View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4142_low_39 (Length: 241)

Name: NF4142_low_39
Description: NF4142
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4142_low_39
NF4142_low_39
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (64-221)||(16206619-16206776)
chr8 (64-233)||(23264257-23264426)
chr8 (81-233)||(39692901-39693054)
chr8 (64-221)||(45539080-45539239)
chr8 (64-233)||(17442450-17442620)
chr8 (64-233)||(18121738-18121911)
chr8 (64-221)||(17796770-17796929)
chr8 (64-233)||(21932231-21932402)
chr8 (64-231)||(18152310-18152478)
chr8 (64-233)||(15934290-15934464)
chr8 (80-233)||(22673164-22673318)
chr8 (71-233)||(29692667-29692833)
chr8 (64-233)||(12758367-12758539)
chr8 (64-233)||(17526366-17526539)
chr8 (80-233)||(33560846-33561001)
chr8 (80-233)||(14990723-14990877)
chr8 (64-233)||(20256141-20256315)
chr8 (64-233)||(15336718-15336892)
chr8 (64-233)||(15425783-15425957)
chr8 (64-233)||(15517087-15517261)
chr8 (64-233)||(19942584-19942757)
chr8 (64-233)||(14990112-14990282)
chr8 (64-233)||(16681883-16682056)
chr8 (64-221)||(19153382-19153541)
chr8 (80-233)||(43773484-43773639)
chr8 (64-233)||(19956966-19957140)
chr8 (64-233)||(18679162-18679335)
chr8 (64-233)||(18718351-18718524)
chr8 (64-233)||(26832424-26832597)
chr8 (80-233)||(22662451-22662606)
chr8 (64-233)||(40846018-40846191)
chr8 (64-196)||(30422070-30422204)
chr8 (64-233)||(13431251-13431422)
chr8 (71-233)||(18772047-18772214)
chr8 (68-230)||(25163423-25163589)
chr8 (64-233)||(9319916-9320090)
chr8 (80-233)||(43639147-43639301)
chr8 (64-180)||(6407106-6407223)
chr8 (80-165)||(1744551-1744637)
chr8 (64-233)||(18321787-18321959)
chr8 (71-231)||(43644252-43644416)
chr8 (64-198)||(19706864-19707002)
chr8 (131-221)||(2810285-2810378)
chr8 (64-172)||(24679080-24679190)
chr8 (100-233)||(45292221-45292354)
chr8 (64-144)||(20383060-20383140)
chr8 (76-143)||(21540322-21540390)
chr8 (161-233)||(24645779-24645851)
chr8 (64-147)||(17928437-17928519)
chr8 (64-147)||(25850708-25850791)
chr8 (76-142)||(21287762-21287829)
chr8 (64-142)||(21298331-21298409)
chr8 (75-233)||(22707703-22707852)
chr8 (78-142)||(45568642-45568707)
chr8 (64-199)||(16376000-16376135)
chr8 (64-146)||(36104688-36104771)
chr8 (67-147)||(18557402-18557481)
chr8 (126-233)||(22462266-22462378)
chr8 (64-144)||(19506063-19506142)
chr8 (64-143)||(40002575-40002653)
chr8 (74-139)||(15969524-15969589)
chr8 (74-139)||(29378965-29379030)
chr8 (74-139)||(17519786-17519851)
chr8 (65-148)||(20161852-20161934)
chr8 (74-148)||(19417936-19418010)
chr8 (74-148)||(19428511-19428585)
chr8 (74-148)||(23470082-23470156)
chr8 (74-139)||(3843106-3843171)
chr8 (74-139)||(7019051-7019116)
chr8 (74-139)||(20260249-20260314)
chr8 (74-139)||(21046879-21046944)
chr8 (74-139)||(22136493-22136558)
chr8 (74-139)||(22167658-22167723)
chr8 (184-221)||(16206769-16206806)
chr8 (65-148)||(19128325-19128407)
chr8 (65-148)||(19224511-19224593)
chr8 (65-148)||(20195562-20195644)
chr8 (64-147)||(23192490-23192573)
[»] chr3 (109 HSPs)
chr3 (64-233)||(28581461-28581632)
chr3 (64-233)||(38178276-38178446)
chr3 (64-233)||(31302704-31302874)
chr3 (64-233)||(47406055-47406226)
chr3 (64-233)||(49554132-49554300)
chr3 (64-233)||(17667761-17667931)
chr3 (64-233)||(13823422-13823592)
chr3 (64-221)||(53057374-53057533)
chr3 (68-233)||(14968723-14968889)
chr3 (64-233)||(25398888-25399058)
chr3 (70-220)||(47207065-47207218)
chr3 (64-233)||(40799252-40799424)
chr3 (64-221)||(46350490-46350650)
chr3 (80-233)||(1728648-1728803)
chr3 (64-221)||(13939251-13939411)
chr3 (64-233)||(49643393-49643566)
chr3 (64-233)||(11222917-11223090)
chr3 (64-233)||(20628065-20628237)
chr3 (64-233)||(20645509-20645681)
chr3 (64-233)||(2025444-2025614)
chr3 (64-221)||(11222169-11222330)
chr3 (64-221)||(22128433-22128590)
chr3 (64-233)||(41494354-41494526)
chr3 (64-233)||(13781217-13781390)
chr3 (73-214)||(11189377-11189519)
chr3 (64-233)||(26418306-26418480)
chr3 (70-230)||(29854766-29854928)
chr3 (64-221)||(46797041-46797199)
chr3 (64-233)||(18122245-18122416)
chr3 (64-233)||(19889545-19889716)
chr3 (64-233)||(2560541-2560714)
chr3 (64-226)||(29952074-29952240)
chr3 (64-226)||(30001228-30001394)
chr3 (64-218)||(52283144-52283303)
chr3 (64-233)||(40850332-40850503)
chr3 (68-233)||(3238051-3238219)
chr3 (64-233)||(12726866-12727039)
chr3 (64-233)||(33582587-33582758)
chr3 (64-221)||(2782834-2782993)
chr3 (64-233)||(17239554-17239726)
chr3 (64-233)||(20724443-20724617)
chr3 (64-233)||(49669122-49669292)
chr3 (64-233)||(16031951-16032124)
chr3 (69-233)||(23538793-23538962)
chr3 (64-236)||(5212934-5213108)
chr3 (80-233)||(9700670-9700825)
chr3 (64-221)||(21638918-21639076)
chr3 (84-218)||(30054828-30054963)
chr3 (80-233)||(21640238-21640393)
chr3 (64-221)||(6090082-6090244)
chr3 (64-233)||(12967663-12967837)
chr3 (64-233)||(14063619-14063793)
chr3 (64-236)||(15902551-15902726)
chr3 (64-230)||(19249985-19250155)
chr3 (80-221)||(50299606-50299748)
chr3 (93-233)||(1241719-1241860)
chr3 (64-233)||(12963716-12963889)
chr3 (80-221)||(14954801-14954944)
chr3 (80-221)||(22463677-22463820)
chr3 (80-221)||(22465135-22465278)
chr3 (64-233)||(6252776-6252949)
chr3 (67-233)||(8874750-8874921)
chr3 (64-233)||(15961260-15961428)
chr3 (64-180)||(52919820-52919940)
chr3 (119-221)||(2784476-2784579)
chr3 (119-221)||(16659235-16659342)
chr3 (84-233)||(12396444-12396596)
chr3 (68-233)||(22804654-22804822)
chr3 (64-233)||(6174691-6174865)
chr3 (147-233)||(14393635-14393722)
chr3 (64-142)||(37411991-37412069)
chr3 (65-147)||(21316910-21316992)
chr3 (76-142)||(45862285-45862352)
chr3 (78-142)||(12753348-12753413)
chr3 (64-147)||(11078111-11078194)
chr3 (64-147)||(13410758-13410841)
chr3 (64-147)||(13698760-13698843)
chr3 (64-172)||(22770550-22770660)
chr3 (64-172)||(16881648-16881758)
chr3 (74-142)||(51340345-51340414)
chr3 (76-142)||(11909767-11909834)
chr3 (64-118)||(2783224-2783278)
chr3 (76-142)||(13147660-13147726)
chr3 (76-142)||(13953630-13953696)
chr3 (76-142)||(15832775-15832841)
chr3 (64-114)||(24776211-24776262)
chr3 (64-142)||(49989617-49989694)
chr3 (191-233)||(24776164-24776206)
chr3 (74-139)||(31114591-31114656)
chr3 (75-147)||(7833311-7833383)
chr3 (125-233)||(10851231-10851339)
chr3 (64-109)||(19885814-19885859)
chr3 (64-147)||(9007098-9007180)
chr3 (64-147)||(27882946-27883028)
chr3 (185-221)||(46797011-46797047)
chr3 (190-221)||(12726818-12726849)
chr3 (74-139)||(1053280-1053345)
chr3 (74-139)||(1063709-1063774)
chr3 (74-148)||(5628607-5628680)
chr3 (74-139)||(15651702-15651767)
chr3 (74-139)||(16076500-16076565)
chr3 (74-139)||(17282032-17282097)
chr3 (64-234)||(27849580-27849748)
chr3 (74-139)||(51989750-51989815)
chr3 (64-109)||(10849946-10849991)
chr3 (65-148)||(933192-933274)
chr3 (64-147)||(8996546-8996628)
chr3 (181-221)||(17667939-17667979)
chr3 (76-139)||(22150613-22150676)
[»] chr1 (83 HSPs)
chr1 (67-221)||(22600753-22600908)
chr1 (64-233)||(1577222-1577392)
chr1 (64-221)||(2266454-2266613)
chr1 (64-231)||(38281921-38282089)
chr1 (64-215)||(38281740-38281892)
chr1 (64-233)||(32786492-32786663)
chr1 (64-233)||(16235861-16236031)
chr1 (64-233)||(23037060-23037230)
chr1 (64-236)||(33256900-33257076)
chr1 (64-236)||(33277072-33277248)
chr1 (64-221)||(36133559-36133717)
chr1 (64-233)||(1899702-1899872)
chr1 (64-233)||(30892449-30892620)
chr1 (64-233)||(22202287-22202459)
chr1 (64-233)||(44824314-44824484)
chr1 (64-221)||(48703618-48703778)
chr1 (64-233)||(21192416-21192590)
chr1 (84-233)||(21702190-21702340)
chr1 (64-233)||(22153210-22153385)
chr1 (80-236)||(29215167-29215325)
chr1 (80-233)||(48570783-48570937)
chr1 (64-233)||(22427890-22428063)
chr1 (75-236)||(12625102-12625267)
chr1 (80-233)||(23024164-23024319)
chr1 (64-221)||(10250344-10250501)
chr1 (80-233)||(21121618-21121773)
chr1 (80-233)||(21205426-21205581)
chr1 (64-233)||(21983951-21984122)
chr1 (69-221)||(2328002-2328156)
chr1 (64-233)||(10756779-10756953)
chr1 (64-233)||(12283777-12283951)
chr1 (91-233)||(2834068-2834213)
chr1 (64-199)||(26702716-26702855)
chr1 (80-233)||(42284012-42284167)
chr1 (80-233)||(21135714-21135868)
chr1 (71-218)||(25449125-25449277)
chr1 (64-233)||(14263984-14264159)
chr1 (64-188)||(28492880-28493006)
chr1 (64-233)||(21215230-21215401)
chr1 (129-233)||(35039588-35039692)
chr1 (65-233)||(7309175-7309345)
chr1 (64-233)||(46088344-46088515)
chr1 (80-233)||(30571571-30571724)
chr1 (64-233)||(22465362-22465535)
chr1 (64-221)||(19214966-19215128)
chr1 (80-221)||(37640380-37640523)
chr1 (86-218)||(14293190-14293327)
chr1 (75-233)||(17017957-17018118)
chr1 (119-233)||(17025514-17025634)
chr1 (75-234)||(20908777-20908940)
chr1 (64-172)||(9346133-9346243)
chr1 (64-147)||(22601225-22601307)
chr1 (153-233)||(2267977-2268057)
chr1 (76-142)||(34256164-34256231)
chr1 (64-121)||(2834012-2834069)
chr1 (64-233)||(18614272-18614446)
chr1 (70-165)||(26280668-26280763)
chr1 (80-142)||(7745697-7745759)
chr1 (64-147)||(16233765-16233848)
chr1 (76-142)||(17370408-17370474)
chr1 (76-142)||(21541171-21541237)
chr1 (64-147)||(27858132-27858213)
chr1 (64-172)||(18130592-18130705)
chr1 (74-139)||(20251169-20251234)
chr1 (74-139)||(23926427-23926492)
chr1 (74-139)||(28379358-28379423)
chr1 (64-147)||(12944701-12944783)
chr1 (64-147)||(21684599-21684682)
chr1 (76-139)||(26548908-26548971)
chr1 (76-142)||(22642230-22642296)
chr1 (74-139)||(674947-675012)
chr1 (74-139)||(11195710-11195775)
chr1 (74-139)||(19037372-19037437)
chr1 (74-139)||(19170977-19171042)
chr1 (74-147)||(20196325-20196398)
chr1 (76-137)||(22018698-22018759)
chr1 (74-139)||(23058959-23059024)
chr1 (65-145)||(26702970-26703049)
chr1 (67-139)||(45071244-45071315)
chr1 (65-148)||(154920-155002)
chr1 (65-148)||(5973252-5973334)
chr1 (64-139)||(8698249-8698324)
chr1 (64-100)||(23053730-23053766)
[»] chr7 (102 HSPs)
chr7 (64-233)||(13138531-13138702)
chr7 (68-233)||(15087906-15088072)
chr7 (64-233)||(19328647-19328817)
chr7 (68-221)||(22579830-22579984)
chr7 (64-233)||(16557224-16557395)
chr7 (64-233)||(16608267-16608438)
chr7 (64-236)||(13879521-13879697)
chr7 (64-236)||(2914241-2914417)
chr7 (64-233)||(9069111-9069281)
chr7 (64-221)||(9710450-9710610)
chr7 (71-233)||(23280587-23280751)
chr7 (64-233)||(48237475-48237647)
chr7 (64-233)||(33421103-33421273)
chr7 (64-233)||(33692335-33692506)
chr7 (64-233)||(44466445-44466618)
chr7 (64-231)||(35954542-35954711)
chr7 (64-233)||(10883805-10883977)
chr7 (64-233)||(13034470-13034644)
chr7 (64-233)||(21284007-21284180)
chr7 (80-233)||(30945993-30946148)
chr7 (64-233)||(331002-331174)
chr7 (64-233)||(12174974-12175144)
chr7 (67-230)||(19711650-19711814)
chr7 (64-233)||(27871069-27871240)
chr7 (64-221)||(13302212-13302372)
chr7 (64-233)||(13731308-13731481)
chr7 (64-233)||(15467269-15467440)
chr7 (64-233)||(4820838-4821007)
chr7 (64-233)||(11318756-11318929)
chr7 (64-231)||(28622995-28623166)
chr7 (64-230)||(14187040-14187210)
chr7 (64-231)||(2266151-2266319)
chr7 (64-233)||(16545971-16546142)
chr7 (64-233)||(16619520-16619691)
chr7 (64-233)||(29935977-29936151)
chr7 (64-233)||(16315173-16315344)
chr7 (64-233)||(16310540-16310713)
chr7 (64-233)||(41843057-41843230)
chr7 (80-221)||(1292458-1292601)
chr7 (80-221)||(14424884-14425027)
chr7 (64-233)||(15574215-15574385)
chr7 (64-233)||(15705122-15705292)
chr7 (64-233)||(16317188-16317360)
chr7 (80-233)||(24795349-24795504)
chr7 (64-233)||(48063446-48063617)
chr7 (64-233)||(4493926-4494100)
chr7 (72-233)||(19237668-19237833)
chr7 (64-233)||(32265354-32265525)
chr7 (80-233)||(19339883-19340038)
chr7 (64-221)||(33604258-33604418)
chr7 (64-233)||(13027534-13027705)
chr7 (64-233)||(11792261-11792434)
chr7 (64-233)||(12367370-12367543)
chr7 (68-233)||(13261248-13261417)
chr7 (64-221)||(13645802-13645962)
chr7 (80-233)||(21382063-21382218)
chr7 (80-233)||(48806514-48806669)
chr7 (64-227)||(5001465-5001632)
chr7 (64-233)||(9099672-9099842)
chr7 (64-221)||(39285148-39285309)
chr7 (64-199)||(9098897-9099036)
chr7 (68-215)||(13259053-13259204)
chr7 (68-215)||(13266393-13266544)
chr7 (91-233)||(14425926-14426071)
chr7 (64-220)||(30025286-30025446)
chr7 (64-164)||(8182311-8182412)
chr7 (64-180)||(24787712-24787832)
chr7 (64-172)||(2499414-2499526)
chr7 (119-233)||(21691767-21691885)
chr7 (119-233)||(13683004-13683121)
chr7 (64-233)||(13902245-13902418)
chr7 (147-233)||(13473130-13473217)
chr7 (64-165)||(21211245-21211350)
chr7 (64-172)||(16411360-16411470)
chr7 (76-142)||(4433266-4433333)
chr7 (167-233)||(16112519-16112585)
chr7 (76-142)||(4412693-4412761)
chr7 (64-172)||(16308405-16308518)
chr7 (87-233)||(7488537-7488686)
chr7 (107-165)||(16155466-16155525)
chr7 (64-172)||(5034646-5034755)
chr7 (64-147)||(16105652-16105734)
chr7 (64-193)||(26042760-26042890)
chr7 (80-142)||(602132-602195)
chr7 (64-119)||(13681646-13681700)
chr7 (74-139)||(13175293-13175358)
chr7 (64-139)||(3477018-3477092)
chr7 (64-147)||(17064199-17064281)
chr7 (64-94)||(4832101-4832131)
chr7 (74-139)||(8933121-8933186)
chr7 (74-139)||(8999623-8999688)
chr7 (74-139)||(12734842-12734907)
chr7 (74-139)||(15215873-15215938)
chr7 (74-139)||(18440752-18440817)
chr7 (74-139)||(26210226-26210291)
chr7 (74-139)||(29589545-29589610)
chr7 (74-139)||(38403890-38403955)
chr7 (74-139)||(13681878-13681942)
chr7 (184-221)||(13731260-13731297)
chr7 (65-148)||(3165285-3165367)
chr7 (65-148)||(20490557-20490639)
chr7 (65-148)||(44280074-44280156)
[»] chr4 (96 HSPs)
chr4 (65-230)||(54679279-54679446)
chr4 (64-233)||(45832737-45832907)
chr4 (64-233)||(19665715-19665888)
chr4 (64-231)||(22676114-22676283)
chr4 (64-233)||(13576705-13576877)
chr4 (64-221)||(19884083-19884242)
chr4 (64-233)||(56033923-56034094)
chr4 (64-233)||(6641035-6641206)
chr4 (64-233)||(16631790-16631963)
chr4 (64-233)||(16939351-16939521)
chr4 (80-233)||(20976824-20976979)
chr4 (64-233)||(37436128-37436294)
chr4 (80-233)||(3500242-3500395)
chr4 (69-236)||(10072289-10072458)
chr4 (64-233)||(11900541-11900714)
chr4 (67-233)||(29120718-29120887)
chr4 (67-218)||(19610939-19611091)
chr4 (64-233)||(6516838-6517008)
chr4 (64-221)||(14605505-14605666)
chr4 (80-233)||(17701345-17701500)
chr4 (80-233)||(38513274-38513429)
chr4 (64-233)||(16852853-16853026)
chr4 (64-221)||(3395000-3395160)
chr4 (67-233)||(11915054-11915225)
chr4 (64-233)||(55379660-55379834)
chr4 (64-233)||(3106008-3106179)
chr4 (64-233)||(17399264-17399435)
chr4 (64-227)||(17788633-17788801)
chr4 (64-233)||(37986200-37986373)
chr4 (83-233)||(56533651-56533803)
chr4 (64-234)||(41115343-41115518)
chr4 (64-233)||(14154584-14154756)
chr4 (64-233)||(16847897-16848070)
chr4 (69-233)||(19912468-19912635)
chr4 (80-233)||(55731214-55731368)
chr4 (80-196)||(39420332-39420449)
chr4 (64-233)||(8103634-8103808)
chr4 (64-233)||(22190196-22190367)
chr4 (64-233)||(23749874-23750047)
chr4 (77-220)||(14904898-14905043)
chr4 (64-233)||(40860021-40860192)
chr4 (64-233)||(12600110-12600280)
chr4 (80-233)||(27189233-27189388)
chr4 (67-233)||(15475733-15475905)
chr4 (64-233)||(8686029-8686204)
chr4 (75-233)||(15014973-15015136)
chr4 (69-196)||(29681142-29681272)
chr4 (80-221)||(9752141-9752284)
chr4 (67-165)||(36470322-36470424)
chr4 (64-233)||(15135079-15135253)
chr4 (133-233)||(25651684-25651784)
chr4 (68-226)||(10661760-10661923)
chr4 (68-226)||(10875905-10876068)
chr4 (64-168)||(23120887-23120992)
chr4 (69-233)||(16475966-16476134)
chr4 (64-172)||(18773445-18773553)
chr4 (64-145)||(22089636-22089717)
chr4 (66-233)||(10249286-10249456)
chr4 (64-147)||(14903090-14903173)
chr4 (64-147)||(20571672-20571755)
chr4 (151-233)||(17539840-17539923)
chr4 (67-147)||(14190088-14190169)
chr4 (73-233)||(18473426-18473585)
chr4 (64-172)||(13027136-13027246)
chr4 (64-147)||(13693198-13693280)
chr4 (64-147)||(19889657-19889740)
chr4 (160-221)||(23122969-23123030)
chr4 (64-233)||(16325087-16325255)
chr4 (64-114)||(17246980-17247030)
chr4 (64-147)||(24628577-24628660)
chr4 (65-118)||(10071906-10071959)
chr4 (74-139)||(31267396-31267460)
chr4 (64-147)||(13890185-13890268)
chr4 (67-103)||(36470268-36470304)
chr4 (74-139)||(14711382-14711447)
chr4 (74-139)||(14779046-14779111)
chr4 (74-139)||(19241610-19241675)
chr4 (64-101)||(14357709-14357746)
chr4 (64-147)||(11535427-11535509)
chr4 (64-130)||(19621679-19621743)
chr4 (74-148)||(3370306-3370380)
chr4 (76-142)||(33377772-33377838)
chr4 (74-147)||(10290217-10290290)
chr4 (74-147)||(10300126-10300199)
chr4 (74-139)||(11514626-11514691)
chr4 (74-139)||(18775286-18775351)
chr4 (74-139)||(23508734-23508799)
chr4 (74-147)||(24713019-24713092)
chr4 (67-139)||(36210713-36210784)
chr4 (64-147)||(2651199-2651282)
chr4 (64-107)||(16847740-16847784)
chr4 (74-134)||(17994362-17994421)
chr4 (76-139)||(18007692-18007755)
chr4 (64-96)||(20575640-20575672)
chr4 (65-148)||(40454942-40455024)
chr4 (65-148)||(40471180-40471262)
[»] chr6 (92 HSPs)
chr6 (64-233)||(15532248-15532418)
chr6 (64-233)||(17380932-17381103)
chr6 (64-233)||(21624447-21624617)
chr6 (71-221)||(10631497-10631648)
chr6 (64-233)||(13601522-13601695)
chr6 (64-233)||(21234514-21234686)
chr6 (64-233)||(13435241-13435410)
chr6 (64-233)||(20731326-20731497)
chr6 (64-221)||(18377798-18377956)
chr6 (64-221)||(9717199-9717358)
chr6 (64-220)||(19952206-19952360)
chr6 (64-233)||(15986709-15986883)
chr6 (80-233)||(26588970-26589126)
chr6 (64-233)||(15301571-15301743)
chr6 (64-233)||(16876259-16876432)
chr6 (64-221)||(32543621-32543780)
chr6 (64-233)||(12716043-12716216)
chr6 (64-221)||(15954054-15954212)
chr6 (65-229)||(16528667-16528836)
chr6 (64-233)||(14101058-14101231)
chr6 (64-233)||(22801495-22801667)
chr6 (64-221)||(12422620-12422778)
chr6 (80-233)||(17317116-17317271)
chr6 (64-233)||(33352850-33353020)
chr6 (64-221)||(20113269-20113430)
chr6 (75-233)||(19688150-19688308)
chr6 (64-233)||(21617602-21617772)
chr6 (64-233)||(14732737-14732911)
chr6 (64-233)||(19470023-19470196)
chr6 (64-233)||(19623335-19623508)
chr6 (80-233)||(19066640-19066795)
chr6 (64-233)||(19833600-19833771)
chr6 (64-221)||(22077009-22077167)
chr6 (64-233)||(25593424-25593597)
chr6 (64-233)||(26941791-26941966)
chr6 (64-233)||(19085514-19085687)
chr6 (64-233)||(19482108-19482279)
chr6 (70-233)||(29917389-29917550)
chr6 (64-233)||(25591978-25592150)
chr6 (67-233)||(24116186-24116356)
chr6 (64-233)||(18434894-18435068)
chr6 (64-188)||(3680469-3680596)
chr6 (64-233)||(17303893-17304065)
chr6 (64-233)||(25929834-25930006)
chr6 (76-233)||(7763020-7763183)
chr6 (64-233)||(17927148-17927320)
chr6 (77-233)||(12347461-12347620)
chr6 (92-233)||(16914808-16914954)
chr6 (64-233)||(19625166-19625340)
chr6 (64-221)||(23296142-23296302)
chr6 (64-147)||(24719443-24719526)
chr6 (64-175)||(29537968-29538082)
chr6 (75-142)||(12041218-12041286)
chr6 (65-171)||(32335199-32335307)
chr6 (64-172)||(18172904-18173014)
chr6 (64-172)||(18226787-18226897)
chr6 (64-233)||(17876797-17876966)
chr6 (80-143)||(14052095-14052159)
chr6 (80-143)||(14070786-14070850)
chr6 (64-233)||(24729142-24729312)
chr6 (174-233)||(29597543-29597602)
chr6 (71-172)||(23006683-23006786)
chr6 (71-172)||(23781580-23781683)
chr6 (64-147)||(14923885-14923967)
chr6 (74-139)||(11205493-11205558)
chr6 (78-172)||(15395305-15395401)
chr6 (77-233)||(17867027-17867183)
chr6 (64-147)||(26185141-26185224)
chr6 (64-139)||(15478464-15478538)
chr6 (76-142)||(20635089-20635155)
chr6 (74-139)||(7586874-7586939)
chr6 (74-139)||(17609024-17609089)
chr6 (74-139)||(21127597-21127662)
chr6 (64-172)||(21034386-21034497)
chr6 (64-97)||(24398204-24398237)
chr6 (64-97)||(25595650-25595683)
chr6 (64-147)||(14883657-14883740)
chr6 (64-147)||(15551382-15551465)
chr6 (76-139)||(25678934-25678997)
chr6 (119-233)||(17446273-17446387)
chr6 (76-142)||(22386172-22386238)
chr6 (74-139)||(11235016-11235081)
chr6 (87-148)||(16124134-16124195)
chr6 (74-147)||(17746384-17746457)
chr6 (74-139)||(18554818-18554883)
chr6 (74-147)||(18835233-18835306)
chr6 (74-147)||(29765059-29765132)
chr6 (67-139)||(12953713-12953784)
chr6 (74-147)||(31571938-31572011)
chr6 (190-222)||(19623525-19623557)
chr6 (65-148)||(26043728-26043810)
chr6 (64-147)||(27167042-27167124)
[»] chr5 (79 HSPs)
chr5 (64-233)||(31487590-31487760)
chr5 (64-232)||(13546138-13546306)
chr5 (64-233)||(17814316-17814489)
chr5 (75-221)||(13736699-13736847)
chr5 (64-233)||(7746306-7746479)
chr5 (64-233)||(12353406-12353580)
chr5 (64-233)||(25097438-25097611)
chr5 (64-233)||(25155408-25155581)
chr5 (64-233)||(28464951-28465121)
chr5 (80-233)||(15516340-15516494)
chr5 (64-233)||(6513043-6513216)
chr5 (64-233)||(30116450-30116620)
chr5 (64-233)||(10848125-10848296)
chr5 (64-233)||(21100314-21100488)
chr5 (67-233)||(21659568-21659735)
chr5 (88-233)||(19536910-19537058)
chr5 (64-233)||(26766448-26766620)
chr5 (68-233)||(26783710-26783878)
chr5 (64-233)||(33022015-33022189)
chr5 (64-233)||(42243035-42243205)
chr5 (64-221)||(22000651-22000812)
chr5 (80-233)||(26764873-26765028)
chr5 (64-233)||(31117231-31117403)
chr5 (64-231)||(4886316-4886485)
chr5 (64-233)||(11993241-11993414)
chr5 (64-233)||(28138957-28139131)
chr5 (64-233)||(643312-643485)
chr5 (68-233)||(23880422-23880591)
chr5 (64-233)||(33932621-33932792)
chr5 (64-233)||(35932620-35932791)
chr5 (64-221)||(3246067-3246225)
chr5 (64-221)||(9088323-9088481)
chr5 (64-221)||(29139030-29139188)
chr5 (64-233)||(21199612-21199785)
chr5 (64-233)||(23413586-23413759)
chr5 (64-233)||(30742335-30742506)
chr5 (67-233)||(9399227-9399398)
chr5 (80-221)||(35986858-35987001)
chr5 (68-233)||(90034-90204)
chr5 (91-233)||(23392218-23392362)
chr5 (107-221)||(14087165-14087281)
chr5 (64-144)||(6498665-6498746)
chr5 (123-233)||(21072848-21072962)
chr5 (64-233)||(20968600-20968768)
chr5 (64-142)||(25112584-25112662)
chr5 (64-142)||(25171675-25171753)
chr5 (64-147)||(39799542-39799625)
chr5 (76-142)||(32160112-32160179)
chr5 (64-135)||(37395517-37395589)
chr5 (80-142)||(11208715-11208778)
chr5 (64-233)||(16606868-16607038)
chr5 (80-180)||(31146271-31146372)
chr5 (64-172)||(26251302-26251412)
chr5 (74-199)||(25156679-25156807)
chr5 (75-147)||(31589643-31589715)
chr5 (132-168)||(13736268-13736304)
chr5 (64-124)||(21075909-21075968)
chr5 (64-139)||(40228011-40228085)
chr5 (65-139)||(26120531-26120605)
chr5 (74-139)||(20215826-20215891)
chr5 (74-139)||(23477738-23477803)
chr5 (74-139)||(23487914-23487979)
chr5 (74-139)||(40033448-40033513)
chr5 (64-127)||(25770360-25770423)
chr5 (74-139)||(13522587-13522652)
chr5 (74-139)||(13533344-13533409)
chr5 (74-139)||(20168757-20168822)
chr5 (74-139)||(20417620-20417685)
chr5 (74-139)||(20625484-20625549)
chr5 (74-139)||(35543818-35543883)
chr5 (184-221)||(89986-90023)
chr5 (64-109)||(26056227-26056272)
chr5 (64-139)||(106837-106911)
chr5 (65-148)||(1108615-1108697)
chr5 (65-148)||(1121373-1121455)
chr5 (65-148)||(19464679-19464761)
chr5 (65-148)||(19478709-19478791)
chr5 (64-92)||(19546279-19546307)
chr5 (64-139)||(21420231-21420305)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (68-218)||(6289-6440)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (68-233)||(236-402)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (64-221)||(38780748-38780906)
chr2 (64-233)||(20569327-20569500)
chr2 (64-233)||(22188681-22188852)
chr2 (64-233)||(25037838-25038011)
chr2 (68-221)||(23234364-23234518)
chr2 (64-221)||(25828513-25828672)
chr2 (75-233)||(13964556-13964712)
chr2 (64-233)||(30557898-30558073)
chr2 (64-233)||(22316943-22317114)
chr2 (64-233)||(24575385-24575558)
chr2 (64-236)||(6574672-6574847)
chr2 (66-233)||(22257554-22257724)
chr2 (64-233)||(22455534-22455709)
chr2 (64-233)||(25188749-25188923)
chr2 (64-226)||(18702091-18702258)
chr2 (64-233)||(40331461-40331631)
chr2 (80-233)||(34322511-34322665)
chr2 (64-218)||(20152593-20152752)
chr2 (64-233)||(39038217-39038391)
chr2 (64-233)||(24376457-24376631)
chr2 (80-233)||(28701791-28701945)
chr2 (65-221)||(40781828-40781987)
chr2 (64-233)||(10010328-10010501)
chr2 (64-233)||(28141178-28141351)
chr2 (64-233)||(19539767-19539940)
chr2 (64-233)||(40331138-40331309)
chr2 (64-233)||(1587610-1587781)
chr2 (67-233)||(23184878-23185048)
chr2 (67-233)||(23596141-23596311)
chr2 (64-233)||(24851239-24851412)
chr2 (64-233)||(26366984-26367157)
chr2 (64-233)||(31801465-31801638)
chr2 (80-233)||(22801838-22801993)
chr2 (84-233)||(28712277-28712427)
chr2 (64-234)||(18431513-18431687)
chr2 (64-233)||(41122262-41122434)
chr2 (64-233)||(16494698-16494869)
chr2 (64-233)||(22271481-22271656)
chr2 (64-231)||(45087562-45087731)
chr2 (71-233)||(17963844-17964008)
chr2 (64-233)||(44839784-44839955)
chr2 (80-216)||(35744572-35744709)
chr2 (87-233)||(22786233-22786381)
chr2 (64-221)||(28551509-28551668)
chr2 (106-233)||(33073621-33073749)
chr2 (80-233)||(22782193-22782348)
chr2 (83-180)||(6392033-6392134)
chr2 (64-233)||(31328540-31328713)
chr2 (64-233)||(31335261-31335434)
chr2 (64-161)||(21537835-21537935)
chr2 (64-229)||(24838456-24838624)
chr2 (119-221)||(27296846-27296953)
chr2 (64-199)||(26623064-26623203)
chr2 (67-233)||(24778726-24778896)
chr2 (87-233)||(24843579-24843728)
chr2 (64-147)||(21845513-21845596)
chr2 (65-143)||(22797779-22797857)
chr2 (74-142)||(1083373-1083442)
chr2 (119-180)||(14580972-14581033)
chr2 (76-165)||(44880638-44880731)
chr2 (64-147)||(22382836-22382919)
chr2 (75-233)||(20567525-20567683)
chr2 (75-147)||(15671240-15671312)
chr2 (67-233)||(21911409-21911575)
chr2 (64-114)||(38631104-38631154)
chr2 (74-142)||(23393339-23393407)
chr2 (67-139)||(38033424-38033495)
chr2 (64-148)||(14794456-14794539)
chr2 (80-134)||(31968460-31968515)
chr2 (67-139)||(38040583-38040654)
chr2 (76-142)||(24802220-24802286)
chr2 (64-134)||(33302663-33302733)
chr2 (64-134)||(33303398-33303468)
chr2 (74-139)||(17970885-17970950)
chr2 (74-139)||(19313609-19313674)
chr2 (74-139)||(19498582-19498647)
chr2 (74-139)||(36785416-36785481)
chr2 (183-231)||(10899093-10899142)
chr2 (190-226)||(10010275-10010311)
chr2 (76-139)||(20647231-20647294)
chr2 (65-148)||(22915470-22915552)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (70-233)||(18394-18559)
scaffold0217 (80-233)||(22713-22867)
scaffold0217 (66-122)||(610-666)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (64-233)||(19206-19378)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (65-233)||(25817-25989)
scaffold0163 (74-139)||(29024-29089)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (64-233)||(523-695)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (64-231)||(7282-7451)
scaffold0026 (77-221)||(59449-59593)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (64-233)||(83749-83921)
scaffold0009 (64-233)||(268139-268311)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (64-233)||(28009-28182)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (64-233)||(2599-2770)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (68-233)||(9317-9487)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (64-233)||(65989-66159)
scaffold0011 (64-221)||(145046-145204)
scaffold0011 (64-147)||(58921-59004)
scaffold0011 (76-142)||(165309-165376)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (64-233)||(9262-9434)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (64-221)||(3264-3422)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (64-233)||(16300-16470)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (64-233)||(24361-24532)
scaffold0028 (68-233)||(80756-80926)
scaffold0028 (65-148)||(14130-14212)
scaffold0028 (65-148)||(54750-54832)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (64-221)||(211712-211873)
scaffold0005 (74-139)||(60619-60684)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (64-233)||(378129-378303)
scaffold0004 (80-233)||(210773-210927)
scaffold0004 (64-233)||(219596-219769)
scaffold0004 (64-233)||(244861-245035)
scaffold0004 (67-233)||(87768-87935)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (66-233)||(7182-7351)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (64-233)||(1966-2139)
[»] scaffold0084 (4 HSPs)
scaffold0084 (71-233)||(48695-48861)
scaffold0084 (64-221)||(31942-32103)
scaffold0084 (76-142)||(1065-1132)
scaffold0084 (74-139)||(57421-57486)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (64-233)||(1015-1188)
[»] scaffold1657 (1 HSPs)
scaffold1657 (69-233)||(1204-1371)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (64-229)||(8015-8185)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (65-230)||(32370-32539)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (64-233)||(73938-74112)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (64-233)||(63694-63868)
scaffold0007 (69-233)||(46025-46194)
scaffold0007 (121-233)||(142511-142624)
[»] scaffold0479 (2 HSPs)
scaffold0479 (64-221)||(9320-9481)
scaffold0479 (190-221)||(9510-9541)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (64-233)||(2641-2814)
scaffold0040 (73-142)||(6812-6881)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (64-233)||(2337-2509)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (64-233)||(14474-14646)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (119-233)||(90639-90754)
scaffold0003 (64-172)||(72-182)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (64-233)||(11553-11725)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (86-233)||(1404-1552)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (64-233)||(16710-16883)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (80-221)||(7335-7480)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (64-233)||(44442-44617)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (64-233)||(18349-18520)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (64-233)||(10689-10862)
scaffold0161 (64-233)||(15353-15526)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (64-233)||(88184-88355)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (68-199)||(5575-5711)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (64-214)||(102926-103081)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (68-233)||(2591-2761)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (64-233)||(7985-8164)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (64-233)||(78938-79113)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (64-233)||(13400-13573)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (91-233)||(106-250)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (64-196)||(36786-36921)
scaffold0022 (64-196)||(134846-134981)
scaffold0022 (132-233)||(158535-158640)
scaffold0022 (64-100)||(158501-158537)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (80-168)||(24003-24092)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (64-221)||(35340-35500)
scaffold0056 (141-233)||(26251-26345)
scaffold0056 (64-122)||(26348-26406)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (64-234)||(20049-20224)
scaffold0035 (119-233)||(99850-99964)
scaffold0035 (64-233)||(29152-29324)
scaffold0035 (80-113)||(110303-110336)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (86-233)||(144284-144436)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (84-233)||(111233-111385)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (64-233)||(2374-2535)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (80-211)||(5874-6007)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (91-233)||(1238-1383)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (64-221)||(2569-2728)
scaffold0116 (132-233)||(21587-21694)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (64-200)||(37361-37500)
scaffold0120 (119-200)||(41560-41644)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (74-199)||(76612-76739)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (64-233)||(2017-2189)
scaffold0622 (69-147)||(4033-4111)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (65-233)||(679-849)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (65-233)||(562-732)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (64-221)||(5046-5208)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (119-180)||(5511-5572)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (121-201)||(13800-13883)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (76-142)||(154-221)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (76-141)||(9335-9401)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (151-233)||(8602-8684)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (65-122)||(14323-14380)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (65-122)||(1365-1422)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (64-142)||(1190-1268)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (76-142)||(38762-38829)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (156-221)||(13083-13148)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (64-146)||(2804-2887)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (64-147)||(9658-9741)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (64-147)||(3665-3748)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (64-103)||(7249-7288)
scaffold0334 (190-233)||(7310-7354)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (64-233)||(19434-19603)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (76-142)||(2461-2528)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (64-122)||(7173-7230)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (67-139)||(59537-59608)
scaffold0017 (74-139)||(40993-41058)
scaffold0017 (74-139)||(174934-174999)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (76-143)||(4484-4551)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (64-147)||(111763-111846)
scaffold0002 (74-139)||(475932-475997)
scaffold0002 (74-139)||(482452-482517)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (76-142)||(26-92)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (76-142)||(5770-5836)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (74-139)||(1652-1717)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (74-139)||(35089-35154)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (74-139)||(61096-61161)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (64-139)||(15272-15346)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (76-142)||(1613-1679)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (76-142)||(1806-1872)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (84-233)||(1458-1607)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (76-142)||(19930-19996)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (64-138)||(21055-21128)
[»] scaffold0752 (1 HSPs)
scaffold0752 (74-139)||(784-849)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (74-139)||(5441-5506)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (74-139)||(11097-11162)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (74-139)||(12755-12820)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (74-139)||(40055-40120)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (74-139)||(4850-4915)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (67-139)||(2353-2424)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (67-139)||(10402-10473)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (64-109)||(18557-18602)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (74-139)||(225-290)
scaffold0090 (74-139)||(4605-4670)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (75-139)||(127197-127261)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (65-148)||(1758-1840)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (65-148)||(44-126)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (65-148)||(8696-8778)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (179-234)||(853-909)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 16206619 - 16206776
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16206619 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattac 16206718  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16206719 aattgctcaatgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaacagcaagag 16206776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23264426 - 23264257
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23264426 gaaagacataaaacaattatataggttccatccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgagagttcactatgtaatatctgatta 23264327  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23264326 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttc-aatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 23264257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 233
Target Start/End: Original strand, 39692901 - 39693054
Alignment:
Q  81 tatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39692901 tatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagtagagttcactatgtaatatctgattacaactgctcactcctaa 39693000  T
Q  180 aactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39693001 aactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 39693054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45539239 - 45539080
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  45539239 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccccttgcacttccaaggagatttcactacgtaatatcttatta 45539140  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcac-aactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45539139 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaaactgcaagag 45539080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17442620 - 17442450
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17442620 gaaagacacagagaaattatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccgaggagagttcactatgtaatatctgatta 17442521  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17442520 caattgctcactactaaaaatagaaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17442450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18121911 - 18121738
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  18121911 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactactatgtaatatctga 18121812  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  18121811 ttacaattgctcactgctaaaaccatcaagagacttcaaatgttcaagcacaactacaagagacttcctatgct 18121738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 17796770 - 17796929
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17796770 gaaagacacaaaacagttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcaccatgtaatatctgatta 17796869  T
Q  163 caattgctcactgct-aaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17796870 caattgctcactactaaaaactagcaagagacttcaaatggtcaagcacaactgcaagag 17796929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 21932231 - 21932402
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932231 gaaagacacaaagcaattatagaggttactttcacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagttcactatgtaatatctgatta 21932330  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  21932331 caattgctcactgctaaaactagcaacatacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 21932402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18152478 - 18152310
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18152478 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 18152380  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatg 231  Q
    |||| |||||| | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18152379 acaaatgctcattactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatg 18152310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15934464 - 15934290
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  15934464 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 15934366  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15934365 attacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagatatttcctatgct 15934290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 22673164 - 22673318
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22673164 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 22673263  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22673264 aacttattaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22673318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 29692667 - 29692833
Alignment:
Q  71 acaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaat 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  29692667 acaaagcaattatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaac 29692766  T
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    | |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  29692767 tactcactactaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 29692833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12758539 - 12758367
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12758539 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcactgttaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 12758441  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12758440 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagactttaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 12758367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17526539 - 17526366
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17526539 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttttacaaaccggaagtcaattatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 17526440  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17526439 ttacaactgctcactgctaaacatagcaagagagttcaaatgctgaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17526366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33561001 - 33560846
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33561001 ttatacaggttccttgcacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactgcta 33560902  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  33560901 aaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagatacttcctatgct 33560846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14990877 - 14990723
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccct-tgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14990877 ttatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagttatgtcccccctgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 14990778  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14990777 aacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14990723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20256315 - 20256141
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  20256315 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaaat-agtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 20256217  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaac-tgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20256216 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactacccaagcacaacttgcaagagatttcctatgct 20256141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15336892 - 15336718
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  15336892 gaaagacacaaagcaatttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctg 15336793  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| ||||| |||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15336792 attgcaatttctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15336718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15425957 - 15425783
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  15425957 gaaagacacaaagcaatttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctg 15425858  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| ||||| |||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15425857 attgcaatttctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15425783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15517261 - 15517087
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  15517261 gaaagacacaaagcaatttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctg 15517162  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| ||||| |||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15517161 attgcaatttctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15517087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 19942584 - 19942757
