View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4154_high_13 (Length: 384)

Name: NF4154_high_13
Description: NF4154
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4154_high_13
NF4154_high_13
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (19-374)||(1547401-1547769)
chr1 (122-367)||(27532776-27533027)
chr1 (122-367)||(7078857-7079110)
chr1 (123-367)||(27227280-27227532)
chr1 (122-367)||(47279318-47279571)
chr1 (122-367)||(38823343-38823596)
chr1 (123-367)||(16415775-16416027)
chr1 (123-365)||(4330412-4330662)
chr1 (122-367)||(2959877-2960130)
chr1 (122-365)||(238307-238558)
chr1 (122-367)||(8222257-8222510)
chr1 (122-367)||(51128988-51129239)
chr1 (122-367)||(15383062-15383316)
chr1 (123-367)||(10181802-10182055)
chr1 (122-367)||(15168225-15168478)
chr1 (122-367)||(32216184-32216437)
chr1 (122-367)||(34012176-34012424)
chr1 (122-367)||(23999476-23999730)
chr1 (122-367)||(25160761-25161015)
chr1 (122-367)||(39393512-39393766)
chr1 (122-367)||(3535061-3535305)
chr1 (123-367)||(19899563-19899816)
chr1 (123-367)||(27266995-27267246)
chr1 (122-366)||(32267164-32267416)
chr1 (122-365)||(37451416-37451667)
chr1 (125-367)||(47682291-47682541)
chr1 (122-367)||(9902848-9903101)
chr1 (123-367)||(27563700-27563952)
chr1 (122-367)||(10922856-10923109)
chr1 (122-367)||(11742162-11742398)
chr1 (122-367)||(30254552-30254805)
chr1 (128-367)||(30326751-30326999)
chr1 (122-367)||(46931540-46931792)
chr1 (122-367)||(28564577-28564828)
chr1 (122-367)||(28769781-28770035)
chr1 (122-367)||(15752158-15752411)
chr1 (122-367)||(3309276-3309536)
chr1 (122-367)||(22170840-22171093)
chr1 (122-367)||(42721168-42721418)
chr1 (122-367)||(14758170-14758414)
chr1 (122-365)||(27763104-27763356)
chr1 (122-304)||(48353735-48353924)
chr1 (142-367)||(18422780-18423006)
chr1 (122-367)||(31621342-31621600)
chr1 (132-367)||(40884942-40885185)
chr1 (123-367)||(41926292-41926537)
chr1 (123-257)||(21289847-21289981)
chr1 (137-259)||(1359744-1359866)
chr1 (122-367)||(33725405-33725647)
chr1 (122-259)||(31962861-31962999)
chr1 (156-367)||(37618729-37618939)
chr1 (286-367)||(48620766-48620847)
chr1 (191-367)||(38759662-38759846)
chr1 (122-177)||(48620916-48620971)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (122-367)||(39572952-39573197)
chr5 (122-367)||(38528026-38528279)
chr5 (122-367)||(19119992-19120245)
chr5 (122-367)||(22980926-22981179)
chr5 (122-367)||(31786435-31786688)
chr5 (122-367)||(40133518-40133771)
chr5 (122-367)||(8741674-8741928)
chr5 (122-367)||(35934028-35934282)
chr5 (122-367)||(36866895-36867148)
chr5 (122-367)||(15992329-15992582)
chr5 (122-367)||(27330437-27330690)
chr5 (123-374)||(5830019-5830278)
chr5 (123-367)||(12910488-12910740)
chr5 (122-367)||(25500715-25500968)
chr5 (122-367)||(5837688-5837941)
chr5 (122-367)||(22973871-22974124)
chr5 (122-367)||(35511271-35511519)
chr5 (123-367)||(699283-699535)
chr5 (122-367)||(30969113-30969366)
chr5 (122-364)||(33908369-33908618)
chr5 (122-367)||(42342864-42343107)
chr5 (122-367)||(7208653-7208906)
chr5 (122-367)||(22019765-22020009)
chr5 (122-367)||(31705401-31705654)
chr5 (122-367)||(35504498-35504751)
chr5 (122-367)||(23116019-23116264)
chr5 (122-367)||(36860556-36860810)
chr5 (122-367)||(7693363-7693607)
chr5 (122-367)||(22255315-22255568)
chr5 (122-367)||(32563282-32563526)
chr5 (122-353)||(25669733-25669962)
chr5 (122-367)||(27318277-27318529)
chr5 (122-367)||(28416340-28416569)
chr5 (122-349)||(2888234-2888469)
chr5 (122-367)||(17157820-17158073)
chr5 (122-362)||(35826275-35826521)
chr5 (122-367)||(9200366-9200610)
chr5 (122-367)||(15724621-15724874)
chr5 (122-366)||(8437099-8437351)
chr5 (122-259)||(24886336-24886473)
chr5 (158-367)||(13956187-13956404)
chr5 (122-367)||(21088558-21088808)
chr5 (122-259)||(14409130-14409267)
chr5 (122-367)||(43308449-43308694)
chr5 (123-259)||(25889619-25889755)
chr5 (122-367)||(23954591-23954831)
chr5 (181-365)||(6824329-6824519)
chr5 (122-246)||(8466988-8467112)
chr5 (122-243)||(26269074-26269195)
chr5 (157-259)||(1428983-1429088)
chr5 (123-209)||(43254154-43254240)
chr5 (122-367)||(14919328-14919570)
chr5 (267-367)||(26268207-26268307)
chr5 (306-367)||(1429126-1429187)
chr5 (308-367)||(14409310-14409369)
chr5 (258-360)||(5112247-5112348)
chr5 (315-367)||(8466877-8466929)
chr5 (322-367)||(24886237-24886282)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (122-367)||(22687347-22687592)
chr7 (122-356)||(26587892-26588126)
chr7 (122-367)||(15612559-15612812)
chr7 (122-367)||(6546627-6546880)
chr7 (122-367)||(9355626-9355879)
chr7 (122-367)||(18797435-18797688)
chr7 (122-365)||(8861395-8861646)
chr7 (123-367)||(37109980-37110234)
chr7 (122-367)||(25691344-25691597)
chr7 (123-367)||(17842385-17842639)
chr7 (122-367)||(21991744-21991988)
chr7 (124-367)||(30055635-30055886)
chr7 (122-367)||(4583027-4583280)
chr7 (122-367)||(32432560-32432813)
chr7 (122-374)||(37703298-37703558)
chr7 (122-367)||(15672559-15672815)
chr7 (122-367)||(31578864-31579117)
chr7 (122-367)||(5657280-5657534)
chr7 (122-367)||(10359014-10359268)
chr7 (128-365)||(27283854-27284100)
chr7 (122-367)||(32820853-32821106)
chr7 (122-367)||(41764878-41765131)
chr7 (122-367)||(23111298-23111553)
chr7 (122-374)||(46480929-46481189)
chr7 (122-367)||(44598774-44599027)
chr7 (122-367)||(24211849-24212103)
chr7 (140-367)||(11071314-11071546)
chr7 (122-367)||(7334902-7335154)
chr7 (122-367)||(10481713-10481966)
chr7 (152-367)||(12165860-12166074)
chr7 (122-327)||(35353256-35353469)
chr7 (177-367)||(33688117-33688315)
chr7 (122-360)||(37347137-37347382)
chr7 (122-367)||(48928097-48928350)
chr7 (122-365)||(43925211-43925456)
chr7 (122-367)||(29173648-29173883)
chr7 (122-367)||(26980431-26980667)
chr7 (193-367)||(43686148-43686330)
chr7 (122-259)||(31520541-31520678)
chr7 (123-259)||(12390450-12390586)
chr7 (127-259)||(44411345-44411477)
chr7 (140-259)||(37704406-37704525)
chr7 (122-259)||(32593007-32593143)
chr7 (122-259)||(34361976-34362115)
chr7 (212-367)||(38258653-38258816)
chr7 (256-365)||(27421322-27421431)
chr7 (256-365)||(37704267-37704376)
chr7 (122-195)||(38258867-38258940)
chr7 (288-367)||(44413353-44413432)
chr7 (267-367)||(48928517-48928617)
chr7 (306-367)||(12390622-12390683)
chr7 (306-360)||(31520716-31520770)
chr7 (306-367)||(38053586-38053647)
chr7 (176-240)||(27421219-27421283)
chr7 (193-259)||(38053685-38053751)
chr7 (306-367)||(32593181-32593242)
chr7 (122-157)||(12166215-12166250)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (122-367)||(38644110-38644363)
chr8 (122-367)||(5299751-5300004)
chr8 (122-367)||(11727156-11727409)
chr8 (122-367)||(16446680-16446933)
chr8 (122-318)||(24823199-24823395)
chr8 (122-361)||(37970324-37970571)
chr8 (122-367)||(1149437-1149690)
chr8 (122-367)||(27082643-27082896)
chr8 (122-367)||(34895099-34895347)
chr8 (122-367)||(36694771-36695024)
chr8 (122-367)||(43643400-43643653)
chr8 (122-367)||(1205059-1205312)
chr8 (123-367)||(4132492-4132743)
chr8 (124-367)||(6098320-6098576)
chr8 (122-358)||(40862560-40862805)
chr8 (122-365)||(44869631-44869882)
chr8 (125-367)||(465974-466214)
chr8 (122-367)||(12876241-12876495)
chr8 (122-367)||(7890762-7891015)
chr8 (122-367)||(16222995-16223248)
chr8 (122-367)||(39098924-39099177)
chr8 (122-365)||(8803621-8803873)
chr8 (122-367)||(1953793-1954047)
chr8 (122-367)||(33906344-33906595)
chr8 (146-367)||(9864280-9864509)
chr8 (122-367)||(23854236-23854489)
chr8 (122-367)||(35459516-35459769)
chr8 (122-259)||(34951862-34951999)
chr8 (122-367)||(30654388-30654641)
chr8 (122-367)||(31933691-31933944)
chr8 (122-259)||(12587830-12587967)
chr8 (122-353)||(18259229-18259464)
chr8 (122-259)||(35859182-35859319)
chr8 (193-367)||(13307755-13307936)
chr8 (122-367)||(10555010-10555260)
chr8 (122-252)||(33198057-33198187)
chr8 (256-367)||(41910935-41911046)
chr8 (153-259)||(1149756-1149862)
chr8 (258-367)||(43025834-43025943)
chr8 (122-206)||(41362723-41362807)
chr8 (122-207)||(43025974-43026059)
chr8 (294-367)||(1150090-1150163)
chr8 (306-366)||(7998427-7998488)
chr8 (306-367)||(34952028-34952089)
chr8 (186-259)||(34463722-34463792)
chr8 (307-367)||(41362647-41362707)
chr8 (122-155)||(13307931-13307964)
chr8 (274-318)||(12585297-12585341)
chr8 (122-154)||(41910863-41910895)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (122-367)||(33341531-33341784)
chr4 (122-374)||(47253866-47254126)
chr4 (122-374)||(7703635-7703895)
chr4 (122-368)||(30002466-30002711)
chr4 (125-367)||(34947923-34948175)
chr4 (122-367)||(28002811-28003064)
chr4 (122-367)||(37775800-37776044)
chr4 (122-367)||(55477716-55477969)
chr4 (122-354)||(55240930-55241170)
chr4 (124-367)||(37663568-37663819)
chr4 (122-367)||(1815434-1815687)
chr4 (122-367)||(17167846-17168099)
chr4 (122-367)||(17272097-17272350)
chr4 (122-367)||(29584025-29584278)
chr4 (124-367)||(19089280-19089531)
chr4 (122-367)||(50764863-50765106)
chr4 (122-367)||(17173423-17173676)
chr4 (122-367)||(23761205-23761457)
chr4 (122-367)||(25184246-25184499)
chr4 (122-367)||(3042752-3043005)
chr4 (122-367)||(27396749-27397000)
chr4 (122-367)||(46887983-46888235)
chr4 (122-365)||(32912404-32912656)
chr4 (122-367)||(35020856-35021113)
chr4 (122-367)||(50697374-50697628)
chr4 (122-367)||(879373-879626)
chr4 (122-367)||(19440473-19440726)
chr4 (122-368)||(37287858-37288115)
chr4 (122-359)||(34361316-34361562)
chr4 (122-367)||(32579579-32579832)
chr4 (122-367)||(32592226-32592470)
chr4 (122-365)||(6864170-6864421)
chr4 (122-367)||(4598125-4598368)
chr4 (122-367)||(49376100-49376353)
chr4 (122-360)||(36493514-36493759)
chr4 (122-365)||(33816341-33816609)
chr4 (122-367)||(25700881-25701135)
chr4 (123-367)||(9139378-9139612)
chr4 (122-259)||(7152029-7152166)
chr4 (122-259)||(39400257-39400394)
chr4 (122-367)||(5047791-5048043)
chr4 (122-246)||(35025392-35025515)
chr4 (122-367)||(42199862-42200116)
chr4 (122-259)||(4205233-4205370)
chr4 (122-237)||(23431826-23431941)
chr4 (122-358)||(46883939-46884177)
chr4 (125-367)||(4934040-4934280)
chr4 (122-248)||(26896346-26896474)
chr4 (193-367)||(38011987-38012169)
chr4 (122-202)||(38012568-38012648)
chr4 (269-367)||(54499217-54499316)
chr4 (294-360)||(39398049-39398115)
chr4 (267-368)||(35025574-35025675)
chr4 (204-259)||(56050179-56050234)
chr4 (41-75)||(7982770-7982804)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (122-367)||(12042-12294)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (122-367)||(3879737-3879990)
chr6 (122-367)||(6090980-6091234)
chr6 (128-367)||(4318626-4318874)
chr6 (122-367)||(33892810-33893054)
chr6 (122-367)||(20768217-20768468)
chr6 (122-359)||(1945975-1946221)
chr6 (122-367)||(21016916-21017163)
chr6 (122-367)||(29182296-29182547)
chr6 (122-367)||(7234830-7235086)
chr6 (122-367)||(5627524-5627778)
chr6 (122-367)||(8513366-8513607)
chr6 (122-258)||(33619080-33619219)
chr6 (122-367)||(6089041-6089282)
chr6 (256-367)||(15491748-15491859)
chr6 (122-247)||(7054570-7054696)
chr6 (222-367)||(30353256-30353409)
chr6 (267-367)||(7055166-7055266)
chr6 (127-182)||(33724062-33724117)
chr6 (324-367)||(33618967-33619010)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (122-365)||(44891623-44891874)
chr3 (122-367)||(22622517-22622770)
chr3 (122-367)||(33698277-33698530)
chr3 (123-367)||(52040722-52040974)
chr3 (122-367)||(4015584-4015836)
chr3 (122-367)||(7327281-7327534)
chr3 (122-367)||(39282776-39283029)
chr3 (122-367)||(32373594-32373846)
chr3 (122-367)||(46297561-46297814)
chr3 (124-367)||(42505876-42506127)
chr3 (122-367)||(26941059-26941312)
chr3 (122-367)||(24707914-24708169)
chr3 (123-367)||(53228952-53229204)
chr3 (122-367)||(2008057-2008316)
chr3 (122-367)||(33378584-33378837)
chr3 (122-362)||(37157836-37158085)
chr3 (122-365)||(1089819-1090070)
chr3 (146-367)||(34133059-34133288)
chr3 (122-367)||(37203191-37203445)
chr3 (122-367)||(14586479-14586722)
chr3 (122-367)||(48355065-48355318)
chr3 (122-362)||(25579868-25580116)
chr3 (123-359)||(3362385-3362631)
chr3 (122-367)||(21193730-21193984)
chr3 (122-367)||(22451092-22451345)
chr3 (122-367)||(36012261-36012517)
chr3 (122-367)||(40552058-40552311)
chr3 (122-367)||(29099479-29099723)
chr3 (122-367)||(29163942-29164179)
chr3 (122-367)||(3654998-3655254)
chr3 (122-367)||(24488761-24489014)
chr3 (122-367)||(44186316-44186553)
chr3 (122-359)||(47481654-47481900)
chr3 (122-367)||(21009600-21009854)
chr3 (152-361)||(46994490-46994707)
chr3 (123-259)||(11357181-11357317)
chr3 (122-367)||(11466948-11467187)
chr3 (123-367)||(22445865-22446116)
chr3 (122-367)||(4761447-4761701)
chr3 (122-359)||(54505939-54506185)
chr3 (193-367)||(43348381-43348563)
chr3 (146-367)||(38591822-38592051)
chr3 (122-367)||(43975691-43975940)
chr3 (168-367)||(54828546-54828753)
chr3 (122-259)||(40936213-40936350)
chr3 (184-367)||(45174629-45174821)
chr3 (184-365)||(11835494-11835678)
chr3 (122-257)||(50475053-50475195)
chr3 (122-259)||(51212576-51212707)
chr3 (122-305)||(11356957-11357140)
chr3 (129-259)||(27480164-27480298)
chr3 (122-334)||(20373062-20373263)
chr3 (267-367)||(35844450-35844550)
chr3 (289-367)||(51212955-51213033)
chr3 (267-367)||(53176178-53176278)
chr3 (306-367)||(11357355-11357416)
chr3 (304-367)||(27480368-27480431)
chr3 (186-259)||(53811597-53811670)
chr3 (319-367)||(20373300-20373348)
chr3 (122-169)||(35844577-35844624)
chr3 (328-367)||(40936115-40936154)
chr3 (122-157)||(43348556-43348591)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (122-364)||(33709049-33709299)
chr2 (122-367)||(4167055-4167308)
chr2 (122-367)||(41960973-41961226)
chr2 (122-367)||(18494098-18494350)
chr2 (122-374)||(2325195-2325455)
chr2 (122-367)||(44913796-44914053)
chr2 (122-367)||(4763764-4764017)
chr2 (122-367)||(31570551-31570804)
chr2 (122-367)||(43648062-43648315)
chr2 (122-367)||(19424459-19424698)
chr2 (122-367)||(26357710-26357963)
chr2 (122-367)||(3177072-3177325)
chr2 (122-367)||(5881672-5881915)
chr2 (122-367)||(33660194-33660438)
chr2 (122-367)||(11366197-11366451)
chr2 (122-367)||(41465634-41465887)
chr2 (123-367)||(29241963-29242208)
chr2 (122-367)||(39167186-39167433)
chr2 (122-367)||(19289140-19289393)
chr2 (122-367)||(35959030-35959278)
chr2 (146-367)||(27349789-27350009)
chr2 (122-367)||(37905841-37906097)
chr2 (122-367)||(43770665-43770909)
chr2 (155-367)||(4263926-4264147)
chr2 (122-367)||(31861985-31862238)
chr2 (122-367)||(33550800-33551056)
chr2 (122-362)||(7006755-7006986)
chr2 (156-367)||(4478502-4478717)
chr2 (172-367)||(44286082-44286285)
chr2 (122-367)||(13711597-13711845)
chr2 (169-367)||(19313984-19314186)
chr2 (129-259)||(19500739-19500869)
chr2 (203-367)||(45327853-45328025)
chr2 (203-367)||(36642119-36642293)
chr2 (122-243)||(41051117-41051238)
chr2 (214-367)||(17071646-17071807)
chr2 (267-367)||(17054066-17054166)
chr2 (122-227)||(41463407-41463512)
chr2 (267-359)||(18258257-18258349)
chr2 (122-220)||(18257355-18257453)
chr2 (122-205)||(33902317-33902400)
chr2 (267-367)||(33902199-33902299)
chr2 (234-367)||(41463779-41463920)
chr2 (122-170)||(45328028-45328076)
chr2 (137-179)||(17053963-17054005)
chr2 (137-179)||(17071604-17071646)
chr2 (122-152)||(4263726-4263756)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (122-367)||(408228-408481)
scaffold0002 (122-367)||(267-514)
scaffold0002 (122-259)||(93900-94036)
scaffold0002 (262-367)||(94330-94435)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (124-367)||(8020-8271)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (122-367)||(44090-44342)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (122-367)||(154445-154697)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (122-367)||(145814-146068)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (122-367)||(267417-267662)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (163-230)||(100993-101058)
scaffold0009 (315-356)||(100894-100935)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1547769 - 1547401
Alignment:
Q  19 acacttaagttgaagtggctgataattgagtgattttaattgattgataatgtaaagnnnnnnnacaattctaactagggagcttctacggtgcagnnnn 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||||| ||||||| ||||||||| ||         
T  1547769 acacttaagttgaagtggctaataattgagtgattttaattgattgatagtgtaaagttgttttacaattctaattagggagtttctacggtacaattat 1547670  T
Q  119 nnna-------------aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 205  Q
       |             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1547669 gaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaa 1547570  T
Q  206 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1547569 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacagagttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggg 1547470  T
Q  306 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1547469 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgatactatg 1547401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 27532776 - 27533027
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532776 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 27532874  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27532875 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttaca 27532974  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532975 cttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatga 27533027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 7078857 - 7079110
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  7078857 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatctta 7078956  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||        |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7078957 gacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttaca 7079056  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7079057 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatga 7079110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 27227280 - 27227532
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27227280 aaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 27227379  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27227380 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacac 27227479  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27227480 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 27227532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47279571 - 47279318
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  47279571 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatcttg 47279472  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||        |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||    
T  47279471 gacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttaca 47279372  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47279371 attaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 47279318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38823596 - 38823343
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  38823596 aaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttta 38823497  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38823496 gacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgttaca 38823397  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38823396 cttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 38823343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16416027 - 16415775
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16416027 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgg 16415928  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  16415927 acttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacac 16415828  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16415827 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatga 16415775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 123 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4330662 - 4330412
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4330662 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattgg 4330563  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4330562 acttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacac 4330463  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4330462 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgat 4330412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2960130 - 2959877
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960130 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 2960031  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||    
T  2960030 gacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttaca 2959931  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2959930 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatga 2959877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Original strand, 238307 - 238558
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238307 aaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 238406  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  238407 gacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 238506  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  238507 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgat 238558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8222510 - 8222257
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8222510 aaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatctt 8222412  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8222411 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttac 8222312  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8222311 gcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 8222257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51129239 - 51128988
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51129239 aaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 51129142  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  51129141 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggtgttaca 51129042  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51129041 cttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatga 51128988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15383316 - 15383062
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383316 aaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 15383217  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttta--------acagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||        ||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15383216 ggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttac 15383117  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15383116 gcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 15383062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 10181802 - 10182055
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10181802 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttgg 10181901  T
Q  223 acttac-atgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||| |||||||||        |||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10181902 acttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 10182001  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10182002 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 10182055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15168478 - 15168225
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15168478 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttg 15168379  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||| |||||  || ||||||||||||| || |||||||||    
T  15168378 tacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttaca 15168279  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  15168278 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatga 15168225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32216437 - 32216184
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32216437 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttg 32216338  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  || |||||||||||||  ||||||        |||||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32216337 gacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 32216238  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| ||||    
T  32216237 cttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatga 32216184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 34012176 - 34012424
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34012176 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttg 34012275  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  34012276 aacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttaca 34012370  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34012371 cttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 34012424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23999730 - 23999476
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23999730 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 23999631  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  23999630 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttat 23999531  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23999530 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 23999476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25161015 - 25160761
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25161015 aaaaggttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 25160916  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25160915 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttac 25160816  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  25160815 acttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatga 25160761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39393766 - 39393512
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39393766 aaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 39393667  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || ||||  ||||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| | ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| || |||||||    
T  39393666 gatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttaca 39393567  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39393566 cttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatga 39393512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3535305 - 3535061
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3535305 aaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 3535206  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3535205 gacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------taagtgttacactttgtggggtgttaca 3535115  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3535114 cttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 3535061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 19899563 - 19899816
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899563 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 19899662  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||     
