
     |  |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16521348 tgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 16521294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 5684404 - 5684586
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  5684404 tgtaaaagagttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagtccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 5684502  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    | |||| |||| ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  5684503 gagatttggtatcacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattgt 5684586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15211698 - 15211515
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||    
T  15211698 tgataaatgtgattggtgattgttaatgaatatttgcgaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattgaggtgtga 15211606  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  ||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15211605 tgtaagtatgaatgtatga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 15211515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 169
Target Start/End: Original strand, 50223696 - 50223806
Alignment:
Q  59 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgca 158  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  50223696 ttttacttcggtgataatgtaagacgggtatgaaatctaacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgatgaccttgaggtgatttggtatcacatgca 50223795  T
Q  159 tgtatgcgtcg 169  Q
    | |||| ||||    
T  50223796 tatatgtgtcg 50223806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Original strand, 8874265 - 8874346
Alignment:
Q  311 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8874265 tatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 8874346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34393666 - 34393610
Alignment:
Q  217 attgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393666 attgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 34393610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 217
Target Start/End: Original strand, 43283043 - 43283138
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatga 217  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  43283043 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatga 43283138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Original strand, 53706515 - 53706591
Alignment:
Q  155 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 231  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  53706515 tgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttggtgattgtgtgtgaataa 53706591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 309
Target Start/End: Original strand, 55378542 - 55378646
Alignment:
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  55378542 gtgattgatgattgtgtatgaatatttgtgatttgatgattgttcatgacacataagattggtgattaattgatgtgagatattggaattatgatgtaag 55378641  T
Q  305 tatat 309  Q
    |||||    
T  55378642 tatat 55378646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8372921 - 8372854
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8372921 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 8372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18167164 - 18167097
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18167164 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattggtgatt 18167097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 273
Target Start/End: Original strand, 7134088 - 7134208
Alignment:
Q  152 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttc 251  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| || ||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  7134088 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtg-ttgcgaatgaatatttgtgaattgatatttattc 7134186  T
Q  252 atgacacatgtgattggtgatt 273  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  7134187 ctgatacatgtgattggtgatt 7134208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9293843 - 9293712
Alignment:
Q  258 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  9293843 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa 9293749  T
Q  356 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     ||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  9293748 atatccatgttatctgttatttggattatgataatgt 9293712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10642505 - 10642374
Alignment:
Q  258 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  10642505 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaa 10642411  T
Q  356 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  10642410 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 10642374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10642683 - 10642586
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  10642683 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 10642586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19998700 - 19998517
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  19998700 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggggtgtga 19998608  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||| |||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  19998607 tgtgagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttgactgttatttggattatgataatgt 19998517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19999183 - 19999005
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  19999183 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 19999086  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19999085 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19999005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 194
Target Start/End: Original strand, 52267125 - 52267196
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtc 194  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  52267125 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtc 52267196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26678491 - 26678428
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26678491 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggt 26678428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 18496065 - 18496334
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga-tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 222  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||| || | | || ||| |||||| ||||    
T  18496065 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaactaggtgcacatcatgacatgagttttaatggtgaaatatgagtgatgactgtg 18496164  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 320  Q
     || ||||| ||||  |||||  || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || || | | | ||||| | ||   |||    
T  18496165 cataaataaatgtgatttgatgattattcatgaaacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatggtatgaatatatttgtg---ata 18496261  T
Q  321 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||  ||| || | |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18496262 ttattatcggattaaatgcatgatatttaaattgaactattcatgttatttgttatatggattatgatgatgt 18496334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19998973 - 19998907
Alignment:
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19998973 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 19998907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 81
Target Start/End: Original strand, 25120617 - 25120663
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaag 81  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25120617 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaag 25120663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 211
Target Start/End: Original strand, 54119906 - 54119976
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat 211  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54119906 gatttggtaccagatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgat 54119976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9294021 - 9293924
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||    
T  9294021 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttcataaatgtgattggtgattgt 9293924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19998845 - 19998780
Alignment:
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  19998845 tgattggtgattgtgtatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtaattggtgatt 19998780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 220
Target Start/End: Original strand, 22356065 - 22356244
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22356065 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22356162  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 220  Q
    | |||| |||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  22356163 gagatttggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 22356244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 274
Target Start/End: Original strand, 13751910 - 13751978
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13751910 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacatatgtgattggtgatta 13751978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 15138134 - 15138238
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| ||| |||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15138134 gcatcgaaaggtgatgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 15138233  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  15138234 gtgat 15138238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18246250 - 18246178
Alignment:
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  18246250 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 18246178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26678626 - 26678522
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  26678626 gcatcgaaagatgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacacgagtcttatgtgaaatatgtgattg 26678527  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  26678526 gtgat 26678522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47355769 - 47355705
Alignment:
Q  209 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  47355769 gattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatatgattggtgatt 47355705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 47355907 - 47355803
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  47355907 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 47355808  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  47355807 gtgat 47355803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16520985 - 16520801
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||    
T  16520985 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatatagatgtaagatatcggggtgtga 16520893  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatg-tttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  16520892 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgttttaaattgaaatatccatgttaactattatttagattatgatgatgt 16520801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7848901 - 7848776
Alignment:
Q  146 ggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgata 244  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||| |||||  ||| ||    
T  7848901 ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatctcatttgaaat-tgtgagtggtgattgtgtgcgaatagttgtggtttggta 7848803  T
Q  245 tttgttcatgacacatgtgattggtga 271  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||    
T  7848802 tttgtttaggacccatgtgattggtga 7848776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8373029 - 8372951
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  8373029 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 8372951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14994772 - 14994678
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  14994772 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 14994678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18167273 - 18167195
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18167273 gatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcaaatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat 18167195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18246762 - 18246668
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18246762 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18246668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 391
Target Start/End: Original strand, 54120066 - 54120195
Alignment:
Q  258 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||| | | |||||||||   ||||||    
T  54120066 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcgaatgcatgatgtt--aattgaa 54120158  T
Q  356 ttattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 391  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  54120159 atatccatgttaattgttaattggattatgttgatgt 54120195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 384
Target Start/End: Original strand, 55378691 - 55378757
Alignment:
Q  318 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatg 384  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  55378691 atattattattgattaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaacagttattggattatg 55378757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 221
Target Start/End: Original strand, 15274361 - 15274442
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  15274361 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 15274442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 34393727 - 34393690
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggtt 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393727 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggtt 34393690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 109922 - 109828
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 305  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  109922 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 109830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16521080 - 16521015
Alignment:
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  16521080 tgattggtgattgtgtatgaataattgttaattgatgattattcatgatacatgtaattggtgatt 16521015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14950602 - 14950498
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  14950602 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgggtcaataagtgcatatcatatcatgagtcctatgtgaaatacgtgattg 14950503  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  14950502 gtgat 14950498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15043443 - 15043381
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 185  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  15043443 gtgacgaccttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15043381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 185
Target Start/End: Original strand, 15110981 - 15111043
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 185  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  15110981 gtgacgaccttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16521263 - 16521168
Alignment:
Q  161 tatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatga-gtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 255  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  16521263 tatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgatggcttattttgaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 16521168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Original strand, 17213378 - 17213420
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatctta 98  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17213378 ctcttttacttcggcgaaaatgtaagacgggtgtgaaatctta 17213420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18246465 - 18246391
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  18246465 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtggattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 18246391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 24237525 - 24237479
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 101  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  24237525 actcttttacttcggcgataatgtaagacgtgcgtgaaatcttacat 24237479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 291
Target Start/End: Original strand, 43283140 - 43283185
Alignment:
Q  247 tgttcatgacacatgtgattggtgattattg-atgtaagatattgg 291  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43283140 tgttcatgacatatgtgattggtgattgttgaatgtaagatattgg 43283185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 386
Target Start/End: Original strand, 5684742 - 5684802
Alignment:
Q  327 ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgat 386  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5684742 ttgatcaagtgcatgatgtttaatttgtaatattcatgttaactgttatttggattatgat 5684802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 181
Target Start/End: Original strand, 53706465 - 53706521
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatat 181  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  53706465 gtgacgaccctgaggtgatctagtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatat 53706521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 60250 - 59865
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  60250 catcatattcgtgttgatattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 60151  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  60150 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 60051  T
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat-tattgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagt 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||| |||||    
T  60050 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatgtattgatgtgagatattgggaatatgatataagt 59951  T
Q  306 atatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    || | | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  59950 at-tatttgtggatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 59865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 9)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 256560 - 256827
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  256560 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 256659  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256660 tgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 256759  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  256760 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaaatattcatattaactgttatttggattatgatgatgt 256827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 221
Target Start/End: Original strand, 125009 - 125089
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  125009 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 125089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 219
Target Start/End: Original strand, 72028 - 72106
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  72028 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 72106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 219
Target Start/End: Original strand, 76409 - 76487
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  76409 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 76487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 193057 - 192985
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  193057 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 192985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 391
Target Start/End: Original strand, 72191 - 72317
Alignment:
Q  261 gtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 358  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||    
T  72191 gtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaata 72283  T
Q  359 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  72284 ttcatgataactgttatttggattatgatgatgt 72317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 391
Target Start/End: Original strand, 76572 - 76698
Alignment:
Q  261 gtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 358  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||    
T  76572 gtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaata 76664  T
Q  359 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||| || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  76665 ttcttgataactgttatttggattatgatgatgt 76698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 391
Target Start/End: Original strand, 125173 - 125298
Alignment:
Q  262 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattat 359  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||    
T  125173 tgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatat 125265  T
Q  360 tcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  125266 tcatgataactgttatttagattatgatgatgt 125298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 192897 - 192768
Alignment:
Q  258 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 355  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||    
T  192897 catgtaattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaa 192805  T
Q  356 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  192804 atattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 192768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 70)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35053515 - 35053141
