View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4234_low_2 (Length: 700)

Name: NF4234_low_2
Description: NF4234
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4234_low_2
NF4234_low_2
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (281-684)||(24268964-24269367)
chr2 (281-683)||(27509296-27509698)
chr2 (281-683)||(17683724-17684126)
chr2 (281-684)||(21395292-21395695)
chr2 (281-683)||(27192411-27192813)
chr2 (281-683)||(27842225-27842627)
chr2 (281-684)||(28666066-28666469)
chr2 (281-684)||(37824900-37825303)
chr2 (281-684)||(41920067-41920470)
chr2 (346-684)||(24245812-24246150)
chr2 (281-536)||(35609607-35609862)
chr2 (23-254)||(3279592-3279823)
chr2 (573-676)||(35609867-35609970)
chr2 (62-254)||(17993736-17993928)
chr2 (120-237)||(17711967-17712084)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (281-674)||(922-1315)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (281-684)||(25542687-25543090)
chr5 (281-684)||(14192706-14193109)
chr5 (281-684)||(39883105-39883508)
chr5 (281-684)||(8428468-8428871)
chr5 (281-684)||(27881006-27881409)
chr5 (281-684)||(37372858-37373261)
chr5 (281-682)||(3689899-3690300)
chr5 (281-682)||(3876487-3876888)
chr5 (347-684)||(17871532-17871868)
chr5 (281-684)||(37261237-37261628)
chr5 (281-485)||(30346637-30346841)
chr5 (281-485)||(10024985-10025189)
chr5 (281-485)||(24629954-24630158)
chr5 (570-684)||(30346523-30346637)
chr5 (570-684)||(10025189-10025303)
chr5 (52-247)||(16688944-16689139)
chr5 (281-381)||(6089132-6089232)
chr5 (570-657)||(24629867-24629954)
chr5 (281-319)||(4051728-4051766)
chr5 (281-319)||(15032840-15032878)
chr5 (281-321)||(2261271-2261311)
chr5 (281-319)||(30314119-30314157)
chr5 (283-311)||(15032720-15032748)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (290-684)||(186486-186879)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (281-684)||(5828449-5828852)
chr7 (281-684)||(21069956-21070359)
chr7 (281-684)||(9001039-9001442)
chr7 (281-684)||(7036642-7037045)
chr7 (281-684)||(12785872-12786275)
chr7 (281-684)||(12781042-12781446)
chr7 (347-684)||(22843792-22844128)
chr7 (281-485)||(42232006-42232210)
chr7 (570-684)||(42232210-42232324)
chr7 (488-533)||(18939139-18939184)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (281-684)||(1860599-1861002)
chr4 (281-684)||(49710095-49710497)
chr4 (281-684)||(35855829-35856232)
chr4 (281-684)||(38518018-38518421)
chr4 (281-684)||(49786722-49787125)
chr4 (1-280)||(18699413-18699692)
chr4 (1-280)||(18679580-18679859)
chr4 (1-280)||(18724098-18724377)
chr4 (1-280)||(18731517-18731796)
chr4 (1-279)||(18655491-18655769)
chr4 (444-684)||(13337320-13337560)
chr4 (281-485)||(55559131-55559335)
chr4 (532-680)||(618122-618270)
chr4 (570-684)||(55559017-55559131)
chr4 (23-280)||(5090980-5091237)
chr4 (1-280)||(18073647-18073923)
chr4 (1-258)||(17989088-17989342)
chr4 (281-319)||(787802-787840)
chr4 (281-318)||(31921395-31921432)
chr4 (283-311)||(787932-787960)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (281-684)||(21113638-21114041)
chr8 (281-684)||(25218459-25218862)
chr8 (281-684)||(7821760-7822163)
chr8 (281-684)||(30307099-30307502)
chr8 (281-684)||(25208941-25209329)
chr8 (281-572)||(31978533-31978824)
chr8 (1-280)||(29273796-29274075)
chr8 (1-237)||(31903733-31903969)
chr8 (281-321)||(14714187-14714227)
chr8 (63-234)||(16373134-16373305)
chr8 (281-318)||(33861640-33861677)
[»] chr6 (82 HSPs)
chr6 (281-684)||(2202073-2202476)
chr6 (281-683)||(10187466-10187868)
chr6 (281-683)||(15333565-15333967)
chr6 (281-677)||(18344047-18344443)
chr6 (1-280)||(27718405-27718684)
chr6 (1-280)||(27611028-27611307)
chr6 (1-280)||(27724871-27725150)
chr6 (347-684)||(30881315-30881651)
chr6 (1-276)||(26802324-26802599)
chr6 (1-280)||(27698520-27698799)
chr6 (281-659)||(29639947-29640326)
chr6 (1-280)||(28781021-28781300)
chr6 (281-659)||(31510118-31510496)
chr6 (1-280)||(27604731-27605010)
chr6 (1-280)||(28786160-28786439)
chr6 (1-280)||(28792281-28792560)
chr6 (8-277)||(27678835-27679104)
chr6 (8-272)||(27593054-27593318)
chr6 (1-280)||(26646361-26646640)
chr6 (1-280)||(26752329-26752608)
chr6 (8-268)||(26655878-26656138)
chr6 (8-268)||(26761849-26762109)
chr6 (1-268)||(27531235-27531502)
chr6 (1-226)||(27229114-27229339)
chr6 (8-277)||(27677643-27677912)
chr6 (1-280)||(26884045-26884326)
chr6 (8-277)||(27706431-27706700)
chr6 (8-280)||(26622865-26623137)
chr6 (8-280)||(26728843-26729115)
chr6 (8-268)||(27338103-27338363)
chr6 (8-268)||(27398843-27399103)
chr6 (13-265)||(25579613-25579865)
chr6 (13-265)||(25481636-25481888)
chr6 (13-265)||(26142759-26143011)
chr6 (8-280)||(31284177-31284449)
chr6 (281-493)||(12517310-12517522)
chr6 (13-265)||(26055820-26056072)
chr6 (13-265)||(26075790-26076042)
chr6 (13-265)||(26048739-26048991)
chr6 (13-265)||(26069908-26070160)
chr6 (8-280)||(26823729-26824001)
chr6 (13-265)||(25538434-25538686)
chr6 (8-247)||(26861505-26861744)
chr6 (14-247)||(28234459-28234692)
chr6 (14-259)||(28226845-28227090)
chr6 (17-280)||(28242702-28242965)
chr6 (14-254)||(28325376-28325616)
chr6 (37-259)||(28181032-28181254)
chr6 (32-267)||(28139454-28139689)
chr6 (51-268)||(26848592-26848809)
chr6 (14-247)||(28185261-28185494)
chr6 (51-240)||(25506975-25507158)
chr6 (14-265)||(26341975-26342226)
chr6 (93-268)||(28149912-28150086)
chr6 (98-269)||(26937073-26937244)
chr6 (50-237)||(29825958-29826145)
chr6 (65-254)||(27665169-27665358)
chr6 (98-259)||(28297760-28297921)
chr6 (98-259)||(28514152-28514313)
chr6 (25-249)||(28098426-28098650)
chr6 (1-280)||(27427632-27427908)
chr6 (38-273)||(27214336-27214571)
chr6 (38-273)||(27234657-27234892)
chr6 (65-254)||(26635636-26635825)
chr6 (65-254)||(26741602-26741791)
chr6 (605-681)||(12517520-12517596)
chr6 (65-252)||(26974998-26975185)
chr6 (119-273)||(2184288-2184442)
chr6 (101-272)||(2184880-2185051)
chr6 (89-234)||(26893543-26893688)
chr6 (49-249)||(25071589-25071789)
chr6 (49-249)||(26949591-26949791)
chr6 (63-247)||(26811453-26811637)
chr6 (65-251)||(26959111-26959298)
chr6 (281-319)||(12519529-12519567)
chr6 (59-144)||(26617266-26617351)
chr6 (59-144)||(26723194-26723279)
chr6 (82-166)||(28491660-28491744)
chr6 (82-166)||(29804070-29804154)
chr6 (89-168)||(29467797-29467876)
chr6 (201-237)||(26617401-26617437)
chr6 (201-237)||(26723329-26723365)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (281-684)||(16041947-16042350)
chr1 (281-684)||(2453011-2453412)
chr1 (281-683)||(2329091-2329490)
chr1 (281-684)||(36207137-36207540)
chr1 (285-684)||(18148614-18149013)
chr1 (281-682)||(48775231-48775632)
chr1 (281-684)||(6310888-6311292)
chr1 (281-684)||(37390046-37390442)
chr1 (282-536)||(48238519-48238773)
chr1 (1-280)||(28164375-28164654)
chr1 (37-280)||(268370-268613)
chr1 (479-684)||(48233498-48233703)
chr1 (1-280)||(28127692-28127972)
chr1 (281-485)||(52500591-52500795)
chr1 (570-657)||(52500795-52500882)
chr1 (281-319)||(25074114-25074152)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (281-683)||(5155-5556)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (281-692)||(10968668-10969078)
chr3 (281-684)||(10110522-10110925)
chr3 (281-684)||(13529961-13530364)
chr3 (281-684)||(50410094-50410493)
chr3 (281-684)||(32693-33096)
chr3 (281-684)||(10000329-10000732)
chr3 (281-684)||(10237478-10237879)
chr3 (287-624)||(52917994-52918330)
chr3 (281-682)||(11362180-11362584)
chr3 (281-684)||(10038562-10038955)
chr3 (281-682)||(11368568-11368962)
chr3 (285-533)||(46912997-46913245)
chr3 (281-505)||(47692891-47693115)
chr3 (281-318)||(41763622-41763659)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (281-683)||(18928-19329)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (281-684)||(466-869)
[»] scaffold0073 (3 HSPs)
scaffold0073 (281-684)||(31855-32257)
scaffold0073 (281-572)||(19379-19670)
scaffold0073 (611-684)||(3-76)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (281-684)||(17770-18166)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (281-682)||(182733-183134)
scaffold0003 (281-682)||(165452-165856)
scaffold0003 (1-280)||(59455-59731)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (281-684)||(48830-49233)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (281-684)||(321230-321633)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (1-277)||(3450-3727)
scaffold0349 (1-280)||(14382-14660)
scaffold0349 (1-46)||(8061-8106)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (1-280)||(13658-13937)
scaffold0277 (1-280)||(4697-4976)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-280)||(7407-7686)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (281-564)||(16606-16889)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (1-213)||(10-222)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (281-485)||(28727-28931)
scaffold0118 (570-684)||(28613-28727)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (281-456)||(24-199)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (14-259)||(34620-34865)
scaffold0038 (14-259)||(27343-27588)
scaffold0038 (17-280)||(42864-43127)
scaffold0038 (14-254)||(116691-116931)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (540-684)||(39937-40081)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (283-414)||(1572-1703)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (37-254)||(58334-58551)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (293-321)||(97080-97108)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 24269367 - 24268964
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  24269367 tttggaattccagagctcttaataccattaaggaattccgttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagt 24269268  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24269267 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 24269168  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24269167 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagga 24269068  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24269067 atttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcag 24268968  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  24268967 gtac 24268964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 281 - 683
Target Start/End: Original strand, 27509296 - 27509698
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27509296 tttgaaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacattagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagc 27509395  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  27509396 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaa 27509495  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  27509496 aaatagcaggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgatatcaacgaatttgttgtgtccgacatgagcaaatctttagga 27509595  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509596 atttctaccttcatctcaccattctcatctgaagcgtcgttgctgtctccaattgagagtatctacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 27509695  T
Q  681 gta 683  Q
    |||    
T  27509696 gta 27509698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 281 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 17684126 - 17683724
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  17684126 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcactttggacatcaaaattttcacccgatcgacaaacaaaatcatagc 17684027  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  17684026 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgttggagcgagtattcccctttcttggaa 17683927  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  17683926 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccaatatgagcgaatattcagga 17683827  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17683826 atttctaccttcattttaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctacag 17683727  T
Q  681 gta 683  Q
    |||    
T  17683726 gta 17683724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 21395292 - 21395695
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21395292 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccggcgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagc 21395391  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21395392 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 21395491  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21395492 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatatacaaagtctataagcgacatcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcagga 21395591  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21395592 atttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccgaaattagcaatttcttcctgatctgcag 21395691  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  21395692 gtac 21395695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 281 - 683
Target Start/End: Original strand, 27192411 - 27192813
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27192411 tttggaatttcagagctcttaataccattaagaaattctattgtgaaatactcgctttggacatcaaaaatttcacccgatcgacaaatagaatcagagc 27192510  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27192511 ttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 27192610  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27192611 aaatagagggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttagga 27192710  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  27192711 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtcaccagttgagagtatccacttgtcaaaattatgaatttcttcctgctctacag 27192810  T
Q  681 gta 683  Q
    |||    
T  27192811 gta 27192813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 281 - 683
Target Start/End: Original strand, 27842225 - 27842627
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27842225 tttggaatttcagagctcttaataccattaagaaattctattgtgaaatactcgctttggacatcaaaaatttcacccgatcgacaaatagaatcagagc 27842324  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27842325 ttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 27842424  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27842425 aaatagagggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttagga 27842524  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  27842525 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtcaccagttgagagtatccacttgtcaaaattatgaatttcttcctgctctacag 27842624  T
Q  681 gta 683  Q
    |||    
T  27842625 gta 27842627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 28666469 - 28666066
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||     
T  28666469 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagagg 28666370  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || || ||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28666369 ttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaa 28666270  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28666269 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcagga 28666170  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28666169 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtag 28666070  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  28666069 gtac 28666066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 37825303 - 37824900
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||     
T  37825303 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagagg 37825204  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || || ||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37825203 ttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaa 37825104  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37825103 aaatagttggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcagga 37825004  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37825003 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtag 37824904  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  37824903 gtac 37824900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 41920470 - 41920067
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||     
T  41920470 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagg 41920371  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||   || || ||| || |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41920370 ttaaatactctttatcttcacctggaatcaacgacatcataaattcgttaacatgcttaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaa 41920271  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  41920270 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcagga 41920171  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  41920170 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattatcaatttcttcctgctctacag 41920071  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  41920070 gtac 41920067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 346 - 684
Target Start/End: Original strand, 24245812 - 24246150
Alignment:
Q  346 agaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||    
T  24245812 agaattttcacccgatcgacaaacagaatcagatcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaa 24245911  T
Q  446 tcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacg 545  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  24245912 tcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaggtctataagtgacatccacg 24246011  T
Q  546 gatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgca 645  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  24246012 gatttgttgtgtccgttatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccaaagcgtcgttgccgtctccaattgagagaatcca 24246111  T
Q  646 ctcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtac 684  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24246112 catgccaacattagcaatttcttcctgctctgcaggtac 24246150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 281 - 536
Target Start/End: Original strand, 35609607 - 35609862
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  35609607 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctgttgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcactcgatcgacaaacataatcagagc 35609706  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35609707 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatactcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 35609806  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtg 536  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35609807 aaatagcgggtcaccaatgttatcattcaaatcggaatacacaaagtctataagtg 35609862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Original strand, 3279592 - 3279823
Alignment:
Q  23 agttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttc 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||| |  ||| | | ||||   ||| ||   |||||||||||||| |  || ||||    
T  3279592 agttttaggggcactgacactcgctatggttttactggaaatctctatagagctttaagtgacggtggattctgcaccttcattgatgatagggagcttc 3279691  T
Q  123 aaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttg 222  Q
    |  |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| || | |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  3279692 atggaggtgatgaaatcacacaatcacttgtcaaggccatcgaagagtccatgatttttattccggtcttctctatcaactatgcttcttctatattttg 3279791  T
Q  223 tttggatgaacttgttcacatcattcattgct 254  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3279792 tttggacgaacttgtccacatcattcattgct 3279823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 573 - 676
Target Start/End: Original strand, 35609867 - 35609970
Alignment:
Q  573 cttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctg 672  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35609867 cttcagaaatttctaccttcatttcaccattctgatccgaaacttcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctg 35609966  T
Q  673 ctct 676  Q
    ||||    
T  35609967 ctct 35609970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17993928 - 17993736
Alignment:
Q  62 aatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggcca 161  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||  ||    
T  17993928 aatctctataaagctctttctgacaagggaattcgaaccttcatcgatgacaaagagcttcagagaggtgatgaaatcacaccgtcgctcctcaagagca 17993829  T
Q  162 ttgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgct 254  Q
    ||||||| || || |||   |||   || || || |   ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  17993828 ttgaagactcaagaattgcgattatcgtcttctcaaaggactatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccacatcattcaatgct 17993736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 237
