View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4149_low_1 (Length: 540)

Name: NF4149_low_1
Description: NF4149
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4149_low_1
NF4149_low_1
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (228-533)||(2566965-2567270)
chr3 (227-533)||(21006059-21006365)
chr3 (227-533)||(52684443-52684749)
chr3 (320-533)||(19878799-19879011)
chr3 (320-533)||(47642215-47642428)
chr3 (320-533)||(7899415-7899627)
chr3 (320-533)||(20509852-20510065)
chr3 (320-532)||(45056998-45057210)
chr3 (320-535)||(25700970-25701187)
chr3 (320-525)||(28968720-28968925)
chr3 (320-533)||(13352891-13353104)
chr3 (229-526)||(25936256-25936560)
chr3 (229-526)||(48123460-48123765)
chr3 (229-526)||(45532241-45532544)
chr3 (320-515)||(19421625-19421826)
chr3 (373-526)||(22311105-22311269)
chr3 (375-531)||(29916034-29916191)
chr3 (375-531)||(29965187-29965344)
chr3 (320-533)||(38888793-38888995)
chr3 (229-525)||(52505002-52505305)
chr3 (320-439)||(30787351-30787470)
chr3 (229-515)||(1678869-1679163)
chr3 (341-526)||(22610455-22610650)
chr3 (373-526)||(28882258-28882422)
chr3 (387-533)||(48333216-48333362)
chr3 (320-533)||(212715-212916)
chr3 (320-533)||(983395-983592)
chr3 (373-526)||(35390125-35390286)
chr3 (375-533)||(22289440-22289597)
chr3 (404-526)||(25322220-25322342)
chr3 (387-533)||(28548300-28548446)
chr3 (387-533)||(48334159-48334305)
chr3 (373-526)||(50286925-50287089)
chr3 (435-526)||(42464318-42464409)
chr3 (375-533)||(19349317-19349480)
chr3 (320-426)||(21157531-21157638)
chr3 (375-533)||(2122951-2123109)
chr3 (229-312)||(10224550-10224633)
chr3 (373-526)||(52121537-52121703)
chr3 (445-526)||(10224337-10224418)
chr3 (453-533)||(21157456-21157536)
chr3 (458-533)||(13748216-13748291)
chr3 (404-531)||(47750631-47750758)
chr3 (351-515)||(28705493-28705670)
chr3 (448-526)||(33241195-33241273)
chr3 (447-515)||(1528891-1528959)
chr3 (465-533)||(30787282-30787350)
chr3 (229-312)||(28705373-28705456)
chr3 (341-442)||(37996565-37996665)
chr3 (466-533)||(45347907-45347974)
chr3 (341-442)||(7327968-7328068)
chr3 (375-526)||(39664657-39664811)
chr3 (320-391)||(55268854-55268925)
chr3 (483-533)||(41741863-41741913)
chr3 (320-385)||(6134226-6134291)
chr3 (375-439)||(42229906-42229970)
chr3 (115-164)||(52684323-52684372)
chr3 (366-417)||(1528802-1528853)
chr3 (115-164)||(2567345-2567394)
chr3 (318-371)||(28548251-28548304)
chr3 (447-515)||(7328086-7328145)
chr3 (447-515)||(37996487-37996547)
chr3 (320-354)||(2122918-2122952)
chr3 (115-148)||(22611347-22611380)
chr3 (111-144)||(37996778-37996811)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (227-533)||(45158872-45159178)
chr2 (323-533)||(31235882-31236092)
chr2 (320-531)||(34146389-34146600)
chr2 (320-525)||(35342527-35342731)
chr2 (375-533)||(14824381-14824539)
chr2 (320-533)||(3545277-3545489)
chr2 (229-525)||(22484903-22485207)
chr2 (375-533)||(1005754-1005912)
chr2 (229-526)||(4169700-4170004)
chr2 (375-533)||(4562031-4562189)
chr2 (229-526)||(40308015-40308320)
chr2 (376-533)||(4355555-4355712)
chr2 (375-526)||(24585777-24585929)
chr2 (229-526)||(6124801-6125112)
chr2 (320-522)||(2319484-2319685)
chr2 (229-526)||(6496851-6497154)
chr2 (375-533)||(40431740-40431897)
chr2 (373-526)||(18301357-18301514)
chr2 (374-533)||(28746378-28746538)
chr2 (375-521)||(8482647-8482793)
chr2 (320-533)||(10573703-10573905)
chr2 (373-526)||(5371337-5371501)
chr2 (375-533)||(5588280-5588438)
chr2 (373-526)||(12819577-12819741)
chr2 (375-533)||(44156840-44156997)
chr2 (416-533)||(35996814-35996931)
chr2 (414-531)||(40536498-40536615)
chr2 (410-533)||(12206264-12206387)
chr2 (399-533)||(3564106-3564239)
chr2 (387-526)||(20537115-20537267)
chr2 (320-533)||(21104691-21104894)
chr2 (341-515)||(7807045-7807231)
chr2 (404-499)||(9293655-9293750)
chr2 (115-164)||(45159256-45159305)
chr2 (483-531)||(14216955-14217003)
chr2 (320-371)||(9293314-9293365)
chr2 (320-354)||(44156807-44156841)
chr2 (375-439)||(1776249-1776312)
chr2 (320-352)||(4355521-4355553)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (228-533)||(24784489-24784794)
chr4 (234-533)||(52721477-52721776)
chr4 (227-526)||(39957804-39958103)
chr4 (318-533)||(24823472-24823687)
chr4 (320-533)||(24793427-24793640)
chr4 (320-531)||(3109003-3109214)
chr4 (320-533)||(17892457-17892670)
chr4 (320-525)||(36943878-36944083)
chr4 (320-526)||(44521749-44521955)
chr4 (320-533)||(55900844-55901057)
chr4 (17-164)||(24784263-24784410)
chr4 (320-533)||(42630174-42630393)
chr4 (375-533)||(31945945-31946102)
chr4 (229-526)||(52572826-52573126)
chr4 (320-526)||(49470489-49470691)
chr4 (229-525)||(14795643-14795947)
chr4 (229-526)||(41146241-41146544)
chr4 (387-533)||(47607355-47607501)
chr4 (229-501)||(53322976-53323255)
chr4 (375-533)||(1177219-1177378)
chr4 (380-533)||(51859042-51859195)
chr4 (373-526)||(5835205-5835369)
chr4 (373-526)||(28377272-28377438)
chr4 (229-515)||(8063282-8063579)
chr4 (229-515)||(3402762-3403056)
chr4 (387-533)||(2586592-2586737)
chr4 (375-533)||(40694312-40694470)
chr4 (380-524)||(258796-258941)
chr4 (404-531)||(30683380-30683507)
chr4 (229-515)||(31226974-31227270)
chr4 (375-533)||(51675031-51675188)
chr4 (375-523)||(36511658-36511809)
chr4 (397-526)||(43509615-43509755)
chr4 (435-525)||(5325197-5325287)
chr4 (320-490)||(46431685-46431842)
chr4 (408-531)||(7952831-7952954)
chr4 (398-492)||(37992293-37992387)
chr4 (341-515)||(38491965-38492136)
chr4 (375-533)||(14614746-14614897)
chr4 (321-418)||(722441-722538)
chr4 (111-164)||(39957682-39957735)
chr4 (321-406)||(754380-754465)
chr4 (320-371)||(2586545-2586596)
chr4 (17-64)||(32824473-32824520)
chr4 (327-369)||(37992394-37992436)
chr4 (229-289)||(52122361-52122421)
chr4 (320-354)||(14614713-14614747)
chr4 (320-354)||(51859004-51859038)
chr4 (111-144)||(8064076-8064109)
chr4 (111-144)||(19738815-19738848)
chr4 (115-148)||(52572310-52572343)
chr4 (111-148)||(53322455-53322492)
chr4 (111-147)||(52122833-52122869)
chr4 (111-155)||(52721382-52721426)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (227-533)||(40412659-40412965)
chr8 (227-524)||(8170811-8171108)
chr8 (322-533)||(27108891-27109102)
chr8 (320-526)||(7411811-7412017)
chr8 (354-533)||(27968338-27968514)
chr8 (229-526)||(28875744-28876049)
chr8 (375-533)||(3892206-3892364)
chr8 (229-525)||(45216400-45216704)
chr8 (366-533)||(20182622-20182789)
chr8 (354-533)||(27886423-27886599)
chr8 (354-533)||(27945081-27945257)
chr8 (354-533)||(28025324-28025500)
chr8 (229-526)||(5540056-5540361)
chr8 (341-526)||(32638393-32638589)
chr8 (373-526)||(32877830-32877996)
chr8 (229-526)||(36484059-36484362)
chr8 (229-515)||(4246563-4246857)
chr8 (373-526)||(6028865-6029031)
chr8 (373-526)||(19436627-19436791)
chr8 (373-526)||(19572776-19572940)
chr8 (229-526)||(37669204-37669507)
chr8 (375-533)||(37372502-37372652)
chr8 (341-533)||(41098663-41098855)
chr8 (341-526)||(32760098-32760293)
chr8 (320-500)||(38388876-38389054)
chr8 (229-526)||(12579708-12580019)
chr8 (229-515)||(34900556-34900853)
chr8 (373-526)||(25022529-25022693)
chr8 (320-510)||(32425130-32425316)
chr8 (393-533)||(28737780-28737920)
chr8 (373-526)||(42949444-42949608)
chr8 (375-531)||(5818051-5818207)
chr8 (435-526)||(43770883-43770974)
chr8 (387-533)||(32856-33005)
chr8 (373-526)||(19947554-19947718)
chr8 (229-312)||(43771115-43771198)
chr8 (341-515)||(22201008-22201194)
chr8 (358-460)||(29355865-29355967)
chr8 (115-164)||(8171186-8171235)
chr8 (111-148)||(32759491-32759528)
chr8 (115-158)||(40412536-40412579)
chr8 (366-417)||(43771004-43771055)
chr8 (320-354)||(3892173-3892207)
chr8 (320-354)||(5818206-5818240)
chr8 (111-144)||(22201304-22201337)
chr8 (111-144)||(34901349-34901382)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (234-533)||(3212692-3212991)
chr6 (227-533)||(32018220-32018518)
chr6 (320-533)||(10894214-10894428)
chr6 (320-533)||(6707736-6707950)
chr6 (320-533)||(7255130-7255340)
chr6 (320-533)||(11105495-11105709)
chr6 (320-533)||(13061071-13061283)
chr6 (229-525)||(7187957-7188262)
chr6 (320-533)||(13045078-13045285)
chr6 (229-520)||(22988838-22989109)
chr6 (229-520)||(23799287-23799558)
chr6 (375-533)||(27084216-27084374)
chr6 (341-533)||(26327525-26327717)
chr6 (375-533)||(19128395-19128554)
chr6 (229-526)||(8357516-8357820)
chr6 (373-526)||(32130237-32130401)
chr6 (229-515)||(1036001-1036298)
chr6 (375-533)||(234551-234715)
chr6 (408-533)||(3299334-3299459)
chr6 (320-521)||(13607489-13607694)
chr6 (373-524)||(31740394-31740558)
chr6 (17-110)||(30386101-30386194)
chr6 (341-503)||(31195551-31195725)
chr6 (325-431)||(31079813-31079924)
chr6 (466-533)||(4153258-4153325)
chr6 (320-354)||(27084183-27084217)
chr6 (111-144)||(1036793-1036826)
chr6 (115-147)||(8357080-8357112)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (234-533)||(9283557-9283856)
chr7 (234-533)||(25969627-25969926)
chr7 (234-533)||(9250007-9250304)
chr7 (320-533)||(23078805-23079018)
chr7 (320-533)||(15878120-15878333)
chr7 (320-531)||(33454276-33454487)
chr7 (320-525)||(1399972-1400177)
chr7 (320-533)||(35160070-35160285)
chr7 (320-533)||(36763488-36763705)
chr7 (320-533)||(36757708-36757925)
chr7 (320-533)||(36767232-36767449)
chr7 (234-365)||(47719952-47720083)
chr7 (375-533)||(48153784-48153942)
chr7 (375-533)||(21409629-21409787)
chr7 (229-526)||(36661100-36661404)
chr7 (229-402)||(11058563-11058734)
chr7 (375-515)||(23969862-23970002)
chr7 (366-533)||(19820694-19820861)
chr7 (366-533)||(44269972-44270139)
chr7 (229-526)||(11830324-11830627)
chr7 (373-526)||(16563933-16564097)
chr7 (373-526)||(16601565-16601729)
chr7 (375-533)||(36413609-36413766)
chr7 (329-533)||(38064881-38065089)
chr7 (375-533)||(554608-554766)
chr7 (351-526)||(47237929-47238116)
chr7 (322-533)||(21180044-21180237)
chr7 (373-526)||(1042758-1042924)
chr7 (373-526)||(26773271-26773437)
chr7 (229-525)||(27397298-27397599)
chr7 (398-525)||(44959041-44959168)
chr7 (373-523)||(19510887-19511041)
chr7 (229-515)||(40096293-40096590)
chr7 (436-526)||(47719858-47719948)
chr7 (388-533)||(24956501-24956644)
chr7 (377-526)||(4291937-4292096)
chr7 (373-526)||(8029071-8029237)
chr7 (375-533)||(26973296-26973458)
chr7 (418-533)||(40053573-40053688)
chr7 (341-515)||(16851046-16851232)
chr7 (17-110)||(305270-305363)
chr7 (17-110)||(2828754-2828847)
chr7 (445-526)||(39521422-39521503)
chr7 (404-531)||(35136297-35136424)
chr7 (445-533)||(11058745-11058833)
chr7 (320-391)||(40041584-40041655)
chr7 (341-515)||(48163671-48163849)
chr7 (341-515)||(27555043-27555221)
chr7 (341-442)||(27354184-27354284)
chr7 (320-371)||(44959993-44960044)
chr7 (111-164)||(25969513-25969566)
chr7 (117-164)||(9250367-9250414)
chr7 (111-150)||(48163523-48163562)
chr7 (320-354)||(21409596-21409630)
chr7 (320-354)||(24956457-24956491)
chr7 (111-145)||(42897106-42897140)
chr7 (115-148)||(11829808-11829841)
chr7 (111-144)||(27354036-27354069)
chr7 (111-144)||(27555336-27555369)
chr7 (111-144)||(40095765-40095798)
chr7 (111-147)||(38263114-38263150)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (234-533)||(30777106-30777405)
chr5 (227-533)||(6242726-6243045)
chr5 (227-519)||(11907407-11907699)
chr5 (320-533)||(26691825-26692039)
chr5 (320-533)||(26961557-26961771)
chr5 (320-525)||(27085558-27085762)
chr5 (320-522)||(17137962-17138163)
chr5 (320-526)||(5722186-5722392)
chr5 (375-533)||(26716515-26716673)
chr5 (375-533)||(26986255-26986413)
chr5 (366-532)||(3701319-3701484)
chr5 (320-533)||(30284296-30284514)
chr5 (387-533)||(21251738-21251884)
chr5 (320-533)||(22738047-22738253)
chr5 (375-531)||(27938401-27938557)
chr5 (375-533)||(25749848-25750006)
chr5 (320-515)||(34032571-34032754)
chr5 (365-518)||(15066445-15066598)
chr5 (320-532)||(18001675-18001875)
chr5 (229-526)||(39689908-39690213)
chr5 (380-533)||(7629293-7629446)
chr5 (375-533)||(1795635-1795794)
chr5 (375-526)||(3934512-3934663)
chr5 (229-515)||(9792932-9793226)
chr5 (229-526)||(1638970-1639271)
chr5 (374-533)||(1921023-1921183)
chr5 (373-526)||(10657220-10657386)
chr5 (320-533)||(41233515-41233717)
chr5 (375-533)||(43357478-43357635)
chr5 (375-533)||(14836574-14836733)
chr5 (404-531)||(39796664-39796791)
chr5 (248-460)||(9729405-9729613)
chr5 (394-526)||(5985655-5985800)
chr5 (435-526)||(30918994-30919085)
chr5 (387-533)||(42365819-42365970)
chr5 (320-426)||(5612244-5612351)
chr5 (229-312)||(26794392-26794475)
chr5 (445-526)||(26794179-26794260)
chr5 (453-533)||(5612169-5612249)
chr5 (229-312)||(12852746-12852829)
chr5 (229-312)||(33830397-33830480)
chr5 (409-531)||(9654026-9654148)
chr5 (463-533)||(9728106-9728176)
chr5 (23-110)||(17171918-17172005)
chr5 (111-164)||(30777468-30777521)
chr5 (483-533)||(35746112-35746162)
chr5 (341-431)||(33830505-33830593)
chr5 (115-169)||(6243109-6243163)
chr5 (115-160)||(11907283-11907328)
chr5 (341-417)||(12852854-12852930)
chr5 (485-533)||(11694466-11694514)
chr5 (229-289)||(32707323-32707383)
chr5 (320-371)||(11694412-11694461)
chr5 (320-354)||(3934662-3934696)
chr5 (111-144)||(39690730-39690763)
chr5 (111-143)||(32624995-32625027)
chr5 (111-147)||(32707795-32707831)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (320-533)||(24851679-24851892)
chr1 (320-535)||(36551593-36551807)
chr1 (320-501)||(47654873-47655054)
chr1 (320-533)||(24589820-24590033)
chr1 (321-533)||(32380776-32380989)
chr1 (330-533)||(3707994-3708185)
chr1 (375-533)||(9528562-9528720)
chr1 (375-533)||(34432133-34432291)
chr1 (375-526)||(10822636-10822787)
chr1 (229-526)||(25257242-25257542)
chr1 (229-526)||(28948386-28948691)
chr1 (379-533)||(14167315-14167469)
chr1 (229-526)||(5984811-5985114)
chr1 (375-533)||(29168189-29168347)
chr1 (351-526)||(28658580-28658768)
chr1 (373-526)||(13012575-13012732)
chr1 (390-533)||(37922471-37922614)
chr1 (229-526)||(3427474-3427785)
chr1 (378-533)||(9781887-9782044)
chr1 (373-526)||(31652994-31653158)
chr1 (373-526)||(14334533-14334697)
chr1 (229-526)||(30324344-30324647)
chr1 (229-515)||(6916049-6916346)
chr1 (229-515)||(38331073-38331370)
chr1 (373-526)||(43190019-43190185)
chr1 (375-533)||(34096270-34096429)
chr1 (229-515)||(52894888-52895185)
chr1 (229-515)||(8132806-8133100)
chr1 (375-533)||(29862039-29862200)
chr1 (404-531)||(32797462-32797589)
chr1 (373-526)||(37346535-37346698)
chr1 (320-482)||(2472682-2472832)
chr1 (341-515)||(37104382-37104568)
chr1 (320-448)||(38218592-38218718)
chr1 (320-476)||(41675743-41675899)
chr1 (379-487)||(10763899-10764009)
chr1 (341-515)||(36367376-36367554)
chr1 (320-471)||(33039819-33039960)
chr1 (409-489)||(15417692-15417772)
chr1 (366-515)||(36363252-36363405)
chr1 (464-531)||(33040711-33040777)
chr1 (492-531)||(15417928-15417967)
chr1 (111-144)||(6916841-6916874)
chr1 (111-144)||(28949208-28949241)
chr1 (111-144)||(36367669-36367702)
chr1 (111-144)||(38218501-38218534)
chr1 (111-144)||(38330545-38330578)
chr1 (111-144)||(38948850-38948883)
chr1 (111-144)||(52895680-52895713)
chr1 (229-289)||(1036892-1036951)
chr1 (229-289)||(1043798-1043857)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (229-525)||(43784-44088)
scaffold0005 (375-533)||(202479-202630)
scaffold0005 (320-354)||(202629-202663)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (341-522)||(13608-13788)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (373-526)||(5906-6068)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (229-526)||(41276-41566)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (445-526)||(29822-29903)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (229-410)||(27092-27268)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (229-289)||(25041-25101)
[»] scaffold0640 (1 HSPs)
scaffold0640 (229-289)||(7579-7639)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 228 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 2567270 - 2566965
Alignment:
Q  228 taattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2567270 taattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgt 2567171  T
Q  328 taactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  2567170 taactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtataacacatacaatgttcttttt 2567071  T
Q  428 ggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatga 527  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2567070 ggatatagcatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 2566971  T
Q  528 tgatgt 533  Q
    ||||||    
T  2566970 tgatgt 2566965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 227 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21006365 - 21006059
Alignment:
Q  227 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21006365 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatattgttgatggaaatggtggagaggagattgagacgattaatg 21006266  T
Q  327 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21006265 ttaaataaaataacttaactattgagtatcgatgtgttcttttttcgatataatgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttt 21006166  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21006165 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattcatg 21006066  T
Q  527 atgatgt 533  Q
     ||||||    
T  21006065 ttgatgt 21006059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 227 - 533
Target Start/End: Original strand, 52684443 - 52684749
Alignment:
Q  227 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52684443 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccaaatttggaagcagttttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 52684542  T
Q  327 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52684543 ttaactaaaataactcaactattgagtactaatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttt 52684642  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52684643 tggatatagtataacaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactcttttaatcgtcaatattatttatatttatg 52684742  T
Q  527 atgatgt 533  Q
     ||||||    
T  52684743 ttgatgt 52684749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 19879011 - 19878799
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||     
T  19879011 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatataatgtttcttttttggatcgatataatatatcactaacaata 19878912  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19878911 ttccttttggatatattatagcactggtggtgctctttttgg-atatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 19878813  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  19878812 atttatgttgatgt 19878799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 47642215 - 47642428
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47642215 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttgaatatagcgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 47642314  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47642315 ttctttttggatatagtataacattgatgatgctctttttgtgatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 47642414  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  47642415 atttatgttgatgt 47642428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 7899627 - 7899415
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7899627 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttta-atatagtgcttctcgtttggatcgatatagtatagcactagcaatg 7899529  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7899528 tttcttttggatgtagtataacactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 7899429  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  7899428 atttatgttgatgt 7899415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 20510065 - 20509852
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  20510065 attaatgttgactaaaataacttaactcttgaatagtgatgtattcttttatggatatagtgcttcttttttggatcgacatagtataacactaacaatg 20509966  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20509965 ttcattttggatatagtatatcattgatggtgctccttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcactattatttat 20509866  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  20509865 atttatgttgatgt 20509852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 320 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 45057210 - 45056998
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  45057210 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactaatgtgttcttttttggatataatgcttattttttggatcgatatagtacaacactaacaatg 45057111  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||    
T  45057110 tttcttttgtatatagtatagcactgctggtgctctttttaggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaattgttgatattatttat 45057011  T
Q  520 atttatgatgatg 532  Q
    ||||||| |||||    
T  45057010 atttatgttgatg 45056998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 320 - 535
Target Start/End: Original strand, 25700970 - 25701187
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcct-ttttagatcgatatagtatagcactaacaa 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||| ||  | ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  25700970 attaatgtttactaaaataacttaactcttgagtacttatgtgttttttttttttatatagtgttttttattttttatcgatatagtataacactaacaa 25701069  T
Q  418 tgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattt 517  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25701070 tgttccttttggatatagtatagcactgacggtgctctttttgggatatattgtgtttgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattt 25701169  T
Q  518 atatttatgatgatgtcc 535  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  25701170 atatttatgttgatgtcc 25701187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 320 - 525
Target Start/End: Original strand, 28968720 - 28968925
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28968720 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtaatgatgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatataatataacactaacaatg 28968819  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28968820 ttcattttggatatagtataacattgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggttaataatcactctattaattgtcaatattatttat 28968919  T
Q  520 atttat 525  Q
    ||||||    
T  28968920 atttat 28968925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 13353104 - 13352891
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  13353104 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatatagtgcttcttttttggatcgacacagtatagcactaacaatg 13353005  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||||||||||||||| ||   |||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||||||    
T  13353004 ttccttttggatatagtatatcattaatggtgttgtttttaggatatattgtgtatgtaattgactaattatcatacttttaatcctcaatattatttat 13352905  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    || |||| ||||||    
T  13352904 atctatgttgatgt 13352891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25936560 - 25936256
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||  ||| || |||| |||||  | ||| |||  |||    
T  25936560 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttagaagctgatttgtatcttgatgatgagaatagatgagatgagatgtaaacg-tta--gtt 25936464  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25936463 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 25936368  T
Q  428 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||||             |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25936367 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactaatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattg 25936268  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  25936267 tttatatttatg 25936256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 48123460 - 48123765
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  48123460 aatttagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttgatttgtatcttgatgatgagaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 48123556  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||    
T  48123557 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtggtcattttttggatatagtgattcttttttgaatcgacatagtataacacaaacaa-gttccttt 48123652  T
Q  427 tggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    ||||||||||             ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48123653 tggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 48123752  T
Q  514 atttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||    
T  48123753 atttatatttatg 48123765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 45532544 - 45532241
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | | |||  |||    
T  45532544 aattgagttagcagagttgtctttggatgaacttgatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaatg-tta--gtt 45532448  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  45532447 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggattgatataatatagcactaacaa-gttcctttt 45532352  T
Q  428 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||||             ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45532351 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaattgactaatgaccaccctcttaatcgtcaatatta 45532253  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  45532252 tttatatttatg 45532241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 320 - 515
Target Start/End: Original strand, 19421625 - 19421826
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  19421625 attaatgttaaccaaaataacttaactcttgagcactgatgtattcttttttggatatagtgcttcttttttgaatcgatatagtataacactaacaatg 19421724  T
Q  420 ttctttttg------gatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    ||| || ||       ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  19421725 ttccttatgaatataaatataatatagcactaatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaagcatcaatttt 19421824  T
Q  514 at 515  Q
    ||    
T  19421825 at 19421826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 22311105 - 22311269
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||           | |||||||||||||||||    
T  22311105 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataacactgatggtgctctttttgg 22311204  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22311205 tatatcttgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 22311269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 375 - 531
Target Start/End: Original strand, 29916034 - 29916191
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  29916034 tatagtgcttctgttttagatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtataacactgatggtgttctttttgggatatattgttta 29916133  T
Q  475 tgtaattgactaat-caccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29916134 tgtaatcgactaatccatcactctcttgatcgacaatattatttatatttatgttgat 29916191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 375 - 531
Target Start/End: Original strand, 29965187 - 29965344
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  29965187 tatagtgcttctgttttagatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtataacactgatggtgttctttttgggatatattgttta 29965286  T
Q  475 tgtaattgactaat-caccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29965287 tgtaatcgactaatccatcactctcttgatcgacaatattatttatatttatgttgat 29965344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 38888995 - 38888793
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgtt-cttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||     
T  38888995 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactggtgtgtttcttttttggatatagtgcttattttttggattgataaagtatagcactaacaa- 38888897  T
Q  419 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 518  Q
               || ||||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38888896 -----------atgtagtataacattgatgatgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactgtcttaatcgtcaatattattta 38888808  T
Q  519 tatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| ||||||    
