View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4244_low_11 (Length: 386)

Name: NF4244_low_11
Description: NF4244
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4244_low_11
NF4244_low_11
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (108-376)||(33342102-33342370)
chr6 (108-376)||(34164761-34165029)
chr6 (108-376)||(34166983-34167251)
chr6 (108-376)||(6027151-6027418)
chr6 (108-376)||(25421208-25421477)
chr6 (108-376)||(16554772-16555040)
chr6 (108-376)||(16631328-16631596)
chr6 (108-376)||(16653015-16653283)
chr6 (108-365)||(27647777-27648031)
chr6 (108-376)||(16578515-16578783)
chr6 (108-376)||(16616597-16616865)
chr6 (108-308)||(13153886-13154086)
chr6 (108-365)||(412016-412273)
chr6 (108-365)||(3072756-3073014)
chr6 (108-365)||(6097448-6097695)
chr6 (108-365)||(2171529-2171792)
chr6 (108-362)||(31404672-31404932)
chr6 (108-358)||(16452326-16452583)
chr6 (114-362)||(30834539-30834794)
chr6 (108-362)||(5406197-5406456)
chr6 (108-362)||(5410522-5410781)
chr6 (118-281)||(5413401-5413561)
chr6 (114-281)||(21588931-21589095)
chr6 (114-281)||(21593664-21593828)
chr6 (118-189)||(5409076-5409146)
chr6 (114-281)||(17762990-17763155)
chr6 (108-281)||(33160349-33160521)
chr6 (108-189)||(3808705-3808785)
chr6 (116-362)||(16568953-16569184)
chr6 (114-278)||(17758026-17758188)
chr6 (114-281)||(2972943-2973107)
chr6 (122-281)||(28137420-28137576)
chr6 (116-281)||(9183037-9183199)
chr6 (114-189)||(26830127-26830200)
chr6 (116-189)||(33211191-33211262)
chr6 (118-189)||(26800679-26800748)
chr6 (114-189)||(5043718-5043792)
chr6 (114-281)||(22424829-22424995)
chr6 (120-189)||(26954296-26954363)
chr6 (208-281)||(3038998-3039071)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (108-376)||(5138193-5138461)
chr4 (108-376)||(5135967-5136236)
chr4 (108-376)||(8395508-8395774)
chr4 (108-376)||(8393299-8393565)
chr4 (108-376)||(7124804-7125073)
chr4 (109-376)||(7122585-7122853)
chr4 (108-349)||(31495313-31495556)
chr4 (108-362)||(13992290-13992544)
chr4 (114-362)||(29999809-30000063)
chr4 (108-349)||(56178634-56178882)
chr4 (108-281)||(48143042-48143214)
chr4 (109-281)||(52095361-52095530)
chr4 (108-267)||(5370080-5370237)
chr4 (114-281)||(41964415-41964580)
chr4 (108-277)||(2209717-2209885)
chr4 (109-261)||(12119559-12119709)
chr4 (114-281)||(41639426-41639590)
chr4 (116-281)||(47038417-47038577)
chr4 (119-281)||(9927467-9927626)
chr4 (114-281)||(46703500-46703666)
chr4 (114-189)||(50673851-50673924)
chr4 (116-281)||(12739556-12739718)
chr4 (116-274)||(5207848-5208003)
chr4 (114-189)||(6656047-6656120)
chr4 (114-189)||(8648230-8648303)
chr4 (116-281)||(26364236-26364398)
chr4 (116-281)||(40632445-40632607)
chr4 (131-189)||(8665499-8665556)
chr4 (120-281)||(37229731-37229890)
chr4 (118-179)||(379480-379541)
chr4 (114-281)||(12073392-12073557)
chr4 (116-189)||(26175642-26175713)
chr4 (116-189)||(48893644-48893715)
chr4 (116-262)||(12743931-12744073)
chr4 (116-262)||(12745320-12745462)
chr4 (116-255)||(26699447-26699585)
chr4 (116-179)||(6542185-6542247)
chr4 (116-281)||(34570420-34570582)
chr4 (116-281)||(36463395-36463557)
chr4 (116-281)||(36994524-36994686)
chr4 (116-281)||(54883020-54883182)
chr4 (119-189)||(35662532-35662600)
chr4 (116-189)||(5429770-5429841)
chr4 (116-189)||(5871911-5871982)
chr4 (116-279)||(46147397-46147557)
chr4 (108-189)||(50262698-50262778)
chr4 (119-179)||(27416974-27417033)
chr4 (119-281)||(37740625-37740784)
chr4 (116-281)||(45687188-45687351)
chr4 (116-180)||(52467360-52467423)
chr4 (116-226)||(4588014-4588121)
chr4 (108-154)||(52082661-52082707)
chr4 (208-281)||(54200001-54200074)
chr4 (116-189)||(31474242-31474313)
chr4 (137-193)||(33089966-33090021)
chr4 (135-226)||(33989899-33989989)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (108-376)||(16546534-16546802)
chr5 (108-376)||(16544312-16544580)
chr5 (108-376)||(40379995-40380262)
chr5 (108-376)||(40382206-40382473)
chr5 (108-376)||(25078023-25078292)
chr5 (108-376)||(25135992-25136261)
chr5 (108-376)||(10593161-10593429)
chr5 (108-369)||(22536287-22536545)
chr5 (108-365)||(29751157-29751414)
chr5 (108-365)||(29720278-29720535)
chr5 (108-365)||(29722438-29722695)
chr5 (108-365)||(9789221-9789478)
chr5 (108-365)||(16409389-16409646)
chr5 (108-365)||(18441645-18441902)
chr5 (108-365)||(26177797-26178053)
chr5 (108-362)||(25412672-25412931)
chr5 (108-365)||(26170688-26170933)
chr5 (108-362)||(13342971-13343231)
chr5 (108-362)||(30182499-30182759)
chr5 (108-362)||(36074040-36074302)
chr5 (108-262)||(37439161-37439312)
chr5 (109-349)||(13239674-13239921)
chr5 (114-281)||(213465-213630)
chr5 (114-281)||(40147261-40147425)
chr5 (109-281)||(28278316-28278485)
chr5 (116-281)||(32636824-32636986)
chr5 (114-189)||(5058136-5058209)
chr5 (134-281)||(13695713-13695859)
chr5 (116-281)||(13488203-13488365)
chr5 (118-362)||(30682930-30683178)
chr5 (116-281)||(42428436-42428598)
chr5 (114-189)||(27637616-27637689)
chr5 (132-179)||(16640961-16641008)
chr5 (116-179)||(19806463-19806525)
chr5 (116-189)||(16452171-16452242)
chr5 (116-189)||(28750661-28750732)
chr5 (116-176)||(4160702-4160762)
chr5 (116-362)||(31182883-31183133)
chr5 (114-189)||(27015614-27015687)
chr5 (116-189)||(533860-533931)
chr5 (120-189)||(8565956-8566023)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (108-376)||(4598520-4598788)
chr3 (108-376)||(10056122-10056390)
chr3 (108-376)||(10058344-10058612)
chr3 (108-376)||(10060566-10060834)
chr3 (108-376)||(10062788-10063056)
chr3 (108-376)||(10065010-10065278)
chr3 (108-376)||(10211298-10211566)
chr3 (108-376)||(4600741-4601009)
chr3 (108-376)||(10209078-10209346)
chr3 (108-376)||(25637331-25637598)
chr3 (108-376)||(3617352-3617621)
chr3 (108-365)||(6716414-6716670)
chr3 (108-365)||(54635039-54635295)
chr3 (108-365)||(45282897-45283157)
chr3 (177-376)||(10067232-10067431)
chr3 (108-365)||(801005-801263)
chr3 (108-316)||(7780001-7780208)
chr3 (247-365)||(6718598-6718718)
chr3 (108-365)||(23200135-23200398)
chr3 (108-365)||(23197936-23198199)
chr3 (108-362)||(45095075-45095334)
chr3 (108-362)||(5258141-5258402)
chr3 (108-362)||(9636123-9636385)
chr3 (108-362)||(5260320-5260581)
chr3 (108-281)||(7762265-7762436)
chr3 (108-278)||(19683886-19684054)
chr3 (108-281)||(37408458-37408629)
chr3 (108-362)||(9581193-9581453)
chr3 (116-281)||(4569952-4570115)
chr3 (108-270)||(7764476-7764635)
chr3 (108-281)||(34491212-34491382)
chr3 (116-278)||(39153367-39153526)
chr3 (108-189)||(43403741-43403821)
chr3 (108-281)||(49199466-49199638)
chr3 (116-281)||(29196392-29196555)
chr3 (114-189)||(6095603-6095676)
chr3 (108-281)||(43401798-43401970)
chr3 (108-150)||(10067435-10067477)
chr3 (120-277)||(30236129-30236283)
chr3 (116-281)||(40734498-40734660)
chr3 (116-281)||(44331545-44331707)
chr3 (114-189)||(54593795-54593868)
chr3 (118-278)||(22835010-22835167)
chr3 (116-189)||(16499120-16499191)
chr3 (116-189)||(40735474-40735545)
chr3 (114-281)||(41819526-41819691)
chr3 (119-178)||(27305719-27305777)
chr3 (119-279)||(31314447-31314604)
chr3 (131-278)||(760850-760995)
chr3 (116-177)||(40913395-40913455)
chr3 (116-189)||(47304342-47304413)
chr3 (118-226)||(53921511-53921616)
chr3 (114-179)||(55301975-55302040)
chr3 (116-362)||(29682269-29682521)
chr3 (120-179)||(46173457-46173515)
chr3 (194-281)||(51352191-51352278)
chr3 (208-281)||(5236551-5236624)
chr3 (131-189)||(29810959-29811016)
chr3 (116-262)||(29813083-29813225)
chr3 (122-179)||(46860574-46860631)
chr3 (208-281)||(5433971-5434046)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (108-376)||(15290427-15290695)
chr8 (108-376)||(15470796-15471064)
chr8 (108-376)||(42575321-42575589)
chr8 (108-369)||(25689865-25690125)
chr8 (108-365)||(3439418-3439674)
chr8 (114-365)||(2627649-2627901)
chr8 (108-362)||(17982563-17982824)
chr8 (108-362)||(34254328-34254586)
chr8 (108-362)||(31218167-31218428)
chr8 (108-281)||(42498193-42498365)
chr8 (108-362)||(34256504-34256762)
chr8 (108-362)||(44303764-44304026)
chr8 (108-262)||(1746216-1746366)
chr8 (108-281)||(19945356-19945529)
chr8 (114-281)||(42434995-42435159)
chr8 (116-281)||(15212786-15212948)
chr8 (114-281)||(4283524-4283688)
chr8 (116-279)||(40321082-40321242)
chr8 (114-189)||(18655491-18655564)
chr8 (116-281)||(33352150-33352312)
chr8 (116-281)||(43036423-43036585)
chr8 (116-189)||(4743220-4743291)
chr8 (131-190)||(1345391-1345449)
chr8 (116-179)||(10930205-10930267)
chr8 (116-281)||(27811278-27811440)
chr8 (116-179)||(40221845-40221907)
chr8 (116-189)||(3303676-3303747)
chr8 (116-189)||(5689362-5689433)
chr8 (116-263)||(12702640-12702783)
chr8 (137-189)||(40328871-40328922)
chr8 (116-179)||(4733806-4733868)
chr8 (116-226)||(6599027-6599134)
chr8 (116-226)||(6674480-6674587)
chr8 (242-281)||(8965820-8965859)
chr8 (117-226)||(41366622-41366727)
chr8 (114-179)||(11384085-11384149)
chr8 (117-189)||(18141911-18141981)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (108-376)||(3723-3990)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (108-376)||(6594555-6594822)
chr7 (108-376)||(6592337-6592604)
chr7 (108-376)||(18388757-18389024)
chr7 (108-376)||(18392193-18392460)
chr7 (108-376)||(32060319-32060590)
chr7 (108-365)||(20343811-20344067)
chr7 (108-365)||(24789755-24790012)
chr7 (210-376)||(1562103-1562268)
chr7 (108-365)||(39731283-39731540)
chr7 (108-365)||(43504151-43504409)
chr7 (108-362)||(35853825-35854085)
chr7 (108-203)||(1560663-1560757)
chr7 (108-365)||(25766957-25767215)
chr7 (108-362)||(29990965-29991224)
chr7 (108-281)||(34310713-34310884)
chr7 (109-365)||(48408709-48408974)
chr7 (108-281)||(23555039-23555211)
chr7 (108-349)||(25615785-25616024)
chr7 (108-362)||(4178685-4178944)
chr7 (114-281)||(22269973-22270137)
chr7 (108-226)||(19502233-19502349)
chr7 (114-189)||(32358058-32358131)
chr7 (116-281)||(14069839-14070001)
chr7 (116-281)||(14379867-14380029)
chr7 (116-281)||(41317440-41317602)
chr7 (114-189)||(8359319-8359393)
chr7 (114-179)||(3259095-3259159)
chr7 (114-281)||(29608737-29608901)
chr7 (118-281)||(30024740-30024900)
chr7 (131-281)||(48491579-48491727)
chr7 (115-179)||(6432071-6432134)
chr7 (116-281)||(27347817-27347979)
chr7 (114-176)||(2390385-2390446)
chr7 (120-281)||(4253538-4253697)
chr7 (114-281)||(48599338-48599502)
chr7 (116-262)||(41649017-41649158)
chr7 (116-281)||(43864244-43864406)
chr7 (114-281)||(4508710-4508874)
chr7 (116-281)||(8153342-8153504)
chr7 (116-263)||(31732975-31733118)
chr7 (116-176)||(48489534-48489593)
chr7 (116-179)||(18396418-18396481)
chr7 (116-179)||(30814536-30814598)
chr7 (208-281)||(23343975-23344048)
chr7 (116-189)||(24525508-24525579)
chr7 (118-189)||(31518993-31519063)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (108-376)||(2601-2868)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (108-376)||(12647383-12647650)
chr2 (108-365)||(6266605-6266862)
chr2 (108-302)||(13656029-13656221)
chr2 (108-365)||(32289479-32289735)
chr2 (108-365)||(4484327-4484592)
chr2 (108-362)||(45099665-45099925)
chr2 (108-365)||(30833252-30833517)
chr2 (108-362)||(4503130-4503390)
chr2 (108-362)||(36205662-36205921)
chr2 (108-362)||(5723253-5723512)
chr2 (108-281)||(2334415-2334586)
chr2 (108-189)||(36988073-36988153)
chr2 (108-262)||(6595003-6595154)
chr2 (116-276)||(33648176-33648335)
chr2 (114-281)||(45726929-45727093)
chr2 (116-349)||(34139776-34140017)
chr2 (116-281)||(29867869-29868031)
chr2 (114-189)||(35446888-35446961)
chr2 (116-263)||(723750-723893)
chr2 (119-226)||(14633834-14633939)
chr2 (109-281)||(24398055-24398228)
chr2 (114-189)||(1631736-1631809)
chr2 (116-189)||(17057375-17057446)
chr2 (116-189)||(17085358-17085429)
chr2 (116-352)||(38312159-38312402)
chr2 (131-362)||(42362262-42362500)
chr2 (116-179)||(39284936-39284998)
chr2 (116-177)||(11151597-11151657)
chr2 (116-189)||(17490154-17490225)
chr2 (116-189)||(36318015-36318086)
chr2 (116-189)||(36773653-36773724)
chr2 (108-179)||(17450678-17450747)
chr2 (207-281)||(13121769-13121843)
chr2 (122-174)||(28672036-28672088)
[»] chr1 (45 HSPs)
chr1 (108-376)||(44203536-44203803)
chr1 (108-376)||(9036320-9036587)
chr1 (108-365)||(21053872-21054129)
chr1 (108-365)||(40282291-40282548)
chr1 (108-365)||(9987116-9987372)
chr1 (108-365)||(20622234-20622492)
chr1 (108-282)||(13316349-13316521)
chr1 (108-365)||(51765302-51765568)
chr1 (108-278)||(8550784-8550952)
chr1 (108-362)||(20762582-20762843)
chr1 (108-281)||(3189330-3189501)
chr1 (108-281)||(3198147-3198318)
chr1 (108-281)||(3206986-3207157)
chr1 (114-281)||(37168297-37168462)
chr1 (114-281)||(29136247-29136412)
chr1 (114-281)||(13547093-13547257)
chr1 (114-189)||(13549004-13549077)
chr1 (116-281)||(44455160-44455322)
chr1 (108-189)||(42297972-42298052)
chr1 (114-281)||(47255343-47255508)
chr1 (114-281)||(7482234-7482399)
chr1 (114-189)||(11348789-11348862)
chr1 (116-281)||(28220232-28220394)
chr1 (116-278)||(834173-834332)
chr1 (114-189)||(28242396-28242469)
chr1 (116-281)||(3156865-3157027)
chr1 (116-226)||(4552643-4552750)
chr1 (116-262)||(28265560-28265702)
chr1 (114-189)||(31925711-31925784)
chr1 (114-281)||(47115171-47115337)
chr1 (114-179)||(193711-193775)
chr1 (116-189)||(13659342-13659413)
chr1 (108-189)||(37033069-37033149)
chr1 (120-281)||(49918350-49918508)
chr1 (115-189)||(34603668-34603740)
chr1 (209-262)||(6378603-6378655)
chr1 (116-189)||(28223427-28223498)
chr1 (116-189)||(45644360-45644431)
chr1 (116-189)||(46065009-46065080)
chr1 (135-226)||(22079371-22079461)
chr1 (139-226)||(5459961-5460046)
chr1 (116-179)||(31659338-31659400)
chr1 (131-189)||(23555286-23555342)
chr1 (116-189)||(19754586-19754657)
chr1 (114-179)||(37876770-37876834)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (108-376)||(6177-6444)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (109-362)||(434443-434703)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (108-365)||(11158-11423)
scaffold0491 (108-283)||(8732-8907)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (108-362)||(827-1086)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (108-281)||(11557-11728)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (108-281)||(114602-114773)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (114-262)||(18007-18151)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (116-179)||(10589-10651)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (116-189)||(149103-149174)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (108-143)||(1-36)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (114-189)||(7418-7491)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (116-189)||(20421-20492)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 33342102 - 33342370
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33342102 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaaga 33342201  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342202 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 33342301  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342302 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 33342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34165029 - 34164761
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34165029 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 34164930  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164929 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 34164830  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34164829 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34164761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34167251 - 34166983
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34167251 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaaga 34167152  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167151 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 34167052  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34167051 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34166983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6027418 - 6027151
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6027418 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 6027319  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027318 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 6027220  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027219 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6027151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25421477 - 25421208
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25421477 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 25421378  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25421377 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 25421279  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421278 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25421208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16555040 - 16554772
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16555040 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaa 16554942  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16554941 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 16554843  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16554842 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16554772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16631596 - 16631328
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16631596 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaa 16631498  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16631497 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 16631399  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16631398 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16631328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16653283 - 16653015
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  16653283 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaaaa 16653185  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16653184 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 16653086  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16653085 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16653015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27648031 - 27647777
