View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4189_low_16 (Length: 242)

Name: NF4189_low_16
Description: NF4189
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4189_low_16
NF4189_low_16
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (6-242)||(16097331-16097567)
chr3 (6-242)||(16103783-16104018)
chr3 (6-234)||(12174152-12174377)
chr3 (6-242)||(15470927-15471162)
chr3 (10-242)||(32307684-32307906)
chr3 (7-242)||(13210211-13210444)
chr3 (6-242)||(9512923-9513146)
chr3 (6-242)||(9520898-9521121)
chr3 (6-242)||(49667967-49668194)
chr3 (7-181)||(14234491-14234665)
chr3 (10-242)||(1644566-1644787)
chr3 (115-242)||(49389512-49389639)
chr3 (22-240)||(37251051-37251270)
chr3 (22-185)||(52523665-52523831)
chr3 (7-184)||(27165251-27165429)
chr3 (21-189)||(24340657-24340826)
chr3 (7-181)||(53301492-53301668)
chr3 (21-189)||(23274705-23274874)
chr3 (22-240)||(22110235-22110454)
chr3 (21-189)||(37642199-37642368)
chr3 (168-242)||(12934194-12934268)
chr3 (7-122)||(18438538-18438653)
chr3 (7-129)||(12399213-12399335)
chr3 (10-129)||(14572596-14572714)
chr3 (7-184)||(14972858-14973036)
chr3 (7-129)||(17487860-17487982)
chr3 (7-129)||(17499342-17499464)
chr3 (7-129)||(36166599-36166719)
chr3 (21-129)||(42386428-42386536)
chr3 (17-129)||(21618460-21618570)
chr3 (7-129)||(13442278-13442400)
chr3 (6-129)||(14576828-14576950)
chr3 (7-184)||(17463179-17463355)
chr3 (7-184)||(34159327-34159503)
chr3 (7-184)||(45606892-45607068)
chr3 (7-184)||(55476492-55476668)
chr3 (7-101)||(11424783-11424876)
chr3 (8-184)||(16282796-16282971)
chr3 (7-129)||(24153204-24153325)
chr3 (22-190)||(43550457-43550625)
chr3 (22-157)||(43925977-43926114)
chr3 (7-190)||(8899095-8899277)
chr3 (33-181)||(22147467-22147616)
chr3 (17-184)||(38961876-38962042)
chr3 (65-185)||(2051137-2051260)
chr3 (7-122)||(20698437-20698552)
chr3 (7-184)||(6469119-6469295)
chr3 (7-184)||(7781332-7781508)
chr3 (7-184)||(9707592-9707768)
chr3 (7-184)||(16454266-16454442)
chr3 (7-129)||(23083356-23083478)
chr3 (7-184)||(28848596-28848772)
chr3 (7-164)||(29172587-29172744)
chr3 (17-184)||(12567571-12567737)
chr3 (17-184)||(13544036-13544202)
chr3 (7-72)||(28194694-28194759)
chr3 (7-184)||(13151775-13151952)
chr3 (7-184)||(13154240-13154417)
chr3 (7-184)||(10247708-10247884)
chr3 (7-125)||(25476384-25476502)
chr3 (7-129)||(26686891-26687013)
chr3 (7-125)||(40213720-40213837)
chr3 (15-129)||(43840944-43841058)
chr3 (7-120)||(55500943-55501055)
chr3 (22-189)||(53070633-53070799)
chr3 (7-125)||(15977516-15977633)
chr3 (7-184)||(17446640-17446815)
chr3 (7-125)||(17672627-17672744)
chr3 (161-240)||(43927291-43927370)
chr3 (17-190)||(50242833-50243005)
chr3 (79-189)||(19775998-19776107)
chr3 (79-189)||(37439403-37439512)
chr3 (104-189)||(23413186-23413271)
chr3 (8-184)||(41123892-41124064)
chr3 (10-125)||(606324-606441)
chr3 (115-181)||(1465354-1465419)
chr3 (79-189)||(4107164-4107273)
chr3 (79-189)||(4111016-4111125)
chr3 (79-189)||(8489232-8489341)
chr3 (79-189)||(15965202-15965311)
chr3 (79-189)||(15969126-15969235)
chr3 (79-189)||(15973050-15973159)
chr3 (79-189)||(16749761-16749870)
chr3 (7-65)||(17737237-17737294)
chr3 (7-184)||(8499519-8499697)
chr3 (7-125)||(12119768-12119886)
chr3 (7-125)||(15412430-15412548)
chr3 (7-54)||(10556986-10557033)
chr3 (79-154)||(16750390-16750464)
chr3 (7-54)||(45577952-45577999)
chr3 (79-189)||(12852300-12852413)
chr3 (79-174)||(45797242-45797337)
chr3 (79-154)||(16749994-16750068)
chr3 (7-54)||(44494810-44494857)
chr3 (24-68)||(13919350-13919393)
chr3 (79-174)||(14501198-14501293)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (6-242)||(10423-10659)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (6-242)||(129908-130144)
scaffold0010 (22-189)||(60649-60818)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (6-242)||(21565545-21565781)
chr5 (7-242)||(19668902-19669136)
chr5 (6-238)||(22959421-22959650)
chr5 (7-240)||(21329381-21329614)
chr5 (7-238)||(21502041-21502273)
chr5 (7-242)||(19660720-19660952)
chr5 (6-242)||(26011917-26012154)
chr5 (22-240)||(20026824-20027043)
chr5 (22-240)||(22178103-22178323)
chr5 (22-189)||(22144068-22144236)
chr5 (21-189)||(40725871-40726040)
chr5 (7-129)||(23390491-23390613)
chr5 (7-104)||(36314581-36314678)
chr5 (7-129)||(24493573-24493694)
chr5 (7-136)||(8286829-8286960)
chr5 (7-184)||(264753-264929)
chr5 (7-129)||(21729059-21729181)
chr5 (7-129)||(21808384-21808506)
chr5 (7-184)||(29329935-29330111)
chr5 (7-184)||(39363385-39363561)
chr5 (7-129)||(13025315-13025436)
chr5 (7-129)||(13095499-13095620)
chr5 (7-129)||(22412188-22412309)
chr5 (7-111)||(21997547-21997651)
chr5 (10-184)||(1096474-1096649)
chr5 (7-185)||(11581183-11581360)
chr5 (7-122)||(24529224-24529339)
chr5 (7-125)||(9077956-9078074)
chr5 (7-164)||(10732944-10733101)
chr5 (7-184)||(20909013-20909189)
chr5 (7-129)||(25421536-25421658)
chr5 (55-191)||(29448054-29448192)
chr5 (7-184)||(42245350-42245526)
chr5 (7-184)||(29345981-29346157)
chr5 (79-189)||(21871507-21871616)
chr5 (79-189)||(21875787-21875896)
chr5 (18-189)||(20901988-20902159)
chr5 (19-129)||(22075035-22075145)
chr5 (7-184)||(29348454-29348630)
chr5 (7-184)||(29350927-29351103)
chr5 (7-113)||(39245137-39245242)
chr5 (7-189)||(2154593-2154775)
chr5 (79-189)||(10753594-10753703)
chr5 (23-127)||(25431414-25431518)
chr5 (7-174)||(36154777-36154941)
chr5 (7-184)||(32027394-32027570)
chr5 (7-65)||(20918052-20918109)
chr5 (79-189)||(22120131-22120240)
chr5 (17-174)||(18319027-18319185)
chr5 (115-171)||(21741486-21741541)
chr5 (7-54)||(10775790-10775837)
chr5 (7-74)||(21293020-21293086)
chr5 (7-54)||(23064512-23064559)
chr5 (22-73)||(26740697-26740747)
chr5 (7-54)||(38619435-38619482)
chr5 (22-75)||(37723922-37723975)
chr5 (69-129)||(20766115-20766175)
chr5 (103-175)||(24767287-24767359)
chr5 (7-63)||(31061069-31061124)
chr5 (125-184)||(36314670-36314728)
chr5 (19-73)||(26732884-26732937)
chr5 (6-54)||(26704074-26704122)
chr5 (6-54)||(26973807-26973855)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (6-242)||(33681010-33681246)
chr1 (6-242)||(22237630-22237867)
chr1 (6-242)||(52927864-52928088)
chr1 (6-242)||(20248282-20248514)
chr1 (6-242)||(22921751-22921987)
chr1 (10-242)||(21754052-21754274)
chr1 (19-242)||(20918620-20918840)
chr1 (22-240)||(21861453-21861672)
chr1 (22-240)||(21896142-21896358)
chr1 (6-184)||(14295495-14295672)
chr1 (10-240)||(16368170-16368401)
chr1 (22-189)||(35261015-35261180)
chr1 (18-191)||(16758664-16758839)
chr1 (22-226)||(41049933-41050138)
chr1 (22-240)||(50613999-50614219)
chr1 (22-240)||(50621827-50622047)
chr1 (22-240)||(50686630-50686850)
chr1 (6-118)||(21161719-21161830)
chr1 (55-190)||(22130844-22130976)
chr1 (7-125)||(50210212-50210330)
chr1 (7-189)||(433013-433193)
chr1 (7-184)||(21475072-21475248)
chr1 (7-184)||(23593719-23593896)
chr1 (7-122)||(34509784-34509899)
chr1 (7-184)||(13988867-13989043)
chr1 (7-184)||(21923276-21923452)
chr1 (22-174)||(45574836-45574989)
chr1 (7-129)||(22532273-22532395)
chr1 (7-129)||(27250724-27250846)
chr1 (7-184)||(29776689-29776865)
chr1 (7-184)||(31612314-31612490)
chr1 (71-184)||(51130632-51130741)
chr1 (17-184)||(16361928-16362095)
chr1 (17-125)||(21840778-21840885)
chr1 (7-174)||(29298138-29298304)
chr1 (22-181)||(16093826-16093987)
chr1 (7-74)||(20847205-20847271)
chr1 (7-129)||(21026684-21026806)
chr1 (24-172)||(26064959-26065108)
chr1 (79-189)||(1924896-1925005)
chr1 (88-240)||(12271639-12271784)
chr1 (79-189)||(20923910-20924019)
chr1 (7-189)||(13212841-13213023)
chr1 (17-68)||(20454610-20454660)
chr1 (7-184)||(22123052-22123229)
chr1 (79-189)||(41387815-41387924)
chr1 (7-189)||(21346962-21347144)
chr1 (110-242)||(20636956-20637087)
chr1 (31-79)||(38801433-38801481)
chr1 (7-54)||(21342097-21342144)
chr1 (7-54)||(21707168-21707215)
chr1 (7-54)||(21711710-21711757)
chr1 (115-181)||(35981631-35981696)
chr1 (115-181)||(49261452-49261517)
chr1 (6-54)||(21714545-21714593)
chr1 (7-54)||(15860123-15860170)
chr1 (79-154)||(41388048-41388122)
chr1 (89-154)||(39243943-39244008)
chr1 (89-154)||(39247498-39247563)
chr1 (7-125)||(16275407-16275525)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (6-242)||(45674-45910)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (6-242)||(22556-22788)
scaffold0037 (7-190)||(82073-82255)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (4-242)||(160685-160922)
scaffold0001 (17-184)||(501095-501261)
scaffold0001 (7-189)||(85559-85741)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (13-242)||(6822-7048)
scaffold0556 (85-237)||(8097-8249)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (6-242)||(132-367)
[»] chr6 (78 HSPs)
chr6 (6-242)||(19652198-19652432)
chr6 (7-242)||(28496356-28496588)
chr6 (7-242)||(29808767-29808999)
chr6 (7-242)||(1561307-1561540)
chr6 (6-240)||(20109140-20109378)
chr6 (18-240)||(19668386-19668609)
chr6 (6-242)||(23019408-23019645)
chr6 (7-104)||(27333238-27333335)
chr6 (7-104)||(27393978-27394075)
chr6 (18-171)||(9098466-9098620)
chr6 (18-189)||(25644335-25644508)
chr6 (6-118)||(4185827-4185939)
chr6 (12-118)||(4186376-4186482)
chr6 (10-189)||(8227445-8227625)
chr6 (7-190)||(22782228-22782410)
chr6 (22-240)||(23076749-23076969)
chr6 (7-125)||(29060544-29060662)
chr6 (6-118)||(31155403-31155515)
chr6 (22-240)||(35008167-35008387)
chr6 (7-190)||(20556873-20557053)
chr6 (7-184)||(2291165-2291341)
chr6 (7-184)||(12742318-12742494)
chr6 (7-129)||(16496248-16496370)
chr6 (7-184)||(18334577-18334753)
chr6 (7-125)||(18409826-18409944)
chr6 (7-184)||(19005047-19005223)
chr6 (7-184)||(19858904-19859080)
chr6 (7-184)||(24422548-24422724)
chr6 (7-184)||(33861795-33861971)
chr6 (7-184)||(33864279-33864455)
chr6 (7-125)||(19303540-19303657)
chr6 (7-109)||(20076704-20076805)
chr6 (17-184)||(30676695-30676861)
chr6 (7-122)||(20638285-20638400)
chr6 (7-184)||(1595550-1595726)
chr6 (7-184)||(8055030-8055206)
chr6 (7-125)||(25629354-25629472)
chr6 (7-184)||(26924625-26924801)
chr6 (58-118)||(4668217-4668277)
chr6 (58-118)||(4675064-4675124)
chr6 (7-129)||(17287791-17287913)
chr6 (15-129)||(20360955-20361069)
chr6 (62-242)||(22080621-22080800)
chr6 (22-189)||(18456735-18456901)
chr6 (7-111)||(25656630-25656733)
chr6 (7-190)||(25754810-25754992)
chr6 (17-184)||(34963384-34963550)
chr6 (7-184)||(1540896-1541072)
chr6 (7-125)||(20593777-20593895)
chr6 (79-189)||(22949375-22949484)
chr6 (79-189)||(22953331-22953440)
chr6 (79-189)||(23871819-23871928)
chr6 (79-189)||(23875775-23875884)
chr6 (79-189)||(27325370-27325479)
chr6 (17-125)||(25688513-25688620)
chr6 (7-122)||(16920634-16920747)
chr6 (7-122)||(35245590-35245703)
chr6 (84-191)||(18706387-18706493)
chr6 (79-189)||(16760525-16760634)
chr6 (22-158)||(18461895-18462031)
chr6 (7-65)||(25714421-25714478)
chr6 (7-174)||(3852011-3852178)
chr6 (145-226)||(28103796-28103877)
chr6 (17-174)||(16448520-16448678)
chr6 (84-192)||(18696569-18696676)
chr6 (24-68)||(22831524-22831568)
chr6 (84-218)||(18204159-18204294)
chr6 (7-54)||(22780297-22780344)
chr6 (103-189)||(16624583-16624669)
chr6 (79-189)||(31477577-31477686)
chr6 (13-66)||(11185515-11185568)
chr6 (24-101)||(33443068-33443146)
chr6 (84-218)||(18177577-18177712)
chr6 (84-218)||(18199321-18199456)
chr6 (22-65)||(18821904-18821946)
chr6 (89-154)||(16624371-16624436)
chr6 (110-175)||(21939488-21939553)
chr6 (6-50)||(4738631-4738675)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (17-240)||(1096-1319)
[»] chr4 (77 HSPs)
chr4 (6-242)||(8846359-8846611)
chr4 (6-242)||(12774010-12774236)
chr4 (18-238)||(43198438-43198661)
chr4 (22-240)||(13734-13953)
chr4 (18-239)||(12288094-12288316)
chr4 (7-234)||(39706179-39706405)
chr4 (7-242)||(15551821-15552052)
chr4 (41-242)||(16596686-16596884)
chr4 (18-189)||(52243128-52243302)
chr4 (22-240)||(53082035-53082254)
chr4 (22-240)||(46640339-46640558)
chr4 (7-129)||(7798778-7798900)
chr4 (15-125)||(16377522-16377630)
chr4 (7-184)||(44615289-44615465)
chr4 (7-129)||(16239965-16240086)
chr4 (7-190)||(18215253-18215435)
chr4 (7-122)||(7088881-7088996)
chr4 (7-181)||(44928866-44929041)
chr4 (7-184)||(15118337-15118513)
chr4 (7-129)||(22636439-22636561)
chr4 (7-184)||(44773072-44773248)
chr4 (7-184)||(52312511-52312687)
chr4 (7-129)||(6899895-6900016)
chr4 (7-129)||(16270231-16270352)
chr4 (7-128)||(52873363-52873484)
chr4 (7-174)||(12301-12468)
chr4 (7-184)||(1837494-1837670)
chr4 (7-129)||(12902761-12902883)
chr4 (7-129)||(14280317-14280438)
chr4 (7-129)||(54798749-54798871)
chr4 (7-179)||(19242700-19242872)
chr4 (17-125)||(19618216-19618323)
chr4 (7-174)||(50222333-50222500)
chr4 (7-129)||(7893707-7893829)
chr4 (7-184)||(18239404-18239580)
chr4 (7-129)||(44052833-44052955)
chr4 (79-189)||(630710-630819)
chr4 (7-129)||(8574864-8574984)
chr4 (8-125)||(14038653-14038770)
chr4 (7-80)||(3096297-3096369)
chr4 (10-129)||(23374354-23374473)
chr4 (7-184)||(3515008-3515184)
chr4 (79-189)||(3331961-3332070)
chr4 (79-189)||(14953897-14954006)
chr4 (17-184)||(15355309-15355476)
chr4 (79-189)||(25690137-25690246)
chr4 (17-125)||(14970751-14970858)
chr4 (7-68)||(17046491-17046552)
chr4 (7-190)||(51463847-51464029)
chr4 (79-175)||(13812759-13812854)
chr4 (7-65)||(7641286-7641343)
chr4 (79-189)||(10713083-10713192)
chr4 (79-189)||(10926853-10926962)
chr4 (7-65)||(12610951-12611008)
chr4 (115-181)||(15099461-15099526)
chr4 (115-181)||(15190428-15190493)
chr4 (79-189)||(15225308-15225417)
chr4 (7-65)||(23803369-23803426)
chr4 (79-184)||(12487941-12488045)
chr4 (7-120)||(14053306-14053418)
chr4 (7-174)||(44102215-44102382)
chr4 (79-189)||(15868645-15868754)
chr4 (85-189)||(15464865-15464970)
chr4 (79-174)||(32851450-32851545)
chr4 (186-237)||(14164732-14164783)
chr4 (79-154)||(15225114-15225188)
chr4 (21-189)||(15367708-15367876)
chr4 (21-189)||(15402721-15402889)
chr4 (31-74)||(17333305-17333347)
chr4 (22-68)||(6190481-6190527)
chr4 (21-125)||(15370036-15370140)
chr4 (21-125)||(16223550-16223654)
chr4 (21-113)||(15371220-15371311)
chr4 (21-113)||(15373501-15373592)
chr4 (145-189)||(15791916-15791960)
chr4 (103-175)||(20157240-20157312)
chr4 (103-175)||(22634163-22634235)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (6-242)||(16219599-16219835)
chr7 (6-242)||(18005649-18005885)
chr7 (6-242)||(811013-811249)
chr7 (7-242)||(34200790-34201022)
chr7 (7-242)||(67749-67983)
chr7 (7-242)||(15754771-15755004)
chr7 (6-238)||(44014181-44014409)
chr7 (7-242)||(47831811-47832046)
chr7 (7-242)||(11995912-11996144)
chr7 (7-242)||(28505183-28505415)
chr7 (18-240)||(16056343-16056564)
chr7 (22-240)||(20220073-20220290)
chr7 (7-184)||(16495406-16495579)
chr7 (18-239)||(12901338-12901560)
chr7 (7-237)||(22072917-22073149)
chr7 (88-240)||(15116565-15116717)
chr7 (6-189)||(2280053-2280238)
chr7 (18-189)||(1867929-1868101)
chr7 (31-185)||(12255729-12255886)
chr7 (88-240)||(15113028-15113180)
chr7 (21-189)||(19486678-19486847)
chr7 (18-190)||(14044761-14044935)
chr7 (18-190)||(14354791-14354965)
chr7 (22-190)||(13647344-13647512)
chr7 (7-129)||(38227485-38227606)
chr7 (7-125)||(3564363-3564481)
chr7 (7-184)||(18430713-18430889)
chr7 (7-184)||(27216861-27217037)
chr7 (7-129)||(18456408-18456529)
chr7 (7-129)||(12698835-12698958)
chr7 (7-184)||(456322-456498)
chr7 (7-129)||(9509193-9509315)
chr7 (7-184)||(11393272-11393448)
chr7 (7-184)||(11972497-11972673)
chr7 (7-184)||(14949107-14949283)
chr7 (7-184)||(15376698-15376874)
chr7 (7-184)||(16232521-16232697)
chr7 (7-189)||(17061895-17062076)
chr7 (7-184)||(20385108-20385284)
chr7 (7-184)||(21189580-21189756)
chr7 (7-184)||(24702239-24702415)
chr7 (7-184)||(32125492-32125668)
chr7 (7-184)||(41522918-41523094)
chr7 (7-184)||(41525380-41525556)
chr7 (26-189)||(15008433-15008597)
chr7 (7-174)||(18640273-18640440)
chr7 (7-184)||(24704689-24704862)
chr7 (7-125)||(48273393-48273511)
chr7 (21-189)||(10063757-10063921)
chr7 (7-189)||(44116510-44116691)
chr7 (7-125)||(16410060-16410177)
chr7 (17-125)||(24275182-24275289)
chr7 (6-125)||(15144037-15144154)
chr7 (7-129)||(16386242-16386365)
chr7 (19-129)||(26212012-26212122)
chr7 (7-174)||(3386334-3386501)
chr7 (7-118)||(16213685-16213795)
chr7 (7-122)||(40443395-40443509)
chr7 (79-189)||(18426070-18426179)
chr7 (79-189)||(39267582-39267691)
chr7 (79-189)||(45169773-45169882)
chr7 (7-125)||(13869347-13869465)
chr7 (88-124)||(16324135-16324171)
chr7 (7-54)||(20110557-20110604)
chr7 (7-73)||(27847881-27847947)
chr7 (19-80)||(10589055-10589115)
chr7 (103-175)||(9751500-9751572)
chr7 (79-155)||(18425668-18425743)
chr7 (79-155)||(18425870-18425945)
chr7 (17-174)||(38898370-38898528)
chr7 (7-54)||(13831374-13831421)
chr7 (195-242)||(16324197-16324244)
chr7 (115-172)||(9389649-9389705)
chr7 (22-74)||(18203831-18203882)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (6-242)||(26355582-26355816)
chr8 (7-242)||(5866159-5866391)
chr8 (7-242)||(21490999-21491231)
chr8 (7-242)||(6520372-6520606)
chr8 (7-242)||(38855134-38855368)
chr8 (7-242)||(17140920-17141152)
chr8 (22-240)||(20498581-20498800)
chr8 (6-217)||(23760751-23760962)
chr8 (22-240)||(37116366-37116586)
chr8 (17-240)||(21285611-21285834)
chr8 (6-238)||(21673707-21673938)
chr8 (7-203)||(21249388-21249582)
chr8 (7-203)||(21255226-21255420)
chr8 (18-239)||(983287-983512)
chr8 (22-240)||(17266876-17267096)
chr8 (21-189)||(13508019-13508188)
chr8 (21-189)||(13597551-13597720)
chr8 (22-240)||(24353039-24353261)
chr8 (21-177)||(17612056-17612213)
chr8 (7-129)||(16092337-16092459)
chr8 (84-238)||(22364744-22364897)
chr8 (7-129)||(22626740-22626861)
chr8 (22-191)||(17439438-17439609)
chr8 (7-184)||(28648983-28649161)
chr8 (7-129)||(22875069-22875190)
chr8 (7-184)||(1484403-1484579)
chr8 (7-184)||(5853277-5853453)
chr8 (7-129)||(7372782-7372904)
chr8 (7-184)||(14409429-14409605)
chr8 (7-184)||(20403228-20403404)
chr8 (7-129)||(20536212-20536334)
chr8 (7-184)||(22001754-22001930)
chr8 (7-122)||(31971261-31971375)
chr8 (7-129)||(26219718-26219838)
chr8 (7-113)||(6759262-6759368)
chr8 (7-122)||(16199647-16199761)
chr8 (7-129)||(18818404-18818526)
chr8 (7-184)||(20046180-20046356)
chr8 (7-129)||(21918995-21919117)
chr8 (7-129)||(21923923-21924045)
chr8 (7-113)||(23406383-23406489)
chr8 (79-189)||(21383887-21383996)
chr8 (17-184)||(16413301-16413467)
chr8 (7-80)||(18879276-18879348)
chr8 (7-189)||(41598189-41598370)
chr8 (7-184)||(4483282-4483457)
chr8 (7-184)||(15203216-15203392)
chr8 (7-129)||(26225288-26225408)
chr8 (7-122)||(21395984-21396097)
chr8 (7-122)||(21790477-21790590)
chr8 (7-184)||(4542358-4542534)
chr8 (79-189)||(18862412-18862521)
chr8 (79-189)||(21387307-21387416)
chr8 (79-189)||(21411180-21411289)
chr8 (79-189)||(21805672-21805781)
chr8 (79-189)||(21827781-21827890)
chr8 (22-189)||(19801362-19801527)
chr8 (7-184)||(19896266-19896445)
chr8 (7-122)||(21389454-21389567)
chr8 (7-122)||(21778780-21778893)
chr8 (7-74)||(45131047-45131113)
chr8 (7-54)||(25484382-25484429)
chr8 (7-174)||(14823775-14823941)
chr8 (84-141)||(40492834-40492891)
chr8 (17-54)||(45290809-45290846)
chr8 (19-125)||(15070571-15070677)
chr8 (7-125)||(19937049-19937167)
chr8 (22-75)||(19154936-19154989)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (7-242)||(12770-13005)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (18-240)||(8481-8706)
scaffold0621 (7-238)||(6539-6769)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (6-242)||(19267-19503)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (6-242)||(100377-100613)
scaffold0023 (6-242)||(40056-40292)
scaffold0023 (7-184)||(94412-94588)
scaffold0023 (6-80)||(101502-101576)
scaffold0023 (7-125)||(44455-44573)
scaffold0023 (7-76)||(119879-119948)
scaffold0023 (17-184)||(17425-17591)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (6-242)||(25175853-25176089)
chr2 (8-242)||(28405981-28406216)
chr2 (7-242)||(22134099-22134323)
chr2 (7-211)||(23071865-23072066)
chr2 (7-169)||(7679589-7679750)
chr2 (33-239)||(7617-7824)
chr2 (18-239)||(18786787-18787009)
chr2 (6-189)||(23708553-23708738)
chr2 (22-240)||(23207296-23207515)
chr2 (88-240)||(22459445-22459598)
chr2 (21-185)||(19671848-19672011)
chr2 (22-239)||(23791292-23791511)
chr2 (7-184)||(22105413-22105590)
chr2 (22-240)||(25108906-25109126)
chr2 (7-129)||(23060517-23060639)
chr2 (22-189)||(20520127-20520295)
chr2 (7-129)||(298809-298932)
chr2 (7-184)||(18808944-18809120)
chr2 (7-184)||(23130863-23131039)
chr2 (7-184)||(23133330-23133506)
chr2 (7-184)||(23709517-23709693)
chr2 (7-184)||(23711998-23712174)
chr2 (7-184)||(34402507-34402683)
chr2 (7-184)||(39682314-39682490)
chr2 (17-184)||(24367785-24367951)
chr2 (7-184)||(571398-571574)
chr2 (7-184)||(6725996-6726172)
chr2 (7-129)||(22337119-22337241)
chr2 (7-129)||(23076446-23076568)
chr2 (7-184)||(23135591-23135767)
chr2 (7-129)||(23285869-23285987)
chr2 (7-129)||(23654381-23654503)
chr2 (7-184)||(26505380-26505556)
chr2 (7-184)||(26507858-26508034)
chr2 (7-184)||(28577100-28577276)
chr2 (7-101)||(38138-38231)
chr2 (17-184)||(21155045-21155211)
chr2 (22-189)||(22413070-22413240)
chr2 (7-190)||(32039477-32039659)
chr2 (7-184)||(24898180-24898357)
chr2 (7-184)||(24900663-24900840)
chr2 (7-184)||(24903140-24903317)
chr2 (7-184)||(24905617-24905794)
chr2 (7-184)||(24908092-24908269)
chr2 (7-129)||(22731229-22731351)
chr2 (7-129)||(23660027-23660148)
chr2 (17-184)||(32214906-32215072)
chr2 (7-122)||(20309112-20309225)
chr2 (7-67)||(23040247-23040306)
chr2 (84-191)||(24697538-24697645)
chr2 (79-189)||(1283657-1283766)
chr2 (7-125)||(23103396-23103512)
chr2 (79-189)||(30344758-30344867)
chr2 (7-80)||(8946661-8946733)
chr2 (7-174)||(45029848-45030015)
chr2 (8-174)||(43137301-43137467)
chr2 (17-65)||(24643054-24643101)
chr2 (7-54)||(22738249-22738296)
chr2 (7-54)||(38967375-38967422)
chr2 (7-54)||(24529643-24529690)
chr2 (24-74)||(23287384-23287433)
chr2 (24-73)||(26392403-26392451)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (6-242)||(32101-32330)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (18-240)||(10542-10764)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (6-242)||(132661-132890)
scaffold0028 (7-242)||(62202-62434)
scaffold0028 (7-184)||(136681-136857)
scaffold0028 (7-184)||(139150-139326)
scaffold0028 (7-184)||(144088-144264)
scaffold0028 (7-184)||(134212-134388)
scaffold0028 (7-184)||(141619-141795)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (6-242)||(12942-13178)
scaffold0138 (84-240)||(18121-18277)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (7-242)||(2001-2233)
scaffold0046 (7-242)||(11296-11528)
scaffold0046 (7-122)||(28418-28533)
scaffold0046 (7-59)||(4556-4608)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (33-240)||(53432-53640)
scaffold0075 (89-189)||(8230-8330)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (7-238)||(6009-6240)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (6-242)||(2527-2763)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (7-242)||(6615-6850)
scaffold0333 (7-242)||(13995-14230)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (7-242)||(15665-15897)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (7-242)||(917-1151)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (14-238)||(5654-5877)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (6-242)||(14579-14815)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (6-240)||(32538-32772)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (22-238)||(12587-12803)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (7-242)||(34127-34359)
scaffold0175 (15-54)||(285-324)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (22-240)||(128853-129072)
scaffold0022 (26-237)||(78345-78556)
scaffold0022 (7-129)||(116431-116551)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (6-242)||(2686-2924)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (24-239)||(7943-8161)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (22-240)||(97024-97244)
scaffold0006 (22-240)||(106302-106522)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (18-240)||(7960-8180)
scaffold0218 (50-242)||(29162-29354)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (7-184)||(38641-38819)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (7-184)||(1013-1186)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (7-141)||(15760-15894)
scaffold0020 (195-242)||(15714-15761)
scaffold0020 (6-54)||(178897-178945)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (22-240)||(6166-6386)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (6-109)||(23898-24001)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (61-242)||(2100-2281)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (26-240)||(38339-38555)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (61-242)||(2327-2505)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (7-184)||(3090-3267)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (22-240)||(19768-19987)
scaffold0080 (7-129)||(39917-40038)
scaffold0080 (79-189)||(48921-49030)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (22-239)||(136252-136471)
scaffold0021 (22-239)||(144960-145179)
scaffold0021 (7-73)||(121770-121835)
scaffold0021 (22-75)||(174785-174838)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (31-189)||(11492-11651)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (31-189)||(38190-38349)
scaffold0124 (79-189)||(21828-21937)
scaffold0124 (79-189)||(24587-24699)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (21-189)||(17961-18130)
scaffold0247 (17-189)||(2108-2280)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (18-189)||(27683-27855)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (22-129)||(1051-1158)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (160-242)||(28693-28775)
scaffold0211 (6-87)||(28806-28888)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (18-172)||(25121-25276)
scaffold0123 (84-191)||(619-725)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (18-189)||(16034-16206)
scaffold0357 (22-189)||(13147-13316)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (15-129)||(39489-39602)
scaffold0141 (79-189)||(13854-13963)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (15-129)||(75210-75323)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (7-129)||(39862-39983)
scaffold0026 (15-129)||(25908-26021)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (84-240)||(87-243)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (18-239)||(103523-103737)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (7-129)||(1855-1977)
scaffold0016 (103-177)||(207467-207541)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (160-242)||(2185-2267)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (22-240)||(267679-267898)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (22-240)||(569-787)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (22-240)||(1681-1900)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (7-125)||(3185-3303)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (7-125)||(17214-17334)
scaffold0056 (22-189)||(79264-79430)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (7-184)||(20748-20924)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (7-129)||(13215-13337)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (7-184)||(37822-37998)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (7-129)||(44702-44824)
scaffold0122 (10-125)||(26064-26179)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (7-184)||(158435-158611)
scaffold0003 (7-184)||(339889-340064)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (7-129)||(32946-33067)
scaffold0145 (7-129)||(38765-38886)
scaffold0145 (7-184)||(9750-9927)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (7-129)||(32952-33073)
scaffold0120 (7-129)||(45932-46053)
scaffold0120 (7-125)||(16117-16235)
scaffold0120 (7-65)||(17389-17446)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (7-122)||(4853-4968)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (7-184)||(4695-4871)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (7-184)||(13393-13569)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (7-129)||(3474-3596)
scaffold0292 (7-129)||(347-468)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (7-184)||(13948-14124)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (7-129)||(51917-52039)
scaffold0011 (7-129)||(167973-168095)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (22-175)||(20372-20524)
scaffold0031 (79-189)||(35853-35962)
scaffold0031 (7-129)||(128755-128876)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (17-125)||(10784-10891)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (7-129)||(8528-8646)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (61-189)||(225465-225593)
scaffold0012 (79-189)||(189144-189253)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (58-118)||(9133-9193)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (7-122)||(1293-1406)
scaffold0106 (7-122)||(7270-7383)
scaffold0106 (7-68)||(15295-15355)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (7-129)||(1043-1165)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (7-129)||(22887-23008)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (7-122)||(15466-15580)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (7-122)||(32071-32184)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (21-129)||(24297-24406)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (7-129)||(6116-6241)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (7-68)||(4890-4950)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (17-125)||(9253-9360)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (7-174)||(16785-16952)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (22-122)||(51601-51699)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (19-122)||(13513-13615)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (15-129)||(4520-4633)
scaffold0228 (15-129)||(12102-12215)
scaffold0228 (15-129)||(22054-22167)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (7-125)||(16599-16717)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (7-184)||(40401-40577)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (7-120)||(16286-16397)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (7-190)||(107-289)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (7-80)||(4716-4788)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (7-122)||(5132-5245)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (7-122)||(8483-8598)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (7-141)||(1956-2091)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (7-75)||(10472-10540)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (7-190)||(12065-12241)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (79-189)||(627-736)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (89-175)||(6-92)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (79-189)||(11268-11377)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (19-174)||(161083-161239)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (79-184)||(32432-32536)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (17-125)||(11299-11406)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (145-233)||(165-252)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (17-65)||(4308-4355)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (7-122)||(1053-1166)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (20-189)||(29946-30114)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (7-189)||(4215-4396)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (22-109)||(2694-2783)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (7-73)||(46999-47065)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (17-125)||(12293-12400)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (9-120)||(11447-11558)
scaffold0235 (79-174)||(13638-13733)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (103-175)||(12758-12830)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (6-54)||(23842-23890)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (103-175)||(9784-9856)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (6-54)||(36453-36501)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (85-184)||(27912-28012)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (22-65)||(11982-12024)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (21-122)||(20928-21030)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (17-54)||(1395-1432)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 16097331 - 16097567
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16097331 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 16097530  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16097531 ggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 16097567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 16103783 - 16104018
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103783 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggattagtcttact 16103981  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16103982 ggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 16104018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12174377 - 12174152
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174377 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 12174278  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    ||||   | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12174277 gcaa---aacaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattgattcatatgcatcagtcttact 12174181  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaactta 234  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12174180 ggaacaacaacagcaagctaaacaactta 12174152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471162
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470927 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 15471026  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |  ||||||   |||| ||||||    
T  15471027 gcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggcttact 15471125  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15471126 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaa 15471162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307906
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 32307783  T
Q  110 gtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 209  Q
     ||| ||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  32307784 -tcaacaacatctcaattatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacattaattcataagcatcagtcttactagaa 32307873  T
Q  210 caacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32307874 caatgacagcaagataaacaacttagtttctaa 32307906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13210444 - 13210211
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13210444 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 13210345  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||   ||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  13210344 caa---atcaacaacttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgaattcatatgcatcagccttact 13210248  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13210247 ggaatgttaacaacaagataaacaacttagtttctaa 13210211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 9512923 - 9513146
