View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4197_low_7 (Length: 465)

Name: NF4197_low_7
Description: NF4197
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4197_low_7
NF4197_low_7
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-457)||(22931834-22932290)
chr6 (1-457)||(23854279-23854735)
chr6 (1-457)||(15421270-15421726)
chr6 (1-457)||(24866506-24866962)
chr6 (1-457)||(27287314-27287770)
chr6 (1-457)||(27626661-27627117)
chr6 (1-457)||(13295901-13296357)
chr6 (1-457)||(26921167-26921623)
chr6 (1-457)||(27021926-27022382)
chr6 (1-457)||(27269537-27269993)
chr6 (1-457)||(34461456-34461912)
chr6 (1-457)||(16752611-16753067)
chr6 (1-457)||(29552347-29552803)
chr6 (1-457)||(3698873-3699329)
chr6 (1-457)||(16676930-16677386)
chr6 (1-457)||(27060296-27060752)
chr6 (42-457)||(26991683-26992098)
chr6 (1-457)||(27010521-27010977)
chr6 (1-457)||(29575804-29576260)
chr6 (1-457)||(27487923-27488379)
chr6 (1-457)||(29504206-29504662)
chr6 (1-457)||(4542724-4543180)
chr6 (1-457)||(4721085-4721541)
chr6 (1-457)||(26113362-26113818)
chr6 (1-457)||(28210244-28210700)
chr6 (1-457)||(4528075-4528531)
chr6 (1-457)||(4775670-4776126)
chr6 (1-457)||(30554966-30555422)
chr6 (1-457)||(4760553-4761009)
chr6 (1-457)||(16940977-16941433)
chr6 (1-454)||(17089393-17089846)
chr6 (114-454)||(20163413-20163753)
chr6 (114-454)||(22169078-22169418)
chr6 (1-142)||(27179561-27179702)
chr6 (1-457)||(18119259-18119715)
chr6 (1-457)||(18212619-18213075)
chr6 (1-439)||(23971720-23972158)
chr6 (44-439)||(27544710-27545105)
chr6 (1-112)||(20171682-20171793)
chr6 (1-112)||(22164198-22164309)
chr6 (17-444)||(9136319-9136746)
chr6 (44-175)||(25707083-25707214)
chr6 (277-329)||(16212102-16212154)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (1-457)||(15889755-15890211)
chr3 (1-457)||(8286520-8286976)
chr3 (1-457)||(20068794-20069250)
chr3 (1-457)||(4724385-4724841)
chr3 (1-457)||(18054016-18054472)
chr3 (1-457)||(18333384-18333840)
chr3 (1-457)||(8298725-8299181)
chr3 (1-457)||(22384628-22385084)
chr3 (1-457)||(7075960-7076416)
chr3 (1-457)||(21677457-21677913)
chr3 (1-457)||(35883520-35883976)
chr3 (1-457)||(4793685-4794141)
chr3 (1-457)||(6204657-6205113)
chr3 (1-457)||(11107402-11107858)
chr3 (1-457)||(28113004-28113460)
chr3 (1-457)||(32441905-32442361)
chr3 (1-457)||(20573893-20574349)
chr3 (1-457)||(29145806-29146262)
chr3 (1-457)||(5606364-5606820)
chr3 (1-457)||(15738144-15738600)
chr3 (1-457)||(18289403-18289859)
chr3 (1-457)||(48468681-48469137)
chr3 (1-457)||(10398898-10399354)
chr3 (1-457)||(18274102-18274558)
chr3 (1-457)||(18304704-18305160)
chr3 (1-457)||(28024036-28024492)
chr3 (1-457)||(8214489-8214945)
chr3 (1-457)||(29662020-29662476)
chr3 (1-457)||(5593407-5593863)
chr3 (1-457)||(47026207-47026663)
chr3 (1-457)||(4343726-4344182)
chr3 (1-457)||(17981999-17982455)
chr3 (1-454)||(19697247-19697700)
chr3 (1-457)||(4419669-4420125)
chr3 (1-457)||(7999314-7999770)
chr3 (1-457)||(51784777-51785233)
chr3 (1-454)||(16621540-16621993)
chr3 (1-457)||(10645827-10646283)
chr3 (1-457)||(22867898-22868354)
chr3 (1-457)||(22882957-22883413)
chr3 (1-457)||(24330917-24331373)
chr3 (1-457)||(28341931-28342387)
chr3 (1-457)||(31961505-31961961)
chr3 (1-457)||(5016468-5016924)
chr3 (1-457)||(6539792-6540248)
chr3 (1-457)||(18245495-18245951)
chr3 (1-457)||(5469742-5470198)
chr3 (1-457)||(18227950-18228406)
chr3 (150-454)||(18533140-18533444)
chr3 (1-457)||(22959207-22959663)
chr3 (1-439)||(7089077-7089515)
chr3 (15-436)||(41440018-41440439)
chr3 (15-436)||(20442892-20443313)
chr3 (1-457)||(11925408-11925864)
chr3 (1-457)||(16431159-16431615)
chr3 (114-439)||(6963596-6963921)
chr3 (1-457)||(15704227-15704683)
chr3 (1-439)||(6571126-6571564)
chr3 (44-439)||(4446207-4446602)
chr3 (210-433)||(15918295-15918518)
chr3 (288-457)||(24208911-24209080)
chr3 (24-433)||(15592984-15593393)
chr3 (17-444)||(5950868-5951295)
chr3 (17-444)||(46380101-46380528)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (1-457)||(27431437-27431893)
chr2 (1-457)||(20840705-20841161)
chr2 (1-457)||(11632180-11632636)
chr2 (1-457)||(12658328-12658784)
chr2 (1-457)||(39048815-39049271)
chr2 (1-457)||(40236300-40236756)
chr2 (1-457)||(12589600-12590056)
chr2 (1-457)||(23125564-23126020)
chr2 (1-457)||(28884999-28885455)
chr2 (1-457)||(34293946-34294402)
chr2 (1-457)||(27806495-27806951)
chr2 (1-457)||(9346982-9347438)
chr2 (1-457)||(12713597-12714053)
chr2 (1-457)||(13933543-13933999)
chr2 (25-457)||(37377963-37378395)
chr2 (1-457)||(37682891-37683347)
chr2 (1-457)||(37698156-37698612)
chr2 (1-457)||(34864476-34864932)
chr2 (1-457)||(19413497-19413953)
chr2 (6-454)||(21700171-21700619)
chr2 (1-457)||(32052595-32053051)
chr2 (1-457)||(39892861-39893317)
chr2 (1-457)||(16826334-16826790)
chr2 (1-457)||(16894690-16895146)
chr2 (1-457)||(37928161-37928617)
chr2 (1-454)||(19453419-19453872)
chr2 (1-457)||(21674171-21674627)
chr2 (1-457)||(31879078-31879534)
chr2 (144-457)||(257892-258205)
chr2 (153-457)||(34288886-34289190)
chr2 (1-302)||(37948858-37949159)
chr2 (1-451)||(27394360-27394810)
chr2 (1-457)||(42393327-42393783)
chr2 (1-143)||(257649-257791)
chr2 (1-457)||(34700868-34701324)
chr2 (44-439)||(26724315-26724710)
chr2 (15-436)||(21760625-21761046)
chr2 (44-439)||(34534482-34534877)
chr2 (17-444)||(12383465-12383892)
chr2 (270-444)||(22949198-22949372)
chr2 (17-152)||(22949490-22949625)
chr2 (283-329)||(23199137-23199183)
chr2 (283-329)||(23624542-23624588)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (1-457)||(24972706-24973162)
chr5 (1-457)||(33295328-33295784)
chr5 (1-457)||(23628770-23629226)
chr5 (1-457)||(33780289-33780745)
chr5 (1-457)||(40470454-40470910)
chr5 (1-457)||(9320276-9320732)
chr5 (1-457)||(12134975-12135431)
chr5 (1-457)||(24685049-24685505)
chr5 (1-457)||(15655662-15656118)
chr5 (1-454)||(26483197-26483650)
chr5 (1-457)||(11552155-11552611)
chr5 (1-457)||(22996021-22996477)
chr5 (1-457)||(30937436-30937891)
chr5 (1-457)||(18497629-18498085)
chr5 (1-457)||(28652042-28652498)
chr5 (1-457)||(41677505-41677961)
chr5 (1-454)||(23895009-23895462)
chr5 (1-457)||(32593178-32593634)
chr5 (1-457)||(3792341-3792797)
chr5 (1-454)||(25203081-25203534)
chr5 (1-454)||(25267236-25267689)
chr5 (1-457)||(28956689-28957145)
chr5 (1-457)||(2513862-2514318)
chr5 (1-457)||(43081055-43081511)
chr5 (1-457)||(13321734-13322190)
chr5 (1-457)||(24726769-24727225)
chr5 (1-457)||(30171269-30171725)
chr5 (1-457)||(31434264-31434720)
chr5 (1-457)||(31823311-31823767)
chr5 (1-457)||(37668390-37668846)
chr5 (1-457)||(8662379-8662835)
chr5 (1-457)||(30154831-30155287)
chr5 (1-457)||(34619318-34619774)
chr5 (1-457)||(37767895-37768351)
chr5 (1-457)||(5640588-5641044)
chr5 (1-457)||(6877105-6877561)
chr5 (1-457)||(22891263-22891719)
chr5 (1-457)||(33519180-33519636)
chr5 (1-457)||(37757783-37758239)
chr5 (1-457)||(18372438-18372894)
chr5 (1-457)||(37355547-37356003)
chr5 (1-457)||(15755756-15756212)
chr5 (1-457)||(30032228-30032684)
chr5 (1-270)||(24586361-24586630)
chr5 (18-436)||(34468443-34468861)
chr5 (44-439)||(352162-352557)
chr5 (1-457)||(3484107-3484563)
chr5 (44-439)||(20388936-20389331)
chr5 (17-444)||(36375882-36376309)
chr5 (17-444)||(37000536-37000963)
chr5 (270-444)||(31520120-31520294)
chr5 (17-444)||(15784645-15785072)
chr5 (17-444)||(17956909-17957336)
chr5 (17-159)||(11944342-11944484)
chr5 (270-444)||(5440398-5440572)
chr5 (17-159)||(31520405-31520547)
chr5 (380-457)||(24684242-24684319)
chr5 (45-159)||(5440173-5440287)
chr5 (210-382)||(11944535-11944707)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (1-457)||(2157364-2157820)
chr7 (1-457)||(16515322-16515778)
chr7 (1-457)||(2107055-2107511)
chr7 (1-457)||(11421671-11422127)
chr7 (1-457)||(26316740-26317196)
chr7 (1-457)||(26271978-26272434)
chr7 (1-457)||(5130786-5131242)
chr7 (1-454)||(9621443-9621896)
chr7 (1-457)||(10913761-10914217)
chr7 (1-457)||(26534765-26535221)
chr7 (1-457)||(26438047-26438503)
chr7 (1-457)||(26515582-26516038)
chr7 (1-457)||(4202179-4202635)
chr7 (1-457)||(5144232-5144688)
chr7 (1-457)||(45390010-45390466)
chr7 (1-454)||(16748409-16748862)
chr7 (7-454)||(16446904-16447351)
chr7 (1-457)||(11443677-11444133)
chr7 (1-457)||(3448096-3448552)
chr7 (1-457)||(31561282-31561738)
chr7 (1-454)||(16044112-16044565)
chr7 (1-457)||(4142138-4142594)
chr7 (1-457)||(24589426-24589882)
chr7 (1-457)||(26666806-26667262)
chr7 (1-454)||(10842886-10843339)
chr7 (1-454)||(10844414-10844866)
chr7 (66-454)||(17526327-17526715)
chr7 (1-439)||(16237289-16237727)
chr7 (1-457)||(15192873-15193329)
chr7 (1-457)||(2556325-2556781)
chr7 (18-436)||(16287288-16287706)
chr7 (15-436)||(798429-798850)
chr7 (54-439)||(25726305-25726690)
chr7 (1-457)||(29089306-29089762)
chr7 (44-439)||(1893510-1893905)
chr7 (1-94)||(22145348-22145441)
chr7 (359-453)||(16733714-16733806)
chr7 (383-454)||(17526816-17526887)
chr7 (366-439)||(25721027-25721100)
chr7 (17-444)||(16393342-16393769)
chr7 (1-195)||(16127710-16127904)
chr7 (17-444)||(9469123-9469550)
chr7 (17-444)||(30369854-30370281)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-454)||(30089-30542)
scaffold0143 (1-454)||(18866-19319)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-457)||(2860-3316)
scaffold0089 (1-457)||(32152-32608)
scaffold0089 (1-457)||(43998-44454)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (1-457)||(27605873-27606329)
chr8 (1-457)||(14560416-14560872)
chr8 (1-457)||(18793496-18793952)
chr8 (1-457)||(2134228-2134684)
chr8 (1-457)||(18712276-18712732)
chr8 (1-454)||(19205330-19205783)
chr8 (1-454)||(28358920-28359373)
chr8 (1-457)||(19690890-19691346)
chr8 (1-457)||(19677239-19677695)
chr8 (1-457)||(29832118-29832574)
chr8 (1-457)||(9357417-9357873)
chr8 (1-457)||(12089691-12090147)
chr8 (1-457)||(31357320-31357776)
chr8 (1-457)||(33261526-33261982)
chr8 (1-457)||(31486839-31487295)
chr8 (1-319)||(16286331-16286649)
chr8 (1-451)||(22077879-22078329)
chr8 (1-457)||(14211831-14212287)
chr8 (1-457)||(22411730-22412186)
chr8 (44-439)||(16768133-16768528)
chr8 (364-457)||(16286235-16286328)
chr8 (1-439)||(19843977-19844415)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-457)||(8829-9285)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (1-457)||(14667822-14668278)
chr4 (1-457)||(24115468-24115924)
chr4 (1-457)||(34185967-34186423)
chr4 (1-457)||(54836197-54836653)
chr4 (1-457)||(17015852-17016308)
chr4 (1-457)||(5008681-5009137)
chr4 (1-457)||(24589368-24589824)
chr4 (1-457)||(6572664-6573120)
chr4 (1-457)||(14760313-14760769)
chr4 (1-457)||(39853443-39853899)
chr4 (1-457)||(18797621-18798077)
chr4 (1-457)||(27160324-27160780)
chr4 (1-457)||(33670807-33671263)
chr4 (1-454)||(15230681-15231134)
chr4 (1-457)||(18314185-18314641)
chr4 (1-457)||(30756566-30757022)
chr4 (1-457)||(36341524-36341980)
chr4 (1-457)||(14101349-14101805)
chr4 (1-457)||(31123519-31123975)
chr4 (1-457)||(40102644-40103100)
chr4 (1-457)||(21972507-21972963)
chr4 (1-454)||(1903063-1903516)
chr4 (25-454)||(15281959-15282388)
chr4 (1-457)||(15388385-15388841)
chr4 (1-142)||(20335428-20335569)
chr4 (1-457)||(14725806-14726262)
chr4 (1-457)||(19767145-19767601)
chr4 (44-439)||(22146619-22147014)
chr4 (18-439)||(1882123-1882544)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-457)||(15374-15830)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-457)||(12364-12820)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-457)||(22672-23128)
scaffold0159 (1-457)||(6186-6642)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-457)||(23198-23654)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (1-457)||(10947872-10948328)
chr1 (1-457)||(10965460-10965916)
chr1 (1-457)||(51641013-51641469)
chr1 (1-454)||(16205041-16205494)
chr1 (1-457)||(28587780-28588236)
chr1 (1-446)||(20463782-20464227)
chr1 (1-457)||(41790317-41790773)
chr1 (1-143)||(3644241-3644383)
chr1 (1-439)||(22488834-22489272)
chr1 (17-444)||(5629021-5629448)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-457)||(10742-11198)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-457)||(11935-12391)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-457)||(33252-33709)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-457)||(8808-9271)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-454)||(8841-9294)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (1-454)||(5678-6131)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (6-457)||(43753-44230)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (1-439)||(49967-50405)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-457)||(10011-10467)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (12-433)||(35258-35679)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (44-439)||(4965-5360)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (17-444)||(28976-29403)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (1-57)||(1116-1172)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (322-433)||(5074-5185)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (283-325)||(85042-85084)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 22931834 - 22932290
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931834 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 22931933  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931934 tccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 22932033  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22932034 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaagagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 22932133  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22932134 cagcattaattagaccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgatgaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 22932233  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22932234 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 22932290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 23854279 - 23854735
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854279 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 23854378  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854379 tccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 23854478  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854479 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaagagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 23854578  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854579 cagcattaattagaccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgatgaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 23854678  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854679 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 23854735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 15421270 - 15421726
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15421270 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 15421369  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15421370 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgctcc 15421469  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15421470 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 15421569  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15421570 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 15421669  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15421670 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtgttatc 15421726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24866962 - 24866506
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24866962 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagtaactt 24866863  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24866862 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 24866763  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24866762 tcatctgttgactttacgatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaagagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 24866663  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24866662 cagcattaattagaccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 24866563  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24866562 attgtaactggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 24866506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 27287314 - 27287770
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287314 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactt 27287413  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27287414 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgttcc 27287513  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287514 tcatctgttgactttacaatcatatcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 27287613  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287614 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtcccccatggggtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 27287713  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27287714 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtgttatc 27287770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 27626661 - 27627117
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626661 cttgcttctcggtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactt 27626760  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27626761 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 27626860  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27626861 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatatcatgaaacagagtagtcattcccctttgataggtagcac 27626960  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626961 cagcgttaattaggccgaatggcatcaccttgtagcagaaagtcccccatggggtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 27627060  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27627061 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 27627117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 13295901 - 13296357
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295901 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 13296000  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13296001 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 13296100  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13296101 tcatctgttgactttacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 13296200  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13296201 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 13296300  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13296301 attgtaactggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 13296357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26921623 - 26921167
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921623 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactt 26921524  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921523 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 26921424  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26921423 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttgataggtagcac 26921324  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921323 cagcattaattagaccgaacgacatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 26921224  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26921223 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtattatc 26921167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 27022382 - 27021926
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022382 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 27022283  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27022282 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatactcaacatgttgctcc 27022183  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022182 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 27022083  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022082 cagcatttattaggccgaacagcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 27021983  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27021982 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 27021926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 27269537 - 27269993
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269537 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcctggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 27269636  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27269637 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgttcc 27269736  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27269737 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 27269836  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27269837 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtaacagaaagtcccccatggggtgatgaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 27269936  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27269937 attgtacccggagaaaccatccatgaaggagaacactttagactgagcagtattatc 27269993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 34461456 - 34461912
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461456 cttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 34461555  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  34461556 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatccttgtcaaatactcaacatgttgttcc 34461655  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34461656 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacgtatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 34461755  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461756 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 34461855  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461856 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 34461912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16753067 - 16752611
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16753067 cttgtttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataattt 16752968  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16752967 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatactcaacatgttgctcc 16752868  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752867 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 16752768  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752767 cagcattaattaggccgaacagcatcactttgtagcagaaagtaccccacggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 16752668  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16752667 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtattatc 16752611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29552803 - 29552347
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29552803 cttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 29552704  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  29552703 cccggatctgacgccgaatgtatatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgttcc 29552604  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29552603 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtggatcatgtcatgaaacagggtagtcatccctctttggtaggtagcac 29552504  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29552503 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtcccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 29552404  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29552403 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 29552347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 3699329 - 3698873
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699329 cttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 3699230  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  3699229 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgttcc 3699130  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3699129 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 3699030  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699029 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 3698930  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3698929 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 3698873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16677386 - 16676930
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16677386 cttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaccgaagcctaataactt 16677287  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16677286 cccggatctgacgccgaatgtacacttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaacatgttgctcc 16677187  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16677186 tcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 16677087  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677086 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 16676987  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676986 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 16676930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 27060752 - 27060296
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27060752 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataattt 27060653  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27060652 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaaacgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 27060553  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27060552 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttgataggtagcac 27060453  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27060452 cagcatttatcaagccgaacggcatcactttgtagcaaaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 27060353  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27060352 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 27060296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26992098 - 26991683
Alignment:
Q  42 cggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26992098 cggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatc 26991999  T
Q  142 gaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttc 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26991998 gaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttc 26991899  T
Q  242 gacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26991898 gacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcaccagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaa 26991799  T
Q  342 gcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttag 441  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26991798 gtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttag 26991699  T
Q  442 actgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||||||||||    
T  26991698 actgagcagtattatc 26991683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 27010977 - 27010521
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010977 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 27010878  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27010877 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 27010778  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27010777 tcatctgctgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 27010678  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010677 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 27010578  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27010577 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 27010521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29576260 - 29575804
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29576260 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 29576161  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29576160 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 29576061  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  29576060 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 29575961  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29575960 cagcattgattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtcccacatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 29575861  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29575860 attataaccagaaaaaccatccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 29575804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 27488379 - 27487923
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488379 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 27488280  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  27488279 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatccttgttaaatattcaacatgctgctcc 27488180  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27488179 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 27488080  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488079 cagcattgattagaccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgatgaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 27487980  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27487979 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 27487923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29504662 - 29504206
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29504662 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 29504563  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29504562 cccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 29504463  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29504462 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 29504363  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29504362 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcctcaggagacattttgatctg 29504263  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29504262 attataaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagtagtattatc 29504206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 4542724 - 4543180
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542724 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 4542823  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4542824 tccggacctgacactgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 4542923  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4542924 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 4543023  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4543024 cggcattgattaggccgaacggcatcactttgtaacagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctg 4543123  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4543124 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 4543180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 4721085 - 4721541
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721085 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 4721184  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4721185 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 4721284  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4721285 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 4721384  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721385 cggcattgattaggccgaacggcatcactttgtaacagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 4721484  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4721485 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 4721541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 26113362 - 26113818
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113362 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 26113461  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  26113462 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttagatattcaacatgctgctcc 26113561  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26113562 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 26113661  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113662 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtaacagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 26113761  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26113762 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 26113818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28210700 - 28210244
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28210700 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 28210601  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28210600 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 28210501  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28210500 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 28210401  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28210400 cggcattgattaggccgaacggcatcactttgtaacagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 28210301  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28210300 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 28210244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4528531 - 4528075
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528531 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 4528432  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4528431 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcagtcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 4528332  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4528331 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 4528232  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528231 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggcgtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 4528132  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4528131 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 4528075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4776126 - 4775670
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776126 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcaacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 4776027  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4776026 tccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 4775927  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4775926 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 4775827  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4775826 cagcattgattaggccgaacgacatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 4775727  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4775726 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 4775670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 30554966 - 30555422
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30554966 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgataatgaagcctaataactt 30555065  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30555066 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 30555165  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30555166 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 30555265  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30555266 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatttg 30555365  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30555366 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 30555422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4761009 - 4760553
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761009 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggaccttatcgggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 4760910  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4760909 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 4760810  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  4760809 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtggcac 4760710  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760709 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaggatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 4760610  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4760609 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 4760553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 16940977 - 16941433
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16940977 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttgactgacaatgaagcctaataactt 16941076  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16941077 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttaggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 16941176  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16941177 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 16941276  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16941277 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatttg 16941376  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16941377 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 16941433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 17089393 - 17089846
