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Alignment Overview

Query: NF4212_high_8 (Length: 236)

Name: NF4212_high_8
Description: NF4212
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4212_high_8
NF4212_high_8
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (2-221)||(34475184-34475403)
chr6 (2-221)||(33489833-33490052)
chr6 (2-222)||(742722-742942)
chr6 (2-222)||(10790532-10790752)
chr6 (12-222)||(8933676-8933886)
chr6 (2-222)||(4210434-4210654)
chr6 (12-221)||(8062840-8063049)
chr6 (2-222)||(4169705-4169925)
chr6 (2-221)||(17595736-17595955)
chr6 (12-222)||(33131004-33131214)
chr6 (2-219)||(32938275-32938492)
chr6 (12-218)||(8659038-8659247)
chr6 (12-221)||(18676575-18676783)
chr6 (12-222)||(28914000-28914206)
chr6 (24-220)||(29863801-29863997)
chr6 (2-221)||(29516706-29516925)
chr6 (2-130)||(5545412-5545541)
chr6 (12-221)||(8313623-8313838)
chr6 (2-221)||(12712968-12713177)
chr6 (12-221)||(9224648-9224863)
chr6 (2-222)||(11590287-11590515)
chr6 (1-177)||(9576069-9576251)
chr6 (22-172)||(25143999-25144155)
chr6 (12-58)||(20554819-20554865)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (1-221)||(5544176-5544396)
chr7 (2-221)||(44061849-44062068)
chr7 (2-222)||(3887711-3887931)
chr7 (2-221)||(18676628-18676847)
chr7 (2-221)||(31587790-31588009)
chr7 (12-222)||(12726089-12726299)
chr7 (12-222)||(40186577-40186787)
chr7 (12-221)||(12848491-12848700)
chr7 (12-221)||(47020341-47020550)
chr7 (2-221)||(41118649-41118868)
chr7 (12-221)||(31621987-31622196)
chr7 (2-221)||(47455091-47455310)
chr7 (12-222)||(40431146-40431356)
chr7 (12-221)||(44291103-44291312)
chr7 (12-221)||(9870274-9870483)
chr7 (20-222)||(38743100-38743302)
chr7 (2-222)||(9741106-9741317)
chr7 (12-222)||(42076385-42076595)
chr7 (29-221)||(25105043-25105235)
chr7 (12-222)||(42697457-42697658)
chr7 (2-176)||(44508544-44508719)
chr7 (12-221)||(3111954-3112156)
chr7 (2-84)||(30888401-30888483)
chr7 (172-221)||(44509059-44509108)
chr7 (22-157)||(38167987-38168127)
chr7 (107-202)||(27418930-27419025)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (2-222)||(1546053-1546273)
chr3 (2-221)||(24348843-24349062)
chr3 (2-221)||(44377822-44378041)
chr3 (12-222)||(43973100-43973310)
chr3 (1-222)||(9745982-9746203)
chr3 (2-222)||(38252559-38252779)
chr3 (2-221)||(51754463-51754682)
chr3 (2-221)||(55274017-55274236)
chr3 (3-221)||(5273450-5273668)
chr3 (12-222)||(49804730-49804940)
chr3 (2-222)||(10048984-10049204)
chr3 (2-221)||(51167047-51167266)
chr3 (12-222)||(10471223-10471433)
chr3 (2-221)||(23150779-23150998)
chr3 (15-221)||(8828486-8828692)
chr3 (12-222)||(22497290-22497500)
chr3 (12-222)||(27449541-27449751)
chr3 (12-222)||(53019031-53019241)
chr3 (12-221)||(8068392-8068601)
chr3 (2-222)||(12227619-12227840)
chr3 (12-221)||(37821112-37821320)
chr3 (2-222)||(10659566-10659786)
chr3 (2-222)||(13286970-13287190)
chr3 (12-221)||(24405821-24406038)
chr3 (2-221)||(2446001-2446220)
chr3 (12-221)||(3019252-3019460)
chr3 (12-221)||(46528140-46528357)
chr3 (12-222)||(41113973-41114183)
chr3 (12-222)||(43218806-43219016)
chr3 (2-221)||(31655085-31655302)
chr3 (12-222)||(17338348-17338558)
chr3 (2-221)||(28555040-28555256)
chr3 (12-221)||(20607570-20607770)
chr3 (18-221)||(26975354-26975548)
chr3 (2-221)||(37126510-37126720)
chr3 (2-221)||(47697808-47698023)
chr3 (2-169)||(35846787-35846954)
chr3 (14-221)||(41454298-41454505)
chr3 (12-222)||(26229422-26229633)
chr3 (12-164)||(30357301-30357453)
chr3 (2-135)||(48458426-48458559)
chr3 (83-221)||(501837-501975)
chr3 (2-221)||(35512933-35513149)
chr3 (1-117)||(998292-998408)
chr3 (132-222)||(48477878-48477968)
chr3 (2-85)||(26717973-26718056)
chr3 (2-66)||(33591130-33591194)
chr3 (12-60)||(501789-501837)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (2-222)||(25828716-25828936)
chr1 (2-221)||(6978942-6979161)
chr1 (2-222)||(45502219-45502439)
chr1 (12-221)||(30159063-30159272)
chr1 (2-221)||(15475847-15476066)
chr1 (2-221)||(15907279-15907498)
chr1 (2-221)||(28226210-28226429)
chr1 (2-220)||(48542420-48542638)
chr1 (12-221)||(28068696-28068905)
chr1 (12-221)||(37094019-37094228)
chr1 (2-221)||(3770544-3770763)
chr1 (12-222)||(47534050-47534260)
chr1 (12-221)||(42885317-42885526)
chr1 (12-221)||(52469300-52469509)
chr1 (2-222)||(40359706-40359926)
chr1 (2-221)||(44233893-44234112)
chr1 (12-222)||(46674794-46675004)
chr1 (14-222)||(24180426-24180635)
chr1 (1-221)||(3046801-3047021)
chr1 (2-222)||(13556116-13556336)
chr1 (13-221)||(29033532-29033740)
chr1 (2-221)||(30361195-30361414)
chr1 (2-222)||(35719750-35719971)
chr1 (12-221)||(3994734-3994946)
chr1 (12-222)||(49456888-49457098)
chr1 (2-221)||(18604898-18605117)
chr1 (2-221)||(44054684-44054903)
chr1 (12-220)||(4490011-4490217)
chr1 (12-222)||(3416355-3416556)
chr1 (12-222)||(25729796-25729996)
chr1 (12-221)||(8895672-8895871)
chr1 (12-221)||(31760578-31760778)
chr1 (12-221)||(17580759-17580959)
chr1 (25-221)||(43106406-43106593)
chr1 (2-134)||(50490842-50490974)
chr1 (68-221)||(11493513-11493657)
chr1 (68-221)||(11335493-11335637)
chr1 (12-124)||(46234296-46234408)
chr1 (2-116)||(26770097-26770211)
chr1 (18-221)||(17926068-17926260)
chr1 (14-135)||(49740137-49740258)
chr1 (12-89)||(20599594-20599671)
chr1 (149-222)||(46234222-46234295)
chr1 (66-164)||(17137000-17137104)
chr1 (12-104)||(8969515-8969607)
chr1 (2-104)||(7042840-7042943)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (2-221)||(21866850-21867069)
chr2 (2-222)||(11124199-11124419)
chr2 (12-221)||(2357388-2357597)
chr2 (14-221)||(30787010-30787217)
chr2 (12-221)||(20115112-20115321)
chr2 (12-221)||(26479719-26479928)
chr2 (2-222)||(19390437-19390657)
chr2 (12-221)||(8113738-8113951)
chr2 (14-221)||(25336577-25336784)
chr2 (1-222)||(6034451-6034673)
chr2 (12-222)||(12242793-12243005)
chr2 (2-222)||(17977612-17977833)
chr2 (12-221)||(41568573-41568782)
chr2 (12-221)||(39430126-39430335)
chr2 (12-222)||(33965311-33965521)
chr2 (1-221)||(2371968-2372179)
chr2 (12-221)||(14287327-14287527)
chr2 (12-222)||(31547147-31547350)
chr2 (12-222)||(2380166-2380367)
chr2 (2-221)||(4049500-4049696)
chr2 (113-221)||(1222305-1222413)
chr2 (18-130)||(11978819-11978931)
chr2 (1-73)||(1222638-1222710)
chr2 (172-221)||(11978930-11978979)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (2-222)||(28867541-28867762)
chr4 (2-222)||(11005479-11005699)
chr4 (1-221)||(29923641-29923861)
chr4 (12-222)||(50621713-50621923)
chr4 (2-222)||(2491872-2492092)
chr4 (12-222)||(39677532-39677742)
chr4 (12-221)||(7327524-7327733)
chr4 (2-222)||(22169150-22169370)
chr4 (2-222)||(33961628-33961848)
chr4 (2-222)||(3931815-3932036)
chr4 (12-221)||(45884609-45884818)
chr4 (2-222)||(36308830-36309050)
chr4 (2-222)||(56162514-56162734)
chr4 (2-222)||(26488391-26488613)
chr4 (2-221)||(36224961-36225180)
chr4 (2-221)||(36432315-36432533)
chr4 (12-222)||(20492554-20492764)
chr4 (12-222)||(54202381-54202591)
chr4 (12-221)||(3874398-3874607)
chr4 (2-222)||(27767463-27767682)
chr4 (2-221)||(7554268-7554487)
chr4 (12-221)||(3875493-3875702)
chr4 (12-221)||(41764518-41764727)
chr4 (2-222)||(55282300-55282519)
chr4 (2-213)||(24744826-24745037)
chr4 (12-222)||(49331959-49332169)
chr4 (2-222)||(29933369-29933580)
chr4 (12-221)||(17445497-17445697)
chr4 (12-221)||(44878093-44878302)
chr4 (14-222)||(43957695-43957894)
chr4 (12-222)||(35949338-35949539)
chr4 (2-221)||(28573609-28573815)
chr4 (14-148)||(11308819-11308953)
chr4 (14-148)||(11381821-11381954)
chr4 (2-85)||(55541865-55541948)
chr4 (166-221)||(11308952-11309007)
chr4 (3-164)||(7326317-7326485)
chr4 (66-94)||(16319341-16319369)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (2-222)||(35393385-35393605)
chr8 (2-222)||(11020443-11020663)
chr8 (2-222)||(29997534-29997754)
chr8 (12-222)||(38098648-38098858)
chr8 (12-221)||(483022-483231)
chr8 (2-222)||(39780352-39780573)
chr8 (2-222)||(8352420-8352640)
chr8 (2-222)||(36781692-36781912)
chr8 (2-221)||(30655041-30655260)
chr8 (2-222)||(33411085-33411306)
chr8 (12-221)||(20187522-20187731)
chr8 (12-221)||(20206591-20206800)
chr8 (12-221)||(24757633-24757841)
chr8 (12-221)||(25487089-25487298)
chr8 (2-221)||(31097555-31097765)
chr8 (18-221)||(30699879-30700084)
chr8 (12-221)||(26416164-26416373)
chr8 (2-221)||(1104810-1105028)
chr8 (2-222)||(12986711-12986920)
chr8 (2-190)||(45084285-45084464)
chr8 (113-221)||(20819064-20819172)
chr8 (2-117)||(27719282-27719397)
chr8 (2-145)||(5458300-5458442)
chr8 (12-164)||(18574843-18575002)
chr8 (2-70)||(20818995-20819063)
chr8 (12-82)||(32834639-32834709)
chr8 (160-221)||(5458438-5458499)
chr8 (11-107)||(20524991-20525086)
chr8 (107-191)||(29225858-29225942)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (2-222)||(42675525-42675745)
chr5 (2-222)||(3390698-3390918)
chr5 (2-221)||(25031464-25031683)
chr5 (12-221)||(8836399-8836607)
chr5 (12-221)||(41743228-41743437)
chr5 (12-222)||(29296237-29296448)
chr5 (2-221)||(8335359-8335578)
chr5 (2-222)||(35065908-35066130)
chr5 (14-222)||(36484467-36484675)
chr5 (1-221)||(23191749-23191971)
chr5 (1-221)||(6230263-6230474)
chr5 (2-221)||(10691787-10691997)
chr5 (2-196)||(18185802-18185995)
chr5 (12-221)||(27771129-27771336)
chr5 (12-221)||(28349084-28349291)
chr5 (2-222)||(15472537-15472753)
chr5 (14-222)||(1421021-1421220)
chr5 (2-164)||(42221766-42221928)
chr5 (2-203)||(33591589-33591781)
chr5 (1-221)||(8782561-8782771)
chr5 (119-222)||(18617562-18617665)
chr5 (14-221)||(33569956-33570144)
chr5 (12-173)||(25472199-25472366)
chr5 (125-170)||(38244527-38244572)
chr5 (164-196)||(42221919-42221951)
[»] scaffold1360 (1 HSPs)
scaffold1360 (2-222)||(810-1031)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (2-221)||(105573-105792)
[»] scaffold0562 (2 HSPs)
scaffold0562 (12-221)||(5217-5426)
scaffold0562 (12-221)||(6312-6521)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (2-221)||(42549-42768)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (24-220)||(19498-19694)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (2-222)||(27687-27898)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (2-221)||(11151-11370)
[»] scaffold0548 (2 HSPs)
scaffold0548 (14-148)||(5309-5443)
scaffold0548 (166-221)||(5442-5497)
[»] scaffold0896 (1 HSPs)
scaffold0896 (84-120)||(50-86)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 34475184 - 34475403
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34475184 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatgaccatagatgtgcaacca 34475283  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34475284 atatctaaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 34475383  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34475384 ttattttggtatgagatatg 34475403  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 33489833 - 33490052
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33489833 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 33489932  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33489933 atatctgaatcaacatctttgttattgatctatactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 33490032  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  33490033 ttgttttggtatgagatatg 33490052  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 742942 - 742722
