View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4226_low_1 (Length: 746)

Name: NF4226_low_1
Description: NF4226
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4226_low_1
NF4226_low_1
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (253-729)||(5613627-5614103)
chr4 (17-727)||(5894401-5895114)
chr4 (18-514)||(5847557-5848049)
chr4 (17-462)||(5885824-5886269)
chr4 (475-727)||(5885508-5885760)
chr4 (17-400)||(5565085-5565468)
chr4 (46-438)||(3749266-3749658)
chr4 (17-400)||(5605402-5605786)
chr4 (17-402)||(5858349-5858734)
chr4 (101-446)||(5852499-5852844)
chr4 (96-403)||(5582866-5583173)
chr4 (122-446)||(5553599-5553923)
chr4 (595-727)||(5847416-5847548)
chr4 (116-403)||(5570659-5570946)
chr4 (473-727)||(5559765-5560019)
chr4 (483-714)||(5582537-5582768)
chr4 (473-717)||(5538467-5538711)
chr4 (473-667)||(5570374-5570568)
chr4 (473-717)||(5858820-5859064)
chr4 (203-367)||(5538832-5538996)
chr4 (203-402)||(5559480-5559679)
chr4 (476-683)||(3749711-3749918)
chr4 (558-715)||(5852215-5852372)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (181-370)||(1485703-1485892)
chr8 (476-727)||(1486008-1486259)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (181-370)||(884-1074)
scaffold0454 (476-727)||(1191-1444)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 253 - 729
Target Start/End: Original strand, 5613627 - 5614103
Alignment:
Q  253 ctgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgatagattacagttagacatgctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagc 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5613627 ctgataggttctctagttttgaaagggaagaatcaagaggtcctgatagattacagttagacatgctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagc 5613726  T
Q  353 attgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagatacagtcgcctcatattgatgagattttggataagcttttgtaaatttgggatt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5613727 attgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagatacagttgcctcatattggtgagattttggataagcttttgtaaatttgggatt 5613826  T
Q  453 ttaggttttgtgtcgacatcagaagagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaatctctattggaatctgccccacaaattcattatatgaca 552  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5613827 ttaggttttgtgtcgacataagaagagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaatctctattggaatctgccccacaaattcattatatgaca 5613926  T
Q  553 aatcaagataagttaacttcaccaacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagatt 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5613927 aatcaagataagttaacttcaccaacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaataattattagccaagttcagtttcttgagatgtaggagatt 5614026  T
Q  653 gaaaagactacttgattcgtcaattccaccagaaatagattctccactcaggtcaaggccaataatatatccctcgt 729  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5614027 gaaaagactacttgattcttcaattccaccagaaatagattcttcactcaggtcaaggccaataatatatccctcgt 5614103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 17 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 5895114 - 5894401
Alignment:
Q  17 tgtgttactcagtataatgctatggagatattcactaagtgagtagtttggaaaataaacatggagattgggattgtcagataagtcaatatctgaaagt 116  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  5895114 tgtgttacgcaatataatgctatgaagagattcactaagtgagtagtctggaaaaaaaacttggagattggggttgccagataagtcaataactgacagt 5895015  T
Q  117 gttctaatttgaaagatggtttgtggaaatgtactggtcaacccacaatcataaagattgagggtggttaggtttttaaaattagcaaatgtttgtggca 216  Q
    || |||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||| ||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5895014 gtcctaatttggaagatcttttgtggaaatgtaccgatcaatccacactttcgaagattgagggtggttaggtttttaaaattggcaaatgtttctggca 5894915  T
Q  217 ctggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgatagattacagttagacat 316  Q
     || |||||||||||||||   |  ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||| |  ||||| | || ||| ||||||||    
T  5894914 atgaggatgaaaaattgtttcgataaagaataatgactgacaggttctgtagtcttgatagggaagaatcaagggatcctgacaaatcacaattagacat 5894815  T