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17089393 cttgcttctcggtccgtggggccggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagcaactt 17089492  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17089493 tcccgatctgacaccgaacgtacatttattaggattcaatcggagcctgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaagtattcgacatgttgctcc 17089592  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17089593 tcatcttttgacttcacaatcatatcgtccacatacacttcgacttctttttgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcgc 17089692  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17089693 cagcatttattaagccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtgatgaaagatgtcttttctctatcctcaggggacattttgatctg 17089792  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17089793 attgtaaccggaaaagccatccatgaaagagaataccttggactgagcagtatt 17089846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 114 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20163753 - 20163413
Alignment:
Q  114 ccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgact 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||  | ||||    
T  20163753 ccgaacgtacatttgttaggattcaagcgaagcttgtactttctacacctttcgaacatcttcgtcaggtattcgacatgttgctcctcatccctcgact 20163654  T
Q  214 ttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattag 313  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||    
T  20163653 tcacaatcatatcatccacatacacttcgacttccttgtgaatcatatcatgaaacagagtagtcatccccctttggtaggtagcactagcatttatcag 20163554  T
Q  314 accgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggag 413  Q
     ||||| | |||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20163553 gccgaacgacatcactttgtaacagagagtaccccatggggtgatgaaagacgtcttttctctatcttcaggggacatcttgatctgattgtaaccagag 20163454  T
Q  414 aaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    || || |||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  20163453 aagccatccatgaaagagaacactttggattgagcagtatt 20163413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 114 - 454
Target Start/End: Original strand, 22169078 - 22169418
Alignment:
Q  114 ccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgact 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||  | ||||    
T  22169078 ccgaacgtacatttgttaggattcaagcgaagcttgtactttctacacctttcgaacatcttcgtcaggtattcgacatgttgctcctcatccctcgact 22169177  T
Q  214 ttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattag 313  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||    
T  22169178 tcacaatcatatcatccacatacacttcgacttccttgtgaatcatatcatgaaacagagtagtcatccccctttggtaggtagcactagcatttatcag 22169277  T
Q  314 accgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggag 413  Q
     ||||| | |||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22169278 gccgaacgacatcactttgtaacagagagtaccccatggggtgatgaaagacgtcttttctctatcttcaggggacatcttgatctgattgtaaccagag 22169377  T
Q  414 aaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    || || |||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  22169378 aagccatccatgaaagagaacactttggattgagcagtatt 22169418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27179702 - 27179561
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27179702 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 27179603  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcg 142  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27179602 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcg 27179561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18119715 - 18119259
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  18119715 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 18119616  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  18119615 accagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 18119519  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || |||||||| || |    
T  18119518 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctttggtaagtgg 18119419  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  18119418 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 18119319  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  18119318 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 18119259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 18212619 - 18213075
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  18212619 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacctttttgactgacgataaagcctaggagttt 18212718  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  18212719 accagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 18212815  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || |||||||| || |    
T  18212816 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctttggtaagtgg 18212915  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  18212916 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 18213015  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  18213016 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 18213075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 23971720 - 23972158
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  23971720 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctttgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 23971819  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  23971820 accagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 23971916  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    || || |||||||| || || || || || |||| ||||||||||||||| ||||||||     | ||||| || |||||||| || |    
T  23971917 tcttctgtgccagaattaacaatcatatcatctacgtagacctcgatttctttgtgaatcatatcatgaaaatttttggtcatgcccctttggtaagtgg 23972016  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || |  || |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  23972017 caccagcatttatcaacccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 23972116  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23972117 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaacctt 23972158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27545105 - 27544710
Alignment:
Q  44 gactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || || | ||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27545105 gactttgtcaggatctacttcaatacccttctggctgacgataaaacccaagagcttgccggatctaacaccgaaggtacacttgttaggattcaaacgg 27545006  T
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcga 243  Q
    || ||||||||||||||||  | |||||||||   |||||| ||||||||||  || |||     ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  27545005 agtttgtactttctcaaccggtggaacatcttcaacaaatactcaacatgttcttcttcagtacctgatttgacaatcatgtcatccacatacacttcaa 27544906  T
Q  244 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagc 343  Q
      ||||| || ||||| || || || |   ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |  || || ||||| |||  ||||||||| ||    
T  27544905 tctctttatgtatcatatcgtggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggcaccagcatttatcaacccaaacggcattactaagtagcagaacgc 27544806  T
Q  344 gccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  27544805 gccccaaggcgtgatgaacgacgtcttttctctatcttctggagccatcttgatctggttatacccggagaatccatccatgaaggagaatacctt 27544710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20171793 - 20171682
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||    
T  20171793 cttgtttctcagtctgcggaaccggcatttctcggatggcgcggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctagcagctt 20171694  T
Q  101 tccggatctgac 112  Q
    ||| ||||||||    
T  20171693 tccagatctgac 20171682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 22164198 - 22164309
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||    
T  22164198 cttgtttctcagtctgcggaaccggcatttctcggatggcgcggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctagcagctt 22164297  T
Q  101 tccggatctgac 112  Q
    ||| ||||||||    
T  22164298 tccagatctgac 22164309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 9136319 - 9136746
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  | |||||||||||| || ||     
T  9136319 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaagctttccggatctaacacca 9136418  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||    |||||||     
T  9136419 aaagtgcatttgttgggattcagacgaagtttgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaattgacttg 9136517  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  9136518 actatcatatcatccacatagacttcaatctctttatgtatcatatcgtggaaaagagtagtcatacccctctgataagtagctccggcattgattaaac 9136617  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  9136618 cgaacggcattactttgtaacagaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaa 9136717  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  9136718 tccatccatgaatgagaagactttagact 9136746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25707214 - 25707083
Alignment:
Q  44 gactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||    
T  25707214 gactttgtcgggatctacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacaccaaaggtacacttcttaggattcaaccga 25707115  T
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctt 175  Q
    || |||||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  25707114 agtttgtacattctcaaccgttgaaacatctt 25707083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16212154 - 16212102
Alignment:
Q  277 tcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcact 329  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  16212154 tcattgctctctggtatgtagcaccagcattttttagaccaaatggcatcact 16212102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 15889755 - 15890211
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889755 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 15889854  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889855 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 15889954  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15889955 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 15890054  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15890055 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccacggagtgataaaagacgtcttttctttatcttcaggagacattttgatctg 15890154  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15890155 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 15890211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 8286520 - 8286976
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286520 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 8286619  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286620 tccggatctgacgtcgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 8286719  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286720 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaatagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 8286819  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286820 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 8286919  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286920 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 8286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 20069250 - 20068794
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069250 cttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 20069151  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069150 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttggcattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 20069051  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20069050 tcatctgttgactttacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 20068951  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20068950 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 20068851  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20068850 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtattatc 20068794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4724841 - 4724385
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724841 cttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 4724742  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724741 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 4724642  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724641 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 4724542  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724541 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 4724442  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4724441 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtattatc 4724385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18054472 - 18054016
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054472 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcagatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 18054373  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054372 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 18054273  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18054272 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcctgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 18054173  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054172 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18054073  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18054072 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcattattatc 18054016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18333840 - 18333384
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333840 cttgcttctcggtctgtggtgctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 18333741  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18333740 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatattcaacatgttgctcc 18333641  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333640 tcatctgttgactttacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 18333541  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333540 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18333441  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333440 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 18333384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 8299181 - 8298725
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299181 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 8299082  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299081 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 8298982  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8298981 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 8298882  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8298881 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagtagaaggtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 8298782  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8298781 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 8298725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 22384628 - 22385084
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384628 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 22384727  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384728 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 22384827  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22384828 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtggcac 22384927  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384928 cagcatttattaagccgaatggcatcactttatagcagaaaataccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 22385027  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22385028 attgtaaccggagaaaccgtcgatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 22385084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 7076416 - 7075960
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076416 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 7076317  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7076316 cccggacctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcagcctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 7076217  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7076216 tcatctgtcgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 7076117  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7076116 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 7076017  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076016 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 7075960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21677913 - 21677457
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677913 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 21677814  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21677813 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcagtcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaacatgttgctcc 21677714  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21677713 tcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 21677614  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677613 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 21677514  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677513 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 21677457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 35883976 - 35883520
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35883976 cttgcttctcggtctgtggtgctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 35883877  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35883876 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 35883777  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35883776 tcatctattgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 35883677  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35883676 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 35883577  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35883576 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcggtattatc 35883520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 4793685 - 4794141
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793685 cttgcttctcggtctgttgagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 4793784  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4793785 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatactcaacatgttgctcc 4793884  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4793885 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatttctctttggtaggtagcac 4793984  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4793985 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatctttaggagacattttgatctg 4794084  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4794085 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 4794141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6205113 - 6204657
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205113 cttgcttctcagtctgtggagctggcatttcttggatggcccgaactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 6205014  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205013 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 6204914  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6204913 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 6204814  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204813 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 6204714  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6204713 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtattatc 6204657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 11107402 - 11107858
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107402 cttgcttctcggtctgtggaactggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 11107501  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11107502 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 11107601  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11107602 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacttcgacctctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 11107701  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107702 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 11107801  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107802 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 11107858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 28113004 - 28113460
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28113004 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccgtactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 28113103  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28113104 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 28113203  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28113204 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 28113303  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28113304 cagcattgattaggccgaacgacatcactttgtagcagaaagtaccccatggcgtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 28113403  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28113404 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 28113460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 32442361 - 32441905
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442361 cttgcttctcgatccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 32442262  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32442261 cccggatctgacgccgaatatacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatactcaacatgttgctcc 32442162  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442161 tcatctgttgactttacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 32442062  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442061 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 32441962  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32441961 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtattatc 32441905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 20573893 - 20574349
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573893 cttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 20573992  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20573993 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaacatgttgctcc 20574092  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20574093 tcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 20574192  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20574193 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 20574292  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20574293 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 20574349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 29145806 - 29146262
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145806 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatacccttttggctgacaatgaagcctaataactt 29145905  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145906 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtatttccttaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 29146005  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29146006 tcatttgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 29146105  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29146106 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 29146205  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29146206 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 29146262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 5606364 - 5606820
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5606364 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 5606463  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5606464 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 5606563  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5606564 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacctctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 5606663  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5606664 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 5606763  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5606764 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 5606820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 15738144 - 15738600
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15738144 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggattgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 15738243  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  15738244 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatactcgacatgttgctcc 15738343  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15738344 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcataaaatagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 15738443  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15738444 cagtatttattaggccgaacggcatcgctttgtagcagaaagtgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 15738543  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15738544 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 15738600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 18289403 - 18289859
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18289403 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 18289502  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18289503 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcatcaaatattcaacatgttgctcc 18289602  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18289603 tcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttctttgtggatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 18289702  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289703 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18289802  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289803 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 18289859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 48469137 - 48468681
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48469137 cttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 48469038  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  48469037 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcagtcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgttaaatattcaacatgttgctcc 48468938  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48468937 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 48468838  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48468837 caacattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 48468738  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48468737 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 48468681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 10399354 - 10398898
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399354 cttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 10399255  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  10399254 cccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgttcc 10399155  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10399154 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtggatcatgtcatgaaacagggtagtcatccctctttggtaggtagcac 10399055  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399054 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 10398955  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10398954 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtattatc 10398898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 18274102 - 18274558
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18274102 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 18274201  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18274202 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcatcaaatattcaacatgttgctcc 18274301  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18274302 tcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttctttgtggatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 18274401  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18274402 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18274501  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18274502 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 18274558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 18304704 - 18305160
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18304704 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 18304803  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18304804 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcatcaaatattcaacatgttgctcc 18304903  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18304904 tcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttctttgtggatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 18305003  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18305004 caacatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18305103  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18305104 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 18305160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28024492 - 28024036
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28024492 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 28024393  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28024392 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttatattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 28024293  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28024292 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 28024193  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28024192 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtaacagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattctgatctg 28024093  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28024092 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 28024036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 8214945 - 8214489
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8214945 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 8214846  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8214845 cccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgctcc 8214746  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8214745 tcatctattgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttctttgtggatcatgtcatgaaatagggtagtcatccctctttggtaggtagcac 8214646  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8214645 cagcattgattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 8214546  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8214545 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 8214489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 29662020 - 29662476
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29662020 cttgcttctcggtctgtggggctggcatttctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 29662119  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  29662120 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtatcttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaacatgttgctct 29662219  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29662220 tcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacctctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 29662319  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29662320 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagatattttgatctg 29662419  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29662420 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 29662476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 5593407 - 5593863
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593407 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 5593506  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5593507 cccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 5593606  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5593607 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 5593706  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593707 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 5593806  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5593807 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 5593863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 47026663 - 47026207
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47026663 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 47026564  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47026563 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 47026464  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  47026463 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 47026364  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47026363 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 47026264  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47026263 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 47026207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 4343726 - 4344182
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4343726 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 4343825  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4343826 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 4343925  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4343926 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctatgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 4344025  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4344026 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 4344125  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4344126 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 4344182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 17981999 - 17982455
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17981999 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 17982098  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17982099 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 17982198  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17982199 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 17982298  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982299 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 17982398  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17982399 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 17982455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 19697700 - 19697247
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19697700 cttgtttctcggtccttggagctggcatttcttggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttctggctgacaatgaagcctagtaactt 19697601  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19697600 tctggatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaagtattcaacatgtttctcc 19697501  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19697500 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 19697401  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19697400 cagcatttattaggccgaacggcattactttgtagcagaaagtaccccatggggtaataaaagatgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctg 19697301  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19697300 attgtaaccggagaagccatccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 19697247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4420125 - 4419669
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4420125 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 4420026  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4420025 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgttgctcc 4419926  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4419925 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 4419826  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4419825 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 4419726  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4419725 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 4419669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 7999770 - 7999314