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19942584 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 19942682  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19942683 ttacaactgctcactgctaaacttagaaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 19942757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14990282 - 14990112
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14990282 gaaagacacaa-gcaatttatacagattccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatataatatctgatt 14990184  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14990183 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14990112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16682056 - 16681883
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  16682056 gaaagacacaaaacaattatacaagttctttccacaaaccagaagtcactcctgtccaccttgcacttctaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 16681957  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  16681956 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaaacacagctgcaagagacttcctatgct 16681883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 19153382 - 19153541
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  19153382 gaaagacacaaagcaattatacaacttccttccacaaact-gaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 19153479  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19153480 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacctcaaatgctcaagcacaactgcaagag 19153541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 43773484 - 43773639
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43773484 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctctctgcta 43773583  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  43773584 aaactagcaagagatttcaacttgcttaagcacaactgcaagatacttcctatgct 43773639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19957140 - 19956966
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19957140 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agccctatcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 19957042  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa--tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19957041 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttaaaacttactcaatcacaactgcaagagatttcctatgct 19956966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 18679162 - 18679335
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    |||||||||||    
T  18679162 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacatccaaggacagttcactaaaaatgtaatatctg 18679260  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  18679261 attacaaatgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaattctcaaacacaacttcaagagacttcctatgct 18679335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 18718351 - 18718524
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    |||||||||||    
T  18718351 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacatccaaggacagttcactaaaaatgtaatatctg 18718449  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  18718450 attacaaatgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaattctcaaacacaacttcaagagacttcctatgct 18718524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 26832424 - 26832597
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgt---aatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||      |||||||||    
T  26832424 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaacaggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaagaaaatatctga 26832522  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26832523 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 26832597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 22662451 - 22662606
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22662451 ttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 22662550  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctc-aagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22662551 aacttagtaagagacttcaaatgctcaaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22662606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40846191 - 40846018
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctg---a 159  Q
    |||||||||||   | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  40846191 gaaagacacaatcaatttatacaagtttcttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 40846092  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40846091 ttacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 40846018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30422204 - 30422070
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30422204 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatataatatctgatt 30422105  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttc 196  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  30422104 acaattgctcacaactaaaactagcaagagacttc 30422070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13431422 - 13431251
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13431422 gaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcactttcaaggggagttcactatgtaatatctgattg 13431323  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13431322 caaatgctcactactaaacttagtaaaagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 13431251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 18772047 - 18772214
Alignment:
Q  71 acaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcactat----gtaatatctgattacaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  18772047 acaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccagaagt-agtcctgtccccctcgcacttccaaggagagttcactaaaaaagtaatatctgattacaa 18772145  T
Q  166 ttgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18772146 ctgctcactgctaacactagcaagagacttcaaactactcaagtacaactgcaagagatttcctatgct 18772214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 25163423 - 25163589
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctgattac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25163423 gacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagt-agacttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattac 25163521  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctat 230  Q
    || |||||||| |||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25163522 aactgctcactactaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctat 25163589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 9319916 - 9320090
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  9319916 gaaagacacaaaacaatttatacaggttcataccataaaccggaagtcagacctatcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctg 9320015  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9320016 attacaattgctcactgctaaactttgcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 9320090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 43639147 - 43639301
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  43639147 ttatacatgttccttccacaa-ctggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 43639245  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43639246 aacttagtaagagacttcaaattgcttaagcacaactgcaagagacttcctatgct 43639301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 180
Target Start/End: Original strand, 6407106 - 6407223
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6407106 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacataccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 6407204  T
Q  162 acaattgctcactgctaaa 180  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  6407205 acaattgctcactactaaa 6407223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 165
Target Start/End: Original strand, 1744551 - 1744637
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1744551 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaagaggagttcactatgtaatatctgattacaa 1744637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18321959 - 18321787
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    |||||||||||    
T  18321959 gaaagacacaaagtaattatacatgttcctttcacaaaccggaagt-agttatgtcccccttgcacttccaaggaaagtttactaaaaagtaatatctga 18321861  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18321860 atacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcac-actgcaagagatttcctatgct 18321787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Original strand, 43644252 - 43644416
Alignment:
Q  71 acaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaat 166  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  43644252 acaaaacaattatacatgttccttccacaatccggaagt-agtcctgccccccttgcaattccaaggagagttcactaaaatataatatctgattacaac 43644350  T
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatg 231  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43644351 tgctcactgctaaaaccaacaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagattttctatg 43644416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 198
Target Start/End: Original strand, 19706864 - 19707002
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctg 158  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||     
T  19706864 gaaacacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatcta 19706962  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaa 198  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19706963 attacaacttctcactcctaaaactagcaagagacttcaa 19707002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Original strand, 2810285 - 2810378
Alignment:
Q  131 ccaaggagagttcactat--gtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2810285 ccaaggagagttcactaaaagtaatatttgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactgctcaagcacaactgcaagag 2810378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24679190 - 24679080
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  24679190 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatctggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgat 24679092  T
Q  161 tacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||    
T  24679091 tacaattgctca 24679080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Original strand, 45292221 - 45292354
Alignment:
Q  100 aaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaa 198  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |  |||||||||    
T  45292221 aaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagacttcaa 45292320  T
Q  199 a-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    | ||||||   |||||||||||||  ||||||||||    
T  45292321 attgctca--gacaactgcaagagacttcctatgct 45292354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20383140 - 20383060
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttca 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20383140 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagacttca 20383060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Original strand, 21540322 - 21540390
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttc 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21540322 gcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcacccttgcacttccaaggagagttc 21540390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 24645779 - 24645851
Alignment:
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  24645779 tacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 24645851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 17928437 - 17928519
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17928437 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttc-acaatccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 17928519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25850791 - 25850708
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25850791 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttccacaatccggaagt-tgtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 25850708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 21287762 - 21287829
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21287762 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaacgagagtt 21287829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 21298331 - 21298409
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  21298331 gaaagacacaga-caattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtt 21298409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 22707703 - 22707852
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcac 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||| || ||||| ||| ||||||||||||           ||||||| |||||||    
T  22707703 agcaattatacacgttccttccacaaacctgaagt-agtcctgacccccttacactttcaatgagagttcactaa----------attacaaatgctcac 22707791  T
Q  174 tgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22707792 tgctcaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagattccctatgct 22707852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 45568707 - 45568642
Alignment:
Q  78 aattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45568707 aattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagagtt 45568642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16376135 - 16376000
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  |   ||||||||||    
T  16376135 gaaagacacaa--caattatataggtttcttccacaaaccggaagt-agtcatgacccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatcaatatctgat 16376039  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa 199  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||||| ||||| ||||    
T  16376038 tacaactgctcactactcaaaatagcaagagactacaaa 16376000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 36104688 - 36104771
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaa-ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact 146  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36104688 gaaagacac-aagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagggttcact 36104771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 18557402 - 18557481
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18557402 agacacaaagcaattatagtggtttcttccacaatccggaagt-agtccactccccttgcacttccaaggagagttcacta 18557481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22462378 - 22462266
Alignment:
Q  126 cacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaaga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||  |||| ||||| |    
T  22462378 cacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctgattaaaactactcactgctaaaacttgcaagagactttaaactactcaaatacaagtgcaaca 22462279  T
Q  221 gttttcctatgct 233  Q
    | |||||||||||    
T  22462278 gatttcctatgct 22462266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19506142 - 19506063
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttca 144  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19506142 gaaagacacaa-gcaattatacaggttacttcgacaatccggaagt-agtcatgttccacttgcacttccaaggagagttca 19506063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 143
Target Start/End: Original strand, 40002575 - 40002653
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttc 143  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  40002575 gaaagacacaaa-caattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttctaaggagagttc 40002653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15969589 - 15969524
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  15969589 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccggtcccccttgcacttccaaggaga 15969524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 29378965 - 29379030
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  29378965 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 29379030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17519851 - 17519786
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||   |||  ||||||||||||||||||||||    
T  17519851 aagcaattatactggttccttccaaaaaccggaagtagttcagttccccttgcacttccaaggaga 17519786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20161934 - 20161852
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20161934 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 20161852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 148
Target Start/End: Original strand, 19417936 - 19418010
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19417936 aagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccctttgcacttccaaggagatttcactat 19418010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 148
Target Start/End: Original strand, 19428511 - 19428585
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19428511 aagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccctttgcacttccaaggagatttcactat 19428585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23470156 - 23470082
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23470156 aagcagttatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 23470082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 3843106 - 3843171
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  3843106 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 3843171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7019116 - 7019051
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagt-catgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  7019116 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccaatcccccttgcacttccaaggaga 7019051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20260314 - 20260249
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20260314 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 20260249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21046944 - 21046879
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  21046944 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 21046879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22136558 - 22136493
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  22136558 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 22136493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22167723 - 22167658
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  22167723 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 22167658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 221
Target Start/End: Original strand, 16206769 - 16206806
Alignment:
Q  184 agcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16206769 agcaagagacttcaaatgctcaagcacaactacaagag 16206806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 19128325 - 19128407
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19128325 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 19128407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 19224511 - 19224593
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19224511 aaagacacaaa-cagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 19224593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 20195562 - 20195644
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  20195562 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactat 20195644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23192573 - 23192490
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  23192573 gaaagacacagagcaattatacaagtttcttccacaattcggaagt-agtcctgtcccccttgcctttccaaggagaattcacta 23192490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 109)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 28581461 - 28581632
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28581461 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 28581560  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28581561 caattgctcactgctaaaactagcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 28581632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38178446 - 38178276
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38178446 gaaagacacaaagtaattatacaggttcattccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactatgtaatatctgatta 38178347  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38178346 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 38178276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 31302704 - 31302874
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31302704 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatacctgatta 31302803  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31302804 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 31302874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47406226 - 47406055
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47406226 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcatgtccccttgcacttcaaaggagaattcactatgtaatatctgatta 47406127  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47406126 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 47406055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49554300 - 49554132
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  49554300 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactacgtaatatctgat-- 49554203  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49554202 caattgttcactgctaaaactagcaaaagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 49554132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 17667761 - 17667931
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17667761 gaaagaaacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccgtaagtcagtcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcactatgaaatatctgatta 17667860  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17667861 caactgctcactactaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagtctttctatgct 17667931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 13823422 - 13823592
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823422 gaaagatacaaagcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 13823521  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  13823522 caattgctcactgctaaaaccatcaagagacttcaaatgttcaagcacaactacaagagacttcctatgct 13823592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53057533 - 53057374
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  53057533 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacgaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatataatatctgatt 53057434  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53057433 acaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 53057374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 14968723 - 14968889
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14968723 gacacaaagcaattatacaggtctgttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgaacttccaaggagagttgactatgtaatatctgattacaat 14968822  T
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14968823 tgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14968889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25399058 - 25398888
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25399058 gaaagacacaaaacaattatacaaattccttccacaaactggaagttagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 25398959  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25398958 caattgctcgctgctaaaactagcaagagacttcaaatgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 25398888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 220
Target Start/End: Original strand, 47207065 - 47207218
Alignment:
Q  70 cacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaatt 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47207065 cacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaatt 47207164  T
Q  168 gctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaaga 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47207165 gctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaaga 47207218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 40799252 - 40799424
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40799252 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggatagttcactatgtaatatctgatt 40799351  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40799352 acaattgctcacttctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 40799424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46350650 - 46350490
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46350650 gaaatacacaaatcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcttgtcccccttatacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 46350551  T
Q  163 caattgctcactgct-aaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46350550 caattgctcactgctaaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 46350490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1728803 - 1728648
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1728803 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaattgttcactgcta 1728704  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1728703 aaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 1728648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 13939251 - 13939411
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  13939251 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtt-gtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 13939349  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13939350 ttacaattgctcagtgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 13939411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49643566 - 49643393
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  49643566 gaaagacacaaagcaattatacagattccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 49643467  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49643466 ttacaactggtcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 49643393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 11222917 - 11223090
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagtt--cactatgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11222917 gaaagacacaaaacaatttatacaggttctttcctcaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttttcactatgtaatatctga 11223016  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11223017 ttacaattgctcaccgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 11223090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20628237 - 20628065
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20628237 gaaagacaaaaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactttgtaatatctgatt 20628138  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20628137 acaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 20628065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 20645509 - 20645681
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||    
T  20645509 gaaagacacaaagcaattatacatgtttcttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcaccaaaatttaatatctga 20645607  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20645608 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 20645681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 2025444 - 2025614
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2025444 gaaagacacaaacaatttatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 2025543  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  2025544 caaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgct 2025614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 11222169 - 11222330
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagtt--cactatgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11222169 gaaagacacaaaacaatttatacaggttccttcctcaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttttcactatgtaatatctga 11222268  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11222269 ttacaattgctcaccgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 11222330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 22128433 - 22128590
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  22128433 gaaagacataaaacaattatacaggttccttctacaaaccggaagtcagtcttgtcccctttgcacttccaaggagagt-cagtatgtaacatctgatta 22128531  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22128532 caattgctcactgttaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 22128590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 41494354 - 41494526
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  41494354 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtcaatcatgtccccctgcactttcaaggagagttcactataatgtaatatctgat 41494453  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41494454 tacaactgctcattgctaaacttaacaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 41494526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13781390 - 13781217
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  13781390 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacatccaaggagagttcactaaaatgaaatatctga 13781291  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13781290 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 13781217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Original strand, 11189377 - 11189519
Alignment:
Q  73 aaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11189377 aaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaacgagagttcactacgtaatatctgattacaattgctc 11189476  T
Q  172 actgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaact 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11189477 actgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaaccacaact 11189519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26418480 - 26418306
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  26418480 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtgccccttgcacttccaagtagagttcactaaaaatgtaatatctg 26418382  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26418381 attacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaatctactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 26418306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 29854766 - 29854928
Alignment:
Q  70 cacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaatt 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29854766 cacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactttgtaatatctgattacaatt 29854865  T
Q  168 gctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctat 230  Q
    ||| ||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29854866 gctaactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctat 29854928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46797199 - 46797041
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46797199 gaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactatgtaatatctgatta 46797100  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46797099 caattgatcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 46797041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18122416 - 18122245
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18122416 gaaagacacaaagcaattataaaggttccttccacaaatcgaaagtcagttttgtccccgttgcacttccaagaagagttcactatgtgatatctgatta 18122317  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  18122316 caattgctcactgctaaaactatcaagagacctcaaattgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgct 18122245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19889716 - 19889545
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||||    
T  19889716 gaaagacacaaagcaattatgtaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtccccttgcacttcgaatgagagttcactaaaatgtaatatctgat 19889618  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  19889617 taaaactgctaactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctaaagcacaactacaagagacttcctatgct 19889545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 2560541 - 2560714
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  2560541 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 2560639  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||    
T  2560640 attacaattgcttactgctaaacttatcaacagacttcaaatgctcaaacacaactgtaatagacttcctatgct 2560714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29952240 - 29952074
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  29952240 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccctttgcactttcaaggggagttcactaaaatgtaatatctga 29952142  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttc 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  29952141 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttc 29952074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30001394 - 30001228
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  30001394 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccctttgcactttcaaggggagttcactaaaatgtaatatctga 30001296  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttc 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  30001295 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttc 30001228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 52283144 - 52283303
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  52283144 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaactgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctg 52283243  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaa 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52283244 attacaatttctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaa 52283303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 40850332 - 40850503
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40850332 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgatt 40850430  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40850431 acaaatgctcactactaaacttagtaagagagttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 40850503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 3238051 - 3238219
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3238051 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattac 3238149  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  3238150 aattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattctcaagcgcaactgcaagcgacttcctatgct 3238219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12727039 - 12726866
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12727039 gaaagacacaaaacaattatataggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 12726940  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12726939 ttacaactgctcactactaaacttagcaagagacttcaaatgctaaagcacaactgcaagagacttcctatgct 12726866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 33582587 - 33582758
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33582587 gaaagacacaaacaatttatacaggttccttccaaaaaccgaaagtcagtcccgtctcccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 33582686  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33582687 caattgctcactactaaacatagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33582758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 2782834 - 2782993
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2782834 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactatgtaatatctgatt 2782932  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2782933 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaacagcaagag 2782993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17239726 - 17239554
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||    
T  17239726 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactaaaatgtaa-atctga 17239629  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17239628 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 17239554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 20724443 - 20724617
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||    
T  20724443 gaaagacacaaaacaattatataggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttactaaaaatgtaatatctg 20724541  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20724542 attacaactgctcactgctaaaattagcaagagacttcaaactactcaagcacaattgcaagagatttcctatgct 20724617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49669292 - 49669122
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49669292 gaaagacacaaacaatttatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctcatta 49669193  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||| ||| |||||  ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49669192 caaatgctaactactaaacttagtaagagacttcaaatgttaaagcacaactgcaagagacttcctatgct 49669122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 16031951 - 16032124
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctga 159  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    |||||||||| |    
T  16031951 gaaagacataaatcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagt-agtcttgtccccttgcacttctaagaagagttcactaaaaatgtaatatctaa 16032049  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16032050 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattactcaagcacaagtgcaagagatttcctatgct 16032124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23538962 - 23538793
Alignment:
Q  69 acacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctgattac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||    
T  23538962 acacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtccccattgcacttccaaggagagttcactaaaaatataatatctgattac 23538864  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23538863 aactgctcaatgctaaaactagcaagaaacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcttatgct 23538793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Original strand, 5212934 - 5213108
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaa-ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcat--gtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5212934 gaaagacac-aagcaatttatacagattccttccacaaaccgaaagttagtcctccccccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatcttat 5213032  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgcttct 236  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5213033 tacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgcttct 5213108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9700825 - 9700670
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  9700825 ttatacaggttccttccacaagccggaagtcagtcctgtccctcttgcacttccaagaggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 9700726  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9700725 aacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 9700670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21639076 - 21638918
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639076 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttcctcaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 21638978  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||| |  || |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21638977 acaattgtttgctactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactacaagag 21638918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30054963 - 30054828
Alignment:
Q  84 acaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaac 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||      
T  30054963 acaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcac-actaaact 30054865  T
Q  183 tagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaa 218  Q
    ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30054864 tagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaa 30054828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 21640238 - 21640393
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21640238 ttatacaggttccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccgcttgcacgtccaaggagagttcattatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 21640337  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21640338 aacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21640393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 6090082 - 6090244
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    ||||| ||||||    
T  6090082 gaaagacacaaagccattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagctcactaaaaatgtagtatctg 6090180  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6090181 attacaacttctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagtacaactgcaagag 6090244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 12967663 - 12967837
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||    
T  12967663 gaaagacacaaatcaattatacaagttccttccacaacccgaaagt-agtcatgtccccattgcactttcaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 12967761  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12967762 attacaactagtcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgct 12967837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14063793 - 14063619
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  14063793 gaaagagacaaaacaattataaaggttccttccacaaactggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 14063695  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14063694 attacaactgctcactgctaaaactagaaagagacttcaaactactcaagcacaagtgcaagagatttcatatgct 14063619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Original strand, 15902551 - 15902726
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||    
T  15902551 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcaaaagtcagttatgtcccccttgcacttccaaggagag-tcactaaaatgtaatttctga 15902649  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgcttct 236  Q
    |||||| | ||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||    
T  15902650 ttacaactactcactgctaaactttgcaagaggcttcaaatgctcaagcacaattacaagagacttcgtatgcttct 15902726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19250155 - 19249985
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||   | ||||||||||    
T  19250155 gaaagacacaaaacaattatacaggtttcttccacaaatcaaaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaatgaaagttcactaaaatataatatctga 19250057  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  19250056 ttacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaacaacaagagatttcctat 19249985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 50299606 - 50299748
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  50299606 ttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat-aaatatctgattacaaatgctcactacta 50299704  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50299705 aacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcgagag 50299748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1241860 - 1241719
Alignment:
Q  93 ttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaataga 192  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| || |||    
T  1241860 ttccacaaatcggaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaagagagttcactatttaatatctgattacaaatgctcacgactaaacttagtaagaga 1241761  T
Q  193 cttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1241760 cttcaaattactcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 1241719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12963889 - 12963716
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  12963889 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagt-aatcatgtcccccttacacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctga 12963791  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||| || ||||  |||||| ||  || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12963790 ttacaactgctcaatgataaacttagcaagagctttgaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 12963716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 14954801 - 14954944
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  14954801 ttatacaggttcctttcataaagcggaagtcagtcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacca 14954900  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||  ||| || |||||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  14954901 aacttagtaagagacttcaaattgatcaaacacaattgcaagag 14954944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22463820 - 22463677