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35053515 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtagaagggttgaactcttttacttatgagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 35053416  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtga---- 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||        
T  35053415 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatgg 35053316  T
Q  211 ---ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
       ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||              
T  35053315 tgtttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattgtggtttg---------- 35053226  T
Q  308 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  35053225 atgtatgagaatgttattattgatcaagtacatggtgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 35053141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 22407894 - 22408162
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22407894 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacataagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtg 22407993  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22407994 tgaataattgtgaattgatatttgctcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatatgagaatatta 22408093  T
Q  324 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22408094 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 22408162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 2422733 - 2422997
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  2422733 gtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 2422832  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  2422833 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaa---tat 2422929  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2422930 tattgatcaagtgtatgatgtttatattgaaatatccatgttaattgttatttggattatgttgatgt 2422997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 5676091 - 5676355
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5676091 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactctcttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 5676190  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg----- 209  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||         
T  5676191 tgcattgaaggtgacgaccttgaggtgatacggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 5676290  T
Q  210 --attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
      |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5676291 taattggtgattgtgtatgaataattatgtattgatatttg-tcatgacacatgtgattggtgatt 5676355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 41217739 - 41217544
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41217739 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttt 41217640  T
Q  297 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41217639 gatgtaagtatatttatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 41217544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Original strand, 5676350 - 5676535
Alignment:
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5676350 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagta 5676449  T
Q  307 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  5676450 tatgcatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttataatgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 5676535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41218126 - 41217945
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41218126 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactattttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 41218027  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41218026 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgtatatatctatcgataggtgcatatcatgacatgagtctt 41217945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20444420 - 20444214
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||     
T  20444420 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttga 20444321  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    | ||||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20444320 ttcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattgg 20444221  T
Q  215 tgattgt 221  Q
    |||||||    
T  20444220 tgattgt 20444214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20252534 - 20252342
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20252534 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatattcgttcatgatacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgat 20252435  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20252434 gtaagtattgatatgataatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 20252342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 37845956 - 37846162
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||     
T  37845956 catcatagtcatgttgaaattgtagttgtaaaagggctgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttga 37846055  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    | ||||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  37846056 ttcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattgg 37846155  T
Q  215 tgattgt 221  Q
    |||||||    
T  37846156 tgattgt 37846162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20530185 - 20529978
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||     
T  20530185 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttga 20530086  T
Q  115 tgcatcgaa-agtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    | |||||||  | |||||| ||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20530085 ttcatcgaagggggacgacgttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 20529986  T
Q  214 atgattgt 221  Q
     |||||||    
T  20529985 gtgattgt 20529978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 38035130 - 38035260
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38035130 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaatgtgacgacc 38035229  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38035230 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 38035260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 159
Target Start/End: Original strand, 13378250 - 13378395
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13378250 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttaagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 13378349  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 159  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13378350 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 13378395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 49966151 - 49966013
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49966151 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 49966052  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtg 263  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  49966051 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtg 49966013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 9786123 - 9786315
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  9786123 tgatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacaaatgtgattggagattattgatgtgagacattgggg-ttga 9786221  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9786222 tgtaagtacatgtatgaggatattattattgatcaagtgtatgatgtttatgatgaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 9786315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19601836 - 19601713
Alignment:
Q  36 gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacctt 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19601836 gtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgttgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctt 19601737  T
Q  136 gaggtgattcggtaccacatgcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19601736 gaggtgattcggtaccacatgcat 19601713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 36357826 - 36357976
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  36357826 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcagagattatgtaagactggagtgaaatcttacatacgatgtttttg 36357925  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36357926 ttgcatcgaagatgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 36357976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 35524082 - 35524350
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 222  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||| |||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  35524082 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcacgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtg 35524181  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 320  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||||| | |||| |||||    
T  35524182 tatgaataactgtgatttggtgattgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatgtaagtatttatatgtgaata 35524281  T
Q  321 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 391  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  35524282 tt---attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttctttggattatgatgatgt 35524350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 37235470 - 37235600
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37235470 ttgtagctataaaatggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttaaatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 37235569  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37235570 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 37235600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20930131 - 20929955
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  20930131 gttgtaaaatggttgagctcttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttacatcggaggtgacgaccttt 20930032  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20930031 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 20929955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21193844 - 21193694
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |  |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21193844 catcatagtcatgttgagttttgtagctgtaaaagaggggtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21193745  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21193744 ttgcatcgaaggtgacaaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 21193694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 328
Target Start/End: Original strand, 22250776 - 22250905
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22250776 tgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgatcattgatgtgagatattggggtttga 22250875  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattatt 328  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22250876 tgtaagtattgatatgagaatattattatt 22250905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22226638 - 22226459
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  22226638 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 22226540  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22226539 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 22226459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 291
Target Start/End: Original strand, 22836911 - 22837078
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 222  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22836911 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgatgattgtt 22837010  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattgg 291  Q
     ||| |||| |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22837011 catg-ataaatgtg-attgaagattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattgg 22837078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Original strand, 8539490 - 8539584
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtac 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8539490 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8539584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Original strand, 8604729 - 8604823
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtac 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8604729 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8604823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22352785 - 22352601
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  22352785 gttgtaaaagggttgagctctcttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 22352687  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22352686 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 22352601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Original strand, 44036401 - 44036582
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  44036401 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcaggggtggacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 44036500  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
    |||  || |||| |||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44036501 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcagtaagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 44036582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 51657986 - 51658255
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||  ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||    
T  51657986 gtgacgaccttggagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtggaatgtgaatgatgattgt 51658085  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tg--atgtaagtatatgtatgaga 317  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||  ||| | |||||||||         
T  51658086 gtatgaataaatgtgatttgataattgttcatgccacatgcgattggtgattaattgatgtaagatattggaattatggtatgaatgtatatgta----g 51658181  T
Q  318 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51658182 atattatt-gtgattaagtatatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 51658255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 164
Target Start/End: Original strand, 5769744 - 5769853
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5769744 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 5769843  T
Q  155 tgcatgtatg 164  Q
    ||||| ||||    
T  5769844 tgcatatatg 5769853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 219 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18505817 - 18505646
Alignment:
Q  219 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaa 318  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   |||| |      
T  18505817 tgtgaatgaatatttgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatatttgggtgtgatgtaagtattaatatgtg-t 18505719  T
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18505718 gattattattgatcaaatgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 18505646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 20895390 - 20895486
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20895390 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20895486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 273
Target Start/End: Original strand, 20956627 - 20956776
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  20956627 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 20956726  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
      ||| || |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20956727 tcatg-attattgtg-attgatgattgttcatgatacatgtgattggtgatt 20956776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 15862938 - 15863149
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  15862938 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 15863032  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 238  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |    
T  15863033 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaa 15863132  T
Q  239 ttgatatttgttcatga 255  Q
    |||||| ||||||||||    
T  15863133 ttgataattgttcatga 15863149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21716624 - 21716430
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt------tga 298  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||      ||     
T  21716624 tgtgattggtaattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagattatggtatgt 21716525  T
Q  299 -tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  21716524 gtgtgtgtatatatatatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttataatgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 21716430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20821590 - 20821476
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20821590 actcttttacttcggcgataatgtaagacgggcgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttgataccaca 20821491  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20821490 tgcatatatgtgtcg 20821476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Original strand, 5471872 - 5472028
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||| | |  | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5471872 catcatagtcatgttgagtcttgaagttgtaaatgaggggtactcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttg 5471971  T
Q  114 ttgcatc-gaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg 169  Q
    |||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  5471972 ttgcatcatggggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 5472028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 9785899 - 9785995
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  9785899 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 9785995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20526791 - 20526725
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaag 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20526791 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaatggttgagctcttttacttcggagattatgtaag 20526725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 365
Target Start/End: Original strand, 20895514 - 20895660
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                        
T  20895514 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgtttatgacacatgtgattggtgattattga-------------------- 20895593  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgt 365  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20895594 tgtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgt 20895660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Original strand, 41213197 - 41213311
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| |||    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41213197 actcttttacttcgatgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttattgtatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 41213296  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  41213297 tgcatatatgtgtcg 41213311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41217867 - 41217793
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41217867 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 41217793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Original strand, 22144923 - 22145036
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22144923 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgaaattttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 22145022  T
Q  156 gcatgtatgcgtcg 169  Q
    |||| |||| ||||    
T  22145023 gcatatatgtgtcg 22145036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 15863325 - 15863508
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  15863325 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 15863417  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15863418 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatggttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 15863508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21857934 - 21857753
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||     ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21857934 tgataaatgtgattggtgattatgaatgaatatttgtgcattgataattgttca-----catg--attgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 21857842  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21857841 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatacatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 21857753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17147003 - 17146820
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| | |||| ||||| |||    
T  17147003 tgatatacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgaaatatcggggtgtga 17146911  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17146910 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17146820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 255
Target Start/End: Original strand, 22250622 - 22250752
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||   | |||||||||  || |||| |    
T  22250622 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgtgtcatatttggaaatgtgattggagactgtgaa 22250721  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 255  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22250722 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 22250752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22352570 - 22352498
Alignment:
Q  201 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22352570 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 22352498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27673355 - 27673257