T  38888807 tatttatgttgatgt 38888793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 229 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 52505305 - 52505002
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  52505305 aattgagttagcagagttgtctttggatga-ccggatttgaaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 52505210  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  52505209 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatataatgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttt 52505114  T
Q  427 tggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    ||||||||||             |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52505113 tggatatagtgtagcattgatgtatagcactaatggtgctctttttagtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 52505014  T
Q  514 atttatatttat 525  Q
    ||||||||||||    
T  52505013 atttatatttat 52505002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 320 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 30787470 - 30787351
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30787470 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttattttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatg 30787371  T
Q  420 ttctttttggatatagtata 439  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  30787370 ttccttttagatatagtata 30787351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1679163 - 1678869
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | |||  | | |||    
T  1679163 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg--tca-gtt 1679067  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  1679066 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacag-gttcattt 1678971  T
Q  427 tggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    || ||||||| |||||             | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1678970 tgaatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 1678871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 341 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22610650 - 22610455
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata------ 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||          
T  22610650 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgtag 22610553  T
Q  435 -------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
           ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22610552 cattgatgtataacactgatagtgctcttttt-gtatatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatg 22610455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28882422 - 28882258
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||           | |||||||||||||||||    
T  28882422 gatatagtgcttctttttatgatcgatatagtatagcattaacaatgtttcttttggatatagtataacattgatataacactgatggtgctctttttgg 28882323  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882322 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 28882258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 387 - 533
Target Start/End: Original strand, 48333216 - 48333362
Alignment:
Q  387 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 486  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||     
T  48333216 tttttggatcgatatagtatagcactaacaatattccttttggatatagtataacactgatggtgttcttttcgggatatattgtgtatgtagttgactg 48333315  T
Q  487 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    | |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  48333316 accgtcactctcttaattgtcaatattatatatatttatgttgatgt 48333362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 212715 - 212916
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||  ||  |         
T  212715 attaatgtcaactaaaattatttaactcttgagtattgatgtgttcttttttggataaaatgcttctttttttgatcgataaagtatactacgga----- 212809  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
           |||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  212810 -------tggatatagtatagcactcatgttgctctttttgagatatattatgtatgtaattgactaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 212902  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||| | ||||||    
T  212903 atttacgttgatgt 212916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 983395 - 983592
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  || ||||||||                   
T  983395 attaatgttaactaaaacaacttaactcttgagtacttatgtgttcttttttggatatagtgtttcttttttgaatggatatagt--------------- 983479  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
     || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  983480 -tccttttggacatagtatagcactgatggtgctctttttatgatatattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttattcgtcaatattatttat 983578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 35390125 - 35390286
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgat--------ggtgctctttttggtat 464  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||        |||||||||||||||||    
T  35390125 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatatgacactggtgctctttttggtat 35390224  T
Q  465 atattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    || ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35390225 attttacgtatgtaattgactaatcatcattctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 35390286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 22289597 - 22289440
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||| |||||||  |||    
T  22289597 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtacaacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgtt-tttttgggatatattcggta 22289499  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22289498 tgtaattgaataatcatcactctattaatcgtcaatattatttatatttacgttgatgt 22289440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 404 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25322342 - 25322220
Alignment:
Q  404 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25322342 tatagcaataacaatgttccttttggatatagtataacattgatagtgctctttttgggatatattatatatgtaattgactaatcatcactctcttaat 25322243  T
Q  504 cgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  25322242 cgtcaatattacttatatttatg 25322220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 387 - 533
Target Start/End: Original strand, 28548300 - 28548446
Alignment:
Q  387 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 486  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||    
T  28548300 tttttggatcgatatagcatagcactaacaatgttctttttgaatatagcatatcactgatgttgctctttttgagttatagtgtatatgtaattgacta 28548399  T
Q  487 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    || | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28548400 attatcactctcttaatcggtaatattatttatatttatgttgatgt 28548446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 387 - 533
Target Start/End: Original strand, 48334159 - 48334305
Alignment:
Q  387 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 486  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||| ||||  ||||||     
T  48334159 tttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtataacacggatggtgttcttttcgggatatattgtgcatgtcgttgactg 48334258  T
Q  487 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    | |   || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  48334259 accgttaccctcttaatcgtcaatattatatatatttatgttgatgt 48334305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 50287089 - 50286925
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||           | |||||||||||||||||    
T  50287089 gatatagtgtttcttttttggatcgatatagtatagcatcaataatgttccttttggatatagtataacattgatataacactgatggtgctctttttgg 50286990  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50286989 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgttaatattatttatatttatg 50286925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 435 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 42464409 - 42464318
Alignment:
Q  435 gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42464409 gtataacactgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 42464318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 19349480 - 19349317
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatat-----att 469  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| | ||| |  ||| |     |||    
T  19349480 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactgacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgttttttattttattttatgtatt 19349381  T
Q  470 gtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19349380 gtgtatgtaattgactaatcgtcgctctcttaatcgtcaatataatttatatttatgttgatgt 19349317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 320 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21157638 - 21157531
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21157638 attaatgttaattaaaataacttaactctcgagtattgatgtgttctttttttggatatagtgcttctttttttgattgatatagtatagcactaacaat 21157539  T
Q  419 gttctttt 426  Q
    ||||||||    
T  21157538 gttctttt 21157531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 2122951 - 2123109
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||||||||||  ||||  ||| | ||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  2122951 tatagtgcttctatttttaatcaaaatagtataagactaacaatctttcttttggatataatataacacttatgatgctctttttgggatatattgtgaa 2123050  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
     ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2123051 agtaattgactaatcatcacccacttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 2123109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10224633 - 10224550
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  10224633 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaagagat 10224550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 52121537 - 52121703
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag-------------caccgatggtgctcttttt 459  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||              ||  |||||||||||||||    
T  52121537 gatatagtgctctttttttggatcgatataatatagcactaacaatgttccttttggatgtagtataatattgatgtataacagtgatggtgctcttttt 52121636  T
Q  460 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52121637 gatatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtaaataatatttatatttatg 52121703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 445 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10224418 - 10224337
Alignment:
Q  445 gatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10224418 gatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgagcactctcttaattgtcaatattatttatatttatg 10224337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 453 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21157536 - 21157456
Alignment:
Q  453 tctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21157536 tcttttggggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattcatatttatgttgatgt 21157456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 458 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 13748291 - 13748216
Alignment:
Q  458 ttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13748291 ttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 13748216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 47750758 - 47750631
Alignment:
Q  404 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 503  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  47750758 tataacactaacaatattccttttggatatagtataatattgatggtgctcttttgggataatattgtatatgtaattgattaatcatcactctcttaat 47750659  T
Q  504 cgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47750658 cttcaatattacttatatttatgttgat 47750631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 351 - 515
Target Start/End: Original strand, 28705493 - 28705670
Alignment:
Q  351 agtactgatgtgttcttttttcga-tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg- 448  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  ||||     
T  28705493 agtacggatgtgttctttttttgaatatagtgattcttttttggatcgatatagaatatcactaacaa-gttcattttggatatagtgtagcattgatgt 28705591  T
Q  449 ------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
                ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28705592 ataacattgatggtgctctttttggtatatattgcatatgtaattgtctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 28705670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 448 - 526
Target Start/End: Original strand, 33241195 - 33241273
Alignment:
Q  448 ggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33241195 ggtgctcttttttatatattttgcatatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 33241273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 447 - 515
Target Start/End: Original strand, 1528891 - 1528959
Alignment:
Q  447 tggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1528891 tggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 1528959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 465 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 30787350 - 30787282
Alignment:
Q  465 atattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  30787350 atattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttgatgt 30787282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 312
Target Start/End: Original strand, 28705373 - 28705456
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28705373 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccgtatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagat 28705456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 37996665 - 37996565
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  37996665 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 37996568  T
Q  440 gca 442  Q
    |||    
T  37996567 gca 37996565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 533
Target Start/End: Original strand, 45347907 - 45347974
Alignment:
Q  466 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45347907 tattgtgtttgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 45347974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 341 - 442
Target Start/End: Original strand, 7327968 - 7328068
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  7327968 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatatagtgta 7328065  T
Q  440 gca 442  Q
    |||    
T  7328066 gca 7328068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 526
Target Start/End: Original strand, 39664657 - 39664811
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatgg----tgctctttttggtatatattg 470  Q
    ||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||    |  | ||||| | ||||||||    
T  39664657 tatagtgcttcttttttgtattgatatagtataacactgacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtatttttttttttttggatatattg 39664756  T
Q  471 tgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    | ||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39664757 t-tatataattgacaaatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatg 39664811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 55268925 - 55268854
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttccttttt 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  55268925 attaatgttaactaaaataacttaagtcttgagtactgatgtgttattttttggatatagttcttctttttt 55268854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 483 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 41741913 - 41741863
Alignment:
Q  483 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41741913 actaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 41741863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6134291 - 6134226
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttc 385  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  6134291 attaatgttgactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgtttttttatggatataatgcttc 6134226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 375 - 439
Target Start/End: Original strand, 42229906 - 42229970
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 439  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42229906 tatattgcttcttttttgaatcgatatagtatagcactaacaatattccttttggatatagtata 42229970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 164
Target Start/End: Original strand, 52684323 - 52684372
Alignment:
Q  115 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 164  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52684323 aaaaaataattatccgatattttccgatacgtcctggatacgcaaaggat 52684372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 417
Target Start/End: Original strand, 1528802 - 1528853
Alignment:
Q  366 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaa 417  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1528802 ttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa 1528853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2567394 - 2567345
Alignment:
Q  115 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  2567394 aaaaaataattatccgatactttccgatacatcccgaatacgcgaaggat 2567345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 318 - 371
Target Start/End: Original strand, 28548251 - 28548304
Alignment:
Q  318 cgattaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 371  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  28548251 cgataaatgttaactaaaataacttaactcttgagtcttaatgtgttctttttt 28548304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 447 - 515
Target Start/End: Original strand, 7328086 - 7328145
Alignment:
Q  447 tggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  7328086 tggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaat---------accactctcttaatcgtcaatattat 7328145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37996547 - 37996487
Alignment:
Q  447 tggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37996547 tggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcatcaatattat 37996487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 354
Target Start/End: Original strand, 2122918 - 2122952
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2122918 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 2122952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22611380 - 22611347
Alignment:
Q  115 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcc 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22611380 aaaaaataattatccgatactttccgatacgtcc 22611347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37996811 - 37996778
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37996811 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 37996778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 227 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 45159178 - 45158872
Alignment:
Q  227 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45159178 gtaattgagttagtagaattgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 45159079  T
Q  327 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45159078 ttaactaaaataattcaactcttcagtacttatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaaaaatgttctttt 45158979  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45158978 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 45158879  T
Q  527 atgatgt 533  Q
     ||||||    
T  45158878 ttgatgt 45158872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 323 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 31236092 - 31235882
Alignment:
Q  323 aatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttc 422  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31236092 aatgttaactaaaataacttaactcttcagtactgatgtgtttttttttggatatagtgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttc 31235993  T
Q  423 tttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatt 522  Q
     |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31235992 cttttggatatagtatatcattgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatt 31235893  T
Q  523 tatgatgatgt 533  Q
    |||| ||||||    
T  31235892 tatgttgatgt 31235882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 320 - 531
Target Start/End: Original strand, 34146389 - 34146600
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  34146389 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtattgatttgttcttttttggatataatgcttattttttagattgatatagtatagcactaacagtg 34146488  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34146489 ttccttttggatatagtataacattgatgatgctctttttgggatatattgtgtaggtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 34146588  T
Q  520 atttatgatgat 531  Q
    ||||||| ||||    
T  34146589 atttatgttgat 34146600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 320 - 525
Target Start/End: Original strand, 35342527 - 35342731
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35342527 attaatgttaactaaaataacttaactcttgattactgatgtgttctttttta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 35342625  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  35342626 ttccttttggatataatataacactgatgatgctctttttaggatatattgtgtatgtaattggctaataatcaatctcttaatcgtcaatattatttat 35342725  T
Q  520 atttat 525  Q
    ||||||    
T  35342726 atttat 35342731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 14824381 - 14824539
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14824381 tataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgta 14824480  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14824481 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 14824539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 3545489 - 3545277
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||| |||     
T  3545489 attaatgttaattaaaataacttaattcttgagtactgatgtgttcttttttggatatagtgctttttatttt-atcgatatagtatagcactaataata 3545391  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||  |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3545390 tttcttttggatatagtataccactgatgatgctccttttaggatatattgtgtatgtaattgattaattatcactctcttaatcgtcaatattatttat 3545291  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  3545290 atttatgttgatgt 3545277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 229 - 525
Target Start/End: Original strand, 22484903 - 22485207
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  22484903 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 22484999  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22485000 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttt 22485095  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatggt-------------gctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||||||||| |||||  |||| |             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22485096 tggatatagtgtagcattgatgtttatctttgatgttgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 22485195  T
Q  514 atttatatttat 525  Q
    ||||||||||||    
T  22485196 atttatatttat 22485207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 1005754 - 1005912
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1005754 tatagtgtttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatattccttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttaggatatattgtgta 1005853  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1005854 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 1005912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4170004 - 4169700
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||  |||    
T  4170004 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctgatttgtatcttgatgatggaaatggaggagaggagattgaaatg-tta--gtt 4169908  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  4169907 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatataatgcttcatttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttt 4169812  T
Q  427 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    | ||||||             ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4169811 ttgatatagtttagcattggtgtatagcactgatggtgctcttttt-gtacatattgcgtatgtaattgactaatgactactctcttaatcgtcaatatt 4169713  T
Q  514 atttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||    
T  4169712 atttatatttatg 4169700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 4562031 - 4562189
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4562031 tatagtgcttcttttttggattgatatagtatatcactaacaatgttccttttggatatagtatagtacttatggtactctttttgggatatattgtgta 4562130  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4562131 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 4562189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 40308320 - 40308015
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  40308320 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 40308224  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  40308223 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttt 40308128  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatgg-------------tgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||||||||| |||||  ||||              ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40308127 tggatatagtgtagcattgatgtataacattgatgatgctcttttcggtatatattgagtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 40308028  T
Q  514 atttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||    
T  40308027 atttatatttatg 40308015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 376 - 533
Target Start/End: Original strand, 4355555 - 4355712
Alignment:
Q  376 atagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtat 475  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  4355555 atagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggggctctttttgggatatattatgtat 4355654  T
Q  476 gtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4355655 gtaattgactaatcatcactctcttagtcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 4355712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 375 - 526
Target Start/End: Original strand, 24585777 - 24585929
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgtt-ctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgt 473  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  24585777 tatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttctttttggatatagtatagcacttatggtactctttttgggatatattctgt 24585876  T
Q  474 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24585877 atgtaattgactaatcttcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 24585929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 6124801 - 6125112
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  6124801 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 6124897  T
Q  329 aactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttc-------gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgtt 421  Q
    | ||    |   ||||||||| |||| ||||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6124898 a-cttgtttgtgttaactctt-agtagtgatgtgttctttttttttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gtt 6124994  T
Q  422 ctttttggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtca 508  Q
    ||||||  |||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6124995 ctttttatatatagtgtagcattgatgtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtca 6125094  T
Q  509 atattatttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6125095 atattatttatatttatg 6125112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 320 - 522
Target Start/End: Original strand, 2319484 - 2319685
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2319484 attaatgttaactaaaataacttaactattgagtactgatgcatttttttatggatatagtgcttcttttttggattgatatagtataacactaacaatg 2319583  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  2319584 ttccttttggatatagtatatccatgat-gtgctctttttgggatatattttctaattaattgactaatcatcattcttttaatcgtcaatattatttat 2319682  T