Q  317 gctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagatacagtcgcctcatattg 416  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5894814 gctcaattcttgtaggtcacgcaaaggtatcaaagcattgctccatttatgtctctgagatgttatagttataccatctagatacagttgcctaatattg 5894715  T
Q  417 atgagattttggataagcttttgtaaatttgggattttaggttttgtg---tcgacatcagaagagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaa 513  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||||    
T  5894714 gtgagattttggataaacttttgtaaatttgggatattaggtttcgtgcgaacgacatcaaaagagagatcaagagtaaccaaccttgtaagttgtgaaa 5894615  T
Q  514 tctctattggaatctgccccacaaattcattatatgacaaatcaagataagttaacttcaccaacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaata 613  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   |   | ||||||||  |||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||   |||||| ||||     
T  5894614 tctcaattggaatctgccccacaaagctagcctttgacaaattcagataagtcaacttctccaatttgctgaatcctgatggaattagagaattgaaatt 5894515  T
Q  614 attatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaaagactacttgattcgtcaattccaccagaaatagattctccactcaggtcaaggcca 713  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||   |||  |||  |||| ||||||||||||    
T  5894514 gttataagccaagttcagttttttgagatgtaggagattgaaaagactgcttgaatcgttaaatccaccatggatatcttcgtcactaaggtcaaggcca 5894415  T
Q  714 ataatatatccctc 727  Q
    |||| || ||||||    
T  5894414 ataacatgtccctc 5894401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 5848049 - 5847557
Alignment:
Q  18 gtgttactcagtataatgctatggagatattcactaagtgagtagtttggaaaataaacatggagattgggattgtcagataagtcaatatctgaaagtg 117  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||         
T  5848049 gtgttacgcaatataatgctatgaagagattcactaagtgagtggtctggaaaaaaaccatggaggttggggttgtcagataagtcaatagctgac---- 5847954  T
Q  118 ttctaatttgaaagatggtttgtggaaatgtactggtcaacccacaatcataaagattgagggtggttaggtttttaaaattagcaaatgtttgtggcac 217  Q
    || ||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||| ||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5847953 ttttaatttggaagatattttgtggaaatgtaccgatcaatccacactttcgaagattgagggtggttaggtttttaaaattggcaaatgtttgtggcac 5847854  T
Q  218 tggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgatagattacagttagacatg 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| | |||||||    
T  5847853 tggggatgaaaagttgttctcaccaagaacaatgaccgtcaggttctctagtcttgttagggaagaatcaaggggtcctgatagatcacaatcagacatg 5847754  T
Q  318 ctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagatacagtcgcctcatattga 417  Q
    ||||  | ||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||     
T  5847753 ctcaacttttgcaggtcacgcaaaggcaacaaagcattgctccattcatgtccccgagatgttatacttataccatctagatacatttgcctaatattgg 5847654  T
Q  418 tgagattttggataagcttttgtaaatttgggattttaggttttgtgtcgacatcagaagagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaat 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5847653 tgagattttggataaacttttgtagatttgggattttaggttttgtgtcgacataagaagagagatcaagagtaaccaacctcgtgagttgtgaaat 5847557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 5886269 - 5885824
Alignment:
Q  17 tgtgttactcagtataatgctatggagatattcactaagtgagtagtttggaaaataaacatggagattgggattgtcagataagtcaatatctgaaagt 116  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||    
T  5886269 tgtgttactcactctaatgctatgaagatattcactaagtgagtaatcagggaaaaaaacatggagattggggttgtcagataagtcaataattgacagt 5886170  T
Q  117 gttctaatttgaaagatggtttgtggaaatgtactggtcaacccacaatcataaagattgagggtggttaggtttttaaaattagcaaatgtttgtggca 216  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||   ||||| || ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5886169 gttctaatttggaagatcttttgtggaaatgtatctgtcaatccgcaattttgaagattgagggtggttaggtttttaaaattggcaaatgtttgtggca 5886070  T
Q  217 ctggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgatagattacagttagacat 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||    
