View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4126_low_26 (Length: 238)

Name: NF4126_low_26
Description: NF4126
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4126_low_26
NF4126_low_26
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (7-237)||(6539-6769)
scaffold0621 (18-238)||(8481-8705)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (6-238)||(19267-19500)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (6-238)||(18005649-18005882)
chr7 (6-237)||(44014181-44014409)
chr7 (7-238)||(67749-67980)
chr7 (6-238)||(16219602-16219835)
chr7 (6-238)||(811016-811249)
chr7 (7-238)||(47831811-47832043)
chr7 (18-238)||(16056343-16056563)
chr7 (7-236)||(22072917-22073149)
chr7 (18-238)||(12901338-12901560)
chr7 (7-170)||(34200790-34200951)
chr7 (7-238)||(15754774-15755004)
chr7 (7-170)||(16495406-16495567)
chr7 (7-170)||(11995983-11996144)
chr7 (7-170)||(28505254-28505415)
chr7 (6-180)||(2280061-2280238)
chr7 (31-126)||(12255789-12255886)
chr7 (7-129)||(38227485-38227606)
chr7 (18-193)||(1867924-1868101)
chr7 (7-125)||(3564363-3564481)
chr7 (22-238)||(20220074-20220290)
chr7 (7-129)||(18456408-18456529)
chr7 (7-129)||(12698835-12698958)
chr7 (22-163)||(13647344-13647487)
chr7 (18-189)||(14044761-14044935)
chr7 (18-189)||(14354791-14354965)
chr7 (7-163)||(18430713-18430870)
chr7 (7-163)||(27216861-27217018)
chr7 (7-129)||(9509193-9509315)
chr7 (7-163)||(456322-456479)
chr7 (7-163)||(11393291-11393448)
chr7 (7-163)||(11972497-11972654)
chr7 (7-163)||(14949126-14949283)
chr7 (7-163)||(15376717-15376874)
chr7 (7-163)||(16232521-16232678)
chr7 (7-163)||(18640273-18640430)
chr7 (7-163)||(20385127-20385284)
chr7 (7-163)||(21189599-21189756)
chr7 (7-163)||(24702239-24702396)
chr7 (7-163)||(32125492-32125649)
chr7 (7-163)||(41522918-41523075)
chr7 (7-163)||(41525380-41525537)
chr7 (111-222)||(9389599-9389709)
chr7 (7-163)||(17061919-17062076)
chr7 (19-129)||(26212012-26212122)
chr7 (7-125)||(48273393-48273511)
chr7 (21-180)||(19486686-19486847)
chr7 (21-129)||(10063813-10063921)
chr7 (7-163)||(16410060-16410217)
chr7 (7-163)||(24704689-24704843)
chr7 (17-125)||(24275182-24275289)
chr7 (6-125)||(15144037-15144154)
chr7 (7-163)||(44116510-44116667)
chr7 (7-129)||(16386242-16386365)
chr7 (26-180)||(15008441-15008597)
chr7 (7-163)||(3386334-3386491)
chr7 (19-122)||(10589055-10589158)
chr7 (7-118)||(16213685-16213795)
chr7 (172-238)||(16324175-16324241)
chr7 (7-122)||(40443395-40443509)
chr7 (7-54)||(13869347-13869394)
chr7 (7-54)||(20110557-20110604)
chr7 (7-73)||(27847881-27847947)
chr7 (7-54)||(13831374-13831421)
chr7 (17-163)||(38898380-38898528)
chr7 (88-124)||(16324135-16324171)
chr7 (22-74)||(18203831-18203882)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (6-238)||(22921754-22921987)
chr1 (6-238)||(33681010-33681243)
chr1 (6-164)||(22237630-22237789)
chr1 (10-157)||(21754052-21754198)
chr1 (6-180)||(20248282-20248454)
chr1 (6-238)||(52927867-52928088)
chr1 (22-238)||(21861454-21861672)
chr1 (22-217)||(21896162-21896358)
chr1 (19-170)||(20918620-20918769)
chr1 (6-170)||(14295507-14295672)
chr1 (6-181)||(21161719-21161892)
chr1 (22-238)||(50614000-50614219)
chr1 (22-238)||(50621828-50622047)
chr1 (22-238)||(50686630-50686849)
chr1 (10-238)||(16368171-16368401)
chr1 (18-192)||(16758664-16758841)
chr1 (111-238)||(35981573-35981700)
chr1 (22-226)||(41049933-41050138)
chr1 (7-125)||(50210212-50210330)
chr1 (7-129)||(22532273-22532395)
chr1 (22-116)||(35261086-35261180)
chr1 (22-163)||(45574846-45574989)
chr1 (111-184)||(49261448-49261521)
chr1 (7-163)||(21475091-21475248)
chr1 (7-122)||(34509784-34509899)
chr1 (7-163)||(13988867-13989024)
chr1 (111-238)||(20636957-20637084)
chr1 (7-163)||(21923295-21923452)
chr1 (7-129)||(21026684-21026806)
chr1 (7-129)||(27250724-27250846)
chr1 (17-125)||(21840778-21840885)
chr1 (7-163)||(23593739-23593896)
chr1 (7-163)||(29298138-29298294)
chr1 (7-163)||(29776689-29776846)
chr1 (7-163)||(31612314-31612471)
chr1 (7-163)||(433013-433168)
chr1 (55-170)||(22130863-22130976)
chr1 (22-181)||(16093825-16093987)
chr1 (7-74)||(20847205-20847271)
chr1 (71-170)||(51130632-51130729)
chr1 (7-163)||(22123071-22123229)
chr1 (17-68)||(20454610-20454660)
chr1 (24-163)||(26064959-26065100)
chr1 (17-163)||(16361928-16362075)
chr1 (7-163)||(13212865-13213023)
chr1 (31-79)||(38801433-38801481)
chr1 (7-54)||(21342097-21342144)
chr1 (7-54)||(21346962-21347009)
chr1 (7-54)||(21707168-21707215)
chr1 (7-54)||(21711710-21711757)
chr1 (6-54)||(21714545-21714593)
chr1 (7-54)||(15860123-15860170)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (14-237)||(5654-5877)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (6-238)||(100377-100610)
scaffold0023 (6-238)||(40059-40292)
scaffold0023 (7-163)||(94412-94569)
scaffold0023 (7-163)||(44455-44613)
scaffold0023 (6-80)||(101502-101576)
scaffold0023 (7-76)||(119879-119948)
scaffold0023 (17-163)||(17444-17591)
[»] chr2 (60 HSPs)
chr2 (6-238)||(25175853-25176086)
chr2 (8-238)||(28405981-28406213)
chr2 (33-238)||(7617-7824)
chr2 (18-238)||(18786787-18787009)
chr2 (7-157)||(22134175-22134323)
chr2 (7-164)||(7679589-7679746)
chr2 (22-238)||(23207296-23207514)
chr2 (7-170)||(23071905-23072066)
chr2 (22-238)||(23791292-23791511)
chr2 (7-163)||(22105413-22105571)
chr2 (7-129)||(298809-298932)
chr2 (21-163)||(19671848-19671991)
chr2 (6-180)||(23708561-23708738)
chr2 (7-129)||(23060517-23060639)
chr2 (22-238)||(25108906-25109125)
chr2 (7-163)||(18808944-18809101)
chr2 (7-163)||(23130863-23131020)
chr2 (7-163)||(23133330-23133487)
chr2 (7-163)||(23709536-23709693)
chr2 (7-163)||(23712017-23712174)
chr2 (7-163)||(34402526-34402683)
chr2 (7-163)||(39682314-39682471)
chr2 (7-129)||(22337119-22337241)
chr2 (7-129)||(23076446-23076568)
chr2 (7-129)||(23285869-23285987)
chr2 (7-129)||(23654381-23654503)
chr2 (7-101)||(38138-38231)
chr2 (7-129)||(23660027-23660148)
chr2 (17-163)||(24367785-24367932)
chr2 (22-163)||(20520152-20520295)
chr2 (7-160)||(23135591-23135745)
chr2 (7-163)||(571398-571555)
chr2 (7-163)||(6725996-6726153)
chr2 (7-163)||(26505380-26505537)
chr2 (7-163)||(26507858-26508015)
chr2 (7-163)||(28577100-28577257)
chr2 (7-129)||(22731229-22731351)
chr2 (17-163)||(21155064-21155211)
chr2 (84-192)||(24697536-24697645)
chr2 (7-163)||(24898199-24898357)
chr2 (7-163)||(24900682-24900840)
chr2 (7-163)||(24903159-24903317)
chr2 (7-163)||(24905636-24905794)
chr2 (7-163)||(24908111-24908269)
chr2 (7-122)||(20309112-20309225)
chr2 (7-67)||(23040247-23040306)
chr2 (7-163)||(32039502-32039659)
chr2 (7-125)||(23103396-23103512)
chr2 (17-163)||(32214925-32215072)
chr2 (7-80)||(8946661-8946733)
chr2 (22-180)||(22413078-22413240)
chr2 (7-163)||(45029858-45030015)
chr2 (8-163)||(43137301-43137457)
chr2 (17-65)||(24643054-24643101)
chr2 (7-54)||(22738249-22738296)
chr2 (22-157)||(23004767-23004905)
chr2 (7-54)||(38967375-38967422)
chr2 (7-163)||(24529532-24529690)
chr2 (24-74)||(23287384-23287433)
chr2 (24-73)||(26392403-26392451)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (6-238)||(2530-2763)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (6-238)||(14582-14815)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (6-237)||(21673707-21673938)
chr8 (6-217)||(23760751-23760962)
chr8 (7-236)||(38855139-38855368)
chr8 (7-238)||(6520372-6520603)
chr8 (17-226)||(21285611-21285820)
chr8 (6-180)||(26355643-26355816)
chr8 (18-217)||(983312-983512)
chr8 (7-170)||(5866230-5866391)
chr8 (7-170)||(21490999-21491160)
chr8 (22-238)||(37116366-37116585)
chr8 (7-170)||(17140920-17141081)
chr8 (22-238)||(17266877-17267096)
chr8 (22-238)||(20498581-20498799)
chr8 (7-170)||(21249388-21249550)
chr8 (7-170)||(21255226-21255388)
chr8 (7-129)||(22626740-22626861)
chr8 (21-198)||(13508009-13508188)
chr8 (7-129)||(16092337-16092459)
chr8 (22-217)||(24353039-24353235)
chr8 (21-198)||(13597541-13597720)
chr8 (7-129)||(21918995-21919117)
chr8 (22-192)||(17439436-17439609)
chr8 (7-129)||(22875069-22875190)
chr8 (21-163)||(17612069-17612213)
chr8 (7-122)||(28649046-28649161)
chr8 (7-129)||(7372782-7372904)
chr8 (7-129)||(20536212-20536334)
chr8 (84-237)||(22364744-22364897)
chr8 (7-122)||(31971261-31971375)
chr8 (7-129)||(26219718-26219838)
chr8 (7-163)||(1484403-1484560)
chr8 (7-163)||(5853296-5853453)
chr8 (7-163)||(14409448-14409605)
chr8 (7-163)||(20046199-20046356)
chr8 (7-163)||(20403228-20403385)
chr8 (7-163)||(22001754-22001911)
chr8 (7-122)||(16199647-16199761)
chr8 (7-129)||(18818404-18818526)
chr8 (7-129)||(21923923-21924045)
chr8 (7-116)||(6759262-6759371)
chr8 (7-116)||(23406383-23406492)
chr8 (7-80)||(18879276-18879348)
chr8 (17-163)||(16413320-16413467)
chr8 (7-129)||(26225288-26225408)
chr8 (7-163)||(4483282-4483438)
chr8 (7-163)||(15203235-15203392)
chr8 (7-122)||(21395984-21396097)
chr8 (7-122)||(21790477-21790590)
chr8 (7-163)||(41598189-41598346)
chr8 (7-163)||(4542377-4542534)
chr8 (7-122)||(21389454-21389567)
chr8 (7-122)||(21778780-21778893)
chr8 (22-162)||(19801387-19801527)
chr8 (7-74)||(45131047-45131113)
chr8 (7-65)||(19896266-19896323)
chr8 (7-54)||(25484382-25484429)
chr8 (84-131)||(40492844-40492891)
chr8 (22-192)||(19154816-19154989)
chr8 (17-54)||(45290809-45290846)
chr8 (7-163)||(14823775-14823931)
chr8 (19-54)||(15070571-15070606)
chr8 (7-54)||(19937120-19937167)
chr8 (79-170)||(21383887-21383978)
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (6-238)||(15470927-15471159)
chr3 (6-238)||(16103783-16104015)
chr3 (6-238)||(16097331-16097564)
chr3 (6-222)||(12174164-12174377)
chr3 (10-157)||(32307684-32307830)
chr3 (7-238)||(14234491-14234725)
chr3 (6-156)||(49668044-49668194)
chr3 (6-154)||(9512923-9513067)
chr3 (6-154)||(9520898-9521042)
chr3 (7-170)||(13210283-13210444)
chr3 (10-157)||(1644642-1644787)
chr3 (22-180)||(52523669-52523831)
chr3 (7-129)||(27165251-27165373)
chr3 (22-238)||(37251052-37251270)
chr3 (7-129)||(12399213-12399335)
chr3 (7-129)||(53301545-53301668)
chr3 (21-180)||(24340665-24340826)
chr3 (22-238)||(22110236-22110454)
chr3 (7-122)||(18438538-18438653)
chr3 (21-129)||(23274705-23274813)
chr3 (10-129)||(14572596-14572714)
chr3 (7-129)||(14972858-14972980)
chr3 (7-129)||(17487860-17487982)
chr3 (7-129)||(17499342-17499464)
chr3 (7-129)||(36166599-36166719)
chr3 (21-129)||(42386428-42386536)
chr3 (22-163)||(43925977-43926121)
chr3 (17-129)||(21618460-21618570)
chr3 (7-129)||(13442278-13442400)
chr3 (6-129)||(14576828-14576950)
chr3 (7-101)||(11424783-11424876)
chr3 (7-129)||(24153204-24153325)
chr3 (111-184)||(1465350-1465423)
chr3 (21-180)||(37642207-37642368)
chr3 (7-163)||(7781351-7781508)
chr3 (7-163)||(17463179-17463336)
chr3 (7-163)||(17672627-17672784)
chr3 (7-122)||(20698437-20698552)
chr3 (7-163)||(29172587-29172744)
chr3 (7-163)||(34159327-34159484)
chr3 (7-163)||(45606911-45607068)
chr3 (7-163)||(55476492-55476649)
chr3 (8-163)||(16282815-16282971)
chr3 (7-129)||(23083356-23083478)
chr3 (17-163)||(38961895-38962042)
chr3 (7-72)||(28194694-28194759)
chr3 (7-160)||(28848618-28848772)
chr3 (22-163)||(43550482-43550625)
chr3 (7-163)||(8899095-8899252)
chr3 (7-163)||(9707611-9707768)
chr3 (7-163)||(16454285-16454442)
chr3 (112-238)||(49389515-49389642)
chr3 (10-125)||(606324-606441)
chr3 (7-125)||(6469178-6469295)
chr3 (7-125)||(25476384-25476502)
chr3 (7-129)||(26686891-26687013)
chr3 (7-125)||(40213720-40213837)
chr3 (15-129)||(43840944-43841058)
chr3 (17-163)||(12567571-12567718)
chr3 (17-163)||(13544036-13544183)
chr3 (7-120)||(55500943-55501055)
chr3 (7-163)||(13151794-13151952)
chr3 (7-163)||(13154259-13154417)
chr3 (22-163)||(53070657-53070799)
chr3 (7-163)||(10247727-10247884)
chr3 (7-163)||(17446659-17446815)
chr3 (7-125)||(15977516-15977633)
chr3 (17-163)||(50242833-50242980)
chr3 (33-180)||(22147467-22147616)
chr3 (65-180)||(2051141-2051260)
chr3 (7-65)||(17737237-17737294)
chr3 (8-163)||(41123892-41124045)
chr3 (7-54)||(8499519-8499566)
chr3 (7-54)||(10556986-10557033)
chr3 (7-54)||(15412430-15412477)
chr3 (7-54)||(45577952-45577999)
chr3 (173-238)||(43927304-43927369)
chr3 (7-114)||(12119780-12119886)
chr3 (7-54)||(44494810-44494857)
chr3 (24-68)||(13919350-13919393)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (6-238)||(2689-2924)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (7-237)||(21502041-21502273)
chr5 (7-238)||(21329382-21329614)
chr5 (6-238)||(21565545-21565778)
chr5 (6-238)||(26011920-26012154)
chr5 (6-169)||(22959489-22959650)
chr5 (22-238)||(20026825-20027043)
chr5 (7-180)||(19668902-19669073)
chr5 (7-170)||(19660791-19660952)
chr5 (22-238)||(22178104-22178323)
chr5 (7-129)||(21729059-21729181)
chr5 (7-129)||(21808384-21808506)
chr5 (22-163)||(22144068-22144211)
chr5 (7-129)||(23390491-23390613)
chr5 (7-104)||(36314581-36314678)
chr5 (7-129)||(24493573-24493694)
chr5 (7-128)||(8286838-8286960)
chr5 (111-170)||(21741486-21741545)
chr5 (7-129)||(13025315-13025436)
chr5 (7-129)||(13095499-13095620)
chr5 (7-129)||(22412188-22412309)
chr5 (7-163)||(264772-264929)
chr5 (10-129)||(1096474-1096593)
chr5 (7-163)||(10732944-10733101)
chr5 (7-163)||(11581203-11581360)
chr5 (7-122)||(24529224-24529339)
chr5 (7-163)||(29329935-29330092)
chr5 (7-163)||(39363385-39363542)
chr5 (7-125)||(9077956-9078074)
chr5 (7-109)||(21997549-21997651)
chr5 (19-129)||(22075035-22075145)
chr5 (7-129)||(25421536-25421658)
chr5 (21-180)||(40725871-40726032)
chr5 (7-163)||(20909013-20909170)
chr5 (7-163)||(42245369-42245526)
chr5 (18-163)||(20902012-20902159)
chr5 (55-157)||(29448054-29448159)
chr5 (7-163)||(2154617-2154775)
chr5 (7-163)||(29345981-29346138)
chr5 (23-127)||(25431414-25431518)
chr5 (7-160)||(39245137-39245291)
chr5 (7-163)||(29348454-29348611)
chr5 (7-163)||(29350927-29351084)
chr5 (7-163)||(36154787-36154941)
chr5 (7-65)||(20918052-20918109)
chr5 (7-163)||(32027394-32027551)
chr5 (7-54)||(10775790-10775837)
chr5 (17-163)||(18319037-18319185)
chr5 (7-74)||(21293020-21293086)
chr5 (7-54)||(23064512-23064559)
chr5 (22-73)||(26740697-26740747)
chr5 (7-54)||(38619435-38619482)
chr5 (22-75)||(37723922-37723975)
chr5 (69-129)||(20766115-20766175)
chr5 (7-63)||(31061069-31061124)
chr5 (19-73)||(26732884-26732937)
chr5 (6-54)||(26704074-26704122)
chr5 (6-54)||(26973807-26973855)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (7-226)||(39706187-39706405)
chr4 (18-238)||(12288094-12288316)
chr4 (6-157)||(12774010-12774160)
chr4 (6-238)||(8846359-8846608)
chr4 (18-126)||(52243192-52243302)
chr4 (7-170)||(15551821-15551982)
chr4 (22-189)||(13784-13953)
chr4 (18-237)||(43198438-43198661)
chr4 (22-238)||(53082036-53082254)
chr4 (22-238)||(46640340-46640558)
chr4 (111-238)||(15099457-15099584)
chr4 (111-238)||(15190424-15190551)
chr4 (15-125)||(16377522-16377630)
chr4 (7-129)||(16239965-16240086)
chr4 (7-122)||(7088881-7088996)
chr4 (41-170)||(16596686-16596813)
chr4 (7-163)||(44615289-44615446)
chr4 (7-129)||(7798778-7798900)
chr4 (7-129)||(22636439-22636561)
chr4 (7-129)||(6899895-6900016)
chr4 (7-129)||(8574864-8574984)
chr4 (7-129)||(16270231-16270352)
chr4 (7-128)||(52873363-52873484)
chr4 (7-163)||(12311-12468)
chr4 (7-163)||(15118356-15118513)
chr4 (7-163)||(18215278-18215435)
chr4 (10-129)||(23374354-23374473)
chr4 (7-163)||(44773091-44773248)
chr4 (7-163)||(52312511-52312668)
chr4 (7-129)||(12902761-12902883)
chr4 (7-129)||(14280317-14280438)
chr4 (7-129)||(54798749-54798871)
chr4 (17-163)||(19618176-19618323)
chr4 (7-163)||(44928883-44929041)
chr4 (7-163)||(50222343-50222500)
chr4 (7-163)||(51463872-51464029)
chr4 (7-129)||(7893707-7893829)
chr4 (7-129)||(44052833-44052955)
chr4 (8-125)||(14038653-14038770)
chr4 (7-80)||(3096297-3096369)
chr4 (7-160)||(18239426-18239580)
chr4 (7-163)||(1837513-1837670)
chr4 (7-163)||(19242700-19242857)
chr4 (17-125)||(14970751-14970858)
chr4 (7-68)||(17046491-17046552)
chr4 (7-163)||(3515008-3515165)
chr4 (7-118)||(23803316-23803426)
chr4 (17-163)||(15355328-15355476)
chr4 (7-65)||(7641286-7641343)
chr4 (7-65)||(12610951-12611008)
chr4 (7-120)||(14053306-14053418)
chr4 (7-163)||(44102215-44102372)
chr4 (85-126)||(15464929-15464970)
chr4 (31-74)||(17333305-17333347)
chr4 (22-68)||(6190481-6190527)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (18-238)||(10542-10763)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (7-238)||(62202-62431)
scaffold0028 (6-154)||(132661-132809)
scaffold0028 (7-163)||(136681-136838)
scaffold0028 (7-163)||(139150-139307)
scaffold0028 (7-163)||(144088-144245)
scaffold0028 (7-163)||(134212-134369)
scaffold0028 (7-163)||(141619-141776)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (61-238)||(2103-2281)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (7-238)||(12770-13002)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (7-226)||(6021-6240)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (6-238)||(10426-10659)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (6-238)||(129908-130141)
scaffold0010 (22-126)||(60713-60818)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (6-238)||(132-364)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (7-234)||(6615-6843)
scaffold0333 (7-234)||(13995-14223)
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (6-238)||(19652198-19652429)
chr6 (6-238)||(23019408-23019642)
chr6 (18-238)||(19668386-19668608)
chr6 (62-238)||(22080624-22080800)
chr6 (7-238)||(1561307-1561537)
chr6 (7-238)||(28496359-28496588)
chr6 (7-238)||(29808770-29808999)
chr6 (18-171)||(9098465-9098620)
chr6 (7-104)||(27333238-27333335)
chr6 (7-104)||(27393978-27394075)
chr6 (6-118)||(4185827-4185939)
chr6 (6-158)||(20109140-20109295)
chr6 (12-118)||(4186376-4186482)
chr6 (7-129)||(16496248-16496370)
chr6 (6-176)||(31155346-31155515)
chr6 (7-125)||(29060544-29060662)
chr6 (7-116)||(20076704-20076812)
chr6 (18-126)||(25644335-25644444)
chr6 (7-163)||(1595550-1595707)
chr6 (7-125)||(18409826-18409944)
chr6 (7-163)||(22782228-22782385)
chr6 (7-125)||(19303540-19303657)
chr6 (7-163)||(2291184-2291341)
chr6 (10-180)||(8227453-8227625)
chr6 (7-163)||(12742318-12742475)
chr6 (7-163)||(18334596-18334753)
chr6 (7-163)||(19005047-19005204)
chr6 (7-163)||(19858923-19859080)
chr6 (7-122)||(20638285-20638400)
chr6 (7-163)||(24422548-24422705)
chr6 (7-163)||(33861795-33861952)
chr6 (7-163)||(33864279-33864436)
chr6 (7-125)||(25629354-25629472)
chr6 (7-163)||(20556898-20557053)
chr6 (17-163)||(30676714-30676861)
chr6 (58-118)||(4668217-4668277)
chr6 (58-118)||(4675064-4675124)
chr6 (7-163)||(8055030-8055187)
chr6 (7-163)||(26924644-26924801)
chr6 (7-129)||(17287791-17287913)
chr6 (15-129)||(20360955-20361069)
chr6 (7-163)||(25754810-25754967)
chr6 (7-125)||(20593777-20593895)
chr6 (7-109)||(25656630-25656731)
chr6 (17-163)||(34963384-34963531)
chr6 (7-160)||(1540918-1541072)
chr6 (22-163)||(18456735-18456877)
chr6 (17-125)||(25688513-25688620)
chr6 (7-122)||(16920634-16920747)
chr6 (134-226)||(28103796-28103887)
chr6 (7-122)||(35245590-35245703)
chr6 (7-65)||(25714421-25714478)
chr6 (22-238)||(23076749-23076968)
chr6 (7-163)||(3852021-3852178)
chr6 (22-125)||(18461895-18461997)
chr6 (24-68)||(22831524-22831568)
chr6 (17-163)||(16448530-16448678)
chr6 (84-190)||(18696569-18696675)
chr6 (7-54)||(22780297-22780344)
chr6 (13-66)||(11185515-11185568)
chr6 (84-192)||(18706387-18706495)
chr6 (22-238)||(35008167-35008386)
chr6 (24-101)||(33443068-33443146)
chr6 (22-65)||(18821904-18821946)
chr6 (6-50)||(4738631-4738675)
chr6 (134-182)||(18896256-18896304)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (6-180)||(22613-22788)
scaffold0037 (7-163)||(82073-82230)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (6-238)||(32538-32771)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (6-238)||(12942-13175)
scaffold0138 (84-238)||(18122-18277)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (4-238)||(160685-160919)
scaffold0001 (17-163)||(501095-501242)
scaffold0001 (7-163)||(85583-85741)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (7-238)||(920-1151)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (13-238)||(6822-7045)
scaffold0556 (85-236)||(8097-8249)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (6-180)||(45735-45910)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (17-238)||(1096-1318)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (18-238)||(7961-8180)
scaffold0218 (50-164)||(29242-29354)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (22-238)||(136252-136471)
scaffold0021 (22-238)||(144960-145179)
scaffold0021 (22-125)||(174785-174886)
scaffold0021 (7-73)||(121770-121835)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (22-238)||(6167-6386)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (6-110)||(23897-24001)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (7-170)||(11296-11457)
scaffold0046 (7-170)||(2001-2162)
scaffold0046 (7-122)||(28418-28533)
scaffold0046 (7-59)||(4556-4608)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (26-238)||(38339-38554)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (22-238)||(128854-129072)
scaffold0022 (26-236)||(78345-78556)
scaffold0022 (7-129)||(116431-116551)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (7-170)||(15665-15826)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (7-170)||(1025-1186)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (7-129)||(38697-38819)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (6-154)||(32101-32249)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (22-237)||(12587-12803)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (7-129)||(3146-3267)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (18-238)||(103523-103737)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (7-109)||(15792-15894)
scaffold0020 (191-238)||(15717-15765)
scaffold0020 (6-54)||(178897-178945)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (33-189)||(53482-53640)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (22-238)||(97024-97243)
scaffold0006 (22-238)||(106302-106521)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (22-129)||(1051-1158)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (7-125)||(3185-3303)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (15-129)||(39489-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (15-129)||(75210-75323)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (7-129)||(39862-39983)
scaffold0026 (15-129)||(25908-26021)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (18-163)||(25121-25268)
scaffold0123 (84-192)||(619-727)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (22-238)||(19769-19987)
scaffold0080 (7-129)||(39917-40038)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (7-129)||(1855-1977)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (7-170)||(34127-34288)
scaffold0175 (15-54)||(285-324)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (7-129)||(32952-33073)
scaffold0120 (7-129)||(45932-46053)
scaffold0120 (7-125)||(16117-16235)
scaffold0120 (7-65)||(17389-17446)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (84-238)||(87-242)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (24-238)||(7943-8161)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (7-122)||(4853-4968)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (22-122)||(13147-13247)
scaffold0357 (18-126)||(16098-16206)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (18-126)||(27747-27855)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (31-180)||(11492-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (31-180)||(38198-38349)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (7-125)||(17214-17334)
scaffold0056 (22-163)||(79288-79430)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (21-180)||(17969-18130)
scaffold0247 (17-163)||(2132-2280)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (10-125)||(26064-26179)
scaffold0122 (7-129)||(44702-44824)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (7-129)||(13215-13337)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (6-87)||(28806-28888)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (7-129)||(32946-33067)
scaffold0145 (7-129)||(38765-38886)
scaffold0145 (7-163)||(9750-9908)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (7-163)||(20748-20905)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (7-163)||(37822-37979)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (7-163)||(158454-158611)
scaffold0003 (7-125)||(339949-340064)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (7-129)||(3474-3596)
scaffold0292 (7-129)||(347-468)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (7-129)||(51917-52039)
scaffold0011 (7-129)||(167973-168095)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (22-238)||(569-786)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (17-125)||(10784-10891)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (7-160)||(13393-13547)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (7-129)||(8528-8646)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (22-238)||(267679-267897)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (7-163)||(4695-4852)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (58-118)||(9133-9193)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (7-122)||(10427-10540)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (7-163)||(13948-14105)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (7-163)||(16785-16942)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (7-122)||(1293-1406)
scaffold0106 (7-122)||(7270-7383)
scaffold0106 (7-68)||(15295-15355)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (22-163)||(20383-20524)
scaffold0031 (7-129)||(128755-128876)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (7-129)||(1043-1165)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (7-129)||(1956-2078)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (7-129)||(22887-23008)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (7-122)||(15466-15580)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (7-122)||(32071-32184)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (21-129)||(24297-24406)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (7-129)||(6116-6241)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (22-238)||(1682-1900)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (7-68)||(4890-4950)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (17-125)||(9253-9360)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (22-122)||(51601-51699)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (7-163)||(40401-40558)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (19-122)||(13513-13615)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (15-129)||(4520-4633)
scaffold0228 (15-129)||(12102-12215)
scaffold0228 (15-129)||(22054-22167)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (7-125)||(16599-16717)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (7-120)||(16286-16397)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (7-80)||(4716-4788)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (7-163)||(107-264)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (7-122)||(5132-5245)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (7-122)||(8483-8598)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (61-170)||(2398-2505)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (20-163)||(29946-30090)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (21-122)||(20928-21030)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (17-163)||(11299-11446)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (17-125)||(4308-4415)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (61-180)||(225465-225585)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (19-163)||(161093-161239)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (7-122)||(1053-1166)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (22-110)||(2694-2784)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (17-163)||(12253-12400)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (7-163)||(12065-12216)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (24-129)||(4545-4650)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (7-73)||(46999-47065)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (7-163)||(4215-4373)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (9-120)||(11447-11558)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (6-54)||(23842-23890)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (6-54)||(36453-36501)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (22-65)||(11982-12024)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (115-157)||(2261-2303)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (17-54)||(1395-1432)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (85-129)||(27912-27956)


Alignment Details
Target: scaffold0621 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Original strand, 6539 - 6769
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 6638  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6639 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 6738  T