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7999770 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaacaactt 7999671  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7999670 gccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 7999571  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7999570 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 7999471  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7999470 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 7999371  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7999370 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 7999314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 51785233 - 51784777
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51785233 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 51785134  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51785133 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 51785034  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  51785033 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 51784934  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51784933 cagcattgattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtcccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 51784834  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51784833 attataaccagaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 51784777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 16621540 - 16621993
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16621540 cttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcgaatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagtaactt 16621639  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16621640 tccagatctgaccccgaacgtacacttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgacatgttgctcc 16621739  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16621740 tcatcttttgacttcacaatcatatcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttagtaggtagcac 16621839  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16621840 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccctatggggtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctg 16621939  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16621940 attgtaaccggagaagccatccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 16621993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 10646283 - 10645827
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10646283 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaacaactt 10646184  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10646183 gccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 10646084  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10646083 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 10645984  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10645983 cagcattgattaggccgaacgacatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 10645884  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10645883 attataaccggaaaaaccgtccatgaaagagaacaccttagattgagcagtattatc 10645827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 22867898 - 22868354
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22867898 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcgatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 22867997  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22867998 tccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 22868097  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22868098 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 22868197  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22868198 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 22868297  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22868298 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 22868354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 22882957 - 22883413
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22882957 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcgatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 22883056  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22883057 tccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 22883156  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22883157 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 22883256  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883257 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 22883356  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22883357 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 22883413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24331373 - 24330917
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24331373 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaaacctaataactt 24331274  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  24331273 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgttcc 24331174  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24331173 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 24331074  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24331073 cagcattaattagaccgaacggcatcactttgtagcaaaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 24330974  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24330973 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 24330917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28342387 - 28341931
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342387 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 28342288  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  28342287 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgttcc 28342188  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28342187 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 28342088  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28342087 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 28341988  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28341987 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 28341931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 31961505 - 31961961
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31961505 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggacggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 31961604  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31961605 gccggatctgacgccgaatgtacatttgctgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 31961704  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31961705 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 31961804  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31961805 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 31961904  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31961905 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 31961961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5016924 - 5016468
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5016924 cttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 5016825  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5016824 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 5016725  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  5016724 tcctctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 5016625  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5016624 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 5016525  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5016524 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 5016468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 6539792 - 6540248
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539792 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggaccttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 6539891  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6539892 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 6539991  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6539992 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 6540091  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6540092 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 6540191  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6540192 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 6540248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18245951 - 18245495
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18245951 cttgcttctctatctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 18245852  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  18245851 tcctgacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatccttgttaaatattcaacatgctgctcc 18245752  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18245751 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 18245652  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18245651 cagcattgattagaccaaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18245552  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18245551 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 18245495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5470198 - 5469742
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5470198 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttttcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 5470099  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5470098 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtatttcctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatttaacatgctgctcc 5469999  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5469998 tcatctgctgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 5469899  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5469898 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtaacagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 5469799  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5469798 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 5469742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18228406 - 18227950
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228406 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 18228307  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18228306 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 18228207  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  18228206 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 18228107  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18228106 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttctctctatcttcaggagacatcttgatttg 18228007  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18228006 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 18227950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 150 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 18533444 - 18533140
Alignment:
Q  150 tactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18533444 tactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtactcaacatgttgctcctcatctgttgacttcacaatcatatcgtccacatatacttcgacttcct 18533345  T
Q  250 tgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgcccca 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  18533344 tgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcatttattaggctgaacggcatcactttctagcagaaagtacccca 18533245  T
Q  350 tggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagca 449  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18533244 tgggatgataaaagacgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctgattgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttggactgagca 18533145  T
Q  450 gtatt 454  Q
    |||||    
T  18533144 gtatt 18533140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 22959663 - 22959207
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  22959663 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 22959564  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  22959563 accagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 22959467  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || |||||||| || |    
T  22959466 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctttggtaagtgg 22959367  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  22959366 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 22959267  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  22959266 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtattatc 22959207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 7089077 - 7089515
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  7089077 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 7089176  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  7089177 accagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 7089273  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | |||||| ||||||||||||||||| |   | ||||| || |||||||| ||||    
T  7089274 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttatgaatcatgtcatgaaatatcttggtcatgcccctttggtaagtag 7089373  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  7089374 caccagcatttatcaatccgaatggcattactaaatagcagaaagcgccccaaggcgtgatgaatgatgttttttctctatcttcaggagccatcctgat 7089473  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7089474 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacccctt 7089515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41440439 - 41440018
Alignment:
Q  15 tgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |  | |||||||||||| || |    
T  41440439 tgcggagctggcatttctctgatggctttgaccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaatgaagcccagaagctttccggatctaacac 41440340  T
Q  115 cgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactt 214  Q
    | || ||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||| | || || ||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||    |||||||    
T  41440339 caaaagtacatttgttgggattcagacgaagtctgtactttcttagccgttggaacatctttagcaaatactcaacatgttgttcttcagtgattgactt 41440240  T
Q  215 tacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattaga 314  Q
     || |||||||| |||||||| || || |  |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || | |    
T  41440239 gacgatcatgtcatccacataaacctcaatctctttgtgtatcatgtcgtgaaagatagtagtcatacccctttgataagtagctcctgcattgatcaaa 41440140  T
Q  315 ccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggaga 414  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41440139 ccgaacggcattactctgtaacagaaagtgccccaaggtgtgatgaaagacgtcttctctctgtcttcgggcgccatcttgatctgattgtaaccggaga 41440040  T
Q  415 aaccgtccatgaaggagaacac 436  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  41440039 aaccatccatgaaggagaacac 41440018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20443313 - 20442892
Alignment:
Q  15 tgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |  | |||||||||||| || |    
T  20443313 tgcggagctggcatttctctgatggctttgaccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaatgaagcccagaagctttccggatctaacac 20443214  T
Q  115 cgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactt 214  Q
    | || ||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||| | || || ||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||    |||||||    
T  20443213 caaaagtacatttgttgggattcagacgaagtctgtactttcttagccgttggaacatctttagcaaatactcaacatgttgttcttcagtgattgactt 20443114  T
Q  215 tacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattaga 314  Q
     || |||||||| |||||||| || || |  |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || | |    
T  20443113 gacgatcatgtcatccacataaacctcaatctctttgtgtatcatgtcgtgaaagatagtagtcatacccctttgataagtagcccctgcattgatcaaa 20443014  T
Q  315 ccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggaga 414  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||| | ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20443013 ccgaacggcattactctgtaacagaaagtgccccaaggtgtgatgaaagacgtcttctctttgtcttcgggcgccatcttgatctgattgtaaccggaga 20442914  T
Q  415 aaccgtccatgaaggagaacac 436  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  20442913 aaccatccatgaaggagaacac 20442892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 11925408 - 11925864
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  11925408 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 11925507  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  11925508 accagatctaacaccgaaagtaaatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 11925604  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || || ||||| || |    
T  11925605 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctctggtaagtgg 11925704  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  11925705 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 11925804  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||    
T  11925805 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttacacttagcagtgttatc 11925864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16431615 - 16431159
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  16431615 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacctttttgactgacgataaagcctaggagttt 16431516  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  16431515 accagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 16431419  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || |||||||| || |    
T  16431418 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctttggtaagtgg 16431319  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  16431318 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 16431219  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  16431218 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 16431159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 439
Target Start/End: Original strand, 6963596 - 6963921
Alignment:
Q  114 ccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgact 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||| ||| ||||||  || |||     |||||    
T  6963596 ccgaaggtacacttgttaggattcaaccggagtttgtactttctcaaccgttgaaacatctttaacaaatactcagcatgttcttcttcagtgcctgact 6963695  T
Q  214 ttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattag 313  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |   ||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |     
T  6963696 tgacaatcatatcatccacatatacttcaatctctttatgtatcatatcatggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggcgccagcatttatcaa 6963795  T
Q  314 accgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggag 413  Q
     || |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || || ||     
T  6963796 tccaaatggcattactaagtagcagaaagcgccccatggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcttccggagccatcttgatctggttatacccagaa 6963895  T
Q  414 aaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    || || ||||||||||||||||||||    
T  6963896 aacccatccatgaaggagaacacctt 6963921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 15704683 - 15704227
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | ||||||||||  ||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |  ||    
T  15704683 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctaatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcccaggagttt 15704584  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||    ||||| ||||||||   |||     
T  15704583 accagatctgacgccgaaggtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaataaatactcaacatg---ctct 15704487  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | |||||| |||||||||||||| || |   | ||||| ||||| ||||| || |    
T  15704486 tcttctgtgccagacttgacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttatgaatcatgtcatggaatattttggtcatgcctctctggtaagtgg 15704387  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||    || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||    
T  15704386 caccagcgtttatcaacccaaatggcatcaccaaataacagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttccctatcttctggagccatctttat 15704287  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  | | ||||||||||||    
T  15704286 ctgattataaccggagaaaccgtccatgaaggaaaaaaccttgcatttagcagtattatc 15704227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 6571564 - 6571126
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  6571564 cttgtttctctgtctttggagcaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 6571465  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  6571464 accagatctgacactgaaggtacatttgttaggattcaaccggagtttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 6571368  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || ||||| | ||||||||||||||||||||| || |   | ||||| ||||| ||||| || |    
T  6571367 tcttctgtgccagacttgacaatcatatcatctacgtagacttcaatttctttgtgaatcatgtcatggaatattttggtcatgcctctctggtaagtgg 6571268  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||    || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  6571267 caccagcgtttatcaacccaaatggcatcaccaaataacaaaaagcaccccaaggcgtgatgaaggacgtcttttctctatcttctggagccatctttat 6571168  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6571167 ctgattatacccggaaaaaccgtccatgaaggagaatacctt 6571126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 4446602 - 4446207
Alignment:
Q  44 gactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4446602 gactttgtcgggatctacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacaccgaaggtacacttgttaggattcaaacgg 4446503  T
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcga 243  Q
    || |||||||||||||||| ||  ||||||||   |||||| ||||||||||  || |||     ||| || || |||||||| |||||||| ||||| |    
T  4446502 agtttgtactttctcaaccgttgaaacatcttcaacaaatactcaacatgttcttcttcagtgcctgatttgacgatcatgtcatccacatacacttcaa 4446403  T
Q  244 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagc 343  Q
      ||||| || ||||| ||||| || |   ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |  || || | ||| |||  ||||||||||||    
T  4446402 tctctttatgtatcatatcatggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggcaccagcatttatcaacccaaacgacattactaagtagcagaaagc 4446303  T
Q  344 gccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||   |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4446302 accccaaggcgtgatgaacgacgtcttttctctatcttctggagccatcttgatctggttatacttggagaatccatccatgaaggagaatacctt 4446207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15918518 - 15918295
Alignment:
Q  210 gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaa 309  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || || |  ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || || || || ||||| |||||||| |    
T  15918518 gacttgactatcatgtcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatgtcatgaaagatagtagtcatacccctctgataagtagctccagcattga 15918419  T
Q  310 ttagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaacc 409  Q
    | |  ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||    
T  15918418 tcaacccgaacggcattactctgtaacagaaagtgccccaaggtgtaataaaagacgtcttctctctatcttcgggtgccatcttgatctgattataacc 15918319  T
Q  410 ggagaaaccgtccatgaaggagaa 433  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  15918318 ggagaaaccatccatgaatgagaa 15918295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 457
Target Start/End: Original strand, 24208911 - 24209080
Alignment:
Q  288 tggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggag 387  Q
    ||||| || ||||||||||| || | ||| |||||||||||    || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24208911 tggtaagtggcaccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacataacagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggag 24209010  T
Q  388 acattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
     |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  24209011 ccatcctgatctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 24209080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 433
Target Start/End: Original strand, 15592984 - 15593393
Alignment:
Q  24 ggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtac 123  Q
    ||||| |||||||| || |  ||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||  | ||| || ||||| || || || || |    
T  15592984 ggcatctctcggatagctctaactttgtcgggatctacttcaatacctttctgactgacaatgaagcctagaagcttcccagatctaacaccaaaagtgc 15593083  T
Q  124 atttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcat 223  Q
    | ||||| |||||||  |||||  |||||||||| ||||  | |||||||||   |||||| || |||||||  || ||     | ||||| || |||||    
T  15593084 acttgttgggattcagacgaagtatgtactttcttaaccgctggaacatcttcaacaaatactctacatgttcttcttcggtaatcgacttgactatcat 15593183  T
Q  224 gtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggc 323  Q
     || |||||||| || || |  ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || || || || ||||| |||||||| || |  ||||| |||    
T  15593184 atcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatgtcatgaaagatagtagtcatacccctctgataagtagctccagcattgatcaacccgaacggc 15593283  T
Q  324 atcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtcca 423  Q
    || ||| |||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  15593284 attactctgtaacagaaagtgccccaaggtgtaataaaagacgtcttctctctatcttcgggtgccatcttgacctgattataaccggagaaaccatcca 15593383  T
Q  424 tgaaggagaa 433  Q
    |||| |||||    
T  15593384 tgaatgagaa 15593393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 5950868 - 5951295
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  | |||||||||||| || ||     
T  5950868 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaagctttccggatctaacacca 5950967  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||    |||||||     
T  5950968 aaagtgcatttgttgggattcagacgaagtttgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaattgacttg 5951066  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  5951067 actatcatatcatccacatagacttcaatctctttatgtatcatatcgtggaaaagagtagtcatacccctctgataagtagctccggcattgattaaac 5951166  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  5951167 cgaacggcattactttgtaacagaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaa 5951266  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  5951267 tccatccatgaatgagaagactttagact 5951295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 46380528 - 46380101
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||     
T  46380528 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaagctttccggatctgacacca 46380429  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || ||     | |||||     
T  46380428 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtttgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcggtaatcgacttg 46380330  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || ||||| || |||||||| || || |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  46380329 actatcatatcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatatcgtggaaaagagtagtcatacccctctgataagtagctccggcattgattaaac 46380230  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  46380229 cgaacggcattactttgtaacagaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccagagaa 46380130  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  46380129 tccatccatgaatgagaagactttagact 46380101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 27431437 - 27431893
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431437 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 27431536  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431537 tccggatctgacaccgaatgtgcatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 27431636  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431637 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 27431736  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27431737 cagcattaattaggccgaaaggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 27431836  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431837 attgtaaccagagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 27431893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 20841161 - 20840705
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20841161 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaacaactt 20841062  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20841061 tccggatctgacgccgaacgtacatttgttgggattcaatcggagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcagcatgttgctcc 20840962  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20840961 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 20840862  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20840861 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 20840762  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20840761 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 20840705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 11632180 - 11632636
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11632180 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 11632279  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11632280 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgccaaatattcaacatgctgctcc 11632379  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11632380 tcatctgttgatttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 11632479  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11632480 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 11632579  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11632580 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtgttatc 11632636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12658784 - 12658328
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12658784 cttgcttctcggtttgtggaactggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 12658685  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12658684 tccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 12658585  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12658584 tcatctgttgactttacaatcatatcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 12658485  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12658484 cagcatttatcaagccgaacggcatcactttgtagcagaaagtactccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcctcaggagacattttgatctg 12658385  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12658384 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcggtattatc 12658328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 39048815 - 39049271
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048815 cttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 39048914  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39048915 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 39049014  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  39049015 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacgtatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcgc 39049114  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39049115 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 39049214  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39049215 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 39049271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 40236756 - 40236300
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40236756 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 40236657  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  40236656 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgttaaatattcaacatgctgctcc 40236557  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40236556 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 40236457  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40236456 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 40236357  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40236356 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 40236300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12590056 - 12589600
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590056 cttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 12589957  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12589956 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 12589857  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12589856 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 12589757  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12589756 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 12589657  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12589656 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 12589600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 23125564 - 23126020
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23125564 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 23125663  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125664 cccggatctaacgccgaatgtacatttgttggaattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 23125763  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23125764 tcatctgttgacttcacaatcatatcatcgacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagcgtagtcatccctctttggtaggtagcac 23125863  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125864 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagtagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 23125963  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125964 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 23126020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28885455 - 28884999
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885455 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 28885356  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28885355 cccggatctgacgccgaatgtatatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatattcaacatgttgctcc 28885256  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28885255 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatacacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 28885156  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28885155 caacatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcgggagacattttgatctg 28885056  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885055 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 28884999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 34294402 - 34293946
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  34294402 cttgcttctcggtctgtggagctggcatctctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgccctttcggctgacaatgaagcctaacaactt 34294303  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34294302 cccagatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacctctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 34294203  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34294202 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtggcac 34294103  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34294102 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttccctatcttcaggagacattttgatctg 34294003  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34294002 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcggtattatc 34293946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 27806951 - 27806495
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27806951 cttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 27806852  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27806851 cccggatctgacgccgaatgtacacttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaacatgttgctcc 27806752  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27806751 tcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttntttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 27806652  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27806651 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 27806552  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27806551 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 27806495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 9346982 - 9347438
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346982 cttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 9347081  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9347082 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 9347181  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9347182 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacgtatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 9347281  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347282 caacattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 9347381  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347382 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 9347438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 12713597 - 12714053