T  5886069 ctggggatgaaaaattgttctcgccaagaataatgaccgataggttctctagttttgaaagggaggaatcaaggggtcctgatagactacagttatacat 5885970  T
Q  317 gctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagatacagtcgcctcatattg 416  Q
    |||||  ||||| | ||| | ||  || |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5885969 gctcaactcttgcaagtcacgcagcggtaacaaagcattactccattcatatcccggagatgttatacttataccatctagatacagttgcctaatattg 5885870  T
Q  417 atgagattttggataagcttttgtaaatttgggattttaggttttg 462  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  5885869 gtaagattttggataagcttttgtagatttgagattttaagttttg 5885824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 475 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 5885760 - 5885508
Alignment:
Q  475 aagagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaatctctattggaatctgccccacaaattcattatatgacaaatcaagataagttaacttcac 574  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||||  |||| ||  || ||||||||  |||||||| |||||| |    
T  5885760 aagagatatcaagagtaaccaaccttgtaagatgggaaatctcaattggaatctccccctgaaatccagcatctgacaaattcagataagtcaacttctc 5885661  T
Q  575 caacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaaagactacttgattcgtca 674  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5885660 caacttgttgaaagctgatggaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgcaagagactgaaaagactacttgattcgtca 5885561  T
Q  675 attccaccagaaatagattctccactcaggtcaaggccaataatatatccctc 727  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5885560 aatccaccaaaaatagattctccactcaggtcaaggccaacaacatatccctc 5885508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 400
Target Start/End: Original strand, 5565085 - 5565468
Alignment:
Q  17 tgtgttactcagtataatgctatggagatattcactaagtgagtagtttggaaaataaacatggagattgggattgtcagataagtcaatatctgaaagt 116  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| ||  || |||||||||||   ||    |||||||||||| | || | |    
T  5565085 tgtgtaactcactataatgctatgaagagattcacttagtgagtagtctgggaatgaaccatggagattgtagttaaatgataagtcaataacagacaat 5565184  T
Q  117 gttctaatttgaaagatggtttgtggaaatgtactggtcaacccacaatcataaagattgagggtggttaggtttttaaaattagcaaatgtttgtggca 216  Q
    |||  ||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5565185 gtttcaatctgaaaaatattttgtggaaatgtaccggtcaacccacaatctacaagactgagggtggtcaggtttttaaaattggcaaatgtttgtggca 5565284  T
Q  217 ctggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgatagattacagttagacat 316  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  |||| | |||||    
T  5565285 ctggggatgaaaaattattgtcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaatcaaggggtcctgaaagaccacagcttgacat 5565384  T
Q  317 gctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagata 400  Q
    ||  | |||||||||||| |  || |||||||||  | || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5565385 gcctaattcttgtaggtcacggaacggcaacaaaagactgctccattcatatccttgagatggtatacttataccatctagata 5565468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 438
Target Start/End: Original strand, 3749266 - 3749658
Alignment:
Q  46 attcactaagtgagtagtttggaaaataaacatggagattgggattgtcagataagtcaatatctgaaagtgttctaatttgaaagatggtttgtggaaa 145  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||    |||| | | |||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||| |  ||||||||    
T  3749266 attcactcattgagtagtgtggaaaaaagccatggagatttttgttgttaaacaagtcaatagttgacagtgttccaatctgaaagattgcatgtggaaa 3749365  T
Q  146 tgtactggtcaacccacaatcataaagattgagggtggttaggtttttaaaattagcaaatgtttgtggcactggggatgaaaaattgttctcaccaaga 245  Q
    ||||| ||||||  |||||     |||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  3749366 tgtaccggtcaattcacaaagcgcaagactgagggtggtcaagtttttaaaattggcaaatgttttcggcactggtgatgaaaaattgttcccatcaaga 3749465  T
Q  246 ataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgatagattacagttagacatgctcagttcttgtaggtcgctcaaaggca 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| || ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| | ||| ||||    
