View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4182_high_2 (Length: 378)

Name: NF4182_high_2
Description: NF4182
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4182_high_2
NF4182_high_2
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (1-204)||(43184297-43184500)
chr7 (1-204)||(26624881-26625084)
chr7 (1-204)||(36658316-36658519)
chr7 (1-204)||(37001974-37002176)
chr7 (1-204)||(7002860-7003063)
chr7 (1-204)||(7048731-7048934)
chr7 (1-204)||(8867560-8867763)
chr7 (1-204)||(34388885-34389088)
chr7 (1-204)||(40919832-40920035)
chr7 (1-203)||(33685699-33685901)
chr7 (1-185)||(38638083-38638268)
chr7 (1-197)||(10868292-10868488)
chr7 (1-204)||(5555622-5555829)
chr7 (1-204)||(8394260-8394467)
chr7 (1-204)||(14776932-14777139)
chr7 (1-204)||(3113922-3114128)
chr7 (1-204)||(36630951-36631158)
chr7 (1-77)||(35090303-35090379)
chr7 (5-92)||(26787732-26787819)
chr7 (47-191)||(44832137-44832278)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-204)||(12278689-12278892)
chr5 (1-204)||(31680502-31680705)
chr5 (1-204)||(33430456-33430659)
chr5 (1-204)||(37254776-37254979)
chr5 (1-204)||(31501547-31501748)
chr5 (1-204)||(28801441-28801644)
chr5 (1-204)||(36291506-36291710)
chr5 (1-204)||(1776201-1776408)
chr5 (1-204)||(16155132-16155339)
chr5 (1-204)||(39434831-39435038)
chr5 (1-204)||(36293446-36293653)
chr5 (1-154)||(17332430-17332583)
chr5 (1-204)||(10034062-10034269)
chr5 (2-197)||(13818113-13818312)
chr5 (1-204)||(16333701-16333908)
chr5 (1-204)||(39657331-39657538)
chr5 (1-204)||(43069012-43069216)
chr5 (1-204)||(26283143-26283350)
chr5 (250-362)||(26620335-26620446)
chr5 (1-118)||(192096-192213)
chr5 (1-191)||(38269240-38269428)
chr5 (1-85)||(19986074-19986158)
chr5 (40-154)||(23236732-23236846)
chr5 (103-158)||(1051455-1051510)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-204)||(30216571-30216774)
chr4 (1-204)||(35546088-35546291)
chr4 (1-201)||(6690067-6690267)
chr4 (1-204)||(3292725-3292928)
chr4 (1-204)||(43143413-43143616)
chr4 (1-204)||(42333605-42333808)
chr4 (1-204)||(50204906-50205109)
chr4 (1-204)||(48989463-48989666)
chr4 (1-204)||(44156786-44156987)
chr4 (1-204)||(48130113-48130316)
chr4 (1-204)||(30110110-30110313)
chr4 (1-204)||(10352713-10352916)
chr4 (1-204)||(6235655-6235862)
chr4 (1-204)||(36382171-36382378)
chr4 (1-204)||(26448187-26448390)
chr4 (1-204)||(20129445-20129652)
chr4 (1-201)||(30077463-30077663)
chr4 (74-204)||(13395048-13395178)
chr4 (1-204)||(25930843-25931050)
chr4 (1-192)||(29319542-29319737)
chr4 (1-197)||(40529150-40529350)
chr4 (1-204)||(17511058-17511265)
chr4 (1-204)||(34407109-34407316)
chr4 (1-204)||(1817852-1818055)
chr4 (1-204)||(29995813-29996015)
chr4 (1-204)||(13012323-13012530)
chr4 (1-204)||(43356039-43356246)
chr4 (1-204)||(26439104-26439311)
chr4 (1-204)||(47500908-47501115)
chr4 (80-204)||(33136276-33136400)
chr4 (1-105)||(28877178-28877282)
chr4 (1-82)||(13392832-13392913)
chr4 (1-82)||(13395971-13396052)
chr4 (46-94)||(9071283-9071331)
chr4 (46-192)||(18990655-18990801)
chr4 (169-201)||(28877146-28877178)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (1-204)||(33041088-33041291)
chr3 (1-204)||(45183116-45183319)
chr3 (1-204)||(6930723-6930926)
chr3 (1-204)||(5135423-5135626)
chr3 (1-204)||(11018039-11018244)
chr3 (1-204)||(6503398-6503601)
chr3 (1-204)||(35514397-35514600)
chr3 (1-204)||(19565330-19565533)
chr3 (1-204)||(27935313-27935516)
chr3 (1-204)||(19390281-19390488)
chr3 (1-204)||(40081566-40081773)
chr3 (1-204)||(45336009-45336212)
chr3 (1-204)||(22968269-22968476)
chr3 (1-204)||(6269251-6269458)
chr3 (1-204)||(34083945-34084154)
chr3 (1-204)||(39771925-39772132)
chr3 (1-120)||(22922230-22922349)
chr3 (1-192)||(38282545-38282738)
chr3 (48-138)||(8257012-8257102)
chr3 (76-195)||(29564989-29565105)
chr3 (46-158)||(219481-219593)
chr3 (47-186)||(38415650-38415789)
chr3 (46-154)||(35937431-35937539)
chr3 (47-80)||(5188888-5188921)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (1-204)||(12756666-12756869)
chr2 (1-204)||(45418718-45418921)
chr2 (1-204)||(8059162-8059365)
chr2 (1-204)||(8147487-8147690)
chr2 (1-204)||(44084432-44084635)
chr2 (1-201)||(4555024-4555224)
chr2 (2-204)||(771135-771337)
chr2 (1-204)||(17444866-17445073)
chr2 (3-197)||(26238080-26238274)
chr2 (1-204)||(7072360-7072562)
chr2 (1-204)||(41251459-41251666)
chr2 (3-204)||(26162531-26162732)
chr2 (1-204)||(31581446-31581654)
chr2 (1-204)||(32126966-32127173)
chr2 (1-204)||(35962850-35963057)
chr2 (1-204)||(6403629-6403836)
chr2 (1-204)||(18981751-18981956)
chr2 (1-204)||(45121370-45121573)
chr2 (48-204)||(2957970-2958130)
chr2 (69-204)||(42442188-42442327)
chr2 (1-94)||(16405735-16405828)
chr2 (1-99)||(2285997-2286095)
chr2 (1-74)||(42440121-42440194)
chr2 (166-204)||(2286096-2286134)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (1-204)||(23402243-23402446)
chr8 (1-204)||(4404143-4404346)
chr8 (1-204)||(9877355-9877558)
chr8 (1-204)||(16787854-16788057)
chr8 (1-204)||(34136654-34136857)
chr8 (1-204)||(2729025-2729228)
chr8 (1-203)||(42231072-42231274)
chr8 (1-196)||(3648627-3648826)
chr8 (1-204)||(15838420-15838626)
chr8 (1-204)||(36408686-36408878)
chr8 (1-142)||(40470366-40470507)
chr8 (1-204)||(39914649-39914856)
chr8 (1-148)||(29728271-29728418)
chr8 (46-204)||(3435445-3435603)
chr8 (46-157)||(32540327-32540438)
chr8 (132-204)||(29728182-29728255)
chr8 (110-192)||(378683-378762)
chr8 (1-63)||(378606-378668)
chr8 (46-96)||(9174947-9174997)
chr8 (48-77)||(33639636-33639665)
chr8 (45-157)||(33947656-33947767)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (1-200)||(18339241-18339440)
chr6 (1-204)||(28996865-28997068)
chr6 (1-204)||(29743418-29743621)
chr6 (1-197)||(34948590-34948790)
chr6 (1-204)||(13837956-13838163)
chr6 (1-204)||(33229165-33229368)
chr6 (1-204)||(398752-398959)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (1-204)||(17445448-17445650)
chr1 (1-204)||(35907687-35907890)
chr1 (1-188)||(3829118-3829305)
chr1 (1-204)||(33489841-33490044)
chr1 (1-204)||(41972086-41972288)
chr1 (1-204)||(32981881-32982088)
chr1 (1-204)||(7433580-7433787)
chr1 (1-204)||(42310766-42310973)
chr1 (1-137)||(321273-321409)
chr1 (1-142)||(26144390-26144531)
chr1 (1-67)||(28463233-28463299)
chr1 (103-192)||(28463304-28463390)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (1-204)||(53060-53263)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-204)||(31615-31818)
[»] scaffold0502 (1 HSPs)
scaffold0502 (1-157)||(5365-5521)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-204)||(480282-480489)
[»] scaffold2142 (1 HSPs)
scaffold2142 (1-204)||(657-864)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (1-39)||(17977-18015)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (47-133)||(17493-17579)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43184500 - 43184297
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43184500 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 43184401  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43184400 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 43184301  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  43184300 tgaa 43184297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 26624881 - 26625084
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26624881 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 26624980  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26624981 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctatatgt 26625080  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  26625081 tgaa 26625084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 36658316 - 36658519
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36658316 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 36658415  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36658416 taaaaatacaaaacatatattctagcattataacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgatctacatgt 36658515  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  36658516 tgaa 36658519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37002176 - 37001974
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  37002176 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatctctgaaaaatgacact 37002077  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37002076 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgac-accctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 37001978  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  37001977 tgaa 37001974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 7002860 - 7003063
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7002860 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgatcctgtaatatacataatgtctgaaaaatgaccct 7002959  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7002960 tcaaaatacaaaacatatactatagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatatgtgtagtctaaaaaagtgacctacatgt 7003059  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  7003060 tgaa 7003063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 7048731 - 7048934
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7048731 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgatcctgtaatatacataatgtctgaaaaatgaccct 7048830  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7048831 tcaaaatacaaaacatatactatagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatatgtgtagtctaaaaaagtgacctacatgt 7048930  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  7048931 tgaa 7048934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8867763 - 8867560
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8867763 ttttatttagcacactattgacggattcatcactcttattttaatggattaattgttcaaattgaccctataatataccttatgtctgaaaaatgaccct 8867664  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8867663 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacatgtactctaaaaatgtgacctacatgt 8867564  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  8867563 tgaa 8867560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34389088 - 34388885
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34389088 ttttatttagcacattatcgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattaaccctgtaatataccttatgtctgaaaaacgaccct 34388989  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34388988 taaaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttattgttgatcaccctgtaatatacatgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 34388889  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  34388888 tgaa 34388885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40920035 - 40919832
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  40920035 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacggattaattgttcaaattgactctgtaatatatcttatgtttgaaaaatgaccct 40919936  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40919935 taaaaatacaaaacatatattctagcattataacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 40919836  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  40919835 tgaa 40919832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 33685699 - 33685901
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33685699 ttttatttagcacactattgacgggtttatctcttttattttaacggattaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 33685798  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  33685799 gtaaaatacaaaacatatattctagcattgcaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtctggtctaaaaatgtgacctacaggt 33685898  T