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  742942 aaaattgctctcttcgtgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 742843  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  742842 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 742743  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  742742 ttgttttggtatgagatatgt 742722  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 10790532 - 10790752
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10790532 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaacccttacaccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 10790631  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10790632 atatctgaatcaaaatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 10790731  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  10790732 ttgttttggtatgagatatgt 10790752  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8933886 - 8933676
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933886 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 8933787  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933786 caacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 8933687  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  8933686 atgagatatgt 8933676  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 4210434 - 4210654
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4210434 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 4210533  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4210534 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaatgttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttgttgt 4210633  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  4210634 ttgttttggtatgagatatgt 4210654  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 8062840 - 8063049
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8062840 tcttcatgtaattttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 8062939  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8062940 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaatgttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 8063039  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  8063040 atgagatatg 8063049  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 4169705 - 4169925
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4169705 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 4169804  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4169805 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaatgttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttgttgt 4169904  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  4169905 ttgttttagtatgagatatgt 4169925  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17595955 - 17595736
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17595955 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 17595856  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17595855 agatctgaatcaacatttttgtcattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 17595756  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  17595755 ttgttttggtacgagatatg 17595736  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33131214 - 33131004
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33131214 tcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaat 33131115  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33131114 caacatctttgttattgatttgtactatattcataaagattagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 33131015  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  33131014 atgagatatgt 33131004  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32938492 - 32938275
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32938492 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttatcccctttcatcgacaaatcaccatagatgtgcaacca 32938393  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32938392 atatatgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 32938293  T
Q  202 ttattttggtatgagata 219  Q
    || |||||||||||||||    
T  32938292 ttgttttggtatgagata 32938275  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 8659038 - 8659247
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttt---tatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659038 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatctttaattatgatcattttgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctg 8659137  T
Q  109 aatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttatttt 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8659138 aatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 8659237  T
Q  209 ggtatgagat 218  Q
    || |||||||    
T  8659238 ggcatgagat 8659247  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18676783 - 18676575
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676783 tcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaacccttacccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 18676685  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18676684 caacatctttgttattgatctgtactatatttataaatgtttttgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 18676585  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  18676584 atgagatatg 18676575  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28914206 - 28914000
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  28914206 tcttcatgtaaatttttaaaaaccaatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcac----gatgtgcaaccaatatctgaat 28914111  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28914110 caacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttaattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 28914011  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  28914010 atgagatatgt 28914000  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29863997 - 29863801
Alignment:
Q  24 tttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgt 123  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29863997 tttttaaaaacccattttttacgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgt 29863898  T
Q  124 tattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29863897 tattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtatgaaatat 29863801  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 29516706 - 29516925
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  29516706 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaattcatcttttatgatcattttggactcttacctcctttcatctacaaatcaccatagatgcgcaacta 29516805  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29516806 agatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 29516905  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  29516906 ttgttttggtatgagatatg 29516925  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 5545412 - 5545541
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaa-tcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5545412 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaattcaccatagatgtgcaacc 5545511  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgat 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5545512 aatatctgaatcaacatctttgttattgat 5545541  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8313838 - 8313623
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatc----- 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||   | ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||         
T  8313838 tcttcatgtaaatttgtaaaaacctttatttcattatcattccgaaccctcaccccctttcatcaataaatcaccatatatgtgtaaccaaaatcaaaga 8313739  T
Q  107 -tgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttat 205  Q
     ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  8313738 ttgaatcaacatctttttcattgatctgtactatattcataaaagtcagtgaatttcataaatttcattttctaagagtttctatttgtttattatttat 8313639  T
Q  206 tttggtatgagatatg 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  8313638 tttggtatgagatatg 8313623  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12713177 - 12712968
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12713177 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaccccatcttttatgatcattctgaaccctcgccccttttcatccacaactcaccatagatgtgcaacca 12713078  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | |||||||| ||| | ||||| |||||||| |||| |||||| |          |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12713077 aaatctgaataaacttctttgtcattgatctatactctattcaca----------aatttcatgaattgtattttctaagagtttctatttgtttattgt 12712988  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12712987 ttattttggtatgagatatg 12712968  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 9224648 - 9224863
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatc----- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||         
T  9224648 tcttcatgtaaattttttaaaacccttctttcattatcattttgaaccctcaccccctttcatctagaaatcaccatagatgtgctaccaagatcaaaga 9224747  T
Q  107 -tgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttat 205  Q
     ||| ||||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |    
T  9224748 ttgagtcaacatctttttcattgatatgtactctattcataaaggttagtgaacttattgaatttcattttctaaaagtttctatttgtatattgtttgt 9224847  T
Q  206 tttggtatgagatatg 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  9224848 tttggtatgagatatg 9224863  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 11590287 - 11590515
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||  | ||||| || ||||||||||||| |  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11590287 aaaattacactcttcatgtaaatttctaaaaatccttctttcattatcattctgaaccatcgccccatttcgtccataaatcaccatagatgtgcaacca 11590386  T
Q  102 atatc------tgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtt 195  Q
    | |||      ||||||||||| ||| | |||||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  11590387 agatcaaagattgaatcaacatctttttcattgatatgtactccattcataaaagtcagtgaatttcataaatttaattttttaagagtttctatttgtt 11590486  T
Q  196 tattg--tttattttggtatgagatatgt 222  Q
    |||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  11590487 tattgtttttttttttgtatgagatatgt 11590515  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 9576069 - 9576251
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    |||||||||  || |||||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |||| | |    
T  9576069 taaaattgctctcatcatgtaaatttctaaaaacccttctttcattatcattctgaaccctcaccccacttcatccacaaatcatcatagacgtgctatc 9576168  T
Q  101 aatatc------tgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttc 177  Q
    || |||      | |||||| || ||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9576169 aagatcaaagattaaatcaatatctttttcattgatctttactctattaataaaggttggtgaatttcatgaatttcattttc 9576251  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25144155 - 25143999
Alignment:
Q  22 aatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaac 115  Q
    ||||| ||||||| | | |||||| |||||| |||   || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||      |||||||||    
T  25144155 aatttctaaaaaccccttttttattatcattatgagttctcaccccctttcatccacagaccaccatagatgtgcaaccaagatcaaagattgaatcaac 25144056  T
Q  116 atatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttca 172  Q
    || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25144055 attttttttattgatatgtactctattcataaaggtcagtgaattttatgaatttca 25143999  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 20554865 - 20554819
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaac 58  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  20554865 tcttcatgtaaatttctaaaaactcttctttcattatcattctgaac 20554819  T