T  3749466 ataatgactgataggttctctagtcttgttagggaagaatcaaggggtcctgataaatcacagtaagacatgctcaattcttgcaagtcacgcaacggca 3749565  T
Q  346 acaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagatacagtcgcctcatattgatgagattttggataagctttt 438  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  3749566 acaaagcattgctcaattcatgtcctcgagatgttatacttatcccatctagatatagttgcctaatattggtgagattttggacaagatttt 3749658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 400
Target Start/End: Original strand, 5605402 - 5605786
Alignment:
Q  17 tgtgttactcagtataatgctatggagatattcactaagtgagtagtttggaaaataaac-atggagattgggattgtcagataagtcaatatctgaaag 115  Q
    ||||||||||   |||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5605402 tgtgttactcgccataatgctgtgaagagattcactaagtgagtagtctggaaaaaaaaccatgaaggttagggttgtcagataagtcaatatctgacag 5605501  T
Q  116 tgttctaatttgaaagatggtttgtggaaatgtactggtcaacccacaatcataaagattgagggtggttaggtttttaaaattagcaaatgtttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5605502 tgttctaatttgaaatatattttgtggaaatgttccagtcaatccacaatcgttaagattgagggtggttaggtttttaaaattggcaaatgtttctggc 5605601  T
Q  216 actggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgatagattacagttagaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| ||||||||   |||  ||||||||| |||| || ||||| | |  |||||  ||||    
T  5605602 actggggatgaaaaattgttcccatcaagaagaatgacagataagttctctaaccttgctagggaagaatcaaggggtcctgaaaaaccacagtctgaca 5605701  T
Q  316 tgctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagata 400  Q
    | |  | |||||||||||| |  |  |||||||||  | || ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  5605702 tacctaattcttgtaggtcacggagcggcaacaaaagactgctccattcatatccttgagctggtatacttataccatctagata 5605786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Original strand, 5858349 - 5858734
Alignment:
Q  17 tgtgttactcagtataatgctatggagatattcactaagtgagtagtttggaaaataaacatggagattgggattgtcagataagtcaatatctgaaagt 116  Q
    ||||| ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  || || |||||||    |||  | ||||||||||  | || | |    
T  5858349 tgtgtcactcactctaattctatgaagagattcacttagtgagtagtttggaaatgaaccacggagattttcgttggaaaataagtcaatcacagacaat 5858448  T
Q  117 gttctaatttgaaagatggtttgtggaaatgtactggtcaacccacaatcataaagattgagggtggttaggtttttaaaattagcaaatgtttgtggca 216  Q
    |||| ||| ||||||||  | ||||||||||||| ||  ||  |||||     |||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  || |    
T  5858449 gttccaatctgaaagatcttctgtggaaatgtaccggataatgcacaaaatgcaagactgagggtagtcaagtttttaaaatttgcaaatgtttcaggaa 5858548  T
Q  217 ctggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgatagattacagttagacat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| |||||  ||||  ||||||    
T  5858549 ctggggatgaaaaatagttctcatcaagaataatgactgataggttctctagttttgttagggaagaatcaaggggacctaatagaccacaggaagacat 5858648  T
Q  317 gctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagataca 402  Q
    ||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  5858649 gctcaattcttgtaggtttcgcaacggcaacaaagcattgatccattcatgtcccttagctgatatacttacactatctagataca 5858734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 5852844 - 5852499
Alignment:
Q  101 gtcaatatctgaaagtgttctaatttgaaagatggtttgtggaaatgtactggtcaacccacaatcataaagattgagggtggttaggtttttaaaatta 200  Q
    ||||||| | || ||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||| | |||||||| ||||||| |||||||    
T  5852844 gtcaataacagacagtgttccaatctgaaagatcttctgtggaaatgtaccagtcaatccacaatctgaaagactaagggtggtcaggttttgaaaatta 5852745  T
Q  201 gcaaatgtttgtggcactggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgata 300  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  5852744 gcaaatgtttctggaacgggggaagaaaaattgttcctatcaagaataatgactgataggttccttagttttgatagggaagaatcaagtggccctgcta 5852645  T
Q  301 gattacagttagacatgctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagata 400  Q
    ||| ||| ||| ||| |||||    |||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||| | ||||| | ||||||||    
