View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4239_high_11 (Length: 263)

Name: NF4239_high_11
Description: NF4239
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4239_high_11
NF4239_high_11
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (11-263)||(17697036-17697288)
chr1 (13-263)||(5765198-5765448)
chr1 (11-263)||(42571739-42571992)
chr1 (13-263)||(13283697-13283947)
chr1 (11-263)||(14173718-14173974)
chr1 (24-263)||(24363764-24364003)
chr1 (11-263)||(6435762-6436018)
chr1 (11-260)||(35586893-35587145)
chr1 (12-263)||(36909552-36909807)
chr1 (11-260)||(17686324-17686577)
chr1 (11-263)||(13972914-13973170)
chr1 (11-263)||(24270323-24270579)
chr1 (13-263)||(35576331-35576582)
chr1 (14-263)||(48568367-48568617)
chr1 (11-239)||(18170015-18170243)
chr1 (11-263)||(38046394-38046650)
chr1 (11-263)||(12791236-12791489)
chr1 (19-263)||(47488000-47488245)
chr1 (13-263)||(39856869-39857120)
chr1 (23-263)||(3658475-3658716)
chr1 (13-234)||(18842431-18842652)
chr1 (11-263)||(39224160-39224413)
chr1 (11-263)||(50068222-50068475)
chr1 (14-263)||(49396697-49396950)
chr1 (14-263)||(13635260-13635510)
chr1 (11-233)||(44337313-44337535)
chr1 (11-237)||(49926370-49926595)
chr1 (11-263)||(27035281-27035534)
chr1 (14-263)||(35184963-35185217)
chr1 (11-263)||(49427377-49427630)
chr1 (14-263)||(23342634-23342887)
chr1 (12-263)||(29762184-29762436)
chr1 (14-263)||(21484606-21484856)
chr1 (11-233)||(29435963-29436185)
chr1 (11-263)||(27486653-27486906)
chr1 (11-263)||(44597691-44597944)
chr1 (11-263)||(51269792-51270045)
chr1 (14-263)||(45689114-45689362)
chr1 (11-263)||(17372717-17372970)
chr1 (11-263)||(19160307-19160560)
chr1 (14-263)||(41874847-41875097)
chr1 (43-263)||(46180243-46180465)
chr1 (13-263)||(16532054-16532304)
chr1 (14-232)||(48215191-48215409)
chr1 (11-263)||(41780683-41780939)
chr1 (51-230)||(37778109-37778288)
chr1 (13-263)||(49262951-49263202)
chr1 (11-181)||(49598921-49599090)
chr1 (13-215)||(35526189-35526391)
chr1 (14-263)||(30309795-30310039)
chr1 (30-263)||(16081294-16081527)
chr1 (137-260)||(40533249-40533376)
chr1 (67-152)||(13148365-13148450)
chr1 (167-260)||(14772499-14772592)
chr1 (13-81)||(16098078-16098146)
chr1 (123-231)||(19262409-19262517)
chr1 (147-221)||(29707547-29707621)
chr1 (13-106)||(14772662-14772755)
chr1 (13-215)||(15471510-15471721)
chr1 (13-55)||(48707090-48707132)
chr1 (231-263)||(27034784-27034816)
chr1 (11-48)||(46181731-46181768)
chr1 (235-263)||(3659321-3659349)
chr1 (235-263)||(39223614-39223642)
chr1 (235-263)||(46924689-46924717)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (14-263)||(33404012-33404261)
chr2 (11-263)||(35491629-35491885)
chr2 (11-263)||(10364594-10364849)
chr2 (11-263)||(19471590-19471846)
chr2 (11-263)||(12968261-12968514)
chr2 (19-263)||(42120014-42120259)
chr2 (16-263)||(10360158-10360406)
chr2 (11-263)||(2919321-2919577)
chr2 (13-263)||(27130465-27130719)
chr2 (11-263)||(41499050-41499306)
chr2 (19-263)||(29906584-29906829)
chr2 (13-230)||(37312488-37312705)
chr2 (11-263)||(34521640-34521896)
chr2 (11-233)||(22493265-22493487)
chr2 (11-263)||(3941731-3941984)
chr2 (13-234)||(6901962-6902183)
chr2 (11-263)||(6976832-6977086)
chr2 (14-263)||(29111155-29111405)
chr2 (11-263)||(42241058-42241311)
chr2 (13-263)||(5420465-5420716)
chr2 (13-234)||(20148114-20148335)
chr2 (11-227)||(32734641-32734857)
chr2 (11-260)||(3937026-3937276)
chr2 (11-260)||(43982850-43983100)
chr2 (13-263)||(17796066-17796314)
chr2 (12-263)||(17424784-17425036)
chr2 (14-263)||(29067726-29067976)
chr2 (11-232)||(39393885-39394106)
chr2 (11-233)||(16581816-16582040)
chr2 (11-227)||(22001828-22002044)
chr2 (14-163)||(39799902-39800051)
chr2 (16-159)||(18392032-18392179)
chr2 (71-237)||(40677361-40677527)
chr2 (123-259)||(27650391-27650527)
chr2 (165-263)||(31991896-31991994)
chr2 (11-145)||(34638960-34639093)
chr2 (162-263)||(16253600-16253701)
chr2 (165-261)||(15891609-15891705)
chr2 (165-263)||(18036122-18036220)
chr2 (15-135)||(16253474-16253594)
chr2 (167-259)||(43491600-43491696)
chr2 (14-81)||(31770360-31770427)
chr2 (11-75)||(40678763-40678827)
chr2 (216-263)||(20148334-20148381)
chr2 (154-263)||(18393486-18393596)
chr2 (221-262)||(6902187-6902228)
chr2 (13-227)||(11679084-11679308)
chr2 (13-207)||(11718741-11718945)
chr2 (11-56)||(26617652-26617697)
chr2 (120-172)||(17112399-17112451)
chr2 (132-215)||(26617485-26617568)
chr2 (165-231)||(18878652-18878718)
chr2 (235-263)||(32736853-32736881)
chr2 (235-263)||(42120779-42120807)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (13-263)||(14115033-14115283)
chr6 (11-263)||(801160-801412)
chr6 (11-263)||(13402527-13402783)
chr6 (11-263)||(32027587-32027843)
chr6 (29-263)||(35058697-35058932)
chr6 (11-236)||(32037677-32037902)
chr6 (11-233)||(29066547-29066769)
chr6 (11-233)||(29075560-29075782)
chr6 (11-233)||(29108134-29108356)
chr6 (11-237)||(34802885-34803111)
chr6 (12-233)||(11692446-11692667)
chr6 (11-233)||(29110531-29110754)
chr6 (11-263)||(27640174-27640427)
chr6 (11-230)||(12396770-12396989)
chr6 (11-233)||(6205478-6205700)
chr6 (14-196)||(22305793-22305975)
chr6 (76-263)||(30257538-30257729)
chr6 (146-263)||(17465298-17465415)
chr6 (167-263)||(34134801-34134897)
chr6 (165-261)||(20192466-20192562)
chr6 (165-261)||(20242092-20242188)
chr6 (165-261)||(22136076-22136172)
chr6 (165-261)||(22143429-22143525)
chr6 (174-263)||(14482785-14482874)
chr6 (13-263)||(28051354-28051614)
chr6 (147-263)||(3765749-3765867)
chr6 (155-263)||(24021059-24021168)
chr6 (155-263)||(2192535-2192644)
chr6 (123-200)||(2402306-2402383)
chr6 (179-263)||(35021196-35021284)
chr6 (231-263)||(14123449-14123481)
chr6 (130-218)||(18743985-18744073)
chr6 (13-67)||(18744144-18744198)
chr6 (235-263)||(34132140-34132168)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (11-263)||(43889460-43889716)
chr4 (13-260)||(3393296-3393543)
chr4 (13-263)||(17211258-17211509)
chr4 (13-263)||(18412587-18412837)
chr4 (11-263)||(22436901-22437157)
chr4 (19-263)||(31824593-31824838)
chr4 (11-263)||(33163508-33163761)
chr4 (11-263)||(51428156-51428409)
chr4 (12-263)||(14330658-14330910)
chr4 (13-263)||(25762590-25762841)
chr4 (12-263)||(49817605-49817860)
chr4 (11-227)||(242417-242633)
chr4 (11-261)||(51027733-51027984)
chr4 (11-263)||(34153247-34153503)
chr4 (13-263)||(10312264-10312514)
chr4 (11-263)||(1226150-1226402)
chr4 (14-263)||(11288288-11288536)
chr4 (11-263)||(21017141-21017394)
chr4 (11-263)||(40353737-40353990)
chr4 (11-235)||(26591678-26591902)
chr4 (13-263)||(24606744-24606995)
chr4 (13-263)||(957416-957670)
chr4 (11-230)||(4785420-4785639)
chr4 (11-263)||(49791897-49792153)
chr4 (12-263)||(2773000-2773255)
chr4 (11-237)||(34529787-34530013)
chr4 (11-263)||(49063969-49064222)
chr4 (16-263)||(20778833-20779081)
chr4 (16-263)||(55796738-55796986)
chr4 (11-263)||(47657316-47657572)
chr4 (14-263)||(32937866-32938116)
chr4 (11-263)||(46816489-46816740)
chr4 (14-263)||(6282284-6282537)
chr4 (11-263)||(13850739-13850991)
chr4 (14-263)||(1042744-1042992)
chr4 (11-263)||(21169441-21169697)
chr4 (11-261)||(13866253-13866503)
chr4 (11-233)||(41794557-41794779)
chr4 (11-233)||(37866396-37866619)
chr4 (11-263)||(44560141-44560397)
chr4 (11-233)||(6177310-6177532)
chr4 (14-263)||(20901632-20901882)
chr4 (11-233)||(56138900-56139122)
chr4 (14-263)||(31324167-31324416)
chr4 (40-263)||(21711549-21711773)
chr4 (14-263)||(36776480-36776733)
chr4 (13-260)||(42886255-42886509)
chr4 (11-233)||(49094735-49094957)
chr4 (11-263)||(28082228-28082481)
chr4 (14-260)||(49423722-49423972)
chr4 (68-263)||(27759374-27759570)
chr4 (14-233)||(45939518-45939737)
chr4 (14-263)||(39588922-39589172)
chr4 (13-263)||(9489671-9489921)
chr4 (142-263)||(49817162-49817283)
chr4 (165-260)||(17292106-17292201)
chr4 (123-263)||(23124490-23124630)
chr4 (13-106)||(21412647-21412740)
chr4 (123-231)||(20759132-20759240)
chr4 (123-231)||(20765523-20765631)
chr4 (235-263)||(1226898-1226926)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (13-263)||(1642550-1642800)
chr7 (11-263)||(18237556-18237809)
chr7 (11-263)||(48270640-48270896)
chr7 (12-263)||(41048776-41049031)
chr7 (11-263)||(15337864-15338120)
chr7 (13-263)||(21614722-21614973)
chr7 (14-263)||(41217609-41217859)
chr7 (11-263)||(43351059-43351314)
chr7 (11-263)||(46862153-46862409)
chr7 (11-226)||(47268891-47269105)
chr7 (11-263)||(20378665-20378918)
chr7 (14-263)||(36393783-36394036)
chr7 (11-230)||(21187295-21187514)
chr7 (11-263)||(48315139-48315395)
chr7 (11-263)||(39477202-39477455)
chr7 (12-263)||(2356282-2356534)
chr7 (12-263)||(40588542-40588794)
chr7 (14-263)||(30360512-30360761)
chr7 (12-233)||(34140858-34141079)
chr7 (11-263)||(42735255-42735510)
chr7 (13-219)||(21650518-21650724)
chr7 (19-263)||(48220706-48220949)
chr7 (12-219)||(17183205-17183412)
chr7 (11-263)||(17839315-17839569)
chr7 (11-233)||(20564751-20564973)
chr7 (29-263)||(30354774-30355012)
chr7 (11-263)||(28114352-28114608)
chr7 (14-188)||(28979060-28979234)
chr7 (11-163)||(26603268-26603420)
chr7 (12-263)||(10523061-10523314)
chr7 (11-263)||(45363214-45363458)
chr7 (119-263)||(2205999-2206144)
chr7 (103-260)||(9367085-9367243)
chr7 (123-259)||(150192-150328)
chr7 (11-135)||(13916825-13916949)
chr7 (173-263)||(3380637-3380727)
chr7 (11-114)||(42682948-42683051)
chr7 (130-253)||(18149638-18149761)
chr7 (123-230)||(28066359-28066466)
chr7 (165-238)||(11824839-11824912)
chr7 (165-263)||(26601740-26601839)
chr7 (144-263)||(13920431-13920551)
chr7 (123-231)||(7414196-7414304)
chr7 (14-63)||(8726381-8726430)
chr7 (130-231)||(12083042-12083143)
chr7 (130-229)||(31267188-31267286)
chr7 (167-263)||(17320163-17320260)
chr7 (12-52)||(3924805-3924845)
chr7 (13-56)||(18146953-18146996)
chr7 (185-263)||(34139332-34139411)
chr7 (235-263)||(26500410-26500438)
chr7 (235-263)||(26592275-26592303)
chr7 (235-263)||(30361280-30361308)
chr7 (235-263)||(39476656-39476684)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (14-263)||(51015284-51015537)
chr3 (14-263)||(39416910-39417160)
chr3 (13-263)||(6754210-6754461)
chr3 (11-263)||(51013237-51013493)
chr3 (15-256)||(6464314-6464556)
chr3 (11-263)||(47065691-47065944)
chr3 (11-263)||(30192542-30192798)
chr3 (13-263)||(44927469-44927720)
chr3 (11-263)||(46414293-46414549)
chr3 (14-263)||(48087514-48087764)
chr3 (11-263)||(42382275-42382528)
chr3 (11-263)||(53826658-53826911)
chr3 (13-263)||(8633324-8633572)
chr3 (19-263)||(41577918-41578166)
chr3 (13-263)||(774301-774551)
chr3 (11-263)||(25576554-25576806)
chr3 (11-263)||(42949982-42950235)
chr3 (14-230)||(34472072-34472288)
chr3 (14-230)||(45100461-45100677)
chr3 (11-263)||(43569914-43570170)
chr3 (11-263)||(55206843-55207099)
chr3 (14-260)||(33449117-33449351)
chr3 (11-263)||(42383055-42383308)
chr3 (11-260)||(2428491-2428744)
chr3 (12-263)||(13895832-13896084)
chr3 (11-237)||(41803906-41804132)
chr3 (11-263)||(2646838-2647091)
chr3 (13-230)||(34647263-34647480)
chr3 (12-263)||(49218698-49218950)
chr3 (13-263)||(34693252-34693503)
chr3 (12-261)||(10053236-10053485)
chr3 (14-263)||(24702234-24702483)
chr3 (11-263)||(3494991-3495244)
chr3 (14-260)||(37281459-37281709)
chr3 (11-230)||(47759887-47760106)
chr3 (13-263)||(7954209-7954464)
chr3 (11-237)||(27186952-27187178)
chr3 (11-263)||(19453191-19453444)
chr3 (11-263)||(43477061-43477314)
chr3 (11-263)||(49610493-49610746)
chr3 (14-263)||(2268456-2268706)
chr3 (11-260)||(49140019-49140269)
chr3 (11-260)||(54390446-54390696)
chr3 (14-263)||(7246101-7246354)
chr3 (12-263)||(44835449-44835701)
chr3 (11-230)||(14631449-14631668)
chr3 (11-263)||(52569368-52569623)
chr3 (11-260)||(34049731-34049981)
chr3 (11-233)||(46403007-46403229)
chr3 (11-233)||(51695599-51695821)
chr3 (11-263)||(4004049-4004302)
chr3 (18-263)||(20375845-20376090)
chr3 (12-263)||(49273404-49273659)
chr3 (12-263)||(36135013-36135264)
chr3 (14-260)||(36721351-36721601)
chr3 (11-261)||(50458652-50458906)
chr3 (11-263)||(14265412-14265661)
chr3 (50-263)||(42323348-42323565)
chr3 (72-260)||(50997453-50997642)
chr3 (135-263)||(18440873-18441001)
chr3 (135-263)||(19485947-19486075)
chr3 (40-263)||(25887571-25887796)
chr3 (106-263)||(46346571-46346732)
chr3 (14-101)||(15637031-15637118)
chr3 (171-263)||(15637155-15637247)
chr3 (142-234)||(7954774-7954866)
chr3 (13-64)||(11378906-11378957)
chr3 (12-61)||(46346745-46346794)
chr3 (216-260)||(7954865-7954909)
chr3 (11-54)||(42328288-42328331)
chr3 (123-215)||(17267306-17267398)
chr3 (223-263)||(773986-774026)
chr3 (231-263)||(27187849-27187881)
chr3 (235-263)||(42949656-42949684)
chr3 (235-263)||(44834902-44834930)
chr3 (235-263)||(47066462-47066490)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (13-263)||(1400264-1400518)
chr5 (13-234)||(33370645-33370866)
chr5 (11-263)||(18308249-18308505)
chr5 (11-263)||(7194-7447)
chr5 (11-263)||(8537943-8538196)
chr5 (12-233)||(40009518-40009739)
chr5 (13-263)||(1971356-1971607)
chr5 (11-263)||(4724036-4724292)
chr5 (11-263)||(541600-541853)
chr5 (11-263)||(8576106-8576359)
chr5 (11-263)||(11346698-11346951)
chr5 (11-263)||(19400352-19400605)
chr5 (11-263)||(3601330-3601583)
chr5 (11-263)||(28880980-28881233)
chr5 (11-263)||(35565261-35565516)
chr5 (14-263)||(11027769-11028019)
chr5 (11-233)||(19036670-19036892)
chr5 (18-263)||(30709594-30709840)
chr5 (14-263)||(38854150-38854399)
chr5 (11-263)||(27661342-27661595)
chr5 (11-260)||(36350279-36350523)
chr5 (11-260)||(6793351-6793604)
chr5 (14-227)||(17366738-17366950)
chr5 (13-196)||(35927470-35927653)
chr5 (11-185)||(3169593-3169766)
chr5 (13-199)||(2599210-2599396)
chr5 (93-263)||(1694860-1695034)
chr5 (123-263)||(18920835-18920975)
chr5 (165-263)||(17195325-17195423)
chr5 (14-127)||(3458828-3458941)
chr5 (123-263)||(25360549-25360690)
chr5 (137-263)||(7082336-7082463)
chr5 (165-263)||(36311911-36312009)
chr5 (165-263)||(13131044-13131142)
chr5 (168-234)||(12742818-12742884)
chr5 (23-96)||(1693382-1693455)
chr5 (11-65)||(7082281-7082335)
chr5 (13-127)||(12742706-12742820)
chr5 (13-127)||(12805524-12805638)
chr5 (168-234)||(12805636-12805702)
chr5 (14-231)||(19748051-19748276)
chr5 (193-253)||(2599426-2599486)
chr5 (216-263)||(12742883-12742930)
chr5 (172-263)||(3458940-3459032)
chr5 (123-231)||(15798078-15798186)
chr5 (216-263)||(12805701-12805748)
chr5 (216-263)||(17366684-17366732)
chr5 (123-231)||(23228668-23228776)
chr5 (216-263)||(10397987-10398035)
chr5 (130-218)||(16418111-16418199)
chr5 (235-263)||(40012378-40012406)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (19-263)||(33799512-33799757)
chr8 (11-263)||(44943039-44943295)
chr8 (11-263)||(41856932-41857188)
chr8 (13-263)||(3589228-3589478)
chr8 (19-263)||(43638638-43638883)
chr8 (13-263)||(34614955-34615206)
chr8 (13-263)||(41363658-41363909)
chr8 (14-263)||(38033886-38034136)
chr8 (11-263)||(15032285-15032538)
chr8 (11-263)||(28706103-28706356)
chr8 (11-263)||(43693137-43693390)
chr8 (5-233)||(40415251-40415479)
chr8 (11-263)||(18440253-18440509)
chr8 (11-233)||(26452325-26452547)
chr8 (13-263)||(31171778-31172028)
chr8 (13-263)||(42168921-42169172)
chr8 (12-263)||(19242120-19242375)
chr8 (12-263)||(19315304-19315559)
chr8 (11-233)||(41275394-41275616)
chr8 (11-227)||(40414610-40414826)
chr8 (11-263)||(42603454-42603710)
chr8 (11-263)||(2416915-2417168)
chr8 (14-191)||(26484580-26484757)
chr8 (11-260)||(485222-485472)
chr8 (12-233)||(24861344-24861565)
chr8 (11-237)||(40702360-40702587)
chr8 (14-263)||(16575695-16575933)
chr8 (11-128)||(22548263-22548380)
chr8 (165-233)||(22549236-22549301)
chr8 (11-53)||(12504896-12504938)
chr8 (16-106)||(22843442-22843532)
chr8 (185-237)||(26486847-26486899)
chr8 (235-263)||(28705555-28705583)
chr8 (235-263)||(33776051-33776079)
chr8 (235-263)||(40416028-40416056)
chr8 (235-263)||(43637179-43637207)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (13-263)||(2261-2512)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (19-263)||(17879-18123)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (12-233)||(1783-2004)
[»] scaffold0181 (2 HSPs)
scaffold0181 (13-234)||(24899-25119)
scaffold0181 (231-263)||(25131-25163)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (11-139)||(63968-64095)
scaffold0004 (168-263)||(64098-64194)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (123-231)||(5453-5561)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (155-263)||(85462-85571)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (167-263)||(14616-14713)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (130-215)||(36775-36860)
scaffold0027 (13-106)||(36649-36742)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (231-263)||(108001-108033)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 17697036 - 17697288
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17697036 cagagacataaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaatgctcgacaagggtagggtatcattcacttgggtggagttaaagtacgacgaaaac 17697135  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17697136 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgc 17697235  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17697236 cagaagatcgtgattaggtaaggaatgcaccttccaactacaacagttgtctt 17697288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 5765198 - 5765448
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |    
T  5765198 gagatacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaactt 5765297  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5765298 gatgagcatgttttgggagcagaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaatgaagatattatcaaccgtctgattccgcca 5765397  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765398 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 5765448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42571992 - 42571739
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571992 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42571893  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  42571892 gtgaagagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 42571793  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt-agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||  | ||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  42571792 cagaagatcgtcattacttaaggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 42571739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 13283697 - 13283947
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||| |||||| |||||| |    
T  13283697 gagacacgaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttagttgggtgaaattaacgaacgatgaaaacat 13283796  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13283797 gacgagcatgttttgggagcgcagcatgttctagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacagtctgattccgcca 13283896  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283897 gaagatcgtgattaggtagagaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 13283947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14173974 - 14173718
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14173974 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 14173875  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  14173874 gtgacgagcatgttttgggaggacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 14173775  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14173774 cagaagatcgtcattaggtacggtatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 14173718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24364003 - 24363764
Alignment:
Q  24 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24364003 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcaatcacttgggtagaattaatgaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 24363904  T
Q  124 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtga 223  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  24363903 tttgggggcacagtatgttctagtggatcgatatgcggttaacgttgttgagagcaactgaagatattatcaagagtttgattccgttagaagatcgtga 24363804  T
Q  224 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24363803 ttaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 24363764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 6435762 - 6436018
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6435762 cagagacacaaggagggtggaaaacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6435861  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  6435862 gtgacgagcaagttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgagtgacgttgttgagatcaagtgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6435961  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6435962 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 6436018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35587145 - 35586893
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  35587145 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 35587046  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  35587045 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaccttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 35586946  T
Q  211 cagaagatcgtgattag---gtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    ||||||||||| |||||   | |  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35586945 cagaagatcgtcattagtacggaatgaatgcacctttcaactacaacagttgt 35586893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Original strand, 36909552 - 36909807
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  36909552 agagacataaggagggtggaatacgttcggtgtaaacgtccaacgctcgacgagggaagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 36909651  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  36909652 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 36909751  T
Q  212 agaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36909752 agaagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtctt 36909807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17686577 - 17686324
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  17686577 cagagacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacgaaaac 17686478  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  17686477 gtgaagagcatgttttgggagcacaacatcttccagtggatcgatatgcgggtgacgtagctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 17686378  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17686377 cagaagatcgtcattaggtatcgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 17686324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 13972914 - 13973170
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13972914 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacactcgactaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 13973013  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13973014 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtgacattgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 13973113  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || |||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13973114 cataagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 13973170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24270579 - 24270323
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24270579 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 24270480  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  24270479 gtgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 24270380  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| | | |||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24270379 cagaagatcatcaataggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 24270323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 35576331 - 35576582
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35576331 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 35576430  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  35576431 gacgagcatgttttgggagcacagcatgttccggtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 35576530  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  35576531 gaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 35576582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48568617 - 48568367
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  48568617 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaatgatgaaaacgtg 48568518  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||    
T  48568517 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccag 48568418  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  48568417 aagattgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 48568367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 18170015 - 18170243
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18170015 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 18170114  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  18170115 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgacattgctgagctcaactgaagatatcatcaaaggtttgattccgc 18170214  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaatgca 239  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  18170215 cagaagatcgtcattaggtaccgaatgca 18170243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38046650 - 38046394
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38046650 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 38046551  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  38046550 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtcgatcaatatgccggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 38046451  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  38046450 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 38046394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12791489 - 12791236
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12791489 cagagacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 12791390  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  12791389 gtgacgagcatttttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgtttttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 12791290  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  12791289 cagaagatcgtcattagttaggataaggtgcattccaactacaacaattgtctt 12791236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47488245 - 47488000
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  47488245 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 47488146  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  47488145 catgttttgggagcacaatattttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatgtcatcaacagcttgatttcgccagaagat 47488046  T
Q  219 cgtgattaggta-gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| ||||| || || || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  47488045 cgtcattagttatggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 47488000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39857120 - 39856869
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39857120 gagacacaagaagggtggaacatgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 39857021  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  39857020 gacgatcatgttttgggagcacgacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcca 39856921  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  39856920 gaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 39856869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 3658475 - 3658716
Alignment:
Q  23 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatg 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||    
T  3658475 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacgtg 3658574  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  3658575 ttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcaagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtc 3658674  T
Q  223 attaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| || |  | |||||||||||||||| |||||    
T  3658675 attaggtagggtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 3658716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 18842431 - 18842652
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18842431 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 18842530  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  18842531 gacgagcatgttttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattgtcaagagtctgatcccgcca 18842630  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggga 234  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  18842631 gaagatcgggattaggtaggga 18842652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39224413 - 39224160
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39224413 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcaacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaatgacgaaaac 39224314  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||   |||||||||    
T  39224313 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaatatatcatcaacaacttgattccgc 39224214  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||    
