View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4197_low_24 (Length: 261)

Name: NF4197_low_24
Description: NF4197
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4197_low_24
NF4197_low_24
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (16-259)||(27119929-27120172)
chr2 (16-261)||(3785896-3786141)
chr2 (16-261)||(13933143-13933388)
chr2 (16-261)||(27779637-27779882)
chr2 (16-261)||(27819394-27819639)
chr2 (16-261)||(31890087-31890332)
chr2 (16-261)||(22924744-22924989)
chr2 (16-261)||(19413097-19413342)
chr2 (16-261)||(31879689-31879934)
chr2 (16-261)||(32053206-32053451)
chr2 (16-261)||(34158247-34158492)
chr2 (16-261)||(37682491-37682736)
chr2 (16-261)||(37697756-37698001)
chr2 (16-261)||(37928772-37929017)
chr2 (16-261)||(257249-257494)
chr2 (16-261)||(16825934-16826179)
chr2 (16-261)||(16895301-16895546)
chr2 (16-261)||(27827863-27828108)
chr2 (16-261)||(39893472-39893717)
chr2 (16-261)||(21673771-21674016)
chr2 (16-261)||(34865087-34865332)
chr2 (16-261)||(40236911-40237156)
chr2 (16-261)||(11631780-11632025)
chr2 (16-261)||(27807106-27807351)
chr2 (16-261)||(9346582-9346827)
chr2 (16-261)||(12658939-12659184)
chr2 (16-261)||(16164883-16165128)
chr2 (16-261)||(34294557-34294802)
chr2 (16-261)||(39048415-39048660)
chr2 (16-260)||(12713197-12713441)
chr2 (16-261)||(12590211-12590456)
chr2 (16-261)||(21699767-21700012)
chr2 (16-261)||(23125164-23125409)
chr2 (16-261)||(37948458-37948703)
chr2 (16-260)||(20841317-20841561)
chr2 (17-259)||(19453020-19453262)
chr2 (16-261)||(27431037-27431282)
chr2 (16-261)||(37381080-37381325)
chr2 (16-261)||(27394965-27395210)
chr2 (63-261)||(28885610-28885808)
chr2 (16-129)||(34271516-34271629)
chr2 (16-122)||(28885821-28885927)
chr2 (16-170)||(34701570-34701724)
chr2 (30-188)||(12384136-12384294)
chr2 (16-170)||(42394029-42394183)
chr2 (19-230)||(34534042-34534253)
chr2 (30-188)||(22949869-22950027)
chr2 (34-188)||(21760229-21760383)
chr2 (19-245)||(26723875-26724101)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (16-261)||(44564387-44564632)
chr8 (16-261)||(21344739-21344984)
chr8 (16-261)||(31357931-31358176)
chr8 (16-261)||(15770977-15771222)
chr8 (16-261)||(18712887-18713132)
chr8 (16-261)||(9358028-9358273)
chr8 (16-259)||(33262139-33262382)
chr8 (16-261)||(29832729-29832974)
chr8 (16-261)||(19204930-19205175)
chr8 (16-261)||(27605473-27605718)
chr8 (16-261)||(14561027-14561272)
chr8 (16-261)||(28358520-28358765)
chr8 (16-260)||(2133828-2134072)
chr8 (16-261)||(12089291-12089536)
chr8 (16-261)||(19691501-19691746)
chr8 (16-261)||(18794107-18794352)
chr8 (16-261)||(19677850-19678095)
chr8 (16-259)||(31486439-31486682)
chr8 (52-261)||(22077515-22077724)
chr8 (16-139)||(33245894-33246017)
chr8 (16-138)||(19657909-19658031)
chr8 (16-227)||(19844604-19844815)
chr8 (16-170)||(22412432-22412586)
chr8 (16-170)||(14212533-14212687)
chr8 (19-245)||(16768742-16768968)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (16-261)||(2776655-2776900)
chr7 (16-261)||(26512188-26512433)
chr7 (16-261)||(26681598-26681843)
chr7 (16-261)||(31127308-31127553)
chr7 (16-261)||(39209631-39209876)
chr7 (16-261)||(4202790-4203035)
chr7 (16-261)||(45390621-45390866)
chr7 (16-261)||(16748009-16748254)
chr7 (16-261)||(26666406-26666651)
chr7 (16-261)||(16446498-16446743)
chr7 (16-261)||(26271578-26271823)
chr7 (16-261)||(26316340-26316585)
chr7 (16-261)||(5143832-5144077)
chr7 (16-261)||(10845021-10845266)
chr7 (16-261)||(16514922-16515167)
chr7 (16-261)||(2157975-2158220)
chr7 (16-261)||(10913361-10913606)
chr7 (16-261)||(11421271-11421516)
chr7 (16-261)||(31560882-31561127)
chr7 (19-261)||(4141741-4141983)
chr7 (16-259)||(10842486-10842729)
chr7 (16-261)||(2106655-2106900)
chr7 (16-261)||(5131397-5131642)
chr7 (16-261)||(22145596-22145841)
chr7 (16-261)||(45734714-45734959)
chr7 (16-259)||(26516195-26516438)
chr7 (16-259)||(16044722-16044961)
chr7 (16-261)||(31087114-31087359)
chr7 (19-261)||(3448707-3448949)
chr7 (16-261)||(26438658-26438903)
chr7 (16-261)||(26534365-26534610)
chr7 (19-261)||(11444288-11444530)
chr7 (16-259)||(24589026-24589269)
chr7 (16-138)||(5161907-5162029)
chr7 (16-170)||(16127310-16127464)
chr7 (16-170)||(29090008-29090162)
chr7 (16-170)||(2557027-2557181)
chr7 (100-230)||(25726929-25727059)
chr7 (16-170)||(15193575-15193729)
chr7 (30-188)||(16392940-16393098)
chr7 (30-188)||(30369452-30369610)
chr7 (30-188)||(9469794-9469952)
chr7 (40-188)||(16286895-16287043)
chr7 (34-188)||(798033-798187)
chr7 (50-168)||(16237975-16238093)
chr7 (19-245)||(1893070-1893296)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (16-261)||(13520742-13520987)
chr6 (16-261)||(14141944-14142189)
chr6 (16-261)||(26789217-26789462)
chr6 (16-261)||(27197586-27197831)
chr6 (16-261)||(27251404-27251649)
chr6 (16-261)||(22455664-22455909)
chr6 (16-261)||(30554566-30554811)
chr6 (16-261)||(4761164-4761409)
chr6 (16-261)||(27358660-27358905)
chr6 (16-261)||(27449003-27449248)
chr6 (16-261)||(28163892-28164137)
chr6 (16-261)||(29504817-29505062)
chr6 (16-261)||(27626261-27626506)
chr6 (16-261)||(34461056-34461301)
chr6 (16-261)||(16677541-16677786)
chr6 (16-261)||(24867117-24867362)
chr6 (16-261)||(27011132-27011377)
chr6 (16-261)||(27060907-27061152)
chr6 (16-261)||(4528686-4528931)
chr6 (16-261)||(4776281-4776526)
chr6 (16-261)||(8902253-8902498)
chr6 (16-261)||(13295501-13295746)
chr6 (16-261)||(15420870-15421115)
chr6 (16-261)||(26775177-26775422)
chr6 (16-261)||(33372981-33373226)
chr6 (16-260)||(29576416-29576660)
chr6 (16-261)||(17088993-17089238)
chr6 (16-261)||(26112962-26113207)
chr6 (16-261)||(27022537-27022782)
chr6 (16-261)||(27179857-27180102)
chr6 (16-261)||(27269137-27269382)
chr6 (16-261)||(27488534-27488779)
chr6 (16-261)||(28210855-28211100)
chr6 (16-261)||(16753222-16753467)
chr6 (16-261)||(22931434-22931679)
chr6 (16-261)||(23853879-23854124)
chr6 (16-261)||(27286914-27287159)
chr6 (16-261)||(29552958-29553203)
chr6 (16-261)||(4542324-4542569)
chr6 (16-261)||(4720685-4720930)
chr6 (16-261)||(3699484-3699729)
chr6 (16-261)||(26921778-26922023)
chr6 (16-261)||(16940577-16940822)
chr6 (16-258)||(20171951-20172193)
chr6 (16-258)||(22163798-22164040)
chr6 (61-261)||(26992196-26992396)
chr6 (16-139)||(24302307-24302430)
chr6 (16-188)||(23971320-23971492)
chr6 (30-188)||(9135917-9136075)
chr6 (16-170)||(18119961-18120115)
chr6 (16-170)||(18212219-18212373)
chr6 (19-245)||(27545319-27545545)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (16-261)||(29887701-29887946)
chr5 (16-261)||(33878541-33878786)
chr5 (16-261)||(43081666-43081911)
chr5 (16-261)||(8661979-8662224)
chr5 (16-261)||(18497229-18497474)
chr5 (16-261)||(30155442-30155687)
chr5 (16-261)||(33519791-33520036)
chr5 (16-261)||(24586785-24587030)
chr5 (16-261)||(28652653-28652898)
chr5 (16-261)||(30032839-30033084)
chr5 (16-259)||(34619931-34620174)
chr5 (16-261)||(3792952-3793197)
chr5 (16-261)||(9320887-9321132)
chr5 (16-261)||(12135586-12135831)
chr5 (16-261)||(40470054-40470299)
chr5 (16-257)||(11327052-11327293)
chr5 (16-261)||(26483805-26484050)
chr5 (16-261)||(31434875-31435120)
chr5 (16-261)||(33295939-33296184)
chr5 (16-260)||(24727381-24727625)
chr5 (16-261)||(9547213-9547458)
chr5 (16-261)||(11552766-11553011)
chr5 (16-261)||(23629381-23629626)
chr5 (16-261)||(25203689-25203934)
chr5 (16-261)||(25267844-25268089)
chr5 (16-261)||(37667990-37668235)
chr5 (17-261)||(22891874-22892118)
chr5 (16-259)||(32592778-32593021)
chr5 (16-261)||(13439187-13439432)
chr5 (16-261)||(15655262-15655507)
chr5 (16-261)||(15755356-15755601)
chr5 (16-261)||(22995621-22995866)
chr5 (16-261)||(24973317-24973562)
chr5 (16-261)||(31822911-31823156)
chr5 (16-261)||(33780900-33781145)
chr5 (16-261)||(37767495-37767740)
chr5 (16-261)||(13321334-13321579)
chr5 (16-261)||(30938046-30938291)
chr5 (16-261)||(37355147-37355392)
chr5 (16-261)||(37758394-37758639)
chr5 (16-261)||(18372038-18372283)
chr5 (16-261)||(30171880-30172125)
chr5 (16-261)||(41678116-41678361)
chr5 (16-259)||(28956289-28956532)
chr5 (16-261)||(18124920-18125165)
chr5 (19-259)||(2514475-2514715)
chr5 (19-261)||(6877716-6877958)
chr5 (16-259)||(13183297-13183540)
chr5 (64-261)||(24684697-24684894)
chr5 (16-259)||(5641201-5641444)
chr5 (186-261)||(23895617-23895692)
chr5 (67-245)||(351770-351948)
chr5 (16-170)||(3483707-3483861)
chr5 (30-188)||(11943940-11944098)
chr5 (30-188)||(15784243-15784401)
chr5 (30-188)||(5439743-5439901)
chr5 (30-188)||(17957581-17957739)
chr5 (30-188)||(31520791-31520949)
chr5 (30-188)||(36375480-36375638)
chr5 (30-188)||(37000134-37000292)
chr5 (34-188)||(34469106-34469260)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (16-261)||(32293993-32294238)
chr3 (16-261)||(17992581-17992826)
chr3 (16-261)||(5017079-5017324)
chr3 (16-261)||(5714438-5714683)
chr3 (16-261)||(5725348-5725593)
chr3 (16-261)||(5766775-5767020)
chr3 (16-261)||(5593007-5593252)
chr3 (16-261)||(28112604-28112849)
chr3 (16-261)||(47026818-47027063)
chr3 (16-261)||(5605964-5606209)
chr3 (16-261)||(8215100-8215345)
chr3 (16-261)||(18246106-18246351)
chr3 (16-261)||(19697855-19698100)
chr3 (16-261)||(21678068-21678313)
chr3 (16-261)||(29661620-29661865)
chr3 (16-261)||(31032886-31033131)
chr3 (16-261)||(7076571-7076816)
chr3 (16-261)||(8286120-8286365)
chr3 (16-261)||(20573493-20573738)
chr3 (16-261)||(24331528-24331773)
chr3 (16-260)||(51785389-51785633)
chr3 (16-259)||(28024649-28024892)
chr3 (16-261)||(4627150-4627395)
chr3 (16-261)||(6205268-6205513)
chr3 (16-261)||(8299336-8299581)
chr3 (16-261)||(15737744-15737989)
chr3 (16-261)||(22384228-22384473)
chr3 (16-261)||(35884131-35884376)
chr3 (16-259)||(18228563-18228806)
chr3 (16-261)||(18304304-18304549)
chr3 (16-261)||(28342542-28342787)
chr3 (16-261)||(29145406-29145651)
chr3 (16-261)||(32442516-32442761)
chr3 (16-261)||(4420280-4420525)
chr3 (16-261)||(4793285-4793530)
chr3 (16-261)||(5470353-5470598)
chr3 (16-261)||(6539392-6539637)
chr3 (16-257)||(10399513-10399754)
chr3 (16-257)||(16621140-16621381)
chr3 (16-261)||(18054627-18054872)
chr3 (16-261)||(18273702-18273947)
chr3 (16-261)||(18289003-18289248)
chr3 (16-257)||(20069409-20069650)
chr3 (16-261)||(4343326-4343571)
chr3 (16-261)||(7999925-8000170)
chr3 (16-261)||(15889355-15889600)
chr3 (16-261)||(18333995-18334240)
chr3 (16-261)||(31961105-31961350)
chr3 (16-261)||(4687020-4687265)
chr3 (16-261)||(4724996-4725241)
chr3 (16-261)||(10646438-10646683)
chr3 (16-261)||(22867498-22867743)
chr3 (16-261)||(22882557-22882802)
chr3 (16-261)||(48469292-48469537)
chr3 (16-259)||(17981599-17981842)
chr3 (16-259)||(11107009-11107245)
chr3 (16-138)||(5653573-5653695)
chr3 (67-245)||(6963134-6963312)
chr3 (16-170)||(11925008-11925162)
chr3 (16-188)||(6571792-6571964)
chr3 (16-188)||(15704911-15705083)
chr3 (16-170)||(7088677-7088831)
chr3 (16-170)||(22959909-22960063)
chr3 (30-167)||(15592575-15592712)
chr3 (30-122)||(15919021-15919113)
chr3 (30-188)||(5950466-5950624)
chr3 (16-170)||(16431861-16432015)
chr3 (30-122)||(37260373-37260465)
chr3 (34-188)||(20443555-20443709)
chr3 (30-188)||(46380772-46380930)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (16-261)||(28153142-28153387)
chr1 (16-261)||(10948483-10948728)
chr1 (16-259)||(3644543-3644787)
chr1 (16-261)||(10966071-10966316)
chr1 (16-261)||(16204641-16204886)
chr1 (16-261)||(28588391-28588636)
chr1 (16-261)||(41789917-41790162)
chr1 (16-261)||(51641624-51641869)
chr1 (16-261)||(20464382-20464627)
chr1 (16-261)||(21894355-21894601)
chr1 (132-261)||(20339024-20339153)
chr1 (16-135)||(20337023-20337142)
chr1 (16-230)||(22489458-22489672)
chr1 (30-188)||(5628619-5628777)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (16-261)||(7364-7609)
scaffold0143 (16-259)||(19476-19719)
scaffold0143 (16-261)||(30697-30942)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (16-261)||(22798-23043)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (16-261)||(31123119-31123364)
chr4 (16-261)||(21973118-21973363)
chr4 (16-261)||(27159924-27160169)
chr4 (16-261)||(36341124-36341369)
chr4 (16-261)||(1903671-1903916)
chr4 (16-261)||(5009292-5009537)
chr4 (16-261)||(18797221-18797466)
chr4 (16-261)||(30757177-30757422)
chr4 (16-261)||(39854054-39854299)
chr4 (16-261)||(40102244-40102489)
chr4 (16-261)||(54836808-54837053)
chr4 (16-261)||(6573275-6573520)
chr4 (16-261)||(14759913-14760158)
chr4 (16-261)||(17016463-17016708)
chr4 (16-261)||(18313785-18314030)
chr4 (16-261)||(34185567-34185812)
chr4 (16-261)||(14668433-14668678)
chr4 (16-261)||(15281544-15281789)
chr4 (16-261)||(24116079-24116324)
chr4 (16-261)||(14101960-14102205)
chr4 (16-261)||(15231289-15231534)
chr4 (16-261)||(20335028-20335273)
chr4 (16-257)||(24588968-24589209)
chr4 (16-261)||(33670407-33670652)
chr4 (16-261)||(15387985-15388230)
chr4 (16-170)||(14725406-14725560)
chr4 (67-230)||(22146227-22146390)
chr4 (16-170)||(19767847-19768001)
chr4 (19-230)||(1881709-1881920)
chr4 (30-185)||(12515725-12515880)
chr4 (34-124)||(55784686-55784776)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (16-261)||(9440-9685)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (16-261)||(9426-9671)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (16-261)||(15985-16230)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (16-261)||(11535-11780)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (16-261)||(3471-3716)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (16-261)||(9449-9694)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (16-261)||(11353-11598)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (16-261)||(12975-13220)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (19-259)||(5789-6029)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (15-254)||(5277-5516)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (68-261)||(43384-43583)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (132-261)||(1347-1476)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (30-128)||(34861-34959)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (16-170)||(10713-10867)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (30-188)||(29647-29805)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (30-185)||(5031-5186)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (67-230)||(4573-4736)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27120172 - 27119929
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120172 gtatgattcaccaaataatgacacaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 27120073  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120072 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 27119973  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27119972 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 27119929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3786141 - 3785896
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3786141 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 3786042  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3786041 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 3785942  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3785941 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 3785896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 13933143 - 13933388
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933143 gtatgattcaccaaataatgccgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 13933242  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  13933243 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 13933342  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933343 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 13933388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27779882 - 27779637
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779882 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 27779783  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779782 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 27779683  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27779682 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 27779637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27819639 - 27819394
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819639 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 27819540  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819539 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 27819440  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27819439 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 27819394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 31890087 - 31890332
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31890087 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaacacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 31890186  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31890187 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 31890286  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31890287 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 31890332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 22924744 - 22924989
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22924744 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 22924843  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22924844 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 22924943  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22924944 caaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 22924989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 19413097 - 19413342
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19413097 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 19413196  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  19413197 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 19413296  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19413297 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 19413342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31879934 - 31879689
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31879934 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 31879835  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31879834 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 31879735  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31879734 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 31879689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 32053451 - 32053206
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32053451 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 32053352  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  32053351 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 32053252  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053251 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 32053206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34158492 - 34158247
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158492 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 34158393  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34158392 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacatatacaaaat 34158293  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34158292 cagaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 34158247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 37682491 - 37682736
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37682491 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 37682590  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  37682591 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 37682690  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682691 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 37682736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 37697756 - 37698001
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37697756 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 37697855  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  37697856 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 37697955  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37697956 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 37698001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37929017 - 37928772
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37929017 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 37928918  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  37928917 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 37928818  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37928817 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 37928772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 257249 - 257494
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257249 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 257348  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  257349 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgctgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 257448  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257449 caacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 257494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 16825934 - 16826179
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16825934 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 16826033  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16826034 tcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcctatggattcatcaaacactgccaaatacataat 16826133  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826134 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 16826179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16895546 - 16895301
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16895546 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 16895447  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16895446 tcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcctatggattcatcaaacactgccaaatacataat 16895347  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895346 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 16895301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27828108 - 27827863
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828108 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 27828009  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27828008 tcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27827909  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827908 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 27827863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39893717 - 39893472
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39893717 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 39893618  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  39893617 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 39893518  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893517 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 39893472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 21673771 - 21674016
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21673771 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 21673870  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  21673871 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 21673970  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673971 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 21674016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34865332 - 34865087
