View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4201-Insertion-18 (Length: 194)

Name: NF4201-Insertion-18
Description: NF4201
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4201-Insertion-18
NF4201-Insertion-18
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (8-177)||(33660360-33660529)
chr2 (8-194)||(19424603-19424789)
chr2 (7-189)||(4264057-4264239)
chr2 (8-178)||(27349930-27350099)
chr2 (8-180)||(33550975-33551147)
chr2 (11-194)||(36642031-36642216)
chr2 (8-178)||(43770830-43771000)
chr2 (8-192)||(4166964-4167148)
chr2 (8-192)||(29242115-29242299)
chr2 (8-178)||(19313894-19314063)
chr2 (8-160)||(4478411-4478564)
chr2 (8-192)||(3176981-3177165)
chr2 (8-192)||(43648222-43648406)
chr2 (8-194)||(44285991-44286177)
chr2 (8-194)||(33709207-33709393)
chr2 (8-194)||(41463825-41464011)
chr2 (11-194)||(31570709-31570892)
chr2 (8-188)||(37905750-37905932)
chr2 (8-192)||(17071714-17071898)
chr2 (24-176)||(39167356-39167508)
chr2 (8-192)||(26357619-26357803)
chr2 (13-192)||(4763678-4763857)
chr2 (8-192)||(17054073-17054257)
chr2 (8-192)||(19289300-19289484)
chr2 (8-174)||(13711506-13711667)
chr2 (8-192)||(2325355-2325531)
chr2 (66-180)||(41960940-41961054)
chr2 (11-192)||(11366358-11366539)
chr2 (26-178)||(5881599-5881750)
chr2 (8-180)||(33902110-33902280)
chr2 (52-177)||(45327806-45327931)
chr2 (8-192)||(44913703-44913890)
chr2 (36-160)||(7006930-7007054)
chr2 (8-194)||(18494256-18494429)
chr2 (67-192)||(31861953-31862078)
chr2 (67-180)||(41465602-41465715)
chr2 (107-194)||(18258262-18258349)
chr2 (16-111)||(41051263-41051359)
chr2 (69-149)||(19501760-19501839)
chr2 (92-192)||(35959023-35959122)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (8-194)||(21991653-21991839)
chr7 (8-194)||(5657439-5657625)
chr7 (8-178)||(22687256-22687426)
chr7 (8-192)||(43686058-43686241)
chr7 (8-194)||(6546536-6546722)
chr7 (8-194)||(15612717-15612902)
chr7 (8-176)||(33688238-33688406)
chr7 (8-178)||(12165769-12165939)
chr7 (8-192)||(27283761-27283945)
chr7 (8-192)||(4582936-4583120)
chr7 (8-180)||(27421352-27421523)
chr7 (8-192)||(38258562-38258746)
chr7 (8-178)||(8861302-8861472)
chr7 (7-192)||(41765038-41765223)
chr7 (8-160)||(26980340-26980492)
chr7 (8-192)||(30055544-30055728)
chr7 (8-180)||(32821025-32821197)
chr7 (8-194)||(25691502-25691689)
chr7 (24-192)||(32432485-32432653)
chr7 (8-192)||(23111207-23111393)
chr7 (11-192)||(9355786-9355967)
chr7 (8-192)||(10481621-10481806)
chr7 (8-192)||(18797346-18797528)
chr7 (8-192)||(31579024-31579213)
chr7 (8-180)||(7334811-7334983)
chr7 (8-192)||(24211758-24211942)
chr7 (8-160)||(29173557-29173709)
chr7 (8-180)||(44413351-44413523)
chr7 (18-192)||(10359174-10359348)
chr7 (7-180)||(11071222-11071395)
chr7 (8-180)||(37109889-37110063)
chr7 (8-170)||(48928279-48928440)
chr7 (8-160)||(12390622-12390774)
chr7 (8-160)||(31520716-31520867)
chr7 (8-180)||(37347039-37347210)
chr7 (8-180)||(17842556-17842730)
chr7 (60-194)||(44598735-44598869)
chr7 (8-170)||(48928546-48928707)
chr7 (84-192)||(15672722-15672830)
chr7 (75-189)||(37704241-37704355)
chr7 (7-96)||(34362205-34362293)
chr7 (10-115)||(26524364-26524469)
chr7 (110-194)||(26588042-26588126)
chr7 (13-160)||(32593181-32593327)
chr7 (52-192)||(37703458-37703590)
chr7 (56-180)||(43925167-43925290)
chr7 (8-160)||(38053503-38053647)
chr7 (8-115)||(35353125-35353233)
chr7 (8-65)||(44598381-44598438)
chr7 (99-192)||(46481089-46481182)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (8-194)||(13307664-13307850)
chr8 (8-178)||(38644019-38644189)
chr8 (8-180)||(5299923-5300095)
chr8 (8-178)||(465883-466053)
chr8 (8-194)||(11727065-11727251)
chr8 (8-192)||(36694931-36695115)
chr8 (8-192)||(6098483-6098667)
chr8 (8-192)||(37970484-37970668)
chr8 (8-192)||(12876150-12876335)
chr8 (8-192)||(27082803-27082987)
chr8 (11-192)||(9864192-9864373)
chr8 (7-192)||(16446840-16447025)
chr8 (8-177)||(34895008-34895177)
chr8 (8-180)||(1204968-1205140)
chr8 (8-192)||(43643560-43643744)
chr8 (8-194)||(41910951-41911138)
chr8 (8-160)||(34952028-34952180)
chr8 (8-170)||(1150092-1150254)
chr8 (8-192)||(40862460-40862644)
chr8 (16-194)||(39099082-39099258)
chr8 (11-180)||(16222907-16223076)
chr8 (8-168)||(10555191-10555351)
chr8 (8-180)||(23854408-23854580)
chr8 (37-192)||(1149597-1149752)
chr8 (8-192)||(30654548-30654732)
chr8 (24-192)||(43025759-43025927)
chr8 (8-192)||(31933851-31934035)
chr8 (27-159)||(41362575-41362707)
chr8 (43-192)||(1953953-1954104)
chr8 (50-180)||(35459688-35459818)
chr8 (71-180)||(33906316-33906425)
chr8 (53-180)||(7890934-7891061)
chr8 (8-194)||(44869537-44869724)
chr8 (8-192)||(8803782-8803959)
chr8 (92-192)||(4132651-4132750)
chr8 (84-160)||(7998411-7998488)
chr8 (65-118)||(33197947-33198000)
chr8 (36-90)||(4133077-4133131)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (8-194)||(30969271-30969457)
chr5 (8-178)||(7693272-7693442)
chr5 (8-194)||(19119901-19120087)
chr5 (12-194)||(5837601-5837783)
chr5 (7-180)||(25500887-25501060)
chr5 (8-192)||(36866804-36866988)
chr5 (23-191)||(6824429-6824599)
chr5 (8-194)||(27330348-27330532)
chr5 (8-178)||(32563191-32563361)
chr5 (8-192)||(23116171-23116355)
chr5 (8-194)||(8741833-8742020)
chr5 (8-178)||(9200275-9200445)
chr5 (8-194)||(26268116-26268302)
chr5 (8-192)||(31786595-31786779)
chr5 (8-192)||(40133427-40133611)
chr5 (8-192)||(38528186-38528369)
chr5 (8-178)||(28416490-28416660)
chr5 (8-178)||(39572861-39573031)
chr5 (8-192)||(699192-699376)
chr5 (8-180)||(5112275-5112446)
chr5 (8-180)||(33908275-33908447)
chr5 (8-178)||(22019674-22019844)
chr5 (8-192)||(12910392-12910581)
chr5 (8-192)||(36860465-36860650)
chr5 (8-160)||(1429126-1429278)
chr5 (8-192)||(27318436-27318620)
chr5 (38-192)||(7208813-7208966)
chr5 (8-192)||(22255223-22255408)
chr5 (36-192)||(23954738-23954895)
chr5 (8-177)||(35511441-35511610)
chr5 (8-194)||(35933944-35934124)
chr5 (8-160)||(8466787-8466938)
chr5 (50-194)||(15992487-15992631)
chr5 (8-192)||(22980835-22981019)
chr5 (8-160)||(24886146-24886298)
chr5 (8-118)||(25668692-25668801)
chr5 (27-180)||(21088727-21088880)
chr5 (8-192)||(14919477-14919661)
chr5 (8-180)||(31705573-31705744)
chr5 (8-158)||(14409310-14409459)
chr5 (7-180)||(43308613-43308785)
chr5 (8-180)||(22974043-22974215)
chr5 (7-178)||(42342774-42342942)
chr5 (8-170)||(15724532-15724692)
chr5 (8-180)||(35826445-35826616)
chr5 (8-180)||(17157992-17158163)
chr5 (20-192)||(5829955-5830118)
chr5 (37-192)||(35504436-35504591)
chr5 (11-180)||(8437011-8437179)
chr5 (7-102)||(11898043-11898138)
chr5 (88-189)||(13956314-13956415)
chr5 (8-61)||(13956425-13956478)
chr5 (113-167)||(25669733-25669787)
chr5 (8-43)||(16004474-16004509)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (8-194)||(11466857-11467043)
chr3 (8-192)||(37203100-37203284)
chr3 (8-192)||(37157741-37157924)
chr3 (8-180)||(4015493-4015665)
chr3 (8-167)||(44186485-44186644)
chr3 (8-194)||(2007966-2008151)
chr3 (8-180)||(35844359-35844532)
chr3 (8-192)||(52040881-52041066)
chr3 (7-194)||(3655159-3655346)
chr3 (2-194)||(32373499-32373689)
chr3 (11-192)||(34132971-34133152)
chr3 (11-192)||(39282689-39282869)
chr3 (12-192)||(42506034-42506214)
chr3 (8-192)||(46297721-46297905)
chr3 (11-192)||(53229111-53229293)
chr3 (13-194)||(7327439-7327620)
chr3 (8-180)||(45174536-45174711)
chr3 (8-194)||(25579772-25579958)
chr3 (8-194)||(44891539-44891716)
chr3 (8-180)||(21193639-21193811)
chr3 (8-192)||(48354974-48355158)
chr3 (8-192)||(4761607-4761792)
chr3 (8-160)||(11357355-11357508)
chr3 (8-177)||(51212955-51213124)
chr3 (20-192)||(24708074-24708246)
chr3 (8-175)||(29099388-29099555)
chr3 (36-194)||(43348319-43348476)
chr3 (25-178)||(14586643-14586796)
chr3 (8-160)||(40936024-40936175)
chr3 (8-194)||(53176088-53176273)
chr3 (8-189)||(26941222-26941403)
chr3 (8-164)||(22451001-22451157)
chr3 (8-192)||(3362286-3362472)
chr3 (69-178)||(29163912-29164021)
chr3 (8-181)||(40552229-40552402)
chr3 (8-191)||(24488922-24489105)
chr3 (87-194)||(33698265-33698372)
chr3 (8-178)||(43975861-43976031)
chr3 (8-164)||(33378772-33378928)
chr3 (8-147)||(20373300-20373439)
chr3 (7-162)||(27480368-27480523)
chr3 (66-192)||(46994620-46994746)
chr3 (7-189)||(54828663-54828844)
chr3 (8-192)||(47481555-47481739)
chr3 (14-192)||(21009761-21009939)
chr3 (5-168)||(38591724-38591891)
chr3 (8-178)||(22446038-22446207)
chr3 (89-192)||(22622677-22622780)
chr3 (84-194)||(11835584-11835695)
chr3 (83-194)||(36012245-36012357)
chr3 (8-192)||(54505841-54506024)
chr3 (124-192)||(1089842-1089911)
chr3 (8-48)||(2613923-2613963)
chr3 (8-47)||(33698221-33698260)
chr3 (52-115)||(53811698-53811767)
chr3 (24-63)||(11835699-11835738)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (8-194)||(47279227-47279413)
chr1 (8-178)||(48620675-48620845)
chr1 (8-192)||(32216093-32216277)
chr1 (8-180)||(3534970-3535142)
chr1 (8-192)||(16415683-16415868)
chr1 (8-180)||(15752067-15752239)
chr1 (7-161)||(3309185-3309339)
chr1 (8-194)||(38823252-38823438)
chr1 (8-192)||(10181962-10182146)
chr1 (50-194)||(27227437-27227581)
chr1 (8-194)||(7079015-7079212)
chr1 (8-194)||(27532933-27533118)
chr1 (11-192)||(15382974-15383155)
chr1 (8-192)||(2959786-2959970)
chr1 (13-192)||(4330323-4330503)
chr1 (53-192)||(25160715-25160854)
chr1 (11-192)||(30326906-30327087)
chr1 (8-177)||(34012346-34012515)
chr1 (8-164)||(14758079-14758235)
chr1 (8-192)||(8222169-8222350)
chr1 (8-194)||(1547325-1547503)
chr1 (8-192)||(238467-238650)
chr1 (8-192)||(9903008-9903192)
chr1 (8-192)||(18422689-18422873)
chr1 (8-180)||(41926201-41926373)
chr1 (36-180)||(42721105-42721249)
chr1 (8-194)||(39393421-39393608)
chr1 (8-192)||(28564737-28564919)
chr1 (8-192)||(51128897-51129081)
chr1 (8-159)||(11742338-11742488)
chr1 (27-192)||(27267154-27267318)
chr1 (8-192)||(32267072-32267256)
chr1 (8-180)||(40884851-40885023)
chr1 (8-192)||(28769691-28769875)
chr1 (7-192)||(37451323-37451507)
chr1 (8-180)||(10922765-10922937)
chr1 (8-192)||(19899723-19899907)
chr1 (8-180)||(30254462-30254633)
chr1 (66-192)||(22170807-22170933)
chr1 (8-180)||(15168127-15168306)
chr1 (27-189)||(47682451-47682614)
chr1 (8-164)||(31621535-31621691)
chr1 (62-176)||(33725570-33725684)
chr1 (8-169)||(27563882-27564043)
chr1 (8-192)||(27763265-27763448)
chr1 (8-192)||(46931449-46931631)
chr1 (8-192)||(23999385-23999569)
chr1 (8-178)||(37618860-37619034)
chr1 (27-114)||(21289729-21289816)
chr1 (51-179)||(38759610-38759742)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (8-194)||(34948078-34948266)
chr4 (7-180)||(25701053-25701227)
chr4 (7-170)||(23761113-23761275)
chr4 (8-192)||(17167755-17167939)
chr4 (8-192)||(17173332-17173516)
chr4 (8-194)||(29584183-29584367)
chr4 (8-192)||(28002971-28003155)
chr4 (8-192)||(35021020-35021204)
chr4 (8-178)||(4598035-4598203)
chr4 (32-194)||(33341465-33341626)
chr4 (8-194)||(55241088-55241273)
chr4 (8-178)||(30002631-30002793)
chr4 (8-194)||(47253791-47253968)
chr4 (8-192)||(25184155-25184339)
chr4 (8-178)||(37775711-37775879)
chr4 (8-178)||(32592135-32592305)
chr4 (8-194)||(7703559-7703737)
chr4 (8-192)||(37663726-37663908)
chr4 (8-192)||(19089438-19089622)
chr4 (8-180)||(27396658-27396830)
chr4 (8-194)||(54499220-54499408)
chr4 (8-140)||(50764774-50764904)
chr4 (8-180)||(49376009-49376181)
chr4 (8-192)||(55477876-55478064)
chr4 (8-192)||(879533-879717)
chr4 (8-180)||(36493686-36493857)
chr4 (8-192)||(46888143-46888326)
chr4 (23-170)||(33816540-33816687)
chr4 (10-180)||(19440645-19440815)
chr4 (8-170)||(39397960-39398113)
chr4 (36-180)||(9139315-9139459)
chr4 (8-192)||(38011896-38012080)
chr4 (7-194)||(37287775-37287956)
chr4 (8-194)||(5047949-5048134)
chr4 (52-189)||(4934190-4934327)
chr4 (8-192)||(6864077-6864261)
chr4 (8-192)||(32912565-32912749)
chr4 (8-192)||(42199771-42199955)
chr4 (8-192)||(50697284-50697467)
chr4 (74-192)||(1815409-1815527)
chr4 (8-192)||(34361477-34361660)
chr4 (8-180)||(35025593-35025757)
chr4 (66-194)||(17272068-17272192)
chr4 (8-180)||(32579486-32579660)
chr4 (88-192)||(3042741-3042845)
chr4 (8-80)||(23518400-23518472)
chr4 (8-71)||(4205158-4205221)
chr4 (7-47)||(7152236-7152276)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (8-194)||(15491657-15491843)
chr6 (8-192)||(3879897-3880081)
chr6 (8-194)||(4318778-4318965)
chr6 (8-194)||(29182205-29182392)
chr6 (8-194)||(30353314-30353500)
chr6 (8-178)||(33892975-33893144)
chr6 (27-192)||(21017070-21017235)
chr6 (8-180)||(7235005-7235176)
chr6 (8-194)||(8513275-8513456)
chr6 (8-151)||(6088950-6089094)
chr6 (8-192)||(1945876-1946060)
chr6 (7-192)||(6091140-6091325)
chr6 (8-192)||(7055173-7055357)
chr6 (8-180)||(20768128-20768296)
chr6 (8-192)||(5627433-5627617)
chr6 (8-140)||(33618876-33619008)
chr6 (8-97)||(18498475-18498565)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (8-192)||(7929-8113)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (11-194)||(11952-12137)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (8-192)||(176-360)
scaffold0002 (8-180)||(94354-94526)
scaffold0002 (20-191)||(408389-408559)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (14-192)||(267331-267511)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (8-180)||(43999-44171)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (8-180)||(154616-154788)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (8-192)||(145975-146159)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (8-47)||(42390-42429)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33660529 - 33660360
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
33660529 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagat 33660430  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacac 177  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
33660429 taacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 33660360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19424789 - 19424603
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
19424789 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttatatagtggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 19424690  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
19424689 taacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacatttaagactatcacatga 19424603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4264239 - 4264057
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
4264239 aaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcatcata 4264140  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatca 189  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
4264139 ttaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatca 4264057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27350099 - 27349930
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
27350099 aagttaacactatagcatcaaaaatgttgtgagtaacaccacactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagat 27350001  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
27350000 taacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 27349930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33551147 - 33550975
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
33551147 aagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaattcatcagat 33551048  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
33551047 taacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactta 33550975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 36642031 - 36642216
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaa 110  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
36642031 ttaatactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaa 36642130  T
111 caagaataaacttaatctaa--ttttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
36642131 caagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 36642216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43771000 - 43770830
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||    
43771000 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtggcatcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagat 43770901  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
43770900 taacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacact 43770830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 4166964 - 4167148
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||     
4166964 aagttaacattatagtatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagac 4167063  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
4167064 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 4167148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29242299 - 29242115
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
29242299 aagttaaaactataacataaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagtggtatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagat 29242200  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
29242199 taacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacat 29242115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 19313894 - 19314063
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
19313894 aagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactatttatacagtgacatcaaaagttcagtcct-atagtatcatcaattcatcagat 19313992  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
19313993 taacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 19314063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 4478411 - 4478564
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
4478411 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattgtttgtacagtggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 4478510  T
108 taacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
4478511 taacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 4478564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 3176981 - 3177165
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
3176981 aagttaatactataatatcaaaaatgttttgagtaacacgcaactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagac 3177080  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
3177081 taagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 3177165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43648406 - 43648222
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
43648406 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagat 43648307  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
43648306 taacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatcacat 43648222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 44285991 - 44286177
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||    
44285991 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagcaatatctcactgtttgtatagtggcatcaaaagtttagtccacatagtatcataaattcatcagat 44286090  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
44286091 taacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 44286177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33709393 - 33709207
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |  | ||||    
33709393 aagttaacactataacatcaaaagtgttgcgagtaacactccactgttagtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaaatattcagat 33709294  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||  |||||| |||||    
33709293 taacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagactatcgcatga 33709207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41464011 - 41463825
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||    
41464011 aagttaatactataaaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcatat 41463912  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||  ||||||||||||    
41463911 taacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacctcacaaaatgtaacatttaagactatcacatga 41463825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31570892 - 31570709
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaa 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||    
31570892 ttaacactataacattaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttttatagtgacatcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcatcagattaa 31570793  T
111 caagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||    
31570792 caagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactgtcacatga 31570709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 37905750 - 37905932
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
37905750 aagttaacactataacataaaaaatgtaacgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 37905849  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaaca--ccccacaaagtataacacttagaactatc 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||    
37905850 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccccacaaagtgtaacacttaaaactatc 37905932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17071898 - 17071714
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| |  | | |||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
17071898 aagttaacactataacaacaaaaatgtagtaagtaacatctcattatttgtacaatgacatcaaaagttcggtattcatagtatcatcaattcatcagat 17071799  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
17071798 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 17071714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39167508 - 39167356
Alignment:
24 atcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaactt 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
39167508 atcaaaagtattgtgagtaacacctcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacactt 39167409  T
124 aatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataaca 176  Q
    | |||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
39167408 attctaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaaca 39167356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 26357619 - 26357803
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||  | |||||||||| | ||    
26357619 aagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacatcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttcttatagagttatcaattcatcatat 26357718  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||    
