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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF4156_high_6 (Length: 212)
Name: NF4156_high_6
Description: NF4156
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4156_high_6 |
 | |
|
| [»] scaffold0070 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0830 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24912933 - 24912753
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
24912933 |
agttttagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
24912834 |
T |
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| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24912833 |
caatgaaccacaggcattgaagaaccaagatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
24912753 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 25490408 - 25490588
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25490408 |
agttttagattgtccttcatccatgagcttagcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
25490507 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25490508 |
caatgaaccacaggcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
25490588 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 25453192 - 25453373
Alignment:
| Q |
17 |
aagtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatc |
116 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25453192 |
aagtttgagattgtccttcatccatgagcttggcaataccaaaatcgctaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattagaaggctttagatc |
25453291 |
T |
|
| Q |
117 |
acaatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25453292 |
acaatgaaccacaggcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
25453373 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 25715404 - 25715584
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25715404 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcgctaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
25715503 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
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||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25715504 |
caatgaaccactggtattgaagaaccacgatggagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
25715584 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 25322867 - 25323046
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25322867 |
agtttgagattgtccttcatccatgagcttggcaataccaaaatcgctaacatgtgcaaccatatttttatccaataagacattggaaggctttagatca |
25322966 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttg |
197 |
Q |
| |
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|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25322967 |
caatgaaccacaggtattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttg |
25323046 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 25695571 - 25695751
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25695571 |
agttttagattgtccttcatccatcagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
25695670 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25695671 |
caatgaaccactggtattgaggaaccatgatggagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
25695751 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 25685858 - 25686037
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25685858 |
agtttgagattgtccttcatccaggagcttggcaataccaaaatcgctaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattcgaaggctttagatcg |
25685957 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttg |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25685958 |
caatgaaccacaggtattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttg |
25686037 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 23258415 - 23258595
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
23258415 |
agtttcagattgtccttcatccatgagctttgaaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattagaaggttttagatcg |
23258514 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23258515 |
caatgaaccacgggtattgaagaaccatgatggagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
23258595 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 25570097 - 25570277
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25570097 |
agttttagattgaccttcatccatgagcttagcaataccaaaatcactaacacgtgcaaccatattttcatccaacatgacattggagggctttagatca |
25570196 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25570197 |
cagtgaaccacaggcattgaagaaccatgatgaagatatttcaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
25570277 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 25604848 - 25605027
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25604848 |
agtttgagattgtccttcatccatgagcttggcaataccaaaatcgctaacatgtgctaccatatttttatccaataagacatttgaaggctttagatct |
25604947 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttg |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25604948 |
caatgaaccacaggtattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttg |
25605027 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 25341191 - 25341371
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25341191 |
agttttagattgtccttcatccatgagcttggcaataccaaaatcgcttacatgtgcaaccatattttcatccaataagacattagaaggctttagatcg |
25341290 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25341291 |
caatgaaccactggtactgaagaaccatgatggagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
25341371 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 25647223 - 25647403
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25647223 |
agttttagattgtccttcacccatgagcttagcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacatttgaaggctttagatct |
25647322 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25647323 |
cattgaaccactggtattgatgaaccatgatggagatattccaattctgatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
25647403 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Original strand, 25475885 - 25476052
Alignment:
| Q |
31 |
ccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatcacaatgaaccacat |
130 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25475885 |
ccttcatcgatgagcttggcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatatttttatccaacatgacattagaaggctttagatcgcaatgaaccacag |
25475984 |
T |
|
| Q |
131 |
gcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25475985 |
gtattgaagaaccatgatggagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatattcaacctttgc |
25476052 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 25800489 - 25800668
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25800489 |
agttttagattgtccttcatccatgagcttggcaataccaaaatcgcttacatgtgcaaccatattttcatccaataagacattagaaggctttagatcg |
25800588 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttg |
197 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25800589 |