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34865332 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 34865233  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  34865232 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 34865133  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34865132 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 34865087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40237156 - 40236911
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237156 gtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 40237057  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  40237056 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttcccgtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 40236957  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40236956 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 40236911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 11631780 - 11632025
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11631780 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 11631879  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  11631880 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtaaacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 11631979  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631980 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 11632025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27807351 - 27807106
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807351 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 27807252  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  27807251 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 27807152  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807151 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 27807106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 9346582 - 9346827
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  9346582 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaact 9346681  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  9346682 tcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 9346781  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346782 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 9346827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12659184 - 12658939
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12659184 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 12659085  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||    
T  12659084 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataat 12658985  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12658984 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 12658939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16165128 - 16164883
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16165128 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 16165029  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16165028 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 16164929  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16164928 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 16164883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34294802 - 34294557
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34294802 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 34294703  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  34294702 tcttgcttaagtagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 34294603  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294602 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 34294557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 39048415 - 39048660
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048415 gtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 39048514  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  39048515 tcttacttaggtagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 39048614  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048615 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 39048660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 12713197 - 12713441
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12713197 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 12713296  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  12713297 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 12713396  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12713397 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccag 12713441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12590456 - 12590211
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590456 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 12590357  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  12590356 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 12590257  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590256 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 12590211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 21699767 - 21700012
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699767 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaact 21699866  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21699867 tcttacttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaatactgacaaatacataat 21699966  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21699967 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagc 21700012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 23125164 - 23125409
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23125164 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 23125263  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  23125264 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 23125363  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23125364 caaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagc 23125409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 37948458 - 37948703
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37948458 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 37948557  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  37948558 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 37948657  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37948658 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 37948703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20841561 - 20841317
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20841561 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 20841462  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||    
T  20841461 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaagtacataat 20841362  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20841361 caaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccag 20841317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 19453020 - 19453262
Alignment:
Q  17 tatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaactt 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453020 tatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttggcggcccaggccggagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaactt 19453119  T
Q  117 cttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatc 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19453120 cttgctcagataatagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatc 19453219  T
Q  217 aaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453220 aaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 19453262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 27431037 - 27431282
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27431037 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 27431136  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||    
T  27431137 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcgccttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactaccaaatacataat 27431236  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431237 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 27431282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37381325 - 37381080
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37381325 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaact 37381226  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  37381225 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccattgattcatcaaatactgccaaatacatgat 37381126  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37381125 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 37381080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27395210 - 27394965
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||    
T  27395210 gtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaact 27395111  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||    
T  27395110 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataat 27395011  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27395010 caagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagc 27394965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 63 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28885808 - 28885610
Alignment:
Q  63 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatct 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28885808 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 28885709  T
Q  163 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885708 tgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataaccaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 28885610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 34271516 - 34271629
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34271516 gtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 34271615  T
Q  116 tcttgctcagatag 129  Q
    ||||||| ||||||    
T  34271616 tcttgcttagatag 34271629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28885927 - 28885821
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28885927 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagttttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 28885828  T
Q  116 tcttgct 122  Q
    |||||||    
T  28885827 tcttgct 28885821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34701724 - 34701570
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  34701724 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 34701625  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  34701624 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 34701570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12384294 - 12384136
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  12384294 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 12384195  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  12384194 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 12384136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42394183 - 42394029
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  42394183 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 42394084  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  42394083 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 42394029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 34534042 - 34534253
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||| |||| ||||||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||| |||||||    
T  34534042 tgattaaccatataatgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcggtaaacttct 34534141  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    | ||||  ||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  |||||    
T  34534142 tactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacaacccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaa 34534241  T
Q  219 aggccttccttc 230  Q
    |||||| |||||    
T  34534242 aggcctcccttc 34534253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22950027 - 22949869
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||| ||||| | |||     
T  22950027 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaactttttgcttaaataa 22949928  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  22949927 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 22949869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 188
Target Start/End: Original strand, 21760229 - 21760383
Alignment:
Q  34 tgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtaga 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| | ||| |||| |||||| || || ||||||||||||| ||| || |    
T  21760229 tgacggaggcgtttggcggcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacaatcagtaaacttcttgctcaaataataaa 21760328  T
Q  134 tagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    | ||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  21760329 tggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtccgagcacacaacccatgga 21760383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 245
Target Start/End: Original strand, 26723875 - 26724101
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||    
T  26723875 tgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttct 26723974  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    | ||||  ||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  |||||    
T  26723975 tactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaa 26724074  T
Q  219 aggccttccttccacgggtgggacaag 245  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||    
T  26724075 aggcctcccttcgaccggagggacaag 26724101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44564632 - 44564387
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564632 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 44564533  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564532 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 44564433  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44564432 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 44564387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 21344739 - 21344984
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21344739 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 21344838  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21344839 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 21344938  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21344939 cgaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 21344984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31358176 - 31357931
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31358176 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 31358077  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31358076 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 31357977  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31357976 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 31357931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15771222 - 15770977
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15771222 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtaaact 15771123  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771122 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 15771023  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15771022 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 15770977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18713132 - 18712887
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18713132 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 18713033  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  18713032 tcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 18712933  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712932 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 18712887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9358273 - 9358028
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9358273 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 9358174  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  9358173 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 9358074  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358073 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 9358028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33262382 - 33262139
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33262382 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 33262283  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  33262282 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 33262183  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262182 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 33262139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29832974 - 29832729
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29832974 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 29832875  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  29832874 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 29832775  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29832774 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 29832729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 19204930 - 19205175
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19204930 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaact 19205029  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19205030 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 19205129  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19205130 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 19205175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 27605473 - 27605718
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27605473 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 27605572  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27605573 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27605672  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605673 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 27605718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14561272 - 14561027
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  14561272 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatt 14561173  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  14561172 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 14561073  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14561072 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 14561027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 28358520 - 28358765
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358520 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 28358619  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  28358620 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 28358719  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28358720 caaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagc 28358765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 2133828 - 2134072
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2133828 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcgatgaact 2133927  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  2133928 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttccttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 2134027  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2134028 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 2134072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 12089291 - 12089536
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12089291 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaact 12089390  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  12089391 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 12089490  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089491 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 12089536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19691746 - 19691501
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19691746 gtatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 19691647  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  19691646 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 19691547  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691546 caaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagc 19691501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18794352 - 18794107
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18794352 gtatgactcatcaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 18794253  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  18794252 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 18794153  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794152 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 18794107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19678095 - 19677850
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19678095 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaact 19677996  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  19677995 tcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 19677896  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19677895 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 19677850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Original strand, 31486439 - 31486682
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31486439 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaact 31486538  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  31486539 tcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 31486638  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31486639 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 31486682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Original strand, 22077515 - 22077724
Alignment:
Q  52 gcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22077515 gcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcatcgtatattgggcttcgcagtcggtaaagttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttc 22077614  T
Q  152 tagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagg 251  Q
     |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22077615 cagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggatagg 22077714  T
Q  252 tggttccagc 261  Q
    ||||||||||    
T  22077715 tggttccagc 22077724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33246017 - 33245894
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33246017 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 33245918  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcat 139  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  33245917 tcttacttagatagtagatagcat 33245894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 19657909 - 19658031
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19657909 gtatgatttaccaaataatggcgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaact 19658008  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagca 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  19658009 tcttgcttagatagtagatagca 19658031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19844815 - 19844604
