View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4197_low_5 (Length: 540)

Name: NF4197_low_5
Description: NF4197
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4197_low_5
NF4197_low_5
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (1-535)||(9543687-9544221)
chr7 (1-535)||(32099740-32100274)
chr7 (1-535)||(5389618-5390152)
chr7 (1-535)||(26304916-26305450)
chr7 (1-535)||(26361368-26361902)
chr7 (1-535)||(6535844-6536378)
chr7 (1-535)||(16140631-16141165)
chr7 (1-535)||(8502409-8502943)
chr7 (1-535)||(44898659-44899193)
chr7 (1-535)||(46498474-46499008)
chr7 (6-535)||(13283877-13284406)
chr7 (148-520)||(42596865-42597237)
chr7 (6-112)||(42596752-42596858)
chr7 (43-442)||(7582477-7582876)
chr7 (43-397)||(15175386-15175740)
chr7 (42-483)||(14643279-14643720)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (1-535)||(45015713-45016247)
chr2 (1-535)||(18652578-18653112)
chr2 (1-535)||(9512211-9512745)
chr2 (6-520)||(27168448-27168962)
chr2 (6-535)||(22903504-22904033)
chr2 (42-391)||(1791955-1792304)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (1-535)||(31358921-31359455)
chr6 (1-535)||(18161425-18161959)
chr6 (1-535)||(16899306-16899840)
chr6 (6-520)||(34766721-34767235)
chr6 (6-535)||(18710425-18710954)
chr6 (6-535)||(18704490-18705019)
chr6 (6-341)||(29541812-29542147)
chr6 (336-535)||(29561121-29561320)
chr6 (310-397)||(25895804-25895891)
chr6 (123-225)||(11375030-11375132)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (1-535)||(26200772-26201306)
chr5 (1-535)||(27413508-27414042)
chr5 (1-535)||(18362637-18363171)
chr5 (1-535)||(33940680-33941214)
chr5 (6-520)||(20949220-20949734)
chr5 (6-519)||(23375368-23375873)
chr5 (42-391)||(5601579-5601928)
chr5 (43-442)||(30453136-30453535)
chr5 (43-442)||(30458214-30458613)
chr5 (43-442)||(24413672-24414071)
chr5 (42-397)||(24299175-24299530)
chr5 (204-467)||(22456358-22456621)
chr5 (79-483)||(20037121-20037526)
chr5 (42-157)||(24289908-24290023)
chr5 (42-261)||(21083014-21083233)
chr5 (123-255)||(15329389-15329521)
chr5 (123-255)||(18709238-18709370)
chr5 (42-114)||(22456711-22456783)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (1-535)||(6693578-6694112)
chr4 (10-535)||(16254607-16255127)
chr4 (6-535)||(17150738-17151267)
chr4 (6-520)||(520375-520889)
chr4 (9-535)||(7844905-7845431)
chr4 (43-442)||(54698311-54698710)
chr4 (51-397)||(26813342-26813688)
chr4 (123-255)||(14933550-14933682)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (1-535)||(21211417-21211951)
chr8 (2-535)||(14892199-14892732)
chr8 (23-533)||(22832121-22832631)
chr8 (42-397)||(25035933-25036288)
chr8 (42-397)||(25049970-25050325)
chr8 (42-397)||(18233759-18234114)
chr8 (42-397)||(18243210-18243565)
chr8 (42-467)||(33600415-33600840)
chr8 (42-397)||(12916388-12916743)
chr8 (86-261)||(23749914-23750089)
chr8 (123-255)||(45497837-45497969)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (1-535)||(9538495-9539029)
chr3 (1-535)||(6423667-6424201)
chr3 (1-535)||(8974206-8974740)
chr3 (2-456)||(12387349-12387802)
chr3 (42-391)||(48979673-48980022)
chr3 (51-397)||(28366656-28367002)
chr3 (42-349)||(4384222-4384529)
chr3 (51-101)||(28374773-28374823)
chr3 (51-101)||(28382595-28382645)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (1-535)||(16156243-16156777)
chr1 (6-520)||(1987651-1988165)
chr1 (10-505)||(22959697-22960190)
chr1 (42-483)||(14280551-14280992)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (6-535)||(52979-53506)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (6-520)||(6030-6544)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (6-520)||(7134-7648)
scaffold0313 (6-520)||(10916-11430)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (6-535)||(148073-148602)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (6-519)||(16592-17097)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (2-372)||(20136-20506)
scaffold0141 (366-535)||(27670-27839)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (117-406)||(1-290)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (10-505)||(189005-189498)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (324-533)||(1-210)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (366-535)||(86973-87142)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (43-442)||(102825-103224)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (42-397)||(257898-258253)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (117-253)||(5060-5196)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 455; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 9544221 - 9543687
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544221 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 9544122  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544121 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggataccctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 9544022  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9544021 agaaaatttgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 9543922  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9543921 catattctactcatgatagaattagaaaaatactaagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcacccaggccaaagatttaaaatc 9543822  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9543821 tatgaacctggaagatcttattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagca 9543722  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  9543721 tctcagcaaagctcatcagctgctgaagatgatgt 9543687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 32099740 - 32100274
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099740 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattattaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 32099839  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099840 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 32099939  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32099940 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 32100039  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32100040 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 32100139  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32100140 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 32100239  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  32100240 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 32100274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 5390152 - 5389618
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5390152 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 5390053  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5390052 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 5389953  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5389952 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 5389853  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5389852 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 5389753  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5389752 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 5389653  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  5389652 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 5389618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 26304916 - 26305450
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26304916 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 26305015  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26305016 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 26305115  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26305116 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 26305215  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26305216 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 26305315  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26305316 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 26305415  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26305416 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26305450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 26361902 - 26361368
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361902 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 26361803  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361802 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 26361703  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26361702 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 26361603  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361602 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 26361503  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26361502 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 26361403  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26361402 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26361368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 6535844 - 6536378
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535844 caaaaagtgcatggtcagcagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 6535943  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535944 agttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 6536043  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6536044 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 6536143  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536144 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 6536243  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6536244 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 6536343  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6536344 tctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 16141165 - 16140631
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16141165 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 16141066  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16141065 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 16140966  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16140965 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 16140866  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16140865 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 16140766  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16140765 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagca 16140666  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16140665 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16140631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 8502409 - 8502943
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8502409 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 8502508  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8502509 agttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 8502608  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8502609 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 8502708  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8502709 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 8502808  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8502809 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 8502908  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  8502909 tctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 8502943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 44898659 - 44899193