Target Start/End: Original strand, 17711967 - 17712084
Alignment:
Q  120 ttcaaagaggagatgaaatcacaccatcact-catcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcat 218  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||| | ||| || ||||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||| || ||| | |    
T  17711967 ttcaaaaaggagaagagatcacaccatcacttcttcaag-ctattcaacaatctaggattttcattgttgttttctctaacaactatgcttcctctactt 17712065  T
Q  219 tttgtttggatgaacttgt 237  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17712066 tttgtttgaatgaacttgt 17712084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 281 - 674
Target Start/End: Original strand, 922 - 1315
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  922 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggtcatcagaattttcgcccgattgacaaacaaaatcagagc 1021  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1022 ttaaatactctttctcttcacttggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcgactgaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 1121  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1122 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagga 1221  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgct 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1222 atttctaccttcatttcaccattctcatccgaagagtcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagaaatttcttcctgct 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 25543090 - 25542687
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25543090 tttggaattccagagctcttaataccattaaggaatttcgttgtgaaccactcgctttggacatcataattttcacccgatcgacaaacagaatcagagc 25542991  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25542990 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 25542891  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25542890 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacatatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcagga 25542791  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  25542790 atttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaagttagcaatttctttctgctttgcag 25542691  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  25542690 gtac 25542687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 14193109 - 14192706
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14193109 tttggaattccagagctcttaataccattacgaaattccgtcgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagc 14193010  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14193009 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 14192910  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14192909 aaatagcggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagaa 14192810  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  14192809 atttctaccttcatttcaccattctgatccgaaacttcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgtcaaaattagcaatttcttcctactctacag 14192710  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  14192709 gtac 14192706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 39883105 - 39883508
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  39883105 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatcataattgtcacccgatctacaaacagaatcagagc 39883204  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  39883205 ttaaatactctttctcttcacttggaatcaacgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggca 39883304  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  39883305 aaatagctgggcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatctttagga 39883404  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  39883405 atatctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcatgctctgcat 39883504  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  39883505 gtac 39883508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 8428871 - 8428468
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||     
T  8428871 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaatattcacccgatctaaaaatagaatcagagg 8428772  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8428771 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaa 8428672  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  8428671 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcagga 8428572  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8428571 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 8428472  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  8428471 gtac 8428468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 27881006 - 27881409
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  27881006 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccagtgtgaaccactcgctttggacatcataattttcacccgatctacaaatagaatcagagc 27881105  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27881106 ttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcagctgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 27881205  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  27881206 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgggtccgatatcagcaaatcttcagga 27881305  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27881306 gtttctacctttatttcaccattgtcatccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttctacctgctctgcat 27881405  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  27881406 gtac 27881409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 37372858 - 37373261
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||    
T  37372858 tttggaattccaaagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattatcacccgatctaaaaatagaatcagagc 37372957  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  37372958 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcataaattggttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttcgaa 37373057  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||    
T  37373058 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttatgtctgatatcagcaaatcttcagga 37373157  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373158 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 37373257  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  37373258 gtac 37373261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 281 - 682
Target Start/End: Original strand, 3689899 - 3690300
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3689899 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctagagatcagaattttcgcccgatcgacaaactgaatcagagc 3689998  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| ||    
T  3689999 ttaaatactctttctctccacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcacttttcttgaaa 3690098  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||    
T  3690099 aaagagtgggtcaccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtccattagtgacatcaacgaatttgttgtatcggatatgagcaaatctttggga 3690198  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3690199 atttctaccttcatttcaccattctcattcgaagtgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcagtttcttcctgctctgcag 3690298  T
Q  681 gt 682  Q
    ||    
T  3690299 gt 3690300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 281 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 3876888 - 3876487
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3876888 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctagagatcagaattttcgcccgatcgacaaactgaatcagagc 3876789  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| ||    
T  3876788 ttaaatactctttctctccacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcacttttcttgaaa 3876689  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||    
T  3876688 aaagagtgggtccccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtccattagtgacatcaacgaatttgttgtatcggatatgagcaaatctttggga 3876589  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3876588 atttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcagtttcttcctgctctgcag 3876489  T
Q  681 gt 682  Q
    ||    
T  3876488 gt 3876487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 347 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 17871868 - 17871532
Alignment:
Q  347 gaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaat 446  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  17871868 gaattttcacccgatcgacaaacagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaat 17871769  T
Q  447 caagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgg 546  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17871768 caagcgttggtgcgagtatttccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacgg 17871669  T
Q  547 atttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcac 646  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||     
T  17871668 atttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcacca-tctcatccgaagcgccgttgccttctctaattgagagtatccat 17871570  T
Q  647 tcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtac 684  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17871569 ttgccaaaattagcaatttattcctgctctgcaggtac 17871532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 37261237 - 37261628
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37261237 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcctttgtgaaccattcgctttggacatcaaaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagc 37261336  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||    
T  37261337 ttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcaagtattcccctttcttgaaa 37261436  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||          | |||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||| | |    
T  37261437 aaataacgggtcattaaggttatcattcaaattgggatacacaaa----------gacatcaacgg--ttgttgtgtccaatataagcaaatcttcggaa 37261524  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  37261525 atttataccttcgtttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcttgctctgcac 37261624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 281 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30346841 - 30346637
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  30346841 tttggaattccagagctcttaataccattaaggaattccgttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagt 30346742  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30346741 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaacttaatcaagtgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 30346642  T
Q  481 aaata 485  Q
    |||||    
T  30346641 aaata 30346637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 281 - 485
Target Start/End: Original strand, 10024985 - 10025189
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  10024985 tttggaataccagagctcttaataccattaaggaattccgttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagt 10025084  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10025085 ttaaatactctttctcttcacttggaatcaatgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 10025184  T
Q  481 aaata 485  Q
    |||||    
T  10025185 aaata 10025189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 281 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24630158 - 24629954
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  24630158 tttggaattccaaagctcttaataccattaaggaattccgttgtgaaccgctcattttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagt 24630059  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24630058 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 24629959  T
Q  481 aaata 485  Q
    |||||    
T  24629958 aaata 24629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 570 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 30346637 - 30346523
Alignment:
Q  570 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  30346637 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 30346538  T
Q  670 ctgctctgcaggtac 684  Q
    |||||||||||||||    
T  30346537 ctgctctgcaggtac 30346523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 570 - 684
Target Start/End: Original strand, 10025189 - 10025303
Alignment:
Q  570 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 669  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  10025189 aatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttaccgtctctaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 10025288  T
Q  670 ctgctctgcaggtac 684  Q
    |||||||||||||||    
T  10025289 ctgctctgcaggtac 10025303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 247
Target Start/End: Original strand, 16688944 - 16689139
Alignment:
Q  52 ttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactc 151  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||     
T  16688944 ttttactggtaatctgtacaaagctctatgtgacaagggaatccgtgtcttcattgatgacaaggaacttcagagaggtgacaaaatcacaccatcactt 16689043  T
Q  152 atcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcatt 247  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||   || || ||||||||||  |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16689044 atcaaggcaattgaagactcaaggattgcaatccccgtgttttctaagaactatgcattttcctcgttttgtttggatgaacttgtcaacatcatt 16689139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 381
Target Start/End: Original strand, 6089132 - 6089232
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6089132 tttgaaatcccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcaccttggatattaaaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagc 6089231  T
Q  381 t 381  Q
    |    
T  6089232 t 6089232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 570 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 24629954 - 24629867
Alignment:
Q  570 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaatt 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  24629954 aatcttcaggaatttctaccttcatttaaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccgaaatt 24629867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 319
Target Start/End: Original strand, 4051728 - 4051766
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4051728 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 4051766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15032878 - 15032840
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032878 tttggaattctagagctcttaataccattaagaaattcc 15032840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2261311 - 2261271
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgt 321  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2261311 tttggaatgccaaagctcttaataccattaagaaattccgt 2261271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 319
Target Start/End: Original strand, 30314119 - 30314157
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30314119 tttggaattccagaggtcttaataccatgaagaaattcc 30314157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15032748 - 15032720
Alignment:
Q  283 tggaattccagagctcttaataccattaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032748 tggaattccagagctcttaataccattaa 15032720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 290 - 684
Target Start/End: Original strand, 186486 - 186879
Alignment:
Q  290 ccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatact 389  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186486 ccagagctcttaataccattaaggaattccgttgagaaccactcgctttggacatcagaattt-cacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatact 186584  T
Q  390 ctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgg 489  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  186585 ctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcagctgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttattggaaaaatagcgg 186684  T
Q  490 gtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctacc 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186685 gtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtacgatatgagcaaatcttcaggaatttctacc 186784  T
Q  590 ttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtac 684  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  186785 ttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaagtac 186879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 5828852 - 5828449
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5828852 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattacaatgtgaaccactcgctttggacatcataattttcacccgatctacaaacagaatcagagc 5828753  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5828752 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgagtcaagtgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 5828653  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5828652 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacatcaaaagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagga 5828553  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5828552 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcag 5828453  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  5828452 gtac 5828449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 21070359 - 21069956
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21070359 tttggaatttcagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcactttggacatctaaattttcacccgatcaacaaacagaatcagagc 21070260  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21070259 ttaaatactctttctcttcaccaggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 21070160  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21070159 aaatagcaggttaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatgagcaaatcttcagga 21070060  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21070059 atttctaccttcatttcaccattctcatccgaaacgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgtcaaaattagcaatttctttctgctctgcag 21069960  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  21069959 gtac 21069956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 9001442 - 9001039
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9001442 tttggaatttcagagctcttaataccattaagaaattccggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagc 9001343  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || || ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  9001342 ttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttagtgcgagtattcccctttcttggaa 9001243  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  9001242 aaatagttggtcaccaaggttatcaatcagatcgggataaacaaagtctataagagacatcaacggatttgttgtgtccgatatcaacaaatcttcaaga 9001143  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9001142 atttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtatccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctatgcag 9001043  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  9001042 gtac 9001039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 7036642 - 7037045
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||     
T  7036642 tttggaattccaaagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagg 7036741  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7036742 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 7036841  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  7036842 aagtagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcgaatcttcagga 7036941  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7036942 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctgcag 7037041  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  7037042 gtac 7037045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 12786275 - 12785872
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||     
T  12786275 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagagg 12786176  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || || ||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12786175 ttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaa 12786076  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12786075 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcagga 12785976  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12785975 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtag 12785876  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  12785875 gtac 12785872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 12781446 - 12781042
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcg-acaaacagaatcagag 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||    
