View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4146_low_2 (Length: 225)

Name: NF4146_low_2
Description: NF4146
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4146_low_2
NF4146_low_2
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (1-211)||(2897707-2897917)
chr3 (7-220)||(15482666-15482879)
chr3 (7-211)||(20461390-20461594)
chr3 (7-211)||(7793239-7793444)
chr3 (7-211)||(327054-327259)
chr3 (7-200)||(30065972-30066165)
chr3 (7-200)||(11854759-11854952)
chr3 (7-200)||(55022893-55023086)
chr3 (7-200)||(11070094-11070287)
chr3 (7-200)||(11165419-11165612)
chr3 (7-200)||(14499351-14499544)
chr3 (37-200)||(15617400-15617563)
chr3 (7-218)||(31097444-31097656)
chr3 (37-200)||(7109724-7109887)
chr3 (37-200)||(7113659-7113822)
chr3 (37-200)||(22336745-22336908)
chr3 (37-200)||(27409564-27409727)
chr3 (37-200)||(28949750-28949913)
chr3 (37-200)||(22321690-22321853)
chr3 (7-145)||(11300401-11300539)
chr3 (38-218)||(15850006-15850183)
chr3 (47-220)||(15464869-15465040)
chr3 (47-220)||(5223068-5223239)
chr3 (15-200)||(19725809-19726001)
chr3 (103-220)||(8489459-8489573)
chr3 (12-220)||(16797949-16798156)
chr3 (12-200)||(18383811-18384006)
chr3 (47-220)||(12339470-12339641)
chr3 (12-200)||(322618-322813)
chr3 (12-220)||(16808776-16808983)
chr3 (12-200)||(12496283-12496479)
chr3 (90-200)||(14668583-14668700)
chr3 (64-200)||(14665427-14665570)
chr3 (103-219)||(11854422-11854535)
chr3 (90-218)||(16750567-16750689)
chr3 (12-200)||(11862819-11863015)
chr3 (73-220)||(11300723-11300868)
chr3 (12-200)||(11851607-11851803)
chr3 (152-220)||(16696789-16696857)
chr3 (12-220)||(3833678-3833885)
chr3 (12-200)||(3402850-3403047)
chr3 (71-200)||(11298482-11298618)
chr3 (36-200)||(12037871-12038042)
chr3 (93-220)||(38814388-38814513)
chr3 (12-200)||(1982705-1982901)
chr3 (34-218)||(17241978-17242161)
chr3 (152-218)||(4589228-4589294)
chr3 (152-218)||(19775353-19775419)
chr3 (150-200)||(12172822-12172872)
chr3 (12-200)||(3389830-3390027)
chr3 (100-220)||(1598464-1598581)
chr3 (90-200)||(4111228-4111332)
chr3 (90-200)||(15964995-15965099)
chr3 (90-200)||(15968919-15969023)
chr3 (90-200)||(15972843-15972947)
chr3 (90-200)||(19775791-19775895)
chr3 (113-220)||(15941902-15942006)
chr3 (90-200)||(4107376-4107480)
chr3 (150-200)||(11557425-11557475)
chr3 (150-200)||(12511087-12511137)
chr3 (150-200)||(23053128-23053178)
chr3 (90-200)||(37439615-37439719)
chr3 (150-200)||(46822295-46822345)
chr3 (156-200)||(11595186-11595230)
chr3 (167-200)||(14878574-14878607)
chr3 (12-99)||(15060428-15060516)
chr3 (148-200)||(30029870-30029922)
chr3 (156-200)||(42325967-42326011)
chr3 (47-132)||(4589039-4589125)
chr3 (150-200)||(15051534-15051584)
chr3 (12-85)||(15051666-15051740)
chr3 (150-200)||(15060310-15060360)
chr3 (150-200)||(15878092-15878142)
chr3 (150-200)||(16909768-16909818)
chr3 (47-140)||(19775515-19775608)
chr3 (12-140)||(11595033-11595162)
chr3 (167-200)||(17525216-17525249)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (7-220)||(13635359-13635572)
chr7 (7-220)||(12318130-12318343)
chr7 (7-211)||(11312660-11312864)
chr7 (7-220)||(15580694-15580907)
chr7 (7-220)||(16583259-16583471)
chr7 (7-218)||(15605162-15605374)
chr7 (7-200)||(70655-70848)
chr7 (7-200)||(74764-74957)
chr7 (7-200)||(33130-33323)
chr7 (37-200)||(39722289-39722452)
chr7 (37-200)||(12714887-12715050)
chr7 (37-200)||(12718691-12718854)
chr7 (37-200)||(16114264-16114427)
chr7 (37-200)||(16117417-16117580)
chr7 (37-200)||(16907121-16907284)
chr7 (37-200)||(18283389-18283552)
chr7 (37-200)||(26292418-26292581)
chr7 (37-200)||(18279426-18279589)
chr7 (37-200)||(12704579-12704742)
chr7 (37-200)||(12723602-12723765)
chr7 (19-220)||(9593348-9593549)
chr7 (7-220)||(18948-19161)
chr7 (47-220)||(13918710-13918881)
chr7 (47-220)||(1859016-1859187)
chr7 (34-210)||(11987225-11987400)
chr7 (12-200)||(14429909-14430104)
chr7 (12-200)||(12321636-12321832)
chr7 (47-220)||(25927433-25927604)
chr7 (34-220)||(8917430-8917615)
chr7 (104-218)||(2530378-2530491)
chr7 (90-220)||(7519332-7519460)
chr7 (93-200)||(16457334-16457439)
chr7 (64-200)||(9751703-9751845)
chr7 (93-220)||(13149158-13149283)
chr7 (152-220)||(16275495-16275563)
chr7 (90-218)||(18425443-18425565)
chr7 (153-220)||(35151609-35151676)
chr7 (64-200)||(2832389-2832532)
chr7 (19-146)||(9644384-9644512)
chr7 (93-220)||(13461764-13461889)
chr7 (14-200)||(2760157-2760351)
chr7 (96-220)||(14216918-14217040)
chr7 (96-220)||(15728328-15728450)
chr7 (7-200)||(3271849-3272050)
chr7 (93-220)||(18556976-18557101)
chr7 (153-220)||(16724665-16724732)
chr7 (153-220)||(17701679-17701746)
chr7 (64-200)||(39267847-39267990)
chr7 (14-82)||(2530040-2530108)
chr7 (90-200)||(45169985-45170089)
chr7 (34-199)||(6801237-6801401)
chr7 (156-200)||(42204020-42204064)
chr7 (150-200)||(9446199-9446249)
chr7 (150-200)||(19649530-19649580)
chr7 (156-200)||(20569643-20569687)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (7-211)||(66305-66509)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (7-211)||(53577-53781)
scaffold0031 (90-200)||(36065-36169)
scaffold0031 (149-200)||(65838-65889)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (7-211)||(17804209-17804413)
chr6 (7-211)||(25767058-25767262)
chr6 (7-218)||(22429920-22430131)
chr6 (7-200)||(14472294-14472486)
chr6 (7-200)||(18955653-18955846)
chr6 (7-200)||(22862969-22863162)
chr6 (37-200)||(1644728-1644891)
chr6 (12-200)||(19870613-19870801)
chr6 (37-200)||(11566885-11567048)
chr6 (37-200)||(23395091-23395254)
chr6 (37-200)||(8243884-8244047)
chr6 (37-200)||(23989943-23990106)
chr6 (37-200)||(18917186-18917349)
chr6 (37-200)||(12618765-12618927)
chr6 (7-220)||(12706692-12706905)
chr6 (7-220)||(16741209-16741422)
chr6 (47-220)||(23414649-23414820)
chr6 (47-220)||(27556407-27556578)
chr6 (12-200)||(18907137-18907333)
chr6 (47-220)||(5616745-5616917)
chr6 (28-220)||(9482204-9482395)
chr6 (90-218)||(16624137-16624259)
chr6 (62-200)||(16523330-16523474)
chr6 (96-220)||(1587711-1587833)
chr6 (90-211)||(27325582-27325712)
chr6 (152-220)||(21702291-21702359)
chr6 (93-220)||(22592780-22592905)
chr6 (47-220)||(27416124-27416289)
chr6 (34-218)||(19662775-19662958)
chr6 (152-218)||(1644293-1644359)
chr6 (93-220)||(12496312-12496437)
chr6 (152-218)||(31478265-31478331)
chr6 (34-220)||(2685236-2685421)
chr6 (96-220)||(20803534-20803656)
chr6 (12-146)||(21834784-21834916)
chr6 (90-200)||(20907955-20908072)
chr6 (90-200)||(21766721-21766838)
chr6 (7-76)||(27415832-27415901)
chr6 (152-220)||(25135706-25135774)
chr6 (71-200)||(18180520-18180655)
chr6 (90-200)||(31477789-31477893)
chr6 (156-200)||(19790826-19790870)
chr6 (148-200)||(19848034-19848086)
chr6 (90-197)||(16760321-16760422)
chr6 (90-200)||(22949131-22949235)
chr6 (90-200)||(22953087-22953191)
chr6 (90-200)||(23871575-23871679)
chr6 (90-200)||(23875531-23875635)
chr6 (150-200)||(27553612-27553662)
chr6 (148-200)||(15041589-15041641)
chr6 (156-200)||(23657468-23657512)
chr6 (148-200)||(23992457-23992509)
chr6 (150-200)||(15894479-15894529)
chr6 (47-140)||(31478076-31478169)
chr6 (156-200)||(27567656-27567700)
chr6 (149-200)||(19873146-19873197)
chr6 (151-197)||(22408345-22408391)
chr6 (12-140)||(19790673-19790802)
chr6 (167-200)||(19863004-19863037)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (7-211)||(24735415-24735619)
chr2 (7-200)||(10101535-10101728)
chr2 (37-200)||(24649380-24649543)
chr2 (37-200)||(12901432-12901595)
chr2 (37-200)||(27379353-27379516)
chr2 (37-200)||(27383399-27383562)
chr2 (37-200)||(27601819-27601982)
chr2 (37-200)||(24628399-24628562)
chr2 (7-140)||(19688646-19688779)
chr2 (37-200)||(41530930-41531087)
chr2 (90-220)||(31344881-31345008)
chr2 (93-220)||(41666953-41667078)
chr2 (12-200)||(25963611-25963806)
chr2 (12-200)||(22811805-22812002)
chr2 (101-220)||(19928487-19928604)
chr2 (12-200)||(25961429-25961625)
chr2 (37-115)||(15477711-15477789)
chr2 (34-218)||(22461106-22461289)
chr2 (153-220)||(27263276-27263343)
chr2 (93-220)||(18855438-18855561)
chr2 (96-220)||(60820-60941)
chr2 (90-200)||(21916072-21916189)
chr2 (93-220)||(26125212-26125332)
chr2 (7-220)||(23187079-23187291)
chr2 (7-220)||(23598342-23598554)
chr2 (71-200)||(21318590-21318727)
chr2 (71-200)||(21327521-21327658)
chr2 (90-200)||(30344970-30345074)
chr2 (150-200)||(37524701-37524751)
chr2 (156-200)||(24869906-24869950)
chr2 (12-200)||(40428489-40428686)
chr2 (90-200)||(1283412-1283516)
chr2 (150-200)||(22799167-22799217)
chr2 (150-200)||(24174826-24174876)
chr2 (150-200)||(24716569-24716619)
chr2 (36-99)||(24673713-24673777)
chr2 (148-200)||(25616215-25616267)
chr2 (150-200)||(24655379-24655429)
chr2 (150-194)||(23019747-23019791)
chr2 (12-85)||(21918210-21918284)
chr2 (156-200)||(24673595-24673639)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (7-220)||(12907-13120)
scaffold0044 (14-220)||(19191-19397)
scaffold0044 (96-220)||(62264-62386)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (7-216)||(24782990-24783199)
chr1 (7-220)||(36819198-36819412)
chr1 (7-200)||(1010746-1010939)
chr1 (7-218)||(16080334-16080545)
chr1 (37-200)||(20228729-20228892)
chr1 (37-200)||(16375378-16375541)
chr1 (37-200)||(21407378-21407541)
chr1 (37-200)||(52639564-52639727)
chr1 (34-220)||(19211870-19212056)
chr1 (47-220)||(33797286-33797457)
chr1 (18-200)||(18182021-18182211)
chr1 (7-200)||(23819189-23819381)
chr1 (18-200)||(22449166-22449356)
chr1 (93-220)||(18882371-18882496)
chr1 (96-220)||(20138086-20138209)
chr1 (36-200)||(3472843-3473013)
chr1 (90-218)||(39244120-39244242)
chr1 (90-218)||(39247675-39247797)
chr1 (90-218)||(41388220-41388342)
chr1 (93-220)||(46975471-46975596)
chr1 (34-218)||(12646876-12647059)
chr1 (94-218)||(20229208-20229330)
chr1 (7-76)||(33797680-33797749)
chr1 (90-200)||(1925108-1925212)
chr1 (12-200)||(8761527-8761724)
chr1 (90-200)||(20924122-20924226)
chr1 (90-200)||(17678560-17678676)
chr1 (10-200)||(45310259-45310459)
chr1 (150-200)||(3705105-3705155)
chr1 (12-200)||(18393858-18394056)
chr1 (151-200)||(33050067-33050116)
chr1 (12-99)||(21022775-21022863)
chr1 (148-200)||(21788081-21788133)
chr1 (166-211)||(21313140-21313185)
chr1 (148-200)||(22468735-22468787)
chr1 (156-200)||(45489790-45489834)
chr1 (150-200)||(20135217-20135267)
chr1 (47-132)||(20229075-20229161)
chr1 (12-99)||(42865105-42865194)
chr1 (156-200)||(21022657-21022701)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (7-211)||(36133852-36134056)
chr4 (7-200)||(17810295-17810488)
chr4 (7-200)||(14757312-14757505)
chr4 (37-200)||(9556553-9556716)
chr4 (7-200)||(27534049-27534242)
chr4 (37-200)||(4561254-4561417)
chr4 (37-200)||(5756858-5757021)
chr4 (64-220)||(22634369-22634525)
chr4 (37-200)||(33742401-33742563)
chr4 (19-220)||(1951663-1951864)
chr4 (34-220)||(18222295-18222481)
chr4 (47-220)||(43256343-43256514)
chr4 (12-200)||(16487972-16488168)
chr4 (7-220)||(17152377-17152589)
chr4 (34-220)||(18228770-18228956)
chr4 (93-220)||(26243642-26243767)
chr4 (47-220)||(18236895-18237067)
chr4 (95-220)||(28569423-28569546)
chr4 (101-220)||(3412802-3412919)
chr4 (152-220)||(14708668-14708736)
chr4 (93-220)||(16243377-16243502)
chr4 (12-200)||(16356847-16357042)
chr4 (93-220)||(19757578-19757703)
chr4 (93-220)||(19782103-19782228)
chr4 (34-220)||(23139275-23139459)
chr4 (64-200)||(20157407-20157550)
chr4 (93-220)||(2014782-2014907)
chr4 (12-200)||(16348559-16348754)
chr4 (152-220)||(42997484-42997552)
chr4 (64-200)||(13812966-13813109)
chr4 (152-218)||(15224800-15224866)
chr4 (7-76)||(43256051-43256120)
chr4 (100-220)||(45938152-45938269)
chr4 (90-200)||(10712876-10712980)
chr4 (90-200)||(10926646-10926750)
chr4 (62-200)||(5338926-5339072)
chr4 (153-220)||(18602766-18602833)
chr4 (90-200)||(14954146-14954250)
chr4 (90-200)||(25689893-25689997)
chr4 (155-220)||(18609340-18609405)
chr4 (113-220)||(9530438-9530542)
chr4 (12-99)||(12570158-12570246)
chr4 (156-200)||(25555506-25555550)
chr4 (150-200)||(12570040-12570090)
chr4 (150-200)||(15353348-15353398)
chr4 (156-200)||(11250608-11250652)
chr4 (148-200)||(15093801-15093853)
chr4 (167-200)||(23843504-23843537)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (7-200)||(3765-3958)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (34-220)||(18549-18735)
[»] scaffold0029 (6 HSPs)
scaffold0029 (37-200)||(65448-65611)
scaffold0029 (37-200)||(61532-61695)
scaffold0029 (7-200)||(80738-80928)
scaffold0029 (152-218)||(80300-80366)
scaffold0029 (150-200)||(12789-12839)
scaffold0029 (71-140)||(80462-80530)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (12-220)||(173295-173501)
scaffold0001 (90-200)||(422505-422622)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (7-200)||(12445-12638)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (7-220)||(2563-2775)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (7-200)||(15236670-15236863)
chr5 (7-220)||(23535479-23535690)
chr5 (37-200)||(20295870-20296033)
chr5 (37-200)||(19472640-19472803)
chr5 (62-211)||(17410452-17410601)
chr5 (47-220)||(20911101-20911272)
chr5 (12-200)||(21366560-21366755)
chr5 (5-220)||(42805423-42805638)
chr5 (47-220)||(18355961-18356132)
chr5 (5-220)||(26742634-26742849)
chr5 (7-220)||(18774206-18774420)
chr5 (93-220)||(21885166-21885291)
chr5 (93-220)||(18784049-18784175)
chr5 (64-198)||(24767493-24767634)
chr5 (12-220)||(20232554-20232761)
chr5 (93-220)||(16674156-16674281)
chr5 (93-220)||(33409232-33409357)
chr5 (34-220)||(24532965-24533150)
chr5 (34-220)||(26666048-26666233)
chr5 (34-220)||(26937645-26937830)
chr5 (152-220)||(26172468-26172536)
chr5 (153-220)||(4036223-4036290)
chr5 (153-220)||(25229441-25229508)
chr5 (153-220)||(25293597-25293664)
chr5 (93-218)||(17718416-17718538)
chr5 (137-200)||(40723607-40723670)
chr5 (152-218)||(10752949-10753015)
chr5 (7-76)||(18356474-18356543)
chr5 (12-200)||(20805578-20805772)
chr5 (113-220)||(21340764-21340869)
chr5 (7-200)||(23451374-23451573)
chr5 (90-200)||(10753387-10753491)
chr5 (7-76)||(20910690-20910759)
chr5 (156-200)||(26680608-26680652)
chr5 (156-200)||(26952215-26952259)
chr5 (150-200)||(123346-123396)
chr5 (150-200)||(1859017-1859067)
chr5 (71-200)||(20767000-20767135)
chr5 (12-140)||(22757219-22757348)
chr5 (156-200)||(12028612-12028656)
chr5 (148-200)||(17517240-17517292)
chr5 (156-200)||(17919198-17919242)
chr5 (156-200)||(31342173-31342217)
chr5 (7-200)||(23458618-23458817)
chr5 (7-200)||(23462879-23463078)
chr5 (150-200)||(24221903-24221953)
chr5 (47-140)||(10753111-10753204)
chr5 (150-200)||(23201386-23201436)
chr5 (150-200)||(23512124-23512174)
chr5 (150-200)||(23572110-23572160)
chr5 (167-200)||(14079175-14079208)
chr5 (167-200)||(21873280-21873313)
chr5 (156-200)||(22757151-22757195)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (7-198)||(13377-13568)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (7-220)||(228263-228475)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (37-200)||(5021-5184)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (37-200)||(43251836-43251999)
chr8 (37-200)||(19278203-19278366)
chr8 (37-200)||(21972505-21972668)
chr8 (37-200)||(21976590-21976753)
chr8 (7-220)||(16231365-16231578)
chr8 (37-170)||(22111904-22112037)
chr8 (7-220)||(22044887-22045100)
chr8 (12-200)||(20465933-20466129)
chr8 (12-200)||(30643185-30643382)
chr8 (47-220)||(14398039-14398210)
chr8 (110-220)||(21387077-21387184)
chr8 (106-220)||(21383657-21383768)
chr8 (7-220)||(30308644-30308855)
chr8 (12-200)||(15602911-15603107)
chr8 (93-220)||(32605214-32605339)
chr8 (93-220)||(23846992-23847117)
chr8 (12-200)||(15611363-15611559)
chr8 (151-220)||(17055412-17055481)
chr8 (93-220)||(15531893-15532018)
chr8 (12-200)||(17926601-17926796)
chr8 (7-145)||(18619555-18619694)
chr8 (152-220)||(32598682-32598750)
chr8 (93-220)||(15538452-15538577)
chr8 (34-132)||(22028647-22028746)
chr8 (71-200)||(16410208-16410344)
chr8 (100-220)||(17828567-17828684)
chr8 (12-200)||(20856319-20856515)
chr8 (90-200)||(18862624-18862728)
chr8 (90-200)||(21827993-21828097)
chr8 (148-200)||(18678141-18678193)
chr8 (148-200)||(32121762-32121814)
chr8 (90-200)||(21410973-21411077)
chr8 (90-200)||(21805465-21805569)
chr8 (150-200)||(39094965-39095015)
chr8 (151-200)||(22010716-22010765)
chr8 (12-99)||(377415-377503)
chr8 (103-200)||(23776821-23776926)
chr8 (12-99)||(24755858-24755946)
chr8 (153-220)||(24445541-24445608)
chr8 (150-200)||(377297-377347)
chr8 (150-200)||(16861365-16861415)
chr8 (150-200)||(24755740-24755790)
chr8 (19-99)||(19259483-19259564)
chr8 (150-200)||(17353984-17354034)
chr8 (150-200)||(19259632-19259682)
chr8 (150-200)||(21162099-21162149)
chr8 (150-200)||(21168772-21168822)
chr8 (167-200)||(19983119-19983152)
chr8 (150-202)||(16184744-16184796)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (7-220)||(19907-20119)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (37-200)||(58639-58802)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (37-200)||(35863-36025)
scaffold0109 (12-220)||(6948-7155)
scaffold0109 (152-220)||(11336-11404)
scaffold0109 (152-220)||(38853-38921)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (7-220)||(9555-9768)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (7-200)||(4456-4657)
scaffold0676 (90-200)||(473-578)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (34-220)||(3447-3633)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (12-200)||(185-382)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (13-200)||(6204-6399)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (34-218)||(18277-18461)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (7-122)||(10474-10589)
scaffold0004 (149-200)||(69820-69871)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (17-200)||(5612-5803)
scaffold0476 (17-200)||(6807-6998)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (12-200)||(419-615)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (12-200)||(42653-42844)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (12-200)||(1520-1715)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (62-200)||(17056-17202)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (47-218)||(30890-31059)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (7-220)||(24858-25072)
scaffold0012 (90-200)||(189356-189460)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (18-200)||(15113-15302)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (12-200)||(46621-46817)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (47-220)||(6684-6855)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (47-220)||(20395-20566)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (47-220)||(207768-207951)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (7-200)||(18545-18746)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (12-220)||(6152-6359)
scaffold0546 (152-220)||(1903-1971)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (12-200)||(9539-9733)
scaffold0104 (12-200)||(1856-2051)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (93-220)||(77148-77273)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (34-150)||(1-118)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (12-200)||(1384-1580)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (152-220)||(9338-9406)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (64-198)||(9990-10131)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (93-220)||(9907-10032)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (93-220)||(63858-63982)
scaffold0042 (93-220)||(75742-75866)
scaffold0042 (12-99)||(34804-34892)
scaffold0042 (150-200)||(34960-35010)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (93-220)||(1880-2005)
scaffold0008 (7-200)||(30634-30833)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (37-123)||(928-1014)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (108-220)||(8503-8613)
scaffold0111 (108-220)||(15647-15757)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (64-198)||(2933-3074)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (152-220)||(15341-15409)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (93-220)||(18358-18483)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (93-220)||(5977-6102)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (153-220)||(372-439)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (12-146)||(21463-21597)
scaffold0037 (152-218)||(80810-80876)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (74-200)||(73725-73857)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (103-220)||(71072-71180)
scaffold0003 (113-220)||(139715-139819)
scaffold0003 (7-76)||(71460-71529)
scaffold0003 (150-199)||(414091-414140)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (12-200)||(1978-2175)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (93-217)||(16640-16762)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (12-200)||(923-1118)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (93-220)||(9424-9549)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (12-200)||(44107-44302)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (7-220)||(23219-23432)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (7-143)||(19181-19317)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (12-200)||(6310-6505)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (113-220)||(36310-36414)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (12-200)||(19626-19823)
scaffold0017 (12-200)||(15104-15301)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (150-200)||(315-365)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (90-200)||(11480-11584)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (90-200)||(14066-14170)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (90-200)||(7497-7614)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (12-200)||(35405-35602)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (103-200)||(4790-4895)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (103-200)||(38465-38570)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (12-200)||(8586-8783)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (12-99)||(6972-7060)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (17-76)||(15317-15376)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (150-200)||(1818-1868)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (150-200)||(6121-6171)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (150-200)||(2477-2527)
scaffold0439 (150-200)||(10337-10387)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (150-200)||(7311-7361)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (150-200)||(16389-16439)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (150-200)||(14127-14177)
scaffold0056 (12-99)||(13971-14059)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (151-200)||(2858-2907)
scaffold0158 (151-200)||(6524-6573)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (156-200)||(2194-2238)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (156-200)||(4273-4317)
scaffold0184 (12-137)||(4119-4245)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (90-181)||(439-524)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (150-200)||(21844-21894)
scaffold0210 (150-200)||(29736-29786)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (149-199)||(48500-48550)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (150-200)||(14690-14740)
scaffold0081 (150-200)||(23705-23755)
scaffold0081 (150-200)||(39129-39179)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (167-200)||(15737-15770)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (12-140)||(192211-192340)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 2897707 - 2897917
Alignment:
Q  1 taatattgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttgg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |     
T  2897707 taatagtgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactgga 2897806  T
Q  101 attattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2897807 attattattgaatgatcaagaagttgatgaaaataaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 2897906  T
Q  201 ttatgaataag 211  Q
     | ||||||||    
T  2897907 gtctgaataag 2897917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15482879 - 15482666
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15482879 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 15482780  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  15482779 attgaatgctcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 15482680  T
Q  207 ataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||    
T  15482679 ataagttgatgatg 15482666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 20461390 - 20461594
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20461390 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 20461489  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  20461490 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 20461589  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  20461590 ataag 20461594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 7793239 - 7793444
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7793239 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttgttgattgattgcattacttgaattatt 7793338  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctg-attatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  7793339 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 7793438  T
Q  206 aataag 211  Q
    ||||||    
T  7793439 aataag 7793444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 327054 - 327259
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  327054 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 327153  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga-ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  327154 attgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 327253  T
Q  206 aataag 211  Q
    ||||||    
T  327254 aataag 327259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30066165 - 30065972
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30066165 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 30066066  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066065 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 30065972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11854952 - 11854759
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11854952 tgagacctatctaagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 11854853  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11854852 attgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatgttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 11854759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 55023086 - 55022893
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  55023086 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 55022987  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55022986 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatactgctattgttatttaactaagttacatga 55022893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11070287 - 11070094
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11070287 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatatcgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 11070188  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11070187 cttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 11070094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 11165419 - 11165612