T  39224213 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattctctt 39224160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 50068475 - 50068222
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  50068475 cagagacgcaaggagggtggaatatgttcggtatgaaggtccaacactcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggatttaaagaacgacaaaaat 50068376  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  50068375 gtgacgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcgtcaacagcttgattccgc 50068276  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  50068275 cagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 50068222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 49396697 - 49396950
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  49396697 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgatttacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 49396796  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||    
T  49396797 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaacaaaagtttgattccgccag 49396896  T
Q  214 aagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49396897 aagatcgtcattaggtatggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 49396950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13635510 - 13635260
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  13635510 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 13635411  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  13635410 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 13635311  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||| ||||||||||||||    
T  13635310 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaaccacaacaattgtctt 13635260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44337535 - 44337313
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  44337535 cagagacacaaggatggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattcacaaacgacgaaaac 44337436  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44337435 gtgacgagcatgttttgggtgcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaatatgattccgc 44337336  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  44337335 cagaagatcgtcattagttaggg 44337313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49926595 - 49926370
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  49926595 cagagacagaagg-gggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtgtcattcacttgtgcggaattaacgaacgacgaaaac 49926497  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  49926496 gtgaggagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49926397  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaatg 237  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  49926396 cagaagatcgtcattaggtacggaatg 49926370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27035534 - 27035281
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27035534 cagagacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaacgctcgacgagggaagggtatcattcacttgggtggagttaaagaatgacgaaaac 27035435  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| |    
T  27035434 gtgacgagtatgttttgggagaacaccatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaacaacttgattccac 27035335  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  27035334 cagaagatcgtcattagttaggataaggtgcattccaactacaacaattgtctt 27035281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 35184963 - 35185217
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  35184963 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 35185062  T
Q  114 aagaacatgtttt-gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  35185063 acgaacatgttttggggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgaaatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 35185162  T
Q  213 gaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35185163 gaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 35185217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 49427377 - 49427630
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  49427377 cagagatacaaggatggtgttacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggaattaacgaacgacgaaaac 49427476  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  49427477 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49427576  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  49427577 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 49427630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 23342634 - 23342887
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23342634 agacacaaggaaggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaacgacgaaaacgtg 23342733  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  23342734 acgagcatgtttttggagcacattatgttcgagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattcctccag 23342833  T
Q  214 aagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23342834 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 23342887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29762436 - 29762184
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29762436 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 29762337  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||    
T  29762336 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatacgggtgacgttgatgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattccgcc 29762237  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| | ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  29762236 agaagatcatcattagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtctt 29762184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21484856 - 21484606
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  21484856 agacacaaggagggtgaaacttgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 21484757  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||||    
T  21484756 acgagcatgtttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcaccag 21484657  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  21484656 aagatcgtcattaggtagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 21484606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 29435963 - 29436185
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29435963 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 29436062  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||  ||    
T  29436063 gtgacgagcatgttttgggagtacagcatgttccagtggatcgatacgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattaagc 29436162  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  29436163 cagaagatcgtcattagttaggg 29436185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27486906 - 27486653
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  27486906 cagagacacaaggagggtagatcaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttaattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 27486807  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  27486806 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 27486707  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    | ||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  27486706 ctgaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 27486653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 44597691 - 44597944
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44597691 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 44597790  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  44597791 gtgatgagtatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgtgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 44597890  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    | ||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  44597891 cggaagatcgtcattagttagggtaaagtgcattccaacttcaacaattgtctt 44597944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 51269792 - 51270045
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  51269792 cagagacacaaggagggtggaacaccttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 51269891  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  51269892 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgggatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 51269991  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  51269992 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtctt 51270045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 45689114 - 45689362
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45689114 agacacaaggagggtggaatatgtttggtt--aacgtccaacgctcgacggggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 45689211  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||     
T  45689212 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatggatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccat 45689311  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  45689312 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 45689362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 17372717 - 17372970
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||     
T  17372717 cagagacgcaaagagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatataatccacttaggtggaattagcgaacgacgaaaat 17372816  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||| |||    
T  17372817 gtgaagaacatgttttgggagcacaccatattccagtggatcgatatacgtgtaacgttgatgagatcaactgaagatatcatcgaaagtttaatttcgc 17372916  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggta-gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17372917 cagaagatcgtcattaggtatggaaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 17372970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 19160307 - 19160560
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19160307 cagagacacgaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgcttgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19160406  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19160407 gtgacgactatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19160506  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  19160507 cagaagattgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 19160560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41875097 - 41874847
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  41875097 agacacaaggagggtggaattagttcggtatcaacgtccaatgctcgaagaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaataacgacgaaaatgtg 41874998  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||   ||||||||||||    
T  41874997 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactaaagatatcattagcaacttgattccgccag 41874898  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||| ||||||||||||||||||    
T  41874897 aagatcgttattagttagggtaaggtgcattcaaactacaacaattgtctt 41874847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 43 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46180465 - 46180243
Alignment:
Q  43 ataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcact-tgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgt 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  46180465 ataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgt 46180366  T
Q  142 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcac 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |  |    
T  46180365 tccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgc 46180266  T
Q  241 cttccaactacaacaattgtctt 263  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  46180265 attccaactacaacaattgtctt 46180243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16532304 - 16532054
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  16532304 gagacacaaggaggatggaatacgttcgatataaacgtacaacgctcgatgaggagagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgt 16532205  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||| || |||||||| | |||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |    
T  16532204 gatgagcatattatgggagcagagcatgctctaatggattgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaatagtctgatttcgcta 16532105  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16532104 gaagatcgtgattaggtatggaatgcatcttccaactacaacaattgtctt 16532054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 48215191 - 48215409
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  48215191 agacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacatg 48215290  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  48215291 acgagcatatttttggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 48215390  T
Q  214 aagatcgtgattaggtagg 232  Q
    ||||| || ||||| ||||    
T  48215391 aagatagtcattagttagg 48215409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 41780683 - 41780939
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41780683 cagagacacaagaagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41780782  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||    
T  41780783 gtgacgaatatattttgggagcacagcatgttccagtagatagatatgcaggtgacgttgctaagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgatttcgc 41780882  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| |||| |||||||| |    ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41780883 cagaagttcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtctt 41780939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 230
Target Start/End: Original strand, 37778109 - 37778288
Alignment:
Q  51 ccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtgga 150  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37778109 ccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaggacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagaacaacatgttccagttga 37778208  T
Q  151 tcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggta 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37778209 tcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 37778288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 49263202 - 49262951
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||    
T  49263202 gagacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacaaaagacgaaaacgt 49263103  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |    
T  49263102 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatctatatgctggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacatcttgattcctcta 49263003  T
Q  213 gaagatcgtgattaggta-gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| ||| | ||||| || || || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  49263002 gaatatcttcattagttatggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 49262951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49599090 - 49598921
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  49599090 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggagttaaagaatgacg-aaac 49598992  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaac 181  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49598991 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaac 49598921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35526391 - 35526189
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||     
T  35526391 gagacacagggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgtcgaaaacga 35526292  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  35526291 gacgaccatgttttgggagcacagaatgttgcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcta 35526192  T
Q  213 gaa 215  Q
    |||    
T  35526191 gaa 35526189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30310039 - 30309795
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30310039 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacggggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 30309940  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  30309939 acgagcatgttttgggagcacaggacgtttcagtggatcgatatgcgggtgac------gagatcaactgaatatatcatcaacagcttgattccgccag 30309846  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||    
T  30309845 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatctt 30309795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 263
Target Start/End: Original strand, 16081294 - 16081527
Alignment:
Q  30 gaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttggg 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||    
T  16081294 gaatacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggaggatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacatgaggagcatgtttttgg 16081393  T
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 229  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||  | || ||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  16081394 agcacaacatgttctagttgatcgatatgcgtgtaacgttgctgcaatcaactgagaatatactgaagagtttaattctgccggaagatcgtgattaggt 16081493  T
Q  230 agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16081494 agggaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 16081527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40533376 - 40533249
Alignment:
Q  137 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt----agg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||    |      
T  40533376 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgccgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaat 40533277  T
Q  233 gaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40533276 gaatgcaccttccagctacaacaattgt 40533249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 13148365 - 13148450
Alignment:
Q  67 ggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13148365 ggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgagagcacaacatgttccagtggatc 13148450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14772592 - 14772499
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    ||||| |||||||| ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14772592 gttgcagagatcaattgaagatgttctcaacagtttgattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaagaattgt 14772499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16098146 - 16098078
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  16098146 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 16098078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19262517 - 19262409
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||    
T  19262517 ttttggcagcacatcatgttcccgaggatcaatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgcctgaagattatg 19262418  T
Q  223 attaggtag 231  Q
    |||||||||    
T  19262417 attaggtag 19262409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29707621 - 29707547
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgt 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  29707621 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgt 29707547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14772755 - 14772662
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacga 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||| | || | || ||||||||||||||    
T  14772755 gagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacaacgggagaatatcgttcagtcggctagaattaaagaacgacga 14772662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 15471510 - 15471721
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || | |||| |  |  |||||||| |||| ||||  | ||    
T  15471510 gagacacaaggagtgtggaatacgtttggtatgaacatccaacgttcgacgaggggagaataacgttcagtcagccggagttaacgaacaacgacgatgt 15471609  T
Q  113 gaagaacatg---------ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatg 203  Q
    || |||||||         |||||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||   || ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||    
T  15471610 gaggaacatgttcttgattttttgtcagcacaacatgttcccgtggattgatgtgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagatattctcaagagtttg 15471709  T
Q  204 attccgccagaa 215  Q
    |||  |||||||    
T  15471710 attatgccagaa 15471721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 48707132 - 48707090
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaac 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48707132 gagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaac 48707090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 27034784 - 27034816
Alignment:
Q  231 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27034784 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 27034816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 46181768 - 46181731
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaac 48  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46181768 cagagacgcaaggaaggtggaatacgttcggtataaac 46181731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3659349 - 3659321
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3659349 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 3659321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Original strand, 39223614 - 39223642
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39223614 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 39223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Original strand, 46924689 - 46924717
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46924689 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 46924717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 33404012 - 33404261
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33404012 agacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaatagtatcattcagttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33404111  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  33404112 acgagcatgttttgggagcacaagatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatgtcgccag 33404211  T
Q  214 aagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33404212 aagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 33404261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 35491629 - 35491885
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35491629 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 35491728  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  35491729 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 35491828  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35491829 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 35491885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10364849 - 10364594
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10364849 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 10364750  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  10364749 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 10364650  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg---gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10364649 cagaagatcgtcattacgtaggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 10364594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19471846 - 19471590
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19471846 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19471747  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19471746 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19471647  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19471646 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 19471590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12968514 - 12968261
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12968514 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 12968415  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |    
T  12968414 gttacgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctc 12968315  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaa---tgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |   |||||  |||||||||||||||||||||    
T  12968314 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcac--tccaactacaacaattgtctt 12968261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Original strand, 42120014 - 42120259
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  42120014 caaggagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgag 42120113  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  42120114 catgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagat 42120213  T
Q  219 cgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||| ||||||||    
T  42120214 cgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacgattgtctt 42120259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10360406 - 10360158
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||     
T  10360406 acacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgac 10360307  T
Q  116 gaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||    
T  10360306 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactgaagatttcatcaacagcttgattccgccagaa 10360207  T
Q  216 gatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  10360206 gatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 10360158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2919577 - 2919321
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2919577 cagagacacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2919478  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  2919477 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaaaagtttgattccgc 2919378  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || |||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2919377 caaaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 2919321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27130719 - 27130465
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27130719 gagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 27130620  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  27130619 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 27130520  T
Q  213 gaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| || |||||||    |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27130519 gaagatagtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctaaaacaattgtctt 27130465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41499306 - 41499050
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  41499306 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacctgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41499207  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  41499206 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41499107  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  41499106 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 41499050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Original strand, 29906584 - 29906829
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29906584 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgtggggagagtatcattcacttgggtgaagttaaagaacgacgaaaacgtgacaaa 29906683  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||| ||||||||||    
T  29906684 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattctgccagaagat 29906783  T
Q  219 cgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |   ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||| ||||||    
T  29906784 cagcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaactgtctt 29906829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37312705 - 37312488
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37312705 gagacacaaggaggatggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagattatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 37312606  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  37312605 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcca 37312506  T
Q  213 gaagatcgtgattaggta 230  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  37312505 gaagatcgtcattaggta 37312488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34521896 - 34521640
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34521896 cagagacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtcaaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34521797  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||      
T  34521796 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccct 34521697  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || |||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34521696 cataagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 34521640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 22493265 - 22493487
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22493265 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacggcgaaaac 22493364  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||    
T  22493365 gtgacgagcatgttttgggagtacagaatgttccagtggattgatatgcgggtaacgttcctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgc 22493464  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  22493465 cagaagatcgtcattagttaggg 22493487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 3941731 - 3941984