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  27648031 gattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 27647934  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27647933 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacatgg 27647835  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647834 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 27647777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 16578515 - 16578783
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  16578515 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaaaa 16578613  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16578614 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 16578712  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16578713 cgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16578783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16616865 - 16616597
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  16616865 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaaaa 16616767  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16616766 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 16616668  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16616667 cgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16616597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 108 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13154086 - 13153886
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154086 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 13153987  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153986 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 13153887  T
Q  308 t 308  Q
    |    
T  13153886 t 13153886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 412273 - 412016
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  412273 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 412176  T
Q  208 --ggttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 302  Q
       |||||||||||||||  |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  412175 agagttacaagaaattagatttgataa-gttcacaatgaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctt 412078  T
Q  303 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  412077 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 412016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 3072756 - 3073014
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  3072756 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 3072853  T
Q  208 --ggttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 302  Q
       |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  3072854 agagttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaatgaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctt 3072951  T
Q  303 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  3072952 caaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 3073014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 6097448 - 6097695
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||              
T  6097448 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaag---------- 6097535  T
Q  208 ggttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctaca 304  Q
     |||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||  ||    
T  6097536 agttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaaagaac-aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcacca 6097633  T
Q  305 aggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097634 aggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6097695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 2171529 - 2171792
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||      
T  2171529 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaag 2171625  T
Q  208 ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  2171626 ggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 2171723  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2171724 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 2171792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 31404672 - 31404932
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  31404672 gattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 31404768  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  31404769 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttc 31404866  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     |||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31404867 actcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaacccta 31404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 358
Target Start/End: Original strand, 16452326 - 16452583
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||  ||  |||     
T  16452326 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttccaaagagatatgaaag- 16452423  T
Q  208 ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  16452424 ggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 16452521  T
Q  296 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaac 358  Q
    | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16452522 cactcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaac 16452583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 362
Target Start/End: Original strand, 30834539 - 30834794
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  |||||| | |||||    
T  30834539 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaaagggtta 30834635  T
Q  213 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctc 300  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||    
T  30834636 caagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 30834733  T
Q  301 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
      | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30834734 accgaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaacccta 30834794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 5406197 - 5406456
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  5406197 gattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 5406293  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  5406294 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5406391  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5406392 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5406456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 5410522 - 5410781
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  5410522 gattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 5410618  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  5410619 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5410716  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5410717 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5410781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 281
Target Start/End: Original strand, 5413401 - 5413561
Alignment:
Q  118 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggttacaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||||||    
T  5413401 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggttacaag 5413497  T
Q  217 aaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5413498 aaattagctttgacaa-gttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 5413561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21589095 - 21588931
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  21589095 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 21589000  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21588999 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21593828 - 21593664
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  21593828 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 21593733  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21593732 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 189
Target Start/End: Original strand, 5409076 - 5409146
Alignment:
Q  118 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5409076 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 5409146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17763155 - 17762990
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||   |||||  ||||||  | ||||    
T  17763155 tcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatc-aatgagttcttccaaaaag--atacaaatgagtta 17763059  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  17763058 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Original strand, 33160349 - 33160521
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  || ||||| |    
T  33160349 gattgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaaa 33160445  T
Q  208 g-gttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 281  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  33160446 gagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 33160521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 3808705 - 3808785
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3808705 gattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 3808785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16569184 - 16568953
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||            |||||||||    
T  16569184 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaa------------aggttacaa 16569100  T
Q  216 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct---acaaggtgtt 311  Q
    ||||||||||| |  | | |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||||||| || ||    |||||||||    
T  16569099 gaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtt 16569003  T
Q  312 tcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16569002 tacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 16568953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17758188 - 17758026
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  17758188 tcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 17758092  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 278  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17758091 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Original strand, 2972943 - 2973107
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  2972943 tcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 2973038  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2973039 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 281
Target Start/End: Original strand, 28137420 - 28137576
Alignment:
Q  122 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaagaaat 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  28137420 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagaaatacaaatgggttacaagaaat 28137515  T
Q  221 tagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  28137516 tagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 28137576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 9183037 - 9183199
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  9183037 acccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 9183132  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  |  ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  9183133 agaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 9183199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 26830127 - 26830200
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26830127 tcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 26830200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 33211191 - 33211262
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33211191 acccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctt 33211262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26800748 - 26800679
Alignment:
Q  118 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26800748 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttctt 26800679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5043792 - 5043718
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5043792 tcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttctt 5043718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Original strand, 22424829 - 22424995
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga---ggt 210  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||  |||||| |   |||    
T  22424829 tcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaaatgggt 22424924  T
Q  211 tacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22424925 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 189
Target Start/End: Original strand, 26954296 - 26954363
Alignment:
Q  120 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26954296 agttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 26954363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 281
Target Start/End: Original strand, 3038998 - 3039071
Alignment:
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||||||| | || | |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3038998 ggttacaagaaattagcttcaaaaagctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5138461 - 5138193
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138461 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 5138362  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138361 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 5138262  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138261 tatttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5138193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5136236 - 5135967
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136236 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 5136137  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136136 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 5136037  T
Q  308 tgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136036 tatttcccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5135967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8395774 - 8395508
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  8395774 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaa 8395676  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395675 ggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 8395577  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395576 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 8395508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8393565 - 8393299
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  8393565 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaa 8393467  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393466 ggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 8393368  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8393367 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccataaaccctagagcttcccctttg 8393299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7125073 - 7124804
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125073 gattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 7124974  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaa 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7124973 ggttacaagaaattagtttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 7124875  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124874 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7124804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 109 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7122853 - 7122585
Alignment:
Q  109 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag 208  Q
    |||| |||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122853 attgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag 7122754  T
Q  209 gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaag 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  7122753 gttacaagaaattagtttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaag 7122655  T
Q  307 gtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122654 gtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7122585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 349
Target Start/End: Original strand, 31495313 - 31495556
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  31495313 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 31495410  T
Q  208 --ggttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 302  Q
       |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  31495411 agagttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaatgaac-aatcctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctt 31495508  T
Q  303 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 349  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31495509 caaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaaga 31495556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 13992290 - 13992544
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||| |    
T  13992290 gattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaagag--atacaaaa 13992385  T
Q  208 g-gttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctct 301  Q
    | |||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||     
T  13992386 gagttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttcactca 13992483  T
Q  302 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13992484 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 13992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 362
Target Start/End: Original strand, 29999809 - 30000063
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||| || ||||    
T  29999809 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaaagatacaaaagagtta 29999906  T
Q  213 caagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctcta 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||| ||  ||| |||      
T  29999907 caagaaattagctttgac-atgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcac 30000004  T
Q  303 caaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30000005 caaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 30000063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 349