T  12781446 tttggaattccatagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctcaaaaatagaatcagag 12781347  T
Q  380 cttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattgga 479  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12781346 gttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgga 12781247  T
Q  480 aaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagg 579  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  12781246 aaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtcttatatcagcaaatcttcagg 12781147  T
Q  580 aatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgca 679  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12781146 aatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcattgtcgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctaca 12781047  T
Q  680 ggtac 684  Q
    |||||    
T  12781046 ggtac 12781042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 347 - 684
Target Start/End: Original strand, 22843792 - 22844128
Alignment:
Q  347 gaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaat 446  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  22843792 gaattttcacccgatcgacaaacagaaacagaacttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaat 22843891  T
Q  447 caagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgg 546  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  22843892 caagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcaggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacag 22843991  T
Q  547 atttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcac 646  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||     
T  22843992 atttgttgtgtcagatatgagcaaatcttcaagaatttctaccttcatttcacca-tctcatccgaagcgacgttgccttctctaattaagagtatccaa 22844090  T
Q  647 tcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtac 684  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22844091 ttgccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtac 22844128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 281 - 485
Target Start/End: Original strand, 42232006 - 42232210
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||     
T  42232006 tttggaattccagagctctaaataccattaaggaattcagttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacaaaatcagagt 42232105  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  42232106 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgagagtattcccctttcttggaa 42232205  T
Q  481 aaata 485  Q
    |||||    
T  42232206 aaata 42232210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 570 - 684
Target Start/End: Original strand, 42232210 - 42232324
Alignment:
Q  570 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  42232210 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaaccgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 42232309  T
Q  670 ctgctctgcaggtac 684  Q
    || ||||||||||||    
T  42232310 ctactctgcaggtac 42232324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 533
Target Start/End: Original strand, 18939139 - 18939184
Alignment:
Q  488 gggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataa 533  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18939139 gggttaccaaagttatcattcaaatcgggatacacaaagtttataa 18939184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 1860599 - 1861002
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1860599 tttggaattccatagctcttaataccattaaggaattccgttgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatcaacaaacagaatcagagc 1860698  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1860699 ttaaatactctttctcttcacccagaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 1860798  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1860799 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttagga 1860898  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1860899 atttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcag 1860998  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  1860999 gtac 1861002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 49710095 - 49710497
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  49710095 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagc 49710194  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49710195 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 49710294  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  49710295 aaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaa-ggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcagga 49710393  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49710394 atttctaccttcatttcaccattttcatccgaagcatcgttgccgtgtccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgttctgcag 49710493  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  49710494 gtac 49710497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 35855829 - 35856232
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||     
T  35855829 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagg 35855928  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35855929 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 35856028  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  35856029 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcagga 35856128  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35856129 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 35856228  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  35856229 gtac 35856232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 38518018 - 38518421
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  38518018 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattttggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagc 38518117  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38518118 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 38518217  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  38518218 aaatagttggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcagga 38518317  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38518318 atttctaccttcatttcaccattgtcacccaaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 38518417  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  38518418 gtac 38518421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 49787125 - 49786722
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||     
T  49787125 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgttaaccactcgctttggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagagg 49787026  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49787025 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaatatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaa 49786926  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  49786925 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcagga 49786826  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49786825 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtag 49786726  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  49786725 gtac 49786722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18699692 - 18699413
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18699692 attcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcactgacactcgtgacggttttactggccatctctacaaagctcttactgacaagggaatccacacc 18699593  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18699592 ttcattgatgaccgtgacctgcaaagtggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatca 18699493  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18699492 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacatcattcactgctacaagacaaaaggtcgtctcgttttg 18699413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18679859 - 18679580
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  18679859 attcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactggtcatctctacaaggctcttactgacaaaggaatccacacc 18679760  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18679759 ttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatca 18679660  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18679659 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttg 18679580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18724377 - 18724098
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18724377 attcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactggtcatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacacc 18724278  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18724277 ttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatca 18724178  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18724177 actatgcctcttcttcattttgtttgaacgaacttgtccacatcatgcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttg 18724098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18731796 - 18731517
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18731796 attcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggccatctctacagagctcttactgacaagggaatccacacc 18731697  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18731696 ttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatca 18731597  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18731596 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcatgcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttg 18731517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18655769 - 18655491
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18655769 attcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactgggcatctctacaaagctcttactgacaagggaatccacacc 18655670  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18655669 ttcattgatgaccgtgagctgcaaagtggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattcaagagtctaggatctttattcctgtgttttctatca 18655570  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgtttt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18655569 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccgcatcattcactgctacaagacaaagggtcgtctcgtttt 18655491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 444 - 684
Target Start/End: Original strand, 13337320 - 13337560
Alignment:
Q  444 aatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13337320 aatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacataaa 13337419  T
Q  544 cggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatg 643  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||     
T  13337420 cggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcatgaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatc 13337519  T
Q  644 cactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtac 684  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13337520 cacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtac 13337560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 281 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 55559335 - 55559131
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  55559335 tttgaaattccagagctctaaataccattaaggaattcagttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagt 55559236  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  55559235 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 55559136  T
Q  481 aaata 485  Q
    |||||    
T  55559135 aaata 55559131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 532 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 618270 - 618122
Alignment:
Q  532 aagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctcca 631  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  618270 aagtgacatgaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcttcgttgtcgtctcca 618171  T
Q  632 attaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||| ||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  618170 attgagagtattcacttgttaaaattaggaatttcttcctgctctgcag 618122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 570 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 55559131 - 55559017
Alignment:
Q  570 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  55559131 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 55559032  T
Q  670 ctgctctgcaggtac 684  Q
    |||||||||||||||    
T  55559031 ctgctctgcaggtac 55559017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5091237 - 5090980
Alignment:
Q  23 agttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttc 122  Q
    |||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  | |||||   || ||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||    
T  5091237 agttttagaggcaccgacactcgttacggttttactggaaatctctatgaagctctacgtgtcaagggaattcacaccttcattgatgacagagagcttc 5091138  T
Q  123 aaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttg 222  Q
    |  |||||||  |||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| |||| | |||   || || |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  5091137 agcgaggagaccaaataacaccgtcacttctcaaggccattcaagaatctaagattgtcattatcgttttctctaaccactatgcttcttcttcgttttg 5091038  T
Q  223 tttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||  ||| ||| |||| ||||||    
T  5091037 tttagatgaacttgtccatattattcactgctccaaggaaaatggttgcctggttttg 5090980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 18073647 - 18073923
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || || |||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  18073647 attcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtacc 18073746  T
Q  101 ttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgtttt 194  Q
    |||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| |||||||| |||||  | ||||    
T  18073747 ttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattttgattcccatatttt 18073837  T
Q  195 ctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||    
T  18073838 ctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgttttg 18073923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17989342 - 17989088
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || || |||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  17989342 attcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtacc 17989243  T
Q  101 ttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgtttt 194  Q
    |||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| |||||||| |||||  | ||||    
T  17989242 ttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattttgattcccatatttt 17989152  T
Q  195 ctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaa 258  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17989151 ctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaa 17989088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 319
Target Start/End: Original strand, 787802 - 787840
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 319  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  787802 tttggaattccatagctcttaataccattaagaaattcc 787840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 318
Target Start/End: Original strand, 31921395 - 31921432
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattc 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31921395 tttggaattctagagctcttaataccattaaaaaattc 31921432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 311
Target Start/End: Original strand, 787932 - 787960
Alignment:
Q  283 tggaattccagagctcttaataccattaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  787932 tggaattccagagctcttaataccattaa 787960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 21114041 - 21113638
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  21114041 tttggaattccagagctcttaataccattaaggaatttcgttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagt 21113942  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21113941 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcaagtattccccttttttggaa 21113842  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21113841 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcaagatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatataagcaaatcttcagga 21113742  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21113741 atttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcag 21113642  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  21113641 gtac 21113638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 25218862 - 25218459
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25218862 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagc 25218763  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25218762 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 25218663  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  25218662 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcagga 25218563  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218562 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 25218463  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  25218462 gtac 25218459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 7821760 - 7822163
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  7821760 tttggaattccagagctcttaatacaattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagc 7821859  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7821860 ttaaatactctttctcttcacctgaaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 7821959  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7821960 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcggaatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcagga 7822059  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  7822060 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttacaaaaattcgcaatttcttcctgctctacag 7822159  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  7822160 gtac 7822163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 30307099 - 30307502
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||||    
T  30307099 tttggaattgcagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcggagc 30307198  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30307199 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 30307298  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30307299 aaatagttggtcaccaaggttatcgttcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcagga 30307398  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30307399 atttctacattcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatctacttgcaaaaattagcaatttcttcccactctgcag 30307498  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  30307499 gtac 30307502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 25209329 - 25208941
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  25209329 tttggaataccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactagctttggacatcagaattttcgcccgatctaaaaatagaatcagagc 25209230  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25209229 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 25209130  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||               |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  25209129 aaatagttggtcaccaaggttatcatt---------------aaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgacatcagcaaatcttcagga 25209045  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25209044 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagtaatttcgtcctgctctgcag 25208945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 281 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 31978824 - 31978533
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31978824 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatctgaattttcccccgatctacaaacagaatcagagc 31978725  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  31978724 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaatttgttgacatgctcaactgaatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaa 31978625  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaat 572  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||    
T  31978624 aaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtttataagtgacatcaacagatttgttgtgcccgatatcagcaaat 31978533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29274075 - 29273796