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3941731 cagagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3941830  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  3941831 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 3941930  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  3941931 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtctt 3941984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 6901962 - 6902183
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6901962 gagacacaaggagggttgaacacattcggcataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 6902061  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6902062 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgaatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcga 6902161  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggga 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  6902162 gaagatcatgattaggtaggga 6902183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 6976832 - 6977086
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  6976832 cagagacacaaggagggtggaacatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagg--agtgtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaac 6976929  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  6976930 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6977029  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
     |||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6977030 gagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 6977086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 29111155 - 29111405
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29111155 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 29111254  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | | ||||||||||    
T  29111255 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaccgaagatatcatcaaaaatttaattccgccag 29111354  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || | ||| | ||||||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||    
T  29111355 aataacgtcactaggtagggtaaagtgcattccaactacaacaattatctt 29111405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42241311 - 42241058
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42241311 cagagacacaaggagggtgaaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacaacgaaaac 42241212  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| ||    
T  42241211 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaccaaaagtttgattctgc 42241112  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  42241111 cataagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 42241058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 5420465 - 5420716
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  5420465 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgt 5420564  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||     
T  5420565 gacgaacatgttttgtgagcacagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgatatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccacct 5420664  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  5420665 gaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 5420716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 20148114 - 20148335
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  20148114 gagacacaaggagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcatttagttggggggaattaaagaacgacgaaaacat 20148213  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20148214 gactagcatgttttaggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtaacgttgctgagattagctgaagatattttcaacagtctgattccgcca 20148313  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20148314 gaagatcgtgattaggtaggga 20148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 32734641 - 32734857
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  32734641 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaactacgaaaat 32734740  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  32734741 gtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgatatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 32734840  T
Q  211 cagaagatcgtgattag 227  Q
    || ||||| || |||||    
T  32734841 caaaagatagtcattag 32734857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3937276 - 3937026
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3937276 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3937177  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  3937176 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 3937077  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||    
T  3937076 cacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgt 3937026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 43982850 - 43983100
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43982850 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43982949  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  43982950 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 43983049  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||    
T  43983050 cacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgt 43983100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17796314 - 17796066
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17796314 gagacacagggagggtggaacacgttaagtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 17796215  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||    
T  17796214 gaagagcatgttttgggagc---acatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttggttccgtca 17796118  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  17796117 gaagctcgtcattaggtagggaaatgtgtcttccaactacaacaattgtctt 17796066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Original strand, 17424784 - 17425036
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17424784 agagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 17424883  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  17424884 tgacgaccatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 17424983  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||| |||||||    
T  17424984 acaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtctt 17425036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 29067726 - 29067976
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||    
T  29067726 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtgcaattaacgaatgacgaaaatgtg 29067825  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  29067826 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 29067925  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||| ||||||||||||||||    
T  29067926 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccagctacaacaattgtctt 29067976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 39393885 - 39394106
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  39393885 cagagacacaaggagggtgtaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaatcaacaaacgacgaaaac 39393984  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||     
T  39393985 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgt 39394084  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg 232  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  39394085 cagaagatcgtcattagttagg 39394106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 16581816 - 16582040
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||     
T  16581816 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaat 16581915  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatc--gatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattcc 208  Q
    |||  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||    
T  16581916 gtgtcgagcatgttttgggagcacatcatgttccattggatcgagatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattcc 16582015  T
Q  209 gccagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    || |||||||| | ||||| |||||    
T  16582016 gctagaagatcttcattagttaggg 16582040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 22001828 - 22002044
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  22001828 cagagacacaaggatggtagaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggaggaattaacgaacgacgaaaac 22001927  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  22001928 gtgacgaccatgttttgggagctcagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgc 22002027  T
Q  211 cagaagatcgtgattag 227  Q
    |||||||| || |||||    
T  22002028 cagaagattgtcattag 22002044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39800051 - 39799902
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  39800051 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 39799952  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggt 163  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39799951 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggt 39799902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 159
Target Start/End: Original strand, 18392032 - 18392179
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaatacgtt----cggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392032 acacaaggagggtggaatacgttcgttcggtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcatttacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 18392131  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgc 159  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18392132 tgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgc 18392179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40677527 - 40677361
Alignment:
Q  71 agtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttg 170  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40677527 agtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacgacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttg 40677428  T
Q  171 ctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40677427 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtacggaatg 40677361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27650527 - 27650391
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27650527 ttttggcaacacaacatgttaccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 27650428  T
Q  223 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27650427 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattg 27650391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31991994 - 31991896
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31991994 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 31991896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 34638960 - 34639093
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34638960 cagagacacaaggagg-tggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 34639058  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttcca 145  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34639059 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttcca 34639093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 162 - 263
Target Start/End: Original strand, 16253600 - 16253701
Alignment:
Q  162 gtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16253600 gtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcgacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagggaatacaccttccaactacaacaattgtc 16253699  T
Q  262 tt 263  Q
    ||    
T  16253700 tt 16253701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15891705 - 15891609
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15891705 acgttgcggagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgctagaatatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 15891609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18036220 - 18036122
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18036220 acgttgcagagatcaactaaaaatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtaggaaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 18036122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 16253474 - 16253594
Alignment:
Q  15 gacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || | |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16253474 gacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgcccaacacttaacgatgggagaatatcattaagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtga 16253573  T
Q  115 agaacatgttttgggagcaca 135  Q
      | |||||||||||||||||    
T  16253574 gcagcatgttttgggagcaca 16253594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 259
Target Start/End: Original strand, 43491600 - 43491696
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||    
T  43491600 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaaagaatgcaccttccaactacaacaattg 43491696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 31770360 - 31770427
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattca 81  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31770360 agacacaaggaggatgtaatatgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagagtatcattca 31770427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 40678827 - 40678763
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  40678827 cagagacacaaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagagtat 40678763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 263
Target Start/End: Original strand, 20148334 - 20148381
Alignment:
Q  216 gatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20148334 gatcgtgattaggtagggaatgctccttccaactacaacaattgtctt 20148381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 263
Target Start/End: Original strand, 18393486 - 18393596
Alignment:
Q  154 atatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactaca 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||| |||||  |||| || |  | |||||||||||    
T  18393486 atatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcataaacaacttgattctgccagaagatcgtcattagtgagggtaaggtgcattccaactaca 18393585  T
Q  253 acaattgtctt 263  Q
    | |||||||||    
T  18393586 aaaattgtctt 18393596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Original strand, 6902187 - 6902228
Alignment:
Q  221 tgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtct 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902187 tgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtct 6902228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11679308 - 11679084
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| | |||||| || | || | |  | | || ||||||||||||||  ||||    
T  11679308 gagacacaaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgatgggagaataacgtttaatcagctagaattaaagaacgacgacgacgt 11679209  T
Q  113 gaagaacatgtt----------ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtat 202  Q
    || |||||||||          || | | |||| |||||||| |||||||||||||    | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11679208 gatgaacatgttctcgattttttttgcaccacatcatgttcccgtggatcgatatgtttctcacgttacttagatcaactgaagatattctcaacagttt 11679109  T
Q  203 gattccgccagaagatcgtgattag 227  Q
    ||||| |||| |||||  |||||||    
T  11679108 gattctgccataagattatgattag 11679084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 11718741 - 11718945
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || | ||| | |||||| || | || | | || | || ||||||||||||||  ||||    
T  11718741 gagacacaaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccagcgttggacgatgggagaataacgtttaatcggctagaattaaagaacgacgacgacgt 11718840  T
Q  113 gaagaacatgtt----------ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtat 202  Q
    || |||||||||          || | | |||| |||||||| |||||||||||||    | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11718841 gatgaacatgttctcgattttttttgcaccacatcatgttcccgtggatcgatatgtttctcacgttactgagatcaactgaagatattctcaacagttt 11718940  T
Q  203 gattc 207  Q
    |||||    
T  11718941 gattc 11718945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 26617697 - 26617652
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacg 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26617697 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaacg 26617652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 172
Target Start/End: Original strand, 17112399 - 17112451
Alignment:
Q  120 atgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgct 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17112399 atgttttgggagcacaatatgttctaatggattgatatgcgggtgacgttgct 17112451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26617568 - 26617485
Alignment:
Q  132 cacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 215  Q
    |||||||||| || |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||    
T  26617568 cacaacatgtccccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagatattcttaagagtttgattccgctagaa 26617485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 231
Target Start/End: Original strand, 18878652 - 18878718
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtag 231  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  18878652 acgttgctgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattccgacagaagattatcattaggtag 18878718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32736881 - 32736853
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32736881 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 32736853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42120807 - 42120779
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42120807 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 42120779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 14115033 - 14115283
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14115033 gagacacaaggagggtgcaaaacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaagtaaagaacgacgaaaacgt 14115132  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  14115133 gacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattctgcca 14115232  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14115233 gaagatagtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 14115283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 801160 - 801412
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  801160 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaaagctcgacgaggggag-gtgtcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaac 801258  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  801259 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 801358  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  801359 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 801412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 13402527 - 13402783
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  13402527 cagagacacaaggagggtggaacacgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaac 13402626  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  13402627 gtgacgagcatgttttgggagcccaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 13402726  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13402727 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 13402783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32027843 - 32027587
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  32027843 cagagacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 32027744  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  32027743 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 32027644  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32027643 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 32027587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35058932 - 35058697
Alignment:
Q  29 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgg 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  35058932 ggaatacgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgg 35058833  T
Q  129 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| | |||||||||| |||||     
T  35058832 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacatcttaattccacaagaagatcgtcattagt 35058733  T
Q  229 taggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  35058732 tagggtaaggtacattccaactacaacaattgtctt 35058697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32037902 - 32037677
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  32037902 cagagacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 32037803  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  32037802 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 32037703  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaat 236  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||    
T  32037702 cagaagatcgtcattaggtaaggaat 32037677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 29066547 - 29066769
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29066547 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29066646  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  29066647 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29066746  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||    
T  29066747 cagtagatcgtcattagttaggg 29066769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 29075560 - 29075782
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29075560 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29075659  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  29075660 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29075759  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||    
T  29075760 cagcagatcgtcattagttaggg 29075782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 29108134 - 29108356
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29108134 cagagacacaaggagggtggaacacctgtggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 29108233  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  29108234 gtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgc 29108333  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  29108334 cagaagatcgtcattagttaggg 29108356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34803111 - 34802885
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34803111 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34803012  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  34803011 gtgatgagcatgttcagggagcacaacatgttccagtaaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgc 34802912  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaatg 237  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||    
T  34802911 caaaagatcgtcattaggtaaggaatg 34802885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 11692446 - 11692667
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11692446 agagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacaaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 11692545  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  11692546 tgacgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 11692645  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    | |||||||| ||||| |||||    
T  11692646 acaagatcgtcattagttaggg 11692667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 29110531 - 29110754
Alignment:
Q  11 cagagacacaagga-gggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29110531 cagagacacaaggatgggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaa 29110630  T
Q  110 cgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccg 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  29110631 cgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccg 29110730  T
Q  210 ccagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||    
T  29110731 ccagcagatcgtcattagttaggg 29110754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 27640174 - 27640427
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27640174 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27640273  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  27640274 gtgacgaccatgttttggaagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 27640373  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||| |||||||    
T  27640374 cacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtctt 27640427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 12396770 - 12396989
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12396770 cagagacataaggagggtggagcacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaac 12396869  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
     ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  12396870 atgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatctactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 12396969  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggta 230  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  12396970 caaaagatcgtcattaggta 12396989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 6205478 - 6205700
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6205478 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6205577  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  6205578 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6205677  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  6205678 cacaagatcgtcattagttaggg 6205700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 22305793 - 22305975
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  22305793 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 22305892  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 196  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  22305893 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaa 22305975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30257729 - 30257538
Alignment:
Q  76 cattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgag 175  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30257729 cattcagttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 30257630  T
Q  176 atcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30257629 atcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 30257538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17465415 - 17465298
Alignment:
Q  146 gtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttcc 245  Q
    |||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17465415 gtggatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagatcgtgattaggtagagaatacaccttcc 17465316  T
Q  246 aactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17465315 aactacaacaattgtctt 17465298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Original strand, 34134801 - 34134897
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34134801 gttgcagagatcaactgaagaaattctcaacagtttgattccgctaaaagatcgtgattaggtagggaatgcacctttcaactacaacaattgtctt 34134897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 261
Target Start/End: Original strand, 20192466 - 20192562
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20192466 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 20192562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20242188 - 20242092
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20242188 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 20242092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22136172 - 22136076
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136172 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 22136076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22143525 - 22143429
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143525 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtgtggttctggcagaagaatgtgattaggaagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 22143429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14482874 - 14482785
Alignment:
Q  174 agatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14482874 agatcaactagacatattgtcaacagtttgattccgctagaagataatgattaggtagggaatgcaccttcccactacaacaattgtctt 14482785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 28051354 - 28051614
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| | ||| | |||||| || | |||| | || | || |||||||||||||| |||||    
T  28051354 gagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgacgggagaataacgttcagtcggctagaattaaagaacgacgacaacgt 28051453  T
Q  113 gaagaacatgtt---------ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatta-tcaacagtat 202  Q
     | || ||||||         |||| |||||| |||| | | |  ||||||||||   || ||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||| |    
T  28051454 caggagcatgttctcgattttttggcagcacagcatggttctggtgatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactggagatatttctcaatagttt 28051553  T
Q  203 gattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  28051554 gattccgctagaagatcgtgattacgtagagaatgcacctttcaactacaaccattttctt 28051614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3765867 - 3765749
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtat-gattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttc 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||| |||||||||| | ||||| ||||| || |  | |||    