T  5852644 gatcacatttatacaagctcaacatttgtagttcacgcagtggcaacaaagcattgctccattcctgcccctcagatgttagagttatatcttctagata 5852545  T
Q  401 cagtcgcctcatattgatgagattttggataagcttttgtaaattt 446  Q
    |||| |||| || ||| | |||||||||| || |||||||| ||||    
T  5852544 cagttgcctaatcttggtcagattttggacaaacttttgtagattt 5852499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5583173 - 5582866
Alignment:
Q  96 gataagtcaatatctgaaagtgttctaatttgaaagatggtttgtggaaatgtactggtcaacccacaatcataaagattgagggtggttaggtttttaa 195  Q
    ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||     |||| ||||||||||||  ||||| |    
T  5583173 gataagtcaataaatgagaacgttccaatttgaaagatggtttttggaaatttaccagtcaatccacaagatgcaagactgagggtggttaattttttga 5583074  T
Q  196 aattagcaaatgtttgtggcactggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccc 295  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||| || ||    
T  5583073 aattggaaaatgtttgtggcactggggatgaaaaattgttcccatcaagaataatgactgataggttctttagtcttgttagggaagaatcaaggggacc 5582974  T
Q  296 tgatagattacagttagacatgctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatct 395  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||| | |||| ||||    ||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  5582973 tgatagatcacaataagacatactcaatacttggaggttaggcaggggcaacaaagcattcctccattcttgtccctgagcttttatacttacaccatct 5582874  T
Q  396 agatacag 403  Q
    ||||||||    
T  5582873 agatacag 5582866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 122 - 446
Target Start/End: Original strand, 5553599 - 5553923
Alignment:
Q  122 aatttgaaagatggtttgtggaaatgtactggtcaacccacaatcataaagattgagggtggttaggtttttaaaattagcaaatgtttgtggcactggg 221  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  || || ||||||     |||| | |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| || |||    
T  5553599 aatttgaaagatcttttgtggaaatgtacctgttaatccacaagatgtaagactaagggtggtcaggttttgaaaattggcaaatgtttctggaacgggg 5553698  T
Q  222 gatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgatagattacagttagacatgctca 321  Q
    || ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  5553699 gaagaaaaattgttcctatcaagaataatgaccgataggttttttagttttgatagggaagaatctagtggccctgctagatcacagttatacatgctca 5553798  T
Q  322 gttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagatacagtcgcctcatattgatgag 421  Q
      |||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||| || ||| | ||    
T  5553799 actcttgtagttcacacagcggcaacaaagcattgctccattcaggtccctcagatgttagagttataccttctaaatacagttgcctaatcttggtaag 5553898  T
Q  422 attttggataagcttttgtaaattt 446  Q
    |||||||| || |||||||| ||||    
T  5553899 attttggacaaacttttgtagattt 5553923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 595 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 5847548 - 5847416
Alignment:
Q  595 gaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaaagactacttgattcgtcaattccaccagaaatagattc 694  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  5847548 gaatggaagaatttaaataattatgagccaagttcagttccttgagatgtaggagattgaaaagaatacttgattcgttaaatccacctgaaatagattc 5847449  T
Q  695 tccactcaggtcaaggccaataatatatccctc 727  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5847448 ttcactcaggtcaaggccaataacatatccctc 5847416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5570946 - 5570659
Alignment:
Q  116 tgttctaatttgaaagatggtttgtggaaatgtactggtcaacccacaatcataaagattgagggtggttaggtttttaaaattagcaaatgtttgtggc 215  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  5570946 tgttccaatttgaaagatattttgtggaaatgtacctgtcaatccacaagatgaaagactgagggtggttagttttttaaaattggaaaatgtttctggc 5570847  T
Q  216 actggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgatagattacagttagaca 315  Q
    ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||| | |||||    
T  5570846 actagggatgagaaatagttcccatcaagaataatgactgataggttctttagtcttgttagggaagaagaaaggggtcctgatagatcacaataagaca 5570747  T
Q  316 tgctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagatacag 403  Q