Q  520 att 522  Q
    |||    
T  2319683 att 2319685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6497154 - 6496851
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  6497154 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 6497058  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  6497057 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataggactaacaa-gttcctttt 6496962  T
Q  428 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||             ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6496961 ggatatagtgtagcattgatgtataacactgatagtgctcttttt-gtatatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctttcaatcgtcaatatta 6496863  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  6496862 tttatatttatg 6496851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 40431897 - 40431740
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40431897 tatagtgct-cctttttttatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacaccgatggtgctctttttaggatattttgtgta 40431799  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40431798 tgtaattgactaagcatcactctgttaatcatcaatattatttgtatttatgttgatgt 40431740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 18301357 - 18301514
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg----gtgctctttttggtatatat 468  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||    |||||||||||||||||| |    
T  18301357 gatacagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactagcaatgttccttttggatataatataacattgatgtatggtgctctttttggtatattt 18301456  T
Q  469 tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18301457 tgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatg 18301514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 374 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 28746538 - 28746378
Alignment:
Q  374 atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttg-gtatatattgtg 472  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  | ||||||||||    
T  28746538 atatagttcttcttttttggatcgatatagtataacaataacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgctttttttttggatatattgtg 28746439  T
Q  473 tatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28746438 tatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgctgatgt 28746378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 375 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 8482793 - 8482647
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  8482793 tataatgcttcttttttggatcgatataatataacattaacaatgttccttttggatatagtatagcaccgatggtgctcgttttgggatatattgtgtt 8482694  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatat 521  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8482693 tgtaattgaccaataatcactctcttaatcgacaatattatctatat 8482647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 10573703 - 10573905
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||        
T  10573703 attaatgttaaccaaaataacttaactattgagtagtgatgtgttcttttttggatatagtgcttattttttggatcgataaagtataacactaac---- 10573798  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaata-ttattta 518  Q
            |||||||||||| ||  | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10573799 --------ggatatagtatatcattggtggtgctctttttgagatatattgtatatgtaattgactaatcatcactcacttaatcgtcaatatttattta 10573890  T
Q  519 tatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| ||||||    
T  10573891 tatttatgttgatgt 10573905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 5371337 - 5371501
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||           | ||||||| | |||||||    
T  5371337 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatataaaatagcattcatataacactgatggtgttttttttgg 5371436  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5371437 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatgtatatttatg 5371501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 5588280 - 5588438
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||||||| || || ||||||||||||    
T  5588280 tatagtgcttattttttggatcgatataatataacactaacaatgtttcttttgcatacagtatatcacttatggtgctctcttcgggatatattgtgta 5588379  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5588380 tgtaattgactaatcatcattctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 5588438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 12819577 - 12819741
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgat-----------ggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||           ||||||||||||||    
T  12819577 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatattccttttggatatagtatagcattgatataacactggtggtgctctttttgg 12819676  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12819677 tatattttacgtatgtaattgactaatcaccactctattaatcgtcaatattatttatatttatg 12819741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 44156840 - 44156997
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |||   |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  44156840 tataatgcttcttttttggatcgatataatatagaactaacaatgtttcttctggatatagtataacacttgtggtgctctttttggg-tatgttgtgta 44156938  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44156939 tgtaattgactaatcatcactcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 44156997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 416 - 533
Target Start/End: Original strand, 35996814 - 35996931
Alignment:
Q  416 aatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35996814 aatgttcattttggatatagtataacacttatggtgctccttttgggatatattgtgcatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattat 35996913  T
Q  516 ttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  35996914 ttatatttatgttgatgt 35996931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 414 - 531
Target Start/End: Original strand, 40536498 - 40536615
Alignment:
Q  414 acaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40536498 acaatgttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttggaatatattgtatatgtaattgactaatcatcactcttttaatcgtcaatatt 40536597  T
Q  514 atttatatttatgatgat 531  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  40536598 acttatatttatgttgat 40536615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 410 - 533
Target Start/End: Original strand, 12206264 - 12206387
Alignment:
Q  410 actaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaa 509  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12206264 actaacaatgttccttttggatataatataacattgatggtgctttttttcggatatattttgtatgtatttgactaatcatcactctcttaatcgtcaa 12206363  T
Q  510 tattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  12206364 tattatttatatttatgttgatgt 12206387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 399 - 533
Target Start/End: Original strand, 3564106 - 3564239
Alignment:
Q  399 tatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctc 498  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3564106 tatagtatagcattaacaatgcttcttttggatatagtataacagttatgatgctctttttgggatatattgtgtatgcaattgactaatcatcactctc 3564205  T
Q  499 ttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3564206 ttaatcgtcaatatta-ttatatttatgttgatgt 3564239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 387 - 526
Target Start/End: Original strand, 20537115 - 20537267
Alignment:
Q  387 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgt 473  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||             |||||||||||| ||||| |||  |    
T  20537115 tttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtataacattgatgtataacactgattgtgctctttttgatatattttgctt 20537214  T
Q  474 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20537215 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 20537267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 21104691 - 21104894
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21104691 attaatgttaactaaaataacttaacttttgagtattgatgtgtactttttttgaatatagtgcttcatttttgtatcgatatagtatatcactaacaat 21104790  T
Q  419 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 518  Q
     ||| ||||||||           | |||| |  | ||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21104791 attccttttggat----------gctgatgatattgtttttgggatatattgtgtatgtaattg-gttataatcactctcttaatcgtcaatattattta 21104879  T
Q  519 tatttatgatgatgt 533  Q
    | |||||| ||||||    
T  21104880 tgtttatgttgatgt 21104894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 341 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 7807231 - 7807045
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||| ||    
T  7807231 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaaa-ttccttttgaatatagtgta 7807134  T
Q  440 gcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    |||  ||||             |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7807133 gcattgatgtataacattgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattttctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 7807045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 499
Target Start/End: Original strand, 9293655 - 9293750
Alignment:
Q  404 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctct 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||| | || || |||||||||||||| ||||||||    
T  9293655 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtataacattaatggtgctctttttgggatataatatgcatttaattgactaatcatcactctct 9293750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 45159305 - 45159256
Alignment:
Q  115 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 164  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45159305 aaaaaatacttatccgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 45159256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 483 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14217003 - 14216955
Alignment:
Q  483 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14217003 actaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 14216955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 371
Target Start/End: Original strand, 9293314 - 9293365
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 371  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9293314 attaatgttaactaaaataactcaactattgagtaccgatgtgttctttttt 9293365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 354
Target Start/End: Original strand, 44156807 - 44156841
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44156807 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 44156841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 375 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1776312 - 1776249
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 439  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||    
T  1776312 tatagtgcttcttttttggatcgatataat-tagcacggacaatgtttcttttggatatagtata 1776249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 320 - 352
Target Start/End: Original strand, 4355521 - 4355553
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgag 352  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4355521 attaatgttaactaaaataacttaactcttgag 4355553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 228 - 533
Target Start/End: Original strand, 24784489 - 24784794
Alignment:
Q  228 taattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgt 327  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24784489 taattgagttagtaaagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagagaagattgagacgattaatgt 24784588  T
Q  328 taactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24784589 taactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagattgatatagtatagcactatcaatgttcttttt 24784688  T
Q  428 ggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatga 527  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24784689 ggatatagtatagcaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 24784788  T
Q  528 tgatgt 533  Q
    ||||||    
T  24784789 tgatgt 24784794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 234 - 533
Target Start/End: Original strand, 52721477 - 52721776
Alignment:
Q  234 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52721477 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttgaaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 52721576  T
Q  334 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 433  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  52721577 aaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 52721676  T
Q  434 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52721677 agtatatcattgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 52721776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 227 - 526
Target Start/End: Original strand, 39957804 - 39958103
Alignment:
Q  227 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 326  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39957804 gtaattgagctaatagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctagtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggatattgagacgattaatg 39957903  T
Q  327 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39957904 ttaactaaaataacttaattcttgaatactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 39958003  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39958004 tagatatagtataacaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 39958103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 318 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 24823687 - 24823472
Alignment:
Q  318 cgattaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24823687 cgattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagattgatatagtatagcactatcaa 24823588  T
Q  418 tgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattt 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24823587 tgttctttttggatatagtatagcaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattt 24823488  T
Q  518 atatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||| ||||||    
T  24823487 atatttatgttgatgt 24823472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 24793640 - 24793427
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24793640 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttaaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 24793541  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24793540 ttccttttggatatagtataacactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatctaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 24793441  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  24793440 atttatgttgatgt 24793427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 320 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 3109214 - 3109003
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3109214 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttattttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 3109115  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3109114 ttccttttggatatagtataacacagatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactcttttaatcgtcaatattatttat 3109015  T
Q  520 atttatgatgat 531  Q
    ||||||| ||||    
T  3109014 atttatgttgat 3109003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 17892457 - 17892670
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17892457 attaatgttaacaaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagattgatatagtataacactaacaatg 17892556  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17892557 ttccttttgaatatagtataacactgatgatgctctttttggtttatattgtgtatgtaattgtctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 17892656  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  17892657 atttatgttgatgt 17892670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 320 - 525
Target Start/End: Original strand, 36943878 - 36944083
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36943878 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtagtgatgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataatactaacaatg 36943977  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  36943978 ttccttttggatatagtataacactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcaatctcttaatcgtcaatattatttat 36944077  T
Q  520 atttat 525  Q
    ||||||    
T  36944078 atttat 36944083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 320 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 44521955 - 44521749
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  44521955 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactaatgtgttcttttttgaatataatgcttcttttttggatcgatatagtataacattaacaatg 44521856  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44521855 ttccttttggatatagtatagcactaatggtgctttttttgagatattttgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatgttatttat 44521756  T
Q  520 atttatg 526  Q
    |||||||    
T  44521755 atttatg 44521749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 55901057 - 55900844
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  55901057 attaatggtgactaaaaaaacttaactcttgagtactgatgtgttcttttatggatataatgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatg 55900958  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||    
T  55900957 ttcattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatcattctcgtaatcgtgagtataatttat 55900858  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  55900857 atttatgttgatgt 55900844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 24784263 - 24784410
Alignment:
Q  17 tttgcacctttacctttttgaatttcatcattagcaatcatatttgtgatgttaattttttgatctgcttgcaattggtcgtgccttttagaagttttaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24784263 tttgcacctttacctttttgaagttcatcattagcaatcatatttgtgctgttaatttcttgatccgcttgcaattggtcgtgccttttagaagttttaa 24784362  T
Q  117 aaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 164  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24784363 aaaataattatcagatactttccgatacatcctggatacgcgaaggat 24784410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 42630393 - 42630174
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttc------gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcacta 413  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||       |||||| |||||| |||||  |||||| ||||||| |||||    
T  42630393 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttcttttttttttttggatataatgcttcttttttgaatcgatgtagtataacacta 42630294  T
Q  414 acaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42630293 acaatgttccttttggatagagtataacactgatgatgcttttttttggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatatt 42630194  T
Q  514 atttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  42630193 atttatatttatgttgatgt 42630174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 31946102 - 31945945
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31946102 tatagtgcttcttttttggatcgatat-gtatagcactaacaatgttccttttagatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgta 31946004  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31946003 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 31945945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 52572826 - 52573126
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  | ||| |||  |||    
T  52572826 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccatatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagagtagatgtaaacg-tta--gtt 52572922  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  52572923 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgctt----tttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 52573014  T
Q  428 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||||             ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52573015 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatactgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatta 52573114  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  52573115 tttatatttatg 52573126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 320 - 526
Target Start/End: Original strand, 49470489 - 49470691
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||  ||| ||  ||||||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  49470489 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactcatgtaaacttttttggata--gtgtttttttttta--tcgatatagtatgtcactaacaatg 49470584  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49470585 ttccttttggatatagtatagcattgatgatgcactttttggaaaatattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 49470684  T
Q  520 atttatg 526  Q
    |||||||    
T  49470685 atttatg 49470691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 229 - 525
Target Start/End: Original strand, 14795643 - 14795947
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  14795643 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatgaaggagaggagatataaacg-tta--gtt 14795739  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  14795740 acttgt--tagtgttaactctt-agtattgatgtgttctttttttggatatagtgattctttttcggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttt 14795835  T
Q  427 tggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||||| |||             ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14795836 tggatacagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttgatatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 14795935  T
Q  514 atttatatttat 525  Q
    ||||||||||||    
T  14795936 atttatatttat 14795947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 41146241 - 41146544
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  41146241 aattgagttagcagagttgtctttggatgatccggatttggaagctgatttgtatcttgattatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 41146337  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  41146338 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttgaatcgatatagtataacactaacaa-gttcctttt 41146433  T
Q  428 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||||             ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41146434 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaattgtcaatatta 41146532  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  41146533 tttatatttatg 41146544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 387 - 533
Target Start/End: Original strand, 47607355 - 47607501
Alignment:
Q  387 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 486  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47607355 tttttggatcgatataatatagcaccaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgacta 47607454  T
Q  487 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47607455 attatcactatcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 47607501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 229 - 501
Target Start/End: Original strand, 53322976 - 53323255
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  53322976 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctaatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 53323072  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53323073 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatacagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 53323168  T
Q  428 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctctta 501  Q
    |||||||             ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53323169 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctctta 53323255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 1177219 - 1177378
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttttt-ggtatatattgtgt 473  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  1177219 tataatgcttcttttttggattgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtacttttttttgggatatattgtgt 1177318  T
Q  474 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1177319 atgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 1177378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 380 - 533
Target Start/End: Original strand, 51859042 - 51859195
Alignment:
Q  380 tgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaa 479  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||| | ||||    
T  51859042 tgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatgatgctctttttgtgatatattgtgaaagtaa 51859141  T
Q  480 ttgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51859142 ttgactaatcatcacccacttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 51859195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 5835205 - 5835369
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgat-----------ggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||           |||||||||||||     
T  5835205 gatatagtgcttctttttttgatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataacattgatggtgctctttttga 5835304  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5835305 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 5835369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 28377272 - 28377438
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-------------ccgatggtgctcttttt 459  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||             | |||||||||||||||    
T  28377272 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatataatatagcattgatgtataacactgatggtgctcttttt 28377371  T
Q  460 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28377372 gttatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgccaatattatttatatttatg 28377438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8063579 - 8063282
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  8063579 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 8063483  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  8063482 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 8063387  T
Q  427 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 510  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8063386 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 8063287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3403056 - 3402762
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  3403056 aattgagttagcaaagttgtccttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 3402960  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  3402959 actt--gctagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttccttt 3402864  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||||||||| |||||  ||||             |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3402863 tggatatagtgtagcattgatgtataacacttattgtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcatcaatatt 3402764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 387 - 533
Target Start/End: Original strand, 2586592 - 2586737
Alignment:
Q  387 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 486  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||    
T  2586592 tttttagatcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatataatataacactgatgatgctcttttgagg-tatattgtgtatgtaattggcta 2586690  T
Q  487 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2586691 ataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 2586737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 40694312 - 40694470
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| |||||||  |||    
T  40694312 tataatgcttcttttttgaatcgatatagtatagtactaacaatgtttcttttggatataatatatcacttatgatgctctttttgggatatattacgta 40694411  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  40694412 tgtaattgactaatcatcactctcttaattgtcgatattatttatatttatgttgatgt 40694470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 258941 - 258796
Alignment:
Q  380 tgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttct-ttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgta 478  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  258941 tgcttcttttttggatcaatatagtatagcagtaacaatgttccgttttggatatagtataacacttatggtactctttttgagatatattgtgtatgta 258842  T
Q  479 attgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattta 524  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  258841 attgactaattatcactctcttaatcgtcactattatttatattta 258796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 404 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 30683507 - 30683380
Alignment:
Q  404 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30683507 tatagcactaacaatgttccttttgaatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgattaatcatcactctcttaat 30683408  T
Q  504 cgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30683407 cgtcgatattatttatatttatgttgat 30683380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Original strand, 31226974 - 31227270
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | | |||  |||    
T  31226974 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaatg-tta--gtt 31227070  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc---ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctt 424  Q
    |  |    || | |||||||||  ||||||||||||||   ||||||  |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31227071 actt--gttagtgttaactctt-tgtactgatgtgttctttttttttttatatagtaattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcct 31227166  T
Q  425 tttggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaata 511  Q
    ||||||||||             |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31227167 tttggatatagtgtagcattgatgtatagcactcatgatgctctttttggtatgtattgcgcatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata 31227266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 51675031 - 51675188
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||| |||  ||| | |||||||||| ||||||||| ||    
T  51675031 tatagtgcttcttttttggatagatatagtatatcactaacaatattcctttctaatatagtataacacttatgattctctttttgg-atatattgtata 51675129  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51675130 tgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 51675188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 375 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 36511809 - 36511658
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggt---atatattgt 471  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||  |   ||||||| |    
T  36511809 tatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactaagaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgtttttttttttttgatatatttt 36511710  T
Q  472 gtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 523  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36511709 gtatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatattt 36511658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 397 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 43509755 - 43509615
Alignment:
Q  397 gatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgact 485  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||           | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43509755 gatatagtatagcattaacaatgttccttttagatataatatagcattgatataatactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgact 43509656  T
Q  486 aatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43509655 aatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 43509615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 435 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5325287 - 5325197
Alignment:
Q  435 gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttat 525  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5325287 gtatagcacttatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttat 5325197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 320 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 46431842 - 46431685
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||        
T  46431842 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttggatatactactt-ctttttggatcgataaagtatagcactaac---- 46431748  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatca 490  Q
            ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46431747 --------ggatacagtatagcactaatggttctctttttgaaatatatcgtgtgtgtaattgactaatca 46431685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 408 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 7952954 - 7952831
Alignment:
Q  408 gcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtc 507  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||  |||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  7952954 gcactaacaatgttccttttggatatagtataacattgatgacgctccttttgggatatattatatatgtaattgattaatcatcactcttttaatcgtc 7952855  T
Q  508 aatattatttatatttatgatgat 531  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||    
T  7952854 aatattacttatatttatgttgat 7952831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 398 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 37992387 - 37992293
Alignment:
Q  398 atatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacc 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37992387 atatagtataggactaacaatgttccttttggatataatatagcactaatggtgctctttttgggatatattgggtatgtaatcgactaatcacc 37992293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 341 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38492136 - 38491965
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 439  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  38492136 ttaactctt-agtaatgatgtgttctttttttggatatagggattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 38492039  T
Q  440 gcaccga------tggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    |||  ||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  38492038 gcattgatgtatctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat 38491965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 14614746 - 14614897
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||| ||   ||| || ||||||||| ||||| ||| ||    
T  14614746 tataatgcttcttttttagatcaatataatatagcactaacaatatttcttttggatataacataacatttatgatgttctttttgggatatactgtata 14614845  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14614846 tgtaattgactaatca-------tttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 14614897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 722538 - 722441
Alignment:
Q  321 ttaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  722538 ttaatgttaactaaactaacttaactcttgtgtattgatgtgttattttttgaatatagtgtttcttttttggatagatatagtatgacactaacaat 722441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 164
Target Start/End: Original strand, 39957682 - 39957735
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39957682 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatacgtcccggatacgcgaaggat 39957735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 406
Target Start/End: Original strand, 754380 - 754465
Alignment:
Q  321 ttaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtat 406  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||    
T  754380 ttaatgttaactaaactaacttaactcttgtgtattgatgtgttattttttgaatatagtgtttcttttttggatagatatagtat 754465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 371
Target Start/End: Original strand, 2586545 - 2586596
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2586545 attaatgttaactaaaataacttaactcttcaggactgatgtgttctttttt 2586596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 64
Target Start/End: Original strand, 32824473 - 32824520
Alignment:
Q  17 tttgcacctttacctttttgaatttcatcattagcaatcatatttgtg 64  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32824473 tttgcacctttacctgtttgaagttcatcattagcaatcatatttgtg 32824520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37992436 - 37992394
Alignment:
Q  327 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttt 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37992436 ttaactaaaataacttaactcttgagtaccgatgtgttctttt 37992394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 52122421 - 52122361
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 289  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  52122421 aattgagttagcatagttgtctttgaatgaaccggattaggaagctgatttgtatcttgtt 52122361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 354
Target Start/End: Original strand, 14614713 - 14614747
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14614713 attaatgttaactaaaataatttaactctcgagta 14614747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 354
Target Start/End: Original strand, 51859004 - 51859038
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51859004 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 51859038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8064109 - 8064076
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8064109 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 8064076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Original strand, 19738815 - 19738848
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19738815 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 19738848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Original strand, 52572310 - 52572343
Alignment:
Q  115 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcc 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52572310 aaaaaataattatccgatactttccgatacgtcc 52572343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 148
Target Start/End: Original strand, 53322455 - 53322492
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcc 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  53322455 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatatgtcc 53322492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 52122869 - 52122833
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtc 147  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  52122869 ttttaaaaaataattatctgatactttccgatacgtc 52122833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 155
Target Start/End: Original strand, 52721382 - 52721426
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatac 155  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  52721382 ttttataaaataattatccgatactttccgatacgtaccggatac 52721426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 227 - 533
Target Start/End: Original strand, 40412659 - 40412965
Alignment:
Q  227 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40412659 gtaattgagttagtagagttatctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatgaaggagaggagattgagacgactaatg 40412758  T
Q  327 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40412759 ttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatatagtgctttttttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctctt 40412858  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40412859 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 40412958  T
Q  527 atgatgt 533  Q
     ||||||    
T  40412959 ttgatgt 40412965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 227 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 8171108 - 8170811
Alignment:
Q  227 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8171108 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctgctttgtatcttgttgatggaaatagaggagaggagattgagacgattaatg 8171009  T
Q  327 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8171008 ttaactaaaataacttaactcttgagtactgatatgctcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaccaatgttctttt 8170909  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattta 524  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8170908 tggatattgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattta 8170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 322 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 27109102 - 27108891
Alignment:
Q  322 taatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgtt 421  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27109102 taatgttaactaaaataacttaactgttaagtaccgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatttt 27109003  T
Q  422 ctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatat 521  Q
    | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  27109002 ccttttggatatagtatagcacttattgtgctctttttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaattgtcaatattatttatag 27108903  T
Q  522 ttatgatgatgt 533  Q
    ||||| ||||||    
T  27108902 ttatgttgatgt 27108891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 320 - 526
Target Start/End: Original strand, 7411811 - 7412017
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7411811 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagaaccgatgtgttcttttttgaacatagtgctttctttttggatcgatatagtataacactaacaatg 7411910  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||  |||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7411911 tttattttagatataatatagcattgatggtgctatttttgggatatattgtttatgcaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttac 7412010  T
Q  520 atttatg 526  Q
    |||||||    
T  7412011 atttatg 7412017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 354 - 533
Target Start/End: Original strand, 27968338 - 27968514
Alignment:
Q  354 actgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgct 453  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||   |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27968338 actgatgtgttcttttttggatatagtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgct 27968434  T
Q  454 ctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27968435 ctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 27968514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28876049 - 28875744
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  28876049 aattgagttagcagagttgtctttagatgaatcagatttggaagttgatttgtatcttgataatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 28875953  T
Q  329 aactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |   |   |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28875952 acttgttagt-tttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 28875856  T
Q  428 ggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    ||||||||| |||||             | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28875855 ggatatagtgtagcattgatgtttattcctgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatta 28875756  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  28875755 tttatatttatg 28875744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 3892206 - 3892364
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3892206 tatagtgcttcttttttggattgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgctctttttaggatatattgtgta 3892305  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3892306 tgtaattgactaatcatcgctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 3892364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 229 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 45216704 - 45216400
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  45216704 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagtttatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 45216608  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  45216607 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatataatgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttt 45216512  T
Q  427 tggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    ||||||||||             ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45216511 tggatatagtgtagcattgatgtatagcaatgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 45216412  T
Q  514 atttatatttat 525  Q
    ||||||||||||    
T  45216411 atttatatttat 45216400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 366 - 533
Target Start/End: Original strand, 20182622 - 20182789
Alignment:
Q  366 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtata 465  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||    
T  20182622 tttttttgatatggtgcttcttttttttatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacattaatggtgctctttttgggata 20182721  T
Q  466 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20182722 tattgtttatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 20182789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 354 - 533
Target Start/End: Original strand, 27886423 - 27886599
Alignment:
Q  354 actgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgct 453  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||   |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  27886423 actgatgtgttattttttggatatagtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggct 27886519  T
Q  454 ctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27886520 ctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 27886599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 354 - 533
Target Start/End: Original strand, 27945081 - 27945257
Alignment:
Q  354 actgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgct 453  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||   |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  27945081 actgatgtgttattttttggatatagtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggct 27945177  T
Q  454 ctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27945178 ctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 27945257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 354 - 533
Target Start/End: Original strand, 28025324 - 28025500
Alignment:
Q  354 actgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgct 453  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||   |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  28025324 actgatgtgttattttttggatatagtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggct 28025420  T
Q  454 ctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28025421 ctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 28025500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 5540056 - 5540361
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  5540056 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatggtaatgaaggagaggagatgcaaacg-tta--gtt 5540152  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  5540153 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatataatatagcactaacaa-gttccttt 5540248  T
Q  427 tggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||||||||| |||||             | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5540249 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaataaactaatgaacactctcttaatcgtcaatatt 5540348  T
Q  514 atttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||    
T  5540349 atttatatttatg 5540361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 341 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 32638589 - 32638393
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagt---- 436  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||        
T  32638589 ttaactctt-agtactcatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatattgtatagcactaacaa-gttccttttgaatatagtgtag 32638492  T
Q  437 ---------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32638491 catcgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 32638393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 32877830 - 32877996
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagc-------------accgatggtgctcttttt 459  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             || |||||||||||||||    
T  32877830 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcgttgatgtataacactgatggtgctcttttt 32877929  T
Q  460 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32877930 ggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctattaatcgtcaatattatttatatttatg 32877996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 36484059 - 36484362
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  36484059 aattgagttggcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 36484155  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36484156 acttgt--tagtgttaactttt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 36484251  T
Q  428 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||             ||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36484252 ggatatagtgtagcattgatgtataacactgatagtgctcttttt-atatatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatatta 36484350  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  36484351 tttatatttatg 36484362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Original strand, 4246563 - 4246857
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | |||  | | |||    
T  4246563 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg--tca-gtt 4246659  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  4246660 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 4246755  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||||||||| |||||  ||||             |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4246756 tggatatagtgtagcattgatgtataacaatgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 4246855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 6028865 - 6029031
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctcttttt 459  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||             |||||||||||    
T  6028865 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatgtataacactgctcgtgctcttttt 6028964  T
Q  460 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6028965 tgtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 6029031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 19436627 - 19436791
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||           | |||||| ||||||||||    
T  19436627 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataaccctgatggtactctttttgg 19436726  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19436727 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 19436791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 19572776 - 19572940
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||           | |||||| ||||||||||    
T  19572776 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataaccctgatggtactctttttgg 19572875  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19572876 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 19572940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 37669204 - 37669507
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  37669204 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 37669300  T
Q  329 aact-aaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |   ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  37669301 acttgttaata--ttaactctt-agtattgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcaatataatatagcactaacaa-gtttctttt 37669396  T
Q  428 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||             |||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  37669397 ggatatactgtagcattgatgtataatactgatagtgctcttttt-gtatatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatatta 37669495  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  37669496 tttatatttatg 37669507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 37372502 - 37372652
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||       ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37372502 tatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcact-------ttctttt-ggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgta 37372593  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37372594 tgtaattgactaatcatcattctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 37372652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 341 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 41098855 - 41098663
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag 440  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| | ||| |||| |||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||||||     
T  41098855 ttaattctggagtaccgatgtgttcttttatggatatagtgtttcttgtttggatcaatatagtataacattaacaatgtacattttagatatagtataa 41098756  T
Q  441 caccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  41098755 cactaattgtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcataattatttatattaatgttgatgt 41098663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 341 - 526
Target Start/End: Original strand, 32760098 - 32760293
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata------ 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||          
T  32760098 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgtag 32760195  T
Q  435 -------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
           ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32760196 cattgatgtataacactgatagtgctcttttt-gtatatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatg 32760293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 500
Target Start/End: Original strand, 38388876 - 38389054
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  38388876 attaatgttgactaaaaaaacttaactctcgagtactgatgtgttcttttatggatgtagagtttcttttttgaatcgatatagtataacactaacaatg 38388975  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctctt 500  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38388976 ttcattttggataaaatatagcactcatgatgctc--tttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatcattctctt 38389054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12580019 - 12579708
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  12580019 aattgagtcagcagagctgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 12579923  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12579922 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 12579827  T
Q  428 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatata--------ttgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgt 506  Q
    |||||||             ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||        ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12579826 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatagtgctcttttt-gtatatattgcgatgttgcgtatgtaattgactaatgaacactctcttaatcgt 12579728  T
Q  507 caatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12579727 caatattatttatatttatg 12579708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34900853 - 34900556
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  34900853 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 34900757  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  34900756 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 34900661  T
Q  427 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 510  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34900660 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 34900561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 25022529 - 25022693
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||           | |||||||||||||||||    
T  25022529 gatatagtgtttcttttttggatcaatatagtatagcattatcaatgttctttttggatatagtgtagcattgatataacactgatggtgctctttttgg 25022628  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25022629 tatattttgcatatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 25022693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 510
Target Start/End: Original strand, 32425130 - 32425316