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  22463820 ttatacagtttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactatta 22463721  T
Q  179 aaactagcaatagacttc-aaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||  ||| |  ||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  22463720 aacttagtatgagactccgaattgctcaagcacaactgcaagag 22463677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22465278 - 22465135
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  22465278 ttatacagtttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactatta 22465179  T
Q  179 aaactagcaatagacttc-aaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||  ||| |  ||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  22465178 aacttagtatgagactccgaattgctcaagcacaactgcaagag 22465135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 6252776 - 6252949
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||| ||||    
T  6252776 gaaagacacaaatcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtttctgtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatcaatatttgat 6252875  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6252876 tacaacagctcactgctaaaactagcaagagacttgaaactactcaatcacaactgcaagagatttcctatgct 6252949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8874921 - 8874750
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||| |||||    
T  8874921 agacacaaagcaagtatacagattctttccacaaagcagaagt-aatcttctcccccttgcacttccaaggagagtttactaaaaatgtaatatttgatt 8874823  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8874822 acaactgctcactgccaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 8874750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15961428 - 15961260
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||    
T  15961428 gaaagacacaaagaaattatacaagttccttccttaatccggaagt-agtcctgtccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgatt 15961330  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||  ||| ||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15961329 acaattgttca-agctcaa--tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagaggtttcctatgct 15961260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 180
Target Start/End: Original strand, 52919820 - 52919940
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctg 158  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||    
T  52919820 gaaagacaaaaagcaattatacaggtttcttccacaaatcggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcgctaaaaatgtaatatctg 52919918  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaa 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  52919919 attacaactgctcactgctaaa 52919940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Original strand, 2784476 - 2784579
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  2784476 ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctaattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaaacacaacagca 2784575  T
Q  218 agag 221  Q
    ||||    
T  2784576 agag 2784579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16659342 - 16659235
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcact-----atgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaac 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  16659342 ccccttgcacttccaaggagacttctctaaaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactaacaagagacttcaaatgctcaagcacaat 16659243  T
Q  214 tgcaagag 221  Q
    | ||||||    
T  16659242 ttcaagag 16659235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 233
Target Start/End: Original strand, 12396444 - 12396596
Alignment:
Q  84 acaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcactatgt--aatatctgattacaattgctcactgctaaa 180  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| |||     | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396444 acaggatccttccacaaaccggaagt-agtcctatctcccttgcacttccaaggagagttcgctaaaatcactatctgattacaattgctcactgctaaa 12396542  T
Q  181 actagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  12396543 aatagcaagagacttcaaattactcaagcacaactacaagagattttctatgct 12396596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22804822 - 22804654
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta--tgtaatatctgattaca 164  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||    
T  22804822 gacacaaagcaattatattacttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaatgagatttcataaaatgtaatatctgattaca 22804724  T
Q  165 attgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    | ||||||||||||||  || ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22804723 actgctcactgctaaatttaacaagaaacttcaaattactcaagcacaactgcaagagattttctatgct 22804654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 6174691 - 6174865
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgta-atatctg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||  | |||| ||    
T  6174691 gaaagacacaaagcaattatacatgtttcttccataaaccggaagt-agttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatatttg 6174789  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  6174790 attacaacagctcactgctaaaactagcaagagacttgaaactactcaatcacaactacaagatgtttcctatgct 6174865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14393722 - 14393635
Alignment:
Q  147 atgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14393722 atgtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 14393635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 37411991 - 37412069
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37411991 gaaagacacaa-gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt 37412069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 147
Target Start/End: Original strand, 21316910 - 21316992
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21316910 aaagacacaaatcaattatacaggttccttccacaatccggaagt-agtcttgtctcccttgcacttccaaggagagttcacta 21316992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 45862352 - 45862285
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45862352 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 45862285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12753413 - 12753348
Alignment:
Q  78 aattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12753413 aattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 12753348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 11078111 - 11078194
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11078111 gaaagacactaagaaattacacaggttccttccacaatccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11078194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13410841 - 13410758
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13410841 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttccacaattcggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13410758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 13698760 - 13698843
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13698760 gaaagacacaaagcaataatacaggttccttccacaatccggtagt-agtcttgtccctcttgcacttccaaggagagttcacta 13698843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22770660 - 22770550
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |   ||||||||||    
T  22770660 gaaagacgcaaaacaattatacaggttccttccacaattcggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactaaaatcaatatctgat 22770562  T
Q  161 tacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||    
T  22770561 tacaattgctca 22770550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 16881648 - 16881758
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  16881648 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccataatccggaagt-agtcttgtccccatttcacttctaaggagagttcactaaaataaatatctgat 16881746  T
Q  161 tacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||    
T  16881747 tacaattgctca 16881758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 142
Target Start/End: Original strand, 51340345 - 51340414
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  51340345 aagcaattatacaggttcctttcacaaaacggaagtcagtcctctcccccttgcacttccaaggagagtt 51340414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11909834 - 11909767
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11909834 gcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtt 11909767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 118
Target Start/End: Original strand, 2783224 - 2783278
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaa-ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt 118  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2783224 gaaagacac-aagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgt 2783278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 13147660 - 13147726
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  13147660 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 13147726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 13953630 - 13953696
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  13953630 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 13953696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 15832775 - 15832841
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  15832775 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 15832841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24776262 - 24776211
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtc 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24776262 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaaatcagtc 24776211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 49989617 - 49989694
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  49989617 gaaagacacaga-caattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 49989694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24776206 - 24776164
Alignment:
Q  191 gacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24776206 gacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 24776164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 31114656 - 31114591
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  31114656 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 31114591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7833383 - 7833311
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7833383 agcaattatacaggttccttccacgatccaaaagt-agtcctttcccctttgcacttctaaggagagttcacta 7833311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Original strand, 10851231 - 10851339
Alignment:
Q  125 gcacttccaaggagagttcactatgt--aatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10851231 gcacttccaaggagagtttactaaaatcaatatctgattacaaatgctcaa-gctcaa--tagaaatagacttcaaaatactcaagcacaactgcaagag 10851327  T
Q  222 ttttcctatgct 233  Q
     |||||||||||    
T  10851328 gtttcctatgct 10851339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19885859 - 19885814
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagt 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19885859 gaaagacacaaaacaattatacaggttctttccacaaaccggaagt 19885814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9007180 - 9007098
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9007180 gaaagacacaa-gcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 9007098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 27882946 - 27883028
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27882946 gaaagacacaa-gcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 27883028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46797047 - 46797011
Alignment:
Q  185 gcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46797047 gcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 46797011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12726849 - 12726818
Alignment:
Q  190 agacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726849 agacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 12726818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 1053280 - 1053345
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  1053280 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 1053345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 1063709 - 1063774
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||    
T  1063709 aagcaattatcctggttccttccacaaaccagaagt-tgtccagtcccccttgcacttccaaggaga 1063774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 5628680 - 5628607
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5628680 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtccccttgcacttccaaggagatttcactat 5628607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15651767 - 15651702
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  15651767 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggaga 15651702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 16076500 - 16076565
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  16076500 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 16076565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17282097 - 17282032
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  17282097 aagcaattatcctggttccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 17282032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 27849580 - 27849748
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagt-catgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaat---atctga 159  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||   ||||||    
T  27849580 gaaagacaaaaagcaattatcctcgttccttccacaatccggaagt-agtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta--taatccaatctga 27849676  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgctt 234  Q
    ||||||||| | |  ||  |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  27849677 ttacaattgttta-agcacaaa--agcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctt 27849748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 51989815 - 51989750
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  51989815 aagcaattatactgattccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 51989750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Original strand, 10849946 - 10849991
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagt 109  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  10849946 gaaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaatccggaagt 10849991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 933192 - 933274
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  933192 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 933274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8996628 - 8996546
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8996628 gaaagacacaa-gcaattattttggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 8996546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Original strand, 17667939 - 17667979
Alignment:
Q  181 actagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17667939 actatcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 17667979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Original strand, 22150613 - 22150676
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  22150613 gcaattatactggttcctttcacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 22150676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 83)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22600908 - 22600753
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22600908 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatcttattacaa 22600809  T
Q  166 ttgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22600808 ttgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 22600753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 1577222 - 1577392
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1577222 gaaagacacagagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 1577321  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1577322 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagtcatcctatgct 1577392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 2266454 - 2266613
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2266454 gaaagacacaaagcaatttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 2266553  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2266554 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 2266613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 38281921 - 38282089
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38281921 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 38282020  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  38282021 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgtaagagacttcctatg 38282089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Original strand, 38281740 - 38281892
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38281740 gaaagacacaaagcaattataaaggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 38281839  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  38281840 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagtacaactg 38281892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32786663 - 32786492
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32786663 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtcaatcctgtctcccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 32786564  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32786563 caattgctcactgctaaaactatcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 32786492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16236031 - 16235861
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16236031 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagttttgtcccccttggacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 16235932  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  16235931 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcacatgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 16235861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23037230 - 23037060
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23037230 gaaagacacataacaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 23037131  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23037130 caattgctcacagctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 23037060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33257076 - 33256900
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  33257076 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 33256977  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgcttct 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33256976 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgcttct 33256900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33277248 - 33277072
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  33277248 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 33277149  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgcttct 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33277148 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgcttct 33277072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 36133559 - 36133717
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133559 gaaagaaacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttagccctggcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 36133658  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133659 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 36133717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 1899702 - 1899872
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1899702 gaaagacacaaagcaattatacatattccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttctaaggagagttcattatgtaatatctgatta 1899801  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1899802 aaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 1899872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 30892449 - 30892620
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  30892449 gaaagacacaaagcaattatacagattccttccacaaaccagaagt-agtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctaat 30892547  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  30892548 tacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctaaagaacaactgcaagagacttcctatgct 30892620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22202459 - 22202287
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  22202459 gaaagacacaaagcaattatacagcttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatgtaatatctga 22202361  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22202360 ttacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgct 22202287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44824484 - 44824314
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44824484 gaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 44824385  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44824384 caattgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 44824314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 48703618 - 48703778
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  48703618 gaaagacacaaagcaattatataagttccttccacaaaccggaagt-agtcatgcccccattgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 48703716  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48703717 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 48703778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21192590 - 21192416
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21192590 gaaagacacaaagcaattatactggttccttcaacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 21192491  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21192490 ttgcaactgctcactgctaaaactagcaagagacatcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 21192416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 233
Target Start/End: Original strand, 21702190 - 21702340
Alignment:
Q  84 acaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaac 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  21702190 acaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatccctcttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactactaaact 21702289  T
Q  183 tagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21702290 tagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21702340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 22153210 - 22153385
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  22153210 gaaagacataaagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtcggtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcactagaaatgtaatatctg 22153309  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22153310 attacaattgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22153385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Original strand, 29215167 - 29215325
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29215167 ttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcacaatataatatctaattacaaatgctcactgcta 29215266  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgcttct 236  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29215267 aaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgcttct 29215325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48570937 - 48570783
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  48570937 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctaactacta 48570838  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48570837 aacttagtaagatacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 48570783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22428063 - 22427890
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  22428063 gaaagacacaaatcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 22427965  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  22427964 attacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgtgagagacttcctatgct 22427890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12625267 - 12625102
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgct 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  12625267 agcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgct 12625169  T
Q  171 cactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgcttct 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12625168 cactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcataactgcaagagatttcctacgcttct 12625102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 23024164 - 23024319
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23024164 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 23024263  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23024264 aacttagtatgagaattcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 23024319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 10250344 - 10250501
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10250344 gaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatctaatatcttatta 10250443  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||  || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10250444 caattgctcacaact-aaattagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 10250501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21121773 - 21121618
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21121773 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 21121674  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21121673 aacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21121618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21205581 - 21205426
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21205581 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 21205482  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |   ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21205481 accttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21205426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 21983951 - 21984122
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21983951 gaaagacacaaaaaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgatta 21984050  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  21984051 caaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagatacttcctatgct 21984122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2328156 - 2328002
Alignment:
Q  69 acacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaat 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2328156 acacaaagcaatttatacaggttccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaagtaatatctgattacaat 2328057  T
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||| | |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2328056 tgctcactaccaaacatagcaagagacttcaaatgctcaagcacgactgcaagag 2328002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 10756779 - 10756953
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||    
T  10756779 gaaagacacaaatcaattatacatgttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 10756877  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10756878 attacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 10756953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 12283777 - 12283951
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||    
T  12283777 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatttg 12283875  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12283876 attacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattacacaagcacaactgcaagagatttcctatgct 12283951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 2834068 - 2834213
Alignment:
Q  91 ccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgct-aaaactagcaa 188  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2834068 ccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcatttccaaggagagttcactatgtaatatttgattacaattgctcactgctaaaaactagcaa 2834167  T
Q  189 tagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2834168 gagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 2834213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26702855 - 26702716
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  26702855 gaaagatacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 26702756  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa 199  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26702755 tcacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa 26702716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 42284012 - 42284167
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  42284012 ttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 42284111  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42284112 aacttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 42284167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21135868 - 21135714
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21135868 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccccttgcactttcaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaa 21135769  T
Q  180 aactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
       ||| |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  21135768 tcttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaacttcaagagacttcctatgct 21135714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25449277 - 25449125
Alignment:
Q  71 acaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctgattacaa 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  25449277 acaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactataaagtaatatctgattacaa 25449178  T
Q  166 ttgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaa 218  Q
    ||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25449177 ttgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaa 25449125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14264159 - 14263984
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc------cttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatc 156  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14264159 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaagtaatatc 14264061  T
Q  157 tgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14264060 tgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgcttaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14263984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28493006 - 28492880
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  28493006 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctatccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgat 28492908  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaa 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28492907 tacaactgctcactgctaaaactagcaa 28492880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21215401 - 21215230
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21215401 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggaattcactatgtaatatctgatt 21215303  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| ||||   ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21215302 acaaatgctcactactaaccttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21215230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Original strand, 35039588 - 35039692
Alignment:
Q  129 ttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  35039588 ttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaaagctcaagcacaactgcaagagacttcct 35039687  T
Q  229 atgct 233  Q
    |||||    
T  35039688 atgct 35039692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Original strand, 7309175 - 7309345
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  7309175 aaagacacaa-gcaattatataggttccttccacaaatcggaagt-agtactgtcccccttgcacttctaaggagagttcactaaaatgtaatatctgat 7309272  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7309273 tacaaatgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 7309345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 46088344 - 46088515
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46088344 gaaagacacaa-gcaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactatgtaatatctgatt 46088442  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||  |||||||| |||||  ||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46088443 acacatgctcacttctaaacttagtaagagacttcaaattgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 46088515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 30571571 - 30571724
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  30571571 ttatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgtactttcaaggagagt-cactatgtaatatctgattacaaatgttcactacta 30571669  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30571670 aatttagtaagagacttcaaatgcttaagcacaactgcaagagacttcctatgct 30571724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22465535 - 22465362
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    | |||||| ||    
T  22465535 gaaagacataaagcaattatacatgtttcttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatataatatttg 22465437  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||    
T  22465436 attacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcataattgcgagagacttcctatgct 22465362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 19214966 - 19215128
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  19214966 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaaatcaatcctgtcccctttgtacttccaaggagagttcactaaaagtaatatctga 19215065  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttc-aaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19215066 ttacaattgctcaatactaaacttagtatgagacttcaaaatgctcaagcacaactgcaagag 19215128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 37640380 - 37640523
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  37640380 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaagaggagttcactatgtaatatctgattacaactgctcaatacta 37640479  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
     |  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37640480 tacttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 37640523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14293327 - 14293190
Alignment:
Q  86 aggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaa 181  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  14293327 aggttccttccacaaaccggaaataagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatccggttacaactgctcactgctaaaa 14293228  T
Q  182 ctagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaa 218  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14293227 ctagcaagagacttcaaactactcaaacacaactgcaa 14293190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 17017957 - 17018118
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgattacaattgctc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |   ||||| |||||||||||||||    
T  17017957 agcaattatacaggttccttccataaatcagaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcgctaaaatcaatatttgattacaattgctc 17018055  T
Q  172 actgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |  ||| ||| |||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17018056 aacgctcaaaatagcaagagatttcaaacaactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 17018118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17025634 - 17025514
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcacta-----tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  17025634 ccccttgcacttccaaggagagtttactaaaaaatgtaatatttgattacaactgctcacttctaaacttagcaagagacttcaaactactcaagcacaa 17025535  T
Q  213 ctgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  17025534 ctgcaagagatttcctatgct 17025514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Original strand, 20908777 - 20908940
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc--ttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgattacaattgct 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |   ||||||||||||||| ||||    
T  20908777 agcaattatacaggttccttccacaaatctgaagt-agtcttgtccccctttgcacttccaaggagagttccctaaaatcaatatctgattacaaatgct 20908875  T
Q  171 cactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgctt 234  Q
    |||| || ||| |||||  |||||| ||| | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20908876 cacttctcaaaatagcacgagacttgaaactactcaaacacaaccgcaagagatttcctatgctt 20908940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 9346133 - 9346243
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |   ||||| ||||    
T  9346133 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttccacaatccgtaagt-agtcatgtcccctttgcacttccaaggagagttcactgaaatcaatatatgat 9346231  T
Q  161 tacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||    
T  9346232 tacaattgctca 9346243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22601307 - 22601225
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22601307 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccac-aatcggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22601225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Original strand, 2267977 - 2268057
Alignment:
Q  153 tatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  2267977 tatctgattacaactactcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 2268057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34256231 - 34256164
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34256231 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagtt 34256164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Original strand, 2834012 - 2834069
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc 121  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2834012 gaaagacacaaaacaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccc 2834069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 18614272 - 18614446
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgta-atatctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| || ||||| ||||   ||||| ||| ||||||||||||| |||||||   |  | |||||||    
T  18614272 gaaagacacaaagcaattataatgattcattccacaatccggaagt-agtccactcccccttgaacttccaaggagaattcactaaaatcaatatatctg 18614370  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  18614371 attacaactgctcactgctcaaaatagcaagagacttcaaactactcaagtataactgcaagagatttcctatgct 18614446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26280763 - 26280668
Alignment:
Q  70 cacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgt-aatatctgattacaa 165  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  26280763 cacaaaacacttatacaggttccttccacaatcaggaagt-agtcctacccccttgcacttccaaggagagttcactaaatcaatatctgattacaa 26280668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7745759 - 7745697
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7745759 ttatacaggttccttccacaaaccggaagt-agccatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 7745697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16233848 - 16233765
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16233848 gaaaggcacaagacaattatacatgttccttccacaatccggaagt-agtcttgtcccccttgcgcttccaaggagagttcacta 16233765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 17370408 - 17370474
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17370408 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtcgagtccccattgcacttccaaggagagtt 17370474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 21541171 - 21541237
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  21541171 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 21541237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 27858132 - 27858213
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27858132 gaaagacacgagacaattatacaggttccttccacaattcggaagt-agtcttg-ccccttacacttccaaggagagttcacta 27858213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18130705 - 18130592
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagt-ca-gtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctg 158  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |  || || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||    
T  18130705 gaaagacataaaacaattatacagattccttccacaatctggatgtacatgtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctg 18130606  T
Q  159 attacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||||    
T  18130605 attacaattgctca 18130592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 20251169 - 20251234
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagt-catgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  20251169 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccattcccccttgcacttccaaggaga 20251234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 23926427 - 23926492
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  23926427 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 23926492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 28379358 - 28379423
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagt-catgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  28379358 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccattcccccttgcacttccaaggaga 28379423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 12944701 - 12944783
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12944701 gaaagacacaa-gcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 12944783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21684682 - 21684599
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  21684682 gaaagaaacaaagcaattatataggttccttccacaattcggaagt-agccatgtcccccttgcaattccaagtagaattcacta 21684599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26548971 - 26548908
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  26548971 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 26548908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 22642230 - 22642296
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||    
T  22642230 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaagaagagtt 22642296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 674947 - 675012
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  674947 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 675012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11195775 - 11195710
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  11195775 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 11195710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 19037372 - 19037437
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19037372 aagcaattatactggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtccaccttgcacttccaaggaga 19037437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19171042 - 19170977
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  19171042 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 19170977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20196398 - 20196325
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20196398 aagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 20196325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 22018698 - 22018759
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaagga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||    
T  22018698 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaagga 22018759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 23058959 - 23059024
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||   |||||||||||||||||||||    
T  23058959 aagcaactatactggttccttccacaaaccggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggaga 23059024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 26702970 - 26703049
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26702970 aaagacacaa-gcaattatacaagttccttccacaatctggaagt-agttctgtccctcttgcacttccaaagagagttcac 26703049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 45071315 - 45071244