26357719 taacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaaaactatcacat 26357803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 4763678 - 4763857
Alignment:
13 aacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaaca 112  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||    
4763678 aacactatatcaacaaaactgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttcccatagtataatcaattcatcagattaaca 4763777  T
113 agaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    | | || ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
4763778 aaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 4763857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17054257 - 17054073
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| |  | |||||||||| || |||||||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||    
17054257 aagttaatactataacatcaaaaatgtagtaagtaacatctcattgtttgtacaatgacatcaaaagtncggtattcataatatcatcaattcatcagat 17054158  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
17054157 taacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaanactatcacat 17054073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19289484 - 19289300
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  | |||||||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||| ||||    
19289484 aagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacaatgacatcaaaagttaagttctcacagtatcatcaactcatcagat 19289385  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
19289384 taataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 19289300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 13711506 - 13711667
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
13711506 aagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtgacatcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcatcagat 13711605  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataa 174  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |     ||||||| |||||||||||| |||||||||    
13711606 taacaagaatacatttaatctaattttatcat-----gttttaagtgtaacaccccataaagtataa 13711667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2325531 - 2325355
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||    
2325531 aagttaacaatataacatcataaatgtattgagtaacaccccattgtttgtacactggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa--------at 2325440  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
2325439 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 2325355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 180
Target Start/End: Original strand, 41960940 - 41961054
Alignment:
66 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccac 165  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
41960940 catcaaaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccac 41961039  T
166 aaagtataacactta 180  Q
    ||||| |||||||||    
41961040 aaagtgtaacactta 41961054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11366539 - 11366358
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaa 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |  ||| |||||| | || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||    
11366539 ttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatctcactatttgtataatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaa 11366440  T
111 caagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
11366439 caagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 11366358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 178
Target Start/End: Original strand, 5881599 - 5881750
Alignment:
26 caaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
5881599 caaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaa 5881698  T
126 tctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
5881699 tctaa-tttatcataccttgttttaagtgtaatacctcacaaagtgtaacact 5881750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 33902110 - 33902280
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||  |||||||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||    
33902110 aagttaacacta--acataaaaaatgtagtgagtaataccccactgtttgtaaaatgacatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcagttcatcagat 33902207  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
33902208 taacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccacaaagtgtaacactta 33902280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 177
Target Start/End: Original strand, 45327806 - 45327931
Alignment:
52 tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaa 151  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
45327806 tgtttatacggtgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaa 45327905  T
152 atgtaacaccccacaaagtataacac 177  Q
     ||||||||| || ||||| ||||||    
45327906 gtgtaacacctcagaaagtgtaacac 45327931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 44913703 - 44913890
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatact-gtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttc-atagtatcatcaattcattag 105  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| | || ||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||    
44913703 aagttaacactgtagtatcaaaaatgttgtgagtaacacctcacttgtttgtaaaatgacataaaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcatcag 44913802  T
106 attaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaaca-ccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
44913803 actaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 44913890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7007054 - 7006930
Alignment:
36 gtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaatttta 135  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
7007054 gtgagtaacatcccactgtttgtacagtagcatcaaaagtttagttcccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaatttta 7006955  T
136 tcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    || || |||||||||| ||||||||    
7006954 tcataccttgttttaagtgtaacac 7006930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18494429 - 18494256
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||            | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
18494429 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac------------gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 18494342  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    | || |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||  | |||||||  ||||||||||||    
18494341 tcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaa-acctcacaaagagtcacacttaagactatcacatga 18494256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 192
Target Start/End: Original strand, 31861953 - 31862078
Alignment:
67 atcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccaca 166  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||  ||||| |||  |||||||||||||    
31861953 atcaaaatttcagtcattatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacaccccaca 31862052  T
167 aagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
31862053 aagtgtaacacttaaaattatcacat 31862078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 180
Target Start/End: Original strand, 41465602 - 41465715
Alignment:
67 atcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccaca 166  Q
    |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| || |    
41465602 atcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcaga 41465701  T
167 aagtataacactta 180  Q
    |||| |||||||||    
41465702 aagtgtaacactta 41465715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258262
Alignment:
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||    
18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatga 18258262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 41051359 - 41051263
Alignment:
16 actataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtac-agtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaac 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
41051359 actatagcatcaaaagtgttgtgtataacacttcactatttgtaccagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 41051263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19501839 - 19501760
Alignment:
69 caaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgtttt 149  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||| |||  |||||||    
19501839 caaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaa-actacatttaatctaattttattctactttgtttt 19501760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 192
Target Start/End: Original strand, 35959023 - 35959122
Alignment:
92 catcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcaca 191  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |  ||||||| |||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||    
35959023 catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacagttaagactatcaca 35959121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 127; Significance: 8e-66; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 21991653 - 21991839
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
21991653 aagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtgtcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagat 21991752  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
21991753 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 21991839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5657625 - 5657439
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
5657625 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcatat 5657526  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||| |||||    
5657525 taacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaatacttaagactatcgcatga 5657439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 22687256 - 22687426
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
22687256 aagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggtatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagat 22687355  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
22687356 taacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 22687426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 43686058 - 43686241
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||     
43686058 aagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtccctatagtatcaacaattcatcagac 43686156  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
43686157 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 43686241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 6546536 - 6546722
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| ||||    
6546536 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtaacatcaaaagtttactatccatagtatcatcaattcatcagat 6546635  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
6546636 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataacacttaatattatcacatga 6546722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15612902 - 15612717
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||    
15612902 aagttaacactataacatcaaa-gtgttatgagtaacaccccagtgtttgtagagtggcatcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcatcagat 15612804  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
15612803 taacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 15612717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33688406 - 33688238
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
33688406 aagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacatcctactgtttgtccagtggcatcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagat 33688307  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataaca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
33688306 taacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaaca 33688238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 12165769 - 12165939
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||| ||||    
12165769 aagttaacactatagcatccaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttaagtcccttaagtatcatcaattcatcagat 12165868  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
12165869 taacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 12165939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 27283761 - 27283945
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  || ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||    
27283761 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgaaatcaaaagttcagtcctcatagtattatcaatttatcagat 27283860  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
27283861 taacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 27283945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 4582936 - 4583120
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||     
4582936 aagttaatactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagac 4583035  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
4583036 taacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 4583120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27421523 - 27421352
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||    
27421523 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcct-ataatatcataaatttatcagat 27421425  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
27421424 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacactta 27421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 38258562 - 38258746
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
38258562 aagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagat 38258661  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
38258662 taacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 38258746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 8861302 - 8861472
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||    
8861302 aagttaacactatagcatcaaaagtgttatgaataacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcagat 8861401  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
8861402 taacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccgcaaagtgtaacact 8861472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41765223 - 41765038
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
41765223 aaagtcaatactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaattcatcaga 41765124  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||    
41765123 ttaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcacat 41765038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 26980340 - 26980492
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||    
26980340 aagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacggtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcaaat 26980439  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
26980440 taacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 26980492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 30055544 - 30055728
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
30055544 aagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagat 30055643  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
30055644 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 30055728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32821197 - 32821025
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
32821197 aagttaacaatataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagat 32821098  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || | ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
32821097 taacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataaagtgtaacactta 32821025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25691689 - 25691502
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaac-accatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||| | |    
25691689 aagttaacactataacatcaaaagtattgtgagtaattacctcactgtttgtacagtggcatcaacagttcagttcttatagtattatcaattcatcata 25691590  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
25691589 ttaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcacatga 25691502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 32432485 - 32432653
Alignment:
24 atcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaactt 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||    
32432485 atcaaaaatgttgtgagtaacaccccattgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagtt 32432584  T
124 aatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
32432585 aatataattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacat 32432653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 23111207 - 23111393
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||    
23111207 aagttaacactataacatcaaaaatattgtgagtaacacaccactatttgtacaatggcatcaaaagttcaaccatcgtagtatcatcaattcattagat 23111306  T
108 taacaagaataaacttaatctaattt--tatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
23111307 taacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 23111393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9355967 - 9355786
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaa 110  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| ||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||| | ||||||| |||||||    
9355967 ttaacactatagcataaaaaatgtagtgagcaataccccactgtttgtacagtgacatcaaaagtttagttctcatattatcgttaattcatcagattaa 9355868  T
111 caagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
9355867 caagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 9355786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 10481621 - 10481806
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccat-actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||   |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
10481621 aagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacacccccactgtttgtacaatgacatcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatcaga 10481720  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
10481721 ttaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 10481806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 18797346 - 18797528
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||    
18797346 aagttaacacta--acataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagat 18797443  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||    
18797444 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacat 18797528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31579213 - 31579024
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttg-----tacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||      |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31579213 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttaatttatacaatgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcat 31579114  T
103 tagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||    
31579113 cagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacat 31579024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 7334811 - 7334983
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || |    
7334811 aagttaacactataacataaaatatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagct 7334910  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
7334911 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacagagtgtaacactta 7334983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 24211758 - 24211942
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |    
24211758 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctactgtttatagaatggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggt 24211857  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||| || ||||||| |||||| ||  ||||||||||    
24211858 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacatcctacaaagtgtaacacctaagactatcacat 24211942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 29173557 - 29173709
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |     
29173557 aagttaacactgtagtatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaac 29173656  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
29173657 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgttacac 29173709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44413523 - 44413351
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  | |||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||    
44413523 aagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacaccccaatgtttgtacactgaaatcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaaat 44413424  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
44413423 taacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 44413351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10359348 - 10359174
Alignment:
18 tataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaat 117  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
10359348 tatagcatcaaaagtgtagtgagtaacatcctactatttatacagtgacatcaaaagttcagtctg-atagtatcatcaattcatcagatcaacaagact 10359250  T
118 aaacttaa-tctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    | |||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
10359249 acacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 10359174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Original strand, 11071222 - 11071395
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||  |||||| |||||||| | | | |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
11071222 aaagttagtactatatcatcaaaaatatagcgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcaga 11071321  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
11071322 ttaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacactta 11071395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 37109889 - 37110063
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||    
37109889 aagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattataatatcatcaattcatcagat 37109988  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctat--cttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
