View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4234_low_1 (Length: 701)

Name: NF4234_low_1
Description: NF4234
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4234_low_1
NF4234_low_1
[»] chr6 (80 HSPs)
chr6 (1-695)||(27604315-27605010)
chr6 (1-695)||(26802324-26803017)
chr6 (8-695)||(27592632-27593318)
chr6 (8-695)||(27678835-27679521)
chr6 (8-695)||(27677231-27677912)
chr6 (1-503)||(27698297-27698799)
chr6 (1-466)||(27718219-27718684)
chr6 (1-466)||(27610842-27611307)
chr6 (8-695)||(27706015-27706700)
chr6 (1-457)||(28781021-28781477)
chr6 (1-457)||(28786160-28786616)
chr6 (1-457)||(28792281-28792737)
chr6 (1-376)||(27724775-27725150)
chr6 (1-536)||(26884045-26884580)
chr6 (1-523)||(27530983-27531502)
chr6 (1-637)||(26646361-26646992)
chr6 (1-637)||(26752329-26752960)
chr6 (8-448)||(26655878-26656318)
chr6 (8-448)||(26761849-26762289)
chr6 (8-457)||(26861505-26861951)
chr6 (8-366)||(31284177-31284535)
chr6 (1-695)||(27427223-27427908)
chr6 (13-481)||(25579613-25580081)
chr6 (1-226)||(27229114-27229339)
chr6 (8-448)||(27337923-27338363)
chr6 (8-448)||(27398663-27399103)
chr6 (13-458)||(25481636-25482081)
chr6 (8-366)||(26622865-26623223)
chr6 (8-366)||(26728843-26729201)
chr6 (13-493)||(25538434-25538914)
chr6 (13-481)||(26142759-26143227)
chr6 (13-483)||(26055820-26056290)
chr6 (13-483)||(26075790-26076260)
chr6 (8-300)||(26823729-26824021)
chr6 (13-339)||(26048739-26049065)
chr6 (13-339)||(26069908-26070234)
chr6 (14-417)||(28234459-28234861)
chr6 (14-417)||(28226845-28227248)
chr6 (17-355)||(28242702-28243040)
chr6 (51-391)||(26848592-26848932)
chr6 (14-355)||(28325376-28325717)
chr6 (37-400)||(28181032-28181395)
chr6 (14-400)||(28185261-28185647)
chr6 (32-309)||(28139454-28139731)
chr6 (38-457)||(27214336-27214758)
chr6 (38-457)||(27234470-27234892)
chr6 (25-373)||(28098302-28098650)
chr6 (50-366)||(29825958-29826274)
chr6 (98-400)||(28297619-28297921)
chr6 (98-400)||(28514152-28514454)
chr6 (49-398)||(26949591-26949940)
chr6 (14-343)||(26341894-26342226)
chr6 (98-345)||(26937073-26937320)
chr6 (51-240)||(25506975-25507158)
chr6 (93-290)||(28149912-28150108)
chr6 (563-682)||(28786677-28786796)
chr6 (563-682)||(28792798-28792917)
chr6 (566-682)||(28781543-28781659)
chr6 (63-321)||(26811453-26811711)
chr6 (65-398)||(27665025-27665358)
chr6 (65-398)||(26635636-26635969)
chr6 (65-398)||(26741602-26741935)
chr6 (65-398)||(26974998-26975331)
chr6 (589-680)||(27698212-27698301)
chr6 (49-398)||(25071589-25071938)
chr6 (119-290)||(2184288-2184459)
chr6 (101-290)||(2184880-2185069)
chr6 (89-234)||(26893543-26893688)
chr6 (65-398)||(26959111-26959445)
chr6 (59-144)||(26617266-26617351)
chr6 (59-144)||(26723194-26723279)
chr6 (327-393)||(25506897-25506963)
chr6 (201-390)||(24715667-24715856)
chr6 (82-166)||(28491660-28491744)
chr6 (82-166)||(29804070-29804154)
chr6 (644-695)||(27610731-27610782)
chr6 (89-168)||(29467797-29467876)
chr6 (594-657)||(26143338-26143399)
chr6 (201-237)||(26617401-26617437)
chr6 (201-237)||(26723329-26723365)
[»] scaffold0349 (4 HSPs)
scaffold0349 (1-466)||(3260-3727)
scaffold0349 (1-466)||(14196-14660)
scaffold0349 (1-46)||(8061-8106)
scaffold0349 (644-695)||(14084-14135)
[»] scaffold0277 (4 HSPs)
scaffold0277 (1-448)||(4529-4976)
scaffold0277 (1-448)||(13490-13937)
scaffold0277 (566-682)||(13299-13415)
scaffold0277 (563-682)||(4336-4457)
[»] scaffold0419 (2 HSPs)
scaffold0419 (1-448)||(7407-7854)
scaffold0419 (566-682)||(7929-8045)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (1-695)||(18731111-18731796)
chr4 (1-695)||(18699007-18699692)
chr4 (1-695)||(18655084-18655769)
chr4 (1-695)||(18723692-18724377)
chr4 (1-695)||(18679167-18679859)
chr4 (1-695)||(18073647-18074332)
chr4 (23-358)||(5090902-5091237)
chr4 (1-336)||(17989013-17989342)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (1-456)||(28127516-28127972)
chr1 (1-456)||(28164200-28164654)
chr1 (37-676)||(267976-268613)
chr1 (569-620)||(28164048-28164100)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-695)||(59455-60140)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (1-213)||(10-222)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (1-448)||(29273628-29274075)
chr8 (1-237)||(31903733-31903969)
chr8 (63-234)||(16373134-16373305)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (14-417)||(34620-35023)
scaffold0038 (14-400)||(27343-27729)
scaffold0038 (17-355)||(42864-43202)
scaffold0038 (14-355)||(116691-117032)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (37-343)||(58245-58551)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (52-342)||(16688944-16689234)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (23-254)||(3279592-3279823)
chr2 (62-397)||(17993593-17993928)
chr2 (120-237)||(17711967-17712084)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 540; Significance: 0; HSPs: 80)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 27605010 - 27604315
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27605010 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcgatacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaattcatacc 27604911  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604910 ttcattgatgaaaatgatcttcgaagaggagatgaaatcacaccagcacttctcaaggccattgatgaatccaggatttttattcctgtgttttctatca 27604811  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604810 aatatgcctcttcttccttttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacacgacaaagggtcgcgtcgttttgcctgttttctttggtgtgga 27604711  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||  |||||||||||    
T  27604710 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttacggtcaagcattggctgagcataaaaaaaggtttcaaaatgatgaggataacataaagaggttgcag 27604611  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27604610 cgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctgggtactcaacactacataaatcctatttttcccttttgt 27604511  T
Q  501 attttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagttat 599  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27604510 attttctttattcaatttcaattacccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaacaagtattagttat 27604411  T
Q  600 ttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27604410 ttatatgtcaaaatagttagaaatgtataatatattctgagtgtacatggatgtgattatgatgttgttacatactaacttatcttattggacatg 27604315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 695
Target Start/End: Original strand, 26802324 - 26803017
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26802324 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatacc 26802423  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26802424 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatca 26802523  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26802524 actatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctattttctttggtgtgga 26802623  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
     ||| || ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  26802624 tcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggctgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggag 26802723  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26802724 cgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttacttaaatcctatttttcccttttat 26802823  T
Q  501 attttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagttat 599  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |   |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26802824 attttatttcttcaacttcaatttcccaataatctcatcttaaaggttaaatggg---aaatacctttcttatatacgtttttaaacaagtattagttat 26802920  T
Q  600 ttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgt---tacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| || |||||||||    
T  26802921 ttatatgttgaaatagttagaaatgtataatatattatgag--tacatggatgtgattgtgatgttgttagtacatactaacttatcttgttggacatg 26803017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 27593318 - 27592632
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || || | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27593318 taccaagtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtacggtttcaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaacaccttcattg 27593219  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593218 atgacaatggtcttcaaagaggaaatgaaatcacaccatcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 27593119  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27593118 ctcttcttcgttttgtttggacgaacttgaccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgccctgttttgcctgttttctttggtgtggatccttct 27593019  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatgga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27593018 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcagggatgga 27592919  T
Q  408 aagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttct 507  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27592918 aagacgctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtacccaactttacttaaatcctatttttcccttttctattttat 27592819  T
Q  508 ttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttac-gtttttaaaaag---tattagttatttat 603  Q
    || ||||| |||||||   |||||||||||| || ||||||||| | |   ||||||||||||||| ||| ||||| || |||   ||||||||||||||    
T  27592818 ttcttcaacttcaattttacaataatctcatcttaaaggttaaaaggg---aaataccttttttatatacagttttaaacaagtactattagttatttat 27592722  T
Q  604 atgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||| |||||    
T  27592721 atgtcgaaatagttagaaatgtataatacattcttag--tacatggatgtgattgtgatgttgttagacactaacttatcttattgcacatg 27592632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 695
Target Start/End: Original strand, 27678835 - 27679521
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || || | |||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27678835 taccaagtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtacggtttcaccgggaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaacaccttcattg 27678934  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27678935 ataagaatggtcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 27679034  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27679035 ctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttctttggtgtggaacctact 27679134  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatgga 407  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27679135 gttgtgcgacatcgtaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcaaggatgga 27679234  T
Q  408 aagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttct 507  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27679235 aaaaggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtacccaactttacttaaatcctatttttcccttttctattttat 27679334  T
Q  508 ttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttac-gtttttaaaaag---tattagttatttat 603  Q
    || ||||| |||||||   |||||||||||| || ||||||||| | |   ||||||||||||||| ||| ||||| || |||   ||||||||||||||    
T  27679335 ttcttcaacttcaattttacaataatctcatcttaaaggttaaaaggg---aaataccttttttatatacagttttaaacaagtactattagttatttat 27679431  T
Q  604 atgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||| |||||    
T  27679432 atgtcgaaatagttagaaatgtataatacattcttag--tacatggatgtgattgtgatgttgttagacactaacttatcttattgcacatg 27679521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 27677912 - 27677231
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||| ||||||| ||| || || | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27677912 taccaagtattcctcaatttcagaggaagtgacactcggtacggtttcaccggcaatctctacaaggctcttgatgacaagggaatccacaccttcattg 27677813  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    |  |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27677812 acaatcatgaacttcaaagaggggatgaaatcacaccatcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattgctgtgttttctatcaactatgc 27677713  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27677712 ctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttctttgctgtggaacctact 27677613  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatgga 407  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27677612 attgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaagcatggagaggttgcagggatgga 27677513  T
Q  408 aagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttct 507  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27677512 aagaggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtacccaactttacttaaatcctatttttcccttttctattttat 27677413  T
Q  508 ttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaaa--agtattagttatttatat 605  Q
    || ||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||||| | |   ||||||||||||||| |||  ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27677412 ttcttcaacttcaatttcacaataatctcatcttaaaggttaaaaggg---aaataccttttttatatacagttttaaaagtactattagttatttatat 27677316  T
Q  606 gtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||   ||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||| |||||    
T  27677315 gtcgaaatagttagaaatgtataatacatt---ag--tacatggatgtgattgtgatgttgttagacactaacttatcttattgcacatg 27677231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 27698799 - 27698297
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698799 attcacttaccaagtgttcatcagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27698700  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27698699 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctctca 27698600  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27698599 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacgagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggtgtgga 27698500  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
    |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27698499 accaactaatgtgagacatcataaaggtagttatggcaaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcag 27698400  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgt 500  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27698399 ggatggaaagaggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcccaggtacccaactttacttaaatcctatatttcccttttgt 27698300  T
Q  501 att 503  Q
    |||    
T  27698299 att 27698297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27718684 - 27718219
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718684 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggcacagttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27718585  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718584 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 27718485  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27718484 actatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtgga 27718385  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27718384 acctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagaggttgcag 27718285  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtac 466  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27718284 cgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtac 27718219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27611307 - 27610842
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611307 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27611208  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611207 ttcattgatgacaatgatcttccaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 27611108  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27611107 actatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtgga 27611008  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27611007 acctactaaagtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagaggttgcag 27610908  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtac 466  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27610907 ggatggaaagtggctctgagccaggctgcaaacttttccggctaccatgatagtcctcctgggtac 27610842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 27706700 - 27706015