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Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5544396 - 5544176
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5544396 taaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 5544297  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5544296 aatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 5544197  T
Q  201 tttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  5544196 tttgttttggtatgagatatg 5544176  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 44061849 - 44062068
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44061849 aaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 44061948  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44061949 agatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 44062048  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44062049 ttattttggtatgagatatg 44062068  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 3887711 - 3887931
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3887711 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 3887810  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3887811 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttatttattgt 3887910  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  3887911 ttgttttggtatgagatatgt 3887931  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18676847 - 18676628
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676847 aaaattgccatcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 18676748  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676747 atatctgaatcaacatatttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttaatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 18676648  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  18676647 ttgttttggtatgagatatg 18676628  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31588009 - 31587790
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31588009 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatatatgtgcaacca 31587910  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31587909 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttttatttgtttattgt 31587810  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31587809 ttgttttggtatgagatatg 31587790  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12726299 - 12726089
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726299 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 12726200  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12726199 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagcgaatttcatgaattttattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 12726100  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  12726099 atgagatatgt 12726089  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40186787 - 40186577
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40186787 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaactcttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaacatctgaat 40186688  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40186687 caacatttttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 40186588  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  40186587 atgagatatgt 40186577  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 12848491 - 12848700
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12848491 tcttcatataaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 12848590  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12848591 caacatctttgttattgatctgtactatatttataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 12848690  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  12848691 atgagatatg 12848700  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47020550 - 47020341
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  47020550 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaaccatcatagatgtgcaaccaatatctgaat 47020451  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47020450 caacacctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 47020351  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  47020350 atgagatatg 47020341  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41118868 - 41118649
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41118868 aaaattgccttcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgataattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 41118769  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41118768 atatctgaatcaacatctttgttattgatgtgtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 41118669  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  41118668 ttgttttggtatgagatatg 41118649  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 31621987 - 31622196
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31621987 tcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaacccttactccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 31622086  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31622087 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcataaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttgat 31622186  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  31622187 atgagatatg 31622196  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 47455091 - 47455310
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47455091 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcatcatagatgtgcaacca 47455190  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47455191 atatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatctgtttattgt 47455290  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  47455291 ttgttttggtatcagatatg 47455310  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40431356 - 40431146
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40431356 tcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaat 40431257  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40431256 caacatctttgttattgatttgtactatattcataaagattagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 40431157  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  40431156 atgagatatgt 40431146  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 44291103 - 44291312
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44291103 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaactcttaccccctttcatctacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 44291202  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44291203 caacatctttgttattgttctgtactatattcataaaggtttgtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 44291302  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  44291303 atgagatatg 44291312  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9870483 - 9870274
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9870483 tcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttattatcattctgaacacttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcatccaatatctgaat 9870384  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9870383 caacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 9870284  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  9870283 atgagatatg 9870274  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38743302 - 38743100
Alignment:
Q  20 taaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatat 119  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38743302 taaaattttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttacctcctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatct 38743203  T
Q  120 ttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagata 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  38743202 ttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattatttgttttggcatgagata 38743103  T
Q  220 tgt 222  Q
    |||    
T  38743102 tgt 38743100  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9741317 - 9741106
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9741317 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 9741218  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9741217 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 9741127  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  9741126 ttgttttggtatgagatatgt 9741106  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 42076385 - 42076595
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42076385 tcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaaccgttaccccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaat 42076484  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42076485 caacatctttgttattgatttgtactatattcataaagattggtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 42076584  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  42076585 atgagatatgt 42076595  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 221
Target Start/End: Original strand, 25105043 - 25105235
Alignment:
Q  29 aaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattg 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25105043 aaaaacccatcttttatgattattctgaacctttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgaaatcaatatctgaatcaacatctttgttattg 25105142  T
Q  129 atctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25105143 atctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtatgagatatg 25105235  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 42697457 - 42697658
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||    
T  42697457 tctttatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcac---------gcaacaaatatctgaat 42697547  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42697548 caacatctttgttattgatctgtaatatattcataaaagttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttatatttgtttattgtttgttttggt 42697647  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  42697648 atgagatatgt 42697658  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 44508544 - 44508719
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttt-taaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44508544 aaaattgccctcttcatgtaaattttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 44508643  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcatttt 176  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  44508644 aatatctaaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgagtttcatgaattttatttt 44508719  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3112156 - 3111954
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3112156 tcttcatgtaaattactaaaaacctatcttttatgatcattatgaaccttcaccccctttcatccacaaattaccatagatgtgcaaccaagatctgaat 3112057  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3112056 caacatctttgtcattgatctgtactatattca-------tagtgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttcttttggt 3111964  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  3111963 atgagatatg 3111954  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 30888483 - 30888401
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatca 84  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30888483 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatattttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatca 30888401  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 44509059 - 44509108
Alignment:
Q  172 attttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44509059 attttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtatgagatatg 44509108  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38168127 - 38167987
Alignment:
Q  22 aatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaac 115  Q
    ||||| ||||||| | | |||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||      |||||||||    
T  38168127 aatttctaaaaaccccttttttgtgatcattttgaaccctcacctc-tttcatccgcaaatcaccataggtgtgcaaccaagatcaaagattgaatcaac 38168029  T
Q  116 atatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtga 157  Q
    ||  || | |||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  38168028 atcattttcattgatctgtgctctattcataaatgttagtga 38167987  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27419025 - 27418930
Alignment:
Q  107 tgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtt 202  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||  |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||    
T  27419025 tgaattaacatctttttcattgatcgatactctatccataaaggtcaatgaatttcatgaattttattatcgaagagtttctatttatttcttgtt 27418930  T