T  3765867 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaaattccaccagaagatcatcattagttagggtaaggtgcattc 3765768  T
Q  245 caactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  3765767 caactgcaacaattgtctt 3765749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24021168 - 24021059
Alignment:
Q  155 tatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaa 253  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||    
T  24021168 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaa 24021069  T
Q  254 caattgtctt 263  Q
    ||||||||||    
T  24021068 caattgtctt 24021059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 263
Target Start/End: Original strand, 2192535 - 2192644
Alignment:
Q  155 tatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaa 253  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||    
T  2192535 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaattttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaa 2192634  T
Q  254 caattgtctt 263  Q
    ||||||||||    
T  2192635 caattgtctt 2192644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 200
Target Start/End: Original strand, 2402306 - 2402383
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  2402306 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagataatctcaacagt 2402383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35021284 - 35021196
Alignment:
Q  179 aactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  35021284 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaagtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 35021196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14123481 - 14123449
Alignment:
Q  231 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14123481 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 14123449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18744073 - 18743985
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||   || | ||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||    
T  18744073 agcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcatgttgctgagatcgtctgaagatattctcgacagtttgattcctccataagat 18743985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18744198 - 18744144
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggg 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  18744198 gagacacaaggagggtggaatacatttggtacgaacgtccaaagttcgacaaggg 18744144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34132168 - 34132140
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34132168 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 34132140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43889716 - 43889460
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43889716 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43889617  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  43889616 gtgacgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatataatcaaaagtttgattccgc 43889517  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||    |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43889516 cagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 43889460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 3393296 - 3393543
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3393296 gagacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgtccaacgctcgaggatgggagattatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 3393395  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3393396 gaggagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 3393495  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3393496 gaagatcatgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacatttgt 3393543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 17211258 - 17211509
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| || || |||| ||||||  |||||||    
T  17211258 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagggaagaatatcattcatttgagtcgaattaacgaacgataaaaacgt 17211357  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17211358 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacagtctgattccgcca 17211457  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17211458 gaagatcgtgattaggtagggaaatgcatcttccaactacaacaattgtctt 17211509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 18412587 - 18412837
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  18412587 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttcggtggaattaatgaacgacgataacgt 18412686  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||    
T  18412687 gaggagcatgttttgggagcacaccatgtttcagtggatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacaatttgattctgcca 18412786  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18412787 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 18412837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 22436901 - 22437157
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  22436901 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaac 22437000  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  22437001 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 22437100  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    | ||||||||| |||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  22437101 cggaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 22437157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31824838 - 31824593
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  31824838 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 31824739  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  31824738 catgttttgggagcacaacatgttctagtggatcaatatgcgggtaacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagat 31824639  T
Q  219 cgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  31824638 cgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 31824593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33163761 - 33163508
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33163761 cagagacgcaatgagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtaacattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaat 33163662  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  33163661 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 33163562  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  33163561 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 33163508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 51428409 - 51428156
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  51428409 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgtgtggagttaacgaacgacgaaaac 51428310  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  51428309 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 51428210  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
     |||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  51428209 aagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 51428156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14330910 - 14330658
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14330910 agagacacaaggagggtggaacactttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacg 14330811  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  14330810 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 14330711  T
Q  212 agaagatcgtgattaggt-agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  14330710 agaagatcgtcattagttaaggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 14330658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 25762590 - 25762841
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25762590 gagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 25762689  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  25762690 gacgaacatgttttgggagcacaacatgttctggtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcca 25762789  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  25762790 gaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 25762841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 49817860 - 49817605
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  49817860 agagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtaacattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 49817761  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    | | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49817760 ttacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcc 49817661  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||| |||||||| |    ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49817660 agaagatcgtcattaggtacggaatgaatgtacctttcaactacaacaattgtctt 49817605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 242633 - 242417
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  242633 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagcatcattcacttaggtggagttaaagaacgatgaaaac 242534  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  242533 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 242434  T
Q  211 cagaagatcgtgattag 227  Q
    ||||||||||| |||||    
T  242433 cagaagatcgtcattag 242417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 51027984 - 51027733
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51027984 cagagacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 51027885  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |    
T  51027884 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccac 51027785  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaa---tgcaccttccaactacaacaattgtc 261  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |   |||||  |||||||||||||||||||    
T  51027784 cataagatcgtcattagttagggtaaggtgcac--tccaactacaacaattgtc 51027733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34153503 - 34153247
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34153503 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34153404  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  34153403 gtgacgatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcggatgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgc 34153304  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||| ||| |    |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  34153303 cagaagatcgtcattatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtctt 34153247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 10312264 - 10312514
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| | |||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10312264 gagacacaaggagtgtggaatatgttcggtataaacatacaacactcgacgatgggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 10312363  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||      
T  10312364 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttaagatcaactgaagatattatcaacaatctaattccgctg 10312463  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10312464 gaagatcgtgattaggtagggaattcaccttccaactacaacaattgtctt 10312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 1226150 - 1226402
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  1226150 cagagacaca-ggagggtggaatacgtttgctataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgtgtggaattaaagaacgacgaaaat 1226248  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  1226249 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 1226348  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  1226349 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 1226402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 11288288 - 11288536
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11288288 agacacaaggagggtggaatacgttccgtataaacgtccaacggtcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 11288387  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |  ||    
T  11288388 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatc-acaatttgattctgttag 11288486  T
Q  214 aagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11288487 aagatcgtgattaagtagggaatgcaccttccaactaccataattgtctt 11288536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21017394 - 21017141
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21017394 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 21017295  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  21017294 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 21017195  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  21017194 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 21017141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40353990 - 40353737
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40353990 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 40353891  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  40353890 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 40353791  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  40353790 cagaagattgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 40353737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26591902 - 26591678
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  26591902 cagagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 26591803  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  26591802 gtgacgaacatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 26591703  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaa 235  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  26591702 cagaagatcgtcattaggtacggaa 26591678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 24606744 - 24606995
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  24606744 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaatgtccaacgctcgacaagcggagagtattattcagttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgt 24606843  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24606844 gacgagcatgtattgggagcacatcatgttcccgtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgcca 24606943  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24606944 gaagatcgtgattaggtaggtaaatgtacattccaactacaacaattgtctt 24606995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 957670 - 957416
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  957670 gagacataaggagggtggaatatgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 957571  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  957570 gacgagcatgttttaggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 957471  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  957470 gaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 957416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4785639 - 4785420
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||    
T  4785639 cagagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtcaaacccttgacgaggggagagcatcattcactttggtggaattaacgaacgacaaaaac 4785540  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4785539 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggggaacgttgctgatatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgc 4785440  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggta 230  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  4785439 cacaagatcgtcattaggta 4785420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 49792153 - 49791897
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  49792153 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtattattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaac 49792054  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  49792053 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 49791954  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || |||||| | |||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  49791953 caaaagatcatcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 49791897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Original strand, 2773000 - 2773255
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2773000 agagacacaaggatggtggaacacgttcgttataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 2773099  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||    
T  2773100 tgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttattgagatcaactgaagataccatcaacaacttgattccgcc 2773199  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||| || ||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  2773200 agaagatcgtcatcaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 2773255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34530013 - 34529787
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||     
T  34530013 cagagacacaagaagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaat 34529914  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  34529913 gtgacgagcattttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 34529814  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaatg 237  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34529813 cagaagatcgtcattaggtacggaatg 34529787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 49063969 - 49064222
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49063969 cagagacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtgtcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 49064068  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  49064069 gtgacgagcatgtttttggagcacaacatgtttccgtggatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49064168  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  49064169 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 49064222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20779081 - 20778833
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaa 115  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  20779081 acacaagaagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 20778982  T
Q  116 gaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20778981 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtttcgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaa 20778882  T
Q  216 gatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| ||||||||||| || |  | ||||||| ||||||||||||||    
T  20778881 gatcgtcattaggtagggtaaggtgcattccaaccacaacaattgtctt 20778833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 263
Target Start/End: Original strand, 55796738 - 55796986
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaa 115  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  55796738 acacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 55796837  T
Q  116 gaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 215  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||    
T  55796838 gaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaa 55796937  T
Q  216 gatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  55796938 gatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 55796986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47657572 - 47657316
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  47657572 cagagacacaaggtgggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgaccaaaac 47657473  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  47657472 gtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 47657373  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||    |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47657372 cagaagatcgtcattaggtatcgaatgaatgcacattccagctacaacaattgtctt 47657316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32938116 - 32937866
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32938116 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 32938017  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||    
T  32938016 acgagcatgtttcgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 32937917  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  32937916 aagatcgtcattagatagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 32937866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46816740 - 46816489
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46816740 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcagtatacacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaac 46816641  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  46816640 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgttgagatca--tgaagatatcatcaatagcttgattccgc 46816543  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  46816542 cagaagatcgtcattagttagggcaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 46816489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6282537 - 6282284
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  6282537 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacaaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 6282438  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  6282437 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 6282338  T
Q  214 aagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| || |    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  6282337 aagatcgtcattagttacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 6282284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 13850739 - 13850991
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| |||| || | ||||  ||||||||  ||    
T  13850739 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgtttgacgatgggagaatatcattcagttggatgaaattaacaaacgacgacgac 13850838  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  13850839 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtatgtaacattgctgagatcaactaaagatattctcaacagtttgattccgc 13850938  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13850939 cagaagaccgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattatctt 13850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 1042744 - 1042992
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1042744 agacacaaggagggtggaacgcctt--gtataaacgtccaacgctagacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 1042841  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  1042842 acgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatataatcaacaacttgattccgccag 1042941  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || | || |||||||| |||||||||||||    
T  1042942 aagatcgtcattagttagggtaaggtacattccaactgcaacaattgtctt 1042992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 21169441 - 21169697
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| ||| ||    
T  21169441 cagagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtcgaattaacggacgatgaatac 21169540  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  21169541 gcgacgagcatgttttgggagcacagcatgtaccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 21169640  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21169641 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 21169697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Original strand, 13866253 - 13866503
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||| | |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||  ||    
T  13866253 cagagacacaaggagggtggaatgcgtttggtataaacgtccaacatttgacgatgggagaatatcattcagttggatggaattaacaaacgacgacgac 13866352  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13866353 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggattgatatgtatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgc 13866452  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13866453 cagaagaccgtgattaggtagggaatgcacctttcaactacaacaattgtc 13866503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41794779 - 41794557
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41794779 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41794680  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  41794679 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41794580  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  41794579 cacaagatcgtcattagttaggg 41794557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 37866396 - 37866619
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  37866396 cagagacacaagaagggtggaacacattcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaac 37866495  T
Q  111 gtgaagaacatgtttt-gggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccg 209  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||    
T  37866496 gtgatgagcatgttttcgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatatcttgattccg 37866595  T
Q  210 ccagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    | |||||||||| ||||| |||||    
T  37866596 ctagaagatcgtcattagttaggg 37866619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44560397 - 44560141
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  44560397 cagagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaac 44560298  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    ||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | |    
T  44560297 gtgacaagcatgttttgggagcaaagcatgttccagtgtattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttctc 44560198  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |  |||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44560197 cttaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 44560141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6177532 - 6177310
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6177532 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 6177433  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  6177432 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 6177333  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  6177332 cacaagatcgtcattagttaggg 6177310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20901882 - 20901632
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20901882 agacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagtggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 20901783  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| || |    
T  20901782 acgagcatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacactgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacctg 20901683  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  20901682 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 20901632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 56138900 - 56139122
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  56138900 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 56138999  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  56139000 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 56139099  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  56139100 cacaagatcgtcattagttaggg 56139122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 31324167 - 31324416
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||||    
T  31324167 agacacaatgaggatggaataggttcagtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatattattcagttgggtggaattaacgaacgacaatgacgtg 31324266  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||    
T  31324267 acgagcatgtttttggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaaagttgctgagatcaactgaagacattctcaacagtttgattccgctag 31324366  T
Q  214 aagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31324367 aagatcatgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 31324416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 263
Target Start/End: Original strand, 21711549 - 21711773
Alignment:
Q  40 ggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21711549 ggtataaacatctaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 21711648  T
Q  140 gttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |     
T  21711649 gttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggt 21711748  T
Q  239 accttccaactacaacaattgtctt 263  Q
     | ||||||||||||||||| ||||    
T  21711749 gcattccaactacaacaattctctt 21711773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36776733 - 36776480
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  36776733 agacacaaggagggtggaacacgttaggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtattattcacttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtg 36776634  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||       
T  36776633 acgagcatggtttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctga 36776534  T
Q  214 aagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36776533 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 36776480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 42886255 - 42886509
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagta---tcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  42886255 gagacacaaggagggtggaacacgttcgttataaacttccaacgctcgacgaggggagagtactatcattcacttgggtggaattaaccaacgacgaaaa 42886354  T
Q  110 cgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccg 209  Q
    | ||| || |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42886355 catgacgagcatgctttgagagcacaacattttctagtggatcgatacgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccg 42886454  T