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||||| |||  |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  29274075 attcacttaccaggtcttcctcaactttagaggcggtgacactcgtgacggttttattggccatctctacaagactcttactgacaagggaatccacacc 29273976  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29273975 ttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaatcatcactcgacaatgtcattgaagagtctagaatttttattcctgtgttttctatca 29273876  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29273875 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgtctcattttg 29273796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 31903733 - 31903969
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||    
T  31903733 attcacctacgatgtgttcctcagctttagaggcttagacactcgctatggttttactggaaatctctacaaagctctttatgataagggaatccacacc 31903832  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    || ||||| ||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| |||||||||   |||  |||| | ||||  |    
T  31903833 tttattgacgatgaagaacttcaaagaggacatgaaatcacaccatcacttttagaggcaattgaagagtctaggattgccattattgtgctctctaaaa 31903932  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgt 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  31903933 actatgcttcttcttcattttgcttacatgaacttgt 31903969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 321
Target Start/End: Original strand, 14714187 - 14714227
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgt 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14714187 tttggaatgccagagctcttaataccattaagaaattccgt 14714227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16373305 - 16373134
Alignment:
Q  63 atctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccat 162  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||    || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||    
T  16373305 atctgtacaaagctctgactgacaaagggatccgtaccttcattcatgattcggagcttcaaataggagatgagatcactccatcgctttttaaggcaat 16373206  T
Q  163 tgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaact 234  Q
     ||||| |||||||||| |||   | | |||||||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  16373205 cgaagagtctaggatttgtataattatattttctacgaactatgcctcttctagcttttgcttggatgaact 16373134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33861677 - 33861640
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattc 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33861677 tttggaattctagagctcttaataccattaaaaaattc 33861640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 82)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 2202476 - 2202073
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2202476 tttggaattccagagctctaaataccattaaggaattcagttgtgaaccactcactttggacatcagaattttcacccgatcgacaaatagaatcagagc 2202377  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2202376 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttctactgaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 2202277  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2202276 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttattgtgttcgatatgagcaaatcttcggga 2202177  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  2202176 atttctacattcatttcaccattctcatttgaagcgtcgttgccttctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcatgctctgcaa 2202077  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  2202076 gtac 2202073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 281 - 683
Target Start/End: Original strand, 10187466 - 10187868
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  10187466 tttggaattcaagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcactttggacatcaaaattttcacccgatcgacaaacagaatcatagc 10187565  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  10187566 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaattgaatcaagtgttggagcgagtattcccttttcttggaa 10187665  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10187666 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggattttttgtgtccaatatgagcaaatattcagga 10187765  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10187766 atttctaccttcattttaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagcatccacgtgcgaaaattagcaatttcttcctgctctacag 10187865  T
Q  681 gta 683  Q
    |||    
T  10187866 gta 10187868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 281 - 683
Target Start/End: Original strand, 15333565 - 15333967
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  15333565 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaatttcgatatgaacctctcgctttggacatcagaattttcacctgatctacaaacagaatcagagc 15333664  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  15333665 ctaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagtgttggtgcgagtattcccatttgttggaa 15333764  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||    
T  15333765 aaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctattagtgacatcaacggatttgttacgtacgatatcaacaaatcttcagga 15333864  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15333865 atttctaccttcatttcactattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcttgctctgcag 15333964  T
Q  681 gta 683  Q
    |||    
T  15333965 gta 15333967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 281 - 677
Target Start/End: Original strand, 18344047 - 18344443
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  18344047 tttggaattttagagctcttaataccattaagaaattctattgtgaaatactcgctttggacatcaaaattttcacccgatcgacaaatagaatcaaagc 18344146  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  18344147 ttaaatactctttctcttcgcctggaatcagcgacatcatatattcgtcaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcaagtattcccctttcttggaa 18344246  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18344247 aaatagatggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatgaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagga 18344346  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctg 677  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18344347 atttctaccttcatttcactattctcatctgaagcttcgttgtcgtctccaattgagagtattcacttgtcaaaattaggaatttcttcctgctctg 18344443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27718684 - 27718405
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718684 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggcacagttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27718585  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718584 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 27718485  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718484 actatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 27718405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27611307 - 27611028
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611307 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27611208  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611207 ttcattgatgacaatgatcttccaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 27611108  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611107 actatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 27611028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27725150 - 27724871
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27725150 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27725051  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27725050 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 27724951  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27724950 actatgcctattcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 27724871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 347 - 684
Target Start/End: Original strand, 30881315 - 30881651
Alignment:
Q  347 gaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaat 446  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  30881315 gaattttcacccgatcgacaaacagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaat 30881414  T
Q  447 caagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacgg 546  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30881415 caagcgttggtgcgagtatttccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacgg 30881514  T
Q  547 atttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcac 646  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||     
T  30881515 atttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcacca-tctcatccgaagcgccgttgccttctctaattgagagtatccat 30881613  T
Q  647 tcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtac 684  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30881614 ttgccaaaattagcaatttattcctgctctgcaggtac 30881651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 26802324 - 26802599
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26802324 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatacc 26802423  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26802424 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatca 26802523  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgt 276  Q
    |||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26802524 actatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgt 26802599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27698799 - 27698520
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698799 attcacttaccaagtgttcatcagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27698700  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27698699 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctctca 27698600  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27698599 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacgagacaaagggtcgcctcgttttg 27698520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 281 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 29640326 - 29639947
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc-gttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagag 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||    
T  29640326 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcttggtgtgaaccactcgctttagacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaattagag 29640227  T
Q  380 cttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattgga 479  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29640226 gttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgga 29640127  T
Q  480 aaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagg 579  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  29640126 aaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcaggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtggttgatatcagcaaatcttcagg 29640027  T
Q  580 aatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattag 659  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  29640026 aatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattag 29639947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 28781021 - 28781300
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28781021 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 28781120  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28781121 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 28781220  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||||| ||||   |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28781221 actatgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttg 28781300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 281 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 31510496 - 31510118
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||     
T  31510496 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttagacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaattagagg 31510397  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  31510396 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaa 31510297  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| || |    
T  31510296 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagattaggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtggttgatatcagcaaatcttaagaa 31510197  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattag 659  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  31510196 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaaacatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattag 31510118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27605010 - 27604731
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27605010 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcgatacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaattcatacc 27604911  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604910 ttcattgatgaaaatgatcttcgaagaggagatgaaatcacaccagcacttctcaaggccattgatgaatccaggatttttattcctgtgttttctatca 27604811  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27604810 aatatgcctcttcttccttttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacacgacaaagggtcgcgtcgttttg 27604731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 28786160 - 28786439
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28786160 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 28786259  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786260 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 28786359  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||| ||| | ||   |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28786360 actacgccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttg 28786439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 28792281 - 28792560
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28792281 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 28792380  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792381 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 28792480  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||| ||| | ||   |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28792481 actacgccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttg 28792560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 27678835 - 27679104
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || || | |||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27678835 taccaagtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtacggtttcaccgggaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaacaccttcattg 27678934  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27678935 ataagaatggtcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 27679034  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgtt 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27679035 ctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgtt 27679104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27593318 - 27593054
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || || | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27593318 taccaagtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtacggtttcaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaacaccttcattg 27593219  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593218 atgacaatggtcttcaaagaggaaatgaaatcacaccatcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 27593119  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcc 272  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593118 ctcttcttcgttttgtttggacgaacttgaccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcc 27593054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 26646361 - 26646640
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||| ||||| || |||||||  || ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26646361 attcacctaccaggtcttcctcaacttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggacatctctacaaggctcttactgacaagggaattcacacc 26646460  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26646461 ttcattgatgattgtgatcttaagagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 26646560  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26646561 actatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgtctcgttttg 26646640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 26752329 - 26752608
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||| ||||| || |||||||  || ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26752329 attcacctaccaggtcttcctcaacttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggacatctctacaaggctcttactgacaagggaattcacacc 26752428  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752429 ttcattgatgattgtgatcttaagagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 26752528  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26752529 actatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgtctcgttttg 26752608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 26655878 - 26656138
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  26655878 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacacccggcacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgataagggaatccatactttcattg 26655977  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||||||    
T  26655978 atgacaatgatcttctcagaggagatgaaatcacaccatcactcgttaaggccattgaagaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgc 26656077  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggt 268  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26656078 atcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctataagacaaagggt 26656138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Original strand, 26761849 - 26762109
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  26761849 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacacccggcacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgataagggaatccatactttcattg 26761948  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||||||    
T  26761949 atgacaatgatcttctcagaggagatgaaatcacaccatcactcgttaaggccattgaagaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgc 26762048  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggt 268  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26762049 atcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctataagacaaagggt 26762109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27531502 - 27531235
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27531502 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcgcggacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatctatacc 27531403  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||   |    
T  27531402 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactaaaaaatgccattgaaaaatctaggatttttattcccgtattttctgaaa 27531303  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggt 268  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27531302 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacatcactcattgctacgatacaaagggt 27531235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 27229114 - 27229339
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27229114 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27229213  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||  ||    
T  27229214 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagacgaaatcacaccatcactcgtcaaggccattgacgaatctcggatttttattcccatattttctgcca 27229313  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27229314 actatgcatcttcttcattttgtttg 27229339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27677912 - 27677643
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||| ||||||| ||| || || | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27677912 taccaagtattcctcaatttcagaggaagtgacactcggtacggtttcaccggcaatctctacaaggctcttgatgacaagggaatccacaccttcattg 27677813  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    |  |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27677812 acaatcatgaacttcaaagaggggatgaaatcacaccatcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattgctgtgttttctatcaactatgc 27677713  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgtt 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27677712 ctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgtt 27677643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 26884045 - 26884326
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26884045 attcacttaccaagtgttcctcagtttcagaggaagtgacactcggtatggtttcactggaaatctctacaaggctcttactaacaagggaatccacacc 26884144  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||    