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12713597 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 12713696  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12713697 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 12713796  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  12713797 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 12713896  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12713897 cagcattgattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtcccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 12713996  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12713997 attataaccagaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 12714053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 13933543 - 13933999
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13933543 cttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaacaactt 13933642  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13933643 cccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttatattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 13933742  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933743 tcgtctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacttcgacctctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 13933842  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  13933843 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtgataaaagacgtcttttctctatcttccggggacattttgatttg 13933942  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933943 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 13933999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 37378395 - 37377963
Alignment:
Q  25 gcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtaca 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37378395 gcatctctcggatggcccggaccttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaacaacttcccggatctgacgccgaatgtaca 37378296  T
Q  125 tttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatg 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  37378295 tttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcgtctgttgacttcacaatcata 37378196  T
Q  225 tcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggca 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37378195 tcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcaccagcattaattaggccgaacggca 37378096  T
Q  325 tcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccat 424  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37378095 tcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccat 37377996  T
Q  425 gaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37377995 gaaggaaaacaccttagactgagcagtgttatc 37377963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 37682891 - 37683347
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682891 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 37682990  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  37682991 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgttcc 37683090  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37683091 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 37683190  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37683191 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 37683290  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37683291 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 37683347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 37698156 - 37698612
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698156 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 37698255  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  37698256 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgttcc 37698355  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37698356 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 37698455  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37698456 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 37698555  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37698556 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 37698612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 34864932 - 34864476
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34864932 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 34864833  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34864832 tccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 34864733  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34864732 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 34864633  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34864632 cagcattgattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 34864533  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34864532 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 34864476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 19413497 - 19413953
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19413497 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaaacctaataactt 19413596  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19413597 tccggacctgacatcgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 19413696  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19413697 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 19413796  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19413797 cagcattgattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctgtcttcaggagacatcttgatctg 19413896  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19413897 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 19413953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 454
Target Start/End: Original strand, 21700171 - 21700619
Alignment:
Q  6 ttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccgg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21700171 ttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccgaactttattagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagtaactttccag 21700270  T
Q  106 atctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatc 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21700271 atctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgacatgttgctcctcatc 21700370  T
Q  206 tgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagca 305  Q
    | ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21700371 ttttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagca 21700470  T
Q  306 ttaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgt 405  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21700471 tttattagaccgatcggcatcactttgtagcagaacgtaccccatggggtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctgattgt 21700570  T
Q  406 aaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  21700571 aaccggagaagccatccatgaagaagaacaccttggactgagcattatt 21700619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 32053051 - 32052595
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053051 cttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 32052952  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32052951 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 32052852  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32052851 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 32052752  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32052751 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctgtcttcaggagacatcttgatctg 32052652  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32052651 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 32052595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 39893317 - 39892861
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893317 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 39893218  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39893217 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 39893118  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39893117 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 39893018  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  39893017 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatttg 39892918  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39892917 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 39892861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 16826334 - 16826790
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826334 cttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 16826433  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16826434 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 16826533  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16826534 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtggatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 16826633  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16826634 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctgtcttcaggagacatcttgatctg 16826733  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16826734 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 16826790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16895146 - 16894690
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895146 cttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 16895047  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16895046 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 16894947  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16894946 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtggatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 16894847  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16894846 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctgtcttcaggagacatcttgatctg 16894747  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16894746 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 16894690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 37928617 - 37928161
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37928617 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 37928518  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37928517 tccggacttgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 37928418  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37928417 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttgataggtagcac 37928318  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  37928317 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcctcaggagacattttgatttg 37928218  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37928217 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 37928161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 19453419 - 19453872
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  19453419 cttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcggatggcacggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttgactgacaatgaagcctagtaattt 19453518  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  19453519 tccagatctgacaccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtagtttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattccatatgttgctcc 19453618  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453619 tcatcttttgacttcacaatcatatcgtccacatatatttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 19453718  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19453719 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctg 19453818  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19453819 attgtaaccggagaagccatccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 19453872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 21674171 - 21674627
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674171 cttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcaacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 21674270  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21674271 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaagtattcaacatgctgctcc 21674370  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21674371 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 21674470  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21674471 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatttg 21674570  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21674571 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 21674627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 31879534 - 31879078
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31879534 cttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 31879435  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31879434 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 31879335  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  31879334 tcctctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 31879235  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31879234 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 31879135  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31879134 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 31879078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 144 - 457
Target Start/End: Original strand, 257892 - 258205
Alignment:
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcga 243  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  257892 agcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgttaaatattcaacatgttgctcctcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcga 257991  T
Q  244 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  257992 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagt 258091  T
Q  344 gccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagac 443  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  258092 accccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagac 258191  T
Q  444 tgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||||||||    
T  258192 tgagcagtattatc 258205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 153 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 34289190 - 34288886
Alignment:
Q  153 tttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgt 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34289190 tttctcaacctttcgaacctctttgtcaaatattcaacatgctgctcctcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgt 34289091  T
Q  253 gaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatgg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34289090 gaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtggcaccagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatgg 34288991  T
Q  353 agtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagta 452  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  34288990 agtgataaaagacgtcttttccctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcggta 34288891  T
Q  453 ttatc 457  Q
    |||||    
T  34288890 ttatc 34288886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 37948858 - 37949159
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37948858 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 37948957  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  37948958 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtatattctcaacctttcaaacatctttgtcaaatactcaacatgttgttcc 37949057  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37949058 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacgtatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 37949157  T
Q  301 ca 302  Q
    ||    
T  37949158 ca 37949159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27394810 - 27394360
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  27394810 cttgcttttcggtctgtggtgccggcatctctctgatggcccggactttgtcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagcagttt 27394711  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27394710 tccggatctgacaccgaacgtacacttgttggggttcagccgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaaatactcaacatgctgctcc 27394611  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27394610 tcatcttttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcaacttgcttatgaatcatatcatgaaacaaagtagtcattcctctttgataggtagcgc 27394511  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    | ||||| || || ||||| |||||  ||||| | ||||| | ||||||||| || || || || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  27394510 ccgcatttatcaggccgaacggcattgctttgcaacagaaggtgccccatggggtaatgaacgatgtcttttccctgtcttcaggcgacattttgatctg 27394411  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagt 451  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27394410 gttataaccggagaagccgtccatgaaggagaacactttggactgagcagt 27394360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 42393783 - 42393327
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  42393783 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 42393684  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  42393683 accagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 42393587  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || |||||||| || |    
T  42393586 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctttggtaagtgg 42393487  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||    
T  42393486 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttatctatcctcaggagccatcctgat 42393387  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  42393386 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtattatc 42393327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 257649 - 257791
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  257649 cttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaacaactt 257748  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  257749 cccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcga 257791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 34701324 - 34700868
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  34701324 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 34701225  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   ||    
T  34701224 accagatctaacaccgaaagtacatttgttgggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---cc 34701128  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || || ||||| || |    
T  34701127 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctctggtaagtgg 34701028  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  34701027 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 34700928  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  34700927 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 34700868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Original strand, 26724315 - 26724710
Alignment:
Q  44 gactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  26724315 gactttgtcgggatccacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacaccgaaggtacacttgttaggattcaaacgg 26724414  T
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcga 243  Q
    || |||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| ||||||||||  || |||     ||| || || |||||||| |||||||| ||||| |    
T  26724415 agtttgtactttctcaaccgttgaaacatcttcgacaaatactcaacatgttcttcttcagtgcctgatttgacgatcatgtcatccacatacacttcaa 26724514  T
Q  244 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagc 343  Q
      ||||| || ||||| ||||| || |   ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |  || || ||||| |||  ||||||||| ||    
T  26724515 tctctttatgtatcatatcatggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggcaccagcatttatcaacccaaacggcattactaagtagcagaacgc 26724614  T
Q  344 gccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  26724615 gccccaaggcgtgatgaacgacgtcttttctctatcttctggagccatcttgatctggttatacccggagaatccatccatgaaggagaatacctt 26724710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 436
Target Start/End: Original strand, 21760625 - 21761046
Alignment:
Q  15 tgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 114  Q
    |||||||||||||||||||  |||||   ||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |  |  ||||||||||| || |    
T  21760625 tgcggagctggcatttctcttatggctttgaccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaatgaagcccagaagatttccggatctaacac 21760724  T
Q  115 cgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactt 214  Q
    | || ||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||| | |  || ||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||    |||||||    
T  21760725 caaaagtacacttgttgggattcagacgaagtctgtactttcttagctgttggaacatctttagcaaatactcaacatgttgttcttcagtgattgactt 21760824  T
Q  215 tacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattaga 314  Q
     || |||||||| |||||||| || || |  |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || | |    
T  21760825 gacgatcatgtcatccacataaacctcaatctctttgtgtatcatgtcgtgaaagatagtagtcatacccctttgataagtagctcctgcattgatcaaa 21760924  T
Q  315 ccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggaga 414  Q
    ||||| ||||| ||| ||||  |||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||| | ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21760925 ccgaacggcattactctgtaatagaaagtgccccaaggtgtgatgaaagacgtcttctctttgtcttcgggcgccatcttgatctgattgtaaccggaga 21761024  T
Q  415 aaccgtccatgaaggagaacac 436  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  21761025 aaccatccatgagggagaacac 21761046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Original strand, 34534482 - 34534877
Alignment:
Q  44 gactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||     
T  34534482 gactttgtcgggatccacttcgatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacaccgaaggtacacttattaggattcaaacgg 34534581  T
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcga 243  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||||||||  || |||      || || |||||||| || |||||||| |||||||    
T  34534582 agtttgtactttctcaaccgttggaacatcttcaacaaatactcaacatgttcttcttcagtacccgatttgacaatcatatcatccacatacacttcga 34534681  T
Q  244 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagc 343  Q
      ||||| || ||||| || || || |   ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |  || || ||||| |||  ||||||||||||    
T  34534682 tctctttatgtatcatatcgtggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggcaccagcatttatcaacccaaacggcattactaagtagcagaaagc 34534781  T
Q  344 gccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| || |||| ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  34534782 gccccaaggcgtgatgaacgatgtcttttctctatcctctggagccatcttgatctggttatacccggagaacccatccatgaaggagaatacctt 34534877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12383892 - 12383465
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||     
T  12383892 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcagggtctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaagctttccggatctgacacca 12383793  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||    | |||||     
T  12383792 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtttgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaatcgacttg 12383694  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || ||||| || |||||||| || || |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  12383693 actatcatatcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatatcgtggaaaagagtagtcatacccctctgataagtagctcctgcattgattaaac 12383594  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| | ||| ||||||||||| |||| |||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  12383593 cgaacgacattactttgtagcaaaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaa 12383494  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  12383493 tccatccatgaatgagaagactttagact 12383465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22949372 - 22949198
Alignment:
Q  270 agagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtct 369  Q
    ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||| |||||| || || ||||| || || |    
T  22949372 agagtagtcatacccctctgataagtagctcctgcattgattaaaccgaacggcattactttgtaacaaaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttt 22949273  T
Q  370 tttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
    | ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  22949272 tctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaatccatccatgaatgagaagactttagact 22949198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22949625 - 22949490
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||  | |||||||||||| || ||     
T  22949625 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacgatgaagcctagaagctttccggatctaacacca 22949526  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtac 152  Q
    || || |||||||| ||||| |  ||||| ||||||    
T  22949525 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtttgtac 22949490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 329
Target Start/End: Original strand, 23199137 - 23199183
Alignment:
Q  283 ctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcact 329  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23199137 ctctctggtatgtagcaccagcattttttagaccgaatggcatcact 23199183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 329
Target Start/End: Original strand, 23624542 - 23624588
Alignment:
Q  283 ctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcact 329  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23624542 ctctctggtatgtagcaccagcattttttagaccgaatggcatcact 23624588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24973162 - 24972706
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973162 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 24973063  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973062 tccggatctgacaccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 24972963  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24972962 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 24972863  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24972862 cagcatttattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 24972763  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24972762 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttggactgagcagtattatc 24972706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 33295784 - 33295328
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295784 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 33295685  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295684 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 33295585  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33295584 tcatctgttgactttacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 33295485  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295484 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 33295385  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295384 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 33295328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 23629226 - 23628770
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629226 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 23629127  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629126 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 23629027  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629026 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 23628927  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23628926 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaggcaccccatggagtaataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 23628827  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23628826 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtgttatc 23628770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 33780745 - 33780289
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780745 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 33780646  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780645 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 33780546  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780545 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 33780446  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780445 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 33780346  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33780345 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtattatc 33780289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 40470454 - 40470910
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470454 cttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 40470553  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  40470554 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgttgctct 40470653  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470654 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgcatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 40470753  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470754 cagcattaattagaccgaatggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 40470853  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470854 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 40470910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 9320732 - 9320276
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320732 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 9320633  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9320632 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 9320533  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9320532 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacctctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 9320433  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9320432 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 9320333  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320332 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 9320276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12135431 - 12134975
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12135431 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 12135332  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12135331 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 12135232  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12135231 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacctctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 12135132  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12135131 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 12135032  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12135031 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 12134975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 24685049 - 24685505
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685049 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 24685148  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24685149 tccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgctcc 24685248  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685249 tcatctgttgactttacaatcatgtcatccacatatacttcgacttctttatgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 24685348  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24685349 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctg 24685448  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685449 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 24685505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 15655662 - 15656118
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655662 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttcttggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 15655761  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15655762 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatctttgtcaaatatccaacatgttgctcc 15655861  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655862 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 15655961  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655962 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 15656061  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15656062 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtattatc 15656118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26483650 - 26483197
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26483650 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 26483551  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26483550 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 26483451  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26483450 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacctctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 26483351  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26483350 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 26483251  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26483250 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtatt 26483197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 11552611 - 11552155
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552611 cttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 11552512  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552511 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttggggttcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 11552412  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11552411 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 11552312  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552311 caacatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaggacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 11552212  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552211 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 11552155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 22996021 - 22996477
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22996021 cttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 22996120  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22996121 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatactcaacatgttgctcc 22996220  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22996221 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaatagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 22996320  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22996321 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 22996420  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22996421 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 22996477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 30937891 - 30937436
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30937891 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 30937792  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30937791 tccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgctcc 30937692  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30937691 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 30937592  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30937591 cagcatttattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttca-gagacattttgatctg 30937493  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30937492 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactaagcagtattatc 30937436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 18497629 - 18498085
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18497629 cttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 18497728  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18497729 cccggatctgacgccgaatgtacacttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaacatgttgctcc 18497828  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18497829 tcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 18497928  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497929 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtcccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18498028  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18498029 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 18498085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28652498 - 28652042