Q  210 ccagaagatcgtgattaggtaggg----aatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    |||||||||| | ||||||||  |    |||| |||||||| |||||||||||||    
T  42886455 ccagaagatcatcattaggtaccgatttaatgtaccttccagctacaacaattgt 42886509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 49094735 - 49094957
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  49094735 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 49094834  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  49094835 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcgtcaaaagtttgattccgc 49094934  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  49094935 cacaagatcgtcattagttaggg 49094957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 28082228 - 28082481
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28082228 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28082327  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
     ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  28082328 atgacgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtggatcaatatgcaggtgaagttacttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 28082427  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  28082428 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 28082481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 49423972 - 49423722
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  49423972 agacacaaggagggtggaacatgttcggtataaatgtccagcgctcgacgaggggagattatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 49423873  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||     
T  49423872 acgagcatgttctgggagcacggcatgttcaagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagaaatcatcaaaagtttgattctgccat 49423773  T
Q  214 aagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    |||||||| |||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  49423772 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 49423722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 263
Target Start/End: Original strand, 27759374 - 27759570
Alignment:
Q  68 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27759374 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 27759473  T
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  | || |||||||||||||||||||    
T  27759474 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcatttcaactacaacaattgtctt 27759570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Original strand, 45939518 - 45939737
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||    
T  45939518 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagaggagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgataatgtg 45939617  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||  |||     
T  45939618 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcttccat 45939717  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  45939718 aagatcgtcattagttaggg 45939737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 39588922 - 39589172
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||    
T  39588922 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 39589021  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||    
T  39589022 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctag 39589121  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| | ||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  39589122 aagatcgtcattagttggggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtctt 39589172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 9489671 - 9489921
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  9489671 gagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgt 9489770  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  9489771 gacgagcatgtttt-ggagcacagcatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttattgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcca 9489869  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  9489870 gaagatcgtcattagttagggtaaagtgcattccaactgcaacaattgtctt 9489921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 49817283 - 49817162
Alignment:
Q  142 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcacc 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49817283 tccagtggatcgatatgcgtgtaacgttgatgagatcaaatgaagatattatcaacagtctgattctgccaaaagatcgtgattaggtagggaatgcacc 49817184  T
Q  242 ttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  49817183 ttccaactacaataattgtctt 49817162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Original strand, 17292106 - 17292201
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17292106 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattatgtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 17292201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23124630 - 23124490
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||||||   | |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||    
T  23124630 ttttggtagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcttaaagatattctcaacaatttgatttcgccagaagattgtg 23124531  T
Q  223 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23124530 attaggtagggaatgcacctttcaactacaacaattgtctt 23124490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21412740 - 21412647
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||||| ||||||| | |||| |||| |||| |||||||||    
T  21412740 gagacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaatgttcaacgaggggagaatatcatttagttggatggaattaacgaacgacga 21412647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20759240 - 20759132
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||   || |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||    
T  20759240 ttttggcagcataacatgttcgcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgatatcgcctgaagatattctcaacaatttgattccaccagaagattatg 20759141  T
Q  223 attaggtag 231  Q
    |||||||||    
T  20759140 attaggtag 20759132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20765631 - 20765523
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||   || |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||    
T  20765631 ttttggcagcataacatgttcgcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgatatcgcctgaagatattctcaacaatttgattccaccagaagattatg 20765532  T
Q  223 attaggtag 231  Q
    |||||||||    
T  20765531 attaggtag 20765523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1226926 - 1226898
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226926 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 1226898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1642800 - 1642550
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  1642800 gagacacaaggagggtggaatacgtttgatataaacgttcaacactcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgt 1642701  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1642700 gaggagcatgttttgggagcacaacatgttcaagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgcca 1642601  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1642600 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 1642550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 18237556 - 18237809
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18237556 cagagacgcaaggatggtggaatacgttcggtataaacgtctaacgctcgacaaggggagaggatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 18237655  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
     ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18237656 atgacgagcatattttgggagcacatcatgttccagtggatcggtatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtttgattccgc 18237755  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  18237756 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 18237809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 48270640 - 48270896
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  48270640 cagagacaaaaggagggtggaacacgttcggtatagacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaac 48270739  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  48270740 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 48270839  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||  ||||||| |    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48270840 cagaagatcgtcgttaggtacggaatgaatgcacattccaactacaacaattgtctt 48270896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Original strand, 41048776 - 41049031
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41048776 agagacagaaggaggatggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 41048875  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  41048876 cgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 41048975  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41048976 agaagatcgtcattaggtacgaaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 41049031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15338120 - 15337864
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  15338120 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 15338021  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15338020 gtgatgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattataaacagtctgattccgc 15337921  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15337920 cagaagatcgtcattaggtatggaatgaatgcaccttctaactaaaacaattgtctt 15337864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21614973 - 21614722
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  21614973 gagacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagggaagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgc 21614874  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  21614873 gacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaattttgattccgcca 21614774  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21614773 gaagttcgtgattaggtagggaaatgcacctttcaactacaacaattgtctt 21614722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 41217609 - 41217859
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41217609 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaaaattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaaagtg 41217708  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||    
T  41217709 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccag 41217808  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||| ||||||||||    
T  41217809 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacagcaattgtctt 41217859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43351314 - 43351059
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43351314 cagagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43351215  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |    
T  43351214 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatg-gggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaatgtctgattccac 43351116  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43351115 cagaagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 43351059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46862409 - 46862153
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  46862409 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaac 46862310  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  46862309 gtgacgagcttgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagattaactgaagatatgatcaaaagtttgattccgc 46862210  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| || ||||| |    ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46862209 cagaagatcgtcataaggtacggaatgaatgcaccttccagatacaacaattgtctt 46862153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 47268891 - 47269105
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47268891 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcg-tataaacgtccagcgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 47268989  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | |||||||||    
T  47268990 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagattaactaaaaatatcatcaacaatttgattccgc 47269089  T
Q  211 cagaagatcgtgatta 226  Q
    || |||||||| ||||    
T  47269090 caaaagatcgtcatta 47269105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20378918 - 20378665
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20378918 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgcacaacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 20378819  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||    
T  20378818 gtgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggacagatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatataattaacaacttgattccgc 20378719  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| | ||||| ||| | || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  20378718 cagaagatcatcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 20378665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36394036 - 36393783
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36394036 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagaatatcattcacttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 36393937  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  36393936 acgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 36393837  T
Q  214 aagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| | |||||||    |  |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  36393836 aagatcttcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacgacaattgtctt 36393783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21187514 - 21187295
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||    
T  21187514 cagagacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgattgacgaaaac 21187415  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||     
T  21187414 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgt 21187315  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggta 230  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  21187314 cagaagatcgtcattaggta 21187295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48315395 - 48315139
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48315395 cagagatagaaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcaacgagaggagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 48315296  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  48315295 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 48315196  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || |||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48315195 cataagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacgattgtctt 48315139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39477455 - 39477202
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39477455 cagatacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggaggatatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 39477356  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||   |||||||||    
T  39477355 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcattaacaacttgattccgc 39477256  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||    
T  39477255 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatctt 39477202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Original strand, 2356282 - 2356534
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |    
T  2356282 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgaagaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacaaaaatg 2356381  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||     
T  2356382 tgacgagcatgttttgggagaacagcatgttccaatggatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgct 2356481  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2356482 ataagaccgtgattaggtagggaaatgcatcttccaactacaacaattgtctt 2356534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Original strand, 40588542 - 40588794
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||     
T  40588542 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaaca 40588641  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||    
T  40588642 tgatgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcggcc 40588741  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||| |||||  |||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  40588742 agaagatcgtcattagtcagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 40588794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 30360512 - 30360761
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  30360512 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtacaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaaaacgacgaaaacgta 30360611  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||    
T  30360612 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggt-gcgttgctgagatcaactgaagatatcataaaaagtttgattccgccag 30360710  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||| ||| ||||||||    
T  30360711 aagatcgtcattagttagggtaatgtgcattccaactataactattgtctt 30360761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 34140858 - 34141079
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  34140858 agagacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacg 34140957  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  34140958 tgacggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgcc 34141057  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    | |||||||| ||||| |||||    
T  34141058 ataagatcgtcattagttaggg 34141079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 42735255 - 42735510
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42735255 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatg-gggaagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 42735353  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  42735354 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatattctagtgaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 42735453  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
     |||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42735454 aagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 42735510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 21650518 - 21650724
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||    
T  21650518 gagacacaaggagggtggaacacgttcattataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggaggaattaacgaacgacgaaaatgt 21650617  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21650618 gacgagcatgttatgggatcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 21650717  T
Q  213 gaagatc 219  Q
     ||||||    
T  21650718 taagatc 21650724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48220949 - 48220706
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  48220949 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 48220850  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  48220849 catg--ttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcaggtgacggtgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccataagat 48220752  T
Q  219 cgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||    
T  48220751 cgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatctt 48220706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 17183205 - 17183412
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17183205 agagacacaaggagggtgtaacacgtttggtataaacgtccaacactcgacgagggaagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 17183304  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  17183305 tgacgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgcc 17183404  T
Q  212 agaagatc 219  Q
    ||||||||    
T  17183405 agaagatc 17183412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 17839315 - 17839569
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17839315 cagagacacaaggatggtggaagacgtttggaataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 17839414  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  17839415 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 17839514  T
Q  211 c-agaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    | | |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  17839515 caaaaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 17839569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 20564751 - 20564973
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20564751 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 20564850  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  20564851 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 20564950  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  20564951 cacaagatcgtcattagttaggg 20564973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30355012 - 30354774
Alignment:
Q  29 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgg 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30355012 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 30354913  T
Q  129 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  30354912 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgtggatgacgttgctgagatcagctgaagatatcatcaaaagtttgattctgccaaaagatcgtcattagg 30354813  T
Q  229 tagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || |    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  30354812 tacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 30354774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28114608 - 28114352
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28114608 cagagaaacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgcccgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28114509  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
     ||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |     
T  28114508 atgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccaatggatcgaaatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattctgt 28114409  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg----aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || ||||| || ||||||||  |    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28114408 caaaagattgtcattaggtaccgaataaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 28114352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28979234 - 28979060
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||    
T  28979234 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgggtgaaattaacgagcgacaaaaacgtg 28979135  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagat 188  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28979134 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagat 28979060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26603420 - 26603268
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26603420 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagggtatcattcacttgggtggaattaaagagcgacgaaaac 26603321  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggt 163  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26603320 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggt 26603268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Original strand, 10523061 - 10523314
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||    
T  10523061 agagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgttggaattaacgaacgacgaaaacg 10523160  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatg-ttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  10523161 tgacgagcatgttttgggagcaccacatgtttcttgtggatcgatatgcgggtgaagtttcttagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 10523260  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||| || |    ||||||||||||||||||||||    
T  10523261 ctgaaaatcgtcattagttagggtaaggtgtattccaactacaacaattgtctt 10523314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45363458 - 45363214
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  45363458 cagagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagcagagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaac 45363359  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  45363358 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgat---------acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 45363268  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  45363267 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 45363214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2206144 - 2205999
Alignment:
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  2206144 catgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagat 2206045  T
Q  219 cgtgattaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| ||||| ||||  || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  2206044 cgtcattagttaggataaggtgcattccaactacaacaattgtctt 2205999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9367243 - 9367085
Alignment:
Q  103 acgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtat 202  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  9367243 acgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 9367144  T
Q  203 gattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||    
T  9367143 gattccgccacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgt 9367085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Original strand, 150192 - 150328
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    || |||||| |||||||  ||||||||||| |||||| | |||||| || |||||||||||    
T  150192 ttttggcagcacatcatgttcccgtggatcgatatatttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattctgctagaagatcgtg 150291  T
Q  223 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  150292 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattg 150328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 13916825 - 13916949
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||     
T  13916825 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacaaaaat 13916924  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcaca 135  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  13916925 gtgatgaccatgttttgggagcaca 13916949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3380727 - 3380637
Alignment:
Q  173 gagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3380727 gagatcaactgaagatattctcaacaatttgattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaacgacaacaattgtctt 3380637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 42682948 - 42683051
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  42682948 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgaacgacgaggggagaatatcattcactttggtggaattaacgaacaacgaaaac 42683047  T
Q  111 gtga 114  Q
    ||||    
T  42683048 gtga 42683051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Original strand, 18149638 - 18149761
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||    | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  18149638 agcacaacatgttcccgtggatcgatttgtttttcaagttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattgcgccagaagatcgtatttaggt 18149737  T
Q  230 agggaatgcaccttccaactacaa 253  Q
    ||||||||||| || |||||||||    
T  18149738 agggaatgcacttttcaactacaa 18149761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 28066359 - 28066466
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  28066359 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaaaagtttgattccgccagaacatcgtg 28066458  T
Q  223 attaggta 230  Q
    ||||||||    
T  28066459 attaggta 28066466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 11824839 - 11824912
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11824839 acgttgcagagatcaactgaagatattttcaacagtttgattccgctagaagatcgtgattaggtagggaatgc 11824912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26601839 - 26601740
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||    
T  26601839 acgttgttgagatcaactgaagatatcatcaatagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatctt 26601740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 263
Target Start/End: Original strand, 13920431 - 13920551
Alignment:
Q  144 cagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg---aatgcac 240  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    |||||     
T  13920431 cagtggatcgatatgcaggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgatttcgccataagatcgtcattagttagggtaagatgca- 13920529  T
Q  241 cttccaactacaacaattgtctt 263  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  13920530 -ttccaactacaacaattgtctt 13920551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7414304 - 7414196
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||   || ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||    
T  7414304 ttttggcagcacaacatgttctcgtggatctatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaaaatattctcaacagtttgatttcgccagaagattatg 7414205  T
Q  223 attaggtag 231  Q
    |||||||||    
T  7414204 attaggtag 7414196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 8726430 - 8726381
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgaca 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  8726430 agacacaaggagggtggaataagttcggtataaacgtccatcgttcgaca 8726381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 231