Target Start/End: Original strand, 56178634 - 56178882
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  56178634 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 56178730  T
Q  208 -ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     ||||||||||||||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  56178731 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 56178829  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 349  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  56178830 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 56178882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 48143214 - 48143042
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||   || ||  |||||| |    
T  48143214 gattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttatgaagag--atacaaaa 48143118  T
Q  208 -ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 281  Q
     ||||||||||||||||||| |  | |||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  48143117 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 48143042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 281
Target Start/End: Original strand, 52095361 - 52095530
Alignment:
Q  109 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aaga 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  |||| ||      
T  52095361 attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gatttc-ttac-aaagagatacaaatg 52095456  T
Q  208 ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  52095457 ggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 52095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 5370080 - 5370237
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  5370080 gattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 5370176  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc--ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 267  Q
     |||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5370177 gggttacaagaaattagcttttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacctcttt 5370237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |  ||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaaatgggtt 41964485  T
Q  212 acaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||| |||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  41964484 acaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2209885 - 2209717
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  2209885 gattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 2209789  T
Q  208 --ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 277  Q
      ||||||||||||||||||| |  | | |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2209788 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12119709 - 12119559
Alignment:
Q  109 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag 208  Q
    |||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||    
T  12119709 attgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttacaaagaga-tacaaaag 12119613  T
Q  209 g-ttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctac 261  Q
    | ||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12119612 ggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctac 12119559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 41639590 - 41639426
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||  | |||| ||  |||||    
T  41639590 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttc-ttacaaatag-atacaaatgggtta 41639495  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| | || |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  41639494 caagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 47038417 - 47038577
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 215  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||  | ||||||  | ||||||    
T  47038417 acccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgag-tccttacaaacag-atacaaatgattacaa 47038512  T
Q  216 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||| |  | | |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47038513 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 281
Target Start/End: Original strand, 9927467 - 9927626
Alignment:
Q  119 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaaga 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  ||||||||||    
T  9927467 cagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 9927562  T
Q  218 aattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9927563 aattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9927626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 46703666 - 46703500
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 211  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||| |  ||||    
T  46703666 tcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 46703570  T
Q  212 acaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||| |  | | |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  46703569 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 50673851 - 50673924
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50673851 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 50673924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 12739556 - 12739718
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  | |||| ||  |||||||    
T  12739556 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-atacaaatag-atacaaatgggttaca 12739651  T
Q  215 agaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12739652 agaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 274
Target Start/End: Original strand, 5207848 - 5208003
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagga-atacaagaggttaca 214  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||||| |||| ||    
T  5207848 acccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaatagatatacaag-ggttgca 5207943  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatc 274  Q
    | |||||||||| |  | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5207944 ataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6656120 - 6656047
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6656120 tcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 6656047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8648303 - 8648230
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8648303 tcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttctt 8648230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26364398 - 26364236
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 214  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||  || |||||  | ||||||    
T  26364398 acccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaatgagttaca 26364303  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26364302 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 40632607 - 40632445
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||||    
T  40632607 acccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggttaca 40632512  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | | |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40632511 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665499
Alignment:
Q  131 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 8665499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 281
Target Start/End: Original strand, 37229731 - 37229890
Alignment:
Q  120 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa-aggaatacaagaggttacaagaa 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||| ||  |||||||| ||    
T  37229731 agttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttc-ttacaaagagatataaaaagggttacaacaa 37229827  T
Q  219 attagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||| |||| |  | | |||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37229828 atttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 379541 - 379480
Alignment:
Q  118 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  379541 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 379480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12073557 - 12073392
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 212  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||    
T  12073557 tcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagtta 12073461  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||| |||||||||| |  | | |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12073460 caataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 26175642 - 26175713
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26175642 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 26175713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 48893644 - 48893715
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48893644 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctt 48893715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 262
Target Start/End: Original strand, 12743931 - 12744073
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  12743931 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 12744026  T
Q  215 agaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 262  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12744027 agaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 262
Target Start/End: Original strand, 12745320 - 12745462
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  12745320 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 12745415  T
Q  215 agaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 262  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12745416 agaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 255
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699585
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 214  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   |||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctttac-aaagagatacaaaagagttaca 26699544  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaat 255  Q
    |||||||||||| |  | | |||| | ||||||||||||||    
T  26699545 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaat 26699585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Original strand, 6542185 - 6542247
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  6542185 acccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 6542247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 34570420 - 34570582
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaa-gaggttaca 214  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||   |||||||    
T  34570420 acccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaattgggttaca 34570515  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | |||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  34570516 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 34570582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 36463395 - 36463557
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  36463395 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 36463490  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36463491 agaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36994686 - 36994524
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  |||||||    
T  36994686 acccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttaca 36994591  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | | |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36994590 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 54883182 - 54883020
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  54883182 acccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 54883087  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54883086 agaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662532
Alignment:
Q  119 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 35662532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5429841 - 5429770
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5429841 acccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 5429770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5871982 - 5871911
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5871982 acccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaa-gagttctt 5871911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 279
Target Start/End: Original strand, 46147397 - 46147557
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  46147397 acccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 46147492  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 279  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  46147493 agaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 50262698 - 50262778
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||   ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  50262698 gattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatc-aatgagttctt 50262778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 179
Target Start/End: Original strand, 27416974 - 27417033
Alignment:
Q  119 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27416974 cagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 27417033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37740784 - 37740625
Alignment:
Q  119 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaaga 217  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  ||||||||||    
T  37740784 cagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 37740689  T
Q  218 aattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||| |  | |||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  37740688 aattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 37740625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 45687188 - 45687351
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||  | |||| |    
T  45687188 acccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaatag-atacaaatgagttata 45687283  T
Q  215 agaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||| ||||||| | |||| | ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  45687284 agaaattagctttgacaa-gctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 180
Target Start/End: Original strand, 52467360 - 52467423
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  52467360 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaa 52467423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4588121 - 4588014
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggttaca 214  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||||    
T  4588121 acccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaagggttaca 4588026  T
Q  215 agaaattagctt 226  Q
    ||||||||||||    
T  4588025 agaaattagctt 4588014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 154
Target Start/End: Original strand, 52082661 - 52082707
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagag 154  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52082661 gattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagag 52082707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 281
Target Start/End: Original strand, 54200001 - 54200074
Alignment:
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54200001 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54200074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31474313 - 31474242
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||   |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31474313 acccagttcggtcc-aacttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatc-aatgagttctt 31474242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089966
Alignment:
Q  137 acctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttaca 193  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctttaca 33089966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  135 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagagg-ttacaagaaattagctt 226  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactat-taacgagttatttac-aaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16546802 - 16546534
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16546802 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 16546703  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546702 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 16546603  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546602 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16546534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16544580 - 16544312
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16544580 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 16544481  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544480 ggttatgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 16544381  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544380 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16544312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40380262 - 40379995
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40380262 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 40380163  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380162 ggttacaagaaattagtttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 40380064  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380063 tgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40379995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40382473 - 40382206
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40382473 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 40382374  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382373 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 40382275  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382274 tgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40382206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25078292 - 25078023