caatgaaccactggtattgaagaaccatgatggagatattctactgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttg |
25800668 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22900659 - 22900479
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22900659 |
agttttagattgtccttcatccatgagtttggcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatatcttcgtccagcaagacattactaggctttagatca |
22900560 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22900559 |
caatggaccacaggtattgaagaaccatgatggagatattccaatgcatatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
22900479 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24875279 - 24875169
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24875279 |
agtttcagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcgctaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
24875180 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccac |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
24875179 |
caatgaaccac |
24875169 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24875159 - 24875126
Alignment:
| Q |
165 |
agatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24875159 |
agatgcagcatctatcattatatttaacctttgc |
24875126 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0070 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:
Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16893 - 16713
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16893 |
agttttagattgaccttcatccatgagcttagcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
16794 |
T |
|
| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16793 |
caatgaaccacaggcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacttctatcattatatttaacctttgc |
16713 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Original strand, 10324071 - 10324240
Alignment:
| Q |
25 |
gattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatcacaatgaa |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10324071 |
gattgtccttcatccatgagcttggcaataccaaaatcgctaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattagaaggctttagatcacaatgaa |
10324170 |
T |
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| Q |
125 |
ccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacct |
194 |
Q |
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| T |
10324171 |
ccacgggtattgaagaaccatgatggagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacct |
10324240 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0830 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0830
Description:
Target: scaffold0830; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4379 - 4199
Alignment:
| Q |
18 |
agtttgagattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatca |
117 |
Q |
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| T |
4379 |
agttttagaatgtccttcgtccatgagcttggcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacatttgaaggctttagatct |
4280 |
T |
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| Q |
118 |
caatgaaccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
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| T |
4279 |
caatgaaccacaggtattgaagaaccatgatgtagatattccaatgctgatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
4199 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 5079967 - 5080129
Alignment:
| Q |
24 |
agattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatcacaatga |
123 |
Q |
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| T |
5079967 |
agattgtccatcatccaagagctttgaaatcccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccagtaacacattgctaggcttcaaatcacaatga |
5080066 |
T |
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| Q |
124 |
accacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattata |
186 |
Q |
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| T |
5080067 |
accactggtattgaagaaccatgatgaagatactccaatgcagatgccacatctatcattata |
5080129 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5119565 - 5119392
Alignment:
| Q |
25 |
gattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatcacaatgaa |
124 |
Q |
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| T |
5119565 |
gattgtccttcatccaagagcttggaaatcccaaaatcactaacatgtgcaaccatatcttcatccagcaacacattactaggcttcaaatcacaatgaa |
5119466 |
T |
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| Q |
125 |
ccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
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| T |
5119465 |
ccactggtattgaagaaccatgatgaagatactccaatgcagatgccacatctatcattatgttcaacctttgc |
5119392 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5102006 - 5101833
Alignment:
| Q |
25 |
gattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatcacaatgaa |
124 |
Q |
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| T |
5102006 |
gattgtccttcatccaagagcttggaaatcccaaaatcactaacatgtgcaatcatattttcatccaataacacattagcaggcttcaagtcacaatgaa |
5101907 |
T |
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| Q |
125 |
ccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
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| T |
5101906 |
ccactggtattaaagaaccatgatggagatactccaatgctgatgccacatctatcattatgttcaacctttgc |
5101833 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16886284 - 16886114
Alignment:
| Q |
28 |
tgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatcacaatgaacca |
127 |
Q |
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| T |
16886284 |
tgtccttcatccaagagcttagaaattccaaaatcactgacatgtgcaaccatattttcatctagtaacacattactaggcttcaaatcacaatgaacca |
16886185 |
T |
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| Q |
128 |
catgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
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| T |
16886184 |
ctggtattgaagaaccatgatggagatactccaatgcagatgcaacatctatcattatattcaacctttgc |
16886114 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 198
Target Start/End: Original strand, 14412279 - 14412452
Alignment:
| Q |
25 |
gattgtccttcatccatgagctttgcaataccaaaatcactaacatgtgcaaccatattttcatccaacaagacattggaaggctttagatcacaatgaa |
124 |
Q |
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| T |
14412279 |
gattgtccttcatccaagagcttggaaatgccaaaatcactcacatgtgcaatcatagcttcatctagtaacacattactaggcttcaagtcacaatgaa |
14412378 |
T |
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| Q |
125 |
ccacatgcattgaagaaccatgatgaagatattccaatgcagatgcaacatctatcattatatttaacctttgc |
198 |
Q |
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14412379 |
ccactggtattgaagaaccatgatggagatactccaatgcagatgccacatctatcattatgttcaacctttgc |
14412452 |
T |
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Back To:
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