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27706700 taccaagtattcctcagtttcagaggaggtgacactcggtacggtttcacaggcaatctctacaaggcttttgatgacaagggaatccacaccttcattg 27706601  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    |  |  |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27706600 acaatcatgaacttcaaagaagggatgaaatcacaccatcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcacctatgc 27706501  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  27706500 ctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttatttggtgtagaacctact 27706401  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatgga 407  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27706400 attgtgcgacatcgtaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcagggatgga 27706301  T
Q  408 aagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttct 507  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27706300 aagaggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtacccaactttacttaaatcctatttttcccttttctattttat 27706201  T
Q  508 ttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttac-gtttttaaaaag---tattagttatttat 603  Q
    || ||||| ||||||| | |||||||||||| || ||| ||||| |     ||||||||||||||| ||| ||||| || |||   ||||||||||||||    
T  27706200 ttcttcaacttcaatttcacaataatctcatcttaaagtttaaagg----gaaataccttttttatatacagttttaaacaagtactattagttatttat 27706105  T
Q  604 atgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| || ||| |||||    
T  27706104 atgtcgaaatagttagaaatgaataatacattcttag--tacatggatgtgattgggatgttgttagacactaacttatcttattgcacatg 27706015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 28781021 - 28781477
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28781021 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 28781120  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28781121 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 28781220  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||||||| ||||   |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28781221 actatgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 28781320  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
     ||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  28781321 tcctactaatgtgcgacatcatacaggtccttatggtgaagcattggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcat 28781420  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcct 457  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  28781421 caatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcct 28781477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 28786160 - 28786616
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28786160 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 28786259  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786260 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 28786359  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||| ||| | ||   |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28786360 actacgccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtcga 28786459  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
     ||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  28786460 tcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcat 28786559  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcct 457  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  28786560 caatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcct 28786616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 28792281 - 28792737
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28792281 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 28792380  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792381 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 28792480  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||| ||| | ||   |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28792481 actacgccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtcga 28792580  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
     ||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  28792581 tcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcat 28792680  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcct 457  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  28792681 caatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcct 28792737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27725150 - 27724775
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27725150 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27725051  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27725050 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 27724951  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27724950 actatgcctattcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtgga 27724851  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgat 376  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27724850 acctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgat 27724775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 536
Target Start/End: Original strand, 26884045 - 26884580
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26884045 attcacttaccaagtgttcctcagtttcagaggaagtgacactcggtatggtttcactggaaatctctacaaggctcttactaacaagggaatccacacc 26884144  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||    
T  26884145 ttcattgatgataatcatcttccaagaggaagcgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattccaatattttctacca 26884244  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcaca--tcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtg 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26884245 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatgtcattcactgctacgagacaaagggtcgcctcgttttgcctgtttttgttggtgtg 26884344  T
Q  299 gaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgc 398  Q
    || ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26884345 gatcctactgatgtgcgacatcatacaggtagttatggtgaagcattggctgaccatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgc 26884444  T
Q  399 agcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttccctttt 498  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||| ||||||||||||  |||   || | ||||  | || ||||||||||| |||||| |  ||||    
T  26884445 agcgatggaaaatggctatgaggcaagttgctaacttgtccggctaccattttag---tcttgggtatcccactttacttaaatcatattttcctttttt 26884541  T
Q  499 gtattttctttattcaatttc-aattgcccaataatctc 536  Q
     |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  26884542 atattttctttctttaatttcaaattccccaataatctc 26884580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 27531502 - 27530983
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27531502 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcgcggacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatctatacc 27531403  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||   |    
T  27531402 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactaaaaaatgccattgaaaaatctaggatttttattcccgtattttctgaaa 27531303  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27531302 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacatcactcattgctacgatacaaagggttgtcttgttttgcctgtttttattggtgtgga 27531203  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
     ||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  27531202 tcctactgatgtgcgacatcacacaggtagatatggtgaagcattagctgtgcataaaaaaaagtttcaaaatgataaggataacactgagaggttgcag 27531103  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgt 500  Q
    | ||||||||  ||||||||||| || |||||||| || ||| | ||| |||     | | ||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27531102 caatggaaagaagctctgagccaagcggctaacttgtctggccagcattata---aacatgggtagcccactttacttaaatcctatttttcccttttat 27531006  T
Q  501 attttctttattcaatttcaatt 523  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  27531005 attttctttctttaatttcaatt 27530983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 637
Target Start/End: Original strand, 26646361 - 26646992
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||| ||||| || |||||||  || ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26646361 attcacctaccaggtcttcctcaacttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggacatctctacaaggctcttactgacaagggaattcacacc 26646460  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26646461 ttcattgatgattgtgatcttaagagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 26646560  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  26646561 actatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgtctcgttttgcccgttttctatggcgtgga 26646660  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgca 399  Q
     ||| ||||  | || ||||| |  || |||||||||||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||||| | |||||||||| |||  | |||||    
T  26646661 tcctactcagatacggcatcaaagtgggagttatggtgaa-catctcactaagcacgaagagagtttccaaaataacaagaaaaacaaggaacgattgca 26646759  T
Q  400 gcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttg 499  Q
     | ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||   |||| ||||| | || ||||||||| | | ||||||| ||||     
T  26646760 tcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggataccattatag---tcctgggtaccccactttacttaaaccttgtttttccttttta 26646856  T
Q  500 tattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaat-gagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagtt 597  Q
    ||||||||||||| |||||   || | ||| |||||||| || ||| |||||| |  | || |||   |||||||| | ||||||||| |||||| | ||    
T  26646857 tattttctttatttaattttttttccacaa-aatctcatcttaaagcttaaataggaaacacata---tttttattaatgtttttaaacaagtataaatt 26646952  T
Q  598 atttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattct 637  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  26646953 atttatatgtcaaaagagttagaactgtataatatattct 26646992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 637
Target Start/End: Original strand, 26752329 - 26752960
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||| ||||| || |||||||  || ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26752329 attcacctaccaggtcttcctcaacttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggacatctctacaaggctcttactgacaagggaattcacacc 26752428  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752429 ttcattgatgattgtgatcttaagagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 26752528  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  26752529 actatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgtctcgttttgcccgttttctatggcgtgga 26752628  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgca 399  Q
     ||| ||||  | || ||||| |  || |||||||||||| ||| |  || |||| ||| |||| || |||||| | |||||||||| |||  | |||||    
T  26752629 tcctactcagatacggcatcaaagtgggagttatggtgaa-catctcactaagcacgaagagagtttccaaaataacaagaaaaacaaggaacgattgca 26752727  T
Q  400 gcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttg 499  Q
     | ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||   |||| ||||| | || ||||||||| | | ||||||| ||||     
T  26752728 tcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggataccattatag---tcctgggtaccccactttacttaaaccttgtttttccttttta 26752824  T
Q  500 tattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaat-gagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagtt 597  Q
    ||||||||||||| |||||   || | ||| |||||||| || ||| |||||| |  | || |||   |||||||| | ||||||||| |||||| | ||    
T  26752825 tattttctttatttaattttttttccacaa-aatctcatcttaaagcttaaataggaaacacata---tttttattaatgtttttaaacaagtataaatt 26752920  T
Q  598 atttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattct 637  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  26752921 atttatatgtcaaaagagttagaactgtataatatattct 26752960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 448
Target Start/End: Original strand, 26655878 - 26656318
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  26655878 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacacccggcacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgataagggaatccatactttcattg 26655977  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||||||    
T  26655978 atgacaatgatcttctcagaggagatgaaatcacaccatcactcgttaaggccattgaagaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgc 26656077  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  26656078 atcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctataagacaaagggttgttcggttttgcctgttttctatggtgtggatcctact 26656177  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatgg 406  Q
    ||  | |||||||| |  || ||||| |||| ||||| |  || |||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  26656178 cacatacgacatcagactggaagttacggtg-agcatcttactaagcatgaaaagaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatgg 26656276  T
Q  407 aaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat 448  Q
    ||  ||||||||| | | ||||| ||||| || |||||||||    
T  26656277 aagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccat 26656318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 448
Target Start/End: Original strand, 26761849 - 26762289
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  26761849 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacacccggcacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgataagggaatccatactttcattg 26761948  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||||||    
T  26761949 atgacaatgatcttctcagaggagatgaaatcacaccatcactcgttaaggccattgaagaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgc 26762048  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  26762049 atcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctataagacaaagggttgttcggttttgcctgttttctatggtgtggatcctact 26762148  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatgg 406  Q
    ||  | |||||||| |  || ||||| |||| ||||| |  || |||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  26762149 cacatacgacatcagactggaagttacggtg-agcatcttactaagcatgaaaagaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatgg 26762247  T
Q  407 aaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat 448  Q
    ||  ||||||||| | | ||||| ||||| || |||||||||    
T  26762248 aagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccat 26762289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 457
Target Start/End: Original strand, 26861505 - 26861951
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||| || ||||||||||| || || | |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  26861505 taccaggtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtatggttttaccggtaatctctacaaggctcttactgacaagggaattcacaccttcatgg 26861604  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||   ||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  26861605 atgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaaagatcactcgacaatgccattgaagagtctagaattttcattcctgtgttttctgccaactatgc 26861704  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |   || ||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||    
T  26861705 ctcttcgtcattttgtttggatgaacttgtccaaatcattaa---ctgcaaggaaaagggtcgcgtcgttttgcctgttttctatggcatggatcctact 26861801  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatgga 407  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  26861802 aatgtgcgacatcatagaggtatttatggtgaagcattggctaagcatgaaaaaaggtttcaaaatgatatggataacatggagaggttgcagagatgga 26861901  T
Q  408 aagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcct 457  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||  |||||||    
T  26861902 aagttgctctgaaccaagctgctaacttgtcaggctaccattttagtcct 26861951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 366
Target Start/End: Original strand, 31284177 - 31284535