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||| |||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  27673355 gtgacgcccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcatatcatgacatgagtctatttgataaatgtgattgatgattgt 27673257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 15863221 - 15863295
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15863221 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatacatgtaattggtgatt 15863295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22352468 - 22352285
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||        |||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22352468 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgaaaattgttcata-------tgattgatgaatattgatatgagatattggggtgtga 22352376  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  |||  |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  22352375 tgtaagtattaatgcgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgataatgt 22352285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22365252 - 22365155
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  22365252 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 22365155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17147362 - 17147258
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17147362 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 17147263  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  17147262 gtgat 17147258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21858035 - 21857966
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtga 210  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21858035 gatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgacatatgtga 21857966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22365074 - 22364943
Alignment:
Q  258 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 355  Q
    |||||||| | |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  22365074 catgtgatggatgattattgacgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaa 22364980  T
Q  356 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  22364979 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 22364943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 35935166 - 35935239
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35935166 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 35935239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 359
Target Start/End: Original strand, 20589963 - 20590078
Alignment:
Q  246 ttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgat 343  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||| || || ||||     
T  20589963 ttgttcatgatacatgcgattggtgatttattgatgtgagatattgtgattatgatataagtatatacatgtggatattattattgattaaatatatgag 20590062  T
Q  344 gtttatattgaattat 359  Q
     |||| ||||||||||    
T  20590063 atttaaattgaattat 20590078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 7642105 - 7642270
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtacca 152  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||     
T  7642105 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagtccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 7642203  T
Q  153 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  7642204 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaattatgtgattggtgat 7642270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17003396 - 17003302
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17003396 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17003302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22080240 - 22080190
Alignment:
Q  342 atgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22080240 atgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 22080190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22034503 - 22034325
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22034503 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22034406  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  22034405 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 22034325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45050324 - 45050185
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||| ||||||  || |||| ||||||||    
T  45050324 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgatgaccttttggagatttggtaccac 45050230  T
Q  154 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
    |||||| |||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||    
T  45050229 atgcatttatgtgtcaacaagtgcatatcataacatgagtcttat 45050185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20444123 - 20444085
Alignment:
Q  269 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20444123 tgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 20444085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20529863 - 20529825
Alignment:
Q  269 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20529863 tgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 20529825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41393023 - 41392929
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||   ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41393023 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagtatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 41392929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51451184 - 51451090
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  51451184 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 51451090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 194
Target Start/End: Original strand, 21651619 - 21651672
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  21651619 gattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtc 21651672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 307
Target Start/End: Original strand, 37846241 - 37846286
Alignment:
Q  262 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37846241 tgattgatgatcattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 37846286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 20826805 - 20826909
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  20826805 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 20826904  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  20826905 gtgat 20826909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27673260 - 27673216
Alignment:
Q  246 ttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  27673260 ttgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatatt 27673216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12874 - 12488
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12874 catcatagtcgtgttgagattgtagtcataaaaggcttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 12775  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||     
T  12774 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcctatttggaaatgtgattgg 12675  T
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg---tttgatgtaag------ 304  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||   |||||||||||          
T  12674 tgattgtgtatgaataattttgaattaat-gttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggggttttgatgtaagtatata 12576  T
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12575 tatatatatgagaatattattattcatcaagtgcatgatgtctatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 91)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6878117 - 6877821
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6878117 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 6878018  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  6878017 tgcatcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccaaatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 6877918  T
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagata-ttggggtttgatgtaagtatat 309  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6877917 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgaatggtgatttattaatgtcagatatttgggttttgatgtaagtatat 6877821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 36892360 - 36892628
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36892360 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 36892459  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36892460 tgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtaagctattggggttttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 36892559  T
Q  324 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36892560 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 36892628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 25877618 - 25877882
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25877618 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgatatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 25877717  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||   |||| |||   |||    
T  25877718 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgcgagatattggggattgatgtaagtattgttatgtgaa---tat 25877814  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25877815 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 25877882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8886814 - 8886450
Alignment:
Q  16 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8886814 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgtt 8886715  T
Q  116 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgat 215  Q
    |||||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8886714 gcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatgtgtgattggt 8886615  T
Q  216 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtat 313  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||  |||| |    
T  8886614 gattgtgagtgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgcgagatattggagtgtgatgtaggtattgatgtgt 8886522  T
Q  314 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8886521 g-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgt 8886450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22862158 - 22861923
Alignment:
Q  19 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22862158 atagttgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgca 22862059  T
Q  119 tcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||   |  |||||||| ||||    
T  22862058 tcgaaggtgacgaccttgaggtgatctcgtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgattcttatttggaagtgtgattggtgat 22861959  T
Q  219 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 254  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  22861958 tgtgaatgaatatttgtgaattgataatcgttcatg 22861923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25600635 - 25600431
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25600635 catcatagtctcgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 25600536  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  25600535 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtaatatggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttgg 25600436  T
Q  215 tgatt 219  Q
    |||||    
T  25600435 tgatt 25600431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 273
Target Start/End: Original strand, 24088880 - 24089120
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24088880 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacgtcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgacgacc 24088979  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaata 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||    
T  24088980 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatg-ata 24089078  T
Q  231 attgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    | |||| ||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24089079 aatgtg-attgatgattgttcatgataaatgtgattgatgatt 24089120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Original strand, 42180210 - 42180402
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  42180210 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 42180309  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  42180310 gtaagtattgatatgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 42180402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Original strand, 19434958 - 19435144
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19434958 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgaaaaagggttgagctcttt-acttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacgtacgatgtttttg 19435056  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19435057 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttgataccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttatt 19435144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15632071 - 15631864
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |     
T  15632071 catcatagtcgtgttgtatttgtagttgtaaaagggttaagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgttcaaga 15631972  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
     ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15631971 ggcatcaaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgcatttttgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgataaatgtgattg 15631872  T
Q  214 atgattgt 221  Q
     |||||||    
T  15631871 gtgattgt 15631864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 21276342 - 21276535
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21276342 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatcgatgtgagatattggggtttga 21276441  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   | || |||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21276442 tgtaagtattgatgtgggaatatgattattgatcaaatgcatgatgcttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 21276535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 252
Target Start/End: Original strand, 43644471 - 43644688
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||  ||| | || |||| ||||||| ||    
T  43644471 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgaagattatgtgaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgcttgattcaacgaaggtgacgatct 43644570  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattg 234  Q
    |  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  43644571 tttggagatttggtaccacatgcatatatgcgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttg 43644670  T
Q  235 tgtattgatatttgttca 252  Q
    || ||||||| |||||||    
T  43644671 tgaattgataattgttca 43644688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19658625 - 19658470
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19658625 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 19658526  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  19658525 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 19658470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 4795 - 4925
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4795 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 4894  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4895 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 4925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25304244 - 25304094
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25304244 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttaagctattttacttcggagattatgtaagaagggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 25304145  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25304144 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 25304094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24966609 - 24966425
Alignment:
Q  205 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 304  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24966609 atgtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaag 24966510  T
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  24966509 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaacttttatttggattatgatgatgt 24966425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 23823027 - 23823157
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23823027 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23823126  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23823127 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23823157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 23824971 - 23825101
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23824971 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23825070  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23825071 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23825101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 23832106 - 23832236
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23832106 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23832205  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23832206 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23832236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 208 - 376
Target Start/End: Original strand, 12638003 - 12638171
Alignment:
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12638003 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattagtgattattgatgtgagacattggggtttgatgtaagtat 12638102  T
Q  308 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
       | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  12638103 tgatgtgggaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 12638171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43641502 - 43641346
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  43641502 catcatagtcatgttgagtcttgtagccgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgttttta 43641403  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43641402 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcga 43641346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27260257 - 27260130
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27260257 catcatagtcatgttgtgtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27260158  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtga 142  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  27260157 tgcatcaaaggtgacgaccttgaggtga 27260130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 19670629 - 19670778
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  19670629 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatg-tcttg 19670727  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19670728 atgcatcgaaggtgacgaccttgaggagattcggcaccacatgcatttatg 19670778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 206 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21140325 - 21140139
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 305  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21140325 tgtgattgatgattgtaaatgaatacttgtgaattgatatttgttccttatacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 21140226  T
Q  306 atatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||   | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  21140225 attgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 21140139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 24296071 - 24296221
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| |    
T  24296071 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcggagattatgtaagacttgggtgaaatcttacatacgatgttttag 24296170  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24296171 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 24296221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7319989 - 7319718
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  7319989 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 7319890  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    |||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  ||| | |||| || | | ||    
T  7319889 gtatgaatgaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggattatg--gtatgaatatatacgtggat 7319792  T
Q  320 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7319791 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 7319718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22282782 - 22282601
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  22282782 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 22282683  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
    |||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22282682 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 22282601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28972543 - 28972272
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  28972543 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 28972445  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggttt--gatgtaagtatatgtatgagaa 318  Q
    | |||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||  ||  | | || |||||| | || |||    
T  28972444 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcaggacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaattttgggaattatggtatatgtatatatgtgtgaa 28972345  T
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28972344 tattattattgatcaagtacatgatgttta-attgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 28972272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 12643812 - 12644000
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12643812 tgatgtatatgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagacattggggtttga 12643911  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  12643912 tgtaagtat-tg-atgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgt 12644000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 31832 - 32102