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512923 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 9513022  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||    ||||||||||||  |||| |||||||| | | |||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9513023 gca----atcaacatctcatttatc-aacataatccatttaatgta--------tataaaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 9513109  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  9513110 ggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaa 9513146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 9520898 - 9521121
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520898 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 9520997  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||    ||||||||||||  |||| |||||||| | | ||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520998 gca----atcaacatctcatttatc-aacataatccatttaatgtatat--aac------acattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 9521084  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  9521085 ggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaa 9521121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 49668194 - 49667967
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668194 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 49668095  T
Q  106 gcaagtcatc-aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 204  Q
    |||| ||| | |||||||||  |||| |||||||| | | ||| ||||||||        | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49668094 gcaa-tcaacaaacatctcatttatc-aacataatccatttaaagtatatac--------agcattatatacaacatcaactcatatgcatcagtcttac 49668005  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49668004 tggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaa 49667967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Original strand, 14234491 - 14234665
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234491 catcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 14234590  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 181  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  14234591 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacat 14234665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644566
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa 1644689  T
Q  110 gtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 209  Q
     ||| ||| ||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644688 -tcaacaatatctcaattatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 1644599  T
Q  210 caacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1644598 caataacaacaagataaacaacttagtttctaa 1644566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 115 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 49389639 - 49389512
Alignment:
Q  115 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49389639 caacatctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 49389540  T
Q  215 acagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  49389539 acaacaagataaacaacttagtttctaa 49389512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251051
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37251171  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  37251170 tctcaac-atcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaacagt 37251072  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37251071 aagataaacaacttagtttct 37251051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523665
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 52523732  T
Q  120 tctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 185  Q
    ||||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52523731 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaat 52523665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 27165251 - 27165429
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||    
T  27165251 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaatg 27165350  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||   ||| ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  27165351 caagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 27165429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24340826 - 24340657
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  24340826 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 24340727  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24340726 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 24340657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 53301668 - 53301492
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  53301668 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 53301569  T
Q  107 caagtca-tcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 181  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||  ||| |   ||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  53301568 caagtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataaacaacat 53301492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274874
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 23274804  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||||||| ||| | |||||||  |||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  23274805 ctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcat 23274874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110235
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagca 22110355  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||  |||| | | ||||| |||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| |||||    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  22110354 tctcaac-atcatatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatacaattcaggcttactgaaacaacaacagt 22110256  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22110255 aagataagcaacttagtttct 22110235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37642368 - 37642199
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||| | ||||||    
T  37642368 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 37642269  T
Q  121 ctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37642268 ctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 37642199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12934268 - 12934194
Alignment:
Q  168 attataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12934268 attataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaa 12934194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 18438538 - 18438653
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  18438538 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 18438636  T
Q  106 gcaagtcatcaacatct 122  Q
    |||||||| ||||||||    
T  18438637 gcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 12399213 - 12399335
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  12399213 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaat 12399311  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  12399312 gcaattcaacaacatcttaaatat 12399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 14572596 - 14572714
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 109  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||  |    
T  14572596 catcaacatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgaga 14572694  T
Q  110 gtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  14572695 gtcaacaacatcttaaatat 14572714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 14972858 - 14973036
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14972858 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14972956  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||| ||| |||||||||| |||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  14972957 gcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 14973036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 17487860 - 17487982
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  17487860 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17487958  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  17487959 gcaattcatcaacatcttaaatat 17487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 17499342 - 17499464
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  17499342 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17499440  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  17499441 gcaattcatcaacatcttaaatat 17499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 36166599 - 36166719
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  36166599 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 36166696  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  36166697 caagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386536
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  120 tctcaaatat 129  Q
    ||||||||||    
T  42386527 tctcaaatat 42386536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618570
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
Q  117 acatctcaaatat 129  Q
    |||||||||||||    
T  21618558 acatctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 13442278 - 13442400
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  13442278 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 13442376  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  13442377 gcaattcatcaacatcttaaatat 13442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14576950 - 14576828
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | || ||||| |||| |||||| | |    
T  14576950 acatcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataa-caacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaatt 14576852  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  14576851 gcaagtcaacaacatcttaaatat 14576828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 17463179 - 17463355
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  17463179 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 17463355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 34159327 - 34159503
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  34159327 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 34159503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45607068 - 45606892
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  45607068 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 45606892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 55476492 - 55476668
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  55476492 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 55476668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 11424876 - 11424783
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11424876 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282796
Alignment:
Q  8 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||| |||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 16282796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 24153325 - 24153204
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  24153325 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-cgatagcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 24153227  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  24153226 caagtcaacaacatcttaaatat 24153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43550625 - 43550457
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  43550625 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-tgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 43550527  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    ||||| || ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  43550526 ctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 43550457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 157
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926114
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 43926076  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatataca 157  Q
    ||||||| |||| | | ||||| ||||||| |||||||    
T  43926077 tctcaaacatcatatacaattcatgtaatgcatataca 43926114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 8899095 - 8899277
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  8899095 catcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 8899277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22147616 - 22147467
Alignment:
Q  33 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaat-atca 131  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||| | ||||||||||||| ||||    
T  22147616 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 22147517  T
Q  132 aacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 181  Q
     | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22147516 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38962042 - 38961876
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  38962042 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 38961945  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  38961944 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 38961876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051137
Alignment:
Q  65 atagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaacta 161  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || || | |||||||  |||||| |||||||| ||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  162 tataacattataaacaacatcaat 185  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacatcaat 2051137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20698552 - 20698437
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || |||||  ||| |||||| | |    
T  20698552 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaatt 20698454  T
Q  106 gcaagtcatcaacatct 122  Q
    |||| ||||||||||||    
T  20698453 gcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6469295 - 6469119
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  6469295 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  6469197 gcaagtcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 6469119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7781508 - 7781332
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  7781508 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 7781332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9707768 - 9707592
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  9707768 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
     ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 9707592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16454442 - 16454266
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16454442 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 16454266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23083478 - 23083356
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  23083478 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaatt 23083380  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  23083379 gcaagtcaacaacatcttaaatat 23083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28848772 - 28848596
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  28848772 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 28848596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 29172744 - 29172587
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29172744 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatat 164  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29172587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 12567571 - 12567737
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  12567571 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 12567668  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  12567669 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 12567737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 13544036 - 13544202
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  13544036 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 13544133  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13544134 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 13544202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Original strand, 28194694 - 28194759
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacag 72  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28194694 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacag 28194759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13151952 - 13151775
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13151952 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 13151775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13154417 - 13154240
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13154417 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 13154240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10247884 - 10247708
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  10247884 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-caacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 10247708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25476502 - 25476384
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  25476502 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaa-aaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25476404  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  25476403 gcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 26686891 - 26687013
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  26686891 catcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 26686989  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||||    
T  26686990 gcaagtcaacatcatcttaaatat 26687013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 40213837 - 40213720
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| || || |||||||| |||| |||||| |||    
T  40213837 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 43840944 - 43841058
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 113  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  43840944 tcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 43841042  T
Q  114 tcaacatctcaaatat 129  Q
     || ||||| ||||||    
T  43841043 acatcatcttaaatat 43841058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 55500943 - 55501055
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  55500943 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
Q  106 gcaagtcatcaacat 120  Q
    |||||||| ||||||    
T  55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070633
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||| ||||    
T  53070701 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatct-aacaacatcaaatcat 53070633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 15977516 - 15977633
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15977516 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  15977614 gcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17446815 - 17446640
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  17446815 catcatcttaatcaacttagacga-ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | || ||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 17446640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 17672627 - 17672744
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  17672627 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||| ||| |||| ||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaa 17672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Original strand, 43927291 - 43927370
Alignment:
Q  161 atataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43927291 atatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttct 43927370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Original strand, 50242833 - 50243005
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |    
T  50242833 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaac 50242930  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  50242931 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 50243005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 19775998 - 19776107
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  19775998 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 19776096  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  19776097 catcaaatcat 19776107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37439512 - 37439403
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  37439512 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 37439414  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  37439413 catcaaatcat 37439403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23413271 - 23413186
Alignment:
Q  104 atgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  23413271 atgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatccatctatataacattataaatatcatcaaatcat 23413186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124064
Alignment:
Q  8 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 41124064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 606441 - 606324
Alignment:
Q  10 catcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |   ||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  606441 catcatcattcatcttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatg 606343  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaa 125  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  606342 caattcaacaacatctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1465419 - 1465354
Alignment:
Q  115 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  1465419 caacatctcaaatatcaa-cataattcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacat 1465354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4107273 - 4107164
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  4107273 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 4107175  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  4107174 catcaaatcat 4107164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4111125 - 4111016
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  4111125 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 4111027  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  4111026 catcaaatcat 4111016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8489341 - 8489232
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  8489341 aatcatcat-atataacaattacaaatacacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaaatatataacattataaatat 8489243  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  8489242 catcaaatcat 8489232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 15965202 - 15965311
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15965202 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15965300  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  15965301 catcaaatcat 15965311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 15969126 - 15969235
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15969126 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15969224  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  15969225 catcaaatcat 15969235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 15973050 - 15973159
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15973050 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15973148  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  15973149 catcaaatcat 15973159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16749870 - 16749761
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  16749870 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 16749772  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  16749771 catcaaatcat 16749761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Original strand, 17737237 - 17737294
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17737237 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 8499519 - 8499697
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  8499519 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 8499616  T
Q  106 gcaagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||| |||||  |||||| || ||| | |||||     ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  8499617 gcaagtcaatcaatgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 8499697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12119886 - 12119768
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12119886 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
Q  106 gcaagtc-atcaacatctcaa 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  12119788 gcaagtcaatcaacgtctcaa 12119768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 15412430 - 15412548
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15412430 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15412527  T
Q  106 gcaagtc-atcaacatctcaa 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  15412528 gcaagtcaatcaacgtctcaa 15412548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 10556986 - 10557033
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10556986 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 10557033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16750464 - 16750390
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 154  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||    
T  16750464 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatgtatat 16750390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 45577999 - 45577952
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45577999 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 45577952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12852413 - 12852300
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata----caactatataacattataa 174  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||    ||| |||||||||||| ||    
T  12852413 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatatatccaattatataacattaaaa 12852315  T
Q  175 acaacatcaattcat 189  Q
    | | |||||| ||||    
T  12852314 aaatcatcaaatcat 12852300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Original strand, 45797242 - 45797337
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  45797242 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaactatataacattataa 45797337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16750068 - 16749994
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 154  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  16750068 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 16749994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 44494810 - 44494857
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  44494810 catcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac 44494857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919393
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatag 13919393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Original strand, 14501198 - 14501293
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  14501198 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaattatataacattataa 14501293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10659 - 10423
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10659 acatcaccatcttcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 10560  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10559 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 10460  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10459 ggaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 129908 - 130144
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129908 acatcttcatcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 130007  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130008 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 130107  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  130108 ggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 130144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60649
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaaca 60720  T
Q  120 tctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  60719 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcat 60649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 21565545 - 21565781
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565545 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 21565744  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21565745 agaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaa 21565781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 19668902 - 19669136
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668902 catcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatg 19669001  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca--attcatatgcatcagtcttac 204  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19669002 caa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatattcatatgcatcagtcttac 19669098  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  19669099 tggaacaacaacaacaagataaacgacttagtttctaa 19669136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22959650 - 22959421
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22959650 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaat 22959551  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22959550 gcaa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattttaaccaacattgattcatatgcatcagtcttact 22959454  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagttt 238  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  22959453 ggaacaaaaacaacaagataaacaacttggttt 22959421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21329614 - 21329381
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  21329614 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatt 21329515  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||||    
T  21329514 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactg 21329415  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21329414 aaacaacaacaacaagataaacaacttagtttct 21329381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21502273 - 21502041
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21502273 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcgaatg 21502174  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 205  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||    
T  21502173 caagtcatcatcatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 21502074  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagttt 238  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21502073 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 21502041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19660952 - 19660720
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||     
T  19660952 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcgaata 19660853  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19660852 taa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactg 19660756  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19660755 gaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 19660720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011917
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  26012154 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatcaaa 26012055  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 204  Q
    ||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||  | ||||   |||| |||||    
T  26012054 tgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggcttac 26011955  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || |||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26011954 tgaaacaacaataacaagataaacaacttagtttctaa 26011917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026824
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaaca 20026944  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||   |||| ||||||| |||||| |||      
T  20026943 tcacaac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaactacaac 20026845  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20026844 aagataaacaacttagtttct 20026824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178103
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 22178224  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||   | ||  |||||| ||||||||||||    
T  22178223 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatataatttaggtttactgaaacaacaacagt 22178124  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22178123 aagataagcaacttagtttct 22178103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144236
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatc 22144167  T
Q  122 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22144168 tcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcat 22144236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 40725871 - 40726040
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||| | ||||||    
T  40725871 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 40725970  T
Q  121 ctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40725971 ctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 40726040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23390613 - 23390491
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23390613 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23390515  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  23390514 gcaattcatcaacatcttaaatat 23390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Original strand, 36314581 - 36314678
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36314581 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 24493573 - 24493694
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  24493573 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 24493671  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  24493672 caagtcaacaacatcttaaatat 24493694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8286960 - 8286829
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| |     
T  8286960 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaat 8286862  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacat 136  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8286861 tgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacat 8286829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 264929 - 264753
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  264929 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 264753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21729181 - 21729059
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |    
