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Alignment Overview

Query: NF4162_low_22 (Length: 201)

Name: NF4162_low_22
Description: NF4162
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4162_low_22
NF4162_low_22
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-201)||(6235645-6235846)
chr4 (1-200)||(29319546-29319746)
chr4 (1-201)||(25930833-25931034)
chr4 (1-201)||(40529140-40529341)
chr4 (1-201)||(17511074-17511276)
chr4 (1-201)||(36382187-36382388)
chr4 (5-201)||(20129435-20129632)
chr4 (5-201)||(47500898-47501095)
chr4 (5-201)||(34407129-34407326)
chr4 (5-201)||(13012313-13012510)
chr4 (5-201)||(43356029-43356226)
chr4 (5-201)||(26439124-26439321)
chr4 (1-201)||(48989453-48989650)
chr4 (1-193)||(6690080-6690269)
chr4 (1-201)||(10352729-10352926)
chr4 (1-195)||(30216587-30216778)
chr4 (1-194)||(35546085-35546275)
chr4 (1-201)||(3292741-3292938)
chr4 (1-201)||(30077476-30077673)
chr4 (1-201)||(43143429-43143626)
chr4 (1-201)||(50204922-50205119)
chr4 (1-195)||(29995829-29996019)
chr4 (1-193)||(48130111-48130300)
chr4 (1-201)||(1817842-1818039)
chr4 (1-193)||(30110108-30110297)
chr4 (1-201)||(42333621-42333818)
chr4 (4-195)||(26448183-26448371)
chr4 (1-201)||(44156776-44156971)
chr4 (93-201)||(28877184-28877292)
chr4 (1-118)||(13395064-13395178)
chr4 (114-193)||(13392836-13392915)
chr4 (114-193)||(13395975-13396054)
chr4 (1-113)||(33136292-33136401)
chr4 (59-142)||(45766081-45766164)
chr4 (114-146)||(9071299-9071331)
chr4 (59-146)||(18990711-18990801)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (1-201)||(5555612-5555813)
chr7 (1-201)||(3113938-3114138)
chr7 (1-201)||(8394250-8394451)
chr7 (5-201)||(14776952-14777149)
chr7 (1-201)||(36630941-36631142)
chr7 (1-201)||(36658306-36658503)
chr7 (1-194)||(43184313-43184503)
chr7 (1-201)||(26624871-26625068)
chr7 (1-201)||(37001990-37002186)
chr7 (1-201)||(40919848-40920045)
chr7 (4-201)||(38638083-38638278)
chr7 (3-195)||(7002856-7003045)
chr7 (3-195)||(7048727-7048916)
chr7 (1-193)||(33685697-33685886)
chr7 (1-201)||(34388901-34389098)
chr7 (1-193)||(10868301-10868490)
chr7 (1-201)||(8867576-8867773)
chr7 (115-201)||(35090293-35090379)
chr7 (99-146)||(8725489-8725536)
chr7 (100-167)||(26787752-26787819)
chr7 (94-146)||(23581194-23581246)
chr7 (94-130)||(32073069-32073105)
chr7 (98-146)||(33386774-33386822)
chr7 (68-152)||(33387562-33387646)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-201)||(16155122-16155323)
chr5 (1-201)||(39657347-39657548)
chr5 (1-201)||(1776217-1776418)
chr5 (1-201)||(10034052-10034253)
chr5 (1-201)||(39434821-39435022)
chr5 (1-201)||(13818102-13818303)
chr5 (1-201)||(16333717-16333918)
chr5 (1-201)||(36293462-36293663)
chr5 (5-201)||(26283163-26283360)
chr5 (1-194)||(36291503-36291694)
chr5 (1-201)||(33430446-33430643)
chr5 (1-201)||(12278705-12278902)
chr5 (1-201)||(31680492-31680689)
chr5 (1-201)||(37254766-37254963)
chr5 (1-200)||(43069003-43069200)
chr5 (41-201)||(17332432-17332593)
chr5 (1-193)||(28801439-28801628)
chr5 (1-193)||(31501563-31501750)
chr5 (105-201)||(19986064-19986160)
chr5 (74-193)||(192094-192213)
chr5 (41-193)||(38269276-38269430)
chr5 (54-152)||(23236748-23236846)
chr5 (67-146)||(31271068-31271147)
chr5 (41-145)||(23033063-23033168)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (1-201)||(31581462-31581664)
chr2 (1-201)||(17444882-17445083)
chr2 (1-201)||(35962840-35963041)
chr2 (5-201)||(41251479-41251676)
chr2 (1-199)||(32126982-32127181)
chr2 (5-201)||(6403649-6403846)
chr2 (1-201)||(18981741-18981940)
chr2 (1-194)||(45418715-45418905)
chr2 (1-201)||(771124-771321)
chr2 (1-200)||(12756682-12756878)
chr2 (1-201)||(8059178-8059375)
chr2 (1-194)||(44084448-44084638)
chr2 (1-144)||(2957986-2958130)
chr2 (1-195)||(8147483-8147674)
chr2 (1-193)||(4555037-4555226)
chr2 (1-189)||(26162547-26162732)
chr2 (1-189)||(26238080-26238265)
chr2 (1-193)||(7072376-7072564)
chr2 (1-118)||(42442193-42442311)
chr2 (98-200)||(16405726-16405828)
chr2 (89-197)||(2285991-2286099)
chr2 (1-193)||(45121368-45121557)
chr2 (118-201)||(42440111-42440194)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (1-197)||(3648635-3648832)
chr8 (1-201)||(15838410-15838610)
chr8 (5-201)||(39914639-39914836)
chr8 (1-201)||(16787870-16788067)
chr8 (45-201)||(29728271-29728428)
chr8 (1-193)||(23402241-23402430)
chr8 (1-201)||(4404133-4404330)
chr8 (3-193)||(9877353-9877540)
chr8 (1-193)||(34136670-34136859)
chr8 (1-193)||(2729041-2729230)
chr8 (1-194)||(42231069-42231259)
chr8 (54-193)||(40470370-40470509)
chr8 (1-194)||(36408683-36408862)
chr8 (1-148)||(3435443-3435587)
chr8 (41-146)||(32540332-32540438)
chr8 (1-49)||(29728198-29728246)
chr8 (119-193)||(378604-378678)
chr8 (96-146)||(9174947-9174997)
chr8 (68-145)||(29351587-29351664)
chr8 (114-146)||(15317586-15317618)
chr8 (114-146)||(15497955-15497987)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (1-201)||(19390271-19390472)
chr3 (5-201)||(6269271-6269468)
chr3 (1-192)||(40081582-40081774)
chr3 (5-201)||(22968289-22968486)
chr3 (1-201)||(34083961-34084164)
chr3 (5-201)||(39771915-39772112)
chr3 (1-201)||(6930739-6930936)
chr3 (1-201)||(45335999-45336196)
chr3 (1-193)||(5135421-5135610)
chr3 (1-201)||(19565346-19565543)
chr3 (1-201)||(33041078-33041275)
chr3 (1-201)||(45183106-45183303)
chr3 (1-194)||(11018055-11018247)
chr3 (1-201)||(27935303-27935500)
chr3 (1-201)||(35514387-35514584)
chr3 (72-199)||(22922222-22922349)
chr3 (1-201)||(6503414-6503611)
chr3 (53-144)||(8257012-8257103)
chr3 (98-193)||(38282543-38282638)
chr3 (41-111)||(29565029-29565100)
chr3 (95-145)||(38415739-38415789)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (1-199)||(34948599-34948798)
chr6 (2-201)||(13837946-13838146)
chr6 (5-201)||(398742-398939)
chr6 (1-201)||(18339231-18339428)
chr6 (1-201)||(29743408-29743605)
chr6 (1-201)||(28996855-28997052)
chr6 (1-192)||(33229181-33229369)
chr6 (59-145)||(23217212-23217299)
chr6 (71-144)||(23217867-23217940)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (1-201)||(7433570-7433771)
chr1 (1-201)||(32981897-32982098)
chr1 (1-200)||(42310782-42310982)
chr1 (1-196)||(3829113-3829305)
chr1 (1-201)||(35907677-35907874)
chr1 (2-201)||(17445438-17445633)
chr1 (1-193)||(33489839-33490028)
chr1 (1-193)||(41972102-41972290)
chr1 (54-201)||(26144380-26144527)
chr1 (55-201)||(321273-321419)
chr1 (129-193)||(28463231-28463295)
chr1 (114-146)||(13904600-13904632)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (5-201)||(480302-480499)
[»] scaffold2142 (1 HSPs)
scaffold2142 (5-201)||(647-844)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (1-201)||(53050-53247)
[»] scaffold0502 (1 HSPs)
scaffold0502 (41-201)||(5355-5516)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-193)||(31613-31802)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (59-145)||(17493-17579)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (153-201)||(17967-18015)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6235846 - 6235645
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6235846 catttttagaccacacgtatattataggatgatcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttattgggtcat 6235747  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6235746 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 6235647  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  6235646 cc 6235645  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 29319546 - 29319746
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  29319546 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttat 29319645  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29319646 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 29319745  T
Q  200 c 200  Q
    |    
T  29319746 c 29319746  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25931034 - 25930833
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  25931034 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatgtatgttttgtactttattgagtcat 25930935  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25930934 ttttcaaacataaagtatattacagagtcaatttgaacaattaatccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 25930835  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  25930834 cc 25930833  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40529341 - 40529140
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  40529341 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatgtatgttttgtattttattggatcat 40529242  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40529241 ttttcaaacataaagtatattacagtgtcaatttgaacaattaatccgttaaaataagagatatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 40529142  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  40529141 cc 40529140  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 17511074 - 17511276
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17511074 catttttagactatatgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttatttggtcat 17511173  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaa-ttccaag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17511174 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaccgatcaataatgtgctaaataaaatttccaag 17511273  T
Q  199 acc 201  Q
    |||    
T  17511274 acc 17511276  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36382187 - 36382388
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36382187 catttttagactacacatatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttattgggtcat 36382286  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36382287 ttttcaaacatagagtatattagagggtaaatttgaacaattaacccgttaagataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 36382386  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  36382387 cc 36382388  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
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Target Start/End: Complemental strand, 20129632 - 20129435
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Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20129632 tttagactacacgtatattatagggtggtcaaaagtaaataagaagaaattcaagttacaatgttagaatatatgttttgtattttattgggtcattttt 20129533  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20129532 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgccaaataaaattctaagacc 20129435  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 47501095 - 47500898
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Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47501095 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaaaaaattcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattgggtcattttt 47500996  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47500995 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgccaaataaaattccaagacc 47500898  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 34407129 - 34407326
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Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34407129 tttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgttagaatatatattttgtattttattgggtcattttt 34407228  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  34407229 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgtcaaataaaatttcaagacc 34407326  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13012510 - 13012313