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  31832 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 31931  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaata 320  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||   ||  | ||| | |||| |||| | |||    
T  31932 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacatatgtgactggtgattatttgatgtgagatattgaaattata-gtatgaatatatatgtg-ata 32029  T
Q  321 ttattattg-atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32030 ttattatcgaattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22273547 - 22273368
Alignment:
Q  37 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||||    
T  22273547 tagttgtaaaagagttgagctcttttacttaagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgacct 22273448  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
    |  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22273447 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 22273368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25600401 - 25600309
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25600401 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgg 25600309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 273
Target Start/End: Original strand, 12643600 - 12643758
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||     
T  12643600 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattgg 12643699  T
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12643700 tgattgtgtatgaatatttctgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 12643758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 269693 - 269422
Alignment:
Q  123 aagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgatt 219  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| | |||    
T  269693 aagtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtaatt 269595  T
Q  220 gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgaga 317  Q
    ||| || ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | |  || | || ||||||  ||| ||    
T  269594 gtgcataaatatatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagatcatggtatatgtatat--atgtga 269497  T
Q  318 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  269496 atattgttattgatcaaattcatgatgtttatatttaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 269422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 391
Target Start/End: Original strand, 24573051 - 24573320
Alignment:
Q  126 tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 222  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  24573051 tgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgggtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgaagattgtg 24573150  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 320  Q
     || ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |  ||| | ||||| | ||   ||     
T  24573151 cataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatagtgtgaatatatttgtg---att 24573247  T
Q  321 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||  ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24573248 ttattatcggattaaatacatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 24573320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15631812 - 15631702
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15631812 tgatatatatgattgataatggtgtatgaataattgtaagttgatattcgttcatgacacatgtgattggagattattgatgtgagatattggagtttga 15631713  T
Q  299 tgtaagtatat 309  Q
    |||||||||||    
T  15631712 tgtaagtatat 15631702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 391
Target Start/End: Original strand, 4450084 - 4450171
Alignment:
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4450084 tatatatatgagaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 4450171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22692949 - 22692768
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| | ||||| | |||||||||||     
T  22692949 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttg-tccatcggaggtgacgacctta 22692851  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgat 218  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22692850 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22692768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22697596 - 22697415
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| | ||||| | |||||||||||     
T  22697596 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttg-tccatcggaggtgacgacctta 22697498  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgat 218  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22697497 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22697415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 22581588 - 22581858
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22581588 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatttatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 22581687  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | || ||| | | ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | || |  ||| | ||||| | ||   ||    
T  22581688 gcataaatgaatatgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgacgtgagatattgagattatagtgtgaatatatttgtg---at 22581784  T
Q  320 attattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||  ||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22581785 attattatcggattaaataaatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 22581858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18534464 - 18534350
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18534464 actcttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgcaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgacgttgaggtgatttggtaccaca 18534365  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18534364 tgcatatatgtgtcg 18534350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24272689 - 24272579
Alignment:
Q  59 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgca 158  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24272689 ttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgca 24272590  T
Q  159 tgtatgcgtcg 169  Q
    | |||| ||||    
T  24272589 tatatgtgtcg 24272579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 3801123 - 3801306
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  3801123 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 3801215  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  3801216 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 3801306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 169
Target Start/End: Original strand, 22137341 - 22137469
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 140  Q
    |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  22137341 tgtaaaagggatgtgctcttttatttcggtgataatgtaagatgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggt 22137440  T
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg 169  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  22137441 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 22137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 38706810 - 38706993
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||||| || |||    
T  38706810 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggtgtgtga 38706902  T
Q  299 tgtaagta-tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||| ||   ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  38706903 tgtaagtacta---atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 38706993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 461219 - 461139
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  461219 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 461139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34822498 - 34822315
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  34822498 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 34822406  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  34822405 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 34822315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Original strand, 9654507 - 9654579
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9654507 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgccatgagtcttattgatatatgtgattg 9654579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 12637665 - 12637843
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  12637665 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 12637762  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  12637763 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 12637843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 221
Target Start/End: Original strand, 20629034 - 20629114
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629034 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcaagagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20629114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21140533 - 21140355
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  21140533 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 21140436  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21140435 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 21140355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Original strand, 12637873 - 12637940
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12637873 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 12637940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 391
Target Start/End: Original strand, 22691823 - 22691910
Alignment:
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22691823 tatatgtatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgt 22691910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 391
Target Start/End: Original strand, 22696470 - 22696557
Alignment:
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22696470 tatatgtatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgt 22696557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25600260 - 25600173
Alignment:
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25600260 tatatgtgtgtgaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 25600173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24966770 - 24966692
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24966770 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgaatcttattgatatatgtgattggtgatt 24966692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 274
Target Start/End: Original strand, 22691607 - 22691758
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 221  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||| |||||||||    || ||||||| |||||||    
T  22691607 gtgaagaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgtgtcttattggcgaattgtgattggtgattgt 22691705  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 274  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22691706 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgatta 22691758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 274
Target Start/End: Original strand, 22696254 - 22696405
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 221  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||| |||||||||    || ||||||| |||||||    
T  22696254 gtgaagaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgtgtcttattggcgaattgtgattggtgattgt 22696352  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 274  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22696353 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgatta 22696405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8941784 - 8941712
Alignment:
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8941784 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 8941712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Original strand, 19888848 - 19888920
Alignment:
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19888848 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 19888920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 21276027 - 21276205
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  21276027 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 21276124  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  21276125 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgat 21276205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25211076 - 25210909
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| || |||||| |||||| ||||| |||    
T  25211076 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatactgatgtgagatatcggggtgtga 25210984  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  25210983 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 25210909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34822645 - 34822578
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  34822645 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcatgatacatgtaattggtgatt 34822578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6877791 - 6877721
Alignment:
Q  322 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6877791 tattattgttcaagtgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 6877721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 307
Target Start/End: Original strand, 20629142 - 20629243
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  20629142 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgtt-------catgtgattgataattattgatgtgagataatggggtgtga 20629234  T
Q  299 tgtaagtat 307  Q
    |||||||||    
T  20629235 tgtaagtat 20629243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 194
Target Start/End: Original strand, 24687161 - 24687322
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatta-tgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacga 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| ||||||    
T  24687161 ttgttgttgtaaaagagttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaagttgacga 24687259  T
Q  132 ccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 194  Q
    |||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  24687260 ccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 24687322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 307
Target Start/End: Original strand, 43644713 - 43644814
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43644713 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgcgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 43644805  T
Q  299 tgtaagtat 307  Q
    |||||||||    
T  43644806 tgtaagtat 43644814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 3800613 - 3800791
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  3800613 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 3800710  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  3800711 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3800791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25211180 - 25211108
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga 271  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || ||||||||    
T  25211180 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacaagtaattggtga 25211108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34822854 - 34822676
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  34822854 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 34822757  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  34822756 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 34822676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Original strand, 3800822 - 3800889
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3800822 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcctgatacatgtgaatggtgatt 3800889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 9654615 - 9654792
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  9654615 tgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtga 9654707  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||| |   ||||||||||||||| | ||||      |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  9654708 tgtaagtattaatatgtg---attattattgatcaaatgcatg------atattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 9654792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 19888362 - 19888456
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19888362 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19888456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22654412 - 22654339
Alignment:
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22654412 tattattattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 22654339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12726709 - 12726531
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  12726709 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 12726612  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  12726611 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 12726531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 5889880 - 5889974
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5889880 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5889974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 11232835 - 11232929
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11232835 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11232929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 14908022 - 14908116
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  14908022 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 14908116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 22514682 - 22514776
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22514682 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22514776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 28777283 - 28777377
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  28777283 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 28777377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Original strand, 24828161 - 24828218
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24828161 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24828218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Original strand, 24832613 - 24832670
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24832613 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24832670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 720918 - 720835
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  720918 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgtcacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 720835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8942228 - 8942124
Alignment:
Q  116 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8942228 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaagtgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 8942129  T
Q  214 atgat 218  Q
     ||||    
T  8942128 gtgat 8942124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23773193 - 23773015
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  23773193 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 23773096  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  23773095 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 23773015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 3800969 - 3801043
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3800969 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 3801043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22273233 - 22273164
Alignment:
Q  322 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||    
T  22273233 tattattgatcaaatacatgatgatta-attgaaatattcatgttaactgctatttggattatgataatgt 22273164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 24089074 - 24089146
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24089074 tgataaatgtgattgatgattgttcatga-taaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattgatgatt 24089146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25211429 - 25211379
Alignment:
Q  148 taccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25211429 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 25211379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 461060 - 461007
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 253  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  461060 gataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgacttgataattgttcat 461007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 307
Target Start/End: Original strand, 23806359 - 23806404
Alignment:
Q  262 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  23806359 tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtgatgtaagtat 23806404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4425
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4805 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgt 4706  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || ||   ||||| |         
T  4705 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtattgttttggatatgtgattg 4606  T
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaag 304  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | || ||| ||  |||||       |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  4605 gtgattggtgaatgtgtatgaataactatgaattaatgattgtt-------catgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggagtatgatgtaag 4513  T