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat- 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  32425130 attaatgttaactaaaataacttaactcttga-------tgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagattgatatagtataacactaacaata 32425222  T
Q  419 --gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 510  Q
      |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  32425223 atgttctttttgaatatagtataacattgatgatgctattttggggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaat 32425316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Original strand, 28737780 - 28737920
Alignment:
Q  393 gatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacc 492  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28737780 gatcgatataatataccattaataatgtttcttttggatatagtatagcacttattgtgctttttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatc 28737879  T
Q  493 actctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28737880 actcttttaatcgtcaatgttatttatatttatgttgatgt 28737920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 42949444 - 42949608
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||           |||||| ||||||||||||    
T  42949444 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatcgcactaacaatgtttatttttgatataaaatagcattgatataacaccgatgatgctctttttgg 42949543  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42949544 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatgtatatttatg 42949608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 375 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 5818207 - 5818051
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcacc-gatggtgctctttttggtatatattgtgt 473  Q
    |||||| ||||  |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||| || |||||||||||    
T  5818207 tatagtacttctgttttggattgatgtagtatagcactaacaatgttccttttgaatatagtatagcatttgatggtgctcttttggg-atatattgtgt 5818109  T
Q  474 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  5818108 atgtagttgactaatcatcactttcttaatggacaatattatttatatttatgttgat 5818051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 435 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 43770974 - 43770883
Alignment:
Q  435 gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43770974 gtataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtcaatattatttatatttatg 43770883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 533
Target Start/End: Original strand, 32856 - 33005
Alignment:
Q  387 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggt---atatattgtgtatgtaattga 483  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||| || | |||||  |   ||||||||| |||||||||||    
T  32856 tttttggatcaatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatgatgttttttttttttggatatattgtatatgtaattga 32955  T
Q  484 ctaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32956 ctaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 33005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 19947718 - 19947554
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgat-----------ggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| ||  |||           ||||||||||||||    
T  19947718 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacattaacaatgtttcttttgggtatagtataacattgatataacactggtggtgctctttttgg 19947619  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19947618 tatgttttgcgtatgtaattgactaatcaccactgtgttaatcgtcaatattatttatatttatg 19947554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43771198 - 43771115
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43771198 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagat 43771115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 341 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22201194 - 22201008
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  22201194 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagtactaacaagtttctttt-ggatatagtgta 22201097  T
Q  440 gcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    |||  ||||             ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22201096 gcattgatgtataacactgttggtgctatttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 22201008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 460
Target Start/End: Original strand, 29355865 - 29355967
Alignment:
Q  358 atgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttt 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||    
T  29355865 atgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttttattaatatagtataacactaacaatgtttcttttgaatatagtatagcactcatggtgctattt 29355964  T
Q  458 ttg 460  Q
    |||    
T  29355965 ttg 29355967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8171235 - 8171186
Alignment:
Q  115 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8171235 aaaaaataattattcgataatttccgatacatcccggatacgcgaaggat 8171186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 148
Target Start/End: Original strand, 32759491 - 32759528
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcc 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32759491 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatacgtcc 32759528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 158
Target Start/End: Original strand, 40412536 - 40412579
Alignment:
Q  115 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcg 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40412536 aaaaaataattatccgatacttttcgatacgtcccggatacgcg 40412579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43771055 - 43771004
Alignment:
Q  366 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaa 417  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  43771055 ttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa 43771004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 354
Target Start/End: Original strand, 3892173 - 3892207
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3892173 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 3892207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5818240 - 5818206
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5818240 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 5818206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22201337 - 22201304
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22201337 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 22201304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34901382 - 34901349
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34901382 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 34901349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 234 - 533
Target Start/End: Original strand, 3212692 - 3212991
Alignment:
Q  234 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3212692 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 3212791  T
Q  334 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 433  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3212792 aaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 3212891  T
Q  434 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3212892 agtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 3212991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 227 - 533
Target Start/End: Original strand, 32018220 - 32018518
Alignment:
Q  227 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||       ||    
T  32018220 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccaaatttggaagctggtttgtatcttattgatggaaatggaagataggaaattgaga-------tg 32018312  T
Q  327 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32018313 ttaactaaaataacttaactcttgagtact-atgtgttcttttttcgatatagtgtttcttttttagattgatatagtataacactaacaatgttctttt 32018411  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32018412 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 32018511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 10894428 - 10894214
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10894428 attaatgttaactaaaattacttaactctcgagtattgatgtgttctttgttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatg 10894329  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta-ttta 518  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10894328 ttccttttggatatagtatagcactgatggtgttctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttta 10894229  T
Q  519 tatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| ||||||    
T  10894228 tatttatgctgatgt 10894214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 6707950 - 6707736
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttag-atcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6707950 attaatgttgactaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttcttttatggatataatgcttctttttttggatcaatatagtataacactaacaat 6707851  T
Q  419 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6707850 gttcattttggatatagtatagcattgatggtgctccttttgggatgtattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattattta 6707751  T
Q  519 tatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| ||||||    
T  6707750 tatttatgttgatgt 6707736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 7255130 - 7255340
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaac-aat 418  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  7255130 attaatgttaacttaaataacttaactcttgagtactgatgtgttatttttttgatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacattaacaaat 7255229  T
Q  419 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7255230 gttccttttggatatagtatagcactgattgtgctctttgtgggatatattg----tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattta 7255325  T
Q  519 tatttatgatgatgt 533  Q
    |||| ||| ||||||    
T  7255326 tattaatgttgatgt 7255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 11105495 - 11105709
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcga-tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||  | || ||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11105495 attaatgttaaataaaataaattaattcttgagtattgatatgttcttttttttaatacagtgcttctcttttggattgatatagtataacactaacaat 11105594  T
Q  419 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 518  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11105595 gttcattttggatataaaataacactgatggtgctctttttgggatatattatgtatgtaattggctaataaccactctcttaatcgtcaatattattta 11105694  T
Q  519 tatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| ||||||    
T  11105695 tatttatgttgatgt 11105709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 13061283 - 13061071
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  13061283 attaatattaactaaaataacttaatttttgagtattgatgtgttattttttggatatagcgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaatgatc 13061184  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| | |||| ||||||||| ||| |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13061183 ttcctcttgggtatagtataacactgatgctgtt-tttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 13061085  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  13061084 atttatgttgatgt 13061071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 229 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 7188262 - 7187957
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | | |||  |||    
T  7188262 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaatg-tta--gtt 7188166  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttc--gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttt 425  Q
    |  |    || | ||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7188165 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctt 7188070  T
Q  426 ttggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatat 512  Q
    |||||||||||             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7188069 ttggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattaactaatgatcactctcttaatcgtcaatat 7187970  T
Q  513 tatttatatttat 525  Q
    |||||||||||||    
T  7187969 tatttatatttat 7187957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 13045285 - 13045078
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     || |||||| |||||||   ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  13045285 attaatgtcaactaaaataacttaactcttgagtactg-----ttattttttggatatagcatttcttttttggattgatatagtataacactaacgatc 13045191  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13045190 ttccttttggatatagtattgcactgatggtgcttttttagg-atatattgtgtatgtaattggctaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 13045092  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  13045091 atttatgttgatgt 13045078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 229 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22989109 - 22988838
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaa---t 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||   |    
T  22989109 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgtgaatggaggagagaagattgagacaattaatatt 22989010  T
Q  326 gttaactaaaataa-tttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctt 424  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||                    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22989009 gttaactaaaataactttaactcttgagaac-gatgtgttct--------------------tttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttcct 22988931  T
Q  425 tttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttata 520  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22988930 tttggatacagtataacactgatggtgttccttttgggatatattgtgtat---tttgactaatcatcactcgcttaatcgtcaatattacttata 22988838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 229 - 520
Target Start/End: Original strand, 23799287 - 23799558
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaa---t 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||   |    
T  23799287 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgtgaatggaggagagaagattgagacaattaatatt 23799386  T
Q  326 gttaactaaaataa-tttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctt 424  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||                    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23799387 gttaactaaaataactttaactcttgagaac-gatgtgttct--------------------tttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttcct 23799465  T
Q  425 tttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttata 520  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23799466 tttggatacagtataacactgatggtgttccttttgggatatattgtgtat---tttgactaatcatcactcgcttaatcgtcaatattacttata 23799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 27084216 - 27084374
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27084216 tatagtgcttcttttttgaatcgatatagtatagaactaacaatgttcctttcggatatagtataacacttatgatgctctttttgggatatattgtgta 27084315  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27084316 tgtaattgactaaccatcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttgatgt 27084374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 341 - 533
Target Start/End: Original strand, 26327525 - 26327717
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag 440  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||     
T  26327525 ttaactctggagtaccgatgtgttcttttatggatatagtgcttcttttttggatcaatatagtataacactaacaatgtacattttagatatagtataa 26327624  T
Q  441 caccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||  || ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  26327625 cactaattgtgctctttttgagatatattgtctatgtaactgactaatcatcactctcttaatcgtcataattatttatattaatgttgatgt 26327717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 19128395 - 19128554
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttg-gtatatattgtgt 473  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||  | |||||||||||    
T  19128395 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgctttttttttggatatattgtgt 19128494  T
Q  474 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19128495 atgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgt 19128554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 8357516 - 8357820
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | | |||  |||    
T  8357516 aattgagttagcagagttgtctttggatgaacctgatttggaagcttatttgtatcttgatgatggtaatggaggagaggagatttaaatg-tta--gtt 8357612  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  8357613 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcaatataatatagtactaacaa-gttcctttt 8357708  T
Q  428 ggat-atagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||| |||||             |||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8357709 ggattatagtgcaacattgatgtatagtactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 8357807  T
Q  514 atttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||    
T  8357808 atttatatttatg 8357820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 32130401 - 32130237
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||           | |||||||||||||||||    
T  32130401 gatatagtgcttcttttttggatcaatatagtatagcattaacaatgttccttttggataaagtataacatttatataacactgatggtgctctttttgg 32130302  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32130301 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 32130237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1036298 - 1036001
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  1036298 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 1036202  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  1036201 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 1036106  T
Q  427 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 510  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1036105 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 1036006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 234551 - 234715
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggt------atatat 468  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| | |||||  |      ||||||    
T  234551 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactgacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgtttttttttttttttttatatat 234650  T
Q  469 tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  234651 tgtgtatgtagttgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 234715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 408 - 533
Target Start/End: Original strand, 3299334 - 3299459
Alignment:
Q  408 gcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtc 507  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  3299334 gcacgaacaatgttccttttggatatattatagcactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcattactctcttaatcgtt 3299433  T
Q  508 aatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  3299434 aatgttatttatattcatgttgatgt 3299459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 320 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 13607694 - 13607489
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgat-------atagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcact 412  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||   |       |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  13607694 attaatgttaactaaaataacttaattcttgagtattgatgtgttttttttttttttttttttatagtgcttcttttttggatcgatttagtataacact 13607595  T
Q  413 aacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatat 512  Q
     ||||| ||  ||||| ||||| |||| ||   ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13607594 tacaatttttcttttgaatataatataaca---atgatgttctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatat 13607498  T
Q  513 tatttatat 521  Q
    | |||||||    
T  13607497 tgtttatat 13607489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 373 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 31740558 - 31740394
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata-------------gtatagcaccgatggtgctcttttt 459  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||             ||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  31740558 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatataatataacattgatgtataacactgattgtgctattttt 31740459  T
Q  460 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattta 524  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31740458 ggtatattttgcgtatgcaaatgactaatccccactctctttatcgtcaatattatttatattta 31740394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 30386101 - 30386194
Alignment:
Q  17 tttgcacctttacctttttgaatttcatcattagcaatcatatttgtgatgttaattttttgatctgcttgcaattggtcgtgccttttagaag 110  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  30386101 tttgcacctttacccgtttgaagttcatcattagcaatcatatttgtgatgttaatttcttgagcggcttgcaattgatcatgccttttagaag 30386194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 341 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 31195725 - 31195551
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata----- 434  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||         
T  31195725 ttaactctt-agtactgttgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 31195628  T
Q  435 --------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 503  Q
            ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  31195627 gcattgatgtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaat 31195551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 431
Target Start/End: Original strand, 31079813 - 31079924
Alignment:
Q  325 tgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagat-----cgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||      ||||||||||| || ||||||||    
T  31079813 tgttaactaaaataacttaaatcttgaatactgatgtgttcttttttggatatagtgtttcttttttggattgatatgatatagtatatcattaacaatg 31079912  T
Q  420 ttctttttggat 431  Q
    ||| ||||||||    
T  31079913 ttccttttggat 31079924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 466 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 4153325 - 4153258
Alignment:
Q  466 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4153325 tattgtgtaagtaattgagtgatcatcactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttgatgt 4153258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 354
Target Start/End: Original strand, 27084183 - 27084217
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27084183 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 27084217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1036826 - 1036793
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1036826 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 1036793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 8357080 - 8357112
Alignment:
Q  115 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtc 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8357080 aaaaaataattatccgatactttccgatacgtc 8357112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 234 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9283856 - 9283557
Alignment:
Q  234 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9283856 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 9283757  T
Q  334 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 433  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9283756 aaataatttaactcttgagtaattatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 9283657  T
Q  434 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9283656 agtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 9283557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 234 - 533
Target Start/End: Original strand, 25969627 - 25969926
Alignment:
Q  234 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25969627 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 25969726  T
Q  334 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 433  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25969727 aaataatttaactcttgagtaattatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 25969826  T
Q  434 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25969827 agtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 25969926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 234 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9250304 - 9250007
Alignment:
Q  234 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 333  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9250304 agttagtagagttg-ctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 9250206  T
Q  334 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 433  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9250205 aaataatttaactcttgagtaattatgtgt-ctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 9250107  T
Q  434 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9250106 agtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 9250007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 23079018 - 23078805
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23079018 attaatgttaattaaaataacttaactcttaagtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatg 23078919  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078918 ttcctttttgatatagtatagcactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgagtaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 23078819  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  23078818 atttatgttgatgt 23078805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15878333 - 15878120
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15878333 attaatattaactaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttctttttttaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 15878234  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15878233 ttcattttggatatagtataacactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 15878134  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  15878133 atttatgttgatgt 15878120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 320 - 531
Target Start/End: Original strand, 33454276 - 33454487
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33454276 attaatgttgactaaaaaaacttaactcttgagtacttatgtgttcttttatggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatg 33454375  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||| ||||||    
T  33454376 ttcattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaatcgactaatcatcattctcttaatcgtcggtataatttat 33454475  T
Q  520 atttatgatgat 531  Q
    ||||||| ||||    
T  33454476 atttatgttgat 33454487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 320 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 1400177 - 1399972
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1400177 attaatgttaattaaaataacttaactcttaagtattgatgtgttattttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 1400078  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1400077 ttccttttggatatagtataacattgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaataatcactatcttaatcgtcaatattatttat 1399978  T
Q  520 atttat 525  Q
    ||||||    
T  1399977 atttat 1399972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 35160070 - 35160285
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaa----c 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |    
T  35160070 attaatgttaattaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttagata--gtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaattaac 35160167  T
Q  416 aatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||    
T  35160168 aatgttccttttggatatagtatagcactaatggtgctttttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaattattaatgttat 35160267  T
Q  516 ttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  35160268 ttatatttatgttgatgt 35160285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 36763705 - 36763488
