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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF4169_high_3 (Length: 382)
Name: NF4169_high_3
Description: NF4169
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4169_high_3 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4777532 - 4777179
Alignment:
| Q |
11 |
cacagacctaaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaaaatattgtctacaaacaatgttcgacggtatctagaatatgtg |
110 |
Q |
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| T |
4777532 |
cacagacctaaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaagatattgtctacaaacaatgttcgacggtatctagaatatgtg |
4777433 |
T |
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| Q |
111 |
agaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatg |
210 |
Q |
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| T |
4777432 |
agaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatg |
4777333 |
T |
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| Q |
211 |
atttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgagatcat |
310 |
Q |
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| T |
4777332 |
atttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgagatcat |
4777233 |
T |
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| Q |
311 |
ttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagg |
364 |
Q |
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| T |
4777232 |
ttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagg |
4777179 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 99 - 357
Target Start/End: Original strand, 4725485 - 4725743
Alignment:
| Q |
99 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
198 |
Q |
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| T |
4725485 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacaaaataaatataacaagtggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
4725584 |
T |
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| Q |
199 |
gtaactatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagatt |
298 |
Q |
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| T |
4725585 |
gtaactatgatgatctaaacaagccaccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtaaacttcaccaatctatcgcgcatcacaac |
4725684 |
T |
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| Q |
299 |
caatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacag |
357 |
Q |
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| T |
4725685 |
cagtgagatcatttacactccatcactagattacatacaaccatgtcttgttaacacag |
4725743 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Original strand, 4680493 - 4680852
Alignment:
| Q |
8 |
gagcacagacctaaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaaaatattgtctacaaacaat---gttcgacggtatctagaa |
104 |
Q |
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| T |
4680493 |
gagcacaggcataagttacatttcagatgccaaattcatagacagtggtgtaagtaagaggatactacctacaagcaatactgttctacagcaactggaa |
4680592 |
T |
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| Q |
105 |
tatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaact |
204 |
Q |
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| T |
4680593 |
tatgtgaggagctttcccagtggagtgaaaaattgttacaaaatagatgtaaccaatggtaccaaatatttaatcagagcttctttctattatggaaact |
4680692 |
T |
|
| Q |
205 |
atgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatga |
304 |
Q |
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| T |
4680693 |
acgatgatttaaatgagccaccacaatttgatcttcattttggacctaatgtttgggatacagtaaagttcacaaatttatcacgcatgacaatcaagga |
4680792 |
T |
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| Q |
305 |
gatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagg |
364 |
Q |
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| T |
4680793 |
gatcatatacactccatcactagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggcaaagg |
4680852 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 99 - 364
Target Start/End: Original strand, 4702717 - 4702982
Alignment:
| Q |
99 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
198 |
Q |
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| T |
4702717 |
ctagaacatgtgaggagttttcctaatggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacaagtgatactaaatatttaatcagagctactttctattatg |
4702816 |
T |
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| Q |
199 |
gtaactatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagatt |
298 |
Q |
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| T |
4702817 |
gtaactatgatgatttaaatgatcccccagaatttgatcttcattttggacctaatgtctgggatacagtgaacttccccaatgcatcactcgtcacatt |
4702916 |
T |
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| Q |
299 |
caatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagg |
364 |
Q |
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| T |
4702917 |
tatggagatcatttacactccatcactagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggcaaagg |
4702982 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 99 - 359
Target Start/End: Original strand, 4688221 - 4688481
Alignment:
| Q |
99 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
198 |
Q |
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| T |
4688221 |
ctagaacatgtgaggagttttcctagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacaagtgatactaaatatttaatcagagcgtctttctattatg |
4688320 |
T |
|
| Q |
199 |
gtaactatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagatt |
298 |
Q |
| |
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| T |
4688321 |
gaaactatgatgatttaaacgagccaccacaatttgatcttcattttggcgctaatgtttgggatacagtaaagttcacaaatttatcactcatcgcaac |
4688420 |
T |
|
| Q |
299 |
caatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggc |
359 |
Q |
| |
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| T |
4688421 |
cagtgagatcatttacactccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggc |
4688481 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 103 - 358
Target Start/End: Original strand, 4714057 - 4714312
Alignment:
| Q |
103 |
aatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaa |
202 |
Q |
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| T |
4714057 |
aatatgtgaggagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacaagtggtattaaatatttaatcagatcttctttctattacggaaa |