T  19899663 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacg 19899762  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19899763 cttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 19899816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 27266995 - 27267246
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27266995 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttag 27267094  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27267095 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacac 27267194  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27267195 tcaaaacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 27267246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 32267416 - 32267164
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32267416 aaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 32267317  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||  || |||        |||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  32267316 gacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacg 32267217  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 366  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32267216 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatg 32267164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37451667 - 37451416
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37451667 aaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 37451568  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  37451567 gacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttaca 37451468  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37451467 cttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgat 37451416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 125 - 367
Target Start/End: Original strand, 47682291 - 47682541
Alignment:
Q  125 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  47682291 aagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggat 47682390  T
Q  225 ttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacactt 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| || ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47682391 ttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacactt 47682490  T
Q  317 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  47682491 aaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatga 47682541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 9902848 - 9903101
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9902848 aaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatcttg 9902947  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9902948 gacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttaca 9903047  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9903048 cttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 9903101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 27563700 - 27563952
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27563700 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaacatcttgg 27563799  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||        |||||| ||| ||| || || ||||||| || |||||| | ||||||||||| ||| ||    
T  27563800 acttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggtattatac 27563899  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27563900 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 27563952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10923109 - 10922856
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10923109 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 10923010  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||    ||||||        |||||| ||| |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||     
T  10923009 gacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacc 10922910  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10922909 cttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 10922856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 11742162 - 11742398
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11742162 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 11742261  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||| || |                  |||||||    
T  11742262 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaa-----------------ttgttaca 11742344  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11742345 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatga 11742398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30254805 - 30254552
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254805 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 30254706  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||        |||||| ||| || ||| |||||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||      
T  30254705 gacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatg 30254606  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30254605 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatga 30254552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Original strand, 30326751 - 30326999
Alignment:
Q  128 ttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 226  Q
    |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326751 ttaattttgattttaatatttgatttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 30326850  T
Q  227 acatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaa 318  Q
    | ||||| |||||||||||||  ||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  30326851 aaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttat 30326950  T
Q  319 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30326951 aacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatga 30326999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46931792 - 46931540
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931792 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 46931693  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  46931692 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 46931593  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     ||   ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  46931592 gct--gaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 46931540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 28564577 - 28564828
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28564577 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 28564676  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||  |||||||||      
T  28564677 gacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag--ttaagtgttacactttacggggtgttatg 28564774  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28564775 cttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 28564828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28770035 - 28769781
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28770035 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatcttg 28769936  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt-ggggtgttac 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||        ||||||  || |||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||    
T  28769935 gacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttac 28769836  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
      ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28769835 gtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 28769781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15752411 - 15752158
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||    
T  15752411 aaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttg 15752312  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  || |||        |||||| ||  |||||| |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||     
T  15752311 gacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacg 15752212  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15752211 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 15752158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3309536 - 3309276
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaa-tcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3309536 aaaaagttaattttaaatctaaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 3309437  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacact-----ttgtggggt 307  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||     | ||| |||    
T  3309436 ggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggt 3309337  T
Q  308 gttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3309336 gttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 3309276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22171093 - 22170840
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||     
T  22171093 aaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatctta 22170994  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22170993 gacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 22170894  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| ||||    
T  22170893 tttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatga 22170840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42721418 - 42721168
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  42721418 aaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatcttg 42721319  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||||        |||| | ||| |||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  42721318 gacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattaca 42721222  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42721221 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42721168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14758414 - 14758170
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758414 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 14758315  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| ||         | ||| ||||||||||||    
T  14758314 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt---------aatttctggggtgttaca 14758224  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  14758223 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatga 14758170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Original strand, 27763104 - 27763356
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27763104 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatctt 27763203  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| | |||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  27763204 gaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttac 27763303  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27763304 gcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgat 27763356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48353924 - 48353735
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48353924 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttg 48353825  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgg 304  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  48353824 gacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18423006 - 18422780
Alignment:
Q  142 aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactatttta 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18423006 aatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgctttttta 18422914  T
Q  242 tcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataa 333  Q
    ||||||  ||||||||||        ||  || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  18422913 tcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataa 18422814  T
Q  334 aattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18422813 aattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 18422780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 31621342 - 31621600
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttt-taaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31621342 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaacatatt 31621441  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt-------------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggt 307  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||             |||| | |||||||||| ||| |||||| || ||||| |||| || ||||||    
T  31621442 gaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcacac-ttctggggt 31621540  T
Q  308 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31621541 attgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 31621600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 132 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40885185 - 40884942
Alignment:
Q  132 ttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatg 231  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40885185 ttttaaccttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatg 40885086  T
Q  232 tactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaa 323  Q
    |||||||||||| | | |||||||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  40885085 tactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaa 40884986  T
Q  324 ggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    | |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40884985 gataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatga 40884942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41926537 - 41926292
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41926537 aaaaattaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttgg 41926439  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||        |||||| ||| |||||| || | |||      ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41926438 acttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaata------agtgttacactttgtggagtgttacac 41926345  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41926344 ttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 41926292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21289981 - 21289847
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21289981 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatcttgg 21289882  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaa 257  Q
    ||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  21289881 acttataagtgttattttatcgttggcatctttaa 21289847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 259
Target Start/End: Original strand, 1359744 - 1359866
Alignment:
Q  137 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtacta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  1359744 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtacta 1359843  T
Q  237 ttttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  1359844 ttttatcgttggaatctttaaca 1359866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 33725405 - 33725647
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttta-aattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||            | ||||||||| ||    
T  33725405 aaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaat------------gtttgcaacatttt 33725492  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||| |||||| ||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  33725493 ggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggggtgttac 33725592  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  33725593 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatga 33725647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31962999 - 31962861
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31962999 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatctt 31962900  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
      |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||    
T  31962899 aaacttacatatattattttatcgttgatttctttaaca 31962861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 367
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37618939
Alignment:
Q  156 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  256 --------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 347  Q
            |||||| ||| |||||| |         | ||||||||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatatta---------tatgagtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtg 37618919  T
Q  348 tattcttgttaatctgatga 367  Q
    || | |||||||||||||||    
T  37618920 tagtattgttaatctgatga 37618939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 286 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48620847 - 48620766
Alignment:
Q  286 tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48620847 tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 48620766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759662
Alignment:
Q  191 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatag 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||||         | ||| |||||| || ||||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  283 ttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||| | || ||||| ||||||    
T  38759746 tctcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatga 38759662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48620971 - 48620916
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48620971 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattaatgat 48620916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39573197 - 39572952
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39573197 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 39573098  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39573097 gacttacatgtactattttatcattggcatctttaacagagttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaac 39572998  T
Q  322 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39572997 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 39572952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 38528026 - 38528279
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528026 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 38528125  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38528126 gacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 38528225  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38528226 cttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 38528279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19120245 - 19119992
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19120245 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 19120146  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||        || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  19120145 gactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttata 19120046  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19120045 cttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatga 19119992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22981179 - 22980926
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22981179 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttg 22981080  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||        |||||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  22981079 gacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttaca 22980980  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22980979 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 22980926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 31786435 - 31786688
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31786435 aaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 31786534  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||        |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31786535 gatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttaca 31786634  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31786635 cttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 31786688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40133771 - 40133518
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40133771 aaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttg 40133672  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40133671 gacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 40133572  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40133571 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 40133518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 8741674 - 8741928
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  8741674 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaacattttg 8741773  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgat-atcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| | || ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  8741774 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 8741873  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8741874 acttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatga 8741928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35934282 - 35934028
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35934282 aaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatcttg 35934183  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--gaa------ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  |||      ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35934182 gacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttaca 35934083  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35934082 cttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatga 35934028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36867148 - 36866895
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36867148 aaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttg 36867049  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36867048 gacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 36866949  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36866948 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 36866895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 15992329 - 15992582
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992329 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 15992428  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||  |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15992429 gacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgca 15992528  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15992529 ctcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatga 15992582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27330690 - 27330437
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27330690 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 27330591  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||        ||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  27330590 gacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttaca 27330491  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27330490 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 27330437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 123 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5830278 - 5830019
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830278 aaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 5830179  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  5830178 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacg 5830079  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 374  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  5830078 cttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat-tgatgatactatg 5830019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12910740 - 12910488
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12910740 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 12910641  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||        |||| ||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12910640 acttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacac 12910541  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12910540 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatga 12910488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 25500715 - 25500968
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  25500715 aaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatctta 25500814  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac------agaa--ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      ||||  ||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25500815 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 25500914  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25500915 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatga 25500968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5837941 - 5837688
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5837941 aaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 5837842  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  5837841 gacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattaca 5837742  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5837741 cttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 5837688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 22973871 - 22974124
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22973871 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 22973970  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||        |||||| ||| | |||| |||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||     
T  22973971 gacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacg 22974070  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22974071 cttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatga 22974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 35511271 - 35511519
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35511271 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttg 35511370  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  35511371 aacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttaca 35511465  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35511466 cttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 35511519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 699535 - 699283
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  699535 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 699436  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  699435 acttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagtgttacac 699336  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  699335 ttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 699283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 30969113 - 30969366