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44898659 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 44898758  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44898759 agttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 44898858  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44898859 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtaaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 44898958  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44898959 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 44899058  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44899059 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 44899158  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  44899159 tctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 44899193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 46498474 - 46499008
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498474 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 46498573  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498574 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatttcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 46498673  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46498674 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 46498773  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498774 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 46498873  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46498874 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtactttaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagca 46498973  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  46498974 tctcagcaaactccatcagttgctgatgaagatgt 46499008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 13284406 - 13283877
Alignment:
Q  6 agtgcatg-gtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagtt 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13284406 agtgcatgtgtcaacagatgaaaaatctcaagtattgttaaattctaaagctagactctttctattatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagtt 13284307  T
Q  105 gatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaa 204  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13284306 gatgaatgcaagaatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcaaaa 13284207  T
Q  205 aatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcata 304  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13284206 agtttgaa-tctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactgcaatagtaaatgaaatgagatctcttgggaaggcata 13284108  T
Q  305 ttctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatg 404  Q
     || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13284107 ctccactcatgagagaatcagaaaaatattaagatgccttccaagtatgtggagacctatggtcacttcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatg 13284008  T
Q  405 aacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  13284007 aacctggaagatctcattggttcacttagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaactagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctc 13283908  T
Q  505 agcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    || ||| |||||||||   ||||||||||||    
T  13283907 agtaaacttcatcagtaactgatgatgatgt 13283877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 148 - 520
Target Start/End: Original strand, 42596865 - 42597237
Alignment:
Q  148 tacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatga 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42596865 tacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactataattgacattagagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgtgaatgaaaccattgatga 42596964  T
Q  248 gatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttcca 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  42596965 gatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgccttcca 42597064  T
Q  348 agtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttg 447  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42597065 agtatgtagagacctatggtcactgcaatcactgaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcatttgttcactgagagctcatgaagttg 42597164  T
Q  448 tacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  42597165 tacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcaacaaacctcatcagt 42597237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Original strand, 42596752 - 42596858
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42596752 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagaggtg 42596851  T
Q  106 atgaatg 112  Q
    |||||||    
T  42596852 atgaatg 42596858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 442
Target Start/End: Original strand, 7582477 - 7582876
Alignment:
Q  43 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 142  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  7582477 taaattctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtttgggacactct 7582576  T
Q  143 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 242  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  7582577 aaaaattcatcatgaaggaactagccatttaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 7582676  T
Q  243 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 342  Q
    ||||| |||||   ||||| |||  | || || |||||| | ||||| |||| |||  | ||| | ||||||| | | || ||||||||  | |||||||    
T  7582677 gatgaaatgtacttcagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttgtaaaaacttataccactcatgttcggataagaaaaatcttaagatgtc 7582776  T
Q  343 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 442  Q
    || |||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  7582777 tttcaagcacatggatacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattggttcattaaaagctcatga 7582876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 397
Target Start/End: Original strand, 15175386 - 15175740
Alignment:
Q  43 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 142  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |  || ||||| || ||||| ||  |    
T  15175386 taaactctaaagcttgactttttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgttacggcaaaagaggtttgggacactct 15175485  T
Q  143 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 242  Q
     ||||| |||||||| |  ||    ||  | |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  15175486 aaaaattcatcatgaagaaactagccacataaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 15175585  T
Q  243 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 342  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  15175586 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 15175685  T
Q  343 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 397  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  15175686 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaa 15175740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 14643720 - 14643279
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  14643720 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaactatggaggaaagtgaaagaatctatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 14643621  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||||| || ||||| || ||    ||||| |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  14643620 taaaaattcaccatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgatgaagaaaacat 14643521  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  14643520 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcccctcatgacagaattagaaaaatattaagatgt 14643421  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatg 441  Q
    || ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||  ||| || ||||| |||||  | || ||||||||||    
T  14643420 ctcccaaacacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagatctaaattccttggccctagaggatcttattggaacgcttagagctcatg 14643321  T
Q  442 aagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaa 483  Q
    || || |||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  14643320 aaattctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 14643279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 451; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 45015713 - 45016247
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015713 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactatactctaaagctagagtctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 45015812  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015813 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 45015912  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  45015913 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatg 45016012  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45016013 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 45016112  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45016113 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagca 45016212  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45016213 tctcagtcaagctcatcagttgctgatgatgatgt 45016247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 18652578 - 18653112
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652578 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 18652677  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652678 agttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 18652777  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18652778 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 18652877  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652878 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 18652977  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18652978 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 18653077  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  18653078 tctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 18653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 9512745 - 9512211
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512745 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 9512646  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9512645 agttgatgagtgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcagagaaactagaattgacattggagtc 9512546  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9512545 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 9512446  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512445 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 9512346  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9512345 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 9512246  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  9512245 tctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 9512211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 27168962 - 27168448
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168962 agtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 27168863  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27168862 atgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagagaccagaattgacattggagtcagaaa 27168763  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27168762 gtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatat 27168663  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27168662 tccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatga 27168563  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  27168562 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaagtaaagtcacttgccttgaaagcctctca 27168463  T