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Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13012510 tttagactacacgtatattatagggtgttcaaaattaaataagaaaaaattcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattgggtcattttt 13012411  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13012410 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccattaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgccaaataaaattccaagacc 13012313  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43356226 - 43356029
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Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43356226 tttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattgggtcattttt 43356127  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  43356126 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgtcaaataaaatttcaagacc 43356029  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 26439124 - 26439321
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26439124 tttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattgggtcattttt 26439223  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  26439224 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaattagagagatgaaactgtcaatagtgtgtcaaataaaatttcaagacc 26439321  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48989650 - 48989453
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaatcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatt 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48989650 catttttagaccagacgtatattatagggtggtcaaaaataaa-aagaa--attcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttacagggtcatt 48989554  T
Q  101 tttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagac 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  48989553 tttcagacataatgtatattacaggatcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgagac 48989454  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 6690080 - 6690269
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  6690080 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 6690175  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6690176 ttttcagacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagacgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaatt 6690269  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10352729 - 10352926
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10352729 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttactatgctagaatatatgttttatattttattgggtcat 10352824  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |  |||||||||||||||||| |||    
T  10352825 ttttcagacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataagagagatgaatccgacactggtgtgctaaataaaattccgaga 10352924  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 30216587 - 30216778
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||    
T  30216587 catttttagactacacgtatattacagggtagtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttctgtatttttaagggtcat 30216682  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattcc 195  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30216683 ttttcagacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattcc 30216778  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35546275 - 35546085
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  35546275 catttttagactatacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 35546180  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattc 194  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35546179 ttttcagacataaggtatattacagggttaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccatcaatagtgtgctaaataaaattc 35546085  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3292741 - 3292938
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||    
T  3292741 catttttagactacacgtatattacaggatggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagagtcat 3292836  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  3292837 ttttcagacataaggtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaactcgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 3292936  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 30077476 - 30077673
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30077476 cattttttgactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttattgagtcat 30077571  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||    
T  30077572 ttttcagacataaagtatattacatggtcaatttgaacaattaatctgttaaaataagagagatgaatccggcactagtgtgctaaataaaatttcaaga 30077671  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 43143429 - 43143626
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  43143429 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 43143524  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  43143525 ttttcagacataaggtatattacaaagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccatcaattgtgtgctaaataaaattccgaga 43143624  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 50204922 - 50205119
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaa-tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  50204922 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaaatcaagttgcaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 50205017  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50205018 ttttcagacataatgtatattacatggtcaatttgaaccattaatccgttaaaataagagtgatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 50205117  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 29995829 - 29996019
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaatc-aagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    |||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29995829 catttttagactacacatatattatagggtggtcaaaa----ataagaggaaatttaagttacaatgctagaatatatgttttatattttattgggtcat 29995924  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattcc 195  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29995925 ttt-caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataatagagatgaatccgtcaatagtgtgcttaataaaattcc 29996019  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48130300 - 48130111
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaatcaa-gttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  48130300 cattttaagactacgcgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaatccatgttacaatgttagaatatatgttttgtattttacagggtcat 48130205  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48130204 ttttcagacataatgtatattatatggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaatt 48130111  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1818039 - 1817842
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaa-tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  1818039 catttttagactacatgtatattatagggtggccaa----aaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatatttcatattttattggatcat 1817944  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  1817943 ttttcagacataaagtaaattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataagagagatgaatccgacaatagtgtgttaaataaaattccgaga 1817844  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30110297 - 30110108
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Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    |||||    
T  30110297 catttttagactacgcgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagtcacaatgctagaatatatgttttgtcttttacaaagtcat 30110202  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30110201 ttttcagagataatgtatattacagggtcaatttgaacacttaacccgttaaaacaagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaatt 30110108  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 42333621 - 42333818
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  42333621 catttttagactacatgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 42333716  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  42333717 ttttcagacataaggtatattacagagtcaatttgaacaattaatccgttaaaataagagagatgaacttatcaattgtgtgctaaataaaattccgaga 42333816  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26448371 - 26448183
Alignment:
Q  4 ttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttt 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  26448371 ttttagactagacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaacttacaatgctagaatatatgttttgtattttacatggtcatttt 26448276  T
Q  103 tcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattcc 195  Q
    ||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26448275 tcagacataatgtatattacattttcaatttgaacaattaacccgttaaaataaaagagataaatccgccaatagtgtgctaaataaaattcc 26448183  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44156971 - 44156776
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  44156971 catttttagactgcacgtatattacaaggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttcaagggtcat 44156876  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  44156875 ttttcagacataatttat-ttacagagtcaatttga-caattaatccattaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 44156778  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Original strand, 28877184 - 28877292
Alignment:
Q  93 gggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaat 192  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28877184 gggtcatttttcagacataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccatcaatagtgtgctaaataaaat 28877283  T
Q  193 tccaagacc 201  Q
    ||| |||||    
T  28877284 tccgagacc 28877292  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 13395064 - 13395178
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  13395064 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 13395159  T
Q  100 ttttcaaacataaagtata 118  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  13395160 ttttcagacataatgtata 13395178  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 193
Target Start/End: Original strand, 13392836 - 13392915
Alignment:
Q  114 gtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  13392836 gtatattacaggatcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaatcattcaatagtgtgctaaataaaatt 13392915  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 193
Target Start/End: Original strand, 13395975 - 13396054
Alignment:
Q  114 gtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  13395975 gtatattacaggatcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaatcattcaatagtgtgctaaataaaatt 13396054  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 33136292 - 33136401
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    ||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||     
T  33136292 catttttagactacacgtatatcacagggtggtcaaaa----ataagaaaaaattcaagttagaatactaaaatatatgttttgtatttttaagggtcaa 33136387  T
Q  100 ttttcaaacataaa 113  Q
    |||||| |||||||    
T  33136388 ttttcagacataaa 33136401  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 45766164 - 45766081
Alignment:
Q  59 ttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaatta 142  Q
    |||||| |||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  45766164 ttacaaggctagaatataagctttttatttgattgggtcatttttcaaacatagtgtatattacaaagtcaattagagcaatta 45766081  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 9071299 - 9071331
Alignment:
Q  114 gtatattacagggtcaatttgaacaattaaccc 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9071299 gtatattacagggttaatttgaacaattaaccc 9071331  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 146
Target Start/End: Original strand, 18990711 - 18990801
Alignment:
Q  59 ttacaatgctataatatatgttt---tgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaaccc 146  Q
    |||||| |||| |||||||||||   | |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  18990711 ttacaaggctagaatatatgtttctttttattttacagggtcatttttcaaacatagtatatattacaaggttaatttaaataattaaccc 18990801  T