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25078292 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 25078193  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25078192 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 25078094  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078093 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25078023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25136261 - 25135992
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25136261 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 25136162  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25136161 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 25136063  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136062 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25135992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10593429 - 10593161
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  10593429 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaaaa 10593331  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10593330 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 10593232  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10593231 ggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttccccctttg 10593161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 108 - 369
Target Start/End: Original strand, 22536287 - 22536545
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  22536287 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 22536384  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22536385 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctgcaggg 22536483  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536484 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 22536545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 29751157 - 29751414
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  29751157 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 29751254  T
Q  208 ggttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctaca 304  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29751255 ggttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 29751353  T
Q  305 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751354 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29751414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29720535 - 29720278
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  29720535 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 29720438  T
Q  208 ggttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctaca 304  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29720437 ggttacaagaaattagattagacaa-gttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 29720339  T
Q  305 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720338 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29720278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29722695 - 29722438
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  29722695 gattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 29722598  T
Q  208 ggttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctaca 304  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29722597 ggttacaagaaattagattagacaa-gttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 29722499  T
Q  305 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722498 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29722438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 9789221 - 9789478
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  9789221 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 9789318  T
Q  208 g-gttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctac 303  Q
    | |||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |    
T  9789319 gagttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcacc 9789416  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  9789417 aaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 9789478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16409646 - 16409389
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  16409646 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 16409549  T
Q  208 g-gttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctac 303  Q
    | |||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |    
T  16409548 gagttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcacc 16409451  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  16409450 aaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 16409389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 18441645 - 18441902
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  18441645 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 18441742  T
Q  208 g-gttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctac 303  Q
    | |||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |    
T  18441743 gagttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaaggaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcacc 18441840  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  18441841 aaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 18441902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26178053 - 26177797
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  26178053 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 26177956  T
Q  208 g-gttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctac 303  Q
    | |||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |    
T  26177955 gagttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcacc 26177859  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  26177858 aaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 26177797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25412931 - 25412672
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  25412931 gattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 25412835  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  25412834 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 25412737  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412736 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 25412672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26170933 - 26170688
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||              
T  26170933 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaag---------- 26170846  T
Q  208 ggttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctaca 304  Q
     |||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||    
T  26170845 agttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaaagaac-aatcctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcacca 26170749  T
Q  305 aggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||    
T  26170748 aggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctgtaatcaaag-actctaaaccctagag 26170688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13343231 - 13342971
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||  |||||| |    
T  13343231 gattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaaa 13343136  T
Q  208 gg-ttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 294  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  13343135 ggattacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 13343038  T
Q  295 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13343037 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcagag-accctaaacccta 13342971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30182759 - 30182499
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  ||| || |    
T  30182759 gattgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatagaaaa 30182663  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 295  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  30182662 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 30182565  T
Q  296 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30182564 cactcaccaaggtgtttgcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaatcccta 30182499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 36074040 - 36074302
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||  |||||| |    
T  36074040 gattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaaa 36074135  T
Q  208 g-gttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc----ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga- 293  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||       |||||||||||||||     
T  36074136 gagttacaagaaattagctttgacaa-gttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 36074233  T
Q  294 -ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074234 tttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37439312 - 37439161
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| |    
T  37439312 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaaa 37439216  T
Q  208 g-gttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 262  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  37439215 gagttacaagaaattaactttgacaa-gttcacaaagaacaa-ccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13239921 - 13239674
Alignment:
Q  109 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| ||    
T  13239921 attgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaaag 13239825  T
Q  209 -gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttct 297  Q
     |||||||||||||||||| |  | |||||| | ||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||       |||||||||||||||  |||     
T  13239824 agttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 13239726  T
Q  298 ctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 349  Q
    |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13239725 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 13239674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 213630 - 213465
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  213630 tcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 213534  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  213533 caagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 40147425 - 40147261
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||    
T  40147425 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagtta 40147330  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40147329 caagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 28278485 - 28278316
Alignment:
Q  109 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aaga 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||| ||      
T  28278485 attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaatg 28278390  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28278389 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 32636986 - 32636824
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  32636986 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 32636891  T
Q  215 agaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32636890 agaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 32636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5058209 - 5058136
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5058209 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 5058136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 281
Target Start/End: Original strand, 13695713 - 13695859
Alignment:
Q  134 ttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagagg-ttacaagaaattagcttgacaat 232  Q
    |||||||||| ||||||||||  |   ||||| |||||||||| || |||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||| |  |     
T  13695713 ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaa-tgagttctttacaaagaga-tacaaaagggttacaagaaattagctttaacaa 13695810  T
Q  233 gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    | |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13695811 gctcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13488365 - 13488203
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  13488365 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 13488270  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13488269 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 13488203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 362
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683178
Alignment:
Q  118 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagt-tctttacaaaaggaatacaaga-ggttacaa 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtattcttac-aaagaaatacaaaagggttacaa 30683026  T
Q  216 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttctctctacaa 305  Q
    ||||||||||| |  | ||||||    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||| |||  |||    
T  30683027 gaaattagcttcaacaagttcac----aaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaa 30683122  T
Q  306 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30683123 ggtgtttacaatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 30683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 42428436 - 42428598
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  42428436 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 42428531  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | |||||| | ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42428532 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 42428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 27637616 - 27637689
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27637616 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttctt 27637689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Original strand, 16640961 - 16641008
Alignment:
Q  132 acttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16640961 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 16641008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19806525 - 19806463
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19806525 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 19806463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16452242 - 16452171
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16452242 acccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactat-gaatgagttctt 16452171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 28750661 - 28750732
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28750661 acccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 28750732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactat 176  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31183133 - 31182883
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| | |  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||    
T  31183133 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaa-tgagttctt-acaaaggga-tacaaatggttacaa 31183038  T
Q  216 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ac--aa 305  Q
    ||||||| ||| |  |   |||| | |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || || ||  ||    
T  31183037 gaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaa 31182939  T
Q  306 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31182938 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 31182883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27015687 - 27015614
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||  || | |||||||||||| |||||||||||    
T  27015687 tcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatc-aatgagttctt 27015614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 533931 - 533860
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  533931 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttctt 533860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 189
Target Start/End: Original strand, 8565956 - 8566023
Alignment:
Q  120 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8565956 agttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 8566023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 4598520 - 4598788
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598520 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 4598619  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4598620 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaggg 4598719  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4598720 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 4598788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10056390 - 10056122
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056390 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 10056291  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056290 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 10056191  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10056190 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10056122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10058612 - 10058344
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058612 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 10058513  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058512 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 10058413  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10058412 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10058344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10060834 - 10060566
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060834 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 10060735  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060734 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 10060635  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10060634 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10060566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10063056 - 10062788
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10063056 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 10062957  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062956 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 10062857  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10062856 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10062788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10065278 - 10065010