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  30969113 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttg 30969212  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||        |||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  30969213 aacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttaca 30969312  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30969313 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 30969366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33908618 - 33908369
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33908618 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatcttg 33908520  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacaga-----attgtt---gatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     || |||   ||||| ||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33908519 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttaca 33908420  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 364  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  33908419 tttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 33908369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42343107 - 42342864
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42343107 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 42343008  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||         ||||||||||||||||||| || |||||    
T  42343007 gacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggtgtattaca 42342917  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342916 cttaaaacaa-gtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 42342864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 7208653 - 7208906
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7208653 aaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttg 7208752  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| |||   |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||     
T  7208753 aacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacg 7208852  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7208853 tttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 7208906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22020009 - 22019765
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22020009 aaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatctta 22019910  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||        ||| ||| ||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22019909 gacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatg---------tgagtgttatactttgtggggtgttaca 22019819  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22019818 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 22019765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 31705401 - 31705654
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31705401 aaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 31705500  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||        |||||| ||| |||||| ||||||| || || ||||||||| |||||| | ||||||     
T  31705501 gacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacg 31705600  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31705601 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31705654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35504751 - 35504498
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35504751 aaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttg 35504652  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  35504651 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 35504552  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35504551 cttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatga 35504498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 23116019 - 23116264
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||    
T  23116019 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtca--------gtaatgcttgcaacatcttg 23116110  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        || ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23116111 gacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 23116210  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23116211 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatga 23116264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36860810 - 36860556
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36860810 aaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttg 36860711  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36860710 gacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 36860611  T
Q  314 ctt-aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||    
T  36860610 cttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatga 36860556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7693607 - 7693363
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7693607 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 7693508  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||        |||||| ||| | ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7693507 gacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttaca 7693417  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  7693416 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatga 7693363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22255568 - 22255315
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22255568 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttg 22255469  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || |||        |||| | ||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  22255468 gacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacg 22255369  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22255368 cttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 22255315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32563526 - 32563282
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  32563526 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaacatctta 32563427  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |        |||||| ||| ||||||||||         |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32563426 gacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtgggctgttaca 32563336  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32563335 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 32563282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25669962 - 25669733
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  25669962 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttta 25669863  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||         |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25669862 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatg---------tgagtgttacac-ttgtggagtgttaca 25669773  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 353  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25669772 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattct 25669733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 27318277 - 27318529
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27318277 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatctt 27318376  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
      ||||  |||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27318377 aaactt--atgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 27318474  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27318475 gcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 27318529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 28416340 - 28416569
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28416340 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatcttg 28416439  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 321  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||       || ||| ||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28416440 gacttaaaagtactattttatcgttggcatc-------gagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaat 28416523  T
Q  322 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28416524 aaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 28416569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 349
Target Start/End: Original strand, 2888234 - 2888469
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2888234 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttg 2888333  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| || ||||||| || ||||||||||||| |||  ||||| |    
T  2888334 gacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaa 2888433  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgta 349  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2888434 cttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgta 2888469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 17157820 - 17158073
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17157820 aaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 17157919  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| | |||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17157920 gacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 17158019  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| || |||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  17158020 cttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatga 17158073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 362
Target Start/End: Original strand, 35826275 - 35826521
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35826275 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 35826374  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| ||||||  | ||||| | || || |||||||||||||| |||||||     
T  35826375 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat--tatgataatcttaagggttacactttgtggagtgttacg 35826472  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  35826473 cttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct 35826521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9200610 - 9200366
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9200610 aaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 9200511  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| |  |||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||         |||||||||||||||||||  |||||||    
T  9200510 gacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggaatgttaca 9200420  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9200419 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatga 9200366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15724874 - 15724621
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  15724874 aaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaatattttg 15724775  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||        |||| | ||||||||||||| ||||||| || | || ||||||||| || |||||| |    
T  15724774 gacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttata 15724675  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15724674 cttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 15724621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 122 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8437351 - 8437099
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8437351 aaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatcttg 8437252  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| | |||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||   |    
T  8437251 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataa 8437152  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 366  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  || | |||| |||||||||    
T  8437151 cttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg 8437099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24886473 - 24886336
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886473 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24886374  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  24886373 gacttacatgtactattttattgttggaatctttaaca 24886336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 158 - 367
Target Start/End: Original strand, 13956187 - 13956404
Alignment:
Q  158 ttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt-- 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||      
T  13956187 ttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaa 13956286  T
Q  256 ------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgta 349  Q
          |||| | ||| |||||| || ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| |    
T  13956287 catgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaa 13956386  T
Q  350 ttcttgttaatctgatga 367  Q
     | |||||||||||||||    
T  13956387 gttttgttaatctgatga 13956404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 21088558 - 21088808
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21088558 aaaaaattaactttaatcttaatgtttgattcatttttaaattg---attatttattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 21088654  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || |||||  |  ||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||    
T  21088655 gatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 21088754  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  21088755 cttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatga 21088808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Original strand, 14409130 - 14409267
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14409130 aaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttg 14409229  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409230 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaaca 14409267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 43308449 - 43308694
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43308449 aaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttc 43308548  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 321  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||     |  ||  | |||  ||||| || |||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  43308549 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatatagtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataac 43308648  T
Q  322 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||    
T  43308649 aaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatga 43308694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25889755 - 25889619
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25889755 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttgg 25889656  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  25889655 atttacaggtactattttattgttggtatctttaaca 25889619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 23954591 - 23954831
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||| |     |||||||    
T  23954591 aaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatcaagtaatgtt-----catcttg 23954678  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttta-------acagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
     |||||||  || ||||||||||||| ||| || |       ||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23954679 cacttacaaatattattttatcgttggcattttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacac 23954778  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23954779 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 23954831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824519
Alignment:
Q  181 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatat 272  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||        || ||| | ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  273 catgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 6824519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 122 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8467112 - 8466988
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8467112 aaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 8467013  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgtt 246  Q
    ||||||||  || ||||||||||||    
T  8467012 gacttacaaataatattttatcgtt 8466988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26269195 - 26269074
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||     
T  26269195 aaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatctta 26269096  T
Q  222 gacttacatgtactattttatc 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  26269095 aacttacaggtactattttatc 26269074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 157 - 259
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429088
Alignment:
Q  157 tttaaattgttga---ttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 253  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 1429082  T
Q  254 ttaaca 259  Q
    ||||||    
T  1429083 ttaaca 1429088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43254240 - 43254154
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254240 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 14919328 - 14919570
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||      | |||||| ||||||    
T  14919328 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaat-gtaattcatct------gattgcaatatcttg 14919420  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||    ||| ||||||| ||||  ||||||||||        || ||| |||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||| |||||||||    
T  14919421 gactta----tacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttaca 14919516  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  14919517 cttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatga 14919570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26268307 - 26268207
Alignment:
Q  267 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 366  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26268307 tgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatg 26268208  T
Q  367 a 367  Q
    |    
T  26268207 a 26268207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Original strand, 1429126 - 1429187
Alignment:
Q  306 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  1429126 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatga 1429187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 308 - 367
Target Start/End: Original strand, 14409310 - 14409369
Alignment:
Q  308 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14409310 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 14409369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 360
Target Start/End: Original strand, 5112247 - 5112348
Alignment:
Q  258 cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtt 357  Q
    |||| ||| |||||| |||||| ||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  5112247 cagagttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgtt 5112345  T
Q  358 aat 360  Q
    |||    
T  5112346 aat 5112348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8466929 - 8466877
Alignment:
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8466929 ttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 8466877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24886282 - 24886237
Alignment:
Q  322 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24886282 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 24886237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22687592 - 22687347
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22687592 aaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaacatcttg 22687493  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22687492 gacttacatgtactattttatcgttggcatccttaacagagttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 22687393  T
Q  322 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22687392 aaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatga 22687347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 122 - 356
Target Start/End: Original strand, 26587892 - 26588126
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26587892 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatcttg 26587991  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 321  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26587992 gacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 26588091  T
Q  322 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26588092 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 15612559 - 15612812
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15612559 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatctta 15612658  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15612659 gacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 15612758  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612759 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 15612812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6546880 - 6546627
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  6546880 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatctta 6546781  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6546780 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttaca 6546681  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6546680 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 6546627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 9355626 - 9355879
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9355626 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 9355725  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9355726 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 9355825  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9355826 cttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 9355879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18797688 - 18797435
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797688 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 18797589  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  18797588 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttaca 18797489  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18797488 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 18797435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8861646 - 8861395
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  8861646 aaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatctta 8861547  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8861546 gacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttaca 8861447  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8861446 cttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgat 8861395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37110234 - 37109980
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37110234 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 37110135  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  37110134 acttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgc 37110035  T
Q  315 ttaaaacaagg--taggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37110034 ttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 37109980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 25691344 - 25691597
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  25691344 aaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttg 25691443  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     ||||||||||  |||||||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25691444 aacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttaca 25691543  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  25691544 cttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatga 25691597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 17842385 - 17842639
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17842385 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgg 17842484  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| |    
T  17842485 acttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgc 17842584  T
Q  315 ttaaaacaagg--taggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17842585 ttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 17842639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21991988 - 21991744
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  21991988 aaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatcttg 21991898  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21991897 gacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 21991798  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21991797 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 21991744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 124 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30055886 - 30055635
Alignment:
Q  124 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 223  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055886 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 30055787  T
Q  224 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||   |||     ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  30055786 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgct 30055687  T
Q  316 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30055686 tatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 30055635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4583280 - 4583027
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4583280 aaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttg 4583181  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     |||||||  || ||||| |||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4583180 aacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 4583081  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4583080 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 4583027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32432813 - 32432560
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32432813 aaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttg 32432714  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||  ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32432713 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttaca 32432614  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32432613 cttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatga 32432560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 122 - 374
Target Start/End: Original strand, 37703298 - 37703558
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37703298 aaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 37703397  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  37703398 gacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttaca 37703497  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 374  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  37703498 cttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgatactatg 37703558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 15672559 - 15672815