    | |||| | |||| ||||  | ||  || ||||||||||   ||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5570746 tactcaatacttggaggttacgcagcggaaacaaagcatcactccattcttgtccctgagcttttaaacttacaccatctagatacag 5570659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 473 - 727
Target Start/End: Original strand, 5559765 - 5560019
Alignment:
Q  473 agaagagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaatctctattggaatctgccccacaaattcattatatgacaaatcaagataagttaacttc 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||||| || ||||||    
T  5559765 agaagagagatcaagagtaaccaaccttttgagctgagaaatctctacaggaatttgccccacaaagctagcatatgacaaattcagatatgtcaacttc 5559864  T
Q  573 accaacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaaagactacttgattcgt 672  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | | |||||||||| ||||| ||||    
T  5559865 tccaacttgttgaatcctgatggaatggaagaattgaaatagttatcagccaaattcagtttctggaggtgttgcaaactgaaaagactgcttgaatcgt 5559964  T
Q  673 caattccaccagaaatagattctccactcaggtcaaggccaataatatatccctc 727  Q
     || |||||||   |||  |||  |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  5559965 taaatccaccatggatatcttcgtcactaaggtcaaggccaataacatgtccctc 5560019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 483 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 5582768 - 5582537
Alignment:
Q  483 tcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaatctctattggaatctgccccacaaattcattatatgacaaatcaagataagttaacttcaccaacttgt 582  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |  |||||||||||  | |||| | ||| ||||||||||||    
T  5582768 tcaagagtaaccaaccttgtaagctgagaaatctctataggaatttgccccacaaagttagcatatgacaaattcaaataactcaacatcaccaacttgt 5582669  T
Q  583 tgaatgctgatggaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaaagactacttgattcgtcaattccacc 682  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| ||||  ||| |||||||||||| ||| |  |||||| | ||| | |||||||| ||||  |  |||| ||||||    
T  5582668 tgaatcctgatggaatgacagaattgaaattgttagcagccaagttcaatttttgaagatgttgaagactaaaaagactgcttgcattatcaaatccacc 5582569  T
Q  683 agaaatagattctccactcaggtcaaggccaa 714  Q
    ||| || |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  5582568 agagattgattcttcactcagatcaagaccaa 5582537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 473 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 5538711 - 5538467
Alignment:
Q  473 agaagagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaatctctattggaatctgccccacaaattcattatatgacaaatcaagataagttaacttc 572  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||  |||||| | ||| ||    
T  5538711 agaagagatatctagagttaccaaccttgtaagctgagaaatctctaaaggaatctgccccacaaagttagcatatgacaaattcagataactcaacatc 5538612  T
Q  573 accaacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaaagactacttgattcgt 672  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | |||| | ||||  ||| |||||||||||| |||||  |||| | | ||| | |||||||||||||  |  |    
T  5538611 accaacttgttgaatcctggtggaatagcagaactgaaattgttagcagccaagttcaatttctgaagattttgaagactaaaaagactacttgtattat 5538512  T
Q  673 caattccaccagaaatagattctccactcaggtcaaggccaataa 717  Q
    ||| ||||||||  || |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  5538511 caaatccaccagtgattgattcttcactcagatcaagaccaataa 5538467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 5570568 - 5570374
Alignment:
Q  473 agaagagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaatctctattggaatctgccccacaaattcattatatgacaaatcaagataagttaacttc 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| | |  |||||| ||||  |||||| | ||| ||    
T  5570568 agaagagagatcaagagtaaccaaccttgtaagctgagaaatctctatagaaatatgccccacaaagttagcatatgataaattcagataattcaacatc 5570469  T
Q  573 accaacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaaagactacttga 667  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||   |||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |  |||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  5570468 accaatttgttaaatcctgatggaataacagaattgaaattgttatcagccaagttcaatttttgaagatgatggagactaaaaagactacttga 5570374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 473 - 717
