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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4237_low_1 (Length: 757)

Name: NF4237_low_1
Description: NF4237
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4237_low_1
NF4237_low_1
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (4-739)||(2890920-2891667)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 587; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 2891667 - 2890920
Alignment:
Q  4 ggagcagcacagaagatgagagagaaagctatgaaagttgtaataggttgaattttgaaatccctgcacatattttagaagcgaatgattttatgtaatg 103  Q
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T  2891667 ggagcaacacagaagatgagagagaaagctatgaaagttgtaataggttgaattttgaaatccctgcacatattttagaagcgaatgattttatgtaatg 2891568  T
Q  104 tgtgcaattggatccataatcatcaacagttaaatcaaccaaacagttgattatttcaccctctgtttttgctgggatatatagctactgtatatctatg 203  Q
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T  2891567 tgtgcaattggatccataatcatcaacagttaaatcaaccaaacagttgattatttcaccctctgtttttgctgggatatatagctactgtctatctatg 2891468  T
Q  204 gatcctttggtggggcatgttgatatgtgtaacatttcctatatttttattgattgataaagtttatatttcttaattgaaatttatctttattataaat 303  Q
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T  2891467 gatcctttggtggggcatgttgatatgtgtaacatttcctatatttttattgattgataaagtttatatttcttaattggaatttatctttattataaat 2891368  T
Q  304 ccctttgtctttattgaattttttaaatttgaaagtttattattgctcaatagcttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctccatagtagtgtgat 403  Q
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T  2891367 ccctttgtctttattgaattttttaaatttgaaattttattattgctccatagcttatcac-aaaaaaaaaaaaaaaaaaattctccatagtagtgtgat 2891269  T
Q  404 atccatgtttacgtcccttcttagatttatgatatatgtcataatcgaattatagagagtaaaatagaaatgaagtgtaactcaaaaacatttgcaaaag 503  Q
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T  2891268 atccatgtttacgtcccttcttagatttatgatatatgtcataatcgaattatagagagtaaaatagaaatgaagtgttactcaaaaacatttgcaaaag 2891169  T
Q  504 atagtattagactctcttcttgttcgatcatagcctctttaaattcaatcatagaattgcacccgcgttaaattcattgggaaagattcacattttggct 603  Q
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T  2891168 atagtattagagtctcttcttgttcgatcatagcctctttaaattcaatcatagaattgcacccgcgttaaattcatttggaaagattcacattttggct 2891069  T
Q  604 catcgcttcaagatattagcatttgtagttgtgtgcaatattatcggatttttacca----------aaaaataaatatgaacaagagttcaatattatt 693  Q
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T  2891068 catcgcttcaagatattagcatttgtagttgcgtgcaatattatcgaatttttaccaaaaaaaaattaaaaataaatacgaacaagagttcaatattatt 2890969  T
Q  694 attatatattgactaatgagttttagtt---gtcaaatcatttagtagt 739  Q
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T  2890968 attatatattgattaatgagttttagttaaggtcaaatcatttagtagt 2890920  T

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