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065278 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 10065179  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065178 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 10065079  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10065078 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10065010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10211566 - 10211298
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211566 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 10211467  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211466 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 10211367  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10211366 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 10211298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 4600741 - 4601009
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4600741 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaa 4600840  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600841 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 4600940  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4600941 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 4601009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10209346 - 10209078
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10209346 gattggtcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaaga 10209247  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209246 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 10209147  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10209146 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 10209078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25637598 - 25637331
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25637598 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 25637499  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637498 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 25637400  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25637399 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagatacccctttg 25637331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3617621 - 3617352
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3617621 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 3617522  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  3617521 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 3617423  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617422 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3617352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6716670 - 6716414
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |    
T  6716670 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaa 6716573  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6716572 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 6716474  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716473 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6716414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 54635295 - 54635039
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |    
T  54635295 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaa 54635198  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  54635197 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 54635099  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635098 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 54635039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45283157 - 45282897
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt--tacaaaaggaatacaa 205  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  45283157 gattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaa 45283058  T
Q  206 gaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tac 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  45283057 aaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttgc 45282959  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282958 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 45282897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 177 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10067431 - 10067232
Alignment:
Q  177 caaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067431 caaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 10067332  T
Q  277 accaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10067331 accaagacactcaatgattctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10067232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 801263 - 801005
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  801263 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 801166  T
Q  208 --ggttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 302  Q
       |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  801165 agagttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctt 801068  T
Q  303 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  801067 caaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 801005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 316
Target Start/End: Original strand, 7780001 - 7780208
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  7780001 gattgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 7780098  T
Q  208 ggttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctaca 304  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||    
T  7780099 ggttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttca 7780196  T
Q  305 aggtgtttccca 316  Q
    ||||||||||||    
T  7780197 aggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718598
Alignment:
Q  247 aaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  345 aaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagag 6718598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 23200135 - 23200398
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  23200135 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttc-ttacaaaaag-atacaaaa 23200231  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||      |||||||||||||||  |||    
T  23200232 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttc 23200329  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23200330 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23200398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 23197936 - 23198199
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  23197936 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttc-ttacaaaaag-atacaaaa 23198032  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||      |||||||||||||||  |||    
T  23198033 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttc 23198130  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23198131 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23198199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45095334 - 45095075
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  45095334 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 45095238  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  45095237 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 45095140  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45095139 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 5258141 - 5258402
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  |||||| |    
T  5258141 gattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaaa 5258237  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 294  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  5258238 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 5258335  T
Q  295 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5258336 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5258402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 9636123 - 9636385
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  9636123 gattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaag-atacaaaa 9636219  T
Q  208 -ggttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctc-------accaagacactcaatga--t 294  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||       |||||||||||||||||  |    
T  9636220 gggttacaagaaattagttttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattt 9636317  T
Q  295 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    || |||  |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9636318 tcactcaccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 9636385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 5260320 - 5260581
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  |||||| |    
T  5260320 gattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaaa 5260416  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctc-------accaagacactcaatga--t 294  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||       |||||||||||||||||  |    
T  5260417 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattt 5260514  T
Q  295 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5260515 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5260581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7762436 - 7762265
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| |    
T  7762436 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaaa 7762340  T
Q  208 g-gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    | |||||||||||||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  7762339 gagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 7762265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 278
Target Start/End: Original strand, 19683886 - 19684054
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  19683886 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 19683982  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 278  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19683983 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 19684054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37408629 - 37408458
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  37408629 gattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 37408533  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37408532 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 37408458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9581453 - 9581193
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aag 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||     
T  9581453 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaat 9581357  T
Q  207 aggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 299  Q
     ||||| ||||||||||||| |  | | |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||       ||||||||||||||||| ||     
T  9581356 gggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttca 9581258  T
Q  300 ct---acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9581257 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 9581193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4570115 - 4569952
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  4570115 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagttaca 4570019  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4570018 agaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7764635 - 7764476
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| |    
T  7764635 gattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaaa 7764539  T
Q  208 g-gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttccc 270  Q
    | |||||||||||||||||| |  | |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7764538 gagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttccc 7764476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 34491382 - 34491212
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||      
T  34491382 gattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaat 34491287  T
Q  208 g-gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    | |||||||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34491286 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 278
Target Start/End: Original strand, 39153367 - 39153526
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 214  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    ||||| ||||||  | ||||||    
T  39153367 acccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttctt--ataaagggatacaaatgagttaca 39153462  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 278  Q
    |||||||||||| |  | | |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39153463 agaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 39153526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 43403741 - 43403821
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43403741 gattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttctt 43403821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Original strand, 49199466 - 49199638
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  49199466 gattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 49199562  T
Q  208 --ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
      ||||||||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  49199563 tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 29196392 - 29196555
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||| ||    
T  29196392 acccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttcca 29196487  T
Q  215 agaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29196488 agaaattagctttgacaa-gctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 6095603 - 6095676
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6095603 tcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 6095676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Original strand, 43401798 - 43401970
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa-aggaatacaag 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  | | ||     
T  43401798 gattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaagagataaaaaat 43401895  T
Q  207 aggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
      |||||||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43401896 gcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10067477 - 10067435
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067477 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30236283 - 30236129
Alignment:
Q  120 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaagaa 218  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||||||||    
T  30236283 agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggttacaagaa 30236188  T
Q  219 attagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 277  Q
    |||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30236187 attagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 40734660 - 40734498
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||  | ||||||    
T  40734660 acccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgtgttaca 40734565  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||| || |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40734564 agaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 44331707 - 44331545
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagagg-ttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  ||||||  || |||||    
T  44331707 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttc-ttac-aaagagatacaaatggcttaca 44331612  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  44331611 agaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 44331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 54593868 - 54593795
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54593868 tcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 54593795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 278
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835167
Alignment:
Q  118 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaag 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  |||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttacaag 22835105  T
Q  217 aaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 278  Q
    |||||||||| |  | | |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22835106 aaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16499191 - 16499120
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16499191 acccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 16499120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40735545 - 40735474
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40735545 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 40735474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Original strand, 41819526 - 41819691
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 211  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||  |||||| |  ||||    
T  41819526 tcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat--aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 41819621  T
Q  212 acaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41819622 acaagaaattagcttagacaa-gctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 178
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  119 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatca 178  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31314604 - 31314447
Alignment:
Q  119 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaaga 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||  ||||||||||    
T  31314604 cagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaaag-atacaaatgggttacaaga 31314509  T
Q  218 aattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 279  Q
    ||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  31314508 aattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 760995 - 760850
Alignment:
Q  131 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaagaaattagcttgac 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |     
T  760995 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaa 760899  T