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Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5555813 - 5555612
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5555813 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttat 5555714  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5555713 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 5555614  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  5555613 cc 5555612  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3113938 - 3114138
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3113938 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttat 3114037  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3114038 ttt-caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 3114136  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  3114137 cc 3114138  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8394451 - 8394250
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8394451 catttttagactacacatatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttattgggtcat 8394352  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8394351 ttttcaaacataaagtattttacagagtaaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagataaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 8394252  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  8394251 cc 8394250  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 14776952 - 14777149
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14776952 tttagactacacgtatattatagggtggccaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgttagaatatatgttttgtattttattgggtcattttt 14777051  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14777052 caaacataaagtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagcgatgaaactgtcaatagtgtgctaaataaaattccaagacc 14777149  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36631142 - 36630941
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36631142 catttctagactacacgtattttataggatggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttagaatgctggaatatatgttttatattttattgggtcat 36631043  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36631042 ttttcaaatataaagtatattacagggtaaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaactaaaattccaaga 36630943  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  36630942 cc 36630941  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36658503 - 36658306
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  36658503 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttataatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 36658408  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  36658407 ttttcagacataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 36658308  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 43184313 - 43184503
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  43184313 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 43184408  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattc 194  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43184409 ttttcagacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattc 43184503  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26625068 - 26624871
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  26625068 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 26624973  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  26624972 ttttcagacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 26624873  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 37001990 - 37002186
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaa-tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||    
T  37001990 catttttagactacacgtatattacagggtg-tcaa----aaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagtgtcat 37002084  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37002085 ttttcagagataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 37002184  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 40919848 - 40920045
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  40919848 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttataatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 40919943  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  40919944 ttttcaaacataagatatattacagagtcaatttgaacaattaatccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 40920043  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 38638083 - 38638278
Alignment:
Q  4 ttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttt 102  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||||    
T  38638083 ttttagactatacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggccatttt 38638178  T
Q  103 tcaaacataaagtatatt-acagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38638179 tcagacataaggtatatttacaaggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgagacc 38638278  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7003045 - 7002856
Alignment:
Q  3 tttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattt 101  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  7003045 tttttagactacacatatattacagggtagtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctatagtatatgttttgtattttgaagggtcattt 7002950  T
Q  102 ttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattcc 195  Q
    |||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7002949 ttcagacattatgtatattacaggatcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattcc 7002856  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7048916 - 7048727
Alignment:
Q  3 tttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattt 101  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  7048916 tttttagactacacatatattacagggtagtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctatagtatatgttttgtattttgaagggtcattt 7048821  T
Q  102 ttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattcc 195  Q
    |||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7048820 ttcagacattatgtatattacaggatcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattcc 7048727  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33685886 - 33685697
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33685886 catttttagaccagacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttgcaatgctagaatatatgttttgtattttacagggtcat 33685791  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33685790 ttttcagacataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaatccgttaaaataaaagagataaacccgtcaatagtgtgctaaataaaatt 33685697  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 34388901 - 34389098
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaa-tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||| |    
T  34388901 catttttagactacatgtatattacagggtgatcaa----caataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatatttttaagggtcgt 34388996  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  34388997 ttttcagacataaggtatattacagggttaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcgataatgtgctaaataaaattccgaga 34389096  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 10868301 - 10868490
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  10868301 catttttagactacgcgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatattttgtattttacagggtcat 10868396  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10868397 ttttcagacataatgtatactacatgatcaatttgaccaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaaaagtgtgctaaataaaatt 10868490  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 8867576 - 8867773
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  8867576 catttttagagtacatgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 8867671  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  8867672 ttttcagacataaggtatattatagggtcaatttgaacaattaatccattaaaataagagtgatgaatccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 8867771  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35090379 - 35090293
Alignment:
Q  115 tatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35090379 tatattacaaggtcaatttgaacaattaatccgttaaaataagagagatgaatccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgagacc 35090293  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 146
Target Start/End: Original strand, 8725489 - 8725536
Alignment:
Q  99 tttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaaccc 146  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8725489 tttttcaaacatattgtatattacaggatcaatttgaacaattaaccc 8725536  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26787819 - 26787752
Alignment:
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaac 167  Q
    |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||||    
T  26787819 ttttcagacatagtgtatattacatggtcaatttgaacaattgacgcttcaaaataagagagatgaac 26787752  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23581246 - 23581194
Alignment:
Q  94 ggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaaccc 146  Q
    ||||||||||||||||||  | || || |||||||||||| ||||||||||||    
T  23581246 ggtcatttttcaaacatagcgaattttccagggtcaatttaaacaattaaccc 23581194  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 32073105 - 32073069
Alignment:
Q  94 ggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaa 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32073105 ggtcatttttcaaacatcaagtattttacagggtcaa 32073069  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33386822 - 33386774
Alignment:
Q  98 atttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaaccc 146  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  33386822 atttttcacacatcaagtatattatagggtcaattcaaacaattaaccc 33386774  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 152
Target Start/End: Original strand, 33387562 - 33387646
Alignment:
Q  68 tataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaa 152  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || ||||| || | || | | |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  33387562 tataatatgtgttttttattttataggatcattgtttagacttcatgtatattacaaggtcaattttgacaattaaccccttaaa 33387646  T

