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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4226-Insertion-15 (Length: 500)

Name: NF4226-Insertion-15
Description: NF4226
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4226-Insertion-15
NF4226-Insertion-15
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (21-500)||(3816984-3817465)
chr7 (22-203)||(339377-339561)
chr7 (21-190)||(3811151-3811323)
chr7 (21-189)||(351791-351962)
chr7 (21-189)||(20238956-20239127)
chr7 (21-189)||(28420942-28421113)
chr7 (8-189)||(42767277-42767462)
chr7 (31-189)||(12804015-12804176)
chr7 (21-189)||(35147986-35148159)
chr7 (31-192)||(5849540-5849705)
chr7 (21-189)||(5979156-5979328)
chr7 (31-222)||(43540000-43540185)
chr7 (32-189)||(26383642-26383806)
chr7 (31-189)||(22741901-22742067)
chr7 (21-138)||(30219283-30219400)
chr7 (48-124)||(18666547-18666622)
chr7 (91-230)||(26381144-26381284)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (21-231)||(32890894-32891107)
chr8 (21-189)||(14417946-14418114)
chr8 (31-190)||(9935294-9935456)
chr8 (21-191)||(32897018-32897191)
chr8 (32-203)||(42992972-42993146)
chr8 (31-190)||(14799398-14799559)
chr8 (32-190)||(5542142-5542303)
chr8 (31-189)||(7771247-7771408)
chr8 (21-189)||(36818977-36819147)
chr8 (31-198)||(1882725-1882897)
chr8 (31-182)||(22219706-22219861)
chr8 (31-206)||(39735514-39735696)
chr8 (8-189)||(10705830-10706020)
chr8 (31-189)||(39727300-39727455)
chr8 (35-114)||(10700049-10700127)
chr8 (87-189)||(24250174-24250278)
chr8 (139-200)||(10700135-10700197)
chr8 (93-162)||(31399047-31399119)
chr8 (139-189)||(39689788-39689838)
chr8 (149-189)||(42033890-42033930)
chr8 (107-184)||(1171414-1171493)
chr8 (21-86)||(1171352-1171415)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (21-203)||(48160965-48161146)
chr4 (21-189)||(48167184-48167351)
chr4 (31-212)||(24288002-24288184)
chr4 (31-203)||(10739308-10739483)
chr4 (31-203)||(10953077-10953252)
chr4 (21-212)||(26963301-26963493)
chr4 (21-189)||(33458249-33458421)
chr4 (31-189)||(10733229-10733390)
chr4 (31-189)||(10946998-10947159)
chr4 (8-189)||(6257188-6257372)
chr4 (31-189)||(50168609-50168769)
chr4 (33-230)||(49976607-49976804)
chr4 (21-134)||(33461434-33461546)
chr4 (75-190)||(26956811-26956929)
chr4 (34-156)||(3769586-3769710)
chr4 (98-189)||(4632869-4632963)
chr4 (31-142)||(50427383-50427501)
chr4 (86-184)||(55473133-55473231)
chr4 (32-129)||(44831658-44831755)
chr4 (55-138)||(9237402-9237485)
chr4 (21-107)||(4632397-4632482)
chr4 (34-159)||(19686341-19686469)
chr4 (49-105)||(50155990-50156046)
chr4 (102-184)||(34308060-34308144)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (21-189)||(605-773)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (21-212)||(10244294-10244488)
chr3 (21-231)||(49151617-49151830)
chr3 (21-223)||(11846012-11846217)
chr3 (21-212)||(42197122-42197316)
chr3 (21-190)||(17055774-17055947)
chr3 (21-190)||(11839707-11839879)
chr3 (21-203)||(10766840-10767025)
chr3 (21-190)||(10238194-10238366)
chr3 (21-189)||(10760633-10760804)
chr3 (21-189)||(30051085-30051256)
chr3 (21-212)||(38455512-38455704)
chr3 (21-189)||(49157684-49157855)
chr3 (21-190)||(8331792-8331964)
chr3 (21-186)||(55003398-55003566)
chr3 (21-189)||(42191203-42191374)
chr3 (31-190)||(38449047-38449207)
chr3 (58-189)||(28964910-28965042)
chr3 (30-189)||(48128030-48128193)
chr3 (31-204)||(17593249-17593426)
chr3 (31-183)||(53069043-53069199)
chr3 (21-124)||(34300502-34300605)
chr3 (32-189)||(13445077-13445227)
chr3 (21-179)||(46656689-46656850)
chr3 (30-124)||(12108718-12108812)
chr3 (92-189)||(24643534-24643635)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (21-212)||(25387464-25387658)
chr1 (25-190)||(34739995-34740163)
chr1 (21-189)||(25381518-25381689)
chr1 (21-189)||(50306195-50306365)
chr1 (21-189)||(1078229-1078400)
chr1 (21-191)||(44410017-44410188)
chr1 (7-222)||(31051536-31051758)
chr1 (30-203)||(24963671-24963847)
chr1 (8-189)||(31058037-31058220)
chr1 (21-189)||(12183562-12183737)
chr1 (30-189)||(24926738-24926899)
chr1 (21-134)||(8092887-8093000)
chr1 (71-189)||(27955216-27955336)
chr1 (30-212)||(38151935-38152114)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (21-231)||(28531423-28531636)
chr5 (21-212)||(12692241-12692435)
chr5 (21-190)||(28525368-28525540)
chr5 (21-229)||(32096903-32097114)
chr5 (21-205)||(24054339-24054528)
chr5 (21-190)||(12686161-12686333)
chr5 (21-189)||(7389531-7389701)
chr5 (31-189)||(41297292-41297453)
chr5 (33-210)||(19066069-19066249)
chr5 (21-189)||(32094142-32094313)
chr5 (31-189)||(30384359-30384521)
chr5 (40-192)||(16215154-16215309)
chr5 (31-189)||(19059747-19059908)
chr5 (51-183)||(14610184-14610321)
chr5 (31-189)||(30772298-30772460)
chr5 (35-179)||(26509871-26510013)
chr5 (47-114)||(28542269-28542336)
chr5 (31-109)||(20500153-20500231)
chr5 (45-182)||(26316782-26316922)
chr5 (50-137)||(37896336-37896423)
chr5 (139-183)||(8706454-8706498)
chr5 (30-65)||(8706532-8706567)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (34-231)||(8662722-8662922)
chr6 (31-190)||(32035268-32035430)
chr6 (8-189)||(4580304-4580488)
chr6 (21-189)||(8650786-8650957)
chr6 (21-189)||(21190849-21191020)
chr6 (21-189)||(21782736-21782907)
chr6 (31-209)||(21196984-21197163)
chr6 (8-189)||(25354204-25354388)
chr6 (35-190)||(31756195-31756355)
chr6 (7-229)||(25343616-25343845)
chr6 (31-189)||(18778598-18778760)
chr6 (21-134)||(21783350-21783461)
chr6 (21-134)||(21789573-21789684)
chr6 (21-183)||(21770546-21770710)
chr6 (21-184)||(17581640-17581797)
chr6 (34-212)||(6097999-6098181)
chr6 (48-123)||(34603382-34603457)
chr6 (48-123)||(34724659-34724734)
chr6 (87-188)||(6102694-6102803)
chr6 (32-96)||(1106229-1106294)
chr6 (30-138)||(17900176-17900283)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (21-212)||(35090610-35090803)
chr2 (31-189)||(36750430-36750591)
chr2 (8-212)||(31002369-31002577)
chr2 (21-189)||(28682928-28683099)
chr2 (21-212)||(13456105-13456299)
chr2 (8-194)||(31008347-31008537)
chr2 (21-183)||(35084665-35084830)
chr2 (21-189)||(44716787-44716959)
chr2 (21-189)||(13462046-13462217)
chr2 (30-184)||(13149674-13149830)
chr2 (31-189)||(30965343-30965505)
chr2 (21-189)||(11048536-11048707)
chr2 (34-189)||(23343579-23343737)
chr2 (68-190)||(35438692-35438816)
chr2 (63-212)||(29833255-29833407)
chr2 (75-114)||(31651664-31651703)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (21-231)||(172831-173044)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (21-189)||(5540-5711)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (21-189)||(1176-1348)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (21-212)||(6528-6722)
scaffold0208 (21-189)||(12401-12572)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (31-185)||(38445-38600)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (35-189)||(1107-1261)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (37-118)||(5945-6025)
[»] scaffold1064 (1 HSPs)
scaffold1064 (55-138)||(1401-1488)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3817465 - 3816984
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817465 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 3817366  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcatatttc 217  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||     
T  3817365 ttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtgtttatgtttg 3817266  T
Q  218 atctactgggattatgatttgatttgttgtggcttgatatatatgtatccgatgactattagtcatcgatgcctattctgtttttgcgaagnnnnnnnng 317  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        |    
T  3817265 atctattggaattatgatttgatttgttgtggcttgatatatatgtatccgatgactattagtcatcgatgcctattctgttttt-cgaagttttttttg 3817167  T
Q  318 ttctaaacctacatgggaatttgttttttcggttatccatgtcgttcg-caattttcgtttatccatatgccgtttgcaaatctttggttatcgattgcc 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3817166 ttctaaacctacatgtgaatttg-tttttcggttattgatgtcgtttgtaaattttcgtttatccatgtgccgtttgcaaatctttggtcatcgattgcc 3817068  T