37109989 taacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacactta 37110063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48928440 - 48928279
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
48928440 aagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagat 48928342  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagt 170  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||    
48928341 taacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagt 48928279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12390774 - 12390622
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||  |||  |||||||| |||||||||| ||||    
12390774 aagttaacactataacatcaaaagtgtaatgagtaacatcccactgtttgtgcagtgacatcaaaagttatgtccccatagtattatcaattcatcagat 12390675  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||    
12390674 taacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaacac 12390622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31520867 - 31520716
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
31520867 aagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacactccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcattaaat 31520769  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
31520768 taacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 31520716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 37347039 - 37347210
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | |  |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
37347039 aagttaatactataccatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaatttattaaat 37347138  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||    
37347139 taacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacactta 37347210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17842730 - 17842556
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||  || ||||||||| || ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||    
17842730 aagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagctcagtcattataatatcatcaattcatcagat 17842631  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctat--cttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||||    
17842630 taacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacatcccacaaagtgtaacactta 17842556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 194
Target Start/End: Original strand, 44598735 - 44598869
Alignment:
60 cagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaaca 159  Q
    |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
44598735 cagtggcatcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaaca 44598834  T
160 ccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
44598835 ccccacaaagtgtaacacctaagactatcacatga 44598869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48928707 - 48928546
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
48928707 aagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagat 48928609  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagt 170  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| || |||||    
48928608 taacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcagaaagt 48928546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15672830 - 15672722
Alignment:
84 catagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaa 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |    
15672830 catagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaaga 15672731  T
184 ctatcacat 192  Q
    |||||||||    
15672730 ctatcacat 15672722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 189
Target Start/End: Original strand, 37704241 - 37704355
Alignment:
75 ttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataa 174  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
37704241 ttcagtccccatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37704340  T
175 cacttagaactatca 189  Q
    ||||||  |||||||    
37704341 cacttaagactatca 37704355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 34362293 - 34362205
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatca 96  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
34362293 aaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatc-aaagttcagttctcatagtatcatca 34362205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26524469 - 26524364
Alignment:
10 gttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagatta 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||    
26524469 gttaacactataacatcaaaaatgttgtgactaacactccattgtttgtgcagtggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcatatta 26524370  T
110 acaaga 115  Q
    ||||||    
26524369 acaaga 26524364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26588042
Alignment:
110 acaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatga 26588042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32593327 - 32593181
Alignment:
13 aacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaaca 112  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||    
32593327 aacactatagcattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatatggtggtatcaaaagttcagtc-tcacagtatcatcaattcatcagattatca 32593229  T
113 agaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    | | |  | |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
32593228 aaactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 32593181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37703590 - 37703458
Alignment:
52 tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaa 151  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
37703590 tgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtctccatagtatcatca--------gattaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaa 37703499  T
152 atgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
     ||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||    
37703498 gtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcacat 37703458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 180
Target Start/End: Original strand, 43925167 - 43925290
Alignment:
56 tgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgt 155  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||     
43925167 tgtacaatgacatcaaaagttcagtctacatagtatcatcaact-atcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgc 43925265  T
156 aacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||| ||||| || ||| |||||    
43925266 aacacctcacaacgtttaatactta 43925290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 38053503 - 38053647
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| |||||||        ||    
38053503 aagttaatactataacataaaaaatgtaatgagtaaaaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtgtcatcaa--------at 38053594  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||    
38053595 taacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttataagtgtaacac 38053647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 115
Target Start/End: Original strand, 35353125 - 35353233
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaag-ttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||  ||| |||||||| ||| |||  |||||||||| |||||||| |||    
35353125 aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccattgtttgtacgatggaatcaaaagtttctgtccccatagtatcaccaattcatcaga 35353224  T
107 ttaacaaga 115  Q
    |||||||||    
35353225 ttaacaaga 35353233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Original strand, 44598381 - 44598438
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtgg 65  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
44598381 aagttaatactataatatcaaaaatgttgtgagtaacactctactgtttggacagtgg 44598438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46481182 - 46481089
Alignment:
99 tcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||| |||||||||||| || |||| || ||||||||| |||  ||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||||  ||||||||||    
46481182 tcatcagattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaacatctcataaagtgtaacacttaagactatcacat 46481089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 13307664 - 13307850
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
13307664 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagat 13307763  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
13307764 tagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 13307850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 38644019 - 38644189
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
38644019 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtctagtggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagat 38644118  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
38644119 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaacact 38644189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5300095 - 5299923
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
5300095 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgtaagtagcactctactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcagat 5299996  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
5299995 taacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 5299923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 465883 - 466053
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
465883 aagttaacacgataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaaattcagtccccttagtatcatcaattcatcagat 465982  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
465983 taacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 466053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 11727065 - 11727251
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||    
11727065 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttgtatagtggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcaaat 11727164  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
11727165 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacatga 11727251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36695115 - 36694931
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||     
36695115 aagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagac 36695016  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
36695015 taagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 36694931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6098667 - 6098483
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | | ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
6098667 aagttaatactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaattcatcagat 6098568  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
6098567 taacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 6098483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37970668 - 37970484
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||    
37970668 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgccatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatatgat 37970569  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
37970568 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 37970484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 12876150 - 12876335
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
12876150 aagttaacactataatataaaaaatgttgtgagtaacacccaactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 12876249  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttaga-actatcacat 192  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
12876250 taagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaagactatcacat 12876335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27082987 - 27082803
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
27082987 aagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccccactgtttgtgcagtggcattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaat 27082888  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||    
27082887 taacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccccgcaaagtgtaacacttaagactatcacat 27082803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 9864192 - 9864373
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaa 110  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||    
9864192 ttaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaa 9864291  T
111 caagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
     ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
9864292 taagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 9864373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16447025 - 16446840
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||    
16447025 aaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtataatggcatcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcaga 16446926  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||    
16446925 ttaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatcacat 16446840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Original strand, 34895008 - 34895177
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
34895008 aagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagat 34895107  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacac 177  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| | ||||||    
34895108 taacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac 34895177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 1204968 - 1205140
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||    
1204968 aagttaacactataacataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatcatat 1205067  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
1205068 taacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactta 1205140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43643744 - 43643560
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
43643744 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatgacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagat 43643645  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||    
43643644 taacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacat 43643560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41911138 - 41910951
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccat-actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||| ||   ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||    
41911138 aagttaatactatatcatcaaaagtgtcgtgagtaacacccccactattataacagtagcatcaaaaattcagtcaacatagtatcatcaattcatcaga 41911039  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
41911038 ttaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaatactatcacatga 41910951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 34952180 - 34952028
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||| | ||    
34952180 aagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacagcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccctttagtatcatcaattcatcaaat 34952081  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
34952080 taataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 34952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1150254 - 1150092
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |  ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
1150254 aagttaacgctataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccactgtttgtacaacgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagat 1150155  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagt 170  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
1150154 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagt 1150092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 40862460 - 40862644
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaag-tgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | | |    
40862460 aagttaacactataatatcaaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtct-catggtatcatcaatttttcata 40862558  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||    
40862559 ctaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 40862644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39099258 - 39099082
Alignment:
16 actataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaaga 115  Q
    |||||||||||||||||  ||  |||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
39099258 actataacatcaaaagt--tgcaagtaacaccccactctttgtacactagcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaa 39099161  T
116 ataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||| |||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| |||||    
39099160 atacacttaatctaattttatcttaccctgttttaagtgtaacatcccacaaagtatcacacttaagactatcgcatga 39099082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 16222907 - 16223076
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaa 110  Q
    ||||||||||||||| |||| | | |||||||   ||  || ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
16222907 ttaacactataacataaaaaatatagtgagtagttccccacagtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatccgattaa 16223006  T
111 caagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
16223007 caagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacaccccaaaaagtgtaacactta 16223076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10555351 - 10555191
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
10555351 aagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagat 10555252  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaa 168  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||| ||||||    
10555251 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcacaaa 10555191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23854580 - 23854408
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||  ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
23854580 aagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccaactgtttgtgcaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcattagat 23854481  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||| | || | |||||||||||||||| || || ||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
23854480 taacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacaccgcataaagtgtaacactta 23854408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1149752 - 1149597
Alignment:
37 tgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttat 136  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
1149752 tgagtaacaacccactgtttgtacaatgacatcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttat 1149653  T
137 cctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    | || |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
1149652 cttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 1149597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30654732 - 30654548
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |    
30654732 aagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgttgaatgacatcaaaagttcagccttcatagtatcatcacttcatcaggt 30654633  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||| | ||  |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
30654632 taacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 30654548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 43025759 - 43025927
Alignment:
24 atcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaactt 123  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||| ||| || |||||||||||    ||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||    
43025759 atcaaaagtgttgtgattaataccccactctttgtacaatggtattaaaagttcagttcatataatatcatcaattcatcagactaagaagaatacattt 43025858  T
124 aatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
43025859 aatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatcacat 43025927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31934035 - 31933851
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | |  |||||||||||  ||| ||| |||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||    
31934035 aagttaacactatgatatcaaaaatataatgagtaacaccccactctttatacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatcaattcatccgat 31933936  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| |||   ||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||    
31933935 taacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcacaaagtgtaacacttaaaattatcacat 31933851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 41362575 - 41362707
Alignment:
27 aaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaat 126  Q
    |||| ||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
41362575 aaaaatgtagtgagtaacaccccactatttgtatagtgacatcaaaagttcagacctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgat 41362674  T
127 ctaattttatcctatcttgttttaaatgtaaca 159  Q
     |||||||||| || |||||||||| |||||||    
41362675 ataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1954104 - 1953953
Alignment:
43 acaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatc-atcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctat 141  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| | || || ||| |||||||||||||| ||     
1954104 acaccctactatttggacagtggcatcaaaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcatac 1954005  T
142 cttgttttaaatgtaaca-ccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
1954004 cttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 1953953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 35459818 - 35459688
Alignment:
50 actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgtttt 149  Q
    |||| ||||||| || ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| |    
35459818 actgattgtacaatgacattaaaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttat 35459719  T
150 aaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||    
35459718 aaatgtaacatcccacagattataacactta 35459688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Original strand, 33906316 - 33906425
Alignment:
