View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4167_low_12 (Length: 365)

Name: NF4167_low_12
Description: NF4167
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4167_low_12
NF4167_low_12
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (41-318)||(22809335-22809612)
chr7 (28-339)||(22880272-22880580)
chr7 (30-329)||(22858142-22858441)
chr7 (27-342)||(22814707-22815019)
chr7 (48-342)||(22888993-22889284)
chr7 (47-346)||(22839752-22840048)
chr7 (48-320)||(22805019-22805279)
chr7 (48-346)||(22875623-22875912)
chr7 (27-318)||(22893633-22893912)
chr7 (47-339)||(22830731-22831020)
chr7 (48-290)||(22913375-22913605)
chr7 (30-260)||(22885308-22885535)
chr7 (42-310)||(22897967-22898223)
chr7 (48-311)||(22825959-22826210)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (27-332)||(21150732-21151034)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Original strand, 22809335 - 22809612
Alignment:
Q  41 ttagctcaggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataattgaccctgttga 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  22809335 ttagctcaggaagtttagagatatcaaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaaccaagaacataatgagaagatagaatagaacctgttga 22809434  T
Q  141 agatgagaatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacattaaaaccaaca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22809435 agatgagaatccaacatacatactagtgttaagaattggagaaagatctttggtgaatgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacattaaaaccaaca 22809534  T
Q  241 ctaattggagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactg 318  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22809535 ttaattggagctaaagtagcatcaatctttttcttttcaccatcatattcaatccatacatgcataggatagccactg 22809612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 339
Target Start/End: Original strand, 22880272 - 22880580
Alignment:
Q  28 tcagcaaatactgttagctcaggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataa 127  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  22880272 tcagcaaatactattggctcatgaagctcagagatttcaaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaaccaagaacataatgagaagctaaaa 22880371  T
Q  128 ttgaccctgttgaagatgagaatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaac 227  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||   |      
T  22880372 ttaaccttgttgaagatgataatccaacatacatactattgttgagaattggagaaagatctttggtcaatgacaacaaatgtcgtgttggttt---att 22880468  T
Q  228 attaaaaccaacactaattggagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactggagagggat 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22880469 attaaaaccaacactaatcggagctaatgtaacctcaatctttttcttcactccatcatagtcaatccatacctgcatgggatatccactggaaagggat 22880568  T
Q  328 aaatccctgaat 339  Q
    |||||| |||||    
T  22880569 aaatccttgaat 22880580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 329
Target Start/End: Original strand, 22858142 - 22858441
Alignment:
Q  30 agcaaatactgttagctcaggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataatt 129  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||    
T  22858142 agcaaatattcttagctcaggaagtttagagatttcaaggttttgagcttggccattaaccttaaaactccaaccaagaatataatgggaagctacaatt 22858241  T
Q  130 gaccctgttgaagatgagaatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacat 229  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22858242 accccggttgaagatgagaatccaacatacattctattgttgagaattggagaaagatctttcgtgaatgataacaaaggtcgtgctggtttaacaacat 22858341  T
Q  230 taaaaccaacactaattggagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactggagagggataa 329  Q
    || |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22858342 tacaaccaaaattaattggagctaatgtaacatcaatatttttcttcactccatcatattctatccatacctgcataggatatccactagaaagggataa 22858441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 342
Target Start/End: Original strand, 22814707 - 22815019
Alignment:
Q  27 ctcagcaaatactgttagctcaggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatata 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |    
T  22814707 ctcagcaaatactgttagcttaggaagttcagatatttcaaggttttgagcttggccattaaccttaaaactccacccaagaatataatgagaagctaca 22814806  T
Q  127 attgaccctgttgaagatgagaatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaa 226  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |     
T  22814807 agtaaccctgttgaagatgagaatccaacatacattctattgttgagaattgaagaaagatctttggtcaatgataacaaaggttgtgttggttt---at 22814903  T
Q  227 cattaaaaccaacactaattggagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactggagaggga 326  Q
     | ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||    
T  22814904 tactagcaccaacactcattggagctaaagtaacatcaatctttttcttcactccatcatagtcaatccatacctgtataggaaatccattggaaaggga 22815003  T
Q  327 taaatccctgaattga 342  Q
    ||| ||||||||||||    
T  22815004 taactccctgaattga 22815019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 342
Target Start/End: Original strand, 22888993 - 22889284
Alignment:
Q  48 aggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataattgaccctgttgaagatgag 147  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  22888993 aggaagttcagagatttcaaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaaccaagaatatactgagaagctaccattaaccctgttgaagatgag 22889092  T