Q  506 gcaaagttcatcagt 520  Q
    |||||  ||||||||    
T  27168462 gcaaacctcatcagt 27168448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 535
Target Start/End: Original strand, 22903504 - 22904033
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903504 agtgcatggtcaacagatgaaaaaactcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 22903603  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22903604 atgaatgtattaatgctaaagatgtatgggatattttgatattacatcatgatggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaa 22903703  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22903704 gtttcaagtctttgaaatgagtgagaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttattacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagacatat 22903803  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    |  |||||||| | ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22903804 ttcactcatgagataatcagaaaaatattgagttgccttccaagtatgtggagacctatggtaactgcaattactcaggccaaagatttgaaatctatga 22903903  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  22903904 acttggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccaatgaagaaggtaaagtcacttgccttaaaagcctctca 22904003  T
Q  506 gcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    |||||  |||||||| | ||| ||||||||    
T  22904004 gcaaacctcatcagtagctgaagatgatgt 22904033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 391
Target Start/End: Original strand, 1791955 - 1792304
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  1791955 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 1792054  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  1792055 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 1792154  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  1792155 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 1792254  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaaga 391  Q
    ||||||| |   |||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  1792255 cttccaactcaatggagacccatggttacggcaatcactcaagctaaaga 1792304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 31358921 - 31359455
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358921 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 31359020  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359021 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 31359120  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31359121 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 31359220  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359221 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 31359320  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31359321 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 31359420  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  31359421 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 31359455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 18161425 - 18161959
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161425 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 18161524  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161525 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 18161624  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18161625 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 18161724  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161725 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 18161824  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18161825 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagca 18161924  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18161925 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18161959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 16899306 - 16899840
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899306 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 16899405  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899406 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgagatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 16899505  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16899506 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 16899605  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899606 catattcaactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 16899705  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16899706 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagca 16899805  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16899806 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16899840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 520
Target Start/End: Original strand, 34766721 - 34767235
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34766721 agtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 34766820  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34766821 atgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaa 34766920  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34766921 gtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatat 34767020  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34767021 tccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatga 34767120  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  34767121 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctca 34767220  T
Q  506 gcaaagttcatcagt 520  Q
    |||||  ||||||||    
T  34767221 gcaaacctcatcagt 34767235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 18710954 - 18710425
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18710954 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactctaaagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttg 18710855  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710854 atgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 18710755  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18710754 gtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatat 18710655  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710654 tccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatga 18710555  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18710554 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgcagttgtacttcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctca 18710455  T
Q  506 gcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    |||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18710454 gcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18710425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 18705019 - 18704490
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18705019 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactctaaagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttg 18704920  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18704919 atgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 18704820  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18704819 ttttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatat 18704720  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18704719 tccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatga 18704620  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18704619 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgcagttgtacttcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctca 18704520  T
Q  506 gcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    |||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18704519 gcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18704490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 29541812 - 29542147
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29541812 agtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 29541911  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29541912 atgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtcaatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaa 29542011  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29542012 atttgaagtctttaaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgaaatctcttggaaaggcatat 29542111  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  29542112 tccactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 29542147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 336 - 535
Target Start/End: Original strand, 29561121 - 29561320
Alignment:
Q  336 agatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagag 435  Q
    ||||||||| ||||| ||||   || |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29561121 agatgtctttcaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagag 29561220  T
Q  436 ctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  29561221 ctcatgaagtcgtacttcaaggagataaaccagtgaagaatgtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 29561320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 397
Target Start/End: Original strand, 25895804 - 25895891
Alignment:
Q  310 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 397  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25895804 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 25895891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 225
Target Start/End: Original strand, 11375030 - 11375132
Alignment:
Q  123 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 222  Q
    |||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||| | || ||||    
T  11375030 aaagaaatttgggatacattaaaaatacatcatgaaggaactagtcatgtgaaagaaacaagaattgacataggtgtacgaaaatttgaattattcgaaa 11375129  T
Q  223 tga 225  Q
    |||    
T  11375130 tga 11375132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 26201306 - 26200772
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26201306 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 26201207  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26201206 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 26201107  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26201106 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 26201007  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26201006 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 26200907  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26200906 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 26200807  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26200806 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26200772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 27413508 - 27414042
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413508 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaaggtcaggtattactaaattttaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 27413607  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27413608 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtt 27413707  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27413708 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 27413807  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413808 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 27413907  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27413908 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgctttgaaagca 27414007  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  27414008 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 27414042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 18362637 - 18363171