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Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16155323 - 16155122
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16155323 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattgggtcat 16155224  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16155223 ttttcaaacataaagtatattacatggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaatctgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 16155124  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  16155123 cc 16155122  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 39657347 - 39657548
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  39657347 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttat 39657446  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39657447 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaagttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 39657546  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  39657547 cc 39657548  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 1776217 - 1776418
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1776217 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttattgggtcat 1776316  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1776317 ttttcaaacataaagtatattacagggtaaatttgaacaattaacccgttaaaataagaaagatgaacctgtcgatagtgtgctaaataaaattccaaga 1776416  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  1776417 cc 1776418  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10034253 - 10034052
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10034253 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaattctagaatatatgttttgtattttattaggttat 10034154  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10034153 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 10034054  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  10034053 cc 10034052  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39435022 - 39434821
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39435022 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaattcaagttacagtgctagaatatatgttttgtattttattgggtcat 39434923  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39434922 ttttcaaacataaagtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgctaaataaaattcaaaga 39434823  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  39434822 cc 39434821  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13818303 - 13818102
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13818303 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttataatgctagaatatatgttttgtattttattagatcat 13818204  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13818203 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgagcccgtcaatagtgtgctaaataaatttccaaga 13818104  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  13818103 cc 13818102  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16333717 - 16333918
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16333717 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattaggttat 16333816  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16333817 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaaccctataaaataagagacatgaatccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 16333916  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  16333917 cc 16333918  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 36293462 - 36293663
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36293462 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgttagaatatatgttttgtattttattgggtcat 36293561  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36293562 ttttcaaacataaagtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtaaatagtgtgctaaataaaattccaaga 36293661  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  36293662 cc 36293663  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 26283163 - 26283360
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26283163 tttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattgggtcattttt 26283262  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26283263 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgccaaataaaattccaagacc 26283360  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36291694 - 36291503
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattataggg-tgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36291694 catttttagactacacgtatattataggggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttattgggtca 36291599  T
Q  99 tttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattc 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36291598 tttttcagacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgttaaataaaattc 36291503  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33430643 - 33430446
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||    
T  33430643 catttttagactacacgtatattacaggatggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagagtcat 33430548  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  33430547 ttttcaaacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 33430448  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 12278705 - 12278902
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||    
T  12278705 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttatgtatttttaagggtcat 12278800  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  12278801 ttttcagacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacctgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 12278900  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31680689 - 31680492
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||    
T  31680689 catttttagactacacgtatattacaggatggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagagtcat 31680594  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  31680593 ttttcagacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 31680494  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37254963 - 37254766
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||| |    
T  37254963 catttttagactacgcgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatatttttaagggtcgt 37254868  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  37254867 ttttcagacataaggtatattacagggttaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaataatgtgctaaataaaattccgaga 37254768  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43069200 - 43069003
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattataggg-tgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||    
T  43069200 catttttagactacacgtatattataggggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttatttagtca 43069105  T
Q  99 tttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaag 198  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  43069104 ttttttagacataaagcatattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataagagagatgaatccggcaatagtgtgctaaataaaattccgag 43069005  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 201
Target Start/End: Original strand, 17332432 - 17332593
Alignment:
Q  41 aaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaa 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17332432 aaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcatttttcagacataaggtatattatagggtcaatttgaacaa 17332531  T
Q  140 ttaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17332532 ttaacccgttaaaataagagagatgaatccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgagacc 17332593  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28801628 - 28801439
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaatcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||    
T  28801628 catttttagactacgcgtatattatagggtggtcaaaaataaa-aagaa--attcaagttacaatactagaatatatgttttgtattttacaaggtcatt 28801532  T
Q  101 tttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  28801531 tttcagatataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacctgtcaatagtgagctaaataaaatt 28801439  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 31501563 - 31501750
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  31501563 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 31501658  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  31501659 ttttcagatataatgtatattacatggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataag--agatgaactcatcaatagtgtgctaaataaaatt 31501750  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19986160 - 19986064
Alignment:
Q  105 aaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  19986160 aaacataaagtatattatagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagggagatgaacctgtcaatagtgtgttaaataaaatttcaagacc 19986064  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 192213 - 192094
Alignment:
Q  74 atatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtca 173  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||    
T  192213 atatgttttgtattttacagggtcatttttcagacatagtgtatattacatggtcaatttaaacaattaaccctttaaaataagagagatgaacctatca 192114  T
Q  174 atactgtgctaaataaaatt 193  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  192113 atagtgtgttaaataaaatt 192094  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Original strand, 38269276 - 38269430
Alignment:
Q  41 aaataagaagaaa-tcaagttacaatgctataatatatgttttgt-attttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaaca 138  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||    
T  38269276 aaataagaagaaactcgaattacaatgctagaatatatgtttttttattttagagggtcatctttcaaacatagtgtatatcacatgatcaatttgaaca 38269375  T
Q  139 attaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  38269376 attaacccttcaaaataagagagatgaacctgccaatagtgtgccaaataaaatt 38269430  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 23236748 - 23236846
Alignment:
Q  54 tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaa 152  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  23236748 tcaaattacaaggctagaatatatgtgttttatttcacagggtcatttttcaaacatagtgtatattacaggaacaatttaaacaattaaccctttaaa 23236846  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31271147 - 31271068
Alignment:
Q  67 ctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaaccc 146  Q
    |||||||||| ||||| | |||||   ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  31271147 ctataatataagttttttgttttacatggtcatttttcaaacatagtgtatatttcaggatcaatttaaacaattaaccc 31271068  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23033168 - 23033063
Alignment:
Q  41 aaataagaagaa-atcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaa 139  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||  |||||||    |||| ||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  23033168 aaataagaagaatatcaaattacaagacaataatatatgtttcttattttacaaagtcagttttcaatcatagtgtatattacaacgtcaatttgaacaa 23033069  T
Q  140 ttaacc 145  Q
    ||||||    
T  23033068 ttaacc 23033063  T