Target Start/End: Original strand, 12083042 - 12083143
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 229  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||   || || |||||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||    
T  12083042 agcacaacatgttcccatggatggatatgtttgtcacattgctgagatcgcctgaagatattctcaacagtttggttccgcctgaagattatgattaggt 12083141  T
Q  230 ag 231  Q
    ||    
T  12083142 ag 12083143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Original strand, 31267188 - 31267286
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||  ||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||  |||||||||    
T  31267188 agcacaacatgttcccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctaagatcgcctgaagatattct-aacagtttgattcagctagaagattatgattaggt 31267286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17320260 - 17320163
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  17320260 gttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 17320163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 52
Target Start/End: Original strand, 3924805 - 3924845
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcc 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3924805 agagacacaaggagggtggaatacgtttgatataaacgtcc 3924845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 56
Target Start/End: Original strand, 18146953 - 18146996
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacg 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  18146953 gagacacaaggagggtggaatacttttggtatgaacgtccaacg 18146996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 263
Target Start/End: Original strand, 34139332 - 34139411
Alignment:
Q  185 agatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  34139332 agatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 34139411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26500438 - 26500410
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26500438 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 26500410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Original strand, 26592275 - 26592303
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26592275 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 26592303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30361308 - 30361280
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30361308 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 30361280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Original strand, 39476656 - 39476684
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39476656 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 39476684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 51015284 - 51015537
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  51015284 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagtgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 51015383  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  51015384 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggaaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 51015483  T
Q  214 aagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51015484 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 51015537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39417160 - 39416910
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39417160 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 39417061  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||    
T  39417060 atgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgatttcgccag 39416961  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  39416960 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 39416910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 6754210 - 6754461
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6754210 gagacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 6754309  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  6754310 gacgatcatgttttgggagtacaacatgttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcta 6754409  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6754410 gaagatcgtgattatgtagggaaatgcaccttccaactacaacaactgtctt 6754461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 51013493 - 51013237
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51013493 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 51013394  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  51013393 gtgacgagcatgttttgggaacacaacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 51013294  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51013293 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 51013237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6464556 - 6464314
Alignment:
Q  15 gacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtga 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6464556 gacacaaagagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtga 6464457  T
Q  115 agaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccaga 214  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6464456 caatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcaaga 6464357  T
Q  215 agatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaa 256  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6464356 agatcgtgattatatagggaaatgcaccttccaactacaacaa 6464314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 47065691 - 47065944
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  47065691 cagagacacaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgaggaaaat 47065790  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||    
T  47065791 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgc 47065890  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  47065891 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 47065944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 30192542 - 30192798
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30192542 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 30192641  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||   | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  30192642 gtgtctagcatgttttgggagtacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 30192741  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30192742 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattttctt 30192798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 44927469 - 44927720
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  44927469 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 44927568  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  44927569 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 44927668  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  44927669 gaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 44927720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46414549 - 46414293
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46414549 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 46414450  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  46414449 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgc 46414350  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46414349 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttctagctacaacaattgtctt 46414293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48087764 - 48087514
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48087764 agacacaaggatggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 48087665  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  48087664 acgagcatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccag 48087565  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||  ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  48087564 aagatcgtcattaattagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 48087514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 42382275 - 42382528
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42382275 cagagacgtaaggagggtggactacgttcagtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42382374  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  42382375 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgc 42382474  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| | ||  ||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  42382475 cagaagatcgtcattagttgggacaatgtgcattccaactacaacaattgtctt 42382528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 53826911 - 53826658
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  53826911 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaat 53826812  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  53826811 gtgatgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 53826712  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  53826711 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 53826658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8633572 - 8633324
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8633572 gagacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 8633473  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || ||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8633472 gacgaatattttttgggatgacaacgtgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgcgatcatctgaagatattatcaacagtctgattccgcca 8633373  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8633372 gaagatcgtcattaggtaccgaatgcacc--ccaactacaacaattgtctt 8633324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Original strand, 41577918 - 41578166
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||     
T  41577918 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgag 41578017  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41578018 catgttttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 41578117  T
Q  219 cgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    | | |||||||| |    ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41578118 catcattaggtacggaatgaatgcacctttcagctacaacaattgtctt 41578166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 774551 - 774301
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||||| ||||||||    
T  774551 gagacacgaggagagtggaatgtgtttgctataaacgtccaacgctcgacgacgggagaatatcattcagttggatggaattaacgaacgatgaaaacgt 774452  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||    
T  774451 gaagaacatgttttcggagcactgcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattccacca 774352  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  774351 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactgcaacaattgtctt 774301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25576806 - 25576554
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25576806 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagattatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 25576707  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||     
T  25576706 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttcca-tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgt 25576608  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  25576607 cagaagatcgtcattatttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 25576554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42950235 - 42949982
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  42950235 cagagacgcaagaagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagggaagagtatcattcacttggatggagttaaagaatgacgaaaac 42950136  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  42950135 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggtttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 42950036  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  42950035 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 42949982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34472288 - 34472072
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34472288 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34472189  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  34472188 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttttattccgccag 34472089  T
Q  214 aagatcgtgattaggta 230  Q
    |||||||| ||||||||    
T  34472088 aagatcgtcattaggta 34472072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45100677 - 45100461
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  45100677 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaatgtg 45100578  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  45100577 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 45100478  T
Q  214 aagatcgtgattaggta 230  Q
    || ||||| ||||||||    
T  45100477 aatatcgtcattaggta 45100461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 43569914 - 43570170
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  43569914 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaactaacgaacgacgaaaac 43570013  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  43570014 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgatttcgc 43570113  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaa----tgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43570114 cagaagatcgtctttatgtacggaatgactgcaccttccagctacaacaattgtctt 43570170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 55207099 - 55206843
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  55207099 cagagacagaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 55207000  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  55206999 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 55206900  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  55206899 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 55206843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33449351 - 33449117
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33449351 agacacaaggagggtgaaatacgttcgatataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33449252  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  33449251 aagaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgata------------tgctgagatcaactgaagatatcatccaaagtttgattccgccag 33449164  T
Q  214 aagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33449163 aagatcgtaattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 33449117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 42383055 - 42383308
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42383055 cagagacgtaaggagggtggactacgttcagtataaacttccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 42383154  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  42383155 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgc 42383254  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg-gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| | ||  || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  42383255 cagaagatcgtcattagttgggacaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 42383308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 2428491 - 2428744
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2428491 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2428590  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  2428591 gtgacgaacatgttttgggagcacaacattttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 2428690  T
Q  211 cagaagatcgtgattagg----tagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
     |||||||||| ||||||    ||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  2428691 tagaagatcgtcattaggtacataatgaatgcacctttcagctacaacaattgt 2428744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13896084 - 13895832
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  13896084 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacg 13895985  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||     
T  13895984 tgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgct 13895885  T
Q  212 agaagatcgtgattaggt-agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  13895884 agaagatcgtcattagttaaggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 13895832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 41803906 - 41804132
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41803906 cagagacaaaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 41804005  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  41804006 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagagtgacgttgatgagatcaaatgaagatataatcaaaagtttgattccgc 41804105  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaatg 237  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41804106 cagaagatcgtcattaggtacggaatg 41804132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2647091 - 2646838
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2647091 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2646992  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  2646991 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 2646892  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
     |||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  2646891 tagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 2646838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34647480 - 34647263
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34647480 gagacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 34647381  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |    
T  34647380 gacgagcatgtttcgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgcta 34647281  T
Q  213 gaagatcgtgattaggta 230  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  34647280 gaagatcgtcattaggta 34647263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 49218950 - 49218698
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  49218950 agagacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacaaacggcgaaaacg 49218851  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  49218850 tgacgaacatgttttgggagcgcaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacaacttgattccgcc 49218751  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  49218750 agaagatcgtcattagttagggtaaagtgcattccaactgcaacaattgtctt 49218698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34693503 - 34693252
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  34693503 gagacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagggttgagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgt 34693404  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  34693403 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaactttgattccgcca 34693304  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  34693303 gaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 34693252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10053485 - 10053236
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10053485 agagacacaaggagggtggaatacattcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 10053386  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  10053385 tgatgagcatgttttgggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaa-atatcatcaaaagtttgattccgcc 10053290  T
Q  212 agaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 261  Q
    |||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10053289 agaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtc 10053236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24702483 - 24702234
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  24702483 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattac-gaacgacgaaaacgtg 24702385  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  24702384 acggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgccag 24702285  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  24702284 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 24702234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3495244 - 3494991
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3495244 cagagacacaaggatggtggaacacgtttgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3495145  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  3495144 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgtttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgc 3495045  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  3495044 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 3494991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Original strand, 37281459 - 37281709
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37281459 agacacaaggatgatggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgagggtagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 37281558  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  37281559 acgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacggaagatatcatcaaaagtttaattccgccag 37281658  T
Q  214 aagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    |||||||| |||||||    |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37281659 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttcaaactacaacaattgt 37281709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47760106 - 47759887
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  47760106 cagagacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaac 47760007  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  47760006 gtgacaaacatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatgtacgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgc 47759907  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggta 230  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  47759906 cagaagatcgtcattaggta 47759887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 7954209 - 7954464
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaagggg-agagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||| |    
T  7954209 gagacacaaggagggtggaatacgttcggcataaacgtccaacactcgatgagggggagggtatcatttagttgggtggaattaacaaacgacgaaaatg 7954308  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  7954309 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaaagttgctaagatcaactgaagatattatcaacaatctgattccgct 7954408  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||| |||||||| |    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7954409 agaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttctaactacaacaattgtctt 7954464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 27186952 - 27187178
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||   |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27186952 cagagacacaaggagggtggaatacgtttagtataaatgtccaatgctcgtagaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27187051  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  27187052 atgacgaacatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatctgattccgc 27187151  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaatg 237  Q
    || || |||||||||||||||||||||    
T  27187152 cataatatcgtgattaggtagggaatg 27187178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19453444 - 19453191
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19453444 cagagatagaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaatgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19453345  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  19453344 gtgacgagcatgttatgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccac 19453245  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||    
T  19453244 cagaagatcatcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattctctt 19453191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 43477061 - 43477314
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43477061 cagagacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 43477160  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||    
T  43477161 gtgacgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccgc 43477260  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||  | |||||||| |||||| ||||||    
T  43477261 cagaagatcgtcattaattagggtaatgtgcattccaacttcaacaactgtctt 43477314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 49610493 - 49610746
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  49610493 cagagacacaaggagggtggaacaccttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 49610592  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  49610593 gtgacgagcatgttttgggagcacagtatgttccagtgggtcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 49610692  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  49610693 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 49610746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2268706 - 2268456
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  2268706 agacacaaggatggtggaacaagtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2268607  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  2268606 acgggcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 2268507  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  2268506 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 2268456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 49140269 - 49140019
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  49140269 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 49140170  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  49140169 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 49140070  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||    
T  49140069 cacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgt 49140019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 54390446 - 54390696
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  54390446 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 54390545  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  54390546 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 54390645  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||    
T  54390646 cacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgt 54390696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 7246101 - 7246354
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7246101 agacacaagaagagtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 7246200  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  7246201 acgagcatgttttgggattataacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 7246300  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg----aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| |||||||| ||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7246301 aagatcgtcattaggtatggaataaatgcaccttccagctacaacgattgtctt 7246354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44835701 - 44835449
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44835701 agagacgcaaggagggtggaatacgttcgatataaacattcaacgttcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 44835602  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |    
T  44835601 tgacgagcatgttttgggagcatagaatgttccagtggatggatatgcgggtaaggttgttgagatcaactgaaaatatcatcaacagcttgattccgtc 44835502  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  44835501 agaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 44835449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 14631449 - 14631668
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  14631449 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagtaaagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacaacgaaaac 14631548  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  14631549 gtgacgagcatgttttgggagcaaaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattctgc 14631648  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggta 230  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  14631649 cagaagatcgtcattaggta 14631668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 52569623 - 52569368
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||     
T  52569623 cagagacaaaaggatggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaa- 52569525  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  52569524 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccggtgaatcgatatgcgggtgacattgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtttgattccgc 52569425  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||    |  |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  52569424 cagaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 52569368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 34049731 - 34049981
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34049731 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 34049830  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  34049831 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 34049930  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||    