4714156 |
T |
|
| Q |
203 |
ctatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaat |
302 |
Q |
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| T |
4714157 |
ctatgatgatttaaatgagccaccagaatttgatcttcattttggacctaatgtttgggatacagtgaagttaactaatatatcacacatcacagacagt |
4714256 |
T |
|
| Q |
303 |
gagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacagg |
358 |
Q |
| |
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|||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
4714257 |
gagatcatatacactccattattagattacatacaaccatgtcttgttaacacagg |
4714312 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21440447 - 21440188
Alignment:
| Q |
108 |
gtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatg |
207 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
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| T |
21440447 |
gtgaggagctttccaagtggagtgagaaactgttacaaaataaatgtaacaagtggtactaaatatttaataagagcttctttctattatggaaactatg |
21440348 |
T |
|
| Q |
208 |
atgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagtt---ccccaatgcatcacgtatgagattcaatga |
304 |
Q |
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| T |
21440347 |
ataatctaaatgaaccaccacaatttgatcttcattttggagctaatgtgtgggatacagtgaagttgttctccaatgcatcacacatcactatcaagga |
21440248 |
T |
|
| Q |
305 |
gatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagg |
364 |
Q |
| |
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| T |
21440247 |
gattatttacactccatcagtagattacataaaaccatgtcttgttaacacaggcaaagg |
21440188 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 103 - 364
Target Start/End: Original strand, 4995518 - 4995779
Alignment:
| Q |
103 |
aatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaa |
202 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
4995518 |
aatatgtgaggagctttccaattggaatgagaaactgttacagaataaatgtagcaagtggtactaaatatttaatcagagcatctttctattatggtaa |
4995617 |
T |
|
| Q |
203 |
ctatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaat |
302 |
Q |
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| T |
4995618 |
ctatgataatctaaacaagccaccagaatttgatcttcattttggacctaatgtttgggatacagtgaagttcgccagtctatcacacatcacagacagt |
4995717 |
T |
|
| Q |
303 |
gagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagg |
364 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4995718 |
gagatcatatacactccatcactagattacattcaaccatgtcttgttaacacaggcaaagg |
4995779 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4914392 - 4914134
Alignment:
| Q |
106 |
atgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaacta |
205 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
4914392 |
atgtgaggagttttcctagtggagttagaaactgttacagaataaatgtaacaagtggtactaaatatttaatcagagcttctttttattatggaaacta |
4914293 |
T |
|
| Q |
206 |
tgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgag |
305 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| | |||| |||| | || | | |||| ||| |
|
|
| T |
4914292 |
tgataatctaaatcaaccaccagaatttgatctacattttggagctaatgtttgggaaacagtaaagttcactaatgtatcaggcatcacactcaaggag |
4914193 |
T |
|
| Q |
306 |
atcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagg |
364 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
4914192 |
atcatatacactccatcacaagatcacatacaaccatgtcttgttaacataggcaaagg |
4914134 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Original strand, 10445877 - 10446236
Alignment:
| Q |
8 |
gagcacagacctaaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaaaatattgtctacaaacaatgttcgacggtatctagaatat |
107 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| ||| | || | | || ||| || | | ||||||||| |
|
|
| T |
10445877 |
gagcacatacataaattacatttcagataccaaattcatagatacaggtgtaagcaagaggatacaatttaaagatgatattcaacagcaactagaatat |
10445976 |
T |
|
| Q |
108 |
gtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatg |
207 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10445977 |
gtgaggagctttcctagtggagtgagaaattgttacagaataaatgttacaagtggtattcaatatttaatcagagtttctttctattatggaaactatg |
10446076 |
T |
|
| Q |
208 |
atgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagtt---ccccaatgcatcacgtatgagattcaatga |
304 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| | |||||| | | | | |||||| || |
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|
| T |
10446077 |
ataatctaaatgaaacaccacagtttgatcttcattttggacctaatgtgtgggatacagtgacgttctcctccaatgatttagggttcgcattcaagga |
10446176 |
T |
|
| Q |
305 |
gatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagg |
364 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10446177 |
gatcatatacactccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggcaaagg |
10446236 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4905213 - 4905019
Alignment:
| Q |
170 |
atatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtg |
269 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
4905213 |
atatttaattagagctactttctattatggtaattatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagcaaatgtttgggatacagta |
4905114 |
T |
|
| Q |
270 |
aagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagg |
364 |
Q |
| |
|
|||||| | | |||||||| | | | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4905113 |
aagttcacaattgcatcactcactacaatcaaggagatcatttacactccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggcaaagg |
4905019 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4891245 - 4890983
Alignment:
| Q |
99 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
198 |
Q |
| |
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| T |
4891245 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaactgttacaacataagtgtaacaagtggtactaaatattttatcagaacttcttttctttatg |
4891146 |
T |
|
| Q |
199 |
gtaactatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagtt---ccccaatgcatcacgtatgag |
295 |
Q |
| |
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| T |
4891145 |
gaaactatgataatctaaacaagccaccacaatttgatcttcactttggagctaatgtgtgggatacagtgaagttgtcctccaatgcatcactcttcac |
4891046 |
T |
|
| Q |
296 |
attcaatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacagg |
358 |
Q |
| |
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||||| || |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4891045 |