71 aaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||  ||| |||||    
33906316 aaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaaaaagt 33906415  T
171 ataacactta 180  Q
     |||||||||    
33906416 gtaacactta 33906425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7891061 - 7890934
Alignment:
53 gtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaa 152  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||  ||||| |||     
7891061 gtttgtacaatggcatcaaaagttcggtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataag 7890962  T
153 tgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
     |||||||||||||| || |||||||||    
7890961 cgtaacaccccacaacgtgtaacactta 7890934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 44869537 - 44869724
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgtt--gtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattag 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |  ||  |||||||| ||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||    
44869537 aagttaacactataacattaaaagtattttgtgagtgatcccc-actgtttgcacaatgacatcaaaagttcaatcgtcatagtatcatcaatttatcag 44869635  T
106 attaacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||    
44869636 attaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgt-tgtccccacaaagtgtaacacttaagactatcaaatga 44869724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8803959 - 8803782
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||   ||| |||||| | || |||||||||||||| ||       |||||||||| || || |    
8803959 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagcct-------atcatcaatttatcaggt 8803867  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| |||  ||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||    
8803866 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaaaaagtgtaacacttaatactatcacat 8803782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132651
Alignment:
92 catcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcaca 191  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||    
4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttg-tttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcaca 4132652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Original strand, 7998411 - 7998488
Alignment:
84 catagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
7998411 cataatatcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 7998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 118
Target Start/End: Original strand, 33197947 - 33198000
Alignment:
65 gcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaata 118  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
33197947 gcatcaaaagttcagtctccataatatcatcaattcatcagattaacaagaata 33198000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 4133131 - 4133077
Alignment:
36 gtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagta 90  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
4133131 gtgagtaatacctgactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagta 4133077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30969457 - 30969271
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
30969457 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttatacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 30969358  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||    
30969357 taacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 30969271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 7693272 - 7693442
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
7693272 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcattagat 7693371  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
7693372 taacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 7693442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 19119901 - 19120087
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
19119901 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgctagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcatcagat 19120000  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
19120001 taacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 19120087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 5837601 - 5837783
Alignment:
12 taacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaac 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
5837601 taacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaatttcagtctccatagtatcatcaattcatcatattaac 5837700  T
112 aagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
5837701 aagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 5837783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25501060 - 25500887
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||    
25501060 aaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgaataacacctcactgtttgtacactgccatcaaaagttaagtccctatagtatcatcaattcatcaga 25500961  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
25500960 ttaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 25500887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 36866804 - 36866988
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||     
36866804 aagttaacactataatatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcatcagac 36866903  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
36866904 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 36866988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6824599 - 6824429
Alignment:
23 catcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagt--tcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
6824599 catcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagtgttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaataca 6824500  T
121 cttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcaca 191  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
6824499 cttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 6824429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 27330348 - 27330532
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27330348 aagttaacactataacatcaaaagtgttg--agtaacaccttactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagat 27330445  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  |||| | |||||||  |||||| |||||    
27330446 taatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatga 27330532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 32563191 - 32563361
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||    
32563191 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtctgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagat 32563290  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
32563291 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaacact 32563361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23116355 - 23116171
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
23116355 aagttaacattataacatcaaaactgtagtgagtagcaccccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcagat 23116256  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
23116255 taacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 23116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8742020 - 8741833
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccat-actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
8742020 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcaaa 8741921  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
8741920 ttaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 8741833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 9200275 - 9200445
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||    
9200275 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtgacatcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcatcatat 9200374  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
9200375 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattccacaaagtgtaacact 9200445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 26268116 - 26268302
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
26268116 aagttaacactatagcatcaaaagtgttttgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattcatcagat 26268215  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||    
26268216 taacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 26268302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31786779 - 31786595
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |   ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
31786779 aagttaacactatagcatgaaaaatgtagtgagcactgccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagat 31786680  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
31786679 taacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 31786595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 40133427 - 40133611
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||     
40133427 aagttaacattatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcatcagac 40133526  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
40133527 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 40133611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38528369 - 38528186
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
38528369 aagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccattgtttatacagtgacatcaaaagttcagtct-catagtatcatcaattcatcagat 38528271  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
38528270 taacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 38528186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28416660 - 28416490
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||    
28416660 aagttaacactataatatcaaaagtattgtgagtaacatcccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatcagat 28416561  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
28416560 taacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 28416490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 39572861 - 39573031
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||    
39572861 aagttaatactataatataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtgacatcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagat 39572960  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
39572961 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacact 39573031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 699192 - 699376
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
699192 aagttaacactatagcataaaaaatctagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagat 699291  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||    
699292 taacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccacaaagtgtaatacttaagactatcacat 699376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5112446 - 5112275
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
5112446 aagttaatactataacataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaat 5112347  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
5112346 taacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa-accccacaaagtacaacactta 5112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 33908275 - 33908447
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||    
33908275 aagtcaacactatatcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattattcagat 33908374  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
33908375 taacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacactta 33908447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 22019674 - 22019844
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||| | ||    
22019674 aagttaaaactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtatagtgacatcaaaagttaagtccccttagtatcatcacttcatcatat 22019773  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
22019774 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtataacact 22019844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 12910392 - 12910581
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagt-----ggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||  ||||||||||||||     | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
12910392 aagttaaaactataacatcaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcat 12910491  T
103 tagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
     ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
12910492 cagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacat 12910581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 36860465 - 36860650
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |     
36860465 aagttaacactatagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatac 36860564  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatc-ttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
36860565 taacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 36860650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1429278 - 1429126
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
1429278 aagttaacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacactggcatcaaaaattcagtctccatagtatcatcaattcatcaaat 1429179  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
1429178 taacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 1429126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27318620 - 27318436
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| | ||    
27318620 aagttaacactaaaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatgacatcaaaagtttagttctcacagtatcatcaattcatcatat 27318521  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
27318520 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 27318436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7208966 - 7208813
Alignment:
38 gagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatc 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
7208966 gagtaacaccctaccgtttgtacattgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatc 7208868  T
138 ctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||    
7208867 ctaccttgttataaacgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacat 7208813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 22255223 - 22255408
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaag-tgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||    
22255223 aagttaacattataacatcaaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagttctcatattatcatcaattcatcaga 22255322  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||    
22255323 ttaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacaccacacaaagtgtaacacttaaaactattacat 22255408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23954895 - 23954738
Alignment:
36 gtgagtaacaccatactgtttgtac-agtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaatttt 134  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||    
23954895 gtgagtaacaccccactgtttttactagtggcatcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaatttt 23954796  T
135 atcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||    
23954795 atcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacat 23954738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35511610 - 35511441
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
35511610 aagttaacattataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagtcatcatactatcaccaattcatcagat 35511511  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacac 177  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| | ||||||    
35511510 taacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac 35511441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 35933944 - 35934124
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||        ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
35933944 aagttaacactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactt-------agtggcatcaaaagtccagtcaccatagtatcatcaattcatcagat 35934036  T
108 taacaagaataaacttaatcta-attttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
35934037 taacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 35934124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 8466787 - 8466938
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||    
8466787 aagttaacactgtaacatcaaaagtgttgtgaataacacccc-ctctttgtacagtggtatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcaaat 8466885  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
8466886 taacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaatgtaacac 8466938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15992631 - 15992487
Alignment:
50 actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgtttt 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| |||    
15992631 actgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgattt 15992532  T
150 aaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
     | || ||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||    
15992531 gagtgcaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatga 15992487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 22980835 - 22981019
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |   |||||||| |||  ||||||||  || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
22980835 aagttaacactatagtatcaaaaatacagtgagtaataccccactgtttgagcaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagat 22980934  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||    
22980935 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacat 22981019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 24886146 - 24886298
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||    
24886146 aagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatat 24886245  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||    
24886246 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacac 24886298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 25668692 - 25668801
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
25668692 aagttaacact-taacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgaacagtggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcattagat 25668790  T
108 taacaagaata 118  Q
    |||||||||||    
25668791 taacaagaata 25668801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21088880 - 21088727
Alignment:
27 aaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaat 126  Q
    |||| |||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | | ||||||||||| | |||||    
21088880 aaaaatgttgtgagtgacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagaatacatttaat 21088781  T
127 ctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
21088780 ctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacactta 21088727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14919661 - 14919477
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||| || | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||    
14919661 aagttaacattataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttatataatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatat 14919562  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||| | ||| |||||  ||||||||||    
14919561 taacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacctcacaaattgtaatacttaagactatcacat 14919477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31705744 - 31705573
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
31705744 aagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagtccagtcctc-tagtatcatcaattcatcagat 31705646  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||| | |||||| | |||||||||    
31705645 taacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcacaaaatgtaacactta 31705573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14409459 - 14409310
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
14409459 aagtcaacactataacatcaaaaatgtagtgagtagcaccccactcttaatacggtggcatcaaaagttcagtct-catagtatcatcaattcatcagat 14409361  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaac 158  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
14409360 taacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac 14409310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43308785 - 43308613
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||     
43308785 aaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgaataacaccc-actgttcgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcagc 43308687  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||| |||||||||    
43308686 ttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccctgaaaagtgtaacactta 43308613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22974215 - 22974043
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |  |||||||||||| |  ||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||| |||     
22974215 aagttaacactataacatcaaaaaagtaatgagtaacatcccactgtttgtacaataacatcaaaagttcaattctcatattatcatcaactcatcagaa 22974116  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| | |||||||||    
22974115 taacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacctcacaaaatgtaacactta 22974043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 42342774 - 42342942
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||  |   ||  | ||||||||||||||||| |||    
42342774 aaagttaatactataacatcaaaaatgttgtgagtaataccccactgtttatacagtgacatcaaaaaatt--tccccttagtatcatcaattcatcaga 42342871  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||    
42342872 ttaacaagaatacacttaatctaattttatctta-cttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacact 42342942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Original strand, 15724532 - 15724692
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||    
15724532 aagttaacactataacatcaaaagttttgtgagtaacaccccactgtttatacaatgacatc-aaagttcagtc-ccataatatcatcaattcatcaaat 15724629  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagt 170  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| | |||||| || ||||||    
15724630 taacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgccccaaagt 15724692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 35826616 - 35826445