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Target: chr2 (Bit Score: 164; Significance: 7e-88; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 31581462 - 31581664
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaa--tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtca 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581462 catttctagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaaaaaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattgggtca 31581561  T
Q  99 tttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31581562 tttttcaaacataaagtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaag 31581661  T
Q  199 acc 201  Q
    |||    
T  31581662 acc 31581664  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 17444882 - 17445083
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444882 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatggtagaatatatgttttgtattttattgggtcat 17444981  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17444982 ttttcaaacataaagtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 17445081  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  17445082 cc 17445083  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35963041 - 35962840
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  35963041 catttttagactacacgtatattataggatggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttat 35962942  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35962941 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 35962842  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  35962841 cc 35962840  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 41251479 - 41251676
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41251479 tttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgttagaatatatgttttgtattttattgggtcattttt 41251578  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41251579 caaacataaagtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgctaaataaaattccaagacc 41251676  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 32126982 - 32127181
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  32126982 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataaaaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttat 32127081  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32127082 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaagttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 32127181  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 6403649 - 6403846
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6403649 tttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattgggtcattttt 6403748  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6403749 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgccaaataaaattccaagacc 6403846  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18981940 - 18981741
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaatcaa-gttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18981940 catttttagactacacatatattttagggtggtcaa--ttaaataagaagaaattaaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttat 18981843  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18981842 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaacagtgtgctaaataaaattccaaga 18981743  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45418905 - 45418715
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45418905 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctaaaatatatgttttgtattttaaagggtcat 45418810  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattc 194  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45418809 ttttcagacataaggtatattacaggatcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattc 45418715  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 771321 - 771124
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  771321 catttttagactacacgtatattataaggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttacagggtcat 771226  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  771225 ttttcagacataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaagataagatagatgaacccgtcaataatgtgctaaataaagttccgaga 771126  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 12756682 - 12756878
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaatc-aagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  12756682 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaatttaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 12756777  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  12756778 ttttcagacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 12756877  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 8059178 - 8059375
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||     
T  8059178 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcaa 8059273  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  8059274 ttttcagacataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataagagaaatgaacccgtcaattgtgtgctaaataaaattccgaga 8059373  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 44084448 - 44084638
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44084448 catttttagaccagacgtatattataggatggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttacagggtcat 44084543  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattc 194  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44084544 ttttcagaaataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaatccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattc 44084638  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 2957986 - 2958130
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2957986 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttat 2958085  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaac 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2958086 ttttcaaatataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaac 2958130  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8147674 - 8147483
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  8147674 catttttagactacacgtatatcacaggatggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttataatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 8147579  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattcc 195  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8147578 ttttcagacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgtcaaaataagatagatgaacccgtcaatagtgtgttaaataaaattcc 8147483  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 4555037 - 4555226
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4555037 catttttatactacgcgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttacagggtcat 4555132  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  4555133 ttttcagacataatgtatattacatggtcaatttgaacaattaactcgttaaaataagagagatgaactcgtcaatagtgtggtaaataaaatt 4555226  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 26162547 - 26162732
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  26162547 catttttagaccagacgtatattattgggtgatcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattctacagtgtcat 26162642  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataa 189  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26162643 ttttcagacataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaaactgttaaaataagagagatgaacccgtcaataatgtgctaaataa 26162732  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26238265 - 26238080
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26238265 catttttagactacgcgtatattatgaggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaatttacaatgctagaatatatgttttgtattttacagggtcat 26238170  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataa 189  Q
    |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26238169 ttttcagacataatgtatattatagagtcaatttgaacaaataactcgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataa 26238080  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 7072376 - 7072564
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  | |||||    
T  7072376 catttttagactacgcgtatattataggatgatcaaaa----ataagaataaattcaagttacaattctagaatatatgttttatattttacagagtcat 7072471  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  7072472 ttttcagacataatgtatattagagggtcaatttgaacaattaaccagttaaaataagagagatgaacccgtcaat-gtgtactaaataaaatt 7072564  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42442311 - 42442193
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  42442311 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttat 42442212  T
Q  100 ttttcaaacataaagtata 118  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42442211 ttttcaaacataaagtata 42442193  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16405828 - 16405726
Alignment:
Q  98 atttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16405828 atttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaa 16405729  T
Q  198 gac 200  Q
    |||    
T  16405728 gac 16405726  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2286099 - 2285991
Alignment:
Q  89 tattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaata 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  2286099 tattgggtcatttttcaaacatagagtatattacagggtaaatttgaacaattaacccgttaaaataagagaaatgaacacgtcaatagtgtgctaaata 2286000  T
Q  189 aaattccaa 197  Q
    |||||||||    
T  2285999 aaattccaa 2285991  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45121557 - 45121368
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaa-tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    |||||    
T  45121557 catttttagactacgcatatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaagctcaagttacattgctagaatatatgttttgtattttacaatgtcat 45121462  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| || ||  |||||||||  |||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  45121461 ttttcagacgtagtgtatattacctggtcaatttgaataattaatcctttaaaataagagacatgaacctgccaatagtgttctaaataaaatt 45121368  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42440194 - 42440111
Alignment:
Q  118 attacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42440194 attacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaatccgtcaatagtgtgctaaataaaattgcaagacc 42440111  T