Target Start/End: Original strand, 5858820 - 5859064
Alignment:
Q  473 agaagagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaatctctattggaatctgccccacaaattcattatatgacaaatcaagataagttaacttc 572  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||  |  || ||  | ||  ||||| || ||||||    
T  5858820 agaagagatatcaagagtaaccaaccttataagctgggaaatttctattggaatcttcccgtgaaatctagcatctgtaagattcagatatgtcaacttc 5858919  T
Q  573 accaacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaaagactacttgattcgt 672  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||| ||| | ||||||| |||||   || ||||| ||||  |  |    
T  5858920 tccagcttgttgaatgctgatggaatggaagaattgaaattgttaaaagccaagttcactttttggagatgttggagaccaaatagactgcttgtatttt 5859019  T
Q  673 caattccaccagaaatagattctccactcaggtcaaggccaataa 717  Q
    ||| ||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5859020 caaatccaccatagatatattctgcactcaagtcaaggccaataa 5859064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5538996 - 5538832
Alignment:
Q  203 aaatgtttgtggcactggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgataga 302  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||  ||||| ||||||||| |||| || || ||  ||||||| |||| || |    
T  5538996 aaatgtttcaggcactggggaagaaaaattgtttccatcgagaataatgatcgatagattctctagtcttgacagagatgattcaagaggtcctgttaaa 5538897  T
Q  303 ttacagttagacatgctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatg 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||  |    || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5538896 ttacagttagacatggtcagttcttctagaccatgtaacggcaacaaagcattgctccattcatg 5538832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 402
Target Start/End: Original strand, 5559480 - 5559679
Alignment:
Q  203 aaatgtttgtggcactggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaagggaagaagcaagaggccctgataga 302  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||  || ||||||||||||  ||||  |||| |||| |||| || || ||| |||| || |||| || |    
T  5559480 aaatgtttcaggcaccggggaagaaaaattgtttccatcaagaataatgatcgataaattctttagtcttgacagagatgaatcaaggggtcctgttaaa 5559579  T
Q  303 ttacagttagacatgctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtccctgagatgttatacttataccatctagataca 402  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||  | | ||| ||||||||||||||| |||||||||| || |  | ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  5559580 ttgcagttagacatggtcagttcttctagaccacgcaacggcaacaaagcattgctccattcatgcccttttgctgttataattacaccatccagataca 5559679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 683
Target Start/End: Original strand, 3749711 - 3749918
Alignment:
Q  476 agagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaatctctattggaatctgccccacaaattcattatatgacaaatcaagataagttaacttcacc 575  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||   |   | ||||||||  ||||| || |||||  ||    
T  3749711 agagagatcaagaataaccaaccttgtaagctgcgaaatctcaatcggaatctgccctacaaagctagcttgtgacaaattcagatatgtcaacttatcc 3749810  T
Q  576 aacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaaagactacttgattcgtcaa 675  Q
    |||||| |||||  ||||||||||  |||||| ||||  || |  |||||||| | ||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  3749811 aacttgatgaatcttgatggaatgtgagaattgaaatggttgtatgccaagtttaatttttggagatgttgaagactgaaaagactacttgaatcgttaa 3749910  T
Q  676 ttccacca 683  Q
     |||||||    
T  3749911 atccacca 3749918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 558 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 5852372 - 5852215
Alignment:
Q  558 agataagttaacttcaccaacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaataa-ttatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaa 656  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||| | |||||||||  ||  || ||| || |||| |||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||    