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Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1546273 - 1546053
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1546273 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 1546174  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1546173 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 1546074  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  1546073 ttgttttggtatgagatatgt 1546053  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 24348843 - 24349062
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348843 aaaattgccatcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 24348942  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24348943 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgattttctatttgtttattgt 24349042  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  24349043 ttgttttggtatgagatatg 24349062  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 44377822 - 44378041
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44377822 aaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 44377921  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44377922 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 44378021  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  44378022 ttgttttggtatgagatatg 44378041  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43973310 - 43973100
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43973310 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 43973211  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43973210 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcataaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 43973111  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  43973110 atgagatatgt 43973100  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 9745982 - 9746203
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9745982 taaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttacccccttttatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 9746081  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9746082 aatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaattttattttcgatgagtttctatttgtttattg 9746181  T
Q  201 tttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  9746182 tttgttttggtatgagatatgt 9746203  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 38252559 - 38252779
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38252559 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcattcacaaatcaccgtagatgtgcaacca 38252658  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38252659 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 38252758  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  38252759 ttgttttggtatgagatatgt 38252779  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 51754463 - 51754682
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51754463 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 51754562  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51754563 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttattgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 51754662  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  51754663 ttgttttggtatgagatatg 51754682  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 55274236 - 55274017
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55274236 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattatgaactcttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 55274137  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55274136 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 55274037  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  55274036 ttgttttggtatgagatatg 55274017  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5273668 - 5273450
Alignment:
Q  3 aaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaa 102  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5273668 aaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccgtagatgtgcaaccaa 5273569  T
Q  103 tatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtt 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273568 tatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtggatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtt 5273469  T
Q  203 tattttggtatgagatatg 221  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  5273468 tgttttggtatgacatatg 5273450  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49804940 - 49804730
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49804940 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 49804841  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49804840 caacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 49804741  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  49804740 atgagatatgt 49804730  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10049204 - 10048984
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10049204 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattatgaacccttaccctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 10049105  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10049104 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 10049005  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  10049004 ttgttttgatatgagatatgt 10048984  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51167266 - 51167047
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51167266 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 51167167  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51167166 atatctaaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggtcagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 51167067  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  51167066 ttgttttggtatgagatatg 51167047  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10471433 - 10471223
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10471433 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacctttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaactaatatctgaat 10471334  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10471333 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcataaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 10471234  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  10471233 atgagatatgt 10471223  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 23150779 - 23150998
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23150779 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctaaacccttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 23150878  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23150879 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 23150978  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  23150979 ttgttttgatatgagatatg 23150998  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8828692 - 8828486
Alignment:
Q  15 tcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8828692 tcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaactcttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaa 8828593  T
Q  115 catatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatg 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8828592 catctttgttattgatctgtactatattcataaaggtcggtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtatg 8828493  T
Q  215 agatatg 221  Q
    |||||||    
T  8828492 agatatg 8828486  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 22497290 - 22497500
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22497290 tcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaat 22497389  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22497390 caacatctttgttattgatttgtactatattcataaagattagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 22497489  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  22497490 atgagatatgt 22497500  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 27449541 - 27449751
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27449541 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttatcccctttcatccacaaattaccatagatgtgcaacaaatatctgaat 27449640  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27449641 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcataaatttcattttcgatgagtttctatttatttattgtttgttttggt 27449740  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  27449741 atgagatatgt 27449751  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 53019031 - 53019241
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53019031 tcttcatgtaaatgtttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaacccttaccccctttcatccacaaatcatcatagatgtgcaaccaatatctgaat 53019130  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53019131 caacatctttgttattgatctgtaatatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 53019230  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  53019231 atgagatatgt 53019241  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8068601 - 8068392
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8068601 tcttcatgtaaatttcttaaaactcatattttatgattattctgaacccttaccccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaat 8068502  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8068501 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 8068402  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  8068401 atgagatatg 8068392  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12227840 - 12227619
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12227840 aaaattgccctcttcacgtaaatttttaaaaacccatcttttatgattattctgaacccttacccccctttcatccacaaatcatcatagatgtgcaacc 12227741  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12227740 aatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 12227641  T
Q  201 tttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  12227640 tttgttttggtatgagatatgt 12227619  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 37821112 - 37821320
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37821112 tcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccgtacctc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 37821210  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37821211 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 37821310  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  37821311 atgagatatg 37821320  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 10659566 - 10659786
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10659566 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcgtttacgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 10659665  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10659666 atatcttaatcaacatctttgttattgatttgtaatatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 10659765  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  10659766 ttgttttggtatgagatatgt 10659786  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 13286970 - 13287190
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13286970 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgataattttgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 13287069  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13287070 atattagaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattttatgaattttattttcgatgagtttctatttgtttattgt 13287169  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  13287170 ttgttttggtatgagatatgt 13287190  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 24405821 - 24406038
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt--------tcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24405821 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttacccccttacctcctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaat 24405920  T
Q  104 atctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgttt 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24405921 atctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgttt 24406020  T
Q  204 attttggtatgagatatg 221  Q
     |||||||||||||||||    
T  24406021 gttttggtatgagatatg 24406038  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 2446001 - 2446220
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2446001 aaaattgccctcttcatgtgaatttttaaaaacccatattttatgatcattctgaacccttaccccatttcatccacaaatcacaatagatgtgcaacca 2446100  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2446101 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcaaaaagcttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 2446200  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  2446201 ttgttttggtatgagatatg 2446220  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 3019252 - 3019460
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3019252 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttataatcattctgaacccttatccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 3019350  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3019351 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaagattagtgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatctgtttattgtttgttttggt 3019450  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  3019451 atgagatatg 3019460  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 46528140 - 46528357
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt--------tcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46528140 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttacccccttacctcctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaat 46528239  T
Q  104 atctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgttt 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46528240 atctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcataaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgttt 46528339  T
Q  204 attttggtatgagatatg 221  Q
     |||||||||||||||||    
T  46528340 gttttggtatgagatatg 46528357  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41114183 - 41113973
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  41114183 tcttcatgtaaatttttaaaaatttatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaatcaatatctaaat 41114084  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41114083 caacatctttgttattgttctgtactatatttataaaggttggtgaatttcatgaattttattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 41113984  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  41113983 atgagatatgt 41113973  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 43218806 - 43219016
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43218806 tcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccgtagatgtgcaaccaatatttgaat 43218905  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43218906 caacatctttgttattgatttgtactatattcataaagattggtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 43219005  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  43219006 atgagatatgt 43219016  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 31655085 - 31655302
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31655085 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttacctcatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 31655184  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31655185 agatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttcta--tgtttattgt 31655282  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31655283 ttgttttggtatgagatatg 31655302  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17338558 - 17338348
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17338558 tcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttactccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaat 17338459  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17338458 caacatctttgttattgatttgtattatattcataaagattagtgaattttatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 17338359  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  17338358 atgagatatgt 17338348  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28555256 - 28555040
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555256 aaaattgtcttcttcatgtaaatttctaaaaacttatcttttatgatcattctgaacccttacctc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 28555158  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555157 agatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttc--gaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 28555060  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || ||||||||||| |||||    
T  28555059 ttgttttggtatgaaatatg 28555040  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20607770 - 20607570
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20607770 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctaaat 20607671  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20607670 caacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 20607580  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  20607579 atgagatatg 20607570  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26975548 - 26975354
Alignment:
Q  18 tgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacat 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26975548 tgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacat 26975449  T
Q  118 atttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgaga 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26975448 ctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgaga 26975358  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37126720 - 37126510
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37126720 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatatacaacca 37126621  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37126620 atatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 37126530  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  37126529 ttgttttggtatgagatatg 37126510  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 47697808 - 47698023
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccct-----ttcatccacaaatcaccatagatgtgc 96  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  47697808 aaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcaatctgaacccttacccccttccctttcatccacaaatcaccatagatgtgc 47697907  T
Q  97 aaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgttt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47697908 aaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttag---------tgaatttcattttcgatgagtttctatttgttt 47697998  T
Q  197 attgtttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  47697999 attgtttgttttggtatgagatatg 47698023  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Original strand, 35846787 - 35846954
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35846787 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 35846886  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatt 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35846887 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatnaatt 35846954  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 41454298 - 41454505
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 113  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41454298 ttcatgtaaattactaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccttcaccccctttcatccaaaaatcaccataaatgtgcaaccaagatctgaatca 41454397  T
Q  114 acatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 213  Q
    |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41454398 acatctttgtcattaatttgtactatattcataaagattagtgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 41454497  T
Q  214 gagatatg 221  Q
    ||||||||    
T  41454498 gagatatg 41454505  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 26229422 - 26229633
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26229422 tcttcatgtaaatgtttaaaaacccatcttttatga--------aacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 26229513  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttag---------tgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtt 202  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26229514 caacatcttagttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtt 26229613  T
Q  203 tattttggtatgagatatgt 222  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  26229614 tgttttggtatgagatatgt 26229633  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 164
Target Start/End: Original strand, 30357301 - 30357453
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30357301 tcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattttgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatatgtaaccaatatctgaat 30357400  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30357401 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 30357453  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 48458426 - 48458559
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48458426 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 48458525  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgta 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48458526 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgta 48458559  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Original strand, 501837 - 501975
Alignment:
Q  83 caccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatga 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  501837 caccatagatgcgcaaccaatatcagaatcaacatttttgccattgatttgtactctattcattaaggttagtgaatttcatgaatttcattttttaaga 501936  T
Q  183 gtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  501937 gtttctatttgtttattgtttgttttggtatgagatatg 501975  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35513149 - 35512933
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  35513149 aaaattgccctcttcatgtagatttttaaaaacccttctttcattatcattctgaaccttcaccccctttcatccaaaaatcatcatagatgtgctacca 35513050  T
Q  102 atatc------tgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtt 195  Q
    | |||      ||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||         |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35513049 agatcaaagattgaatcaacatatttttcattgatatgtattctattcataaaggttag---------tgaatttcattttccaagagtttctatttgtt 35512959  T
Q  196 tattgtttattttggtatgagatatg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  35512958 tattgtttgttttggtatgagatatg 35512933  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 998408 - 998292
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  998408 taaaattgccatcttcatgtaaatttctaaaaacccatgttttatgatcattctgaacccttaccccctttcattcacaaatcaccatagatgtacaacc 998309  T
Q  101 aatatctgaatcaacat 117  Q
    || ||||||||||||||    
T  998308 aagatctgaatcaacat 998292  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 222
Target Start/End: Original strand, 48477878 - 48477968
Alignment:
Q  132 tgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatgt 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48477878 tgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtatgagatatgt 48477968  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26718056 - 26717973
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcac 85  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26718056 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcac 26717973  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 33591130 - 33591194
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccc 66  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33591130 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccc 33591194  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Original strand, 501789 - 501837
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccc 60  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501789 tcttcatgtaaatttctaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccc 501837  T