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  45071315 agacacaaa-caattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 45071244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 155002 - 154920
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  155002 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 154920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 5973252 - 5973334
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5973252 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 5973334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 139
Target Start/End: Original strand, 8698249 - 8698324
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  8698249 gaaagagacaaagtaattatcctcgttccttccacaatccagaagt-agtctagtccccattgcacttccaaggaga 8698324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 100
Target Start/End: Original strand, 23053730 - 23053766
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23053730 gaaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaa 23053766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 102)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13138702 - 13138531
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13138702 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgagagttcactatgtaatatcttatta 13138603  T
Q  163 caattgctcactgctaaaac-tagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13138602 caattgctcactgctaaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 13138531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 15087906 - 15088072
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaat 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15087906 gacacaaagaaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaat 15088005  T
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15088006 tgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15088072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19328817 - 19328647
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19328817 gaaagacacaaagcaattatacagattccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 19328718  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19328717 taattgctcactgctaaaactatcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgctagagacttcctatgct 19328647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22579984 - 22579830
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22579984 gacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactatgtaatatctgattacaat 22579885  T
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22579884 tgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 22579830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16557395 - 16557224
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16557395 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 16557296  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  16557295 acaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 16557224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 16608267 - 16608438
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16608267 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 16608366  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  16608367 acaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 16608438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Original strand, 13879521 - 13879697
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13879521 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttctaaggagagttcactatgtaatatctgatta 13879620  T
Q  163 caat---tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgcttct 236  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  13879621 caattaatgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaacaacaagagacttcctatgcttct 13879697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2914417 - 2914241
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  2914417 gaaagacacaaagcaattatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactataatgtaatatctga 2914318  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgcttct 236  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  2914317 ttacaattgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgcttct 2914241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 9069111 - 9069281
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9069111 gaaagacacaaatcgattatacaggttctttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtagtatctgatta 9069210  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9069211 cagctgctctttgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 9069281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9710610 - 9710450
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9710610 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactatgtaatatctgatt 9710511  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9710510 acaatttctcattgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 9710450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23280751 - 23280587
Alignment:
Q  71 acaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgc 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23280751 acaaagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttactatgtaatatctgattacaattgc 23280652  T
Q  170 tcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23280651 tcactgctaaaactagcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 23280587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48237647 - 48237475
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48237647 gaaagacacaaaacaatttatacgggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaattcactatgtaatatctgatt 48237548  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48237547 acagttgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 48237475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 33421103 - 33421273
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33421103 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 33421201  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33421202 acaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33421273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33692506 - 33692335
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33692506 gaaagacgcaaaacaattatacagattccttccacaaaccggaagtcagttttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 33692407  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33692406 caattgatcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33692335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 44466445 - 44466618
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  44466445 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 44466544  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44466545 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 44466618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35954711 - 35954542
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35954711 gaaagacacaaaacaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 35954612  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatg 231  Q
    |||||| |||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35954611 acaattcctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatg 35954542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10883977 - 10883805
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||    
T  10883977 gaaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatttga 10883879  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  10883878 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagaacaactgcaagagacttcctatgct 10883805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13034644 - 13034470
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13034644 gaaagacacaaagaaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 13034545  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13034544 ttacaacttctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 13034470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21284180 - 21284007
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  21284180 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttccacaaaccgggagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 21284081  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21284080 ttacaactgttcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21284007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30946148 - 30945993
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30946148 ttatataggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaactgctcactgcta 30946049  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30946048 aaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 30945993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 331002 - 331174
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttg-cacttccaaggagagttcactat--gtaatatctga 159  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  331002 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctggcacttccaaggagagttcactataagtaatatctga 331100  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  331101 ttacaaatgctcactgctaaacctagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 331174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12175144 - 12174974
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12175144 gaaagacacaaacaatttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcttgccccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 12175045  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12175044 caattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 12174974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19711814 - 19711650
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19711814 agacacaaagcaattatactggttccttccataaaccagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaa 19711716  T
Q  166 ttgctcactgctaaaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  19711715 ttgctcactgctaaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactccaagagacttcctat 19711650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 27871069 - 27871240
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27871069 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgatt 27871167  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27871168 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 27871240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 13302212 - 13302372
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |    
T  13302212 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggatagttcactaaaatgtaatatctta 13302310  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13302311 ttacaactgctgactgctaaaactagcaagaggcttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 13302372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13731481 - 13731308
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  13731481 gaaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaagctggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 13731382  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| || ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13731381 ttacaaatgttcaatgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 13731308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 15467269 - 15467440
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15467269 gaaagacacatatcaattatacaagttccttccacaaaccagaaatcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagaattcactatgtaatatctgatta 15467368  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  15467369 caattgctcatttctaaaactagcaagagacttcaaatttctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 15467440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 4820838 - 4821007
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  4820838 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaagtagtatttgatta 4820936  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| ||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4820937 caattgctcactactatacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 4821007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 11318756 - 11318929
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||    
T  11318756 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttcaataaaatgtaatatctga 11318855  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| || |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11318856 ttacaaatgttcactgctaaacttaacaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 11318929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28623166 - 28622995
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28623166 gaaagacacaaagcaatttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctaatt 28623067  T
Q  162 acaattgctcactgct-aaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatg 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  28623066 acaattgctcactgctaaaaactagcaagagacttcaaattactcaagtacaattgcaagagacttcctatg 28622995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 230
Target Start/End: Original strand, 14187040 - 14187210
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  14187040 gaaagacacaaagaaattatacaggttccttccacaaatcggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 14187138  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctat 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14187139 attacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctat 14187210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2266319 - 2266151
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2266319 gaaagacacaatcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagccttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatttgatta 2266220  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatg 231  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  2266219 caattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactggaagagacttcctatg 2266151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16546142 - 16545971
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatta-tacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16546142 gaaagacacaaaacaatttgtacaggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactacgtaatatctcatt 16546043  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16546042 acaattgctcactattaaaactagcaagagacttcaaatactcaaccacaactgcaagagacttcctatgct 16545971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 16619520 - 16619691
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatta-tacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16619520 gaaagacacaaaacaatttgtacaggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactacgtaatatctcatt 16619619  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16619620 acaattgctcactattaaaactagcaagagacttcaaatactcaaccacaactgcaagagacttcctatgct 16619691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29936151 - 29935977
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcact-----atgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||     
T  29936151 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaaatgtaatatcta 29936053  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29936052 attacaattgctcactgctaaacttagcaaaagtcttcaaattactcaagcacaactgcaagagattttctatgct 29935977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16315344 - 16315173
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||| ||    
T  16315344 gaaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagt-agtcatgcccccttgcacttccaaggagaattcactaaaaagtaatatctaat 16315246  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  16315245 tacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagtacaactgtaagagacttcctatgct 16315173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16310713 - 16310540
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  16310713 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcaattccatggagagttcactaaaatgtaatatctga 16310615  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16310614 ttacaactgctcactactaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcttatgct 16310540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41843230 - 41843057
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  41843230 gaaaaacacaaagcaattatacaagttccttccataaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 41843132  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  41843131 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagatttcaaactactcaagcacaactgcaagatatttcatatgct 41843057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 1292458 - 1292601
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  1292458 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctaactacta 1292557  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||  ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1292558 aacttagtaagagacttcaaattgctcaaacacaactgcaagag 1292601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 14424884 - 14425027
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14424884 ttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 14424983  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14424984 aacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 14425027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15574385 - 15574215
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15574385 gaaagacacaa-gcaatttatacagtttccttccacaaatcggaagtcaaacctgtcccccttgcacttctaaggagagttcactatgtaatatctgata 15574287  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  15574286 acaattgctcactactaaaattagtaatagacttcaaacgctcatgcacaactgcaagagacttcctatgct 15574215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15705292 - 15705122
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  15705292 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggatagttcattatgtaatatcttatt 15705194  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||| || |||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15705193 acaattgctctctactaaatttagtaagagacttcaaatgcttaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15705122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16317360 - 16317188
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  16317360 gaaagacacaaagcaatcatacaggttccttccacaaacaggaagt-agtccgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatttaatatctgat 16317262  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16317261 tacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 16317188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24795504 - 24795349
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  24795504 ttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactatta 24795405  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  24795404 aacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 24795349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48063617 - 48063446
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48063617 gaaagacacaagcaaattatacaggtttcttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgatta 48063518  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| |||||  ||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  48063517 caaatgctcactactaaacttagtatgagacttcaaattgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgct 48063446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 4493926 - 4494100
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||    
T  4493926 gaaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagt-attcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 4494024  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  4494025 attacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 4494100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19237833 - 19237668
Alignment:
Q  72 caaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaatt 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  19237833 caaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaatgagagttcactaaaatgtaatatctgattacaatt 19237735  T
Q  168 gctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  19237734 gctcactgctaaaactagcaaaaaacttcaaactactcaagcacacaagcaagagatttcctatgct 19237668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32265525 - 32265354
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32265525 gaaagacacaa-gcaatttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttctaaggggagttcactatgtaatatctgatt 32265427  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    | || |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32265426 aaaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 32265354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19340038 - 19339883
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19340038 ttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 19339939  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |  |||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  19339938 aacttagtatgagacttcaaattgctcaagaacaactgcaagagacttcctatgct 19339883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 33604258 - 33604418
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||    || ||||||||    
T  33604258 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttccacttccaaggagagttcgctaaaaagtcatatctga 33604356  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33604357 ttacaactgctcactgttaaacttagcaagatacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 33604418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13027705 - 13027534
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||    
T  13027705 gaaagacacaaagcaagtatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaattttaatatctga 13027606  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13027605 ttac---tgctcacttctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgct 13027534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 11792261 - 11792434
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  11792261 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 11792359  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||| | || ||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  11792360 ttacaactgctcattgctaaacttagcaagagacttcaaattacttaagaacaaatgcaagagacttcctatgct 11792434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12367543 - 12367370
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  12367543 gaaagatacaaagcaattatacaggttccttccacaaactggaagt-agttatgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactaaaatgtaatatctga 12367445  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12367444 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagaaacttcaaattaatcaagcaaaactgcaagagatttcctatgct 12367370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13261417 - 13261248
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattac 163  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  13261417 gacataaagcaattatacatgttccttccacaaactggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattac 13261319  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || |||| |||| ||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13261318 aactgcttactgttaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 13261248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 13645802 - 13645962
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  13645802 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccgtaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaagcagagttcactaaaatgtaatatctga 13645900  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| | ||||||  || ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  13645901 ttacaactactcactaatataactagcaagagacttttaatactcaagcacaactgcaagag 13645962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21382218 - 21382063
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21382218 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttcctagttgagttcactatgtaatatctgattacaattgctcatttcta 21382119  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     |  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21382118 tatttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21382063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48806669 - 48806514
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  48806669 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagaggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcaatacta 48806570  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |  |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48806569 aacttagtatgagacttcaaattgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 48806514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5001632 - 5001465
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  5001632 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 5001534  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcc 227  Q
    |||||| | ||||||||||||  || ||| |||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||    
T  5001533 ttacaactactcactgctaaacttatcaagagacttcaaattacacaagcacaactgcaagagatttcc 5001465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9099842 - 9099672
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||    
T  9099842 gaaagacacaaagcaattatagaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatattcctcttgcacttccaaggagagtccactaaaaatgtaatatttg 9099744  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||    |||||||||| |||||||||||    
T  9099743 attacaattgctcactgctaaaactaccaagagacttcaaactactcaag----actgcaagagatttcctatgct 9099672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39285309 - 39285148
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  39285309 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtctcccttccacttccaaagagagttcactaaaatgtaatatctga 39285211  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| | || || ||||||||||||||    
T  39285210 ttacaactgctcactactaaaactagcaagaaacttcaaactacttaaacacaactgcaagag 39285148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9099036 - 9098897
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||    
T  9099036 gaaagacacaaagcaattatagaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatattcctcttgcacttccaaggagagtccactaaaaatgtaatatttg 9098938  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9098937 attacaattgctcactgctaaaactaccaagagacttcaaa 9098897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13259204 - 13259053
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattac 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  13259204 gacataaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattac 13259106  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactg 215  Q
    || ||||||||| ||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  13259105 aactgctcactgttaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactg 13259053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13266544 - 13266393
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattac 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  13266544 gacataaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattac 13266446  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactg 215  Q
    || ||||||||| ||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  13266445 aactgctcactgttaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactg 13266393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 14425926 - 14426071
Alignment:
Q  91 ccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagc 186  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  14425926 ccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactaaaaagtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagc 14426024  T
Q  187 aatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14426025 acgagacttaaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14426071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Original strand, 30025286 - 30025446
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||    
T  30025286 gaaagacacaaaacaattatacatgttccttcaacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttccacttccagagagagttcactaaaatgtaatatctga 30025384  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaaga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30025385 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcatgcacaactgcaaga 30025446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 164
Target Start/End: Original strand, 8182311 - 8182412
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8182311 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 8182409  T
Q  162 aca 164  Q
    |||    
T  8182410 aca 8182412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 180
Target Start/End: Original strand, 24787712 - 24787832
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  24787712 gaaagacacacaacaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 24787811  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaa 180  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  24787812 ttacaactactcactgctaaa 24787832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 2499414 - 2499526
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatg-tccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  2499414 gaaagatacaaagcatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 2499513  T
Q  160 ttacaattgctca 172  Q
    |||||| ||||||    
T  2499514 ttacaactgctca 2499526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 21691767 - 21691885
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttc-aaatgctcaagcacaact 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  21691767 ccccttgaacttccaaggagagttcactaaaatgttatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaaatactcaagcacaact 21691866  T
Q  215 gcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  21691867 gcaagagatttcctatgct 21691885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 13683004 - 13683121
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||     
T  13683004 ccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattgcaactgctcattgctaaaactaggaagagacttcaaatactcaagcacaacta 13683103  T
Q  216 caagagttttcctatgct 233  Q
    || |||  ||||||||||    
T  13683104 catgagacttcctatgct 13683121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13902418 - 13902245
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||   || |||| ||| |    
T  13902418 gaaagaaacaaagcaattatacatatttcttccacaaaccagaagt-agtcctgtcccccttgtacttccaagaagagttcgctaaaatataatttctaa 13902320  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  13902319 ttacaattgctcattgctgaagctagcaaaagacttcaaactactcaagcacaactgtaagtgatttcctatgct 13902245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13473217 - 13473130
Alignment:
Q  147 atgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  13473217 atgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaaaagacttcaaactactcaagcacaagtgcaagagattttctatgct 13473130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21211350 - 21211245
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||| ||    
T  21211350 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttgcaaggagagttcactaaaaatgtaatatttg 21211252  T
Q  159 attacaa 165  Q
    |||||||    
T  21211251 attacaa 21211245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 16411360 - 16411470
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  16411360 gaaagacacagagaaattatacaggttccttccacaatccggaagt-agtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgat 16411458  T
Q  161 tacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||    
T  16411459 tacaattgctca 16411470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4433333 - 4433266
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4433333 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagtt 4433266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16112585 - 16112519
Alignment:
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16112585 tgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16112519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4412761 - 4412693
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaag-tcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4412761 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 4412693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16308518 - 16308405
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaat---tatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatct 157  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |   |||||||    
T  16308518 gaaagacacaaagcaataattatacaggttccttccacaatccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatcaatatct 16308420  T
Q  158 gattacaattgctca 172  Q
    |||||||||||||||    
T  16308419 gattacaattgctca 16308405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7488686 - 7488537
Alignment:
Q  87 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgt--aatatctgattacaattgctcactgctaaaact 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||     ||||||| ||||||| || ||||| || ||| |    
T  7488686 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttacacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctaattacaaatgttcactactcaaaat 7488588  T
Q  184 agcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  7488587 agcaaaagacttcaaattactcaagcacaatttcaagagatttcctatgct 7488537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16155525 - 16155466
Alignment:
Q  107 agtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaa 165  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16155525 agtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagaattcactatgtaatatctgattacaa 16155466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 5034646 - 5034755
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact-atgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||    
T  5034646 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaatccggaggt-agtcctgtcccccttggacttccaaggagaattcactaaattaatatatgatt 5034744  T
Q  162 acaattgctca 172  Q
    |||| ||||||    
T  5034745 acaaatgctca 5034755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16105734 - 16105652
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16105734 gaaagacacaa-gcaattatacaggttccttccacaatccggaagt-agtcctgccctccttgcacttctaaggagagttcacta 16105652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Original strand, 26042760 - 26042890
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |   ||| |||||||||    
T  26042760 gaaagacacaa--caattatacaggttcattccacaaactggaagtcggtactgtctcccttgcactttcaaagagagttcattaaaatg-aatatctga 26042856  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagac 193  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  26042857 ttacaactgctcactattaaaactagcaagagac 26042890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 142
Target Start/End: Original strand, 602132 - 602195
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  602132 ttatacaggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 602195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 119
Target Start/End: Original strand, 13681646 - 13681700
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  13681646 gaaagacacaaagcaattatacaggttccatccacaaaccggaagt-agtcatgtc 13681700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13175358 - 13175293
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  13175358 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 13175293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 3477092 - 3477018
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  3477092 gaaagacacaa-gcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 3477018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17064281 - 17064199
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtc-atgtccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17064281 gaaagacacaa-gcaattatcctggttccttccacaaaacggaagt-agtccattcccccttgcacttccaaggagatttcacta 17064199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 4832131 - 4832101
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttcctt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4832131 gaaagacacaaagcaattatacaggttcctt 4832101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 8933121 - 8933186
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  8933121 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 8933186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8999688 - 8999623
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  8999688 aagcaattatactgattccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 8999623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12734907 - 12734842
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  12734907 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 12734842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 15215873 - 15215938
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  15215873 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 15215938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 18440752 - 18440817
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  18440752 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 18440817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26210291 - 26210226
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  26210291 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 26210226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 29589545 - 29589610
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  29589545 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 29589610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38403955 - 38403890
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  38403955 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 38403890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 13681878 - 13681942
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  13681878 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagaccccttgcacttcgaaggaga 13681942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13731297 - 13731260
Alignment:
Q  184 agcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13731297 agcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 13731260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 3165285 - 3165367
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3165285 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 3165367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 20490557 - 20490639
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20490557 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 20490639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 44280074 - 44280156
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  44280074 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactat 44280156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 96)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Original strand, 54679279 - 54679446
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54679279 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattag 54679378  T
Q  164 aattgctcactgct-aaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctat 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  54679379 aattgctcactgctaaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctat 54679446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 45832737 - 45832907
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45832737 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccaaaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 45832836  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45832837 caattgctcactgctaaacctagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 45832907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 19665715 - 19665888
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaag--gagagttcactatgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  19665715 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagagtttactatgtaatatctgat 19665814  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaac-tagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19665815 tacaactgctcactgctaaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 19665888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22676283 - 22676114
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22676283 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 22676184  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatg 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22676183 caattgttcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgtaagagacttcctatg 22676114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13576877 - 13576705
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13576877 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactatgtaatatctgatt 13576778  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13576777 acaatttctcattgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 13576705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 19884083 - 19884242
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19884083 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 19884182  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19884183 caattgctcactactaaaattagcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 19884242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 56033923 - 56034094
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56033923 gaaagacacaaaacaattatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatatctgatta 56034022  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  56034023 aaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagtacaactgcaagagacttcctatgct 56034094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 6641035 - 6641206
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  6641035 gaaagacacaaaacaattatacaagttccttccacaaacc-gaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 6641132  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6641133 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 6641206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 16631790 - 16631963
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  16631790 gaaagacagaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctta 16631889  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16631890 ttacaaatgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagaaacttcctatgct 16631963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 16939351 - 16939521
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16939351 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 16939449  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16939450 acaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16939521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 20976824 - 20976979
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20976824 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaggagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 20976923  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20976924 aaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 20976979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37436294 - 37436128
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||    
T  37436294 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttca-----taatatctgatt 37436200  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37436199 acaattgcttactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 37436128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3500395 - 3500242