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362637 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 18362736  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362737 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 18362836  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18362837 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 18362936  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362937 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 18363036  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18363037 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagca 18363136  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18363137 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18363171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 33940680 - 33941214
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33940680 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 33940779  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33940780 agttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 33940879  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33940880 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 33940979  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33940980 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 33941079  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33941080 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 33941179  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  33941180 tctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 33941214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 520
Target Start/End: Original strand, 20949220 - 20949734
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949220 agtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 20949319  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20949320 atgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaa 20949419  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20949420 gtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatat 20949519  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20949520 tccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaggatttgaaatctatga 20949619  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  20949620 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctca 20949719  T
Q  506 gcaaagttcatcagt 520  Q
    |||||  ||||||||    
T  20949720 gcaaacctcatcagt 20949734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 23375873 - 23375368
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23375873 agtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctagactctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttg 23375774  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    || |||| | |||||||||||| |||||||| |  || | | |||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  23375773 ataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaaggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaa 23375674  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   ||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | ||||    
T  23375673 gtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtattttagatttactacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatat 23375574  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||     |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23375573 tccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggagacctatgga---tgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatga 23375482  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23375481 accttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaagacaaaccagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctca 23375382  T
Q  506 gcaaagttcatcag 519  Q
     |||| ||||||||    
T  23375381 acaaacttcatcag 23375368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 391
Target Start/End: Original strand, 5601579 - 5601928
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  5601579 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 5601678  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  5601679 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 5601778  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  5601779 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 5601878  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaaga 391  Q
    ||||||| |   |||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  5601879 cttccaactcaatggagacccatggttacggcaatcactcaagctaaaga 5601928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30453535 - 30453136
Alignment:
Q  43 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 142  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  30453535 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30453436  T
Q  143 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 242  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  30453435 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30453336  T
Q  243 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 342  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  30453335 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 30453236  T
Q  343 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 442  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  30453235 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 30453136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30458613 - 30458214
Alignment:
Q  43 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 142  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  30458613 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30458514  T
Q  143 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 242  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  30458513 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30458414  T
Q  243 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 342  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  30458413 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 30458314  T
Q  343 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 442  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  30458313 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 30458214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 442
Target Start/End: Original strand, 24413672 - 24414071
Alignment:
Q  43 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 142  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  24413672 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 24413771  T
Q  143 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 242  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  24413772 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 24413871  T
Q  243 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 342  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| |||| |||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  24413872 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttgaaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 24413971  T
Q  343 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 442  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  24413972 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 24414071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24299530 - 24299175
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  24299530 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 24299431  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  24299430 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 24299331  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  24299330 tgatgaaatgtattcatgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 24299231  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 397  Q
    || |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24299230 ctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 24299175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 22456621 - 22456358
Alignment:
Q  204 aaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcat 303  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| | | |||||||||  |||| ||  | |||||   ||    
T  22456621 aaatttgaaatcttcgaaatgaatgaagaggaaaacattgatgaaatgtatttcagatttacttctaaagtaaatgagttgaggtcattgggaaaaatat 22456522  T
Q  304 attctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctat 403  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||| |||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||  |    
T  22456521 attctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtcttcctaatatatggagacctatggttacagaaatcactcaagccaaagatttaaattcctt 22456422  T
Q  404 gaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaacca 467  Q
    |    | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  22456421 ggctttagaagatctcattggaacactaagagctcatgaagttttgcttcaagaagacaaacca 22456358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 483
Target Start/End: Original strand, 20037121 - 20037526
Alignment:
Q  79 taaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaa-tacatcatgagggtacatctcatgtcaaag 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| || |||| | |||||||| || ||    ||||| ||||    
T  20037121 taaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgttaaaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaag 20037220  T
Q  178 aaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaa 277  Q
    |||| || || || |||||  |  ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| ||    
T  20037221 aaacaaggatagatattggcatacgaaaattcgaaatttttgaaatgagtgaagaagaaaacattgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaa 20037320  T
Q  278 tgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatc 377  Q
    |||  | || ||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||  | ||||| ||||||||| ||  |||||    
T  20037321 tgagttaaggtcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaaacacgtggagacctatggttacaacaatc 20037420  T
Q  378 actcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaagg 477  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||  ||    | ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  20037421 actcaagccaacgatctaaattccttggctttagaaaatctcattggaacacttagagctcatgaagttctactccaagaagataaaccggtgaaaaagg 20037520  T
Q  478 taaaaa 483  Q
     |||||    
T  20037521 gaaaaa 20037526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24290023 - 24289908
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  24290023 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 24289924  T
Q  142 tgaaaatacatcatga 157  Q
    | ||||| ||||||||    
T  24289923 taaaaattcatcatga 24289908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21083233 - 21083014
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| || |||||||  ||| || |||||||  ||| ||||| || |||||||| | |||||||||  |||||||  |||    
T  21083233 ttaaactctaaagctcaactttttctaacatgtgctttaagcagggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagcct 21083134  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| |  |||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||    