T  34049931 cacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgt 34049981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 46403007 - 46403229
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46403007 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 46403106  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  46403107 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 46403206  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  46403207 cacaagatcgtcattagttaggg 46403229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51695821 - 51695599
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  51695821 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaaaagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaatac 51695722  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  51695721 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 51695622  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    ||||||||| | ||||| |||||    
T  51695621 cagaagatcatcattagttaggg 51695599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4004302 - 4004049
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  4004302 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacgtgggtggaattaacgaacgacaaaaac 4004203  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  4004202 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgc 4004103  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  4004102 cagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 4004049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20376090 - 20375845
Alignment:
Q  18 acaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaaga 117  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  20376090 acaaggaagatggaatatgttcggtataaacgtctaatgctcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgagga 20375991  T
Q  118 acatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaaga 217  Q
      |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||| || ||||||||||| || |    
T  20375990 gtatgttttgagagcacaacatgttcaagtagatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaatttaagataataacaactgtttgattccgccaaaata 20375891  T
Q  218 tcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20375890 tcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaaaaattgtctt 20375845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Original strand, 49273404 - 49273659
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  49273404 agagacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgagggcagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacg 49273503  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||  ||    
T  49273504 tgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagttgatcaatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattcttcc 49273603  T
Q  212 agaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||| ||||| |||||||    |  ||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  49273604 agaatatcgtcattaggtcctgaatgaacgcaccttccagctaccacaattgtctt 49273659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Original strand, 36135013 - 36135264
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  36135013 agagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgagggga-agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 36135111  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  36135112 tgacgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc 36135211  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg---aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||| || ||||| ||| |    |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36135212 agaagattgtcattagttagagtaagatgca--ttccaactacaacaattgtctt 36135264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36721601 - 36721351
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||||    
T  36721601 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgattggaataaacgaacgacgaaaacgtg 36721502  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  36721501 acgagcaatgtttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 36721402  T
Q  214 aagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    |||||||| ||| |||    |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36721401 aagatcgtcatttggtatcgaatgaatgcaccttccacctacaacaattgt 36721351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 50458906 - 50458652
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| |  | |||||||||||||    
T  50458906 cagagacacaaggagggtgggacacggtcgatataagtgtccaacgctcgacgaggggagagtatcgtttaattgggtggaatctacgaacgacgaaaac 50458807  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  50458806 ttgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatagatatgcgggtgacgttgttgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 50458707  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtc 261  Q
    | ||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50458706 ctgaagatcgtcattaggtaccgaacgaatgcaccttccagctacaacaattgtc 50458652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 14265412 - 14265661
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| || ||||||||| |||| || | |||| |||||||||   |    
T  14265412 cagagacacaaggaaggtggaatacgttcggtataaacatccaacgttcgacgatgggtgaatatcattcagttggatgaaattaaggaacgacga---c 14265508  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| || | |||||||| ||||||| |||| |||||||| || | ||| |||||||||    
T  14265509 gtgacgaacatgttttgggaccacaacatgttaccgtggatcgatttgtgtgtaacgttactgagattaactaaagatattctccagagtttgattccgc 14265608  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14265609 ctgaagatcgtgattaggtagggattgcactttccaactacatcaattgtctt 14265661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42323565 - 42323348
Alignment:
Q  50 tccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtgg 149  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  42323565 tccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagctcaaaatgtttcagtgg 42323466  T
Q  150 atcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttcc 245  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||| |||||||    |  |||||||||||||    
T  42323465 atcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccactggaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttcc 42323366  T
Q  246 aactacaacaattgtctt 263  Q
    | ||||||||||||||||    
T  42323365 agctacaacaattgtctt 42323348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 260
Target Start/End: Original strand, 50997453 - 50997642
Alignment:
Q  72 gtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgc 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  50997453 gtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgaagttgc 50997552  T
Q  172 tgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||    
T  50997553 ttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgt 50997642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 135 - 263
Target Start/End: Original strand, 18440873 - 18441001
Alignment:
Q  135 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  18440873 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagaga 18440972  T
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18440973 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 18441001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 135 - 263
Target Start/End: Original strand, 19485947 - 19486075
Alignment:
Q  135 aacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19485947 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagaga 19486046  T
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19486047 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 19486075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25887796 - 25887571
Alignment:
Q  40 ggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  25887796 ggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcactcagttgggtggaattaacaaacgacgaggatgtgaggaccatgttttgggagcacaacat 25887697  T
Q  140 gttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg---attaggtagggaat 236  Q
    ||||  ||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||||    
T  25887696 gttctcgtggatc-atatgtgtggaacgttgttgagatcaactgaagatattctccacagtttgattccgctagaatatcgtgattattaggtagggaat 25887598  T
Q  237 gcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25887597 gcaccttccaactacaacaattgtctt 25887571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46346732 - 46346571
Alignment:
Q  106 aaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgat 205  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  46346732 aaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 46346633  T
Q  206 tccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46346632 tccgccagaagattgtcattatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 46346571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Original strand, 15637031 - 15637118
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  15637031 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacactcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaac 15637118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 263
Target Start/End: Original strand, 15637155 - 15637247
Alignment:
Q  171 ctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||  ||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15637155 ctgagatcaactgaagatattatcaatattttgattttgctggaagatcgtaattcggtagggaattcaccttccaactacaacaattgtctt 15637247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 234
Target Start/End: Original strand, 7954774 - 7954866
Alignment:
Q  142 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 234  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7954774 tccagttgatcgatatacgtgtaactttgatgagatcaactaaagattttatcaacagtcttatttcgccagaagatcgtgattaagtaggga 7954866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11378957 - 11378906
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 64  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11378957 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 11378906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 46346794 - 46346745
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcga 61  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  46346794 agagacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcga 46346745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 7954865 - 7954909
Alignment:
Q  216 gatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7954865 gatcgtgatcaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgt 7954909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 42328331 - 42328288
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42328331 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaa 42328288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17267398 - 17267306
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 215  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||   || |||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  17267398 ttttggcagcacatcatgttcccgtggatcgatatgtaagttacgttgctgagattgcctaaagatattctcaagagtttgattctgccagaa 17267306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 263
Target Start/End: Original strand, 773986 - 774026
Alignment:
Q  223 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  773986 attaggtacggaatgcaccttcaaactacaacaattttctt 774026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27187881 - 27187849
Alignment:
Q  231 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27187881 gggaatgtaccttccaactacaacaattgtctt 27187849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Original strand, 42949656 - 42949684
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42949656 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 42949684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Original strand, 44834902 - 44834930
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44834902 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 44834930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47066490 - 47066462
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47066490 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 47066462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1400518 - 1400264
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1400518 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 1400419  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  1400418 gacgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatccatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcca 1400319  T
Q  213 gaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| |||||||    || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1400318 gaagatcgtcattaggtacggagtgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 1400264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 33370645 - 33370866
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33370645 gagacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 33370744  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33370745 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcca 33370844  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggga 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  33370845 gaagatcatgattaggtaggga 33370866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 18308249 - 18308505
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18308249 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 18308348  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  18308349 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgc 18308448  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| |||| |  |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18308449 cagtagattgacattaggtatggaatgaatgcaccttccacctacaacaattgtctt 18308505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7447 - 7194
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7447 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 7348  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  7347 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 7248  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  7247 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 8537943 - 8538196
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8537943 cagagacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 8538042  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  8538043 atgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 8538142  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  8538143 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 8538196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 40009518 - 40009739
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40009518 agagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 40009617  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |     
T  40009618 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagacatcatcaacagcttgattccaca 40009717  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||    
T  40009718 agaagatcgtcattagttaggg 40009739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 1971356 - 1971607
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  1971356 gagacacaaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttcggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 1971455  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  1971456 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 1971555  T
Q  213 gaagatcgtgattaggta-gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| ||| | ||||| || || || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  1971556 gaaaatcatcattagttatggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 1971607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4724292 - 4724036
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  4724292 cagagacacaaggaaagtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaac 4724193  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  4724192 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 4724093  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||    |  ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4724092 cagaagatcgtcattaggtaccaaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtctt 4724036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 541853 - 541600
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  541853 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 541754  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| |||    
T  541753 gggacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactggagatatcatcaacaacttgatttcgc 541654  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  541653 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctt 541600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8576359 - 8576106
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  8576359 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgaagaaaac 8576260  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  8576259 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccggtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 8576160  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  8576159 cagaagattgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 8576106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 11346698 - 11346951
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  11346698 cagagacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgaaattaatgaacgacgaaaac 11346797  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  11346798 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 11346897  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  11346898 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 11346951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 19400352 - 19400605
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  19400352 cagagacacaaggatggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtgtcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 19400451  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  19400452 gtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 19400551  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  19400552 cagaatatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 19400605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 3601330 - 3601583
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3601330 cagagacacaaggagggtagaacatattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3601429  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||     
T  3601430 gtgacgagcatgttttaagagcacaacatgttccagtgtttcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgt 3601529  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  3601530 cagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 3601583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 28880980 - 28881233
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28880980 cagagacacaaggatggtggaaaacatttggtacaaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 28881079  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  28881080 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 28881179  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  28881180 cacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 28881233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 35565261 - 35565516
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |    
T  35565261 cagagacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaa-c 35565359  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  35565360 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcagaagtttgattccgc 35565459  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||    |  ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  35565460 cagaagatcgtcattaggtgcggaatgaatgcacctttcagctacaacaattatctt 35565516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 11027769 - 11028019
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  11027769 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 11027868  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  11027869 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcgaaagtttgattccgccag 11027968  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||| ||||||||||||||    
T  11027969 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaaccacaacaattgtctt 11028019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19036892 - 19036670
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19036892 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 19036793  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19036792 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 19036693  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  19036692 cacaagatcgtcattagttaggg 19036670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 30709594 - 30709840
Alignment:
Q  18 acaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaaga 117  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||    
T  30709594 acaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacga 30709693  T
Q  118 acatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaaga 217  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  30709694 ccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaaga 30709793  T
Q  218 tcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  30709794 tcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 30709840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 38854150 - 38854399
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  38854150 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 38854249  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  38854250 acgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 38854349  T
Q  214 aagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||| ||| ||||| |||| || |  | ||||||| ||||||||||||||    
T  38854350 aagaccgtcattagttaggtaaggtgcattccaaccacaacaattgtctt 38854399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27661595 - 27661342
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27661595 cagagacacaaggatggtggaacacgtttagtataaacttccattgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 27661496  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  27661495 gtgacgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgc 27661396  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  27661395 cagaagattgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 27661342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36350523 - 36350279
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36350523 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaac 36350424  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||         ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  36350423 gtgacgagcat---------gcacaacatgttccagtggatcgatatgtaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccac 36350333  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36350332 cagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 36350279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6793604 - 6793351
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||     
T  6793604 cagagacacaaggaggatggaacacattcggtataaacgcctaacgctcgacgaggagtgagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaat 6793505  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  6793504 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtgaatcgatatgcggatgaggttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattcagc 6793405  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6793404 cagaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 6793351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17366950 - 17366738
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  17366950 agacacaaggagggtggaata-gttcgatataaacgtccaaccctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 17366852  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17366851 acaaacatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtaccgttgttgagatcaactaaagatattatcaagagtctgattctgccag 17366752  T
Q  214 aagatcgtgattag 227  Q
    || |||||||||||    
T  17366751 aatatcgtgattag 17366738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35927653 - 35927470
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35927653 gagacacaattagggtgtaacacgttcgttataaacgtccaatgctcgacgagggaagagtatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 35927554  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaa 196  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35927553 gacgaacatgttttgggagcacatcatctttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaa 35927470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 3169593 - 3169766
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3169593 cagagacataaagagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 3169691  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaa 185  Q
    |||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3169692 gtgacgagcatattttaagagcacaacatgttccagtggatcggtatgcgggtgacgttgctgagatcagctgaa 3169766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 2599210 - 2599396
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| |||   || |    
T  2599210 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacattcgacgatgagagaatatcattcagttgggtggaattagcgaacaacggcgacat 2599309  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacag 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  2599310 gaagagcatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagattaactgatgatattctcaacag 2599396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Original strand, 1694860 - 1695034
Alignment:
Q  93 ttaaagaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatta 192  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1694860 ttaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgtttcactggaacgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatca 1694959  T
Q  193 tcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1694960 tcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt 1695034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 18920835 - 18920975
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| ||||||||||| | | |  ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18920835 ttttggcagcacaacatggttccgatgatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 18920934  T
Q  223 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18920935 attaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 18920975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17195423 - 17195325
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17195423 acgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcatcttccaactacaacaattgtctt 17195325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 3458828 - 3458941
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3458828 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggttgagttaaagaacgacgaaaacgtg 3458927  T
Q  114 aagaacatgttttg 127  Q
    | ||  ||||||||    
T  3458928 acgagtatgttttg 3458941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25360690 - 25360549
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtt-gctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgt 221  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||   || ||||| |||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25360690 ttttggcagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgtttgctgagatcgcctgaagatgttttcaacagtttgattccgtcagaagatcgt 25360591  T
Q  222 gattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25360590 gattaggtagagaatgcacctttcaactacaacaattgtctt 25360549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 263
Target Start/End: Original strand, 7082336 - 7082463
Alignment:
Q  137 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggta-gggaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| || || ||    
T  7082336 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttatggtaa 7082435  T
Q  236 tgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
     |  | ||||||||||||||||| ||||    
T  7082436 ggtgcattccaactacaacaattctctt 7082463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36312009 - 36311911
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || |||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36312009 acgttgctgagatcgcctgaagatcttctcaatagtttaattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 36311911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13131142 - 13131044
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131142 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacattttgattttgctagaagatcgtgattagctagagaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 13131044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 234