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Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 25828716 - 25828936
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25828716 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 25828815  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25828816 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 25828915  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  25828916 ttgttttggtatgagatatgt 25828936  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 6978942 - 6979161
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6978942 aaaattgccttcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaactcttaccccctttcatccacaaatcaacatagatgtgcaacca 6979041  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6979042 atatctgaatcaacatttttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 6979141  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  6979142 ttgttttggtatgagatatg 6979161  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45502439 - 45502219
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45502439 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 45502340  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45502339 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 45502240  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  45502239 ttgttttggtatgagatatgt 45502219  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 30159063 - 30159272
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30159063 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaactcttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 30159162  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30159163 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcatttttgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 30159262  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  30159263 atgagatatg 30159272  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15476066 - 15475847
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15476066 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttattatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 15475967  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15475966 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaagttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 15475867  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  15475866 ttgttttggtatgagatatg 15475847  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 15907279 - 15907498
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15907279 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaatca 15907378  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15907379 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 15907478  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  15907479 ttgttttggtatgagatatg 15907498  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28226429 - 28226210
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28226429 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgattattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 28226330  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28226329 atatctgaatcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 28226230  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  28226229 ttgttttggtatgagatatg 28226210  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48542638 - 48542420
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48542638 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacacatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacaa 48542539  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48542538 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactgtattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 48542439  T
Q  202 ttattttggtatgagatat 220  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  48542438 ttgttttggtatgaaatat 48542420  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28068905 - 28068696
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28068905 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccataaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 28068806  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28068805 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttgat 28068706  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  28068705 atgagatatg 28068696  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37094228 - 37094019
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37094228 tcttcatgtaaatttttaaaaacccctcttttacgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 37094129  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37094128 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 37094029  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  37094028 atgagatatg 37094019  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 3770544 - 3770763
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3770544 aaaattgccttcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgcgcaacca 3770643  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3770644 atatataaatcaatatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 3770743  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  3770744 ttgttttggtatgagatatg 3770763  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 47534050 - 47534260
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47534050 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 47534149  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47534150 caacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 47534249  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  47534250 atgagatatgt 47534260  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 42885317 - 42885526
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42885317 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatacacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 42885416  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42885417 caacatctttgttattgatatgtactatattcttaaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 42885516  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  42885517 atgagatatg 42885526  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52469509 - 52469300
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52469509 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattatgaaccattaccccctttcttccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctaaat 52469410  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52469409 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 52469310  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  52469309 atgagatatg 52469300  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 40359706 - 40359926
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40359706 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaacccttacctcctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 40359805  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40359806 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 40359905  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  40359906 ttgttttggtatgagatatgt 40359926  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44234112 - 44233893
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44234112 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatcaacaaatcaccatagatgtgcaacca 44234013  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44234012 agatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 44233913  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  44233912 ttgttttggtatgagatatg 44233893  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 46674794 - 46675004
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46674794 tcttcatgtaaatttttaaaatcccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgtaaccaatatctgaat 46674893  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46674894 caacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 46674993  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  46674994 atgagatatgt 46675004  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24180635 - 24180426
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactc-atcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180635 ttcatgtaaatttttaaaaaccccatcttttatgatcattctgaacccttacaccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatc 24180536  T
Q  113 aacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggta 212  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180535 aacatttttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggta 24180436  T
Q  213 tgagatatgt 222  Q
    ||||||||||    
T  24180435 tgagatatgt 24180426  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 3046801 - 3047021
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3046801 taaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttatatcctttcatccacaaattaccatagatgtgcaacc 3046900  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3046901 aatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttaatgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttatttattg 3047000  T
Q  201 tttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  3047001 tttgttttggtatgagatatg 3047021  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 13556116 - 13556336
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13556116 aaaattgccctcttcatgtcaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcgtccacaaatcaccatagttgtgcaacca 13556215  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13556216 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcatttccaatgagtttctatttgtttattgt 13556315  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  13556316 ttgctttggtatgagatatgt 13556336  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29033740 - 29033532
Alignment:
Q  13 cttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29033740 cttcatgtaaatttttaaaaacttattttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccataaatcaccatagatgtgcaaccaatatctaaatc 29033641  T
Q  113 aacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggta 212  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29033640 aacatctttcttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttatatttgtttattgtttattttggta 29033541  T
Q  213 tgagatatg 221  Q
    |||||||||    
T  29033540 tgagatatg 29033532  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 30361195 - 30361414
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30361195 aaaattgctctcttcatgtaaatttctaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccccttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 30361294  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30361295 agatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgagtttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 30361394  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  30361395 ttgttttggtatgagatatg 30361414  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 35719750 - 35719971
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactc-atcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35719750 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccccatcttttatgatcattctgaacccttacaccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 35719849  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35719850 aatatctgaatcaacatttttgttattaatttgtactatattcataaaggttagtgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 35719949  T
Q  201 tttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  35719950 tttgttttggtatgagatatgt 35719971  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3994946 - 3994734
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3994946 tcttcatgaaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacacttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtacaaccaatatctgaat 3994847  T
Q  112 caacatatttgtt---attgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttatttt 208  Q
    |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3994846 caacatctttgttgttattgatctgtactatattcataaaggttaatgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttt 3994747  T
Q  209 ggtatgagatatg 221  Q
    |||||||||||||    
T  3994746 ggtatgagatatg 3994734  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 49456888 - 49457098
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49456888 tcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaacccttaccatctttcatccacaaatcactatagatgtgcaaccaatatctgaat 49456987  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  49456988 caacatctttattattgatctgtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaatttcattttcgataagtttctatttatttattgtttgttttggt 49457087  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  49457088 atgagatatgt 49457098  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 18604898 - 18605117
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18604898 aaaattgccctcttcatgtaaattactaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctcaccccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 18604997  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18604998 agatctgaatcaacatctttgtcattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatttatttattgt 18605097  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  18605098 ttgttttggtatgagatatg 18605117  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44054903 - 44054684
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44054903 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattttgaacccttaccccttttcatccacaaatcaccatagatgtacaacca 44054804  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44054803 agatttaaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgttttttgt 44054704  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  44054703 ttgttttggtatgagatatg 44054684  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4490217 - 4490011
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4490217 tcttcatgtaaatttctaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttactctctttcatccataaatcaccatagatgtgcaaccaagatttgaat 4490118  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  4490117 caacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttcta--tgtttattgtttgttttggt 4490020  T
Q  212 atgagatat 220  Q
    |||||||||    
T  4490019 atgagatat 4490011  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 3416355 - 3416556
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  3416355 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaacccttaccccctttcatccacaaatcac---------gcaaccaatatctgaat 3416445  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3416446 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggtcagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 3416545  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  3416546 atgagatatgt 3416556  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25729996 - 25729796
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25729996 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatga---------aaccttacccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 25729907  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25729906 caacatctttgttattgatctatactatattcataaaggttagtgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 25729807  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  25729806 atgagatatgt 25729796  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 8895672 - 8895871
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8895672 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaactcttaccccctttcatccacaaatcac-atagatgtgcaaccaatatctgaat 8895770  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8895771 caacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttag---------tgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 8895861  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31760778 - 31760578
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31760778 tcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtacaaccaagatctgaat 31760679  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31760678 caacatctttgttattgatatgtattatattcataaaggttagtgaatt---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 31760588  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  31760587 atgagatatg 31760578  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17580959 - 17580759
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17580959 tcttcatgtaattttctaaaaacctatcttttatgatcattctgaactcttaccccctttcatccacaaatcaccatagatatgcaaccaagatctgaat 17580860  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17580859 caacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 17580769  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  17580768 atgagatatg 17580759  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43106593 - 43106406
Alignment:
Q  25 ttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgtt 124  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43106593 ttttaaaaacctatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatcaaaaaatcaccatagatatacaaccaatatctgaatcaacatctttgtt 43106494  T
Q  125 attgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatg 221  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43106493 attgatatgtaatatattcataaaggttagtgaatt---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtatgagatatg 43106406  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 50490842 - 50490974
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50490842 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 50490941  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgt 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50490942 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgt 50490974  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11493657 - 11493513
Alignment:
Q  68 ctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  11493657 ctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt------- 11493565  T
Q  168 tttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatg 221  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11493564 --tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtatgagatatg 11493513  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11335637 - 11335493
Alignment:
Q  68 ctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  11335637 ctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatt------- 11335545  T
Q  168 tttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatg 221  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11335544 --tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtatgagatatg 11335493  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 46234408 - 46234296
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46234408 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcattcacaaatcaccatagatgtacaaccaatatctgaat 46234309  T
Q  112 caacatatttgtt 124  Q
    |||||| ||||||    
T  46234308 caacatctttgtt 46234296  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26770211 - 26770097
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26770211 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 26770112  T
Q  102 atatctgaatcaaca 116  Q
    | |||||||||||||    
T  26770111 agatctgaatcaaca 26770097  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17926260 - 17926068
Alignment:
Q  18 tgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacat 117  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17926260 tgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaattttttccct-tttcatctacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaatcaacat 17926162  T
Q  118 atttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgaga 217  Q
     ||||| ||||||||||| | ||||||||          |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17926161 ctttgtcattgatctgtaatctattcata----------aatttcatgaattttattttctaatagtttctatttgtttatggtttgttttggtatgaga 17926072  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 49740137 - 49740258
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49740137 ttcatgtaaatttctaaaaacccatcttatataatcattctgaattttcacctcctttcatccacaaatcactatagatgtgcaaccaagatctgaatca 49740236  T
Q  114 acatatttgttattgatctgta 135  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  49740237 acatctttgtcattgatctgta 49740258  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 20599671 - 20599594
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccata 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20599671 tcttcatgtaaatttttaaaaacttatattttatgatcattctgaacccttaccccctttcatacacaaatcaccata 20599594  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 46234295 - 46234222
Alignment:
Q  149 ggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46234295 ggttagtgaatttcatgaatttcaatttcgatgaggttctatttgtttattgtttgttttggtatgagatatgt 46234222  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 164
Target Start/End: Original strand, 17137000 - 17137104
Alignment:
Q  66 ccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatc------tgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||      ||||||||||| ||| | ||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  17137000 ccctttcatccacaaatcaccatagatgtaaaatcaagatcaaagattgaatcaacatctttttcattgatcggtgctttattcataaaggttagtgaat 17137099  T
Q  160 ttcat 164  Q
    |||||    
T  17137100 ttcat 17137104  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Original strand, 8969515 - 8969607
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaata 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||  | ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||   |||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  8969515 tcttcatgtaaatttctaaaaatccttctttcattatcattctgaaccctcaccccttttctcgcacaaaccaccatagatatgcaatcaata 8969607  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 7042943 - 7042840
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttacccc-ctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||   ||||| || |||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |    
T  7042943 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaaccattctttcattatcattttgaaccctcacccctttttcacccacaaaccaccatggatatgcaatc 7042844  T
Q  101 aata 104  Q
    ||||    
T  7042843 aata 7042840  T