T  26884145 ttcattgatgataatcatcttccaagaggaagcgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattccaatattttctacca 26884244  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcaca--tcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26884245 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatgtcattcactgctacgagacaaagggtcgcctcgttttg 26884326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27706700 - 27706431
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27706700 taccaagtattcctcagtttcagaggaggtgacactcggtacggtttcacaggcaatctctacaaggcttttgatgacaagggaatccacaccttcattg 27706601  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    |  |  |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27706600 acaatcatgaacttcaaagaagggatgaaatcacaccatcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcacctatgc 27706501  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgtt 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27706500 ctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgtt 27706431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 26622865 - 26623137
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26622865 taccaagtgttcctaagtttcagaggcagtgacactcggtacggtttcactggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattg 26622964  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||   ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26622965 atgatcgtgaacttcaaagaggggacgaaatcaaaccatcacttgacaatgctatcgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctcccaactatgc 26623064  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26623065 atattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattcactgctacaaaacaaagggtcgtctcgttttg 26623137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 26728843 - 26729115
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26728843 taccaagtgttcctaagtttcagaggcagtgacactcggtacggtttcactggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattg 26728942  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||   ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26728943 atgatcgtgaacttcaaagaggggacgaaatcaaaccatcacttgacaatgctatcgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctcccaactatgc 26729042  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26729043 atattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattcactgctacaaaacaaagggtcgtctcgttttg 26729115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27338363 - 27338103
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  27338363 taccatgtgttcctcagttttagggacattgacactctttacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcaaaaccttcattg 27338264  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||   ||||||||    
T  27338263 atgacaacgatcttgaaagaggagatgaaagcacaccatcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttgattcccatattttctgcaaactatgc 27338164  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggt 268  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27338163 atcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaggggt 27338103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27399103 - 27398843
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  27399103 taccatgtgttcctcagttttagggacattgacactctttacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcaaaaccttcattg 27399004  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||   ||||||||    
T  27399003 atgacaacgatcttgaaagaggagatgaaagcacaccatcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttgattcccatattttctgcaaactatgc 27398904  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggt 268  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27398903 atcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaggggt 27398843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 25579613 - 25579865
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||| |||||||     
T  25579613 agtgttcctcagtttcagaggcagtgacactcgcaacacttttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtaccttctttgatgat 25579712  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25579713 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 25579812  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaag 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25579813 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 25579865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 25481636 - 25481888
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  25481636 agtgttcctcaatttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtactttcattgatgaa 25481735  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25481736 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttgtattcccatattttctgccaactatgcatctt 25481835  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaag 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25481836 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 25481888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 26142759 - 26143011
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||   ||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  26142759 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaaatttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtactttcattgatgat 26142858  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26142859 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26142958  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaag 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26142959 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 26143011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 31284177 - 31284449
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31284177 taccaagtattccttagtttcaggggaagtgacactcggtatggtttcaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattg 31284276  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    |||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  31284277 atgatagtgaacttcaaagaggggatgaaatcacaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatttttatccccgtgttttctgccaactatgc 31284376  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || |||  ||| |||||||||||||||    
T  31284377 ctcttcgtcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcacttgtataagcaaaatggtcgcctcgttttg 31284449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 281 - 493
Target Start/End: Original strand, 12517310 - 12517522
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  12517310 tttggaattccaaagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcaccccatcatcaaacagaatcagagc 12517409  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  12517410 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcaaatattcccctttcttggaa 12517509  T
Q  481 aaatagcgggtca 493  Q
    ||||||| |||||    
T  12517510 aaatagctggtca 12517522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 26055820 - 26056072
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||     
T  26055820 agtgttcctcattttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattaatactttcattgatgaa 26055919  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26055920 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26056019  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaag 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26056020 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaacacaaag 26056072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 26075790 - 26076042
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||     
T  26075790 agtgttcctcaatttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattaatactttcattgatgaa 26075889  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26075890 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26075989  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaag 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26075990 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaacacaaag 26076042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 26048739 - 26048991
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  26048739 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctctcattgacaagggaatttgtactttcattgatgat 26048838  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26048839 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacacccaaacttgtcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26048938  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaag 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26048939 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 26048991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 26069908 - 26070160
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  26069908 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctctcattgacaagggaatttgtactttcattgatgat 26070007  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26070008 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacacccaaacttgtcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26070107  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaag 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26070108 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 26070160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 26823729 - 26824001
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||    
T  26823729 taccaagtgtttctcagttttagaggcgctgacactcggtatgaatttaccggcaatctctacaaggctcttacagacaagggaatccacaccttttttg 26823828  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||   ||| ||||||||||| ||| |||||  || ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26823829 atgatcgtgaacttcaaagaggggataaaatcgaacaatcactcaataatgccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctgccaactatgc 26823928  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  26823929 ctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcgcgtctacaaggaaaaggggcgcctcgttttg 26824001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 25538434 - 25538686
Alignment:
Q  13 agtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgac 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||   ||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||   ||| ||||| |||||     
T  25538434 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaaatttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattagtactttcatagatgat 25538533  T
Q  113 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25538534 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccatcgaagaatctagaatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 25538633  T
Q  213 cttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaag 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  25538634 cttcattttgtttggacgaacttgtccagatcattcactgctacaagacaaag 25538686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 26861505 - 26861744
Alignment:
Q  8 taccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattg 107  Q
    ||||| || ||||||||||| || || | |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  26861505 taccaggtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtatggttttaccggtaatctctacaaggctcttactgacaagggaattcacaccttcatgg 26861604  T
Q  108 atgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgc 207  Q
    ||||   ||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  26861605 atgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaaagatcactcgacaatgccattgaagagtctagaattttcattcctgtgttttctgccaactatgc 26861704  T
Q  208 ctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcatt 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26861705 ctcttcgtcattttgtttggatgaacttgtccaaatcatt 26861744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 28234459 - 28234692
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||  | |||||||| |  |||||||| |  ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28234459 gtgttccttagttttagaggtagtgacactcgctatggttttaccgaaaatctctatagagctctttgtcacaagggaatccacaccttcattgatgaca 28234558  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  28234559 gggagcttcaaggaggagatgaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttc 28234658  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcatt 247  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  28234659 ttcattttgcttggacgaacttgtccacatcatt 28234692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 28226845 - 28227090
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||  | ||||  | | |||||||| || || ||| ||||||| |    
T  28226845 gtgttccttagttttagaggtattgacactcgttatggttttactggaaatctctacagtgatctttgtaagaagggaattcacacattctttgatgata 28226944  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  28226945 gagagcttcaaggaggtgatgaaataacatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttc 28227044  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaag 259  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28227045 ttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcaag 28227090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 28242702 - 28242965
Alignment:
Q  17 ttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatg 116  Q
    ||||| |||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | ||||  | | |||||||| |  ||||||||||||||||  |    
T  28242702 ttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaagaagggaattcgcaccttcattgatgacagag 28242801  T
Q  117 atcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttc 216  Q
    | |||| | |||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  28242802 aacttccaggaggtgacaaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttc 28242901  T
Q  217 attttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||||    
T  28242902 attttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaagaaaaatggacgcctagttttg 28242965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 254
Target Start/End: Original strand, 28325376 - 28325616
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | ||||  |   ||| |||| | |||||||||||||||||    
T  28325376 gtgttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaggaagagaattcgtaccttcattgatgaca 28325475  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
    | || |||||| |||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| |||||    
T  28325476 aagaccttcaacgaggtgacgaaataacaccgtcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctattttgtctatcaattatgcttcttc 28325575  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgct 254  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28325576 ttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactgct 28325616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Original strand, 28181032 - 28181254
Alignment:
Q  37 tgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaa 136  Q
    |||||||||  | ||||||||||| |||||| | |  ||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || |||    
T  28181032 tgacactcgttatggttttactggaaatctcaatagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaa 28181131  T
Q  137 atcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttg 236  Q
    || ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28181132 ataacatcatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttg 28181231  T
Q  237 ttcacatcattcattgctacaag 259  Q
    | ||||||||||| |||| ||||    
T  28181232 tccacatcattcactgcttcaag 28181254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Original strand, 28139454 - 28139689
Alignment:
Q  32 ggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggag 131  Q
    |||| |||||||||   |||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||   |||||||| || || |||||||| |  || |||||| |||| |    
T  28139454 ggcagtgacactcgtttcggtttcactggaaatctctacaaagctcttcgtgactgtggaatccacacttttattgatgatagggagcttcaaggaggtg 28139553  T
Q  132 atgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatga 231  Q
    | |||||  |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  28139554 acgaaatatcaccgtcactcgtaaaagccattgaagaatctaggattttcatccctgtgttttccatcaactatgcctcttcttcgttttgcttggacga 28139653  T
Q  232 acttgttcacatcattcattgctacaagacaaaggg 267  Q
    |||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||    
T  28139654 acttgtccacatcattgactgcttcaacacaaaggg 28139689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 26848592 - 26848809
Alignment:
Q  51 gttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcact 150  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||    
T  26848592 gtttcactggtaatctctataaagctctttctgacaatggaatccgaaccttcattgatgacaaggatcttcagagtggtgatgagatcacaccttcgct 26848691  T
Q  151 catcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcat 250  Q
    | |||||  ||||||||| || |||||||  |||| ||| || |||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26848692 cctcaagaacattgaagactcgaggatttccattcttgtattctctgagaactatgccacttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcat 26848791  T
Q  251 tgctacaagacaaagggt 268  Q
    |||| ||||  |||||||    
T  26848792 tgctccaaggaaaagggt 26848809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 28185261 - 28185494
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| || ||||| || | |||||||||  |  |||||||||| |||||| | |  ||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  28185261 gtgttccttagctttagaggtagtgacactcgttatcgttttactggaaatctcaatagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgaca 28185360  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||| |||| || ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  28185361 gagagcttcaaggaggtgaagaaataacatcatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttc 28185460  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcatt 247  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  28185461 ttcattttgcttggacgaacttgtccacatcatt 28185494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25507158 - 25506975
Alignment:
Q  51 gttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcact 150  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||   |||||||||||| ||      |||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25507158 gttttactagccatctctacacggctctatatgacaagggaattca------cattgatgattgtgatctgaaaagaggagatgaaatcacaccatcagt 25507065  T
Q  151 catcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttca 240  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  25507064 cgtcatcgccattgaagaatctaggatttttattccggttctttctatcaactatgcctcttcaaaattttgtttggaggaacttgttca 25506975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26342226 - 26341975
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||| |  |||||   ||||   ||| |||  |||||||||||||| |    
T  26342226 gtgttcctcaattttaggggcattggcactcgctatggttttactggcaatatctatagagctctatgtgacggtggagtccgcaccttcattgatgata 26342127  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||  |||| ||  ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| || |||||||| |||||  | || || ||||||||||| |||||    
T  26342126 gggagcttcatggaggtgacaaaatcacacaatcacttgtcaaagccattgaagagtccaggattttcattccaattttctcaatcaactatgcttcttc 26342027  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaag 265  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  26342026 ttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcaaggcaaag 26341975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 268
Target Start/End: Original strand, 28149912 - 28150086
Alignment:
Q  93 tccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgtt 192  Q
    |||| |||||||||||||| |  || ||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||  | ||    
T  28149912 tccacaccttcattgatgatacggagctttaacgaggggacgaaatcacaccatcactc-tcaaggccattgaagagtccaggattttcattccaatctt 28150010  T
Q  193 ttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggt 268  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  28150011 ctctatcaactatacttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacattattcactgcttcaaggcaaagggt 28150086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 269
Target Start/End: Original strand, 26937073 - 26937244
Alignment:
Q  98 accttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttcta 197  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||   || ||||| || ||||    
T  26937073 accttcattgatgacaaggagctccatggaggagaagaaatcacaccatcacttgtcaaggcaattgaagattccgggattgccatacctgtattctcta 26937172  T
Q  198 tcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtc 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||| ||||||||| ||||    