Q  201 tga 203  Q
    |||    
T  33685899 tga 33685901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38638268 - 38638083
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaa-tatacattatgtctgaaaaatgaccc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  38638268 ttttatttagcacactattgacgggttcatctatcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccttgtaaatataccttatgtctgaaaaatggccc 38638169  T
Q  100 ttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38638168 ttaaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtatagtctaaaa 38638083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10868488 - 10868292
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10868488 ttttatttagcacacttttgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattggtcaaattgatcatgtagtatacattatgtctgaaaaatgaccct 10868389  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctaca 197  Q
      ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10868388 gtaaaatacaaaatatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgcgtagtctaaaaatgtgacctaca 10868292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 5555622 - 5555829
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||      
T  5555622 ttttatttagcacactattgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaataaccta 5555721  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5555722 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacttac 5555821  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  5555822 aggttgaa 5555829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8394260 - 8394467
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||| |||||||||||||     
T  8394260 ttttatttagcacactattgacgggtttatctctcttattttaacgggttaattgttcaaatttactctgtaaaatactttatgtttgaaaaatgaccca 8394359  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8394360 ataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatatgtgtagtctaaaaatgtgacctac 8394459  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  8394460 aggttgaa 8394467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14777139 - 14776932
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  14777139 ttttatttagcacactattgacagtttcatcgctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 14777040  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14777039 ataaaatacaaaacatatattctaacattgtaacttgaatttcttcttatttaattttggccaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 14776940  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  14776939 atgttgaa 14776932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3114128 - 3113922
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| | |||      
T  3114128 ttttatttagcacactattgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaa-taaccta 3114030  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3114029 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacttac 3113930  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  3113929 aggttgaa 3113922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 36630951 - 36631158
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||     
T  36630951 ttttagttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaatttaccctgtaatatactttatatttgaaaaatgaccca 36631050  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      |||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||| | ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36631051 ataaaatataaaacatatattccagcattctaacttgaatttcttcttatttaattttgaccatcctataaaatacgtgtagtctagaaatgtgacctac 36631150  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  36631151 aggttgaa 36631158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 35090303 - 35090379
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatata 77  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  35090303 ttttatttagcacactattgacggattcatctctcttattttaacggattaattgttcaaattgaccttgtaatata 35090379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 92
Target Start/End: Original strand, 26787732 - 26787819
Alignment:
Q  5 atttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaa 92  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  26787732 atttaacacactattggcatgttcatctctcttattttgaagcgtcaattgttcaaattgaccatgtaatatacactatgtctgaaaa 26787819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 191
Target Start/End: Original strand, 44832137 - 44832278
Alignment:
Q  47 ggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttc 146  Q
    ||||||||||| ||||| | | | ||| ||| || ||||||||||||||||| |  |||||| |||  | |||||||| | |||||| ||||  ||||||    
T  44832137 ggttaattgtttaaattgatcttgtaaaatatatgatgtctgaaaaatgaccatgtaaaataaaaagtacatattttaactttgtaatttgagattcttc 44832236  T
Q  147 ttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtga 191  Q
    ||||||||   |||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  44832237 ttattttt---taccttttaatatacgtgtggtccaaaaaagtga 44832278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12278892 - 12278689
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12278892 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 12278793  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12278792 taaaaatacataacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 12278693  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  12278692 tgaa 12278689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 31680502 - 31680705
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  31680502 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtctgaaaaatgactct 31680601  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31680602 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccatcctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 31680701  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  31680702 tgaa 31680705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 33430456 - 33430659
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  33430456 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtttgaaaaatgactct 33430555  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33430556 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccatcctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 33430655  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  33430656 tgaa 33430659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 37254776 - 37254979
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37254776 ttttatttagcacattattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattaaccctgtaatataccttatgtctgaaaaacgaccct 37254875  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37254876 taaaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgcgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 37254975  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  37254976 tgaa 37254979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31501748 - 31501547
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31501748 ttttatttagcacactattgatgagttcatctct--tattttaacgggttaattgttcaaattgaccatgtaatatacattatatctgaaaaatgaccct 31501651  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31501650 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 31501551  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  31501550 tgaa 31501547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 28801441 - 28801644
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28801441 ttttatttagctcactattgacaggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatatctgaaaaatgacctt 28801540  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28801541 gtaaaatacaaaacatatattctagtattgtaacttgaatttctttttatttttgaccaccctataatatacgcgtagtctaaaaatgtgacctacaggt 28801640  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  28801641 tgaa 28801644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 36291506 - 36291710
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  36291506 ttttatttaacacactattgacgggttcatctctcttattttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtctgaaaaatgaccca 36291605  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgacta-ccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatg 199  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36291606 ataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccacccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgatctacatg 36291705  T
Q  200 ttgaa 204  Q
    |||||    
T  36291706 ttgaa 36291710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1776408 - 1776201
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  1776408 ttttatttagcacactatcgacaggttcatctttcttattttaacgggttaattgttcaaatttaccctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 1776309  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1776308 ataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 1776209  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  1776208 atgttgaa 1776201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16155132 - 16155339
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  16155132 ttttatttagcacactattgacagattcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccatgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 16155231  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16155232 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 16155331  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  16155332 aagttgaa 16155339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 39434831 - 39435038
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  39434831 ttttatttagcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 39434930  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39434931 ataaaatacaaaacatatattctagcactgtaacttgaatttcttcttatttaattttgatcaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 39435030  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  39435031 atgttgaa 39435038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36293653 - 36293446
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  36293653 ttttatttagcacactatttacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 36293554  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36293553 ataaaatacaaaacatatattctaacattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctaa 36293454  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  36293453 atgttgaa 36293446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17332583 - 17332430
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17332583 ttttatttagcacactattgacggattcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctataatataccttatgtctgaaaaatgaccct 17332484  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttattttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17332483 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttattttt 17332430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 10034062 - 10034269
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||      
T  10034062 ttttatttagcacactattgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaataaccta 10034161  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10034162 ataaaatacaaaacatatattctagaattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 10034261  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  10034262 aggttgaa 10034269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 13818113 - 13818312