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
35826616 aagttaatactataacatcaaaaatgtactgagtaacacttcattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttca-tagat 35826518  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||| |  | | ||||||||||||||| |||  |||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||    
35826517 taacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacactccacaaagtgtaaccctta 35826445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17158163 - 17157992
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||   || ||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||    
17158163 aagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttc-gtcattatagtatcattaattcatcagat 17158065  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || ||||| | ||||| |||| || ||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
17158064 taacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 17157992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Original strand, 5829955 - 5830118
Alignment:
20 taacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataa 119  Q
    |||||| |||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||         ||||||| ||     
5829955 taacataaaaaatgtaatgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaatt---------aacaagactac 5830045  T
120 acttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
5830046 acttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 5830118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 35504436 - 35504591
Alignment:
37 tgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttat 136  Q
    |||||||||||  || |||||||   || ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| |||||||||    
35504436 tgagtaacacctcaccgtttgtatgatgacatcaaaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttat 35504535  T
137 cctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||| | | || |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
35504536 cctaccatattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 35504591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 8437011 - 8437179
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaa 110  Q
    ||||||||||| | || ||||||| |||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||| ||||| |    
8437011 ttaacactatagcttccaaagtgtagtgagtaacatcccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcattatatcatcaa-ccatcagattta 8437109  T
111 caagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||    
8437110 caaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccacaatgtgtaacactta 8437179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 102
Target Start/End: Original strand, 11898043 - 11898138
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcat 102  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||   ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
11898043 aaagttaatattatagcatcaaaagtgcactgagtaacaccctactagttgtacagtgacatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcat 11898138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13956415 - 13956314
Alignment:
88 gtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||  |||||    
13956415 gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccctacaaagcgtaacacttaagactat 13956316  T
188 ca 189  Q
    ||    
13956315 ca 13956314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13956478 - 13956425
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtaca 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
13956478 aagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacacctcactgtttgtaca 13956425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 167
Target Start/End: Original strand, 25669733 - 25669787
Alignment:
113 agaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaa 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
25669733 agaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa 25669787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 16004509 - 16004474
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaa 43  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
16004509 aagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaa 16004474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 11466857 - 11467043
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
11466857 aagttaagactataacatcgcaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagat 11466956  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
11466957 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 11467043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 37203100 - 37203284
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
37203100 aagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcataagat 37203199  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
37203200 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 37203284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 37157741 - 37157924
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
37157741 aagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtt-gtacagtggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttataagat 37157839  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
37157840 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 37157924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 4015493 - 4015665
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
4015493 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtagagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatat 4015592  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
4015593 taacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacactta 4015665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44186644 - 44186485
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||    
44186644 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccgctgtttatacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcaaat 44186545  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaa 167  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
44186544 taacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccacaa 44186485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 2007966 - 2008151
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||    
2007966 aagttaacactatagcgttaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcagat 2008065  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
2008066 taacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgt-acactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 2008151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 35844359 - 35844532
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
35844359 aagttaacactataacaacaaaaatgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtgacatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagat 35844458  T
108 taacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
35844459 taacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacactta 35844532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 52041066 - 52040881
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatac-tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
52041066 aagttaatactataacatcaaaagtgtagtgagtaactccccaaatgtttgtatagtggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaga 52040967  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||    
52040966 ttaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatagtgtaacacttaagactatcacat 52040881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3655346 - 3655159
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
3655346 aaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaga 3655247  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
3655246 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacaccacaaaatgtaacacttaaaactatcacatga 3655159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 32373499 - 32373689
Alignment:
2 ccaacaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattca 101  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||   |   || ||||||||||||||    
32373499 ccaataaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaactcca--ctgtttgtacagtggcatcaaaagttccaccccaatggtatcatcaattca 32373596  T
102 ttagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
32373597 tcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtgacacttaagactatcacatga 32373689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 34132971 - 34133152
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaa 110  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||    
34132971 ttaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaa 34133070  T
111 caagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
     ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
34133071 taagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 34133152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 39282689 - 39282869
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaa 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||    
39282689 ttaacactataacatcaaaactgt-gtgagtaataccccactgtttatacagtggcatcaaaagttcagttctcatattatcatccattcatcagattaa 39282787  T
111 caagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
39282788 caagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 39282869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42506214 - 42506034
Alignment:
12 taacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaac 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
42506214 taacactataacatcaaaattgtaatgagtaataccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 42506115  T
112 aagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
42506114 aagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 42506034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46297905 - 46297721
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
46297905 aagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcattagat 46297806  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||| | || |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
46297805 taacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 46297721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53229293 - 53229111
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccat-actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagatta 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
53229293 ttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagcaacaccctcaatgtttgtacagttgcatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagatta 53229194  T
110 acaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
53229193 acaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaactccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 53229111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7327620 - 7327439
Alignment:
13 aacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaaca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
7327620 aacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattatttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcggattaaca 7327521  T
113 agaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
7327520 agaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 7327439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 45174536 - 45174711
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtg--agtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
45174536 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgtgagtaacacttcactgtttgtacagtagcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcag 45174635  T
106 attaacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||    
45174636 attaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacactctacaaagtgtaacactta 45174711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 25579772 - 25579958
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||   |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||    
25579772 aagttaatactatagcatcaaaagtgttgtgaataacattctactatttatacagtgacatcaaaagttcagtccccatattatcatcagtttattagat 25579871  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
25579872 taacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacatga 25579958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 44891539 - 44891716
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||         ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||    
44891539 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgt---------ggcatcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattaatcagat 44891629  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
44891630 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 44891716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 21193639 - 21193811
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||    
21193639 aagttaacactgttgaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtagagtgacatcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcatcagat 21193738  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||    
21193739 taacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccataaaggataacactta 21193811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 48354974 - 48355158
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
48354974 aagttaacactataatattaaaaatgtaatgagtaacaccccattgtttgtacaatggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagat 48355073  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||    
48355074 taacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacataccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 48355158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4761792 - 4761607
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||    
4761792 aagttaatactataatatcaaaaatgtaatgagtaacacttcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatctgat 4761693  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaaca-ccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
4761692 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacccccacaaagtataacacttaagactatcacat 4761607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11357508 - 11357355
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccat-actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
11357508 aagttaacactatagcatcaaaagtatagtgagtaacacccccactgtttgtacagttgcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaga 11357409  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
11357408 ttaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 11357355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 51213124 - 51212955
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||  |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
51213124 aagttaacactgtaacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaactcatcagat 51213025  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacac 177  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
51213024 taacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24708246 - 24708074
Alignment:
20 taacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataa 119  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
24708246 taacatcaaaactgcagtgagtaacacctcactgt--gtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactac 24708149  T
120 ac--ttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||  || |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
24708148 acttttgatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaacaatcacat 24708074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Original strand, 29099388 - 29099555
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||    
29099388 aagttaacactataacataaaaaatgtcgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatctaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcatat 29099487  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataac 175  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
29099488 taacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac 29099555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Original strand, 43348319 - 43348476
Alignment:
36 gtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaatttta 135  Q
    ||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
43348319 gtgagcaacaccccactgtttgtttagtggcatcaaaagttcagtcttt-tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttta 43348417  T
136 tcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||  ||||||||||||    
43348418 tcctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagactatcacatga 43348476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14586796 - 14586643
Alignment:
25 tcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaactta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||  ||||||||||  |||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
14586796 tcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttatacagtgatatcaaaagttttgtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacactta 14586697  T
125 atctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
14586696 atctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 14586643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 40936024 - 40936175
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
40936024 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcattgtttatacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatctattcatcagat 40936123  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacac 160  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
40936124 taacaagaatacacttaatataattttatcc-aactttttttaagtgtaacac 40936175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 53176088 - 53176273
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||   |  |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
53176088 aagttaacatcataacatcaaaaatgttgtaagtaatgtcc-actgtttgtacaataacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 53176186  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
53176187 taacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 53176273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26941403 - 26941222
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||    
26941403 aagttaacactataaaatcaaaattataatgagtaacaccccactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcatggtatcattaattcatcagat 26941304  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatca 189  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||||    
26941303 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctcataaagtgtaacacttaaaactatca 26941222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Original strand, 22451001 - 22451157
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||    
22451001 aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactgtttgtatggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatat 22451100  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacacccca 164  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||    
22451101 taacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacacccca 22451157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 3362286 - 3362472
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| ||||| || | | |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |  |    
3362286 aagttaacactatagcatcagaaatatagtgagtaacatcccactatttgtacagtggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaattcatcatgt 3362385  T
108 taacaagaataaac--ttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
3362386 taacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 3362472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 178
Target Start/End: Original strand, 29163912 - 29164021
Alignment:
69 caaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaa 168  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
29163912 caaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 29164011  T
169 gtataacact 178  Q
    || |||||||    
29164012 gtgtaacact 29164021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40552402 - 40552229
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||   || ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
40552402 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagat 40552303  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttag 181  Q
    |||||| | || ||||||| |||||||||| || |||||| |||  |||||| ||||||| || ||||||||||    
40552302 taacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaacatcccacaacgtgtaacacttag 40552229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24489105 - 24488922
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||    |||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||     
24489105 aagttaagactatagtattaaaaatgttgtgagtaacattccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcagtccccatattatcatcaattcatcagac 24489006  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcaca 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||  |||||||||    
24489005 taacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacacttaagactatcaca 24488922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698372
Alignment:
87 agtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaacta 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 33698364  T
187 tcacatga 194  Q
    || |||||    
33698365 tcgcatga 33698372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43976031 - 43975861
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||   ||| |||||||  || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||    
43976031 aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactatttgtacgatgacatcaaaagtttaatcctcataatatcatcaattcatcagat 43975932  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    |||||| | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
43975931 taacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacact 43975861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33378928 - 33378772
