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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4157_low_10 (Length: 290)

Name: NF4157_low_10
Description: NF4157
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4157_low_10
NF4157_low_10
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (2-279)||(33826640-33826916)
chr5 (2-279)||(2416539-2416815)
chr5 (2-279)||(39878552-39878828)
chr5 (11-279)||(39348310-39348577)
chr5 (11-58)||(2416500-2416547)
chr5 (11-58)||(33826601-33826648)
chr5 (11-58)||(39878820-39878867)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (2-279)||(9061490-9061766)
chr8 (11-58)||(9061758-9061805)
chr8 (11-58)||(27018616-27018663)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (2-279)||(24773660-24773936)
chr7 (11-279)||(35349742-35350009)
chr7 (11-58)||(24773621-24773668)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (2-279)||(27313879-27314155)
chr2 (148-279)||(10788791-10788922)
chr2 (11-58)||(27313840-27313887)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (11-279)||(16652401-16652668)
chr3 (11-279)||(7604966-7605233)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (2-266)||(920727-920992)
chr6 (11-279)||(2276819-2277086)
chr6 (11-58)||(920984-921031)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (11-279)||(15197836-15198106)
chr1 (11-279)||(4014153-4014420)
chr1 (11-279)||(25880544-25880815)
chr1 (2-189)||(38443473-38443660)
chr1 (11-58)||(38443652-38443699)
[»] scaffold0531 (1 HSPs)
scaffold0531 (11-209)||(11174-11371)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 33826640 - 33826916
Alignment:
Q  2 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnn 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  33826640 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagaa 33826739  T
Q  102 nnnnntactattatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtat 201  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33826740 aaaag-actattattgatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtat 33826838  T
Q  202 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33826839 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttagcagcactacacacaatccttgactacttctatcagttcat 33826916  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 2416539 - 2416815
Alignment:
Q  2 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnn 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  2416539 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagaa 2416638  T
Q  102 nnnnntactattatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtat 201  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2416639 aaaag-actattattgatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtat 2416737  T
Q  202 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2416738 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttaacagcactacacacaatccttgactacttctatcagttcat 2416815  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39878828 - 39878552
Alignment:
Q  2 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnn 101  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  39878828 aacaaatacactcaaattcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagaa 39878729  T
Q  102 nnnnntactattatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtat 201  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39878728 aaaag-actattattgatcataagataaagaaaaatgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttactctcaaggtat 39878630  T
Q  202 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  39878629 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttagcagcactacacacaatccttgactacttctatcaattcat 39878552  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39348577 - 39348310
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnnnnnnntact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||    
T  39348577 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagagaaaag-act 39348479  T
Q  111 attatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaactacat 210  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39348478 attattgatcagaagataaagaaaaacgatcgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaatgtataaattacat 39348379  T
Q  211 attttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39348378 attttagccatacaaactctcaaatttagcagcactacacacaatccttgactacttctatcagctcat 39348310  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 2416500 - 2416547
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2416500 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 2416547  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 33826601 - 33826648
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33826601 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 33826648  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 39878867 - 39878820
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39878867 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 39878820  T

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Target: chr8 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9061766 - 9061490
Alignment:
Q  2 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnn 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  9061766 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagaa 9061667  T
Q  102 nnnnntactattatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtat 201  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9061666 aaaag-actattattgatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtat 9061568  T
Q  202 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9061567 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttaacagcactacacacaatccttgactacttctatcagttcat 9061490  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 9061805 - 9061758
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9061805 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 9061758  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 27018663 - 27018616
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018663 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 27018616  T

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Target: chr7 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 24773660 - 24773936
Alignment:
Q  2 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnn 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  24773660 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagaa 24773759  T
Q  102 nnnnntactattatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtat 201  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24773760 aaaag-actattattgatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtat 24773858  T
Q  202 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24773859 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttagcagcactacacacaatccgtgactacttctatcagttcat 24773936  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35350009 - 35349742
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnnnnnnntact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||    
T  35350009 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagagaaaag-act 35349911  T
Q  111 attatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaactacat 210  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35349910 attattgatcagaagataaagaaaaacgatcgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaatgtataaattacat 35349811  T
Q  211 attttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35349810 attttagccatacaaactctcaaatttagcagcactacacacaatccttgactacttctatcagctcat 35349742  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 24773621 - 24773668
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24773621 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 24773668  T