T  21083133 taaaaattcatcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaagaatagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccat 21083034  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagat 261  Q
    ||||||||||| ||| ||||    
T  21083033 tgatgagatgtttgcaagat 21083014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15329521 - 15329389
Alignment:
Q  123 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 222  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  15329521 aaagaaatttgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 15329422  T
Q  223 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 255  Q
    |||  ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  15329421 tgaaggaaaccgaaaccattgatgaaatgtatg 15329389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 255
Target Start/End: Original strand, 18709238 - 18709370
Alignment:
Q  123 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 222  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  18709238 aaagaaatttgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 18709337  T
Q  223 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 255  Q
    |||  ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  18709338 tgaaggaaaccgaaaccattgatgaaatgtatg 18709370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22456783 - 22456711
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgta 114  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22456783 ttaaattccaaagctcaactctttttacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgta 22456711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 6693578 - 6694112
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693578 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 6693677  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693678 agttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 6693777  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6693778 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 6693877  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693878 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 6693977  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6693978 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 6694077  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6694078 tctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6694112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 535
Target Start/End: Original strand, 16254607 - 16255127
Alignment:
Q  10 catggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254607 catggtcaacagatgaaaaagctcaagtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 16254706  T
Q  110 atgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 209  Q
    ||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254707 atgtaagaatgctaaaga-----gggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 16254801  T
Q  210 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattcta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16254802 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattcta 16254901  T
Q  310 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 409  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254902 ctcatgatagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgtaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacct 16255001  T
Q  410 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16255002 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaa 16255101  T
Q  510 agttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16255102 agttcatcagttgctgatgatgatgt 16255127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 535
Target Start/End: Original strand, 17150738 - 17151267
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150738 agtgcatggtcaacagatgaaaatgctcaggtattgttaaactttaaagctagactctttctatcatttgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 17150837  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17150838 atgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaa 17150937  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  17150938 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaattaaatgagatatcttgaaaaggcatat 17151037  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17151038 tctactcatgtttgaattagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtttggagacctatggtcaatgcaattactcaggccaaagatttataatctatga 17151137  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151138 acctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 17151237  T
Q  506 gcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    |||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  17151238 gcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 17151267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 520889 - 520375
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520889 agtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 520790  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  520789 atgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaa 520690  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  520689 gtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaaacatat 520590  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  520589 tccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatga 520490  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  520489 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctca 520390  T
Q  506 gcaaagttcatcagt 520  Q
    |||||  ||||||||    
T  520389 gcaaacctcatcagt 520375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 7845431 - 7844905
Alignment:
Q  9 gcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatg 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7845431 gcatggtcaacagatgaaaaggctcatgtattactaaactctaaagctagactttttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatg 7845332  T
Q  109 aatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatt 208  Q
    | ||||  ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7845331 agtgtaaaaatgccaaagaggtatgggacactctgaaaatatatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgatattggagtcagaaaatt 7845232  T
Q  209 tgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattct 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7845231 tgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcttattct 7845132  T
Q  309 actcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacc 408  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7845131 acttatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaatc 7845032  T
Q  409 tggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagca 508  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  7845031 tagaagatctcattggctcattgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgcattgaaagcatctcaaca 7844932  T
Q  509 aagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  7844931 aagctcattagtagctgatgatgatgt 7844905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 54698710 - 54698311
Alignment:
Q  43 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 142  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  54698710 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 54698611  T
Q  143 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 242  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||    
T  54698610 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 54698511  T
Q  243 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 342  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  54698510 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 54698411  T
Q  343 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 442  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  54698410 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 54698311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 397
Target Start/End: Original strand, 26813342 - 26813688
Alignment:
Q  51 aaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatac 150  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  26813342 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgttactgcaaaagaagtttgggacactctaaaaattc 26813441  T
Q  151 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 250  Q
    |||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||||||| ||    
T  26813442 atcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacattgatgaaat 26813541  T
Q  251 gtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagt 350  Q
    |||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| || |||||  | ||| | ||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||     
T  26813542 gtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcactgggaaaaacttataccactcatgatcgaataagaaaaattttaagatgtcttccaagc 26813641  T
Q  351 atgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 397  Q
    |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  26813642 acatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaa 26813688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 255
Target Start/End: Original strand, 14933550 - 14933682
Alignment:
Q  123 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 222  Q
    |||||| | |||||| | || |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  14933550 aaagaaatttgggatgctttcaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtgaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 14933649  T
Q  223 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 255  Q
    |||  ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  14933650 tgaaggaaaccgaaaccatagatgaaatgtatg 14933682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 21211951 - 21211417
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211951 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 21211852  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211851 agttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 21211752  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21211751 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 21211652  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211651 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 21211552  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21211551 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 21211452  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  21211451 tctcagcaaacctcatcagttgatgatgaagatgt 21211417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 14892732 - 14892199
Alignment:
Q  2 aaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892732 aaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 14892633  T
Q  102 gttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtca 201  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14892632 gttgatgaatgtaagaatgataaagaggtatgggataccttaaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtca 14892533  T
Q  202 gaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  14892532 gaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggt 14892433  T
Q  302 atattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatct 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  14892432 atattctactcatgatagaattagaaaaatattgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggcagaagatttaaaatct 14892333  T