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||| |||||||  |||  | | ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
33378928 aagtcaacactatagtatcaaaagtgtagtgagtagtaccccaatatttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagat 33378829  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacacccca 164  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
33378828 taacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 33378772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20373439 - 20373300
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||    
20373439 aagttaatactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatggtatcatcaattcatcaaat 20373340  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgtt 147  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
20373339 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 20373300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27480523 - 27480368
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| || |  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |    
27480523 aaagtcaacactataacatcaaaagtataatgagtagcatccaattgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcata 27480424  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccc 162  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
27480423 ttaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccc 27480368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46994746 - 46994620
Alignment:
66 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccac 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||    
46994746 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgccccac 46994647  T
166 aaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||    
46994646 aaaatgtaacacttaagactatcacat 46994620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 54828844 - 54828663
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||  || ||||  |||  | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |    
54828844 aaagttaacactataacataaaaa-tgtaatgagtaacaccccaccgtttaaacaacgacatcaaaaattcattcttcatagcatcatcaattcatcata 54828746  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatca 189  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
54828745 tgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaaactatca 54828663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 47481555 - 47481739
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |  |    
47481555 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatgacatcaaaagtttagccctcatagtatcatcaattcatcatgt 47481654  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||  || ||| || |||   |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
47481655 taacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 47481739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21009939 - 21009761
Alignment:
14 acactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaa 113  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||| |||||| | || |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||    
21009939 acactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatattatcatcaattcatcaggttaacaa 21009840  T
114 gaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    || || ||||||| |||||||||| || |||||| |||   |||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||    
21009839 gactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 21009761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Original strand, 38591724 - 38591891
Alignment:
5 acaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgt----ttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| |  | |||    ||||||| |||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||    
38591724 acaaagttaacactataacatcaaaattatagggagtaacatctcattgtattgttgtacaatggcatcaaaagttaagtccacatattattatcaactc 38591823  T
101 attagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaa 168  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
38591824 atcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccccacaaa 38591891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22446207 - 22446038
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtct-tcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| | |    
22446207 aagttaacattatatcatcaaaaatatagtgagtaacaccccact-tttgtacagtggcatcaaaagttcaaaccctcatagtatcatcaattcatcata 22446109  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    | || |||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
22446108 taaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca-ctcacaatgtataacact 22446038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622677
Alignment:
89 tatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatc 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatc 22622681  T
189 acat 192  Q
    ||||    
22622680 acat 22622677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11835695 - 11835584
Alignment:
84 catagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaat-tttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttaga 182  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||      
11835695 catagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaacaattaag 11835596  T
183 actatcacatga 194  Q
    ||||||||||||    
11835595 actatcacatga 11835584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 194
Target Start/End: Original strand, 36012245 - 36012357
Alignment:
83 tcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttag 181  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||     
36012245 tcataatatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacacttaa 36012344  T
182 aactatcacatga 194  Q
     ||||||| ||||    
36012345 gactatcaaatga 36012357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 54505841 - 54506024
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  | | ||| || | || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||  | |    
54505841 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttatagaatgacatcaaaaattcagcct-catagtatcataaatacatcgggt 54505939  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| |||   |||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||    
54505940 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 54506024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 192
Target Start/End: Original strand, 1089842 - 1089911
Alignment:
124 aatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaaca-ccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
1089842 aatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 1089911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 48
Target Start/End: Original strand, 2613923 - 2613963
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacca 48  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
2613923 aagttaacactataacaccaaaagtgttgtgagtaacacca 2613963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 47
Target Start/End: Original strand, 33698221 - 33698260
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacc 47  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
33698221 aagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacacc 33698260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 53811767 - 53811698
Alignment:
52 tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagt------cttcatagtatcatcaattcattagattaacaaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
53811767 tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtatataaccccatagtatcatcaattcatcagattaacaaga 53811698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 11835738 - 11835699
Alignment:
24 atcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagt 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
11835738 atcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagt 11835699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 47279227 - 47279413
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
47279227 aagttaacattatactatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcgaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 47279326  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||    
47279327 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtgtaacacttaagactatcacatga 47279413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 48620675 - 48620845
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
48620675 aagttaacaatataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagat 48620774  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
48620775 taacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 48620845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 32216093 - 32216277
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
32216093 aagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagat 32216192  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
32216193 taacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 32216277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 3534970 - 3535142
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | || ||| |||||||||| ||||    
3534970 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactgtttgtgcagtgacatcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatcagat 3535069  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
3535070 taacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 3535142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 16415683 - 16415868
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatac-tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
16415683 aagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccctaaatgtttgtacagtggcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattcattaga 16415782  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | | ||| |||||  ||||||||||    
16415783 ttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatattgtaatacttaagactatcacat 16415868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 15752067 - 15752239
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
15752067 aagttaacactataacataaaaaatatagtgagtaacacctcactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 15752166  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
15752167 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataaagtgtaacactta 15752239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 3309185 - 3309339
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
3309185 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacagtggtatcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcatcaga 3309283  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaacacc 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
3309284 ttaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaacacc 3309339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 38823252 - 38823438
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||    
38823252 aagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtgtcatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagat 38823351  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
38823352 taacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 38823438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10182146 - 10181962
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| | | ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
10182146 aagttaaaactgtaacataaaaaatatagtgcgtaacacgccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagat 10182047  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
10182046 taacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 10181962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27227581 - 27227437
Alignment:
50 actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgtttt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
27227581 actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgtttt 27227482  T
150 aaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
27227481 aagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacatga 27227437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7079212 - 7079015
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatact-----------gtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatca 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||           ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
7079212 aagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactaacacctcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatca 7079113  T
97 attcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
7079112 attcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataagacttaagactatcacatga 7079015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27533118 - 27532933
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||    
27533118 aagttaacactatagcatcaaaagtattgtgggtaacaacccactctttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagat 27533019  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
27533018 taacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaagactatcacatga 27532933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 15382974 - 15383155
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaa 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |  || ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
15382974 ttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccaccgtttgtacaatgtcatcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaattcatcagattaa 15383073  T
111 caagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
15383074 caagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 15383155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 2959786 - 2959970
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
2959786 aagttaacactataacatcaaaactgtagtaagtaacatcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcagat 2959885  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| | |||||||||  ||||||||||    
2959886 taacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaagactatcacat 2959970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 4330323 - 4330503
Alignment:
13 aacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccat-actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaac 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
4330323 aacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacacccccaatgtttgtacagtgggatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttatcagattaac 4330422  T
112 aagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
4330423 aagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacat 4330503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 192
Target Start/End: Original strand, 25160715 - 25160854
Alignment:
53 gtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaa 152  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |||     
25160715 gtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataag 25160814  T
153 tgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
25160815 tgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatcacat 25160854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30327087 - 30326906
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaa 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||  || ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
30327087 ttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaatacccaaccgtttgtacaatagcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaa 30326988  T
111 caagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||| | || ||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
30326987 caaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 30326906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34012515 - 34012346
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
34012515 aagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagat 34012416  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacac 177  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| | ||||||    
34012415 taacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac 34012346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Original strand, 14758079 - 14758235
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
14758079 aagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacacaactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccccatagtttcatcaattcattagat 14758178  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacacccca 164  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
14758179 taacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 14758235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 8222169 - 8222350
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || |||   ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||    
8222169 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtt---acaatggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcatat 8222265  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
8222266 taacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 8222350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 1547325 - 1547503
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||        |||    
1547325 aagttaacactataacataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatca--------gat 1547416  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
1547417 taacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatga 1547503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 238650 - 238467
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||     
238650 aagttaacactatagtattaaaaatgttgtgagtaacatcc-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattaatcagac 238552  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
238551 taacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 238467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9903192 - 9903008
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| | ||    
9903192 aagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacaccccgctgtttgtacagtgacatcaaaagttcaatccacatactatcatcaattcatcaaat 9903093  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
9903092 taacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacat 9903008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 18422689 - 18422873
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
18422689 aagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagat 18422788  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
18422789 taacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 18422873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 41926201 - 41926373
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | |||||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
41926201 aagttaatactataacatcaaaaatatagtgagtaatatcccactgtttgtacagtggcatcacaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagat 41926300  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
41926301 taacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacactta 41926373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 180
Target Start/End: Original strand, 42721105 - 42721249
Alignment:
36 gtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaatttta 135  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
42721105 gtgagtaacaccccactgtttgtacagtaacatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttta 42721204  T
136 tcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
42721205 tcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtataacactta 42721249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 39393421 - 39393608
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||||    
39393421 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaatacttcattgtttgtacagtggcatcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcagat 39393520  T
108 taacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||| ||||    
39393521 taacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacatcctacaaagtgtaacacttaagactatcatatga 39393608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28564919 - 28564737
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
28564919 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatat 28564820  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |  |||||| |||   |||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||    
28564819 taacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgtaaagtgtaacactt--aactatcacat 28564737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 51128897 - 51129081
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||   || ||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||    
51128897 aagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatcaattcatcatat 51128996  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
51128997 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacat 51129081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11742488 - 11742338
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||    
11742488 aagttaacactatattatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtc-ccataatatcatcaattcatcggat 11742390  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaaca 159  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
11742389 taacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaaca 11742338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27267318 - 27267154
Alignment:
27 aaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaat 126  Q
    |||| ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
27267318 aaaaatgtagtgagtgacaccccactgtttgtacagtggcattaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaat 27267219  T
127 ctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||    
27267218 ctaatttaat-ctaccttgttttgagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacat 27267154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 32267072 - 32267256