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31284177 taccaagtattccttagtttcaggggaagtgacactcggtatggtttcaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattg 31284276  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    |||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  31284277 atgatagtgaacttcaaagaggggatgaaatcacaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatttttatccccgtgttttctgccaactatgc 31284376  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  31284377 ctcttcgtcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcacttgtataagcaaaatggtcgcctcgttttgcccgttttctttggcgtggatccttct 31284476  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtt 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31284477 catgtgcgacatcatagaggtagttatggagaagcattggctaagcatgaagagaggtt 31284535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 27427908 - 27427223
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || || |||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  27427908 attcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtacc 27427809  T
Q  101 ttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgtttt 194  Q
    |||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| |||||||| |||||  | ||||    
T  27427808 ttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattttgattcccatatttt 27427718  T
Q  195 ctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttgg 294  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27427717 ctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgttttgcctgttttctttgg 27427618  T
Q  295 tgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagagg 394  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27427617 tgtggaacctactgatgtgcgacatcatacaggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaataggtttcaaaatgatacgaaaaacatggagagg 27427518  T
Q  395 ttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttccc 494  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||  || |||||||||||  |  || | ||||| |    |||||||| ||||  |||| |     
T  27427517 ttgcagcaatggaaagtggctctgagtctggctgctaacttgcccagctaccatgatgatagtcatgggtacgcctatttacttaattcct-gttttgct 27427419  T
Q  495 ttttgtattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtatt 593  Q
    ||||| ||||  |||||| |||||| ||| | |||||    ||| || |||  ||||||   |  || |||||||||||||| ||||||||| || | ||    
T  27427418 ttttgcatttaatttatttaatttctattcctcaata---ccatcttaaagcctaaatg---tgtaacaccttttttatttatgtttttaaacaattgtt 27427325  T
Q  594 agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgat--tgtgacgttgttacatactaacttattttcttgga 691  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  27427324 agttatttatatgtcaaaatagttaaaaatgtataatatattatgag--tacatggatgtgattgtgtgatgttgttacatactaacttatattattgga 27427227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 481
Target Start/End: Original strand, 25579613 - 25580081
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||| |||||||     
T  25579613 agtgttcctcagtttcagaggcagtgacactcgcaacacttttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtaccttctttgatgat 25579712  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25579713 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 25579812  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgt 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||||||| ||||  |    
T  25579813 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcacat 25579912  T
Q  313 gcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagt 411  Q
     |||||||| |  || |||||||||| || || |  || |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||  | ||||||  |    
T  25579913 acgacatcagagtgggagttatggtg-agtatcttactaagcatgaagagaggtttcaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagat 25580011  T
Q  412 ggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaa 481  Q
     ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||| | || |||||||||    
T  25580012 agctcttacccaagctgctaacttgtccggctatcattatagtcctcatgggtaccccactttacttaaa 25580081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 27229114 - 27229339
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27229114 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27229213  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||  ||    
T  27229214 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagacgaaatcacaccatcactcgtcaaggccattgacgaatctcggatttttattcccatattttctgcca 27229313  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27229314 actatgcatcttcttcattttgtttg 27229339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27338363 - 27337923
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  27338363 taccatgtgttcctcagttttagggacattgacactctttacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcaaaaccttcattg 27338264  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||   ||||||||    
T  27338263 atgacaacgatcttgaaagaggagatgaaagcacaccatcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttgattcccatattttctgcaaactatgc 27338164  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |    |||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||    
T  27338163 atcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaggggttgttcggttttgcctgttttctatggtgcggatcctact 27338064  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatgg 406  Q
    || || |||||||| |  || ||||||||||| |||| |  || |||||||| | | ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  27338063 cacgtacgacatcagactgggagttatggtga-gcatcttactaagcatgaagataagttccaaaataacaaggaaaacatggagaggttgaagaaatgg 27337965  T
Q  407 aaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat 448  Q
    ||  ||||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  27337964 aagatggctcttacccaagctgctaacttctccggccaccat 27337923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27399103 - 27398663
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  27399103 taccatgtgttcctcagttttagggacattgacactctttacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcaaaaccttcattg 27399004  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||   ||||||||    
T  27399003 atgacaacgatcttgaaagaggagatgaaagcacaccatcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttgattcccatattttctgcaaactatgc 27398904  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |    |||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||    
T  27398903 atcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaggggttgttcggttttgcctgttttctatggtgcggatcctact 27398804  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatgg 406  Q
    || || |||||||| |  || ||||||||||| |||| |  || |||||||| | | ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  27398803 cacgtacgacatcagactgggagttatggtga-gcatcttactaagcatgaagataagttccaaaataacaaggaaaacatggagaggttgaagaaatgg 27398705  T
Q  407 aaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat 448  Q
    ||  ||||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  27398704 aagatggctcttacccaagctgctaacttctccggccaccat 27398663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 458
Target Start/End: Original strand, 25481636 - 25482081
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  25481636 agtgttcctcaatttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtactttcattgatgaa 25481735  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25481736 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttgtattcccatattttctgccaactatgcatctt 25481835  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgt 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || | || || || ||||||| ||||||||| ||| || ||||    
T  25481836 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattacccgttttctatggtgtggatcctactgatgt 25481935  T
Q  313 gcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtg 412  Q
     |||| ||||| | ||||||||||||||    || || |||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||| | ||||  | ||||||  ||    
T  25481936 tcgacgtcatacatgtagttatggtgaatatctgactaagcatgaagaggggttccaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatg 25482035  T
Q  413 gctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctc 458  Q
    ||||| |  || |||||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  25482036 gctcttactcaagctgctaatttgtccggctatcattatagtcctc 25482081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 366
Target Start/End: Original strand, 26622865 - 26623223
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26622865 taccaagtgttcctaagtttcagaggcagtgacactcggtacggtttcactggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattg 26622964  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||   ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26622965 atgatcgtgaacttcaaagaggggacgaaatcaaaccatcacttgacaatgctatcgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctcccaactatgc 26623064  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| ||| ||    
T  26623065 atattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattcactgctacaaaacaaagggtcgtctcgttttgcccgtcttctatggcgtggatcctact 26623164  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtt 366  Q
    ||  | || ||||| |  || |||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  26623165 cacatacggcatcaaactgggagttatggcgaagcacttgctaagcatgcaaagaggtt 26623223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 366
Target Start/End: Original strand, 26728843 - 26729201
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26728843 taccaagtgttcctaagtttcagaggcagtgacactcggtacggtttcactggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattg 26728942  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||   ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26728943 atgatcgtgaacttcaaagaggggacgaaatcaaaccatcacttgacaatgctatcgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctcccaactatgc 26729042  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttct 307  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| ||| ||    
T  26729043 atattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattcactgctacaaaacaaagggtcgtctcgttttgcccgtcttctatggcgtggatcctact 26729142  T
Q  308 catgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtt 366  Q
    ||  | || ||||| |  || |||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  26729143 cacatacggcatcaaactgggagttatggcgaagcacttgctaagcatgcaaagaggtt 26729201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 493
Target Start/End: Original strand, 25538434 - 25538914
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||   ||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||   ||| ||||| |||||     
T  25538434 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaaatttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattagtactttcatagatgat 25538533  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25538534 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccatcgaagaatctagaatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 25538633  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgt 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||||||| ||||  |    
T  25538634 cttcattttgtttggacgaacttgtccagatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcagtt 25538733  T
Q  313 gcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattgg-ctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagt 411  Q
     |||||||| |  || ||||||||||| |||||   || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||  | ||||||  |    
T  25538734 acgacatcagagtgggagttatggtga-gcattttactaagcatgaagagaggtttcaaaataatgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagat 25538832  T
Q  412 ggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcc 493  Q
     ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||| | || ||||||||||| | |||||||    
T  25538833 agctcttatccaagctgctaacttgtccggctatcattatagtcctcatgggtaccccactttacttaaatcttgtttttcc 25538914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 481
Target Start/End: Original strand, 26142759 - 26143227
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||   ||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  26142759 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaaatttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtactttcattgatgat 26142858  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26142859 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26142958  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgt 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || | || || || ||||||| || |||||||||| ||||  |    
T  26142959 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtatttcccgttttctatgatgtggaacctactcacat 26143058  T
Q  313 gcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagt 411  Q
     ||| |||| |  || | |||||||| ||||| |  || |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||  | ||||||  |    
T  26143059 acgaaatcagagtgggatttatggtg-agcatcttactaagcatgaagagaggtttcaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagat 26143157  T
Q  412 ggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaa 481  Q
     ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||| | || |||||||||    
T  26143158 agctcttatccaagctgctaacttgtccggctatcattatagtcctcatgggtaccccactttacttaaa 26143227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 483
Target Start/End: Original strand, 26055820 - 26056290
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||     
T  26055820 agtgttcctcattttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattaatactttcattgatgaa 26055919  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26055920 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26056019  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgt 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||||||| ||||  |    
T  26056020 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaacacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcacat 26056119  T
Q  313 gcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagt 411  Q
     |||||||| |  || |||||||||| ||||| |  || ||||| || || |||| |||||| |  |||||||||||||| | ||||  | ||||||  |    
T  26056120 acgacatcagagtgggagttatggtg-agcatcttactaagcataaagaggggttccaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagat 26056218  T
Q  412 ggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatc 483  Q
    |||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |  |||| | || |||||||||||    
T  26056219 ggctcttactcaagctgctaacttgtccggctatcattatagtcctcatgagtaccctactttacttaaatc 26056290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 483
Target Start/End: Original strand, 26075790 - 26076260
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||     
T  26075790 agtgttcctcaatttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattaatactttcattgatgaa 26075889  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26075890 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26075989  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgt 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||||||| ||||  |    
T  26075990 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaacacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcacat 26076089  T
Q  313 gcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagt 411  Q
     |||||||| |  || |||||||||| ||||| |  || ||||| || || |||| |||||| |  |||||||||||||| | ||||  | ||||||  |    
T  26076090 acgacatcagagtgggagttatggtg-agcatcttactaagcataaagaggggttccaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagat 26076188  T
Q  412 ggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatc 483  Q
    |||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |  |||| | || |||||||||||    
T  26076189 ggctcttactcaagctgctaacttgtccggctatcattatagtcctcatgagtaccctactttacttaaatc 26076260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Original strand, 26823729 - 26824021