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3500395 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccccttgtacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaa 3500296  T
Q  180 aactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3500295 atttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 3500242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 236
Target Start/End: Original strand, 10072289 - 10072458
Alignment:
Q  69 acacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaatt 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10072289 acacaaatcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttcgaaggagagttcattatgtaatatatgattacaatt 10072388  T
Q  168 gctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgcttct 236  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  10072389 gctcattgctaaaactatcaaaagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgcttct 10072458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 11900541 - 11900714
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  11900541 gaaagacacaaagtaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctaa 11900639  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11900640 ttacaattactcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 11900714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 29120718 - 29120887
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattaca 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  29120718 agacacaaagcaatttatacaggttccttctacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagaattctctaagtaatatctgattaca 29120817  T
Q  165 attgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29120818 attgctcactgctaaaactagcaaaagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 29120887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19611091 - 19610939
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaa 165  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19611091 agacacaaaacaattttacaggttctttccacaaactggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatttgattacaa 19610992  T
Q  166 ttgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaa 218  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19610991 ctgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaa 19610939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 6516838 - 6517008
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6516838 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 6516936  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    | ||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6516937 aaaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 6517008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14605666 - 14605505
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  14605666 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 14605567  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14605566 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcgcaactgcaagag 14605505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17701500 - 17701345
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17701500 ttatacaggttccttcaacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatatctaattacaattgctcactacta 17701401  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17701400 aaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17701345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 38513274 - 38513429
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38513274 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttacacttccaagaggagttcactatgtaatatctgattacaattactcactgcta 38513373  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38513374 aaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 38513429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 16852853 - 16853026
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat--gtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  16852853 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaagtaatatctga 16852952  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16852953 ttacaattgctcactactaaatttagtaagagacttcaaatgcttaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16853026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 3395000 - 3395160
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  3395000 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccgaaagt-agtcatgtccctcttgcacttccaaggagagtttactaaaatgtaatatctga 3395098  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3395099 ttacaattgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcataactgcaagag 3395160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 11915054 - 11915225
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||    
T  11915054 agacacagagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggatagttcactaaaaatgtaatatcttatt 11915152  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11915153 acaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 11915225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 55379660 - 55379834
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  55379660 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaacggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 55379758  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55379759 attacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 55379834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3106179 - 3106008
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3106179 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagttatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 3106081  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| || ||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3106080 acaaatgttcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 3106008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17399435 - 17399264
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17399435 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 17399337  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17399336 acaaatgctcactactaaacttagtaagagtcttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17399264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17788801 - 17788633
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||||||| ||    
T  17788801 gaaagatacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcatttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatttg 17788703  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcc 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  17788702 attacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcc 17788633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37986373 - 37986200
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttcc-aaggagagttcacta---tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||   ||||||||| |    
T  37986373 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcactttataaggagagttcactaaaatgtaatatccg 37986275  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37986274 attacaattgatcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagatttcgtatgct 37986200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 56533803 - 56533651
Alignment:
Q  83 tacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  56533803 tacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcttccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactactaaac 56533704  T
Q  182 ctagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  56533703 ttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgct 56533651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41115518 - 41115343
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||    
T  41115518 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttcctcaaaccggaagt-agccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactgaaaatgtaatatttg 41115420  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgctt 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41115419 attacaactgctcactgctaaaactagcaagagactttaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctt 41115343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14154756 - 14154584
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta--tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  14154756 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaattcactaggtgtaataactga 14154658  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  14154657 ttacaaatgttcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 14154584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 16847897 - 16848070
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat--gtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  16847897 gaaagacacaaagaaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaagtaatatctga 16847996  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||| ||| |  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16847997 ttacaattgctcactactatatttagtaagagacttcaaatgcacaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16848070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19912635 - 19912468
Alignment:
Q  69 acacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||    
T  19912635 acacaaagcaattatacaggttccttctacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcattttcaaggagagttcagtaaaatgtaatatctaattaca 19912537  T
Q  165 attgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19912536 actgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcactactgcaagagacttcctatgct 19912468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 55731214 - 55731368
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  55731214 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgttcactacta 55731313  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  55731314 aacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaaatgcaagagacttcctatgct 55731368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39420449 - 39420332
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39420449 ttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttacaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 39420350  T
Q  179 aaactagcaatagacttc 196  Q
    |||||||||| |||||||    
T  39420349 aaactagcaagagacttc 39420332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 8103634 - 8103808
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||    
T  8103634 gaaagacacaaagcaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatttg 8103733  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8103734 attacaattgctcactgttaaacttagcaagagacttcaaatgctcaaggacaactgcaagagacttcctatgct 8103808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 22190196 - 22190367
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22190196 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgttcccgttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgatt 22190294  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  22190295 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 22190367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 23749874 - 23750047
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23749874 gaaagacacaaagcaattatacagattccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 23749972  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  23749973 ttacaactgttcactgttaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaggatatttcctatgct 23750047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14905043 - 14904898
Alignment:
Q  77 caattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactg 175  Q
    |||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14905043 caattatacatgttcctgacacaggccggaagtcagtcttgtcccccttgtacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactg 14904944  T
Q  176 ctaaaa-ctagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaaga 220  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14904943 ctaaaacctatcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaaga 14904898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 40860021 - 40860192
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40860021 gaaagacacaa-gcaatttatacaggctccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgatt 40860119  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    | || |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40860120 aaaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 40860192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 12600110 - 12600280
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12600110 gaaagacacaaaacaattatacaagttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgaacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 12600208  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12600209 ttacaactgctcactgctaca-ctag-aagagacttcaaatgctcaaccacaactgcaagagatttcctatgct 12600280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27189388 - 27189233
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27189388 ttatacaggttccttccacaagccggaagtcagtcctgtccctcttgcacttccaagaggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 27189289  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27189288 aacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 27189233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15475905 - 15475733
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccct------tgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15475905 agacacaaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagcccccccccccctgcacttccaaggagagttcactatgtaatatttgat 15475807  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15475806 tacaattgctcaatgctaaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15475733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8686204 - 8686029
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta-----tgtaatatct 157  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||    
T  8686204 gaaagacacaaaacaattatacaagttccttccacaaaccggaagt-agtcctgccccccttgcactttcaaggagagttcactaaaaaatgtaatatct 8686106  T
Q  158 gattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  8686105 gattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttaaaactactcaagcacaactacaagagatttcccatgct 8686029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15015136 - 15014973
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctgattacaattgc 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||| |||    
T  15015136 agcaattttacaggttccttccacaaatcggaagt-agtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctaattacaactgc 15015038  T
Q  170 tcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15015037 tcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaattgcaagagatttcctatgct 15014973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29681272 - 29681142
Alignment:
Q  69 acacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctgattaca 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  29681272 acacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccagaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatatgattaca 29681174  T
Q  165 attgctcactgctaaaactagcaatagacttc 196  Q
    | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29681173 acttctcactgctaacactagcaagagacttc 29681142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9752284 - 9752141
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  9752284 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcctgtcccccttgcacttccaagaggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcaatacta 9752185  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9752184 aacttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 9752141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 36470322 - 36470424
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  36470322 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgatta 36470421  T
Q  163 caa 165  Q
    |||    
T  36470422 caa 36470424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 15135079 - 15135253
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  15135079 gaaagacacaaagcagttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtccagtcccccttgcgcatccaaggagagttcactaaaatgtaatatctaa 15135178  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||  |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  15135179 ttacagctgctcattgtgaaaactagcaagagacttcaaacaactcaagcacaacaacaagagatttcctatgct 15135253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25651784 - 25651684
Alignment:
Q  133 aaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgc 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25651784 aaggagagttcattatgtaatatcttattacaattgctcactactaaatttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagatttcctatgc 25651685  T
Q  233 t 233  Q
    |    
T  25651684 t 25651684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10661923 - 10661760
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattac 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||   |  |||||||||||||    
T  10661923 gacataaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccacttgcacctcccaggagagttcactaaaatcaaatatctgattac 10661825  T
Q  164 aattgctcactgct-aaaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttc 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  10661824 aattgctcactgctcaaaactagcaagagacttcaagctactcaaccacaagtgcaagagatttc 10661760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10876068 - 10875905
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattac 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||   |  |||||||||||||    
T  10876068 gacataaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccacttgcacctcccaggagagttcactaaaatcaaatatctgattac 10875970  T
Q  164 aattgctcactgct-aaaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttc 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  10875969 aattgctcactgctcaaaactagcaagagacttcaagctactcaaccacaagtgcaagagatttc 10875905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 168
Target Start/End: Original strand, 23120887 - 23120992
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23120887 gaaagacacaaaacaattatacatgttccttccacaaaccggaagtttgtcttgtcccccttgcacttccaaggatagttcactatgtaatatctaatta 23120986  T
Q  163 caattg 168  Q
    ||||||    
T  23120987 caattg 23120992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16476134 - 16475966
Alignment:
Q  69 acacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctgattac 163  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||| |||||     
T  16476134 acacaaagcagttatacatgttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactaaaaatgtaatatcggattat 16476036  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || || | ||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  16476035 aactgtttactactaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcac-acaacaagagatttcctatgct 16475966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 18773445 - 18773553
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  18773445 gaaagacgcaaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagt-agtcatgtcccccttgccctttcaaggagagttcactaatcaatatctgatta 18773543  T
Q  163 caattgctca 172  Q
    ||||||||||    
T  18773544 caattgctca 18773553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 22089636 - 22089717
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcac 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22089636 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaa-ttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 22089717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 233
Target Start/End: Original strand, 10249286 - 10249456
Alignment:
Q  66 aagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  |   |||||  |||||    
T  10249286 aagacacaaagcaactatacagattccttccacaaaccggaact-agtcatgtcccccttgcacctccaagaagagttcactaaaatcaatattcgatta 10249384  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  10249385 caattgctcagggctcaaaatagcaagagacttcaaactactcaagaacaactacaagagatttcctatgct 10249456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14903173 - 14903090
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14903173 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagt-agtcctgtctcccttgcacttccaaggagagttcacta 14903090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20571755 - 20571672
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20571755 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagt-agtcctgtccctcttgcacttccaaggatagttcacta 20571672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 233
Target Start/End: Original strand, 17539840 - 17539923
Alignment:
Q  151 aatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  17539840 aatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcgcaactacaagagatttcctatgct 17539923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14190169 - 14190088
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14190169 agacacaaacaatttatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14190088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 18473426 - 18473585
Alignment:
Q  73 aaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgattacaattgc 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |   ||||||||||||||| |||    
T  18473426 aaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactaaaatcaatatctgattacaaatgc 18473524  T
Q  170 tcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||  ||  | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||   ||||||| |||||||||||    
T  18473525 tca-agc--atacaagcaagagacttcaaatactcaaccacacaagcaagagatttcctatgct 18473585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 13027136 - 13027246
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  13027136 gaaagacacaaagaaattatgcaggttccttccacaatctagaagt-agtcttgtcccctttgtacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgat 13027234  T
Q  161 tacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||    
T  13027235 tacaattgctca 13027246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 13693198 - 13693280
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13693198 gaaagacacaa-gcaattatacaggttccttccataatccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13693280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19889740 - 19889657
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19889740 gaaagacacaaagaaattatataggttccttccacaatccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19889657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 221
Target Start/End: Original strand, 23122969 - 23123030
Alignment:
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23122969 ttacaattgctcactgctaaaactaccaagagacttcaaatgctcaagtacaattgcaagag 23123030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16325255 - 16325087
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |   ||||| ||||    
T  16325255 gaaagacgcaaagcaattatacaggt-ccttccataatccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatttgat 16325158  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||  ||  |||  ||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  16325157 tacaattgctca-agcacaaa--agcaagagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgct 16325087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 114
Target Start/End: Original strand, 17246980 - 17247030
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17246980 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtc 17247030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24628660 - 24628577
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24628660 gaaagacacaaaacaattatacagatttcttccacaaaccagaagt-agtcctgtcccccttacactttcaaagagagttcacta 24628577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 118
Target Start/End: Original strand, 10071906 - 10071959
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10071906 aaagacacaaatgaattatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcatgt 10071959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 31267460 - 31267396
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31267460 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtccccttgcacttccaaggaga 31267396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 13890185 - 13890268
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13890185 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttccacaattcgaaagt-agttttgtcccccttgtacttccaaggagagttcacta 13890268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Original strand, 36470268 - 36470304
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaacc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36470268 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaacc 36470304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14711447 - 14711382
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  14711447 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 14711382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14779111 - 14779046
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  14779111 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 14779046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 19241610 - 19241675
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19241610 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcctccttgcacttccaaggaga 19241675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 101
Target Start/End: Original strand, 14357709 - 14357746
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14357709 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaa 14357746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 11535427 - 11535509
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11535427 gaaagacacaa-gcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 11535509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19621743 - 19621679
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcactt 130  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  19621743 gaaagacacaaagc--ttatacagattccttccacaaaccagaagt-actcatgtcccccttgcactt 19621679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 148
Target Start/End: Original strand, 3370306 - 3370380
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3370306 aagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 3370380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 33377772 - 33377838
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  33377772 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtccccattacacttccaaggagagtt 33377838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 10290217 - 10290290
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10290217 aagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 10290290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 10300126 - 10300199
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10300126 aagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 10300199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 11514626 - 11514691
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  11514626 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 11514691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18775351 - 18775286
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  18775351 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 18775286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 23508734 - 23508799
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23508734 aagcaattatcctggttcattccacaaaccggaagt-agtcaagtcccccttgcacttccaaggaga 23508799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 24713019 - 24713092
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24713019 aagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtccccattgcacttccaaggagatttcacta 24713092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36210784 - 36210713
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  36210784 agacacaaa-caattatactggttcgttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 36210713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 2651199 - 2651282
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||    
T  2651199 gaaaaacacaaatcaattatacaggtttcttccataatccggaagt-agtcctgtcccccttgcactttcaggtagagttcacta 2651282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 107
Target Start/End: Original strand, 16847740 - 16847784
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaa 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16847740 gaaagacacaaaacaatttatacaggttccttccagaaaccagaa 16847784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17994421 - 17994362
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaa 134  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  17994421 aagcaattatactggttccttctacaaaccggaagt-agtccagtccccctgcacttccaa 17994362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18007755 - 18007692
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  18007755 gcaattatactggttctttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 18007692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 96
Target Start/End: Original strand, 20575640 - 20575672
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttcc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20575640 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttcc 20575672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40455024 - 40454942
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40455024 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 40454942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40471262 - 40471180
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40471262 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 40471180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 92)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15532418 - 15532248
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15532418 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcattatgtaatatctgatta 15532319  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15532318 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 15532248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 17380932 - 17381103
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  17380932 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatatctaatt 17381031  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17381032 acaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17381103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 21624447 - 21624617
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21624447 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaagtaatatctaatta 21624546  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21624547 caattgctcactgctaaaactagcaagatacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21624617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 71 - 221
Target Start/End: Original strand, 10631497 - 10631648
Alignment:
Q  71 acaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgc 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10631497 acaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatgtttgattacaattgc 10631596  T
Q  170 tcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10631597 tcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 10631648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 13601522 - 13601695
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  13601522 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 13601621  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13601622 ttacaactgctcactgctaaaactagcacgagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 13601695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 21234514 - 21234686
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21234514 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 21234613  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttc-aaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  21234614 acaattgctcactgctaaaactagcaagagatttcaaaatgctcaagcacaacggcaagagacttcctatgct 21234686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 13435241 - 13435410
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435241 gaaagacacaaagcaattatgcaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctttcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 13435339  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  13435340 caattgttcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 13435410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20731497 - 20731326
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  20731497 gaaagacacaaagcaatttatataggttccttccacaaaccggaaatcagtcctgtccccttgcacttccaacgagagttcactctttaatatctgatta 20731398  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20731397 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 20731326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 18377798 - 18377956
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18377798 gaaaaacacaaatcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtccggtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctaatta 18377897  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18377898 caaatgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactacaagag 18377956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 9717199 - 9717358
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9717199 gaaagacacaaagcaattatataggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcactaagtaatatctgatta 9717298  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9717299 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 9717358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19952360 - 19952206
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19952360 gaaagacacaaagcaat---acaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcattatgtaatatctgatta 19952264  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaaga 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19952263 caattgctcactgctaaaattagcaaaagacttcaaatgctcaaacacaactgcaaga 19952206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 15986709 - 15986883
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  15986709 gaaagacacaaagcaattatacagtttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttcaaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 15986808  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15986809 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 15986883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 26588970 - 26589126
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattac-aattgctcactgct 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26588970 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctaattacaaattgctcactgct 26589069  T
Q  178 aaaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26589070 aaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 26589126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 15301571 - 15301743
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  15301571 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccagaagt-agacctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 15301669  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15301670 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagatttcaaaagctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15301743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 16876259 - 16876432
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||    
T  16876259 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccttgcacttcgaaggagagttcactaaaaagtaatatctga 16876358  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16876359 ttacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16876432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 32543621 - 32543780
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32543621 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcattttcaaggagagttcactatataatatctgatta 32543720  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32543721 cagttgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 32543780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12716216 - 12716043
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12716216 gaaagacacaaagcatatatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 12716117  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12716116 ttacaactgctcattgctaaacttagcaagagactataaatgctcaagcacaactgcaagagaattcctatgct 12716043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 15954054 - 15954212
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15954054 gaaagaca-aaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagatcactatttaatatctgatt 15954152  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15954153 acaattgctcattgctaaaactagcaagagaattcaaatgctcaagcacaattgcaagag 15954212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Original strand, 16528667 - 16528836
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  16528667 aaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgat 16528766  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttccta 229  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16528767 tacaactgctcactactaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacgactgcaagagatttccta 16528836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14101231 - 14101058
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  14101231 gaaagacataaatcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 14101133  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14101132 ttacaactgctctctgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14101058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 22801495 - 22801667
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22801495 gaaagacacaaagcaatttatacagattccttccacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcatttccaaggagatttcactatgtaatatctgatt 22801594  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22801595 acaattgctcacttctaagactagtaagagacttcaaatttctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22801667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 12422620 - 12422778
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12422620 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcactcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 12422718  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12422719 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 12422778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17317271 - 17317116
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17317271 ttatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcctgtccccctagcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaattactcactgcta 17317172  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17317171 aaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17317116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33353020 - 33352850
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33353020 gaaagacacaa-gcaatttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatatcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaaaatctgatt 33352922  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33352921 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33352850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20113430 - 20113269
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  20113430 gaaagacacaaagcaattatacaggttacttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctaa 20113332  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20113331 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagag 20113269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 19688150 - 19688308
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcac 173  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  19688150 agcaattatacaagttccttccataagcaggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattgcaatcgctcaa 19688249  T
Q  174 tgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19688250 tgct-aaactagcaaaagatttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 19688308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 21617602 - 21617772
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21617602 gaaagacacaaacaatttatactggttcattccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcactatgtaatatctgatta 21617701  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  21617702 caattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagaacaattgcaagagacttcctatgct 21617772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14732911 - 14732737
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaagga-gagttcacta---tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||||| |||  | ||||||||||   |||||||||||    
T  14732911 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaactggaagttagtcctgtcccccttgcactttcaaacaagagttcactaaaatgtaatatctg 14732812  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14732811 attacaactgctcactgctaaaactagcacgagacttcaaatgcacaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14732737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 19470023 - 19470196
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||    
T  19470023 gaaagacacaaaaaaattatacaagttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtccccctagcacttctaaggagagttcactataatgtgatatctga 19470121  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19470122 ttacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgct 19470196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 19623335 - 19623508
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||    
T  19623335 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagtgtttactaaaatgtaatatctga 19623433  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19623434 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattattcaagcacaactgcaagaggtttcctatgct 19623508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19066795 - 19066640
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19066795 ttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 19066696  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19066695 aacttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 19066640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19833771 - 19833600
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19833771 gaaagacacaaagcaatttataaaggttccttacacaaaccgaaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcaatatgtaatatcttatt 19833672  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  19833671 acaattgctcactactaaacttagtaacagatttcaaatgctcaagtacaactgcaagagacttcctatgct 19833600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22077167 - 22077009
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22077167 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccataaatcagaagtcagttatgtcccccttgcacttccaagtagagttcactatgtaatatctgatt 22077069  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||| ||  ||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077068 acaattgctctctattaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 22077009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 25593424 - 25593597
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |   | |||||| |||    
T  25593424 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaaatcagtcctgccccccttgcatttccaaggagagttcaccaaaatataatatttga 25593523  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  25593524 ttacaaatgctcactgctaaacttagcaaaagacttcaaatgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 25593597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 26941791 - 26941966