Alignment:
Q  2 tttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |       
T  13818113 tttatttagcacactattgacgggctcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaatgatctaa 13818212  T
Q  102 aaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctaca 197  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13818213 taaaatacaaaacatatattctagcattataacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctaca 13818312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16333908 - 16333701
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||      
T  16333908 ttttatttagcacactattgacggattcatgtctcttattttatagggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaataaccta 16333809  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16333808 ataaaatacaaaacatatattatagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 16333709  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  16333708 aggttgaa 16333701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39657538 - 39657331
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||      
T  39657538 ttttatttagcacactattgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaacttgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaataaccta 39657439  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39657438 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgatcaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 39657339  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  39657338 aagttgaa 39657331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 43069012 - 43069216
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||       
T  43069012 ttttatttagcacactattgccggattcatctctcttattttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatatgctttatgtctaaaaaatgactaa 43069111  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgacta-ccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatg 199  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43069112 ataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccacccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacagg 43069211  T
Q  200 ttgaa 204  Q
    |||||    
T  43069212 ttgaa 43069216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26283350 - 26283143
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  26283350 ttttatttggcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 26283251  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26283250 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 26283151  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  26283150 atgttgaa 26283143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 250 - 362
Target Start/End: Original strand, 26620335 - 26620446
Alignment:
Q  250 tgatttggcttctcaattttgaatcaaaagaggaagagtcatgtaaaatctttatgtaactctccatgcagaaatgcattgtttacatctaactggtgga 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26620335 tgatttggcttctcaattttgaatcaaa-gaggaagagtcatgtaaaatctttatgtaactctccatgcagaaatgcattgtttacatctaactggtgga 26620433  T
Q  350 ggtaccaattatt 362  Q
    |||||||||||||    
T  26620434 ggtaccaattatt 26620446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 192096 - 192213
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  192096 ttttatttaacacactattgataggttcatctctcttattttaaagggttaattgtttaaattgaccatgtaatatacactatgtctgaaaaatgaccct 192195  T
Q  101 taaaaatacaaaacatat 118  Q
      ||||||||||||||||    
T  192196 gtaaaatacaaaacatat 192213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38269428 - 38269240
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | | | ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  38269428 ttttatttggcacactattggcaggttcatctctcttattttgaagggttaattgttcaaattgatcatgtgatatacactatgtttgaaagatgaccct 38269329  T
Q  101 -taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtga 191  Q
     |||||  | |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |   |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  38269328 ctaaaataaaaaaacatatattctagcattgtaattcgagtttcttcttatttgt---taccctataatatatgcgtagtataaaaatgtga 38269240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 19986074 - 19986158
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgt 85  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  19986074 ttttatttaacacactattgacaggttcatctcccttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctataatatactttatgt 19986158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23236846 - 23236732
Alignment:
Q  40 tttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaa 139  Q
    ||||| |||||||||||| |||||   ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||    
T  23236846 tttaaagggttaattgtttaaattgttcctgtaatatacactatgtttgaaaaatgaccctgtgaaataaaacacatatattctagccttgtaatttgaa 23236747  T
Q  140 tttcttcttattttt 154  Q
     || |||||||||||    
T  23236746 attattcttattttt 23236732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1051510 - 1051455
Alignment:
Q  103 aaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgact 158  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1051510 aaaataaaaaacacatattttaatattgtaatttgaaattcttcttatttttgact 1051455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30216774 - 30216571
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30216774 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 30216675  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30216674 taaaaatacagaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 30216575  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  30216574 tgaa 30216571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 35546088 - 35546291
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35546088 ttttatttagcacactattgatgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattaaccctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 35546187  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35546188 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtatagtctaaaaatgtgacctacatgt 35546287  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  35546288 tgaa 35546291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6690267 - 6690067
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6690267 ttttatttagcacactattgacgggttcgtctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 6690168  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6690167 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 6690068  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  6690067 t 6690067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3292928 - 3292725
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  3292928 ttttatttagcacactattgacgagttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatataccttatgtctgaaaaatgactct 3292829  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3292828 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccatcctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 3292729  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  3292728 tgaa 3292725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43143616 - 43143413
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43143616 ttttatttagcacacaattgatgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactttgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 43143517  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43143516 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 43143417  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  43143416 tgaa 43143413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42333808 - 42333605
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42333808 ttttatttagcacacaattgataagttcatctctcttattttaacggattaattgttcaaattgactctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 42333709  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42333708 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacatgtagtctaaaaatgtgacctagatgt 42333609  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  42333608 tgaa 42333605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50205109 - 50204906
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50205109 ttttatttagcacactattgacgggttcatcactcttattttaacggattaatggttcaaattgaccatgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 50205010  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50205009 taaaaatacaaaacatatattctagcattgcaacttgattttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgatctacatgt 50204910  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  50204909 tgaa 50204906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 48989463 - 48989666
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48989463 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgatcctgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 48989562  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||    
T  48989563 gtaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttctttttatttttgaccaccctataatatacgtctggtctaaaaatgagacctacaggt 48989662  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  48989663 tgaa 48989666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 44156786 - 44156987
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44156786 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaatggattaattgt-caaattgactctgtaa-ataaattatgtctgaaaaatgaccct 44156883  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  44156884 tgaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccttgtaatatacgtgcagtctaaaaatgtgacctacgtgt 44156983  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  44156984 tgaa 44156987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 48130113 - 48130316
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48130113 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccatataatatacattatgtctgaaaaatgaccct 48130212  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  48130213 gtaaaatacaaaacatatattctaacattgtaacatggatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgcgtagtcttaaaatgtgacctacaagt 48130312  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  48130313 tgaa 48130316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 30110110 - 30110313
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  30110110 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttgttttaacgggttaagtgttcaaattgaccctgtaatatacattatctctgaaaaatgacttt 30110209  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  30110210 gtaaaagacaaaacatatattctagcattgtgacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgcgtagtctaaaaatgtgacctacaagt 30110309  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  30110310 tgaa 30110313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10352916 - 10352713
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||| | || | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  10352916 ttttatttagcacaccagtgtcggattcatctctcttattttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtctgaaaaatgaccca 10352817  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10352816 ataaaatataaaacatatattctagcatagtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacaagt 10352717  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  10352716 tgaa 10352713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 6235655 - 6235862