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15672559 aaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 15672658  T
Q  222 gacttacatgtac---tattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 310  Q
    |||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  15672659 gacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgtt 15672758  T
Q  311 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15672759 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatga 15672815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 31578864 - 31579117
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31578864 aaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 31578963  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||        | | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| |    
T  31578964 gacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttata 31579063  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31579064 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31579117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 5657280 - 5657534
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatctt-aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5657280 aaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 5657379  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  5657380 agacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttac 5657479  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5657480 acttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatga 5657534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 10359014 - 10359268
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10359014 aaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatcttg 10359113  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||        |||||| ||| || | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10359114 gacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 10359213  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattaga-ttaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10359214 cttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatga 10359268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 128 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27284100 - 27283854
Alignment:
Q  128 ttaattttaatcttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 226  Q
    |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284100 ttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 27284001  T
Q  227 acatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaa 318  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||        |||| | ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27284000 acaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttat 27283901  T
Q  319 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27283900 aacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgat 27283854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 32820853 - 32821106
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32820853 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 32820952  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||     
T  32820953 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacg 32821052  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  32821053 cttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatga 32821106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 41764878 - 41765131
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41764878 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttg 41764977  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  41764978 gacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttaca 41765077  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41765078 cttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 41765131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23111553 - 23111298
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  23111553 aaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttctagtaatgctttcaacatcttt 23111454  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  23111453 gatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 23111354  T
Q  314 cttaaaacaaggtagg--ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23111353 cttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatga 23111298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 374
Target Start/End: Original strand, 46480929 - 46481189
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  46480929 aaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctta 46481028  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||    
T  46481029 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagatgttaca 46481128  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 374  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  46481129 cttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatgatactatg 46481189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44599027 - 44598774
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattact---gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 218  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  44599027 aaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacatc 44598931  T
Q  219 ttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 310  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||        || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  44598930 ttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgtt 44598831  T
Q  311 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44598830 acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 44598774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24212103 - 24211849
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24212103 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 24212004  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||        | | ||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||||    
T  24212003 ggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttac 24211904  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24211903 acttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 24211849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 140 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11071546 - 11071314
Alignment:
Q  140 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11071546 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattt 11071447  T
Q  240 tatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat 331  Q
    ||||||||   |||||||||   |||     ||| |||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11071446 tatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggat 11071350  T
Q  332 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  11071349 aaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatga 11071314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7335154 - 7334902
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7335154 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 7335055  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca-------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    || ||||| |||||||||||| || |  ||||||||||        | ||| |||||| || ||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7335054 gatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaactagttgatgatattatctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacac 7334955  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7334954 ttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatga 7334902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10481966 - 10481713
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10481966 aaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttg 10481867  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||   ||||||||||| ||||  ||||||        || ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10481866 gacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 10481767  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10481766 cttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatga 10481713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165860
Alignment:
Q  152 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  252 cttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatta 343  Q
    ||||        |||||| ||| |||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagatta 12165884  T
Q  344 agtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12165883 agtgtattcttgttaatctgatga 12165860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 35353469 - 35353256
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35353469 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 35353370  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||| |||||| ||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35353369 gacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttaca 35353270  T
Q  314 cttaaaacaaggta 327  Q
    ||||||||||||||    
T  35353269 cttaaaacaaggta 35353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688315
Alignment:
Q  177 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttg 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||| ||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  269 atatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33688315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37347382 - 37347137
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37347382 aaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttg 37347283  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  37347282 gacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttaca 37347184  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 360  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37347183 cttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaat 37347137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 48928097 - 48928350
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48928097 aaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 48928196  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| || ||  ||||||||| || |||||||||    
T  48928197 gacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttaca 48928296  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  48928297 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatga 48928350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43925456 - 43925211
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43925456 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 43925357  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||      ||| ||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||||| || || ||| ||| || ||||| |||||| ||    
T  43925356 gac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgca 43925263  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43925262 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat 43925211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29173883 - 29173648
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173883 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 29173784  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctt-------taacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |                 |||| ||||    
T  29173783 gacttacagatactattttatcgttggcattttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgtaacac 29173701  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29173700 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatga 29173648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26980667 - 26980431
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  26980667 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatctta 26980568  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||| || |                 ||||||||    
T  26980567 gacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaa-----------------gtgttaca 26980485  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26980484 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatga 26980431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686148
Alignment:
Q  193 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaa--------ttgttgatatcatgtgatagtt 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |         ||| |||||| |||||||||||    
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  285 ttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 43686148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Original strand, 31520541 - 31520678
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31520541 aaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatcttg 31520640  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31520641 gacttacagatactattttatcgttggcatctttaaca 31520678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 12390450 - 12390586
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12390450 aaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttgg 12390549  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12390550 acttacatgtactattttatcattggcatctttaaca 12390586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 44411345 - 44411477
Alignment:
Q  127 gttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 226  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411345 gttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 44411444  T
Q  227 acatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  44411445 acagataatattttatcgttggcatctttaaca 44411477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37704525 - 37704406
Alignment:
Q  140 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattt 239  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37704525 ttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattt 37704426  T
Q  240 tatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  37704425 tatcgttggcatctttaaca 37704406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Original strand, 32593007 - 32593143
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  32593007 aaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaacatcttg 32593105  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32593106 gacttacatgtactattttaacgttgacatctttaaca 32593143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Original strand, 34361976 - 34362115
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaa-tctt-aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 219  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34361976 aaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatct 34362075  T
Q  220 tggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  34362076 tggacttacagatactattttatcgttgatatttttaaca 34362115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258653
Alignment:
Q  212 caacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtg 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||         | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  304 gggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38258716 gggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 38258653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 256 - 365
Target Start/End: Original strand, 27421322 - 27421431
Alignment:
Q  256 aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttg 355  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421322 aacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttg 27421421  T
Q  356 ttaatctgat 365  Q
    ||||||||||    
T  27421422 ttaatctgat 27421431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 256 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37704376 - 37704267
Alignment:
Q  256 aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttg 355  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37704376 aacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttg 37704277  T
Q  356 ttaatctgat 365  Q
    ||||||||||    
T  37704276 ttaatctgat 37704267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38258940 - 38258867
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258940 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 288 - 367
Target Start/End: Original strand, 44413353 - 44413432
Alignment:
Q  288 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  44413353 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatga 44413432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Original strand, 48928517 - 48928617
Alignment:
Q  267 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 366  Q
    |||||| ||| |||||| || ||  ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48928517 tgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatg 48928616  T
Q  367 a 367  Q
    |    
T  48928617 a 48928617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Original strand, 12390622 - 12390683
Alignment:
Q  306 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12390622 gtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 12390683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 360
Target Start/End: Original strand, 31520716 - 31520770
Alignment:
Q  306 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 360  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31520716 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 31520770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38053647 - 38053586
Alignment:
Q  306 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38053647 gtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 38053586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421283
Alignment:
Q  176 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 240  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053685
Alignment:
Q  193 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaaca 38053685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Original strand, 32593181 - 32593242
Alignment:
Q  306 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||| |||||||||||    
T  32593181 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatga 32593242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12166250 - 12166215
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12166250 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 12166215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38644363 - 38644110
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38644363 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 38644264  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38644263 gacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttaca 38644164  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38644163 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 38644110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 5299751 - 5300004
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299751 aaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 5299850  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||| ||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5299851 gacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 5299950  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299951 cttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 5300004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11727409 - 11727156
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11727409 aaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 11727310  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||        |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11727309 gacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttaca 11727210  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11727209 cttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatga 11727156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 16446680 - 16446933
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446680 aaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 16446779  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  16446780 gacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttaca 16446879  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16446880 cttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatga 16446933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 318
Target Start/End: Original strand, 24823199 - 24823395
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24823199 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24823298  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24823299 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacagagttgttgatatcatgtgataatcttgagtattatactttgtggggtgttacacttaa 24823395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 361
Target Start/End: Original strand, 37970324 - 37970571
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970324 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 37970423  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||| ||    ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37970424 gacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 37970523  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatc 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37970524 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 37970571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 1149437 - 1149690
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149437 aaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 1149536  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||        |||| | ||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  1149537 gacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 1149636  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1149637 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 1149690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 27082643 - 27082896
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27082643 aaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 27082742  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |    
T  27082743 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcggggtgttaga 27082842  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27082843 cttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 27082896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34895347 - 34895099
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34895347 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttg 34895248  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  34895247 aacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttaca 34895153  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34895152 cttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 34895099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 36694771 - 36695024
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36694771 aaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttg 36694870  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36694871 gatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 36694970  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36694971 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 36695024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 43643400 - 43643653
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43643400 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 43643499  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  || |||        |||||| ||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||     
T  43643500 gacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacg 43643599  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43643600 cttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatga 43643653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1205312 - 1205059
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1205312 aaaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttg 1205213  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||        |||||| ||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  1205212 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 1205113  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1205112 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatga 1205059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 4132492 - 4132743
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4132492 aaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 4132591  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4132592 acttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacac 4132691  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4132692 tt-aaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 4132743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 367
Target Start/End: Original strand, 6098320 - 6098576
Alignment:
Q  124 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 223  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098320 aaagttaatcatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 6098419  T
Q  224 cttacatgtac-----tattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 310  Q
    |||||| ||||     |||| |||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6098420 cttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtt 6098519  T
Q  311 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6098520 acacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatga 6098576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40862805 - 40862560
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40862805 aaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 40862706  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacaga-----attgttg---atatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     || ||||   |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  40862705 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttac 40862606  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtta 358  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40862605 acttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgtta 40862560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44869882 - 44869631
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44869882 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttg 44869783  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--gaa------ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||      ||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    |||    
T  44869782 gacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-acaaca 44869684  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44869683 cttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgat 44869631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 125 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 466214 - 465974