T  21729181 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 21729083  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  21729082 gcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21808506 - 21808384
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |    
T  21808506 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 21808408  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  21808407 gcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 29329935 - 29330111
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29329935 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29330111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 39363385 - 39363561
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  39363385 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 39363561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 13025315 - 13025436
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||    
T  13025315 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatg 13025413  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  13025414 caagtcaacaacatcttaaatat 13025436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 13095499 - 13095620
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||    
T  13095499 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatg 13095597  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  13095598 caagtcaacaacatcttaaatat 13095620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22412188 - 22412309
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  22412188 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataa-caacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 22412286  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  22412287 caagtcaacaacatctcaaatat 22412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 21997651 - 21997547
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21997651 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21997553  T
Q  106 gcaagt 111  Q
    ||||||    
T  21997552 gcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 1096474 - 1096649
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||| || ||| | |||| |||||| ||||||    
T  1096474 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgca 1096572  T
Q  109 agtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    | ||| |||||||||| |||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  1096573 aatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 1096649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11581360 - 11581183
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11581360 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 185  Q
    ||||||||  ||| |||||| || |||   |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaat 11581183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 24529224 - 24529339
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| |||    
T  24529224 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  106 gcaagtcatcaacatct 122  Q
    |||||||| ||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 9077956 - 9078074
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  9077956 catcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagt 9078054  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  9078055 gcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10733101 - 10732944
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  10733101 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatat 164  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10732944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 20909013 - 20909189
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20909013 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caaaagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 20909189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 25421536 - 25421658
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  25421536 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 25421634  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||||    
T  25421635 gcaagtcaacagcatcttaaatat 25421658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Original strand, 29448054 - 29448192
Alignment:
Q  55 caacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtat 152  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||    
T  29448054 caacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcat 29448153  T
Q  153 atacaactatataacattataaacaacatcaattcatat 191  Q
    |||||| || || || |||| | ||||||||| ||||||    
T  29448154 atacaaatacatcaccttattatcaacatcaaatcatat 29448192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 42245526 - 42245350
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  42245526 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 42245350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 29345981 - 29346157
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29345981 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-caacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29346157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21871616 - 21871507
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21871616 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacataattcatgcaatatatatcgaattatataacattataaatat 21871518  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||||||||    
T  21871517 catcaattcat 21871507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21875896 - 21875787
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21875896 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacataattcatgcaatatatatcgaattatataacattataaatat 21875798  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||||||||    
T  21875797 catcaattcat 21875787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20902159 - 20901988
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  20902159 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaaca 20902062  T
Q  117 acatctcaa--atatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    || ||||||  || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  20902061 acgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 20901988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Original strand, 22075035 - 22075145
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 117  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||    
T  22075035 caacttagaccgactcattcagcttagttaaataa-caacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 22075133  T
Q  118 catctcaaatat 129  Q
    ||||| ||||||    
T  22075134 catcttaaatat 22075145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 29348454 - 29348630
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29348454 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29348630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 29350927 - 29351103
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29350927 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29351103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 39245137 - 39245242
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  39245137 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
Q  106 gcaagtca 113  Q
    ||||||||    
T  39245235 gcaagtca 39245242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2154775 - 2154593
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  2154775 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa--atatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2154677 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 2154593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 10753594 - 10753703
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  10753594 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 10753692  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  10753693 catcaaatcat 10753703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 127
Target Start/End: Original strand, 25431414 - 25431518
Alignment:
Q  23 ttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||    
T  25431414 ttagaccgactcatgcatcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 25431512  T
Q  122 tcaaat 127  Q
    | ||||    
T  25431513 ttaaat 25431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36154941 - 36154777
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||| ||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  36154941 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 36154777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 32027394 - 32027570
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  32027394 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataa-caacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
     ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 32027570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 20918109 - 20918052
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20918109 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 20918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22120240 - 22120131
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  22120240 aatcatcat-atataacaattacaaatgaacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 22120142  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  22120141 catcaaatcat 22120131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18319185 - 18319027
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-at 114  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||| ||    
T  18319185 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 18319088  T
Q  115 caacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  18319087 caacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 18319027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21741541 - 21741486
Alignment:
Q  115 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacatta 171  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21741541 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10775837 - 10775790
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10775837 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 10775790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21293086 - 21293020
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    ||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21293086 catcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064559
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 23064559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 38619435 - 38619482
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38619435 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 38619482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 75
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37723975
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 75  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20766175 - 20766115
Alignment:
Q  69 acagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20766175 acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24767359 - 24767287
Alignment:
Q  103 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 175  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  24767359 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 24767287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Original strand, 31061069 - 31061124
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaa 63  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31061069 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaa 31061124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 184
Target Start/End: Original strand, 36314670 - 36314728
Alignment:
Q  125 aatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36314670 aatatcgaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 36314728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 26704074 - 26704122
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26704074 acatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 26704122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 26973807 - 26973855
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26973807 acatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 26973855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681246
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681010 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 33681109  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681110 gcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 33681209  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33681210 agaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaa 33681246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237867
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237630 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 22237729  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  22237730 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaattcatatgtatcagtctcgct 22237829  T
Q  206 ggaacaacaa-cagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22237830 ggaacaacaatcagcaagataaacaacttagtttctaa 22237867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 52928088 - 52927864
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928088 acatcaccatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 52927989  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
                |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927988 ------------catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 52927901  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  52927900 ggaacaacaatagcaagataaacaacttagtttctaa 52927864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 20248282 - 20248514
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248282 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    ||||   ||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20248382 gcaa---atcaacaacttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacatggattcatatgcatcagtcttact 20248478  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  20248479 gg-acaacaacatcaagataaataacttagtttctaa 20248514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22921987 - 22921751
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921987 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacaaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 22921789  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22921788 tgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 22921751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754274
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa 21754151  T
Q  110 gtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 209  Q
     ||| ||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754152 -tcaacaacatctcaattatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 21754241  T
Q  210 caacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21754242 caatgacagcaagataaacaacttagtttctaa 21754274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918840
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa---atcaac 20918716  T
Q  119 atctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 218  Q
    | ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||     
T  20918717 aactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatcaattcataagcatgagtcttactggaacattaacaa 20918816  T
Q  219 taagataaacaacttagtttctaa 242  Q
     ||| ||||| |||||||||||||    
T  20918817 caaggtaaacgacttagtttctaa 20918840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861453
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21861573  T
Q  122 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 220  Q
    ||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||    |||| ||||||| |||||||| || |    
T  21861572 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatagca 21861473  T
Q  221 agataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21861472 agataaacaacttagtttct 21861453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896142
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21896259  T
Q  122 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 220  Q
    ||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||| ||||||| |||||||||   |    
T  21896258 tcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactgaaacaacaac---a 21896162  T
Q  221 agataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21896161 agataaacaacttagtttct 21896142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295495
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaac---ttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 102  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 14295573  T
Q  103 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14295572 aatgtaa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 14295495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16368401 - 16368170
Alignment:
Q  10 catcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  16368401 catcatcattcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatg 16368303  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
    ||| ||| |||||||||||  |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| |||||||    
T  16368302 caaatcaacaacatctcaac-atcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactg 16368204  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16368203 aaacaacaacagtaagataaacaacttaatttct 16368170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261015
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacatc 35261084  T
Q  122 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||| | ||| |||||||||  |||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35261083 tcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcat 35261015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758839
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||  || |    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatat 191  Q
    |||||| |||   ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16758764 aacatcacaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatat 16758839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049933
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||  |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  41050038 tctcaac-atcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 41049940  T
Q  220 aagataa 226  Q
    |||||||    
T  41049939 aagataa 41049933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50613999
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50614120  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  | ||||||||| ||||||   |||| ||||||| |  |||||| ||    
T  50614119 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacggt 50614020  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  50614019 aagacaaacaacttagtttct 50613999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621827
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50621948  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  | ||||||||| ||||||   |||| ||||||| |  |||||| ||    
T  50621947 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacggt 50621848  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  50621847 aagacaaacaacttagtttct 50621827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686850
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||    |||  |  ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaatagttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaaca 50686729  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||   ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  50686730 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 50686829  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  50686830 aagataagcaacttagtttct 50686850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 118
Target Start/End: Original strand, 21161719 - 21161830
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21161719 acatcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaa-acagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaat 21161817  T
Q  106 gcaagtcatcaac 118  Q
    |||| ||||||||    
T  21161818 gcaattcatcaac 21161830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22130976 - 22130844
Alignment:
Q  55 caacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 154  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  22130976 caacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatat 22130880  T
Q  155 acaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22130879 acaattatataacattataagcaacatcaaatcata 22130844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 50210330 - 50210212
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  50210330 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50210232  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  50210231 gcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Original strand, 433013 - 433193
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     |||||| || |||||| ||||  ||||| || |||| |||||| |||    
T  433013 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcat 433193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21475248 - 21475072
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21475248 catcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21475072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23593896 - 23593719
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23593896 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 23593719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 34509784 - 34509899
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| |||    
T  34509784 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  106 gcaagtcatcaacatct 122  Q
    |||||||| ||||||||    
T  34509883 gcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 13988867 - 13989043
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13988867 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 13989043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21923452 - 21923276
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21923452 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21923276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45574989 - 45574836
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||| | ||||||||||| |||| |    
T  45574989 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgt 45574891  T
Q  121 ctcaaatatcaa-acataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    ||||| ||| || | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  45574890 ctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 45574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22532273 - 22532395
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22532273 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccatt 22532371  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  22532372 gcaattcaacaacatcttaaatat 22532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27250846 - 27250724
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  27250846 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 27250748  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  27250747 gcaattcatcaacatcttaaatat 27250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 29776689 - 29776865
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  29776689 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29776865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 31612314 - 31612490
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  31612314 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 31612490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130741
Alignment:
Q  71 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacatt 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 51130728  T
Q  171 ataaacaacatcaa 184  Q
    || |||||||||||    
T  51130729 at-aacaacatcaa 51130741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 16361928 - 16362095
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  16361928 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-cgacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 16362025  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  16362026 aacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 16362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 21840778 - 21840885
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  21840778 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 21840875  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  21840876 aacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 29298138 - 29298304
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29298138 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 29298304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093826
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat-caac 118  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||  ||| || |||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaac 16093889  T
Q  119 atctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 181  Q
    |||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  16093888 atctcaaacatcataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacat 16093826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20847271 - 20847205
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20847271 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 21026684 - 21026806
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| |||||  |||  ||||| | |    
T  21026684 catcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaatt 21026782  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  21026783 gcaattcaacaacatcttaaatat 21026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 172
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065108
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||   |||  |  |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaatacc-aatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  122 tcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattat 172  Q
    ||||| |||| | |||||||  |||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  26065058 tcaaagatcatatataattcaagtaatacatatacaaatatatcacattat 26065108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1925005 - 1924896
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  1925005 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 1924907  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  1924906 catcaaatcat 1924896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 240
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271784
Alignment:
Q  88 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattc 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |   |||| |   ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatatttacgtataactaaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactc 12271738  T
Q  188 atatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    |       ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  12271739 a-------cagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttct 12271784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20924019 - 20923910
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  20924019 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 20923921  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  20923920 catcaaatcat 20923910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13213023 - 13212841
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13213023 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 13212926  T
Q  106 gcaagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||| |||||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  13212925 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 13212841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20454660 - 20454610
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20454660 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatag 20454610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22123229 - 22123052
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  22123229 catcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 22123131  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||  |||||| || ||| |  ||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22123130 gcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 22123052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41387924 - 41387815
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  41387924 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 41387826  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  41387825 catcaaatcat 41387815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Original strand, 21346962 - 21347144
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21346962 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaaagacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21347059  T
Q  106 gcaagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||| |||||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21347060 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 21347144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 242
Target Start/End: Original strand, 20636956 - 20637087
Alignment:
Q  110 gtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 209  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||   |||    |||| ||||||||||    
T  20636956 gtcaacaacatcccaaata-caaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaatacaattcaggcttactggaa 20637054  T
Q  210 caacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
      ||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  20637055 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaa 20637087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 38801481 - 38801433
Alignment:
Q  31 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa 79  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  38801481 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 21342097 - 21342144
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21342097 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 21342144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 21707168 - 21707215
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21707168 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 21707215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 21711710 - 21711757
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21711710 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 21711757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35981696 - 35981631
Alignment:
Q  115 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  35981696 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacat 35981631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 181
Target Start/End: Original strand, 49261452 - 49261517
Alignment:
Q  115 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  49261452 caacatctcaaatatcaa-cataatttatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacat 49261517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 21714545 - 21714593
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21714545 acatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 21714593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 15860170 - 15860123
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15860170 catcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac 15860123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 41388122 - 41388048
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 154  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  41388122 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 41388048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39244008 - 39243943
Alignment:
Q  89 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 154  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  39244008 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 39243943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39247563 - 39247498
Alignment:
Q  89 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 154  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  39247563 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 39247498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16275525 - 16275407
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  16275525 catcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataa-caacaacgacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 16275428  T
Q  106 gcaagtc-atcaacatctcaa 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  16275427 gcaagtcaatcaacgtctcaa 16275407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45910 - 45674
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45910 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaattatcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 45711  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  45710 ggaacaattacagcaatataaacaacttagtttctaa 45674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22788 - 22556
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22788 acatcatcaccttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 22689  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  22688 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca----atatgcatcagtcttact 22593  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  22592 ggaacagcaacatcaagacaaacaacttagtttctaa 22556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 82073 - 82255
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  82073 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 82255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 160685 - 160922
Alignment:
Q  4 ggacatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  160685 ggacatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaa 160784  T
Q  104 atgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctta 203  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160785 atgcaa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctta 160883  T
Q  204 ctggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  160884 ccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaa 160922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 501095 - 501261
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  501095 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 501192  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  501193 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 501261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 85741 - 85559