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  6235655 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 6235754  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttattt----ttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6235755 ataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgatcatcctataatatacgtgtggtctaaaaatgtgacctac 6235854  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  6235855 atgttgaa 6235862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36382378 - 36382171
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||     
T  36382378 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttatcttaacgggttaattgttcaaatttaccctctaatatactctatgtttgaaaaatgaccca 36382279  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36382278 ataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatatgtgtagtctaaaaatgtgacctac 36382179  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  36382178 aagttgaa 36382171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 26448187 - 26448390
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26448187 ttttatttagcacactattggcggatttatctcttttattttaacgggttaattgttcaaattgaaaatgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccat 26448286  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26448287 gtaaaatacaaaacatatattctagcattgtaagttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtctagtctaaaagtgtgacctacatgt 26448386  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  26448387 tgaa 26448390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20129445 - 20129652
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  20129445 ttttatttggcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 20129544  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20129545 ataaaatacaaaacatatattctaacattgtaacttgaatttcttcttatttacttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 20129644  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  20129645 atgttgaa 20129652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30077663 - 30077463
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||| |     
T  30077663 ttttatttagcacactagtgccggattcatctctcttattttaacagattaattgttcaaattgaccatgtaatatactttatgtctgaaaaatgactca 30077564  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30077563 ataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtcaaaaaatgtgacctacatgt 30077464  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  30077463 t 30077463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13395178 - 13395048
Alignment:
Q  74 tatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacg 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13395178 tatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacg 13395079  T
Q  174 tgtagtctaaaaatgtgacctacatgttgaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13395078 tgtagtctaaaaatgtgacctacatattgaa 13395048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25930843 - 25931050
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||| |     
T  25930843 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacggattaattgttcaaattgactctgtaatatactttatgtttgaaaaatgactca 25930942  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25930943 ataaagtacaaaacatacattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacatac 25931042  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  25931043 atgttgaa 25931050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29319737 - 29319542
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||      
T  29319737 ttttatttagcacactattgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaataaccta 29319638  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgac 192  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29319637 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgac 29319542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 40529150 - 40529350
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||     
T  40529150 ttttatttagcacactattgacgggttcatatctcttattttaacggattaattgttcaaattgacactgtaatatactttatgtttgaaaaatgatcca 40529249  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40529250 ataaaatacaaaacatacattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 40529349  T
Q  197 a 197  Q
    |    
T  40529350 a 40529350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17511265 - 17511058
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||      
T  17511265 ttttatttagcacattattgatcggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccaa 17511166  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17511165 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgatcaccctataatatacatatagtctaaaaatgtgacctac 17511066  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  17511065 aggttgaa 17511058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34407316 - 34407109
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  34407316 ttttatttgacacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 34407217  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  34407216 ataaaatacaaaatatatattctaacattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 34407117  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  34407116 atgttgaa 34407109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 1817852 - 1818055
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||     
T  1817852 ttttatttaacacactattgtcggattcatctctcttattttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatttactttatgtctgaaaaatgatcca 1817951  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1817952 ataaaatatgaaatatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttggccaccctataatatacatgtagtctaaaaatgtgacctacaggt 1818051  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  1818052 tgaa 1818055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29996015 - 29995813
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||     
T  29996015 ttttattaagcacactattgacggattcatctctattattttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaa-tgaccca 29995917  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29995916 ataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttaaatttcctcttatttttgaccaccctataatatatgtgtagtctaaaaatgtgacctacaggt 29995817  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  29995816 tgaa 29995813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 13012323 - 13012530
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  13012323 ttttatttggcacactattgacagtttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 13012422  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13012423 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaattttttcttatttaattttgaacaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 13012522  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  13012523 atgttgaa 13012530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 43356039 - 43356246
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  43356039 ttttatttgacacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 43356138  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  43356139 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 43356238  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  43356239 atgttgaa 43356246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26439311 - 26439104
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  26439311 ttttatttgacacactattgacagtttcatctctctaattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 26439212  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26439211 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 26439112  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  26439111 atgttgaa 26439104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 47500908 - 47501115
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  47500908 ttttatttggcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 47501007  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  47501008 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaattttttcttatttaattttgatcaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 47501107  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  47501108 atgttgaa 47501115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33136400 - 33136276
Alignment:
Q  80 ttatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagt 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33136400 ttatgtctgaaaattgacccttaaaaatacaaaacatatattttagtattctaacttgaattttttcttatttttgaccaccctgtgatatacgtgtagt 33136301  T
Q  180 ctaaaaatgtgacctacatgttgaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33136300 ctaaaaatgtgacctacatgttgaa 33136276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28877282 - 28877178
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28877282 ttttatttagcacactattgatgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 28877183  T
Q  101 taaaa 105  Q
    |||||    
T  28877182 taaaa 28877178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13392913 - 13392832
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacatta 82  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  13392913 ttttatttagcacactattgaatgattcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgatcctgtaatatacatta 13392832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13396052 - 13395971
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacatta 82  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  13396052 ttttatttagcacactattgaatgattcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgatcctgtaatatacatta 13395971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 9071331 - 9071283
Alignment:
Q  46 gggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||    
T  9071331 gggttaattgttcaaattaaccctgtaatatacgtaaagtctgaaaaat 9071283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18990801 - 18990655
Alignment:
Q  46 gggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaataca---aaacatatattttagcattgtaacttgaattt 142  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||| |   ||||||||||| |||| |||||| ||    ||    
T  18990801 gggttaattatttaaattaaccttgtaatatatactatgtttgaaaaatgaccctgtaaaataaaaagaaacatatattctagccttgtaatttcggatt 18990702  T
Q  143 cttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgac 192  Q
     |||||||||||   |||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  18990701 attcttattttt---taccctctaatgtacatgtagtccaaaaaagtgac 18990655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28877178 - 28877146
Alignment:
Q  169 atacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28877178 atacgtgtagtctaaaaatgcgacctacatgtt 28877146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 33041088 - 33041291
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33041088 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctataatataccttatgtctgaaaaatgaccct 33041187  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33041188 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 33041287  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  33041288 tgaa 33041291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 45183116 - 45183319