T  26937173 tcaactatgccacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcgttgactgcttcaagacaaaaggtc 26937244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Original strand, 29825958 - 29826145
Alignment:
Q  50 ggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcac 149  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  29825958 ggttttaccggcaatctctacaaagctctaactgacaagaaaattcgcaccttcattgatgacaaagagcttcaaagaggggacgaaatcacaccctcac 29826057  T
Q  150 tcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgt 237  Q
    |  | ||||| ||| |||||||||||||    |||||| | || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  29826058 ttgtgaaggcaattcaagaatctaggatagccattcctattttctctaccaattatgcttcttcttcgttttgcttagatgaacttgt 29826145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27665358 - 27665169
Alignment:
Q  65 ctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattg 164  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||  || || ||||||||||| ||||||   |||  |||||    
T  27665358 ctctataaggctctttctgacaaaggaatccacaccttcattgatgacaaggagcttccaactggtgacgaaatcacaccttcactccggaagagcattg 27665259  T
Q  165 aagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgct 254  Q
    ||||||| ||||||   |||  | | || ||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27665258 aagaatcgaggattgccattattatattctctaagaactatgctacttcttcattttgtttagatgaacttgtccacatcattcattgct 27665169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28297921 - 28297760
Alignment:
Q  98 accttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttcta 197  Q
    ||||||||||||||||  || ||| || |||| || ||||| |||||||||||  |||||  |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||    
T  28297921 accttcattgatgacagagagcttaaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaagcacattgaagagactaggattttcattcctgtcttatcta 28297822  T
Q  198 tcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaag 259  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  28297821 ccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaag 28297760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 259
Target Start/End: Original strand, 28514152 - 28514313
Alignment:
Q  98 accttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttcta 197  Q
    ||||||||||||||||  || ||| || |||| || ||||| |||||||||||  |||||  |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||    
T  28514152 accttcattgatgacagagagcttaaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaagcacattgaagagactaggattttcattcctgtcttatcta 28514251  T
Q  198 tcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaag 259  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  28514252 ccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaag 28514313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28098650 - 28098426
Alignment:
Q  25 ttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaa 124  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||   ||| |||  |||||||||||  | || ||||||||     
T  28098650 ttttaggggcaccgacactcggtatggttttactggaaatctctacaaagctctttgtgacggaggagtccgcaccttcattgaccataaagatcttcat 28098551  T
Q  125 agaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtt 224  Q
      ||| |||  |||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||  |||||||| |||||||  |||||||    
T  28098550 gaaggtgatagaatcacacaatcccttgtcaaggccatcgaagagtccaggattttaattccggtcttctctaagaactatgcttcttctttgttttgtt 28098451  T
Q  225 tggatgaacttgttcacatcattca 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  28098450 tggatgaacttgtccacatcattca 28098426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27427908 - 27427632
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || || |||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  27427908 attcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtacc 27427809  T
Q  101 ttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgtttt 194  Q
    |||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| |||||||| |||||  | ||||    
T  27427808 ttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattttgattcccatatttt 27427718  T
Q  195 ctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||    
T  27427717 ctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgttttg 27427632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 273
Target Start/End: Original strand, 27214336 - 27214571
Alignment:
Q  38 gacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaa 137  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||    
T  27214336 gacactcgacacggtttcaccggtaatctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgacgaaa 27214435  T
Q  138 tcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgt 237  Q
    ||||| | || |||  ||||   |||||||| || ||||||| | ||  ||| || ||    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27214436 tcacatcttcgctccacaagaaaattgaagactcgaggatttctgttattgtattctcagagaactatgctacttcttcattttgtttggacgaacttgt 27214535  T
Q  238 tcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcct 273  Q
     ||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  27214536 ccacatcactcattgctccaaggaaaaaggtcgcct 27214571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27234892 - 27234657
Alignment:
Q  38 gacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaa 137  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||    
T  27234892 gacactcgacacggtttcaccggtaatctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgacgaaa 27234793  T
Q  138 tcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgt 237  Q
    ||||| | || |||  ||||   |||||||| || ||||||| | ||  ||| || ||    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27234792 tcacatcttcgctccacaagaaaattgaagactcgaggatttctgttattgtattctcagagaactatgctacttcttcattttgtttggacgaacttgt 27234693  T
Q  238 tcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcct 273  Q
     ||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  27234692 ccacatcactcattgctccaaggaaaaaggtcgcct 27234657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 254
Target Start/End: Original strand, 26635636 - 26635825
Alignment:
Q  65 ctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattg 164  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||  |||||    
T  26635636 ctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacaccttcattgatgacaaggagcttaaaaaaggggatgaaatcacaccttcgctcctcaagagcattg 26635735  T
Q  165 aagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgct 254  Q
    |||| || ||||||   |||   || || ||||   | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26635736 aagagtcgaggattgccattatcgttttctctaaggaatatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattcattgct 26635825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 254
Target Start/End: Original strand, 26741602 - 26741791
Alignment:
Q  65 ctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattg 164  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||  |||||    
T  26741602 ctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacaccttcattgatgacaaggagcttaaaaaaggggatgaaatcacaccttcgctcctcaagagcattg 26741701  T
Q  165 aagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgct 254  Q
    |||| || ||||||   |||   || || ||||   | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26741702 aagagtcgaggattgccattatcgttttctctaaggaatatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattcattgct 26741791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 605 - 681
Target Start/End: Original strand, 12517520 - 12517596
Alignment:
Q  605 tcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcagg 681  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517520 tcatccgaagtgtcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcagg 12517596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 252
Target Start/End: Original strand, 26974998 - 26975185
Alignment:
Q  65 ctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattg 164  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||||| || ||| ||| ||| || ||||||||||| || ||| |||||  |||||    
T  26974998 ctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacatcttcattgatgacaaggagcttaaaaaaggggacgaaatcacaccttcgctcctcaagagcattg 26975097  T
Q  165 aagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattg 252  Q
    |||| || ||||||   |||   || || ||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26975098 aagactcgaggattaccattatcgtcttctctaaagactatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattg 26975185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 273
Target Start/End: Original strand, 2184288 - 2184442
Alignment:
Q  119 cttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcat 218  Q
    |||||| |||| | |||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||| || || |  |||||||| ||||||||||    
T  2184288 cttcaacgagggggtgaaataacagcatcacttatgaaagccattgaagagtccagaattttcatccctgttttctcaaagaactatgcttcttcttcat 2184387  T
Q  219 tttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcct 273  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || || |||| ||||||| |||||    
T  2184388 tttgtttggacgaacttgtccacatcattcgttactccaagtcaaagggacgcct 2184442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 272
Target Start/End: Original strand, 2184880 - 2185051
Alignment:
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||| |||||| | || |||||| |||| | |||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||| || ||||| || ||||| || || |       
T  2184880 ttcatggatgacgaagagcttcaacgagggggtgaaataacaccatcgcttgtgaaagccattgaagaatccagaattttcatccctgttttctcaaagg 2184979  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcc 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||    
T  2184980 actatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccatatcattcgttgctccaagtcaaagggacgcc 2185051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26893688 - 26893543
Alignment:
Q  89 ggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctg 188  Q
    ||||| || |||||||||||||| |  || ||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |  ||||| |    
T  26893688 ggaattcacaccttcattgatgatacagagcttcatagaggtgacgaaatctcaccatcacttatcaaggcaattgaagagtctatgatatacattccag 26893589  T
Q  189 tgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaact 234  Q
    |  | |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||    
T  26893588 tcctctctatcaactatgcttcttctatattttgtttggaagaact 26893543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 25071589 - 25071789
Alignment:
Q  49 cggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatca 148  Q
    ||||||||| || ||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| | ||||| || ||||||||||| ||     
T  25071589 cggttttaccggtaatctttataaagctctttctgacaaaggaatccacacctttattgatgacaaagagcttaagagaggtgacgaaatcacaccttcg 25071688  T
Q  149 ctcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattc 248  Q
    |||  ||||  ||||||||| || || |||   |||   || || ||||   ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  25071689 ctccgcaagagcattgaagattcgagaattgccattatcgtcttctctaaagactatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccacatcattc 25071788  T
Q  249 a 249  Q
    |    
T  25071789 a 25071789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 26949591 - 26949791
Alignment:
Q  49 cggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| | ||| || ||||||||||| |||    
T  26949591 cggtttcaccggtaatctctataaagctctctctgacaagggaatccgaaccttcattgatgataaggagcttcagaaaggtgacgaaatcacaccttca 26949690  T
Q  149 ctcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattc 248  Q
    ||| |||||   ||||||||||| || |||   |||   || |||||||   | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||    
T  26949691 ctcctcaagagaattgaagaatcgagaattgccattatcgtcttttctaaggaatatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccatatcattc 26949790  T
Q  249 a 249  Q
    |    
T  26949791 a 26949791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Original strand, 26811453 - 26811637
Alignment:
Q  63 atctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccat 162  Q
    ||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||  |||    
T  26811453 atctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgacgaaatcacaccttcgctcctcaagagcat 26811552  T
Q  163 tgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcatt 247  Q
    |||| | |||||||||   |||  ||| || |||   ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  26811553 tgaacactctaggattgccattattgtattctctgagaactatgcaacttcgtcgttttgtttagatgagcttgtccacatcatt 26811637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 251
Target Start/End: Original strand, 26959111 - 26959298
Alignment:
Q  65 ctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc-aaggccatt 163  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||  || |||  ||||    
T  26959111 ctctataaagctctttctgacaaaggaatcgacaccttcattgatgacaaagagcttaaaaaaggggatgaaatcacaccttcgcttctcaaagagcatt 26959210  T
Q  164 gaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcatt 251  Q
    ||||| || ||||||   |||   || || ||||   | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26959211 gaagactcgaggattgccattatcgttttctctaaggaatatgcttcttcttcgttttatttggatgaacttgtccacatcattcatt 26959298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 319
Target Start/End: Original strand, 12519529 - 12519567
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12519529 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 12519567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 26617266 - 26617351
Alignment:
Q  59 ggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacacc 144  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26617266 ggcaatctctataaagctctttgtgacaaaggagtccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgatgaaatcacacc 26617351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 26723194 - 26723279
Alignment:
Q  59 ggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacacc 144  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26723194 ggcaatctctataaagctctttgtgacaaaggagtccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgatgaaatcacacc 26723279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28491744 - 28491660
Alignment:
Q  82 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaa 166  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||| || ||| | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28491744 tgacaaaggagtccgtactttcatggacgacgaggagcttcaaaaaggtgaagaaatcacaccatcactcatcaaagccattgaa 28491660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 29804154 - 29804070
Alignment:
Q  82 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaa 166  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||| || ||| | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29804154 tgacaaaggagtccgtactttcatggacgacgaggagcttcaaaaaggtgaagaaatcacaccatcactcatcaaagccattgaa 29804070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Original strand, 29467797 - 29467876
Alignment:
Q  89 ggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaaga 168  Q
    ||||| || |||||||| |||||  | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29467797 ggaattcacaccttcatggatgatgaagaacttcaaaaaggcgaagaaatcacaccatcactcatcaaagctattgaaga 29467876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 237
Target Start/End: Original strand, 26617401 - 26617437
Alignment:
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26617401 actatgcttcttcttcattttgtttagatgaacttgt 26617437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 237
Target Start/End: Original strand, 26723329 - 26723365
Alignment:
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26723329 actatgcttcttcttcattttgtttagatgaacttgt 26723365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 16041947 - 16042350
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16041947 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagc 16042046  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  16042047 ttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggca 16042146  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16042147 aaatagctgggcaccaaggttatcattcagattgggatacacaaagtctataagcgacatcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcagga 16042246  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16042247 atttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcat 16042346  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  16042347 gtac 16042350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 2453412 - 2453011
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2453412 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccattgtgaatc--tcgttttggacatcagaattttcacccgatcgacaaatagaatcagagc 2453315  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2453314 ctaaatactctttctcttcacctggaattagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactcaataaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 2453215  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2453214 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcggaattcacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 2453115  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2453114 atttctaccttcatttcaccattctcatttgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgtcaaaattagcaatttcttcatgctctgcag 2453015  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  2453014 gtac 2453011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 281 - 683
Target Start/End: Original strand, 2329091 - 2329490
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2329091 tttggaattccatagctcttaataccatttagaaattccgttgtgaaccactctctttggacatcagaattttcacccgatcgacaaagagaatcagagc 2329190  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  2329191 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcgactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaa 2329290  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2329291 aaatagtggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacac---gtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcagga 2329387  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2329388 atttctaccttcattttaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctctaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 2329487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 36207137 - 36207540
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  36207137 tttggagtttcagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaacaactcactttggacatcataattttcacccgatcgacaaacataatcaaagc 36207236  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||| ||    
T  36207237 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaattgttggggcgagtattcccctttcttgaaa 36207336  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  36207337 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtcggatatgagaaaatcatcagga 36207436  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36207437 atttctaccttcaattcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtcttcaattgagagtatccacttgccaaaattatcaatttcttcctgctttgcag 36207536  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  36207537 gtac 36207540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 285 - 684
Target Start/End: Original strand, 18148614 - 18149013
Alignment:
Q  285 gaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaa 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18148614 gaattccagagctcttaataccattaaggaattccgttgtgaaccacttgctttggacataagaattttcatccgatcgacaaacagaataagagcttaa 18148713  T
Q  385 atactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18148714 atactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaaatgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaat 18148813  T
Q  485 agcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaattt 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  18148814 agcgggtcaccaaggttatcattcaaattgagatacacaaagtcgataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcataaattt 18148913  T
Q  585 ctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtac 684  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18148914 ctaccttcatttcaccattctccttcgaagcgttattgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtac 18149013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 281 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 48775632 - 48775231