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11165419 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 11165518  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11165519 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 11165612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14499544 - 14499351
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14499544 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaattgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 14499445  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14499444 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgataagatctgattatgcggttattgttatttaactaagttgcatga 14499351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15617563 - 15617400
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15617563 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattacattacttgaattattattgaatgatcaggaacttgttgaaaatga 15617464  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617463 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 15617400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Original strand, 31097444 - 31097656
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatga-aatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  || |||||| |||||    
T  31097444 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgagaatgctaagtgattatgttgtgatatattgattgattccactacttgaattat 31097543  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||    
T  31097544 tgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactatgttgcatgagtctg 31097643  T
Q  206 aataagttgatga 218  Q
    |||||||||||||    
T  31097644 aataagttgatga 31097656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7109887 - 7109724
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7109887 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 7109788  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7109787 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 7109724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7113822 - 7113659
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7113822 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 7113723  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7113722 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 7113659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22336908 - 22336745
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22336908 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 22336809  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22336808 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 22336745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 27409564 - 27409727
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27409564 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 27409663  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27409664 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 27409727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28949913 - 28949750
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28949913 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 28949814  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28949813 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 28949750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22321853 - 22321690
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22321853 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 22321754  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22321753 attggtattaagctattgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 22321690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Original strand, 11300401 - 11300539
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11300401 tgagacctatctaagatgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 11300500  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11300501 attgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatatt 11300539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 15850006 - 15850183
Alignment:
Q  38 gtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa 137  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15850006 gtgaagcttttatgaaatgctaaatgattatattgtgatatatggattgattgcataacttgaattattgttgaatgatcaagaaattg-tgaaaatgaa 15850104  T
Q  138 ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    ||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  15850105 ttgttattaaac--ttgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagactgaataagttgatga 15850183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15465040 - 15464869
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  15465040 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 15464942  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15464941 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 15464869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5223239 - 5223068
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  5223239 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 5223141  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5223140 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgtatgagtatgaataagttgatgatg 5223068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Original strand, 19725809 - 19726001
Alignment:
Q  15 atttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaat 113  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||| ||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||| | |||||||||||    
T  19725809 atttaagatgtcaactgaaatctgtgaaactgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattacattacttgaaatattattgaat 19725908  T
Q  114 gatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19725909 gatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgagtcatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 19726001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Original strand, 8489459 - 8489573
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgatt 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  8489459 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 8489555  T
Q  203 atgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8489556 atgaataagttgatgatg 8489573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 16797949 - 16798156
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattg 110  Q
    |||||| ||||| || ||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| |||    
T  16797949 cctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttg 16798048  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||| |||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  16798049 aatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtt--tgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaactatgttgcatgagtatgaataa 16798146  T
Q  211 gttgatgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  16798147 gttgatgatg 16798156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 18383811 - 18384006
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||| || |||| ||||| || ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  18383811 cctatttaagatgttaactgagatcagtgaagctgttatgaactgttaagctgattttaatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 18383910  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18383911 aatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18384006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12339641 - 12339470
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  12339641 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 12339543  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    || ||  ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12339542 aaact--tgatgagaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 12339470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 322813 - 322618
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  322813 cctatttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 322714  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  322713 aatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatattgttgtgatctgattatgccgctattgttatttaactaagttgcatga 322618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 16808776 - 16808983
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattg 110  Q
    |||||| ||||| || ||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| |||    
T  16808776 cctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttg 16808875  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 210  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||  |||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  16808876 aatggtcaagaaattgttgcaaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaactatattgcatgagtatgaataa 16808973  T
Q  211 gttgatgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  16808974 gttgatgatg 16808983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12496479 - 12496283
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  12496479 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 12496381  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12496380 aatgatcaagatgttgtagaaa-tgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 12496283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14668700 - 14668583
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668700 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 14668602  T
Q  182 atttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14668601 atttaactaagttgcatga 14668583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14665570 - 14665427
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   |||     |||||||    
T  14665570 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattttaaagttatactgttga 14665472  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665471 tgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 14665427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11854535 - 11854422
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgatt 202  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11854535 tattattgaaagattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgccgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 11854439  T
Q  203 atgaataagttgatgat 219  Q
    |||||||||||| ||||    
T  11854438 atgaataagttgttgat 11854422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 218
Target Start/End: Original strand, 16750567 - 16750689
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16750567 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaact 16750660  T
Q  190 aagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  16750661 aagttgcaagaatatgaataagttgatga 16750689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11863015 - 11862819
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||  ||  | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  11863015 cctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 11862916  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt--tgat------gtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||  | ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11862915 aatgaccaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatattttggtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 11862819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 11300723 - 11300868
Alignment:
Q  73 tgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgct 172  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  11300723 tgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaaac-gtt-atgtgatttgattatgct 11300819  T
Q  173 gctattgttatttaactaagttgcatgattatg-aataagttgatgatg 220  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  11300820 acaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 11300868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11851803 - 11851607
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||||||||||||||| |||  |  |||||||||  |||||| || |||| |||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  11851803 cctatttaagatgttatctgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 11851704  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |         ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11851703 aatgaacaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctaattatgctactatcgttatttaactaagttgcatga 11851607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16696857 - 16696789
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16696857 ttgatgtgatttgtttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 16696789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3833885 - 3833678
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattg 110  Q
    |||||| |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| || |||| ||||||    |||  ||| ||||||| || || ||||| |||||| |||    
T  3833885 cctattaaagatgatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttg 3833786  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 210  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3833785 aatgatcaagcaattgttgagaatgacttgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgtctatgaataa 3833688  T
Q  211 gttgatgatg 220  Q
    | ||||||||    
T  3833687 gctgatgatg 3833678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 3402850 - 3403047
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| |||    
T  3402850 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctattatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattccttgatttattcttg 3402949  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| | |  || |||||||||||||||||| |        ||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3402950 aataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 3403047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 200
Target Start/End: Original strand, 11298482 - 11298618
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatc 162  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| |||||||    
T  11298482 tgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatc 11298580  T
Q  163 tgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298581 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 11298618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Original strand, 12037871 - 12038042
Alignment:
Q  36 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat 134  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12037871 ctgtgaaaccattttgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaat 12037969  T
Q  135 gaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||        ||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12037970 gaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatga 12038042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38814513 - 38814388
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38814513 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 38814416  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||    
T  38814415 ttgcatgtctatcaataagctgatgatg 38814388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 1982705 - 1982901
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattga 111  Q
    |||| |||||||||||||||  |  ||||||| | ||||||| || ||||| ||| || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||| ||||    
T  1982705 cctaattaagatgttaactgcaatatgtgaagttgttatgaactgttaagttattgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaactatttttga 1982804  T
Q  112 atgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| | | | |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1982805 atgacctatatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttatagtgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 1982901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17242161 - 17241978
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  17242161 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 17242063  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg-aataagttgatga 218  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  17242062 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttgatga 17241978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Original strand, 4589228 - 4589294
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4589228 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 4589294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19775419 - 19775353
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19775419 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 19775353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12172872 - 12172822
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172872 tgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 12172822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 3389830 - 3390027
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| |||    
T  3389830 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttg 3389929  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||  | |  || |||||||||||||||||| |        ||||   || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3389930 aaaaaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 3390027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 220
Target Start/End: Original strand, 1598464 - 1598581
Alignment:
Q  100 gattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 198  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1598464 gattattgttaattgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttatttaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaat-gttatttaactaagttgcat 1598559  T
Q  199 gattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |  |||| ||||| ||||||||    
T  1598560 gtctatgtataagctgatgatg 1598581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 4111228 - 4111332
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  4111228 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 4111321  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  4111322 aagttgcatga 4111332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15965099 - 15964995
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  15965099 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 15965006  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  15965005 aagttgcatga 15964995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15969023 - 15968919
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  15969023 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 15968930  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  15968929 aagttgcatga 15968919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15972947 - 15972843
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  15972947 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 15972854  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  15972853 aagttgcatga 15972843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19775895 - 19775791
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  19775895 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 19775802  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  19775801 aagttgcatga 19775791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Original strand, 15941902 - 15942006
Alignment:
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  || | |||||     
T  15941902 tgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttattaaatt--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgtctaagtataagc 15941998  T
Q  213 tgatgatg 220  Q
    ||||||||    
T  15941999 tgatgatg 15942006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 4107376 - 4107480
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  4107376 gcattagttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 4107469  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  4107470 aagttgcatga 4107480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 11557425 - 11557475
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11557425 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 11557475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12511137 - 12511087
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 12511087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 23053128 - 23053178
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23053128 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 23053178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 37439615 - 37439719
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||| | |||||| || ||||    
T  37439615 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctacaattgttgttaaact 37439708  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  37439709 aagttgcatga 37439719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 46822345 - 46822295
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822345 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 11595186 - 11595230
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11595186 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 11595230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 200
Target Start/End: Original strand, 14878574 - 14878607
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14878574 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 14878607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15060516 - 15060428
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  15060516 cctatataagatggtaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttg 15060428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30029922 - 30029870
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30029922 gctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42326011 - 42325967
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  42326011 tgtgatctgattatgctgctgctgttttttaactaagttgcatga 42325967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 4589039 - 4589125
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4589039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 4589125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15051584 - 15051534
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15051584 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15051534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15051740 - 15051666
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgatt 85  Q
    ||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  15051740 cctatataagatgttaactgcaatttgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgatt 15051666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15060360 - 15060310
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15060360 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15060310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878142
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15878142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16909818 - 16909768
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16909818 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatga 16909768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19775608 - 19775515
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19775608 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 19775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Original strand, 11595033 - 11595162
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| |||||| |||    
T  11595033 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttg 11595132  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  11595133 aataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 11595162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 200
Target Start/End: Original strand, 17525216 - 17525249
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17525216 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 17525249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 13635359 - 13635572
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13635359 tgaggcctatttaagatattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 13635458  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  13635459 attgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 13635558  T
Q  207 ataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||    
T  13635559 ataagttgatgatg 13635572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12318343 - 12318130
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12318343 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 12318244  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  12318243 attgaatgattaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 12318144  T
Q  207 ataagttgatgatg 220  Q
    ||||| ||||||||    
T  12318143 ataagatgatgatg 12318130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11312864 - 11312660
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11312864 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 11312765  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  11312764 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 11312665  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  11312664 ataag 11312660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15580907 - 15580694
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15580907 tgagacctatttaggatgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattatt 15580808  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  15580807 attgaatgataaaaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaactaagttgcatgagtctga 15580708  T
Q  207 ataagttgatgatg 220  Q
    ||||| ||||||||    
T  15580707 ataagatgatgatg 15580694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16583471 - 16583259
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  16583471 tgagacctatataagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttat-gattgattgcattacttgaattatt 16583373  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||    
T  16583372 gttgaatgatcgagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactacgttgcatgagtctga 16583273  T
Q  207 ataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||    
T  16583272 ataagttgatgatg 16583259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Original strand, 15605162 - 15605374
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15605162 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 15605261  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||    
T  15605262 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaaaatgcatgagtctg 15605361  T
Q  206 aataagttgatga 218  Q
    |||| | ||||||    
T  15605362 aatatgatgatga 15605374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 70655 - 70848
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  70655 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 70754  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  70755 attgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 70848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 74764 - 74957
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  74764 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 74863  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  74864 attgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 74957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33323 - 33130