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  45183116 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtctaaaaaatgaccct 45183215  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45183216 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccgtgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 45183315  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  45183316 tgaa 45183319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6930926 - 6930723
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6930926 ttttatttagcacactattgacgagttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 6930827  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6930826 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacttacatgt 6930727  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  6930726 tgaa 6930723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 5135423 - 5135626
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5135423 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattattcaaattgaccatgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 5135522  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5135523 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgcgtagtctaaaaatgtgacgtacatgt 5135622  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  5135623 tgaa 5135626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11018244 - 11018039
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11018244 ttttatttagcacacaattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatatactttatgtctgaaaaatgaccct 11018145  T
Q  101 taaaaatacaaaacat--atattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacat 198  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11018144 taaaaatacaaaacatatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttaaccaccctgtaatatacatgtagtctaaaaatgtgacctacat 11018045  T
Q  199 gttgaa 204  Q
    ||||||    
T  11018044 gttgaa 11018039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6503601 - 6503398
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6503601 ttttatttagcacacaattgatgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactatgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccgt 6503502  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6503501 taaaaatacaaaacatatatactagcattgtaacttgaatttcttcatatttttgaccaccctgtaatatacgtgtattctaaaaatgtgacctacatgt 6503402  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  6503401 tgaa 6503398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 35514397 - 35514600
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  35514397 ttttattttgcacactattgacgggttcatctctcttattttaacggattaattgttcaaattgaccttgtaatatagattatgtctgaaaaatgatcct 35514496  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35514497 ggaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccttataatatacgtgtagtttaaaaatgtgacctacatgt 35514596  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  35514597 tgaa 35514600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19565533 - 19565330
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |     
T  19565533 ttttatttagcacactagtaccggattcatctctcttattttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtctgaaaaatgactca 19565434  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19565433 ataaaatataaaacatatattatagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 19565334  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  19565333 tgaa 19565330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 27935313 - 27935516
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  27935313 ttttatttagcatactattgacgggttcatctctcttattctaacgggttaatttttcaaattgaccctgtaatataaattatgtctgaaaaaagacctt 27935412  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  27935413 gtaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtctggtctaaaaatgtgacctacaggt 27935512  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  27935513 tgaa 27935516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19390281 - 19390488
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  19390281 ttttatttagcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 19390380  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19390381 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccttataatatacgtgtagtctaaaaatgcgacctac 19390480  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  19390481 atgttgaa 19390488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40081773 - 40081566
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  40081773 ttttttttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 40081674  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40081673 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctatagtatacttgtagtctaaaaatgtgacctac 40081574  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  40081573 atgttgaa 40081566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 45336009 - 45336212
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |     
T  45336009 ttttatttagcacactagtgccggattcatctctcttattttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtctgaaaaatgactca 45336108  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  45336109 ataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgatctacaggt 45336208  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  45336209 tgaa 45336212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22968476 - 22968269
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  22968476 ttttatttagcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 22968377  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22968376 ataaaatacaaaacatatattctaacattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 22968277  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  22968276 atgttgaa 22968269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6269458 - 6269251
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  6269458 ttttatttagcacactattgacagtttcatctatcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 6269359  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  6269358 ataaaatacaaaacatatattctaacattgcaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 6269259  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  6269258 atgttgaa 6269251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34084154 - 34083945
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttatttt--aatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacc 98  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34084154 ttttatttagcacactattgatgggttcatctctcttattttttaacaggttaattgttcaaatttacccggtaatatactttatgtttgaaaaatgacc 34084055  T
Q  99 cttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacct 194  Q
    |   |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34084054 caataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacct 34083955  T
Q  195 acatgttgaa 204  Q
    ||| ||||||    
T  34083954 acaagttgaa 34083945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 39771925 - 39772132
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  39771925 ttttatttgacacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 39772024  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39772025 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 39772124  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  39772125 atgttgaa 39772132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 22922230 - 22922349
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||     
T  22922230 ttttatttaacacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaatttaccctgtaatatactctatgtttgaaaaatgaccca 22922329  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatat 120  Q
      |||||| |||||||||||    
T  22922330 ataaaatataaaacatatat 22922349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 38282545 - 38282738
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  38282545 ttttatttagcacactattatgaggttcatctctcttattctgaagggttaattgttcaaattgaccatgtaatatacactatgtctgaaaaattatcct 38282644  T
Q  101 -taaaaatacaaaacatatattttagcatt----gtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgac 192  Q
     ||| |  | |||||||||||||| | |||    |||| | || ||||||||||||||||   || || ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38282645 gtaagataaaaaaacatatattttggtattttacgtaattcgagtttcttcttatttttg---acactataatatacgcgtagtataaaaatgtgac 38282738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Original strand, 8257012 - 8257102
Alignment:
Q  48 gttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttga 138  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||  |  |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  8257012 gttaattgttcaaattaaccttgtaatatacactatgtttgaaaaatgacaatgtaaaataaaaaacatatattctagccttgtaatttga 8257102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29565105 - 29564989
Alignment:
Q  76 tacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtg 175  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||   |||||| ||||||| | |    
T  29565105 tacactatgtttgaaaaatgaccttgtaaaataaaaaacatatattatagccttgtaatttgatattcttcttattttt---taccctataatataagcg 29565009  T
Q  176 tagtctaaaaatgtgaccta 195  Q
    ||||| ||||| || |||||    
T  29565008 tagtcgaaaaaagtaaccta 29564989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 219593 - 219481
Alignment:
Q  46 gggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttctt 145  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||| |||| | ||||||||||||||||  |  |||||| |||| | |||||||| | ||| || ||||| |||||    
T  219593 gggttaattgtttaaattgactctgtaaaatacgtgatgtctgaaaaatgacattgtaaaataaaaaatagatattttaaccttgcaatttgaaattctt 219494  T
Q  146 cttatttttgact 158  Q
    |||||||||||||    
T  219493 cttatttttgact 219481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38415789 - 38415650
Alignment:
Q  47 ggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaat--acaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttct 144  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||  | |||||| |||||||| |  ||||| ||||  ||||    
T  38415789 ggttagttgttcaaattgacgctgtaatatacatgatgtctgaaaaatgacattgtaaaataaaaaaaacacatattttaaccctgtaatttgagattct 38415690  T
Q  145 tcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaa 186  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  38415689 tcttattttt--ttaccctataatatacgcgtagtccaaaaa 38415650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 154
Target Start/End: Original strand, 35937431 - 35937539
Alignment:
Q  46 gggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttctt 145  Q
    |||||||| ||| ||||| ||| | ||| |||| | ||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||   |||||| ||||  |||||    
T  35937431 gggttaatcgttaaaattgaccttgtaaaatacgtgatgtctgaaaaatgatcctgtaaaataaaaaatatatattttaatcttgtaatttgatattctt 35937530  T
Q  146 cttattttt 154  Q
    |||||||||    
T  35937531 cttattttt 35937539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 80
Target Start/End: Original strand, 5188888 - 5188921
Alignment:
Q  47 ggttaattgttcaaattaaccctctaatatacat 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5188888 ggttaattgttcaaattaaccctgtaatatacat 5188921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12756869 - 12756666