attcagggaaatcatttacactccgtcgctagattacatacaaccatgtcttgttaacacagg |
4890983 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 359
Target Start/End: Original strand, 4744961 - 4745216
Alignment:
| Q |
99 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
198 |
Q |
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| T |
4744961 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaactg--aca---taagtgtaacaagtggaaatatatatttaatcagagcttctttctattatg |
4745055 |
T |
|
| Q |
199 |
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298 |
Q |
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| T |
4745056 |
gaaactatgataatctaaatcaaccaccacaatttgatcttcattttggtgctaatgtgtgggatacggtgaatttccccaatgtatcagtcaccacaac |
4745155 |
T |
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| Q |
299 |
caatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggc |
359 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
4745156 |
aagggagatcatttacactccatcactagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggc |
4745216 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4876220 - 4875979
Alignment:
| Q |
114 |
agctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctgg-tactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatgat |
212 |
Q |
| |
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| T |
4876220 |
agctttccaagtggagtgagaaattgctacagaataaatgtaa-acatggatattcaatatttaatcagagctactttctattatggaaactatgataat |
4876122 |
T |
|
| Q |
213 |
ttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgagatcattt |
312 |
Q |
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| T |
4876121 |
ctaaatgatccaccacaatttgatcttcattttggacctaatgtgtgggatacagtgaagttcacaaatttatcacgcaccacaatcaaggagatcatat |
4876022 |
T |
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| Q |
313 |
acagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacac |
355 |
Q |
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| T |
4876021 |
acactccatcactagactacatagaaccatgtcttgttaacac |
4875979 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 114 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4926113 - 4925863
Alignment:
| Q |
114 |
agctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaa-catctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatgat |
212 |
Q |
| |
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| T |
4926113 |
agctttccaagtggagttagaaactgttacagaataaatgtaaacatg-ggtgttcaatatttaatcagagctactttcctttatggaaactatgataat |
4926015 |
T |
|
| Q |
213 |
ttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgagatcattt |
312 |
Q |
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| T |
4926014 |
ataaatgaaccaccacaatttgatcttcattttggacctaatgtgtgggatacggtgttgttatccaatgcatcacgccccacaatcaaggagatcattt |
4925915 |
T |
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| Q |
313 |
acagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagg |
364 |
Q |
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| T |
4925914 |
acattccatcaaaagattacatacaaccatgtcttgttaaaacaggcaaagg |
4925863 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Original strand, 4735874 - 4736219
Alignment:
| Q |
19 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaaaatattgtctacaaacaatg---ttcgacggtatctagaatatgtgagaag |
115 |
Q |
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| T |
4735874 |
taaattatatttcagatgccaaattcatagatactggtgtaactaagaggataacgcctacaaacaataatattaaacaggaactagaatatttgaggag |
4735973 |
T |
|
| Q |
116 |
ctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatgattta |
215 |
Q |
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| T |
4735974 |
ctttccaagtggagtgagaaattgttacaaaataaatgtaacaagtggtactaaatatttaatcagagctacttttctttatggaagctatgatggttta |
4736073 |
T |
|
| Q |
216 |
aatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttcccca---atgcatcacgtatgagattcaatgagatcattt |
312 |
Q |
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| T |
4736074 |
gacaagccaccacaatttgatcttcattttggacctaatgtggtggctacagtgaggttctccaaccatacatcacacttcacatacagggaaatcattt |
4736173 |
T |
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| Q |
313 |
acagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacagg |
358 |
Q |
| |
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| T |
4736174 |
atactccatcacaagattacatacaaccatgttttgttaacacagg |
4736219 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Original strand, 4713976 - 4714028
Alignment:
| Q |
19 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaaaata |
71 |
Q |
| |
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| T |
4713976 |
taaattatatttcagatgccaaattcatagatgcaggtgtaagtaagaaaata |
4714028 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 4688138 - 4688169
Alignment:
| Q |
19 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagat |
50 |
Q |
| |
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| T |
4688138 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagat |
4688169 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4905937 - 4905875
Alignment:
| Q |
114 |
agctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatattta |
176 |
Q |
| |
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| T |
4905937 |
agctttcctagtggagtaggaaattgttacaaagtatatgtaacaagtggtactaaatattta |
4905875 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Original strand, 4995424 - 4995466
Alignment:
| Q |
9 |
agcacagacctaaattacatttcagatgccaaattcatagata |
51 |
Q |
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| T |
4995424 |
agcacacacataaattacatttctgatgccaaattcatagata |
4995466 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Original strand, 4725402 - 4725434
Alignment:
| Q |
19 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagata |
51 |
Q |
| |
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| T |
4725402 |
taaattatatttcagatgccaaattcatagata |
4725434 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 4891328 - 4891296
Alignment:
| Q |
19 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagata |
51 |
Q |
| |
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| T |
4891328 |
taaattacatatcagatgccaaattcatagata |
4891296 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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