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||    
T  26823729 taccaagtgtttctcagttttagaggcgctgacactcggtatgaatttaccggcaatctctacaaggctcttacagacaagggaatccacaccttttttg 26823828  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||   ||| ||||||||||| ||| |||||  || ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26823829 atgatcgtgaacttcaaagaggggataaaatcgaacaatcactcaataatgccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctgccaactatgc 26823928  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26823929 ctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcgcgtctacaaggaaaaggggcgcctcgttttgcctgttttctatggtgtgga 26824021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Original strand, 26048739 - 26049065
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  26048739 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctctcattgacaagggaatttgtactttcattgatgat 26048838  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26048839 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacacccaaacttgtcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26048938  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgt 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || | || ||||| ||||| | || |||||||||| ||||  |    
T  26048939 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttttatgatgtggaacctactcacat 26049038  T
Q  313 gcgacatcataaaggtagttatggtga 339  Q
     ||||||||||  || |||||||||||    
T  26049039 acgacatcatagtggaagttatggtga 26049065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Original strand, 26069908 - 26070234
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  26069908 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctctcattgacaagggaatttgtactttcattgatgat 26070007  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26070008 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacacccaaacttgtcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26070107  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgt 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || | || ||||| ||||| | || |||||||||| ||||  |    
T  26070108 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttttatgatgtggaacctactcacat 26070207  T
Q  313 gcgacatcataaaggtagttatggtga 339  Q
     ||||||||||  || |||||||||||    
T  26070208 acgacatcatagtggaagttatggtga 26070234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 28234459 - 28234861
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||  | |||||||| |  |||||||| |  ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28234459 gtgttccttagttttagaggtagtgacactcgctatggttttaccgaaaatctctatagagctctttgtcacaagggaatccacaccttcattgatgaca 28234558  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  28234559 gggagcttcaaggaggagatgaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttc 28234658  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtg 313  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||| | ||  |||  | ||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||||| |||    
T  28234659 ttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattta-tgcttcgaggaaaatagacgcctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtg 28234757  T
Q  314 cgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtgg 413  Q
    |||||||| || || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||| ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||  ||||||  |||    
T  28234758 cgacatcacaagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggataacatggagaggttgcagaaatggaagatgg 28234857  T
Q  414 ctct 417  Q
    ||||    
T  28234858 ctct 28234861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 28226845 - 28227248
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||  | ||||  | | |||||||| || || ||| ||||||| |    
T  28226845 gtgttccttagttttagaggtattgacactcgttatggttttactggaaatctctacagtgatctttgtaagaagggaattcacacattctttgatgata 28226944  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  28226945 gagagcttcaaggaggtgatgaaataacatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttc 28227044  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtg 313  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||  | ||||| ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||    
T  28227045 ttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcaaggaaaatcggcgccttgttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcatgtg 28227144  T
Q  314 cgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtgg 413  Q
    |||||||| || || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  | ||||||| |||||| | ||| | | |||||| |||||||||  ||||||  |||    
T  28227145 cgacatcacaagggcagttatggtaaagcactggatgatcatatagagaggttccaaaataacaagcatagcatggataggttgcagaaatggaagatgg 28227244  T
Q  414 ctct 417  Q
    ||||    
T  28227245 ctct 28227248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 355
Target Start/End: Original strand, 28242702 - 28243040
Alignment:
Q  17 ttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatg 116  Q
    ||||| |||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | ||||  | | |||||||| |  ||||||||||||||||  |    
T  28242702 ttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaagaagggaattcgcaccttcattgatgacagag 28242801  T
Q  117 atcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttc 216  Q
    | |||| | |||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  28242802 aacttccaggaggtgacaaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttc 28242901  T
Q  217 attttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcga 316  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||| | ||| ||    
T  28242902 attttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaagaaaaatggacgcctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctaacgtgaga 28243001  T
Q  317 catcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcat 355  Q
    ||||| |  || ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28243002 catcagattggcagttatggtaaagcactggctgagcat 28243040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 391
Target Start/End: Original strand, 26848592 - 26848932
Alignment:
Q  51 gttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcact 150  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||    
T  26848592 gtttcactggtaatctctataaagctctttctgacaatggaatccgaaccttcattgatgacaaggatcttcagagtggtgatgagatcacaccttcgct 26848691  T
Q  151 catcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcat 250  Q
    | |||||  ||||||||| || |||||||  |||| ||| || |||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26848692 cctcaagaacattgaagactcgaggatttccattcttgtattctctgagaactatgccacttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcat 26848791  T
Q  251 tgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctg 350  Q
    |||| ||||  ||||||| || | ||| | |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||     
T  26848792 tgctccaaggaaaagggtagcatggttattcctgttttctatggcatagaaccttctcatgtgcgacatcagaatagtagttatggtgaagcacttgcta 26848891  T
Q  351 agcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggag 391  Q
    |||||||| ||  |||||||||| | ||| ||| |||||||    
T  26848892 agcatgaagaggtgtttcaaaataacaaggaaagcatggag 26848932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 28325376 - 28325717
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | ||||  |   ||| |||| | |||||||||||||||||    
T  28325376 gtgttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaggaagagaattcgtaccttcattgatgaca 28325475  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
    | || |||||| |||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| |||||    
T  28325476 aagaccttcaacgaggtgacgaaataacaccgtcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctattttgtctatcaattatgcttcttc 28325575  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtg 313  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||   ||| || ||||| |||| ||| |||||||  | ||||||||||||||| |||    
T  28325576 ttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactgcttcaaagaaaatgggcgcctagtttagccagttttctacgatgtggaaccttctcacgtg 28325675  T
Q  314 cgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcat 355  Q
    |||||||| || || ||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  28325676 cgacatcacaagggcagttatggtaaagcactggccgagcat 28325717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 400
Target Start/End: Original strand, 28181032 - 28181395
Alignment:
Q  37 tgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaa 136  Q
    |||||||||  | ||||||||||| |||||| | |  ||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || |||    
T  28181032 tgacactcgttatggttttactggaaatctcaatagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaa 28181131  T
Q  137 atcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttg 236  Q
    || ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28181132 ataacatcatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttg 28181231  T
Q  237 ttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatgg 336  Q
    | ||||||||||| |||| ||||  ||  || || || ||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  28181232 tccacatcattcactgcttcaaggaaagcgggcgtctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacaagggcagttatgg 28181331  T
Q  337 tgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
    | ||||| ||| ||| |||  | ||||||| |||||| | ||| | | |||||| |||||||||    
T  28181332 taaagcactggatgatcatatagagaggttccaaaataacaagcatagcatggataggttgcag 28181395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 400
Target Start/End: Original strand, 28185261 - 28185647
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| || ||||| || | |||||||||  |  |||||||||| |||||| | |  ||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  28185261 gtgttccttagctttagaggtagtgacactcgttatcgttttactggaaatctcaatagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgaca 28185360  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||| |||| || ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  28185361 gagagcttcaaggaggtgaagaaataacatcatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttc 28185460  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtg 313  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||||  ||  || || || ||||||||  |||||| || ||||||||||||||| |||    
T  28185461 ttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattaactgcttcaaggaaagcgggcgtctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtg 28185560  T
Q  314 cgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
    |||||||| |  || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||| ||| |||||| | ||| | | ||||||||||||||||    
T  28185561 cgacatcacacgggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcag 28185647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 309
Target Start/End: Original strand, 28139454 - 28139731
Alignment:
Q  32 ggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggag 131  Q
    |||| |||||||||   |||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||   |||||||| || || |||||||| |  || |||||| |||| |    
T  28139454 ggcagtgacactcgtttcggtttcactggaaatctctacaaagctcttcgtgactgtggaatccacacttttattgatgatagggagcttcaaggaggtg 28139553  T
Q  132 atgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatga 231  Q
    | |||||  |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  28139554 acgaaatatcaccgtcactcgtaaaagccattgaagaatctaggattttcatccctgtgttttccatcaactatgcctcttcttcgttttgcttggacga 28139653  T
Q  232 acttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctca 309  Q
    |||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||  |  | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28139654 acttgtccacatcattgactgcttcaacacaaagggatgtttggttttgcctgttttctatggtgtggatccttctca 28139731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 457
Target Start/End: Original strand, 27214336 - 27214758
Alignment:
Q  38 gacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaa 137  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||    
T  27214336 gacactcgacacggtttcaccggtaatctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgacgaaa 27214435  T
Q  138 tcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgt 237  Q
    ||||| | || |||  ||||   |||||||| || ||||||| | ||  ||| || ||    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27214436 tcacatcttcgctccacaagaaaattgaagactcgaggatttctgttattgtattctcagagaactatgctacttcttcattttgtttggacgaacttgt 27214535  T
Q  238 tcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatc---ataaaggtagttat 334  Q
     ||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| ||| | |||||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||   | ||    ||||||    
T  27214536 ccacatcactcattgctccaaggaaaaaggtcgccttgttctacctgttttctatggcgttgaaccttctcacttgcgacatctgaacaacaacagttat 27214635  T
Q  335 ggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaact 434  Q
    ||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||  | ||||| | ||| ||||||||||    
T  27214636 ggtgaagcgcttgctaagcatgaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctgctaact 27214735  T
Q  435 tttccggctaccatgatagtcct 457  Q
    | || ||||| ||| ||||||||    
T  27214736 tatctggctatcattatagtcct 27214758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 27234892 - 27234470
Alignment:
Q  38 gacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaa 137  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||    
T  27234892 gacactcgacacggtttcaccggtaatctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgacgaaa 27234793  T
Q  138 tcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgt 237  Q
    ||||| | || |||  ||||   |||||||| || ||||||| | ||  ||| || ||    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27234792 tcacatcttcgctccacaagaaaattgaagactcgaggatttctgttattgtattctcagagaactatgctacttcttcattttgtttggacgaacttgt 27234693  T
Q  238 tcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatc---ataaaggtagttat 334  Q
     ||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| ||| | |||||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||   | ||    ||||||    
T  27234692 ccacatcactcattgctccaaggaaaaaggtcgccttgttctacctgttttctatggcgttgaaccttctcacttgcgacatctgaacaacaacagttat 27234593  T
Q  335 ggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaact 434  Q
    ||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||  | ||||| | ||| ||||||||||    
T  27234592 ggtgaagcgcttgctaagcatgaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctgctaact 27234493  T
Q  435 tttccggctaccatgatagtcct 457  Q
    | || ||||| ||| ||||||||    
T  27234492 tatctggctatcattatagtcct 27234470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28098650 - 28098302
Alignment:
Q  25 ttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaa 124  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||   ||| |||  |||||||||||  | || ||||||||     
T  28098650 ttttaggggcaccgacactcggtatggttttactggaaatctctacaaagctctttgtgacggaggagtccgcaccttcattgaccataaagatcttcat 28098551  T
Q  125 agaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtt 224  Q
      ||| |||  |||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||  |||||||| |||||||  |||||||    
T  28098550 gaaggtgatagaatcacacaatcccttgtcaaggccatcgaagagtccaggattttaattccggtcttctctaagaactatgcttcttctttgttttgtt 28098451  T
Q  225 tggatgaacttgttcacatcattcattgctac-aagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcata 323  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||| ||||||| || ||||||| ||| |||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28098450 tggatgaacttgtccacatcattcaccgttacgaaga-aaagggttgcttcgtttttcctattttttgtgacgtggaaccttctcacgtgcgacatcaga 28098352  T
Q  324 aaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaat 373  Q
      || ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  28098351 cggggagttatggtgaagcattagctaagcatgaagagaggttccaaaat 28098302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 366
Target Start/End: Original strand, 29825958 - 29826274
Alignment:
Q  50 ggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcac 149  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  29825958 ggttttaccggcaatctctacaaagctctaactgacaagaaaattcgcaccttcattgatgacaaagagcttcaaagaggggacgaaatcacaccctcac 29826057  T
Q  150 tcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattca 249  Q
    |  | ||||| ||| |||||||||||||    |||||| | || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||  || |    
T  29826058 ttgtgaaggcaattcaagaatctaggatagccattcctattttctctaccaattatgcttcttcttcgttttgcttagatgaacttgtgcatatagttga 29826157  T
Q  250 ttgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggct 349  Q
     ||   |||||  |||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||| | || ||    
T  29826158 gtgtgtcaagaggaagggtcgtctcgttttgcctattttctatgatgtggatccttctcatgtgcgacatcagactgggagttatggtaaaggaatgact 29826257  T
Q  350 gagcatgaaaagaggtt 366  Q
    || | |||| |||||||    
T  29826258 gatcttgaagagaggtt 29826274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28297921 - 28297619
Alignment:
Q  98 accttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttcta 197  Q
    ||||||||||||||||  || ||| || |||| || ||||| |||||||||||  |||||  |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||    
T  28297921 accttcattgatgacagagagcttaaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaagcacattgaagagactaggattttcattcctgtcttatcta 28297822  T
Q  198 tcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgt 297  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||   | || || ||||||||  |||| | || |||    
T  28297821 ccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaaggaaagtagccgtctagttttgccgattttttatgatgt 28297722  T
Q  298 ggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  28297721 ggaaccttctcatgtgcgacatcaacatggaagttatgctaaagcactggatgatcatatagagaagttccaaaataacaagaataacatggagaggttg 28297622  T
Q  398 cag 400  Q
    |||    
T  28297621 cag 28297619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 400
Target Start/End: Original strand, 28514152 - 28514454
Alignment:
Q  98 accttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttcta 197  Q
    ||||||||||||||||  || ||| || |||| || ||||| |||||||||||  |||||  |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||    
T  28514152 accttcattgatgacagagagcttaaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaagcacattgaagagactaggattttcattcctgtcttatcta 28514251  T
Q  198 tcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgt 297  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||   | || || ||||||||  |||| | || |||    
T  28514252 ccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaaggaaagtagccgtctagttttgccgattttttatgatgt 28514351  T
Q  298 ggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  28514352 ggaaccttctcatgtgcgacatcaacatggaagttatgctaaagcactggatgatcatatagagaagttccaaaataacaagaataacatggagaggttg 28514451  T
Q  398 cag 400  Q
    |||    
T  28514452 cag 28514454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 398
Target Start/End: Original strand, 26949591 - 26949940
Alignment:
Q  49 cggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| | ||| || ||||||||||| |||    
T  26949591 cggtttcaccggtaatctctataaagctctctctgacaagggaatccgaaccttcattgatgataaggagcttcagaaaggtgacgaaatcacaccttca 26949690  T
Q  149 ctcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattc 248  Q
    ||| |||||   ||||||||||| || |||   |||   || |||||||   | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||    
T  26949691 ctcctcaagagaattgaagaatcgagaattgccattatcgtcttttctaaggaatatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccatatcattc 26949790  T
Q  249 attgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggc 348  Q
    | | || ||||  ||| |||||||| ||| |||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||| | ||    
T  26949791 actacttcaaggaaaaaggtcgccttgttctgccagttttctatgatgtagaaccttctcacgtgcgacatcagaattatagttatggtgaagcacttgc 26949890  T
Q  349 tgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgc 398  Q
    | |||||||| ||||||| |||||    || |||||||||||| ||||||    
T  26949891 taagcatgaagagaggttccaaaagagcaaaaaaaacatggagcggttgc 26949940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26342226 - 26341894
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||| |  |||||   ||||   ||| |||  |||||||||||||| |    
T  26342226 gtgttcctcaattttaggggcattggcactcgctatggttttactggcaatatctatagagctctatgtgacggtggagtccgcaccttcattgatgata 26342127  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||  |||| ||  ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| || |||||||| |||||  | || || ||||||||||| |||||    
T  26342126 gggagcttcatggaggtgacaaaatcacacaatcacttgtcaaagccattgaagagtccaggattttcattccaattttctcaatcaactatgcttcttc 26342027  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaag---ggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcat 310  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||   ||||||    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  26342026 ttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcaaggcaaagaagggtcgcaaaattttgcctgttttctatgacatggaaccttctcat 26341927  T
Q  311 gtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagca 343  Q
    || |||| ||| |  || ||||| |||||||||    
T  26341926 gtacgacgtcagattgggagttacggtgaagca 26341894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 345
Target Start/End: Original strand, 26937073 - 26937320
Alignment:
Q  98 accttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttcta 197  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||   || ||||| || ||||    
T  26937073 accttcattgatgacaaggagctccatggaggagaagaaatcacaccatcacttgtcaaggcaattgaagattccgggattgccatacctgtattctcta 26937172  T
Q  198 tcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgt 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||| ||||||||| ||||  ||  |||||||| |||||| ||  ||    
T  26937173 tcaactatgccacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcgttgactgcttcaagacaaaaggtcatctaattttgcctattttctatgaagt 26937272  T
Q  298 ggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcatt 345  Q
    ||| |||||||| || ||||| || |  || |||||||||| ||||||    
T  26937273 ggatccttctcacgttcgacaccaaactgggagttatggtgcagcatt 26937320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25507158 - 25506975
Alignment:
Q  51 gttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcact 150  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||   |||||||||||| ||      |||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25507158 gttttactagccatctctacacggctctatatgacaagggaattca------cattgatgattgtgatctgaaaagaggagatgaaatcacaccatcagt 25507065  T
Q  151 catcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttca 240  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  25507064 cgtcatcgccattgaagaatctaggatttttattccggttctttctatcaactatgcctcttcaaaattttgtttggaggaacttgttca 25506975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 290
Target Start/End: Original strand, 28149912 - 28150108
Alignment:
Q  93 tccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgtt 192  Q
    |||| |||||||||||||| |  || ||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||  | ||    
T  28149912 tccacaccttcattgatgatacggagctttaacgaggggacgaaatcacaccatcactc-tcaaggccattgaagagtccaggattttcattccaatctt 28150010  T
Q  193 ttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttct 290  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||| || | ||| ||||| ||||||    
T  28150011 ctctatcaactatacttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacattattcactgcttcaaggcaaagggttgcttagttctgcctattttct 28150108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 563 - 682
Target Start/End: Original strand, 28786677 - 28786796
Alignment:
Q  563 accttttttatttacgtttttaaa-aagtatt-agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtg 660  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28786677 accttttctatttacgtttttaaacaagtatttaattatttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtg 28786774  T
Q  661 acgttgttacatactaacttat 682  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  28786775 atgttgttacatactaacttat 28786796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 563 - 682
Target Start/End: Original strand, 28792798 - 28792917
Alignment:
Q  563 accttttttatttacgtttttaaa-aagtatt-agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtg 660  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28792798 accttttctatttacgtttttaaacaagtatttaattatttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtg 28792895  T
Q  661 acgttgttacatactaacttat 682  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  28792896 atgttgttacatactaacttat 28792917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 566 - 682
Target Start/End: Original strand, 28781543 - 28781659
Alignment:
Q  566 ttttttatttacgtttttaaa-aagtatt-agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacg 663  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  28781543 ttttctatttacgtttttaaacaattatttaattatttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtgatg 28781640  T
Q  664 ttgttacatactaacttat 682  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28781641 ttgttacatactaacttat 28781659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 321
Target Start/End: Original strand, 26811453 - 26811711
Alignment:
Q  63 atctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccat 162  Q
    ||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||  |||    
T  26811453 atctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgacgaaatcacaccttcgctcctcaagagcat 26811552  T
Q  163 tgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagaca 262  Q
    |||| | |||||||||   |||  ||| || |||   ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | | || ||||  |    
T  26811553 tgaacactctaggattgccattattgtattctctgagaactatgcaacttcgtcgttttgtttagatgagcttgtccacatcattaactacttcaaggaa 26811652  T
Q  263 aagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatca 321  Q
    || |||||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26811653 aaaggtcgccttgttctaccagttttctatggtgtggaaccttctcacgtgcgacatca 26811711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27665358 - 27665025
Alignment:
Q  65 ctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattg 164  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||  || || ||||||||||| ||||||   |||  |||||    
T  27665358 ctctataaggctctttctgacaaaggaatccacaccttcattgatgacaaggagcttccaactggtgacgaaatcacaccttcactccggaagagcattg 27665259  T
Q  165 aagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctaca-agacaa 263  Q
    ||||||| ||||||   |||  | | || ||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||    
T  27665258 aagaatcgaggattgccattattatattctctaagaactatgctacttcttcattttgtttagatgaacttgtccacatcattcattgcttcagaga-aa 27665160  T
Q  264 agggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagag 363  Q
    ||| |  |   ||| | |||||||||| |||    |||||||||||||||||| | |   |||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||  |      
T  27665159 aggttaccaaggttattcctgttttctatggcaccgaaccttctcatgtgcgaaaactggaagacagttatggtgaagcacttgctaagcatgaagtgga 27665060  T
Q  364 gtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgc 398  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| ||||||    
T  27665059 gtttcaaaatgacatggaaaacatggagcggttgc 27665025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 398
Target Start/End: Original strand, 26635636 - 26635969
Alignment:
Q  65 ctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattg 164  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||  |||||    
T  26635636 ctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacaccttcattgatgacaaggagcttaaaaaaggggatgaaatcacaccttcgctcctcaagagcattg 26635735  T
Q  165 aagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaa 264  Q
    |||| || ||||||   |||   || || ||||   | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||    
T  26635736 aagagtcgaggattgccattatcgttttctctaaggaatatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattcattgctccaatgaaaa 26635835  T
Q  265 gggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagagg 364  Q
    |||| ||   ||| | |||||||||| |||    |||||||||||||||||| | |  || |  ||||||||||||||  | ||| |||||||| |   |    
T  26635836 gggtagcaaggttattcctgttttctatggcaccgaaccttctcatgtgcgaaaactaaatgacagttatggtgaagcgcttgctaagcatgaagatcag 26635935  T
Q  365 tttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgc 398  Q
    |||||||||   ||| ||||||||||| ||||||    
T  26635936 tttcaaaatagcaaggaaaacatggagtggttgc 26635969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 398
Target Start/End: Original strand, 26741602 - 26741935
Alignment:
Q  65 ctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattg 164  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||  |||||    
T  26741602 ctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacaccttcattgatgacaaggagcttaaaaaaggggatgaaatcacaccttcgctcctcaagagcattg 26741701  T
Q  165 aagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaa 264  Q
    |||| || ||||||   |||   || || ||||   | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||    
T  26741702 aagagtcgaggattgccattatcgttttctctaaggaatatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattcattgctccaatgaaaa 26741801  T
Q  265 gggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagagg 364  Q
    |||| ||   ||| | |||||||||| |||    |||||||||||||||||| | |  || |  ||||||||||||||  | ||| |||||||| |   |    
T  26741802 gggtagcaaggttattcctgttttctatggcaccgaaccttctcatgtgcgaaaactaaatgacagttatggtgaagcgcttgctaagcatgaagatcag 26741901  T
Q  365 tttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgc 398  Q
    |||||||||   ||| ||||||||||| ||||||    
T  26741902 tttcaaaatagcaaggaaaacatggagtggttgc 26741935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 398
Target Start/End: Original strand, 26974998 - 26975331
Alignment:
Q  65 ctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattg 164  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||||| || ||| ||| ||| || ||||||||||| || ||| |||||  |||||    
T  26974998 ctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacatcttcattgatgacaaggagcttaaaaaaggggacgaaatcacaccttcgctcctcaagagcattg 26975097  T
Q  165 aagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaa 264  Q
    |||| || ||||||   |||   || || ||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||   |||    
T  26975098 aagactcgaggattaccattatcgtcttctctaaagactatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgttccaatgaaaa 26975197  T
Q  265 gggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagagg 364  Q
    |||| || | ||| | |||||||||| |||    |||||||||||||||||  | |  || |  ||||||||||||| | | ||| |||||||| || ||    
T  26975198 gggtagcatagttattcctgttttctatggcacagaaccttctcatgtgcgtaaactgaatgacagttatggtgaagtacttgctaagcatgaagagggg 26975297  T
Q  365 tttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgc 398  Q
    ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||||    
T  26975298 tttcaaaataaaaatgaaaacttggagcggttgc 26975331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 589 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 27698301 - 27698212
Alignment:
Q  589 gtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaactt 680  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27698301 gtattagttatttatatgtcgaaatagttagaaatttataatatattctgag--tacatagatgtgattgtgatgttgtttcatactaactt 27698212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 398
Target Start/End: Original strand, 25071589 - 25071938
Alignment:
Q  49 cggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatca 148  Q
    ||||||||| || ||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| | ||||| || ||||||||||| ||     
T  25071589 cggttttaccggtaatctttataaagctctttctgacaaaggaatccacacctttattgatgacaaagagcttaagagaggtgacgaaatcacaccttcg 25071688  T
Q  149 ctcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattc 248  Q
    |||  ||||  ||||||||| || || |||   |||   || || ||||   ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  25071689 ctccgcaagagcattgaagattcgagaattgccattatcgtcttctctaaagactatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccacatcattc 25071788  T
Q  249 attgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggc 348  Q
    | | || ||||  |||| ||||||| ||| | ||  |||||| |||    |||||||| || |||||| | |  || |  |||||||||||| |||| ||    
T  25071789 actacttcaaggaaaagagtcgccttgttctaccaattttctatggcaccgaaccttcgcaggtgcgaaaactgaatgacagttatggtgaatcatttgc 25071888  T
Q  349 tgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgc 398  Q
    | |||||||| || ||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||    
T  25071889 taagcatgaagaggggtttcaaaataacaaggaacacatggagcggttgc 25071938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 290
Target Start/End: Original strand, 2184288 - 2184459
Alignment:
Q  119 cttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcat 218  Q
    |||||| |||| | |||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||| || || |  |||||||| ||||||||||    
T  2184288 cttcaacgagggggtgaaataacagcatcacttatgaaagccattgaagagtccagaattttcatccctgttttctcaaagaactatgcttcttcttcat 2184387  T
Q  219 tttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttct 290  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || || |||| ||||||| ||||| ||| | || |||||||    
T  2184388 tttgtttggacgaacttgtccacatcattcgttactccaagtcaaagggacgcctggttctaccagttttct 2184459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 290
Target Start/End: Original strand, 2184880 - 2185069
Alignment:
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||| |||||| | || |||||| |||| | |||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||| || ||||| || ||||| || || |       
T  2184880 ttcatggatgacgaagagcttcaacgagggggtgaaataacaccatcgcttgtgaaagccattgaagaatccagaattttcatccctgttttctcaaagg 2184979  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttct 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  2184980 actatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccatatcattcgttgctccaagtcaaagggacgcccggttctgccagttttct 2185069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26893688 - 26893543
Alignment:
Q  89 ggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctg 188  Q
    ||||| || |||||||||||||| |  || ||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |  ||||| |    
T  26893688 ggaattcacaccttcattgatgatacagagcttcatagaggtgacgaaatctcaccatcacttatcaaggcaattgaagagtctatgatatacattccag 26893589  T
Q  189 tgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaact 234  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||    
T  26893588 tcctctctatcaactatgcttcttctatattttgtttggaagaact 26893543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 398
Target Start/End: Original strand, 26959111 - 26959445
Alignment:
Q  65 ctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc-aaggccatt 163  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||  || |||  ||||    
T  26959111 ctctataaagctctttctgacaaaggaatcgacaccttcattgatgacaaagagcttaaaaaaggggatgaaatcacaccttcgcttctcaaagagcatt 26959210  T
Q  164 gaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaa 263  Q
    ||||| || ||||||   |||   || || ||||   | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||   ||    
T  26959211 gaagactcgaggattgccattatcgttttctctaaggaatatgcttcttcttcgttttatttggatgaacttgtccacatcattcatttctccaatgaaa 26959310  T
Q  264 agggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagag 363  Q
    | ||| ||    || | |||||||||| |||    |||||||||||||||||| | |  || || ||||||||||||||  | ||| |||||||| ||      
T  26959311 aaggtagcacgattattcctgttttctatggcacagaaccttctcatgtgcgaaaactaaatggcagttatggtgaagcgcttgctaagcatgaagagca 26959410  T
Q  364 gtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgc 398  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||    
T  26959411 gtttcaaaatagcaaggaaaacatggagcggttgc 26959445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 26617266 - 26617351
Alignment:
Q  59 ggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacacc 144  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26617266 ggcaatctctataaagctctttgtgacaaaggagtccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgatgaaatcacacc 26617351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 26723194 - 26723279
Alignment:
Q  59 ggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacacc 144  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26723194 ggcaatctctataaagctctttgtgacaaaggagtccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgatgaaatcacacc 26723279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25506963 - 25506897
Alignment:
Q  327 gtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagag 393  Q
    |||||||||||||||   || || |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25506963 gtagttatggtgaagatctgactaagcatgaagagaagtttcaaaataataagaaaaacatggagag 25506897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 390
Target Start/End: Original strand, 24715667 - 24715856
Alignment:
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||   |||||||| ||||||| ||| |  |||||| || | ||| | |||||||||| |||   |||    
T  24715667 actatgcttcttcttcattttgtttaggcgaactttcccacatcatccattgcttcaataacaagggtggcatggttattcctgttttctatggcacgga 24715766  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatgga 390  Q
    |||||||||||||||| | |  || |  ||||||||||||||  | ||| |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||||    
T  24715767 accttctcatgtgcgaaaactaaatgacagttatggtgaagctcttgctaagcatgaagacgggtttcaaaataacaaggaacacatgga 24715856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28491744 - 28491660
Alignment:
Q  82 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaa 166  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||| || ||| | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28491744 tgacaaaggagtccgtactttcatggacgacgaggagcttcaaaaaggtgaagaaatcacaccatcactcatcaaagccattgaa 28491660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 29804154 - 29804070
Alignment:
Q  82 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaa 166  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||| || ||| | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29804154 tgacaaaggagtccgtactttcatggacgacgaggagcttcaaaaaggtgaagaaatcacaccatcactcatcaaagccattgaa 29804070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 644 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 27610782 - 27610731
Alignment:
Q  644 acatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||    
T  27610782 acatggatgtgattgtgatgttgtcacatactaacttatcttattgggcatg 27610731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Original strand, 29467797 - 29467876
Alignment:
Q  89 ggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaaga 168  Q
    ||||| || |||||||| |||||  | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29467797 ggaattcacaccttcatggatgatgaagaacttcaaaaaggcgaagaaatcacaccatcactcatcaaagctattgaaga 29467876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 657
Target Start/End: Original strand, 26143338 - 26143399
Alignment:
Q  594 agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgatt 657  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  26143338 agttatttatatgtcaaaaaagttagaattgcataatatattctca--atacatggatgtgatt 26143399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 237
Target Start/End: Original strand, 26617401 - 26617437
Alignment:
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26617401 actatgcttcttcttcattttgtttagatgaacttgt 26617437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 237
Target Start/End: Original strand, 26723329 - 26723365
Alignment:
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26723329 actatgcttcttcttcattttgtttagatgaacttgt 26723365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 3727 - 3260
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3727 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 3628  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3627 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 3528  T
Q  201 a-ctatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgg 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3527 acctatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttatttggtgtgg 3428  T
Q  300 aaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataag-aaaaacatggagaggttgc 398  Q
    ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3427 aacctactattgtgcgacatcgtaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaaacatggagaggttgc 3328  T
Q  399 agcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtac 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3327 agcgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtac 3260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14660 - 14196
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660 attcacttaccaagtgttcatcagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 14561  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14560 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 14461  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14460 actatgcct-ttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtgga 14362  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14361 acctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcag 14262  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtac 466  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14261 ggatggaaagaggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtac 14196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 8106 - 8061
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcgg 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8106 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgg 8061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 644 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 14135 - 14084
Alignment:
Q  644 acatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  14135 acatggatgtgattgtgatgttgtcacatactaacttatcttattggacatg 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4976 - 4529
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4976 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 4877  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4876 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatccctccgcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatct 4777  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4776 tctatgccttttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtgga 4677  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
    |||| || | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  4676 acctactaacgtgcgacatctgaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagaggttgcat 4577  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat 448  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4576 caatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccat 4529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13937 - 13490
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13937 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 13838  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 13738  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||| ||| ||||   |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13737 actacgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 13638  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
     ||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||     
T  13637 tcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagcgattgcat 13538  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat 448  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13537 caatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccat 13490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 566 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 13415 - 13299
Alignment:
Q  566 ttttttatttacgtttttaaa-aagtatt-agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacg 663  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  13415 ttttctatttacgtttttaaacaagtatttaattacttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtgatg 13318  T
Q  664 ttgttacatactaacttat 682  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13317 ttgttacatactaacttat 13299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 563 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 4457 - 4336
Alignment:
Q  563 accttttttatttacgtttttaaa-aagtatt-agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtata--atatattctgagtctacatggatgtgattg 658  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  4457 accttttatatttacgtttttaaacaagtatttaattacttttatgtcacaatagttagaaatgtataccatatattatgagt--acatggatgtgattg 4360  T
Q  659 tgacgttgttacatactaacttat 682  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  4359 tgatgttgttacatactaacttat 4336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 7407 - 7854
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7407 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 7506  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 7606  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||| ||| ||||   |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7607 actacgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacagaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 7706  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
     ||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||     
T  7707 tcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagcgattgcat 7806  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat 448  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7807 caatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccat 7854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 566 - 682
Target Start/End: Original strand, 7929 - 8045
Alignment:
Q  566 ttttttatttacgtttttaaa-aagtatt-agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacg 663  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  7929 ttttctatttacgtttttaaacaagtatttaattacttttatgtcaaaatagttagaaatgtatactatattctgagt--acatggatgtgattgtgatg 8026  T
Q  664 ttgttacatactaacttat 682  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8027 ttgttacatactaacttat 8045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 18731796 - 18731111
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18731796 attcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggccatctctacagagctcttactgacaagggaatccacacc 18731697  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18731696 ttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatca 18731597  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||    
T  18731596 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcatgcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatggcgtgga 18731497  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgca 399  Q
     |||  |||  | |||||||| |  || |||||||||||| ||| |  || ||||  ||||||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  18731496 tcctagtcacatacgacatcaaagtgggagttatggtgaa-catctcactaagcacaaaaagagtttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgca 18731398  T
Q  400 gcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttg 499  Q
     | ||||||  ||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||  |||   || | |||||||  | |||||| ||| ||  |||||| |||||    