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Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 3648635 - 3648832
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3648635 catttttagactacacgtatattataggatggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattgggtcac 3648734  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3648735 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataatagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaa 3648832  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15838610 - 15838410
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15838610 catttttagactacacgtatattatagggtg-tcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttattgggtcat 15838512  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15838511 ttttcaaacatagagtatattacaggataaatttaaacaattaacccgttaaaataagatatatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 15838412  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  15838411 cc 15838410  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39914836 - 39914639
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39914836 tttagactacgcgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaaaaaattcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattgggtcattttt 39914737  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39914736 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaactcgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgccaaataaaattccaagacc 39914639  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16787870 - 16788067
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  16787870 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctataatatatgttttgtatttttaagggtcat 16787965  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16787966 ttttcagacataaggtatatgacagagtcaatttaaacaattaacccgttcaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 16788065  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Original strand, 29728271 - 29728428
Alignment:
Q  45 aagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaa 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29728271 aagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggtcatttttcaaacataaagtatattacatggtcaatttgagcaattaa 29728370  T
Q  144 cccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29728371 cccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattcgaagacc 29728428  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23402430 - 23402241
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  23402430 catttttagactacacgtatattataggatggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 23402335  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  23402334 ttttcagacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaccagtcaatagtgtgttaaataaaatt 23402241  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4404330 - 4404133
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  4404330 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagtcacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 4404235  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  4404234 ttttcagacataaggtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccatcaattgtgtgctaaataaaattccgaga 4404135  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9877540 - 9877353
Alignment:
Q  3 tttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||    
T  9877540 tttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctataatatatgctttgtatttttaagggtcattt 9877445  T
Q  102 ttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||||||||    
T  9877444 ttcagacataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaatttgacaatagtgtgctaaataaaatt 9877353  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 34136670 - 34136859
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  34136670 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagctacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 34136765  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  34136766 ttttcagacataaggtatattacggagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccatcaattgtgtgctaaataaaatt 34136859  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 2729041 - 2729230
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2729041 catttttagaccagacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttacagggtcat 2729136  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  2729137 ttttcagacataatgtatattacagggtcaatatgagcaattaactcgttaaaataagagagatgaatccatcaatagtgtgctaaataaaatt 2729230  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42231259 - 42231069
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||    
T  42231259 catttttataccagacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttacagtgtcat 42231164  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattc 194  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42231163 ttttcagacataatgtatattacatggtcaatttgaacaattaatccgttaaaataaaagagatgaatccgtcaatagtgtgctaaataaaattc 42231069  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 193
Target Start/End: Original strand, 40470370 - 40470509
Alignment:
Q  54 tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40470370 tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttacagcgtcatttttcagacataatgtatattacaaggtcaatttgaacaattatcccgttaaaa 40470469  T
Q  154 taagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40470470 taagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaatt 40470509  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36408862 - 36408683
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||           |||||||| ||||||||||||||||    
T  36408862 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttaca-----------tatgttttatattttattgggtcat 36408778  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattc 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  36408777 ttttcagacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataagagagatgaatccggcaatagtgtgttaaataaaattc 36408683  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3435587 - 3435443
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaa-tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| || |    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  3435587 catttttagactatgcgtatattatagggtgctcca----aaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatgtgttttgtattttacatggtcat 3435492  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgt 148  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3435491 ttttcaaacataatgtatattatagggtcaatttgaaaaattaacccgt 3435443  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 146
Target Start/End: Original strand, 32540332 - 32540438
Alignment:
Q  41 aaataagaagaa-atcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaa 139  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||| ||||    
T  32540332 aaataagaataatatcaaattacaaggctaaaatatatgttttttattttacaggatcatttttcaaacaatgtgtatattagagggtcaatttgtacaa 32540431  T
Q  140 ttaaccc 146  Q
    |||||||    
T  32540432 ttaaccc 32540438  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 29728198 - 29728246
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaa 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29728198 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaagaagaa 29728246  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 378678 - 378604
Alignment:
Q  119 ttacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  378678 ttacatggtcaatttgaacaattaaccgttcaaaataagataaatgaacctgctaataatgtgctaaataaaatt 378604  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9174997 - 9174947
Alignment:
Q  96 tcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaaccc 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  9174997 tcatttttcaaacataatgtatattacaagataaatttgaacaattaaccc 9174947  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29351664 - 29351587
Alignment:
Q  68 tataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacc 145  Q
    |||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29351664 tataatatgtattttttattttatagagtcatttttcagacatcgtgtattttacatggtcaatttaaacaattaacc 29351587  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 15317586 - 15317618
Alignment:
Q  114 gtatattacagggtcaatttgaacaattaaccc 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15317586 gtatattacatggtcaatttgaacaattaaccc 15317618  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 15497955 - 15497987
Alignment:
Q  114 gtatattacagggtcaatttgaacaattaaccc 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15497955 gtatattacatggtcaatttgaacaattaaccc 15497987  T