Q  402 atgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcat 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14892332 atgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcat 14892233  T
Q  502 ctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  14892232 ctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 14892199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 23 - 533
Target Start/End: Original strand, 22832121 - 22832631
Alignment:
Q  23 tgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgct 122  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  22832121 tgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatgaaagaaagtgaaagagttgatgagtgtaaaaatgcc 22832220  T
Q  123 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 222  Q
    ||||| |||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  22832221 aaagaggtatgggacactttgagagtacatcatgaaggtacatctcatatcaaagaaactagaattgataatggagtcagaaagtttaaggtctttgaaa 22832320  T
Q  223 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaat 322  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  22832321 tgagtgagaatgaaaccatttatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattccactcatgaaagaat 22832420  T
Q  323 tagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcatt 422  Q
      |||| || | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22832421 cggaaagattccgagatgtcttccaattatgtggagacctatcgtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaaccttgaagatctcatt 22832520  T
Q  423 ggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttg 522  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |    
T  22832521 ggttcactgagagctcctgaagtagtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagtag 22832620  T
Q  523 ttgatgatgat 533  Q
     ||||||||||    
T  22832621 ctgatgatgat 22832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 25036288 - 25035933
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  25036288 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25036189  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||| | |||| |||    
T  25036188 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25036089  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||  | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  25036088 tgatgaaatgtattcacgattcacctctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 25035989  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 397  Q
     | ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25035988 ttcccaaacacatggagacctatggttacggcaatcactcaagccaaagacttaaa 25035933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 25050325 - 25049970
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  25050325 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25050226  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||| | |||| |||    
T  25050225 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25050126  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||  | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  25050125 tgatgaaatgtattcacgattcacctctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 25050026  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 397  Q
     | ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25050025 ttcccaaacacatggagacctatggttacggcaatcactcaagccaaagacttaaa 25049970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 397
Target Start/End: Original strand, 18233759 - 18234114
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  18233759 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18233858  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  18233859 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18233958  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18233959 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 18234058  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 397  Q
    || |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18234059 ctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 18234114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 397
Target Start/End: Original strand, 18243210 - 18243565
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  18243210 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18243309  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  18243310 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18243409  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18243410 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 18243509  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 397  Q
    || |||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18243510 ctcccaaatacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 18243565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 33600840 - 33600415
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||| |||||| | ||||| || |    
T  33600840 ttaaattccaaagctcaactctttctacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaaggatttatgaatgtagtactgcaaaagaaatttgggacacat 33600741  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| ||||||||  | || || ||||| ||  ||||||||||| | || ||||||| |||| | |||| |||    
T  33600740 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacacggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgaatgaagaagaaaacat 33600641  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||  | |||||||||||| | || ||  | |||||   ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  33600640 tgatgaaatgtattccagatttacctctatagtaaatgaattaaggtcattgggaaaaatatactctcctcatgacagaatcagaaaaatcctcagatgt 33600541  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatg 441  Q
    ||||| |  || |||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| ||  ||    | ||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  33600540 cttcctaaaatatggagacctatggttacagcaatcactcaatccaaagacttaaattccttggctttagaagatctcattggaacactaagagcccatg 33600441  T
Q  442 aagttgtacttcaaggagacaaacca 467  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  33600440 aagttttgcttcaagaagacaaacca 33600415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 397
Target Start/End: Original strand, 12916388 - 12916743
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  12916388 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 12916487  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  12916488 taaaaattcatcatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttagaaatgagtgatgaagaaaacat 12916587  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  12916588 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcctctcatgacagaattagaaaaatattaagatgt 12916687  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 397  Q
    || ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  12916688 ctcccaaacacatggagacctatggttacagcaatcactcaagacaaagatctaaa 12916743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23750089 - 23749914
Alignment:
Q  86 ggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactaga 185  Q
    |||||||  ||| ||||| || |||||||| | |||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||   |||    
T  23750089 ggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagccttaaaaattcatcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaaga 23749990  T
Q  186 attgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagat 261  Q
    || ||||| ||||| |  |||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23749989 atagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccattgatgagatgtttgcaagat 23749914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 45497969 - 45497837
Alignment:
Q  123 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 222  Q
    |||||| | |||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || ||||    
T  45497969 aaagaaatttgggatgctttgaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtgaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 45497870  T
Q  223 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatg 255  Q
    |||  ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  45497869 tgaaggaaaccgaaaccatagatgaaatgtatg 45497837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 9538495 - 9539029
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538495 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 9538594  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538595 agttgatgaatgtacaaatgctaaacaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 9538694  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9538695 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 9538794  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538795 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 9538894  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9538895 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagca 9538994  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  9538995 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 9539029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 6423667 - 6424201
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423667 caaaaaatgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcgtgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 6423766  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423767 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 6423866  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6423867 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatg 6423966  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423967 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgaggtgtcttccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 6424066  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6424067 tataaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 6424166  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  6424167 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 6424201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 8974206 - 8974740
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974206 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 8974305  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974306 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 8974405  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8974406 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 8974505  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974506 catattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 8974605  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8974606 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgccttaaaagca 8974705  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  8974706 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 8974740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 456
Target Start/End: Original strand, 12387349 - 12387802
Alignment:
Q  2 aaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12387349 aaaaagtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaagtattaataaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaactgaaaga 12387448  T
Q  102 gttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtca 201  Q
    ||| |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12387449 gtttatgaatttaagaatgc-aaagaggtatgggataccttgatagtacatcatgaagttacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattgaagtca 12387547  T