Q  230 aatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 278  Q
     | | |||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  760898 caagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcac 760850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40913455 - 40913395
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatc 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  40913455 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc 40913395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 47304413 - 47304342
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47304413 acccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 47304342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 226
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921616
Alignment:
Q  118 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttacaag 216  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  | ||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaaatga-tacaaatgagttacaag 53921606  T
Q  217 aaattagctt 226  Q
    ||||||||||    
T  53921607 aaattagctt 53921616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Original strand, 55301975 - 55302040
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  55301975 tcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 55302040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29682521 - 29682269
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  ||| |||    
T  29682521 acccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggtgaca 29682426  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---ac 303  Q
    |||||||||||| |  | | |||| | ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |    
T  29682425 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactcaccc 29682327  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29682326 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 29682269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 46173515 - 46173457
Alignment:
Q  120 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  46173515 agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 46173457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 281
Target Start/End: Original strand, 51352191 - 51352278
Alignment:
Q  194 aaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| ||| | || | |||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  51352191 aaagaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccctaacttctatcattttcctaatctcaccaa 51352278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 281
Target Start/End: Original strand, 5236551 - 5236624
Alignment:
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5236551 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5236624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29811016 - 29810959
Alignment:
Q  131 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29811016 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 29810959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29813225 - 29813083
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 215  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||    ||  ||||||||    
T  29813225 acccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttc-ttacaaagagatgcaaatgggttacaa 29813129  T
Q  216 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 262  Q
    ||||||||||| |  | |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  29813128 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 29813083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 46860631 - 46860574
Alignment:
Q  122 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||    
T  46860631 ttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaa 46860574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 281
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434046
Alignment:
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||||||| |  | | |||| | |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15290695 - 15290427
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290695 gattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 15290596  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290595 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 15290496  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15290495 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 15290427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15471064 - 15470796
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471064 gattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 15470965  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470964 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 15470865  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15470864 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 15470796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 42575321 - 42575589
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575321 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 42575420  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575421 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 42575520  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42575521 tgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 42575589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 108 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25690125 - 25689865
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  25690125 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 25690028  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25690027 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 25689929  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689928 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 25689865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3439674 - 3439418
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  3439674 gattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 3439577  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaa 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  3439576 ggttacaagaaattagcttgccaa-gttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctttacaa 3439478  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439477 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 3439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2627901 - 2627649
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagagg--tt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||| | |  ||    
T  2627901 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttctt-acacaagagatacaaaaagagtt 2627804  T
Q  212 acaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggt 308  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  2627803 gcaagaaattagatttgacaa-gttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggt 2627706  T
Q  309 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  2627705 gtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 2627649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17982824 - 17982563
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  |||||| |    
T  17982824 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaaa 17982728  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 294  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  17982727 gggttacaagaaattaactttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 17982630  T
Q  295 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17982629 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 17982563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 34254328 - 34254586
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  |||||| |    
T  34254328 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttc-ttac-aaagagatacaaaa 34254424  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  34254425 gggttacaagaaattaactttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 34254522  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     |||  |||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34254523 actcaccaaggtgtttacaatgtctccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 34254586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31218428 - 31218167
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||  |||||| |    
T  31218428 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaaa 31218332  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 294  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  31218331 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 31218234  T
Q  295 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31218233 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 31218167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 42498365 - 42498193
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |    
T  42498365 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagaaatacaaaa 42498269  T
Q  208 -ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 281  Q
     ||||||||||||||||||| |  | |||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  42498268 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 42498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 34256504 - 34256762
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  34256504 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 34256600  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  34256601 gggttacaagaaattaactttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 34256698  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     | |  |||||||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34256699 acacaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaacccta 34256762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44304026 - 44303764
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||  |||||| |    
T  44304026 gattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--aaaaagagatacaaaa 44303930  T
Q  208 gg-ttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc---ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga-- 293  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||    ||||||||||||||       |||||||||||||||      
T  44303929 ggattacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatt 44303832  T
Q  294 ttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44303831 ttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 44303764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 1746216 - 1746366
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||  |||||| |    
T  1746216 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaaa 1746311  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 262  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  1746312 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 1746366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Original strand, 19945356 - 19945529
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||  | | |||     
T  19945356 gattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttccaaagagatacaaaagt 19945454  T
Q  208 ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  19945455 ggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaa 19945529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Original strand, 42434995 - 42435159
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  42434995 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 42435090  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  42435091 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15212948 - 15212786
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  15212948 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 15212853  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15212852 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 15212786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4283688 - 4283524
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  4283688 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 4283593  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4283592 caagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40321242 - 40321082
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  40321242 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagtt-tttac-aaagagatactaatgggttaca 40321147  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 279  Q
    |||||||| ||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40321146 agaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18655564 - 18655491
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18655564 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctt 18655491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33352312 - 33352150
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  33352312 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 33352217  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||| || |  | |||||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33352216 agaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 33352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43036585 - 43036423
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  |  |||||    
T  43036585 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgaattaca 43036490  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||| || |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43036489 agaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 4743220 - 4743291
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4743220 acccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 4743291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Original strand, 1345391 - 1345449
Alignment:
Q  131 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttcttt 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1345391 aacttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatc-aatgagttcttt 1345449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Original strand, 10930205 - 10930267
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10930205 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 10930267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27811440 - 27811278
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||| |||||||||||| |||| |||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  27811440 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgggttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 27811345  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27811344 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40221907 - 40221845
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  40221907 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 40221845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 3303676 - 3303747
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3303676 acccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctt 3303747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5689433 - 5689362
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5689433 acccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 5689362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 263
Target Start/End: Original strand, 12702640 - 12702783
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa-aggaatacaagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||  | | ||| |||||||    
T  12702640 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttc-ttacaaagagacacaaaag-ggttaca 12702735  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 263  Q
    |||||||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  12702736 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 12702783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328871
Alignment:
Q  137 acctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 40328871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4733868 - 4733806
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  4733868 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaa 4733806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6599134 - 6599027
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||  |||||||    
T  6599134 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaa-gtatacaaatgggttaca 6599039  T
Q  215 agaaattagctt 226  Q
    ||||||||||||    
T  6599038 agaaattagctt 6599027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6674587 - 6674480
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||  |||||||    
T  6674587 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaa-gtatacaaatgggttaca 6674492  T
Q  215 agaaattagctt 226  Q
    ||||||||||||    
T  6674491 agaaattagctt 6674480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 281
Target Start/End: Original strand, 8965820 - 8965859
Alignment:
Q  242 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8965820 gaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 226
Target Start/End: Original strand, 41366622 - 41366727
Alignment:
Q  117 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaa 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||| || |||||| ||    
T  41366622 cccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttc-ttac-aaagggatacaaataggttaaaa 41366716  T
Q  216 gaaattagctt 226  Q
    |||||||||||    
T  41366717 gaaattagctt 41366727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11384149 - 11384085
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |   ||||||||||| ||||||    
T  11384149 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaa 11384085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141911
Alignment:
Q  117 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctt 18141911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 3723 - 3990
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3723 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 3822  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3823 ggttacaagaaattagcttgaca-tgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 3921  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 6594555 - 6594822