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||    
T  26941791 gaaagacacaaagcaattatacagatttcttccacaaaccagaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagagtttactaaaaatgtaatatctg 26941890  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  26941891 attacaactgctcactactaaacttagcaagagacttcaaactactcaatcacaactgcaagagattacctatgct 26941966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 19085514 - 19085687
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  19085514 gaaagacacaaagcaattatacacattccttccacaaaccggaagt-agtattgtcgcccttacacttccaaggagagttcaccaaaatgtaatatctga 19085612  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19085613 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 19085687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 19482108 - 19482279
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482108 gaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 19482207  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||| | |||||  ||| |  |||||||||| |||| |||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  19482208 caaatgctcattactaaacttagtatgagacttcaaattgctgaagcgcaactgtaagagacttcctatgct 19482279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Original strand, 29917389 - 29917550
Alignment:
Q  70 cacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattg 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29917389 cacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagt-agtctagtccccgttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatcttattacaattg 29917487  T
Q  169 ctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||   | ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29917488 ctc---gttaaaattagcaagagacttgaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 29917550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 25591978 - 25592150
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatc--tgat 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    | |||  ||||    
T  25591978 gaaagacacatagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaataaatcactgat 25592076  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25592077 tacaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 25592150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 24116186 - 24116356
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24116186 agacacaaaacaagtatacaggttccttccacaaaccagaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgatta 24116284  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| |||||  |||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24116285 caactgctcacttctaaacttagcgagagactttaaattactcaagcacaactgcaagagattttctatgct 24116356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 18434894 - 18435068
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta-----tgtaatatct 157  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||| |    
T  18434894 gaaagacacaaagcaattatacaacttccttccacaaatcggaagt-actcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaaatgtaatatgt 18434992  T
Q  158 gattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18434993 aattacaactgctcactgctaaatttagcaagagacttcaaatgatcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 18435068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 188
Target Start/End: Original strand, 3680469 - 3680596
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |    
T  3680469 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctta 3680567  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaa 188  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3680568 ttacaattgatcactgctaaaactagcaa 3680596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17304065 - 17303893
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  17304065 gaaagacacatagcaattatatagatttcttccacaaaccggaagt-agtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcactacaatcaatatctgat 17303967  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17303966 tacaattgctcactgctcaaaatagcaagagacttcaaactactaaagcacaactgcaagagatttcatatgct 17303893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 25929834 - 25930006
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  25929834 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttcaacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgat 25929932  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25929933 cacaaatgctcactgctcaaaatagcaagagacttcaaactacgcaagtacaactgcaagagatttcctatgct 25930006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 7763020 - 7763183
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctgattacaattgct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||| |    
T  7763020 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcccgtcccccttgcactttcaagaagagttcactaaaaatgtaatatctgattacaattgtt 7763119  T
Q  171 cactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     | |||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7763120 gagtgctaaacttagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcatatgct 7763183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 17927148 - 17927320
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  17927148 gaaagaaacaaatcaattatacaggttccttccacaaactggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgat 17927246  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17927247 tacaactgctcaatgctaaaattagcaagagacttcaaactactcaaacacaattgcaagagatttcctatgct 17927320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 233
Target Start/End: Original strand, 12347461 - 12347620
Alignment:
Q  77 caattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgt--aatatctgattacaattgctcac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||| ||||    
T  12347461 caattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtccccattgcacttccaaggaaagttcactaaaatcaatatctgattacaattgttcac 12347559  T
Q  174 tgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12347560 tgctcaaaatagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgct 12347620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 233
Target Start/End: Original strand, 16914808 - 16914954
Alignment:
Q  92 cttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagca 187  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  16914808 cttccacaaatcggaagtcagtcatgtcccccttgcatttctaaggagagtttactaaaatgtaatatctgattacgactactcactgctaaaactagca 16914907  T
Q  188 atagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16914908 agagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 16914954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 19625166 - 19625340
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||    
T  19625166 gaaagacacaaatcaattatacaagttcctttcacaaactggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgttatatctg 19625264  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  19625265 attacaactgcttactactaaaactagcaagagacatcaaactactcgaacacaactgcaagagatttcctatgct 19625340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 23296142 - 23296302
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |   ||||||||||    
T  23296142 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-attcttgttcccttagcacttccaaggagagttcaataaaatcaatatctgat 23296240  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    || || || |||||||| ||| || ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23296241 tataaatgttcactgctcaaaataccaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagag 23296302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24719526 - 24719443
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24719526 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccagaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24719443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 175
Target Start/End: Original strand, 29537968 - 29538082
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||    
T  29537968 gaaagccacaaagcaattatataggttccttccataaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaagtagagtttactaaaatgtaatatctga 29538066  T
Q  160 ttacaattgctcactg 175  Q
    |||||| |||||||||    
T  29538067 ttacaactgctcactg 29538082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 142
Target Start/End: Original strand, 12041218 - 12041286
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12041218 agcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt 12041286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Original strand, 32335199 - 32335307
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |   |||||||||||    
T  32335199 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccggaaat-agtcatgtcccctttgcatttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgatt 32335297  T
Q  162 acaattgctc 171  Q
    ||||||||||    
T  32335298 acaattgctc 32335307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18173014 - 18172904
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  18173014 gaaagtcacaaaacaattatacaagttccttccacaatccggaagt-agtcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgat 18172916  T
Q  161 tacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||    
T  18172915 tacaattgctca 18172904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 18226787 - 18226897
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  18226787 gaaagtcacaaaacaattatacaagttccttccacaatccggaagt-agtcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgat 18226885  T
Q  161 tacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||    
T  18226886 tacaattgctca 18226897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 17876797 - 17876966
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |   ||||||||||    
T  17876797 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaatccagaagt-attcttgtcacccttgcccttccaaggagcgttcactaaaatcaatatctgat 17876895  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  17876896 tacaattgctca-tgcacaaa--agcaagagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcatatgct 17876966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14052159 - 14052095
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14052159 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttc 14052095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14070850 - 14070786
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14070850 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttc 14070786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24729312 - 24729142
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcac-ttccaaggagagttcact--atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |   ||||||| |    
T  24729312 gaaagacacaaaacaattatacaagttccttccacaatccggaagt-agtcttgtcccccttgcactttccaaggagagttcactaaaatcaatatctta 24729214  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||  ||  |||  ||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24729213 ttacaattgctca-agcacaaa--agcaaaagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgct 24729142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 233
Target Start/End: Original strand, 29597543 - 29597602
Alignment:
Q  174 tgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29597543 tgctaaaactagcaagagacttcaaatgctgaagcacaactgcaagagacttcctatgct 29597602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23006786 - 23006683
Alignment:
Q  71 acaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgattacaatt 167  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |   |||||||||||||||||    
T  23006786 acaaagcaattatacaagttccttccataatccggaagt-agtcatgtcccccttccactttcaaggagagttcactaaaatcaatatctgattacaatt 23006688  T
Q  168 gctca 172  Q
    |||||    
T  23006687 gctca 23006683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 172
Target Start/End: Original strand, 23781580 - 23781683
Alignment:
Q  71 acaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgattacaatt 167  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |   |||||||||||||||||    
T  23781580 acaaagcaattatacaagttccttccataatccggaagt-agtcatgtcccccttccactttcaaggagagttcactaaaatcaatatctgattacaatt 23781678  T
Q  168 gctca 172  Q
    |||||    
T  23781679 gctca 23781683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14923967 - 14923885
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14923967 gaaagacacaaa-caattatacatgttccttccacaatccggaagt-agtcattcctcccttgcacttccaaggagagttcacta 14923885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 11205493 - 11205558
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagt-catgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  11205493 aagcaattatactggttccttccacaaaccagaagt-agtccattcccccttgcacttccaaggaga 11205558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15395401 - 15395305
Alignment:
Q  78 aattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgattacaattgctca 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |   ||||| ||||||||||||||||    
T  15395401 aattatacaagttccttccacaatccggaagt-agtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcacttaaatcaatatatgattacaattgctca 15395305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 233
Target Start/End: Original strand, 17867027 - 17867183
Alignment:
Q  77 caattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgattacaattgctcac 173  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |   ||||||||||||||||||||||     
T  17867027 caattatacaagttccttccacaatccagaagt-attcttgtcacccttgcccttccaaggagcgttcactaaaatcaatatctgattacaattgctca- 17867124  T
Q  174 tgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||  |||  ||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  17867125 tgcacaaa--agcaagagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcatatgct 17867183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 26185141 - 26185224
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26185141 gaaaaacacaaaacaattatacaggttacttccacaatccggatgt-agtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 26185224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15478538 - 15478464
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15478538 gaaagacacaaaacaattatcttggttccttccacaatccggaagt-agtccagtccccttgcacttccaaggaga 15478464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 20635089 - 20635155
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  20635089 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 20635155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7586939 - 7586874
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  7586939 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 7586874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17609089 - 17609024
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  17609089 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtctcccttgcacttccaaggaga 17609024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 21127597 - 21127662
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  21127597 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 21127662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 21034386 - 21034497
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctga 159  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||    
T  21034386 gaaagactcaaagcaatttatagtggttccttccacaatacagaagt-agtccactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctga 21034484  T
Q  160 ttacaattgctca 172  Q
    |||||||||||||    
T  21034485 ttacaattgctca 21034497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 97
Target Start/End: Original strand, 24398204 - 24398237
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttcca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24398204 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttcca 24398237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 97
Target Start/End: Original strand, 25595650 - 25595683
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttcca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25595650 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttcca 25595683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14883740 - 14883657
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || ||| || || |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14883740 gaaagacacaaaacaattatacatatttctttcaaaatccagaagt-agtctggtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14883657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 15551382 - 15551465
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||  || |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15551382 gaaagacataaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagt-agtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcacta 15551465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Original strand, 25678934 - 25678997
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  25678934 gcaattatcctggttccttccacaaaccagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 25678997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17446387 - 17446273
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||| ||||||||||| ||||  ||  |||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |    
T  17446387 ccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatttgattacaatttctca-agcacaaa--agcaagagacttcaaactactcaagcacaacag 17446291  T
Q  216 caagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||    
T  17446290 caagaggtttcctatgct 17446273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 22386172 - 22386238
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22386172 gcaattatactggtttcttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 22386238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 11235016 - 11235081
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagt-catgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  11235016 aagcaattatactgattccttccacaaaccggaagt-agtccattcccccttgcacttccaaggaga 11235081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16124195 - 16124134
Alignment:
Q  87 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16124195 ggttccttccacaaatcggaagt-agtcaagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 16124134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17746457 - 17746384
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17746457 aagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 17746384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 18554818 - 18554883
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  18554818 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 18554883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18835306 - 18835233
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18835306 aagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 18835233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 29765059 - 29765132
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29765059 aagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcctccttgcacttccaaggagatttcacta 29765132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12953784 - 12953713
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  12953784 agacacaaa-caattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 12953713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 31571938 - 31572011
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | |||||   |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31571938 aagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 31572011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 222
Target Start/End: Original strand, 19623525 - 19623557
Alignment:
Q  190 agacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagt 222  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19623525 agacttctaatgctcaagcacaactgcaagagt 19623557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 26043728 - 26043810
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26043728 aaagacacaa-gcaattatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 26043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27167124 - 27167042
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  27167124 gaaagacacaa-gcaattatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcacta 27167042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 79)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 31487590 - 31487760
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31487590 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacagaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 31487689  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  31487690 caattgctcactgctaaaactacaaagagacttcaaatgctcaagcacagctgcaagagacttcctatgct 31487760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13546306 - 13546138
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13546306 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaagtaatatctgatta 13546208  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgc 232  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13546207 caatagctcaatgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgc 13546138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 17814316 - 17814489
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17814316 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgctcttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 17814415  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17814416 ttacaattgatcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17814489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13736847 - 13736699
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcac 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13736847 agcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatttgattacaattgctcac 13736748  T
Q  174 tgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13736747 tactaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 13736699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7746479 - 7746306
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  7746479 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactagaatgtaatatctga 7746381  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7746380 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 7746306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12353580 - 12353406
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  12353580 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttccacaagccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 12353481  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  12353480 ttacaaatgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcataattgcaagagatttcctatgct 12353406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25097611 - 25097438
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  25097611 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtccccctagcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 25097513  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25097512 ttacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactacttaagcacaattgcaagagatttcctatgct 25097438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25155581 - 25155408
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  25155581 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtccccctagcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 25155483  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25155482 ttacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactacttaagcacaattgcaagagatttcctatgct 25155408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28465121 - 28464951
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28465121 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 28465023  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28465022 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 28464951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 15516340 - 15516494
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15516340 ttatacaggttcctaccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctaattacaattgctcactacta 15516439  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15516440 aacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15516494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6513216 - 6513043
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  6513216 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactataatgtagtatctga 6513117  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6513116 ttacaactgctcactgctaaacatagcaagagactttaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 6513043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30116620 - 30116450
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30116620 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcatttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 30116522  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30116521 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 30116450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 10848125 - 10848296
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10848125 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 10848223  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10848224 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 10848296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21100488 - 21100314
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  21100488 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcattactgtcccccttgcatttccaatgagagttcactaaaatgtaatatctga 21100389  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21100388 ttacaacggctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 21100314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 21659568 - 21659735
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaa 165  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21659568 agacacaaatcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcactttcaaggagagttcactatgtaatatctgattacaa 21659666  T
Q  166 ttgctcactgctaaaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21659667 ttgctcattgctaagactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21659735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19537058 - 19536910
Alignment:
Q  88 gttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaact 183  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19537058 gttccttccacaaatcggaagt-agtcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaact 19536960  T
Q  184 agcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19536959 agcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 19536910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26766620 - 26766448
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  26766620 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcatttccaagaagagttcactaagatgtaatatctga 26766522  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  26766521 ttacaactaatcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagtacaaatgcaagagacttcctatgct 26766448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 26783710 - 26783878
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||| ||||    
T  26783710 gacacaaagcaattatacaggttccttcaacaaaccggaagt-agtattgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatgtaacatctgtttac 26783808  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26783809 aactgctcactgctaaaactagaaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 26783878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 33022015 - 33022189
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33022015 gaaagacacaaagcaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactatgtaatatctaatt 33022114  T
Q  162 acaatt--gctcactgctaaaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  33022115 acaattgcgctcactgctaaaactagcaagagacttcaagtttctcaagcacatctgcaagagacttcctatgct 33022189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 42243035 - 42243205
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42243035 gaaagacacaa-gcaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcactatataatatctgatt 42243133  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| || ||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42243134 acaaatgttcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 42243205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22000812 - 22000651
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22000812 gaaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaaaccagaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 22000714  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  22000713 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaattgcaagag 22000651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 26764873 - 26765028
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattac-aattgctcactgct 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26764873 ttatacaggctccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatataatatctgattacaaattgctcactact 26764972  T
Q  178 aaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  26764973 aaagttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgct 26765028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 31117231 - 31117403
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  31117231 gaaagacacaaagtagttatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttactaaaatgtaatatctga 31117329  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31117330 ttacaactactcactgctaaacttagcaagagacttcaaatactcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 31117403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 4886316 - 4886485
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4886316 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactatgtaatatctgatt 4886414  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatg 231  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  4886415 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaaacacaattgcaagagacttcctatg 4886485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 11993241 - 11993414
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat--gtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| |    
T  11993241 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaagtattatctaa 11993340  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  11993341 ttacaattgctcactactaaacttagtaagagaattcaaatgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 11993414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 28138957 - 28139131
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28138957 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaaaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatatctgatt 28139055  T
Q  162 acaattgctcac----tgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||    |||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28139056 acaattgctcactacgtgctaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 28139131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 643485 - 643312
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  643485 gaaagacacaaaacaattatacaagttccttctacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 643387  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||| | |||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  643386 ttacaactgctcactactaaaactagcaagaggcttcaaattactcaagcataactgcaagagatttcttatgct 643312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 23880422 - 23880591
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  23880422 gacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggatgt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattac 23880520  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || | |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23880521 aactactcactgctacaactagcaagagacttcaaattactcaagcccaactgcaagagatttcctatgct 23880591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 33932621 - 33932792
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33932621 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgcaatatctgatt 33932719  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33932720 acaaatgctcactactaaatttactaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33932792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35932791 - 35932620
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35932791 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgatt 35932693  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  35932692 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttaaaattgctcaagcacaactgcaggagacttcctatgct 35932620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3246225 - 3246067
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3246225 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaacggaagtcggtcctgtcctccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 3246127  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3246126 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgtttaagcacaactgcaagag 3246067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 9088323 - 9088481
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9088323 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaatcggaaatcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactatgtaatatctgatt 9088421  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9088422 acaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagtgcaactgcaagag 9088481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29139188 - 29139030
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29139188 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcattatgtaatatcttatt 29139090  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||| || |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29139089 acaattgctccctactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 29139030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21199785 - 21199612
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||   | ||||||||||    
T  21199785 gaaagacacaaaacaaatatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcactttcgaggagagttcactaaaatttaatatctga 21199687  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21199686 ttataactactcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 21199612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23413759 - 23413586
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  23413759 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttacacaaaccggaagt-agtcttgtccccctttcacttccaaggagagttcattaaaatgtaatatctga 23413661  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23413660 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagaaacttcaaattactcgagcacaactgcaagagatttcctatgct 23413586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 30742335 - 30742506
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30742335 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaccaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagggttcactatgtaatatctgatt 30742433  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| ||||||||  ||||  ||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30742434 acaaatgctcactattaaacttagtaagagacttcaaattgttcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 30742506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9399398 - 9399227
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  9399398 agacacaaaacaattatacaagttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctgatt 9399300  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| | ||||  |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9399299 acaactactcagagctacaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaggagatttcctatgct 9399227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35987001 - 35986858
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  35987001 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcactaccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgttcactacta 35986902  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35986901 aacttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 35986858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 90204 - 90034
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||    
T  90204 gacacaaatcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactaaaaatgtaatatctgatta 90106  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| || |||||||||||  |||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  90105 caactgttcactgctaaacttagctagagacttcaaattactaaagcacaactgcaagagatttcctatgct 90034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23392362 - 23392218
Alignment:
Q  91 ccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccct-tgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaat 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  23392362 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccctgcacttccaaagggagttcactatgtaatatctgattacaattgctcacggctaaaactagcagg 23392263  T
Q  190 agacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23392262 agacttcaacttcctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 23392218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14087281 - 14087165
Alignment:
Q  107 agtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctc 204  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| |||||    
T  14087281 agtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctc 14087182  T
Q  205 aagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  14087181 aagcacaactgcaagag 14087165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 144
Target Start/End: Original strand, 6498665 - 6498746
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttca 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6498665 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccacggagagttca 6498746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21072962 - 21072848
Alignment:
Q  123 ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaa 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21072962 ttgcacttccaatgagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaa 21072863  T
Q  219 gagttttcctatgct 233  Q
    ||  |||||||||||    
T  21072862 gatatttcctatgct 21072848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 20968600 - 20968768
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcactatgt-aatatctgatt 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| |||    
T  20968600 gaaagacacaaatcaattatacaggttccttccacaatccggaagt-agtcatgtcctccttgcacttccaagcagagttcactaaatcaatatcttatt 20968698  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagactt-caaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| ||||||    ||||   ||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  20968699 acaaatgctcaagcataaa---agcaagagacttccaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcctatgct 20968768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25112662 - 25112584
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25112662 gaaagacacaa-gcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtt 25112584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25171753 - 25171675
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25171753 gaaagacacaa-gcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtt 25171675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39799625 - 39799542
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39799625 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttccacaattcagaagt-agccatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 39799542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 32160112 - 32160179
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatg-tccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32160112 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgttccccttgcacttccaaggagagtt 32160179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 135
Target Start/End: Original strand, 37395517 - 37395589
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaag 135  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37395517 gaaaaacacatagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgcccccttgcacttccaag 37395589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11208778 - 11208715
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatg-tccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11208778 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagtt 11208715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 16606868 - 16607038
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |   |   ||||||||||||    
T  16606868 gaaagacacaaagcaattatacatgtttgttttacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccatggagagcactaaaatcaatatctgatta 16606966  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | || ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  16606967 gaattactcactgctcaaactagcaagagacttcaaactactgaagcataaatgcaagagatttcctatgct 16607038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31146372 - 31146271
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||| |||    
T  31146372 ttatactggttccttccacaaaccggaagtcaatgatatcccccttgcacttccaaggggagtttactatgtaatatctaaatgcaaatgctcactacta 31146273  T
Q  179 aa 180  Q
    ||    
T  31146272 aa 31146271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 26251302 - 26251412
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  26251302 gaaaggcacaaagcaattatacagattccttccaaaatccaaaagt-agtcatgtccccctcacacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgat 26251400  T
Q  161 tacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||    
T  26251401 tacaattgctca 26251412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25156807 - 25156679
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgc 169  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||  | |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||| |||||    
T  25156807 aagcacttatacagggtccttcctcaaaccggatct-agtcgtgtccccctagcacttacaaggagagttcattaaaatgttatatctgattaccattgc 25156709  T
Q  170 tcactgctaaaactagcaatagacttcaaa 199  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25156708 tcactgctaaaactcgcaagagacttcaaa 25156679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31589715 - 31589643
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31589715 agcaattatacaggttcattccacaatccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 31589643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13736304 - 13736268
Alignment:
Q  132 caaggagagttcactatgtaatatctgattacaattg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13736304 caaggagagttcactatgtaatatctgattacaattg 13736268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21075968 - 21075909
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  21075968 gaaagacacaaaacaattatacagattccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccctt 21075909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 139
Target Start/End: Original strand, 40228011 - 40228085
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  40228011 gaaagacacaa-gcaattatactggttccttccacaaactagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 40228085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26120605 - 26120531
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26120605 aaagactcaaatcaattatacaggttccttccacaatccggaagt-agtcctgtcccccttgtacttccaaggaga 26120531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20215891 - 20215826
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20215891 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 20215826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 23477738 - 23477803