Q  202 gaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggc 301  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12387548 taaagttggaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaataagatcttttggaaaggc 12387647  T
Q  302 atattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatct 401  Q
    |||||| ||| |||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| |    
T  12387648 atattccacttatgagagagtcagaaaaatattgagatgccttccaagtatgcgaagacctatggtcactgcaattactcaggctaaatatttacaatat 12387747  T
Q  402 atgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaag 456  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12387748 atgaacttggaagatctcattgattcactgatagctcatgaagttgtacttcaag 12387802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 391
Target Start/End: Original strand, 48979673 - 48980022
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  48979673 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 48979772  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  48979773 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 48979872  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  48979873 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 48979972  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaaga 391  Q
    ||||||| |   |||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  48979973 cttccaactcaatggagacccatggttacggcaatcactcaagctaaaga 48980022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 28367002 - 28366656
Alignment:
Q  51 aaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatac 150  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  28367002 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtcactgcaaaagaagtttgggacactctaaaaattc 28366903  T
Q  151 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 250  Q
    |||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||||||| ||    
T  28366902 atcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacattgatgaaat 28366803  T
Q  251 gtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagt 350  Q
    |||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| || |||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||     
T  28366802 gtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcactgggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaattttaagatgtcttccaagc 28366703  T
Q  351 atgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 397  Q
    |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  28366702 acatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaa 28366656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4384529 - 4384222
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||||||||||||| || | | | |||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || || ||||| |    
T  4384529 ttaaattctaaagctcgagtctatctatcatgcagattaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtttgagatactt 4384430  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | |||||  ||||||| || |||   || || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||| |||| ||||||| |||| |  | | |||    
T  4384429 taaaaatcaatcatgaaggaacaaggcacgtaaaagaaacaagaatagatatcggtgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaatgaataaaataacat 4384330  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||  | |||| |||  | |||||||||||| | ||||| ||||| ||  | |||||| |  |||| | ||||| ||||||| | | ||||    
T  4384329 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaattaagatcacttgggaaaacttattctgccgatgacataattaaaaaaatattaaaatgt 4384230  T
Q  342 cttccaag 349  Q
    ||||||||    
T  4384229 cttccaag 4384222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 28374823 - 28374773
Alignment:
Q  51 aaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 101  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28374823 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28374773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 28382645 - 28382595
Alignment:
Q  51 aaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 101  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28382645 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28382595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 535
Target Start/End: Original strand, 16156243 - 16156777
Alignment:
Q  1 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156243 caaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaag 16156342  T
Q  101 agttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156343 agttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtc 16156442  T
Q  201 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16156443 agaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagg 16156542  T
Q  301 catattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatc 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16156543 catattctactcatgataaaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggcaaaagatttaaaatc 16156642  T
Q  401 tatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagca 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16156643 tatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaacgagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacctgctttgaaagca 16156742  T
Q  501 tctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16156743 tctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16156777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1988165 - 1987651
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988165 agtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 1988066  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1988065 atgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaa 1987966  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1987965 gtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatat 1987866  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1987865 tccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgacttccaagtatgtggagacctatggtcactgaaatcactcaggccaaagatttgaaatctatga 1987766  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  1987765 atctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctca 1987666  T
Q  506 gcaaagttcatcagt 520  Q
    |||||  ||||||||    
T  1987665 gcaaatctcatcagt 1987651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 10 - 505
Target Start/End: Original strand, 22959697 - 22960190
Alignment:
Q  10 catggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 109  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22959697 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcattaaccttggaagaaagtgaaagggttgatga 22959796  T
Q  110 atgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 209  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| || ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22959797 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaaccactcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 22959895  T
Q  210 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattcta 309  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || || | |||| | |    
T  22959896 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaatgtatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatacca 22959995  T
Q  310 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 409  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||   |    
T  22959996 ctcatgatagaatcaggaagatactaagatgtcttccaagtatatggagacctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgacttt 22960095  T
Q  410 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  22960096 ggaagaactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaaggagataaaccagtgaggaaggtaaaatcacttaccttaaaagcttctca 22960190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 14280992 - 14280551
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||| ||||||||   ||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  14280992 ttaaactctaaagcccaactctttttacaatgttcaataaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 14280893  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  14280892 taaaaattcatcatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgatgaagaaaacat 14280793  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| ||||||| |||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  14280792 tgatgatatgtattcacgattcacttcaatagtgaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcccctcatgacagaattagaaaaattttaagatgt 14280693  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatg 441  Q
    || ||||  |  |||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||    | || |||||||||||  | || ||||||||||    
T  14280692 ctcccaaacacatggagacccatggttacagcaatcactcaagccaaagatctaaattccttggctttagaggatctcattggaacgcttagagctcatg 14280593  T
Q  442 aagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaa 483  Q
    || || |||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  14280592 aaattctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 14280551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 53506 - 52979
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53506 agtgcatggtcaatagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcattaaccatggaagaaagtgaaagagttg 53407  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53406 atgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttaaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 53307  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  53306 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatat 53207  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53206 tctactcatgatagaatcagaaaaata--gagatgtcttccaagtatatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatga 53109  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53108 acctcgaagatctcattggatcactgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaactagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctca 53009  T
Q  506 gcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
     ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  53008 tcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 52979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 6544 - 6030
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6544 agtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 6445  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6444 atgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaa 6345  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6344 gtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatat 6245  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6244 tccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatga 6145  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  6144 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctca 6045  T
Q  506 gcaaagttcatcagt 520  Q
    |||||  ||||||||    
T  6044 gcaaacctcatcagt 6030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 520
Target Start/End: Original strand, 7134 - 7648
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7134 agtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 7233  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7234 atgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaa 7333  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7334 gtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatat 7433  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7434 tccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatga 7533  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  7534 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctca 7633  T