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  85741 catcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
Q  106 gcaagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||| |||||| ||| || || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 85559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Original strand, 6822 - 7048
Alignment:
Q  13 catcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 112  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  6822 catcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaa--- 6918  T
Q  113 atcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaa 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6919 atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacaa 7018  T
Q  213 caacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7019 caacagcaagataaacaacttagtttctaa 7048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 237
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8249
Alignment:
Q  85 catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |     
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattag 8196  T
Q  185 ttcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtt 237  Q
     | ||||   |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8197 attatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagtt 8249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 132 - 367
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132 acatcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcatatgtatcagtctcact 331  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  332 agaacaacaacagcaagat-aacaactcagtttctaa 367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 78)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 19652198 - 19652432
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652198 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| | | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatctcaaacatc-aacataatccatttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 19652395  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19652396 ggaacaataacagcaagataaacaacttagtttctaa 19652432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28496588 - 28496356
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28496588 catcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 28496489  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28496488 taa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtcttactg 28496392  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28496391 gaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 28496356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29808999 - 29808767
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29808999 catcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 29808900  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29808899 taa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtcttactg 29808803  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29808802 gaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 29808767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 1561307 - 1561540
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1561307 catcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 1561406  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1561407 caa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtcttact 1561503  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1561504 ggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaa 1561540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109378
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||    
T  20109140 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatcaaa 20109239  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatataca--actatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20109240 tgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgatatacatcagtct 20109339  T
Q  202 tactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    |||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20109340 tactagaaagacatcagcaagataaacaacttagtttct 20109378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668609
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 215  Q
    |||||| |||  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19668486 aacatcacaac-atcatacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaacaa 19668584  T
Q  216 cagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  19668585 cagcaagataaacaacttagtttct 19668609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019645
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  23019408 acatcatcatctttcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaa 23019507  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 204  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |  | ||||   |||| |||||    
T  23019508 tgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggcttac 23019607  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23019608 tgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 23019645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27333335 - 27333238
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333335 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27394075 - 27393978
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394075 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098466
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  ||| |    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacatta 171  Q
    ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9098520 aacttcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacatta 9098466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644508
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  117 acatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||||||||| | ||| | |||||||  ||||||  ||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaatcat 25644508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4185939 - 4185827
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4185939 acatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaat 4185840  T
Q  106 gcaagtcatcaac 118  Q
    |||| ||||||||    
T  4185839 gcaattcatcaac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 4186376 - 4186482
Alignment:
Q  12 tcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 111  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4186376 tcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaatt 4186475  T
Q  112 catcaac 118  Q
    |||||||    
T  4186476 catcaac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8227625 - 8227445
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 109  Q
    |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||    
T  8227625 catcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaa 8227526  T
Q  110 gtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    || | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8227525 gtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 8227445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 22782228 - 22782410
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22782228 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 22782410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076969
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | ||| |||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
     || ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagt 23076948  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  23076949 aagataagcaaattagtttct 23076969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 29060544 - 29060662
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  29060544 catcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29060642  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  29060643 gcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 31155515 - 31155403
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaa-cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31155515 acatcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgatataacaatatcgaa 31155417  T
Q  105 tgcaagtcatcaac 118  Q
    ||||| ||||||||    
T  31155416 tgcaattcatcaac 31155403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008387
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | |||  ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
     || ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  35008267 acttaaacatcatatataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaataacagt 35008366  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  35008367 aagataagcaacttagtttct 35008387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20557053 - 20556873
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| |||    
T  20557053 catcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  20556955 gcaagtcaacaacgtctc-aatttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 20556873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2291341 - 2291165
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  2291341 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 2291165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 12742318 - 12742494
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12742318 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 12742494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 16496248 - 16496370
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |    
T  16496248 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 16496346  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  16496347 gcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18334753 - 18334577
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18334753 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 18334577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18409944 - 18409826
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18409944 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaat 18409846  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  18409845 gcaagtcaacaacatctcaa 18409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 19005047 - 19005223
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  19005047 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 19005223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19859080 - 19858904
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  19859080 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 19858904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 24422548 - 24422724
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  24422548 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24422724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 33861795 - 33861971
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  33861795 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 33861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 33864279 - 33864455
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  33864279 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 33864455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19303657 - 19303540
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  19303657 catcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 19303559  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaa 125  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  19303558 caagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Original strand, 20076704 - 20076805
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  20076704 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 20076802  T
Q  107 caa 109  Q
    |||    
T  20076803 caa 20076805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30676861 - 30676695
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  30676861 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaac 30676764  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  30676763 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 30676695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20638400 - 20638285
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  20638400 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 20638302  T
Q  106 gcaagtcatcaacatct 122  Q
    |||| | ||||||||||    
T  20638301 gcaatttatcaacatct 20638285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 1595550 - 1595726
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  1595550 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 1595726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 8055030 - 8055206
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  8055030 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 8055206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25629472 - 25629354
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  25629472 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatta-caacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaat 25629374  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  25629373 gcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26924801 - 26924625
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  26924801 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 26924625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668217
Alignment:
Q  58 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675064
Alignment:
Q  58 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17287913 - 17287791
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | |    
T  17287913 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaatt 17287815  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||||    
T  17287814 gcaagtcaacatcatcttaaatat 17287791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20361069 - 20360955
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 113  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  20361069 tcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattca 20360971  T
Q  114 tcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||| ||||||    
T  20360970 tcaacatcttaaatat 20360955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22080800 - 22080621
Alignment:
Q  62 aacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca-agtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaact 160  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||   |||||||  | |||||||||||||  |    
T  22080800 aacataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcgaatgcacag--aacaacatctcaaacatc-gtcataattaatataatgtatatacattt 22080704  T
Q  161 atataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||||||||  |||| ||| |  ||||||  | | || ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  22080703 atataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggcttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttctaa 22080621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456901
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18456833 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 18456901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 111
Target Start/End: Original strand, 25656630 - 25656733
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  25656630 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  106 gcaagt 111  Q
    ||||||    
T  25656728 gcaagt 25656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 25754810 - 25754992
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  25754810 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 25754992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 34963384 - 34963550
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  34963384 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 34963481  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34963482 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 34963550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1541072 - 1540896
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| |||    
T  1541072 catcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatat-aacaacatcaa 1540896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 20593777 - 20593895
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20593777 catcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 20593875  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  20593876 gcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 22949375 - 22949484
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  22949375 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 22949473  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  22949474 catcaaatcat 22949484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 22953331 - 22953440
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  22953331 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 22953429  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  22953430 catcaaatcat 22953440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 23871819 - 23871928
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  23871819 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 23871917  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  23871918 catcaaatcat 23871928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 23875775 - 23875884
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  23875775 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 23875873  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  23875874 catcaaatcat 23875884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27325479 - 27325370
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||| |||||| || |||||||||||||||| |     
T  27325479 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattaatgcaatatatatataattatataacattataaatat 27325381  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  27325380 catcaaatcat 27325370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 25688513 - 25688620
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |    
T  25688513 atcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaac 25688610  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  25688611 aacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16920747 - 16920634
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||||| |||     
T  16920747 catcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa--catcatgacataagtatatcaaatt 16920650  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    | | ||||||||||||    
T  16920649 ccattcatcaacatct 16920634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 35245590 - 35245703
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| | |     
T  35245590 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa--caacatgacataataatatcaattt 35245687  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  35245688 caattcatcaacatct 35245703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 191
Target Start/End: Original strand, 18706387 - 18706493
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 183  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  18706387 tcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatgacattattaacaacatca 18706485  T
Q  184 attcatat 191  Q
    | ||||||    
T  18706486 aatcatat 18706493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 16760525 - 16760634
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  16760525 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 16760623  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  16760624 catcaaatcat 16760634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 158
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462031
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaa 158  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||||||    
T  18461993 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaa 18462031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Original strand, 25714421 - 25714478
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25714421 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3852178 - 3852011
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| || | |||||  |||    
T  3852178 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 3852011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103796
Alignment:
Q  145 taatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataa 226  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28103877 taatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 28103796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16448678 - 16448520
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-at 114  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||| ||    
T  16448678 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 16448581  T
Q  115 caacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  16448580 caacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 16448520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 192
Target Start/End: Original strand, 18696569 - 18696676
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 183  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||| || |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| |    
T  18696569 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T
Q  184 attcatatg 192  Q
    | |||||||    
T  18696668 aatcatatg 18696676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Original strand, 22831524 - 22831568
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22831524 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 22831568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Original strand, 18204159 - 18204294
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca-tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatc 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | ||| || || ||| ||| |||| | |||||||   ||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  18204159 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18204258  T
Q  183 aattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 218  Q
    || |||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  18204259 aaatcatttacatcagacttactgaaacaacaacag 18204294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22780344 - 22780297
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22780344 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac 22780297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 189
Target Start/End: Original strand, 16624583 - 16624669
Alignment:
Q  103 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  16624583 aatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 16624669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31477686 - 31477577
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||  || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  31477686 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacaaaatttatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 31477588  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  31477587 catcaaatcat 31477577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 66
Target Start/End: Original strand, 11185515 - 11185568
Alignment:
Q  13 catcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacat 66  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11185515 catcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 101
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443146
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatc 33443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18177712 - 18177577
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca-tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatc 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | ||| || || ||| ||| |||| | |||||||   ||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  18177712 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18177613  T
Q  183 aattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 218  Q
    || |||| |  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  18177612 aaatcatttatatcagacttactgaaacaacaacag 18177577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18199456 - 18199321
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca-tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatc 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | ||| || || ||| ||| |||| | |||||||   ||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  18199456 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18199357  T
Q  183 aattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 218  Q
    || |||| |  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  18199356 aaatcatttatatcagacttactgaaacaacaacag 18199321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821904
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 18821904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 154
Target Start/End: Original strand, 16624371 - 16624436
Alignment:
Q  89 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 154  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  16624371 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 16624436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 175
Target Start/End: Original strand, 21939488 - 21939553
Alignment:
Q  110 gtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 175  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  21939488 gtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 21939553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 4738675 - 4738631
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaa 50  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  4738675 acatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaa 4738631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Original strand, 1096 - 1319
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1096 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaggtcatca 1195  T
Q  117 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 216  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1196 acatttcaaacatcaaacataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttactggaacaacaac 1295  T
Q  217 agtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    |  |||||||| ||||||||||||    
T  1296 aacaagataaaaaacttagtttct 1319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 77)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 8846359 - 8846611
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataac---------- 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||              
T  8846359 acatcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaat 8846458  T
Q  96 ------aatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8846459 gctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcat 8846558  T
Q  190 atgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  8846559 atgcatcagtcttactggaacaacaactacaagataaacaacttagtttctaa 8846611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 12774010 - 12774236
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774010 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 12774109  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
     ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774110 acaa-tcaacaacatctcaattatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 12774199  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12774200 ggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 12774236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198438
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  116 aacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 214  Q
    || ||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcattagtcttactggaacatca 43198462  T
Q  215 acagtaagataaacaacttagttt 238  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  43198461 acaacaagataaacaacttagttt 43198438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13734
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 13854  T
Q  122 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 220  Q
    ||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||  |    
T  13853 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataa 13754  T
Q  221 agataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13753 agataaacaacttagtttct 13734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288094
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 215  Q
    |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||||| ||||||||    
T  12288216 aacatcacaac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 12288118  T
Q  216 cagtaagataaacaacttagtttc 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  12288117 cagcaagataaacaacttagtttc 12288094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39706405 - 39706179
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706405 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 39706306  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||| ||||||     
T  39706305 caagtcatgaacatcataaacatc-aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggcttacta 39706207  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaactta 234  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39706206 aaacaacaacagcaagataaacaactta 39706179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 15551821 - 15552052
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |    
T  15551821 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcgaagg 15551920  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  15551921 taa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgattcataagcatcagtcttactg 15552017  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    | |||  ||||| | | | |||||||||||||||||    
T  15552018 ggacattaacagcagggt-aacaacttagtttctaa 15552052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 242
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596884
Alignment:
Q  41 cttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataatt 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||   |||| |||||||| ||| |    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaagt 16596782  T
Q  141 cgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16596783 catgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttataagcatcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttct 16596882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243128
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||| |    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||||||| | ||| | ||||| |  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52243202 aacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 52243128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082035
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||  ||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataaca 53082156  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  53082155 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 53082056  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  53082055 aagataagcaacttagtttct 53082035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640339
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |||  ||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataaca 46640459  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||| || ||||||||||| ||||||   ||||  |||||| ||||| ||||||    
T  46640458 tctcaac-atcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaataacagt 46640360  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  46640359 aagataagcaacttagtttct 46640339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 7798778 - 7798900
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7798778 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7798876  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  7798877 gcaagtcatcaacatcttaaatat 7798900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16377630 - 16377522
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||     
T  16377630 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 16377533  T
Q  115 caacatctcaa 125  Q
    |||||||||||    
T  16377532 caacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 44615289 - 44615465
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44615289 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 44615465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16240086 - 16239965
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  16240086 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataa-caatagcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 16239988  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  16239987 caagtcaacaacatcttaaatat 16239965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18215435 - 18215253
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18215435 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 18215253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 7088881 - 7088996
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7088881 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7088979  T
Q  106 gcaagtcatcaacatct 122  Q
    |||| ||||||||||||    
T  7088980 gcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 44929041 - 44928866
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||| || |||    
T  44929041 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 181  Q
    ||||||||  |||||||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacat 44928866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15118513 - 15118337
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15118513 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15118337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22636439 - 22636561
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22636439 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22636537  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  22636538 gcaattcatcaacatcttaaatat 22636561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44773248 - 44773072
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44773248 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 44773072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 52312511 - 52312687
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  52312511 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 52312687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 6899895 - 6900016
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || |||   |||| |||||| ||||    
T  6899895 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatcaaatg 6899993  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  6899994 caagtcaacaacatcttaaatat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16270352 - 16270231