Q  207 aaataacaacagcaagataacaacttagttt 237  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6739 aaacaacaacagcaagataacaacttagttt 6769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8705
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
Q  118 catctcaaatat-ca-acataattcatataatgtatatacaat--tatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataac 213  Q
    |||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||  |||||  |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| || |||    
T  8581 catctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacat-cagtcttactggaacaac 8679  T
Q  214 aacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||    
T  8680 atcagcaagataaacaacttagtttc 8705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 19267 - 19500
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19267 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttact 19466  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19467 gaaacaacaacatcaagataaacaacttagtttc 19500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 18005649 - 18005882
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005649 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 18005848  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18005849 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 18005882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Original strand, 44014181 - 44014409
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014181 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014281 gcaaatcaac---atctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttact 44014377  T
Q  206 gaaataacaacagcaagataacaacttagttt 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44014378 gaaacaacaacagcaagataacaacttagttt 44014409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Original strand, 67749 - 67980
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67749 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 67848  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 206  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  67849 caaatcaacaacatctc-aatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctcactg 67947  T
Q  207 aaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  67948 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 67980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219602
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219835 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 16219736  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16219735 gcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttac 16219637  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16219636 tgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 16219602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 811249 - 811016
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811249 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    |||| |||  ||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttac 811051  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  811050 tgaaactacaacagcaagataaataacttagtttc 811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Original strand, 47831811 - 47832043
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47831811 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcgaatg 47831910  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  47831911 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattata-caattcaggcttact 47832009  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||||||||    
T  47832010 gaaacaacaacaacaagataaataacttagtttc 47832043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056563
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 117  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
Q  118 catctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaac 216  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||    
T  16056442 catctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-tcattcaggcttaccgaaacaacaac 16056540  T
Q  217 agcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    | |||||| ||||||||||||||    
T  16056541 atcaagataaacaacttagtttc 16056563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 22072917 - 22073149
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22072917 catcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 22073016  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 203  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22073017 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggctta 22073115  T
Q  204 ctgaaataacaacagcaaga-taacaacttagtt 236  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  22073116 ctgaaacaacaacatcaagacaaacaacttagtt 22073149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901560
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  116 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 214  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  12901438 aacatcacaac-atcatacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaagcttactgaaacaaca 12901535  T
Q  215 acagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  12901536 acaacaagataaacaacttagtttc 12901560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 34200790 - 34200951
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34200790 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 34200889  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34200890 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 34200951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15755004 - 15754774
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15755004 catcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 15754905  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaattcaggcttac 204  Q
    ||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||  | |||| |||||    
T  15754904 caaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgca-tcagtcttac 15754809  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15754808 tggaatattaacagcaagataaacaacttagtttc 15754774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 16495406 - 16495567
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16495406 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 16495505  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16495506 taaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11996144 - 11995983
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  11996144 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatg 11996045  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || |||||||   |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11996044 taaatcaacaa---ctcaaatatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 11995983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28505415 - 28505254
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||     
T  28505415 catcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcggata 28505316  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28505315 taaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28505254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280061
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||    
T  2280238 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatcaaa 2280139  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||  ||||| ||||||||  |||||  ||||||||    
T  2280138 tgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacat 2280061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12255886 - 12255789
Alignment:
Q  31 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  12255886 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatctcaaa 12255789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 38227485 - 38227606
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  38227485 catcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 38227583  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  38227584 caagtcaacaacatcttaaatat 38227606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867924
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  116 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaa 193  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| ||||    
T  1868002 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaa 1867924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3564481 - 3564363
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  3564481 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    | || |||||||||||||||    
T  3564382 gtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220074
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||   | |||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaaca 20220194  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  20220193 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactggaacaacaacag 20220095  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  20220094 taagataagcaacttagtttc 20220074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18456529 - 18456408
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  18456529 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-cgatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 18456431  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  18456430 caagtcaacaacatcttaaatat 18456408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 12698835 - 12698958
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| |     
T  12698835 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaat 12698933  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||    
T  12698934 tgcaattcatcaacatcttaaatat 12698958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Original strand, 13647344 - 13647487
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  13647344 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 13647442  T
Q  121 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13647443 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13647487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044935
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14044859  T
Q  115 caacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 189  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14044860 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354965
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14354889  T
Q  115 caacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 189  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14354890 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 18430713 - 18430870
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  18430713 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaat 18430810  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18430811 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18430870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 27216861 - 27217018
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  27216861 catcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 27217018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 9509193 - 9509315
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | || ||||| |||| |||||| | |    
T  9509193 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaatt 9509291  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  9509292 gcaattcatcaacatcttaaatat 9509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 456322 - 456479
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  456322 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 456479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393291
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11393291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 11972497 - 11972654
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11972497 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11972654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14949283 - 14949126
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14949283 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14949126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15376874 - 15376717
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15376874 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15376717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 16232521 - 16232678
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16232521 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16232678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 18640273 - 18640430
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18640273 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18640430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20385284 - 20385127
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20385284 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20385127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21189756 - 21189599
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21189756 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21189599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 24702239 - 24702396
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  24702239 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24702396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 32125492 - 32125649
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  32125492 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32125649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 41522918 - 41523075
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  41522918 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41523075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 41525380 - 41525537
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  41525380 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41525537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9389709 - 9389599
Alignment:
Q  111 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  9389709 tcaacaacatctcatatatcaacataattcatacaatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatata-caatccaggcttactggaat 9389611  T
Q  211 aacaacagcaag 222  Q
     |||||| ||||    
T  9389610 gacaacatcaag 9389599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17062076 - 17061919
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||    
T  17062076 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcag-cagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaatg 17061978  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| ||| |||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17061977 caagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Original strand, 26212012 - 26212122
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 117  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||    
T  26212012 caacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 26212110  T
Q  118 catctcaaatat 129  Q
    ||||| ||||||    
T  26212111 catcttaaatat 26212122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 48273393 - 48273511
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  48273393 catcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  48273492 gcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19486847 - 19486686
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||    
T  19486847 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 19486748  T
Q  121 ctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  | ||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  19486747 ctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063813
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacat 10063822  T
Q  121 ctcaaatat 129  Q
    |||||||||    
T  10063821 ctcaaatat 10063813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 16410060 - 16410217
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16410060 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16410158 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatat 16410217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 24704689 - 24704843
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||  | || || |||| |||||| ||||    
T  24704689 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaatg 24704784  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24704785 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24704843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 24275182 - 24275289
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  24275182 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 24275279  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  24275280 aacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15144154 - 15144037
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| | || || ||||| | |||||| ||    
T  15144154 acatcatcatc-tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaa 15144058  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  15144057 tgcaagccaacaacatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 44116510 - 44116667
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44116510 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatat 44116667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16386365 - 16386242
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  16386365 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 16386266  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    | | |||| |||||||| ||||||    
T  16386265 gtatttcatcaacatcttaaatat 16386242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008441
Alignment:
Q  26 gaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctc 15008499  T
Q  124 aaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    ||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  ||||||||    
T  15008498 aaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 3386334 - 3386491
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| || | |||||| |||    
T  3386334 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatat 3386491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 10589055 - 10589158
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 117  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| | |||||||||||||    
T  10589055 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgcaattcaacaa 10589153  T
Q  118 catct 122  Q
    |||||    
T  10589154 catct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 118
Target Start/End: Original strand, 16213685 - 16213795
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16213685 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
Q  106 gcaattcaacaac 118  Q
     ||| ||||||||    
T  16213783 ccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 238
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324241
Alignment:
Q  172 caacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttc 16324241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 40443395 - 40443509
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  40443395 catcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaattt 40443493  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  40443494 caattcatcaacatct 40443509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 13869347 - 13869394
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13869347 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 13869394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 20110557 - 20110604
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20110557 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 20110604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27847947 - 27847881
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    ||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27847947 catcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 13831374 - 13831421
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13831374 catcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 13831421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38898528 - 38898380
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 114  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||     
T  38898528 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacgacacag-cagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 38898431  T
Q  115 caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  38898430 caacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 38898380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 124
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324171
Alignment:
Q  88 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctca 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 16324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 18203831 - 18203882
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18203831 cttagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacaacaacatagacagta 18203882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22921987 - 22921754
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921987 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacaaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 22921788  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22921787 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 22921754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681243
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681010 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 33681109  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  33681110 gcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 33681208  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |  || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33681209 tagaacaacaacaacaagataaacaacttagtttc 33681243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237789
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237630 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 22237729  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatata 164  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22237730 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatata 22237789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754198
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa 21754151  T
Q  110 ttcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 157  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21754152 -tcaacaacatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa 21754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 20248282 - 20248454
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248282 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    |||| |||||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacat 20248454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52928088 - 52927867
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928088 acatcaccatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 52927989  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
                ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  52927988 ------------catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 52927902  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  52927901 tggaacaacaatagcaagataaacaacttagtttc 52927867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861454
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21861573  T
Q  122 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 219  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21861572 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataat-attcaggcttactgaaacaacaatagc 21861474  T
Q  220 aagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  21861473 aagataaacaacttagtttc 21861454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896162
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21896259  T
Q  122 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 217  Q
    ||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  21896258 tcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataat-attcaggcttactgaaacaacaaca 21896162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918769
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||     
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa- 20918718  T
Q  119 atctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
      ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20918719 --ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 20918769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295507
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaac---ttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 102  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 14295573  T
Q  103 aatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
    |||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14295572 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Original strand, 21161719 - 21161892
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21161719 acatcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaa-acagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaat 21161817  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaat-atcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 181  Q
    |||||||| ||||   ||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  21161818 gcaattcatcaac--ttcatatcatcaacataaatcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcatt 21161892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614000
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50614120  T
Q  120 tctcaaatatcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  50614119 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacgg 50614021  T
Q  219 caaga-taacaacttagtttc 238  Q
     ||||  ||||||||||||||    
T  50614020 taagacaaacaacttagtttc 50614000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621828
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50621948  T
Q  120 tctcaaatatcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  50621947 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacgg 50621849  T
Q  219 caaga-taacaacttagtttc 238  Q
     ||||  ||||||||||||||    
T  50621848 taagacaaacaacttagtttc 50621828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686849
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||    |||  |  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaatagttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaaca 50686729  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50686730 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 50686828  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  50686829 taagataagcaacttagtttc 50686849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16368401 - 16368171
Alignment:
Q  10 catcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  16368401 catcatcattcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatg 16368303  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    ||| ||||||||||||| || |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  16368302 caaatcaacaacatctc-aacatcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttact 16368205  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  16368204 gaaacaacaacagtaagataaacaacttaatttc 16368171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758841
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
Q  116 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 192  Q
    |||||| |||   ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||  | |||||||||    
T  16758764 aacatcacaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatatta 16758841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981573
Alignment:
Q  111 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 35981602  T
Q  211 aacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
     |||||| |||||| || |||||||||||    
T  35981601 gacaacatcaagataaataacttagtttc 35981573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049933
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    |||| || |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41050038 tctc-aacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 41049941  T
Q  219 caagataa 226  Q
     |||||||    
T  41049940 taagataa 41049933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 50210330 - 50210212
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  50210330 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50210232  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  50210231 gcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22532273 - 22532395