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| ||||||||||    
T  19844815 gtatgattaatcatataatgacggagacgtttggcagcccaggctaaatcacaacaagttttctcaagtaccgaatatcgggactcacaatcggtgaact 19844716  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || |||||||| || || || ||||  |||||||  ||    
T  19844715 tcttactcaaatagtagatagcttgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaacacacagcccatggaatcttccaatactgttaaatacatgat 19844616  T
Q  216 caaaggccttcc 227  Q
    |||||| |||||    
T  19844615 caaaggtcttcc 19844604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22412586 - 22412432
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  22412586 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 22412487  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22412486 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 22412432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14212687 - 14212533
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  14212687 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 14212588  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  14212587 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 14212533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16768968 - 16768742
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||    
T  16768968 tgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttct 16768869  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    | ||||  ||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  |||||    
T  16768868 tactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaa 16768769  T
Q  219 aggccttccttccacgggtgggacaag 245  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||    
T  16768768 aggcctcccttcgaccggagggacaag 16768742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2776900 - 2776655
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776900 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttcgcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 2776801  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776800 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 2776701  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2776700 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 2776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 26512188 - 26512433
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512188 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 26512287  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512288 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 26512387  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26512388 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 26512433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 26681598 - 26681843
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681598 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 26681697  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681698 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 26681797  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26681798 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 26681843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31127553 - 31127308
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127553 gtatgattcatcaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 31127454  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127453 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 31127354  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31127353 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 31127308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 39209631 - 39209876
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209631 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 39209730  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209731 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 39209830  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39209831 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 39209876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4203035 - 4202790
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4203035 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 4202936  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4202935 tcttgctcagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 4202836  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202835 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 4202790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45390866 - 45390621
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45390866 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 45390767  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  45390766 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 45390667  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45390666 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 45390621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 16748009 - 16748254
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16748009 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 16748108  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  16748109 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 16748208  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16748209 caaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagc 16748254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 26666406 - 26666651
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26666406 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 26666505  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26666506 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 26666605  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26666606 caaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagc 26666651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 16446498 - 16446743
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446498 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttaacggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaact 16446597  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16446598 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacataat 16446697  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446698 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 16446743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 26271578 - 26271823
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26271578 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 26271677  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26271678 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 26271777  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271778 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 26271823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 26316340 - 26316585
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26316340 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 26316439  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26316440 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 26316539  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316540 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 26316585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 5143832 - 5144077
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143832 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 5143931  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  5143932 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 5144031  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144032 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 5144077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10845266 - 10845021
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10845266 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaact 10845167  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10845166 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataat 10845067  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10845066 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagc 10845021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 16514922 - 16515167
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16514922 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 16515021  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  16515022 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 16515121  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16515122 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 16515167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2158220 - 2157975
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2158220 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 2158121  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||    
T  2158120 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataat 2158021  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158020 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 2157975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 10913361 - 10913606
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10913361 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 10913460  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  10913461 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 10913560  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913561 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 10913606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 11421271 - 11421516
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11421271 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 11421370  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  11421371 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 11421470  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421471 caaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 11421516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 31560882 - 31561127
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31560882 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 31560981  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  31560982 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 31561081  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31561082 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 31561127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 4141741 - 4141983
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4141741 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttct 4141840  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4141841 tgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaa 4141940  T
Q  219 aggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4141941 aggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 4141983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Original strand, 10842486 - 10842729
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10842486 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaact 10842585  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10842586 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacctattacgcaccccacagattcatcaaacactgacaaatacataat 10842685  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10842686 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 10842729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 2106655 - 2106900
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2106655 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 2106754  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  2106755 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaattacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 2106854  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106855 caaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 2106900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5131642 - 5131397
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5131642 gtatgattcaccaaataatgacacaggcgtttagcggcctaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 5131543  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  5131542 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 5131443  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131442 caaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 5131397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22145841 - 22145596
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22145841 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 22145742  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  22145741 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 22145642  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145641 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 22145596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45734959 - 45734714
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  45734959 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaact 45734860  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45734859 tcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 45734760  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45734759 caaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 45734714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26516438 - 26516195
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516438 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 26516339  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  26516338 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccgagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 26516239  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516238 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 26516195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16044961 - 16044722
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16044961 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaagccagagcacaa---gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaact 16044865  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16044864 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataat 16044765  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16044764 caaagg-cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 16044722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 31087114 - 31087359
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087114 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 31087213  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087214 tcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 31087313  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  31087314 caaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagc 31087359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3448949 - 3448707
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3448949 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttct 3448850  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||    
T  3448849 tgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaa 3448750  T
Q  219 aggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3448749 cggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 3448707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26438903 - 26438658
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438903 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 26438804  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  26438803 tcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 26438704  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26438703 caacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagc 26438658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 26534365 - 26534610
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  26534365 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaatt 26534464  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  26534465 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 26534564  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26534565 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 26534610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11444530 - 11444288
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11444530 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttct 11444431  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||    
T  11444430 tgcttagatagtagataacatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaa 11444331  T
Q  219 aggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11444330 cggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 11444288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Original strand, 24589026 - 24589269
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24589026 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaact 24589125  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  24589126 tcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 24589225  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24589226 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattcca 24589269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5162029 - 5161907
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5162029 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 5161930  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagca 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  5161929 tcttgcttagatagtagatagca 5161907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 16127310 - 16127464
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  16127310 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 16127409  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16127410 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 16127464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29090162 - 29090008
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  29090162 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 29090063  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  29090062 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 29090008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2557181 - 2557027
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  2557181 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 2557082  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  2557081 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 2557027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25727059 - 25726929
Alignment:
Q  100 tcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaaca 199  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  25727059 tcacaatcagtgaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccaagcacacagcccatagaatcatctaaca 25726960  T
Q  200 ctgacaaatacaaaatcaaaggccttccttc 230  Q
    | | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  25726959 cagtcaaatacatgatcaacggccttccttc 25726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15193729 - 15193575
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  15193729 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaaatacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 15193630  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  15193629 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttcttcccggtttcatcttgttgacc 15193575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 16392940 - 16393098
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  16392940 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 16393039  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  16393040 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 16393098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 30369452 - 30369610
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  30369452 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 30369551  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  30369552 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 30369610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9469952 - 9469794
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  9469952 ataatgacggaggcgtctggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 9469853  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  9469852 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 9469794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 188
Target Start/End: Original strand, 16286895 - 16287043
Alignment:
Q  40 aggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 139  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||    
T  16286895 aggcgttttgcagcccaggctagtgcacaacaggttttctcgagcatgggatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgctcaaataataaatggcat 16286994  T
Q  140 gttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    | || ||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  16286995 gctcctttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 16287043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 188
Target Start/End: Original strand, 798033 - 798187
Alignment:
Q  34 tgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtaga 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| | ||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| || |    
T  798033 tgacggaggcgtttggcggcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgaccatggaatagcgagattcacaatcggtaaacttcttgctcaaataataaa 798132  T
Q  134 tagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    | ||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  798133 tggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtccgagcacacaacccatgga 798187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16238093 - 16237975
Alignment:
Q  50 cagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctt 149  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  16238093 cagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtatagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaataggagatagcgtgctctttctt 16237994  T
Q  150 tctagtctcatcttgttga 168  Q
    ||  || ||||||||||||    
T  16237993 tccggtttcatcttgttga 16237975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 245
Target Start/End: Original strand, 1893070 - 1893296
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||    
T  1893070 tgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttct 1893169  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    | ||||  ||||| || |  || |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  |||||    
T  1893170 tactcaagtagtaaatggtgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaa 1893269  T
Q  219 aggccttccttccacgggtgggacaag 245  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||    
T  1893270 aggcctcccttcgaccggagggacaag 1893296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 13520742 - 13520987
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13520742 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 13520841  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520842 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 13520941  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13520942 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 13520987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 14141944 - 14142189