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| ||||    
32267072 aagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcactcctcatattatcatcaacccatcagat 32267171  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||    
32267172 taacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactccacaaagtgtaacactcaagactatcacat 32267256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 40884851 - 40885023
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||    
40884851 aagtcaacaccataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaattcatcagat 40884950  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||| |||||||||    
40884951 taacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacactta 40885023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 28769691 - 28769875
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||    
28769691 aagttaacactatgacatcaaaaatgtaatgagtaacaccc-accgtttgtacaatggcatcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaattcatcatat 28769789  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaaca-ccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||    
28769790 taacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccacaaagtgtaacgcttaagactatcacat 28769875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 37451323 - 37451507
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |    
37451323 aaagttaacactataacatcaaaaatgtaataagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaatttatcata 37451421  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||    
37451422 ttaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaaaaagtgtaacacttaagactatcacat 37451507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 10922765 - 10922937
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||    
10922765 aagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaagaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagat 10922864  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||    
10922865 taacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcacaaagtgtaacactta 10922937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19899907 - 19899723
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |    
19899907 aagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacacctcactgtttgtagaatggcatcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaattcatcaggt 19899808  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| ||  ||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
19899807 taacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 19899723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 30254462 - 30254633
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
30254462 aagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaatac-acactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaattcatcagat 30254560  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||| | ||||| |||||||||    
30254561 taacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacaccctataaagtgtaacactta 30254633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 22170807 - 22170933
Alignment:
66 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccac 165  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
22170807 catcaaaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacaccccac 22170906  T
166 aaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||    
22170907 aaagtgtaacacttaagactatcacat 22170933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 15168127 - 15168306
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtaca-------gtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattc 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||        ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
15168127 aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacgttgtacggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattc 15168226  T
101 attagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    || |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
15168227 atcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacactta 15168306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 47682614 - 47682451
Alignment:
27 aaaagtgttgtgagtaacac-catactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaa 125  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||    
47682614 aaaaatgttgtgagtaacactcccactgcttgtacagtggtatcaaaagttcattcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaa 47682515  T
126 tctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatca 189  Q
     |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||    
47682514 actaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatca 47682451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31621691 - 31621535
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||   || ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
31621691 aagtcaacactataacatcaaaggtgtattgagtagcaccccgctatttgtacggtggcatcaaaaattcagtccccatagtatcatcaattcatcagat 31621592  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacacccca 164  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
31621591 taacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaatacccca 31621535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33725684 - 33725570
Alignment:
62 gtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacacc 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
33725684 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacc 33725585  T
162 ccacaaagtataaca 176  Q
    ||| ||||| |||||    
33725584 ccagaaagtgtaaca 33725570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27564043 - 27563882
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||| | |||| | | |||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||    ||| ||| |||||||||| ||||    
27564043 aagttaacactataactttaaaaatatagtgagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagttccgataatattatcaattcatcagat 27563944  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaag 169  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
27563943 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccacaaag 27563882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27763448 - 27763265
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacc-atactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||  ||||||| | || |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||     
27763448 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacccata--gtttgtagaatgacatcaaaagtccagccctcatagtatcatcaatttatcagg 27763351  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| || || ||| |||  ||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||    
27763350 ttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacat 27763265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 46931449 - 46931631
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||  |||||||||| |  |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| || |    
46931449 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccactgtttgtagaacggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaattcatcaggt 46931548  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || ||||  || |  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
46931549 taacaagactacacttaatataattttatcataccttg--ttcagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 46931631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 23999385 - 23999569
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | |   ||||||||||  ||| |||||| | || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || |    
23999385 aagttaacactacaacataaaaaatataacgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggt 23999484  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| |||   |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
23999485 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 23999569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37619034 - 37618860
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaa--caccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtat--catcaattcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||  ||||  |||||||||| | || |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||     
37619034 aagttaacactataacatcaaaaatttaatgagtaaaacaccccactgtttgtaaaatgacatcaaaagttcagttctcatagtatatcatcaattcatc 37618935  T
104 agattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||| |||| ||||| |||||||    
37618934 agattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacatcccataaagtgtaacact 37618860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 21289729 - 21289816
Alignment:
27 aaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaag 114  Q
    |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||    
21289729 aaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaag 21289816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 179
Target Start/End: Original strand, 38759610 - 38759742
Alignment:
51 ctgtttgtacagtggcatcaaaagttcag----tcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgt 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||| || |||||||||||||| | ||||| || | || | ||||| |||||||||| |||||| |    
38759610 ctgtttgtacagtgacatcaaaagttcagccagtcttcgtaatatcatcaattcatcatattaataaaactacatttaatttaattttatcatatcttat 38759709  T
147 tttaaatgtaacaccccacaaagtataacactt 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
38759710 tttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactt 38759742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 122; Significance: 8e-63; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34948266 - 34948078
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||    
34948266 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcatat 34948167  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataac--acttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||    
34948166 taacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacaccccacaaagtgtaacgtacttaagactatcacatga 34948078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25701227 - 25701053
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
25701227 aaagttaacattataacatcaaaagtgtagtgagtaacaccctactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaga 25701128  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaaca-ccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||| || || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
25701127 ttaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacactta 25701053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 23761113 - 23761275
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
23761113 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcaga 23761212  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagt 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| || |||||    
23761213 ttaacaagaatacacttaatctaattttat-ctaccttgttttaagtgtaacacctcataaagt 23761275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 17167755 - 17167939
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||     
17167755 aagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcattctccatagtatcattaattcatcagac 17167854  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
17167855 taagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 17167939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 17173332 - 17173516
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||     
17173332 aagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatctccatagtatcattaattcatcagac 17173431  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
17173432 taagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 17173516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29584367 - 29584183
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
29584367 aagttaacactataacatcaaaagtgttg--agtaacacctcactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagat 29584270  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||  |||| | |||||||  |||||| |||||    
29584269 taatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatga 29584183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28003155 - 28002971
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||  ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
28003155 aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtcagtagtactccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcggat 28003056  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
28003055 taacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaaaactatcacat 28002971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35021204 - 35021020
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||    
35021204 aagttaacattataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacattggcgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcattagat 35021105  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
35021104 taacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 35021020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 4598035 - 4598203
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||| | ||    
4598035 aagttaacactataacatcaaa-gtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccttagactcatcaattcatcatat 4598133  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
4598134 taacaagaatacacttaatttaattttatcct-gcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 4598203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 194
Target Start/End: Original strand, 33341465 - 33341626
Alignment:
32 tgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaat 131  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
33341465 tgttgcgaggaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataat 33341563  T
132 tttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||    
33341564 tttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 33341626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 55241273 - 55241088
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||     
55241273 aagttaatactatattatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcaga- 55241175  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||    
55241174 taagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 55241088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30002793 - 30002631
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||    
30002793 aagttaacactgtagcatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcttagtatcatc--------agat 30002702  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
30002701 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 30002631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 47253791 - 47253968
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||        |||    
47253791 aagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-attgtttatacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatca--------gat 47253881  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
47253882 taacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 47253968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 25184155 - 25184339
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
25184155 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatgacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagat 25184254  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||    
25184255 taacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacat 25184339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 37775711 - 37775879
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   | |  ||||||||||||||||| ||||    
37775711 aagttagcactataatattaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcccccct--tagtatcatcaattcatcagat 37775808  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
37775809 taacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 37775879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 32592135 - 32592305
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
32592135 aagttaacactacagtatcaaaagtgttgagagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagat 32592234  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
32592235 taacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 32592305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 7703559 - 7703737
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||        ||||    
7703559 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtcagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatc--------agat 7703650  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
7703651 taacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtcacacttaagactatcacatga 7703737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37663908 - 37663726
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
37663908 aagttaacacta--acattaaaactgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 37663811  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
37663810 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 37663726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19089622 - 19089438
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
19089622 aagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 19089523  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | ||   ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
19089522 taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 19089438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 27396658 - 27396830
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||    
27396658 aagttaacattatagcattaaaagtgttatgagtaacaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcatcagat 27396757  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||    
27396758 taacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtcacactta 27396830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 54499408 - 54499220
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtac-agtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |    
54499408 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccaccgtttgtactaatgacatcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcata 54499309  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||  ||||||||||||    
54499308 ttaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaagactatcacatga 54499220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Original strand, 50764774 - 50764904
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
50764774 aagttaacacta--acatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcattagat 50764871  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatccta 140  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
50764872 taacaagaatacatttaatctaattttatccta 50764904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 49376009 - 49376181
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
49376009 aagttaacattatagcatcaaaagtgtcgtgagtaacaccccactgcttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagat 49376108  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| |   ||||||||||| || |||||||||    
49376109 taacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacaccccacaatgtgtaacactta 49376181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 55478064 - 55477876
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatac----tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||   ||    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
55478064 aagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacactccactgtttgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatc 55477965  T
104 agattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| |  ||||||||||    
55477964 agattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaacaccccacaacgtgtaacactgaagactatcacat 55477876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 879717 - 879533
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||  | |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||    
879717 aagtaaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcattgtttgtacaatgacatcaaaagtttaatcttcatagtatcatcaactcatcagat 879618  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||    
879617 taacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacatttaagactatcacat 879533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36493857 - 36493686
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | | ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
36493857 aagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacaccccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaat 36493758  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||    
36493757 taacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacactta 36493686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46888326 - 46888143
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||| ||||    
46888326 aagttaatactataacatcaaaattgtagtgagtaataccccactatttgtacagcggcatcaaaagttcagtccccatactatcgttaattcatcagat 46888227  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
46888226 taacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacacttag-actatcacat 46888143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33816687 - 33816540
Alignment:
23 catcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaact 122  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |  |||    
33816687 catcaaaagtgtagtgagtagcacctcactatttatacggtggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcact 33816588  T
123 taatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagt 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
33816587 taatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagt 33816540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19440815 - 19440645
Alignment:
10 gttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagatta 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