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Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19390472 - 19390271
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390472 catttttagactacacgtatattataaggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattgggtcat 19390373  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19390372 ttttcaaacataaagtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgctaaataaaattccaaga 19390273  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  19390272 cc 19390271  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 6269271 - 6269468
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6269271 tttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttgcaatgttagaatatatgttttgtattttattgggtcattttt 6269370  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6269371 caaacataaagtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaaactgtcaatagtgtgctaaataaaattccaagacc 6269468  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 40081582 - 40081774
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40081582 catttttagactacaagtatactatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattgggtcat 40081681  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaat 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40081682 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaaaaaaat 40081774  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 22968289 - 22968486
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22968289 tttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgttagaatatatgttttgtattttattgggtcattttt 22968388  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22968389 caaacataaagtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgctaaataaaatttcaagacc 22968486  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 34083961 - 34084164
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34083961 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttattgggtcat 34084060  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgtt--aaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34084061 ttttcaaacataaagtatattaccgggtaaatttgaacaattaacctgttaaaaaataagagagatgaacccatcaatagtgtgctaaataaaattccaa 34084160  T
Q  198 gacc 201  Q
    ||||    
T  34084161 gacc 34084164  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39772112 - 39771915
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39772112 tttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattgggtcattttt 39772013  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  39772012 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgtcaaataaaatttcaagacc 39771915  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 6930739 - 6930936
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  6930739 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 6930834  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6930835 ttttcagacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaactcgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 6930934  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45336196 - 45335999
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45336196 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttattgagtcat 45336101  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  45336100 ttttcagacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataagagagatgaatccggcactagtgtgctaaataaaattccaaga 45336001  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5135610 - 5135421
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5135610 catttttagactacgcgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttatagggtcat 5135515  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5135514 ttttcagacataatgtatattacatggtcaatttgaataattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaatt 5135421  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19565346 - 19565543
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19565346 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctataatatatgttttatattttattgagtcat 19565441  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  | || |||||||||||||||||| |||    
T  19565442 ttttcagacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataagagagatgaatccggtactagtgtgctaaataaaattccgaga 19565541  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33041275 - 33041078
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  33041275 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 33041180  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  33041179 ttttcagacataaggtatattatagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 33041080  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45183303 - 45183106
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  45183303 catttttagactacacgtatattacacggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 45183208  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  45183207 tttttagacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 45183108  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 11018055 - 11018247
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaa-tcaagttacaatgctata--atatatgttttgtattttattgggtc 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||   |||||    
T  11018055 catttttagactacatgtatattacagggtggttaa----aaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatatgttttgtatttttaagggtc 11018150  T
Q  98 atttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11018151 atttttcagacataaagtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaattgtgtgctaaataaaattc 11018247  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27935500 - 27935303
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| |    
T  27935500 catttttagaccagacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttacaaggtctt 27935405  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  27935404 ttttcagacataatttatattacagggtcaatttgaaaaattaacccgttagaataagagagatgaacccgtcaatagtatgctaaataaaattccgaga 27935305  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35514584 - 35514387
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||    
T  35514584 catttttaaactacacgtatattataaggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttccaggatcat 35514489  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  35514488 ttttcagacataatctatattacaaggtcaatttgaacaattaatccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgcaaaataaaattcctaga 35514389  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22922349 - 22922222
Alignment:
Q  72 atatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgt 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22922349 atatatgttttatattttattgggtcatttttcaaacatagagtatattacagggtaaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgt 22922250  T
Q  172 caatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22922249 caatagtgtgttaaataaaattccaaga 22922222  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 6503414 - 6503611
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    ||||||    
T  6503414 catttttagaatacacgtatattacagggtggtcaaaa----atatgaagaaattcaagttacaatgctagtatatatgttttgtatttttaacggtcat 6503509  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||    
T  6503510 ttttcagacataaggtatattacatagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccatcaattgtgtgctaaataaaaatccgaga 6503609  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8257103 - 8257012
Alignment:
Q  53 atcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaac 144  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8257103 atcaaattacaaggctagaatatatgttttttattttacattgtcatttttcaaacatagtgtatattacaaggttaatttgaacaattaac 8257012  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38282638 - 38282543
Alignment:
Q  98 atttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||    
T  38282638 atttttcagacatagtgtatattacatggtcaatttgaacaattaacccttcagaataagagagatgaacctcataatagtgtgctaaataaaatt 38282543  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 111
Target Start/End: Original strand, 29565029 - 29565100
Alignment:
Q  41 aaataagaagaa-atcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacata 111  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  29565029 aaataagaagaatatcaaattacaaggctataatatatgttttttattttacaaggtcatttttcaaacata 29565100  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 145
Target Start/End: Original strand, 38415739 - 38415789
Alignment:
Q  95 gtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacc 145  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38415739 gtcatttttcagacatcatgtatattacagcgtcaatttgaacaactaacc 38415789  T

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Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 34948599 - 34948798
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34948599 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttat 34948698  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34948699 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaatttcaaga 34948798  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13838146 - 13837946
Alignment:
Q  2 atttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13838146 atttttagactacacgtatattatagggtggtcagatttaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttatt 13838047  T
Q  101 tttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13838046 tttcaaacataaagtatattacagggtcaagttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccaagac 13837947  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  13837946 c 13837946  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 398939 - 398742
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  398939 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaaaaaattcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattgggtcattttt 398840  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  398839 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgccaaataaaattccaagacc 398742  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18339428 - 18339231
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  18339428 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 18339333  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  18339332 ttttcaaacataaggtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 18339233  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29743605 - 29743408
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaa-tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29743605 catttttagactacacatatattatagggtggtaaa----aaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttattgggtcat 29743510  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||| |||    
T  29743509 ttttcagacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataagagagatgaatccggcactagtgtgctaaataaaattccgaga 29743410  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28997052 - 28996855
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||    
T  28997052 catttttagaatacacgtatattacaggatggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagagtcat 28996957  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  28996956 ttttcagacataaggtatattacagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 28996857  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 33229181 - 33229369
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||    
T  33229181 catttttagactacacatatattataaggtgttcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatattttgtttggtcat 33229276  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaat 192  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  33229277 ttttcagacataaagcatattacaaggtcaatttgaacaattaacctgttaaaataagagagatgaatccggcaatagtgtgctaaataaaat 33229369  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23217299 - 23217212
Alignment:
Q  59 ttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttc-aaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacc 145  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23217299 ttacaaggctataatatacgttttttattttataaagtcatttttttaaacatagtgtatattatagggtcaatttgaacaattaacc 23217212  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 23217867 - 23217940
Alignment:
Q  71 aatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaac 144  Q
    ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23217867 aatatgtgttttatattttactaggtcatttttcagacatcacttatattacagggtcaatttcaataattaac 23217940  T