Target Start/End: Original strand, 12742818 - 12742884
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742818 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 12742884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Original strand, 1693382 - 1693455
Alignment:
Q  23 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaa 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1693382 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcactcacttgggtggaattaa 1693455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 7082281 - 7082335
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 65  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7082281 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 7082335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 12742706 - 12742820
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || | ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||      
T  12742706 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacag 12742805  T
Q  113 gaagaacatgttttg 127  Q
    |  ||||||||||||    
T  12742806 gtggaacatgttttg 12742820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 12805524 - 12805638
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | || | ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||     
T  12805524 gagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaatgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacgg 12805623  T
Q  113 gaagaacatgttttg 127  Q
    |  ||||||||||||    
T  12805624 gtggaacatgttttg 12805638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 234
Target Start/End: Original strand, 12805636 - 12805702
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12805636 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattatgccagaagatcgtgattaggtaggga 12805702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 19748051 - 19748276
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||||| |||||| || | |||| |  | | || |||| |||||||||  |||||    
T  19748051 agacacaagaagggtggaatacatttgatatgaacgtccaacgttggacaacgggagaataacgttcagtcagctagaattaacgaacgacgacgacgtg 19748150  T
Q  114 aagaacatgtt---------ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatga 204  Q
    |||||||||||         |||| ||||||||||||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||    
T  19748151 aagaacatgttctccattttttggcagcacaacatgtttccgtggatcgatatgtttgta-cgttgctgagatcgcctgaagatattctcaacaatttga 19748249  T
Q  205 ttccgccagaagatcgtgattaggtag 231  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||    
T  19748250 ttccgccataagattatgattaggtag 19748276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 253
Target Start/End: Original strand, 2599426 - 2599486
Alignment:
Q  193 tcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaa 253  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2599426 tcaacagtttgattccgtcagaagatcgtgattaggtagagaatgcacctttcaactacaa 2599486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 263
Target Start/End: Original strand, 12742883 - 12742930
Alignment:
Q  216 gatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12742883 gatcgtgattaggtagggaatgcatcttccaactacaacaattgtctt 12742930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 263
Target Start/End: Original strand, 3458940 - 3459032
Alignment:
Q  172 tgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  3458940 tgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 3459032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15798186 - 15798078
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||   || |||||| ||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  15798186 ttttggcagcacaacatgtttccgtggattgatatgtttgtcacgttgatgagattgcctgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagattatg 15798087  T
Q  223 attaggtag 231  Q
    |||||||||    
T  15798086 attaggtag 15798078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 263
Target Start/End: Original strand, 12805701 - 12805748
Alignment:
Q  216 gatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12805701 gatcgtgattaggtagggaatgcatcttccaactgcaacaattgtctt 12805748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17366732 - 17366684
Alignment:
Q  216 gatcgtgattaggtagggaa-tgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17366732 gatcgtgattaggtagggaaatgcaccttccaactataacaattgtctt 17366684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23228776 - 23228668
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||   || |||||| ||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||| |||| ||  ||    
T  23228776 ttttggcagcaccgcatgttcccgtgaatcgatatgtttgtcacgttgttgagatcacttgaagatattctgaacagtttgattccgctagaaaattatg 23228677  T
Q  223 attaggtag 231  Q
    |||||||||    
T  23228676 attaggtag 23228668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 263
Target Start/End: Original strand, 10397987 - 10398035
Alignment:
Q  216 gatcgtgattaggtagggaa-tgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  10397987 gatcgtgattaggtagtgaaatgcaccttccaactacacaaattgtctt 10398035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16418199 - 16418111
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    ||||||||||||||| | |||| || |||   || || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| || ||||||||||    
T  16418199 agcacaacatgttcccgaggattgagatggatgttacattgctgagatcacctgaagatattctcaagagtttgactctgccagaagat 16418111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40012406 - 40012378
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40012406 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 40012378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33799757 - 33799512
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  33799757 caaggagggtggaatatgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgag 33799658  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  33799657 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggataacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagat 33799558  T
Q  219 cgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  33799557 cgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 33799512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44943295 - 44943039
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44943295 cagagacacaaggatggtgtaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 44943196  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  44943195 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 44943096  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggga----atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| || |||||||| |||    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44943095 cagaagattgtcattaggtacggaatgtatgcaccttccagctacaacaattgtctt 44943039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41857188 - 41856932
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  41857188 cagagacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacttgggtggaattaacgaacgacgaaaat 41857089  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  41857088 gtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 41856989  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  41856988 cagaagatcgtcattaggtacgaaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 41856932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3589478 - 3589228
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | | | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  3589478 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcaaacgattgtctatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgataacgt 3589379  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3589378 gatgggcatgttttgggagcacaggatgttccagtggatcgatatgcgtgtaacattgttgagatcaactgaagacattatcaacagtttgattccgcca 3589279  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3589278 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttcaaactacaacaattgtctt 3589228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43638883 - 43638638
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  43638883 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatccttcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgag 43638784  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  43638783 catgttttgggagcacaacatgttccagtgcatcgatatgcgcgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagat 43638684  T
Q  219 cgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||| |||||||||    
T  43638683 cgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaataattgtctt 43638638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 34614955 - 34615206
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  34614955 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgt 34615054  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||    
T  34615055 gacgaacatgttttgggagcacaacatgatccagtggattgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacca 34615154  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| || ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  34615155 gaagatagtaattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 34615206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 41363658 - 41363909
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  41363658 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtatacacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgt 41363757  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||    
T  41363758 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctcca 41363857  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  41363858 gaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 41363909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38034136 - 38033886
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38034136 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctctacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 38034037  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |    
T  38034036 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgccgg 38033937  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  38033936 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 38033886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15032538 - 15032285
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15032538 cagagacacaagtatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 15032439  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  15032438 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 15032339  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||| |||||||    
T  15032338 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtctt 15032285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28706356 - 28706103
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  28706356 cagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgagtggagttaaagaacaacgaaaac 28706257  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  28706256 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttttagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaccgcttgattccgc 28706157  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  28706156 cagaagattgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 28706103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 43693137 - 43693390
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43693137 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcggcgaggggaggatatcattcatttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 43693236  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |    
T  43693237 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctc 43693336  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||| ||||    
T  43693337 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattttctt 43693390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 40415251 - 40415479
Alignment:
Q  5 cagcagcagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgac 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40415251 cagcaccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgac 40415350  T
Q  105 gaaaacgtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatga 204  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||    
T  40415351 gaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcccgtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaacttaagatatcatcaacagcttga 40415450  T
Q  205 ttccgccagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  40415451 ttccgtcagaagatcgtcattagttaggg 40415479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18440509 - 18440253
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  18440509 cagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgaacgatgaaaac 18440410  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  18440409 gtgacgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgc 18440310  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
     |||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18440309 gagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattatctt 18440253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 26452325 - 26452547
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  26452325 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 26452424  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  26452425 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 26452524  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
     |||||||||| ||||| |||||    
T  26452525 tagaagatcgtcattagttaggg 26452547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31172028 - 31171778
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  || |    
T  31172028 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgacgacat 31171929  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    ||  ||||| |||  | |||||| |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31171928 gacaaacatttttcagaagcacagcatgttaccgtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaaaatattatcaacagtttgattccgcca 31171829  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31171828 gaagatcgtgattaggtatggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 31171778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42169172 - 42168921
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  42169172 gagacacgaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcccttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgt 42169073  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  42169072 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgcagagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 42168973  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtagg---gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||     |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42168972 gaagatcgtcattagttaggataagatgca--ttccaactacaacaattgtctt 42168921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19242375 - 19242120
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  19242375 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacg 19242276  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |     
T  19242275 tgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacg 19242176  T
Q  212 agaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||| || |||||||    |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242175 agaagattgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 19242120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19315559 - 19315304
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  19315559 agagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacg 19315460  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |     
T  19315459 tgacgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacg 19315360  T
Q  212 agaagatcgtgattaggt----agggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||| || |||||||    |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315359 agaagattgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 19315304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 41275394 - 41275616
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  41275394 cagagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaac 41275493  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  41275494 gtgacgagcatgttttgagagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgc 41275593  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  41275594 cagaagatcgtcattagttaggg 41275616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 40414610 - 40414826
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40414610 cagagacacaaggaaggtggaacacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaac 40414709  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |    
T  40414710 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccac 40414809  T
Q  211 cagaagatcgtgattag 227  Q
    ||||||||||| |||||    
T  40414810 cagaagatcgtcattag 40414826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 42603454 - 42603710
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42603454 cagagacagaaggagggcggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 42603553  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  42603554 gtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgaaatcaaccgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 42603653  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    || |||||||| |||||||| |    |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  42603654 caaaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt 42603710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 2416915 - 2417168
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2416915 cagaaacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacattcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 2417014  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||   ||||||| |    
T  2417015 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccac 2417114  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||    
T  2417115 cagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtctt 2417168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 26484580 - 26484757
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26484580 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 26484679  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatt 191  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26484680 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgcataacattgctgagatcaactgaagatatt 26484757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 485472 - 485222
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  485472 cagagacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 485373  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  485372 gtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcggatgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 485273  T
Q  211 cagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgt 260  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||||||    
T  485272 cacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgt 485222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 24861344 - 24861565
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |    
T  24861344 agagacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatg 24861443  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||    
T  24861444 tgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcaattggattgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattctgcc 24861543  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||    
T  24861544 agaagatcgtcattagttaggg 24861565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 40702360 - 40702587
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40702360 cagagacagaaggagagtggaacacgttcagtataaacgtccaacgttcgacgaagggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 40702459  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgc 210  Q
    |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  40702460 gtgacgagcatgttttgggaacaaaacatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgc 40702559  T
Q  211 cagaagatc-gtgattaggtagggaatg 237  Q
    || |||||| || |||||||| ||||||    
T  40702560 caaaagatcggtcattaggtacggaatg 40702587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 16575695 - 16575933
Alignment:
Q  14 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |    
T  16575695 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtttcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaacggg 16575794  T
Q  114 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccag 213  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||            || |   ||  ||| ||||||||||||    
T  16575795 atgagcatgttttgggaccacaacatgttccagtgcatcgatacgcgcgtaatgttgttga------------atttcgccagaagtttgattccgccag 16575882  T
Q  214 aagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16575883 aagttcgtgattaggcagggaaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 16575933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Original strand, 22548263 - 22548380
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  22548263 cagagacacaaggagggtggaacacattcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaac 22548362  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgg 128  Q
    |||| || ||||||||||    
T  22548363 gtgacgagcatgttttgg 22548380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 233
Target Start/End: Original strand, 22549236 - 22549301
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22549236 acgttgctgacatcaactgaagatatcatcaac---ttgattccgccagaagatcgtcattagttaggg 22549301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12504938 - 12504896
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  12504938 cagagacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaatgtcca 12504896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22843532 - 22843442
Alignment:
Q  16 acacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||| | |||||| || | |||| |||  ||||||||| ||| |||||    
T  22843532 acacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccatcgtttgacgatgggagaataacgttcagttgattggagttaacgaaggacga 22843442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 237
Target Start/End: Original strand, 26486847 - 26486899
Alignment:
Q  185 agatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaatg 237  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26486847 agatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcattaggtacggaatg 26486899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Original strand, 28705555 - 28705583
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28705555 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 28705583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Original strand, 33776051 - 33776079
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33776051 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 33776079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40416056 - 40416028
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40416056 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 40416028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 263
Target Start/End: Original strand, 43637179 - 43637207
Alignment:
Q  235 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43637179 atgcaccttccaactacaacaattgtctt 43637207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 2261 - 2512
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2261 gagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 2360  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  2361 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgatgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgcca 2460  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
     |||||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  2461 aaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 2512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18123 - 17879
Alignment:
Q  19 caaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagaa 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18123 caaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgag 18025  T
Q  119 catgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  18024 catgttttgggagcacaacatgttatagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagat 17925  T
Q  219 cgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||| ||||| ||||| || |  | || |||||||||||||||||||    
T  17924 cgtcattagttagggtaaggtgcatttcaactacaacaattgtctt 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 1783 - 2004
Alignment:
Q  12 agagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  1783 agagacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacg 1882  T
Q  112 tgaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcc 211  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  1883 tgacggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgcc 1982  T
Q  212 agaagatcgtgattaggtaggg 233  Q
    | |||||||| ||||| |||||    
T  1983 ataagatcgtcattagttaggg 2004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 24899 - 25119
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||    
T  24899 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtatagacgtacaacgctcgaggaggggagagtagcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaatgt 24998  T
Q  113 gaagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgcca 212  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  24999 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatctatttgcggataacattgctaagatcaactgaagatatta-caagagtctgattgcgcca 25097  T
Q  213 gaagatcgtgattaggtaggga 234  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  25098 atagatcgtgattaggtaggga 25119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 25131 - 25163
Alignment:
Q  231 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25131 gggaatgcaccttccaactacatcaattgtctt 25163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Original strand, 63968 - 64095
Alignment:
Q  11 cagagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||    
T  63968 cagagacacaaggagggtggagcacgttcggtataaatgtccaacgctcgacaaggg-agagtatcattcagttgagtggaatcaatgaacgacgaaaac 64066  T
Q  111 gtgaagaacatgttttgggagcacaacat 139  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||    
T  64067 gtgacgagcatgttttgggagcacaacat 64095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 168 - 263
Target Start/End: Original strand, 64098 - 64194
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  64098 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtagggtaaggtacattccaactacaacaattgtctt 64194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 5453 - 5561
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtg 222  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||   || |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  5453 ttttggcagcacaacatgttcccatggatcaatatgtttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacagtttgatttcgccagaagatcgag 5552  T
Q  223 attaggtag 231  Q
    |||||||||    
T  5553 attaggtag 5561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 263
Target Start/End: Original strand, 85462 - 85571
Alignment:
Q  155 tatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaa 253  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| || |  | ||||||||||||    
T  85462 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattcagccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaa 85561  T
Q  254 caattgtctt 263  Q
    ||||||||||    
T  85562 caattgtctt 85571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Original strand, 14616 - 14713
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  14616 gttgcttagatcaacttaagatttcatcaaaagtatgataccgccataagatcgtcgttagttagggtaacgtgcattccaactacaacaattgtctt 14713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 36775 - 36860
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtatgattccgccagaa 215  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||    
T  36775 agcacatcatgttcccgtggatcgatatgcttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaagagtttaattccgctagaa 36860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 36649 - 36742
Alignment:
Q  13 gagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacga 106  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||  |||||||| || |||||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  36649 gagacacatggaacgtggaatacgtttggtatgaacgtcccacgtttgatgaggggagaataacattcagttggccggagttaacgaacgacga 36742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 108001 - 108033
Alignment:
Q  231 gggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  108001 gggaatgcaccttccaactacaacaattatctt 108033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University