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaa---- 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||        
T  36763705 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgtcctttttttggatatagtgcctcttttttggatcgatatagtataacactaattaa 36763606  T
Q  415 caatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  36763605 caatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgctttttttgg-atatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatgtta 36763507  T
Q  515 tttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  36763506 tttatatttatgttgatgt 36763488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 36757925 - 36757708
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcact----aac 415  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||    |||    
T  36757925 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgtcattttttgtatatagtgcttattttttggatcgatatagtataacactgattaac 36757826  T
Q  416 aatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  36757825 aatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgcttttcttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatgttat 36757726  T
Q  516 ttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  36757725 ttatatttatgttgatgt 36757708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 36767449 - 36767232
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcact----aac 415  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||    |||    
T  36767449 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgtcattttttgtatatagtgcttattttttggatcgatatagtataacactgattaac 36767350  T
Q  416 aatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  36767349 aatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgcttttcttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatgttat 36767250  T
Q  516 ttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  36767249 ttatatttatgttgatgt 36767232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 234 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47720083 - 47719952
Alignment:
Q  234 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47720083 agttagtagagttgtctttggatgagccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 47719984  T
Q  334 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttc 365  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47719983 aaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 47719952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 48153784 - 48153942
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48153784 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcacttatgatgctctttttgggatatattgtgta 48153883  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  48153884 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaccattatttatatttatgttgatgt 48153942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 21409629 - 21409787
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21409629 tataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatatttcttttggatatagtatagcacttatgttgctctttttggaatatattgtgta 21409728  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21409729 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttacatttatgttgatgt 21409787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 36661100 - 36661404
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  36661100 aattgagttagaagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatgcaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 36661196  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  36661197 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatacagtgcttcttttttggatcgataaagtataacactaacaa-gttcctttt 36661292  T
Q  428 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||||             ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36661293 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattacgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatta 36661392  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  36661393 tttatatttatg 36661404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 229 - 402
Target Start/End: Original strand, 11058563 - 11058734
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11058563 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatgaaggagagaagattgagacaattaatgtt 11058662  T
Q  329 aactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatata 402  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  11058663 aactaaaataacttaactcttgtgtactgatgtgttcttttttggatatagttctt--tttttggatcgatata 11058734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 375 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23970002 - 23969862
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23970002 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggataaattgtgta 23969903  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23969902 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattat 23969862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 366 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 19820861 - 19820694
Alignment:
Q  366 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtata 465  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||    
T  19820861 ttttttggatatagtgcttctttttcgaatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtataatactgatggtgctctttttgagata 19820762  T
Q  466 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19820761 tattgtgcatgtaattgactaatcatcactattttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 19820694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 366 - 533
Target Start/End: Original strand, 44269972 - 44270139
Alignment:
Q  366 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtata 465  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||    
T  44269972 tttttttgatatggtgcttcttttttttatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacattaatggtgctctttttgggata 44270071  T
Q  466 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44270072 tattgtttatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 44270139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 11830324 - 11830627
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  11830324 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttgaaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 11830420  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11830421 actt--gttagtgttaactctt-agtactgacgtgttcttttttggatataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 11830516  T
Q  428 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||             ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  11830517 ggatataatgtagcattgatgtatagcactgatggtgctcttttt-gtatatattgcgtatgtaattgaccaatgaccactatcttaattgtcaatatta 11830615  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  11830616 tttatatttatg 11830627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16564097 - 16563933
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag-----------caccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||    
T  16564097 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagtattgatataacactgatggtgctctttttgg 16563998  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16563997 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 16563933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 16601565 - 16601729
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag-----------caccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||    
T  16601565 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagtattgatataacactgatggtgctctttttgg 16601664  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16601665 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 16601729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 36413609 - 36413766
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  36413609 tatagtgcttctttttt-gatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacaccgatgatgctctttttaggatatattgtgta 36413707  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36413708 tgtaattgattaagcatcactcacttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 36413766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 329 - 533
Target Start/End: Original strand, 38064881 - 38065089
Alignment:
Q  329 aactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttc----gatatagtgcttcctttttag-atcgatatagtatagcactaacaatgttct 423  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| |     ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  38064881 aactaaaataacttaacttttgagtactaatgtgtttttttgtgtgtggatatagtgcttctttttttggatcgatataatataacactaacaatgttcc 38064980  T
Q  424 ttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 523  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  38064981 ttttggatatagtatagcact-atggtgctctttttgggatatattgcgtatgtaattgactaatcatgactatcttaatcatcaatattgtttatattt 38065079  T
Q  524 atgatgatgt 533  Q
    ||| ||||||    
T  38065080 atgttgatgt 38065089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 554766 - 554608
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  554766 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgtatcttttagatatagtatatcacttatgatgctctttttgggatatattgtgta 554667  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  554666 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgttaatattacttatatttatgttgatgt 554608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 351 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 47238116 - 47237929
Alignment:
Q  351 agtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagt------------at 438  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||            ||    
T  47238116 agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttgaatcgatatagtatagcattaacaatgtcccttttggatgtagttagcattgatgtat 47238017  T
Q  439 agcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47238016 agcactggtggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcatcactttcttaatcgtcaatattatttatatttatg 47237929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 322 - 533
Target Start/End: Original strand, 21180044 - 21180237
Alignment:
Q  322 taatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgtt 421  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||      ||||||||||         
T  21180044 taatgataactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttattttttggatcgata------agcactaaca----- 21180132  T
Q  422 ctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatat 521  Q
           ||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21180133 -------gatatagtataacactgatgatgttctttttgggatatattgtatatctaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatat 21180225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1042924 - 1042758
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-------------ccgatggtgctcttttt 459  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||             | |||||||||||||||    
T  1042924 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatataatatagcattgatgtataacactgatggtgctcttttt 1042825  T
Q  460 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1042824 ggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatg 1042758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26773437 - 26773271
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctcttttt 459  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||             |||||||||||    
T  26773437 gatataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccgtttggatatagtatagcattgatgtataacactaatggtgctcttttt 26773338  T
Q  460 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26773337 ggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 26773271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27397599 - 27397298
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | | |||  |||    
T  27397599 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttgaaagctaatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaatg-tta--gtt 27397503  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  27397502 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtttt-ttttttggatataatgcttcttttttggatcgatatattatagcactaacaa-gttcctttt 27397408  T
Q  428 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    | |||||||             ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27397407 gaatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatta 27397309  T
Q  515 tttatatttat 525  Q
    |||||||||||    
T  27397308 tttatatttat 27397298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 398 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 44959168 - 44959041
Alignment:
Q  398 atatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactct 497  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44959168 atatagtatagcactagcaatgttccttttggatatagtacaacactcatagtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactct 44959069  T
Q  498 cttaatcgtcaatattatttatatttat 525  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44959068 cttaatcgtcaatattatttatgtttat 44959041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 373 - 523
Target Start/End: Original strand, 19510887 - 19511041
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg----gtgctctttttggtatatat 468  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||    ||||||||||| |||||| |    
T  19510887 gatatagtgcttctttcttggatcgatataatataacactagcaatgttccttttggatatagtataacattgatgtatggtgctcttttttgtatattt 19510986  T
Q  469 tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 523  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19510987 tgagtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatattt 19511041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Original strand, 40096293 - 40096590
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  40096293 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 40096389  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  40096390 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgatttttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 40096485  T
Q  427 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 510  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40096486 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 40096585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 436 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 47719948 - 47719858
Alignment:
Q  436 tatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47719948 tatatcaccgatggtgctctttttggtatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 47719858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 388 - 533
Target Start/End: Original strand, 24956501 - 24956644
Alignment:
Q  388 ttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccg-atggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 486  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24956501 ttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttgga---agtatagcactttatggtgctctctttgggatatattatgtatgtaattgacta 24956597  T
Q  487 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24956598 atcatcactctattaattgtcaatattatttatatttatgttgatgt 24956644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 377 - 526
Target Start/End: Original strand, 4291937 - 4292096
Alignment:
Q  377 tagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttggtata 465  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||           | |||| ||||||||||||||||    
T  4291937 tagtgcttc-tttttggatcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatataacactgatgatgctctttttggtata 4292035  T
Q  466 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4292036 ttttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgttaatagtatttatatttatg 4292096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 8029071 - 8029237
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-------------ccgatggtgctcttttt 459  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||             | |||||||||||||||    
T  8029071 gatatagtacttcttttttgaatcgatatactatagcactaacaatgtttcttttagatatagtatagcattgatgtataacactgatggtgctcttttt 8029170  T
Q  460 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8029171 ggtatattttgcgtatgtaagtgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 8029237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 26973296 - 26973458
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggt----gctctttttggtatatattg 470  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||  |||||    |  ||||||  |||||||||    
T  26973296 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtacaacacttatggtataagtgcttttttttatatattg 26973395  T
Q  471 tgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
      ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26973396 gatatgtaattgagtaattgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 26973458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 418 - 533
Target Start/End: Original strand, 40053573 - 40053688
Alignment:
Q  418 tgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattt 517  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  40053573 tgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgaggtatattgcatatgtaattgactaatcatcactctcttagtcatcaatattattt 40053672  T
Q  518 atatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||| ||||||    
T  40053673 atatttatgttgatgt 40053688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 341 - 515
Target Start/End: Original strand, 16851046 - 16851232
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  16851046 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaagtttctttt-ggatatagtgta 16851143  T
Q  440 gcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    |||  ||||             |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16851144 gcattgatgtataatactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattatctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 16851232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 305270 - 305363
Alignment:
Q  17 tttgcacctttacctttttgaatttcatcattagcaatcatatttgtgatgttaattttttgatctgcttgcaattggtcgtgccttttagaag 110  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  305270 tttgcacctttacccgtttgaagttcatcattagcaatcatatttgtgatgttaatttcttgagcggcttgcaattgatcatgccttttagaag 305363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 2828847 - 2828754
Alignment:
Q  17 tttgcacctttacctttttgaatttcatcattagcaatcatatttgtgatgttaattttttgatctgcttgcaattggtcgtgccttttagaag 110  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  2828847 tttgcacctttacccgtttgaagttcatcattagcaatcatatttgtgatgttaatttcttgagcggcttgcaattgatcatgccttttagaag 2828754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 445 - 526
Target Start/End: Original strand, 39521422 - 39521503
Alignment:
Q  445 gatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39521422 gatgatgctcttttttgtatatattgcgtatgtaattgattaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 39521503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 531
Target Start/End: Original strand, 35136297 - 35136424
Alignment:
Q  404 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 503  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||   ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  35136297 tatagcactaataatgttcattttgaatatattatagcattaatgatgctctttttgagatatattgtatatgtaattgactaatcatcattctcttaat 35136396  T
Q  504 cgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
     | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  35136397 tgccaatattacttatatttatgttgat 35136424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 445 - 533
Target Start/End: Original strand, 11058745 - 11058833
Alignment:
Q  445 gatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11058745 gatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgacaaatcatcattctcttaatcgtcaatattacttatatttatgttgatgt 11058833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 391
Target Start/End: Original strand, 40041584 - 40041655
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttccttttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  40041584 attaatgttaactaaaataatttaactattgagtactgatgtgttcttttttagatataatgcttctttttt 40041655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 341 - 515
Target Start/End: Original strand, 48163671 - 48163849
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata----- 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||         
T  48163671 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 48163768  T
Q  435 --------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
            ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  48163769 gcattgatgtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat 48163849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 341 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27555221 - 27555043
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata----- 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||         
T  27555221 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatatagtgta 27555124  T
Q  435 --------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
            ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  27555123 gcattgatgtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat 27555043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 341 - 442
Target Start/End: Original strand, 27354184 - 27354284
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  27354184 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatataatatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 27354281  T
Q  440 gca 442  Q
    |||    
T  27354282 gca 27354284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 320 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44960044 - 44959993
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44960044 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 44959993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 164
Target Start/End: Original strand, 25969513 - 25969566
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 164  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25969513 ttttataaaataattatccgatactttccgatacgtcccggatacgcgaaggat 25969566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9250414 - 9250367
Alignment:
Q  117 aaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9250414 aaaataattatccgatactttccgatacgtcccggatacgcgaaggat 9250367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 150
Target Start/End: Original strand, 48163523 - 48163562
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctg 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48163523 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatacatcctg 48163562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 354
Target Start/End: Original strand, 21409596 - 21409630
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21409596 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 21409630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 354
Target Start/End: Original strand, 24956457 - 24956491
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24956457 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 24956491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 145
Target Start/End: Original strand, 42897106 - 42897140
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacg 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42897106 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatacg 42897140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Original strand, 11829808 - 11829841
Alignment:
Q  115 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcc 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11829808 aaaaaataattatccgatactttccgatacgtcc 11829841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Original strand, 27354036 - 27354069
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27354036 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 27354069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27555369 - 27555336
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27555369 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 27555336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Original strand, 40095765 - 40095798
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40095765 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 40095798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 147
Target Start/End: Original strand, 38263114 - 38263150
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtc 147  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38263114 ttttaaaaaataattatctgatactttccgatacgtc 38263150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 234 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 30777405 - 30777106
Alignment:
Q  234 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30777405 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 30777306  T
Q  334 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 433  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30777305 aaataatttaactcttgagtaattatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 30777206  T
Q  434 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30777205 agtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 30777106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 227 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 6243045 - 6242726
Alignment:
Q  227 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6243045 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagattttgaagctggtgtgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 6242946  T
Q  327 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-----------atatagtgcttcctttttagatcgatata--gtatagcacta 413  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||             |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  6242945 ttaactaaaacaatttaactcttaaatactgatgtgttctttttttttttttttttttatatagtgcttcttttttagatcgatatatagtataacacta 6242846  T
Q  414 acaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6242845 acaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctttttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatatt 6242746  T
Q  514 atttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  6242745 atttatattaatgttgatgt 6242726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 227 - 519
Target Start/End: Original strand, 11907407 - 11907699
Alignment:
Q  227 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 326  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11907407 gtaattgagttactagagttttctttggatgaaccacatttgaaagctgatttgtatcttgatgacgggaatggaggagaggagattgagacgattaatg 11907506  T
Q  327 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| | |||    
T  11907507 ttaactaaaataacttaactcctgagtactgatgtattctttttttgatatagtgcttcttttttggatcgatatattataacaccaacaatgtaccttt 11907606  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11907607 tggatatagtataacactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 11907699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 26691825 - 26692039
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  26691825 attaatgttaactaaaataacttaagttttgagtactgatgtgttatttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatagagtataacactaacaat 26691924  T
Q  419 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 518  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26691925 gttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattta 26692024  T