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652498 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactt 28652399  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28652398 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 28652299  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28652298 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 28652199  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652198 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 28652099  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652098 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 28652042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 41677961 - 41677505
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41677961 cttgcttctcggtctgtggagctggcatctctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 41677862  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41677861 ccctgatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 41677762  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41677761 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaatagagtagtcatccctctttggtaggtggcac 41677662  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41677661 cagcatttattaagccgaatggcatcactttatagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattctgatctg 41677562  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41677561 attgtaaccggagaaatcgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 41677505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23895462 - 23895009
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23895462 cttgtttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggctcggactttatcagggtcaacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagtaactt 23895363  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23895362 tccggatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaagtattcaacatgttgctcc 23895263  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23895262 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatacacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 23895163  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23895162 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtattttctctatcctcaggggacattttgatctg 23895063  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23895062 attgtaaccggagaagccatccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 23895009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 32593178 - 32593634
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32593178 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 32593277  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32593278 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttatattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgttgctct 32593377  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32593378 tcatttgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcgc 32593477  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32593478 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 32593577  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32593578 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 32593634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 3792797 - 3792341
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3792797 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 3792698  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3792697 cccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 3792598  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3792597 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttgataggtagcac 3792498  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3792497 cagcattaattaggccgaacggcatcactttgtaacagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 3792398  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3792397 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagattgagcagtattatc 3792341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25203534 - 25203081
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25203534 cttgtttctcggtctgcgaggctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagtaactt 25203435  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25203434 tccggatctgacgtcgaacgtacatttgttagggttcaattgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattccacatgttgctcc 25203335  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203334 tcatctgttgactttacaatcatatcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 25203235  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25203234 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtaataaaagatgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctg 25203135  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25203134 attgtaaccggagaagccgtccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 25203081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25267689 - 25267236
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25267689 cttgtttctcggtctgcgaggctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagtaactt 25267590  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25267589 tccggatctgacgtcgaacgtacatttgttagggttcaattgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattccacatgttgctcc 25267490  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25267489 tcatctgttgactttacaatcatatcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 25267390  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25267389 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtaataaaagatgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctg 25267290  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25267289 attgtaaccggagaagccgtccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 25267236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 28956689 - 28957145
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28956689 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 28956788  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28956789 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 28956888  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28956889 tcatctgtcgacttcacaatcatgtcgtccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 28956988  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28956989 cagcattgattaggccgaacggcattactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 28957088  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28957089 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagattgagcagtattatc 28957145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 2514318 - 2513862
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2514318 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 2514219  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2514218 tccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 2514119  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2514118 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 2514019  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2514018 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 2513919  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2513918 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 2513862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 43081511 - 43081055
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081511 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 43081412  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  43081411 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcgacgtgctgctcc 43081312  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43081311 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 43081212  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081211 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtaacagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 43081112  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081111 attataaccgaaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 43081055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 13321734 - 13322190
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321734 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 13321833  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  13321834 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctct 13321933  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13321934 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 13322033  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13322034 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 13322133  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13322134 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 13322190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24727225 - 24726769
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24727225 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 24727126  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24727125 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgtagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 24727026  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24727025 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 24726926  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24726925 cagcattgattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtcccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 24726826  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24726825 attataaccagaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 24726769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 30171725 - 30171269
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30171725 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttcttggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 30171626  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30171625 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 30171526  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30171525 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 30171426  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30171425 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcgggagacattttgatctg 30171326  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30171325 attataaccagaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 30171269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 31434720 - 31434264
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31434720 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 31434621  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31434620 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 31434521  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31434520 tcatctgctgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 31434421  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31434420 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagtagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 31434321  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31434320 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 31434264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 31823311 - 31823767
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31823311 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 31823410  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31823411 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 31823510  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31823511 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 31823610  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31823611 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 31823710  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31823711 attataaccagaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 31823767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 37668390 - 37668846
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37668390 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 37668489  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37668490 tccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 37668589  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37668590 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 37668689  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37668690 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 37668789  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37668790 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 37668846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 8662379 - 8662835
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662379 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 8662478  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8662479 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaagtattcaacatgttgctcc 8662578  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8662579 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 8662678  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8662679 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatttg 8662778  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8662779 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 8662835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 30155287 - 30154831
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30155287 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 30155188  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30155187 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 30155088  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30155087 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttgataggtagcac 30154988  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30154987 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 30154888  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30154887 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 30154831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 34619774 - 34619318
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34619774 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 34619675  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  34619674 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcaacttatattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcgacatgctgctcc 34619575  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34619574 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttgataggtagcac 34619475  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34619474 cagcattgattaggccgaacgacatcactttgtaacagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 34619375  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34619374 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagattgagcagtattatc 34619318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 37767895 - 37768351
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767895 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 37767994  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37767995 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtatcttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 37768094  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37768095 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 37768194  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37768195 cagcattgattagaccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 37768294  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37768295 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 37768351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5641044 - 5640588
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641044 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 5640945  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5640944 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 5640845  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5640844 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcgacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 5640745  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5640744 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 5640645  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5640644 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 5640588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6877561 - 6877105
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6877561 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 6877462  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6877461 gccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 6877362  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  6877361 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 6877262  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6877261 cagcattgattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaggtcccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 6877162  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6877161 attataaccagaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 6877105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 22891719 - 22891263
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22891719 cttgtttctcggtttgaggggctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagtaactt 22891620  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22891619 tccagatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgacatgttgctcc 22891520  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22891519 tcatcttttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 22891420  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22891419 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccagggggtgatgaaagacgccttttctctatcttcaggggatattttgatctg 22891320  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22891319 attgtaaccagagaaaccatccatgaaggagaataccttggactgagcagtattatc 22891263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 33519636 - 33519180
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33519636 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 33519537  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33519536 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 33519437  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33519436 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 33519337  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33519336 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatttg 33519237  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33519236 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 33519180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 37758239 - 37757783
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37758239 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 37758140  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37758139 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 37758040  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37758039 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 37757940  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37757939 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtaacagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 37757840  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37757839 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 37757783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 18372438 - 18372894
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372438 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggattgacttcaatgcccctttggctgacaatgaagcctaataactt 18372537  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18372538 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 18372637  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  18372638 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 18372737  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372738 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18372837  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18372838 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 18372894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 37355547 - 37356003
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355547 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 37355646  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37355647 tccagacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 37355746  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  37355747 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcatccccctttggtaggtagcac 37355846  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355847 cagcattgattagaccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgacaaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 37355946  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37355947 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 37356003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 15755756 - 15756212
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755756 cttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 15755855  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15755856 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagctggtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 15755955  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15755956 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 15756055  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15756056 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatttg 15756155  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15756156 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 15756212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 30032684 - 30032228
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30032684 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 30032585  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30032584 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 30032485  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30032484 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 30032385  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30032384 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttccctatcttcaggagacatcttgatttg 30032285  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30032284 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagattgagcagtattatc 30032228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24586630 - 24586361
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586630 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 24586531  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  24586530 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctccacctttccaacatctttgttaaatattcaacatgctggtcc 24586431  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaaca 270  Q
    ||||||| ||||||    ||| |||| |||| |||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||    
T  24586430 tcatctgctgacttccacatcctgtcatccaaatatacctccacttccttggtaatcatgtcatgaaaca 24586361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 34468861 - 34468443
Alignment:
Q  18 ggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccga 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| |  | |||||| ||||| || || |    
T  34468861 ggagctggcatttctctgatggctttgaccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaataaagcccagaagctttccagatctaacaccaa 34468762  T
Q  118 atgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttac 217  Q
    | ||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||| | || || ||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||    ||||||| ||    
T  34468761 aagtacatttgttgggattcaggcgaagtctgtactttcttagccgttggaacatctttagcaaatactcaacatgttgttcttcagtgattgacttgac 34468662  T
Q  218 aatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccg 317  Q
     |||||||| |||||||| || || |  |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || | ||||    
T  34468661 gatcatgtcatccacataaacctcaatctctttgtgtatcatgtcgtgaaagatagtagtcatacccctttgataagtagctcctgcattgatcaaaccg 34468562  T
Q  318 aatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaac 417  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34468561 aacggcattactctgtaacagaaagtgccccaaggtgtgatgaaagacgtcttctctctgtcttcgggtgccatcttgatctgattgtaaccggagaaac 34468462  T
Q  418 cgtccatgaaggagaacac 436  Q
    | |||||||||||||||||    
T  34468461 catccatgaaggagaacac 34468443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Original strand, 352162 - 352557
Alignment:
Q  44 gactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| || || | ||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  352162 gactttgtcaggatctacttcaatacctttctgactgacaatgaaacccaagagcttgccagatctaacaccgaaggtacacttgttaggatttaatcgg 352261  T
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcga 243  Q
    || |||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||| ||||||||||  || |||     |||||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  352262 agtttgtactttctcaaccgttgaaacatctttaacaaatactcaacatgttcttcttcagtgcctgacttgacaatcatatcatccacatatacttcaa 352361  T
Q  244 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagc 343  Q
      ||||| || ||||| ||||| || |   ||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |  || |||||||| |||  ||||||||||||    
T  352362 tctctttatgtatcatatcatggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggcgccagcatttatcaatccaaatggcattactaagtagcagaaagc 352461  T
Q  344 gccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  352462 gccccatggcgtgatgaaagacgtgttttctctatcttccggagccatcttgatctggttatacccggaaaacccatccatgaaggagaacacctt 352557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 3484107 - 3484563
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  3484107 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 3484206  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  3484207 accagatctaacaccgaacgtacatttgttaggattcaaccggagtttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 3484303  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || || ||||| || |    
T  3484304 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctctggtaagtgg 3484403  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  3484404 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacataacagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 3484503  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  3484504 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 3484563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Original strand, 20388936 - 20389331
Alignment:
Q  44 gactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  20388936 gactttgtcgggatctacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacatcgaaggtacacttgttaggattcaaacgg 20389035  T
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcga 243  Q
    || |||||||||||||||| ||  ||||||||   |||||| ||||||||||  || |||     ||| || || |||||||| |||||| | ||||| |    
T  20389036 agtttgtactttctcaaccgttgaaacatcttcaacaaatactcaacatgttcttcttcagtgcctgatttgacgatcatgtcatccacacacacttcaa 20389135  T
Q  244 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagc 343  Q
      ||||| || ||||| ||||| || |   ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |  || || ||||| |||  ||||||||||||    
T  20389136 tctctttatgtatcatatcatggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggcaccagcatttatcaacccaaacggcattactaagtagcagaaagc 20389235  T
Q  344 gccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  20389236 accccaaggcgtgatgaacgacgtcttttctctatcttctggagccatcttgatctggttatacccggagaatccatccatgaaggagaatacctt 20389331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 36375882 - 36376309
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||     
T  36375882 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcgggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaagcctagaagctttccggatctgacacca 36375981  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||    | |||||     
T  36375982 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtttgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaatcgacttg 36376080  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || |||||||| |||||||| || || |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  36376081 actatcatgtcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatatcgtggaagagagtagtcatacccctctgataagtagctcctgcattgattaaac 36376180  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  36376181 cgaacggcattactttgtaacagaaagtgccccaaggtgtaataaatgacgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccgaagaa 36376280  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  36376281 tccatccatgaatgagaagactttagact 36376309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 37000536 - 37000963
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||     
T  37000536 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcgggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaagcctagaagctttccggatctgacacca 37000635  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| ||||| |  |||||  ||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||    | |||||     
T  37000636 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtctgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaatcgacttg 37000734  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || |||||||| |||||||| || || |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  37000735 actatcatgtcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatatcgtggaagagagtagtcatacccctctgataagtagctcctgcattgattaaac 37000834  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  37000835 cgaacggcattactttgtaacagaaagtgccccaaggtgtaataaatgacgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaa 37000934  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  37000935 tccatccatgaatgagaagactttagact 37000963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31520294 - 31520120
Alignment:
Q  270 agagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtct 369  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| || || ||||| || || |    
T  31520294 agagtagtcatccccctctggtaagtagctcctgcattgattaaaccgaacggcattactttgtagcaaaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttt 31520195  T
Q  370 tttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
    | ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  31520194 tctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaatccatccatgaatgagaagactttagact 31520120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 15784645 - 15785072
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||| ||     
T  15784645 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcagggtctacttcgatgcctttctggctgacgatgaaacctagaagctttccggatctgacacca 15784744  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||    | |||||     
T  15784745 aaagtgcatttgttgggatttaaacgaagtttgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaatcgacttg 15784843  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || ||||| || |||||||| || || |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  15784844 actatcatatcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatatcgtggaaaagagtagtcatacccctctgataagtagctcctgcattgattaaac 15784943  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15784944 cgaacggcattactttgtagcaaaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaa 15785043  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  15785044 tccatccatgaatgagaagactttagact 15785072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17957336 - 17956909
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||     
T  17957336 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaagctttccggatctgacacca 17957237  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || |  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||    | |||||     
T  17957236 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtttgtacttccttaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaatcgacttg 17957138  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| || || |  ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  17957137 actatcatatcatccacatagacttcaatctctttatgtatcatatcgtggagaagagtagtcatacccctctgataagtagctccggcattgattaaac 17957038  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  17957037 cgaacggcattactttgtaacagaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaa 17956938  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  17956937 tccatccatgaatgagaagactttagact 17956909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Original strand, 11944342 - 11944484
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||     
T  11944342 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaagcctagaagctttccggatctgacacca 11944441  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctca 159  Q
    || || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||    
T  11944442 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtttgtacttcctca 11944484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 444
Target Start/End: Original strand, 5440398 - 5440572
Alignment:
Q  270 agagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtct 369  Q
    ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| |||||| | ||| |||||||| || |||| |||||| || || ||||| || || |    
T  5440398 agagtagtcatacccctctgataagtagctcctgcattgattaaaccgaacgacattactttgtaacaaaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttt 5440497  T
Q  370 tttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
    | ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  5440498 tctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaatccatccatgaatgagaagactttagact 5440572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31520547 - 31520405
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||     
T  31520547 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaagctttccggatctgacacca 31520448  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctca 159  Q
    || || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||    
T  31520447 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtttgtacttcctca 31520405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24684319 - 24684242
Alignment:
Q  380 ttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24684319 ttcaggcgacatttcgatctgattttaaccagaaaacccgtccagaaaggagaacactttagattgagcagtattatc 24684242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 5440173 - 5440287
Alignment:
Q  45 actttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaa 144  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||| |||| || || || || |||||||| ||||| |  ||||    
T  5440173 actttgtcaggatctacttcgatgcctttttggctgacgatgaagcctagaagctttccgaatctaacaccaaaagtgcatttgttgggatttagacgaa 5440272  T
Q  145 gcttgtactttctca 159  Q
    | |||||||| ||||    
T  5440273 gtttgtacttcctca 5440287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 382
Target Start/End: Original strand, 11944535 - 11944707
Alignment:
Q  210 gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaa 309  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || || |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |    
T  11944535 gacttgactatcatatcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatatcgtggaaaagagtagtcatacccctctgataagtagctcctgcattga 11944634  T
Q  310 ttagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttc 382  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| || |||| |||||| || |||||||| || || || |||||||||||    
T  11944635 ttaaaccgaacggcattactttgtaacaaaaagtgccccaaggtgtgataaatgatgttttctctctatcttc 11944707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 2157820 - 2157364