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33323 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 33224  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33223 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgttccgattatgctgttattgttatttaactcagttgcatga 33130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39722452 - 39722289
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39722452 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattaattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 39722353  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722352 gttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 39722289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12715050 - 12714887
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12715050 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 12714951  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12714950 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 12714887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12718854 - 12718691
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12718854 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 12718755  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12718754 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 12718691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16114427 - 16114264
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16114427 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 16114328  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16114327 attgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 16114264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16117580 - 16117417
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16117580 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 16117481  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16117480 attgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 16117417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 16907121 - 16907284
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16907121 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 16907220  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16907221 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 16907284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18283552 - 18283389
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18283552 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 18283453  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18283452 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 18283389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26292581 - 26292418
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26292581 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattaattgaattattattgaatgataaggaagttgttgaaaatga 26292482  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292481 attgatattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 26292418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18279589 - 18279426
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18279589 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 18279490  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18279489 attggtattaagttgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 18279426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 12704579 - 12704742
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12704579 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgaatgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 12704678  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12704679 attggtattaagctgctgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 12704742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12723765 - 12723602
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12723765 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaataa 12723666  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12723665 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgatattgttatttaactaagttacatga 12723602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9593549 - 9593348
Alignment:
Q  19 aagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatc 117  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||  || | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9593549 aagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatc 9593450  T
Q  118 aagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaa-taagttgat 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  9593449 aagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaattaagttgat 9593352  T
Q  217 gatg 220  Q
    ||||    
T  9593351 gatg 9593348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 18948 - 19161
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||    
T  18948 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattat 19047  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19048 tattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtctg 19145  T
Q  206 aa-taagttgatgatg 220  Q
    || |||||||||||||    
T  19146 aattaagttgatgatg 19161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 13918710 - 13918881
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  13918710 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 13918808  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13918809 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 13918881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 1859016 - 1859187
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  1859016 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgttatt 1859114  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||  || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1859115 aagct--tgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 1859187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11987400 - 11987225
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    |||| |||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11987400 aactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaataataagtgaattatggattgattgcatttacttgatttattattgaatgatcaagaaactgttgaaa 11987301  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 210  Q
    |||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11987300 atgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataa 11987225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14430104 - 14429909
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  14430104 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 14430005  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14430004 aatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtatactgttgttgtgatctgattatgcggctattgttatttaactaagttgcatga 14429909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 12321636 - 12321832
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||| || ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | |||||| |    
T  12321636 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaaactgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatgg 12321735  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12321736 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatga 12321832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 25927433 - 25927604
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  25927433 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaatttttatt 25927531  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25927532 aagtt--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 25927604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8917615 - 8917430
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  |    
T  8917615 aactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtga 8917516  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8917515 atgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 8917430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Original strand, 2530378 - 2530491
Alignment:
Q  104 attattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatg-tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgatt 202  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  2530378 attatggaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagct--tgattatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 2530475  T
Q  203 atgaataagttgatga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  2530476 atgaataagttgatga 2530491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 220
Target Start/End: Original strand, 7519332 - 7519460
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7519332 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 7519428  T
Q  190 aagttgcatgattatgaa-taagttgatgatg 220  Q
    |||||| |||| | |||| ||| |||||||||    
T  7519429 aagttggatgagtctgaattaaattgatgatg 7519460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 200
Target Start/End: Original strand, 16457334 - 16457439
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  16457334 ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatg 16457431  T
Q  193 ttgcatga 200  Q
    ||||||||    
T  16457432 ttgcatga 16457439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Original strand, 9751703 - 9751845
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgat 156  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |       ||||||||    
T  9751703 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttggaa-tgaattgatattatgaattatactgttgat 9751801  T
Q  157 gtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9751802 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 9751845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13149283 - 13149158
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13149283 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 13149186  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  13149185 ttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 13149158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16275563 - 16275495
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275563 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 16275495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18425565 - 18425443
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18425565 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaact 18425472  T
Q  190 aagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  18425471 aagttgcaagaatatgaataagttgatga 18425443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35151676 - 35151609
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151676 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 35151609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Original strand, 2832389 - 2832532
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   || |     |||||    
T  2832389 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatattgttga 2832487  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2832488 tgggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 2832532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9644512 - 9644384
Alignment:
Q  19 aagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatc 117  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||  || | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9644512 aagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatc 9644413  T
Q  118 aagaagttgttgaaaatgaattgatatta 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9644412 aagaaattgttgaaaatgaattgttatta 9644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13461889 - 13461764
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||     
T  13461889 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgtaattaaactaat 13461792  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13461791 ttgcatgagtatgaataagttgatgatg 13461764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2760351 - 2760157
Alignment:
Q  14 tatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| ||| || | || |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||   ||||||||||    
T  2760351 tatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgagatattattgaa 2760253  T
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |         ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2760252 tgatcatgatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttcgttatttaactaagttgcatga 2760157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14217040 - 14216918
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14217040 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattgaactaagttg 14216943  T
Q  196 catgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  14216942 catgaatatgaataagttgatgatg 14216918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15728450 - 15728328
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15728450 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttg 15728353  T
Q  196 catgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15728352 catgaatatgaataagttgatgatg 15728328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3272050 - 3271849
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||| || ||    
T  3272050 tgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttactgattaattgcattacttgaat-at 3271952  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgc 196  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3271951 tattgaataatcaagatgttgtagaaa-tgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgc 3271853  T
Q  197 atga 200  Q
    ||||    
T  3271852 atga 3271849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18557101 - 18556976
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18557101 ttacttgaattattgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgctattgaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 18557004  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18557003 ttgcatgactatgtataagttgatgatg 18556976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Original strand, 16724665 - 16724732
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16724665 tgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 16724732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Original strand, 17701679 - 17701746
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17701679 tgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 17701746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Original strand, 39267847 - 39267990
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |         |||||     
T  39267847 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatagtattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaagttttaatgttgt 39267945  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39267946 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 39267990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 2530040 - 2530108
Alignment:
Q  14 tatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattg 82  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  2530040 tatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgatatattg 2530108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 45169985 - 45170089
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  45169985 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 45170078  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  45170079 aagttgcatga 45170089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6801401 - 6801237
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat-ttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaa 131  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||   ||||  |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| || | |||||||||| |||||||     
T  6801401 aactgtgaagccattatgatatattaagtgattatgaagtgaaattatggattgattgcccttacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgag 6801303  T
Q  132 aatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 199  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  6801302 aatgatttgttattaagct--tgacatgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatg 6801237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42204064 - 42204020
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42204064 tgtgatctgattatgctgctgttgttgtttaactaagttgcatga 42204020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 9446199 - 9446249
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9446199 tgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 9446249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 19649530 - 19649580
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19649530 tgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 19649580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 20569643 - 20569687
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20569643 tgtgatatgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 20569687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 66305 - 66509
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  66305 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 66404  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  66405 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 66504  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  66505 ataag 66509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 53781 - 53577
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53781 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 53682  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  53681 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 53582  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  53581 ataag 53577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36169
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  36065 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 36158  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  36159 aagttgcatga 36169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Original strand, 65838 - 65889
Alignment:
Q  149 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  65838 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 65889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17804413 - 17804209
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17804413 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 17804314  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  17804313 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 17804214  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  17804213 ataag 17804209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 25767058 - 25767262
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25767058 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaaactattatgaaatgctaagtgattataatgtaatttattgattgattgcattacttgaattatt 25767157  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  25767158 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttacttaactaagttgcatgagtctga 25767257  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  25767258 ataag 25767262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Original strand, 22429920 - 22430131
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22429920 tgagacctatttaagatgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 22430019  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||    
T  22430020 attaaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaactaagttgcatgagtctga 22430119  T
Q  207 ataagttgatga 218  Q
    ||| | ||||||    
T  22430120 atatgatgatga 22430131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14472486 - 14472294
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14472486 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 14472387  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14472386 attgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgtta-ttaactaagttgcatga 14472294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 18955653 - 18955846
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18955653 tgagacctatataagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattgattgattgattgcattacttgaattatt 18955752  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18955753 attgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 18955846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22863162 - 22862969
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22863162 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 22863063  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22863062 attgaatgattagaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 22862969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1644891 - 1644728
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1644891 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 1644792  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1644791 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatga 1644728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19870801 - 19870613
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattga 111  Q
    ||||||||||||  | | ||| || |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19870801 cctatttaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattga 19870702  T
Q  112 atgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19870701 atgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 19870613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11567048 - 11566885
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11567048 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 11566949  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11566948 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 11566885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23395254 - 23395091
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23395254 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 23395155  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23395154 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 23395091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8244047 - 8243884
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8244047 tgtggagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 8243948  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8243947 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 8243884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23990106 - 23989943
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23990106 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 23990007  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23990006 attggtaataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 23989943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 18917186 - 18917349
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18917186 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 18917285  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917286 attgatattgggctgttgatatgatataattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18917349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 12618765 - 12618927
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  12618765 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatga 12618863  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12618864 attggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 12618927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12706905 - 12706692
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||   ||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  12706905 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaaatgaattatggattgattgcatttacttgaattat 12706806  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12706805 ttttgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctg 12706708  T
Q  206 aa-taagttgatgatg 220  Q
    || |||||||||||||    
T  12706707 aattaagttgatgatg 12706692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16741422 - 16741209
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16741422 tgagacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattat 16741323  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  | ||    
T  16741322 tattgaatgatcaagaaattgttgacagtgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctacaattgttattaaactaagttgcatgtgtctg 16741225  T
Q  206 aa-taagttgatgatg 220  Q
    || |||||||||||||    
T  16741224 aattaagttgatgatg 16741209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23414820 - 23414649
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  23414820 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 23414722  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23414721 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 23414649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27556578 - 27556407
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  27556578 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 27556480  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27556479 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 27556407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18907333 - 18907137
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtg-attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||| || |||||  |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  18907333 cctatttaagatgttaactgcaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttcattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 18907234  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18907233 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatga 18907137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 5616745 - 5616917
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| || |||||||||||   |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  5616745 ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgagaatgatttgttatt 5616844  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    || ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5616845 aaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 5616917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 9482204 - 9482395
Alignment:
Q  28 actgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttg 126  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| || |||| ||||||    ||| |||| ||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  9482204 actgtaaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattatgaaatgaattatagattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattg 9482303  T
Q  127 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  9482304 ttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgcttatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 9482395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16624259 - 16624137
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||| |  |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16624259 gcattacttgaagtattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagtt--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaact 16624166  T
Q  190 aagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  16624165 aagttgcaagaatatgaataagttgatga 16624137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 200