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4512 tattgatatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttatattgacttattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14354 - 13964
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14354 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaattcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtcaaatcttacatacgatgtttttgt 14255  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt---------attgatata 205  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||  ||     
T  14254 tgcatcgaagatgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgatt 14155  T
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaa 303  Q
     |||||||| ||||||||||||||   ||||  |||||  |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||    
T  14154 ggtgattgacgattgtgtatgaatgtctgtgatttgatgattgttcatgacacatacgattgatgacttattaatgtgagatattggggttatgatataa 14055  T
Q  304 gtatat--gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14054 gtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 13964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31304 - 31038
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31304 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 31205  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31204 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatttttatgagaatattat 31106  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31105 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 31038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21128 - 20860
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  21128 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgtttgtgta 21029  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatatta 323  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21028 tgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttatgattggtgattattgatgtgagatattgggattatgatgtaagtatatgtatgagaatatta 20929  T
Q  324 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    || || ||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20928 ttgttaatcaaatgcatgatgcttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 20860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 124 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28719 - 28450
Alignment:
Q  124 agtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 223  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  28719 agtgacgaccttgaggagatttggcaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgtttgagt 28620  T
Q  224 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatatt 322  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28619 atgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttgtgattggtgattattgatgtgagatattcagatcatgatgtaagtctatgtatgagaatatt 28520  T
Q  323 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28519 attgttgatcaaatgcatgatgtttcaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 28450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 213
Target Start/End: Original strand, 129700 - 129877
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||   ||||| ||||| | |||| ||| ||     
T  129700 gttgtaaaagagttgagctcttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacaatgttgagttgttccatcggaggtgaagacgttt 129799  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  129800 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 129877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 249025 - 249313
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  249025 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttaggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgt 249124  T
Q  115 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat 211  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||    
T  249125 tgcatcgaaggtgacgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgat 249224  T
Q  212 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    || |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  249225 tggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 249313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 6)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3301 - 3095
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3301 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgt 3202  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||     
T  3201 tgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattgg 3102  T
Q  215 tgattgt 221  Q
    |||||||    
T  3101 tgattgt 3095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2811 - 2737
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2811 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2939 - 2865
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2939 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2683 - 2616
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2683 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3067 - 2993
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3067 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2561 - 2475
Alignment:
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2561 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 2475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 7)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5909 - 5703
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5909 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgt 5810  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||     
T  5809 tgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattgg 5710  T
Q  215 tgattgt 221  Q
    |||||||    
T  5709 tgattgt 5703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 943 - 813
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| |    
T  943 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgaagattgtgaa 844  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 255  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  843 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5547 - 5480
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5547 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 5480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5675 - 5601
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5675 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 5601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 511 - 328
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  511 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 419  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  418 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatggtaactgttatttggattatgataatgt 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5425 - 5339
Alignment:
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5425 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 5339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 641
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  715 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgatacatgtaattggtgatt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8108 - 7842
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8108 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 8009  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    | || |         
T  8008 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgagtg 7909  T
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7908 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgattggtgatt 7842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 199 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7631 - 7453
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  7631 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggtgattattgatgggagatattggggttttt 7532  T
Q  297 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  7531 gatgtaagtatatgtatgagaatattattcttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttat 7453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7759 - 7682
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatt 276  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7759 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatt 7682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 124 - 391
Target Start/End: Original strand, 7012 - 7287
Alignment:
Q  124 agtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 223  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7012 agtgacgaccttgaggttatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgt 7111  T
Q  224 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta------tatgtatgag 316  Q
     ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||      ||| ||||||    
T  7112 gtgaataattgaaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatgag 7211  T
Q  317 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  7212 aatatcattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaattattcatgttaacttttattttgattatgatgatgt 7287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 4)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 13680 - 13884
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13680 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 13779  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  13780 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgtatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttgg 13879  T
Q  215 tgatt 219  Q
    |||||    
T  13880 tgatt 13884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16103 - 15922
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| | ||||| | |||||||||||     
T  16103 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttg-tccatcggaggtgacgaccttt 16005  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
     || |||| | |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16004 tggagatttgataccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 15922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 199 - 292
Target Start/End: Original strand, 13914 - 14007
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13914 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatgttggg 14007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 391
Target Start/End: Original strand, 14078 - 14154
Alignment:
Q  316 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  14078 gaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 14154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 802 - 535
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||    
T  802 gtgacgacctttaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataccatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtaattacgta 703  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  702 tgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattat 603  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  602 tattgatcaagtgcatgatgcttaaattgaaatattcatgctaactgttatttgtattatgatgatgt 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3335 - 3129
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3335 catcatagtcttgttgagtttgtagttgaaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 3236  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||     
T  3235 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcaataggtgcatatcatgccacgagtcttattgataaatgtggttgg 3136  T
Q  215 tgattgt 221  Q
    |||||||    
T  3135 tgattgt 3129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3101 - 2907
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 297  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||  ||  |    
T  3101 tgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattagtgactattgctgtgagatattggaattggg 3002  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    || || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  3001 atataggtatatttatgtgaatactattattgttcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 2907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 3784 - 4044
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3784 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatataagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 3883  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtga 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||    
T  3884 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtattattggtgaaatgtga 3983  T
Q  211 ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984 ttgatgattgtgcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatt 4044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27250 - 27067
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27250 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27151  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27150 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtactacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttat 27067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26954 - 26889
Alignment:
Q  311 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26954 tatgtgaatattatttttgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatt 26889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 1046 - 1307
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1046 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgggta 1145  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   || | |||          
T  1146 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattgatacgtgaa------ 1239  T
Q  325 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||    
T  1240 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgataactattattttgattatgatgatgt 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 8)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20067 - 19799
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20067 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagtgttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 19968  T
Q  115 tgcatcgaa--agtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat---- 206  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  || || |        
T  19967 tgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgatt 19868  T
Q  207 -gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 274  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  19867 ggtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattgctgatta 19799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17983 - 17776
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17983 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagtgttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 17884  T
Q  115 tgcatcgaa--agtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 212  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||    
T  17883 tgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgatt 17784  T
Q  213 gatgattg 220  Q
    | ||||||    
T  17783 ggtgattg 17776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 8140 - 8293
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8140 catcatagtcatgtagagtttgttgttgtaaataggttgaactcttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 8239  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtc 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8240 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 8293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 13529 - 13682
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13529 catcatagtcatgtagagtttgttgttgtaaataggttgaactcttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 13628  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtc 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13629 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 13682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17716 - 17526
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17716 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 17617  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17616 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 17526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19746 - 19556
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19746 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 19647  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  19646 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 19556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 391
Target Start/End: Original strand, 8466 - 8539
Alignment:
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8466 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 8539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 391
Target Start/End: Original strand, 13855 - 13928
Alignment:
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13855 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 13928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 236597 - 236412
Alignment:
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  236597 gtgattggtgattgtgtatgaataatggtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtcagatattggggttcgatgtaagta 236498  T
Q  307 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  236497 tatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaattgttatttgaattatgatgatgt 236412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 236857 - 236652
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  236857 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagaaaggtgtgaaatcttacatacgatgttaaagt 236758  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 214  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  236757 agcatcgaaggtgacgacctagaggtgataaggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 236658  T
Q  215 tgattg 220  Q
    ||||||    
T  236657 tgattg 236652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 270785 - 270545
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||     
T  270785 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgat 270686  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 231  Q
    |||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||     
T  270685 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgaatat 270586  T
Q  232 ttgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  270585 ttgtgaattgata-ttattcatgatacatgtaattggtgatt 270545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 270515 - 270329
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  270515 tgataaatgtgattggttattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggggtttga 270423  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  270422 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 270329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 119
Target Start/End: Original strand, 255963 - 256007
Alignment:
Q  75 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcat 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  255963 atgtaagacgggtatgaaatcttacatttgatgtttttgttgcat 256007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28145 - 27950
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg--gttt 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  28145 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtgttt 28046  T
Q  297 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28045 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 27950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28327 - 28179
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  28327 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttgatgattgagta 28228  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||    
T  28227 tgaataactgtgaattgatatttgttaatgatatatgtggttgatgatt 28179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28199 - 28125
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  28199 tgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgatt 28125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3248 - 3055
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  3248 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttga 3149  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3148 tgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatttttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 477 - 281
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  477 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtgattgttgaggtaagatattggggttttg 378  T
Q  298 atgtaag--tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  377 atgtaagtatatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgataatgt 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 739 - 577
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  739 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 640  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 199  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  639 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3518 - 3430
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3518 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 3430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 30843 - 30650
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-ga 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  30843 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtgattattaatgtgagatattggggttttga 30744  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30743 tgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 30650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31090 - 31002