Q  148 aatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacattaaaaccaacactaattg 247  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |  | ||  ||||||||| ||||    
T  22889093 aatccaacatacattctattgttgagaattgaagaaagatctttggtcaatgataacaaaggttgtgttggttt---attactagcaccaacactcattg 22889189  T
Q  248 gagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactggagagggataaatccctgaattga 342  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22889190 gtgctaaagtaacatcaatctttttcttcactccatcatattcaatccatacctgcatagggtatccactggaaagggataaatccttgaattga 22889284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 47 - 346
Target Start/End: Original strand, 22839752 - 22840048
Alignment:
Q  47 caggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataattgaccctgttgaagatga 146  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||    
T  22839752 caggaaggtcagagatttcaaggttttgagattggccattaaccataaaactccaaccatgaatataatgagaagctgcaatgaaccctgttgaagatga 22839851  T
Q  147 gaatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacattaaaaccaacactaatt 246  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||  |    ||||||||||||||| |    
T  22839852 gaatccaacatacattctattgttgagaattggggaaagatctttggtcaatgataacgtcggttgtgttggtttatgac---taaaaccaacactaaat 22839948  T
Q  247 ggagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactggagagggataaatccctgaattgattat 346  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22839949 ggagctaaggtaacatcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactggagagggataaatccctgaatcgattat 22840048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 320
Target Start/End: Original strand, 22805019 - 22805279
Alignment:
Q  48 aggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataattgaccctgttgaagatgag 147  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  || | |||||||||||||||||    
T  22805019 aggaaattgagagattacaaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaaccaagaatataatgagaagctgcaagtaaccctgttgaagatgag 22805118  T
Q  148 aatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacattaaaaccaacactaattg 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||          ||    
T  22805119 aatccaacatacatactattgttaagaattggagaaagatctttggtcattgataacgaaggtcctgttggtttaacaacat--aaac----------tg 22805206  T
Q  248 gagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactgga 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  22805207 gagctaaagtaacatcaatctttttcttcactccatcataatcaatccatacctgtataggatttccactgga 22805279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 346
Target Start/End: Original strand, 22875623 - 22875912
Alignment:
Q  48 aggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataattgaccctgttgaagatgag 147  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  22875623 aggaagttcagagatttcaagggtttgagcttgaccattaaccttaaaactccaaccaagaatataatgagaagctaaaattaaacctgttgaagatgag 22875722  T
Q  148 aatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacattaaaaccaacactaattg 247  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||      |||   || | ||   ||||    
T  22875723 aatccaacatacattctattgttgagaattggagaaagatctttggtcaatgataacaaaggttgtgttggttt------att---actagcatctattg 22875813  T
Q  248 gagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactggagagggataaatccctgaattgattat 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  22875814 gagctaaagtaacatcaatcttttttttcactccatcatagtcaatccatacctgcatgggatatccactgaaaagggataaatccctgaatcgattat 22875912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Original strand, 22893633 - 22893912
Alignment:
Q  27 ctcagcaaatactgttagctcaggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatata 126  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  22893633 ctcagctaatactggtaactcaggaagttcagagattacaaggttttgagcttgaccattaatcttaaaactccaaccaagaatataatgagaagttaga 22893732  T
Q  127 attgaccctgttgaagatgagaatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaa 226  Q
    | ||| || || |  ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22893733 aatgaaccagtagctgatgaaaatccaacatacatactattgttaagaattggagaaagatctttggtcaatgataacaaaggttgttttggtttaacaa 22893832  T
Q  227 cattaaaaccaacactaattggagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactg 318  Q
    |||            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22893833 cat------------taattggagctaaagtaacatcaatctttttcttttcaccatcatattcaatccatacctgcataggatagccactg 22893912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 339
Target Start/End: Original strand, 22830731 - 22831020
Alignment:
Q  47 caggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataattgaccctgttgaagatga 146  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||    
T  22830731 caggaaggtcagagatttcaaggttttgagattggccattaaccataaaactccaaccatgaatataatgagaagctgcaatgaaccctgttgaagatga 22830830  T
Q  147 gaatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacattaaaaccaacactaatt 246  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||   |  | ||||||||||||||| |    