Target Start/End: Original strand, 16523330 - 16523474
Alignment:
Q  62 tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt-------tg 154  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |  ||       ||    
T  16523330 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacctgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaa-tgaattgatatgatgaagtataaagttg 16523428  T
Q  155 atgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523429 ttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16523474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Original strand, 1587711 - 1587833
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1587711 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttg 1587808  T
Q  196 catgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  1587809 catgaatatgaataagttgatgatg 1587833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Original strand, 27325582 - 27325712
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 180  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |        ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27325582 gcattacttgaaatattatggaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatattatgaagttatactgttgatgtgatatgattatgctgctattgt 27325681  T
Q  181 tatttaactaagttgcatgattatgaataag 211  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27325682 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 27325712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21702359 - 21702291
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702359 ttgatgtgatttgattttgctgcaattgttatttaattaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 21702291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 22592780 - 22592905
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  22592780 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctacaaatgttatttaactaag 22592877  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  22592878 ttgcatgtctatgaataagctgatgatg 22592905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 27416124 - 27416289
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  ||||||||   | ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  27416124 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactctaaatattaatgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 27416222  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||       |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27416223 aagct-------tgat-tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaatatgttgatgatg 27416289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19662958 - 19662775
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  19662958 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 19662860  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg-aataagttgatga 218  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  19662859 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttgatga 19662775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1644359 - 1644293
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1644359 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 1644293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12496437 - 12496312
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 191  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||  || ||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12496437 ttacttgaaatattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttatagaacctgttg---tgatctgattatgctgcaaatgttatttaactaa 12496341  T
Q  192 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  12496340 gttgcatgtctatgaataagctgatgatg 12496312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Original strand, 31478265 - 31478331
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31478265 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 31478331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 2685236 - 2685421
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||| |    
T  2685236 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgtcgattgatcaagaa-ttgttgaga 2685334  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg-aataagttgatgatg 220  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  2685335 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 2685421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Original strand, 20803534 - 20803656
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  20803534 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagctg 20803631  T
Q  196 catgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  20803632 catgaatatgaataagttgatgatg 20803656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 21834784 - 21834916
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||   || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |  | |||||||| | ||||||||    
T  21834784 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgttt--aactgctaagttgattataatgtgatttaatgattaaatgtattacttgaaatattattg 21834881  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 146  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21834882 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21834916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 20907955 - 20908072
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  20907955 gcattacttgaattattcttgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgtt 20908053  T
Q  182 atttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20908054 atttaactaagttgcatga 20908072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21766838 - 21766721
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  21766838 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgtt 21766740  T
Q  182 atttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21766739 atttaactaagttgcatga 21766721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 27415832 - 27415901
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27415832 tgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 27415901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Original strand, 25135706 - 25135774
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135706 ttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaattgagttgcatgattatgaataagttgatgatg 25135774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18180655 - 18180520
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatct 163  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| ||||||||    
T  18180655 tgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatct 18180557  T
Q  164 gattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18180556 gattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 18180520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 31477789 - 31477893
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  31477789 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 31477882  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  31477883 aagttgcatga 31477893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 19790826 - 19790870
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19790826 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 19790870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 19848034 - 19848086
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19848034 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 19848086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16760422 - 16760321
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  16760422 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 16760329  T
Q  190 aagttgca 197  Q
    ||||||||    
T  16760328 aagttgca 16760321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22949235 - 22949131
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  22949235 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 22949142  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  22949141 aagttgcatga 22949131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22953191 - 22953087
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  22953191 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 22953098  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  22953097 aagttgcatga 22953087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23871679 - 23871575
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  23871679 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 23871586  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  23871585 aagttgcatga 23871575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23875635 - 23875531
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  23875635 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 23875542  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  23875541 aagttgcatga 23875531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 27553612 - 27553662
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27553612 tgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttctttaactaagttgcatga 27553662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 15041589 - 15041641
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15041589 gctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatga 15041641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 23657468 - 23657512
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23657468 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 23657512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23992509 - 23992457
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23992509 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatga 23992457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 15894479 - 15894529
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15894479 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 15894529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Original strand, 31478076 - 31478169
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31478076 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 31478169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 27567656 - 27567700
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  27567656 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgtatga 27567700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19873197 - 19873146
Alignment:
Q  149 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19873197 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 19873146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Original strand, 22408345 - 22408391
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 197  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22408345 gttgttgtgatctgattatactgcttttgttatttaaccaagttgca 22408391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Original strand, 19790673 - 19790802
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| |||||| |||    
T  19790673 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttg 19790772  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  19790773 aataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 19790802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19863037 - 19863004
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19863037 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 19863004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24735619 - 24735415
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24735619 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatcgcattacttgaattatt 24735520  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  24735519 attgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 24735420  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  24735419 ataag 24735415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 10101535 - 10101728
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10101535 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 10101634  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101635 attgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 10101728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24649543 - 24649380
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24649543 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatga 24649444  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24649443 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 24649380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 12901432 - 12901595
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12901432 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatga 12901531  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12901532 attgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 12901595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 27379353 - 27379516
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27379353 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 27379452  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379453 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 27379516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 27383399 - 27383562
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27383399 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 27383498  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383499 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 27383562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27601982 - 27601819
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27601982 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 27601883  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27601882 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 27601819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 24628399 - 24628562
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24628399 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 24628498  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24628499 attggtattaagctgttaatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 24628562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 19688646 - 19688779
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19688646 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 19688745  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19688746 attgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattg 19688779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 41530930 - 41531087
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    ||||||    
T  41530930 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagatgttg----aaatga 41531025  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  41531026 attgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 41531087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31345008 - 31344881
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31345008 gcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattattatttaact 31344912  T
Q  190 aagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31344911 aagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 31344881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41667078 - 41666953
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41667078 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 41666981  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41666980 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 41666953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 25963611 - 25963806
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || |||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  25963611 cctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 25963709  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25963710 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattgaactaagttgcatga 25963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 22811805 - 22812002
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattga-tggcattacttggattattatt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||  |||||| |  ||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||| || | |||||||    
T  22811805 cctatttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctgctatgaactattaagttgattataatgtgatttaatgattaaattgcattacctgaagtattatt 22811904  T
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||        |||   ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22811905 gaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatgatgaagttataatgttgttgtgatttgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 22812002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 220
Target Start/End: Original strand, 19928487 - 19928604
Alignment:
Q  101 attattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  19928487 attattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgt 19928584  T
Q  201 ttatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  19928585 ttatgaataatctgatgatg 19928604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 25961429 - 25961625
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattga 111  Q
    |||||||||||||||| |||  |  ||||||  | ||||||| || |||||  || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||| ||||    
T  25961429 cctatttaagatgttagctgcaatatgtgaatttgttatgaactgttaagttgttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaattattcttga 25961528  T
Q  112 atgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25961529 atgatctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 25961625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 15477789 - 15477711
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatga 115  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15477789 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 15477711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Original strand, 22461106 - 22461289
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  22461106 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 22461204  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg-aataagttgatga 218  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  22461205 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttgatga 22461289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27263343 - 27263276
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27263343 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 27263276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 18855438 - 18855561
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  18855438 ttacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttgtttaactaag 18855534  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  18855535 ttgcatg-ttatgaataaactgatgatg 18855561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 60941 - 60820
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  60941 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgat-tgattatgctgcaattgttattaaactaagttg 60845  T
Q  196 catgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||    
T  60844 catgaatatgaataagttgttgatg 60820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 21916072 - 21916189
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||| ||| ||||||||||||||| || | |||||    
T  21916072 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttgtttttgtt 21916170  T
Q  182 atttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21916171 atttaactaagttgcatga 21916189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26125332 - 26125212
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| |   ||| ||||||| ||||||||||     |||||||||||||||    
T  26125332 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gtttatgtgatttgattatgct-----tgttatttaactaag 26125240  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26125239 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 26125212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23187291 - 23187079
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| |||||  | ||||| |||||||||||| ||||||  || |||||||||||   |||| || | |||| || | ||| ||||| |||||    
T  23187291 tgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtatttacttgaattat 23187192  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    | |||||||||||||||  | |||| ||||| ||  |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  23187191 tgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacc--tgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagttccatgagtatg 23187094  T
Q  206 aataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||    
T  23187093 aataagttgatgatg 23187079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23598554 - 23598342
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| |||||  | ||||| |||||||||||| ||||||  || |||||||||||   |||| || | |||| || | ||| ||||| |||||    
T  23598554 tgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtatttacttgaattat 23598455  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    | |||||||||||||||  | |||| ||||| ||  |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  23598454 tgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaacc--tgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagttccatgagtatg 23598357  T
Q  206 aataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||    
T  23598356 aataagttgatgatg 23598342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 200
Target Start/End: Original strand, 21318590 - 21318727
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgat 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||         ||| |||| || ||||||    
T  21318590 tgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtagaaa-tgaattgataattatgaagttatgctgctgttgtgat 21318688  T
Q  162 ctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21318689 ctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 21318727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 200
Target Start/End: Original strand, 21327521 - 21327658
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgat 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||         ||| |||| || ||||||    
T  21327521 tgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtagaaa-tgaattgataattatgaagttatgctgctgctgtgat 21327619  T
Q  162 ctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21327620 ctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 21327658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 30344970 - 30345074
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  30344970 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 30345063  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  30345064 aagttgcatga 30345074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37524751 - 37524701
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  37524751 tgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 37524701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24869950 - 24869906
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24869950 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 24869906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40428686 - 40428489
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| ||     
T  40428686 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattctta 40428587  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| | |  || |||||||||||||||||| ||||| |         | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40428586 aataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatattgttgtgatctgaatatgctgcttttgttattgaactaagttgcatga 40428489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1283516 - 1283412
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||| || | ||    
T  1283516 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaatct 1283423  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  1283422 aagttgcatga 1283412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 22799167 - 22799217
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22799167 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 22799217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24174876 - 24174826
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24174876 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 24174826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 24716569 - 24716619
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24716569 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 24716619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24673777 - 24673713
Alignment:
Q  36 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  24673777 ctgtgaagctattatgaaatgttaagctgattatactgtgatttaatgattaattgcattacttg 24673713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25616267 - 25616215
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25616267 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 24655379 - 24655429
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24655379 tgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 24655429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 194
Target Start/End: Original strand, 23019747 - 23019791
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 194  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019747 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagtt 23019791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 21918210 - 21918284
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgatt 85  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  21918210 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgatt 21918284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24673639 - 24673595
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24673639 tgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcatga 24673595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13120 - 12907
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13120 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 13021  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  13020 attgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 12921  T
Q  207 ataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||    
T  12920 ataagttgatgatg 12907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19397 - 19191
Alignment:
Q  14 tatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaat 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  19397 tatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaat 19298  T
Q  114 gatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagtt 213  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19297 gatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagtt 19198  T
Q  214 gatgatg 220  Q
    |||||||    
T  19197 gatgatg 19191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 62386 - 62264
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  62386 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgagttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 62289  T
Q  196 catgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  62288 catgattatgaataagttgatgatg 62264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Original strand, 24782990 - 24783199