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14141944 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 14142043  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14142044 tcttgctcagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 14142143  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14142144 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 14142189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26789462 - 26789217
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789462 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcttttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 26789363  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789362 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 26789263  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26789262 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 26789217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27197831 - 27197586
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197831 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagctcaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 27197732  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197731 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 27197632  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27197631 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 27197586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 27251404 - 27251649
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251404 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagctcaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 27251503  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251504 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 27251603  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27251604 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 27251649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 22455664 - 22455909
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22455664 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcgatgaact 22455763  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  22455764 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcaccaaacactgacaaatacataat 22455863  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22455864 caaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagc 22455909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 30554566 - 30554811
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30554566 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 30554665  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  30554666 tcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 30554765  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30554766 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 30554811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4761409 - 4761164
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761409 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 4761310  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  4761309 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 4761210  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761209 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 4761164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 27358660 - 27358905
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358660 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 27358759  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27358760 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27358859  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358860 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 27358905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 27449003 - 27449248
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449003 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 27449102  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27449103 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27449202  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449203 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 27449248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28164137 - 28163892
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28164137 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 28164038  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||    
T  28164037 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataat 28163938  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28163937 caaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 28163892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29505062 - 29504817
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29505062 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 29504963  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  29504962 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 29504863  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29504862 caacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 29504817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 27626261 - 27626506
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27626261 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacggtcggtgaact 27626360  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||    
T  27626361 tcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaagtacataat 27626460  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27626461 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagc 27626506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 34461056 - 34461301
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461056 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcctctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 34461155  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  34461156 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 34461255  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461256 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 34461301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16677786 - 16677541
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16677786 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcagtgaact 16677687  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  16677686 tcttgctcaggtagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 16677587  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677586 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 16677541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24867362 - 24867117
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24867362 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 24867263  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  24867262 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacaaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 24867163  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867162 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 24867117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27011377 - 27011132
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27011377 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 27011278  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27011277 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27011178  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011177 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 27011132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27061152 - 27060907
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27061152 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 27061053  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27061052 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27060953  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27060952 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 27060907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4528931 - 4528686
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4528931 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 4528832  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  4528831 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 4528732  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528731 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 4528686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4776526 - 4776281
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4776526 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 4776427  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  4776426 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 4776327  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4776326 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 4776281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 8902253 - 8902498
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8902253 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagttttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaact 8902352  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8902353 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagatgcatcaaacactgacaaatacaaaat 8902452  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8902453 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 8902498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 13295501 - 13295746
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13295501 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 13295600  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  13295601 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 13295700  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295701 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 13295746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 15420870 - 15421115
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15420870 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcgcaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 15420969  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  15420970 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 15421069  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15421070 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 15421115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 26775177 - 26775422
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26775177 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 26775276  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  26775277 tcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 26775376  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26775377 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 26775422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 33372981 - 33373226
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33372981 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcagtgtataccgagtttcgcaatcggtaaact 33373080  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  33373081 tcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 33373180  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33373181 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 33373226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29576660 - 29576416
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29576660 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 29576561  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  29576560 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 29576461  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29576460 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccag 29576416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 17088993 - 17089238
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17088993 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaact 17089092  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17089093 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtcccatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcgaacactgacaaatacataat 17089192  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17089193 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagc 17089238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 26112962 - 26113207
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26112962 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaact 26113061  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  26113062 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 26113161  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113162 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 26113207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27022782 - 27022537
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27022782 gtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 27022683  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27022682 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27022583  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022582 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 27022537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27180102 - 27179857
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27180102 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 27180003  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27180002 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27179903  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27179902 caaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagc 27179857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 27269137 - 27269382
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27269137 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 27269236  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27269237 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27269336  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27269337 caaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagc 27269382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27488779 - 27488534
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27488779 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 27488680  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27488679 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27488580  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488579 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 27488534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28211100 - 28210855
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28211100 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaact 28211001  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  28211000 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 28210901  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28210900 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 28210855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16753467 - 16753222
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16753467 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaact 16753368  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  16753367 tcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 16753268  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16753267 cagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagc 16753222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 22931434 - 22931679
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22931434 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcggttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 22931533  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  22931534 tcttgcttagatagtagatatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 22931633  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22931634 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagc 22931679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 23853879 - 23854124
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23853879 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcggttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 23853978  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  23853979 tcttgcttagatagtagatatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 23854078  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23854079 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagc 23854124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 27286914 - 27287159
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27286914 gtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccatgccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 27287013  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27287014 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27287113  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27287114 caaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagc 27287159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29553203 - 29552958
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29553203 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaact 29553104  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  29553103 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacagcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 29553004  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553003 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 29552958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 4542324 - 4542569
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4542324 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaact 4542423  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  4542424 tcttacttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 4542523  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542524 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 4542569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 4720685 - 4720930
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4720685 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaact 4720784  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  4720785 tcttacttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 4720884  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720885 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 4720930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3699729 - 3699484
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3699729 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 3699630  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  3699629 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 3699530  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3699529 caaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagc 3699484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26922023 - 26921778
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26922023 gtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaggtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaact 26921924  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  26921923 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 26921824  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26921823 cagaggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagc 26921778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 16940577 - 16940822
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16940577 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 16940676  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  16940677 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaatacataat 16940776  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940777 caaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 16940822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20172193 - 20171951
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20172193 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcaacccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaact 20172094  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||| | | |||| |||||||||| |||||||| |||    
T  20172093 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaattacacatcctacgaattcgtcaaacactgccaaatacataat 20171994  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcc 258  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20171993 caaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcc 20171951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 258
Target Start/End: Original strand, 22163798 - 22164040
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22163798 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcaacccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaact 22163897  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||| | | |||| |||||||||| |||||||| |||    
T  22163898 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaattacacatcctacgaattcgtcaaacactgccaaatacataat 22163997  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcc 258  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22163998 caaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcc 22164040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 61 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26992396 - 26992196
Alignment:
Q  61 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26992396 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 26992297  T
Q  161 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 260  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26992296 cctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 26992197  T
Q  261 c 261  Q
    |    
T  26992196 c 26992196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 24302307 - 24302430
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24302307 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacggtcggtgaact 24302406  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24302407 tcttgctcagatagtagatagcat 24302430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Original strand, 23971320 - 23971492
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  23971320 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 23971419  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  23971420 tcttactcaaatagtagatatcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaacacacagcccatgga 23971492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 9135917 - 9136075
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  9135917 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 9136016  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  9136017 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 9136075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18120115 - 18119961
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  18120115 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 18120016  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  18120015 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 18119961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 18212219 - 18212373