T  22830831 gaatccaacatacattctattgttgagaattggggaaagatctttggtcaatgataacgtcggttgtgttggttt---atgactaaaaccaacactaact 22830927  T
Q  247 ggagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactggagagggataaatccctgaat 339  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||    
T  22830928 ggagctaaggtaacatcaatctttttcttcactccatcatattcaatccatacctgcataggatgtccactggtaagggataaattcctgaat 22831020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 290
Target Start/End: Original strand, 22913375 - 22913605
Alignment:
Q  48 aggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataattgaccctgttgaagatgag 147  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  22913375 aggaagttcagagattacaagattttgagcttgaccattaaccttaaaactccaaccaagaatataatgagaagttagaattgaacctgttgaagatgag 22913474  T
Q  148 aatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacattaaaaccaacactaattg 247  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||            ||||||    
T  22913475 aatccaacatacatactagtgttaagaattgaagaaagatctttgttcaatgataacaaaggttgttttggtttaacaacat------------taattg 22913562  T
Q  248 gagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattc 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22913563 gagctaaagtaacatcaatctttttcttcactccatcatattc 22913605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Original strand, 22885308 - 22885535
Alignment:
Q  30 agcaaatactgttagctcaggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataatt 129  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  22885308 agcaaatattcttggctcaggaagttcagagatttcaaggttttgagcttggctattaaccttaaaactccaaccaagaatataatgagaagctacaatt 22885407  T
Q  130 gaccctgttgaagatgagaatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacat 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   | ||     
T  22885408 aaccctgttgaagatgagaatccaacatacattctattgttgagtattggagaaagatctttggtcaatgataacaaaggttgtgttggttt---atcac 22885504  T
Q  230 taaaaccaacactaattggagctaaagtaac 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22885505 taaaaccaacactaattggagctaaagtaac 22885535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 310
Target Start/End: Original strand, 22897967 - 22898223
Alignment:
Q  42 tagctcaggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataattgaccctgttgaa 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||| || || |      
T  22897967 tagcttaggaagttcagagattacaaggttttcagcttgaccattaaccttaaaactccaaccaagaatataatgagaagtgaaaactgaaccagtagct 22898066  T
Q  142 gatgagaatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacattaaaaccaacac 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||                
T  22898067 gatgaaaatccaacatacatactattgtttaaaattggagaaagatctctggtcaatgacaacaaaggttgttttggtttaacaacat------------ 22898154  T
Q  242 taattggagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggat 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22898155 taattggagctaaagtaacatcaatctttttcttttcaccatcatattcaatccatacctgcataggat 22898223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 311
Target Start/End: Original strand, 22825959 - 22826210
Alignment:
Q  48 aggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatataattgaccctgttgaagatgag 147  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||  | || ||| || || |  ||||||    
T  22825959 aggaagttcagaaattacaagattttgagcttgaccattaagcttaaaacttcaaccaagaatataatgagaagtgaaaactgaaccagtagctgatgag 22826058  T
Q  148 aatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaacattaaaaccaacactaattg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||            ||||||    
T  22826059 aatccaacatacatactattgttcaaaattggaggaagatctctggtcaatgaaaacaaaggttgttttggtttaacaacat------------taattg 22826146  T
Q  248 gagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggata 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  | | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22826147 gagctaaagtaacatcaatctttttattttcaccatcatattctatccatacctgcataggata 22826210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21151034 - 21150732
Alignment:
Q  27 ctcagcaaatactgttagctcaggaagttcagagattactaggttttgagcttgaccattaaccttaaaactccaactaagaacataatgagaagatata 126  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |    
T  21151034 ctcagaaaatactgttacttcaggaagttcagagatttcaaggttttgagccaggccattaaccttaaaactccaaccaagaatataatgagaagctgca 21150935  T
Q  127 attgaccctgttgaagatgagaatccaacatacatactattttgaagaattggagaaagatctttggtcattgataacaaaggtcgtgttggtttaacaa 226  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||         
T  21150934 agtaaccctgttgaagatgagaatccaacatacatactattgttgagaactggagaaagatctttggtcaatgataacaaaggtcttgctggttt---tt 21150838  T
Q  227 cattaaaaccaacactaattggagctaaagtaacttcaatctttttcttcactctatcatattcaatccatacttgcataggatatccactggagaggga 326  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||  | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21150837 tattaaaaccaacactaattggagctaaagtaacattaatcttcttcttttcaccatcatattcaatccatacatgcataggatatccactgaaaaggga 21150738  T
Q  327 taaatc 332  Q
    ||||||    
T  21150737 taaatc 21150732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University