Q  417 tatttgcctctcatttatccatgcttccgttttgtttaatattgaagtgacaaacaattgtgcctttaatttcggtcctcgatg 500  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3817067 tatttgactctaatttatccatgcttttgttttctttaatattgaagtgacaaacatttgtgcatttaatttcagtcctcgatg 3816984  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 203
Target Start/End: Original strand, 339377 - 339561
Alignment:
Q  22 agctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgct 121  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339377 agctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgct 339476  T
Q  122 tcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagc 203  Q
    ||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  339477 tccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctctttatattaagagctaaatttccaacaagtggtatcagagc 339561  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3811323 - 3811151
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811323 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 3811224  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3811223 ttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctacatttccaacag 3811151  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 351791 - 351962
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351791 aagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 351890  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| || ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  351891 ttccgctgttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagagctaaatttccaaca 351962  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 20238956 - 20239127
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20238956 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 20239055  T
Q  121 ttcccctattgat---tcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| ||||||||   | || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20239056 ttccgctattgatgtatgattgttgaacatgttttatgaaatttgtttatattaagacctaaatttccaaca 20239127  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28421113 - 28420942
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421113 aagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 28421014  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  28421013 ttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatatcaagagctaaatttccaaca 28420942  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42767462 - 42767277
Alignment:
Q  8 agggttgctaccgaagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| ||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42767462 agggctgctacaaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaatatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 42767363  T
Q  108 atgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42767362 atattttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 42767277  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 12804015 - 12804176
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12804015 caggtattcttaataccctaattcttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatgttcatgttcaatgttttgcttgcttccgctatt 12804114  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12804115 gattcataatcgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 12804176  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35148159 - 35147986
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148159 aagctttatccaggtattcctaatacccctaattcttaatatccttgataaatcaaacgtgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 35148060  T
Q  120 cttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacct-aaatttccaaca 189  Q
    ||||| |||| |||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35148059 cttccgctatcgatttataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacataaaatttccaaca 35147986  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 5849540 - 5849705
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5849540 caggtattcctaatatcctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttggttgcttccgctatt 5849639  T
Q  131 gattcata---gttgaacat-attttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggt 192  Q
    ||||||||    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5849640 gattcataatcattgaacataattttataaaatttgtttttattaagacctaaatttgcaacaggt 5849705  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5979328 - 5979156
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5979328 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaacatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataatcatgttcaatagtttgtttgc 5979229  T
Q  121 ttcccctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    || | |||||||||    || ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5979228 tttcgctattgatttacgattgttcaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaattttcaaca 5979156  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 222
Target Start/End: Original strand, 43540000 - 43540185
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| |||||    
T  43540000 caggtattcataataccctaatttttaatattcttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatattttatttaattccgctatt 43540099  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcatatttcatcta 222  Q
    ||||||||    |||||||| || |||||||||||||||||||||||          ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43540100 gattcataattattgaacatgttctatgaaatctgtttttattaaga---------tcaaaaggtggtatcagagcggtcttcatgtttcatcta 43540185  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 189
Target Start/End: Original strand, 26383642 - 26383806
Alignment:
Q  32 aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||   | |||    
T  26383642 aggtattcctaataccctaattcttagtatgcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcatgatcatgttcaatattttgtttgtttctgttgttg 26383741  T
Q  132 attcata---gttgaacatattttatgaaatctgt----ttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||   ||||||||| | ||||||||||| |    ||||||| |||| |||||||||||||    
T  26383742 attcataattgttgaacatgtcttatgaaatctattctgttttatttagacttaaatttccaaca 26383806  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22742067 - 22741901
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  22742067 caggtattcctaatacc-taatcctcaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttcagtttgcttccgctatt 22741970  T
Q  131 g-------attcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |       |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22741969 gttgattcattcataattgttgaacatgttttatgaaacctgttcttattgagacctaaatttccaaca 22741901  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30219400 - 30219283
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||     
T  30219400 aagctttatccagatattcctaataccataattcttaatatctttaataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattcatgttcaacgttttgtttga 30219301  T
Q  121 ttcccctattgattcata 138  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  30219300 ttccgctaatgattcata 30219283  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18666622 - 18666547
Alignment:
Q  48 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 124  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18666622 ctaattattaatatcattgctaaatcaaacatgtcgtaa-tctgatcataatcaagttcaatgttttgtttgcttcc 18666547  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 230
Target Start/End: Original strand, 26381144 - 26381284
Alignment:
Q  91 gatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaa 187  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||| || |||  ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||    
T  26381144 gatcatgatcatgttcaatattgtgtttgttttcccccttgattcataattgttgaacatgtcttatgaaatct-attttatttagacctaaatttctaa 26381242  T
Q  188 caggtggtatcagagcggtcttcatatttcatctactgggatt 230  Q
       ||| ||||||||| || ||||||||| || || |||||||    
T  26381243 tgagtgatatcagagc-gtgttcatatttgatttattgggatt 26381284  T