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48775632 tttggaattccatagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagactttttgcccgatcgacaaactgaatcagagc 48775533  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | | || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  48775532 ttaaatactctttctcttcacctggaatcatttacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaa 48775433  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  48775432 aaagagcaggtcaccaatgttatcattctaatcgggatatacaaagtgtattagtgacatcaaagaatttgttgtgtcggatatgagcaaatcttcggga 48775333  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  48775332 atttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcagtttctttctgctctgtag 48775233  T
Q  681 gt 682  Q
    ||    
T  48775232 gt 48775231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 6311292 - 6310888
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcg-acaaacagaatcagag 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||    
T  6311292 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctcaaaaatagaatcagag 6311193  T
Q  380 cttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattgga 479  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6311192 gttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgga 6311093  T
Q  480 aaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagg 579  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  6311092 aaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcgaatcttcagg 6310993  T
Q  580 aatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgca 679  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6310992 aatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaatggagactatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgca 6310893  T
Q  680 ggtac 684  Q
    |||||    
T  6310892 ggtac 6310888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 37390442 - 37390046
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||       |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||     
T  37390442 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactc-------acatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagg 37390350  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37390349 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 37390250  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  37390249 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcagga 37390150  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37390149 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatctttgccgtctccaattgagaatatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 37390050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 282 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 48238773 - 48238519
Alignment:
Q  282 ttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagct 381  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48238773 ttggaatttcagagctcttaataccattaagaaattctattgtgaaatactcgctttggacatcaaagttttcacccgatcgacaaacagaatcagagct 48238674  T
Q  382 taaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaa 481  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  48238673 taaatactctttctcttcgcctggaatcagcgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcctctttcttggaaa 48238574  T
Q  482 aatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtg 536  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48238573 aatagagggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtg 48238519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28164654 - 28164375
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||| || ||     
T  28164654 attcacataccaagtgttcctcagttttaggggcagtgacactcgtgacggtttcactggccatctctataaggcccttgacgacaagggaattcacaca 28164555  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    |||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  28164554 ttcattgatgattgtgatcttgagagaggagaagaaatcacaccgtcattcatcaaggccattgaaaaatcttgaatttttattcctgtgttatctatca 28164455  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28164454 actatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctagttttg 28164375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 268613 - 268370
Alignment:
Q  37 tgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaa 136  Q
    |||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||    
T  268613 tgacactcgtgagggttttattggccatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaa 268514  T
Q  137 atcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttg 236  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  268513 atcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttg 268414  T
Q  237 ttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  268413 tccacatcattcactgctacaagaaaaagggtcgtctcattttg 268370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 479 - 684
Target Start/End: Original strand, 48233498 - 48233703
Alignment:
Q  479 aaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcag 578  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48233498 aaaaatagagggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcagcggatttgttgtgttcgatatgagtaaatcttcag 48233597  T
Q  579 gaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgc 678  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48233598 gaatttctaccttcatttccccattctcatctgaagcgtcgttgtcgtctcaagttgagagtattcacttgtcaaaattaggaatttcttcctgctctgc 48233697  T
Q  679 aggtac 684  Q
    ||||||    
T  48233698 aggtac 48233703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28127972 - 28127692
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||     
T  28127972 attcacataccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtgacggtttcactggccatctctacaaggccctttatgacaagggaatccacaca 28127873  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggag-atgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatc 199  Q
    |||||||||||   | ||||| | ||||||| |  |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  28127872 ttcattgatgattgtaatcttgagagaggagaaaaaaatcacaccgtcacttttaaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtattttctacc 28127773  T
Q  200 aactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28127772 aactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtgcacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctagttttg 28127692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 281 - 485
Target Start/End: Original strand, 52500591 - 52500795
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  52500591 tttggaattccaaagctcttaataccattaaggaattccgttgtgaaccgctcattttggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagt 52500690  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52500691 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 52500790  T
Q  481 aaata 485  Q
    |||||    
T  52500791 aaata 52500795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 570 - 657
Target Start/End: Original strand, 52500795 - 52500882
Alignment:
Q  570 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaatt 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  52500795 aatcttcaggaatttctaccttcatttaaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccgaaatt 52500882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25074152 - 25074114
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25074152 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcc 25074114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 281 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 5556 - 5155
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5556 tttggaattccagagctcttaataccattaaggaattctgttgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagc 5457  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  5456 ttaaatactctttctcttcacctgaaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgg-a 5358  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5357 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacatcaatagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagga 5258  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5257 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgctgttgtcgtctccaagtcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctttgcag 5158  T
Q  681 gta 683  Q
    |||    
T  5157 gta 5155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 281 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 10969078 - 10968668
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  10969078 tttgaaattctagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatcgacaaacaaaataagagc 10968979  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||    
T  10968978 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctaaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccccttgcttagaa 10968879  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |    
T  10968878 aaatagcaggtcacgaagtttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatc-tcagaa 10968780  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10968779 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccatctccaattgagagtgtccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctatag 10968680  T
Q  681 gtactgatgatg 692  Q
    ||||||| ||||    
T  10968679 gtactgaagatg 10968668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 10110522 - 10110925
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||    
T  10110522 tttggaattccagagctcttaatatcattaaggaattccgttgtgaaccacttgatttggacatcagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagc 10110621  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10110622 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 10110721  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  10110722 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtgacatcaacagatttgttgcgtctgatatgagcaaatcttcagga 10110821  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10110822 atttctaccttcatttcaccattctcctccgaagcgttgttgccgtctccaattcatagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgtag 10110921  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  10110922 gtac 10110925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 13529961 - 13530364
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || ||||||||| ||||| ||||||    
T  13529961 tttggaattccagagctcttaataccactaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacaccaaaattttcacctgatcgacaagcagaaccagagc 13530060  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13530061 ttaaatactctttctcttcacctggactcagtgacatcatatattcgttaaaatgctcaactgaatgaagtgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 13530160  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||    
T  13530161 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatgaccaaatcttctaga 13530260  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13530261 atttctaccttcatttcaccattctcacctgatgcgtcgttgccgtctccaattgagagtatatacttgccaaaattagcaatttattcctgctctacag 13530360  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  13530361 gtac 13530364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 50410094 - 50410493
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  50410094 tttggaattccagagctcttaataccatttagaaattccgctgtgaaccactctcattggacatcagaattttcacccgatcgacaaagagaatcagagc 50410193  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  50410194 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatatttgttaacatgctcgactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaa 50410293  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  50410294 aaatagtgggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcagcggatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcagga 50410393  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  50410394 attt----cttcatttcaccattctcatccaaagcgtcgttaccgtctctaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttattcctgctctacag 50410489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 32693 - 33096
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||     
T  32693 tttggatttccagagctcttaataccattaagaaattatggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagg 32792  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32793 ttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 32892  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32893 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtccataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcagga 32992  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32993 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcattgttgccgtctctaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 33092  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  33093 gtac 33096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 10000329 - 10000732
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||    
T  10000329 tttggaattccagagctcttaatatcattagggaattccgttgtgaaccacttgatttggacatcagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagc 10000428  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  10000429 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcctctttcttggaa 10000528  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  10000529 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtgatatcaacagatttgttgcatctgatatgagcaaatcttcagga 10000628  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  10000629 atttctaccttcatttcaccattctcctccgaagcgttgttgccgtctccaattcatagtatccacttgccaaaattaacaatttctttctactctgcag 10000728  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  10000729 gtac 10000732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 10237478 - 10237879
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||    
T  10237478 tttggaattccagagctcttaatatcattaaggaattccgttgtgaaccacttgatttggacatcagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagc 10237577  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || | || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  10237578 ttaa-tactctttctcttcacctggaatcagtaacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaa 10237676  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||    
T  10237677 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtgacatcaacagatttgttgcgtctgatatgagcaattcttcagga 10237776  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10237777 atttctaccgttatttcaccattc-cctccgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctcagcag 10237875  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  10237876 gtac 10237879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 287 - 624
Target Start/End: Original strand, 52917994 - 52918330
Alignment:
Q  287 attccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaaat 386  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52917994 attccagagctcttagtaccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatcgacaaacaaaatcagagcttaaat 52918093  T
Q  387 actctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaatag 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  52918094 actctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgggtattcccctttcttggaaaaatag 52918193  T
Q  487 cgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttct 586  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||   ||||||| ||||||||||||    
T  52918194 cgagtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacgaagtctataagtggcatcaacagatttgttgtgtccggtaacggcaaatc-tcaggaatttct 52918292  T
Q  587 accttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgcc 624  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52918293 accttcatttcaccattcccatccgaagcgtcgttgcc 52918330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 281 - 682
Target Start/End: Original strand, 11362180 - 11362584
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11362180 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctagacatcagacttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagc 11362279  T
Q  381 ttaaatac-tctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattgga 479  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  11362280 ttaaaaaaatctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttgga 11362379  T
Q  480 aaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagg 579  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||| ||    
T  11362380 aaaatagtgggtcaccaatgttatcatttaaatcgggatatacaaagtctattagtgacatcaacgaatttgttgtatcggatatgagtaaatcttcggg 11362479  T
Q  580 aatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagag--tatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctg 677  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  11362480 aatttcccccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgtcgtctccaattgagagtatatccacttgccaaaattagcagtttattcttgctctg 11362579  T
Q  678 caggt 682  Q
    |||||    
T  11362580 caggt 11362584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 10038562 - 10038955
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10038562 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattcctttgtgaaccattcgctttgggcatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatgagagc 10038661  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  10038662 ttaaataatatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaattgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaa 10038761  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||          | ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||   |    
T  10038762 aaatagcgggtcactaaggttatcattcaaattgggatacacaaa----------gacatcaacagatttgttgtgtctgatataagcaaatcttcgaaa 10038851  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  10038852 atttataccttcgtttcaccattctcatctaaagcgtcgttgccgtcttcaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcttgctctgcac 10038951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 281 - 682
Target Start/End: Original strand, 11368568 - 11368962
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaatttt-cgcccgatcgacaaacagaatcagag 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||  |||||||||    
T  11368568 tttggaattctagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagactttttcacccaatcgacaaattgaatcagag 11368667  T
Q  380 cttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattgga 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  11368668 cttaaatactctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttgga 11368767  T
Q  480 aaaat-agcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcag 578  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  11368768 aaaaagagcgggtcaccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtctatgagtgacatcaacggatttgttgtgtcggatatgagcaaatcttcgg 11368867  T
Q  579 gaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgc 678  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||         |||||| | ||||||||| || |||| |||| |||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  11368868 gaatttctacattcatttcaccattctca---------tcgttgtcctctccaattgagggtatccacttgccaaaattatcagtttcttccttctctgc 11368958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 285 - 533
Target Start/End: Original strand, 46912997 - 46913245
Alignment:
Q  285 gaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagcttaa 384  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  46912997 gaattccatagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacatcagaatttccccccgatcgacaaacataatcaaagcttaa 46913096  T
Q  385 atactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaaaaat 484  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  46913097 atactatttttcttcacctggaattggtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattctcctttcttggaaaaat 46913196  T
Q  485 agcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataa 533  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913197 agcgggtcgccaaagttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataa 46913245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 281 - 505
Target Start/End: Original strand, 47692891 - 47693115
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  47692891 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaatttcgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgtccgatcgacaaacagaatcagagg 47692990  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |    