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22532273 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccatt 22532371  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  22532372 gcaattcaacaacatcttaaatat 22532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261086
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 35261086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45574989 - 45574846
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| |    
T  45574989 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgt 45574891  T
Q  121 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| ||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45574890 ctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 184
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261521
Alignment:
Q  111 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaacataatttatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaga 49261521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21475248 - 21475091
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21475248 catcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21475091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 34509784 - 34509899
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| |||    
T  34509784 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  106 gcaattcaacaacatct 122  Q
    |||| ||||||||||||    
T  34509883 gcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 13988867 - 13989024
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13988867 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13989024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 238
Target Start/End: Original strand, 20636957 - 20637084
Alignment:
Q  111 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 210  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  |||  ||||||||||||||| |||    
T  20636957 tcaacaacatcccaaatacaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaata-caattcaggcttactggaat 20637055  T
Q  211 aacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
     |||||| |||| | || |||||||||||    
T  20637056 gacaacatcaaggtaaataacttagtttc 20637084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21923452 - 21923295
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21923452 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21923295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 21026684 - 21026806
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| |||||  |||  ||||| | |    
T  21026684 catcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaatt 21026782  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  21026783 gcaattcaacaacatcttaaatat 21026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27250846 - 27250724
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  27250846 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 27250748  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  27250747 gcaattcatcaacatcttaaatat 27250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 21840778 - 21840885
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  21840778 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 21840875  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  21840876 aacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23593896 - 23593739
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23593896 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 23593739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 29298138 - 29298294
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29298138 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29298294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 29776689 - 29776846
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  29776689 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29776846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 31612314 - 31612471
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  31612314 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| ||||||||||||||  |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 31612471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 433013 - 433168
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     |||||| || |||||| ||||  ||||| || |||| |||||| |||    
T  433013 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 433168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22130976 - 22130863
Alignment:
Q  55 caacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatat 153  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||    
T  22130976 caacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatat 22130880  T
Q  154 acaattatataccatta 170  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22130879 acaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093825
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caac 118  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||  ||| || |||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaac 16093889  T
Q  119 atctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 181  Q
    |||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||    
T  16093888 atctcaaacatcataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20847271 - 20847205
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20847271 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 170
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130729
Alignment:
Q  71 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatt 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 51130728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22123229 - 22123071
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  22123229 catcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 22123131  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaaca--taattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||  |||||| |||  |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22123130 gcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatat 22123071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20454660 - 20454610
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20454660 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatag 20454610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 163
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065100
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||   |||  |  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  122 tcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||| | ||||||||  ||||  |||||||| |||||    
T  26065058 tcaaagatcatatataattcaagtaatacatatacaaatatat 26065100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 16361928 - 16362075
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  16361928 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-cgacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 16362025  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16362026 aacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatat 16362075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13213023 - 13212865
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13213023 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 13212926  T
Q  106 gcaattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13212925 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 13212865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 38801481 - 38801433
Alignment:
Q  31 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa 79  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  38801481 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 21342097 - 21342144
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21342097 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 21342144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 21346962 - 21347009
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21346962 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 21347009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 21707168 - 21707215
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21707168 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 21707215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 21711710 - 21711757
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21711710 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 21711757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 21714545 - 21714593
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21714545 acatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 21714593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 15860170 - 15860123
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15860170 catcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac 15860123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 5654 - 5877
Alignment:
Q  14 atcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5654 atcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 5753  T
Q  114 acaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5754 acaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaac 5853  T
Q  214 aacagcaagataacaacttagttt 237  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  5854 aacaacaagataaaaacttagttt 5877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 100377 - 100610
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  100377 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatattaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttact 100576  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  100577 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttc 100610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40292 - 40059
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40292 acatcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttact 40093  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||| ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  40092 gaaacaacaacatcaaggtaaacaacttagtttc 40059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 94412 - 94569
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  94412 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 94569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 44455 - 44613
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44455 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  44553 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatat 44613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Original strand, 101502 - 101576
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  101502 acatcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 119879 - 119948
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatg 76  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  119879 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17591 - 17444
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  17591 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 17494  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  17493 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 17444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 25175853 - 25176086
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175853 acatcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 25176052  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25176053 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 25176086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 238
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406213
Alignment:
Q  8 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||     
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatcaacttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttacta 28406180  T
Q  207 aaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28406181 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 28406213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7824 - 7617
Alignment:
Q  33 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 131  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  7824 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattca 7725  T
Q  132 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 229  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  7724 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacatgataaacaa 7626  T
Q  230 cttagtttc 238  Q
    |||||||||    
T  7625 cttagtttc 7617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786787
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 18786910  T
Q  116 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 214  Q
    ||| || | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  18786909 aacgtcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcata-taatttaggcttactgaaacaaca 18786812  T
Q  215 acagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||    
T  18786811 acagcatgataaacaacttagtttc 18786787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22134323 - 22134175
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22134323 catcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatg 22134225  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 157  Q
    ||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22134224 caa-tcaataacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatatacaa 22134175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679746
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatg 7679687  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatata 164  Q
     || ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7679688 taagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatata 7679746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207514
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgaca 23207395  T
Q  120 tctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 219  Q
    ||||||   |  | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||  || ||||||||     
T  23207396 tctcaacattataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttacttgaacaacaacagt 23207494  T
Q  220 aagataa-caacttagtttc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  23207495 aagataagcaacttagtttc 23207514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23072066 - 23071905
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  23072066 catcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaata 23071967  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23071966 taaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791511
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  | | |||| |||||||| |||||   ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaaca 23791391  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| || | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  23791392 tctcaaacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaa 23791490  T
Q  219 caagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  23791491 caagataaacaacttagtttc 23791511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 22105413 - 22105571
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22105413 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22105571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 298932 - 298809
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  298932 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 298833  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  298832 gcaattcaacaacatcttaaatat 298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Original strand, 19671848 - 19671991
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  19671848 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 19671947  T
Q  121 ctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||||   ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19671948 ctcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19671991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708561
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |     
T  23708738 acatcatcatctttcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaat 23708639  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatat--caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    ||||| ||| | |||||||||| ||   || ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  23708638 tgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 23060517 - 23060639
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23060517 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23060615  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  23060616 gcaagtcaacaacatcttaaatat 23060639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109125
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   |||  |  |||||||||||||||||| ||   || ||||||| |    
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaatagttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaata 25109005  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25109006 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 25109104  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  25109105 taagataagcaacttagtttc 25109125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 18808944 - 18809101
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18808944 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18809101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 23130863 - 23131020
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23130863 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23131020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 23133330 - 23133487
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23133330 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23133487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23709693 - 23709536
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23709693 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23709536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23712174 - 23712017
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23712174 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23712017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34402683 - 34402526
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  34402683 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34402526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 39682314 - 39682471
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  39682314 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39682471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22337119 - 22337241
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||   ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22337119 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaat 22337217  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  22337218 gcaagacaacaacatctcaaatat 22337241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 23076446 - 23076568
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23076446 catcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 23076544  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||    
T  23076545 gcaagtcaacaatatcttaaatat 23076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 23285869 - 23285987
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  | || || |||| |||||| | ||    
T  23285869 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa--aaca-gacataataatatcaattg 23285964  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  23285965 caattcatcaacatcttaaatat 23285987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23654503 - 23654381
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| || ||||| |||||||| |||| |||||| | |    
T  23654503 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaatt 23654405  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  23654404 gcaattcatcaacatcttaaatat 23654381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 38231 - 38138
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 101  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38231 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 23660027 - 23660148
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | || ||  |||| |||| |||||| ||||    
T  23660027 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatcaaatg 23660125  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  23660126 caaatcaacaacatcttaaatat 23660148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 24367785 - 24367932
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  24367785 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 24367882  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24367883 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24367932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520152
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 20520197  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  20520196 tctcaaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatat 20520152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 23135591 - 23135745
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23135591 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 160  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 23135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 571398 - 571555
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  571398 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| | |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 571555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 6725996 - 6726153
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  6725996 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    | || |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 6726153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 26505380 - 26505537
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  26505380 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26505537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 26507858 - 26508015
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  26507858 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26508015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 28577100 - 28577257
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  28577100 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||  ||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 28577257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22731351 - 22731229
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22731351 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22731253  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||| | ||||||    
T  22731252 gcaattcatcaacatattaaatat 22731229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21155211 - 21155064
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  21155211 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 21155114  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21155113 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21155064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24697645 - 24697536
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  24697645 tcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataa 24697546  T
Q  183 gatcatatta 192  Q
     |||||||||    
T  24697545 aatcatatta 24697536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24898357 - 24898199
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24898357 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24898199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24900840 - 24900682
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24900840 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24903317 - 24903159
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24903317 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24903159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24905794 - 24905636
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24905794 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24905636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24908269 - 24908111
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24908269 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24908111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 20309112 - 20309225
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  20309112 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 20309209  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  20309210 caattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23040306 - 23040247
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacata 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040306 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32039659 - 32039502
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  32039659 catcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32039502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23103512 - 23103396
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || |  ||||| |||     
T  23103512 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacatgattatatcaaatt 23103415  T
Q  107 caattcaacaacatctcaa 125  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  23103414 caattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32215072 - 32214925
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  32215072 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 32214975  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  32214974 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 32214925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 8946661 - 8946733
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 80  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  8946661 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataa-caatagcaacataggcagtatacaaa 8946733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413078
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatat--cgaatgcaattcaacaa 117  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaa 22413141  T
Q  118 catctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    |||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||    
T  22413140 catctc-aacatcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45030015 - 45029858
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  45030015 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatat 45029858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137457
Alignment:
Q  8 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-taatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||||| |||||| | |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 43137457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 24643101 - 24643054
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24643101 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22738296 - 22738249
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22738296 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 22738249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 157
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004905
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||   |||  |  ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23004866  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaa 157  Q
    ||||||| |||| | ||||| || |||||| ||||||||    
T  23004867 tctcaaacatcatatataatccacataatgcatatacaa 23004905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 38967375 - 38967422
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38967375 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 38967422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24529690 - 24529532
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  24529690 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataa-caacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagt 24529593  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| | |||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24529592 gcaagttaacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatat 24529532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 73
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2763 - 2530
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2763 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaat 2664  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2663 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 2564  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  2563 gaaacaacatcagcaagataaacaacttaatttc 2530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14815 - 14582
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14815 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttact 14616  T