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Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Original strand, 32890894 - 32891107
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890894 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 32890993  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcatatttc 217  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  32890994 ttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatgtttg 32891093  T
Q  218 atctactgggatta 231  Q
    || || ||||||||    
T  32891094 atttattgggatta 32891107  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 14417946 - 14418114
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14417946 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 14418045  T
Q  121 ttcccctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14418046 ttccgctattgattcatagttaaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 14418114  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Original strand, 9935294 - 9935456
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9935294 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgctatt 9935393  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9935394 gattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 9935456  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 32897018 - 32897191
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32897018 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 32897117  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacagg 191  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32897118 ttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacagg 32897191  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42993146 - 42992972
Alignment:
Q  32 aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42993146 aggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattg 42993048  T
Q  132 attcata---gttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagc 203  Q
    |||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  42993047 attcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccatcaagtggtatcagagc 42992972  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14799559 - 14799398
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14799559 caggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 14799461  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    ||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14799460 gattcataattgttgaacatgtattatgaaatttgtttatattaagacctaaatttccaacag 14799398  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5542303 - 5542142
Alignment:
Q  32 aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5542303 aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattg 5542204  T
Q  132 attcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    |||||||   ||||||||| | |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5542203 attcataattgttgaacatgtattataaaatctatttatattaaaacctaaatttccaacag 5542142  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 7771247 - 7771408
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7771247 caggtattcttaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 7771346  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7771347 gatttataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 7771408  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 36818977 - 36819147
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36818977 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgc 36819075  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36819076 ttccactattgattcataattgttgaacatgtattatgagatttgtttatattaagacctaaatttccaaca 36819147  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1882897 - 1882725
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtc-gtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1882897 caggtattcctaataccctaattcttaacatccttgataaatcaaacatgtcattagatccgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 1882798  T
Q  130 tgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttt-tattaagacctaaatttccaacaggtggtatc 198  Q
    ||||||   || ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1882797 tgattcttaattgttgaacatgttctatgaaatctgttttatattaagacctaaatttccaacaagtggtatc 1882725  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22219861 - 22219706
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgtttt-gtttgcttcccctat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||  ||||    
T  22219861 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaaagttttctttttcttctgctat 22219762  T
Q  130 tgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatt 182  Q
    |||||||||    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22219761 tgattcataactattgaacatgttttatgaaatctctttttattaagacctaaatt 22219706  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39735696 - 39735514
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  39735696 caggtattccttataccctagttcttaatatctttgataaatcaaacatgtcgtagatacaatcataatcatgttcaatattttatttacttccgctatt 39735597  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttatt----aagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggt 206  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39735596 gattcataattgttgaacatgttttatgaaatctatttttattattaaaaacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggt 39735514  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 10705830 - 10706020
Alignment:
Q  8 agggttgctaccgaagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccg------atcataatca 101  Q
    |||| ||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||    
T  10705830 agggctgctacaaaagctttatccaggtaatcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcataatca 10705928  T
Q  102 tgttcaatgttttgtttgcttcccctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    || ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10705929 tgttcaatgttttgtttgcttacgctattgatttacgattgttaaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 10706020  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39727455 - 39727300
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  39727455 caggtatttcttataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgt---------gatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgttatt 39727365  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgttt---ttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  39727364 gattcataattgttgaacatgttttatgaaatctatttttattattaagacctaaatttccaaca 39727300  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Original strand, 10700049 - 10700127
Alignment:
Q  35 tattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgtttt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10700049 tattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 10700127  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 189
Target Start/End: Original strand, 24250174 - 24250278
Alignment:
Q  87 atccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaattt 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24250174 atccgatcataataatgttcaatattttgtttgtttccgctattgattcatatttgttcaacatgttttatgaaatatgttttt-ttaagacctaaattt 24250272  T
Q  184 ccaaca 189  Q
     |||||    
T  24250273 tcaaca 24250278  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 10700135 - 10700197
Alignment:
Q  139 gttgaacatattttatgaaatctgttttta-ttaagacctaaatttccaacaggtggtatcag 200  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10700135 gttaaacatgtattatgaaatatgtttttaattaagacctaaatttccaacaagtggtatcag 10700197  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31399119 - 31399047
Alignment:
Q  93 tcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctg 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    |||||||||| |||| |||||||    
T  31399119 tcataatcatgttcaatgtattgtttgcctccactattgattcataattattgaacatatgttattaaatctg 31399047  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 189
Target Start/End: Original strand, 39689788 - 39689838
Alignment:
Q  139 gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  39689788 gttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaaaacctaagtctccaaca 39689838  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 42033890 - 42033930
Alignment:
Q  149 ttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42033890 ttttatgaaatctatttttagtaagacctaaatttccaaca 42033930  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 184
Target Start/End: Original strand, 1171414 - 1171493
Alignment:
Q  107 aatgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttc 184  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||   |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1171414 aatgttttgtttgcttccgcggttgaatcataattgttgaatatgtttcatgaaatctgtttt-attaagacctaaatttc 1171493  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Original strand, 1171352 - 1171415
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaa 86  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1171352 aagctttaaccaggtattcctaatacc-taattcttgttatc-ttgataaatcaaatatgtcgtaa 1171415  T