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12756869 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 12756770  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12756769 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttaaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 12756670  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  12756669 tgaa 12756666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 45418718 - 45418921
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45418718 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgatcctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 45418817  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45418818 ttaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 45418917  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  45418918 tgaa 45418921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8059365 - 8059162
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8059365 ttttatttagcacacaattgacgggttcatttctcttattttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatgtctgaaaattgaccct 8059266  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8059265 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 8059166  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  8059165 tgaa 8059162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8147487 - 8147690
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8147487 ttttatttaacacactattgacgggttcatctatcttattttgacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 8147586  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8147587 taaaaatacaaaacatatattctagcattataacttgaatttcttcttatttttgaccatcctgtgatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 8147686  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  8147687 tgaa 8147690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44084635 - 44084432
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44084635 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacggattaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatttctgaaaaatgaccct 44084536  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  44084535 gtaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccatcctataatatacgtctggtctaaaaatgtgacctacaggt 44084436  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  44084435 tgaa 44084432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4555224 - 4555024
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4555224 ttttatttaccacactattgacgagttcatctctcttattttaacgagttaattgttcaaattgaccatgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 4555125  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4555124 gtaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgcgtagtataaaaatgtgacctacatgt 4555025  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  4555024 t 4555024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 771135 - 771337
Alignment:
Q  2 tttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccctt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  771135 tttatttagcacattattgacgggttcatctatcttatcttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccctg 771234  T
Q  102 aaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgtt 201  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  771235 taaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccttataatatacgtgtagtctaaaaatgtgtcttacaggtt 771334  T
Q  202 gaa 204  Q
    |||    
T  771335 gaa 771337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17445073 - 17444866
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  17445073 ttttatttagcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 17444974  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444973 ataaaatacaaaacatatattctaccattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 17444874  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  17444873 atgttgaa 17444866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 26238080 - 26238274
Alignment:
Q  3 ttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccctta 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26238080 ttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgagttatttgttcaaattgactctataatatacattatgtctgaaaaatgaccctgt 26238179  T
Q  103 aaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctaca 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26238180 aaaatacaaaacatatattctagcattgtaaattgaatttcttcttatttttgaccacctcataatatacgcgtagtctaaaaatgtgacctaca 26238274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7072562 - 7072360
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7072562 ttttatttagtacac-attgacgggttcatctctcttattttaactggttaattgttcaaattgaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgactct 7072464  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7072463 gtaaaatataaaacatatattctagaattgtaacttgaatttattcttatttttgatcatcctataatatacgcgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 7072364  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  7072363 tgaa 7072360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41251666 - 41251459
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  41251666 ttttatttagcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 41251567  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  41251566 ataaaatacaaaacatatattctaacattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 41251467  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  41251466 atgttgaa 41251459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26162732 - 26162531
Alignment:
Q  3 ttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccctta 102  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  26162732 ttatttagcacattattgacgggttcatctctcttattttaacagtttaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatgtctgaaaaatgacactgt 26162633  T
Q  103 aaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgttg 202  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  26162632 agaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgatcacccaataatatacgtctggtctaaaaatgagacctacatgttg 26162533  T
Q  203 aa 204  Q
    ||    
T  26162532 aa 26162531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31581654 - 31581446
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  31581654 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 31581555  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaa-tttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgaccta 195  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31581554 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttttttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctagaaatgtgaccta 31581455  T
Q  196 catgttgaa 204  Q
    |||||||||    
T  31581454 catgttgaa 31581446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32127173 - 32126966
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||      
T  32127173 ttttatttagcacactattgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaacttgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaataaccta 32127074  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32127073 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttctttttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 32126974  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  32126973 aggttgaa 32126966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 35962850 - 35963057
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||      
T  35962850 ttttatttagcacactattgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaataaccta 35962949  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35962950 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccatcctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacttac 35963049  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  35963050 aggttgaa 35963057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6403836 - 6403629
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  6403836 ttttatttggcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 6403737  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  6403736 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 6403637  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  6403636 atgttgaa 6403629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18981751 - 18981956
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||      
T  18981751 ttttatttagcacactgttgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaataaccta 18981850  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttattt--ttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacat 198  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  18981851 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaactttaatttcttcttatttaattgaccaccctaaaatatatgtgtagtctaaaaatgtgacctacag 18981950  T
Q  199 gttgaa 204  Q
    ||||||    
T  18981951 gttgaa 18981956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 45121370 - 45121573
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| |||   ||||||||| || ||||||||||||||  |    
T  45121370 ttttatttagaacactattggcaggttcatgtctcttattttaaaggattaattattcaaattgaccaggtaatatacactacgtctgaaaaatgacatt 45121469  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||    
T  45121470 gtaaaatacaaaacatatattctagcaatgtaacttgagcttcttcttatttttgaccaccctataatatatgcgtagtctaaaaatgtgacttacaagt 45121569  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  45121570 tgaa 45121573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2958130 - 2957970
Alignment:
Q  48 gttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttct 147  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||| |||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2958130 gttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatatttgaaaaataacctaataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttct 2958031  T
Q  148 tat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgttgaa 204  Q
    |||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2958030 tatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgatctacaggttgaa 2957970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 204
Target Start/End: Original strand, 42442188 - 42442327
Alignment:
Q  69 tctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctg 164  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||| |||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||     
T  42442188 tctagtatactttatgtttgaaaaataacctaataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccacccta 42442287  T
Q  165 taatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgttgaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42442288 taatatacgtgtagtctaaaaatgtgatctacatgttgaa 42442327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16405735 - 16405828
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  16405735 ttttatttagcacactattgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaat 16405828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 2285997 - 2286095
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2285997 ttttatttagcacactattgacgtgttcatttctcttattttaacgggttaattgttcaaatttaccctgtaatatactctatgtttgaaaaatgaccc 2286095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 42440121 - 42440194
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaat 74  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42440121 ttttatttagcacactattgacggattcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaat 42440194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 204