T  5852372 agataattcaacatcaccaacttgttgaatcccgatggaatgacagt-ttcaaacaagttataagccaaattcagtttctggagatgttcgagactgaaa 5852274  T
Q  657 agactacttgattcgtcaattccaccagaaatagattctccactcaggtcaaggccaat 715  Q
    ||||||||||| |  ||||  ||| |||| |||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  5852273 agactacttgaattatcaaaaccatcagagatatcttcttcactcaagtcaaggccaat 5852215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 370
Target Start/End: Original strand, 1485703 - 1485892
Alignment:
Q  181 tggttaggtttttaaaattagcaaatgtttgtggcactggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaaggga 280  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  1485703 tggtcaggtttttaaaattggtaaatgtttctggaattggcgatgaaagattgttcttatcaagaataatgatggttaggttctctagttttgaaaggga 1485802  T
Q  281 agaagcaagaggccctgatagattacagttagacatgctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtcc 370  Q
     ||| |||  || ||||||||| |||| ||   ||||||||   |||| || || | ||  |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1485803 ggaatcaacgggtcctgatagactacaattgctcatgctcaacacttgcagctcacgcagcggcaacaaggcattgctccattcatgtcc 1485892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 727
Target Start/End: Original strand, 1486008 - 1486259
Alignment:
Q  476 agagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaatctctattggaatctgccccacaaattcattatatgacaaatcaagataagttaacttcacc 575  Q
    ||||| |||||||||||||||  | || || || ||||||||||| ||||||| ||| |||||   |  || ||||||||  | |||| | ||| |||||    
T  1486008 agagaaatcaagagtaaccaaatttgtaagttgtgaaatctctataggaatctcccctacaaagctagcatgtgacaaattcaaataattcaacatcacc 1486107  T
Q  576 aacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaaagactacttgattcgtcaa 675  Q
    || ||||||||| ||||||| |||  |||||| ||    || ||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| | || ||    
T  1486108 aatttgttgaatcctgatgggatgagagaattgaatctgttttcagctaagttgagtctctcgagatgttggagactaaaaagactacttgaattgttaa 1486207  T
Q  676 ttccaccagaaatagattctccactcaggtcaaggccaataatatatccctc 727  Q
     ||||||||  || |||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||    
T  1486208 atccaccagtgattgattcttcactaaggtcaaggtcaataacatgtccctc 1486259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 370
Target Start/End: Original strand, 884 - 1074
Alignment:
Q  181 tggttaggtttttaaaattagc-aaatgtttgtggcactggggatgaaaaattgttctcaccaagaataatgactgataggttctctagttttgaaaggg 279  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  884 tggtcaggtttttaaaattaggtaaatgtttctggaattggcgatgaaagattgttcttatcaagaataatgatggttaggttctctagttttgaaaggg 983  T
Q  280 aagaagcaagaggccctgatagattacagttagacatgctcagttcttgtaggtcgctcaaaggcaacaaagcattgatccattcatgtcc 370  Q
    | ||| |||  || ||||||||| |||| ||   ||||||||   |||| || || | ||  |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  984 aggaatcaacgggtcctgatagactacaattgctcatgctcaacacttgcagctcacgcagcggcaacaaggcattgctccattcatgtcc 1074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 727
Target Start/End: Original strand, 1191 - 1444
Alignment:
Q  476 agagagatcaagagtaaccaacctcgtgagctgggaaatctctattggaatctgccccacaaattcattatatgacaaatcaagataagtt-aacttcac 574  Q
    ||||| |||||||||||||||  | || || || ||||||||||| ||||||| ||| |||||   |  || ||||||||  | |||| || ||| ||||    
T  1191 agagaaatcaagagtaaccaaatttgtaagttgtgaaatctctataggaatctcccctacaaagctagcatgtgacaaattcaaataaattcaacatcac 1290  T
Q  575 caacttgttgaatgctgatggaatggaagaatttaaataattatcagccaagttcagtttcttgagatgtaggagattgaaaa-gactacttgattcgtc 673  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||  |||||| ||    || ||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||| | ||     
T  1291 caatttgttgaatcctgatgggatgagagaattgaatctgttttcagctaagttgagtctctcgagatgttggagactaaaaaagactacttgaattgtt 1390  T
Q  674 aattccaccagaaatagattctccactcaggtcaaggccaataatatatccctc 727  Q
    || ||||||||  || |||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||    
T  1391 aaatccaccagtgattgattcttcactaaggtcaaggtcaataacatgtccctc 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University