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31090 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 31002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 56615 - 56369
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  56615 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtttgaattcttacatacgatgtttttgt 56516  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat--- 211  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||       
T  56515 tgcatcgaatgtgacgaccttttggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgt 56416  T
Q  212 ----tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 254  Q
        |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  56415 tgaatgatgattgtgtatgagtaactgtgaattgatgtttgttcatg 56369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 56370 - 56206
Alignment:
Q  219 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgag 316  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||             
T  56370 tgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgac-catgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtat--------- 56281  T
Q  317 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  56280 -atatttatattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 56206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 13548 - 13740
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13548 tgatatttgtgattggtgattgtgtataaataattgtgaattgatatt-gttcatgacacatgtgattagtgaatattgatgtgagatattggggtttga 13646  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13647 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 13740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 249
Target Start/End: Original strand, 13434 - 13557
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  13434 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggttcatatcatgacatgagtctt-ttgatatatgtgtttagtgattgtgta 13532  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgt 249  Q
    ||| |||||||  | ||||||||||    
T  13533 tgagtaattgttaaatgatatttgt 13557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8754 - 8493
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8754 catcatagtcttgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 8655  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 212  Q
    || |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  || ||||    
T  8654 tgaatcggaggtgacggccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgagatt 8555  T
Q  213 gatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 274  Q
    | ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  8554 ggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacgtgtgagtggtgatta 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8387
Alignment:
Q  336 tacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8443 tacatgacgtttatagtgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 8387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 15006 - 15271
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt-gtgt 223  Q
    ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||     
T  15006 gtgacgaccctgagatgattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatacatgtgactggtgatttgtga 15105  T
Q  224 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatat 321  Q
    ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||     ||    
T  15106 atgaatattagtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgattattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtatg-----at 15200  T
Q  322 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15201 tattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 15271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26642 - 26451
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  26642 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattatgaatgtgagatattgggg-ttgat 26544  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26543 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 23915 - 24058
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  23915 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatg-tgttg 24013  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
     ||||||||| ||       | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24014 atgcatcgaaggt------atggaggtgattcggtaccacatgcatttatg 24058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 4638 - 4831
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4638 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 4737  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4738 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 4831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 221
Target Start/End: Original strand, 4250 - 4435
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  4250 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 4349  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4350 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 4435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 49478 - 49671
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49478 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 49577  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49578 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 49671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 221
Target Start/End: Original strand, 49090 - 49275
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  49090 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 49189  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  49190 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 49275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 125 - 309
Target Start/End: Original strand, 3707 - 3893
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||     
T  3707 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttgttgatatatgtgattgatgatggtgtg 3806  T
Q  225 tgaataattgtgtattgata-tttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatat 309  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3807 tgaataattgtgaattgatattttgttcatgacacatgtgattagtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatat 3893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 305 - 391
Target Start/End: Original strand, 3927 - 4014
Alignment:
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||    
T  3927 tatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattataatgatgt 4014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 21633 - 21827
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21633 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacattttttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 21732  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21733 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatttatgctaactgttatttggattatgatgatgt 21827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 156183 - 156376
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  156183 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggagtttga 156282  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  156283 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 156376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 85966 - 86149
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  85966 tgataaatgtgattgttgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtga 86058  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  |||| |||     || ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  86059 tgtaagtattaatgtgtga-----ttgttattgatcaaatgcatgatgtttatagtgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 86149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34989 - 34811
Alignment:
Q  43 taaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  |     
T  34989 taaaaggattgaactcttttacttcg-atattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttga 34891  T
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  34890 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 34811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Original strand, 156062 - 156129
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  156062 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 156129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 155937 - 156031
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  155937 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcagatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat 156031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 125 - 284
Target Start/End: Original strand, 26416 - 26575
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26416 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 26515  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaag 284  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26516 tgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtaag 26575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 131 - 391
Target Start/End: Original strand, 66322 - 66592
Alignment:
Q  131 accttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg-------tgt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||       |||    
T  66322 accttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattttgaagtgtgattggtgattgggaattgtgt 66421  T
Q  224 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatat 321  Q
    |||| ||| | || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || ||||||||||||   |||| ||||||    
T  66422 atgagtaactatggattgatgattgttcatgattcatgtgattggtgattaattgatatgagatattgagattatgatgtaagtattgatatgtgaatat 66521  T
Q  322 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  66522 tattattgagcaagtacatgatgattatattgaattattcatgttaaatgtcatttggattatgatgatgt 66592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 70883 - 71003
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  70883 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagataggtgtgaaatcttccatacgatgtttttgt 70982  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgacctt 135  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  70983 tgcatcgaaggtgacgacctt 71003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 391
Target Start/End: Original strand, 26590 - 26660
Alignment:
Q  322 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  26590 tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttctttggattatgatgatgt 26660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 208 - 391
Target Start/End: Original strand, 2474 - 2658
Alignment:
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2474 tgattggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 2573  T
Q  308 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
       | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  2574 tgatttgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgt 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4346 - 4078
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 222  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||| || |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  4346 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgtatatatgtgtcgggctaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtg 4247  T
Q  223 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 320  Q
    ||||||||| ||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | |||| |||||    
T  4246 tatgaataactgtgatttggtgagtgttcatgacacatgtgattggttattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatgtatatgtgaata 4147  T
Q  321 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4146 ctatt---gatcaagcacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 4078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 165
Target Start/End: Original strand, 2112 - 2262
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 114  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2112 catcatagtcatgtagagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 2211  T
Q  115 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgc 165  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2212 tgaatcgaaggtgacgatcttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgc 2262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 391
Target Start/End: Original strand, 2438 - 2511
Alignment:
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2438 tattatcattgattaagtatatgaaatttggattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 2511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 71768 - 71922
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  71768 catcatagtcatgttgagttttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttg 71867  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtc 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  71868 ttgcatcgaatgtgacgaccttgaggtgatttggtaccacaggcatttatgcgtc 71922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 391
Target Start/End: Original strand, 72093 - 72166
Alignment:
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  72093 tattatcattgattaagtatatgatatttgaaatgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 72166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 199 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 77793 - 77600
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||  |||    
T  77793 tgatatatgtgattggtgattgtgcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggtggttatggatgtgagatattagggttttt 77694  T
Q  297 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgat 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  77693 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaaatgttatttggattatgatgat 77600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36047 - 35999
Alignment:
Q  246 ttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36047 ttgttcatgatacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggg 35999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 77977 - 77919
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 199  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  77977 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgatatgagtcttatt 77919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 106409 - 106559
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  106409 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttg 106508  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  106509 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 106559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 113903 - 114150
Alignment:
Q  146 ggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgat 243  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||| |||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||||| ||||| | ||  ||| |    
T  113903 ggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcaagacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtgtataaataactatgatttggt 114002  T
Q  244 atttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatg 341  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | |||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  114003 gattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatttatatgtgaatatt---attgatcaagtacatg 114099  T
Q  342 atgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  114100 atgtttatattgaattattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 114150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 6649 - 6830
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| | ||||| | |||||||||||     
T  6649 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttg-tccatcggaggtgacgaccttt 6747  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6748 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 6830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 130522 - 130409
Alignment:
Q  56 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 155  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  130522 ctcttttacttcggtgataacgtaagaccggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 130423  T
Q  156 gcatgtatgcgtcg 169  Q
    |||| |||| ||||    
T  130422 gcatatatgtgtcg 130409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59117
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||   ||| | ||||| | |||||||||||     
T  58936 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacataagatgttgacttg-tccatcggaggtgacgaccttt 59034  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
         ||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  59035 ttaaaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 59117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 108156 - 108058
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  108156 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaacttggtgcacatcatgacatgagtcttattgggaaatgtgattgatggttgt 108058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 208 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15032 - 14849
Alignment:
Q  208 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta 306  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15032 tgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagta 14933  T
Q  307 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  14932 tatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 14849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17928 - 17735
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttga 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |  |||    
T  17928 gatatatgtgattggtgattgtgtattaataactgttaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaggtattgggataatga 17829  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  17828 tataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatggtgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattttgatgatgt 17735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18151 - 18055
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  18151 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 18055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 205 - 391
Target Start/End: Original strand, 499 - 683
Alignment:
Q  205 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 304  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  499 atgtgattggtgatggtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatatgagatattggggtttgatgtaag 598  T
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  599 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29830 - 29653
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29830 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataacggtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 29731  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 376  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  29730 tgtaagtattgatttgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 29653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 4842 - 4991
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4842 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcggagattatgtatgacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 4941  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4942 ttgcatc-aaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 4991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33580 - 33395
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  33580 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 33481  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  33480 tgtaagtat--------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 33395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Original strand, 32688 - 32869
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  32688 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 32787  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
    |||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32788 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 32869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33848 - 33725
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||| | |||     
T  33848 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgagtatgtg 33749  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttg 248  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  33748 tgaataattgtgaattgatgtttg 33725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 39264 - 39449
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  39264 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 39363  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  39364 tgtaagtat--------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 39449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40156 - 39975
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  40156 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 40057  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
    |||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40056 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 39975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 248
Target Start/End: Original strand, 38996 - 39119
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||| | |||     
T  38996 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgagtatgtg 39095  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttg 248  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  39096 tgaataattgtgaattgatgtttg 39119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 68964 - 68785