Alignment:
Q  125 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  466214 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagac 466115  T
Q  225 ttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacactt 316  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466114 ttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat-atg---------tgagtgttacactttgtggggtgttacactt 466025  T
Q  317 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466024 aaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 465974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12876495 - 12876241
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12876495 aaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttg 12876396  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagt-tttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12876395 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttac 12876296  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12876295 gcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatga 12876241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 7890762 - 7891015
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7890762 aaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttta 7890861  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||        |||| ||| |||||| |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||     
T  7890862 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacg 7890961  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7890962 cttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatga 7891015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16223248 - 16222995
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16223248 aaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 16223149  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||     
T  16223148 gacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacg 16223049  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16223048 tttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatga 16222995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 39098924 - 39099177
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39098924 aaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 39099023  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||        |||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||    
T  39099024 gacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttaca 39099123  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39099124 cttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga 39099177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Original strand, 8803621 - 8803873
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8803621 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatctt 8803720  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  8803721 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttac 8803820  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  8803821 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgat 8803873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 1953793 - 1954047
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1953793 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 1953892  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgggg-tgttac 312  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||        |||||| ||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1953893 gatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttac 1953992  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||    
T  1953993 acttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatga 1954047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33906595 - 33906344
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906595 aaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 33906498  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||  ||||||     
T  33906497 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacc 33906398  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33906397 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 33906344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864280
Alignment:
Q  146 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgt 9864410  T
Q  246 tgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 337  Q
    || |||||||        |||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864409 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 9864310  T
Q  338 agattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9864309 atattaagtgtattcttattagtctgatga 9864280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 23854236 - 23854489
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854236 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 23854335  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||        |||| ||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||    
T  23854336 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttaca 23854435  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||    
T  23854436 cttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatga 23854489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 35459516 - 35459769
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  35459516 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttg 35459615  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  ||||||||||| || || ||||||        |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||| | | |||||| |||||||    
T  35459616 gacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgtgggatgttaca 35459715  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35459716 tttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 35459769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Original strand, 34951862 - 34951999
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||     
T  34951862 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatctta 34951961  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34951962 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 34951999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 30654388 - 30654641
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30654388 aaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatctt 30654486  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||        ||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  30654487 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 30654586  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30654587 gcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatga 30654641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 31933691 - 31933944
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||     
T  31933691 aaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatctta 31933790  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||        |||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||      
T  31933791 gacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatg 31933890  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31933891 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatga 31933944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12587967 - 12587830
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12587967 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttt 12587868  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587867 gacttacaggtactattttatcgttgacatctttaaca 12587830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18259464 - 18259229
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18259464 aaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatctta 18259365  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||| ||||||| |||||     ||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  18259364 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga----cttaggtgttacactttgtgggatgttaca 18259269  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 353  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  18259268 cttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgtattct 18259229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35859319 - 35859182
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35859319 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcg 35859220  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35859219 aacttacaagtactattttatcgttggcatctttaaca 35859182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307755
Alignment:
Q  193 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttta-------acagaattgttgatatcatgtgatagttt 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || |       ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacattttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtct 13307837  T
Q  286 tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13307836 taagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatga 13307755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 10555010 - 10555260
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt--aattcatctagtaatgcttgcaacatct 219  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10555010 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatct 10555106  T
Q  220 tggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |  ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||  |  ||||||||  |||||| ||||||     
T  10555107 tggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag--tcaagtgttacgttttgtgaggtgttg 10555204  T
Q  312 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10555205 cgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 10555260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33198187 - 33198057
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  33198187 aaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatttta 33198088  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33198087 gacttacatgtactattttatcgttggcatc 33198057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 367
Target Start/End: Original strand, 41910935 - 41911046
Alignment:
Q  256 aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttg 355  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41910935 aacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttg 41911034  T
Q  356 ttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||    
T  41911035 ttaatctgatga 41911046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 259
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149862
Alignment:
Q  153 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  253 tttaaca 259  Q
    |||||||    
T  1149856 tttaaca 1149862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 258 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43025943 - 43025834
Alignment:
Q  258 cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtt 357  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  43025943 cagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttctt 43025844  T
Q  358 aatctgatga 367  Q
    | ||||||||    
T  43025843 agtctgatga 43025834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41362807 - 41362723
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41362807 aaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43026059 - 43025974
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43026059 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 367
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150163
Alignment:
Q  294 acactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 1150163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 306 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998427
Alignment:
Q  306 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 7998427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952089
Alignment:
Q  306 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatga 34952089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463722
Alignment:
Q  186 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaaca 34463722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362647
Alignment:
Q  307 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatga 41362647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13307964 - 13307931
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13307964 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 13307931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12585341 - 12585297
Alignment:
Q  274 atgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaa 318  Q
    |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12585341 atgtgatagtattaagtgttagattttgtggggtgttacacttaa 12585297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 154
Target Start/End: Original strand, 41910863 - 41910895
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattca 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41910863 aaaaagttaattttaatctgaatgtttgattca 41910895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33341784 - 33341531
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33341784 aaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 33341685  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  33341684 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttaca 33341585  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33341584 cttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatga 33341531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 47254126 - 47253866
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47254126 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 47254027  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  47254026 gacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 47253927  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47253926 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgatactatg 47253866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 122 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7703895 - 7703635
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7703895 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttc 7703796  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7703795 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttaca 7703696  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7703695 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatactatg 7703635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 368
Target Start/End: Original strand, 30002466 - 30002711
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30002466 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 30002565  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002566 gacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttaca 30002656  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002657 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgat 30002711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 125 - 367
Target Start/End: Original strand, 34947923 - 34948175
Alignment:
Q  125 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34947923 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 34948022  T
Q  225 ttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagt--gttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||        |||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  34948023 ttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcac 34948122  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34948123 tttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 34948175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 28002811 - 28003064
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28002811 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttg 28002910  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28002911 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttaca 28003010  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  28003011 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatga 28003064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37776044 - 37775800
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37776044 aaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 37775945  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||| | ||| ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37775944 gacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttaca 37775854  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37775853 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 37775800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 55477716 - 55477969
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477716 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 55477815  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  55477816 gacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttaca 55477915  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55477916 cttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 55477969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 354
Target Start/End: Original strand, 55240930 - 55241170
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  55240930 aaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatcttg 55241029  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  55241030 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttaca 55241129  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattctt 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55241130 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattctt 55241170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 124 - 367
Target Start/End: Original strand, 37663568 - 37663819
Alignment:
Q  124 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 223  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663568 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 37663667  T
Q  224 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||   |||     ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37663668 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgct 37663767  T
Q  316 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37663768 tatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 37663819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1815687 - 1815434
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1815687 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 1815588  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  1815587 gatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacc 1815488  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  1815487 cttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatga 1815434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17168099 - 17167846
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17168099 aaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctta 17168000  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17167999 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 17167900  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17167899 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 17167846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17272350 - 17272097
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17272350 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 17272251  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||        || ||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  17272250 gacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttaca 17272151  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17272150 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 17272097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 29584025 - 29584278
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584025 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 29584124  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||        ||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||    
T  29584125 gacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaaca 29584224  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29584225 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 29584278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 124 - 367
Target Start/End: Original strand, 19089280 - 19089531
Alignment:
Q  124 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 223  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089280 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 19089379  T
Q  224 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   |||     ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |     
T  19089380 cttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgca 19089479  T
Q  316 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19089480 tatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 19089531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50765106 - 50764863
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50765106 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 50765007  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50765006 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtggggtgttaca 50764907  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50764906 c----------gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatga 50764863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17173676 - 17173423
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17173676 aaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctta 17173577  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17173576 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 17173477  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17173476 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 17173423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23761457 - 23761205
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23761457 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 23761358  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||||||| |||||| || | ||| ||||||| || |||||||||    
T  23761357 gacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttaca 23761258  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23761257 cttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 23761205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25184499 - 25184246
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184499 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 25184400  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  || |||        |||||| ||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||     
T  25184399 gacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacg 25184300  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25184299 cttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatga 25184246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3043005 - 3042752
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3043005 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgttg 3042906  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  3042905 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 3042806  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3042805 cttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatga 3042752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27397000 - 27396749
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27397000 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 27396903  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| | |||| | ||||||||||||||||||        |||||  ||| |||||||||| ||| || || ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  27396902 gacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttaca 27396803  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396802 cttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 27396749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 46887983 - 46888235
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46887983 aaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttg 46888082  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||        || ||| |||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  46888083 gatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatag-tctaagtgttacgttttgtggggtgttaca 46888181  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  46888182 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 46888235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Original strand, 32912404 - 32912656
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32912404 aaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 32912503  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  32912504 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 32912603  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  32912604 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgat 32912656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 35020856 - 35021113
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatca----atagtaattcatctagtaatgcttgcaacat 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35020856 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatat 35020955  T
Q  218 cttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35020956 cttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgt 35021055  T
Q  310 tacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  35021056 tacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatga 35021113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50697628 - 50697374
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50697628 aaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 50697529  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt---------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    || ||||| |||||||||||||||||  ||||||         |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  50697528 gaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttac 50697429  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  50697428 gcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 50697374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 879373 - 879626
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879373 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 879472  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||| ||    ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||     
T  879473 gacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacg 879572  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  879573 cttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatga 879626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 19440473 - 19440726