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Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7433771 - 7433570
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7433771 catttttagactacatgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttattaggttat 7433672  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  7433671 ttttcaaacataaagtacattccagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagacatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaatttcaaga 7433572  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  7433571 cc 7433570  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 32981897 - 32982098
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32981897 catttttagactacatgtatattatagggtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttacaatgttagaatatatgttttgtattttattgggtcat 32981996  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32981997 ttttcaaacataaagtattttacagggtcaatttgaacaattaaccctttaaaataagagagatgaatctgtcaatagagtgctaaataaaattccaaga 32982096  T
Q  200 cc 201  Q
    ||    
T  32982097 cc 32982098  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 42310782 - 42310982
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42310782 catttttagactacacgtatattatagagtggtcaaaattaaataagaagaaattcaagttgcaatgctagaatatatattttttattttattgggtcat 42310881  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  42310882 ttttcaaacataaagtatattacaaggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagcgtactaaataaaatttcaaga 42310981  T
Q  200 c 200  Q
    |    
T  42310982 c 42310982  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3829305 - 3829113
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3829305 catttttagaccagacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaaagttagaatatatgttttgtattttacagggtcat 3829210  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattcca 196  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3829209 ttttcagacataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattcca 3829113  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35907874 - 35907677
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||| |    
T  35907874 catttttagactacacgtatattacagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttatatttttaagggtcgt 35907779  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  35907778 ttttcaaacataaggtatattacagggttaatttgaacagttaacccgttaaaataagagagatgaactcgtcaataatgtgctaaataaaattccgaga 35907679  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17445633 - 17445438
Alignment:
Q  2 atttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaatc-aagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  17445633 atttttagactacacgtatattacagggtagtcaaaa----ataagaagaaatttaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcatt 17445538  T
Q  101 tttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagac 200  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17445537 tt-cagacataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagaaagatgaacccgtcaataatgtgctaaataaaattccgagac 17445439  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33490028 - 33489839
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||    
T  33490028 catttttagactatgcgtatattataggatggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttacagtgtcat 33489933  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33489932 ttttcagacatattgtatattgcaaggtcaatttgaacaattagcccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaatt 33489839  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 41972102 - 41972290
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  41972102 catttttagactacgcctatattatagg-tggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtattttacaggttcat 41972196  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41972197 ttttcagacaaaatgtatattacacggtcaatttgaacaattaatccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaatt 41972290  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26144527 - 26144380
Alignment:
Q  54 tcaagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaa 153  Q
    ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26144527 tcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaa 26144428  T
Q  154 taagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26144427 taagagagatgaaactgtcaatagtgtgccaaataaaattccaagacc 26144380  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Original strand, 321273 - 321419
Alignment:
Q  55 caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaat 154  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  321273 caagttacaatggtagaatatatgttttgtattttacagagtcattttttagacataatgtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaat 321372  T
Q  155 aagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  321373 aagagagatgaacccgtcaataatgtgttaaataaaattccgagacc 321419  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28463295 - 28463231
Alignment:
Q  129 aatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  28463295 aatttgaacaattaaccattcaaaataagagagatgaacccaccaatagtgtgctaaataaaatt 28463231  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13904632 - 13904600
Alignment:
Q  114 gtatattacagggtcaatttgaacaattaaccc 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13904632 gtatattacagggtcaatttaaacaattaaccc 13904600  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 480302 - 480499
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  480302 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaaaaaattcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattgggtcattttt 480401  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  480402 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgccaaataaaattccaagacc 480499  T

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Target: scaffold2142 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold2142
Description:

Target: scaffold2142; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 844 - 647
Alignment:
Q  5 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcattttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  844 tttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaaaaaattcaagttacaatgttagagtatatattttgtattttattggatcattttt 745  T
Q  104 caaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  744 caaacataaagtatattaaagagtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaaactgtcaatagtgtgccaaataaaattccaagacc 647  T

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Target: scaffold0041 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 53247 - 53050
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  53247 catttttagactacacgtatattatagggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttataatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcat 53152  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaaga 199  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  53151 ttttcaaacataagatatattacagagtcaatttgaacaattaatccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgaga 53052  T

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Target: scaffold0502 (Bit Score: 122; Significance: 8e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0502
Description:

Target: scaffold0502; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5516 - 5355
Alignment:
Q  41 aaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaa 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5516 aaataagaagaaattcaagttacaatgctagaatatatgttttgtatttttaagggtcatttttcaaacataaggtatattacagggtcaatttgaacaa 5417  T
Q  140 ttaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5416 ttaacccgttaaaataagagagatgaacccgtcaatagtgtgctaaataaaattccgagacc 5355  T

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Target: scaffold0154 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31802 - 31613
Alignment:
Q  1 catttttagactacacgtatattatagggtgatcaaaattaaataagaagaaat-caagttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||| |    
T  31802 catttttagactacccgtatattataaggtggtcaaaa----ataagaagaaattcaagttacaatgttagaatatatgttttgtattttacagtgtcgt 31707  T
Q  100 ttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaatt 193  Q
    |||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  31706 ttttcagacataatcaatattacaaggtcaatttgaacaattaacccgttaaaataagagagatgaacctgtcaatagtgtgcaaaataaaatt 31613  T

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Target: scaffold0134 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17579 - 17493
Alignment:
Q  59 ttacaatgctataatatatgttttgtattttattgggtcatttttcaaacataaagtatattacagggtcaatttgaacaattaacc 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | || |   ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17579 ttacaaggctataatatatgttttttttattttatagtcattttttaaacatagtgtatattatagggtcaatttgaaaaattaacc 17493  T

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Target: scaffold0069 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18015 - 17967
Alignment:
Q  153 ataagatagatgaacccgtcaatactgtgctaaataaaattccaagacc 201  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18015 ataagagagatgaaactgtcaatagtgtgctaaataaaatttcaagacc 17967  T

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