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Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21867069 - 21866850
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21867069 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 21866970  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21866969 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 21866870  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  21866869 ttgttttggtatgagatatg 21866850  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11124419 - 11124199
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11124419 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 11124320  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11124319 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 11124220  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  11124219 ttgttttggtatgagatatgt 11124199  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 2357388 - 2357597
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357388 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 2357487  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2357488 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattggttgttttggt 2357587  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  2357588 atgagatatg 2357597  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30787217 - 30787010
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30787217 ttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatta 30787118  T
Q  114 acatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30787117 acatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 30787018  T
Q  214 gagatatg 221  Q
    ||||||||    
T  30787017 gagatatg 30787010  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 20115112 - 20115321
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20115112 tcttcatgtaaattttttaaaacccatcttttatgatcattctgaacctttaccctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 20115211  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20115212 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 20115311  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  20115312 atgagatatg 20115321  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26479928 - 26479719
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26479928 tcttcatgtaaatttttaaaaaccaatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 26479829  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26479828 caacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtaaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 26479729  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  26479728 atgagatatg 26479719  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19390657 - 19390437
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390657 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaacccttaccccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 19390558  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19390557 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 19390458  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  19390457 ttgttttggtatgagatatgt 19390437  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 8113738 - 8113951
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaaccctta----ccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8113738 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttacttaccccctttcatccacaagtcaccatagatgtgcaaccaatatct 8113837  T
Q  108 gaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8113838 gaatcaacatatttgttattgatctgtactatatttataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttt 8113937  T
Q  208 tggtatgagatatg 221  Q
    ||||||||||||||    
T  8113938 tggtatgagatatg 8113951  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 25336577 - 25336784
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25336577 ttcatgtaaatttttaaaaatctatcttttatgattattctgaacctttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 25336676  T
Q  114 acatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25336677 acatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 25336776  T
Q  214 gagatatg 221  Q
    ||||||||    
T  25336777 gagatatg 25336784  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 6034451 - 6034673
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactc-atcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaac 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6034451 taaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccccatcttttatgatcattctgaacccttacaccctttcatccacaaatcactatagatgtgcaac 6034550  T
Q  100 caatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttatt 199  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6034551 taatatctgaatcaacatttttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttatt 6034650  T
Q  200 gtttattttggtatgagatatgt 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  6034651 gtttgttttggtatgaaatatgt 6034673  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 12242793 - 12243005
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccc--tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12242793 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccccatttcatccacaaatcatcatagatgtgcaaccaatatctga 12242892  T
Q  110 atcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttg 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12242893 atcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaagttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttg 12242992  T
Q  210 gtatgagatatgt 222  Q
    |||||||||||||    
T  12242993 gtatgagatatgt 12243005  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17977833 - 17977612
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactc-atcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17977833 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcacaatagatgtgcaacc 17977734  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17977733 aatatctgaatcaacaactttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgacgagtttctatttgtttattg 17977634  T
Q  201 tttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  17977633 tttgttttggtatgatatatgt 17977612  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41568782 - 41568573
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41568782 tcttcatgtaaatttctaaaaactcatcttttatgatcattttgaacccttaccccttttcatccacaaatcaccatagatgtacaaccaagatctgaat 41568683  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41568682 catcatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 41568583  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  41568582 atgagatatg 41568573  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39430335 - 39430126
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  39430335 tcttcatgtaaatttctaaaaactcatattttatgatcattctgaacccttaccccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatttaaat 39430236  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39430235 caatatatttgttattgatctgtactatatttataaaggttagtgaatttaatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 39430136  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  39430135 atgagatatg 39430126  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33965521 - 33965311
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33965521 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttgccctctttcatccacaaatcaccataaatgtgcaaccaatatctgaat 33965422  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33965421 caacatctctgttattgatttgtattatattcataaaggtcagtgaatttcatgaatttcatttttgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 33965322  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  33965321 atgagatatgt 33965311  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2372179 - 2371968
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2372179 taaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaatc 2372080  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2372079 aatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattg 2371989  T
Q  201 tttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  2371988 tttgttttggtatgagatatg 2371968  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14287527 - 14287327
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14287527 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacctttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 14287428  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14287427 taacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt---------tcattttcgatgagtttctatttatttattgtttgttttggt 14287337  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  14287336 atgagatatg 14287327  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31547350 - 31547147
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||    
T  31547350 tcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaacccttacctcctttcatccacaaatcaccatatatgtg-------tatctgaat 31547258  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31547257 caacatctttgttattgatctgtactatattcttaaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattatttgttttggt 31547158  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  31547157 atgagatatgt 31547147  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2380367 - 2380166
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2380367 tcttcatgtaaatttttaaaaatcaatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaat 2380268  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2380267 caacatctttgttattgatttgtactatattcataaagatta---------atgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 2380177  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  2380176 atgagatatgt 2380166  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 4049500 - 4049696
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4049500 aaaattgtcttcttcatgtaaatttttaaaaac-catcttttatgattattctgaacccttaccccctttcatctacaaatcaccatagatgtgcaacca 4049598  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    ||||||||||||||||||                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4049599 atatctgaatcaacatat----------------------tcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttttatttgtttattgt 4049676  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1222413 - 1222305
Alignment:
Q  113 aacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggta 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1222413 aacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttaatgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggta 1222314  T
Q  213 tgagatatg 221  Q
    |||||||||    
T  1222313 tgagatatg 1222305  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 11978819 - 11978931
Alignment:
Q  18 tgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacat 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11978819 tgtaaatttttaaaaacccattttttatgatcattctgaactcttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaatcaatatttgaatcaacat 11978918  T
Q  118 atttgttattgat 130  Q
     ||| ||||||||    
T  11978919 ctttattattgat 11978931  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 1222710 - 1222638
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttca 73  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1222710 taaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttatcccctttca 1222638  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 11978930 - 11978979
Alignment:
Q  172 attttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11978930 attttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtatgagatatg 11978979  T

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Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28867762 - 28867541
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28867762 aaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 28867663  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttg-tttattg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28867662 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgttttattg 28867563  T
Q  201 tttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  28867562 tttgttttggtatgagatatgt 28867541  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11005699 - 11005479
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005699 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 11005600  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11005599 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 11005500  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  11005499 ttgttttggtatgagatatgt 11005479  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 29923641 - 29923861
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29923641 taaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacctatcttttatgatcattttgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 29923740  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29923741 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 29923840  T
Q  201 tttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  29923841 tttgttttggtatgagatatg 29923861  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 50621713 - 50621923
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621713 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 50621812  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50621813 caaaatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 50621912  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  50621913 atgagatatgt 50621923  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 2491872 - 2492092
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2491872 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 2491971  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2491972 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaattttattttcaatgagtttctatttgtttattgt 2492071  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  2492072 ttgttttggtatgagatatgt 2492092  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39677742 - 39677532
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39677742 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 39677643  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39677642 caacatctttattattgatttgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 39677543  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  39677542 atgagatatgt 39677532  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7327733 - 7327524
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7327733 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaatctttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacaaatatctgaat 7327634  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7327633 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 7327534  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  7327533 atgagatatg 7327524  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 22169150 - 22169370
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22169150 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 22169249  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22169250 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaattttattttcgatgagtttctatttgtttattgt 22169349  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  22169350 ttgttttggtatgagatatgt 22169370  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33961848 - 33961628
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33961848 aaaattgccatcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttctgatcattctgaacccttactccctttcatccacaaatcaccataggtgtgcaacca 33961749  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33961748 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 33961649  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  33961648 ttgttttggtatgagatatgt 33961628  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3932036 - 3931815
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaac-tcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3932036 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacctcatcttttatgatcattctgaacccttacccccttttatccacaaatcaccatagatgtgtaacc 3931937  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3931936 aatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 3931837  T
Q  201 tttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3931836 tttattttggtatgagatatgt 3931815  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 45884609 - 45884818
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45884609 tcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 45884708  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45884709 caacatctttgttattgatctctactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgttggttttggt 45884808  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  45884809 atgagatatg 45884818  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36309050 - 36308830
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36309050 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttactccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 36308951  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36308950 atatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgaatttctatttgtttattgt 36308851  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  36308850 ttgttttggtatgagatatgt 36308830  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 56162514 - 56162734
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56162514 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 56162613  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  56162614 atatatgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 56162713  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  56162714 ttgttttggtatgagatatgt 56162734  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 26488391 - 26488613
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttacccc--ctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaac 99  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26488391 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccccctttcatccacaaatcatcatagatgtgcaac 26488490  T
Q  100 caatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttatt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26488491 caatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttatt 26488590  T
Q  200 gtttattttggtatgagatatgt 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  26488591 gtttgttttggtatgagatatgt 26488613  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36225180 - 36224961
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36225180 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaactcttactccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 36225081  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36225080 atatctgaatcaacatctttattattgatctgtactatattcataaaggatagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 36224981  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  36224980 ttgttttggtatgagatatg 36224961  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36432533 - 36432315
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36432533 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaac-catcttttatgatcattctgaacccttactccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 36432435  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36432434 atatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggtcagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 36432335  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  36432334 ttgttttggtatgagatatg 36432315  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 20492554 - 20492764
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20492554 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctaaaacattaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaactaatatctgaat 20492653  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20492654 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgactttctatttgtttattgtttgttttggt 20492753  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  20492754 atgagatatgt 20492764  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 54202381 - 54202591
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54202381 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatttgcaaccaatatctgaat 54202480  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54202481 caacatatttattattgatctgtactatattcataaagattaatgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 54202580  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  54202581 atgagatatgt 54202591  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3874607 - 3874398
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3874607 tcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccaaagatgtgcaaccaagatctgaat 3874508  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3874507 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 3874408  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  3874407 atgagatatg 3874398  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27767682 - 27767463
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27767682 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaacccttacccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 27767584  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27767583 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 27767484  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  27767483 ttgttttggtatgagatatgt 27767463  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7554487 - 7554268
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  7554487 aaaattgccatcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaacccttaccccctttcattcataaaccaccatagatgtgcaacca 7554388  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554387 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaagattagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 7554288  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  7554287 ttgttttggtatgagatatg 7554268  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3875702 - 3875493
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875702 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatattttatgatcattctgaacccttatcccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 3875603  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3875602 caacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 3875503  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  3875502 atgagatatg 3875493  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41764727 - 41764518
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41764727 tcttcatgtaaatttttaaaaacttatcttttatgatcattctgaactcttacctccttttatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 41764628  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41764627 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagcgaatttcatgaatttcattttcgatgaatttctatttgtttattgtttgttttggt 41764528  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  41764527 atgagatatg 41764518  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 55282519 - 55282300
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55282519 aaaattgccctcttcatgtaattttttaaaaacccatattttatgatcattctgaacccttacctc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 55282421  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55282420 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttatttattgt 55282321  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  55282320 ttgttttggtatgagatatgt 55282300  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24745037 - 24744826
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24745037 aaaattgccctcttcatataaatttttaaaaatccatcttttataatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 24744938  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744937 atatctaaatcaacatctttgttattaatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 24744838  T
Q  202 ttattttggtat 213  Q
    || |||||||||    
T  24744837 ttgttttggtat 24744826  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49332169 - 49331959
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49332169 tcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaat 49332070  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49332069 caacatctttgttattgatttgtactgtattcataaagatcagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 49331970  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  49331969 atgagatatgt 49331959  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29933580 - 29933369
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||    
T  29933580 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgattattctgaacccttaccctctttcatccacaaatcac---------gcaacca 29933490  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29933489 atatctgaatcaacatctctgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 29933390  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  29933389 ttgttttggtatgagatatgt 29933369  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17445697 - 17445497
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17445697 tcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaat 17445598  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17445597 caacatctttgttattgacatgtactatattcataaaggttagtgaatt---------tcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 17445507  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  17445506 atgagatatg 17445497  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 44878093 - 44878302
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44878093 tcttcatgtaaatttctagaaactcatcttttatgatcgttctgaaccttcaccccctttcatccataaatcaccatagatgtgcaactaagatctgaat 44878192  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  44878193 caacatctttgtcattgatttgtactatattcataaatgttagtgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtttttgt 44878292  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  44878293 atgagatatg 44878302  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43957894 - 43957695
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  43957894 ttcatgtaaaattttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcac---------gcaaccaatatctgaatca 43957804  T
Q  114 acatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43957803 acatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 43957704  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35949539 - 35949338
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||    
T  35949539 tctttatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcac---------gcaacaaatatctgaat 35949449  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35949448 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttatatttgtttattgtttgttttggt 35949349  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  35949348 atgagatatgt 35949338  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28573815 - 28573609
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28573815 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatct-------------tgaacccttaccccctttcatccacaaatcactatagatgtgcaacca 28573729  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28573728 atatctgaatcaacatctttgttattaatttgtacgatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 28573629  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  28573628 ttgttttggtatgagatatg 28573609  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Original strand, 11308819 - 11308953
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11308819 ttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaattctcaccccctttcatccacaaatcaccatatatgtgcaaccaagatctgaatca 11308918  T
Q  114 acatatttgttattgatctgtactatattcataaa 148  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  11308919 acatctttgtcattgatctgtaatctattcataaa 11308953  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11381954 - 11381821
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11381954 ttcaagtaaatttctaaaaactcatcttttatgatcattctaaattctcacccc-tttcatccacaaatcatcatagatgtgcaaccaagatctgaatca 11381856  T
Q  114 acatatttgttattgatctgtactatattcataaa 148  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  11381855 acatctttgtcattgatctgtaatctattcataaa 11381821  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 85
Target Start/End: Original strand, 55541865 - 55541948
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcac 85  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55541865 aaaattgctctcttcatgtaaaattttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcac 55541948  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Original strand, 11308952 - 11309007
Alignment:
Q  166 aatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11308952 aatttcattttctaagagtttctatttgtttatggtttgttttggtatgagatatg 11309007  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7326485 - 7326317
Alignment:
Q  3 aaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactc-atcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    |||||||  ||| |||||||| || ||||||| | || ||| ||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |    
T  7326485 aaattgccctctccatgtaaaattctaaaaaccccatttttcatgatcattttgaacctttaacctctttcacccacaaaccaccatagatgttaaacaa 7326386  T
Q  102 atatc------tgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 164  Q
    | |||      ||||||||||| ||| | | |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7326385 agatcaaagattgaatcaacatctttttcactgatcgatacactattcataaaggttagtgaatttcat 7326317  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 94
Target Start/End: Original strand, 16319341 - 16319369
Alignment:
Q  66 ccctttcatccacaaatcaccatagatgt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16319341 ccctttcatccacaaatcaccatagatgt 16319369  T