Target Start/End: Original strand, 2286096 - 2286134
Alignment:
Q  166 aatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgttgaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2286096 aatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacaagttgaa 2286134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23402243 - 23402446
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23402243 ttttatttaacacactattgactggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 23402342  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402343 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccatcctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 23402442  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  23402443 tgaa 23402446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 4404143 - 4404346
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4404143 ttttatttagcacacaattgatgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 4404242  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4404243 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtgacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 4404342  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  4404343 tgaa 4404346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 9877355 - 9877558
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877355 ttttatttagcacactattgtcaaattcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 9877454  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9877455 taaaaatacaaagcatatattatagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaacgtgacctacatgt 9877554  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  9877555 tgaa 9877558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16788057 - 16787854
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16788057 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttatttgaacgggttaattgtttaaattgactctgtcatataccttatgtctgaaaaatgaccct 16787958  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16787957 taaaaatacaaaacatatattatagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 16787858  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  16787857 tgaa 16787854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34136857 - 34136654
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34136857 ttttatttagcacacaattgatgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactccgtaatataccttatgtctgaaaaatgaccct 34136758  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34136757 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtagcttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 34136658  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  34136657 tgaa 34136654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2729228 - 2729025
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2729228 ttttatttagcacactattgatggattcatctctcttattttaacgagttaattgctcatattgaccctgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 2729129  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||    
T  2729128 gtaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtctggtctaaaaatgagacctacaggt 2729029  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  2729028 tgaa 2729025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 42231072 - 42231274
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42231072 ttttatttagcacactattgacggattcatctcttttattttaacggattaattgttcaaattgaccatgtaatatacattatgtctgaaaaatgacact 42231171  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||    
T  42231172 gtaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtctggtataaaaatgtgacctacaagt 42231271  T
Q  201 tga 203  Q
    |||    
T  42231272 tga 42231274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3648826 - 3648627
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||     
T  3648826 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctattattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaagtgaccca 3648727  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3648726 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccatcctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 3648627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15838420 - 15838626
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||     
T  15838420 ttttatttagcacactattgacgggttcatatatcttattttaacgggttaattgtttaaatttatcctgtaatatactctatgtttgaaaaatgaccca 15838519  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15838520 ataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgac-accctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 15838618  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  15838619 aggttgaa 15838626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 36408686 - 36408878
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  36408686 ttttatttaacacactattgccggattcatctctcttattttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtctgaaaaatgaccca 36408785  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      |||||| ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36408786 ataaaatataaaacata-----------tgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacaggt 36408874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40470507 - 40470366
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40470507 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggataattgttcaaattgaccttgtaatatacattatgtctgaaaaatgacgct 40470408  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaattt 142  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40470407 gtaaaatacaaaacatatattatagcattgtaacttgaattt 40470366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 39914649 - 39914856
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  39914649 ttttatttggcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgagttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 39914748  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||    ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  39914749 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaattttttcttatttaattttgatcaccctataatatacgcgtagtctaaacatgtgacctaa 39914848  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  39914849 atgttgaa 39914856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 29728418 - 29728271
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||      
T  29728418 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgctcaaattgaccatgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccta 29728319  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttctt 148  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29728318 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttctt 29728271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 3435445 - 3435603
Alignment:
Q  46 gggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttctt 145  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3435445 gggttaatttttcaaattgaccctataatatacattatgtttgaaaaatgaccatgtaaaatacaaaacacatattctagcattgtaacttgaatttctt 3435544  T
Q  146 cttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgttgaa 204  Q
    |||||||| ||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3435545 cttattttggagcaccctataatatacgcatagtctaaaaatgtgaccaacaggttgaa 3435603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32540438 - 32540327
Alignment:
Q  46 gggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttctt 145  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||    
T  32540438 gggttaattgtacaaattgaccctctaatatacacattgtttgaaaaatgatcctgtaaaataaaaaacatatattttagccttgtaatttgatattatt 32540339  T
Q  146 cttatttttgac 157  Q
    ||||||||||||    
T  32540338 cttatttttgac 32540327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29728255 - 29728182
Alignment:
Q  132 aacttgaatttcttctt-atttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgttgaa 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29728255 aacttgaatttcttctttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacaggttgaa 29728182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 378683 - 378762
Alignment:
Q  110 aaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgac 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  378683 aaaacatatattctagcattgtaattcgagtttcttcttatttttg---accctataatatacgcgtagtataaaaatgtgac 378762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 378606 - 378668
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaatt 63  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  378606 ttttatttagcacattattagcaggttcatttatcttattttgaacggttaattgttcaaatt 378668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 96
Target Start/End: Original strand, 9174947 - 9174997
Alignment:
Q  46 gggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatga 96  Q
    |||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9174947 gggttaattgttcaaatttatcttgtaatatacattatgtttgaaaaatga 9174997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 33639665 - 33639636
Alignment:
Q  48 gttaattgttcaaattaaccctctaatata 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33639665 gttaattgttcaaattaaccctctaatata 33639636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33947767 - 33947656
Alignment:
Q  45 tgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct-taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttc 143  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||||| | | ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||    
T  33947767 tgggttaattattcaaattgacaatgtaatatacgtaaagtctgaaaa-tgaccatgtaaaaata-aaaacatatattttaaccctgtaatttgaaattc 33947670  T
Q  144 ttcttatttttgac 157  Q
     |||||||||||||    
T  33947669 atcttatttttgac 33947656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 18339241 - 18339440
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18339241 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtttgaaaaatgaccct 18339340  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18339341 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacttacatgt 18339440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 28996865 - 28997068
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  28996865 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctgtaatataccttatgtctgaaaaatgactct 28996964  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28996965 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccatcctgtaatatacgtgtattctaaaaatgtgacctacatgt 28997064  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  28997065 tgaa 28997068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 29743418 - 29743621
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29743418 ttttatttagcacactagtgccggattcatctctcttattttaacaggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtctgaaaaatgaccca 29743517  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29743518 ataaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttattttttaccaccctataatatatgtgtagtctaaaaatgtgacctacaggt 29743617  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  29743618 tgaa 29743621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34948790 - 34948590
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||      