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157820 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 2157721  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157720 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 2157621  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157620 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 2157521  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157520 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 2157421  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157420 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 2157364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 16515322 - 16515778
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16515322 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 16515421  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16515422 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcagatattcaacatgttgctcc 16515521  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16515522 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatacacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtggcac 16515621  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16515622 cagcatttattaggccgaatggcaccactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 16515721  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16515722 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 16515778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 2107055 - 2107511
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2107055 cttgcttctcggtatgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactt 2107154  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2107155 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 2107254  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2107255 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtggcac 2107354  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2107355 cagcatttattaagccgaatggcatcactttatagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttccctatcttcaggagacattttgatctg 2107454  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2107455 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 2107511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 11421671 - 11422127
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421671 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 11421770  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11421771 tccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgctcc 11421870  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11421871 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 11421970  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11421971 cagcatttattaggccaaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcagaagacattttgatctg 11422070  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11422071 gttgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaacttagactgagcagtattatc 11422127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 26316740 - 26317196
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316740 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 26316839  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26316840 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatttttgtcaaatattcaacatgctgctcc 26316939  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26316940 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacctctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 26317039  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26317040 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 26317139  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26317140 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 26317196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 26271978 - 26272434
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26271978 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaacaactt 26272077  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26272078 cccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 26272177  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26272178 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcgtgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 26272277  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26272278 cagcattaattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcgggagacattttgatttg 26272377  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26272378 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 26272434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5131242 - 5130786
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131242 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 5131143  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131142 cccggatctgacgccgaatgtacatttattgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 5131043  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5131042 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaagagggtagtcatccctctttggtaggtagcac 5130943  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5130942 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 5130843  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5130842 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 5130786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 9621896 - 9621443
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9621896 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 9621797  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9621796 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 9621697  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9621696 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 9621597  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9621596 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 9621497  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9621496 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtatt 9621443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 10913761 - 10914217
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10913761 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgataatgaagcctaataactt 10913860  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10913861 tccggatctgacgccggacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgctcc 10913960  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10913961 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcgtgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 10914060  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914061 cagcatttattaggccgaacagcatcactttgtagcagaaagtaccgcatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 10914160  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914161 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 10914217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 26534765 - 26535221
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26534765 cttgcttctcggtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 26534864  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26534865 cccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 26534964  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26534965 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 26535064  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26535065 cagcattaattagaccgaatgtcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaatgatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 26535164  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26535165 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 26535221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26438503 - 26438047
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26438503 cttgtttctcggtctgtggagctggcatttctcgaatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctaacaacgaagcctaataactt 26438404  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26438403 cccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 26438304  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26438303 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcgtgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 26438204  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438203 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 26438104  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438103 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 26438047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26516038 - 26515582
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26516038 cttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 26515939  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  26515938 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgttaaatattcaacatgctgctcc 26515839  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26515838 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 26515739  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26515738 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 26515639  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26515638 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 26515582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4202635 - 4202179
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202635 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 4202536  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  4202535 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgatcc 4202436  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4202435 tcatctgttgacttcacgatcatgtcgtctacatatatttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 4202336  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4202335 cagcattgattaggccgaacggcattactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 4202236  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4202235 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 4202179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 5144232 - 5144688
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5144232 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggaccttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 5144331  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5144332 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtatttcctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 5144431  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5144432 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacctctttgtgaatcatgtcgtgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 5144531  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5144532 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcgggagacattttgatttg 5144631  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5144632 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtgttatc 5144688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 45390466 - 45390010
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45390466 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttgactgacaatgaagcctaataactt 45390367  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45390366 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 45390267  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  45390266 tcatccgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 45390167  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45390166 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 45390067  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45390066 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 45390010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 16748409 - 16748862
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16748409 cttgcttctctgtttttggagctggcatttctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttgactgacaatgaagcctaacaactt 16748508  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  16748509 gccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacgtgctgctcc 16748608  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16748609 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 16748708  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748709 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtcccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 16748808  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748809 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 16748862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 454
Target Start/End: Original strand, 16446904 - 16447351
Alignment:
Q  7 tctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccgga 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16446904 tctcggtctgcgaagctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatccccttttggctgacaatgaagcctagtaactttccgga 16447003  T
Q  107 tctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatct 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16447004 tctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgacatgttgctcctcatct 16447103  T
Q  207 gttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcat 306  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16447104 tttgacttcacaatcatatcgtccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcat 16447203  T
Q  307 taattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgta 406  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16447204 ttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctgattgta 16447303  T
Q  407 accggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16447304 accggagaagccatccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 16447351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 11444133 - 11443677
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11444133 cttgcttctctgtctgtggagctggcatctctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 11444034  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11444033 gccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 11443934  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  11443933 tcgtctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcgc 11443834  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11443833 cagcattgattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtcccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 11443734  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11443733 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 11443677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 3448552 - 3448096
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3448552 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 3448453  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3448452 gccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgttgctcc 3448353  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  3448352 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 3448253  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3448252 cagcattgattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaggtcccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 3448153  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3448152 attataaccagaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 3448096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 31561282 - 31561738
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31561282 cttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 31561381  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31561382 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 31561481  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31561482 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 31561581  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31561582 cagcattgattaggccgaacgacatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 31561681  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31561682 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtgttatc 31561738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16044565 - 16044112
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16044565 cttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccctttggctgacaataaagcctagtaactt 16044466  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  16044465 cccagatctgacgccgaacgtacatttattagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtactcaacatgttgctcc 16044366  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16044365 tcatctgttaactttacaatcatatcgtccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 16044266  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16044265 cagcatttattagaccgaacggcatcactgtgtagcagaaagtaccccatggggtgataaaagatgtcttttctctatcctcaggggacattttgatctg 16044166  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16044165 attgtaaccggagaagccgtccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 16044112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 4142138 - 4142594
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4142138 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 4142237  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4142238 gccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 4142337  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  4142338 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 4142437  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4142438 cagcattgattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaggtcccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 4142537  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4142538 attataaccagaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 4142594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 24589426 - 24589882
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589426 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 24589525  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24589526 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 24589625  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24589626 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 24589725  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589726 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 24589825  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24589826 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 24589882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 26666806 - 26667262
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666806 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 26666905  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26666906 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 26667005  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26667006 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttgataggtagcac 26667105  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26667106 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 26667205  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26667206 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 26667262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 10842886 - 10843339
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  10842886 cttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcggatggcccggacattatcagggtcgacttcaatgcccttttgactgacaatgaagcctagtaattt 10842985  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10842986 ttcagatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgacatgttgctcc 10843085  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10843086 tcatcttttgacttcacaatcatatcgtccacatatatttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacatagtagtcattcctctttggtaggtagcac 10843185  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  10843186 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagtagaaagtaccccatggggtgataaaagacgtcttttctctatcttcaagggacattttgatatg 10843285  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10843286 attgtaatcggagaaaccatccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 10843339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10844866 - 10844414
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  10844866 cttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcggatggcacggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttgactgacaatgaagcctagtaattt 10844767  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10844766 tccagatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgacatgttgctcc 10844667  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10844666 tcatcttttgacttcacaatcatatcgtccacatatatttcgacttctttgggaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 10844567  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10844566 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtatcccatgg-gtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggggacattttgatcag 10844468  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10844467 attgtaaccggagaagccatccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 10844414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 66 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17526715 - 17526327
Alignment:
Q  66 atgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaaccttt 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17526715 atgcccttttgactgacaatgaagcctaacaacttgccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaaccttt 17526616  T
Q  166 cgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatg 265  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17526615 caaacatctttgttaaatattcaacgtgctgctcctcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatg 17526516  T
Q  266 aaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagac 365  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  17526515 aaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcaccagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtcccccatggagtgataaaagat 17526416  T
Q  366 gtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17526415 gtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 17526327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 16237727 - 16237289
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  16237727 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 16237628  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  16237627 accagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaactgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 16237531  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || |||| ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || |||||||| || |    
T  16237530 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcgatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatgcccctttggtaagtgg 16237431  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || |  || ||||||||||||  ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  16237430 caccagcatttatcaacccaaatggcatcactaagtagcagtaagcgccccaaggtgtgatgaaagacgtcttttctctatcttccggagccatctttat 16237331  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16237330 ctgattataaccggagaaaccgtccatgaaggagaaaacctt 16237289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 15193329 - 15192873
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  15193329 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 15193230  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  15193229 accagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 15193133  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || || ||||| || |    
T  15193132 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctctggtaagtgg 15193033  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  15193032 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 15192933  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||    
T  15192932 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttacacttagcagtgttatc 15192873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 2556781 - 2556325
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  2556781 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacctttttgactgacgataaagcctaggagttt 2556682  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  2556681 accagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 2556585  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || |||||||| || |    
T  2556584 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctttggtaagtgg 2556485  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  2556484 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 2556385  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  2556384 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 2556325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 436
Target Start/End: Original strand, 16287288 - 16287706
Alignment:
Q  18 ggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccga 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |  | |||||||||||| || || |    
T  16287288 ggagctggcatttctctgatggctttgaccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaatgaagcccagaagctttccggatctaacaccaa 16287387  T
Q  118 atgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttac 217  Q
    | ||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||| | || || ||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||    ||||||| ||    
T  16287388 aagtacacttgttgggattcaggcgaagtctgtactttcttagccgttggaacatctttagcaaatactcaacatgttgttcttcagtgattgacttgac 16287487  T
Q  218 aatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccg 317  Q
     |||||||| |||||||| || || |  |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || | ||||    
T  16287488 gatcatgtcatccacataaacctcaatctctttgtgtatcatgtcgtgaaagatagtagtcatacccctttgataagtagctcctgcattgatcaaaccg 16287587  T
Q  318 aatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaac 417  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16287588 aacggcattactctgtaacagaaagtgccccaaggtgtgatgaaagacgtcttctctctgtcttcgggcgccatcttgatctgattgtaaccggaggaac 16287687  T
Q  418 cgtccatgaaggagaacac 436  Q
    | |||||||||||||||||    
T  16287688 catccatgaaggagaacac 16287706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 436
Target Start/End: Original strand, 798429 - 798850
Alignment:
Q  15 tgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 114  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |  | |||||||||||| || |    
T  798429 tgcggagctggcatctctctgatggctttgaccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaatgaagcccagaagctttccggatctaacac 798528  T
Q  115 cgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactt 214  Q
    | || ||||| ||||| |||||||  |||||  |||||||||| | || || ||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||    |||||||    
T  798529 caaaagtacacttgttgggattcagacgaagtctgtactttcttagccgttggaacatctttagcaaatactcaacatgttgttcttcagtgattgactt 798628  T
Q  215 tacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattaga 314  Q
     || |||||||| |||||||| || || |  |||||||| |||||||  ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || | |    
T  798629 gacgatcatgtcatccacataaacctcaatctctttgtgtatcatgttgtgaaagatagtagtcatacccctttgataagtagcccctgcattgatcaaa 798728  T
Q  315 ccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggaga 414  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||| | ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  798729 ccgaacggcatcactctgtaacagaaagtgccccaaggtgtgatgaaagacgtcttctctttgtcttcgggcgccatcttgatctgattgtaaccggaga 798828  T
Q  415 aaccgtccatgaaggagaacac 436  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  798829 aaccatccatgaaggagaacac 798850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 25726690 - 25726305
Alignment:
Q  54 ggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtact 153  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |  |  || |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  25726690 ggatctacttcaatacctttctggctgacaataaagcccaggagtttgccggatttaacaccgaaggtacacttgttaggattcaaacggagtttgtact 25726591  T
Q  154 ttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtg 253  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||| ||||||||||  || |||     ||| || |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  25726590 ttctcaaccgttggaacatcttcaacaaatactcaacatgtttttcttcagtgcctgatttgacaatcatatcatccacatatacctcgatttctttgtg 25726491  T
Q  254 aatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatgga 353  Q
    |||||||||||||||     | ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || |  || |||||||||||    ||||||||||| ||| | ||     
T  25726490 aatcatgtcatgaaaatttttggtcatacccctttggtaagtggcaccggcatttatcaacccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccctagggt 25726391  T
Q  354 gtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25726390 gtgatgaaagacgtcttttctctatcttcaggagccatcctgatctgattgtaaccggagaaactgtccatgaaggagaaaacctt 25726305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29089762 - 29089306
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  29089762 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 29089663  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  29089662 accagatctaacaccgaaagtacatttgttgggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 29089566  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || |||||||| || |    
T  29089565 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctttggtaagtgg 29089466  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  29089465 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggtgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 29089366  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  29089365 ctgattgtagccggagaaaccgtccacgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 29089306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Original strand, 1893510 - 1893905
Alignment:
Q  44 gactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  1893510 gactttgtcgggatccacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacaccgaaggtacacttgttaggattcaaacgg 1893609  T
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcga 243  Q
    || |||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| ||||||||||  || |||     ||| || || |||||||| |||||||| ||||| |    
T  1893610 agtttgtactttctcaaccgttgaaacatcttcgacaaatactcaacatgttcttcttcagtgcctgatttgacgatcatgtcatccacatacacttcaa 1893709  T
Q  244 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagc 343  Q
      ||||| || ||||| ||||| || |   ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |  || || ||||| |||  ||||||||| ||    
T  1893710 tctctttatgtatcatatcatggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggcaccagcatttatcaacccaaacggcattactaagtagcagaacgc 1893809  T
Q  344 gccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  1893810 gccccaaggcgtgatgaacgacgtcttttctctatcttctggagccatcttgatctggttatacccggagaatccatccatgaaggagaatacctt 1893905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22145441 - 22145348
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaa 94  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145441 cttgtttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaa 22145348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 359 - 453
Target Start/End: Original strand, 16733714 - 16733806
Alignment:
Q  359 aaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtat 453  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16733714 aaaagatgtcttttctctatct-caggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaaca-cttagactgagcagtat 16733806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 383 - 454
Target Start/End: Original strand, 17526816 - 17526887
Alignment:
Q  383 aggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17526816 aggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 17526887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 366 - 439
Target Start/End: Original strand, 25721027 - 25721100
Alignment:
Q  366 gtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25721027 gtcttttctctatcttcaggagccatcctgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaaaacctt 25721100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 16393342 - 16393769
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||     
T  16393342 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaagctttccggatctgacacca 16393441  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||    | |||||     
T  16393442 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtttgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaatcgacttg 16393540  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || ||||| || |||||||| || || |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  16393541 actatcatatcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatatcgtggaaaagagtagtcatacccctctgataagtagctcctgcattgattaaac 16393640  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  16393641 cgaacggcattactttgtagcaaaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaa 16393740  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  16393741 tccatccatgaatgagaagactttagact 16393769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16127710 - 16127904
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  16127710 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 16127809  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgtt 195  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||    
T  16127810 accagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt 16127904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9469550 - 9469123
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||     
T  9469550 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcagggtctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaagctttccggatctgacacca 9469451  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||    | |||||     
T  9469450 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtttgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaatcgacttg 9469352  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || ||||| || |||||||| || || |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  9469351 actatcatatcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatatcgtggaaaagagtagtcatacccctctgataagtagctcctgcattgattaaac 9469252  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  9469251 cgaacggcattactttgtagcaaaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaa 9469152  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  9469151 tccatccatgaatgagaagactttagact 9469123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 30369854 - 30370281
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||     
T  30369854 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaagctttccggatctgacacca 30369953  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||      |||||     
T  30369954 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtttgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaaccgacttg 30370052  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || ||||| || |||||||| || || |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  30370053 actatcatatcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatatcgtggaaaagagtagtcatccccctctgataagtagctccggcattgattaaac 30370152  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  30370153 cgaacggcattactttgtaacagaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaa 30370252  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  30370253 tccatccatgaatgagaagactttagact 30370281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 30542 - 30089
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30542 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 30443  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30442 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 30343  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30342 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 30243  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30242 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 30143  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30142 attataaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 30089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 19319 - 18866