Q  206 gaaataacaacagcaagata-acaacttagtttc 238  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14615 gaaacaacaacagcaagatatacaacttagtttc 14582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Original strand, 21673707 - 21673938
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673707 acatgatcatcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21673806  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21673807 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaatataatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttact 21673906  T
Q  206 gaaataacaacagcaagataacaacttagttt 237  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21673907 gaaacaacaacaacaagataacaacttagttt 21673938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760751
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23760962 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattgaat 23760863  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23760862 tcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggcttact 23760763  T
Q  206 gaaataacaaca 217  Q
    |||| |||||||    
T  23760762 gaaacaacaaca 23760751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38855368 - 38855139
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855368 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 38855269  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  38855268 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactg 38855170  T
Q  207 aaataacaacagcaagat-aacaacttagtt 236  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38855169 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 38855139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Original strand, 6520372 - 6520603
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520372 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 6520471  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 206  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  6520472 caagtcatcaacatcataaacatcaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactg 6520570  T
Q  207 aaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  6520571 aaacaacaacagcaagataaataacttagtttc 6520603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 21285611 - 21285820
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21285611 atcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 21285710  T
Q  117 acatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaa 215  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21285711 acatctcaaacatcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaa 21285809  T
Q  216 cagcaagataa 226  Q
    || ||||||||    
T  21285810 caacaagataa 21285820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26355816 - 26355643
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355816 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaat 26355717  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  26355716 gcaa-tcaacaacatctcagccatcaacatattccatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 26355643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983312
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  116 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 214  Q
    |||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  983412 aacatcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcata-taattcagacttactgaaacaaca 983315  T
Q  215 aca 217  Q
    |||    
T  983314 aca 983312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5866391 - 5866230
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5866391 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 5866292  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5866291 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 5866230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 21490999 - 21491160
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  21490999 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatg 21491098  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21491099 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21491160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116585
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  37116466 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactgaaacaacaacag 37116564  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  37116565 taagataagcaacttagtttc 37116585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 17140920 - 17141081
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  17140920 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcgaatg 17141019  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17141020 taaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 17141081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266877
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||| | ||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggctcactgaaacaacaacag 17266898  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  17266897 taagataagcaacttagtttc 17266877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498799
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 20498680  T
Q  122 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 219  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||  |||| ||||| |||| | ||||| |    
T  20498681 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttaccgaaacatcaacatc 20498779  T
Q  220 aagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  20498780 aagataaacaacttagtttc 20498799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 21249388 - 21249550
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21249388 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaat 21249487  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
    | || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21249488 gtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21249550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 21255226 - 21255388
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21255226 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaat 21255325  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
    | || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21255326 gtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21255388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22626740 - 22626861
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||     
T  22626740 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaata 22626838  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  22626839 caaatcaacaacatcttaaatat 22626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508009
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13508089  T
Q  121 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcag 198  Q
    |||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  13508088 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcag 13508009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16092459 - 16092337
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16092459 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16092361  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  16092360 gcaagtcaacaacatctcaaatat 16092337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 217
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353235
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 24353137  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 217  Q
    ||||||| |||  | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24353138 tctcaaacatcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaaca 24353235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597541
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13597621  T
Q  121 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcag 198  Q
    | |||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  13597620 cccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcag 13597541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21919117 - 21918995
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  21919117 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 21919019  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  21919018 gcaattcaacaacatcttaaatat 21918995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439436
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 192  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  17439509 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatatta 17439436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22875069 - 22875190
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  22875069 catcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 22875167  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  22875168 caagtcaacaacatctcaaatat 22875190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17612213 - 17612069
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||    
T  17612213 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 17612114  T
Q  121 ctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17612113 ctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17612069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28649161 - 28649046
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  28649161 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 28649063  T
Q  106 gcaattcaacaacatct 122  Q
    |||| ||||||||||||    
T  28649062 gcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 7372782 - 7372904
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7372782 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7372880  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  7372881 gcaagtcaacatcatcttaaatat 7372904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 20536212 - 20536334
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  20536212 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 20536310  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  20536311 gcaattcatcaacatcttaaatat 20536334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 237
Target Start/End: Original strand, 22364744 - 22364897
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 182  Q
    |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||  |||||||| |    
T  22364744 tcatgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  183 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagttt 237  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22364843 aatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagttt 22364897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 31971261 - 31971375
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  31971261 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattc 31971359  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  31971360 caattcatcaacatct 31971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 26219718 - 26219838
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| ||||  |  |||| |||| |||||| ||||    
T  26219718 catcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaatg 26219815  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  26219816 caagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 1484403 - 1484560
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  1484403 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 1484560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5853453 - 5853296
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  5853453 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 5853296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14409605 - 14409448
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14409605 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14409448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20046356 - 20046199
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20046356 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20046199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 20403228 - 20403385
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20403228 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20403385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 22001754 - 22001911
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22001754 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22001911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16199761 - 16199647
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  16199761 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatcaattt 16199663  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| | ||||||    
T  16199662 caattcatctacatct 16199647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18818526 - 18818404
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  18818526 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 18818428  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    | || |||||| ||||| ||||||    
T  18818427 gtaagtcaacatcatcttaaatat 18818404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21924045 - 21923923
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| || | |||||| | |    
T  21924045 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaatt 21923947  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  21923946 gcaagtcaacaacatcttaaatat 21923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 6759262 - 6759371
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  6759262 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 6759360  T
Q  106 gcaattcaaca 116  Q
    |||| ||||||    
T  6759361 gcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 23406383 - 23406492
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23406383 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23406481  T
Q  106 gcaattcaaca 116  Q
    |||| ||||||    
T  23406482 gcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18879348 - 18879276
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 80  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18879348 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16413467 - 16413320
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  16413467 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 16413370  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16413369 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 16413320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26225408 - 26225288
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||| ||| |||| ||  |||| |||| |||||| |||     
T  26225408 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgacataataatatcaaata 26225311  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  26225310 caagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 4483282 - 4483438
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4483282 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 4483438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15203392 - 15203235
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15203392 catcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    | || |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15203235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21396097 - 21395984
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21396097 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaatt 21396000  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21395999 caattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21790590 - 21790477
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21790590 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaatt 21790493  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21790492 caattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 41598189 - 41598346
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  41598189 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41598346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4542534 - 4542377
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  || | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4542534 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatat 4542377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21389567 - 21389454
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21389567 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 21389470  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21389469 caattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21778893 - 21778780
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21778893 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 21778796  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21778795 caattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801387
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  122 tcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattata 162  Q
    |||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattata 19801387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 45131113 - 45131047
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45131113 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Original strand, 19896266 - 19896323
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19896266 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 19896323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 25484429 - 25484382
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25484429 catcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataac 25484382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492844
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154816
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatc--atcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| |  |||  ||||||| |||||| | ||| | |||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacatatccagatataataatatcaagtgctaatcaacaaca 19154890  T
Q  120 tctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 192  Q
     || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  19154889 acttaaacatcttaaataattcagataatgcatatacaaatatattacattagtatcaacattaaatcatatta 19154816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 45290846 - 45290809
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45290846 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 45290809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 14823775 - 14823931
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| |||    
T  14823775 catcatcttaatcaatttagacca-ctcatgcagcaaagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14823931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 54
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070606
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 15070606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19937167 - 19937120
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19937167 catcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac 19937120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 170
Target Start/End: Original strand, 21383887 - 21383978
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  21383887 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471159
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470927 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 15471026  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15471027 gcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcata-taattcaggcttac 15471124  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15471125 tgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttc 15471159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 16103783 - 16104015
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103783 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  ||| || |||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggatt-agtcttac 16103980  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16103981 tggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 16104015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 16097331 - 16097564
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16097331 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 16097529  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16097530 tggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 16097564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12174377 - 12174164
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174377 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 12174278  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    ||||   ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   ||||||  | |||| |||||    
T  12174277 gcaa---aacaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattgattcatatgca-tcagtcttac 12174182  T
Q  205 tgaaataacaacagcaag 222  Q
    || || ||||||||||||    
T  12174181 tggaacaacaacagcaag 12174164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307830
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 32307783  T
Q  110 ttcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 157  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32307784 -tcaacaacatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa 32307830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Original strand, 14234491 - 14234725
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234491 catcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 14234590  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  14234591 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatta-aacaattcaggcttact 14234689  T
Q  206 ga--aataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||  || ||||||| |||||| || |||||||||||    
T  14234690 gaacaacaacaacaacaagataaataacttagtttc 14234725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 49668194 - 49668044
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668194 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 49668095  T
Q  106 gcaattcaacaa-catctcaaatatcaacataattcatataatgtatataca 156  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  49668094 gcaat-caacaaacatctcatttatcaacataatccatttaaagtatataca 49668044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 9512923 - 9513067
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512923 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 9513022  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatata 154  Q
    |||||    ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9513023 gcaat----caacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatata 9513067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 9520898 - 9521042
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520898 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 9520997  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatata 154  Q
    |||||    ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9520998 gcaat----caacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatata 9521042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13210444 - 13210283
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13210444 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 13210345  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
    ||| |||||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13210344 caaatcaacaa---cttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 13210283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644642
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa 1644689  T
Q  110 ttcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 157  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1644688 -tcaacaatatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa 1644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523669
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 52523732  T
Q  120 tctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    ||||||| | ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  52523731 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 27165251 - 27165373
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||    
T  27165251 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaatg 27165350  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||    
T  27165351 caagtcatcaatatctcaaatat 27165373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251052
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37251171  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    |||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  37251170 tctc-aacatcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcagacttactggaacaacaacag 37251073  T
Q  219 caagat-aacaacttagtttc 238  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  37251072 taagataaacaacttagtttc 37251052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 12399213 - 12399335
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  12399213 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaat 12399311  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  12399312 gcaattcaacaacatcttaaatat 12399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 53301668 - 53301545
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  53301668 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 53301569  T
Q  107 caattca-acaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||  ||| |||||||||||    
T  53301568 caagtcattcaatatctcaaatat 53301545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24340826 - 24340665
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  24340826 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 24340727  T
Q  121 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    |||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  24340726 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110236
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagca 22110355  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||  |||| | | ||||||| |||||  |||||| ||||||  |||||  |||||| | | ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22110354 tctcaac-atcatatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatac-aattcaggcttactgaaacaacaacag 22110257  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  22110256 taagataagcaacttagtttc 22110236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 18438538 - 18438653
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  18438538 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 18438636  T
Q  106 gcaattcaacaacatct 122  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18438637 gcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274813
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 23274804  T
Q  121 ctcaaatat 129  Q
    |||||||||    
T  23274805 ctcaaatat 23274813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 14572596 - 14572714
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 109  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||  |    
T  14572596 catcaacatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgaga 14572694  T
Q  110 ttcaacaacatctcaaatat 129  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  14572695 gtcaacaacatcttaaatat 14572714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 14972858 - 14972980
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14972858 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14972956  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||    
T  14972957 gcaaatcaacaacatctcatatat 14972980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 17487860 - 17487982
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  17487860 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17487958  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  17487959 gcaattcatcaacatcttaaatat 17487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 17499342 - 17499464
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  17499342 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17499440  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  17499441 gcaattcatcaacatcttaaatat 17499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 36166599 - 36166719
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  36166599 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 36166696  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  36166697 caagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386536
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  120 tctcaaatat 129  Q
    ||||||||||    
T  42386527 tctcaaatat 42386536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926121
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 43926076  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||||| |||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  43926077 tctcaaacatcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618570
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