T  34948790 ttttatttagcacactattgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaataaccta 34948691  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34948690 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacttac 34948591  T
Q  197 a 197  Q
    |    
T  34948590 a 34948590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 13837956 - 13838163
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||      
T  13837956 ttttatttagcacactattgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaacttgaccctgtaatatactttatgtttgaaaaataaccta 13838055  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttt----tgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13838056 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaaatctgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatatgacctac 13838155  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  13838156 aagttgaa 13838163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33229368 - 33229165
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||      
T  33229368 ttttatttagcacactattgccggattcatctctcttattttaacaggttaattgttcaaattgaccttgtaatatgctttatgtctgaaaaatgaccaa 33229269  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  33229268 acaaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaacaccttataatatatgtgtagtctaaaaatgtgaactataggt 33229169  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  33229168 tgaa 33229165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 398752 - 398959
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  398752 ttttatttggcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 398851  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  398852 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaattttttcttatttaattttgatcaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 398951  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  398952 atgttgaa 398959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17445448 - 17445650
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17445448 ttttatttagcacattattgacgggttcatctttcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatgtctgaaaa-tgaccct 17445546  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17445547 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttaaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatttgacctacatgt 17445646  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  17445647 tgaa 17445650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 35907687 - 35907890
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  35907687 ttttatttagcacattattgacgagttcatctctcttattttaacgggttaactgttcaaattaaccctgtaatataccttatgtttgaaaaacgaccct 35907786  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35907787 taaaaatataaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 35907886  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  35907887 tgaa 35907890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 3829118 - 3829305
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3829118 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 3829217  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatg 188  Q
      ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  3829218 gtaaaatacaaaacatatattctaactttgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtctggtctaaaaatg 3829305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 33489841 - 33490044
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33489841 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggctaattgttcaaattgaccttgcaatatacaatatgtctgaaaaatgacact 33489940  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33489941 gtaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccatcctataatatacgcatagtctaaaaatgtgacctacatgt 33490040  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  33490041 tgaa 33490044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41972288 - 41972086
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41972288 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacggattaattgttcaaattgaccgtgtaatatacattttgtctgaaaaatgaacct 41972189  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  41972188 gtaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgacca-cctataatataggcgtagtctaaaaatgtgacctacaggt 41972090  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  41972089 tgaa 41972086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32982088 - 32981881
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||     
T  32982088 ttttatttagcactctattgacagattcatctctcttattttaaagggttaattgttcaaattgaccctgtaaaatactttatgtttgaaaaatgaccca 32981989  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32981988 ataaaatacaaaacatatattctaacattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacatgtagtctaaaaatgtgacctac 32981889  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  32981888 atgttgaa 32981881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 7433580 - 7433787
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||      
T  7433580 ttttatttagcacactattgacgggttcatgtctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctggaatgtactttatgtttgaaaaataaccta 7433679  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  7433680 ataaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttaattttgaccaccctataatatacatgtagtctaaaaatgtgacttac 7433779  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    | ||||||    
T  7433780 aggttgaa 7433787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42310973 - 42310766
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  42310973 ttttatttagtacgctattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccttgtaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 42310874  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      |||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42310873 ataaaataaaaaatatatattctagcattgcaacttgaatttcttcttatttaattttgaccactctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgccctac 42310774  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  42310773 atgttgaa 42310766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 321409 - 321273
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  321409 ttttatttaacacattattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatatacattatgtctaaaaaatgactct 321310  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttg 137  Q
      ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  321309 gtaaaatacaaaacatatattctaccattgtaacttg 321273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 26144390 - 26144531
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  26144390 ttttatttggcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 26144489  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaattt 142  Q
      ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||    
T  26144490 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaattt 26144531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 28463233 - 28463299
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaacc 67  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  28463233 ttttatttagcacactattggtgggttcatctctcttattttgaatggttaattgttcaaattaacc 28463299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Original strand, 28463304 - 28463390
Alignment:
Q  103 aaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgac 192  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||| | || ||||||||||||||||   ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28463304 aaaataaaaaacatatatactaacattgtaattcgagtttcttcttatttttg---accgtataatatacgcgtagtataaaaatgtgac 28463390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 53060 - 53263
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  53060 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacggattaattgttcaaattgactctgtaatatatcttatgtttgaaaaatgaccct 53159  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53160 taaaaatacaaaacatatattctagcattataacttgaatttcttcttatttttgaccaccctataatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 53259  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  53260 tgaa 53263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 31615 - 31818
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  31615 ttttattttgcacactattgacaggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccttgtaatattgattatgtctgaaaaacgacact 31714  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctacatgt 200  Q
      ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  31715 gtaaaatacaaaacatatattctaacattgtaacttgaatttcttcttatttttgaccaccttataatatacgggtagtctaaaaatgtgacctacaggt 31814  T
Q  201 tgaa 204  Q
    ||||    
T  31815 tgaa 31818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0502 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0502
Description:

Target: scaffold0502; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 5365 - 5521
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5365 ttttatttagcacactattgacgggttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgaccctgtaatataccttatgtttgaaaaatgaccct 5464  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgac 157  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5465 taaaaatacaaaacatatattctagcattgtaacttgaatttcttcttatttttgac 5521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 480489 - 480282
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||     
T  480489 ttttatttggcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgaccca 480390  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  480389 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaattttttcttatttaattttgatcaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 480290  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  480289 atgttgaa 480282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2142 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold2142
Description:

Target: scaffold2142; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 657 - 864
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttattttaatgggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgaccct 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||     
T  657 ttttatttggcacactattgacagtttcatctctcttattttaacgggttaattgttcaaattgactctttaatatactttatgtttgaaaaatgatcca 756  T
Q  101 taaaaatacaaaacatatattttagcattgtaacttgaatttcttcttat----ttttgactaccctgtaatatacgtgtagtctaaaaatgtgacctac 196  Q
      ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  757 ataaaatacaaaatatatactctaacattgtaacttgaattttttcttatttaattttgatcaccctataatatacgtgtagtctaaacatgtgacctaa 856  T
Q  197 atgttgaa 204  Q
    ||||||||    
T  857 atgttgaa 864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 17977 - 18015
Alignment:
Q  1 ttttatttagcacactattgacaggttcatctctcttat 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17977 ttttatttagcacactattgacagtttcatctctcttat 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 133
Target Start/End: Original strand, 17493 - 17579
Alignment:
Q  47 ggttaattgttcaaattaaccctctaatatacattatgtctgaaaaatgacccttaaaaatacaaaacatatattttagcattgtaa 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||  | ||| | | |||||||||||| |||| ||||||    
T  17493 ggttaatttttcaaattgaccctataatatacactatgtttaaaaaatgactataaaataaaaaaaacatatattatagccttgtaa 17579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University