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19440473 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 19440572  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||| |||   || || ||||||| ||||||||||||||     
T  19440573 gacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacg 19440672  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19440673 cttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 19440726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 37288115 - 37287858
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaa-tcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37288115 aaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatctt 37288016  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctt--------taacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt-ggggtgtta 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||         |||| | ||| |||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  37288015 ggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgtta 37287916  T
Q  312 cacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgat 368  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37287915 cacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatcttatgat 37287858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 359
Target Start/End: Original strand, 34361316 - 34361562
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34361316 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 34361415  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  34361416 ggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttac 34361515  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 359  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  34361516 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaa 34361562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32579832 - 32579579
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32579832 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 32579733  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||| | ||| |||||| ||  |||||| || || |||||||||| || ||| |||||    
T  32579732 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttaca 32579633  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  32579632 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatga 32579579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32592470 - 32592226
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32592470 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacatcttg 32592371  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||        |||| | ||| ||| ||||         | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592370 aacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatca---------tatgagtgttacactttgtggggtgttaca 32592280  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32592279 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatga 32592226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6864421 - 6864170
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6864421 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 6864322  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     |||||||  || |||||||||||||  ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||     
T  6864321 aacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacg 6864222  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  6864221 cttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgat 6864170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4598368 - 4598125
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4598368 aaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttg 4598269  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598268 gatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttaca 4598178  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4598177 cttaaaacaa-gcaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatga 4598125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49376353 - 49376100
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  49376353 aaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttg 49376254  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||   |    
T  49376253 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataa 49376154  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  49376153 cttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatga 49376100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 122 - 360
Target Start/End: Original strand, 36493514 - 36493759
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  36493514 aaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatctta 36493613  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  36493614 gacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttaca 36493712  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 360  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36493713 cttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 36493759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Original strand, 33816341 - 33816609
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33816341 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 33816440  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttg------------ 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||                
T  33816441 gacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattaca 33816540  T
Q  302 -----tggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33816541 ctttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgat 33816609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 25700881 - 25701135
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||     
T  25700881 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatctta 25700980  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgggg-tgttac 312  Q
    || ||||   |||||||||||||||||| |||||        |||| | ||| |||| | |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25700981 gatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttac 25701080  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  25701081 acttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatga 25701135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9139612 - 9139378
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9139612 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaacatcttgg 9139515  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaca 322  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||       ||  | || | | |  | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9139514 acttacatgtactacgttatcgttggcatctttaaca-------tgcaaaca-gagtttatcttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaaca 9139423  T
Q  323 aggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9139422 aggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 9139378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Original strand, 7152029 - 7152166
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7152029 aaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 7152128  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7152129 gacttacaggtactattttatcgttgacatatttaaca 7152166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39400394 - 39400257
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39400394 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 39400295  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
     ||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39400294 aacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaaca 39400257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 5047791 - 5048043
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  5047791 aaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttg 5047890  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||        |||| | ||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  |||| |||||    
T  5047891 gacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttg-cgggtattaca 5047989  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  5047990 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatga 5048043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 122 - 246
Target Start/End: Original strand, 35025392 - 35025515
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35025392 aaaaagttaattttgat-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 35025490  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgtt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35025491 gacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42200116 - 42199862
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    ||||||||||||| | | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42200116 aaaaagttaatttgatt-ttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 42200018  T
Q  221 ggacttac-atgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtta 311  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||        ||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  42200017 ggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgtta 42199918  T
Q  312 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
      |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42199917 tgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42199862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4205370 - 4205233
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4205370 aaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttg 4205271  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4205270 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 4205233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23431941 - 23431826
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23431941 aaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatcttg 23431842  T
Q  222 gacttacatgtactat 237  Q
    |||||||| |||||||    
T  23431841 gacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 358
Target Start/End: Original strand, 46883939 - 46884177
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  46883939 aaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc--g 46884036  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||  || |||        |||| ||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||      
T  46884037 gacttaca--tactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatag-tttaagtgttacattttgtgagatgtta-g 46884132  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtta 358  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  46884133 cttataacaagatatgataaaattagattaagtgtagtctcgtta 46884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 367
Target Start/End: Original strand, 4934040 - 4934280
Alignment:
Q  125 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||          
T  4934040 aagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaattcatctattaatgcgtgcaacat------ 4934133  T
Q  224 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 315  Q
         | ||||||||||||||||| |||||||||||         | ||| |||||| || ||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||    
T  4934134 -----aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggact 4934228  T
Q  316 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4934229 taaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 4934280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26896474 - 26896346
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26896474 aaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacatttt 26896375  T
Q  221 -ggacttacatgtactattttatcgttga 248  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26896374 cggacttacaagtactattttatcgttga 26896346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011987
Alignment:
Q  193 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagtt 284  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||        | | ||| |||||| ||||||||||     
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  285 ttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatga 38011987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38012648 - 38012568
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctag 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012648 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 367
Target Start/End: Original strand, 54499217 - 54499316
Alignment:
Q  269 atatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  54499217 atatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatga 54499316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39398049
Alignment:
Q  294 acactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 39398049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 267 - 368
Target Start/End: Original strand, 35025574 - 35025675
Alignment:
Q  267 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 366  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||    
T  35025574 tgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaacaagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgatg 35025673  T
Q  367 at 368  Q
    ||    
T  35025674 at 35025675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050179
Alignment:
Q  204 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaaca 56050179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 75
Target Start/End: Original strand, 7982770 - 7982804
Alignment:
Q  41 taattgagtgattttaattgattgataatgtaaag 75  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7982770 taattgggtgattttaattgattgataatgtaaag 7982804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12294 - 12042
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12294 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 12196  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12195 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttaca 12096  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12095 cttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 12042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 3879737 - 3879990
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3879737 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 3879836  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3879837 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 3879936  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3879937 tttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatga 3879990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 6090980 - 6091234
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6090980 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 6091079  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagt-tttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6091080 gacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttac 6091179  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  6091180 gcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatga 6091234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4318874
Alignment:
Q  128 ttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttt 4318725  T
Q  228 catgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaa 319  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4318726 cccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaa 4318825  T
Q  320 acaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4318826 acaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatga 4318874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 33892810 - 33893054
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33892810 aaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttg 33892909  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||        || ||| ||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |    
T  33892910 gacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttata 33893000  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33893001 cataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33893054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20768468 - 20768217
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20768468 aaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttg 20768369  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||||||| |||| |||||||    
T  20768368 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttaca 20768269  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  20768268 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaa--gtaatcttgttaatctgatga 20768217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1946221 - 1945975
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1946221 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatctt 1946122  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  1946121 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 1946022  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 359  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1946021 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 1945975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 21016916 - 21017163
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21016916 aaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 21017015  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||      ||||||||||||||||||||| |||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21017016 gac------gtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 21017109  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21017110 cttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatga 21017163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29182547 - 29182296
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  29182547 aaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaattcatctagtaatacttgcaacatctta 29182451  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt-ggggtgttac 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  29182450 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttac 29182351  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29182350 acttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatga 29182296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 7234830 - 7235086
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg---attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7234830 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatc 7234929  T
Q  219 ttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  7234930 ttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgtt 7235029  T
Q  311 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7235030 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 7235086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5627778 - 5627524
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5627778 aaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatctt 5627679  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||     
T  5627678 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttat 5627579  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5627578 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 5627524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8513607 - 8513366
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  8513607 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaagattttg 8513515  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||         
T  8513514 gacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtg----- 8513420  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8513419 -ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatga 8513366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33619219 - 33619080
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat---taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33619219 aaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacata 33619120  T
Q  219 ttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33619119 ttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaac 33619080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6089282 - 6089041
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6089282 aaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttg 6089190  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||| | |||         
T  6089189 gacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtg----- 6089095  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  6089094 -ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatga 6089041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 256 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15491859 - 15491748
Alignment:
Q  256 aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttg 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15491859 aacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattcttg 15491760  T
Q  356 ttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||    
T  15491759 ttaatctgatga 15491748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 122 - 247
Target Start/End: Original strand, 7054570 - 7054696
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7054570 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatctt 7054669  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttg 247  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||    
T  7054670 ggacttacagttactattttatcgttg 7054696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 222 - 367
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353409
Alignment:
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 30353355  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatga 30353409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Original strand, 7055166 - 7055266
Alignment:
Q  267 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 366  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7055166 tgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatg 7055265  T
Q  367 a 367  Q
    |    
T  7055266 a 7055266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 182
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724117
Alignment:
Q  127 gttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618967
Alignment:
Q  324 ggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33619010 ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 33618967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44891874 - 44891623
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44891874 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 44891775  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44891774 gacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttaca 44891675  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44891674 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 44891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 22622517 - 22622770
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22622517 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 22622616  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  22622617 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttaca 22622716  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22622717 cttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 22622770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33698530 - 33698277
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  33698530 aaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaatatctta 33698431  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| |||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33698430 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 33698331  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698330 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33698277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 52040722 - 52040974
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52040722 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttgg 52040821  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  52040822 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacac 52040921  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52040922 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 52040974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4015836 - 4015584
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4015836 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 4015737  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca-------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||        | |||||||||  ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4015736 gacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaacaagttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacac 4015637  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  4015636 ttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatga 4015584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 7327281 - 7327534
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7327281 aaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 7327380  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7327381 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 7327480  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7327481 ctagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatga 7327534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39283029 - 39282776
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39283029 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 39282930  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||        | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39282929 gatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 39282830  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39282829 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 39282776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32373846 - 32373594
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  32373846 aaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 32373748  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  32373747 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttaca 32373648  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32373647 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 32373594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 46297561 - 46297814
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297561 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 46297660  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  46297661 gacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 46297760  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  46297761 cttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatga 46297814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 124 - 367
Target Start/End: Original strand, 42505876 - 42506127