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  24782990 tgagacctacttaagatgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattaattgcattacttgaattatt 24783089  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24783090 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctga 24783189  T
Q  207 ataagttgat 216  Q
    ||||| ||||    
T  24783190 ataagatgat 24783199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 36819198 - 36819412
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||    
T  36819198 tgagacctatttaagatattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattatattgtgatttatttattgattgcatttcttgaattatt 36819297  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  36819298 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 36819397  T
Q  206 aataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||    
T  36819398 aataagttgatgatg 36819412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1010939 - 1010746
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1010939 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 1010840  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010839 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 1010746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Original strand, 16080334 - 16080545
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16080334 tgagacctatttaagagattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 16080433  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||    
T  16080434 attggatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgataataagttattgatgtgatctgattatgctgctatttttaattaactaagttgcatgagtctga 16080533  T
Q  207 ataagttgatga 218  Q
    ||| | ||||||    
T  16080534 atatgatgatga 16080545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 20228729 - 20228892
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20228729 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 20228828  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20228829 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatga 20228892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 16375378 - 16375541
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16375378 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 16375477  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16375478 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 16375541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21407541 - 21407378
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21407541 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 21407442  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21407441 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 21407378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 52639727 - 52639564
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52639727 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 52639628  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  52639627 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatga 52639564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19212056 - 19211870
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  19212056 aactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaga 19211957  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaa-taagttgatgatg 220  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  19211956 atgaattgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 19211870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33797457 - 33797286
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  33797457 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattaatcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 33797359  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33797358 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 33797286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 18182021 - 18182211
Alignment:
Q  18 taagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgat 116  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||||| | ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  18182021 taagaagttaactgcaaactgtgaagctgttatgagatgctaagttgtttataatgtgattcaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgat 18182120  T
Q  117 caagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||        ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182121 caagatgttgttg-aaataaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18182211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 23819189 - 23819381
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatgg-cattacttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||    
T  23819189 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgtctttacttgaattat 23819288  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23819289 tattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaacgaagttgcatga 23819381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 22449166 - 22449356
Alignment:
Q  18 taagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgat 116  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  22449166 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttgaaatattattgaatgat 22449265  T
Q  117 caagaagttgttgaaaa----tga-at--tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||||    ||| ||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22449266 caagatgttgttgaaaagtattgatattatgaaattatgctcttgttgtgatctgattatgctgctactattatttaactaagttgcatga 22449356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18882496 - 18882371
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  18882496 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgataatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaag 18882399  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  18882398 ttgcatttttatgaataagctgatgatg 18882371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20138209 - 20138086
Alignment:
Q  96 cttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 195  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20138209 cttgaattattgttgaatgttcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 20138112  T
Q  196 catgattatgaa-taagttgatgatg 220  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||    
T  20138111 catgagtctgaattaagttgatgatg 20138086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Original strand, 3472843 - 3473013
Alignment:
Q  36 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||  | ||||||||| ||||| |  | |||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||  |    
T  3472843 ctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgtttgaaatgtgatttaatgattaaatgaattacttgaaatattgttgaatgatcaagatgttgttgaag-t 3472941  T
Q  135 gaattgatattaagctgttgat------gtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    || ||||||||| |  ||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3472942 gatttgatattatgaagttaatactcttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 3473013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 218
Target Start/End: Original strand, 39244120 - 39244242
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  ||||||| |  |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39244120 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaagtt--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaact 39244213  T
Q  190 aagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  39244214 aagttgcaagaatatgaataagttgatga 39244242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 218
Target Start/End: Original strand, 39247675 - 39247797
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  ||||||| |  |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39247675 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaagtt--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaact 39247768  T
Q  190 aagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  39247769 aagttgcaagaatatgaataagttgatga 39247797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 218
Target Start/End: Original strand, 41388220 - 41388342
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  |||||||||  ||||  ||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41388220 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaatttttattaagct--tgatacgaattgattatgctgcaattgttatttaact 41388313  T
Q  190 aagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  41388314 aagttgcaagaatatgaataagttgatga 41388342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 46975596 - 46975471
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  46975596 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 46975499  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  46975498 ttgcacgtctatgaataagctgatgatg 46975471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12647059 - 12646876
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  12647059 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 12646961  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg-aataagttgatga 218  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  12646960 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgaatctgaaataagttgatga 12646876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 218
Target Start/End: Original strand, 20229208 - 20229330
Alignment:
Q  94 tacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 193  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20229208 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaacttttgagaatgatttgttatttaact--taatgtgatttgattatgctggaattgttatttaactaagt 20229305  T
Q  194 tgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  20229306 tgcaagagtatgaataagttgatga 20229330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 33797749 - 33797680
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33797749 tgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 33797680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 1925108 - 1925212
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  1925108 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 1925201  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  1925202 aagttgcatga 1925212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 8761527 - 8761724
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |  |||| | |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||    
T  8761527 cctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctaattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattg 8761626  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||         ||| | ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  8761627 aataatcaagatgttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgttatttaactatgatgcatga 8761724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 20924122 - 20924226
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  20924122 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 20924215  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  20924216 aagttgcatga 20924226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 17678560 - 17678676
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 182  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17678560 gcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgtta 17678658  T
Q  183 tttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| |||||||||||    
T  17678659 tttaaccaagttgcatga 17678676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 45310259 - 45310459
Alignment:
Q  10 ggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| |    
T  45310259 ggcctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattgcttgatttattct 45310358  T
Q  109 tgaatgatcaagaagttgttgaaaatg-aattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 199  Q
    ||||| | |  |||||||||||||||| ||||| |        ||||   || || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45310359 tgaataaccttgaagttgttgaaaatgaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgtcgttatttaactaagttgcatg 45310458  T
Q  200 a 200  Q
    |    
T  45310459 a 45310459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 3705105 - 3705155
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3705105 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 3705155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 18393858 - 18394056
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| |||    
T  18393858 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttg 18393957  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaa----ttgatat-----taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| | |  ||||||||||||||| ||    ||| |||     ||   || || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18393958 aataaccttgaagttgttgaaaataaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 18394056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Original strand, 33050067 - 33050116
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33050067 gttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 33050116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21022863 - 21022775
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  21022863 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagctgattataatgtgaattaatgattaattgcattacttg 21022775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 21788081 - 21788133
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21788081 gctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatga 21788133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21313185 - 21313140
Alignment:
Q  166 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21313185 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 21313140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 22468735 - 22468787
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22468735 gctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 22468787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 45489790 - 45489834
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  45489790 tgtgatctgattatgctgctgctattatttaactaagttgcatga 45489834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20135267 - 20135217
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20135267 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 20229075 - 20229161
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20229075 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 20229161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 42865105 - 42865194
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| | |||   |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  42865105 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaaggttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttg 42865194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21022701 - 21022657
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21022701 tgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgttgcatga 21022657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 36133852 - 36134056
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  36133852 tgagacctatttaagatattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgagttatt 36133951  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  36133952 attgaatgatcaggaagttgttgaagatgaatggatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga 36134051  T
Q  207 ataag 211  Q
    |||||    
T  36134052 ataag 36134056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17810488 - 17810295
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17810488 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 17810389  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810388 attgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 17810295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 14757312 - 14757505
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14757312 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 14757411  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14757412 attgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 14757505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9556716 - 9556553
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9556716 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattagtattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 9556617  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556616 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 9556553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27534242 - 27534049
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  27534242 tgagacctatctgagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagttgttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaatcatt 27534143  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27534142 attgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttattaaactaagttgcatga 27534049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 4561254 - 4561417
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  4561254 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaataa 4561353  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4561354 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 4561417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 5756858 - 5757021
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5756858 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 5756957  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5756958 attggtattaagttgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatga 5757021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Original strand, 22634369 - 22634525
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 163  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634369 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 22634468  T
Q  164 gattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  22634469 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgcgtctgaataagttgatgatg 22634525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33742563 - 33742401
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  33742563 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatga 33742465  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33742464 attggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 33742401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 1951663 - 1951864
Alignment:
Q  19 aagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatc 117  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||  || | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1951663 aagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatc 1951762  T
Q  118 aagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaa-taagttgat 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  1951763 aagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaattaagttgat 1951860  T
Q  217 gatg 220  Q
    ||||    
T  1951861 gatg 1951864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 18222295 - 18222481
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18222295 aactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaa 18222394  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaa-taagttgatgatg 220  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  18222395 atgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaattaagttcatgatg 18222481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 43256343 - 43256514
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  43256343 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 43256441  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43256442 aagct--tgatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 43256514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 16487972 - 16488168
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  16487972 cctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 16488071  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||        ||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16488072 aatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16488168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 17152377 - 17152589
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||    
T  17152377 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagattttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattat 17152476  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17152477 tattgaatgatcaaggaattgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtctg 17152573  T
Q  206 aa-taagttgatgatg 220  Q
    || |||||||||||||    
T  17152574 aattaagttgatgatg 17152589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 18228770 - 18228956
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatgg-cattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  18228770 aactgtgaagcttttacgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtctttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttggaa 18228869  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaa-taagttgatgatg 220  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  18228870 atgaattgttatgaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaatttttatttaactaagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 18228956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 26243642 - 26243767
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26243642 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 26243739  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26243740 ttgcatgtttatgaataagctgatgatg 26243767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18237067 - 18236895
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| || |||||||||||   |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||    
T  18237067 ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgattaagaaattgttgagaatgatttgttatt 18236968  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    || |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18236967 aaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 18236895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 220
Target Start/End: Original strand, 28569423 - 28569546
Alignment:
Q  95 acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 194  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| |   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28569423 acttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 28569520  T
Q  195 gcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28569521 gcatgattatgaataagttgatgatg 28569546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3412919 - 3412802
Alignment:
Q  101 attattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3412919 attattgttgaatgatcaagaaattattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 3412822  T
Q  201 ttatgaataagttgatgatg 220  Q
     |||||||||||||||||||    
T  3412821 gtatgaataagttgatgatg 3412802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Original strand, 14708668 - 14708736
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14708668 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 14708736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 16243377 - 16243502
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16243377 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 16243474  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16243475 ttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 16243502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 16356847 - 16357042
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-tagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||| ||||||||  ||  || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  16356847 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttttttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 16356945  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356946 aatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16357042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 19757578 - 19757703
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19757578 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 19757675  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19757676 ttgcatgtttatgaataagctgatgatg 19757703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19782228 - 19782103
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19782228 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 19782131  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19782130 ttgcatgtttatgaataagctgatgatg 19782103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23139459 - 23139275
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcat-tacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||   |||||| |||||| || | |||||||||| ||||||| |    
T  23139459 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccatacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgaga 23139361  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23139360 atgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgtttatgaataagctgatgatg 23139275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Original strand, 20157407 - 20157550
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   || |     |||||    
T  20157407 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttataccgttga 20157505  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20157506 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatga 20157550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2014907 - 2014782
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2014907 ttacttgaattattgtggaatgatcaagaaattgttgcgaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 2014810  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  2014809 ttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 2014782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 16348559 - 16348754
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || | || |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||  | ||||||||    
T  16348559 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttaaaatattattg 16348657  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |        |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348658 aattatcaagatgttgtggaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16348754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Original strand, 42997484 - 42997552
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42997484 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatgattatgaataagttgatgatg 42997552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Original strand, 13812966 - 13813109
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |         |||||     
T  13812966 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaagttttaatgttgt 13813064  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813065 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 13813109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15224866 - 15224800
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15224866 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataagttgatga 15224800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 43256051 - 43256120
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43256051 tgagacctatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 43256120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45938269 - 45938152