T  47692991 ttaaatactctttctcttcacctggaattagtgacatcatgtattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgaggattcccctttcttggga 47693090  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatca 505  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  47693091 aaattgtgggtcaccaaggttatca 47693115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41763659 - 41763622
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattc 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41763659 tttggaattctagagctcttaataccattaaaaaattc 41763622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 281 - 683
Target Start/End: Original strand, 18928 - 19329
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18928 tttggaattccagagctcttaataccattaaggaattccgttgtgaaccactcgctttgcacatcagaattttcactcgatcgacaaacagaatcagagc 19027  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19028 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccccttttttggaa 19127  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19128 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcaagatacacaaagtctataagtgacatcaacatatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagaa 19227  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| | || ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19228 atttctaccttcatttcatcattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcaaagtatccccttgcc-aaattagcaatttctttctgctctgcag 19326  T
Q  681 gta 683  Q
    |||    
T  19327 gta 19329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 869 - 466
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||     
T  869 tttggaattccatagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccaatctacaaacagaatcagagg 770  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | || || ||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  769 ttaaatactctttcttttcacctggaatcagcgacatcataaattcattaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttattggaa 670  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  669 aaatagctggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacaaagtttataagtgacatcaacgggtttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcagga 570  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  569 atttctaccttcatttcatcattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 470  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  469 gtac 466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Original strand, 31855 - 32257
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  31855 tttgggattccaaagatcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagt 31954  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  | || ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  31955 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcaacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcaagtat-cccctttcttggaa 32053  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32054 aaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcagga 32153  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32154 atttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtatccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 32253  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  32254 gtac 32257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 281 - 572
Target Start/End: Original strand, 19379 - 19670
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19379 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgatgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagc 19478  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  19479 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaatttgttgacatgctcaactgaatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaa 19578  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaat 572  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  19579 aaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtttataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgatatcagcaaat 19670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 611 - 684
Target Start/End: Original strand, 3 - 76
Alignment:
Q  611 gaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtac 684  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3 gaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtac 76  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 18166 - 17770
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  18166 tttggaattctagagctcttaataccattaagaaattctgttgtgaaccactcgctttggacatcataattttcacccgatcggcaaacagaatcaaagc 18067  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||       
T  18066 ttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactaaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttg--- 17970  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17969 ----agcggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagga 17874  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17873 acttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcttcgttgctgtctccaattgagagtatccacttgctaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 17774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 281 - 682
Target Start/End: Original strand, 182733 - 183134
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  182733 tttgaaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcactctagccatcagatttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagc 182832  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  182833 ttaaatactctttctcttcacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaa 182932  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  182933 aaagagtgggtcaccaatgatatcattcaaatcgggatatacaaagtctattagtgacatcaacgaatttgttgtatcggatatgagcaaatcttcggga 183032  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  183033 atttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcagtttcttcctgctctgcag 183132  T
Q  681 gt 682  Q
    ||    
T  183133 gt 183134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 281 - 682
Target Start/End: Original strand, 165452 - 165856
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  165452 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctagacatcagacttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagc 165551  T
Q  381 ttaaatac-tctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattgga 479  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  165552 ttaaaaaaatctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttgga 165651  T
Q  480 aaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagg 579  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||| ||    
T  165652 aaaatagtgggtcaccaatgttatcatttaaatcgggatatacaaagtctattagtgacatcaacgaatttgttgtatcggatatgagtaaatcttcggg 165751  T
Q  580 aatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagag--tatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctg 677  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  165752 aatttcccccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgtcgtctccaattgagagtatatccacttgccaaaattagcagtttattcttgctctg 165851  T
Q  678 caggt 682  Q
    |||||    
T  165852 caggt 165856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 59455 - 59731
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || || |||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  59455 attcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgacaagggaattcgtacc 59554  T
Q  101 ttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgtttt 194  Q
    |||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| |||||||| |||||  | ||||    
T  59555 ttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattttgattcccatatttt 59645  T
Q  195 ctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||    
T  59646 ctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgttttg 59731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 49233 - 48830
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||     
T  49233 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctggtgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagagg 49134  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || || ||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49133 ttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaa 49034  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  49033 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcagga 48934  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48933 atttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtag 48834  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  48833 gtac 48830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 281 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 321633 - 321230
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  321633 tttggaattccagagctctgaataccattaagaaattctgatgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagc 321534  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | || || ||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  321533 ttaaatactctttctcttcacctgaaatcagcgatatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcattggtgcgagtattcccctttcttggaa 321434  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcagga 580  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  321433 aaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacaaaaagtctataagtgacatcaacggatttgttttgtccgatatcagcaaatcttcagga 321334  T
Q  581 atttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |  |||||||||| |||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  321333 atttctaccttcatttcaccattatcaaccgaagcataattgccgtctcaaattgagaatatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcag 321234  T
Q  681 gtac 684  Q
    ||||    
T  321233 gtac 321230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3727 - 3450
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3727 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 3628  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3627 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 3528  T
Q  201 a-ctatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgtt 277  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3527 acctatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgtt 3450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14660 - 14382
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660 attcacttaccaagtgttcatcagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 14561  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14560 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 14461  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14460 actatgcct-ttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 14382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 8106 - 8061
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcgg 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8106 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgg 8061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13937 - 13658
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13937 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 13838  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 13738  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||| ||| ||||   |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13737 actacgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttg 13658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4976 - 4697
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4976 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 4877  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4876 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatccctccgcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatct 4777  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776 tctatgccttttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 4697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 7407 - 7686
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7407 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 7506  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 7606  T
Q  201 actatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||| ||| ||||   |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7607 actacgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacagaaggtcgcctcgttttg 7686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 281 - 564
Target Start/End: Original strand, 16606 - 16889
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||    
T  16606 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattctgttgtgaaccactcgctttggacatcagaattttcgctcgattgaaaaacagaatcatagc 16705  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16706 ttaaaaactctttctcttcacctagaatcagtgaaatcatatatgcgttaacatactccactaaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 16805  T
Q  481 aaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgttcgatat 564  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16806 aaatagcgggtcaccaaagttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatat 16889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 222 - 10
Alignment:
Q  1 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  222 attcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacc 123  T
Q  101 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 23  T
Q  201 actatgcctcttc 213  Q
    |||| ||| ||||    
T  22 actacgccacttc 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 281 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28931 - 28727
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  28931 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcactttggacatcaaaattttcacccaagcgacaaacagaatcagagt 28832  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtatgcccctttattggaa 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28831 ttaaatactttttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaa 28732  T
Q  481 aaata 485  Q
    |||||    
T  28731 aaata 28727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 570 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 28727 - 28613
Alignment:
Q  570 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagagtatgcactcgccaaaattagcaatttcttc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  28727 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgctgtcttcaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 28628  T
Q  670 ctgctctgcaggtac 684  Q
    |||||||||||||||    
T  28627 ctgctctgcaggtac 28613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 281 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 199 - 24
Alignment:
Q  281 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  199 tttggaattccagagctcttaataccattaagaaattccattgtgaaccactcgttttggaaatcagaattttcacccgatcgacatacaaaatcagagc 100  T
Q  381 ttaaatactctttctcttcacctggaatcggtgaaattatatatgcgttaatatgctcaactgaatcaagcgttgg 456  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  99 ttaaatactctttctcgccacctgaaatcagtgacatcgtatattcgttaacatgctcaactgaatcaagccttgg 24  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 34620 - 34865
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||  | |||||||| |  |||||||| |  ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34620 gtgttccttagttttagaggtagtgacactcgctatggttttaccgaaaatctctatagagctctttgtcacaagggaatccacaccttcattgatgaca 34719  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  34720 gggagcttcaaggaggagatgaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttc 34819  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaag 259  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  34820 ttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaag 34865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 27343 - 27588
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||  | ||||  | | |||||||| || || ||| ||||||| |    
T  27343 gtgttccttagttttagaggtattgacactcgttatggttttactggaaatctctacagtgatctttgtaagaagggaattcacacattctttgatgata 27442  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
      || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  27443 gagagcttcaaggaggtgatgaaataacatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttc 27542  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaag 259  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27543 ttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcaag 27588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 42864 - 43127
Alignment:
Q  17 ttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatg 116  Q
    ||||| |||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | ||||  | | |||||||| |  ||||||||||||||||  |    
T  42864 ttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaagaagggaattcgcaccttcattgatgacagag 42963  T
Q  117 atcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttc 216  Q
    | |||| | |||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  42964 aacttccaggaggtgacaaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttc 43063  T
Q  217 attttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 280  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||||    
T  43064 attttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaagaaaaatggacgcctagttttg 43127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 254
Target Start/End: Original strand, 116691 - 116931
Alignment:
Q  14 gtgttcctcagttttaggggcattgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgaca 113  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | ||||  |   ||| |||| | |||||||||||||||||    
T  116691 gtgttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaggaagagaattcgtaccttcattgatgaca 116790  T
Q  114 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 213  Q
    | || |||||| |||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| |||||    
T  116791 aagaccttcaacgaggtgacgaaataacaccgtcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctattttgtctatcaattatgcttcttc 116890  T
Q  214 ttcattttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgct 254  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  116891 ttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactgct 116931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 540 - 684
Target Start/End: Original strand, 39937 - 40081
Alignment:
Q  540 tcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattaagag 639  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  39937 tcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaagaatttctacctttatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccatctccaattgagag 40036  T
Q  640 tatgcactcgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtac 684  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40037 tattcacttgccaaagttagcaatttcttcctgctctgtaggtac 40081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 283 - 414
Target Start/End: Original strand, 1572 - 1703
Alignment:
Q  283 tggaattccagagctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctctggacatcagaattttcgcccgatcgacaaacagaatcagagctt 382  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  1572 tggaattctagtgctcttaataccattaagaaattccgttgtgaaccactcgctttggacatcaaaattttcacccgatcgataaacataatcagagttt 1671  T
Q  383 aaatactctttctcttcacctggaatcggtga 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1672 aaatacgctttctcttcacctggaatcagtga 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 58551 - 58334
Alignment:
Q  37 tgacactcggcacggttttactggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaa 136  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || |||    
T  58551 tgacactcgctatggttttactggaaatctctacagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgacgaa 58452  T
Q  137 atcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggatgaacttg 236  Q
    || |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  58451 ataacaccatcacttttcaaggccattaaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaactatgcttcttcttcattttgcttgaacgaacttg 58352  T
Q  237 ttcacatcattcattgct 254  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  58351 tccacatcattcactgct 58334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 97108 - 97080
Alignment:
Q  293 gagctcttaataccattaagaaattccgt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  97108 gagctcttaataccattaagaaattccgt 97080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University