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  16270352 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 16270254  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||| | |||||||| ||||||    
T  16270253 caagttaacaacatcttaaatat 16270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 52873484 - 52873363
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  52873484 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 52873386  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata 128  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  52873385 gcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12468 - 12301
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12468 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 12301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1837670 - 1837494
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||| | |||    
T  1837670 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattat-aacaacatcaa 1837494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 12902761 - 12902883
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  12902761 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 12902859  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    | || |||||||||||| ||||||    
T  12902860 gtaattcatcaacatcttaaatat 12902883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 14280317 - 14280438
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14280317 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 54798871 - 54798749
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  54798871 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatat 54798749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 19242700 - 19242872
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  19242700 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19242797  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaac 179  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  19242798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaac 19242872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19618323 - 19618216
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  19618323 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 19618226  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  19618225 aacgtctcaa 19618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 50222500 - 50222333
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  50222500 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 50222333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 7893707 - 7893829
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7893707 catcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7893805  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||||    
T  7893806 gcaagtcaacatcatcttaaatat 7893829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18239580 - 18239404
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18239580 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 18239404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 44052833 - 44052955
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  44052833 catcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataa-caacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 44052931  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  44052932 gcaattcatcaacatcttaaatat 44052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 630819 - 630710
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  630819 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatgcatgcaatatatatccaattatataacattataaataa 630721  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  630720 catcaaatcat 630710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8574984 - 8574864
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  8574984 catcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 8574887  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
     || ||| |||||||||||||||    
T  8574886 taattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  8 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaa 125  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 3096297 - 3096369
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 80  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3096297 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374354
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 108  Q
    |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  109 agtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    | ||| |||||||| ||||||    
T  23374374 attcaacaacatcttaaatat 23374354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 3515008 - 3515184
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||| || || || |||| |||||| |||    
T  3515008 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa-aaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 3515184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 3331961 - 3332070
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  3331961 aatcatcat-atataacaattacaaatgcatgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 3332059  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  3332060 catcaaatcat 3332070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14954006 - 14953897
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  14954006 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 14953908  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  14953907 catcaaatcat 14953897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15355476 - 15355309
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-at 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||| ||    
T  15355476 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 15355379  T
Q  115 caacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15355378 caacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15355309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 25690137 - 25690246
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  25690137 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 25690235  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  25690236 catcaaatcat 25690246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 14970858 - 14970751
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  14970858 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 14970761  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  14970760 aacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Original strand, 17046491 - 17046552
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046491 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 17046552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 51464029 - 51463847
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  51464029 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 51463847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13812854 - 13812759
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 175  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  13812854 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 13812759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 7641343 - 7641286
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7641343 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 10713083 - 10713192
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  10713083 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 10713181  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  10713182 catcaaatcat 10713192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 10926853 - 10926962
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  10926853 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 10926951  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  10926952 catcaaatcat 10926962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Original strand, 12610951 - 12611008
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12610951 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 181
Target Start/End: Original strand, 15099461 - 15099526
Alignment:
Q  115 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  15099461 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacat 15099526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 181
Target Start/End: Original strand, 15190428 - 15190493
Alignment:
Q  115 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  15190428 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacat 15190493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 15225308 - 15225417
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15225308 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15225406  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  15225407 catcaaatcat 15225417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 23803426 - 23803369
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23803426 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 23803369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 184
Target Start/End: Original strand, 12487941 - 12488045
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  12487941 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 12488039  T
Q  179 catcaa 184  Q
    ||||||    
T  12488040 catcaa 12488045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14053418 - 14053306
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  14053418 catcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaattt 14053320  T
Q  107 caagtcatcaacat 120  Q
    ||| ||||||||||    
T  14053319 caattcatcaacat 14053306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 44102215 - 44102382
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44102215 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaataacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||||| | |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 44102382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15868754 - 15868645
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  | | | |||||||| || |||  |||| ||| |||||||||||||||| |     
T  15868754 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcagcgaccataattcatgcaataaatatccaattatataacattataaatat 15868656  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||||||||    
T  15868655 catcaattcat 15868645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464865
Alignment:
Q  85 catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||| | |||||||  ||| || |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatcaaattttaaacgacatca 15464871  T
Q  184 attcat 189  Q
    | ||||    
T  15464870 aatcat 15464865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Original strand, 32851450 - 32851545
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  32851450 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaactatataacattataa 32851545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Original strand, 14164732 - 14164783
Alignment:
Q  186 tcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtt 237  Q
    |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14164732 tcatatgattcaggcttactagaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 14164783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Original strand, 15225114 - 15225188
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 154  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  15225114 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 15225188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 15367708 - 15367876
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-atcaac 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15367708 acttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaac 15367805  T
Q  119 atctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
     |||||| || ||| | |||||||   ||| | |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  15367806 gtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 15367876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 15402721 - 15402889
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-atcaac 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15402721 acttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaac 15402818  T
Q  119 atctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
     |||||| || ||| | |||||||   ||| | |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  15402819 gtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 15402889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 74
Target Start/End: Original strand, 17333305 - 17333347
Alignment:
Q  31 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17333305 actcatgcagcttagttaa-taaacaacagcaacatagacagta 17333347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 68
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190527
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacatag 6190527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 125
Target Start/End: Original strand, 15370036 - 15370140
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-atcaac 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15370036 acttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaac 15370133  T
Q  119 atctcaa 125  Q
     ||||||    
T  15370134 gtctcaa 15370140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 125
Target Start/End: Original strand, 16223550 - 16223654
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-atcaac 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  16223550 acttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaatgcaagtcaatcaac 16223647  T
Q  119 atctcaa 125  Q
     ||||||    
T  16223648 gtctcaa 16223654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Original strand, 15371220 - 15371311
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 113  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15371220 acttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 15371311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Original strand, 15373501 - 15373592
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 113  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15373501 acttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 15373592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 189
Target Start/End: Original strand, 15791916 - 15791960
Alignment:
Q  145 taatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15791916 taatgcatatacaactatatcacattattaacaacatcaaatcat 15791960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20157312 - 20157240
Alignment:
Q  103 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 175  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || | | |||||  || ||||||||||||||||    
T  20157312 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcagtatatatctaattatataacattataaa 20157240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22634235 - 22634163
Alignment:
Q  103 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 175  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||  || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  22634235 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataatttatgcaatatatatctaattatataacattataaa 22634163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219599
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219835 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 16219736  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| ||||||    
T  16219735 gcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttact 16219636  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16219635 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 16219599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 18005649 - 18005885
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005649 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| |||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttac 18005847  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18005848 tgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 18005885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 811249 - 811013
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811249 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttact 811050  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    | ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  811049 gaaactacaacagcaagataaataacttagtttctaa 811013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 34200790 - 34201022
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34200790 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 34200889  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34200890 taa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactg 34200986  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    | |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34200987 ggacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 34201022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 67749 - 67983
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67749 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 67848  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 205  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| || |||    
T  67849 caaatcaacaacatctc-aatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctcact 67946  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  67947 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 67983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15755004 - 15754771
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15755004 catcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 15754905  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15754904 caa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtcttact 15754808  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15754807 ggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaa 15754771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 44014181 - 44014409
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014181 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 204  Q
    ||||   |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  44014281 gcaa---atcaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttac 44014376  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagttt 238  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44014377 tgaaacaacaacagcaagat-aacaacttagttt 44014409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 47831811 - 47832046
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47831811 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcgaatg 47831910  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |  | |||    |||| |||||||    
T  47831911 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggcttactg 47832010  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
     ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  47832011 aaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaa 47832046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11996144 - 11995912
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  11996144 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatg 11996045  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11996044 taa---atcaacaactcaaatatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactg 11995948  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    | |||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  11995947 ggacattaacagcaaggtaaacaaattagtttctaa 11995912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28505415 - 28505183
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||     
T  28505415 catcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcggata 28505316  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   |||| || ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28505315 taa---atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactg 28505219  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||   |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  28505218 gaacattgacaacaaggtaaacaacttagtttctaa 28505183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056564
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 117  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
Q  118 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaaca 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| ||||| | ||||||||||    
T  16056442 catctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaaca 16056541  T
Q  218 gtaagataaacaacttagtttct 240  Q
      |||||||||||||||||||||    
T  16056542 tcaagataaacaacttagtttct 16056564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220073
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaaca 20220194  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20220193 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactggaacaacaacagt 20220094  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  20220093 aagataagcaacttagtttct 20220073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 16495406 - 16495579
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16495406 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 16495505  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
     ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16495506 taa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 16495579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901560
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 215  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||   |||  ||||||| ||||||||    
T  12901438 aacatcacaac-atcatacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaacaa 12901536  T
Q  216 cagtaagataaacaacttagtttc 239  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  12901537 caacaagataaacaacttagtttc 12901560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Original strand, 22072917 - 22073149
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22072917 catcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 22073016  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 204  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| |||||    
T  22073017 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttac 22073116  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtt 237  Q
    || ||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22073117 tgaaacaacaacatcaagacaaacaacttagtt 22073149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 240
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116717
Alignment:
Q  88 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattc 187  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||| | |||| ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactc 15116664  T
Q  188 atatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15116665 atatacatcagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagtttct 15116717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280053
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||    
T  2280238 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatcaaa 2280139  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||||   ||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2280138 tgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 2280053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867929
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | | |    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1868002 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat 1867929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12255886 - 12255729
Alignment:
Q  31 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||  |||||||||||| |    
T  12255886 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatctcaaaca 12255787  T
Q  129 -tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 185  Q
     ||| | |||||||  |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12255786 ttcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaat 12255729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 240
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113180
Alignment:
Q  88 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattc 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| | |||| ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaactc 15113127  T
Q  188 atatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  15113128 atataaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttct 15113180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19486847 - 19486678
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||| | ||||||    
T  19486847 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 19486748  T
Q  121 ctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||| |||| | |||||||  || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19486747 ctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 19486678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044935
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtca-t 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14044859  T
Q  115 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  14044860 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354965
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtca-t 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14354889  T
Q  115 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  14354890 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Original strand, 13647344 - 13647512
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  13647344 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 13647442  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  13647443 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 13647512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 38227485 - 38227606
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  38227485 catcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 38227583  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  38227584 caagtcaacaacatcttaaatat 38227606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3564481 - 3564363
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  3564481 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  3564382 gtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 18430713 - 18430889
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  18430713 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaat 18430810  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18430811 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 18430889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 27216861 - 27217037
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  27216861 catcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 27217037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18456529 - 18456408
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  18456529 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-cgatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 18456431  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  18456430 caagtcaacaacatcttaaatat 18456408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 12698835 - 12698958
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| |     
T  12698835 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaat 12698933  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  12698934 tgcaattcatcaacatcttaaatat 12698958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 456322 - 456498
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  456322 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 456498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 9509193 - 9509315
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | || ||||| |||| |||||| | |    
T  9509193 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaatt 9509291  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  9509292 gcaattcatcaacatcttaaatat 9509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393272
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 11393272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 11972497 - 11972673
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11972497 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 11972673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14949283 - 14949107
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14949283 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 14949107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15376874 - 15376698
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15376874 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15376698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 16232521 - 16232697
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16232521 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 16232697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17062076 - 17061895
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||    
T  17062076 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcag-cagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaatg 17061978  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaa-acataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| || | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17061977 caagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 17061895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20385284 - 20385108
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20385284 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20385108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21189756 - 21189580
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21189756 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21189580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 24702239 - 24702415
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  24702239 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24702415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 32125492 - 32125668
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  32125492 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 32125668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 41522918 - 41523094
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  41522918 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 41523094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 41525380 - 41525556
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  41525380 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 41525556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008433
Alignment:
Q  26 gaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctc 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctc 15008499  T
Q  124 aaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15008498 aaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat 15008433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 18640273 - 18640440
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18640273 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 18640440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 24704689 - 24704862
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||  | || || |||| |||||| ||||    
T  24704689 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaatg 24704784  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24704785 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24704862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 48273393 - 48273511
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  48273393 catcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  48273492 gcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063757
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacat 10063822  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||||||| ||| | |||||||     |   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10063821 ctcaaatattcacatataattc-----aaacatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 10063757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Original strand, 44116510 - 44116691
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44116510 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  | |||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 44116691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 16410060 - 16410177
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16410060 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  16410158 gcaagtcaacaacgtctcaa 16410177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 24275182 - 24275289
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  24275182 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 24275279  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  24275280 aacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15144154 - 15144037
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| | || || ||||| | |||||| ||    
T  15144154 acatcatcatc-tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaa 15144058  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  15144057 tgcaagccaacaacatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16386365 - 16386242
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  16386365 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 16386266  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    | |  |||||||||||| ||||||    
T  16386265 gtatttcatcaacatcttaaatat 16386242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Original strand, 26212012 - 26212122
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 117  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||    
T  26212012 caacttagaccgactcatacaacttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 26212110  T
Q  118 catctcaaatat 129  Q
    ||||| ||||||    
T  26212111 catcttaaatat 26212122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 3386334 - 3386501
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| || | |||||| |||    
T  3386334 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||  |||||||| ||||| ||| |||||    
T  3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcacaatataa 3386501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 118
Target Start/End: Original strand, 16213685 - 16213795
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16213685 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
Q  106 gcaagtcatcaac 118  Q
     ||||||| ||||    
T  16213783 ccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 40443395 - 40443509