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6594555 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 6594654  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594655 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 6594753  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594754 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6594822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 6592337 - 6592604
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6592337 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 6592436  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592437 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 6592535  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592536 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6592604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 18388757 - 18389024
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18388757 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 18388856  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388857 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 18388955  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388956 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18389024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 18392193 - 18392460
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18392193 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 18392292  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392293 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 18392391  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392392 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18392460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 32060319 - 32060590
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaa--ggaatacaa 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  32060319 gattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaa 32060418  T
Q  206 gaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  32060419 gaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttac 32060517  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32060518 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttaccctttg 32060590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20344067 - 20343811
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  20344067 gattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt-acaaaagggatacaaaa 20343970  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20343969 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 20343871  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343870 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20343811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24790012 - 24789755
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |    
T  24790012 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaa-gagtt-tttacaaaagggatacaaaa 24789915  T
Q  208 ggttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctaca 304  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24789914 tgttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctaca 24789816  T
Q  305 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789815 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 24789755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 210 - 376
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562268
Alignment:
Q  210 ttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaaggtg 1562201  T
Q  310 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562202 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 1562268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39731540 - 39731283
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  39731540 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 39731443  T
Q  208 g-gttacaagaaattagct-tgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctac 303  Q
    | ||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |    
T  39731442 gagttacaagaaattagatctgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcacc 39731345  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39731344 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 39731283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 43504151 - 43504409
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  43504151 gattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 43504248  T
Q  208 --ggttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 302  Q
       |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||     
T  43504249 agagttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcgatgattttctctctt 43504346  T
Q  303 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  43504347 caaggtgtttcccatgtttcccaagccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 43504409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 35854085 - 35853825
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |    
T  35854085 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 35853989  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 295  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  35853988 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 35853891  T
Q  296 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35853890 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaacccta 35853825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 1560663 - 1560757
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1560663 gattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatac 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 25766957 - 25767215
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||  | | |||     
T  25766957 gattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttcaaaagagatacaaaagg 25767055  T
Q  208 ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc----accaagacactcaatga--ttctct 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    | |||||||||||||||  ||| ||    
T  25767056 ggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagacactcaatgattttcact 25767153  T
Q  300 ctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |  |||||||||| | ||||||    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25767154 caccaaggtgtttacaatgttt---cccaaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 25767215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29991224 - 29990965
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||    ||||  |||||| |    
T  29991224 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttatt--agaaagagatacaaaa 29991128  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  29991127 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 29991030  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29991029 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 29990965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Original strand, 34310713 - 34310884
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||      
T  34310713 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaaaaga-tacaaat 34310809  T
Q  208 g-gttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34310810 gtgttacaagaaattagcttcaacaat-ttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 48408974 - 48408709
Alignment:
Q  109 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac--aag 206  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||  |||    
T  48408974 attgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatc-aatgagttattt-caaaagagatacaaaag 48408877  T
Q  207 aggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 295  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||| || | |||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  48408876 gggttacaagaaattagctttgacaa-gtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 48408779  T
Q  296 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48408778 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 48408709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23555211 - 23555039
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaa-aggaatacaag 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||     
T  23555211 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaagagg--tacaaa 23555116  T
Q  207 ag-gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 281  Q
    || |||||||||||||||||| |  | |||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  23555115 agtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 23555039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25616024 - 25615785
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aag 206  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||     
T  25616024 gattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaatg-atacaaat 25615928  T
Q  207 aggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct---a 302  Q
     ||||||||||||||||||| |  | |  |||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||        
T  25615927 gggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacactcaatgattttctctcacc 25615832  T
Q  303 caaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 349  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615831 caaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4178944 - 4178685
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| |||||||||||    ||||  |||||| |    
T  4178944 gattgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaaa 4178849  T
Q  208 -ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
     |||||||||||||||||||  | | |||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  4178848 gggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 4178750  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4178749 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 4178685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22270137 - 22269973
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  22270137 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatcagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 22270042  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22270041 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19502349 - 19502233
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| |    
T  19502349 gattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaaa 19502253  T
Q  208 g-gttacaagaaattagctt 226  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  19502252 gagttacaagaaattagctt 19502233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 32358058 - 32358131
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32358058 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 32358131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 14069839 - 14070001
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  14069839 acccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 14069934  T
Q  215 agaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14069935 agaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14070001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 14379867 - 14380029
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  14379867 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 14379962  T
Q  215 agaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14379963 agaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14380029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 41317440 - 41317602
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagagg-ttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||  || |||||    
T  41317440 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatggattaca 41317535  T
Q  215 agaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||| ||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  41317536 agaaattagctttgacaa-gctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 8359319 - 8359393
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8359319 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 8359393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3259159 - 3259095
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  3259159 tcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 3259095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29608901 - 29608737
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 212  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||  | ||||    
T  29608901 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgagtta 29608806  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29608805 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 281
Target Start/End: Original strand, 30024740 - 30024900
Alignment:
Q  118 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaag 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||||    
T  30024740 ccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaag 30024835  T
Q  217 aaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||| |  | | |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30024836 aaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30024900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491579
Alignment:
Q  131 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaagaaattagcttgac 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||  |||| ||  ||||||||||||||||||| |     
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttt--caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaa 48491631  T
Q  230 aatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
     | |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48491630 caagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48491579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6432071
Alignment:
Q  115 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaa 6432071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27347979 - 27347817
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  27347979 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 27347884  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | |||||| | |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27347883 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2390446 - 2390385
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactat 176  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  2390446 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 2390385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 281
Target Start/End: Original strand, 4253538 - 4253697
Alignment:
Q  120 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagga-atacaagaggttacaagaa 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||  ||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||  || ||| ||| ||||||| |||    
T  4253538 agttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaa-tgagttctttccaaagagatataaaag-ggttacatgaa 4253634  T
Q  219 attagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||| |  | | |||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  4253635 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Original strand, 48599338 - 48599502
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||  ||||||  | ||||    
T  48599338 tcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagctctt--ccaaagagatacaaatgagtta 48599433  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  48599434 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 262
Target Start/End: Original strand, 41649017 - 41649158
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  |||||||    
T  41649017 acccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttaca 41649112  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 262  Q
    |||||||||||  |||| | |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41649113 agaaattagctaaacaa-gctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 41649158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43864406 - 43864244
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  43864406 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aattagtt-tttac-aaagagatacaaatgggttaca 43864311  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
     ||||||||||| |  | |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43864310 ggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaa 43864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Original strand, 4508710 - 4508874
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||  |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  4508710 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 4508805  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  4508806 caagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8153504 - 8153342
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 214  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||  ||||||  | ||||||    
T  8153504 acccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-attac-aaagagatacaaatgagttaca 8153409  T
Q  215 agaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  8153408 agaaattagctttgacaat-ctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 263
Target Start/End: Original strand, 31732975 - 31733118
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  31732975 acccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 31733070  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 263  Q
    |||||||||||| || | | |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  31733071 agaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 31733118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48489593 - 48489534
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactat 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  48489593 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 48489534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18396481 - 18396418
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  18396481 acccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaa 18396418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30814598 - 30814536