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Target: chr4 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 48160965 - 48161146
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48160965 aagctttattcaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgc 48161063  T
Q  121 ttcccctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagc 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48161064 ttccgctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctatttttattaagacctaaatttctaacaagtggtatcagagc 48161146  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 48167184 - 48167351
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48167184 aagctttattcaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgc 48167282  T
Q  121 ttcccctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48167283 ttccgctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctatttttattaagacctaaatttctaaca 48167351  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Original strand, 24288002 - 24288184
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24288002 caggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagatacgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 24288101  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24288102 gattcataattgttgaacatgttttatgaaatc--tatttattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 24288184  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10739483 - 10739308
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10739483 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttctgctatt 10739384  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagc 203  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10739383 gattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatgttaagagctaaatgtccaacaagtggtatcagagc 10739308  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10953252 - 10953077
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10953252 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttctgctatt 10953153  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagc 203  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10953152 gattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatgttaagagctaaatgtccaacaagtggtatcagagc 10953077  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26963493 - 26963301
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26963493 aagctttatccaggtattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttgtttgc 26963396  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26963395 ttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaaatttgtttttattaagacctaaatttccaacaagtagtatcagagcggtcttcat 26963301  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33458421 - 33458249
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33458421 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgc 33458322  T
Q  121 ttcccctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33458321 ttccgctattgatttacgattgttgaacatatattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 33458249  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10733390 - 10733229
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10733390 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgctatt 10733291  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  10733290 gattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatgttaagagctaaatgtccaaca 10733229  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10947159 - 10946998
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10947159 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgctatt 10947060  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  10947059 gattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatgttaagagctaaatgtccaaca 10946998  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6257372 - 6257188
Alignment:
Q  8 agggttgctaccgaagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6257372 agggctgctacgaaagctttatccaggtattcctaatatcctaattcttaacatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttca 6257273  T
Q  108 atgttttgtttgcttcccctattgat---tcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||| || |||||   | || ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6257272 atgttttgtttgcttccgctgttgatttatgattgttgaacatgtattatgaaatctatttatattaagacctaaatttccaaca 6257188  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 50168609 - 50168769
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50168609 caggtattccttatacc-taattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtatattcgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 50168707  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||   ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50168708 gattcataattgttgaacgtgttttatgtaatctggttttattaagacctaaatttccaaca 50168769  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 230
Target Start/End: Original strand, 49976607 - 49976804
Alignment:
Q  33 ggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattga 132  Q
    |||||||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  49976607 ggtattcctaatactctaattatta---tccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgctttcgctatcga 49976703  T
Q  133 ttcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcatatttcatctactgggat 229  Q
    ||||||   |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||    
T  49976704 ttcataattgttgaatatgttttatgaaatttgtttttattaaaatctaaatttctaacaagtggtatcagagtggtcttcatgtttgatttattgggat 49976803  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33461546 - 33461434
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33461546 aagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgaccataatcatgttcaatgttttgtttgc 33461448  T
Q  121 ttcccctattgatt 134  Q
    |||| |||||||||    
T  33461447 ttccactattgatt 33461434  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26956929 - 26956811
Alignment:
Q  75 aacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttatta 171  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26956929 aacatgtcgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttatttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaaatctgtttttatta 26956830  T
Q  172 agacctaaatttccaacag 190  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26956829 agacctaaatttccaacag 26956811  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Original strand, 3769586 - 3769710
Alignment:
Q  34 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgat 133  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  3769586 gtattcctaatacc-taattattaatatccttgattaatgaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttaaattattgat 3769684  T
Q  134 tcata---gttgaacatattttatga 156  Q
    |||||    |||||||||||||||||    
T  3769685 tcataattattgaacatattttatga 3769710  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 189
Target Start/End: Original strand, 4632869 - 4632963
Alignment:
Q  98 atcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632869 atcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgattaataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 4632963  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 142
Target Start/End: Original strand, 50427383 - 50427501
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaa--------acatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgctt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  50427383 caggtattcctaataccctaattcttaatcttcttgataaatcaataaattaaacatgtcgtacatccgatcataatcat-ttcaatgttttgattgctt 50427481  T
Q  123 cccctattgattcatagttg 142  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  50427482 ccactattaattcatagttg 50427501  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 55473231 - 55473133
Alignment:
Q  86 aatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttc 184  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  55473231 aatccaatcataatcatattcaatattttatttgcttccgctattgatttattattgaacatattttatgaaatttgtttctattaagacctaaatttc 55473133  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 44831755 - 44831658
Alignment:
Q  32 aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctat 129  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  44831755 aggtattcttaataccctagttcttaatatccttgataaattaaacatgtcgtagattcgatcatattcatgttcaatgattaatttgcttccgctat 44831658  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 138
Target Start/End: Original strand, 9237402 - 9237485
Alignment:
Q  55 ttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  9237402 ttaatatacttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgagcataatcatattcaatgttctgtttgcttcgactattcattcata 9237485  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Original strand, 4632397 - 4632482
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    ||||||||  || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4632397 aagctttatccaagtatttctgataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 4632482  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19686469 - 19686341
Alignment:
Q  34 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgat 133  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  19686469 gtattcataatacccgaattcttaatatgcttgattaatcaagcatgttgtagatccgatgataattacgttcaatattttgtttgcttccgttattgat 19686370  T
Q  134 tcatag---ttgaacatattttatgaaat 159  Q
    | ||||   |||||||| |||||||||||    
T  19686369 ttatagttattgaacatgttttatgaaat 19686341  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Original strand, 50155990 - 50156046
Alignment:
Q  49 taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgtt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  50155990 taattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtatatccgatcttaattatgtt 50156046  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34308144 - 34308060
Alignment:
Q  102 tgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttc 184  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34308144 tgttcaatattttgtatgcttccgctattgattcataattattgaacatgttttataaaatctg-ttttattaagacgtaaatttc 34308060  T

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Target: scaffold0363 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 773 - 605
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  773 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 674  T
Q  121 ttcccctattgattcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  673 ttccgctattgattcatagttaaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 605  T