Alignment:
Q  100 gattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 199  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  45938269 gattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagatgcatg 45938173  T
Q  200 attatgaataagttgatgatg 220  Q
      |||| ||||| ||||||||    
T  45938172 tctatgtataagctgatgatg 45938152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10712980 - 10712876
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  10712980 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 10712887  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  10712886 aagttgcatga 10712876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10926750 - 10926646
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  10926750 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 10926657  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  10926656 aagttgcatga 10926646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 200
Target Start/End: Original strand, 5338926 - 5339072
Alignment:
Q  62 tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgt 152  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||         ||| |||||    
T  5338926 tgattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaagattttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgctgt 5339024  T
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    || ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  5339025 tgttgtgatctgcttgtgctgttattgttatttaactatgatgcatga 5339072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Original strand, 18602766 - 18602833
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18602766 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatgagtatgaataagttgacgatg 18602833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 14954146 - 14954250
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  14954146 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 14954239  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  14954240 aagttgcatga 14954250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25689997 - 25689893
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  25689997 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 25689904  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  25689903 aagttgcatga 25689893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 220
Target Start/End: Original strand, 18609340 - 18609405
Alignment:
Q  155 atgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18609340 atgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatgagtatgaataagttgacgatg 18609405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9530542 - 9530438
Alignment:
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagt 212  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||      
T  9530542 tgatcaagaa-ttgttgagaatgatttattattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgtcatttaactaagttgcatttttatgaacaaac 9530446  T
Q  213 tgatgatg 220  Q
    ||||||||    
T  9530445 tgatgatg 9530438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12570246 - 12570158
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  12570246 cctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttg 12570158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25555550 - 25555506
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25555550 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 25555506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12570090 - 12570040
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12570090 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 12570040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 15353348 - 15353398
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15353348 tgttgctgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 15353398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 11250608 - 11250652
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11250608 tgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 11250652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15093853 - 15093801
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15093853 gctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatga 15093801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23843537 - 23843504
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23843537 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 23843504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 3765 - 3958
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3765 tgagacctatctgagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 3864  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3865 attgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 3958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 18549 - 18735
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaa 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  18549 aactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatttttgaatgatcaagaaattattgaaaa 18648  T
Q  134 tgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18649 tgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacctaagttgcatgagtctgaataagttgatgatg 18735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 6)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 65448 - 65611
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65448 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 65547  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65548 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 65611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 61532 - 61695
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  61532 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 61631  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61632 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 61695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 80928 - 80738
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  80928 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattatt 80829  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  80828 attgaatgatcaggaagatgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 80738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 80366 - 80300
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  80366 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 80300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12839 - 12789
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  12839 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatga 12789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 80530 - 80462
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  80530 tgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 80462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 173501 - 173295
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattga 111  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  173501 cctattaaagatattaactgagaactttgaagctattatgaaatgctaagtgattatattgtgatatattgattgattgcattacttgaattattattga 173402  T
Q  112 atgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 211  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  173401 atgataaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataag 173304  T
Q  212 ttgatgatg 220  Q
    |||||||||    
T  173303 ttgatgatg 173295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 422505 - 422622
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| |||||||| |||||||||||  ||||    
T  422505 gcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctaattatgctgctgctgtt 422603  T
Q  182 atttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||    
T  422604 atttaactaagttgcatga 422622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12638 - 12445
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12638 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 12539  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12538 attaaatgattgggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 12445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 2563 - 2775
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| ||| ||    
T  2563 tgagacctatttaagatattaactgagaattgtgaagcttttatgaactgctaagtgattatattgtgatatattgattgattggattacttgaattgtt 2662  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  2663 attgaatgatcaagaaattgttg-aaatgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactaagttgcatgagtctga 2761  T
Q  207 ataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||    
T  2762 ataagttgatgatg 2775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 15236670 - 15236863
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15236670 tgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattatt 15236769  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15236770 cttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 15236863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 23535479 - 23535690
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||    
T  23535479 tgagacctgtttaagatattaaatgagaactgtgaagcttctatgaaatgctaagtgattatac-gtgatttattgatagattgcattactttaattatt 23535577  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23535578 attgaatgatcaagaaattgttgaaa-tgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctga 23535676  T
Q  207 ataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||    
T  23535677 ataagttgatgatg 23535690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20296033 - 20295870
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20296033 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 20295934  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20295933 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 20295870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 19472640 - 19472803
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19472640 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttaaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 19472739  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19472740 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 19472803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17410601 - 17410452
Alignment:
Q  62 tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgat 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17410601 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtcgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgat 17410502  T
Q  162 ctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17410501 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 17410452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 20911101 - 20911272
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  20911101 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 20911199  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20911200 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 20911272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 21366560 - 21366755
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  21366560 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 21366659  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366660 aatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 21366755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42805638 - 42805423
Alignment:
Q  5 attgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggatt 103  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||| |||||||   ||| ||||| |||    
T  42805638 attgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattttatttacttgaatt 42805539  T
Q  104 attattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgatta 203  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |     
T  42805538 attattaaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaaccaagttgcatgagtc 42805441  T
Q  204 tgaa-taagttgatgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42805440 tgaattaagttgatgatg 42805423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18356132 - 18355961
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  18356132 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 18356034  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    || ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18356033 aaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 18355961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 26742634 - 26742849
Alignment:
Q  5 attgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggatt 103  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| | ||||| | ||| ||| | |||    
T  26742634 attgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatattaagtgattataaagtgaattatggtttgattgtatttactcgaatt 26742733  T
Q  104 attattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgatta 203  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |     
T  26742734 attattgaatgatcaaggaattgttgagaatgagttgttattaagcc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtc 26742831  T
Q  204 tgaa-taagttgatgatg 220  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26742832 tgaactaagttgatgatg 26742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18774420 - 18774206
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat-ttattgattgatggcatt-acttggatta 104  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||| || | |||||||||   ||||  |||| ||||||| | ||| ||||| ||||    
T  18774420 tgagacctattaaagatattacctgagaactgtgaagcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattgattgtatttacttgaatta 18774321  T
Q  105 ttattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattat 204  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | |    
T  18774320 ttgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtct 18774223  T
Q  205 gaa-taagttgatgatg 220  Q
    ||| |||||||||||||    
T  18774222 gaattaagttgatgatg 18774206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 21885166 - 21885291
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21885166 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 21885263  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21885264 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 21885291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18784175 - 18784049
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  18784175 ttacttgaattattgttgaatgataaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatg 18784078  T
Q  193 ttgcatgattatgaa-taagttgatgatg 220  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||    
T  18784077 ttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 18784049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 198
Target Start/End: Original strand, 24767493 - 24767634
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||     || ||||    
T  24767493 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactattga 24767591  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24767592 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 24767634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20232761 - 20232554
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattg 110  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| || || ||||| |||||| |||    
T  20232761 cctatttaagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcctttacttgaattattgttg 20232662  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg-aata 209  Q
    | ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||    
T  20232661 attgatcaataa-ttgttgagaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcataagtctgaaata 20232565  T
Q  210 agttgatgatg 220  Q
    |||||||||||    
T  20232564 agttgatgatg 20232554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16674281 - 16674156
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16674281 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 16674184  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  16674183 ttgcatgtttaagaataagctgatgatg 16674156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33409357 - 33409232
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33409357 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 33409260  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33409259 ttgcatgtctatgaataagctgatgatg 33409232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 24532965 - 24533150
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattga-tggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| || ||||||||||||   |||| |||| |||||| || | ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  24532965 aactgtgaagcctttatgatatactaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 24533063  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg-aataagttgatgatg 220  Q
    |||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  24533064 atgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 24533150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 26666048 - 26666233
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  26666048 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 26666146  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg-aataagttgatgatg 220  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  26666147 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 26666233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 26937645 - 26937830
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  26937645 aactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgaga 26937743  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg-aataagttgatgatg 220  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  26937744 atgatttgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaaataagttgatgatg 26937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26172536 - 26172468
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26172536 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgaatgattatgattaagttgatgatg 26172468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4036290 - 4036223
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4036290 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 4036223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Original strand, 25229441 - 25229508
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25229441 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 25229508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Original strand, 25293597 - 25293664
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25293597 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 25293664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 218
Target Start/End: Original strand, 17718416 - 17718538
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||| | |   ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  17718416 ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatctgttattgaaca--tgatgtgatttgattatgcggcaaatgttatttaactaag 17718513  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17718514 ttgcatg-ttatgaataagctgatga 17718538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 200
Target Start/End: Original strand, 40723607 - 40723670
Alignment:
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40723607 attgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 40723670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10753015 - 10752949
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10753015 ttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 10752949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18356543 - 18356474
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18356543 tgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 18356474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20805772 - 20805578
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-tagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||| |||||||| |||  || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | | ||||||    
T  20805772 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttattggtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatgttattg 20805674  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |         ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20805673 aatgatctagatgttgttgaa--tgaattgatattatgaaattattttgttcttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 20805578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Original strand, 21340764 - 21340869
Alignment:
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg-aataag 211  Q
    |||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  21340764 tgatcaagaa-ttgtttagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtctgaaataag 21340860  T
Q  212 ttgatgatg 220  Q
    |||||||||    
T  21340861 ttgatgatg 21340869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23451573 - 23451374
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||| |||||||| | || ||  ||||||||  |||| |  |||||||||| | |||    
T  23451573 tgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaaagtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatat 23451475  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 198  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23451474 tattgaatgattatgatgttgttgaaaa-gaattgatgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcat 23451376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10753491 - 10753387
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  10753491 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 10753398  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  10753397 aagttgcatga 10753387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 20910690 - 20910759
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| |||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20910690 tgagacctatttaagatgttatctgaggactgtgaagctattgtgaaatgctaagtgattataatgtgat 20910759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26680652 - 26680608
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26680652 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 26680608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26952259 - 26952215
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26952259 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 26952215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 123346 - 123396
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  123346 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 123396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 1859017 - 1859067
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1859017 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 1859067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20767135 - 20767000
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatc 162  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||| | | ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |         ||||| ||||||     
T  20767135 tgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatgttattgaatgatctagatgttgttgaa--tgaattgatattatgaacttatgttgttgttgtgatt 20767038  T
Q  163 tgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 20767000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22757348 - 22757219
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||| |||||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  22757348 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattattg 22757249  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  22757248 aataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 22757219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 12028612 - 12028656
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12028612 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 12028656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 17517240 - 17517292
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17517240 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 17517292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 17919198 - 17919242
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17919198 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 17919242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31342217 - 31342173
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31342217 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 31342173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23458817 - 23458618
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||| |||||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| | |||    
T  23458817 tgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatat 23458719  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 198  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  23458718 tattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcat 23458620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23463078 - 23462879
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||| |||||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| | |||    
T  23463078 tgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatat 23462980  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 198  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  23462979 tattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcat 23462881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24221953 - 24221903
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  24221953 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaggttgcatga 24221903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10753204 - 10753111
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10753204 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 10753111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23201436 - 23201386
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23201436 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 23201386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23512174 - 23512124
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23512174 tgttgatgcgatctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatga 23512124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23572160 - 23572110
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23572160 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatga 23572110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14079208 - 14079175
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14079208 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 14079175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21873313 - 21873280
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21873313 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 21873280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22757195 - 22757151
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22757195 tgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttacatga 22757151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 198
Target Start/End: Original strand, 13377 - 13568
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  13377 tgagacctatttaagatattaactgataactgtgtagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactttaattatt 13476  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  13477 attgaatgatcaagaagttgttgaagatcgattgatattaagttgttgatgtgatctgattattctgttattgttaattaactgagttgcat 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 228263 - 228475