Q  506 gcaaagttcatcagt 520  Q
    |||||  ||||||||    
T  7634 gcaaacctcatcagt 7648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 520
Target Start/End: Original strand, 10916 - 11430
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916 agtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 11015  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11016 atgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaa 11115  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11116 gtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatat 11215  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11216 tccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatga 11315  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  11316 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctca 11415  T
Q  506 gcaaagttcatcagt 520  Q
    |||||  ||||||||    
T  11416 gcaaacctcatcagt 11430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 535
Target Start/End: Original strand, 148073 - 148602
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  148073 agtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaggtattactaaactcttaagctagactctttctatcatgtgcacttaccatggaagaaagtgaaagagttg 148172  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148173 atgaatgtaagaatgctaaagaggtatgtgataccttaaaaatacatcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 148272  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  148273 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatat 148372  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148373 tatactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 148472  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  148473 acctagaggatctcattggttcactgagagctcatgacgttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaagtaaaaacacttaccttgaaagcatctca 148572  T
Q  506 gcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  148573 gcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 148602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 519
Target Start/End: Original strand, 16592 - 17097
Alignment:
Q  6 agtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttg 105  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16592 agtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctagactctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttg 16691  T
Q  106 atgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaa 205  Q
    || |||| | |||||||||||| |||||||| |  || | | |||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  16692 ataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaaggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaa 16791  T
Q  206 atttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatat 305  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   ||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | ||||    
T  16792 gtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtattttagatttactacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatat 16891  T
Q  306 tctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatga 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||     |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16892 tccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggagacctatgga---tgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatga 16983  T
Q  406 acctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16984 accttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaagacaaaccagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctca 17083  T
Q  506 gcaaagttcatcag 519  Q
     |||| ||||||||    
T  17084 acaaacttcatcag 17097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 372
Target Start/End: Original strand, 20136 - 20506
Alignment:
Q  2 aaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  20136 aaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaatctcaggtattactaaactccaaagctagactctttctatcatgtgcactgactagggaagaaagtgaaaga 20235  T
Q  102 gttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtca 201  Q
    |||||||  ||||  ||||| ||||| |||||||| ||  ||| | |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20236 gttgatgtgtgtaaaaatgccaaagatgtatgggacactctgagagtacatcataaaggtacatctcatgtcaaaggaactagaattgacattggagtca 20335  T
Q  202 gaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggc 301  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20336 gaaagtttgaactctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggc 20435  T
Q  302 atattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactg 372  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20436 atattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaagaatgtggagacctatggtcactg 20506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 366 - 535
Target Start/End: Original strand, 27670 - 27839
Alignment:
Q  366 gtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaac 465  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27670 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 27769  T
Q  466 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  27770 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 27839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 117 - 406
Target Start/End: Original strand, 1 - 290
Alignment:
Q  117 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtct 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1 aatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaagtttgaagtct 100  T
Q  217 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  101 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgaaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttagaaaagcatattccactcatga 200  T
Q  317 tagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaa 406  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  201 aagaataagaaaaataatgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaa 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 189498 - 189005
Alignment:
Q  10 catggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 109  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  189498 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcactaaccttggaagaaattgaaagggttgatga 189399  T
Q  110 atgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 209  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  189398 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaacctctcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 189300  T
Q  210 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattcta 309  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || || | ||||   |    
T  189299 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgataaaatatatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatagca 189200  T
Q  310 ctcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacct 409  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||   |    
T  189199 ctcatgatagaattaggaagatactaagatgtcttccaagtacatggaggcctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgacttt 189100  T
Q  410 ggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 505  Q
    |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  189099 ggaagtactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaaggagataaaccaatgagaaaggtaaaatcacttgccttaaaagcttctca 189005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 324 - 533
Target Start/End: Original strand, 1 - 210
Alignment:
Q  324 agaaaaatactgagatgtcttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 423  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 agaaaaatattgagatgtcttccaagtatttggagacctatggtcactgcaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 100  T
Q  424 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  101 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacactttccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgc 200  T
Q  524 tgatgatgat 533  Q
    ||||||||||    
T  201 tgatgatgat 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 366 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 87142 - 86973
Alignment:
Q  366 gtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaac 465  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  87142 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 87043  T
Q  466 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 535  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  87042 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 86973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 103224 - 102825
Alignment:
Q  43 taaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 142  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  103224 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 103125  T
Q  143 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 242  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||    
T  103124 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 103025  T
Q  243 gatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtc 342  Q
    ||||| |||||  |||||| |||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| | || ||||||||  | |||||||    
T  103024 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 102925  T
Q  343 ttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatga 442  Q
    ||||||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    || |||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  102924 ttccaagcacatggagacccatggtaactgcaatcacacaagctaaagacttaaactctttagctcttgaagatctcattgggtcattaaaagctcatga 102825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 397
Target Start/End: Original strand, 257898 - 258253
Alignment:
Q  42 ttaaattctaaagctagactatttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 141  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| |||||||||| |    
T  257898 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatatgggatacgt 257997  T
Q  142 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 241  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  257998 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 258097  T
Q  242 tgatgagatgtatgccagatgcactacaatagtaaatgaaatgagatcccttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgt 341  Q
    |||||| |||||| |  ||| |||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  258098 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 258197  T
Q  342 cttccaagtatgtggacacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaa 397  Q
    || ||||  |  |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  258198 ctcccaaaaacatggagacctatggttacagcaatcactcaagccaaagacttaaa 258253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 253
Target Start/End: Original strand, 5060 - 5196
Alignment:
Q  117 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtct 216  Q
    ||||| |||||| | |||||||| || ||  |||||||||| || ||   ||| || |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| | |    
T  5060 aatgccaaagaaatttgggatacattaaaggtacatcatgaaggcaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacattggtgttcgaaaatttgaactat 5159  T
Q  217 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgta 253  Q
    |||||||||  ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  5160 ttgaaatgaaagaaaccgaaaccatagatgaaatgta 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University