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  |  || || |  ||||| || |||||||    
T  18212219 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagtgaact 18212318  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||| | || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  18212319 tcttactcaaatagtagataacgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 18212373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27545545 - 27545319
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||| |||||||    
T  27545545 tgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcggtaaacttct 27545446  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    | ||||  ||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  |||||    
T  27545445 tactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaa 27545346  T
Q  219 aggccttccttccacgggtgggacaag 245  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||    
T  27545345 aggcctcccttcgaccggagggacaag 27545319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 29887701 - 29887946
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887701 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 29887800  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887801 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttattgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 29887900  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29887901 caaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagc 29887946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33878786 - 33878541
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33878786 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 33878687  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878686 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 33878587  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33878586 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 33878541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 43081911 - 43081666
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081911 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 43081812  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081811 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 43081712  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081711 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 43081666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 8661979 - 8662224
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8661979 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 8662078  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  8662079 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 8662178  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662179 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 8662224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 18497229 - 18497474
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497229 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 18497328  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  18497329 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 18497428  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497429 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 18497474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30155687 - 30155442
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30155687 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 30155588  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  30155587 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 30155488  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30155487 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 30155442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33520036 - 33519791
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33520036 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 33519937  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  33519936 tcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 33519837  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33519836 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 33519791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24587030 - 24586785
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24587030 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 24586931  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  24586930 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 24586831  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24586830 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 24586785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28652898 - 28652653
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28652898 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 28652799  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  28652798 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 28652699  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652698 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 28652653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30033084 - 30032839
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30033084 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 30032985  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  30032984 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 30032885  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30032884 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 30032839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34620174 - 34619931
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34620174 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 34620075  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  34620074 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcattaaacactgccaaatacataat 34619975  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34619974 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 34619931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3793197 - 3792952
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793197 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 3793098  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  3793097 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataat 3792998  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3792997 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagc 3792952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9321132 - 9320887
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9321132 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 9321033  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  9321032 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 9320933  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320932 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 9320887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12135831 - 12135586
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12135831 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 12135732  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  12135731 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 12135632  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12135631 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 12135586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 40470054 - 40470299
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470054 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 40470153  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  40470154 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataat 40470253  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  40470254 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagc 40470299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11327293 - 11327052
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11327293 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaact 11327194  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11327193 tcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacaggttcatcaaacactgacaaatacaaaat 11327094  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttc 257  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11327093 caaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttc 11327052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26484050 - 26483805
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26484050 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 26483951  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26483950 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcctgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 26483851  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26483850 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 26483805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31435120 - 31434875
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31435120 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 31435021  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31435020 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 31434921  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31434920 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 31434875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33296184 - 33295939
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33296184 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 33296085  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  33296084 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 33295985  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295984 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 33295939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24727625 - 24727381
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24727625 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 24727526  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  24727525 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 24727426  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24727425 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccag 24727381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 9547213 - 9547458
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9547213 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaact 9547312  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9547313 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 9547412  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9547413 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 9547458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11553011 - 11552766
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11553011 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 11552912  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  11552911 tcttgcttaaatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 11552812  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552811 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 11552766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23629626 - 23629381
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23629626 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 23629527  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23629526 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 23629427  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629426 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 23629381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25203934 - 25203689
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203934 gtatgattcaccaaaaaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 25203835  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25203834 tcttgcttagatagtatatagcatgttctttctttcccgtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaagtacataat 25203735  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203734 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 25203689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25268089 - 25267844
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25268089 gtatgattcaccaaaaaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 25267990  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25267989 tcttgcttagatagtatatagcatgttctttctttcccgtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaagtacataat 25267890  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25267889 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 25267844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 37667990 - 37668235
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37667990 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 37668089  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  37668090 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 37668189  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37668190 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 37668235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22892118 - 22891874
Alignment:
Q  17 tatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaactt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892118 tatgattcaccaaatagtgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaactt 22892019  T
Q  117 cttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22892018 cttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcgtcaaacactgacaaatacataatc 22891919  T
Q  217 aaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22891918 aaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 22891874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Original strand, 32592778 - 32593021
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32592778 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaact 32592877  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  32592878 tcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccggtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 32592977  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592978 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 32593021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 13439187 - 13439432
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13439187 gtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 13439286  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  13439287 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 13439386  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13439387 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 13439432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 15655262 - 15655507
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15655262 gtatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttagcagcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 15655361  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  15655362 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 15655461  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15655462 caaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagc 15655507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 15755356 - 15755601
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15755356 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 15755455  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||    
T  15755456 tcttgcttaaatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgctaaatacatgat 15755555  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755556 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 15755601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 22995621 - 22995866
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22995621 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatt 22995720  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  22995721 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 22995820  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995821 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 22995866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24973562 - 24973317
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24973562 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaaggacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 24973463  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  24973462 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 24973363  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973362 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 24973317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 31822911 - 31823156
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31822911 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaact 31823010  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  31823011 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgcccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 31823110  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31823111 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 31823156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33781145 - 33780900
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33781145 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 33781046  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  33781045 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 33780946  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33780945 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagc 33780900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 37767495 - 37767740
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37767495 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 37767594  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||    
T  37767595 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccagatacataat 37767694  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767695 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 37767740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321579
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13321334 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 13321433  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  13321434 tcttgcttagataatagataacatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 13321533  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13321534 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 13321579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30938291 - 30938046
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30938291 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 30938192  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  30938191 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 30938092  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30938091 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagc 30938046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 37355147 - 37355392
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37355147 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaact 37355246  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  37355247 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 37355346  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355347 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 37355392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37758639 - 37758394
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37758639 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 37758540  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  37758539 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataat 37758440  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37758439 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 37758394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 18372038 - 18372283
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18372038 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaact 18372137  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  18372138 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 18372237  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372238 caacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 18372283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30172125 - 30171880
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30172125 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 30172026  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  30172025 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 30171926  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30171925 caacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 30171880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41678361 - 41678116
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  41678361 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaact 41678262  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  41678261 tcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 41678162  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678161 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 41678116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Original strand, 28956289 - 28956532
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28956289 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcgcaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 28956388  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  28956389 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 28956488  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28956489 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 28956532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 18124920 - 18125165
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18124920 gtatgatttaccaaataatgacgcaggcgttttgcggcccgggccaaggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 18125019  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  18125020 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 18125119  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18125120 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 18125165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2514715 - 2514475
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2514715 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttct 2514616  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  2514615 tgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaa 2514516  T
Q  219 aggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2514515 aggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 2514475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6877958 - 6877716
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6877958 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttct 6877859  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||    
T  6877858 tgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaa 6877759  T
Q  219 aggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6877758 cggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 6877716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Original strand, 13183297 - 13183540