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Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35393605 - 35393385
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35393605 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 35393506  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35393505 atatctgaatcaaaatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 35393406  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  35393405 ttgttttggtatgagatatgt 35393385  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 11020443 - 11020663
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11020443 aaaattgccctcttcatataaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 11020542  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11020543 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaattttattttcgatgagtttctatttgtttattgt 11020642  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  11020643 ttgttttggtatgagatatgt 11020663  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 29997534 - 29997754
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29997534 aaaattgccttcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgattattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacaa 29997633  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29997634 atatctgaatcaacatttttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattat 29997733  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  29997734 ttgttttggtatgagatatgt 29997754  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38098858 - 38098648
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38098858 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcgttctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 38098759  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38098758 caacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 38098659  T
Q  212 atgagatatgt 222  Q
    |||||||||||    
T  38098658 atgagatatgt 38098648  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 483231 - 483022
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  483231 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaactaatatctgaat 483132  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  483131 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 483032  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  483031 atgagatatg 483022  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 39780352 - 39780573
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactc-atcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39780352 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaaccccatcttttatgatcattctgaacccttacaccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 39780451  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39780452 aatatctgaatcaacatttttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 39780551  T
Q  201 tttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  39780552 tttgttttggtatgagatatgt 39780573  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 8352420 - 8352640
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8352420 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttcccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 8352519  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8352520 atatctgaatcaacatttttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcatttttgatgagtttctatttgtttattgt 8352619  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  8352620 ttgttttggtatgagatatgt 8352640  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 36781692 - 36781912
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36781692 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattttgaacccttaccccctttcatccacaaatcatcatagatgtgcaacca 36781791  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36781792 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattttatgaatttcattttcgatgaatttctatttgtttattgt 36781891  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  36781892 ttgttttggtatgagatatgt 36781912  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 30655041 - 30655260
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655041 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacctattttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 30655140  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655141 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggctagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 30655240  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  30655241 ttgttttggtatgagatatg 30655260  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 33411085 - 33411306
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttt-taaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411085 aaaattgccctcttcatgtaaattttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaacccttaccctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 33411184  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411185 aatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagggaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 33411284  T
Q  201 tttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  33411285 tttgttttggtatgagatatgt 33411306  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 20187522 - 20187731
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20187522 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaactcttaccccctttcatctacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 20187621  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20187622 caacatctttgttattgttctgtactatattcataaaggtttgtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 20187721  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  20187722 atgagatatg 20187731  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 20206591 - 20206800
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20206591 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattatgaactcttaccccctttcatctacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 20206690  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20206691 caacatctttgttattgttctgtactatattcataaaggtttgtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 20206790  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  20206791 atgagatatg 20206800  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24757841 - 24757633
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24757841 tcttcatgtaaatttttaaaaacccat-ttttatgatcattctgaactcttaccccttttcatccacaaatcaccatagatgtgcaatcaatatctgaat 24757743  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24757742 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 24757643  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  24757642 atgagatatg 24757633  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25487298 - 25487089
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25487298 tcttcatgtaaatttctaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcagccaagatctgaat 25487199  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25487198 caacatcttttttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaacttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 25487099  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  25487098 atgagatatg 25487089  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 31097555 - 31097765
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31097555 aaaattgtcttcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatga---------acccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 31097645  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31097646 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgttttttgt 31097745  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31097746 ttgttttggtatgagatatg 31097765  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30700084 - 30699879
Alignment:
Q  18 tgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaaca- 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30700084 tgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacat 30699985  T
Q  117 -tatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatga 215  Q
     | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30699984 ttttttgttattaatttgtactatattcataaaggttaatgaatttcataaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgtattggtatga 30699885  T
Q  216 gatatg 221  Q
    ||||||    
T  30699884 gatatg 30699879  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26416373 - 26416164
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26416373 tcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgattattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcacaatagatgtgcaaccaagatctgaat 26416274  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26416273 caacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggtcagtgaatttcaagaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggc 26416174  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    |||| |||||    
T  26416173 atgaaatatg 26416164  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1105028 - 1104810
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1105028 aaaattgctttcttcatgtaaattactaaaaacccatcttttatgataattctgaactctcacccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 1104930  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1104929 agatctgaatcaacatctttgtcattgatctgtactatattcataaaggttagtgaattttatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 1104830  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  1104829 ttgttttggtatgagatatg 1104810  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 12986711 - 12986920
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  12986711 aaaattgccctcttcgtgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttacca--tttcatccacaaattatcatagatgtgaaacca 12986808  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12986809 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttag---------tgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 12986899  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  12986900 ttgttttagtatgagatatgt 12986920  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Original strand, 45084285 - 45084464
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||    
T  45084285 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcac---------gcaacca 45084375  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctat 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45084376 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctat 45084464  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 221
Target Start/End: Original strand, 20819064 - 20819172
Alignment:
Q  113 aacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggta 212  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20819064 aacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggta 20819163  T
Q  213 tgagatatg 221  Q
    |||||||||    
T  20819164 tgagatatg 20819172  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 27719282 - 27719397
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27719282 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 27719381  T
Q  102 atatctgaatcaacat 117  Q
    | ||||||||||||||    
T  27719382 agatctgaatcaacat 27719397  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 5458300 - 5458442
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5458300 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaatt-tcaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 5458398  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcat 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  5458399 agatctgaatcaacatctttgtcattgatcggtaatctattcat 5458442  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 164
Target Start/End: Original strand, 18574843 - 18575002
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaa-ctcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatc---- 106  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||  || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        
T  18574843 tcttcatgtaaatttgtaaaaaactcttcttccattatcattttgaaccctcaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatcaaat 18574942  T
Q  107 --tgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 164  Q
      |||||||||   ||| | |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  18574943 attgaatcaactactttttcattgatatgtactctattcataaaagttactgaatttcat 18575002  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 70
Target Start/End: Original strand, 20818995 - 20819063
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt 70  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20818995 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt 20819063  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 32834639 - 32834709
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaat 82  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32834639 tcttcatgtaaatttttaaaaatccattttttatgattattctgaacccttatcccctttcatccacaaat 32834709  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 221
Target Start/End: Original strand, 5458438 - 5458499
Alignment:
Q  160 ttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatg 221  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5458438 ttcatgaatttcattttctaagagtttctatttgtttatggtttgttttggtatgagatatg 5458499  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 20524991 - 20525086
Alignment:
Q  11 ttcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatct 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||| | |||||| ||| ||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  20524991 ttcttcatgtaaattttttaaaac-cttctttcattatcactttgaacctttatcccttttcacccaaaaatcatcatggatgtgcaatcaatatct 20525086  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29225942 - 29225858
Alignment:
Q  107 tgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatt 191  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||| | | || ||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||    
T  29225942 tgaatcaacttatttttcattgatatgtactctattcacataagtaagtgaatttcatgaatttcttcattgaagagtttctatt 29225858  T