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  228263 tgagacctacttaagatattaactgagaactgtgaagtttttatgaaatgctaagtgattatatagtgatttattgattgattgcatttacttgaattat 228362  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  228363 tattgaatgatcaagaaatagttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctg 228460  T
Q  206 aataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||    
T  228461 aataagttgatgatg 228475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 5021 - 5184
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5021 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 5120  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5121 attgatattaagttgttgatatgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 5184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43251999 - 43251836
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  43251999 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatga 43251900  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43251899 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 43251836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 19278203 - 19278366
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19278203 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 19278302  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19278303 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 19278366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 21972505 - 21972668
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21972505 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 21972604  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21972605 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 21972668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 21976590 - 21976753
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21976590 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 21976689  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21976690 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 21976753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 16231365 - 16231578
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16231365 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattat 16231464  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16231465 tattgaatgatcaagaatttgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctg 16231562  T
Q  206 aa-taagttgatgatg 220  Q
    || |||||||||||||    
T  16231563 aattaagttgatgatg 16231578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22112037 - 22111904
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22112037 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 22111938  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 170  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22111937 attggtattaagctgttgatataatctgattatg 22111904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22045100 - 22044887
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22045100 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattat 22045001  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  22045000 tatggaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatcaaactaagttgcatgagtctg 22044903  T
Q  206 aa-taagttgatgatg 220  Q
    || |||||||| ||||    
T  22044902 aattaagttgacgatg 22044887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 20465933 - 20466129
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  20465933 cctatataagaggttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 20466032  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466033 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatga 20466129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 30643185 - 30643382
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaa-gctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattatt 109  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| ||| || ||||| ||||||| | ||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||    
T  30643185 cctatttaagatgttaactgcaatctgtgaaagctgttacgaactgttaagttgattataatatgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 30643284  T
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643285 gaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 30643382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 14398039 - 14398210
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  14398039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagttgttgttgaaa-tgaattgttatt 14398137  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||| |  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14398138 aagcttt--atgcgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatg 14398210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21387184 - 21387077
Alignment:
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaata 209  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21387184 gaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaata 21387088  T
Q  210 agttgatgatg 220  Q
    |||||||||||    
T  21387087 agttgatgatg 21387077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21383768 - 21383657
Alignment:
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21383768 tattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatg 21383672  T
Q  206 aataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||    
T  21383671 aataagttgatgatg 21383657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 30308644 - 30308855
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||   |||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  30308644 tgagacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtattacttgaattatt 30308743  T
Q  107 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatga 206  Q
     ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||     ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  30308744 gttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaa--atctgatgggatttgattatgttgcaattgttattaaactaatttgcatgagtatga 30308841  T
Q  207 ataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||    
T  30308842 ataagttgatgatg 30308855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 15602911 - 15603107
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattatt 109  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || ||||| ||||||||  | | || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||||||    
T  15602911 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactgctaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 15603009  T
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15603010 gaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaatcgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 15603107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32605339 - 32605214
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32605339 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaag 32605242  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32605241 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 32605214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 23846992 - 23847117
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 191  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23846992 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaatctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaa 23847088  T
Q  192 gttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23847089 gttgcatgtttatgaataagctgatgatg 23847117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 15611363 - 15611559
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattatt 109  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || ||||| | ||||||  | | || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||||||    
T  15611363 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactactaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 15611461  T
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  15611462 gaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctggttttgttatttaaccaagttgcatga 15611559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 151 - 220
Target Start/End: Original strand, 17055412 - 17055481
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17055412 gttgatgttatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 17055481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15532018 - 15531893
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15532018 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 15531921  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  15531920 ttgcatgtctatgtataagctgatgatg 15531893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 17926601 - 17926796
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || |||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  17926601 cctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 17926699  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17926700 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatga 17926796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18619694 - 18619555
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatgg-cattacttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||    
T  18619694 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgtctttacttgaattat 18619595  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  18619594 tattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattganatt 18619555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32598750 - 32598682
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32598750 ttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 32598682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15538577 - 15538452
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15538577 ttacttgagttattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 15538480  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  15538479 ttgcatgtctatgtataagctgatgatg 15538452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22028746 - 22028647
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22028746 aactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa 22028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 200
Target Start/End: Original strand, 16410208 - 16410344
Alignment:
Q  71 tgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatc 162  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |        |||||| |||||||    
T  16410208 tgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatc 16410306  T
Q  163 tgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16410307 tgcctatgctgctattgttatttcactaagttgcatga 16410344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 220
Target Start/End: Original strand, 17828567 - 17828684
Alignment:
Q  100 gattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 199  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  17828567 gattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttaattaactaagttgcatg 17828663  T
Q  200 attatgaataagttgatgatg 220  Q
      |||| ||||| ||||||||    
T  17828664 tctatgtataagctgatgatg 17828684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 20856319 - 20856515
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||  | ||||||| || ||||||| ||||||| || || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||| |||    
T  20856319 cctattaaagatgttagctgagatctgtgaacctgttatgaattgctaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaattattcttg 20856418  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| | | ||| |||||||||||||||||| | ||| |         | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20856419 aataacctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatattgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatga 20856515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 18862624 - 18862728
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  18862624 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 18862717  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  18862718 aagttgcatga 18862728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 21827993 - 21828097
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  21827993 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 21828086  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  21828087 aagttgcatga 21828097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 18678141 - 18678193
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678141 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32121814 - 32121762
Alignment:
Q  148 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121814 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21411077 - 21410973
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  21411077 gcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 21410984  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  21410983 aagttgcatga 21410973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21805569 - 21805465
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  21805569 gcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 21805476  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  21805475 aagttgcatga 21805465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 39094965 - 39095015
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39094965 tgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 39095015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Original strand, 22010716 - 22010765
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22010716 gttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 22010765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 377503 - 377415
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  377503 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgatcataatgtgatttaatgattaattgcattacttg 377415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 200
Target Start/End: Original strand, 23776821 - 23776926
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 194  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||        ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23776821 tattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagtt 23776920  T
Q  195 gcatga 200  Q
    ||||||    
T  23776921 gcatga 23776926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24755946 - 24755858
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  24755946 cctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttg 24755858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Original strand, 24445541 - 24445608
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  24445541 tgatgtgatttgattatgctgtaaatgttatttaactaagttgcatgtctatgtataagctgatgatg 24445608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 377347 - 377297
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  377347 tgttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatga 377297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 16861365 - 16861415
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  16861365 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccgagttgcatga 16861415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24755790 - 24755740
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24755790 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 24755740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 19259483 - 19259564
Alignment:
Q  19 aagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  19259483 aagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttg 19259564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 17353984 - 17354034
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17353984 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 17354034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 19259632 - 19259682
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19259632 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatga 19259682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 21162099 - 21162149
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21162099 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatga 21162149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 21168772 - 21168822
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21168772 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatga 21168822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19983152 - 19983119
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19983152 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 19983119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16184796 - 16184744
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgatt 202  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  16184796 tgttgttgtgatatgcttatgctgctattgttgtttaaccaacttgcatgatt 16184744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 19907 - 20119
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19907 tgagacctattaaagatattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatttacttgaattat 20006  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  20007 tattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatctgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatgaatctg 20104  T
Q  206 aataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||    
T  20105 aataagttgatgatg 20119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 58639 - 58802
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  58639 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 58738  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  58739 attggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 58802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Original strand, 35863 - 36025
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  35863 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttg-aaatta 35961  T
Q  137 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35962 attgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 36025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7155 - 6948
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattg 110  Q
    |||||| ||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||   |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| |||    
T  7155 cctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttg 7056  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 210  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||    
T  7055 aatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagcatgaataa 6958  T
Q  211 gttgatgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  6957 gttgatgatg 6948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Original strand, 11336 - 11404
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11336 ttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatgattatgaataagttgatgatg 11404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Original strand, 38853 - 38921
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| || |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38853 ttgatgtcatttgataatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatgattatgaataagttgatgatg 38921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 9555 - 9768
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattat 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  9555 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgattataatgtgatttattgattgatcgcatttacttgaattat 9654  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattat 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |    
T  9655 tattgaatgatcaagaaattgttattaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattacgctgcaattgttaattaactatgttgcatgagtct 9752  T
Q  205 gaataagttgatgatg 220  Q
     |||||||||||||||    
T  9753 aaataagttgatgatg 9768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4657 - 4456
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| | |||    
T  4657 tgagacctatataagaagttaactgtaaactgtgaaactattatgaaatgctaagttgattataatgtgatttattgattaattgcattacttgaaatat 4558  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 197  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4557 tatcgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgttatttaactaagttgca 4459  T
Q  198 tga 200  Q
    |||    
T  4458 tga 4456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 578 - 473
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  578 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgctattgttatttaact 485  T
Q  190 -aagttgcatga 200  Q
     |||||||||||    
T  484 aaagttgcatga 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 3447 - 3633
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3447 aactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatatagagtgaattatggattgattgcatttacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttgaaa 3546  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaa-taagttgatgatg 220  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  3547 atgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatactgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaattaagttgatgatg 3633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 382 - 185
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||| ||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||| | || |||||||||| | ||||||||    
T  382 cctaattaagatgttaacggaaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgactaattgcattacttgaaatattattg 283  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  282 aatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6399
Alignment:
Q  13 ctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattga 111  Q
    ||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| | ||| || |||||||||| | |||||||||    
T  6204 ctatttaggatgttaaatgcaatctgtgaagctattatgaaatgttaagttgtttatattgtgatttaattattaattgcattacttgaaatattattga 6303  T
Q  112 atgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304 atgatcaagaagttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 6399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Original strand, 18277 - 18461
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||  |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18277 aactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaaaataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaa 18376  T
Q  133 atgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaa-taagttgatga 218  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  18377 atgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaattaagttgatga 18461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 10474 - 10589
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattatt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10474 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 10573  T
Q  107 attgaatgatcaagaa 122  Q
    ||||||||||||||||    
T  10574 attgaatgatcaagaa 10589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 69871 - 69820
Alignment:
Q  149 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  69871 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 69820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5612
Alignment:
Q  17 ttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatga 115  Q
    |||||||||||||||  | || ||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||| | ||| | || ||||||||||   |||||||||||||    
T  5803 ttaagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcattacttgagatattattgaatga 5704  T
Q  116 tcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||       || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5703 tcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatga 5612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6998 - 6807
Alignment:
Q  17 ttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatga 115  Q
    |||||||||||||||  | || ||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||| | ||| | || ||||||||||   |||||||||||||    
T  6998 ttaagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcattacttgagatattattgaatga 6899  T
Q  116 tcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||       || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6898 tcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatga 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 615 - 419
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  615 cctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 516  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  515 aatgatcaagatgtcgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42844 - 42653
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| ||||| || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  42844 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaactgttaagctgattctaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 42745  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| ||||    |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42744 aatgatcaagatgttg----aaatgaattgatattatgaagttaatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 42653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1715 - 1520
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  1715 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 1616  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1615 aatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataaagttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 1520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 200
Target Start/End: Original strand, 17056 - 17202
Alignment:
Q  62 tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgtt 153  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||    
T  17056 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgttcaagatgttgttggaaatgaattgatattatgaagttatgctgtt 17155  T
Q  154 gatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17156 gatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatga 17202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31059 - 30890
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  31059 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 30961  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30960 aagct--tgatgagatttgattatgctgtaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatga 30890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 24858 - 25072
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24858 tgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattat 24957  T
Q  106 tattgaatgatcaa-gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattat 204  Q
    |||||||||||||| | | || |||||||||  ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | |    
T  24958 tattgaatgatcaaaggaattattgaaaatgtgttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactgagttgcatgagtct 25055  T
Q  205 gaa-taagttgatgatg 220  Q
    ||| |||||||||||||    
T  25056 gaattaagttgatgatg 25072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 189356 - 189460