Alignment:
Q  124 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 223  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505876 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 42505975  T
Q  224 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||   |||     ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42505976 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgct 42506075  T
Q  316 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42506076 tatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42506127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 26941059 - 26941312
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26941059 aaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 26941158  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||     
T  26941159 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacg 26941258  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26941259 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 26941312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 24707914 - 24708169
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  24707914 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaacttcttg 24708013  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24708014 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 24708113  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagat--taagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  24708114 cttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatga 24708169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 53228952 - 53229204
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53228952 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttga 53229051  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  53229052 acttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacac 53229151  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  53229152 ttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatga 53229204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2008316 - 2008057
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2008316 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaa 2008217  T
Q  215 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgggg 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  2008216 catcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggag 2008117  T
Q  307 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2008116 tg-tacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatga 2008057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 33378584 - 33378837
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33378584 aaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 33378683  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| ||| || ||| |||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  33378684 aacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttaca 33378783  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33378784 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 33378837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37158085 - 37157836
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  37158085 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattg 37157986  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac---------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||         | | ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37157985 gacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 37157886  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 362  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37157885 acttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 37157836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1090070 - 1089819
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1090070 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 1089971  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgggg-tgttac 312  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||        ||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1089970 gattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttac 1089872  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||||    
T  1089871 acttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgat 1089819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34133059
Alignment:
Q  146 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 34133189  T
Q  246 tgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 337  Q
    || |||||||        |||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133188 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 34133089  T
Q  338 agattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34133088 atattaagtgtattcttattagtctgatga 34133059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37203445 - 37203191
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  37203445 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattg 37203346  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac---------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||         | | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  37203345 gacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatac 37203246  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37203245 actaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatga 37203191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 14586479 - 14586722
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14586479 aaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttg 14586578  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||||||||||||         |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14586579 gacttac-cgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatca---------tacgagtgttacactttgtggggtgttaca 14586668  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14586669 cttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatga 14586722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48355318 - 48355065
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48355318 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttg 48355219  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  ||||||||||| || |  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||    
T  48355218 gacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttaca 48355119  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  48355118 tttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatga 48355065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25580116 - 25579868
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  25580116 aaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctta 25580017  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || ||| | ||||  ||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25580016 gatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 25579917  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 362  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25579916 ctaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatct 25579868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 123 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3362631 - 3362385
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3362631 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattgg 3362532  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    ||||  | |||| ||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3362531 acttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcac 3362432  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagatta--agtgtattcttgttaa 359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  3362431 ttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaa 3362385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21193984 - 21193730
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21193984 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttg 21193885  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagt-tttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
     ||||||   ||||||||||||||    ||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| ||| |||||||    
T  21193884 aacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttac 21193785  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21193784 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 21193730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22451345 - 22451092
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22451345 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 22451246  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||  |||||| || | ||||||||||  ||||||||||||    
T  22451245 gacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttaca 22451146  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  22451145 cttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatga 22451092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36012517 - 36012261
Alignment:
Q  122 aaaaagttaa-ttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  36012517 aaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcatttt 36012418  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac---------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtta 311  Q
    |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||         ||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||    
T  36012417 ggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgtta 36012318  T
Q  312 cacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36012317 cactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatga 36012261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 40552058 - 40552311
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40552058 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatg 40552157  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||| | |  | |||||||||| ||||||| ||||||     
T  40552158 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacg 40552257  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| |||||| || |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  40552258 cttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatga 40552311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29099723 - 29099479
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29099723 aaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 29099624  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  |||||||        |||||| ||| ||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  29099623 gacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaa---------gttacactttgtggggtgttaca 29099533  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29099532 cttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatga 29099479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29164179 - 29163942
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29164179 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatctta 29164087  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||        || ||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  29164086 gacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttaca 29163996  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29163995 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatga 29163942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 3654998 - 3655254
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc--atctagtaatgcttgcaacatc 218  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3654998 aaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacatc 3655097  T
Q  219 ttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 310  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||  ||||||        ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  3655098 ttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgtt 3655197  T
Q  311 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3655198 acgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 3655254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 24488761 - 24489014
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24488761 aaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24488860  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     ||||||    |||||||||| |||| ||||||||||        ||| ||| ||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  24488861 aacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttaca 24488960  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24488961 cttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatga 24489014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 44186316 - 44186553
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  44186316 aaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 44186415  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||||||||||||||||||||                |||||||||||||||    
T  44186416 gacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatag----------------ttgtggggtgttaca 44186499  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44186500 tttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatga 44186553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47481900 - 47481654
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47481900 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 47481801  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||        || ||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  47481800 gaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttat 47481701  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 359  Q
     |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  47481700 gcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 47481654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 21009600 - 21009854
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21009600 aaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 21009699  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca-gaa-------ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
     |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | |       ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||     
T  21009700 agacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttat 21009799  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     |||| |||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21009800 gcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 21009854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 361
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994707
Alignment:
Q  152 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacat 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |  ||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  252 cttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatta 343  Q
    ||||        |||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagatta 46994689  T
Q  344 agtgtattcttgttaatc 361  Q
    |||||| |||||||||||    
T  46994690 agtgtagtcttgttaatc 46994707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 11357181 - 11357317
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357181 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 11357280  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11357281 acttacaagtactattttatcgttggtatctttaaca 11357317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11467187 - 11466948
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||     
T  11467187 aaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatcta-------ttgcaacatctta 11467102  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||  ||||| ||||        || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  11467101 gacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattaca 11467002  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11467001 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 11466948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 22445865 - 22446116
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  22445865 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttgg 22445964  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaa----cagaa----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||    || ||    ||| |||||| || ||||||| |||||||||| || |||| | |||||||||    
T  22445965 acttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgt-gagtgttacac 22446063  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  22446064 ttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatga 22446116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 4761447 - 4761701
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  4761447 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacattttg 4761546  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt-ggggtgttac 312  Q
    |||||| | |||||||||||| || |  |||||||||        | | ||| |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||     
T  4761547 gacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttat 4761646  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4761647 acttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatga 4761701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 122 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 54506185 - 54505939
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54506185 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatttt 54506086  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||        | | | | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||     
T  54506085 ggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttat 54505986  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 359  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  54505985 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 54505939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 193 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348381
Alignment:
Q  193 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagtt 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||||     
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  285 ttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 43348381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591822
Alignment:
Q  146 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||    
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgt 38591952  T
Q  246 tgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 337  Q
    || |||||||        || ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38591951 tgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaatt 38591852  T
Q  338 agattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38591851 agattaagtgtagtcttgttaatctgatga 38591822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 43975691 - 43975940
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43975691 aaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 43975790  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt-----------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||           |||| | ||| |||||| ||| |||       ||||||||||||| |||||||||    
T  43975791 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgat-------agtgttacactttctggggtgtt 43975883  T
Q  311 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  43975884 acacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatga 43975940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 367
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828753
Alignment:
Q  168 gattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aaca 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||        ||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  260 gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 359  Q
     | ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  54828646 tagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttca 54828745  T
Q  360 tctgatga 367  Q
    | ||||||    
T  54828746 tatgatga 54828753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40936350 - 40936213
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40936350 aaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 40936251  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40936250 gacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaaca 40936213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174629
Alignment:
Q  184 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||        || ||| |||||||||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  276 gtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     | ||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatga 45174629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 184 - 365
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835678
Alignment:
Q  184 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctt--taacagaattgttgatatcatgtgata 281  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |   || ||| ||| |||||||||||||||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacatcatgcaaatagagttgatgatatcatgtgata 11835593  T
Q  282 gttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa-attagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    || || | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11835594 gtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgat 11835678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 50475195 - 50475053
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat-------caatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 214  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50475195 aaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaa 50475096  T
Q  215 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaa 257  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50475095 catcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaa 50475053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Original strand, 51212576 - 51212707
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51212576 aaaaagttaattttgatcttaat------ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 51212669  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||    
T  51212670 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaaca 51212707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 305
Target Start/End: Original strand, 11356957 - 11357140
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||    
T  11356957 aaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagtaat--------taatgcttgcaacatcttg 11357048  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggg 305  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||        |||| ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11357049 gacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactttgtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 259
Target Start/End: Original strand, 27480164 - 27480298
Alignment:
Q  129 taattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg----caacatcttggac 224  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     ||||| ||||||    
T  27480164 taattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggac 27480263  T
Q  225 ttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27480264 ttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 27480298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 122 - 334
Target Start/End: Original strand, 20373062 - 20373263
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||    
T  20373062 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt-------------------catcttg 20373142  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||     
T  20373143 gacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatgggatattacg 20373242  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaa 334  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  20373243 cttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35844550 - 35844450
Alignment:
Q  267 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 365  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35844550 tgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 35844452  T
Q  366 ga 367  Q
    ||    
T  35844451 ga 35844450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 289 - 367
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213033
Alignment:
Q  289 gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 51213033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 53176278 - 53176178
Alignment:
Q  267 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 366  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53176278 tgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatg 53176179  T
Q  367 a 367  Q
    |    
T  53176178 a 53176178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Original strand, 11357355 - 11357416
Alignment:
Q  306 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11357355 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatga 11357416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 367
Target Start/End: Original strand, 27480368 - 27480431
Alignment:
Q  304 gggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  27480368 gggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatga 27480431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 259
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811670
Alignment:
Q  186 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaaca 53811670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 367
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373348
Alignment:
Q  319 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 20373348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35844624 - 35844577
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttga 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35844624 aaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40936154 - 40936115
Alignment:
Q  328 ggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40936154 ggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatga 40936115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 43348591 - 43348556
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43348591 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcattt 43348556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 364
Target Start/End: Original strand, 33709049 - 33709299
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709049 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 33709148  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||||||        |||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33709149 gatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttaca 33709248  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33709249 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctga 33709299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4167308 - 4167055