Alignment:
Q  54 aactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccac 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  68964 aactcttttacttgggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatggtaccac 68865  T
Q  154 atgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 231  Q
    |||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  68864 atgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtgtatgaataa 68785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 215 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 68773 - 68597
Alignment:
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattat-tgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgta 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | ||    
T  68773 tgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacatgtgattggtgattaactgatgtgagaaattgggattatgatataagtatttata 68674  T
Q  313 tgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatga 388  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  68673 tgcgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 68597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 69441 - 69394
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactctttt 62  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  69441 catcatagtcatgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactctttt 69394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 30531 - 30314
Alignment:
Q  174 gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 272  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||| |||||||    
T  30531 gtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatatgattgataattgtgtgtgaataaatgtg-attgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgat 30434  T
Q  273 t-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaatt 370  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||   ||| | |||| |||| | ||||||||||  ||| || | |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  30433 tgattgatgtgagata-tggggattatagtatgaatatatatgtg-atattattatcggattaaatgcatgatatttgaattgaattattcatgttaatt 30336  T
Q  371 gttat-tggattatgatgatgt 391  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  30335 attatatagattatgatgatgt 30314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 7175 - 6984
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  7175 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacgtgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 7076  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatga 388  Q
    |  ||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7075 agataagtatacatgtatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 6984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7298 - 7214
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 209  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7298 gtgacgaccttgaggtgatttagtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 7214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 242 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23190 - 23040
Alignment:
Q  242 atatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatg 341  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23190 atatttgttcagaacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatg 23091  T
Q  342 atgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23090 atgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 23040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16445 - 16376
Alignment:
Q  323 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16445 attattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 7153 - 7303
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgagattg-tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7153 catcatagtcatgttgagtctggtagtcgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttg 7252  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7253 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 7303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 391
Target Start/End: Original strand, 7416 - 7489
Alignment:
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7416 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 7489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 78342 - 78472
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  78342 ttgtaggtgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacaacc 78441  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  78442 ttgaggtgattcagtaccacatgcatttatg 78472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 118094 - 118244
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  118094 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagatggctgtgaaatcttacatacgatgtttttg 118193  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatg 164  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  118194 ttgaatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcagtaccacatgcatatatg 118244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 163901 - 163817
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163901 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 163817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 201 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 94495 - 94335
Alignment:
Q  201 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgat 299  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| || ||||    
T  94495 atatatgtgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatatgagatattgggattatgat 94396  T
Q  300 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattatt 360  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  94395 ataattatatatatgagaatattattattgatccagtacatgatgtttgaattgaattatt 94335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 94742 - 94695
Alignment:
Q  174 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  94742 gtgcatatcatgacatgagtcttatatataaatgtgattggtgattgt 94695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Original strand, 2627 - 2869
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  2627 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 2726  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtg--catatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaat 229  Q
    |||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  2727 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcacatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgaat 2826  T
Q  230 aattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    | ||||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  2827 atttgtg-attaatgattattcatgatacatgtaattggtgatt 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 2899 - 3083
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtaagatattggggtttg 297  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  2899 tgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgattgattattgatgtgagatatcggggtgtg 2991  T
Q  298 atgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt-ggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||  |||| |||     |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2992 atgtaagtattaatgtgtga-----ttattaatgatcaagtgcattatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 391
Target Start/End: Original strand, 19255 - 19489
Alignment:
Q  148 taccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatattt 247  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||    
T  19255 taccacatgcatatatgtggcgataggtgcatatcatgacatgagtctttttgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataatt 19354  T
Q  248 gttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgt 345  Q
    |||       ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | ||||||||    
T  19355 gtt-------catatgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgt 19442  T
Q  346 ttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19443 ttatattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgt 19489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 125 - 273
Target Start/End: Original strand, 90600 - 90748
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 224  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  90600 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccaaatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgtgta 90699  T
Q  225 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90700 agaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 90748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 78337 - 78228
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  78337 ttgtagttgtaaaagggttcagctcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 78238  T
Q  134 ttgaggtgat 143  Q
    ||||||||||    
T  78237 ttgaggtgat 78228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 90802 - 91018
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-g 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |    
T  90802 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaatgtgagatattggggttttg 90901  T
Q  298 atgtaag----------------------tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta- 374  Q
    |||||||                      ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  90902 atgtaagtatatacatatatatatatatatatatatatatgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttat 91001  T
Q  375 ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||    
T  91002 ttggattatgatgatgt 91018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 129026 - 128867
Alignment:
Q  57 tcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||| |||||||||    
T  129026 tcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 128932  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  128931 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgttataggtgattgatgat 128867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 128804 - 128730
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  128804 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 128730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 145195 - 145016
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||    
T  145195 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgacc 145096  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  145095 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattg 145016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 147454 - 147275
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||| ||||    
T  147454 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgatgacc 147355  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  147354 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattg 147275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 144980 - 144926
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 253  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  144980 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 144926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 147239 - 147185
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 253  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  147239 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 147185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34128 - 34006
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  34128 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacaggtgtgaaatgttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgact 34029  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34028 ttgaggtgattcggtaccacatg 34006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 199 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16961 - 16826
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16961 tgatgtatatgattggtgattgtgtgtgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgatcattgatgtgagatattggggtttga 16862  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 334  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  16861 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaa 16826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17128 - 17070
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 199  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17128 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 17070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 5)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 54300 - 54118
Alignment:
Q  37 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||  | |||||||||||||||||||     
T  54300 tagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcagagattatgtaagctgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaagtgacgaccttt 54202  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 219  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  54201 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgatt 54118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109799
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  109582 gttgtaaaatggttgatctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 109680  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtg 236  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||||| |||||    
T  109681 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgatttgagattgtgaatgaatatttgtg 109780  T
Q  237 tattgatatttgttcatga 255  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  109781 aattgataattgttcatga 109799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 109897 - 109971
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109897 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 109971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 54112 - 54011
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  54112 tgataaatgtgattggtgatagtgaattaataattgtgaattgataattgttcatg-------tgattggtgattattgatgtgagatattggagtgtga 54020  T
Q  299 tgtaagtat 307  Q
     ||||||||    
T  54019 cgtaagtat 54011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 253
Target Start/End: Original strand, 110002 - 110055
Alignment:
Q  200 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 253  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  110002 gatatatgtgattagtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 110055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Original strand, 197600 - 197778
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  197600 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtcttt-tatcatcgaaggtgacgacct 197698  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
    |  || |||| ||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  197699 tttggagatttggtaccacatgtatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 197778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 85056 - 84942
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  85056 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 84957  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  84956 tgcatatatgtgtcg 84942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26194 - 26080
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26194 actcttttacttcggtgataatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgacctttaggtgatttggtaccaca 26095  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||| |||| ||||    
T  26094 tgcatatatgtgtcg 26080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1925 - 1652
Alignment:
Q  122 aaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgat 218  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  1925 aaagagacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgat 1826  T
Q  219 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgaga 317  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||  | ||| | |||| |||| |     
T  1825 tgtgcatgaataaatgtgatttgaagattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagatattgggattata-gtatgaatatatatgtg- 1728  T
Q  318 atattattattg-atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1727 atattattatcgaattaagtacatgatgtttaaattaaattactcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 185
Target Start/End: Original strand, 25101 - 25274
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25101 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagaggtgtgctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttg 25200  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 185  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  25201 ttgcatttaaggtgacgaccttgaggtgattttgtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 25274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Original strand, 217246 - 217426
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  217246 tgtaattgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggg-gtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 217344  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
    |||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  217345 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 217426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5396 - 5221
Alignment:
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 306  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  5396 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 5304  T
Q  307 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  5303 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 5221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5755 - 5661
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  5755 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 5661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 9930 - 10122
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9930 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttattcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10029  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||| |   | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||  || |||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  10030 tgtaagtgttgatttgagaataatattatcgataaagtgcatgatg-ttaaattgaaaaatacatgttaactgtcatttggattatgataatgt 10122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3393 - 3244
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3393 actcttatacttcggtgattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctagaggtgatttggtaccaca 3294  T
Q  155 tgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg---acatgagtcttatt 199  Q
    ||||| |||| |||||  || ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3293 tgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttcacatgagtcttatt 3244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 11532 - 11716
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 134  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  11532 tgtagttgtaaaagggtggt--tcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 11628  T
Q  135 tgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    |  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  11629 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatgacatgagtcttatttgatgtatgtgattggtgattgt 11716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Original strand, 11796 - 11845
Alignment:
Q  258 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  11796 catgtgattgatgattattgatgagaaatattggggtgtgatgtaagtat 11845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4501 - 4320
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  4501 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 4403  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4402 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6123
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6386 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 6287  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaata 320  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  | ||| | |||| | || | |||    
T  6286 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcataacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattata-gtatgaatatatgtgtg-ata 6189  T
Q  321 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatg 384  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  6188 ttattatcggattaagtacatgatatttaaattgaattactcatgttaatttttatgtggattatg 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 213
Target Start/End: Original strand, 5102 - 5274
Alignment:
Q  42 gtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgagg 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||  ||||||| ||||||||  ||||  ||||| | |||||||||||  ||    
T  5102 gtaaaagggttgagctcttttactttggagattatgtaaggcggcagtgaacccttacatacgatgtttacttgtc-catcggaggtgacgaccttttgg 5200  T
Q  140 tgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
     |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5201 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgattg 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Original strand, 12788 - 12876
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12788 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 199 - 334
Target Start/End: Original strand, 21158 - 21288
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-- 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||      
T  21158 tgatatatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggttttt 21250  T
Q  297 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 21288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 20906 - 21002