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13183297 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaact 13183396  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  13183397 tcttgcttagatagtagatagcatgatctttctttccagtttcatcttgttgaccaattacacatcccacggattcatcaaatactgccaaatacataat 13183496  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183497 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 13183540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 64 - 261
Target Start/End: Original strand, 24684697 - 24684894
Alignment:
Q  64 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatctt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24684697 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctt 24684796  T
Q  164 gttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24684797 gttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 24684894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5641444 - 5641201
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5641444 gtatgattcaccagataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaact 5641345  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  5641344 tcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacccagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 5641245  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641244 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 5641201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23895692 - 23895617
Alignment:
Q  186 ggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895692 ggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 23895617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Original strand, 351770 - 351948
Alignment:
Q  67 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgtt 166  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  351770 caacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgtt 351869  T
Q  167 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaag 245  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  351870 gaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtcaaatacatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaag 351948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 3483707 - 3483861
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  3483707 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 3483806  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  3483807 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 3483861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 11943940 - 11944098
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  11943940 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 11944039  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  11944040 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 11944098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 15784243 - 15784401
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  15784243 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 15784342  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  15784343 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 15784401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 5439743 - 5439901
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  5439743 ataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 5439842  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  5439843 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 5439901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17957739 - 17957581
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  17957739 ataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 17957640  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  17957639 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 17957581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31520949 - 31520791
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  31520949 ataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 31520850  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  31520849 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 31520791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 36375480 - 36375638
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |  || |||| |||||| || || ||||| ||||| | |||     
T  36375480 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagtatggagtatcgagattcacattcagtaaactttttgcttaaataa 36375579  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || ||||||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  36375580 taaatggcgtgttcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 36375638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 37000134 - 37000292
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |  || |||| |||||| || || ||||| ||||| | |||     
T  37000134 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagtatggagtatcgagattcacattcagtaaactttttgcttaaataa 37000233  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || ||||||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  37000234 taaatggcgtgttcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 37000292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34469260 - 34469106
Alignment:
Q  34 tgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtaga 133  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| || |    
T  34469260 tgacggagacgtttggcagcccagactagtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgctcaaataataaa 34469161  T
Q  134 tagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    | ||||| || ||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  34469160 tggcatgctcctttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 34469106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 32294238 - 32293993
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32294238 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 32294139  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32294138 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 32294039  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32294038 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 32293993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 17992581 - 17992826
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992581 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 17992680  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992681 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 17992780  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17992781 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 17992826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5017324 - 5017079
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5017324 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 5017225  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  5017224 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 5017125  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017124 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 5017079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5714683 - 5714438
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714683 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 5714584  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  5714583 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 5714484  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714483 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 5714438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5725593 - 5725348
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5725593 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 5725494  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  5725493 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 5725394  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5725393 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 5725348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 5766775 - 5767020
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5766775 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 5766874  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  5766875 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 5766974  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5766975 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 5767020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 5593007 - 5593252
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593007 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 5593106  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  5593107 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 5593206  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593207 caacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 5593252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 28112604 - 28112849
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28112604 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 28112703  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  28112704 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 28112803  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112804 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 28112849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 47027063 - 47026818
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47027063 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 47026964  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  47026963 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 47026864  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47026863 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 47026818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 5605964 - 5606209
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5605964 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 5606063  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  5606064 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 5606163  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5606164 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 5606209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8215345 - 8215100
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215345 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 8215246  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||    
T  8215245 tcttgcttagatagtaggtagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataat 8215146  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215145 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 8215100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18246351 - 18246106
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18246351 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 18246252  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  18246251 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 18246152  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246151 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 18246106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19698100 - 19697855
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19698100 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 19698001  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19698000 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcgaacactgacaaatacataat 19697901  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19697900 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 19697855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21678313 - 21678068
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678313 gtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 21678214  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  21678213 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttcccgtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 21678114  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678113 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 21678068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 29661620 - 29661865
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29661620 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtaaact 29661719  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  29661720 tcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 29661819  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661820 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 29661865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 31032886 - 31033131
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31032886 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 31032985  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31032986 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 31033085  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31033086 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 31033131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7076816 - 7076571
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7076816 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 7076717  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  7076716 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 7076617  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076616 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 7076571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 8286120 - 8286365
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8286120 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 8286219  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  8286220 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 8286319  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286320 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 8286365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 20573493 - 20573738
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573493 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 20573592  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  20573593 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 20573692  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573693 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 20573738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24331773 - 24331528
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24331773 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 24331674  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24331673 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 24331574  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24331573 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 24331528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51785633 - 51785389
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51785633 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 51785534  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  51785533 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 51785434  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51785433 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccag 51785389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28024892 - 28024649
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28024892 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaact 28024793  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  28024792 tcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 28024693  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024692 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 28024649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4627395 - 4627150
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627395 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 4627296  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||    
T  4627295 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcgaatactgccaaatacataat 4627196  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627195 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 4627150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6205513 - 6205268
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6205513 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 6205414  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  6205413 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 6205314  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6205313 caagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagc 6205268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8299581 - 8299336
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8299581 gtatgattcatcaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 8299482  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  8299481 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccaatctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 8299382  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299381 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 8299336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 15737744 - 15737989
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15737744 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 15737843  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  15737844 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 15737943  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15737944 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 15737989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 22384228 - 22384473
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22384228 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 22384327  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  22384328 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 22384427  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384428 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 22384473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35884376 - 35884131
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35884376 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaact 35884277  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  35884276 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 35884177  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884176 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 35884131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18228806 - 18228563
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18228806 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 18228707  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  18228706 tcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 18228607  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228606 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 18228563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 18304304 - 18304549
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18304304 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 18304403  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  18304404 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 18304503  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18304504 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 18304549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28342787 - 28342542
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28342787 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaact 28342688  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  28342687 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 28342588  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342587 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 28342542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 29145406 - 29145651
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29145406 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 29145505  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  29145506 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 29145605  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145606 caaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 29145651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 32442761 - 32442516
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32442761 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 32442662  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  32442661 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 32442562  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32442561 caaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagc 32442516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4420525 - 4420280
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4420525 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 4420426  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  4420425 tcttgcttagataatagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 4420326  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4420325 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 4420280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 4793285 - 4793530
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4793285 gtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 4793384  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  4793385 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 4793484  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793485 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 4793530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5470598 - 5470353
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5470598 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccacgctagagcacaacaagtcttctctagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 5470499  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  5470498 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 5470399  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5470398 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 5470353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 6539392 - 6539637
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6539392 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 6539491  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  6539492 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 6539591  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539592 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 6539637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10399754 - 10399513
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10399754 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 10399655  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  10399654 tcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 10399555  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttc 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399554 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttc 10399513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 16621140 - 16621381