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  19319 cttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcggatggcccggacattatcagggtcgacttcaatgcccttttgactgacaatgaagcctagtaattt 19220  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19219 ttcagatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgacatgttgctcc 19120  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19119 tcatcttttgacttcacaatcatatcgtccacatatatttcgacttctttgggaatcatgtcatgaaacatagtagtcattcctctttggtaggtagcac 19020  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19019 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtatcccatggggtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggggacattttgatcag 18920  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18919 attgtaaccggagaagccatccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 18866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 3316 - 2860
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3316 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 3217  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3216 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 3117  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3116 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaagagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 3017  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3016 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 2917  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2916 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 2860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 32152 - 32608
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32152 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 32251  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32252 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 32351  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32352 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaagagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 32451  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32452 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 32551  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32552 attgtaaccagagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 32608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 43998 - 44454
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43998 cttgcttctgggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 44097  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44098 cccggatctgacaccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctctcgaacatctttgttaaatattcaacatgttgctcc 44197  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44198 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 44297  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44298 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 44397  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44398 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 27605873 - 27606329
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605873 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 27605972  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605973 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 27606072  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27606073 tcatctgttgactttacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 27606172  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27606173 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 27606272  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27606273 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 27606329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14560872 - 14560416
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14560872 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 14560773  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14560772 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 14560673  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14560672 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 14560573  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14560572 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcctcaggagacattttgatctg 14560473  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14560472 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 14560416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18793952 - 18793496
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793952 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 18793853  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18793852 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatactcaacatgttgctcc 18793753  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793752 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 18793653  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793652 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18793553  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793552 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 18793496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 2134228 - 2134684
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2134228 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaaacctaataactt 2134327  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2134328 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 2134427  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2134428 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtggcac 2134527  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2134528 ctgcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcctcaggagacattttgatctg 2134627  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2134628 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgggcagtattatc 2134684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18712732 - 18712276
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712732 cttgtttctcggtctgtggagctggcatctctcggatggcccggaccttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactt 18712633  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18712632 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatccttgtcaaatattcaacatgctgctcc 18712533  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18712532 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 18712433  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712432 cagcattaattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18712333  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712332 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 18712276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 19205330 - 19205783
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19205330 cttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 19205429  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19205430 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 19205529  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19205530 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 19205629  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19205630 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcctcaggagacattttgatctg 19205729  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19205730 attataaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtatt 19205783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 28358920 - 28359373
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358920 cttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 28359019  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28359020 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 28359119  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28359120 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 28359219  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28359220 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 28359319  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28359320 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagactgagcagtatt 28359373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 19691346 - 19690890
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19691346 cttgcttctcggtttgtggaactggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgataatgaagcctaataactt 19691247  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19691246 tccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgctcc 19691147  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19691146 tcatctgttgactttacaatcatatcgtccacatatacttcgacttccttgtgaatcatgtcatgaaagagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 19691047  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19691046 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcctcaggagacattttgatctg 19690947  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19690946 attgtaaccagagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 19690890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 19677695 - 19677239
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19677695 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 19677596  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19677595 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 19677496  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19677495 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 19677396  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19677395 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 19677296  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19677295 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 19677239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29832574 - 29832118
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29832574 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 29832475  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  29832474 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgcccc 29832375  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29832374 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 29832275  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29832274 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 29832175  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29832174 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 29832118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 9357873 - 9357417
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9357873 cttgcttctctgtctgtggaactggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactt 9357774  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9357773 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 9357674  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9357673 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatacacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 9357574  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9357573 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 9357474  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9357473 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 9357417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 12089691 - 12090147
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089691 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 12089790  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12089791 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 12089890  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12089891 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 12089990  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089991 cggcattgattaggccgaacggcatcactttgtaacagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 12090090  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12090091 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 12090147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 31357776 - 31357320
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31357776 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 31357677  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  31357676 gccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctct 31357577  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31357576 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 31357477  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31357476 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 31357377  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31357376 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 31357320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 33261982 - 33261526
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33261982 cttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 33261883  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33261882 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 33261783  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  33261782 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 33261683  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33261682 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 33261583  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33261582 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagattgagcagtattatc 33261526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 31486839 - 31487295
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31486839 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatccggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 31486938  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31486939 cccggatctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttatattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 31487038  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31487039 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 31487138  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31487139 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 31487238  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31487239 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 31487295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16286649 - 16286331
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16286649 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 16286550  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16286549 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgctcc 16286450  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16286449 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 16286350  T
Q  301 cagcattaattagaccgaa 319  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  16286349 cagcatttattaggccgaa 16286331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 451
Target Start/End: Original strand, 22077879 - 22078329
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||    
T  22077879 cttgcttttcggtctgtggtgccggcatctctctgatggcccggaatttgtcaagatcgacttcaatgcccttttggctaacaatgaagcctagcagttt 22077978  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  22077979 tccggatctgacaccgaacgtacacttgttggggttcagccgaagcttgtactttctcaacctttctaacatttttgtcaaatactcaacatgctgttcc 22078078  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22078079 tcatcttttgacttcacaatcatatcgtccacgtatacttcaacttgtttatgaatcatatcatgaaataaagtagtcattcctctttgataggtagcgc 22078178  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
      ||||| || || ||||| |||||  ||||| | ||||| | ||||||||| || || || || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  22078179 tcgcatttatcaggccgaacggcattgctttgcaacagaaggtgccccatggggtaatgaacgatgtcttttccctgtcttcaggtgacattttgatctg 22078278  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagt 451  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22078279 gttataaccggagaagccgtccatgaaggagaacaccttggactgagcagt 22078329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14212287 - 14211831
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  14212287 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 14212188  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  14212187 accagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 14212091  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || |||||||| || |    
T  14212090 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctttggtaagtgg 14211991  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  14211990 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 14211891  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  14211890 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 14211831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 22412186 - 22411730
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  22412186 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 22412087  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  22412086 accagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 22411990  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || |||||||| || |    
T  22411989 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctttggtaagtgg 22411890  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  22411889 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 22411790  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  22411789 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 22411730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 16768528 - 16768133
Alignment:
Q  44 gactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||     
T  16768528 gactttgtcgggatccacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacaccgaaggtacacttattaggattcaaacgg 16768429  T
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcga 243  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||||||||  || |||     ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16768428 agtttgtactttctcaaccgttggaacatcttcaacaaatactcaacatgttcttcttcagtacctgatttgacaatcatgtcatccacatacacttcaa 16768329  T
Q  244 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagc 343  Q
      ||||| || ||||| || || || |   ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |  || || ||||| |||  ||||||||| ||    
T  16768328 tctctttatgtatcatatcgtggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggcaccagcatttatcaacccaaacggcattactaagtagcagaacgc 16768229  T
Q  344 gccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16768228 gccccaaggcgtgatgaacgacgtcttttctctatcttctggagccatcttgatctggttatacccggagaatccatccatgaaggagaatacctt 16768133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 364 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16286328 - 16286235
Alignment:
Q  364 acgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16286328 acgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtgttatc 16286235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19844415 - 19843977
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||  | ||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || |  |  ||    
T  19844415 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggttccgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttgtgactgacgataaaacccaggagttt 19844316  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |  |||||||||  |||||| ||||||||||  ||     
T  19844315 accggatctaacaccgaatgtacatttgttaggattcaaacggagcttgtactttctcaagcgctgaaacatctttaacaaatactcaacatgttcttct 19844216  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||       ||||| || ||||| || ||    || || |||| |||||||||||||||||||||||| |   | ||||| || |||||||| || ||||    
T  19844215 tccgtaccggacttgacgatcatatcatctttgtagacctcgatttctttgtgaatcatgtcatgaaatatcttggtcatgcccctttggtaagtggcac 19844116  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    | ||||| || |  || |||||||||||    ||||||||||| ||||| |  ||||| || || ||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||    
T  19844115 ccgcatttatcaatccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccaggctgtgatgaatgatgtcttttctctgtcttcgggagccatcctgatctg 19844016  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19844015 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaaaacctt 19843977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 9285 - 8829
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9285 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 9186  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9185 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatccttgtcaaatattcaacatgctgctcc 9086  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9085 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 8986  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8985 cagcattaattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 8886  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8885 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 8829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14668278 - 14667822
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668278 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccgaactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 14668179  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14668178 tccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttttcaacctttcgaacatctttgtcaaatactcaacatgttgctcc 14668079  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14668078 tcatctgttgactttacaatcatatcgtccacatatacttcgacttccttgtgaatcatgtcatgaaagagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 14667979  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14667978 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 14667879  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14667878 attgtaaccggagaaaccgtccaaaaaggagaacaccttagactgagcagtgttatc 14667822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24115924 - 24115468
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24115924 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 24115825  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24115824 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 24115725  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24115724 tcatctgttgactttacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 24115625  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24115624 cagcatttattaagccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcctccggagacattttgatctg 24115525  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24115524 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 24115468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 34185967 - 34186423
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185967 cttgcttctcggtctgtggagcaggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 34186066  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34186067 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 34186166  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34186167 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcacgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 34186266  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34186267 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 34186366  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34186367 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 34186423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 54836653 - 54836197
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836653 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatagcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 54836554  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54836553 gccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgctgctcc 54836454  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  54836453 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacttcgacctctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtaatcattcctctttgataggtagcac 54836354  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836353 cagcatttatcaagccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 54836254  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836253 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 54836197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 17016308 - 17015852
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016308 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 17016209  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016208 cccggatctgacgtcgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 17016109  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17016108 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 17016009  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016008 cagcatttattaggccgaacgacatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 17015909  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17015908 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 17015852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5009137 - 5008681
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009137 cttgcttctctgtctgtggagctggcatctctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 5009038  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5009037 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 5008938  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5008937 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 5008838  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5008837 cagcattgattagaccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcctcaggagacattttgatctg 5008738  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5008737 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtgttatc 5008681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 24589368 - 24589824
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24589368 cttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcccaataactt 24589467  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24589468 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatactcaacatgttgctcc 24589567  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24589568 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaatagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 24589667  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589668 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 24589767  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589768 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 24589824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6573120 - 6572664
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573120 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttattaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 6573021  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  6573020 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgttcc 6572921  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6572920 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtggatcatgtcatgaaacagggtagtcatccctctttggtaggtagcac 6572821  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6572820 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctg 6572721  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6572720 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 6572664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 14760313 - 14760769
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14760313 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 14760412  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14760413 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcatcaaatattcaacatgttgctcc 14760512  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14760513 tcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcgacttctttgtggatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 14760612  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14760613 cagcatttattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 14760712  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14760713 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 14760769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 39853899 - 39853443
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39853899 cttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 39853800  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39853799 cccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgttgctcc 39853700  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39853699 tcatctgttgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 39853600  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39853599 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 39853500  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39853499 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 39853443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 18797621 - 18798077
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797621 cttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 18797720  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18797721 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 18797820  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18797821 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacttcgacttctttgtgagtcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaagtagcac 18797920  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797921 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18798020  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18798021 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 18798077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 27160324 - 27160780
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160324 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 27160423  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27160424 cccggatctgacgccgaatgtacacttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatattcaacatgttgctcc 27160523  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || |||||| |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27160524 tcgtctgttaacttcacaatcatatcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 27160623  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27160624 cagcattaattagaccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 27160723  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160724 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 27160780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 33670807 - 33671263
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33670807 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 33670906  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33670907 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 33671006  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33671007 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 33671106  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33671107 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttccggagacattttgatctg 33671206  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33671207 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 33671263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15231134 - 15230681
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15231134 cttgtttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagcaactt 15231035  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15231034 tccagatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgacatgttgctcc 15230935  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15230934 tcatcttttgacattacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 15230835  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15230834 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagaggttttttctctatcttcaggggacattttgatctg 15230735  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15230734 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 15230681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 18314185 - 18314641
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18314185 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 18314284  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18314285 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 18314384  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18314385 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 18314484  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18314485 cagcattgattagaccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgatgaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 18314584  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18314585 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 18314641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 30757022 - 30756566
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30757022 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 30756923  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30756922 gccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 30756823  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30756822 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 30756723  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30756722 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 30756623  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30756622 attatagccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 30756566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 36341524 - 36341980
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36341524 cttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 36341623  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36341624 cccggatctgacgccgaatgtacacttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgttaaatattcaacatgttgctcc 36341723  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36341724 tcgtctgtcgacttcacgatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtggatcatgtcatgaaatagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 36341823  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341824 cagcatttattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccaaggagtgataaacgacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 36341923  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341924 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 36341980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14101805 - 14101349
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14101805 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 14101706  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14101705 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 14101606  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14101605 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 14101506  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14101505 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 14101406  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14101405 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 14101349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 31123519 - 31123975
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31123519 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 31123618  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31123619 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 31123718  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31123719 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 31123818  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31123819 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatttg 31123918  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31123919 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 31123975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 40102644 - 40103100
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102644 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 40102743  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40102744 cccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 40102843  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  40102844 tcatctgctgacttcacaatcatatcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 40102943  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  40102944 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcctcaggagacattttgatttg 40103043  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40103044 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 40103100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21972963 - 21972507