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  189356 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 189449  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  189450 aagttgcatga 189460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15302 - 15113
Alignment:
Q  18 taagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgat 116  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  15302 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttataaaaagttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgat 15203  T
Q  117 caagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt-------tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||       || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15202 caagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgtgttgtgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 15113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 46621 - 46817
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  46621 cctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattg 46720  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||        ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46721 aatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaagttatgctattgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgtaactaagttgcatga 46817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6855 - 6684
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  6855 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatagaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 6757  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6756 aagct--tgatgagatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttcatgatg 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 20395 - 20566
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||  | | ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  20395 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacacgaaatattattgaataatcaagatgttgatgaaa-tgaattgttatt 20493  T
Q  146 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20494 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 20566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 207768 - 207951
Alignment:
Q  47 ttatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatat 144  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  207768 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatat 207867  T
Q  145 taag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    || |        |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  207868 tatgaagttatactgttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataagttgatgatg 207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 18545 - 18746
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||| | |||    
T  18545 tgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatggtatgttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatat 18644  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |        |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18645 tattgaatgatcaagatgttgttg-aaacgaattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgca 18743  T
Q  198 tga 200  Q
    |||    
T  18744 tga 18746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 6152 - 6359
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattg 110  Q
    |||||| ||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||   |||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||| |||    
T  6152 cctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttg 6251  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataa 210  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||    
T  6252 aatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagcatgaataa 6349  T
Q  211 gttgatgatg 220  Q
    ||||||||||    
T  6350 gttgatgatg 6359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1971 - 1903
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1971 ttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatgattatgaataagttgatgatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9733 - 9539
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  9733 cctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 9635  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9634 aatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgagttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaactaagttgcatga 9539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2051 - 1856
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  2051 cctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattg 1953  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1952 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaactaagttgcatga 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 77148 - 77273
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  77148 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 77245  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  77246 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 77273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 118 - 1
Alignment:
Q  34 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcatt-acttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  118 aactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaga 19  T
Q  133 atgaattgatattaagct 150  Q
    |||||||| |||||||||    
T  18 atgaattgttattaagct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 1384 - 1580
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||| |||  || | || |||||||||| | ||||||||    
T  1384 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgacttaacgaataattgcattacttgaaatattattg 1483  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1484 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttggttatttaactaagttgcatga 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9406 - 9338
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9406 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 198
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10131
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||     || ||||    
T  9990 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactattga 10088  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10089 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 10131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10032 - 9907
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10032 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 9935  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  9934 ttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 9907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 63982 - 63858
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  63982 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaag 63885  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  63884 ttgcatg-ttatgaataagctgatgatg 63858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 75866 - 75742
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  75866 ttacttgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaacc--tgttgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaag 75769  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  75768 ttgcatg-ttatgaataagctgatgatg 75742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 34804 - 34892
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  34804 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttg 34892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 34960 - 35010
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34960 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 35010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1880
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2005 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgtgatttaactaag 1908  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 1880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 30634 - 30833
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||| ||| | || |||| | |||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||    
T  30634 tgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtaaagttgtt-tgaacttctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatat 30732  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 198  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| | ||| |        ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30733 tattgaatgataaagatgtagttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatccgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcat 30831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 123
Target Start/End: Original strand, 928 - 1014
Alignment:
Q  37 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaag 123  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  928 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaag 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8503
Alignment:
Q  108 ttgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaa 207  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8613 ttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaa 8516  T
Q  208 taagttgatgatg 220  Q
    |||||||||||||    
T  8515 taagttgatgatg 8503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15757 - 15647
Alignment:
Q  108 ttgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaa 207  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15757 ttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaa 15660  T
Q  208 taagttgatgatg 220  Q
    |||||||||||||    
T  15659 taagttgatgatg 15647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 2933
Alignment:
Q  64 attatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 155  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||   || |     |||||    
T  3074 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatt-aattgatattataaagttatattgttga 2976  T
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2975 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 2933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15409 - 15341
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15409 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcataattatgaataagttgatgatg 15341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18483 - 18358
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  18483 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgtttatgctgcaaatgttatttaactaag 18386  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  18385 ttgcatgtgtatgaataagctgatgatg 18358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6102
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5977 ttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaag 6074  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6075 ttgcatgagtatgaataagttgatgatg 6102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 372
Alignment:
Q  153 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  439 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaattaagttgcatgattatgaataagttgatgatg 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 21463 - 21597
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||||  |||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| | ||||||||    
T  21463 cctatttaagatgttaactgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgtattacttgaaatattattg 21562  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 146  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21563 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 218
Target Start/End: Original strand, 80810 - 80876
Alignment:
Q  152 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagttgatga 218  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  80810 ttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagtatgaataagttgatga 80876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 200
Target Start/End: Original strand, 73725 - 73857
Alignment:
Q  74 gatttattgattgatggcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgat 166  Q
    |||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |        ||||| |||||||||||    
T  73725 gatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaa-tgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgat 73823  T
Q  167 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73824 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 73857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 71180 - 71072
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgatt 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||       |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  71180 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct-------tgat-tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 71090  T
Q  203 atgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  71089 atgaatatgttgatgatg 71072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 139819 - 139715
Alignment:
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagt 212  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  139819 tgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttgttaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgtttatgaataaac 139723  T
Q  213 tgatgatg 220  Q
    ||||||||    
T  139722 tgatgatg 139715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 71529 - 71460
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  71529 tgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 71460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 199
Target Start/End: Original strand, 414091 - 414140
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  414091 tgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatg 414140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 1978 - 2175
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattatt 109  Q
    |||||||||||| |||||||  |  ||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||| ||||| ||||| |  |||||||||| | | | |||    
T  1978 cctatttaagatattaactgaaatatgtgaagctgttatgaaaatgctaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcattacttgaaatttcatt 2077  T
Q  110 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2078 gaatgatcaagatgttgttgaaa-tggattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 2175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 217
Target Start/End: Original strand, 16640 - 16762
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| |   |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16640 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 16737  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatg 217  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16738 tcgcatgattatgaataagttgatg 16762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1118 - 923
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||  |||||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| | ||||||||    
T  1118 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgacctgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattg 1020  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |        |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1019 aatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattgaactaagttgcatga 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9549 - 9424
Alignment:
Q  93 ttacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || | |||| | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  9549 ttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgttatgatttaattatactgcaaatgttatttaactaag 9452  T
Q  193 ttgcatgattatgaataagttgatgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9451 ttgcatgtttatgaataagctgatgatg 9424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 44302 - 44107
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || | || |||||||| | || || ||||||||| ||||| |  |||||||||  | ||||||||    
T  44302 cctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttaaaatattattg 44204  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |        |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203 aattatcaagatgttgtggaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 44107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23432 - 23219
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgatttattgattgatggca-ttacttggattat 105  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||   |||| |||| ||||||| | | ||||||| |||||    
T  23432 tgagacctattcaagatattgactgagaactatgaagcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattat 23333  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatg 205  Q
    | |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||| | ||    
T  23332 tgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattaagctgcaattattattaaactatgtttcatgagtctg 23235  T
Q  206 aa-taagttgatgatg 220  Q
    || || ||||||||||    
T  23234 aattacgttgatgatg 23219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Original strand, 19181 - 19317
Alignment:
Q  7 tgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattat 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |  |||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||   |||    
T  19181 tgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatat 19280  T
Q  106 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata 143  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19281 tattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 19317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 6310 - 6505
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||| || |||| |||||| | | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||    
T  6310 cctatttaagatgttaactgaaatatgtgaagctgtt-tgaactgctaacttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattg 6408  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6409 aatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 6505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36414 - 36310
Alignment:
Q  113 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgattatgaataagt 212  Q
    |||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  36414 tgatcaagaa-ttgttaagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaattaagttgcatgtttatgaataaac 36318  T
Q  213 tgatgatg 220  Q
    ||||||||    
T  36317 tgatgatg 36310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 19626 - 19823
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||  | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| |||    
T  19626 cctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactgggtttattcttg 19725  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19726 aataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 19823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 15104 - 15301
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||  | || || ||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| |||    
T  15104 cctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactgggtttattcttg 15203  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15204 aataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgatgcttttgttatttaactaagttgcatga 15301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 365 - 315
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  365 tgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 11480 - 11584
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  11480 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 11573  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  11574 aagttgcatga 11584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Original strand, 14066 - 14170
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 189  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||| || ||||    
T  14066 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 14159  T
Q  190 aagttgcatga 200  Q
    |||||||||||    
T  14160 aagttgcatga 14170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7614 - 7497
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  7614 gcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgctgctgctgtt 7516  T
Q  182 atttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7515 atttaactaagttgcatga 7497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 35405 - 35602
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |  |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| |||    
T  35405 cctatttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttg 35504  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35505 aataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 35602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 200
Target Start/End: Original strand, 4790 - 4895
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 194  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||        |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4790 tattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagtt 4889  T
Q  195 gcatga 200  Q
    ||||||    
T  4890 gcatga 4895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 200
Target Start/End: Original strand, 38465 - 38570
Alignment:
Q  103 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 194  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||         ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38465 tattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagtt 38564  T
Q  195 gcatga 200  Q
    ||||||    
T  38565 gcatga 38570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8783 - 8586
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || || |||||||||  |||| |  |||||||||| |||||| |||    
T  8783 cctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttg 8684  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8683 aataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 8586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 6972 - 7060
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||    
T  6972 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgagatttaatgattaattgcattacttg 7060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Original strand, 15317 - 15376
Alignment:
Q  17 ttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattatagtgtgat 76  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15317 ttaaaatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgataagtgattataatgtgat 15376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1868 - 1818
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1868 tgttgttgtggtctgattatgctgcctttgttatttaactaagttgcatga 1818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6171 - 6121
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6171 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 2477 - 2527
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2477 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatga 2527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 10337 - 10387
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  10337 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatga 10387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 7311 - 7361
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7311 tgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 7361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 16389 - 16439
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16389 tgttgttgtgatatgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 14127 - 14177
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14127 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 14177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 13971 - 14059
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttg 99  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  13971 cctatataggatgttaactgaaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgaattacttg 14059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2907 - 2858
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2907 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatga 2858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6573 - 6524
Alignment:
Q  151 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6573 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatga 6524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2238 - 2194
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2238 tgtgatttgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 2194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 4273 - 4317
Alignment:
Q  156 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4273 tgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Original strand, 4119 - 4245
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||||||| || |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| |||    
T  4119 cctatttaagatgttaactgagatatgtgaatctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttg 4218  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaa 137  Q
    ||| | |  ||||||||||||||||||    
T  4219 aataaccttgaagttgttgaaaatgaa 4245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 524 - 439
Alignment:
Q  90 gcattacttggattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 181  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  524 gcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgtt 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 21844 - 21894
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21844 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 21894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 29736 - 29786
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29736 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 29786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 199
Target Start/End: Original strand, 48500 - 48550
Alignment:
Q  149 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 199  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  48500 ctgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatg 48550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14740 - 14690
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14740 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatga 14690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23755 - 23705
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23755 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatga 23705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39179 - 39129
Alignment:
Q  150 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39179 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatga 39129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 200
Target Start/End: Original strand, 15737 - 15770
Alignment:
Q  167 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15737 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Original strand, 192211 - 192340
Alignment:
Q  12 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattatagtgtgatttattgattgatggcattacttggattattattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||| |  |||| || || || ||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| |||    
T  192211 cctatttaagatgttaactgagatctgtgaagttgttatgaatttttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttg 192310  T
Q  111 aatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 140  Q
    ||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  192311 aattaccttgatgttgttgaaaatgaattg 192340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University