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16621140 gtatgattcaccaaataatgacgcaagcgtttggcggcccagaccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcagtgaact 16621239  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16621240 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaacactgacaaatacataat 16621339  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16621340 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttc 16621381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18054872 - 18054627
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18054872 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccagaccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 18054773  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  18054772 tcttacttaaatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 18054673  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054672 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 18054627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 18273702 - 18273947
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18273702 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 18273801  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  18273802 tcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 18273901  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273902 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 18273947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 18289003 - 18289248
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18289003 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 18289102  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  18289103 tcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 18289202  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289203 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 18289248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20069650 - 20069409
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20069650 gtatgattcaccagataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgcataccgagtttcacaatcggtgaact 20069551  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  20069550 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 20069451  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttc 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069450 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttc 20069409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 4343326 - 4343571
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4343326 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 4343425  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||    
T  4343426 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactaccaaatacataat 4343525  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4343526 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 4343571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8000170 - 7999925
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8000170 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 8000071  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  8000070 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcgtcaaatactgccaaatacataat 7999971  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7999970 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 7999925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 15889355 - 15889600
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15889355 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaact 15889454  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  15889455 tcttgcttatatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 15889554  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889555 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 15889600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18334240 - 18333995
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18334240 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtaaact 18334141  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  18334140 tcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 18334041  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18334040 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagc 18333995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 31961105 - 31961350
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31961105 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 31961204  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  31961205 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 31961304  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31961305 caaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagc 31961350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4687265 - 4687020
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4687265 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 4687166  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  4687165 tcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 4687066  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4687065 caagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagc 4687020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4725241 - 4724996
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4725241 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 4725142  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  4725141 tcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 4725042  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4725041 caagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagc 4724996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10646683 - 10646438
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10646683 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 10646584  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  10646583 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatctcatggattcgtcaaatactgccaaatacataat 10646484  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10646483 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 10646438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 22867498 - 22867743
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22867498 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagtgcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 22867597  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  22867598 tcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggttttatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 22867697  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22867698 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 22867743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 22882557 - 22882802
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22882557 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagtgcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 22882656  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  22882657 tcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggttttatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 22882756  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22882757 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 22882802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 48469537 - 48469292
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48469537 gtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaact 48469438  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  48469437 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 48469338  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469337 caacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 48469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Original strand, 17981599 - 17981842
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17981599 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaact 17981698  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  17981699 tcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 17981798  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17981799 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 17981842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Original strand, 11107009 - 11107245
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11107009 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagaggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatt 11107108  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  11107109 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 11107208  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  11107209 caacggccttccttcca-------gacaaggataggtggttcca 11107245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5653695 - 5653573
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5653695 gtatgattcaccaaataatgacgcaagcgtttagcggcccaggccagagcataacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgagct 5653596  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagca 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  5653595 tcttgcttagatagtagatagca 5653573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Original strand, 6963134 - 6963312
Alignment:
Q  67 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgtt 166  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  6963134 caacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgtt 6963233  T
Q  167 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaag 245  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  6963234 gaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtcaagtacatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaag 6963312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 11925008 - 11925162
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  11925008 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 11925107  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  11925108 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 11925162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6571964 - 6571792
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || ||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  ||||| || |||||||    
T  6571964 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcggcccaggccaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgagactcacaatcagtgaact 6571865  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  6571864 tcttactcaaatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacctaacacacagcccatgga 6571792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15705083 - 15704911
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |  |  || || |  ||||| || ||||| |    
T  15705083 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagtgaatt 15704984  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  15704983 tcttactcaaatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgacctaacacacagcccatgga 15704911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 7088677 - 7088831
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  7088677 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 7088776  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  7088777 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 7088831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22960063 - 22959909
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  22960063 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 22959964  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22959963 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 22959909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 167
Target Start/End: Original strand, 15592575 - 15592712
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| | |||     
T  15592575 ataatgacggaggcgtttggcaacccaggctagagcacaacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcaccgtcagtaaacttcttgcttaaataa 15592674  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttg 167  Q
    || || || || || ||  ||||||| |||||||||||    
T  15592675 taaatggcgtgctcctttcttctagtttcatcttgttg 15592712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15919113 - 15919021
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgct 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  15919113 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggccagagcacaacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaactttttgct 15919021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 5950466 - 5950624
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  5950466 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 5950565  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  5950566 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 5950624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16432015 - 16431861
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  |  || || |  ||||| || |||||||    
T  16432015 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagtgaact 16431916  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||| | || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16431915 tcttactcaaatagtagataacgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 16431861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 122
Target Start/End: Original strand, 37260373 - 37260465
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgct 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || |||||||||||    
T  37260373 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagtaaacttcttgct 37260465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20443709 - 20443555
Alignment:
Q  34 tgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtaga 133  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| || |    
T  20443709 tgacggagacgtttagcagcccaggctagtgcgcaacaagtcttctcgagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgctcaaataataaa 20443610  T
Q  134 tagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    | ||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  20443609 tggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtccgagcacacaacccatgga 20443555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 46380930 - 46380772
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  46380930 ataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 46380831  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  46380830 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 46380772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28153387 - 28153142
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28153387 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 28153288  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28153287 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaat 28153188  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28153187 caaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagc 28153142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10948728 - 10948483
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10948728 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 10948629  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10948628 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 10948529  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948528 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 10948483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3644787 - 3644543
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagttt-cacagtcggtgaac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3644787 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagttttcacagtcggtgaac 3644688  T
Q  115 ttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  3644687 ttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataa 3644588  T
Q  215 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644587 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 3644543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10966316 - 10966071
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10966316 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 10966217  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10966216 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 10966117  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966116 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 10966071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 16204641 - 16204886
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204641 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcctaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 16204740  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  16204741 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 16204840  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204841 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 16204886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28588636 - 28588391
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28588636 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 28588537  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  28588536 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 28588437  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588436 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 28588391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 41789917 - 41790162
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41789917 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgcttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 41790016  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  41790017 tcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 41790116  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41790117 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 41790162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 51641869 - 51641624
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51641869 gtatggttcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 51641770  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  51641769 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 51641670  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51641669 caacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 51641624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20464627 - 20464382
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464627 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcattttgcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagtatcgtataccgagtttcacagtcggtgaact 20464528  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20464527 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaacactgacaaatacataat 20464428  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20464427 taaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagc 20464382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 21894355 - 21894601
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21894355 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcacaacaagtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 21894454  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagca-tgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaa 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  21894455 tcttgcttagatagtagatagcagtgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataa 21894554  T
Q  215 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894555 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 21894601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 132 - 261
Target Start/End: Original strand, 20339024 - 20339153
Alignment:
Q  132 gatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttcc 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20339024 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccacggattcatcaaacattgacaaatacataatcaaaggccttccttcc 20339123  T
Q  232 acgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20339124 acgggtgggacaaggataggaggttccagc 20339153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Original strand, 20337023 - 20337142
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20337023 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaagttttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaact 20337122  T
Q  116 tcttgctcagatagtagata 135  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20337123 tcttgctcagatagtagata 20337142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22489672 - 22489458
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| | || ||| || |  ||||| || |||||||    
T  22489672 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaatcacaacaagttttctcaagtactgaatatcgggactcacaatcagtgaact 22489573  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| || | ||| || |||||||| ||  | || ||||  |||||||  ||    
T  22489572 tcttactcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttggcccaacacacagcccatggaatctcccaatactgttaaatacatgat 22489473  T
Q  216 caaaggccttccttc 230  Q
    |||||| ||||||||    
T  22489472 caaaggtcttccttc 22489458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 5628619 - 5628777
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  5628619 ataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 5628718  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  5628719 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 5628777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7609 - 7364
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7609 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 7510  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  7509 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 7410  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7409 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19719 - 19476
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19719 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaact 19620  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19619 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataat 19520  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19519 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 19476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30942 - 30697
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30942 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 30843  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  30842 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 30743  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30742 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 30697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 22798 - 23043
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22798 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 22897  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22898 tcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 22997  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22998 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 23043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 31123119 - 31123364