19440815 gttaacactataacatcaaaaatgtaatgattaacactccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagatta 19440716  T
110 acaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||||||| || |||| ||||    
19440715 acaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacaccccacaacgtgtaaccctta 19440645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Original strand, 39397960 - 39398113
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||         ||    
39397960 aagttaacactataacattaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttctcagtatcatca---------at 39398050  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagt 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
39398051 taacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagt 39398113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 180
Target Start/End: Original strand, 9139315 - 9139459
Alignment:
36 gtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaatttta 135  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
9139315 gtgagtaacaccccaccgtttgtacagtgacataaaaagttcaatccccatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaatttta 9139414  T
136 tcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
9139415 tcctaccttgttttaactgtaacaccctacaaagtgtaacactta 9139459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 38011896 - 38012080
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||    
38011896 aagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgaatagcaccccactgtttgtacggtgccatcaaaagttcagtccccataatattatcaattcatcagat 38011995  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||  ||||||||||    
38011996 taacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccagaaagtgtaacgcttaagactatcacat 38012080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 194
Target Start/End: Original strand, 37287775 - 37287956
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||        |||| |||    
37287775 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcataata--------tcataaga 37287866  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaac-accccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||  ||||||||| | |||||||||  |||| |||||||    
37287867 ttaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgcccccacaaaatgtaacacttaagactagcacatga 37287956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5048134 - 5047949
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
5048134 aagtcaactctataacatcaaaagtgtagtgagtaggaccacactgtttgtacgatgatatcaaaagttcagttcccatagtatcatcaattcatgagat 5048035  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||| | |||||||||  ||||||||||||    
5048034 taacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata-cccgcaaaatgtaacacttaagactatcacatga 5047949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4934327 - 4934190
Alignment:
52 tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
4934327 tgtttgtacactggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaa 4934228  T
152 atgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatca 189  Q
     |  |||||| |||||||| |||||||||  |||||||    
4934227 gtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatca 4934190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 6864077 - 6864261
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |  ||| ||||| |  ||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||    
6864077 aagttatcactataacatcaaaaatttaatgaataacatccaactttttgtacaatagcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcagat 6864176  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||    
6864177 taacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaatacttaagactatcacat 6864261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 32912749 - 32912565
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || | |||||| | ||  |||||||||||||   ||||| ||||||||||| || || |    
32912749 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctagtatttgtagaatgatatcaaaagttcagcactcataatatcatcaatttatcaggt 32912650  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
32912649 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 32912565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 42199771 - 42199955
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||  | | |||||| | || ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
42199771 aagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccattatttgtagaatgacataaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagat 42199870  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| |||   |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
42199871 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 42199955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 50697284 - 50697467
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | |   |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||    
50697284 aagtaaacactataacataaaaaatataacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctc-tagtatcatcaattcatcagat 50697382  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||    
50697383 taacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacaccacacaaagtgcaacacttaagactatcacat 50697467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 192
Target Start/End: Original strand, 1815409 - 1815527
Alignment:
74 gttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtata 173  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
1815409 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgta 1815508  T
174 acacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||  ||||||||||    
1815509 acacttaagactatcacat 1815527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 34361660 - 34361477
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||  |||||||||| | || ||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||  | |    
34361660 aagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatgacattaaaagttcagcct-cataatatcatcaattcatccggt 34361562  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||| | || ||||||| |||||||||| || |||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||    
34361561 taacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaagctatcacat 34361477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 35025757 - 35025593
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||  || |||||||||||||||| || |||||||||||        |||    
35025757 aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatacgttgacatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatca--------gat 35025666  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||    
35025665 taacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacaccccagaaagtgtaacactta 35025593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 194
Target Start/End: Original strand, 17272068 - 17272192
Alignment:
66 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccac 165  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||     
17272068 catcaaaagttcagtct----agtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccat 17272163  T
166 aaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
     |||| | |||||||  |||||| |||||    
17272164 gaagtgtcacacttaagactatcgcatga 17272192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 32579486 - 32579660
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgt---ttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatta 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  | |||   |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |    
32579486 aagtcaacattataacatcaaaagtgcagtgagtagcaccccagtgtttgttgtacggtgccatcaaaagtttagtc-tcatagtattatcagttcatca 32579584  T
105 gattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||| |||| ||||    
32579585 gattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaagacctcagaaagtgtaactctta 32579660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Original strand, 3042741 - 3042845
Alignment:
88 gtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactat 187  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| |||||||||| || ||| || |||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
3042741 gtatcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactat 3042840  T
188 cacat 192  Q
    |||||    
3042841 cacat 3042845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23518472 - 23518400
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagt 80  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||    
23518472 aagttaacactataacattaaaactgtagtgactaacaccccactgttaatacagtggcatcaaaaattcagt 23518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 4205158 - 4205221
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaa 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||||| || ||||||    
4205158 aagttaacactataatatcaaaaatgttctgaataacaccccactgtttgtacaatgacatcaa 4205221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 7152276 - 7152236
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacc 47  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
7152276 aaagttaacattataacatcaaaagtatagtgagtaacacc 7152236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 119; Significance: 5e-61; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 15491657 - 15491843
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
15491657 aagttaacattgtaacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacagtggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagat 15491756  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||    
15491757 taacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaaatatcacatga 15491843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3880081 - 3879897
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||     
3880081 aagttaacattatagtatcaaaagtgttgtgagtaacaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagac 3879982  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
3879981 taacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 3879897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4318965 - 4318778
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
4318965 aagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcaacccccatagtatcatcaattcattagat 4318866  T
108 taacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||    
4318865 taacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacatga 4318778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 29182205 - 29182392
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
29182205 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtgtcatcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcagat 29182304  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaaca-ccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||    
29182305 taataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacacccccataaagtgtaacacttaagactatcacatga 29182392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30353500 - 30353314
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
30353500 aagttaacattataacatcaaaagtgttgcgagtaatatctcactgtttgtacagtggcatcgatagttcagtctccatagtatcatcaattcatcatat 30353401  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
30353400 aaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 30353314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33893144 - 33892975
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||  || ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
33893144 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgatattaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagat 33893046  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacact 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||| |||||||    
33893045 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccacaaagtgtaacact 33892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21017235 - 21017070
Alignment:
27 aaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataaacttaat 126  Q
    |||| ||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
21017235 aaaaatgttgtgagtaacaccccattatttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaataaacttaat 21017136  T
127 ctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
21017135 ctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 21017070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7235176 - 7235005
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
7235176 aagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtgccatcaaaagttcagtct-catagtattatcaattcatcagat 7235078  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||    
7235077 taacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacgctta 7235005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 8513275 - 8513456
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||    
8513275 aagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcatat 8513374  T
108 taacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||      |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
8513375 taacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttt------taacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatga 8513456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Original strand, 6088950 - 6089094
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
6088950 aagttaacactatagtatcaaaagtgttgtgagtaacgccccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagat 6089049  T
108 taacaagaataaacttaatctaa-ttttatcctatcttgttttaa 151  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
6089050 taacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaa 6089094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 1945876 - 1946060
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |  |    
1945876 aagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatgaattcatcaagt 1945975  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
1945976 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 1946060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6091325 - 6091140
Alignment:
7 aaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||   | |||||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
6091325 aaagttaaca-tgtaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccattgtttgtacaatgccatcaaaagttcagtactcgtagtatcatcaattcattaga 6091227  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttaga-actatcacat 192  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||    
6091226 ttaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaacaaagtgtaacacttaaagactatcacat 6091140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7055357 - 7055173
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||||  ||| |||||| | || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |    
7055357 aagttaacactataacataaaaaatataattagtaacacctcactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggt 7055258  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||    
7055257 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgctacaaagtgtaacacttaaaactatcacat 7055173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 20768128 - 20768296
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaaca-ccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattaga 106  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
20768128 aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcatccat--tgtttgtt-agtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcaga 20768224  T
107 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
20768225 ttaacaagatt--acttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtaacactta 20768296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 5627433 - 5627617
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||  ||| |||||| | || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || |    
5627433 aagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggt 5627532  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| |||   |||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||    
5627533 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacat 5627617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Original strand, 33618876 - 33619008
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| || |  | | ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
33618876 aagtcaacactatcgcatcaaaagtgtagtgagtagcaacccattatttgtacggtggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagat 33618975  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatccta 140  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||||    
33618976 taacaagactgcacttaatctaattttatccta 33619008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 97
Target Start/End: Original strand, 18498475 - 18498565
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccat-actgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaa 97  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18498475 aagttaacattatagcatcaaaagtgtagtgagcaacacccccacagtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 18498565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 7929 - 8113
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
7929 aagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 8028  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
8029 taacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacat 8113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 11952 - 12137
Alignment:
11 ttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccat-actgtttgta-cagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagatt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
11952 ttaacaccataacattaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtatcagtggtatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagatt 12051  T
109 aacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacatga 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||    
12052 aacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatga 12137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 176 - 360
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
176 aagttaacactgtagtataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagac 275  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||    
276 taacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacat 360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 94526 - 94354
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||| ||||    
94526 aagttaacattataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttggtccccatactatcatcaattcatgagat 94427  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
94426 taacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 94354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 408559 - 408389
Alignment:
20 taacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaacaagaataa 119  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||| | ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
408559 taacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttaccgtttgtaaaatgaaatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactac 408461  T
120 acttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcaca 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||    
408460 acttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagactatcaca 408389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 267331 - 267511
Alignment:
14 acactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgttt-gtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagattaaca 112  Q
    |||||||| |||||||| | | |||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||    
267331 acactatagcatcaaaaatatagtgagtaacatccaactgttttgtacagtgtcatcaaaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagca 267430  T
113 agaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttaga-actatcacat 192  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
267431 agactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaagactatcacat 267511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 43999 - 44171
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
43999 aagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 44098  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||| |||| || | ||||| |||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||    
44099 taataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacactta 44171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 154788 - 154616
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
154788 aagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagat 154689  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacactta 180  Q
    ||| |||| || | ||||| |||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||    
154688 taataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacactta 154616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 73; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 146159 - 145975
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccatactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcattagat 107  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||  | | |||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
146159 aagttaacattataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttgtagaatgacatcaaaagttcagccttcatagtatcatcaattcatcaggt 146060  T
108 taacaagaataaacttaatctaattttatcctatcttgttttaaatgtaacaccccacaaagtataacacttagaactatcacat 192  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| |||   |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||    
146059 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat 145975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 47
Target Start/End: Original strand, 42390 - 42429
Alignment:
8 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacc 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42390 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacc 42429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University