Q  117 acatctcaaatat 129  Q
    |||||||||||||    
T  21618558 acatctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 13442278 - 13442400
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  13442278 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 13442376  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  13442377 gcaattcatcaacatcttaaatat 13442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14576950 - 14576828
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | || ||||| |||| |||||| | |    
T  14576950 acatcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataa-caacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaatt 14576852  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  14576851 gcaagtcaacaacatcttaaatat 14576828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 11424876 - 11424783
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11424876 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 24153325 - 24153204
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  24153325 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-cgatagcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 24153227  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  24153226 caagtcaacaacatcttaaatat 24153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465350
Alignment:
Q  111 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattaga 1465350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37642368 - 37642207
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||    
T  37642368 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 37642269  T
Q  121 ctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  37642268 ctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7781508 - 7781351
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  7781508 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 7781351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 17463179 - 17463336
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  17463179 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17463336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 17672627 - 17672784
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  17672627 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatat 17672784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20698552 - 20698437
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || |||||  ||| |||||| | |    
T  20698552 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaatt 20698454  T
Q  106 gcaattcaacaacatct 122  Q
    |||||||| ||||||||    
T  20698453 gcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29172744 - 29172587
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29172744 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29172587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 34159327 - 34159484
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  34159327 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34159484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45607068 - 45606911
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  45607068 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45606911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 55476492 - 55476649
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  55476492 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 55476649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282815
Alignment:
Q  8 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||| |||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16282815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23083478 - 23083356
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  23083478 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaatt 23083380  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  23083379 gcaagtcaacaacatcttaaatat 23083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38962042 - 38961895
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  38962042 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 38961945  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  38961944 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 38961895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Original strand, 28194694 - 28194759
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacag 72  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28194694 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacag 28194759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28848772 - 28848618
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  28848772 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 160  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 28848618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43550625 - 43550482
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  43550625 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-tgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 43550527  T
Q  121 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43550526 ctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 8899095 - 8899252
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  8899095 catcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 8899252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9707768 - 9707611
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  9707768 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
     ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 9707611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16454442 - 16454285
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16454442 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16454285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389515
Alignment:
Q  112 caacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| ||     
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaac 49389544  T
Q  211 aacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaacttagtttc 49389515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 606441 - 606324
Alignment:
Q  10 catcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |   ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  606441 catcatcattcatcttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatg 606343  T
Q  107 caattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||||||||||||||||||    
T  606342 caattcaacaacatctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6469295 - 6469178
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  6469295 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  6469197 gcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25476502 - 25476384
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  25476502 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaa-aaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25476404  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  25476403 gcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 26686891 - 26687013
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  26686891 catcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 26686989  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  26686990 gcaagtcaacatcatcttaaatat 26687013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 40213837 - 40213720
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| || || |||||||| |||| |||||| |||    
T  40213837 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 43840944 - 43841058
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 113  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  43840944 tcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 43841042  T
Q  114 acaacatctcaaatat 129  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  43841043 acatcatcttaaatat 43841058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 12567571 - 12567718
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  12567571 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 12567668  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12567669 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 12567718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 13544036 - 13544183
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  13544036 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 13544133  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  13544134 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 13544183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 55500943 - 55501055
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  55500943 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
Q  106 gcaattcaacaacat 120  Q
    |||| ||||||||||    
T  55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13151952 - 13151794
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13151952 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13154417 - 13154259
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13154417 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13154259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070657
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  121 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  53070701 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 53070657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10247884 - 10247727
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  10247884 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-caacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10247727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17446815 - 17446659
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  17446815 catcatcttaatcaacttagacga-ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatat 17446659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 15977516 - 15977633
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15977516 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  15977614 gcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 50242833 - 50242980
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  50242833 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaac 50242930  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  50242931 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 50242980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22147616 - 22147467
Alignment:
Q  33 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 131  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  22147616 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 22147517  T
Q  132 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  22147516 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  65 atagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaatta 160  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  161 tataccattaacaacaacat 180  Q
    |||  |||||  ||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Original strand, 17737237 - 17737294
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17737237 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124045
Alignment:
Q  8 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41124045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 8499519 - 8499566
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8499519 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 8499566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 10556986 - 10557033
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10556986 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 10557033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 15412430 - 15412477
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15412430 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 15412477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 45577999 - 45577952
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45577999 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 45577952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 238
Target Start/End: Original strand, 43927304 - 43927369
Alignment:
Q  173 aacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttc 238  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43927304 aacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttc 43927369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 12119886 - 12119780
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12119886 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
Q  106 gcaattcaa 114  Q
    |||| ||||    
T  12119788 gcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 44494810 - 44494857
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  44494810 catcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac 44494857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919393
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatag 13919393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2924 - 2689
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2924 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatg----tatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggct 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatatcagcttaattcataaaatgtatatatatacaat--tataccattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggct 2727  T
Q  202 tactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2726 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 2689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21502273 - 21502041
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21502273 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcgaatg 21502174  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    ||| ||| || ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502173 caagtcatcatcatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 21502074  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagttt 237  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21502073 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 21502041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21329614 - 21329382
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  21329614 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatt 21329515  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  21329514 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttact 21329416  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21329415 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttc 21329382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 21565545 - 21565778
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565545 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 21565743  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |  || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21565744 tagaacaacaacaacaagataaacaacttagtttc 21565778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011920
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  26012154 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatcaaa 26012055  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 203  Q
    ||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  26012054 tgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattata-tagttcaggctta 26011956  T
Q  204 ctgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  26011955 ctgaaacaacaataacaagataaacaacttagtttc 26011920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22959650 - 22959489
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22959650 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaat 22959551  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatt 169  Q
    |||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22959550 gcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 22959489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026825
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaaca 20026944  T
Q  120 tctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    || | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||     
T  20026943 tcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacata-taattcaggcttactgaaacaactacaa 20026846  T
Q  219 caagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  20026845 caagataaacaacttagtttc 20026825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Original strand, 19668902 - 19669073
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668902 catcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatg 19669001  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    ||| |||||||   |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  19669002 caaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 19669073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19660952 - 19660791
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||     
T  19660952 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcgaata 19660853  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19660852 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 19660791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178104
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 22178224  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||   |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  22178223 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcata-taatttaggtttactgaaacaacaacag 22178125  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  22178124 taagataagcaacttagtttc 22178104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21729181 - 21729059
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |    
T  21729181 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 21729083  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  21729082 gcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21808506 - 21808384
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |    
T  21808506 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 21808408  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  21808407 gcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144211
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatc 22144167  T
Q  122 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22144168 tcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22144211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23390613 - 23390491
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23390613 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23390515  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  23390514 gcaattcatcaacatcttaaatat 23390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Original strand, 36314581 - 36314678
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36314581 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 24493573 - 24493694
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  24493573 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 24493671  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  24493672 caagtcaacaacatcttaaatat 24493694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8286960 - 8286838
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| |     
T  8286960 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaat 8286862  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaata 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  8286861 tgcaattcatcaacatcttaaata 8286838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  111 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 13025315 - 13025436
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||    
T  13025315 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatg 13025413  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  13025414 caagtcaacaacatcttaaatat 13025436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 13095499 - 13095620
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||    
T  13095499 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatg 13095597  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  13095598 caagtcaacaacatcttaaatat 13095620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22412188 - 22412309
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  22412188 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataa-caacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 22412286  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  22412287 caagtcaacaacatctcaaatat 22412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 264929 - 264772
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  264929 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 264772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 1096474 - 1096593
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||| || ||| | |||| |||||| ||||||    
T  1096474 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgca 1096572  T
Q  109 attcaacaacatctcaaatat 129  Q
    | |||||||||||||| ||||    
T  1096573 aatcaacaacatctcacatat 1096593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10733101 - 10732944
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  10733101 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10732944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 11581360 - 11581203
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11581360 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||| ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatat 11581203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 24529224 - 24529339
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| |||    
T  24529224 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  106 gcaattcaacaacatct 122  Q
    |||| ||||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 29329935 - 29330092
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29329935 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29330092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 39363385 - 39363542
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  39363385 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39363542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 9077956 - 9078074
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  9077956 catcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagt 9078054  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  9078055 gcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 21997651 - 21997549
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21997651 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21997553  T
Q  106 gcaa 109  Q
    ||||    
T  21997552 gcaa 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Original strand, 22075035 - 22075145
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 117  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||    
T  22075035 caacttagaccgactcattcagcttagttaaataa-caacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 22075133  T
Q  118 catctcaaatat 129  Q
    ||||| ||||||    
T  22075134 catcttaaatat 22075145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 25421536 - 25421658
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  25421536 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 25421634  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  25421635 gcaagtcaacagcatcttaaatat 25421658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Original strand, 40725871 - 40726032
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||    
T  40725871 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 40725970  T
Q  121 ctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  40725971 ctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 20909013 - 20909170
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20909013 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caaaagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20909170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 42245526 - 42245369
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  42245526 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 42245369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20902159 - 20902012
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
T  20902159 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaaca 20902062  T
Q  117 acatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    || ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20902061 acgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 20902012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 157
Target Start/End: Original strand, 29448054 - 29448159
Alignment:
Q  55 caacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtat 151  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||    
T  29448054 caacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcat 29448153  T
Q  152 atacaa 157  Q
    ||||||    
T  29448154 atacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2154775 - 2154617
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  2154775 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2154677 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 2154617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 29345981 - 29346138
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29345981 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-caacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29346138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 127
Target Start/End: Original strand, 25431414 - 25431518
Alignment:
Q  23 ttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||    
T  25431414 ttagaccgactcatgcatcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 25431512  T
Q  122 tcaaat 127  Q
    | ||||    
T  25431513 ttaaat 25431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 39245137 - 39245291
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  39245137 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 160  Q
    |||| |||| ||| || ||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  39245235 gcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 39245291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 29348454 - 29348611
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29348454 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29348611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 29350927 - 29351084
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29350927 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29351084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36154941 - 36154787
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||| ||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  36154941 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 36154787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 20918109 - 20918052
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20918109 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 20918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 32027394 - 32027551
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  32027394 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataa-caacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
     ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32027551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10775837 - 10775790
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10775837 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 10775790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18319185 - 18319037
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 114  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||     
T  18319185 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 18319088  T
Q  115 caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18319087 caacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 18319037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21293086 - 21293020
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    ||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21293086 catcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064559
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 23064559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 38619435 - 38619482
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38619435 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 38619482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 75
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37723975
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 75  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20766175 - 20766115
Alignment:
Q  69 acagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766175 acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Original strand, 31061069 - 31061124