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Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10244488 - 10244294
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244488 aagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 10244389  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10244388 ttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagagctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 10244294  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Original strand, 49151617 - 49151830
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151617 aagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 49151716  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcatatttc 217  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  49151717 ttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatgtttg 49151816  T
Q  218 atctactgggatta 231  Q
    || || ||||||||    
T  49151817 atttattgggatta 49151830  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11846217 - 11846012
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846217 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatacttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 11846118  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcatatttc 217  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  11846117 ttccgctattgatttataattgttgaacatgtattataaaatctgttttaattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatgtttg 11846018  T
Q  218 atctac 223  Q
    ||||||    
T  11846017 atctac 11846012  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42197316 - 42197122
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42197316 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgc 42197217  T
Q  121 ttcccctattgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||| ||||||||||   || ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42197216 ttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatgaaatctatttatattaagacctatatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 42197122  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17055947 - 17055774
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17055947 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 17055848  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctg-tttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17055847 ttccgctattgattcataattgttgaacatattttatgaaaactgttttttattaagacctaaatttcgaacag 17055774  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11839879 - 11839707
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839879 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 11839780  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11839779 ttccgctattgattcataattgttgaacatgtatcatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacag 11839707  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10767025 - 10766840
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10767025 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccggtcataatcatgttcaatgttttgtttgc 10766926  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagc 203  Q
    |||| || |||||| |||   ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10766925 ttccgctgttgatttataattgttgaacatgtattatgaaatttgtttttaataagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 10766840  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10238366 - 10238194
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238366 aagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 10238267  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10238266 ttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagagctaaatttccaacag 10238194  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10760804 - 10760633
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10760804 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgc 10760705  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10760704 ttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaataagacctaaatttccaaca 10760633  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30051256 - 30051085
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30051256 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatctgattataatcatgttcaatattttgtttgc 30051157  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30051156 ttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaattttcaaca 30051085  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38455704 - 38455512
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455704 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 38455605  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38455604 ttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaaatc--tttatattaagaccgaaatttccaacaaatggtatcagagcggtcttcat 38455512  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 49157684 - 49157855
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157684 aagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 49157783  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49157784 ttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 49157855  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Original strand, 8331792 - 8331964
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331792 aagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 8331891  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8331892 ttccgctattgatttataattgttgaacatgttttataaaatctatttatattaagagctaaatttccaacag 8331964  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 55003566 - 55003398
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55003566 aagctttatccagatatttctaataccctaattcttaatatacttgataaattaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgc 55003467  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttcca 186  Q
    |||  |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55003466 ttctgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttcca 55003398  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42191374 - 42191203
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42191374 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgc 42191275  T
Q  121 ttcccctattgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| ||||||||||   || ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42191274 ttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatgaaatctatttatattaagacctatatttccaaca 42191203  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38449207 - 38449047
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38449207 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 38449108  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    |||| |||   ||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38449107 gatttataattgttgaacatgtattatgaaatc--tttatattaagaccgaaatttccaacag 38449047  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Original strand, 28964910 - 28965042
Alignment:
Q  58 atatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcatagttgaacatattttatgaa 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28964910 atatctttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcattgttgaacatgttttatgaa 28965009  T
Q  158 atctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28965010 atctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 28965042  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 48128193 - 48128030
Alignment:
Q  30 tcaggtattcctaa-taccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccccta 128  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  48128193 tcaggtattccaaaataccctaattcttaatattcttaataaatcaaacatgtcgtagaaccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgtttccgcta 48128094  T
Q  129 ttgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48128093 ttgattcataattgttgaacatgtttcatgaaatctgtttttattgagacctaaatttccaaca 48128030  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17593426 - 17593249
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17593426 caggtattcctaataccctaattcttaatattcttgataaattaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcgatt 17593327  T
Q  131 gatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcg 204  Q
    ||||    || ||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  17593326 gatttacgattgttgaacatctattatgaaatatatttttaattaagacctaaatttcctacaagtgttatcagagcg 17593249  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 53069199 - 53069043
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctat 129  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53069199 caggtattcttaatacccctgattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcatagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 53069100  T
Q  130 tgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaattt 183  Q
     |||| |||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53069099 cgatttataattgttgaacatgttttataaaatctgtttttattaagacctaaattt 53069043  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Original strand, 34300502 - 34300605
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34300502 aagcttaattcaggtattcctaataccctaattcttaatatcctttataaatcaaatatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 34300601  T
Q  121 ttcc 124  Q
    ||||    
T  34300602 ttcc 34300605  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 189
Target Start/End: Original strand, 13445077 - 13445227
Alignment:
Q  32 aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||||||| ||||||||| ||||||    
T  13445077 aggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat----------aatgttttatttgcttccgctattg 13445166  T
Q  132 attcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||| |||   ||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13445167 atttataattgttgaacatgttctatcaaatctatttttatttagacctaaatttctaaca 13445227  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 46656689 - 46656850
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||| |    
T  46656689 aagcttcattcaggtatttctaataccctcattctcaatatcattgataaatcaaacatatcgtagatccgatcataattatattgaatgttttatttac 46656788  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaa 179  Q
    |||  ||||| |||||||    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  46656789 ttcagctattaattcatatttattgaacatgttttatgaaatatgtttttatttagacctaa 46656850  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12108812 - 12108718
Alignment:
Q  30 tcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttg-tttgcttcc 124  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12108812 tcaggtattcttaatacc-taattgttaatatccttgataaatcaaacatgtcttagatcaaatcataatcatattcaatgttttgatttgcttcc 12108718  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24643635 - 24643534
Alignment:
Q  92 atcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacatattt--tatgaaatctgtttttattaagacctaaatttcca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||   ||||||||| |||  |||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  24643635 atcataatcatgttcaatgttttatttacttccgctattgattcataaatgttgaacatgttttatatgaagtttg-ttttattaagacctaaatttcca 24643537  T
Q  187 aca 189  Q
    |||    
T  24643536 aca 24643534  T

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Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25387658 - 25387464
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387658 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 25387559  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25387558 ttccgctattgattcatatttgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagatctatatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 25387464  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 34739995 - 34740163
Alignment:
Q  25 tttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739995 tttattcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcc 34740094  T
Q  125 cctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
     |||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  34740095 gctattgattcataattgatgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaatttcctacag 34740163  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25381689 - 25381518
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381689 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatttcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 25381590  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25381589 ttccgctattgattcatagttgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctatatttccaaca 25381518  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 50306195 - 50306365
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50306195 aagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgattataatcatgttcaatgttttgtttgc 50306293  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50306294 ttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 50306365  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 1078229 - 1078400
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078229 aagctttatccaggtattcttaataccctaattcttaatattcttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 1078328  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1078329 ttccgctattgattaataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 1078400  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 44410017 - 44410188
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44410017 aagctttatccaggtattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttgc 44410114  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacagg 191  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44410115 ttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatgaaatctgtttttagtaagacctaaatttccaacagg 44410188  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 222
Target Start/End: Original strand, 31051536 - 31051758
Alignment:
Q  7 aagggttgctaccgaagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttc 106  Q
    ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31051536 aagggttgctacaaaagttttatccaggtattcttaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataatcatgttc 31051634  T
Q  107 aatgttttgtttgcttcccctattgatt---catagttgaaca-----tattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatc 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    || ||||||||     |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  31051635 aatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgatatgaaatctgtttatattaagacctaaattcctaacaagtggtatc 31051734  T
Q  199 agagcggtcttcatatttcatcta 222  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    
T  31051735 agagcggtcttcatgtttgatcta 31051758  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24963847 - 24963671
Alignment:
Q  30 tcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctat 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24963847 tcaggtattcctaatactttaattcttactattcttgataaatcaaacatggcgtagatccgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 24963748  T
Q  130 tgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagc 203  Q
    |||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||    
T  24963747 tgattcatattcgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagatctaaattttcaacaaatggtattagagc 24963671  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 31058037 - 31058220
Alignment:
Q  8 agggttgctaccgaagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||||||||||  ||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31058037 agggttgctacaaaagttttatccaagtattcttaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 31058135  T
Q  108 atgttttgtttgcttcccctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31058136 atgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttctaaca 31058220  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12183737 - 12183562
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12183737 aagctttattcaggtattcctaatactcaaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataattatgttcaatattttgtttgc 12183639  T
Q  121 ttcccctattgattcata--------gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12183638 ttccactattgattcataattatattgttgaacatattttatgaaatctatttttattaagaactaaatttccaaca 12183562  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24926899 - 24926738
Alignment:
Q  30 tcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctat 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24926899 tcaggtattcctaatacgttaattcttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattaatgttcaatgttttggttgcttccgctat 24926800  T
Q  130 tgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24926799 tgattcataatcgttgaacatgttttatg-aatctgtttttattaagacctaaattttcaaca 24926738  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8093000 - 8092887
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8093000 aagctttatccaggtattcctcatacccaaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcatagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgc 8092901  T
Q  121 ttcccctattgatt 134  Q
    |||  |||||||||    
T  8092900 ttctgctattgatt 8092887  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Original strand, 27955216 - 27955336
Alignment:
Q  71 atcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgat--tcatagttgaacatattttatgaaatctgttttta 168  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27955216 atcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattatgattattaaacatgttttatgaaatctgttttta 27955315  T
Q  169 ttaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  27955316 ttaagacctaaatttctaaca 27955336  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38152114 - 38151935
Alignment:
Q  30 tcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||      | |||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  38152114 tcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc------tgatcatgttcaatattttgtttgcttccgctgt 38152021  T
Q  130 tgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcg-gtcttcat 212  Q
    ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38152020 tgattaataattgttgaacatgttttatgaaatct-attttattaagacttggatttctaacaagtggtatcagagcgagtcttcat 38151935  T