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Target: chr2 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 27313879 - 27314155
Alignment:
Q  2 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnn 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  27313879 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagaa 27313978  T
Q  102 nnnnntactattatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtat 201  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27313979 aaaag-actattattgatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtat 27314077  T
Q  202 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27314078 aaactacatattttagccatacaaactctcaaatttaacagcactacacacaatccttgactacttctatcagttcat 27314155  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 148 - 279
Target Start/End: Original strand, 10788791 - 10788922
Alignment:
Q  148 cactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaactacatattttagccatacaaactctcaaatttaggagcacta 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10788791 cactaaatttatttatattaagtacaattattctattttttattctcaaggtataaattacatattttagccatacaaactcttaaatttagcagcacta 10788890  T
Q  248 cacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  10788891 cacacaatccttcattacttctatcaattcat 10788922  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 27313840 - 27313887
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27313840 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 27313887  T

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Target: chr3 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16652668 - 16652401
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnnnnnnntact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||    
T  16652668 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagaaaaaag-act 16652570  T
Q  111 attatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaactacat 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16652569 attattgatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaactacat 16652470  T
Q  211 attttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16652469 attttagccatacaaactctcaaatttagcagcactacacacaatccttgactacttctatcagttcat 16652401  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 7604966 - 7605233
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnnnnnnntact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||        |||    
T  7604966 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatatttactaagatatttaagaaaaaag-act 7605064  T
Q  111 attatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaactacat 210  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7605065 attattgatcattagttaaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtatacactacat 7605164  T
Q  211 attttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7605165 attttagccatacaaactctcaaatttaacagcactacacacaatccttgactacttctatcagttcat 7605233  T

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Target: chr6 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 920992 - 920727
Alignment:
Q  2 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnn 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       
T  920992 aacaaatacactcaagttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaaaaa 920893  T
Q  102 nnnnnt-actattatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggta 200  Q
           ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  920892 aaaaaagactattattgatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggta 920793  T
Q  201 taaactacatattttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactact 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  920792 taaactacatattttagccatacaaactctcaaatttagcagcactacacacaatccttgactact 920727  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2277086 - 2276819
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnnnnnnntact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||    
T  2277086 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagagaaaag-act 2276988  T
Q  111 attatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaactacat 210  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2276987 attattgatcagaagataaagaaaaacgatcgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaatgtataaattacat 2276888  T
Q  211 attttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2276887 attttagccatacaaactctcaaatttagcagcactacacacaatccttgactacttctatcagctcat 2276819  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 921031 - 920984
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 58  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  921031 actcatgttcaatgtcatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 920984  T

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Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 15197836 - 15198106
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnnnnnnntact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||    
T  15197836 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagaaaaaag-act 15197934  T
Q  111 attatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaactacat 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15197935 attattgatcataagataaagaaaaacgatcgagcctcactaaatttatttatatcaagtataatttttcagtttcttattctcaaggtataaactacat 15198034  T
Q  211 attttagccatacaaactctcaaatttaggagc---actacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15198035 attttagccatacaaactctcaaatttagcagcagtactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 15198106  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4014420 - 4014153
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnnnnnnntact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||    
T  4014420 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagagaaaag-act 4014322  T
Q  111 attatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaactacat 210  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4014321 attattgatcagaagataaagaaaaacgatcgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaatgtataaattacat 4014222  T
Q  211 attttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4014221 attttagccatacaaactctcaaatttagcagcactacacacaatccttgactacttctatcagctcat 4014153  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25880815 - 25880544
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaa--caaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnnnnnnnta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||        |    
T  25880815 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatactgactaagatatttaagaaaaaag-a 25880717  T
Q  109 ctattatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttat--ttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaact 206  Q
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T  25880716 ctattattgatgagaagataaagaaaaacgattaagcctcactaaatttatatttatatcaagtacaattattttgtttcttattctcaaggtataaatt 25880617  T
Q  207 acatattttagccatacaaactctcaaatttaggagcactacacacaatctttgactacttctatcagttcat 279  Q
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T  25880616 acatattttagtcatacaaactctcaaatttagcagcactacacacaatccttgactacttctatcaattcat 25880544  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38443660 - 38443473
Alignment:
Q  2 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnn 101  Q
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T  38443660 aacaaatacactcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagaa 38443561  T
Q  102 nnnnntactattatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttc-tgtttctta 189  Q
          ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38443560 aaaag-actattattgatcatcagttaaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttcttgtttctta 38443473  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 38443699 - 38443652
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38443699 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatac 38443652  T

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Target: scaffold0531 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0531
Description:

Target: scaffold0531; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Original strand, 11174 - 11371
Alignment:
Q  11 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagttacaaccaaacaaaatacatactaagatatttaagnnnnnnntact 110  Q
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T  11174 actcatgttcaatgacatgataataataatttgaatcaaaacaaatactttagtcacaaccaaacaaaatacttactaagatatttaagaaaaaag-act 11272  T
Q  111 attatttatcataagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaactaca 209  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11273 attattgatcagaagataaagaaaaacgattgagcctcactaaatttatttatatcaagtacaatttttctgtttcttattctcaaggtataaactaca 11371  T

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