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaa 63  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31061069 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaa 31061124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 26704074 - 26704122
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26704074 acatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 26704122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 26973807 - 26973855
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26973807 acatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 26973855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39706405 - 39706187
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706405 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 39706306  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 206  Q
    ||| |||  ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39706305 caagtcatgaacatcataaacatcaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcata-taattcaggcttacta 39706207  T
Q  207 aaataacaacagcaagataa 226  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  39706206 aaacaacaacagcaagataa 39706187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288094
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  116 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 214  Q
    |||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12288216 aacatcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaaca 12288119  T
Q  215 acagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  12288118 acagcaagataaacaacttagtttc 12288094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 12774010 - 12774160
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774010 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 12774109  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 157  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12774110 acaa-tcaacaacatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa 12774160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 8846359 - 8846608
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgata-------------- 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |                  
T  8846359 acatcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaat 8846458  T
Q  92 --taacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcat 188  Q
      |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||    
T  8846459 gctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 8846558  T
Q  189 attaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||  | |||| ||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  8846559 atgca-tcagtcttactggaacaacaactacaagataaacaacttagtttc 8846608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243192
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  116 aacatctcaaa 126  Q
    |||||||||||    
T  52243202 aacatctcaaa 52243192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 15551821 - 15551982
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |    
T  15551821 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcgaagg 15551920  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15551921 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15551982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13784
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 13854  T
Q  122 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 189  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||    
T  13853 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata 13784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198438
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  116 aacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataac 213  Q
    || |||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |  ||||||  ||| || ||||||| || | |    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcatt-agtcttactggaacatc 43198463  T
Q  214 aacagcaagat-aacaacttagttt 237  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  43198462 aacaacaagataaacaacttagttt 43198438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082036
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataaca 53082156  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  53082155 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 53082057  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  53082056 taagataagcaacttagtttc 53082036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640340
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataaca 46640459  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    |||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |  |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||    
T  46640458 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcata-taattcaggtttactgaaacaataacag 46640361  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  46640360 taagataagcaacttagtttc 46640340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 238
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099584
Alignment:
Q  111 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 15099555  T
Q  211 aacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
     |||||| |||| | || |||||||||||    
T  15099556 gacaacatcaaggtaaataacttagtttc 15099584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 238
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190551
Alignment:
Q  111 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 15190522  T
Q  211 aacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
     |||||| |||| | || |||||||||||    
T  15190523 gacaacatcaaggtaaataacttagtttc 15190551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16377630 - 16377522
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  16377630 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 16377533  T
Q  115 caacatctcaa 125  Q
    |||||||||||    
T  16377532 caacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16240086 - 16239965
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  16240086 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataa-caatagcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 16239988  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  16239987 caagtcaacaacatcttaaatat 16239965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 7088881 - 7088996
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7088881 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7088979  T
Q  106 gcaattcaacaacatct 122  Q
    |||||||| ||||||||    
T  7088980 gcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596813
Alignment:
Q  41 cttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataatt 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagt 16596782  T
Q  140 catataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16596783 catgtaatgtatatacaattatataacatta 16596813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 44615289 - 44615446
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44615289 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44615446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 7798778 - 7798900
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7798778 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7798876  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  7798877 gcaagtcatcaacatcttaaatat 7798900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22636439 - 22636561
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22636439 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22636537  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  22636538 gcaattcatcaacatcttaaatat 22636561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 6899895 - 6900016
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || |||   |||| |||||| ||||    
T  6899895 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatcaaatg 6899993  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  6899994 caagtcaacaacatcttaaatat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8574984 - 8574864
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  8574984 catcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 8574887  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  8574886 taattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16270352 - 16270231
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  16270352 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 16270254  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| | |||||||||| ||||||    
T  16270253 caagttaacaacatcttaaatat 16270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 52873484 - 52873363
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  52873484 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 52873386  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaata 128  Q
    |||| |||||| ||||| |||||    
T  52873385 gcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12468 - 12311
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12468 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15118513 - 15118356
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15118513 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15118356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18215435 - 18215278
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18215435 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18215278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374354
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 108  Q
    |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  109 attcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  23374374 attcaacaacatcttaaatat 23374354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44773248 - 44773091
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44773248 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatat 44773091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 52312511 - 52312668
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  52312511 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 52312668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 12902761 - 12902883
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  12902761 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 12902859  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    | |||||| |||||||| ||||||    
T  12902860 gtaattcatcaacatcttaaatat 12902883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 14280317 - 14280438
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14280317 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 54798871 - 54798749
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  54798871 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatat 54798749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19618323 - 19618176
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  19618323 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 19618226  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19618225 aacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatat 19618176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44929041 - 44928883
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||| || |||    
T  44929041 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||| |||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44928883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50222500 - 50222343
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  50222500 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 50222343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 51464029 - 51463872
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  51464029 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatat 51463872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 7893707 - 7893829
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7893707 catcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7893805  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  7893806 gcaagtcaacatcatcttaaatat 7893829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 44052833 - 44052955
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  44052833 catcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataa-caacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 44052931  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  44052932 gcaattcatcaacatcttaaatat 44052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  8 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  107 caattcaacaacatctcaa 125  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 3096297 - 3096369
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 80  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3096297 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18239580 - 18239426
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18239580 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 160  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 18239426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1837670 - 1837513
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||| | |||    
T  1837670 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatat 1837513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 19242700 - 19242857
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  19242700 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19242797  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19242798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 19242857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 14970858 - 14970751
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  14970858 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 14970761  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  14970760 aacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Original strand, 17046491 - 17046552
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046491 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 17046552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 3515008 - 3515165
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||| || || || |||| |||||| |||    
T  3515008 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa-aaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 3515165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23803426 - 23803316
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23803426 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23803329  T
Q  106 gcaattcaacaac 118  Q
    |||| ||||||||    
T  23803328 gcaaatcaacaac 23803316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15355476 - 15355328
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||     
T  15355476 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 15355379  T
Q  115 caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15355378 caacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 15355328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 7641343 - 7641286
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7641343 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Original strand, 12610951 - 12611008
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12610951 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14053418 - 14053306
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  14053418 catcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaattt 14053320  T
Q  107 caattcaacaacat 120  Q
    ||||||| ||||||    
T  14053319 caattcatcaacat 14053306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 44102215 - 44102372
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44102215 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaataacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| | |||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44102372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464929
Alignment:
Q  85 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 15464929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 74
Target Start/End: Original strand, 17333305 - 17333347
Alignment:
Q  31 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17333305 actcatgcagcttagttaa-taaacaacagcaacatagacagta 17333347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 68
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190527
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacatag 6190527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10763
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
Q  118 catctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaac 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10642 catctcaaacatcgaacataattcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaac 10740  T
Q  217 agcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  10741 agcaagataaacaacttagtttc 10763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Original strand, 62202 - 62431
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  62202 catcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatg 62301  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 206  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  62302 ca---caacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactg 62398  T
Q  207 aaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  62399 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 62431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 132661 - 132809
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  132661 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaa 132760  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatata 154  Q
    || || ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  132761 tgtaa-tcatcaacgtctcaattatcaacataatccatttaatgtatata 132809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 136681 - 136838
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  136681 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 139150 - 139307
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  139150 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 139307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 144088 - 144245
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  144088 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 144245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 134212 - 134369
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  134212 catcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 134369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 141619 - 141776
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  141619 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 141776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 61 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2103
Alignment:
Q  61 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaatta 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcagcataattcatataatgtatatacaatta 2182  T
Q  161 tataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2181 tataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttc 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Original strand, 12770 - 13002
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12770 catcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 12869  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12870 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcata-taattcaggcttact 12968  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    | || |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12969 ggaacaacaacagcaagataaaccacttagtttc 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6240 - 6021
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6240 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 6141  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    ||| |||  ||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  6140 caagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttact 6042  T
Q  206 gaaataacaacagcaagataa 226  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  6041 gaaacaataacagcaagataa 6021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10659 - 10426
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10659 acatcaccatcttcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 10560  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  10559 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 10461  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    || || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10460 tggaacaacaacaacaagataaacaacttagtttc 10426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 129908 - 130141
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129908 acatcttcatcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 130007  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  130008 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 130106  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  130107 tggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 130141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60713
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaaca 60720  T
Q  120 tctcaaa 126  Q
    |||||||    
T  60719 tctcaaa 60713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 132 - 364
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132 acatcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |  ||||||  | |||| || ||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcatatgta-tcagtctcac 330  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagataacaacttagtttc 238  Q
    |  || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  331 tagaacaacaacagcaagataacaactcagtttc 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 6615 - 6843
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6615 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatg 6714  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    ||| | | || |||   ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6715 caagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagcttact 6813  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttag 234  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6814 aaaacaacaacagcaagataaacaacttag 6843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 13995 - 14223
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13995 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatg 14094  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    ||| | | || |||   ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14095 caagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagcttact 14193  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttag 234  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14194 aaaacaacaacagcaagataaacaacttag 14223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 19652198 - 19652429
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652198 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatctcaaacatcaacataatccatttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 19652395  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19652396 ggaacaataacagcaagataaacaacttagtttc 19652429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019642
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  23019408 acatcatcatctttcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaa 23019507  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 203  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  23019508 tgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattata-tagttcaggctta 23019606  T
Q  204 ctgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23019607 ctgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 23019642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668608
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  116 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 214  Q
    |||||| | || |||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||| ||  |||| |||||||||| ||||    
T  19668486 aacatcac-aacatcatacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcata-tacatcagacttactgaaacaaca 19668583  T
Q  215 acagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  19668584 acagcaagataaacaacttagtttc 19668608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22080800 - 22080624
Alignment:
Q  62 aacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattat 161  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22080800 aacataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcgaatgcacag-aacaacatctcaaacatcgtcataattaatataatgtatatacatttat 22080702  T
Q  162 ataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttc 238  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22080701 ataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggcttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttc 22080624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Original strand, 1561307 - 1561537
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1561307 catcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 1561406  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaattcaggcttac 204  Q
    ||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||  | |||| |||||    
T  1561407 caaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgca-tcagtcttac 1561502  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1561503 tggaatattaacagcaagataaacaacttagtttc 1561537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28496588 - 28496359
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28496588 catcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 28496489  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
     || |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||  | |||| ||||||    
T  28496488 taaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgca-tcagtcttact 28496393  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  28496392 ggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttc 28496359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29808999 - 29808770
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29808999 catcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 29808900  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
     || |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||  | |||| ||||||    
T  29808899 taaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgca-tcagtcttact 29808804  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  29808803 ggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttc 29808770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098465
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  116 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaa 171  Q
    ||| || | || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9098520 aacttcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacattaa 9098465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27333335 - 27333238
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333335 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27394075 - 27393978
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394075 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4185939 - 4185827
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4185939 acatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaat 4185840  T
Q  106 gcaattcaacaac 118  Q
    |||||||| ||||    
T  4185839 gcaattcatcaac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 158
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109295
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||    
T  20109140 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatcaaa 20109239  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaat 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  20109240 tgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaat 20109295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 4186376 - 4186482
Alignment:
Q  12 tcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatt 111  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4186376 tcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaatt 4186475  T
Q  112 caacaac 118  Q
    || ||||    
T  4186476 catcaac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 16496248 - 16496370
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |    
T  16496248 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 16496346  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16496347 gcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31155515 - 31155346
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaa-cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31155515 acatcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgatataacaatatcgaa 31155417  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaat-atcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaaca 176  Q