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Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28531636 - 28531423
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531636 aagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 28531537  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcatatttc 217  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  28531536 ttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcatgtttg 28531437  T
Q  218 atctactgggatta 231  Q
    || || ||||||||    
T  28531436 atttattgggatta 28531423  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12692435 - 12692241
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692435 aagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 12692336  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12692335 ttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatatcaagagctaaatttccaacaagtggtatcagagccgtcttcat 12692241  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28525540 - 28525368
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525540 aagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 28525441  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28525440 ttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacag 28525368  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32097114 - 32096903
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097114 aagctttattcaggtaatcctaatacc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatcctatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 32097016  T
Q  121 ttcccctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcatattt 216  Q
    |||| |||||||||    || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  32097015 ttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacaaatggtatcagagcggtcttcatgttt 32096916  T
Q  217 catctactgggat 229  Q
     || || ||||||    
T  32096915 gatttattgggat 32096903  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 24054339 - 24054528
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaata-ccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 119  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24054339 aagctttatccaggtattcctaatatcccaaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 24054438  T
Q  120 cttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacct-aaatttccaacaggtggtatcagagcgg 205  Q
    ||||| |||| |||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24054439 cttccgctatagatttataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacctaaaattttcaacaagtggtatcagagcgg 24054528  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12686333 - 12686161
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686333 aagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 12686234  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  12686233 ttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatatcaagagctaaatttccaacag 12686161  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7389701 - 7389531
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389701 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtggatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 7389603  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7389602 ttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatgaaatttgtttatattaagacctaaatttccaaca 7389531  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 41297292 - 41297453
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  41297292 caggtattcctaataccctaattctttatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgcttctgctatt 41297391  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||   ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41297392 gattcataattgttgaacatgtattatgaaatctctttatattaagacccaaatttccaaca 41297453  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19066249 - 19066069
Alignment:
Q  33 ggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattga 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||    
T  19066249 ggtattcctaataccataattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattcatgcttaatgttttgtttgcttccgctaatga 19066150  T
Q  133 ttcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttc 210  Q
    || |||   |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19066149 tttataatcgttgaacatggtttatgaaatatgtttttattaagacttaaatttccaactagtggtatcagagcggtcttc 19066069  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32094313 - 32094142
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094313 aagctttattcaggtattcctaatacc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatcctatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 32094215  T
Q  121 ttcccctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||    || ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32094214 ttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattataaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 32094142  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30384521 - 30384359
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30384521 caggtattcttaatacccttattcttaatatccttgataaatcagacatgtc-tagatccgatcataatcgtgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 30384423  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctg--tttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30384422 gattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttttattaaaacctaaatttccaaca 30384359  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16215309 - 16215154
Alignment:
Q  40 ctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata- 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  16215309 ctaataccctaatttttaatatccttgataaatcaaacatttcgtagatccaatcataatcatgttaaatgttttgtttgcttccgctattgattcataa 16215210  T
Q  139 --gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggt 192  Q
      |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16215209 ttgttgaatatgtgttatgaaatctgtttttataaagacctaaatttctaacaggt 16215154  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19059908 - 19059747
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  19059908 caggtatttctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgtttatattcatgtttaatattttgtttgcttcccctaat 19059809  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||   |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19059808 gatttataatcgttgaatacgttttatgaaatatgtttttattaagacctaaatttccaaca 19059747  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 14610184 - 14610321
Alignment:
Q  51 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||   |||||||||    
T  14610184 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatggtttatttgcttccgctattaattcataattgttgaacat 14610283  T
Q  148 attttatgaaatctg--tttttattaagacctaaattt 183  Q
     ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  14610284 gttttatgaaatctgtttttttgttaagacctaaattt 14610321  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 30772298 - 30772460
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatg-ttttgtttgcttcccctat 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |    
T  30772298 caggtaatcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtcgatccgatcataatcatgttcattgtttttgtttgcttccactgt 30772397  T
Q  130 tgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    | |||||||    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30772398 ttattcataattattgaacatgttttatgaaatttatttttattaagaactaaatttccaaca 30772460  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 179
Target Start/End: Original strand, 26509871 - 26510013
Alignment:
Q  35 tattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgatt 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |   |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |    
T  26509871 tattcctaatacc-taattcttaatatc-ttgatgaatcaaatatgtcgtagtttatatcataattatgttcaatgttttgtttgcttccactatttcat 26509968  T
Q  135 catagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaa 179  Q
     ||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26509969 aatgattgaacatgttttatgaaatctgtttttatttaggcctaa 26510013  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 28542269 - 28542336
Alignment:
Q  47 cctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgtttt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  28542269 cctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagtttcgatcataatcatgttcaatgtttt 28542336  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 109
Target Start/End: Original strand, 20500153 - 20500231
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaat 109  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20500153 caggtatttctaatactctaattcttagtatccttgataaatcaagtatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaat 20500231  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26316922 - 26316782
Alignment:
Q  45 accctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgatt---catagtt 141  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    ||  ||    
T  26316922 accctaattattaataccgtagataaatcaaacatgtcctagatccaatcatattaatgttcaatgttttttttgcttccactattaatttaaaattatt 26316823  T
Q  142 gaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatt 182  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  26316822 gaacatgttttatgaaatatgtttttatgtagacctaaatt 26316782  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 37896423 - 37896336
Alignment:
Q  50 aattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcat 137  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||  || |||||||||    
T  37896423 aattattaatattcttgataaatcaatcatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaacattttatttacttctgctgttgattcat 37896336  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8706498 - 8706454
Alignment:
Q  139 gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaattt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8706498 gttgaacatattttatgaaatctatttttattaagacctaaattt 8706454  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 8706567 - 8706532
Alignment:
Q  30 tcaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8706567 tcaggtattcctaataccctaattcttaatatcctt 8706532  T