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31123119 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 31123218  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31123219 tcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataat 31123318  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31123319 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 31123364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21973363 - 21973118
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21973363 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 21973264  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  21973263 tcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 21973164  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973163 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 21973118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 27159924 - 27160169
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27159924 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 27160023  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  27160024 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 27160123  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160124 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 27160169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 36341124 - 36341369
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341124 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 36341223  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  36341224 tcttgctcagatagtagatagcgtgttctttctttccagtttcatcttgttgacccagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 36341323  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341324 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 36341369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1903916 - 1903671
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1903916 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaact 1903817  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1903816 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacataat 1903717  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903716 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 1903671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5009537 - 5009292
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009537 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 5009438  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  5009437 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 5009338  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009337 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 5009292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 18797221 - 18797466
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18797221 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 18797320  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  18797321 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgtccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 18797420  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797421 caacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 18797466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30757422 - 30757177
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30757422 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 30757323  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  30757322 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 30757223  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30757222 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 30757177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39854299 - 39854054
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854299 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 39854200  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  39854199 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 39854100  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39854099 caaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagc 39854054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 40102244 - 40102489
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40102244 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 40102343  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  40102344 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 40102443  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102444 caacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 40102489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 54837053 - 54836808
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54837053 gtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 54836954  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  54836953 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 54836854  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836853 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 54836808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6573520 - 6573275
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573520 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaaactaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 6573421  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  6573420 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacaacccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 6573321  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573320 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 6573275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 14759913 - 14760158
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14759913 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 14760012  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  14760013 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 14760112  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14760113 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 14760158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17016708 - 17016463
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17016708 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 17016609  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  17016608 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 17016509  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016508 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 17016463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 18313785 - 18314030
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18313785 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 18313884  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  18313885 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 18313984  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18313985 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 18314030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 34185567 - 34185812
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34185567 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttatcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 34185666  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  34185667 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 34185766  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185767 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 34185812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14668678 - 14668433
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14668678 gtatgattcaccaaataatgacgcagacgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 14668579  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||    
T  14668578 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatacttccaaatacataat 14668479  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668478 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 14668433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 15281544 - 15281789
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281544 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcttttggcggcccaggccagagagcaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaact 15281643  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15281644 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacgaattcatcaaacactgacaaatacataat 15281743  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281744 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 15281789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24116324 - 24116079
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24116324 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 24116225  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  24116224 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 24116125  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24116124 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagc 24116079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14102205 - 14101960
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14102205 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 14102106  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  14102105 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 14102006  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102005 caacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 14101960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15231534 - 15231289
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15231534 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtggcccaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataacgagtttcacagtcggtgaact 15231435  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15231434 tcttgctcagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcattaaacactgacaaatacataat 15231335  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231334 caaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 15231289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 20335028 - 20335273
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20335028 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggaggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 20335127  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  20335128 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 20335227  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335228 caaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagc 20335273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 24588968 - 24589209
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24588968 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 24589067  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  24589068 tcttgcttagatagtagttatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 24589167  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttc 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589168 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttc 24589209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 33670407 - 33670652
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  33670407 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaact 33670506  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  33670507 tcttgcttaggtagtagataacatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 33670606  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33670607 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 33670652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 15387985 - 15388230
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||    
T  15387985 gtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcatcgtatatcgggcttcgcagtcggtaaact 15388084  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||    
T  15388085 tcttgctcaaatagtagatagcatgctctttctttccagtcttgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactatcaagtacataat 15388184  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15388185 caagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagc 15388230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 14725406 - 14725560
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  14725406 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 14725505  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14725506 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 14725560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 22146227 - 22146390
Alignment:
Q  67 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgtt 166  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  22146227 caacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgtt 22146326  T
Q  167 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttc 230  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22146327 gaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtcaagtacatgatcaaaggccttccttc 22146390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19768001 - 19767847
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  19768001 gtatgattaatcatataatgacggaaacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 19767902  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19767901 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 19767847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 1881709 - 1881920
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||| |||| ||||||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||| |||||||    
T  1881709 tgattaaccatataatgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcggtaaacttct 1881808  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    | ||||  ||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  |||||    
T  1881809 tactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacaacccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaa 1881908  T
Q  219 aggccttccttc 230  Q
    |||||| |||||    
T  1881909 aggcctcccttc 1881920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12515880 - 12515725
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||  ||||  || || ||||||||||||| ||||    
T  12515880 ataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacatcaagtcttctcaagtatgaaataccgagactcactatctgtaaacttcttgctcaaatag 12515781  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccat 185  Q
    || ||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| || || ||||| || |||||    
T  12515780 taaataacatgttctttccttccagtttcttcttgctgcccgagcacacaacccat 12515725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 55784776 - 55784686
Alignment:
Q  34 tgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctca 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| | ||| |||| |||||| || || |||||||||||||    
T  55784776 tgacggaggcgtttggcagcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacaatcagtaaacttcttgctca 55784686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9685 - 9440
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9685 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 9586  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  9585 tcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 9486  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9485 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 9440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9671 - 9426
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9671 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 9572  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  9571 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 9472  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9471 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 9426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16230 - 15985
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16230 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 16131  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  16130 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 16031  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16030 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 15985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 11535 - 11780
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11535 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaact 11634  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  11635 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 11734  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11735 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 11780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3716 - 3471
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3716 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 3617  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  3616 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 3517  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3516 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 3471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9694 - 9449
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9694 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggccaaggccagagcacaacaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaact 9595  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  9594 tcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgacagatacataat 9495  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9494 caaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagc 9449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11598 - 11353
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11598 gtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaact 11499  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  11498 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataat 11399  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11398 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 11353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13220 - 12975
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13220 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagtggcccaggctaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaact 13121  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaat 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  13120 tcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgat 13021  T
Q  216 caaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13020 caaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagc 12975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 5789 - 6029
Alignment:
Q  19 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5789 tgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttct 5888  T
Q  119 tgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaa 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||    
T  5889 tgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaa 5988  T
Q  219 aggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5989 cggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 6029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 254
Target Start/End: Original strand, 5277 - 5516
Alignment:
Q  15 agtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaac 114  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||    
T  5277 agtatgatttaccaggtaatgacgaaggcgtttggcagcccaggctagagcacagcaagtcttctcaagcatcgtataccgaatttcgcagtcggtaaac 5376  T
Q  115 ttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaa 214  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |    
T  5377 ttcttgcttagatagtagatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaatacacatcccatagattcatcaaacactgatagatacatga 5476  T
Q  215 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgg 254  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5477 tcaacgaccttccttccacaggtgggacaaggataggtgg 5516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 261
Target Start/End: Original strand, 43384 - 43583
Alignment:
Q  68 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttc-acagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc-tttctagtctca-tcttg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  43384 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttctacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttcttttccagtctcattcttg 43483  T
Q  165 ttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaataca-aaatc-aaaggccttccttccacgggtgggacaaggat-aggtggttccagc 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43484 ttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataaatcaaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagc 43583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 132 - 261
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1476
Alignment:
Q  132 gatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttcc 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1347 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccacggattcatcaaacattgacaaatacataatcaaaggccttccttcc 1446  T
Q  232 acgggtgggacaaggataggtggttccagc 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1447 acgggtgggacaaggataggaggttccagc 1476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 34861 - 34959
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  34861 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgcttagata 34959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10867 - 10713
Alignment:
Q  16 gtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaact 115  Q
    |||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || |||||||    
T  10867 gtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaact 10768  T
Q  116 tcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 170  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  10767 tcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 10713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29805 - 29647
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || || ||||||||||| | |||     
T  29805 ataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagtaaacttcttgcttaaataa 29706  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 188  Q
    || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  29705 taaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 29647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Original strand, 5031 - 5186
Alignment:
Q  30 ataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 129  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||  ||||  || || ||||||||||||| ||||    
T  5031 ataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacatcaagtcttctcaagtatgaaataccgagactcactatctgtaaacttcttgctcaaatag 5130  T
Q  130 tagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccat 185  Q
    || ||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| || || ||||| || |||||    
T  5131 taaataacatgttctttccttccagtttcttcttgctgcccgagcacacaacccat 5186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 4573 - 4736
Alignment:
Q  67 caacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgtt 166  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  4573 caacaagttttctcaagcatagagtatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgtt 4672  T
Q  167 gaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttc 230  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  4673 gaccaagcacgcaacccatagaatcatccaacacagtcaagtacatgatcaaaggcattccttc 4736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University