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Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42675745 - 42675525
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42675745 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 42675646  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42675645 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcataaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 42675546  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  42675545 ttgttttggtatgagatatgt 42675525  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3390918 - 3390698
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390918 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 3390819  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3390818 atatctgaatcaacatctttgttattgatctttactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 3390719  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  3390718 ttgatttggtatgagatatgt 3390698  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 25031464 - 25031683
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25031464 aaaattgcactcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaatccttaccccctttcatccacaaatcaccgtagatatgcaacca 25031563  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25031564 atatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 25031663  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  25031664 ttgttttggtatgagatatg 25031683  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8836607 - 8836399
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8836607 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt-catccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 8836509  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8836508 caacatctttgttattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 8836409  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  8836408 atgagatatg 8836399  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41743437 - 41743228
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41743437 tcttcatgtaaatttttaaaaattcatcttttatgatcattttgaacccttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 41743338  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41743337 caacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 41743238  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  41743237 atgagatatg 41743228  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 29296237 - 29296448
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaat-atctgaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29296237 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaactcttaccctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaattatctgaa 29296336  T
Q  111 tcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttgg 210  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29296337 tcaacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttgg 29296436  T
Q  211 tatgagatatgt 222  Q
    ||||||||||||    
T  29296437 tatgagatatgt 29296448  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 8335359 - 8335578
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8335359 aaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctttccctctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 8335458  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8335459 atatctgaatcaacatctatgttattgatctgtaatatattcataaaagttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 8335558  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  8335559 ttgttttggtatgagatatg 8335578  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35066130 - 35065908
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35066130 aaaattgctctcttcatgtaaatttttaaaaacccat-ttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 35066032  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtt---tat 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  35066031 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattat 35065932  T
Q  199 tgtttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    
T  35065931 tgtttgttttggtataagatatgt 35065908  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36484675 - 36484467
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36484675 ttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatttgaatca 36484576  T
Q  114 acatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36484575 acatctttgttattgatttgtactatattcataaagattagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 36484476  T
Q  214 gagatatgt 222  Q
    |||||||||    
T  36484475 gagatatgt 36484467  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23191971 - 23191749
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23191971 taaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaatc 23191872  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttc---tatttgttta 197  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  23191871 aagatctgaatcaacatctttgtta-tgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctattatttgttta 23191773  T
Q  198 ttgtttattttggtatgagatatg 221  Q
     ||||| || ||||||||||||||    
T  23191772 atgtttgttatggtatgagatatg 23191749  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 6230263 - 6230474
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6230263 taaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaactcatattttatgatcattctgaacccttatcccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 6230362  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6230363 aatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttag---------tgaatttcattttcgatgagtttctatttatttattg 6230453  T
Q  201 tttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  6230454 tttgttttggtatgagatatg 6230474  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10691997 - 10691787
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10691997 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttacccgatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 10691898  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10691897 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggtta---------atgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 10691807  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  10691806 ttattttggtatgaaatatg 10691787  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 18185802 - 18185995
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18185802 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattttgaactcttacccc-tttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 18185900  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgttt 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18185901 atatctgaatcaacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgttt 18185995  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27771336 - 27771129
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27771336 tcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaactcttacctcatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaat 27771237  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||    
T  27771236 caacatctttgttattgatatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtt--tatatgtttattgtttgttttggt 27771139  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  27771138 atgagatatg 27771129  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 28349084 - 28349291
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28349084 tcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatgattctgaacccttacctcatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaagatctgaat 28349183  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  28349184 caacatctttgttattggtatgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttcta--tgtttattgtttgttttggt 28349281  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  28349282 atgagatatg 28349291  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15472753 - 15472537
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctt-----tcatccacaaatcaccatagatgtgc 96  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  15472753 aaaattgtcttcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcaatctgaacccttacccccttccctttcatccacaaatcaccatagatgtgc 15472654  T
Q  97 aaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgttt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15472653 aaccaatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatt---------tcattttcgatgagtttctatctgttt 15472563  T
Q  197 attgtttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15472562 attgtttgttttggtatgagatatgt 15472537  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 1421021 - 1421220
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  1421021 ttcatgtaaaattttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcac---------gcaaccaatatctgaatca 1421111  T
Q  114 acatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1421112 acatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtat 1421211  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 164
Target Start/End: Original strand, 42221766 - 42221928
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42221766 aaaattgcactcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccataggtgtgcaacca 42221865  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 164  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42221866 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcat 42221928  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33591781 - 33591589
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33591781 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaatccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 33591682  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33591681 atatctgaatcaacatctttgttattgatcagtactatattcataaaggtta---------ttgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 33591591  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8782771 - 8782561
Alignment:
Q  1 taaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8782771 taaaattgtcttgttcatgtaaatttctaaaaacccatctttcatgatcattctgaattctcaccccctttcatccacaaattaccatagatgtgcaacc 8782672  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    || || ||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||          |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  8782671 aagatttgaatcaacatctttgccattgatctgtaatctattcata----------aatttcatgaattttattttctaagagtttctatttgtttatgg 8782582  T
Q  201 tttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  8782581 ttttttttggtatgagatatg 8782561  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 222
Target Start/End: Original strand, 18617562 - 18617665
Alignment:
Q  119 tttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagat 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18617562 tttgttattgatctgtactgtattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtatgagat 18617661  T
Q  219 atgt 222  Q
    ||||    
T  18617662 atgt 18617665  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33570144 - 33569956
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||         ||||||||||| ||||||||||    
T  33570144 ttcatgtaaatttctaaaaacccaccttttatgatcattctgaattctcacccccttttatccacaaat---------tgtgcaaccaagatctgaatca 33570054  T
Q  114 acatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtat 213  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||          |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33570053 acatctttgtcattgatctgtaatctattcataaa----------tttcatgaattttattttctaagagtttctatttgtttatggtttgttttggtat 33569964  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25472366 - 25472199
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatc----- 106  Q
    ||||||| |||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||  | | ||||||||| | ||||| || |||| ||||| |||||| |||         
T  25472366 tcttcatttaaaattctaaaaacccatttttcatgatcattctgaactttcatcccctttcacctacaaaccatcataaatgtgaaaccaaaatcaaaga 25472267  T
Q  107 -tgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcat 173  Q
     |||||||| || ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  25472266 ttgaatcaatatttttttcattgatcggtactctattcataaaggttactaaatttcataaatttcat 25472199  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38244572 - 38244527
Alignment:
Q  125 attgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaattt 170  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38244572 attgatccgtgctctatttataaaggttagtgaatttcatgaattt 38244527  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 196
Target Start/End: Original strand, 42221919 - 42221951
Alignment:
Q  164 tgaatttcattttcgatgagtttctatttgttt 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42221919 tgaatttcattttcaatgagtttctatttgttt 42221951  T

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Target: scaffold1360 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1031 - 810
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaac-tcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1031 aaaattgccctcttcatgtaaatttctaaaaacctcatcttttatgatcattctgaacccttacccccttttatccacaaatcaccatagatgtgtaacc 932  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 aatatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggtttgtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 832  T
Q  201 tttattttggtatgagatatgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  831 tttattttggtatgagatatgt 810  T

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Target: scaffold0041 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 105792 - 105573
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105792 aaaattgccttcttcatgtaaatttttaaaaatccatcttttatgataattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 105693  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105692 atatctgaatcaacatctttgttattgatgtgtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaaattcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 105593  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  105592 ttgttttggtatgagatatg 105573  T

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Target: scaffold0562 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5426 - 5217
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5426 tcttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccaaagatgtgcaaccaagatctgaat 5327  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5326 caacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 5227  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  5226 atgagatatg 5217  T

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Target: scaffold0562; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6521 - 6312
Alignment:
Q  12 tcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6521 tcttcatgtaaatttttaaaaacccatattttatgatcattctgaacccttatcccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaat 6422  T
Q  112 caacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggt 211  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6421 caacatctttgttattgatttgtactatattcataaaggttggtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggt 6322  T
Q  212 atgagatatg 221  Q
    ||||||||||    
T  6321 atgagatatg 6312  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42768 - 42549
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactc-atcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42768 aaaattgccctcttcatgtaaatttt-aaaaactccatcttttatgatcattttgaacccttaccccatttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacc 42670  T
Q  101 aatatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42669 aatatctgaattaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattg 42570  T
Q  201 tttattttggtatgagatatg 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  42569 tttgttttggtatgagatatg 42549  T

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Target: scaffold0237 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19694 - 19498
Alignment:
Q  24 tttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatttgt 123  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19694 tttttaaaaacccattttttacgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatctttgt 19595  T
Q  124 tattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19594 tattgatctgtattatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttgttttggtatgaaatat 19498  T

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Target: scaffold0189 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27898 - 27687
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||    
T  27898 aaaattgccctcttcatgtaaatttttaaaaacccatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcac---------gcaacca 27808  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27807 atatctgaatcaacatctttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcaatgagtttctatttgtttattgt 27708  T
Q  202 ttattttggtatgagatatgt 222  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  27707 ttgttttggtatgagatatgt 27687  T

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Target: scaffold0081 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 11151 - 11370
Alignment:
Q  2 aaaattgcattcttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaacca 101  Q
    ||||||||  |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11151 aaaattgccctcttcatgtatattactaaaaacccatcttttatgatcattctgaaccctcatcccctttcatccaaaaatcaccatagatgtgcaacca 11250  T
Q  102 atatctgaatcaacatatttgttattgatctgtactatattcataaaggttagtgaatttcatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 201  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11251 agatctgaatcaacatctttgtcattgatatgtactatattcataaaggttagtgaattttatgaatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgt 11350  T
Q  202 ttattttggtatgagatatg 221  Q
    || |||||||||||||||||    
T  11351 ttgttttggtatgagatatg 11370  T

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Target: scaffold0548 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0548
Description:

Target: scaffold0548; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Original strand, 5309 - 5443
Alignment:
Q  14 ttcatgtaaatttttaaaaactcatcttttatgatcattctgaacccttaccccctttcatccacaaatcaccatagatgtgcaaccaatatctgaatca 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5309 ttcatgtaaatttctaaaaacccatcttttatgatcattctgaattctcaccccctttcatccacaaatcaccatatatgtgcaaccaagatctgaatca 5408  T
Q  114 acatatttgttattgatctgtactatattcataaa 148  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  5409 acatctttgtcattgatctgtaatctattcataaa 5443  T

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Target: scaffold0548; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Original strand, 5442 - 5497
Alignment:
Q  166 aatttcattttcgatgagtttctatttgtttattgtttattttggtatgagatatg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5442 aatttcattttctaagagtttctatttgtttatggtttgttttggtatgagatatg 5497  T

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Target: scaffold0896 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0896
Description:

Target: scaffold0896; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 86 - 50
Alignment:
Q  84 accatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  86 accatagatgtgcaaccaatatctgaatcaacatatt 50  T

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