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  23477738 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtccctcttgcacttccaaggaga 23477803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 23487914 - 23487979
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  23487914 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 23487979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40033513 - 40033448
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  40033513 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 40033448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 25770423 - 25770360
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatg-tccccttgca 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||    
T  25770423 gaaagacacaaaacaattatacagattccttccacaatccggaagt-agtcatgttccccttgca 25770360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 13522587 - 13522652
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  13522587 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 13522652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 13533344 - 13533409
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  13533344 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 13533409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20168822 - 20168757
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20168822 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggaga 20168757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20417685 - 20417620
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20417685 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 20417620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20625549 - 20625484
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20625549 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggaga 20625484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 35543883 - 35543818
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  35543883 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 35543818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 90023 - 89986
Alignment:
Q  184 agcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  90023 agcaagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagag 89986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26056272 - 26056227
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagt 109  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  26056272 gaaagacacaaagcaattatcttggttccttccacaatccagaagt 26056227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 106911 - 106837
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  106911 gaaagacacaa-gcaattatcctggttccttccacaatccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 106837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 1108615 - 1108697
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1108615 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 1108697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 1121373 - 1121455
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1121373 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 1121455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19464761 - 19464679
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19464761 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 19464679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19478791 - 19478709
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19478791 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 19478709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19546307 - 19546279
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttcc 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19546307 gaaagacacaaagcaattatacaggttcc 19546279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 139
Target Start/End: Original strand, 21420231 - 21420305
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  21420231 gaaagacacaa-gcaattatcctggttccttccacaatccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 21420305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6440 - 6289
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6440 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaatggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaat 6341  T
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6340 tgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaa 6289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 402 - 236
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  402 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggatagttcactatgtaatatctgattacaat 303  T
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  302 tgctcattgctaaaactagcatgaaacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 38780748 - 38780906
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38780748 gaaagacacaaaacaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatattccccttgcatttcgaaggagagttcactatgtaatatctgatta 38780847  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38780848 caattgctcactgctaaaactagcaacagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 38780906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20569500 - 20569327
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  20569500 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctagcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 20569401  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20569400 ttacaactggtcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 20569327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22188852 - 22188681
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22188852 gaaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaaaccggaaatcagttttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 22188753  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22188752 caattgctcactgctaaaactagcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22188681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25038011 - 25037838
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  25038011 gaaagaaacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaaatcagtcatgtcacccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 25037912  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25037911 ttacaactgctcactgctaaaacaagcaagagacttcaagtgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 25037838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 23234364 - 23234518
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23234364 gacacaaagcaattatacaggttccttctacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatatctaattacaat 23234463  T
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23234464 tgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgcttaagcacaactgcaagag 23234518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 25828513 - 25828672
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  25828513 gaaagacacaaaccaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgat 25828611  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25828612 tacaactgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactacaagag 25828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13964712 - 13964556
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13964712 agcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcaccatgtaatatctgattacaattgctcac 13964613  T
Q  174 tgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  13964612 tgctaaaact---aagagacttcaaatgctcaagcgcaactgcaagagacttcctatgct 13964556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30558073 - 30557898
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  30558073 gaaagacacaaatcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctg 30557974  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30557973 attacagttgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 30557898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 22316943 - 22317114
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22316943 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaaaatctgatta 22317042  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttca-aatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  22317043 caattgctcactgctaaaactagcaagtgacttcagattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 22317114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 24575385 - 24575558
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  24575385 gaaagatacaaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagccagtcctctcccctttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 24575484  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24575485 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 24575558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6574847 - 6574672
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6574847 gaaagacacaaagccatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtttactatttaatatctgatt 6574748  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgcttct 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  6574747 acaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctaaagcacaactgcaaaagacttcctatgcttct 6574672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 233
Target Start/End: Original strand, 22257554 - 22257724
Alignment:
Q  66 aagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||    
T  22257554 aagacacaaagcaattatataggttccttccacaaatcggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctaatt 22257652  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22257653 acaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcccaactgcaagagacttcctatgct 22257724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22455709 - 22455534
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22455709 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcaattccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 22455610  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaac-tgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22455609 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactacccaagcacaacttgcaagagatttcctatgct 22455534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 25188749 - 25188923
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  25188749 gaaagacacaaaacaagtatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtttactaaaatgtaatatctga 25188848  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25188849 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactattcaagcacaactgcaagagattttctatgct 25188923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 18702091 - 18702258
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  18702091 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccgaaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 18702189  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  18702190 attacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttc 18702258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 40331461 - 40331631
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaa-ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40331461 gaaagacac-aagcaatttatacaggttcctcccacaaaccggaagtcagtcctgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 40331559  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40331560 caaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 40331631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34322665 - 34322511
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34322665 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactacta 34322566  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34322565 aacttagtaagagacttcaaatgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 34322511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20152752 - 20152593
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20152752 gaaagacacaaagcaatttatacaggctccttccacaaaccggaagttagtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 20152653  T
Q  162 acaatt--gctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaa 218  Q
    ||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20152652 acaattactctcactgctaaaactagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaa 20152593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39038391 - 39038217
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  39038391 gaaagatacaaatcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccgcttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 39038292  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39038291 ttacaactgctcattgcttaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 39038217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 24376457 - 24376631
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||    
T  24376457 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttctaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 24376555  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24376556 attacaactgctcacttctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 24376631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28701945 - 28701791
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28701945 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactacta 28701846  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || | ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  28701845 aacttagtaagaaacttcaaattctcaagaacaactgcaagagacttcctatgct 28701791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Original strand, 40781828 - 40781987
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||    
T  40781828 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaataagagttcactaaaatgtaatatctgat 40781926  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40781927 tacaactgctcactcctaaaactagcaagagacttccaatgctcaagcacaactgcaagag 40781987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10010501 - 10010328
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||    
T  10010501 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttacactttcaaggagagttcactaaaaatgtaatatttg 10010403  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10010402 attacaactgcccactgctaaaactagcaagagacttcaaatgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 10010328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28141351 - 28141178
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  28141351 gaaatacacaaagtaattatacatgttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctg 28141253  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28141252 atcacaactactcactgctaaaactagcaagagacttcaaatactcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 28141178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 19539767 - 19539940
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19539767 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaaat-agtcctgtcccgcttgaacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 19539865  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19539866 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 19539940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 40331138 - 40331309
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40331138 gaaagacacaa-gcaatttatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 40331236  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40331237 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 40331309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1587781 - 1587610
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc--ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1587781 gaaagacacaa-gcaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccccccttgcacttcaaaggagagttcactatgtaatatctgat 1587683  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1587682 tacaattgttcactactaaacttagtaagagacttcaaatcctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 1587610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23185048 - 23184878
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23185048 agacacaaagcaattatataggtctcttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaatatctgatta 23184950  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23184949 caactgctcactgctcaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 23184878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23596311 - 23596141
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23596311 agacacaaagcaattatataggtctcttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaatatctgatta 23596213  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23596212 caactgctcactgctcaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 23596141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24851412 - 24851239
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  24851412 gaaagacacaaagatattatagaggttccttccacaaatcggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 24851314  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24851313 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcataactgcaagagatttcctatgct 24851239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26367157 - 26366984
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  26367157 gaaagatacaaagcaattatacaagttccttccacaaatcgaaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctta 26367059  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26367058 ttacaactgttcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 26366984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31801638 - 31801465
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctg 158  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||    
T  31801638 gaaagacacaaaacaatttatacagattc-ttccacaaaccggaagtcattcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaaagtaatatctg 31801540  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31801539 attacaattgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 31801465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 22801838 - 22801993
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22801838 ttatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagtgttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 22801937  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22801938 aacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22801993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28712427 - 28712277
Alignment:
Q  84 acaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaac 182  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||      
T  28712427 acaggttccttccataaaccggaagtcattcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatcttattacaattgctcactactaaact 28712328  T
Q  183 tagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28712327 tagtacgagacttcaaatgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 28712277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18431687 - 18431513
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  18431687 gaaagacacaaaacaattgtacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtccccgttgcacttccaatgagagttcactaaaatgtaatatctga 18431589  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgctt 234  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18431588 ttacaactgctcactgttaaaactagcaagagacttcaaactactcaagtacaactgcaagagattttctatgctt 18431513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41122434 - 41122262
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  41122434 gaaagacacaa--caattatgcagattcctttcacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 41122337  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41122336 ttacaattgctcactgttaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagatatttcctatgct 41122262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 16494698 - 16494869
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16494698 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactgtgtaatatctgatt 16494796  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     ||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16494797 gcaaatgctcactactaaacttagtaaaagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16494869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 22271481 - 22271656
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta-----tgtaatatct 157  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||    
T  22271481 gaaagacgcaaagcaattatataggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttggacttcaaaggagagttcactaaaaagtgtaatatct 22271579  T
Q  158 gattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22271580 tattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 22271656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45087731 - 45087562
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45087731 gaaagacacaa-gcaatttatacaggtttcttccacaaaccggaagacagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactacgtaatatctgatt 45087633  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatg 231  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  45087632 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 45087562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17964008 - 17963844
Alignment:
Q  71 acaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||   |||||||| |||||||||     
T  17964008 acaaagcaattatacaggttccttccataa-ccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttttaaggaaagttcactaaaatgtaatatttgattacaac 17963911  T
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17963910 tgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagatttcctgtgct 17963844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 44839784 - 44839955
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44839784 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagaattcactatgtaatatctgatt 44839882  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  44839883 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgttcaagtacaactgcaagagacttcctatgct 44839955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35744709 - 35744572
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  35744709 ttatacatgtcccttccacaaaccggaaatcagtcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcgatacta 35744610  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgc 216  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35744609 aacttagtaagagacttcaaatgctcaaacacaactgc 35744572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22786381 - 22786233
Alignment:
Q  87 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactag 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||    
T  22786381 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgtacttccaaggagagtttactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttag 22786282  T
Q  186 caatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     || |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  22786281 taagagacttcaaattgctcaagcacaactgtaagagacttcctatgct 22786233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28551668 - 28551509
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28551668 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccgcaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcgctatgtaatatctgatt 28551570  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
     ||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28551569 gcaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 28551509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 33073621 - 33073749
Alignment:
Q  106 aagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctc 204  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||| ||||||||    
T  33073621 aagtcagtcttgtcccccttgcacttccaattagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagactttaaatgctc 33073720  T
Q  205 aagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33073721 aagcacaactgcaagagatttcctatgct 33073749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22782348 - 22782193
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  22782348 ttatacaggttccatccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacaa 22782249  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  22782248 aacttagtaagagacttcaaattgctcaagcataactgcaacagacttcctatgct 22782193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 180
Target Start/End: Original strand, 6392033 - 6392134
Alignment:
Q  83 tacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6392033 tacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctgattacaattgctcactgcta 6392132  T
Q  179 aa 180  Q
    ||    
T  6392133 aa 6392134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31328713 - 31328540
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatg--taatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||    ||||||||||    
T  31328713 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaacgggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaagagaagttcactaaaaataatatctga 31328614  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||| ||| | |||||  ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31328613 ttacaattgttcaatactaaacttagtacgagacttcaaatgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgct 31328540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31335434 - 31335261
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatg--taatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||    ||||||||||    
T  31335434 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaacgggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaagagaagttcactaaaaataatatctga 31335335  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||| ||| | |||||  ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31335334 ttacaattgttcaatactaaacttagtacgagacttcaaatgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgct 31335261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21537935 - 21537835
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21537935 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 21537837  T
Q  160 tt 161  Q
    ||    
T  21537836 tt 21537835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 24838456 - 24838624
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  24838456 gaaagacacaaatcaattatacatgttccttccacaaatcggaagt-tgttatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgat 24838554  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttc-aaatgctcaagcacaactgcaagagttttccta 229  Q
    |||||  | |||||||| ||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24838555 tacaacagttcactgctcaaaataggaagagacttcaaaatactcaagcacaactgcaagagatttccta 24838624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Original strand, 27296846 - 27296953
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  27296846 ccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgcaatatctcattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaac 27296945  T
Q  214 tgcaagag 221  Q
    ||||||||    
T  27296946 tgcaagag 27296953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26623203 - 26623064
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    || ||||||||    
T  26623203 gaaagacacgcagcaattatacatgttctttccacaaactggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcattaaaaatgcaatatctg 26623105  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  26623104 attacaactgctcactactaaaactagcaagagactccaaa 26623064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 24778726 - 24778896
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||  ||| | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  24778726 agacacaaagtaattatatagattctttccacaaactggaaat-agtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaatatctgatta 24778824  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    | | || |||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  24778825 cgactgttcactgctaaatttagcaagagacttcaaattactcaagcacagctgcaatagatttcctatgct 24778896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 24843579 - 24843728
Alignment:
Q  87 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcactatgt--aatatctgattacaattgctcactgctaaaact 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  24843579 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccactccaccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatttgattacaaatgctcactgctcaaaat 24843677  T
Q  184 agcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24843678 agcaagagacttcaaactaatcaagcacaactgcaagagatttcttatgct 24843728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 21845513 - 21845596
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21845513 gaaagatacaaagcaattatacaagttccttccacaatcgagaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21845596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 143
Target Start/End: Original strand, 22797779 - 22797857
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttc 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22797779 aaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaatccaaaagt-agtcatatcccccttgcacttccaaggagagttc 22797857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 142
Target Start/End: Original strand, 1083373 - 1083442
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  1083373 aagcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtt 1083442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 180
Target Start/End: Original strand, 14580972 - 14581033
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaa 180  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14580972 ccccttgcacttataaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaa 14581033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 165
Target Start/End: Original strand, 44880638 - 44880731
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctgattacaa 165  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  44880638 gcaattatacacgtctcttccacaaaccagaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactaaaaatgtaatatctgattacaa 44880731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 22382836 - 22382919
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22382836 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaatccggaagt-agtcctgtccccctggctcttccaaggagagttcacta 22382919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 20567525 - 20567683
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact-atgt-aatatctgattacaattgctc 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  20567525 agcaattatacaggttccttccacgatctggaagt-agtcatgtaccccttgcacttccaaatagagttcactaaagtcaatatctgattaccattgctc 20567623  T
Q  172 actgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |  ||| ||  |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20567624 a-agctcaa--tagcaagagacatcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcccatgct 20567683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15671312 - 15671240
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15671312 agcaattatacaggttccttctacaatctaaaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15671240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21911575 - 21911409
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgattac 163  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |   |||||||||||||    
T  21911575 agacacaaatcaattatacatgttcattccacaatccggaagt-agtcctgtcctccttgcacttccaaggagagtttactaaaatcaatatctgattac 21911477  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagactt-caaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || ||||||  ||  | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  21911476 aaatgctca-agc--acactagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgct 21911409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 114
Target Start/End: Original strand, 38631104 - 38631154
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtc 114  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38631104 gaaagacacaaaacaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtc 38631154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23393407 - 23393339
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  23393407 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 23393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38033495 - 38033424
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  38033495 agacacaaa-caattatactggttccttccacaaaccagaagt-agtccagtctcccttgcacttccaaggaga 38033424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14794539 - 14794456
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14794539 gaaagacacaaaccaattatcctggttccttcaacaattcggaagt-agtccagtccccttgcacttccaaggagatttcactat 14794456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31968515 - 31968460
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  31968515 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcctgtccccattgcacttccaa 31968460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38040654 - 38040583
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  38040654 agacacaaa-caattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtctcccttgcacttccaaggaga 38040583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24802286 - 24802220
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24802286 gcaattatactggttctttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 24802220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 134
Target Start/End: Original strand, 33302663 - 33302733
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaa 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33302663 gaaagacacaaagtaattatacatgttccttccataattcggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaa 33302733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 134
Target Start/End: Original strand, 33303398 - 33303468
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaa 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33303398 gaaagacacaaagtaattatacatgttccttccataattcggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaa 33303468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17970950 - 17970885
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  17970950 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggaga 17970885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19313674 - 19313609
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  19313674 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 19313609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19498647 - 19498582
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  19498647 aagcagttatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 19498582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36785481 - 36785416
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  36785481 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 36785416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10899142 - 10899093
Alignment:
Q  183 tagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatg 231  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10899142 tagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatg 10899093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10010311 - 10010275
Alignment:
Q  190 agacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttc 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10010311 agacttctaatgctcaagcacaactgcaagagatttc 10010275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20647294 - 20647231
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20647294 gcaattatactggttctttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 20647231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22915552 - 22915470
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22915552 aaagacacaa-gcaattatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 22915470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Original strand, 18394 - 18559
Alignment:
Q  70 cacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattg 168  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18394 cacaaagaaattatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactatgtaatatctgattacaattg 18493  T
Q  169 ctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18494 ctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 18559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22867 - 22713
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22867 ttatacaggttccttgcacaaacccaaagtcagtcctgtcccccttgcactaccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactacta 22768  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  22767 aacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 22713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 666 - 610
Alignment:
Q  66 aagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  666 aagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccc 610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19378 - 19206
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19378 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcatccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 19279  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaac-tagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19278 agaattgcttagtgctaaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagtgttcctatgct 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Original strand, 25817 - 25989
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  25817 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctgat 25916  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25917 tacaactgctcattgctaaacttagcaagagacttcaaatgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 25989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 29024 - 29089
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  29024 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 29089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 695 - 523
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  695 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactttgtaatatctgatt 596  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||| ||| ||  ||||||||||    
T  595 acaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgttcaagcataactacaatagacttcctatgct 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 7282 - 7451
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  7282 gaaagacacatagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagt-agtcctatccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgat 7380  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatg 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7381 tacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatg 7451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 221
Target Start/End: Original strand, 59449 - 59593
Alignment:
Q  77 caattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||   ||||| ||||||    
T  59449 caattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtaccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatct---tacaactgctca 59544  T
Q  173 ctgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  59545 ctactaaaactagcaagagacttctaattctcaagcacaactgcaagag 59593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 83749 - 83921
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83749 gaaaaacacaaagcaattatacaggtaccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 83848  T
Q  163 caattgctcactgc-taaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  83849 caattgctcactgcttaaaactagcaagagacttcaaatttctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 83921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 268139 - 268311
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcat-gtccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||| ||||    
T  268139 gaaagtcacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctattccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatttgat 268237  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| | ||||||||| ||| |||||| | |||||||| | ||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  268238 tacaacttctcactgctcaaaatagcaagacacttcaaactactcaagcacaattgtaagatatttcctatgct 268311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28182 - 28009
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  28182 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctaa 28083  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28082 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 28009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2770 - 2599
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  2770 gaaagacacaaagcaattatataggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtgcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgat 2672  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  2671 tacaactgctcactgttaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgct 2599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 9317 - 9487
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9317 gacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccagaagtcagtcctgttccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattac 9416  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9417 aactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactattcaagcacaactgcaagagattttctatgct 9487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 66159 - 65989
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66159 gaaagacacaagaaatttatgcaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttccacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 66060  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  66059 caaatgctcactactaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 65989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 145204 - 145046
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  145204 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagtatagttcactatgtaatatctgatt 145106  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||| |||||||| |||||  ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  145105 acaaatgctcactactaaacttactaagagacttcaaatgctcaagcacaattgcaagag 145046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 58921 - 59004
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  58921 gaaagacacaaatcaattatacaggtttcttccacaattcggaagt-agtcatgtccctcttgcatttccaaggagagttcacta 59004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 165376 - 165309
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  165376 gcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcactcctgtctcccttgcacttccaaggagagtt 165309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 9262 - 9434
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  9262 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 9360  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  9361 ttacaacttctcactgctaaacttagcaagagacttcaaacgctcaagcacaaatgcaagagacttcctatgct 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3422 - 3264
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3422 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 3324  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323 acaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16470 - 16300
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16470 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 16372  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16371 acaaatgctcactactaaacttagtaagagatttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24532 - 24361
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24532 gaaagacacagagcaatttatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatatcttatt 24433  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24432 acaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 24361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 80756 - 80926