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Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8662922 - 8662722
Alignment:
Q  34 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgat 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8662922 gtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgat 8662823  T
Q  134 tcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcatatttcatctactgggatt 230  Q
    |||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||    
T  8662822 tcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagagctaaatttacaacaagtggtatcagagcggtctttatgtttgatttattgggatt 8662723  T
Q  231 a 231  Q
    |    
T  8662722 a 8662722  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32035430 - 32035268
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32035430 caggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 32035331  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32035330 gattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaacag 32035268  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4580488 - 4580304
Alignment:
Q  8 agggttgctaccgaagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    ||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4580488 agggttgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 4580389  T
Q  108 atgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4580388 atgttttgtttgcttccgctattgattcatagttgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 4580304  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8650957 - 8650786
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650957 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 8650858  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8650857 ttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagagctaaatttacaaca 8650786  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21191020 - 21190849
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21191020 aagctttatccaggtatttctaataccctaattcttaatatctttgataaatcaaatatatcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 21190921  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21190920 ttccgctattgattcataattgttgaacatattttatgaaatctgtttataataagacctaaatttccaaca 21190849  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21782907 - 21782736
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21782907 aagctttatccagctattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 21782808  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21782807 ttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttctaaca 21782736  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21197163 - 21196984
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21197163 caggtattcataatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 21197066  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtctt 209  Q
    ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21197065 gattcataatcgttgaacatgttttatgaaatctgtttttactatgacctaaatttccaacaagtggtatcagagcggtctt 21196984  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 25354204 - 25354388
Alignment:
Q  8 agggttgctaccgaagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25354204 agggctgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 25354302  T
Q  108 atgttttgtttgcttcccctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25354303 atgctttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagatctaaatttccaaca 25354388  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31756355 - 31756195
Alignment:
Q  35 tattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgatt 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||    
T  31756355 tattcataataccctaattcttaatatccttgataattcaaacatgtcgtagatccgattataatcatgttcaatgttttatttgcttccgttgttgatt 31756256  T
Q  135 cata---gttgaacatattttatgaaatctg--tttttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31756255 cataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttttattaagacctaaatttccaacag 31756195  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 25343616 - 25343845
Alignment:
Q  7 aagggttgctaccgaagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttc 106  Q
    ||||| ||||||  ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25343616 aagggctgctacaaaagctttatctaggtattcctaatactctaattcttaatatc-ttgataaatcaaaaatgtcgtagatccgatcataatcatgttc 25343714  T
Q  107 aatgttttgtttgcttcccctattgatt---catagttgaa----catattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaggtggtatc 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||    || ||||||    ||| | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25343715 aatgttttgtttgcttctgctattgatttacgattgttgaacatgcatgtattatgaaatttgtttttaattaagatataaatttccaacaagtggtatc 25343814  T
Q  199 agagcggtcttcatatttcatctactgggat 229  Q
    |||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  25343815 agagcggtcttcatgtttgatttattgggat 25343845  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 18778598 - 18778760
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctat 129  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18778598 caggtattcctaaaacccctaattcttaatata-ttgataaatcaaatacgtcgtagatccgatcataattatgttcaacgttttgtttgcttccgctat 18778696  T
Q  130 tgattcata---gttgaacat-attttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||||||||    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18778697 tgattcataattattgaacatgtttttatgaaatttgttttaattaagacctaaatttccaaca 18778760  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21783461 - 21783350
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21783461 aagctttattcaggtattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttgc 21783364  T
Q  121 ttcccctattgatt 134  Q
    |||| |||||||||    
T  21783363 ttccgctattgatt 21783350  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21789684 - 21789573
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21789684 aagctttattcaggtattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttgc 21789587  T
Q  121 ttcccctattgatt 134  Q
    |||| |||||||||    
T  21789586 ttccgctattgatt 21789573  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21770710 - 21770546
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |    
T  21770710 aagctttattcagatattcctaatac--taattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttac 21770613  T
Q  121 ttcccctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaattt 183  Q
    |||| ||||| |||    || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21770612 ttcctctattaatttacgattgttgatcatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaattt 21770546  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Original strand, 17581640 - 17581797
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17581640 aagctttatccaggtattcctaataccctaattctt---------ggtaaatcaaacatgtcgtagatcctataataatcatgttcaatgttttgtttgc 17581730  T
Q  121 ttcccctattgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttc 184  Q
    |||| |||| |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||    
T  17581731 ttccgctatcgattcataatagttgaacatgttttatgaattatgtttttatttagatctaaatttc 17581797  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 6097999 - 6098181
Alignment:
Q  34 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccccta-ttga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||    |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  6097999 gtattcctaataccctaattcttaacat-cttgataaatcaaacacgtcgtagatccgttc---ttcatgttcaatgttttgtctacttccgctatttga 6098094  T
Q  133 ttcata------gttgaacatattttatgaaatctg-tttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    ||||||      ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||  |||||||    
T  6098095 ttcataattgttgttgaacatgttttatgaaatttgttttttattaagacctaagttttcaacaagtggtatgagagcaatcttcat 6098181  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 34603457 - 34603382
Alignment:
Q  48 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34603457 ctaattgttaatatccttgataaatcaaacatgccatagatccgatcataattatgttcaatgctttgtttgcttc 34603382  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 34724734 - 34724659
Alignment:
Q  48 ctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttc 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34724734 ctaattgttaatatccttgataaatcaaacatgccatagatccgatcataattatgttcaatgctttgtttgcttc 34724659  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Original strand, 6102694 - 6102803
Alignment:
Q  87 atccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt-gattcata------gttgaacatattttatgaaatctg-tttttattaagaccta 178  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||       ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  6102694 atccgttcatattgatgttcaatgttttgtctgcttccgctatttgattcatgattgttgttgaacatattttatgaaatatgttttttatgaagaccta 6102793  T
Q  179 aatttccaac 188  Q
    ||||||||||    
T  6102794 aatttccaac 6102803  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Original strand, 1106229 - 1106294
Alignment:
Q  32 aggtattcctaataccct-aattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcat 96  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1106229 aggtattcctaataccttgaattattaatattcttgatgaatcaaacatgttgtagatccgatcat 1106294  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17900283 - 17900176
Alignment:
Q  30 tcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctat 129  Q
    |||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||| || ||| |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||     
T  17900283 tcagatattccaaatacc-tgattattaatatccttgatggaccaaacatgttgtagattcgaacatatttatgtacaattttttgtttgcttcccctaa 17900185  T
Q  130 tgattcata 138  Q
    | |||||||    
T  17900184 taattcata 17900176  T