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  40443395 catcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaattt 40443493  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  40443494 caattcatcaacatct 40443509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 18426070 - 18426179
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  18426070 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 18426168  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  18426169 catcaaatcat 18426179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39267691 - 39267582
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||| |||||||| |     
T  39267691 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataaaattataaatat 39267593  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  39267592 catcaaatcat 39267582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45169882 - 45169773
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  45169882 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 45169784  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  45169783 catcaaatcat 45169773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 13869347 - 13869465
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13869347 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13869444  T
Q  106 gcaagtc-atcaacatctcaa 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  13869445 gcaagtcaatcaacgtctcaa 13869465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 124
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324171
Alignment:
Q  88 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 16324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 20110557 - 20110604
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20110557 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 20110604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27847947 - 27847881
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    ||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27847947 catcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 10589055 - 10589115
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 80  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  10589055 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatatgcagtatacaaa 10589115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9751572 - 9751500
Alignment:
Q  103 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 175  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  9751572 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 9751500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 18425668 - 18425743
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata 155  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  18425668 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatata 18425743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 18425870 - 18425945
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata 155  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  18425870 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatata 18425945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38898528 - 38898370
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-at 114  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||| ||    
T  38898528 atcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacgacacag-cagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 38898431  T
Q  115 caacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    ||||||||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  38898430 caacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacagtataa 38898370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 13831374 - 13831421
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13831374 catcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 13831421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 242
Target Start/End: Original strand, 16324197 - 16324244
Alignment:
Q  195 tcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16324197 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttctaa 16324244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9389705 - 9389649
Alignment:
Q  115 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattat 172  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9389705 caacatctcatatatcaa-cataattcatacaatgtatatacaattatataacattat 9389649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 18203831 - 18203882
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18203831 cttagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacaacaacatagacagta 18203882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26355816 - 26355582
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355816 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaat 26355717  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||| ||| ||||||||||   ||| |||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355716 gcaa-tcaacaacatctcagccatc-aacatattccatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 26355619  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
     |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26355618 agaacaataacaaaaagataaacaacttagtttctaa 26355582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5866391 - 5866159
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5866391 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 5866292  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5866291 taa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactg 5866195  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5866194 gaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 5866159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 21490999 - 21491231
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  21490999 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatg 21491098  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21491099 taa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataggcatcagtcttactg 21491195  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21491196 gaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 21491231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 6520372 - 6520606
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520372 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 6520471  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
    |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||||    
T  6520472 caagtcatcaacatcataaacatc-aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactg 6520570  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6520571 aaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaa 6520606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38855368 - 38855134
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855368 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 38855269  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||||    
T  38855268 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactg 38855170  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38855169 aaacaacaacagcaagataaacaacttagttcctaa 38855134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 17140920 - 17141152
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  17140920 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcgaatg 17141019  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     || ||||||||   |||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17141020 taaatcatcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactg 17141116  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17141117 gaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 17141152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498800
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 20498680  T
Q  122 tcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 220  Q
    ||||| || || | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |||||  |    
T  20498681 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtcttaccgaaacatcaacatca 20498780  T
Q  221 agataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20498781 agataaacaacttagtttct 20498800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760751
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23760962 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattgaat 23760863  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 204  Q
     ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  23760862 tcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggcttac 23760764  T
Q  205 tggaacaacaaca 217  Q
    || ||||||||||    
T  23760763 tgaaacaacaaca 23760751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116586
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37116466 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacagt 37116565  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  37116566 aagataagcaacttagtttct 37116586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Original strand, 21285611 - 21285834
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  21285611 atcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 21285710  T
Q  117 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 216  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| || |  | ||||   |||| ||||||| |||||||||    
T  21285711 acatctcaaacatcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttactgaaacaacaac 21285810  T
Q  217 agtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    |  ||||||||  |||||||||||    
T  21285811 aacaagataaagcacttagtttct 21285834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 21673707 - 21673938
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673707 acatgatcatcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21673806  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||  |||||    
T  21673807 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aatataatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttac 21673905  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagttt 238  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  21673906 tgaaacaacaacaacaagat-aacaacttagttt 21673938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 21249388 - 21249582
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21249388 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaat 21249487  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctta 203  Q
    | ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21249488 gtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctta 21249582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 21255226 - 21255420
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21255226 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaat 21255325  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctta 203  Q
    | ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21255326 gtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctta 21255420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983287
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 215  Q
    |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||   |||| ||||||| ||||||||    
T  983412 aacatcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaacaa 983314  T
Q  216 cagtaa---gataaacaacttagtttc 239  Q
    ||  ||   ||||||||||||||||||    
T  983313 caacaacatgataaacaacttagtttc 983287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266876
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |   |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| || |||| ||||||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggctcactgaaacaacaacagt 17266897  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  17266896 aagataagcaacttagtttct 17266876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508019
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13508089  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13508088 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 13508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597551
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13597621  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    | |||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13597620 cccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 13597551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353261
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 24353137  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg---gaacaacaac 216  Q
    ||||||| |||  | | ||||| ||||||| |||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||   |||| |||||||    |||||||||    
T  24353138 tctcaaacatcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaac 24353237  T
Q  217 agtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  24353238 agtaagataagcaacttagtttct 24353261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17612213 - 17612056
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||| | ||||||    
T  17612213 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacat 17612114  T
Q  121 ctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaaca 177  Q
    ||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17612113 ctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaaca 17612056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16092459 - 16092337
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16092459 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16092361  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  16092360 gcaagtcaacaacatctcaaatat 16092337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 238
Target Start/End: Original strand, 22364744 - 22364897
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 183  Q
    |||||||||||||||||| || | || ||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| || |||| ||||||||||    
T  22364744 tcatgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  184 attcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagttt 238  Q
    | ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22364843 aatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagttt 22364897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22626740 - 22626861
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||     
T  22626740 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaata 22626838  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  22626839 caaatcaacaacatcttaaatat 22626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439438
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatat 191  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||| || ||||||    
T  17439509 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatat 17439438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28649161 - 28648983
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  28649161 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 28649063  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||  ||||||| ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  28649062 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 28648983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22875069 - 22875190
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  22875069 catcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 22875167  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  22875168 caagtcaacaacatctcaaatat 22875190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 1484403 - 1484579
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  1484403 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 1484579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5853453 - 5853277
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  5853453 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 5853277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 7372782 - 7372904
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  7372782 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7372880  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||||    
T  7372881 gcaagtcaacatcatcttaaatat 7372904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14409605 - 14409429
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  14409605 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 14409429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 20403228 - 20403404
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20403228 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20403404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 20536212 - 20536334
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  20536212 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 20536310  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  20536311 gcaattcatcaacatcttaaatat 20536334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 22001754 - 22001930
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22001754 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 22001930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 31971261 - 31971375
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  31971261 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattc 31971359  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  31971360 caattcatcaacatct 31971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 26219718 - 26219838
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| ||||  |  |||| |||| |||||| ||||    
T  26219718 catcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaatg 26219815  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  26219816 caagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 6759262 - 6759368
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  6759262 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 6759360  T
Q  106 gcaagtca 113  Q
    ||||||||    
T  6759361 gcaagtca 6759368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16199761 - 16199647
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  16199761 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatcaattt 16199663  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  16199662 caattcatctacatct 16199647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18818526 - 18818404
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  18818526 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 18818428  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    | |||||| || ||||| ||||||    
T  18818427 gtaagtcaacatcatcttaaatat 18818404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20046356 - 20046180
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20046356 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || | | | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20046180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21919117 - 21918995
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  21919117 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 21919019  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  21919018 gcaattcaacaacatcttaaatat 21918995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21924045 - 21923923
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| || | |||||| | |    
T  21924045 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaatt 21923947  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  21923946 gcaagtcaacaacatcttaaatat 21923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 23406383 - 23406489
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23406383 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23406481  T
Q  106 gcaagtca 113  Q
    ||||||||    
T  23406482 gcaagtca 23406489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 21383887 - 21383996
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21383887 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21383985  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  21383986 catcaaatcat 21383996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16413467 - 16413301
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  16413467 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 16413370  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16413369 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 16413301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18879348 - 18879276
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 80  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18879348 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Original strand, 41598189 - 41598370
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  41598189 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 41598370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 4483282 - 4483457
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4483282 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 4483457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15203392 - 15203216
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  15203392 catcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    | |||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15203216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26225408 - 26225288
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||| ||| |||| ||  |||| |||| |||||| |||     
T  26225408 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgacataataatatcaaata 26225311  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  26225310 caagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21396097 - 21395984
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21396097 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaatt 21396000  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  21395999 caattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21790590 - 21790477
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21790590 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaatt 21790493  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  21790492 caattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4542534 - 4542358
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  || | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4542534 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | ||| |||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 4542358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18862521 - 18862412
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  18862521 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 18862423  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  18862422 catcaaatcat 18862412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 21387307 - 21387416
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21387307 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21387405  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  21387406 catcaaatcat 21387416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 21411180 - 21411289
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21411180 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21411278  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  21411279 catcaaatcat 21411289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 21805672 - 21805781
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21805672 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21805770  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  21805771 catcaaatcat 21805781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21827890 - 21827781
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21827890 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21827792  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  21827791 catcaaatcat 21827781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801362
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  122 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatat-aacaacatcaagtcat 19801362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 19896266 - 19896445
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatga---tataacaatatcg 102  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| | ||| || |||||    |||| ||||||     
T  19896266 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatca 19896363  T
Q  103 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  19896364 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 19896445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21389567 - 21389454
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21389567 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 21389470  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  21389469 caattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21778893 - 21778780
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  21778893 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 21778796  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  21778795 caattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 45131113 - 45131047
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45131113 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 25484429 - 25484382
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25484429 catcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataac 25484382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 14823775 - 14823941
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| |||    
T  14823775 catcatcttaatcaatttagacca-ctcatgcagcaaagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 14823941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492834
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattc 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcataaataattc 40492834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 45290846 - 45290809
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45290846 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 45290809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 125
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070677
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-atca 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 15070668  T
Q  117 acatctcaa 125  Q
    || ||||||    
T  15070669 acgtctcaa 15070677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19937167 - 19937049
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| || ||| |||    
T  19937167 catcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataagatcaaat 19937070  T
Q  106 gcaagtc-atcaacatctcaa 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  19937069 gcaagtcaatcaacgtctcaa 19937049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154936
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 75  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 12770 - 13005
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12770 catcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 12869  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||| |||||||    
T  12870 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggcttactg 12969  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12970 gaacaacaacagcaagataaaccacttagtttctaa 13005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8706
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
Q  118 catctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatataca--actatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 214  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8581 catctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacatcagtcttactggaacaaca 8680  T
Q  215 acagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
     ||| |||||||||||||||||||||    
T  8681 tcagcaagataaacaacttagtttct 8706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Original strand, 6539 - 6769
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 6638  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 205  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||    
T  6639 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 6737  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagttt 238  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6738 gaaacaacaacagcaagat-aacaacttagttt 6769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 19267 - 19503
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19267 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  |||||  ||||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttac 19465  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19466 tgaaacaacaacatcaagataaacaacttagtttctaa 19503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 100377 - 100613
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  100377 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | | || |||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatat-taacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttac 100575  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  100576 tgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaa 100613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40292 - 40056
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40292 acatcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttac 40094  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  40093 tgaaacaacaacatcaaggtaaacaacttagtttctaa 40056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 94412 - 94588
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  94412 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 94588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Original strand, 101502 - 101576
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  101502 acatcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 44455 - 44573
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44455 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  44553 tgcaagtcaacaacatctcaa 44573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 119879 - 119948
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatg 76  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  119879 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17591 - 17425
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  17591 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 17494  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17493 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacagtat-aacaacatcaa 17425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 25175853 - 25176089
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175853 acatcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 25176051  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25176052 tgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 25176089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406216
Alignment:
Q  8 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 205  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||  |  ||||| |  || || ||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttact 28406179  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28406180 aaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 28406216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22134323 - 22134099
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22134323 catcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatg 22134225  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
    ||| |||  |||||||||  |||| |||||||| | | ||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22134224 caa-tcaataacatctcatttatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacaccaattcatatgcatcagtcttactg 22134135  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22134134 gaaaaatgacagcaagataaacaacttagtttctaa 22134099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23072066 - 23071865
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  23072066 catcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaata 23071967  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   |||| || ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23071966 taa---atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactg 23071870  T
Q  207 gaaca 211  Q
    |||||    
T  23071869 gaaca 23071865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679750
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatg 7679687  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacat 169  Q
     ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7679688 taagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7824 - 7617
Alignment:
Q  33 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tca 131  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7824 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattca 7725  T
Q  132 aacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaac 231  Q
     | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  7724 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaacatgataaacaac 7625  T
Q  232 ttagtttc 239  Q
    ||||||||    
T  7624 ttagtttc 7617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786787
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 18786910  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 215  Q
    ||| || |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||   | || ||||||| ||||||||    
T  18786909 aacgtcacaac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaacaa 18786811  T
Q  216 cagtaagataaacaacttagtttc 239  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  18786810 cagcatgataaacaacttagtttc 18786787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708553
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |     
T  23708738 acatcatcatctttcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaat 23708639  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23708638 tgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcat 23708553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207515
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgaca 23207395  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||  || | | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| |||||| |||||||||||||    
T  23207396 tctcaac-attataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaacagt 23207494  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  23207495 aagataagcaacttagtttct 23207515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459445
Alignment:
Q  88 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaatt 186  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| || | |||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |    
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaact 22459499  T
Q  187 catatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22459498 cgtatacatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttct 22459445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 19671848 - 19672011