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||  |||    
T  80756 gacacaaatcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcctcattgtacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctactta 80854  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  80855 caactgctcactcctaaaactggcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagacatttcctatgct 80926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 14130 - 14212
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14130 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 14212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 54832 - 54750
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  54832 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 54750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 211712 - 211873
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  211712 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcattcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 211811  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  211812 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagctcaactgcaagag 211873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 60619 - 60684
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  60619 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 60684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 378303 - 378129
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattata--caggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatct 157  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  378303 gaaagacacaaagcaattatatacaagttccttccacaaactggaagt-agtcatgccccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatct 378205  T
Q  158 gattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  378204 gattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagtcttcttatgct 378129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Original strand, 210773 - 210927
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccct-tgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  210773 ttatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagttatgtcccccctgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacta 210872  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  210873 aacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 210927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 219596 - 219769
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  219596 gaaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaaatcggaagt-agtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 219694  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  219695 ttacaaaagctcactgataaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 219769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 245035 - 244861
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    |||||||||||    
T  245035 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcgtgtcccccttgcactttcaaggagggttcactaaaaatgtaatatctg 244937  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  244936 attacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacagctgcaagaaatttcctatgct 244861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 87768 - 87935
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgattac 163  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || |||||   |||   ||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||| |||||||    
T  87768 agacacaaagcaatttatagtggttccttccacaatccggaagtagttcactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatatgattac 87867  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||  ||| |||  ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  87868 aattgctca-agctcaaa--agcaggagacttcaaactactcaagcacaactgcaagaggtttcctatgct 87935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 233
Target Start/End: Original strand, 7182 - 7351
Alignment:
Q  66 aagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattaca 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7182 aagacacaaatcaattatacaggttccttccaaaaactggaagtcagtcctatcccccttacacttccaaggagagttcactatgtaatatttgattaca 7281  T
Q  165 attgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7282 attaatcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 7351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2139 - 1966
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  2139 gaaagacacaaagcaattatacatgtttcttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 2041  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2040 ttacaactgcgcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 1966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 48695 - 48861
Alignment:
Q  71 acaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctgattacaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||     
T  48695 acaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaac 48794  T
Q  167 tgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  48795 tgctcactactaaacttaacaagagacttcaaatgctcaaccacaaatgcaagagacttcctatgct 48861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 31942 - 32103
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  31942 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 32041  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||  | | |||  | |||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32042 ttaagactactcgatactaaacttagcaagagacttcaaatgctcaagaacaactgcaagag 32103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1132 - 1065
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1132 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 1065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 57486 - 57421
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  57486 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggaga 57421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 1015 - 1188
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  1015 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccttaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaatgagagttcactaaaatgtaatatctga 1114  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  1115 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaatgctcaaggacaactgcaagagacttcctatgct 1188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1657 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1657
Description:

Target: scaffold1657; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Original strand, 1204 - 1371
Alignment:
Q  69 acacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctgattacaa 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  1204 acacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagt-agtcatatccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctgattacaa 1302  T
Q  166 ttgctcactgctaaaactagcaatagac-ttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1303 ttgctcactactaaaactagcaagagactttaaaatactcaagcataactgcaagagatttcctatgct 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 8015 - 8185
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  8015 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttccaataaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcagtaaaatgtaatatctga 8114  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttccta 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8115 ttacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactattcaagcacaactgcaagagatttccta 8185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32539 - 32370
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  32539 aaagacacaaagcaattatataggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcatttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgat 32441  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctat 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32440 tacaactgctcactgctaaaactagaaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctat 32370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 73938 - 74112
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||    
T  73938 gaaagacacaaagcaattatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatttaatatttga 74037  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  74038 ttacaattgctcactgttaaacttagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcttatgct 74112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 63694 - 63868
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctg 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||   |  |||||||||    
T  63694 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttgaaggagagttcactaaaaaataatatctg 63793  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  63794 attacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 63868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Original strand, 46025 - 46194
Alignment:
Q  69 acacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctgattac 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||    
T  46025 acacaaagcaatttatacaggttccttctacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctggttac 46124  T
Q  164 aattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46125 aattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 46194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 142511 - 142624
Alignment:
Q  121 ccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaag 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  142511 ccttgcacttctaaggagagttcactatgtaatatctaattacaattgctcactactaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcgcaactgcaag 142610  T
Q  220 agttttcctatgct 233  Q
    ||  ||||||||||    
T  142611 agacttcctatgct 142624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 9320 - 9481
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  9320 gaaacacacaaagcaattatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttacaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 9419  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9420 ttacaactgctcactactaaacttagcaagagacttcaaatgctaaagcacaactgcaagag 9481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 221
Target Start/End: Original strand, 9510 - 9541
Alignment:
Q  190 agacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9510 agacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 9541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2814 - 2641
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    ||||||||||     
T  2814 gaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaatccggaagt-agtcatgtccccctttcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctt 2716  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2715 attacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttaaactactcaagcacaactgcaagagatttcatatgct 2641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6881 - 6812
Alignment:
Q  73 aaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6881 aaagcaattatacaggttcctttcacaatccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 6812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 2337 - 2509
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2337 gaaagacacgaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtactgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 2436  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  2437 acaaatgctcactactaaaaatagaaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 14474 - 14646
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||    
T  14474 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactaaaatgtaa-atctga 14571  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14572 ttacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 14646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 90754 - 90639
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  90754 ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctaactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgca 90655  T
Q  218 agagttttcctatgct 233  Q
    ||||  ||||||||||    
T  90654 agagacttcctatgct 90639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 172
Target Start/End: Original strand, 72 - 182
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  72 gaaagacacagagaaattatacaggttccttccacaatccggaagt-agtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgat 170  T
Q  161 tacaattgctca 172  Q
    ||||||||||||    
T  171 tacaattgctca 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 11553 - 11725
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11553 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactaagtaatatctgatt 11651  T
Q  162 acaattgctcactgct-aaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| || |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  11652 acaaatgctcactactaaaaattagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 11725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1552 - 1404
Alignment:
Q  86 aggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactag 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||    
T  1552 aggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttag 1453  T
Q  186 caatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  1452 tatgagacttcaaattgctcaagcacaacttcaagagacttcctatgct 1404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16883 - 16710
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  16883 gaaagacattaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcacgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 16785  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16784 ttataactgctcacttctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgct 16710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7480 - 7335
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctgattacaattgctcactg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||     
T  7480 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctgattacaattgctcacta 7381  T
Q  176 ctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7380 ctaaacttagtaagagatttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 7335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44617 - 44442
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcac----tatgtaatatct 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     ||||||||| |    
T  44617 gaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcgcctttgcactttcaaggagagttcacaaaaaatgtaatattt 44519  T
Q  158 gattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44518 gattacaattggtcactgctaaaactaggaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 44442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18520 - 18349
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaatcggaagtctctcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 18422  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  18421 acaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaagttgctcaagcacagctgcaagagacttcctatgct 18349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10862 - 10689
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||   | |||||||||||    
T  10862 gaaagacacaatgcaattatacaggttccttccacaaaccaaaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaagaaaagttcactaaaaagtaatatctga 10764  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10763 ctacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 10689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15526 - 15353
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||   | |||||||||||    
T  15526 gaaagacacaatgcaattatacaggttccttccacaaaccaaaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaagaaaagttcactaaaaagtaatatctga 15428  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
     ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15427 ctacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 88355 - 88184
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  88355 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagacatgtcccctttgcacttccaaggggagttcaatatgtaatatctgatt 88257  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  88256 acaaatgctcactactaaacgtagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 88184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 199
Target Start/End: Original strand, 5575 - 5711
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||    
T  5575 gacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaacgagagttcactaaaactgtaatatctgatta 5674  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5675 caactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa 5711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 102926 - 103081
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat----gtaatatctg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||    
T  102926 gaaagacacaaagcaattatataagttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggatagttcactaaaaaagtaatatctg 103025  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaact 214  Q
    ||||||| || ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  103026 attacaactgttcactgccaaaccaagcaaaagacttcaaatgctcaagcacaact 103081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 2591 - 2761
Alignment:
Q  68 gacacaaagcaattatacaggttccttccacaaa-ccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgatta 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  2591 gacacaaagcaattatataggttccttccacaaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttacaaggagagttcactaaaatgtaatatctgatta 2689  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2690 caactgctcactactaaaactggcaagagacttcaaactactcaaacacaactgcaagagatttcctatgct 2761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 7985 - 8164
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagag----ttcacta----tgtaata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||  || |||| ||||||||||||||||||    | |||||    |||||||    
T  7985 gaaagacacaaagcaattatacatgttccttccacaaatcggaagtgagttctgccccccttgcacttccaaggagagagagtacactaaaaatgtaata 8084  T
Q  155 tctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8085 tctgattacaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 8164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 79113 - 78938
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatta-tacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctg 158  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  79113 gaaagacacaacacaattaatacagattctttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctg 79014  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  79013 attacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 78938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 13400 - 13573
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13400 gaaagatacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagt-tgtcctgtcccccttacactaccaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 13498  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || | | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13499 ttgcgactgctcactgctaaaactagcaagagactacaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 13573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 106 - 250
Alignment:
Q  91 ccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccct-tgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaat 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  106 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccctgcacttccaaagggagttcactatgtaatatctgattacaattgctcacggctaaaactagcagg 205  T
Q  190 agacttcaa-atgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  206 agacttcaacttcctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 196
Target Start/End: Original strand, 36786 - 36921
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  36786 gaaagacaaaaaacaattatacaggttccttccacaaaccagaagt-agtcctatcccctttgcacttacaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 36884  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  36885 ttacaattgctcactgctagaactagcaagagacttc 36921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 196
Target Start/End: Original strand, 134846 - 134981
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccctt-gcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctga 159  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  134846 gaaagacaaaaaacaattatacaggttccttccacaaaccagaagt-agtcctatcccctttgcacttacaaggagagttcactaaaatgtaatatctga 134944  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  134945 ttacaattgctcactgctagaactagcaagagacttc 134981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Original strand, 158535 - 158640
Alignment:
Q  132 caaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcc 227  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  158535 caaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactgctcatgcacaactgcaagagatttcc 158634  T
Q  228 tatgct 233  Q
    ||||||    
T  158635 tatgct 158640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 100
Target Start/End: Original strand, 158501 - 158537
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158501 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaa 158537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 168
Target Start/End: Original strand, 24003 - 24092
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24003 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattg 24092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35500 - 35340
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35500 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgatt 35402  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaac-tagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||| |||||||  || |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  35401 acaaatgctcacaacttaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaattgcaagag 35340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26345 - 26251
Alignment:
Q  141 ttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaac-tagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  26345 ttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactacttaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagtacaactgcaagagacttcctatgct 26251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26406 - 26348
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaa-ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc 122  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26406 gaaagacac-aagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc 26348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20224 - 20049
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact----atgtaatatctg 158  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||     
T  20224 gaaagatacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaaatgtaatatctt 20126  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgctt 234  Q
    ||||||| ||||||  ||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20125 attacaactgctcaacgctaaacatagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctacgctt 20049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 99964 - 99850
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaa 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||  | | || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  99964 ccccttgcacttccacggagagttcactatgtaatatcttattataattgctgactactaaacttggtaagagactttaaatgctcaagcacaactgcaa 99865  T
Q  219 gagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||    
T  99864 gagatttcctatgct 99850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 29152 - 29324
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcactatgta--atatctgat 160  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||      |||||||||    
T  29152 gaaaggcacaaaacaattatacaagttccttccataaaccggaagt-agtcttgtcgcccttgcacttccatggagtgttcactaaaatccatatctgat 29250  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    || | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29251 tatagttgctcactgctcaaaatagcaagagacttcaaactactcaagcacaattgcaagaggtttcctatgct 29324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 110336 - 110303
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  110336 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagt 110303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Original strand, 144284 - 144436
Alignment:
Q  86 aggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaa 180  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  144284 aggttccttccacaatccggaagt-agtcatgtcccccttgcacttctaaggagagttcactaaaaatcaaatatctgtttacaattgctcactgctaaa 144382  T
Q  181 actagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  144383 actagcaagagacttcaaattactcaagcacaaatgcaagagatttcctatgct 144436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 111385 - 111233
Alignment:
Q  84 acaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctgattacaattgctcactgctaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  111385 acaggttccttccacaaaccggtagtca-tcttgtccctcttgcacttccaaggagatttcactaaaaggtaatatctgattacaattcctcactgctaa 111287  T
Q  180 aactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  111286 acttaacaagagacttcaaatgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 111233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2535 - 2374
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcc-ccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||      ||||    
T  2535 gaaagacaaaaagcaattatacaggttccttccacaattcggaagt-agtcctgtcctccttgcacttccaaggagagttcacta---aa------atta 2446  T
Q  163 caattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2445 caactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactacttaagcacaactgcaagagatttcctatgct 2374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6007 - 5874
Alignment:
Q  80 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  6007 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactaagtaatatctgattacaaacgctcactacta 5908  T
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcaca 211  Q
    ||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||    
T  5907 aacttagtatgagacttcaaattgctcaagcaca 5874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1383 - 1238
Alignment:
Q  91 ccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat---gtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagc 186  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  1383 ccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccccttgcacttccaagtagagttcactaaaaagtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagc 1285  T
Q  187 aatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1284 acgagacttaaaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 1238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2728 - 2569
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2728 gaaagacacaa-gcaatttatacaggttccttgcacaaatcggaagtcagacttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatt 2630  T
Q  162 acaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||| ||| |||| | |||  ||  || | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2629 acaaatgcccactacgaaacttattaagacacttcaaattgctcaagcacaactgcaagag 2569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21694 - 21587
Alignment:
Q  132 caaggagagttcact-----atgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtttt 225  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  21694 caaggagagttcactaaaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaactgctcaaccacaactgcaagagactt 21595  T
Q  226 cctatgct 233  Q
    ||||||||    
T  21594 cctatgct 21587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37500 - 37361
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact---atgtaatatctga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||   || ||||||||||    
T  37500 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagt-agtcctgtcccccttgctcttccaaggagagtttactaaaatctaatatctga 37402  T
Q  160 ttacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaat 200  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  37401 ttacaattgctgactgctaaacttagcaagagacttgaaat 37361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 200
Target Start/End: Original strand, 41560 - 41644
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  41560 ccccttgctcttccaaggagagtttactaaaatctaatatctgattacaattgctgactgctaaacttagcaagagacttgaaat 41644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 199
Target Start/End: Original strand, 76612 - 76739
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgattacaattgct 170  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  |   ||||||||||||||| ||||    
T  76612 aagcaattctacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatcaatatctgattacaactgct 76710  T
Q  171 cactgctaaaactagcaatagacttcaaa 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  76711 cactgctaaaactagcaagagacttcaaa 76739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 2017 - 2189
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccc-cttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |  |   ||||||||||    
T  2017 gaaagacacaaagcaattatataggttccttccacaaactggaagt-agtcctgtcccatttgcacttccaaggagagtttattaaaatcaatatctgat 2115  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||   |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  2116 tacaaatgctcactgctcaaaatagcaagagacttcaaacaactcaagaaaaactgcaagagatttcctatgct 2189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4111 - 4033
Alignment:
Q  69 acacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111 acacaaagcaattatacaggttccttacacaatccagaagt-agtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 4033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Original strand, 679 - 849
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact-----atgtaatatctg 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||    
T  679 aaagacacaaaacaattatacaggttctttccacaaaccgaaagt-agtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaaatgtaatatctg 777  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
         ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  778 ----taattgctcactgctaaaactaacaagagacttcaaactactcaagcacacaagcaagagtttccctatgct 849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 732 - 562
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact-----atgtaatatctg 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||    
T  732 aaagacacaaaacaattatacaggttctttccacaaaccgaaagt-agtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaaatgtaatatctg 634  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
         ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  633 ----taattgctcactgctaaaactaacaagagacttcaaactactcaagcacacaagcaagagtttccctatgct 562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 5046 - 5208
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta----tgtaatatctg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   || | |||| ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||    |||||||||||    
T  5046 gaaagacacaaagcaattataaaggttctttccacaaactgaaact-agtcctgtcccccttgcacttccaaccagagttaactaaaaatgtaatatctg 5144  T
Q  159 attacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5145 attacaactgcttactgcgaaaactagcaagagacttaaaactactcaagcacaactgcaagag 5208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 180
Target Start/End: Original strand, 5511 - 5572
Alignment:
Q  119 ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5511 ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactactaaa 5572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13883 - 13800
Alignment:
Q  121 ccttgcacttccaaggagagttcacta---tgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13883 ccttgcacttccaaggagagtacactacaatgtaatatctgattacaactgcccactgctaaaactagcaagagacttcaaatg 13800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 221 - 154
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  221 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 9335 - 9401
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9335 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagt 9401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 233
Target Start/End: Original strand, 8602 - 8684
Alignment:
Q  151 aatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  8602 aatatctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaatgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 8684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Original strand, 14323 - 14380
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14323 aaagacacaaagcaattatacaggctccttccacaaaccagaagtcagtcttgtcccc 14380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Original strand, 1365 - 1422
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1365 aaagacacaaagcaattatacaggctccttccacaaaccagaagtcagtcttgtcccc 1422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 1190 - 1268
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  1190 gaaagacacaga-caattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtt 1268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 38829 - 38762
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38829 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacatccaaggagagtt 38762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 13083 - 13148
Alignment:
Q  156 ctgattacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagag 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13083 ctgattacaactgctcactgctaaaactagaaagagacttctaatgttcaagcacaactgcaagag 13148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 2804 - 2887
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaa-ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcact 146  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2804 gaaagacac-aagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagggttcact 2887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9741 - 9658
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9741 gaaagacacgaagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagt-agtcctgtcccccttgtacttccaaggagagttcacta 9658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 3665 - 3748
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3665 gaaagacataaagcaattatacatgttccttccacaatccggaagt-agtcttctcccccttgtacttccaaggagagttcacta 3748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 103
Target Start/End: Original strand, 7249 - 7288
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaacc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7249 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaacc 7288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 233
Target Start/End: Original strand, 7310 - 7354
Alignment:
Q  190 agacttcaaatg-ctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7310 agacttcaaattactcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 7354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 19434 - 19603
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatg-tccccttgcacttccaaggagagttcact--atgtaatatctgat 160  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||    
T  19434 gaaagacacaaaagaattatacaggttcctttcataattcggaagt-agtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgat 19532  T
Q  161 tacaattgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||  ||  |||  ||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  19533 tacaattgctca-agcacaaa--agcaagagacttcaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgct 19603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2528 - 2461
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2528 gcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtt 2461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7230 - 7173
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  7230 gaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccc 7173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 59608 - 59537
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  59608 agacacaaa-caattatactggttccttccacaaaccagaagt-agtccagtctcccttgcacttccaaggaga 59537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 41058 - 40993
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  41058 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtctagtcccccttgcacttccaaggaga 40993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 174934 - 174999
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  174934 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 174999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Original strand, 4484 - 4551
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagttc 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  4484 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagttc 4551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 111763 - 111846
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcacta 147  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  111763 gaaagacacgaaccaattatataggttccttccacaatccgaaagt-agtcctgtctcccttgtacttccaaggagagttcacta 111846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 475997 - 475932
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  475997 aagcaattatactggttccttccacaaactggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 475932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 482517 - 482452
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  482517 aagcaattatactggttccttccacaaactggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 482452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 92 - 26
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  92 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 5770 - 5836
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  5770 gcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 5836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1717 - 1652
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  1717 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 35089 - 35154
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  35089 aagcaattatcctggttccttccacaaaccagaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 35154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 61096 - 61161
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  61096 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 61161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 139
Target Start/End: Original strand, 15272 - 15346
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  15272 gaaagacacaa-gcaattattctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 15346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1679 - 1613
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1679 gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 1613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1872 - 1806
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1872 gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagagtt 1806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1607 - 1458
Alignment:
Q  84 acaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggagagttcactat--gtaatatctgattacaattgctcactgctaaa 180  Q
    |||||||||||| |||| |  ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||  ||  ||    
T  1607 acaggttccttcaacaatctggaagt-agtcttgtcacccatgcacttccaaggagagttcactataatcaatatttgattacaattgctca-agcacaa 1510  T
Q  181 actagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgct 233  Q
    |  ||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  1509 a--agcaagagacttcaaattactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgct 1458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 19930 - 19996
Alignment:
Q  76 gcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagt-catgtccccttgcacttccaaggagagtt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19930 gcaattatactggttccttccacaaactggaagt-agtccagttccccttgcacttccaaggagagtt 19996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21128 - 21055
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggag 138  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||    
T  21128 gaaagacacata-caattatactggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggag 21055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 784 - 849
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  784 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5506 - 5441
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  5506 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 5441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 11097 - 11162
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  11097 aagcaattatactggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccctttgcacttccaaggaga 11162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12820 - 12755
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  12820 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 12755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 40055 - 40120
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  40055 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 40120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 4850 - 4915
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  4850 aagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 4915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2353
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtc-cccttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2424 agacacaaa-caattatactggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtctcccttgcacttccaaggaga 2353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10473 - 10402
Alignment:
Q  67 agacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  10473 agacacaaa-caattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 10402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Original strand, 18557 - 18602
Alignment:
Q  64 gaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagt 109  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  18557 gaaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaatccggaagt 18602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 225 - 290
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||    
T  225 aagcaattatcttggttccttccacaaaccagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggaga 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 4605 - 4670
Alignment:
Q  74 aagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||    
T  4605 aagcaattatcttggttccttccacaaaccagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggaga 4670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 139
Target Start/End: Original strand, 127197 - 127261
Alignment:
Q  75 agcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 139  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  127197 agcaattatcctggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 127261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 1758 - 1840
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1758 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 1840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 44
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  126 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 44  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8778 - 8696
Alignment:
Q  65 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 148  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8778 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaaaacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 8696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 909 - 853
Alignment:
Q  179 aaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagttttcctatgctt 234  Q
    |||||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  909 aaactagccagagacttcaaactactaaagcacaactgcaagagatttcctatgctt 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University