Q  519 tatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| ||||||    
T  26692025 tatttatgttgatgt 26692039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 26961557 - 26961771
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  26961557 attaatgttaactaaaataacttaagttttgagtactgatgtgttatttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatagagtataacactaacaat 26961656  T
Q  419 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 518  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26961657 gttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattta 26961756  T
Q  519 tatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| ||||||    
T  26961757 tatttatgttgatgt 26961771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 320 - 525
Target Start/End: Original strand, 27085558 - 27085762
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27085558 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactaacaatg 27085657  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27085658 ttcattttgaatatagtatagcactcgtggtgctctttttgg-atatattgtgtatgtaattgactaattatcactttcttaatcatcaatattatttat 27085756  T
Q  520 atttat 525  Q
    | ||||    
T  27085757 aattat 27085762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 320 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 17138163 - 17137962
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17138163 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggattgatataatatagcactaacaatg 17138064  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17138063 ttccttttgcatataatatagcattgatggtgctc-ttttgggatatattgtgtatatatttgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 17137965  T
Q  520 att 522  Q
    |||    
T  17137964 att 17137962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 320 - 526
Target Start/End: Original strand, 5722186 - 5722392
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  5722186 attaatgttgactaaaaaaacttaactcttgagtacttatgtgttcttttatggatatagtgcttcttttttgaatcgatataggataacactaacaatg 5722285  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  5722286 tttattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaatcgactaatcatcattctcttaatcgtcagtataatttat 5722385  T
Q  520 atttatg 526  Q
    |||||||    
T  5722386 atttatg 5722392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 26716515 - 26716673
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26716515 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttcattttggatatagtataacacctatggtgctctttttgggatatattgtgta 26716614  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26716615 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 26716673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 26986255 - 26986413
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26986255 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttcattttggatatagtataacacctatggtgctctttttgggatatattgtgta 26986354  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26986355 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 26986413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 366 - 532
Target Start/End: Original strand, 3701319 - 3701484
Alignment:
Q  366 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtata 465  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  3701319 ttttttggatacagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgctctttttgg-ata 3701417  T
Q  466 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatg 532  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3701418 tattgtgcatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattttttatatttatgttgatg 3701484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 30284514 - 30284296
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30284514 attaatgttaactaaaataacttaactcctgagtagtgatgtgttcttttttgaatatagtgctt--tttttggatcgatatagtataacactaacaatg 30284417  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttttt-------ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatat 512  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||        | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30284416 ttcattttggatatagtatagcactaatggtgttttttttttttttgtggatatattgtgtttctaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatat 30284317  T
Q  513 tatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  30284316 tatttatatttatgttgatgt 30284296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 387 - 533
Target Start/End: Original strand, 21251738 - 21251884
Alignment:
Q  387 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 486  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21251738 tttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgttctttttgcgatatattgtgtatgtaattgacta 21251837  T
Q  487 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21251838 atcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 21251884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 22738047 - 22738253
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22738047 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagcactgatgtgttctttttg-gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatg 22738145  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta---atcaccactctcttaatcgtcaatattatt 516  Q
    ||| |||||||||||||||| ||          ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22738146 ttccttttggatatagtataaca---------ttctttttgggatatattgtgtatgtaactgactaaatatcatcactctcttaatcgttaatattatt 22738236  T
Q  517 tatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||| ||||||    
T  22738237 tatatttatgttgatgt 22738253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 375 - 531
Target Start/End: Original strand, 27938401 - 27938557
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27938401 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtgtagcactaacagtgttccttttggatatagtatagcacgtatggtgctctttttgggatatattgtgta 27938500  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27938501 tgtaattgactaattatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgat 27938557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 25749848 - 25750006
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25749848 tatagtgcttcttttttggatcgatgtaatatagcactaacaatgttcattttggatatagtgtagcacttatggtgctctttttgagatatattgtgta 25749947  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25749948 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 25750006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 320 - 515
Target Start/End: Original strand, 34032571 - 34032754
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||        
T  34032571 attaatgttaactaaaataatttaacttttgagtactaatgtgttctttttttaatatagtgcttattttttggatcgataaagtatagcactaac---- 34032666  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34032667 --------ggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattat 34032754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 518
Target Start/End: Original strand, 15066445 - 15066598
Alignment:
Q  365 cttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtat 464  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15066445 cttttttggatataatgcttcttttttggatcaatatagtataacactaacaatgttcctttcggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggat 15066544  T
Q  465 atattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15066545 atattgtgtatgtaattgactaatcattactctcttaatcgtcaatattattta 15066598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 320 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 18001875 - 18001675
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||         
T  18001875 attaatgttaactaaaataacttaattattgagtactgatgtgttcttttttgaatatagtgcttcttttttggatcgataaagtatagcactaa----- 18001781  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  18001780 -------tggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggatatattggatatgtaattgattaatcatcactctcttacttgtcaatattatttat 18001688  T
Q  520 atttatgatgatg 532  Q
    ||||||| |||||    
T  18001687 atttatgttgatg 18001675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 39690213 - 39689908
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||  | ||| |||  |||    
T  39690213 aattgagttagcagagttgtctttggatgaatcggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgagaatggatgagaggagatgtaaacg-tta--gtt 39690117  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  39690116 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttt 39690021  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||||||||| |||||  ||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39690020 tggatatagtgtagcattgatgtatagctatgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 39689921  T
Q  514 atttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||    
T  39689920 atttatatttatg 39689908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 380 - 533
Target Start/End: Original strand, 7629293 - 7629446
Alignment:
Q  380 tgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaa 479  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7629293 tgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtatcttttggatatagtatagcactaatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtca 7629392  T
Q  480 ttgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7629393 ttgactaatcatcactctcttaatcgccaatattatttatatttatgttgatgt 7629446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 1795635 - 1795794
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttttt-ggtatatattgtgt 473  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||| |    
T  1795635 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgcttttttttgggatatattgtat 1795734  T
Q  474 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1795735 atgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 1795794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 375 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3934663 - 3934512
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  3934663 tataatgcttcttttttggatcgatataatataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatgatgatctttttgagatatattgtgta 3934564  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3934563 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 3934512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Original strand, 9792932 - 9793226
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||  | |||  | | |||    
T  9792932 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgagaatggaggagaggagatgtaaacg--tca-gtt 9793028  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  9793029 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 9793124  T
Q  427 tggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||||||||| |||||             | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9793125 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 9793224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1639271 - 1638970
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  1639271 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttgcaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 1639175  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  1639174 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttaggatatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactaacaa-gttcatttt 1639079  T
Q  428 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||             ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  1639078 ggatataatgtagcattgatgtatatcactgacggtgctcttttt-gtatatattgcgtatgtaattgactaatgacca--ctcttaatcgtcaatatta 1638982  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  1638981 tttatatttatg 1638970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 374 - 533
Target Start/End: Original strand, 1921023 - 1921183
Alignment:
Q  374 atatagtgcttcctttttagatcgatatagtat-agcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtg 472  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  1921023 atatagtgcttcttttttggatcgatataatattaacactaacaatgatccttttggatatagtatatcactgatgatgctctttttgggatatattttg 1921122  T
Q  473 tatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
     |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1921123 catgtaatatactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 1921183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 10657220 - 10657386
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctcttttt 459  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||             |||||||||||    
T  10657220 gatataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccgtttggatatagtatagcattgatgtataacactaatggtgctcttttt 10657319  T
Q  460 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10657320 ggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 10657386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 41233515 - 41233717
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttag-atcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | || |||| |||||||||||||| |     
T  41233515 attaatgttaactaaaataacttaactgttgagtactaatgtgttcttttttggatatagtccttctttttttggattgataaagtatagcactaacga- 41233613  T
Q  419 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 518  Q
               ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41233614 -----------atataatatagcactcctgatgctctttttggtatatatcgtatatgtaattgactaatcatcacgctcttaatcgtcaatattattta 41233702  T
Q  519 tatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| ||||||    
T  41233703 tatttatgttgatgt 41233717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 43357635 - 43357478
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgc-tctttttggtatatattgtgt 473  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||| ||||||| |||    
T  43357635 tatagtgcttcttttttgaatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagtacttatggtgcttttttttgggatatattatgt 43357536  T
Q  474 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43357535 atgtaattgac--atcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 43357478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 14836574 - 14836733
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttt-ttggtatatattgtgt 473  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| |||  |||||||| ||| |||  ||||||| |||    
T  14836574 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatatcactaacaaagtttcttttggatatagtataacacttatggtgctttttattgagatatattttgt 14836673  T
Q  474 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14836674 atgtaattgactaatcgtcactctcttaaccgtcaatattatttatatttatgttgatgt 14836733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 404 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 39796791 - 39796664
Alignment:
Q  404 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 503  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39796791 tatagaactaacaatgttccttttagatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtatatgtaattgactaatcatcactctcttaat 39796692  T
Q  504 cgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39796691 cgtcaatattacttatatttatgttgat 39796664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 248 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 9729613 - 9729405
Alignment:
Q  248 tctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaactaaaataatttaactc 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9729613 tctttggatgaaccgtatttggaagttgatttgtatcttgatgaccggaatggaggagaggagattgagacaattaatattaactaaaataacttaactc 9729514  T
Q  348 -ttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccga 446  Q
     || |||||| ||||||| ||||||  |||||||  ||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    ||| ||    
T  9729513 tttaagtactaatgtgtt-ttttttttatatagt--tt--tttttttatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatactgcgacactga 9729419  T
Q  447 tggtgctctttttg 460  Q
    ||||||||||||||    
T  9729418 tggtgctctttttg 9729405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 394 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5985800 - 5985655
Alignment:
Q  394 atcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaat 480  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||             | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5985800 atcgatatagtatagcactagcaatgttccttttggataaagtatagcattgatgtataacactgatgatgctctttttggtatattttgcgtatgtaat 5985701  T
Q  481 tgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5985700 tgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 5985655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 435 - 526
Target Start/End: Original strand, 30918994 - 30919085
Alignment:
Q  435 gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30918994 gtataacactgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 30919085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 387 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 42365970 - 42365819
Alignment:
Q  387 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag-----caccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaatt 481  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  42365970 tttttggatcgatatagtatataactaagaatcttccttttggatatagtataatattacactcatggtgctctttttgggatatattgtgcatctaatt 42365871  T
Q  482 gactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42365870 gactaatcatcactctgttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 42365819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 320 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5612351 - 5612244
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5612351 attaatgttaattaaaataacttaactctcgagtattgatgtgttctttttttggatatagtgcttctttttttgattgatatagtatagcactaacaat 5612252  T
Q  419 gttctttt 426  Q
    ||||||||    
T  5612251 gttctttt 5612244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26794475 - 26794392
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  26794475 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaagagat 26794392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 445 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26794260 - 26794179
Alignment:
Q  445 gatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26794260 gatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgagcactctcttaattgtcaatattatttatatttatg 26794179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 453 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 5612249 - 5612169
Alignment:
Q  453 tctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5612249 tcttttggggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattcatatttatgttgatgt 5612169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 312
Target Start/End: Original strand, 12852746 - 12852829
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 312  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12852746 aattgagttagcatagttgtctttggatgaactggatttggaagttgatttgtatcttgatgatggaaatggaggagaggagat 12852829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 312
Target Start/End: Original strand, 33830397 - 33830480
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 312  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33830397 aattgagttagcagagctgtctttggatgaaccggatttgaaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagat 33830480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 409 - 531
Target Start/End: Original strand, 9654026 - 9654148
Alignment:
Q  409 cactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtca 508  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||| || | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| || |    
T  9654026 cactaacaatattccttatggatatattataacatcaatggtgctctttttgtgatatattgtgtatgcaattgactaatcatcattttcttaattgtta 9654125  T
Q  509 atattatttatatttatgatgat 531  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  9654126 atattacttatatttatgttgat 9654148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 463 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9728176 - 9728106
Alignment:
Q  463 atatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9728176 atatattgtgtacgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 9728106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 17172005 - 17171918
Alignment:
Q  23 cctttacctttttgaatttcatcattagcaatcatatttgtgatgttaattttttgatctgcttgcaattggtcgtgccttttagaag 110  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  17172005 cctttacctatttaaagttcatcattagcaatcatatttgtggtgttaatttcttgagcggcttgcaattgatcatgccttttagaag 17171918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30777521 - 30777468
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 164  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30777521 ttttataaaataattatccgatactttccgatacgtcccggatacgcgaaggat 30777468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 483 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 35746162 - 35746112
Alignment:
Q  483 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35746162 actaatcatcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttgatgt 35746112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 341 - 431
Target Start/End: Original strand, 33830505 - 33830593
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggat 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  33830505 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattt-tttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggat 33830593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6243163 - 6243109
Alignment:
Q  115 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggatgctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6243163 aaaaaataattatccgatatttttcgatacgtcccggatacgcgaaggatactta 6243109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 160
Target Start/End: Original strand, 11907283 - 11907328
Alignment:
Q  115 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaa 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11907283 aaaaaataattatccgatacttttcgatacgtcccggatacgcgaa 11907328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 417
Target Start/End: Original strand, 12852854 - 12852930
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaa 417  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12852854 ttaactctt-agtacttatgtgttttttttttggatataatgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa 12852930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 533
Target Start/End: Original strand, 11694466 - 11694514
Alignment:
Q  485 taatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11694466 taatcatcactctcttaatcgtgaatattatttatacttatgttgatgt 11694514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32707383 - 32707323
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 289  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  32707383 aattgagttagcatagttgtctttgaatgaaccggattaggaagctgatttgtatcttgtt 32707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 371
Target Start/End: Original strand, 11694412 - 11694461
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 371  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11694412 attaatgttaa-taaaataacttaactctt-agtactgatgtgttctttttt 11694461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3934696 - 3934662
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3934696 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 3934662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 39690763 - 39690730
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39690763 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 39690730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 143
Target Start/End: Original strand, 32624995 - 32625027
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgata 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32624995 ttttaaaaaataattatccgatactttccgata 32625027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32707831 - 32707795
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtc 147  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32707831 ttttaaaaaataattatctgatactttccgatacgtc 32707795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Original strand, 24851679 - 24851892
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24851679 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtaatgatgtgttctttttttgatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatg 24851778  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24851779 ttcgttttggatatagtatagcacaaatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 24851878  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  24851879 atttatgttgatgt 24851892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 320 - 535
Target Start/End: Original strand, 36551593 - 36551807
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36551593 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtagtgatgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 36551692  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36551693 ttccttttggatataatataacactgat-atgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaacaatcactctcttaatcgtcaatattatttat 36551791  T
Q  520 atttatgatgatgtcc 535  Q
    ||||||| ||||||||    
T  36551792 atttatgttgatgtcc 36551807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 320 - 501
Target Start/End: Original strand, 47654873 - 47655054
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  47654873 attaatgttgactaaaaaaacttaactcttgagtactgatgtgttcttttacggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatg 47654972  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctctta 501  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  47654973 ttcattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatcattctctta 47655054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 24590033 - 24589820
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtg-ttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24590033 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgcttcttttttgaatatagtgtttcttttttggatcgatatagtataacactaacaat 24589934  T
Q  419 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 518  Q
    |||||||||| ||||| ||||  |  ||||  |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24589933 gttctttttgaatataatatataattgatgaagctctttttaagatatattgtgta-gtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattta 24589835  T
Q  519 tatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||| ||||||    
T  24589834 tatttatgttgatgt 24589820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 321 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 32380989 - 32380776
Alignment:
Q  321 ttaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |||||| | ||||| |||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||||    
T  32380989 ttaatgttaactaaaataacttaactctagagcactgatgttttttttttttggatataatgcttcttttttgaataaatatagtataacactaacaatg 32380890  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 519  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32380889 ttccttttgaatatagtataacactaatggtgctctttttgggatatattatgtatgtaatcgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 32380790  T
Q  520 atttatgatgatgt 533  Q
    ||||||| ||||||    
T  32380789 atttatgttgatgt 32380776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 330 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 3708185 - 3707994
Alignment:
Q  330 actaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttgg 429  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||            ||    
T  3708185 actaaaataacttaactcttgagtaccgatgtgttcttttttagatataatgcttcttttttggatcgataaagtatagcactaac------------gg 3708098  T