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4167308 aaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttg 4167209  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4167208 gacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 4167109  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4167108 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 4167055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41961226 - 41960973
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961226 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 41961127  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||        || ||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41961126 gacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 41961027  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41961026 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 41960973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 18494098 - 18494350
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18494098 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 18494197  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| |||||    
T  18494198 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt-ttaca 18494296  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  18494297 cttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatga 18494350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 374
Target Start/End: Original strand, 2325195 - 2325455
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325195 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 2325294  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    || ||||| |||||||||||||||||  ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  2325295 gatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 2325394  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 374  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  2325395 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgatactatg 2325455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44914053 - 44913796
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca---tctagtaatgcttgcaacatc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  44914053 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatc 44913954  T
Q  219 ttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt-ggggtgt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  44913953 ttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgt 44913854  T
Q  310 tacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44913853 tacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatga 44913796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4764017 - 4763764
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4764017 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttg 4763918  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||        ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4763917 gacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctaca 4763818  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4763817 cttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 4763764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 31570551 - 31570804
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  31570551 aaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatctta 31570650  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31570651 aacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttaca 31570750  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31570751 cttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 31570804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 43648062 - 43648315
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43648062 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatcttg 43648161  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--gaa------ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||      ||| |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  43648162 gacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttaca 43648261  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43648262 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 43648315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 19424459 - 19424698
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19424459 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 19424558  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 321  Q
    ||||| || ||||     |||| || ||||    |||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19424559 gacttgcaggtac-----tatctttaacat-gcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 19424652  T
Q  322 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19424653 aaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatga 19424698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26357963 - 26357710
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26357963 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 26357864  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||| |  |||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  26357863 gacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttaca 26357764  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26357763 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatga 26357710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3177325 - 3177072
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3177325 aaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttg 3177226  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3177225 gacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 3177126  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3177125 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 3177072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5881915 - 5881672
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5881915 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 5881816  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5881815 gacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatg---------tgagtgttacactttgtgaggtattaca 5881725  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5881724 cttaaaacaaggtatgat-aaattagattaaatgtattcttgttaatatgatga 5881672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 33660194 - 33660438
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33660194 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctca 33660293  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| ||||||||||         || |||||||||||||||||||||||||    
T  33660294 gacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatg---------tgggtgttacactttgtggggtgttaca 33660384  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33660385 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatga 33660438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 11366197 - 11366451
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366197 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 11366296  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  11366297 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttat 11366396  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
      ||| |||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  11366397 gtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatga 11366451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41465887 - 41465634
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41465887 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttg 41465788  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||| ||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  41465787 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttaca 41465688  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||    
T  41465687 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatga 41465634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 29241963 - 29242208
Alignment:
Q  123 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 222  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |       |||||||    
T  29241963 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaattc-------atcttgg 29242055  T
Q  223 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 314  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||        || ||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29242056 acttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacac 29242155  T
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29242156 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 29242208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 39167186 - 39167433
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  39167186 aaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaacaatttg 39167285  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||      |||||||||||||||| |||||||    
T  39167286 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt------tgttacactttgtgggatgttaca 39167379  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39167380 cttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatga 39167433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 19289140 - 19289393
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19289140 aaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttg 19289239  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttta--------acagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |  |||||||        ||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  19289240 gacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 19289339  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19289340 tttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 19289393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35959278 - 35959030
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35959278 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 35959179  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |    |||||||||||||||||||||| ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||     
T  35959178 g----acatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacg 35959083  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  35959082 cttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatga 35959030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Original strand, 27349789 - 27350009
Alignment:
Q  146 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  27349789 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgt 27349888  T
Q  246 tgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 337  Q
    ||  ||||||        |||||| ||  ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27349889 tggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaatt 27349979  T
Q  338 agattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27349980 agattaagtgtattcttgttaatctgatga 27350009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37906097 - 37905841
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37906097 aaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatctt 37905998  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt--ggggtgtt 310  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||        |||||| ||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  37905997 ggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgtt 37905898  T
Q  311 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37905897 acgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 37905841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 43770665 - 43770909
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43770665 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 43770764  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
     ||||| |  ||||||||||| |||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43770765 aacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtgaggtgttaca 43770855  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43770856 cttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatga 43770909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 155 - 367
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264147
Alignment:
Q  155 tttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  255 t--------aacagaattgttgatatcatg-tgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 345  Q
    |        |||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 4264125  T
Q  346 tgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||| ||||| ||||||    
T  4264126 tgtattcttcttaatatgatga 4264147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31862238 - 31861985
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||    
T  31862238 aaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatcttg 31862139  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  ||| ||        |||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  31862138 gacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacg 31862039  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31862038 cttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31861985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 33550800 - 33551056
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga----tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacat 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33550800 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacat 33550899  T
Q  218 cttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgt 309  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||        |||| | ||| |||||| ||  | |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33550900 attggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgt 33550998  T
Q  310 tacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33550999 tacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 33551056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 122 - 362
Target Start/End: Original strand, 7006755 - 7006986
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006755 aaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 7006854  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||| | || ||                 |||||||    
T  7006855 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaag-----------------tgttaca 7006937  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006938 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 7006986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 156 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478502
Alignment:
Q  156 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  256 --------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagt 346  Q
            |||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacacttt-----gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagt 4478523  T
Q  347 gtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4478522 gtattcttgttaatctgatga 4478502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44286285 - 44286082
Alignment:
Q  172 actgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aat 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||         | |    
T  44286285 actgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagt 44286186  T
Q  264 tgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctg 363  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44286185 tgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctg 44286086  T
Q  364 atga 367  Q
    ||||    
T  44286085 atga 44286082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13711845 - 13711597
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  13711845 aaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaacatctta 13711746  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttta--------acagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||        ||||| ||| ||||||||||| ||||| || | | ||| ||||| ||||||||||||    
T  13711745 gacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggggtgttaca 13711646  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||||     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13711645 cttaaaac-----atgataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 13711597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 169 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19314186 - 19313984
Alignment:
Q  169 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta---catgtactattttatcgttgacatctttaacag----- 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||          
T  19314186 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaa 19314087  T
Q  261 ---aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtt 357  Q
       | ||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19314086 catagttgctgatatcatgtgatagt-------gttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgtt 19313994  T
Q  358 aatctgatga 367  Q
    ||||||||||    
T  19313993 aatctgatga 19313984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 129 - 259
Target Start/End: Original strand, 19500739 - 19500869
Alignment:
Q  129 taattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttac 228  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19500739 taattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattac 19500838  T
Q  229 atgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19500839 atgtactattttatcgttaacatctttaaca 19500869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327853
Alignment:
Q  203 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgtta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||  |||||| ||| |||||| ||  ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  295 cactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 45327853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642119
Alignment:
Q  203 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgtta 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||        || ||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  295 cactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat--aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36642193 cactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatga 36642119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 41051117 - 41051238
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41051117 aaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatcttg 41051216  T
Q  222 gacttacatgtactattttatc 243  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  41051217 aacttacaggtactattttatc 41051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 367
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071807
Alignment:
Q  214 acatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggg 305  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||         | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  306 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 17071807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Original strand, 17054066 - 17054166
Alignment:
Q  267 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 366  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17054066 tgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatg 17054165  T
Q  367 a 367  Q
    |    
T  17054166 a 17054166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 227
Target Start/End: Original strand, 41463407 - 41463512
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||     
T  41463407 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatctta 41463506  T
Q  222 gactta 227  Q
    ||||||    
T  41463507 gactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 267 - 359
Target Start/End: Original strand, 18258257 - 18258349
Alignment:
Q  267 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 359  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18258257 tgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 220
Target Start/End: Original strand, 18257355 - 18257453
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257355 aaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33902400 - 33902317
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33902400 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33902299 - 33902199
Alignment:
Q  267 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 366  Q
    |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||    
T  33902299 tgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatg 33902200  T
Q  367 a 367  Q
    |    
T  33902199 a 33902199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 367
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463920
Alignment:
Q  234 ctattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagg 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaag 41463878  T
Q  326 taggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || |||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  41463879 tatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatga 41463920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45328076 - 45328028
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45328076 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 179
Target Start/End: Original strand, 17053963 - 17054005
Alignment:
Q  137 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17053963 atcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 179
Target Start/End: Original strand, 17071604 - 17071646
Alignment:
Q  137 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17071604 atcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 152
Target Start/End: Original strand, 4263726 - 4263756
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4263726 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt 4263756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 408228 - 408481
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408228 aaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 408327  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| ||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||     
T  408328 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacg 408427  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  408428 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 408481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 514 - 267
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 415  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    |||      ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  414 gac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttaca 321  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  320 cttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Original strand, 93900 - 94036
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93900 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 93998  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  93999 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaaca 94036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 367
Target Start/End: Original strand, 94330 - 94435
Alignment:
Q  262 attgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatc 361  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  94330 attgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatc 94429  T
Q  362 tgatga 367  Q
    | ||||    
T  94430 tcatga 94435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 124 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8271 - 8020
Alignment:
Q  124 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 223  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8271 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 8172  T
Q  224 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||     ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8171 cttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgct 8072  T
Q  316 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8071 tatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 8020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44342 - 44090
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  44342 aaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttg 44243  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||      
T  44242 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaag 44144  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| |||||| || |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  44143 cttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatga 44090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 154445 - 154697
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  154445 aaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttg 154544  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||      
T  154545 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaag 154643  T
Q  314 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    |||| |||||| || |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  154644 cttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatga 154697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 145814 - 146068
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  145814 aaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatctt 145913  T
Q  221 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  145914 ggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttat 146013  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  146014 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 146068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 267662 - 267417
Alignment:
Q  122 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 221  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |         |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  267662 aaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt---------taattcatctagtaattcttgcagcatcttg 267572  T
Q  222 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagt-tttgagtgttacactttgtggggtgttac 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||         | ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  267571 gacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtgggatgttac 267472  T
Q  313 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  267471 atttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatga 267417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100993
Alignment:
Q  163 ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacat 100993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 100935 - 100894
Alignment:
Q  315 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  100935 ttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University