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972963 cttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 21972864  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21972863 tccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 21972764  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21972763 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcatccccctttggtaggtagcac 21972664  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21972663 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctgtcttcaggagacatcttgatctg 21972564  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21972563 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 21972507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 1903516 - 1903063
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| || ||| ||    
T  1903516 cttgtttctcggtctgtcgagctggcatttctcggatgacccggactttatcagggtcgacttcaatgctctcttgactgacaatgaagcatagtaattt 1903417  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  1903416 tccgaatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtactcgacatgttgctcc 1903317  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903316 tcatattttgacttcacaatcatatcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 1903217  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1903216 cagtatttattagaccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtgataaaagatgtcttttctctatcctcaggggacattttgatctg 1903117  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1903116 attgtaaccggagaagccgtccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 1903063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 454
Target Start/End: Original strand, 15281959 - 15282388
Alignment:
Q  25 gcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtaca 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15281959 gcatttctcggatggcgcggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagtctagtaactttccagatctgacgccgaacgtaca 15282058  T
Q  125 tttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatg 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  15282059 tttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgacatgttgctcctcatcttttgacttcacaatcata 15282158  T
Q  225 tcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggca 324  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  15282159 ttgttcacatatatttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcatttattaggccgaacgaca 15282258  T
Q  325 tcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccat 424  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15282259 tcactttgtagcagaaagtaccccatggggtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggggacattttgatctgattgtaaccggagaaaccagccat 15282358  T
Q  425 gaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15282359 gaaggagaacaccttggactgagcagtatt 15282388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 15388385 - 15388841
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||    
T  15388385 cttgcttttcggtctgtggtgccggcatctctctgatggcccgaactttgtcaggatcgacttcaatgcccttttggctaacaatgaagcctagcagttt 15388484  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  15388485 tccagatctgacaccgaacgtacacttgttggggttcagccgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaaatactcaacatgatgttcc 15388584  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15388585 tcatcttttgacttcacaatcatatcgtccacgtatacttcaacttctttatgaatcatatcatgaaataaagtagtcattcctctttgataggtagcgc 15388684  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    | ||||| || || ||||| |||||  ||||| | || || | ||||||||| || || || || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  15388685 ccgcatttatcaggccgaacggcattgctttgcaacataaggtgccccatggggtaatgaacgatgtcttttccctgtcttcaggtgacattttgatctg 15388784  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15388785 gttataaccggagaagccgtccatgaaggagaacaccttggactgagcagtgttatc 15388841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 20335428 - 20335569
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20335428 cttgcttctcggtccgtggagctggcatttctcgaatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 20335527  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcg 142  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20335528 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcg 20335569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 14725806 - 14726262
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || |  ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  14725806 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgttgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 14725905  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | |||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  14725906 accagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctggaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 14726002  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||  || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || |||||||| || |    
T  14726003 tcttctgtgccagacttaacaatcaaatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctttggtaagtgg 14726102  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  14726103 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 14726202  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  14726203 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 14726262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 19767601 - 19767145
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  19767601 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 19767502  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  19767501 accagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttttcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 19767405  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || || ||||| || |    
T  19767404 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctctggtaagtgg 19767305  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  19767304 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggtgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 19767205  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  19767204 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaaaaccttgcacttagcagtgttatc 19767145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Original strand, 22146619 - 22147014
Alignment:
Q  44 gactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
    |||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||||||| || || | ||| || ||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||     
T  22146619 gactttgtcgggatctacttcaatacctttctgactgacaatgaaacccaagagcttgccagatctaacactgaaggtacacttgttaggattcaatcgg 22146718  T
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcga 243  Q
    || |||||||||||||||| ||  ||||| |||  |||||| ||| ||||||  || |||     |||||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  22146719 agtttgtactttctcaaccgttgaaacatttttaacaaatactcagcatgttcttcttcagtgcctgacttgacaatcatatcatccacatatacttcaa 22146818  T
Q  244 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagc 343  Q
      ||||| || ||||| ||||| || |   ||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |  || |||||||| |||  ||||||||||||    
T  22146819 tctctttatgtatcatatcatggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggcgccagcatttatcaatccaaatggcattactaagtagcagaaagc 22146918  T
Q  344 gccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  22146919 gccccatggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcttccggagccatcttgatctggttatacccggaaaactcatccatgaaggagaacacctt 22147014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 439
Target Start/End: Original strand, 1882123 - 1882544
Alignment:
Q  18 ggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccga 117  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||   |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || || | ||| |||||||| || ||||    
T  1882123 ggagcaggcatttctctgatagctttgactttgtcgggatctacttcaatacccttctggctgacgataaaacccaagagcttgccggatctaacaccga 1882222  T
Q  118 atgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttac 217  Q
    | ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||||||||  || |||      || || ||    
T  1882223 aggtacacttattaggattcaaacggagtttgtactttctcaaccgttggaacatcttcaacaaatactcaacatgttcttcttcagtacccgatttgac 1882322  T
Q  218 aatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccg 317  Q
    |||||| || |||||||| |||||||  ||||| || ||||| || || || |   ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |  ||     
T  1882323 aatcatatcatccacatacacttcgatctctttatgtatcatatcgtggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggcaccagcatttatcaaccca 1882422  T
Q  318 aatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaac 417  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| || || |||||||| |    
T  1882423 aatggcattactaagtagcagaaagcgccccaaggcgtgatgaacgacgtcttttctctatcctctggagccatcttgatctggttatacccggagaacc 1882522  T
Q  418 cgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  1882523 catccatgaaggagaatacctt 1882544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 15830 - 15374
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15830 cttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaacaactt 15731  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15730 gccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 15631  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15630 tcatctgttgactttacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 15531  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15530 cagcatttattaagccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcctccggagacattttgatctg 15431  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15430 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 15374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12820 - 12364
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12820 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 12721  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12720 gccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 12621  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12620 tcatctattgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 12521  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12520 cagcattgattaggccgaacggcatcactttataacagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattctgatctg 12421  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12420 attataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 12364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 23128 - 22672
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23128 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataactt 23029  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23028 gccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgttgttcc 22929  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22928 tcatctgttgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 22829  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22828 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacatcttgatctg 22729  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22728 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 22672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 6186 - 6642
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6186 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 6285  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  6286 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgttgttcc 6385  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6386 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttggtaggtagcac 6485  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6486 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaggtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatttg 6585  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6586 attataaccggaaaaaccatccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 6642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 23198 - 23654
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23198 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 23297  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  23298 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctct 23397  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23398 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 23497  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23498 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 23597  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23598 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 23654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 10948328 - 10947872
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948328 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaaggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 10948229  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10948228 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 10948129  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10948128 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcccctttgataggtagcac 10948029  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948028 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 10947929  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10947928 attataaccagaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 10947872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 10965916 - 10965460
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965916 cttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 10965817  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10965816 cccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 10965717  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10965716 tcatctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 10965617  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965616 cagcattgattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaagtgccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 10965517  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10965516 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 10965460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 51641469 - 51641013
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51641469 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 51641370  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51641369 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 51641270  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51641269 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacaaagtagtcattcccctttggtaggtagcac 51641170  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51641169 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 51641070  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51641069 attataaccagaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 51641013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 16205041 - 16205494
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16205041 cttgcttctcggtctttggagccggcatttctcggatggcccggaatttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagtaattt 16205140  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16205141 tccgaatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcaacatgttgctcc 16205240  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16205241 tcatctattgacttcacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgccatgaaacagagtagtcatccctctttggtaggtagcac 16205340  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16205341 cagcatttattagaccgaacgacatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtaataaaagatgttttttctctatcttcaggggacattttgatctg 16205440  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16205441 attgtaaccggagaagccgtccataaaggagaacaccttaaactgagcagtatt 16205494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28588236 - 28587780
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588236 cttgcttctctgtctgtggaactggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 28588137  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28588136 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 28588037  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28588036 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 28587937  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  28587936 cagcattgattaggccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctgtcttcaggagacattttgatttg 28587837  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28587836 attataaccggagaaaccgtccatgaaggaaaacaccttagattgagcagtattatc 28587780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 20464227 - 20463782
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20464227 cttgtttctcggtctgcggggctgggatttctcggatggcccgaactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctagtaactt 20464128  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20464127 tccagatctgacgccgaacatacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgacatgttgctcc 20464028  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464027 tcatcttttgacttcacaatcatatcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 20463928  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    || |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20463927 caacatttattaggccgaacgacatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtgatgaaagacgtcttttctctatcttcaagggacattttgatctg 20463828  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactga 446  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20463827 attgtaaccggagaagccatccatgaaggagaacaccttggactga 20463782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 41790317 - 41790773
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41790317 cttgcttctctgtttttggagctggcatttctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcgatgcccttttgactgacaatgaagcctaacaactt 41790416  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41790417 gccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtatcttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 41790516  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  41790517 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcatccccctttgataggtagcac 41790616  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41790617 cagcattgattaggccgaatggcatcactttgtagcagaaggtcccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 41790716  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41790717 attataaccagaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 41790773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3644383 - 3644241
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644383 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 3644284  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3644283 cccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcga 3644241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22489272 - 22488834
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | |||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  22489272 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgactttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 22489173  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||  ||     
T  22489172 accagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtttttct 22489073  T
Q  201 tcatctgtt-gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagca 299  Q
    || | ||   || || |||||||| || || || || || |||| ||||||||||||||| ||||||||     ||||||| ||||| ||||| || |||    
T  22489072 tc-tgtgccagatttaacaatcatatcatctacgtagacctcgatttctttgtgaatcatatcatgaaaatttttagtcatgcctctctggtaagtggca 22488974  T
Q  300 ccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatct 399  Q
    |||||||| || |  || ||||||||||||  |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||    
T  22488973 ccagcatttatcaatccaaatggcatcactaagtagcagaaagcaccccaaggtgtgatgaaagacgtcttttctctatctcctggagccatctttatct 22488874  T
Q  400 gattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22488873 gattataaccggagaaaccgtccatgaaggagaaaacctt 22488834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 5629021 - 5629448
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||     
T  5629021 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaagctttccggatctgacacca 5629120  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||    | |||||     
T  5629121 aaagtgcatttgttgggatttagacgaagtttgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaatcgacttg 5629219  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || ||||| || |||||||| || || |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  5629220 actatcatatcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatatcgtggaaaagagtagtcatacccctctgataagtagctccggcattgattaaac 5629319  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| || || || || |||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  5629320 cgaacggcattactttgtaacagaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttttctccctatcttcgggtgccatcttgatttgattataaccggagaa 5629419  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  5629420 tccatccatgaatgagaagactttagact 5629448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 11198 - 10742
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11198 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 11099  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11098 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 10999  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10998 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttggtaggtagcac 10899  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10898 cggcattgattaggccgaacggcatcactttgtaacagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 10799  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10798 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 10742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 11935 - 12391
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 12034  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12035 tccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgctgctcc 12134  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  12135 tcatctgctgacttcacaatcatgtcatccacatatacctcaacttccttgtgaatcatgtcatgaaacagagtggtcattcccctttgataggtagcac 12234  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12235 cagcattgattaggccgaacggcatcaccttgtagcagaaagtaccccatggagtgataaaagatgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 12334  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12335 attataaccggaaaaaccgtccatgaaggagaacaccttagattgagcagtattatc 12391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 33709 - 33252
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709 cttgtttctcgtcctgcggggctggcatttctcgaatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 33610  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatcttt-gtcaaatattcaacatgttgctc 199  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  33609 cccggatctgacgtcgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacattttttgtcaagtattcgacatgttgctc 33510  T
Q  200 ctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagca 299  Q
    | ||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33509 cgcatcttttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaatagagtagtcatccctctttggtaggtagca 33410  T
Q  300 ccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatct 399  Q
    |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33409 ccagcatttattaggccgaacgacatcactttgtagtagaaagtaccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatct 33310  T
Q  400 gattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33309 gattgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 33252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 9271 - 8808
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggacttt-atcaggatcgacttcaatgccctttt-ggctgacaatgaagcctaataac 98  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9271 cttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggacttttatcaggatcgacttcaatgccctttttggctgacaacgaagcctaataac 9172  T
Q  99 tttccggatctgacgccgaatgtaca-tttgttaggattcaatcgaagcttgtacttt-ctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttg 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9171 ttcccggatctgacgccgaatgtacactttgttgggattcaatcgaagcttgtatttttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaacatgttg 9072  T
Q  197 ctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctc-tttggtaggt 295  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9071 ctcctcgtctgttgacttcacaatcatatcatccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattccccttttggtaggt 8972  T
Q  296 agcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtc-ttttctctatcttcaggagaca-ttt 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  8971 agcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtcccccatggagtgataaaagatgtctttttctctatcttcaggagacatttt 8872  T
Q  394 tgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8871 tgatctgattataaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 8808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 9294 - 8841
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9294 cttgtttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggctcggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggttgacaatgaagcctagtaactt 9195  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  9194 tctgcatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtactcaacatgttgctcc 9095  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9094 tcatctgttgactttacaatcatatcgtccacatacacctcaacttccttgggaatcatgtcaggaaacagagtagtcattcctcgttggtaggtagcac 8995  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8994 cagcatttattaagccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtaataaaagacgtcttttcactatcttcaggggacattttgatctg 8895  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8894 attgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttggactgagctgtatt 8841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 5678 - 6131
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5678 cttgcttctcagtctgcggagctggcatttcgcggatagcccggactttatcaggatcgatttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctagcaactt 5777  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  5778 cccggatctgacgtcgaatgtacacttgttagggtttaatcgaagcctgtacttcctcagcctctcgaacattttggtcaagtactcaacatgttgctcc 5877  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5878 tcatcttctgacttcacaatcatgtcatccacatatacttcaacttctttatgaatcatgtcatgaaacaaggtagtcattcctctttggtaagtagcac 5977  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5978 cagcatttattagaccgaacggcatcactttgtagcagaaagtaccccacggggtgataaaagatgtcttttctctatcctcaggggacattttaatctg 6077  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtatt 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6078 attgtaaccggagaagccgtccatgaaggagaacaccttggactgagcagtatt 6131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 457
Target Start/End: Original strand, 43753 - 44230
Alignment:
Q  6 ttctcggtct-gcggagctggcatttctcggatgg--cccggacttt-atcaggatcgacttcaatgccctttt-ggctgacaa-tgaagcct-aataac 98  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  43753 ttctcggtcttgtggagctggcatttctcggatgggccccggacttttatcaggatcgacttcaatgccctttttggctgacaaatgaagccttaataac 43852  T
Q  99 tttccggatctgacgccgaatgt-acatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaaccttt-cgaacatctttgtcaaat-attc--aacatg 193  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  43853 tttccggatctgacaccgaatgttacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaaccttttcgaacatctttgtcaaattattccaaacatt 43952  T
Q  194 --ttgctcctcatctgttgacttt-acaat-catgtcgtccac-atatacttcg-acttctttgt-gaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcc-tc 285  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  43953 gtttgctcctcatctgttgacttttacaattcatgtcgtccactatatacttcgtacttctttgttgaatcatgtcatgaaacagagtagtcatcccctc 44052  T
Q  286 tttggtaggt-agcaccagca-ttaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaa-gacgtcttttctctatcttc 382  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||     
T  44053 tttggtaggttagcaccagcaatttattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagtaccccatggggtgataaaaagatgtcttttctctatcttt 44152  T
Q  383 --aggagacatttt-gatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
      |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44153 cgaggagacatttttgatttgattgtaaccggagaaaccatccatgaaggagaacaccttggactgagcagtattatc 44230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 50405 - 49967
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  50405 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagttt 50306  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   |  ||||||||   |||||| ||||||||||  ||     
T  50305 accagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaactgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgttcttct 50206  T
Q  201 tcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcac 300  Q
    || |     || || |||||||| || || || || || |||| ||||||| ||||||| |||||||| |   ||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  50205 tctttgccagatttaacaatcatatcatctacgtagacctcgatttctttgggaatcatatcatgaaaaattttagtcatgcctctctggtaagtggcac 50106  T
Q  301 cagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctg 400  Q
    ||||||| || |  || ||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  50105 cagcatttatcaatccaaatggcatcactaagtagcagaaagcgccctaaggtgtgatgaaagacgtcttttctctatcttccggagccatctttatctg 50006  T
Q  401 attgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50005 attataaccggagaaaccgttcatgaaggagaaaacctt 49967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 10467 - 10011
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  |  ||    
T  10467 cttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctacgagttt 10368  T
Q  101 tccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcc 200  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |  ||||||||   |||||| ||||||||||   |     
T  10367 accagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaaccgctgaaacatcttcaacaaatactcaacatgtt---ct 10271  T
Q  201 tcatctgtt---gactttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtag 297  Q
    || |||||    ||||| |||||||| || || || || || || | ||||||||||||||| |||||||| |   | ||||| || || ||||| || |    
T  10270 tcttctgtgccagacttaacaatcatatcatctacgtagacctcaatttctttgtgaatcatatcatgaaagattttggtcatacccctctggtaagtgg 10171  T
Q  298 caccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgat 397  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  10170 caccagcatttatcaaaccaaatggcatcaccacatagcagaaagcaccccagggcgtgatgaaagacgtcttttctctatcctcaggagccatcctgat 10071  T
Q  398 ctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacaccttagactgagcagtattatc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  10070 ctgattgtagccggagaaaccgtccatgaaggagaagaccttgcacttagcagtgttatc 10011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Original strand, 35258 - 35679
Alignment:
Q  12 gtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctga 111  Q
    |||| |||||| ||||| |||| ||| || |  ||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||  | ||| |||||||| |    
T  35258 gtcttcggagcaggcatctctctgatagctctaactttgtcgggatctacttcaatacctttctgactgacaatgaagcctagaagcttcccggatctaa 35357  T
Q  112 cgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttga 211  Q
    | || || || || ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||   |||||| || |||||||  || |||    | ||    
T  35358 caccaaaagtgcacttgttgggattcagacgaagtttgtactttcttaaccgctggaacatcttcagcaaatagtcgacatgttcttcttcagtaatcga 35457  T
Q  212 ctttacaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaatt 311  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || |  ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||| || || || || ||||| || ||||| ||     
T  35458 cttgactatcatgtcatccacatatacctcaatctctttatgtatcatgtcatgaaagatagtggtcatacccctctgataagtagctcccgcattgatc 35557  T
Q  312 agaccgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccgg 411  Q
    | |||||| ||||| ||| |||| || |||| |||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||     
T  35558 aaaccgaacggcattactctgtaacaaaaagtgccccaaggtgtaataaaagacgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatctgattgtaaccga 35657  T
Q  412 agaaaccgtccatgaaggagaa 433  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  35658 agaaaccgtccatgaatgagaa 35679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Original strand, 4965 - 5360
Alignment:
Q  44 gactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcga 143  Q
    |||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| || || || || | ||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |     
T  4965 gactttgtcgggatctacttcaatacctttctgactgacgataaaacccaagagcttgccagatctaacaccgaaggtacacttgttaggattcaactgg 5064  T
Q  144 agcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgactttacaatcatgtcgtccacatatacttcga 243  Q
    || |||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||| ||| ||||||  || ||      | |||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  5065 agtttgtactttctcaaccgttgaaacatctttaacaaatactcatcatgttcttcttcggtgcctaacttgacaatcatatcatccacatatacttcaa 5164  T
Q  244 cttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcatcactttgtagcagaaagc 343  Q
      ||||| || ||||| ||||| || |   ||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || |  || |||||||| | |  ||||||||||||    
T  5165 tctctttatgtatcatatcatggaatattttagtcatgcctctctggtaagtggagccagcatttatcaatccaaatggcattaataagtagcagaaagc 5264  T
Q  344 gccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtccatgaaggagaacacctt 439  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5265 gccccatggcgtgatgaaagacgtcttctctctatcttccggagccatcttgatctggttatacccggagaatccatccatgaaggagaacacctt 5360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29403 - 28976
Alignment:
Q  17 cggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccg 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||| ||     
T  29403 cggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaagctttccggttctgacacca 29304  T
Q  117 aatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctt-tgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttt 215  Q
    || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| | ||| |  ||||| |  || |||    | |||||     
T  29303 aaagtgcatttgttgggatttaaacgaagtttgtacttcctcaggcgctggaacatcttctgt-agatacttgacatggtcttcttcagtaatcgacttg 29205  T
Q  216 acaatcatgtcgtccacatatacttcgacttctttgtgaatcatgtcatgaaacagagtagtcattcctctttggtaggtagcaccagcattaattagac 315  Q
    || ||||| || |||||||| || || |  ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||| ||    
T  29204 actatcatatcatccacatagacctcaatctctttatgtatcatatcgtggaaaagagtagtcatacccctctgataagtagctccggcattgattaaac 29105  T
Q  316 cgaatggcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaa 415  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  29104 cgaacggcattactttgtagcagaaagtgccccaaggtgtaataaatgatgttttctctctatcttcgggtgccatcttgatttgattatatccggagaa 29005  T
Q  416 accgtccatgaaggagaacaccttagact 444  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||    
T  29004 tccatccatgaatgagaagactttagact 28976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1172 - 1116
Alignment:
Q  1 cttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggat 57  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1172 cttgcttctcggtctgtggagctggcatctctcggatggcccggactttatcaggat 1116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5185 - 5074
Alignment:
Q  322 gcatcactttgtagcagaaagcgccccatggagtgataaaagacgtcttttctctatcttcaggagacattttgatctgattgtaaccggagaaaccgtc 421  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  5185 gcatcactttgtaacaaaaagtgccccaaggtgtgatgaaagatgtcttttctttgtcttcaggtgccatcttgatttgagtgtaaccggagaaaccatc 5086  T
Q  422 catgaaggagaa 433  Q
    |||||| |||||    
T  5085 catgaaagagaa 5074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 85084 - 85042
Alignment:
Q  283 ctctttggtaggtagcaccagcattaattagaccgaatggcat 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  85084 ctctttggtatgtagcaccagcattttttagaccgaatggcat 85042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University