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  19671848 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 19671947  T
Q  121 ctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 185  Q
    |||||   ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19671948 ctcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattat-aacaacatcaat 19672011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791511
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  | | |||| |||||||| |||||   ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaaca 23791391  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| || | | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||      
T  23791392 tctcaaacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaac 23791491  T
Q  220 aagataaacaacttagtttc 239  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23791492 aagataaacaacttagtttc 23791511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 22105413 - 22105590
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22105413 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 22105590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109126
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   |||  |  |||||||||||||||||| ||   || ||| ||| |    
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaatagttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaata 25109005  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  25109006 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 25109105  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  25109106 aagataagcaacttagtttct 25109126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 23060517 - 23060639
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23060517 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23060615  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  23060616 gcaagtcaacaacatcttaaatat 23060639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520127
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 20520197  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  20520196 tctcaaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcat 20520127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 298932 - 298809
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  298932 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 298833  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  298832 gcaattcaacaacatcttaaatat 298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 18808944 - 18809120
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18808944 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 18809120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 23130863 - 23131039
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23130863 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 23131039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 23133330 - 23133506
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23133330 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 23133506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23709693 - 23709517
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23709693 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 23709517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23712174 - 23711998
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23712174 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 23711998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34402683 - 34402507
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  34402683 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 34402507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 39682314 - 39682490
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  39682314 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 39682490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 24367785 - 24367951
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  24367785 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 24367882  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24367883 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24367951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 571398 - 571574
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  571398 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| |  ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 571574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 6725996 - 6726172
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  6725996 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    | |||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 6726172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22337119 - 22337241
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||   ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22337119 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaat 22337217  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  22337218 gcaagacaacaacatctcaaatat 22337241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 23076446 - 23076568
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  23076446 catcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 23076544  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||    
T  23076545 gcaagtcaacaatatcttaaatat 23076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 23135591 - 23135767
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  23135591 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 23135767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 23285869 - 23285987
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  | || || |||| |||||| | ||    
T  23285869 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa--aaca-gacataataatatcaattg 23285964  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  23285965 caattcatcaacatcttaaatat 23285987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23654503 - 23654381
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| || ||||| |||||||| |||| |||||| | |    
T  23654503 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaatt 23654405  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  23654404 gcaattcatcaacatcttaaatat 23654381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 26505380 - 26505556
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  26505380 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 26505556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 26507858 - 26508034
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  26507858 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 26508034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 28577100 - 28577276
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  28577100 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||| || |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 28577276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 38231 - 38138
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 101  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38231 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21155211 - 21155045
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |    
T  21155211 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 21155114  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21155113 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21155045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413070
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatat--cgaatgcaagtcatcaa 117  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaa 22413141  T
Q  118 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22413140 catctcaac-atcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcat 22413070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32039659 - 32039477
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  32039659 catcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 32039477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24898357 - 24898180
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24898357 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24898180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24900840 - 24900663
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24900840 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24900663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24903317 - 24903140
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24903317 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24903140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24905794 - 24905617
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24905794 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24905617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24908269 - 24908092
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagc-ttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24908269 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24908092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22731351 - 22731229
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22731351 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22731253  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||| | ||||||    
T  22731252 gcaattcatcaacatattaaatat 22731229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 23660027 - 23660148
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || ||  |||| |||| |||||| ||||    
T  23660027 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaa-caacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatcaaatg 23660125  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  23660126 caaatcaacaacatcttaaatat 23660148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 32215072 - 32214906
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  32215072 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 32214975  T
Q  116 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  32214974 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 32214906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 20309112 - 20309225
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  20309112 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 20309209  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  20309210 caattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23040306 - 23040247
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacata 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040306 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24697645 - 24697538
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||| | | ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| |    
T  24697645 tcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataa 24697546  T
Q  184 attcatat 191  Q
    | ||||||    
T  24697545 aatcatat 24697538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 1283657 - 1283766
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  1283657 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 1283755  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  1283756 catcaaatcat 1283766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23103512 - 23103396
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || |  ||||| |||     
T  23103512 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacatgattatatcaaatt 23103415  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaa 125  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  23103414 caattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30344867 - 30344758
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  30344867 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 30344769  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  30344768 catcaaatcat 30344758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 8946661 - 8946733
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 80  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  8946661 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataa-caatagcaacataggcagtatacaaa 8946733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45030015 - 45029848
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  45030015 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||  ||||| ||| |||||    
T  45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcacaatataa 45029848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137467
Alignment:
Q  8 atcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-taatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    ||||||| |||| |||||| |  ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 43137467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 24643101 - 24643054
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24643101 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22738296 - 22738249
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22738296 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 22738249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 38967375 - 38967422
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38967375 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 38967422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 24529690 - 24529643
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24529690 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac 24529643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 74  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 73
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 32101 - 32330
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32101 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaa 32200  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 204  Q
    || || |||||||| |||||| |||||| |||||| | | |||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32201 tgtaa-tcatcaacgtctcaattatcaa-cataatccatttaatgtatata------tacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 32292  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32293 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 32330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10764
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
Q  118 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaaca 217  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |  | ||||   |||| ||||||| ||||||||||    
T  10642 catctcaaacatcgaacataattcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaaca 10741  T
Q  218 gtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  10742 gcaagataaacaacttagtttct 10764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 132661 - 132890
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  132661 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaa 132760  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 204  Q
    || || |||||||| |||||| |||||| |||||| | | |||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132761 tgtaa-tcatcaacgtctcaattatcaa-cataatccatttaatgtatata------tacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 132852  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132853 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 132890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 62202 - 62434
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  62202 catcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatg 62301  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 205  Q
    ||   || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| | ||||||   | |||| ||||||    
T  62302 ca---caacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttact 62397  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  62398 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 62434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 136681 - 136857
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  136681 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 136857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 139150 - 139326
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  139150 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 139326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 144088 - 144264
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  144088 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 144264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 134212 - 134388
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  134212 catcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 134388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 141619 - 141795
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  141619 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 141795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13178
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12942 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcgaat 13041  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 205  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||     |||| ||||||    
T  13042 gcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggcttact 13141  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13142 gaaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaa 13178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18277 - 18121
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 183  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  ||||||||||    
T  18277 tcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  184 attcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    |  |||||   |||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18177 aaacatataattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttct 18121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 2001 - 2233
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2001 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 2100  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  2101 taa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagacttactg 2197  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2198 gaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 2233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 11296 - 11528
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11296 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 11395  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  11396 taa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatactattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactt 11492  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  11493 gaacattaacaccaaggtaaacaacttagtttctaa 11528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 28418 - 28533
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  28418 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 28516  T
Q  106 gcaagtcatcaacatct 122  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  28517 gcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Original strand, 4556 - 4608
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaaca 59  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4556 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 53640 - 53432
Alignment:
Q  33 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tca 131  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53640 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattca 53541  T
Q  132 aacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaac 231  Q
     | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  53540 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataaagataaacaac 53441  T
Q  232 ttagtttct 240  Q
    |||||||||    
T  53440 ttagtttct 53432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8330 - 8230
Alignment:
Q  89 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattca 188  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||| |||||  || |||||||||||||||| | |||||| |||    
T  8330 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataattcatacaatatatatttaattatataacattataaatatcatcaaatca 8231  T
Q  189 t 189  Q
    |    
T  8230 t 8230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6240 - 6009
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6240 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 6141  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||||    
T  6140 caagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactg 6041  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagttt 238  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  6040 aaacaataacagcaagataaataacttagttt 6009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2763 - 2527
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2763 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaat 2664  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||    
T  2663 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttac 2565  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2564 tgaaacaacatcagcaagataaacaacttaatttctaa 2527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 6615 - 6850
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6615 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatg 6714  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
    ||||| |||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||  ||||||     
T  6715 caagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagcttacta 6814  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6815 aaacaacaacagcaagataaacaacttagattctaa 6850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 13995 - 14230
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13995 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatg 14094  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
    ||||| |||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||  ||||||     
T  14095 caagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagcttacta 14194  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14195 aaacaacaacagcaagataaacaacttagattctaa 14230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 15665 - 15897
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15665 catcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaatg 15764  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||    
T  15765 taa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcataagaatcagtcttactg 15861  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15862 gatcattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 15897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 917
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1151 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcgaatg 1052  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca-attcatatgcatcagtcttact 205  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | |||  ||    |||| ||||||    
T  1051 caagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatt--tacaattcaggcttact 954  T
Q  206 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  953 gaaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaa 917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 5654 - 5877
Alignment:
Q  14 atcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5654 atcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 5753  T
Q  114 tcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaa 212  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| |||||    
T  5754 acaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaa 5852  T
Q  213 caacagtaagataaacaacttagttt 238  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||    
T  5853 caacaacaagataaa-aacttagttt 5877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14815 - 14579
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14815 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttac 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| | |||||| |||||  || ||||| |  ||||| |  ||||| |||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttac 14617  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14616 tgaaacaacaacagcaagatatacaacttagtttctaa 14579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32772
Alignment:
Q  6 acatcatcatcat-caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  32538 acatcatcatctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaa 32637  T
Q  105 tgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 204  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |  | ||||   |||| |||||    
T  32638 tgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggcttac 32736  T
Q  205 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    || ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  32737 tgaaacaataacaacaagataaacaacttagtttct 32772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12803
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 12686  T
Q  122 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 220  Q
    ||||||| | | | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||| || ||||||| ||||||||||| |    
T  12687 tcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaacagca 12785  T
Q  221 agataaacaacttagttt 238  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12786 agataaacaacttagttt 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 34127 - 34359
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  34127 catcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcgaatg 34226  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 206  Q
     ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34227 taa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcaagtaatatatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactg 34323  T
Q  207 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||| |  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34324 gaaaattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 34359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 54
Target Start/End: Original strand, 285 - 324
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  285 tcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac 324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128853
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacagt 128874  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  128873 aagataagcaacttagtttct 128853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78556
Alignment:
Q  26 gaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctc 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctc 78443  T
Q  124 aaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaaga 223  Q
    ||  |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  78444 aac-atcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 78542  T
Q  224 taaacaacttagtt 237  Q
    ||| ||||||||||    
T  78543 taagcaacttagtt 78556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 116431 - 116551
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| ||||    
T  116431 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaatg 116528  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  116529 caagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2924 - 2686
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2924 acatcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatataca-acta-tataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtctt 202  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | | |||||| |  |||||||||| | || | |||| |||||  |||||||  |  ||||| |  ||||| |||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-agcttaattcataaaatgtatatatatacaattataccattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggctt 2726  T
Q  203 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2725 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 2686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7943
Alignment:
Q  24 tagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatc 8062  T
Q  122 tcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 220  Q
    | ||| || || | |||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  8061 ttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtctcactggaacaacatcagca 7962  T
Q  221 agataaacaacttagtttc 239  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7961 agataaacaacttagtttc 7943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97244
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 97123  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  97124 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagt 97223  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  97224 aagaaaagcaacttagtttct 97244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106522
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 106401  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  106402 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagt 106501  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  106502 aagaaaagcaacttagtttct 106522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7960
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaac 8081  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 215  Q
    |||||| |||  |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||   |||| |||||||    |||||    
T  8080 aacatcacaac-atcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactg---aaacaa 7985  T
Q  216 cagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  7984 cagcaagataaacaacttagtttct 7960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29162
Alignment:
Q  50 ataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatg 149  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||   |||| |||||||| ||| || |||| ||    
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtactg 29258  T
Q  150 tatatacaactatataacat---tataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29257 tatatacaattatataacataattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 29162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38819 - 38641
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  38819 catcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 38720  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | | |||||||  ||| ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  38719 caagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 38641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1186 - 1013
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1186 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 1087  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
     ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1086 taa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 1013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15894 - 15760
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15894 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatg 15795  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattc 141  Q
    |||||||||| ||||  | | ||||||||||||||    
T  15794 caagtcatcatcatcatatacatcaaacataattc 15760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15761 - 15714
Alignment:
Q  195 tcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15761 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 15714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 178897 - 178945
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  178897 acatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 178945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6166
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  6286 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 6187  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  6186 gagataagcaacttagtttct 6166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23898
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001 acatcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 23902  T
Q  106 gcaa 109  Q
    ||||    
T  23901 gcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2100
Alignment:
Q  61 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaact 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-agcataattcatataatgtatatacaatt 2183  T
Q  161 atataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    ||||| |||||  ||||||||    ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2182 atataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttctaa 2100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38555
Alignment:
Q  26 gaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctc 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc 38438  T
Q  124 aaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaaga 223  Q
    ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||    ||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38439 aaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 38538  T
Q  224 taaacaacttagtttct 240  Q
    ||| |||||||||||||    
T  38539 taagcaacttagtttct 38555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2505 - 2327
Alignment:
Q  61 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaact 160  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||   |||| |||||||| ||| || | |||||||||||||| |    
T  2505 caacttagaccgtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaatt 2409  T
Q  161 atataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || || ||| |||| ||||||||||||||    
T  2408 atataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaatagcaaggtaaaaaacttagtttctaa 2327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3267 - 3090
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  3267 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 3169  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  3168 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 3090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19768
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 19888  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    |||||   |||| | |||| || ||||||| |||||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||||||   |||  ||||||||||||||||||||    
T  19887 tctcagc-atcataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcatataattcatgcttactggaacaacaacagt 19789  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  19788 aagataagcaacttagtttct 19768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 39917 - 40038
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  39917 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 40015  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    || ||||  ||||||| ||||||    
T  40016 catgtcaataacatcttaaatat 40038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 49030 - 48921