    ||||||||| ||||   ||| || |||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  31155416 tgcaattcatcaac--ttcatatcatcaacataaatcatgcaatgtttatacatttatataacatcaacaaca 31155346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 29060544 - 29060662
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29060544 catcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29060642  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  29060643 gcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 20076704 - 20076812
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  20076704 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 20076802  T
Q  107 caattcaaca 116  Q
    ||| ||||||    
T  20076803 caaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 126
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644444
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| || ||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  117 acatctcaaa 126  Q
    ||||||||||    
T  25644435 acatctcaaa 25644444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 1595550 - 1595707
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  1595550 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatat 1595707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18409944 - 18409826
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18409944 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaat 18409846  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  18409845 gcaagtcaacaacatctcaa 18409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 22782228 - 22782385
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22782228 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19303657 - 19303540
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  19303657 catcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 19303559  T
Q  107 caattcaacaacatctcaa 125  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  19303558 caagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2291341 - 2291184
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  2291341 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 2291184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8227625 - 8227453
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 109  Q
    |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||    
T  8227625 catcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaa 8227526  T
Q  110 ttcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
     | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  8227525 gtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 12742318 - 12742475
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12742318 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12742475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18334753 - 18334596
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18334753 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18334596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 19005047 - 19005204
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  19005047 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19005204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19859080 - 19858923
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  19859080 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19858923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20638400 - 20638285
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  20638400 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 20638302  T
Q  106 gcaattcaacaacatct 122  Q
    |||||| | ||||||||    
T  20638301 gcaatttatcaacatct 20638285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 24422548 - 24422705
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  24422548 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 33861795 - 33861952
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  33861795 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33861952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 33864279 - 33864436
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  33864279 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33864436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25629472 - 25629354
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  25629472 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatta-caacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaat 25629374  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  25629373 gcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20557053 - 20556898
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| |||    
T  20557053 catcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20556955 gcaagtcaacaacgtctc-aatttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20556898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30676861 - 30676714
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  30676861 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaac 30676764  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  30676763 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 30676714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668217
Alignment:
Q  58 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675064
Alignment:
Q  58 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 8055030 - 8055187
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  8055030 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 8055187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26924801 - 26924644
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  26924801 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26924644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17287913 - 17287791
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | |    
T  17287913 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaatt 17287815  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  17287814 gcaagtcaacatcatcttaaatat 17287791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20361069 - 20360955
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 113  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  20361069 tcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattca 20360971  T
Q  114 acaacatctcaaatat 129  Q
     |||||||| ||||||    
T  20360970 tcaacatcttaaatat 20360955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 25754810 - 25754967
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  25754810 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 25754967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 20593777 - 20593895
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20593777 catcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 20593875  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  20593876 gcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Original strand, 25656630 - 25656731
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  25656630 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  106 gcaa 109  Q
    ||||    
T  25656728 gcaa 25656731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 34963384 - 34963531
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  34963384 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 34963481  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  34963482 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 34963531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1541072 - 1540918
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| |||    
T  1541072 catcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 160  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 1540918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456877
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  121 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18456833 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18456877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 25688513 - 25688620
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  25688513 atcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaac 25688610  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  25688611 aacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16920747 - 16920634
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||||| |||     
T  16920747 catcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa--catcatgacataagtatatcaaatt 16920650  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    | ||||| ||||||||    
T  16920649 ccattcatcaacatct 16920634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28103887 - 28103796
Alignment:
Q  134 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 226  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28103887 ataattcacataatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 28103796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 35245590 - 35245703
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| | |     
T  35245590 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa--caacatgacataataatatcaattt 35245687  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35245688 caattcatcaacatct 35245703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Original strand, 25714421 - 25714478
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25714421 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076968
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
     || ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| |  || |||||||||||||| ||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatat-caggcttactgaaacaacaacag 23076947  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||| ||||||||    
T  23076948 taagataagcaaattagtttc 23076968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3852178 - 3852021
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| || | |||||  |||    
T  3852178 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 3852021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18461997
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  121 ctcaa 125  Q
    |||||    
T  18461993 ctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Original strand, 22831524 - 22831568
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22831524 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 22831568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16448678 - 16448530
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 114  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||     
T  16448678 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 16448581  T
Q  115 caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16448580 caacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 16448530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 190
Target Start/End: Original strand, 18696569 - 18696675
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 182  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||    
T  18696569 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T
Q  183 gatcatat 190  Q
     |||||||    
T  18696668 aatcatat 18696675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22780344 - 22780297
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22780344 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac 22780297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 66
Target Start/End: Original strand, 11185515 - 11185568
Alignment:
Q  13 catcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacat 66  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11185515 catcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 192
Target Start/End: Original strand, 18706387 - 18706495
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 182  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  18706387 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatgacattattaacaacatca 18706485  T
Q  183 gatcatatta 192  Q
     |||||||||    
T  18706486 aatcatatta 18706495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008386
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | |||| ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
     || ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| |  || |||||||||||||| || |||||    
T  35008267 acttaaacatcatatataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatat-caggcttactgaaacaataacag 35008365  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  35008366 taagataagcaacttagtttc 35008386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 101
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443146
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatc 33443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821904
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 18821904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 4738675 - 4738631
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaa 50  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  4738675 acatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaa 4738631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18896304 - 18896256
Alignment:
Q  134 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 182  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  18896304 ataattcacataatgcatatacaattatatcccattactaacaacatta 18896256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22788 - 22613
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22788 acatcatcaccttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 22689  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22688 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 22613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 82073 - 82230
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  82073 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 82230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32771
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  32538 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaa 32637  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 203  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32638 tgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattata-taattcaggctta 32735  T
Q  204 ctgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  32736 ctgaaacaataacaacaagataaacaacttagtttc 32771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13175
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12942 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcgaat 13041  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  13042 gcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattat-ccaattcaggcttac 13140  T
Q  205 tgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  13141 tgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttc 13175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18277 - 18122
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 182  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| |    
T  18277 tcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  183 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttc 238  Q
     | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  18177 aaacata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttc 18122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Original strand, 160685 - 160919
Alignment:
Q  4 ggacatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  160685 ggacatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaa 160784  T
Q  104 atgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctt 202  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||    
T  160785 atgcaa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtctt 160882  T
Q  203 actgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  160883 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttc 160919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 501095 - 501242
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  501095 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 501192  T
Q  116 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  501193 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 501242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 85741 - 85583
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  85741 catcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
Q  106 gcaattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||| |||| ||| || |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 85583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 920
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1151 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcgaatg 1052  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 205  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||||||    
T  1051 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagat--ttacaattcaggcttact 954  T
Q  206 gaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||||||||    
T  953 gaaacaacaacaacaagataaataacttagtttc 920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 6822 - 7045
Alignment:
Q  13 catcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattc 112  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6822 catcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatc 6921  T
Q  113 aacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaata 211  Q
    |||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||  | |||| ||||||| || |    
T  6922 aacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgca-tcagtcttactggaaca 7017  T
Q  212 acaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7018 acaacagcaagataaacaacttagtttc 7045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 236
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8249
Alignment:
Q  85 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattag 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattag 8196  T
Q  184 atcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtt 236  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8197 attata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagtt 8249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45910 - 45735
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45910 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    | || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaattatcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacat 45735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 1096 - 1318
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||    
T  1096 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaggtcatca 1195  T
Q  117 acatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaa 215  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  |||| ||||||| || |||||    
T  1196 acatttcaaacatcaaacataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttactggaacaacaa 1294  T
Q  216 cagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    || |||||| || |||||||||||    
T  1295 caacaagataaaaaacttagtttc 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7961
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaac 8081  T
Q  116 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 214  Q
    |||||| | || |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||    
T  8080 aacatcac-aacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcata-taattcaggcttactga---aaca 7986  T
Q  215 acagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  7985 acagcaagataaacaacttagtttc 7961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29242
Alignment:
Q  50 ataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatg 148  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| || ||    
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtactg 29258  T
Q  149 tatatacaattatata 164  Q
    ||||||||||||||||    
T  29257 tatatacaattatata 29242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136252
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 217  Q
    || ||   |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  136371 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaaca 136274  T
Q  218 gcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  136273 gcaagataaacaacttagtttc 136252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144960
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 217  Q
    || ||   |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  145079 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaaca 144982  T
Q  218 gcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  144981 gcaagataaacaacttagtttc 144960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 174785 - 174886
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  174785 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacatgattatatcaaattcaattcaacaacatc 174882  T
Q  122 tcaa 125  Q
    ||||    
T  174883 tcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 121770 - 121835
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  121770 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6167
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6286 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 6188  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
      |||||| ||||||||||||    
T  6187 tgagataagcaacttagtttc 6167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23897
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 23902  T
Q  106 gcaat 110  Q
    |||||    
T  23901 gcaat 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 11296 - 11457
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11296 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 11395  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  11396 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatactattatataacatta 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 2001 - 2162
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2001 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 2100  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2101 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 2162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 28418 - 28533
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  28418 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 28516  T
Q  106 gcaattcaacaacatct 122  Q
    |||||||||||||||||    
T  28517 gcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Original strand, 4556 - 4608
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaaca 59  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4556 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38554
Alignment:
Q  26 gaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc 38438  T
Q  124 aaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaag 222  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||   |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  38439 aaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaag 38537  T
Q  223 ataa-caacttagtttc 238  Q
    |||| ||||||||||||    
T  38538 ataagcaacttagtttc 38554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128854
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactgaaacaacaacag 128875  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  128874 taagataagcaacttagtttc 128854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78556
Alignment:
Q  26 gaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctc 78443  T
Q  124 aaatatcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaag 222  Q
    ||  |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  78444 aac-atcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaag 78541  T
Q  223 ataa-caacttagtt 236  Q
    |||| ||||||||||    
T  78542 ataagcaacttagtt 78556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 116431 - 116551
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| ||||    
T  116431 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaatg 116528  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  116529 caagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 15665 - 15826
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15665 catcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaatg 15764  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15765 taaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1186 - 1025
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1186 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 1087  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1086 taaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38819 - 38697
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  38819 catcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 38720  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||    
T  38719 caagtcatcaatatctcaaatat 38697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 32101 - 32249
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32101 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaa 32200  T
Q  105 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatata 154  Q
    || || ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32201 tgtaa-tcatcaacgtctcaattatcaacataatccatttaatgtatata 32249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12803
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 12686  T
Q  122 tcaaata--tcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 219  Q
    |||||||  |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | || |||   ||| || |||||||||| |||||||||    
T  12687 tcaaatacttatatataattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacatt-agacttactgaaacaacaacagc 12784  T
Q  220 aagat-aacaacttagttt 237  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  12785 aagataaacaacttagttt 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3267 - 3146
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  3267 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 3169  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  3168 caagtcaacaacatctcaaatat 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103523
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaac 103638  T
Q  116 aacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaa 215  Q
    ||||||      ||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  103637 aacatc------at--acataattcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaa 103547  T
Q  216 cagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||| ||||| || |||||||||||    
T  103546 caggaagataaagaacttagtttc 103523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15894 - 15792
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15894 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatg 15795  T
Q  107 caa 109  Q
    |||    
T  15794 caa 15792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15765 - 15717
Alignment:
Q  191 taattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15765 taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttc 15717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 178897 - 178945
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  178897 acatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 178945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 53640 - 53482
Alignment:
Q  33 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 131  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  53640 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattca 53541  T
Q  132 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 189  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||    
T  53540 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata 53482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97243
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 97123  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  97124 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacag 97222  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     |||| || ||||||||||||    
T  97223 taagaaaagcaacttagtttc 97243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106521
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 106401  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  106402 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacag 106500  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     |||| || ||||||||||||    
T  106501 taagaaaagcaacttagtttc 106521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatc 1150  T
Q  122 tcaaatat 129  Q
    ||||||||    
T  1151 tcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3303 - 3185