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Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35090803 - 35090610
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090803 aagctttatccaggtattcctaatacactaattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 35090704  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35090703 ttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaattt-caacaagtggtatcagagcggtcttcat 35090610  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 36750430 - 36750591
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36750430 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatt 36750529  T
Q  131 gattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36750530 gattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagacttaaatttccaaca 36750591  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 31002369 - 31002577
Alignment:
Q  8 agggttgctaccgaagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31002369 agggctgctacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttgatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 31002468  T
Q  108 atgttttgtttgcttcccctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagc 203  Q
    || |||||||||||||| |||||||||    || ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31002469 atattttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacaagtggtatcagagc 31002568  T
Q  204 ggtcttcat 212  Q
    |||||||||    
T  31002569 ggtcttcat 31002577  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28683099 - 28682928
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683099 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 28683000  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28682999 ttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaatttccaaca 28682928  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 13456105 - 13456299
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13456105 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgc 13456204  T
Q  121 ttcccctattgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||| ||||||||||   || ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13456205 ttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatgaaatctatttatattaagacctatatttccaacaagtggtatcagagcggtcttcat 13456299  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 31008347 - 31008537
Alignment:
Q  8 agggttgctaccgaagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttca 107  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31008347 agggctgctacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttgatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 31008446  T
Q  108 atgttttgtttgcttcccctattgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaacaggtgg 194  Q
    || |||||||||||||| |||||||||    || ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31008447 atattttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaacaggtgg 31008537  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35084830 - 35084665
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35084830 aagctttatccaggtattcctaatacactaattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcattttcaatgttttgtttgc 35084731  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaattt 183  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35084730 ttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatattaagacctaaattt 35084665  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44716959 - 44716787
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgtttt-gtttg 119  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44716959 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttcttttg 44716860  T
Q  120 cttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||||| ||||||||| |||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44716859 cttccgctattgattgataaccgttgaacatgttttatgatatctgtttttattaagacctaaatttctaaca 44716787  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 13462046 - 13462217
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13462046 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgc 13462145  T
Q  121 ttcccctattgattc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| ||||||||||   || ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13462146 ttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatgaaatctatttatattaagacctatatttccaaca 13462217  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13149830 - 13149674
Alignment:
Q  30 tcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctat 129  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13149830 tcaggtattcttaataccctaattcttaatatc-ttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctat 13149732  T
Q  130 tgatt---catagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttc 184  Q
    |||||    || ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13149731 tgatttacgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttatattaagacctaaatttc 13149674  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Original strand, 30965343 - 30965505
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30965343 caggtattcctaataccctaattcttaaaataattgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctatt 30965442  T
Q  131 gat---tcatagttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||   | || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30965443 gatttatgattgttgaacatgtattatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttctaaca 30965505  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11048707 - 11048536
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11048707 aagctttatccaagtattcctagtgccctaattcttaatatccttggtacatcaaacatgacgtatatccaatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 11048608  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||  |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11048607 ttcagctattgattcataattgttggacatgttttatgaaatttatttttaataagacctaaatttccaaca 11048536  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 23343579 - 23343737
Alignment:
Q  34 gtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgat 133  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23343579 gtattcctaataccccaactcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagattcgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgat 23343678  T
Q  134 tc---atagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    ||   || ||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||    
T  23343679 tcgtaatcgttgaacatgttttatgaaatctcttcttatcaagatctaaatttcaaaca 23343737  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35438816 - 35438692
Alignment:
Q  68 taaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtt 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| || |    
T  35438816 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgctattgattcataactgttgaacatgttttatgaaatttg-t 35438718  T
Q  165 tttattaagacctaaatttccaacag 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35438717 tttattaaggcctaaatttccaacag 35438692  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 212
Target Start/End: Original strand, 29833255 - 29833407
Alignment:
Q  63 cttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattc---atagttgaacatattttatgaaat 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||   ||  || ||||| | |||||||||    
T  29833255 cttgataaatcaaacatgttgtcgatccgatcataattatgttcaatattttatttgtttccgttattgattcacaattattaaacatgtattatgaaat 29833354  T
Q  160 ctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    || ||| |||| | ||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||    
T  29833355 ctctttatatttatacctaaatttctaacaagtagtatcagagcagtcttcat 29833407  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 114
Target Start/End: Original strand, 31651664 - 31651703
Alignment:
Q  75 aacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgtttt 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31651664 aacatgtcataaatccgatcataatcatgttcaatgtttt 31651703  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 173044 - 172831
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  173044 aagctttatccatgtattcctaatatcctaattcttaatatccttgataaattaaacatgtcgtagatccgatcataatcattttcaatgttttgtttgc 172945  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcatatttc 217  Q
    |||| |||||||||||||   || |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  172944 ttccgctattgattcataattgtagaacatgttttatgaaacctgtttatattaagacctaaattttcaacaagtagtatcagagcggtcttcatgtttg 172845  T
Q  218 atctactgggatta 231  Q
    || || ||||||||    
T  172844 atttattgggatta 172831  T

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Target: scaffold0236 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 5540 - 5711
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5540 aagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 5639  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  5640 ttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttatatcaagagctaaatttccaaca 5711  T

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Target: scaffold0440 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1348 - 1176
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1348 aagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatatcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 1249  T
Q  121 ttcccctattgattcata---gttgaacatattttatgaaatctgttttt-attaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |  ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1248 ttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatgaaatctgtttttaattaagacctaaatttccaaca 1176  T

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Target: scaffold0208 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 6528 - 6722
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6528 aagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtagattcagtcataatcatgttcaatgttttgtttgc 6627  T
Q  121 ttcccctattgattcata----gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaacaggtggtatcagagcggtcttcat 212  Q
    |||| |||||||||||||    |||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6628 ttccgctattgattcataaattgttgaacatggtttatgaaat-tgtttatattaagagctaaatttccaacaagtggtatcagagccgtcttcat 6722  T

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Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 12401 - 12572
Alignment:
Q  21 aagctttagtcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgc 120  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12401 aagctttatccagatattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagattcgatcataattatgttcaatgttttatttgc 12500  T
Q  121 ttcccctattgattcata----gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
    |||| |||||||||||||    |||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12501 ttccgctattgattcataaattgttgaatatggtttatgaaat-tgtttatattaagagctaaatttccaaca 12572  T

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Target: scaffold0085 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 185
Target Start/End: Original strand, 38445 - 38600
Alignment:
Q  31 caggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctatt 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  38445 caggtattcctaatacc-taattattaatattcttgataaa-caaacatgttgtagatccgatcataactatgttcaatgttttgtttgcttccactgtt 38542  T
Q  131 gat---tcatagttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttcc 185  Q
    |||   | ||  |||||||| | |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  38543 gatttctaatgattgaacatgtcttatgaaatctggttttatttaatcctaaatttcc 38600  T

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Target: scaffold1114 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 1107 - 1261
Alignment:
Q  35 tattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcccctattgatt 134  Q
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T  1107 tatttctaatactctaattgttaatatgcatgataagtcaaacatgtcgttgatccgatcataatcatatctaaa---ttgtttgctttcgatattgatt 1203  T
Q  135 cata---gttgaacatattttatgaaatctgtttttattaagacctaaatttccaaca 189  Q
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T  1204 cataatggttgaacatgttttatgaaatctgtttttattaagatctgaatttccaaca 1261  T

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Target: scaffold0185 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 118
Target Start/End: Original strand, 5945 - 6025
Alignment:
Q  37 ttcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatgttttgttt 118  Q
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T  5945 ttcctaatacc-taattaataatatttttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcatattcatgttcaatgttttgttt 6025  T

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Target: scaffold1064 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1064
Description:

Target: scaffold1064; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 138
Target Start/End: Original strand, 1401 - 1488
Alignment:
Q  55 ttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataat----catgttcaatgttttgtttgcttcccctattgattcata 138  Q
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T  1401 ttaatatatttgattaatcaaacatgtcgtaaatccgagcataatatacaatattcaatgttctgtttgcttagactattgattcata 1488  T

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