T  18731397 tcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattttag---tcatgggtactcctctttactt-aattcttgttttccattttg 18731302  T
Q  500 tattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagtta 598  Q
     ||||| |||||| |||||  ||| | |||||||  ||| || |||  |||||  |   ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18731301 cattttatttatttaatttttattcctcaataataccatcttaaagcctaaattgg---aaacacctttttt-tttacatttttaaacaagtattagtta 18731206  T
Q  599 tttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  18731205 tttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatattatgag--gacatggatgtgactgtgatgttgttacatactgacttatcttattggacatg 18731111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 18699692 - 18699007
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18699692 attcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcactgacactcgtgacggttttactggccatctctacaaagctcttactgacaagggaatccacacc 18699593  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18699592 ttcattgatgaccgtgacctgcaaagtggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatca 18699493  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  18699492 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacatcattcactgctacaagacaaaaggtcgtctcgttttgcctgttttctatggcgtaga 18699393  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgca 399  Q
     ||| ||||  | |||||||| |  || |||||||||||| ||| |  || |||| | |||||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  18699392 tcctactcacatacgacatcaaagtgggagttatggtgaa-catctcactaagcacggaaagagtttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgca 18699294  T
Q  400 gcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttg 499  Q
     | ||||||  | ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||  |||   | || |||||||  | |||||| ||| ||  |||||| |||||    
T  18699293 tcaatggaagttagctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattttag---ttctgggtactcctctttactt-aattcttgttttcctttttg 18699198  T
Q  500 tattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagtta 598  Q
     ||||| |||||| |||||  ||| | |||| ||  ||| || |||  |||||  |   ||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18699197 cattttatttatttaatttttattcctcaatgataccatcttaaagcctaaattgg---aaacacc-tttttaattacgtttttaaacaagtattagtta 18699102  T
Q  599 tttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||   |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||| || |||||||||    
T  18699101 tttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatactatgag--gacatggatgtgactgtgatgttgttacacactgatttatcttattggacatg 18699007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 18655769 - 18655084
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18655769 attcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactgggcatctctacaaagctcttactgacaagggaatccacacc 18655670  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18655669 ttcattgatgaccgtgagctgcaaagtggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattcaagagtctaggatctttattcctgtgttttctatca 18655570  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  18655569 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccgcatcattcactgctacaagacaaagggtcgtctcgtttttcctgttttctatggcgtgga 18655470  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgca 399  Q
     ||| ||||  | |||||||| |  || |||||||||||| ||| |  || ||||   |||||  || |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  18655469 tcctactcacatacgacatcaaactggaagttatggtgaa-catctcactaagcacagaaagaatttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgca 18655371  T
Q  400 gcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttg 499  Q
     | ||||||  ||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||  |||   |||| |||||||  | | |||||| || |  |||||| |||||    
T  18655370 tcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattctag---tcctgggtactcctcttcacttaattcat-gttttcctttttg 18655275  T
Q  500 tattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagtta 598  Q
     ||||| |||||| |||||  ||| | |||| ||  ||| || |||  |||||  |   ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18655274 cattttatttatttaatttttattcctcaatgataccatcttaaagcctaaattcg---aaacacc-tttttatttacatttttaaacaagtattagtta 18655179  T
Q  599 tttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||| || |||||||||    
T  18655178 tttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatattatgag--taaatggatgtgactgtgatgttgttacacactgatttatcttattggacatg 18655084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 18724377 - 18723692
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18724377 attcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactggtcatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacacc 18724278  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18724277 ttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatca 18724178  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||    
T  18724177 actatgcctcttcttcattttgtttgaacgaacttgtccacatcatgcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatggcgtgga 18724078  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgca 399  Q
     |||  |||  | ||||| || |  || |||||||||||| ||| |  || ||||  ||| ||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  18724077 tcctagtcacatacgacaccaaagtgggagttatggtgaa-catctcactaagcacaaaatgagtttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgca 18723979  T
Q  400 gcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttg 499  Q
     | ||||||  ||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||  |||   |||| |||||||  | |||||| ||| ||  |||||| |||||    
T  18723978 tcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattttag---tcctgggtactcctctttactt-aattcttgttttcctttttg 18723883  T
Q  500 tattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagtta 598  Q
     ||||| |||||| || ||  |   | || ||||  ||| || |||  |||||  |   ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18723882 cattttatttatttaaattttaaacctcagtaataccatcttaaagcctaaattgg---aaacacc-tttttatttacatttttaaacaagtattagtta 18723787  T
Q  599 tttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttggacatg 695  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  18723786 tttataagtcaaaatagttagaaatgtatgatatattatgag--taaatggatgtgactgtgatgttgttacatactgacttatcttattggacatg 18723692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 18679859 - 18679167
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  18679859 attcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactggtcatctctacaaggctcttactgacaaaggaatccacacc 18679760  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18679759 ttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatca 18679660  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  |||||    
T  18679659 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatgtcgtgga 18679560  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgca 399  Q
     ||| ||||  |  ||||||| |  ||||||||||||||| ||| |  || | ||   |||||| || |||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  18679559 tcctactcacatatgacatcaaagtggtagttatggtgaa-catctcactaatcactgaaagagtttccaaaataacaataaaaacatggagcggttgca 18679461  T
Q  400 gcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttg 499  Q
     | ||||||  | ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||  |||   |||| |||||||  | |||||| ||| ||  |||||| |||||    
T  18679460 tcaatggaagttagctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattttag---tcctgggtactcctctttactt-aattcttgttttcctttttg 18679365  T
Q  500 tattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagtta 598  Q
     ||||| |||||| ||| |  ||| | |||||||  ||     |||  |||||  |   ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18679364 cattttatttatttaatatttattcctcaataataccaaccgaaagcctaaattgg---aaacacc-tttttatttacgtttttaaacaagtattagtta 18679269  T
Q  599 tttatatgtcacaatag-------ttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgattgtgacgttgttacatactaacttattttcttgga 691  Q
    |||||| |||| |||||       |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  18679268 tttataagtcaaaatagtttgaatttagaaatgtatgatatattatgag--tacatgggtgtgactgtgatgttgttacatactgacttatcttattgga 18679171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 695
Target Start/End: Original strand, 18073647 - 18074332
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || || |||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  18073647 attcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtacc 18073746  T
Q  101 ttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgtttt 194  Q
    |||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| |||||||| |||||  | ||||    
T  18073747 ttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattttgattcccatatttt 18073837  T
Q  195 ctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttgg 294  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18073838 ctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgttttgcctgttttctttgg 18073937  T
Q  295 tgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagagg 394  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18073938 tgtggaacctactgatgtgcgacatcatacaggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaataggtttcaaaatgatacgaaaaacatggagagg 18074037  T
Q  395 ttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttccc 494  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||  || |||||||||||  |  || | ||||| |    |||||||| ||||  |||| |     
T  18074038 ttgcagcaatggaaagtggctctgagtctggctgctaacttgcccagctaccatgatgatagtcatgggtacgcctatttacttaattcct-gttttgct 18074136  T
Q  495 ttttgtattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtatt 593  Q
    ||||| ||||  |||||| |||||| ||| | |||||    ||| || |||  ||||||   |  || |||||||||||||| ||||||||| || | ||    
T  18074137 ttttgcatttaatttatttaatttctattcctcaata---ccatcttaaagcctaaatg---tgtaacaccttttttatttatgtttttaaacaattgtt 18074230  T
Q  594 agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgat--tgtgacgttgttacatactaacttattttcttgga 691  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  18074231 agttatttatatgtcaaaatagttaaaaatgtataatatattatgag--tacatggatgtgattgtgtgatgttgttacatactaacttatattattgga 18074328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5091237 - 5090902
Alignment:
Q  23 agttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttc 122  Q
    |||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  | |||||   || ||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||    
T  5091237 agttttagaggcaccgacactcgttacggttttactggaaatctctatgaagctctacgtgtcaagggaattcacaccttcattgatgacagagagcttc 5091138  T
Q  123 aaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttg 222  Q
    |  |||||||  |||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| |||| | |||   || || |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  5091137 agcgaggagaccaaataacaccgtcacttctcaaggccattcaagaatctaagattgtcattatcgttttctctaaccactatgcttcttcttcgttttg 5091038  T
Q  223 tttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcat 322  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||  ||| ||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5091037 tttagatgaacttgtccatattattcactgctccaaggaaaatggttgcctggttttgcctattttctatggtgtggaaccttctcatgtgcgatatcag 5090938  T
Q  323 aaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaa 358  Q
    |  || ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5090937 actggaagttatggtgaagcacttgctgagcatgaa 5090902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17989342 - 17989013
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || || |||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  17989342 attcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtacc 17989243  T
Q  101 ttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgtttt 194  Q
    |||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| |||||||| |||||  | ||||    
T  17989242 ttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattttgattcccatatttt 17989152  T
Q  195 ctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcc-tgttttctttg 293  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||  |  |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  17989151 ctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaacc--agggt-tcctcgttttgccttgttttctttg 17989055  T
Q  294 gtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatgg 336  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17989054 gtgtggaacc-tctgatgtgcgacatcatacaggtaggtatgg 17989013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28127972 - 28127516
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||     
T  28127972 attcacataccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtgacggtttcactggccatctctacaaggccctttatgacaagggaatccacaca 28127873  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggag-atgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatc 199  Q
    |||||||||||   | ||||| | ||||||| |  |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  28127872 ttcattgatgattgtaatcttgagagaggagaaaaaaatcacaccgtcacttttaaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtattttctacc 28127773  T
Q  200 aactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28127772 aactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtgcacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctagttttgcctgttttctttggcgtgg 28127673  T
Q  300 aaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgca 399  Q
    | ||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||   | ||| |||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||||||| | |||||    
T  28127672 atcctactgatgtgcgatatcatacagggagttatggtgaagagcttgctaagcatggagagaggttccaaaataacaagaaaaacatggagcgattgca 28127573  T
Q  400 gcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcc 456  Q
     | ||||||  | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28127572 ccaatggaagatagctctaacccaagctgctaacttgtccggctaccattatagtcc 28127516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28164654 - 28164200
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||| || ||     
T  28164654 attcacataccaagtgttcctcagttttaggggcagtgacactcgtgacggtttcactggccatctctataaggcccttgacgacaagggaattcacaca 28164555  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  28164554 ttcattgatgattgtgatcttgagagaggagaagaaatcacaccgtcattcatcaaggccattgaaaaatcttgaatttttattcctgtgttatctatca 28164455  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  28164454 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctagttttgcctgttttc-ttggcgtgga 28164356  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
     ||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||   |  || ||||||   ||||||| |||||| | ||||||||||||||| | |||||     
T  28164355 tcctactgatgtgcgacatcatacagggagttatggcaaagatcttactaagcatggtgagaggttccaaaataacaagaaaaacatggagcgattgcac 28164256  T
Q  401 cgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcc 456  Q
    | ||||||  | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28164255 caatggaagatagctctaacccaagctgctaacttgtccggctaccattatagtcc 28164200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 268613 - 267976
Alignment:
Q  37 tgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaa 136  Q
    |||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||    
T  268613 tgacactcgtgagggttttattggccatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaa 268514  T
Q  137 atcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttg 236  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  268513 atcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttg 268414  T
Q  237 ttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatgg 336  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||| ||| ||||| ||| ||||  | |||||||| |  || ||||||||    