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20906 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttaatgatatatgtgattggtgattgt 21002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 273
Target Start/End: Original strand, 21030 - 21104
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21030 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 21104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4686 - 4568
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  4686 ttgtagttgtaaaagggttgggctcttttacttcagagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatg-tgttgatgcatcgaaggtgacgacc 4588  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccac 153  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  4587 tggaggtgattcagtaccac 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 163
Target Start/End: Original strand, 14101 - 14250
Alignment:
Q  15 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  14101 catcatagtcatgttgagtcttgaagttgtaaaagaggggtactcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaattttacatatgatgtttttg 14200  T
Q  114 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtat 163  Q
    |||||||    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14201 ttgcatcatgggtaacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtat 14250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 275
Target Start/End: Original strand, 15935 - 16011
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattat 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15935 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaacaactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattat 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 221
Target Start/End: Original strand, 15833 - 15907
Alignment:
Q  147 gtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||    
T  15833 gtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacgtgagtcttattcataaatgtggttggtgattgt 15907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 6410 - 6583
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
T  6410 tgataaatgtggttggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgat------------------- 6490  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 391  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  6491 -gtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 6583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 391
Target Start/End: Original strand, 22 - 119
Alignment:
Q  295 ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  22 ttgatgtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 221
Target Start/End: Original strand, 6310 - 6406
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6310 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattaatgattgt 6406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51690 - 51511
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||| ||||||  |    
T  51690 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtcaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgatgaccttttg 51592  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| |||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51591 gagatttggtaccacgtgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 51511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 3125 - 3395
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| |||| |||||  || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||| | |||||||     
T  3125 gtgacgaccttgaagtgaaatggtatcacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaattatgattgc 3223  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 319  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||  ||| | |||| |||| | ||    
T  3224 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgagattatg--gtatgaatatatatgtggat 3321  T
Q  320 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  3322 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 391
Target Start/End: Original strand, 75550 - 75727
Alignment:
Q  207 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaag 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  75550 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatatgagatattggggttatgatgtaag 75649  T
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| |         |||| |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  75650 tatatat---------ttatga-cgatcaagtacatgatgtttgaattaaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 75727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 196
Target Start/End: Original strand, 72106 - 72177
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  72106 gtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 72177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14958 - 14779
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  14958 gttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggtgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 14860  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| ||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14859 gagatttggttccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28479 - 28300
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  28479 gttgtaaaagggttgagctcttttaattcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 28381  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    | |||| ||| |||||||||| |||| ||| |||  || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28380 gagatttggtgccacatgcatttatgtgtcaataaatgaatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 28300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25718 - 25594
Alignment:
Q  210 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtata 308  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  25718 attgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtatt 25619  T
Q  309 tgtatgagaatattattattgatca 333  Q
      |||| ||||||| ||||||||||    
T  25618 gttatgtgaatatttttattgatca 25594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25799 - 25735
Alignment:
Q  209 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  25799 gattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatatgattggtgatt 25735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 211
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  346 ttgtggttgtaaaagggacgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 247  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  246 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5401 - 5266
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  5401 ttgtggttgtaaaagggacgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 5302  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  5301 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 5266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3934 - 3799
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  3934 ttgtggttgtaaaagggatgtgctcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 3835  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcg 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  3834 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 3799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 1
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 133  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| |    
T  126 tgtagttgtaaaagggttgagcttttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgagc 27  T
Q  134 ttgaggtgattcggtaccacatgcat 159  Q
    ||  || |||| ||||||||||||||    
T  26 ttttggagatttggtaccacatgcat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 203 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44443 - 44288
Alignment:
Q  203 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 301  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | || |||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  44443 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgtttattgatgtgagatattggggttttggtgt 44351  T
Q  302 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 364  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  44350 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatg 44288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 52597 - 52457
Alignment:
Q  218 ttgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgtaagtatatgtatgag 316  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |    
T  52597 ttgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgattgatgactattgatctgagatattggggttttgatttaagtatatgcatgtg 52505  T
Q  317 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 364  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  52504 aatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatg 52457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 106660 - 106479
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||   ||| | ||||| | |||||||||||     
T  106660 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgatcccttacatatgatgttgacttg-tccatcggaggtgacgaccttt 106562  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
     || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  106561 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgacttatgtgattggtgat 106479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27352 - 27169
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||        |||| | ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  27352 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgctcata-------tgatcgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 27260  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  27259 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 27169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32093 - 31925
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 221  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| |||||    
T  32093 gtgacgaccttgaggtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattgataattgt 31995  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 290  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31994 gtatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattg 31925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31850 - 31776
Alignment:
Q  316 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  31850 gaatattattattgatcaagtgcatgaag-ttaaattgaaatattcatg-taaatgttatgtgggttatgatgatgt 31776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 220
Target Start/End: Original strand, 1292 - 1469
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 138  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  1292 gttgtaaaagagttgagctcttttactttggagattatgtaag----gagtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 1386  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattg 220  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  1387 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattg 1469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 35
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc-ttga 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | ||||||||| ||      
T  215 gttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttt 117  T
Q  138 ggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    || || | |||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  116 ggagaattggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtggttggtgat 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40098 - 40010
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40098 gtgacaaccctgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 40010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37697 - 37627
Alignment:
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  37697 attattattgatcaaatgcatgatgttaat--tgaattattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 37627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 56026 - 55922
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  56026 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggggattttgtaccaca 55927  T
Q  155 tgcat 159  Q
    |||||    
T  55926 tgcat 55922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41371 - 41190
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||  ||||||| |||||||    |||| ||||| | ||||||||    
T  41371 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgtagattatgtaaggcaggggtgaacccttacatacgatgttgagctgttccatcggaggtgacgac 41272  T
Q  133 cttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc-ttattgatatatgtgattg 213  Q
    |||  || |||| ||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||  ||||| |||| || || |||||||||||||    
T  41271 cttttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatccagacataagtctttttttatatatgtgattg 41190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 145412 - 145283
Alignment:
Q  146 ggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgat 243  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||   | |||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  145412 ggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgagtagtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 145313  T
Q  244 atttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
      || |||||||||||||||||||||||||    
T  145312 gatttttcatgacacatgtgattggtgatt 145283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 145060 - 144987
Alignment:
Q  319 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  145060 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattaatcatgttaattgttatgtggattatgataatgt 144987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 9426 - 9607
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt-tgcatcgaaagtgacgaccttga 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||  ||| ||    | | ||||| | |||| ||||||      
T  9426 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggggttgaacccttacatatgatattgacatgtccatcggaggtgatgacctttt 9525  T
Q  138 ggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    || |||| |||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9526 ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaaaaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 269 - 364
Target Start/End: Original strand, 12989 - 13085
Alignment:
Q  269 tgattattgatgtaagatattggggttt-gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 364  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  12989 tgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 13085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31192 - 31120
Alignment:
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  31192 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31391 - 31333
Alignment:
Q  215 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 273  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  31391 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 31333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7641 - 7465
Alignment:
Q  39 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||  |||| || |||||||   ||| | ||||  | |||| ||||||     
T  7641 gttgtaaaagggttgaactcttttactttggagattatgtaaggctggggtgaacccttatatacgatgttgacttg-tccatcagaggtgatgaccttt 7543  T
Q  137 aggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 213  Q
     || |||| ||||| |||||||| |||| ||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7542 tggagatttggtacgacatgcatttatgtgtcaacaagtacatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 101
Target Start/End: Original strand, 52771 - 52837
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  52771 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacat 52837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 101
Target Start/End: Original strand, 56723 - 56789
Alignment:
Q  35 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  56723 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacat 56789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 804
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  987 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 895  T
Q  299 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  894 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgt 804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1509
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 219  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1587 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1427 - 1298
Alignment:
Q  258 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||    
T  1427 catgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaa 1335  T
Q  356 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  1334 atattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Original strand, 15167 - 15239
Alignment:
Q  320 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15167 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 15239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 391
Target Start/End: Original strand, 4639 - 4725
Alignment:
Q  305 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4639 tatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgaag-ttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgt 4725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 274
Target Start/End: Original strand, 4528 - 4596
Alignment:
Q  206 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4528 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgatta 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 218
Target Start/End: Original strand, 1 - 94
Alignment:
Q  126 tgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 264 - 448
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| |||| | ||    
T  264 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattggtcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcgggggtgtg 356  T
Q  298 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  357 atgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgt 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6898
Alignment:
Q  141 gattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 213  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6826 gatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatatgattg 6898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 391
Target Start/End: Original strand, 6934 - 7115
Alignment:
Q  199 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |       ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||    
T  6934 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattggt-------catatgattgatgactattgatgtgagatattgggatgtga 7026  T
Q  299 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 391  Q
     ||||||||  |||| ||     |||| |||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7027 agtaagtattaatgtgtg-----attactattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 7115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30009 - 29855
Alignment:
Q  41 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  30009 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 29911  T
Q  139 gtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 194  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  29910 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 29855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Original strand, 17586 - 17771
Alignment:
Q  34 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacga 131  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| ||||||    
T  17586 ttgttgttgtaaaagggatga-ctcttttactttg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacga 17683  T
Q  132 ccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    |||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17684 ccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37862 - 37768
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 218  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37862 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 4578 - 4532
Alignment:
Q  55 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  4578 actcttttacttcggagataatgtaagacggacgtgaaatcttacat 4532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 274
Target Start/End: Original strand, 2839 - 2989
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  2839 gtgacgaccttgaggtgaat-ggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 2936  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 274  Q
    |||||||||| ||||  |||||  || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  2937 gtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 2989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 274
Target Start/End: Original strand, 26542 - 26692
Alignment:
Q  125 gtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 221  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  26542 gtgacgaccttgaggtgaat-ggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 26639  T
Q  222 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 274  Q
    |||||||||| ||||  |||||  || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  26640 gtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 26692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12329 - 12285
Alignment:
Q  75 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12329 atgtaagatgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcat 12285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7299
Alignment:
Q  350 attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7341 attgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University