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  3303 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 3205  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  3204 gtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 39489 - 39602
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  39489 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 39587  T
Q  115 caacatctcaaatat 129  Q
    |||||||||||||||    
T  39588 caacatctcaaatat 39602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 75323 - 75210
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  75323 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 75225  T
Q  115 caacatctcaaatat 129  Q
    |||||||||||||||    
T  75224 caacatctcaaatat 75210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 39862 - 39983
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||    
T  39862 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatg 39960  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  39961 caagtaaacaacatctcaaatat 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 25908 - 26021
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| | ||    
T  25908 tcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaa 26006  T
Q  115 caacatctcaaatat 129  Q
    |||||||||||||||    
T  26007 caacatctcaaatat 26021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25268
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaac 25219  T
Q  116 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25220 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatat 25268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 192
Target Start/End: Original strand, 619 - 727
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 182  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  619 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  183 gatcatatta 192  Q
     |||||||||    
T  718 aatcatatta 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19769
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 19888  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    |||| |  |||| | |||| |||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  || ||||| | |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  19887 tctc-agcatcataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcata-taattcatgcttactggaacaacaacag 19790  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  19789 taagataagcaacttagtttc 19769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 39917 - 40038
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  39917 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 40015  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||  |||| ||||||| ||||||    
T  40016 catgtcaataacatcttaaatat 40038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 1855 - 1977
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  1855 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 1953  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  1954 gcaattcatcaacatcttaaatat 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 34127 - 34288
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  34127 catcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcgaatg 34226  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccatta 170  Q
     || ||||||||   |||| |||||| | ||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  34227 taaatcaacaac---tcaattatcaaacttaagtcaagtaatatatatacaattatataacatta 34288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 54
Target Start/End: Original strand, 285 - 324
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  285 tcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac 324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33073 - 32952
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  33073 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaa-caacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 32975  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  32974 caattcaacaacatcttaaatat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 45932 - 46053
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  45932 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaa-caacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 46030  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  46031 caattcaacaacatcttaaatat 46053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 16117 - 16235
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || || ||||| | |||||| |||    
T  16117 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaat 16215  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    ||||  ||||| ||||||||    
T  16216 gcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17446 - 17389
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17446 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 238
Target Start/End: Original strand, 87 - 242
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||| |    
T  87 tcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatataacattattaacaacatca 186  T
Q  183 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagata-acaacttagtttc 238  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  187 aatcat-ttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttc 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7943
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatc 8062  T
Q  122 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagc 219  Q
    | ||| | ||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||  |||| || |||| || |||| ||||    
T  8061 ttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtctcactggaacaacatcagc 7963  T
Q  220 aagat-aacaacttagtttc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  7962 aagataaacaacttagtttc 7943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 4853 - 4968
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  4853 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaat 4951  T
Q  106 gcaattcaacaacatct 122  Q
    |||||||||||||||||    
T  4952 gcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13247
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 13246  T
Q  122 t 122  Q
    |    
T  13247 t 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16098
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
Q  118 catctcaaa 126  Q
    |||||||||    
T  16106 catctcaaa 16098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27747
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
Q  118 catctcaaa 126  Q
    |||||||||    
T  27755 catctcaaa 27747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 180
Target Start/End: Original strand, 11492 - 11643
Alignment:
Q  31 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-at 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||    
T  11492 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 11591  T
Q  130 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  11592 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38349 - 38198
Alignment:
Q  31 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-at 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||    
T  38349 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 38250  T
Q  130 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  38249 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17334 - 17214
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc---aaatcatcatgatataacaatatcga 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |   ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  17334 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaa 17236  T
Q  104 atgcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  17235 atgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79288
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||   ||| || ||||| |||| ||| || ||||||| |||||||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  121 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  79332 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatat 79288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18130 - 17969
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  18130 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 18031  T
Q  121 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 180  Q
    |||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  18030 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2280 - 2132
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 114  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||     
T  2280 atcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 2183  T
Q  115 caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
     ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2182 taacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 2132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  109 attcaacaacatctcaa 125  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 44824 - 44702
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44824 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  44725 gcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 13215 - 13337
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  13215 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 13313  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  13314 gcaattcatcaacatcttaaatat 13337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 28888 - 28806
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-caacagcaacatagacagtatgcaaatcatcat 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28888 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 32946 - 33067
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  32946 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 33044  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| | |||||||||| ||||||    
T  33045 caagttaacaacatcttaaatat 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 38765 - 38886
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  38765 catcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 38863  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| | |||||||||| ||||||    
T  38864 caaataaacaacatcttaaatat 38886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 9750 - 9908
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  9750 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagt 9847  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9848 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 9908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 20748 - 20905
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20748 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 37822 - 37979
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  37822 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 37979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 158611 - 158454
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  158611 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 158454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 340064 - 339949
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||     
T  340064 catcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat- 339968  T
Q  107 caattcaacaacatctcaa 125  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  339967 caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 3474 - 3596
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  3474 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 3572  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  3573 gcaattcatcaacatcttaaatat 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 347 - 468
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||  | |||||  ||| |||||| | ||    
T  347 catcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatcaattg 445  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
     || |||||||||||| ||||||    
T  446 gaagtcaacaacatcttaaatat 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 51917 - 52039
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  51917 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 52015  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||    
T  52016 gcaagtcaacatcatcttaaatat 52039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 168095 - 167973
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | |    
T  168095 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaatt 167997  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  167996 gcaattcatcaacatcttaaatat 167973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 569 - 786
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 667  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    || | || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| | ||||   ||||   | || || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  668 tc-ccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 765  T
Q  219 caagat-aacaacttagtttc 238  Q
      |||| ||||||||||||||    
T  766 ttagataaacaacttagtttc 786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 10784 - 10891
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  10784 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 10881  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  10882 aacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 13393 - 13547
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13393 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 160  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8646 - 8528
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||  ||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  8646 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatcaattg 8551  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||    
T  8550 caagtcaacatcatcttaaatat 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267897
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||  ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaata 267778  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    |||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||| ||| | |||||| | || |||||||||||||| |||| |||    
T  267779 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcata-tcatccaggcttactgaaacaacagcag 267876  T
Q  219 caagataa-caacttagtttc 238  Q
     ||| ||| ||||||||||||    
T  267877 taagctaagcaacttagtttc 267897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 4695 - 4852
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4695 catcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9193
Alignment:
Q  58 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10540 - 10427
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| | |     
T  10540 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataataatatcaattt 10443  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||||||||||||    
T  10442 caattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 13948 - 14105
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13948 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 16785 - 16942
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16785 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 1293 - 1406
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||  |||||||| ||||  ||||| |||     
T  1293 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatcaaatt 1390  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  1391 caattcatcaacatct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 7270 - 7383
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  7270 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--caacatgaaataattatatcaaatt 7367  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  7368 caattcatcaacatct 7383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15355 - 15295
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15355 catcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacatag 15295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20383
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  122 tcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 128755 - 128876
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | | |  |   ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  128755 catcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataa-caaaagcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 128853  T
Q  107 caattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  128854 caagtcaacaacatcttaaatat 128876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 1043
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | |    
T  1165 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaatt 1067  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  1066 gcaattcatcaacatcttaaatat 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 1956 - 2078
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  1956 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaa-caacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatt 2054  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  2055 gcaattcaacaacatcttaaatat 2078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22887 - 23008
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22887 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  22985 gcaagtcaacaacatcttaaatat 23008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15580 - 15466
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  15580 catcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattt 15482  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  15481 caattcatcaacatct 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 32071 - 32184
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  32071 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtaaacaaa-caacatgacataataatatcaattt 32168  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  32169 caattcatcaacatct 32184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24297
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  119 atctcaaatat 129  Q
    |||| ||||||    
T  24307 atcttaaatat 24297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6241 - 6116
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac--caacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||| | ||| || ||||| || | |||||| |    
T  6241 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaa 6142  T
Q  104 atgcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||    
T  6141 ttgcaattcatcaacatcttaaatat 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1682
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||  |||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 1801  T
Q  120 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacag 218  Q
    |||| || |||| | |||||| || ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||| | | |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||    
T  1800 tctc-aacatcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcata-taattcaggcttactggaacaacaatag 1703  T
Q  219 caagata-acaacttagtttc 238  Q
     ||||||  ||||||||||||    
T  1702 taagataggcaacttagtttc 1682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 4950 - 4890
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4950 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacatag 4890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 9253 - 9360
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  9253 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 9350  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  9351 aacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 51601 - 51699
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||| | ||| ||||||| |||||||    
T  51601 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattataacaaattcaattcatcaacatc 51698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 40401 - 40558
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| |||    
T  40401 catcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacat--aattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40499 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatat 40558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 13513 - 13615
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || | |||||| | | | ||||| ||||    
T  13513 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatcaatttcgattcatcaac 13611  T
Q  119 atct 122  Q
    ||||    
T  13612 atct 13615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 4520 - 4633
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  4520 tcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 4617  T
Q  114 acaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||    
T  4618 acaacatctcaaatat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 12102 - 12215
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  12102 tcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 12199  T
Q  114 acaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||    
T  12200 acaacatctcaaatat 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 22054 - 22167
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  22054 tcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 22151  T
Q  114 acaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||    
T  22152 acaacatctcaaatat 22167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16717 - 16599
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16717 catcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 16619  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaa 125  Q
    | || |||||| ||||||||    
T  16618 ggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 16286 - 16397
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  16286 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 16383  T
Q  107 caattcaacaacat 120  Q
    ||||||| ||||||    
T  16384 caattcatcaacat 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 4716 - 4788
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 80  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  4716 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaa 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 107 - 264
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  107 catcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5245 - 5132
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||  |||||||| ||||  ||||| |||     
T  5245 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaatt 5148  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  5147 caattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 8483 - 8598
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  8483 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataa-caatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaatt 8581  T
Q  106 gcaattcaacaacatct 122  Q
    |||| ||||||||||||    
T  8582 gcaagtcaacaacatct 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2505 - 2398
Alignment:
Q  61 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaatt 159  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  2505 caacttagaccgtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaatt 2409  T
Q  160 atataccatta 170  Q
    ||||| |||||    
T  2408 atataacatta 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30090
Alignment:
Q  20 aacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || ||||||||    
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaac 30043  T
Q  119 atctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
     |||||| |||  ||  |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30044 gtctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatat 30090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 20928 - 21030
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 119  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  20928 acttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaaca 21027  T
Q  120 tct 122  Q
    |||    
T  21028 tct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 11299 - 11446
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  11299 atcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 11396  T
Q  116 aacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  11397 aacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 11446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 4308 - 4415
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  4308 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaaatcaac 4405  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  4406 aacgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 180
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  61 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaat 158  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  159 tatataccattaacaacaacat 180  Q
    |||||  |||||  ||||||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 161239 - 161093
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-ca 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||| | ||| ||| |||| |||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  161239 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaat-atcaacagcgacacag-cagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 161142  T
Q  117 acatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  161141 acatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 161093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1166 - 1053
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||||| | |     
T  1166 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattatatcaattt 1069  T
Q  107 caattcaacaacatct 122  Q
    ||||||| ||||||||    
T  1068 caattcatcaacatct 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 110
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2784
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaat 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12400 - 12253
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 115  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || | ||| || ||||| | || |||||| ||||||| |||||    
T  12400 atcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagtcaac 12303  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaca--taattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    ||| |||||| |||  |||  |||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12302 aacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatat 12253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 12065 - 12216
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12065 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta-------aacagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
Q  106 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 129
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4650
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||  |||||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T
Q  123 caaatat 129  Q
     ||||||    
T  4644 taaatat 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 46999 - 47065
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  46999 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 4215 - 4373
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4215 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-cgacagcgacacag-cagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
Q  106 gcaattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 163  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 4373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11558 - 11447
Alignment:
Q  9 tcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 107  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | | |    
T  11558 tcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatttc 11460  T
Q  108 aattcaacaacat 120  Q
    |||||| ||||||    
T  11459 aattcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 23842 - 23890
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23842 acatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 23890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 36453 - 36501
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36453 acatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 36501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 65
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2303 - 2261
Alignment:
Q  115 caacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2303 caacatctcgaatatcaacataatccatttaatgtatatacaa 2261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 1432 - 1395
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1432 atcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 1395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 129
Target Start/End: Original strand, 27912 - 27956
Alignment:
Q  85 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 129  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 27956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University