Q  430 atatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatg 529  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3708097 atatagtatagcactggtggtcctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttg 3707998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9528720 - 9528562
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  9528720 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacgatgtttcttttggatatagtatagcacttatgatgtcctttttgggatatattgtgta 9528621  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9528620 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 9528562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 34432291 - 34432133
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  34432291 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgtttctttgggatatagtatagtacttatggtgttctttttgagatatattgtgta 34432192  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34432191 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 34432133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 375 - 526
Target Start/End: Original strand, 10822636 - 10822787
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10822636 tataatgcttcttttttggatcgatataatatatcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttacggtgctctttttgggatatattgtgta 10822735  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10822736 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 10822787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 25257242 - 25257542
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||  | ||| |||  |||    
T  25257242 aattgagttagaagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaagagag-agatgtaaacg-tta--gtt 25257337  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25257338 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 25257433  T
Q  428 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||             ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25257434 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctcttttt-gtatatattgcgtatgtaattgactaa--accactctcttaatcgtcaatatta 25257530  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  25257531 tttatatttatg 25257542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28948691 - 28948386
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||  | ||| |||  |||    
T  28948691 aattgagttagcagagttgtctttggatgaatcggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgagaatggatgagaggagatgtaaacg-tta--gtt 28948595  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  28948594 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttt 28948499  T
Q  427 tggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||||||||| |||||  ||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28948498 tggatatagtgtagcattgatgtatagctatgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 28948399  T
Q  514 atttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||    
T  28948398 atttatatttatg 28948386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 379 - 533
Target Start/End: Original strand, 14167315 - 14167469
Alignment:
Q  379 gtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgta 478  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14167315 gtgcttctttcttggatcgatatagtataacactaacaatgtatcttttggatatagtatagctcttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgta 14167414  T
Q  479 attgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14167415 attgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 14167469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 5984811 - 5985114
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  5984811 aattgagttagcagagttgtctttggatgaactgaatttggaagctgatttgtatcttaatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 5984907  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  5984908 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactgacaa-gttcctttt 5985003  T
Q  428 ggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    ||||||||| |||||             | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5985004 ggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaatttactaatgaccactctcttaatcgtcaatatta 5985102  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  5985103 tttatatttatg 5985114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 29168189 - 29168347
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  29168189 tataatgcttcttttttggatcaatatagtatagtactaacaatgtttcttttggatatagtatatcacttatgatgctcttttttggatatattgtgta 29168288  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  29168289 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcgatattatttatatttatgttgatgt 29168347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 351 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28658768 - 28658580
Alignment:
Q  351 agtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagt------------at 438  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||            ||    
T  28658768 agtactgatgtgttctttttttgatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgtagcatgatgtat 28658670  T
Q  439 agcaccgat--ggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28658669 agcactgatatggtgttctttttggtatatattgcatatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 28658580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13012732 - 13012575
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg----gtgctctttttggtatatat 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||    |||||||||||||||||| |    
T  13012732 gatatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactagcaatgttccttttagatatagtataacattgatgtatggtgctctttttggtatattt 13012633  T
Q  469 tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13012632 tgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatg 13012575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 390 - 533
Target Start/End: Original strand, 37922471 - 37922614
Alignment:
Q  390 ttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatc 489  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||     
T  37922471 ttagatagatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgattgatt 37922570  T
Q  490 accactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37922571 ataactctcttaatcgccaatattatttatatttatgttgatgt 37922614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 3427474 - 3427785
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  3427474 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 3427570  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttc-------gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgt 420  Q
    |  |    || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3427571 acttgt--tagtgttaactctt-agtagtgatgtgttctttttttttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gt 3427666  T
Q  421 tctttttggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtc 507  Q
    || ||||  |||||||             ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3427667 tcattttatatatagtgtagcattgatgtatagcacagatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtc 3427766  T
Q  508 aatattatttatatttatg 526  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3427767 aatattatttatatttatg 3427785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 378 - 533
Target Start/End: Original strand, 9781887 - 9782044
Alignment:
Q  378 agtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttttt--ggtatatattgtgtat 475  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  || ||||||||||||     
T  9781887 agtgcttcttttttggatcgatacagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgctttttttttgggatatattgtgtac 9781986  T
Q  476 gtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9781987 gtaattgactaatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 9782044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31653158 - 31652994
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgat-----------ggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||           ||||||||||||||    
T  31653158 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaattttccttttggatatagtatagcattgatataacacttatggtgctctttttgg 31653059  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31653058 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 31652994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 14334533 - 14334697
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||    
T  14334533 gatatggtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcattgatataacactgatggtgctctttttgg 14334632  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334633 tatattttacgtatgtaattgactaatcaacactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 14334697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Original strand, 30324344 - 30324647
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  30324344 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaaggtgatttgtatctcgatgatgagaatggaggagaggagatataaacg-tta--gtt 30324440  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  30324441 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-attcctttt 30324536  T
Q  428 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 514  Q
    |||||||||             ||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  30324537 ggatatagtgtagcattgatgcataacactgatagtgatcttttt-gtatatattgcgtacgtaattgactaatgaccactctcttattcgccaatatta 30324635  T
Q  515 tttatatttatg 526  Q
    ||||||||||||    
T  30324636 tttatatttatg 30324647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6916346 - 6916049
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  6916346 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 6916250  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  6916249 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 6916154  T
Q  427 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 510  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6916153 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 6916054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Original strand, 38331073 - 38331370
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  38331073 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 38331169  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  38331170 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 38331265  T
Q  427 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 510  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38331266 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 38331365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 43190019 - 43190185
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctcttttt 459  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||             |||||||||||    
T  43190019 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatgtataacactgctcgtgctcttttt 43190118  T
Q  460 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
     |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43190119 tgtatattttgcgtatgtatttgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 43190185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 34096429 - 34096270
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcac---cgatggtgctctttttggtatatattgt 471  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||   ||||| |  | ||||||| | |||||||    
T  34096429 tatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttagatatagtatagcacttacgatgtt--tttttttgggacatattgt 34096332  T
Q  472 gtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34096331 gtatgtaattgattgatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 34096270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 52895185 - 52894888
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  52895185 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 52895089  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  52895088 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgatttttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 52894993  T
Q  427 tggatatagtatag-------------caccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 510  Q
    |||||||||| |||             ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52894992 tggatatagtgtagcattgatgtattacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 52894893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 229 - 515
Target Start/End: Original strand, 8132806 - 8133100
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | || || |  |||    
T  8132806 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaac-atca--gtt 8132902  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    
T  8132903 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttgaatatagtgattcttttttggatcgatatagaatatcactaacaa-gttcattt 8132998  T
Q  427 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    ||||||||             ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8132999 tggatatagtgtagcattgatgtataacagtgatggtgctctttttggtatatattgcatatgtaattggctaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 8133098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Original strand, 29862039 - 29862200
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttttt---ggtatatattgt 471  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||  || ||| | |||||   || |||||||||    
T  29862039 tatagtgcttcttttttggattgataaagtataccactaacaatgtttcttttggatatagtatatcacttatagtgtttttttttttgggatatattgt 29862138  T
Q  472 gtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29862139 gtatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 29862200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 404 - 531
Target Start/End: Original strand, 32797462 - 32797589
Alignment:
Q  404 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 503  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32797462 tataacactaataatgttcattttggatatagtatatcattgatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgactaatcatcactctcttaat 32797561  T
Q  504 cgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32797562 cgtcaatattacttatatttatgttgat 32797589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 37346698 - 37346535
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttct-ttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttg 460  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||           || |||||||||||||||    
T  37346698 gatatagtgcttctttttttgattgatatagtatagcattaacaatgttccctttttgatatagtatagcattgatataacaccaatggtgctctttttg 37346599  T
Q  461 gtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37346598 gtattt--tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 37346535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 320 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2472832 - 2472682
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||       
T  2472832 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtacgaatgtgttattttttggatatagtgcttctttttctgatcgataaagtatagcactaaca--- 2472736  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattg 482  Q
              |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2472735 ---------tatatagtatagcactgatggtgctctttttaggatatattgtgtatgtaattg 2472682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 341 - 515
Target Start/End: Original strand, 37104382 - 37104568
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata----- 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||         
T  37104382 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gtttcttttggatatagtgta 37104479  T
Q  435 --------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
            ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37104480 gcattgatgtataacactgttggtgctatttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 37104568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 448
Target Start/End: Original strand, 38218592 - 38218718
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 419  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  38218592 attaatattagctaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttctttttttaatatagtgttt--tttttagatcgatataatataacactaacaatg 38218689  T
Q  420 ttctttttggatatagtatagcaccgatg 448  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  38218690 ttacttttggatataatataacactgatg 38218718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 320 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 41675899 - 41675743
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgct-tcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 418  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | | || | | ||||||||||||||| || |||||||    
T  41675899 attaatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttgaatataatgttatactatat-gatcgatatagtataacattaacaat 41675801  T
Q  419 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatg 476  Q
    |||  |||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  41675800 gttgcttttagatatagtataacattgatgatgctctttttgaaatatattgtgtatg 41675743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 379 - 487
Target Start/End: Original strand, 10763899 - 10764009
Alignment:
Q  379 gtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgc--tctttttggtatatattgtgtatg 476  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||  |||||||  | ||||||| ||||||||||||||    
T  10763899 gtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaaaaatgtttcttttggatatagaatatcacttatggtgctttttttttggaatatattgtgtatg 10763998  T
Q  477 taattgactaa 487  Q
    |||||||||||    
T  10763999 taattgactaa 10764009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 341 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36367554 - 36367376
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata----- 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||         
T  36367554 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 36367457  T
Q  435 --------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
            ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  36367456 gcattgatgtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat 36367376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 320 - 471
Target Start/End: Original strand, 33039819 - 33039960
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtg-cttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaa 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||  |||||  ||||||| |||||||||||||       
T  33039819 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttggaatatagtgtttttttttttttatcgataaagtatagcactaa--- 33039915  T
Q  418 tgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgt 471  Q
             ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33039916 ---------tggatatagtagagcactgatggtgctctttttgggatatattgt 33039960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 409 - 489
Target Start/End: Original strand, 15417692 - 15417772
Alignment:
Q  409 cactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatc 489  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15417692 cactaacaatgttcctttttgatatagtataacattgatggtcctctttttgggatatattgtatatgtaattgactaatc 15417772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 366 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36363405 - 36363252
Alignment:
Q  366 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata-------------gtatagcaccgatggtgc 452  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||             ||||| ||| | ||||||    
T  36363405 ttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgtagcattgatgtataacactgctggtgc 36363307  T
Q  453 tctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 515  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  36363306 tctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat 36363252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 464 - 531
Target Start/End: Original strand, 33040711 - 33040777
Alignment:
Q  464 tatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33040711 tatattgtgtatgta-ttgaataataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 33040777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 531
Target Start/End: Original strand, 15417928 - 15417967
Alignment:
Q  492 cactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15417928 cactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 15417967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6916874 - 6916841
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6916874 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 6916841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28949241 - 28949208
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28949241 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 28949208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36367702 - 36367669
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36367702 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 36367669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Original strand, 38218501 - 38218534
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38218501 ttttaaaaaataattattcgatacttcccgatac 38218534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Original strand, 38330545 - 38330578
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38330545 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 38330578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Original strand, 38948850 - 38948883
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38948850 ttttaaaaaataattatacgatactttccgatac 38948883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 52895713 - 52895680
Alignment:
Q  111 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52895713 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 52895680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 289
Target Start/End: Original strand, 1036892 - 1036951
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 289  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  1036892 aattgagttagcagagttgt-tttgaatgaaccggattaggaagctgatttgtatcttgtt 1036951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 289
Target Start/End: Original strand, 1043798 - 1043857
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 289  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  1043798 aattgagttagcagagttgt-tttgaatgaaccggattaggaagctgatttgtatcttgtt 1043857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 229 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 44088 - 43784
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  44088 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatgaaggagaggagatataaacg-tta--gtt 43992  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 426  Q
    |  |    || | ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  43991 acttgt--tagtgttaactctt-agtattgatgtgttctttttttggatatagtgattctttttcggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttt 43896  T
Q  427 tggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 513  Q
    |||||| |||             ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43895 tggatacagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttgatatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 43796  T
Q  514 atttatatttat 525  Q
    ||||||||||||    
T  43795 atttatatttat 43784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 375 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 202630 - 202479
Alignment:
Q  375 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 474  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||| ||   ||| || ||||||||| ||||| ||| ||    
T  202630 tataatgcttcttttttagatcaatataatatagcactaacaatatttcttttggatataacataacatttatgatgttctttttgggatatactgtata 202531  T
Q  475 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgatgatgt 533  Q
    ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  202530 tgtaattgactaatca-------tttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 202479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 202663 - 202629
Alignment:
Q  320 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  202663 attaatgttaactaaaataatttaactctcgagta 202629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 341 - 522
Target Start/End: Original strand, 13608 - 13788
Alignment:
Q  341 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag 440  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||||||     
T  13608 ttaactctggagtaccgatgtgttcttttatggatatagtgcttc-tttttggatcaatatagtataacagtaacaatgtacattttagatatagtataa 13706  T
Q  441 caccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatt 522  Q
    |||  || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13707 cactaattgtgctctttttgatatatattgtgtatgtcattgactaatcatcactctcttaatcgtcataattatttatatt 13788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 373 - 526
Target Start/End: Original strand, 5906 - 6068
Alignment:
Q  373 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 461  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||           |||||||||||||||||||    
T  5906 gatatagtgcttctttttttgattgatatagtataacattaacaatgttcctttttgatatagtatagcattgatataacaccgatggtgctctttttgg 6005  T
Q  462 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6006 tattt--tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 6068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 229 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 41566 - 41276
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  41566 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccgaatttgcaagctgatttgtatcttgctgatggaaatgaaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 41470  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 427  Q
    | ||    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  41469 acctgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttcctttt 41374  T
Q  428 ggatatagtatagcaccgatg-gtgctctttttggt-atatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttat 525  Q
    ||||||| | |||  ||||||  |    ||  |||| || | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41373 ggatataatgtag--ccgatgtatagcattgatggtgatct-ttttgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgttaatattatttatatttat 41277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 445 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 29903 - 29822
Alignment:
Q  445 gatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 526  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29903 gatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgttaatattatttatatttatg 29822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27268 - 27092
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  27268 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttgaaagataatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 27172  T
Q  329 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagca 410  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27171 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatggtgcttcttttttggatcgatatagtatagca 27092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25101 - 25041
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 289  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  25101 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagattaggaagctgatttgtatcttgtt 25041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7639 - 7579
Alignment:
Q  229 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  7639 aattgagttagcagagttgtctttgaatgaaccggattaggaagctgatttgtatcttgtt 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University