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  49030 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 48932  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  48931 catcaaatcat 48921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136252
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 218  Q
    || ||   |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||   |||| ||||||| |||||||||||    
T  136371 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacag 136273  T
Q  219 taagataaacaacttagtttc 239  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  136272 caagataaacaacttagtttc 136252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144960
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 218  Q
    || ||   |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||   |||| ||||||| |||||||||||    
T  145079 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacag 144981  T
Q  219 taagataaacaacttagtttc 239  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  144980 caagataaacaacttagtttc 144960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 121770 - 121835
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  121770 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 75
Target Start/End: Original strand, 174785 - 174838
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 75  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  174785 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 174838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 11492 - 11651
Alignment:
Q  31 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaat-at 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||| | ||||||||||||| ||    
T  11492 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 11591  T
Q  130 caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    || | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11592 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 11651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38349 - 38190
Alignment:
Q  31 actcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaat-at 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||| | ||||||||||||| ||    
T  38349 actcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 38250  T
Q  130 caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    || | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38249 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 38190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21937 - 21828
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21937 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatctacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21839  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  21838 catcaaatcat 21828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24699 - 24587
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatata--caactatataacattataaa 175  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  24699 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatttcatgcaatatatatatccaattatataacattataaa 24601  T
Q  176 caacatcaattcat 189  Q
     | |||||| ||||    
T  24600 tatcatcaaatcat 24587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18130 - 17961
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  18130 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 18031  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    |||||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18030 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 17961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2280 - 2108
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-at 114  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||| ||    
T  2280 atcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaat 2183  T
Q  115 caacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
     ||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2182 taacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27683
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||| |||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
Q  118 catctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  27755 catctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 27683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatc 1150  T
Q  122 tcaaatat 129  Q
    ||||||||    
T  1151 tcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28775 - 28693
Alignment:
Q  160 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28775 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaa 28693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 28888 - 28806
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-caacagcaacatagacagtatgcaaatcatcat 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28888 acatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25276
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaac 25219  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattat 172  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25220 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattat 25276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 191
Target Start/End: Original strand, 619 - 725
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 183  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  619 tcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  184 attcatat 191  Q
    | ||||||    
T  718 aatcatat 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16034
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||| |||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
Q  118 catctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||||| | ||  | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  16106 catctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 16034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13316
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 13246  T
Q  122 tcaaa--tatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    | |||    ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  13247 tgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 13316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 39489 - 39602
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||     
T  39489 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 39587  T
Q  115 caacatctcaaatat 129  Q
    |||||||||||||||    
T  39588 caacatctcaaatat 39602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13963 - 13854
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  13963 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacttcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 13865  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  13864 catcaaatcat 13854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 75323 - 75210
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||     
T  75323 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 75225  T
Q  115 caacatctcaaatat 129  Q
    |||||||||||||||    
T  75224 caacatctcaaatat 75210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 39862 - 39983
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||    
T  39862 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatg 39960  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||| | |||||||||||||||    
T  39961 caagtaaacaacatctcaaatat 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 25908 - 26021
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||| |     
T  25908 tcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaa 26006  T
Q  115 caacatctcaaatat 129  Q
    |||||||||||||||    
T  26007 caacatctcaaatat 26021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 240
Target Start/End: Original strand, 87 - 243
Alignment:
Q  84 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 183  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  87 tcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatataacattattaacaacatca 186  T
Q  184 attcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 240  Q
    | |||| |   | || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  187 aatcatttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttct 243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103523
Alignment:
Q  18 tcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaac 103638  T
Q  116 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 215  Q
    ||||||         | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||||| ||||||||    
T  103637 aacatc---------atacataattcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 103547  T
Q  216 cagtaagataaacaacttagtttc 239  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  103546 caggaagataaagaacttagtttc 103523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 1855 - 1977
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  1855 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 1953  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  1954 gcaattcatcaacatcttaaatat 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 207541 - 207467
Alignment:
Q  103 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaaca 177  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  207541 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatataattatataacattataaaca 207467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2267 - 2185
Alignment:
Q  160 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2267 tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactgggataagatcagtaagataaacaacttagtttctaa 2185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267898
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||  ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |    
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaata 267778  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactggaacaacaacag 218  Q
    |||| || |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||    
T  267779 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcatat-catccaggcttactgaaacaacagcag 267876  T
Q  219 taagataaacaacttagtttct 240  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  267877 taagctaagcaacttagtttct 267898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 569 - 787
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 667  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    || |||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||   |||| | |||||  | || ||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  668 tcccaac-atcatatataattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 766  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  767 tagataaacaacttagtttct 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1681
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||  |||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 1801  T
Q  120 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 219  Q
    ||||||  |||| | ||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||   |||| |||||||||||||||| |||    
T  1800 tctcaac-atcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactggaacaacaatagt 1702  T
Q  220 aagataaacaacttagtttct 240  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  1701 aagataggcaacttagtttct 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3303 - 3185
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  3303 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 3205  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    | || ||| |||||||||||    
T  3204 gtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17334 - 17214
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc---aaatcatcatgatataacaatatcga 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |   ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  17334 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaa 17236  T
Q  104 atgcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  17235 atgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79264
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||   ||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  121 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  79332 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 79264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 20748 - 20924
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  20748 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 13215 - 13337
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  13215 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 13313  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  13314 gcaattcatcaacatcttaaatat 13337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 37822 - 37998
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  37822 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 37998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 44824 - 44702
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  44824 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  44725 gcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  10 catcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  109 agtcatcaacatctcaa 125  Q
    | ||| |||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 158611 - 158435
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  158611 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 158435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 340064 - 339889
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||     
T  340064 catcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat- 339968  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||  ||||||| ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  339967 caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 339889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 32946 - 33067
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  32946 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 33044  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||| | |||||||| ||||||    
T  33045 caagttaacaacatcttaaatat 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 38765 - 38886
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  38765 catcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 38863  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||| | | |||||||| ||||||    
T  38864 caaataaacaacatcttaaatat 38886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 9750 - 9927
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  9750 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagt 9847  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa--atatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  9848 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 9927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33073 - 32952
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  33073 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaa-caacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 32975  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  32974 caattcaacaacatcttaaatat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 45932 - 46053
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  45932 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaa-caacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 46030  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  46031 caattcaacaacatcttaaatat 46053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 16117 - 16235
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || || ||||| | |||||| |||    
T  16117 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaat 16215  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    ||||| || || ||||||||    
T  16216 gcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17446 - 17389
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17446 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 4853 - 4968
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  4853 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaat 4951  T
Q  106 gcaagtcatcaacatct 122  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  4952 gcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 4695 - 4871
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4695 catcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 4871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 13393 - 13569
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13393 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 13569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 3474 - 3596
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  3474 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 3572  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  3573 gcaattcatcaacatcttaaatat 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 347 - 468
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||  | |||||  ||| |||||| | ||    
T  347 catcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatcaattg 445  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
     |||||| |||||||| ||||||    
T  446 gaagtcaacaacatcttaaatat 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 13948 - 14124
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  13948 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 14124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 51917 - 52039
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  51917 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 52015  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||||    
T  52016 gcaagtcaacatcatcttaaatat 52039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 168095 - 167973
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | |    
T  168095 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaatt 167997  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  167996 gcaattcatcaacatcttaaatat 167973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20372
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  122 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 175  Q
    |||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaa 20372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35962 - 35853
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  35962 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 35864  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  35863 catcaaatcat 35853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 128755 - 128876
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | | |  |   ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  128755 catcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataa-caaaagcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 128853  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  128854 caagtcaacaacatcttaaatat 128876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 10784 - 10891
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  10784 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 10881  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  10882 aacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8646 - 8528
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||  ||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  8646 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatcaattg 8551  T
Q  107 caagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    ||||||| || ||||| ||||||    
T  8550 caagtcaacatcatcttaaatat 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225593
Alignment:
Q  61 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaac 159  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| || || | |||||||  |||||| ||||||||     
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  160 tatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacatcaaatcat 225593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 189253 - 189144
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  189253 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 189155  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  189154 catcaaatcat 189144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9193
Alignment:
Q  58 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 1293 - 1406
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||  |||||||| ||||  ||||| |||     
T  1293 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatcaaatt 1390  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  1391 caattcatcaacatct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 7270 - 7383
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  7270 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--caacatgaaataattatatcaaatt 7367  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  7368 caattcatcaacatct 7383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15355 - 15295
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15355 catcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacatag 15295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 1043
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | |    
T  1165 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaatt 1067  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  1066 gcaattcatcaacatcttaaatat 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 22887 - 23008
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22887 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  22985 gcaagtcaacaacatcttaaatat 23008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15580 - 15466
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  15580 catcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattt 15482  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  15481 caattcatcaacatct 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 32071 - 32184
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| | |     
T  32071 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtaaacaaa-caacatgacataataatatcaattt 32168  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  32169 caattcatcaacatct 32184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24297
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  119 atctcaaatat 129  Q
    |||| ||||||    
T  24307 atcttaaatat 24297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6241 - 6116
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac--caacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||| | ||| || ||||| || | |||||| |    
T  6241 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaa 6142  T
Q  104 atgcaagtcatcaacatctcaaatat 129  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||    
T  6141 ttgcaattcatcaacatcttaaatat 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 4950 - 4890
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 68  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4950 catcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacatag 4890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 9253 - 9360
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  9253 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 9350  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  9351 aacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 16785 - 16952
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16785 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    |||||||| |||| |||||| || | | | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 16952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 51601 - 51699
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||| | ||| ||| |||||||||||    
T  51601 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattataacaaattcaattcatcaacatc 51698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 13513 - 13615
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || | |||||| | | | | ||||||||    
T  13513 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatcaatttcgattcatcaac 13611  T
Q  119 atct 122  Q
    ||||    
T  13612 atct 13615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 4520 - 4633
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  4520 tcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 4617  T
Q  114 tcaacatctcaaatat 129  Q
     |||||||||||||||    
T  4618 acaacatctcaaatat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 12102 - 12215
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  12102 tcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 12199  T
Q  114 tcaacatctcaaatat 129  Q
     |||||||||||||||    
T  12200 acaacatctcaaatat 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 22054 - 22167
Alignment:
Q  15 tcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  22054 tcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 22151  T
Q  114 tcaacatctcaaatat 129  Q
     |||||||||||||||    
T  22152 acaacatctcaaatat 22167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16717 - 16599
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16717 catcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 16619  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaa 125  Q
    | |||||| || ||||||||    
T  16618 ggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 40401 - 40577
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| |||    
T  40401 catcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 184  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | | |||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  40499 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 40577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 16286 - 16397
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| |||     
T  16286 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaatt 16383  T
Q  107 caagtcatcaacat 120  Q
    ||| ||||||||||    
T  16384 caattcatcaacat 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 107 - 289
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  107 catcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 4716 - 4788
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 80  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  4716 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaa 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5245 - 5132
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||  |||||||| ||||  ||||| |||     
T  5245 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaatt 5148  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  5147 caattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 8483 - 8598
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  8483 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataa-caatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaatt 8581  T
Q  106 gcaagtcatcaacatct 122  Q
    |||||||| ||||||||    
T  8582 gcaagtcaacaacatct 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Original strand, 1956 - 2091
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  1956 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaa-caacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatt 2054  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattc 141  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  2055 gcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattc 2091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 10540 - 10472
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  10540 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtat 10472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Original strand, 12065 - 12241
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  12065 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta-------aacagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
Q  106 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 190  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 12241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 627 - 736
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  627 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 725  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  726 catcaaatcat 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Original strand, 6 - 92
Alignment:
Q  89 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 175  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  6 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 92  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11377 - 11268
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  11377 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 11279  T
Q  179 catcaattcat 189  Q
    |||||| ||||    
T  11278 catcaaatcat 11268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 161239 - 161083
Alignment:
Q  19 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-atca 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||| | ||| ||| |||| |||| |||||| |||||||||| ||||    
T  161239 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaat-atcaacagcgacacag-cagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 161142  T
Q  117 acatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  161141 acatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 161083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 32536 - 32432
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  32536 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 32438  T
Q  179 catcaa 184  Q
    ||||||    
T  32437 catcaa 32432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 11299 - 11406
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  11299 atcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 11396  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  11397 aacgtctcaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Original strand, 165 - 252
Alignment:
Q  145 taatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaactt 233  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  165 taatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttact-gaacaacaatagtaatataaacaactt 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 4308 - 4355
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4308 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 4355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1166 - 1053
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||||| | |     
T  1166 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattatatcaattt 1069  T
Q  107 caagtcatcaacatct 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  1068 caattcatcaacatct 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30114
Alignment:
Q  20 aacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || |||||| ||||    
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaac 30043  T
Q  119 atctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
     |||||| || ||| | |||||||   ||||  |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  30044 gtctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 30114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Original strand, 4215 - 4396
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  4215 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataa-cgacagcgacacag-cagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
Q  106 gcaagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 189  Q
    ||||||| |||||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| |||  ||| |||||||||| ||||    
T  4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca--atatacaacatcaaatcat 4396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2783
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaa 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 46999 - 47065
Alignment:
Q  7 catcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 73  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  46999 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12400 - 12293
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || | ||| || ||||| | || |||||| ||||||||||| |    
T  12400 atcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagtcaac 12303  T
Q  116 aacatctcaa 125  Q
    ||| ||||||    
T  12302 aacgtctcaa 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11558 - 11447
Alignment:
Q  9 tcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 107  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | | |    
T  11558 tcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatttc 11460  T
Q  108 aagtcatcaacat 120  Q
    || ||||||||||    
T  11459 aattcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Original strand, 13638 - 13733
Alignment:
Q  79 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 174  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  13638 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaactatataacattataa 13733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12830 - 12758
Alignment:
Q  103 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 175  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  12830 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 12758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 23842 - 23890
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23842 acatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 23890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9856 - 9784
Alignment:
Q  103 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 175  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  9856 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 9784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Original strand, 36453 - 36501
Alignment:
Q  6 acatcatcatcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36453 acatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 36501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28012
Alignment:
Q  85 catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 183  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| ||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 28011  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  28012 a 28012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 65
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  22 cttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaaca 65  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 20928 - 21030
Alignment:
Q  21 acttagaccaactcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 119  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  20928 acttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaaca 21027  T
Q  120 tct 122  Q
    |||    
T  21028 tct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 1432 - 1395
Alignment:
Q  17 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac 54  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1432 atcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac 1395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University