T  268413 tccacatcattcactgctacaagaaaaagggtcgtctcattttgcccgtcttctatggcgtggatcctactcacatacgacatcaaagtgggagttatgg 268314  T
Q  337 tgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaactt 435  Q
    |||| ||| |  || |||| ||| |||| || ||||||   ||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  268313 tgaa-catctcactaagcacgaagagagtttccaaaatagcaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagcttctaactt 268215  T
Q  436 ttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttcccttttgtattttctttattcaatttcaattgcccaataatct 535  Q
     || |||||||||  |||   || | ||||||   | |||||| ||| ||  |||||| ||||  ||||| |||||| |||||| ||| | | |||||      
T  268214 gtctggctaccattctag---tcgtgggtactgctctttactt-aattcttgttttccttttttcattttatttatttaatttctattcctcgataatac 268119  T
Q  536 catattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatat 634  Q
    ||| || ||   ||||||    | || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  268118 catcttaaaccataaatg---gctaaaaccttttttatttacgtttctaaataagtattagttgtttatatgacgaaatagttagaaacgtataatatat 268022  T
Q  635 tctgagt--ctacatggatgtgat--tgtgacgttgttacatacta 676  Q
    | |||||   | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  268021 tttgagtacatgcatggatgtgattgtgtgatgttgttacatacta 267976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 569 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 28164100 - 28164048
Alignment:
Q  569 tttatttacgtttttaaa-aagtattagttatttatatgtcacaatagttaga 620  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  28164100 tttatttatgtttttaaacaagtataagatatttatatgtcaaaatagttaga 28164048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 695
Target Start/End: Original strand, 59455 - 60140
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || || |||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  59455 attcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtacc 59554  T
Q  101 ttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgtttt 194  Q
    |||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| |||||||| |||||  | ||||    
T  59555 ttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattttgattcccatatttt 59645  T
Q  195 ctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttgg 294  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  59646 ctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgttttgcctgttttctttgg 59745  T
Q  295 tgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagagg 394  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  59746 tgtggaacctactgatgtgcgacatcatacaggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaataggtttcaaaatgatacgaaaaacatggagagg 59845  T
Q  395 ttgcagcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctaggtactcaacattacttaaatcctatttttccc 494  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||  || |||||||||||  |  || | ||||| |    |||||||| ||||  |||| |     
T  59846 ttgcagcaatggaaagtggctctgagtctggctgctaacttgcccagctaccatgatgatagtcatgggtacgcctatttacttaattcct-gttttgct 59944  T
Q  495 ttttgtattttctttattcaatttcaattgcccaataatctcatattcaaggttaaatgagatcaaataccttttttatttacgtttttaaa-aagtatt 593  Q
    ||||| ||||  |||||| |||||| ||| | |||||    ||| || |||  ||||||   |  || |||||||||||||| ||||||||| || | ||    
T  59945 ttttgcatttaatttatttaatttctattcctcaata---ccatcttaaagcctaaatg---tgtaacaccttttttatttatgtttttaaacaattgtt 60038  T
Q  594 agttatttatatgtcacaatagttagaaatgtataatatattctgagtctacatggatgtgat--tgtgacgttgttacatactaacttattttcttgga 691  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  60039 agttatttatatgtcaaaatagttaaaaatgtataatatattatgag--tacatggatgtgattgtgtgatgttgttacatactaacttatattattgga 60136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 222 - 10
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  222 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 123  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 23  T
Q  201 actatgcctcttc 213  Q
    |||| ||| ||||    
T  22 actacgccacttc 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 29274075 - 29273628
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||||| |||  |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  29274075 attcacttaccaggtcttcctcaactttagaggcggtgacactcgtgacggttttattggccatctctacaagactcttactgacaagggaatccacacc 29273976  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29273975 ttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaatcatcactcgacaatgtcattgaagagtctagaatttttattcctgtgttttctatca 29273876  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtgga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||    
T  29273875 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgtctcattttgcctgtcttctatggcgtgga 29273776  T
Q  301 accttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgca 399  Q
     ||| ||||  | |||||||| |  || |||||||||||| ||| |  || || | ||| |||| || ||||||   ||||||||||||||  |||||||    
T  29273775 tcctactcacatacgacatcaaagtgggagttatggtgaa-catctcactaagtacgaagagagtttccaaaatagcaagaaaaacatggatcggttgca 29273677  T
Q  400 gcgatggaaagtggctctgagccatgctgctaacttttccggctaccat 448  Q
     | ||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  29273676 tcaatggaagttggctctgacccaagcttctaacttgtctggctaccat 29273628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 31903733 - 31903969
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||    
T  31903733 attcacctacgatgtgttcctcagctttagaggcttagacactcgctatggttttactggaaatctctacaaagctctttatgataagggaatccacacc 31903832  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    || ||||| ||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| |||||||||   |||  |||| | ||||  |    
T  31903833 tttattgacgatgaagaacttcaaagaggacatgaaatcacaccatcacttttagaggcaattgaagagtctaggattgccattattgtgctctctaaaa 31903932  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgt 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  31903933 actatgcttcttcttcattttgcttacatgaacttgt 31903969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16373305 - 16373134
Alignment:
Q  63 atctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccat 162  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||    || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||    
T  16373305 atctgtacaaagctctgactgacaaagggatccgtaccttcattcatgattcggagcttcaaataggagatgagatcactccatcgctttttaaggcaat 16373206  T
Q  163 tgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaact 234  Q
     ||||| |||||||||| |||   | | |||||||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  16373205 cgaagagtctaggatttgtataattatattttctacgaactatgcctcttctagcttttgcttggatgaact 16373134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Original strand, 34620 - 35023
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||  | |||||||| |  |||||||| |  ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34620 gtgttccttagttttagaggtagtgacactcgctatggttttaccgaaaatctctatagagctctttgtcacaagggaatccacaccttcattgatgaca 34719  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  34720 gggagcttcaaggaggagatgaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttc 34819  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtg 313  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||  || || || ||||||||  |||||| || ||||||||||||||| |||    
T  34820 ttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaaggaaagcgggcgtctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtg 34919  T
Q  314 cgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtgg 413  Q
    |||||||| || || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||| ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||  ||||||  |||    
T  34920 cgacatcacaagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggataacatggagaggttgcagaaatggaagatgg 35019  T
Q  414 ctct 417  Q
    ||||    
T  35020 ctct 35023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 400
Target Start/End: Original strand, 27343 - 27729
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||  | ||||  | | |||||||| || || ||| ||||||| |    
T  27343 gtgttccttagttttagaggtattgacactcgttatggttttactggaaatctctacagtgatctttgtaagaagggaattcacacattctttgatgata 27442  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  27443 gagagcttcaaggaggtgatgaaataacatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttc 27542  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtg 313  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||  | ||||| ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||    
T  27543 ttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcaaggaaaatcggcgccttgttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcatgtg 27642  T
Q  314 cgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttgcag 400  Q
    |||||||| || || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  | ||||||| |||||| | ||| | | |||||| |||||||||    
T  27643 cgacatcacaagggcagttatggtaaagcactggatgatcatatagagaggttccaaaataacaagcatagcatggataggttgcag 27729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 355
Target Start/End: Original strand, 42864 - 43202
Alignment:
Q  17 ttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatg 116  Q
    ||||| |||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | ||||  | | |||||||| |  ||||||||||||||||  |    
T  42864 ttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaagaagggaattcgcaccttcattgatgacagag 42963  T
Q  117 atcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttc 216  Q
    | |||| | |||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  42964 aacttccaggaggtgacaaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttc 43063  T
Q  217 attttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcga 316  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||| | ||| ||    
T  43064 attttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaagaaaaatggacgcctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctaacgtgaga 43163  T
Q  317 catcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcat 355  Q
    ||||| |  || ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43164 catcagattggcagttatggtaaagcactggctgagcat 43202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 116691 - 117032
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | ||||  |   ||| |||| | |||||||||||||||||    
T  116691 gtgttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaggaagagaattcgtaccttcattgatgaca 116790  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
    | || |||||| |||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| |||||    
T  116791 aagaccttcaacgaggtgacgaaataacaccgtcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctattttgtctatcaattatgcttcttc 116890  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtg 313  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||   ||| || ||||| |||| ||| |||||||  | ||||||||||||||| |||    
T  116891 ttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactgcttcaaagaaaatgggcgcctagtttagccagttttctacgatgtggaaccttctcacgtg 116990  T
Q  314 cgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcat 355  Q
    |||||||| || || ||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  116991 cgacatcacaagggcagttatggtaaagcactggccgagcat 117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 58551 - 58245
Alignment:
Q  37 tgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaa 136  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || |||    
T  58551 tgacactcgctatggttttactggaaatctctacagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgacgaa 58452  T
Q  137 atcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttg 236  Q
    || |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  58451 ataacaccatcacttttcaaggccattaaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaactatgcttcttcttcattttgcttgaacgaacttg 58352  T
Q  237 ttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatgg 336  Q
    | ||||||||||| |||| | ||  | | || ||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||    
T  58351 tccacatcattcactgcttcgaggaatatgggcgcctagttttgccaattttctatgacgtggaaccttctcacgtgcgacatcaagatggaagttatgg 58252  T
Q  337 tgaagca 343  Q
    | |||||    
T  58251 taaagca 58245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 342
Target Start/End: Original strand, 16688944 - 16689234
Alignment:
Q  52 ttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactc 151  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||     
T  16688944 ttttactggtaatctgtacaaagctctatgtgacaagggaatccgtgtcttcattgatgacaaggaacttcagagaggtgacaaaatcacaccatcactt 16689043  T
Q  152 atcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcatt 251  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||   || || ||||||||||  |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||| ||     
T  16689044 atcaaggcaattgaagactcaaggattgcaatccccgtgttttctaagaactatgcattttcctcgttttgtttggatgaacttgtcaacatcattgatg 16689143  T
Q  252 gctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagc 342  Q
    ||| ||   |||| ||||| || |||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||| ||||||| |  || ||||||||||||||    
T  16689144 gcttcagtgcaaaaggtcggctagttttgcctgttttctatgacgtggatccttcgcatgtgagacatcagattggaagttatggtgaagc 16689234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Original strand, 3279592 - 3279823
Alignment:
Q  23 agttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttc 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||| |  ||| | | ||||   ||| ||   |||||||||||||| |  || ||||    
T  3279592 agttttaggggcactgacactcgctatggttttactggaaatctctatagagctttaagtgacggtggattctgcaccttcattgatgatagggagcttc 3279691  T
Q  123 aaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttg 222  Q
    |  |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| || | |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  3279692 atggaggtgatgaaatcacacaatcacttgtcaaggccatcgaagagtccatgatttttattccggtcttctctatcaactatgcttcttctatattttg 3279791  T
Q  223 tttggatgaacttgttcacatcattcattgct 254  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3279792 tttggacgaacttgtccacatcattcattgct 3279823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 17993928 - 17993593
Alignment:
Q  62 aatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggcca 161  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||  ||    
T  17993928 aatctctataaagctctttctgacaagggaattcgaaccttcatcgatgacaaagagcttcagagaggtgatgaaatcacaccgtcgctcctcaagagca 17993829  T
Q  162 ttgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagac 261  Q
    ||||||| || || |||   |||   || || || |   ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| |||       
T  17993828 ttgaagactcaagaattgcgattatcgtcttctcaaaggactatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccacatcattcaatgctccaatga 17993729  T
Q  262 aaagggt-cgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaa 360  Q
    ||||||| || |  ||  | |||||||||| |||    ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  17993728 aaagggtacgac-ggtaattcctgttttctatggcacagaaccttctcaggtgcgacatcagaatgatagttatggtgaagcacttgctaagcatgaaga 17993630  T
Q  361 gaggtttcaaaatgataagaaaaacatggagaggttg 397  Q
    | | |||||||||   ||| ||||||||||| |||||    
T  17993629 gggttttcaaaatagcaaggaaaacatggagcggttg 17993593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 237
Target Start/End: Original strand, 17711967 - 17712084
Alignment:
Q  120 ttcaaagaggagatgaaatcacaccatcact-catcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcat 218  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||| | ||| || ||||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||| || ||| | |    
T  17711967 ttcaaaaaggagaagagatcacaccatcacttcttcaag-ctattcaacaatctaggattttcattgttgttttctctaacaactatgcttcctctactt 17712065  T
Q  219 tttgtttggatgaacttgt 237  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17712066 tttgtttgaatgaacttgt 17712084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University