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  30814598 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 30814536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23344048 - 23343975
Alignment:
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||||||| |  | | |||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23344048 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 24525508 - 24525579
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24525508 acccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 24525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518993
Alignment:
Q  118 ccagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtc-aatgagttctt 31518993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 2601 - 2868
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2601 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 2700  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2701 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 2799  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2800 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 2868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 12647383 - 12647650
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12647383 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 12647482  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647483 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 12647581  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647582 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 12647650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6266862 - 6266605
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  6266862 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 6266765  T
Q  208 ggttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctaca 304  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6266764 ggttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 6266666  T
Q  305 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266665 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6266605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 108 - 302
Target Start/End: Original strand, 13656029 - 13656221
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13656029 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatacaaga 13656127  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656128 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcta 13656221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32289735 - 32289479
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  32289735 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 32289638  T
Q  208 g-gttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctac 303  Q
    | |||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |    
T  32289637 gagttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcacc 32289541  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  32289540 aaggtgtttaccatgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 32289479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 4484327 - 4484592
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  4484327 gattgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 4484424  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt-- 295  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||      |||||||||||||||||      
T  4484425 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaagaacaagacactcaatgattta 4484522  T
Q  296 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4484523 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 4484592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45099925 - 45099665
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||  |||||| |    
T  45099925 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaaa 45099830  T
Q  208 g-gttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 294  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  |    
T  45099829 gagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 45099732  T
Q  295 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45099731 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 30833517 - 30833252
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  30833517 gattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 30833420  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt-- 295  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||      |||||||||||||||||      
T  30833419 gggttacaagaaattaactttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattta 30833322  T
Q  296 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    | |||  ||| |||||| | ||||||  |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30833321 cactcaccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagataagctctaatcaaa-aaccctaaaccctagag 30833252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 4503130 - 4503390
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||  |||||| |    
T  4503130 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt---caaagagatacaaaa 4503225  T
Q  208 g-gttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctc-------accaagacactcaatga--t 294  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    ||||||||||||       | |||||||||||||||  |    
T  4503226 gagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattt 4503323  T
Q  295 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503324 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaacccta 4503390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 36205662 - 36205921
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| || || |||||||||||    ||||  |||||| |    
T  36205662 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtc-aatgagttctt---caaagagatacaaaa 36205757  T
Q  208 g-gttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 295  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  36205758 gagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 36205855  T
Q  296 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    | |||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36205856 cactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Original strand, 5723253 - 5723512
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aag 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||     
T  5723253 gattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaa 5723349  T
Q  207 aggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--ttc 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||       |||||||||||||||  |||    
T  5723350 aggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5723447  T
Q  297 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
     |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5723448 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaacccta 5723512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Original strand, 2334415 - 2334586
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| |    
T  2334415 gattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaaa 2334511  T
Q  208 g-gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 281  Q
    | ||||| |||||||||||| |  | |||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2334512 gagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaa-cccttatttctacccattttcccaatctcaccaa 2334586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 36988073 - 36988153
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36988073 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 36988153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 6595003 - 6595154
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||||  || |  ||      
T  6595003 gattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttc-ttacaaagagattcaaaag 6595100  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 262  Q
    ||||||||||||||||||| |  | |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  6595101 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 6595154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33648335 - 33648176
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggttaca 214  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||    
T  33648335 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatc-aatgagttctttac-aaagaaatacaaaagggttaca 33648238  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 276  Q
     ||||||||||| |  | | |||| | |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  33648237 ggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 45727093 - 45726929
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  45727093 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 45726998  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45726997 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 349
Target Start/End: Original strand, 34139776 - 34140017
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaataca-agaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||    
T  34139776 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagggatacatatgggttaca 34139872  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---ac 303  Q
    |||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |    
T  34139873 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 34139971  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 349  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34139972 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 34140017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29868031 - 29867869
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  29868031 acccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 29867936  T
Q  215 agaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29867935 agaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 35446888 - 35446961
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35446888 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 35446961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 263
Target Start/End: Original strand, 723750 - 723893
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  |||||||    
T  723750 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttaca 723845  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 263  Q
    |||||||||||| |  | | |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  723846 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 723893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 226
Target Start/End: Original strand, 14633834 - 14633939
Alignment:
Q  119 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaaga 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  14633834 cagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-tatgagttc-ttacaaaagggatacaaatgggttacaaga 14633930  T
Q  218 aattagctt 226  Q
    |||||||||    
T  14633931 aattagctt 14633939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24398228 - 24398055
Alignment:
Q  109 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga- 207  Q
    |||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||| |     
T  24398228 attgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctttac-aaagagatacaaaag 24398131  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccct--ttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||||||| |  | | |||| | ||||||||| ||| |||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  24398130 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 1631736 - 1631809
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1631736 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttctt 1631809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 17057375 - 17057446
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17057375 acccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 17057446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 17085358 - 17085429
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17085358 acccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 17085429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38312402 - 38312159
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  38312402 acccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagatc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 38312307  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---ac 303  Q
    ||||||||| || |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||    
T  38312306 agaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacac 38312208  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaacc 352  Q
    ||||||| | | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38312207 aaggtgtatacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaacc 38312159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362262
Alignment:
Q  131 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaagaaattagcttgac 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |     
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaa 42362404  T
Q  230 aatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct---acaaggtgtttcccatg 318  Q
     | | |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | |||    
T  42362403 caagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatg 42362305  T
Q  319 ttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42362304 tttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 42362262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39284998 - 39284936
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  39284998 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 39284936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Original strand, 11151597 - 11151657
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatc 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  11151597 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatc 11151657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 17490154 - 17490225
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17490154 acccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatc-aatgagttctt 17490225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 36318015 - 36318086
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36318015 acccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 36318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36773724 - 36773653
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36773724 acccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctt 36773653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17450747 - 17450678
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17450747 gattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 17450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13121843 - 13121769
Alignment:
Q  207 aggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||||| ||| |  | | |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  13121843 aggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28672036
Alignment:
Q  122 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccact 174  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccact 28672036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44203803 - 44203536
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44203803 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaaga 44203704  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203703 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 44203605  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203604 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 44203536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9036587 - 9036320
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  9036587 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 9036490  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9036489 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 9036391  T
Q  306 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9036390 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 9036320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21054129 - 21053872
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |    
T  21054129 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaa 21054032  T
Q  208 ggttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctaca 304  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  21054031 ggttgcaagaaattagatttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttttctctaca 21053933  T
Q  305 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21053932 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 21053872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40282548 - 40282291
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  40282548 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 40282451  T
Q  208 ggttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctaca 304  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40282450 ggttacaagaaattagattagacaa-gttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 40282352  T
Q  305 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282351 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 40282291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9987372 - 9987116
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |    
T  9987372 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa-tgagttcttg-caaaagggatacaaaa 9987275  T
Q  208 ggttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctaca 304  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9987274 ggttgcaagaaattagattagacaa-gttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 9987177  T
Q  305 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987176 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 9987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 20622234 - 20622492
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttcttt-acaaaaggaatacaag 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||     
T  20622234 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaaaagggatacaaa 20622332  T
Q  207 aggttacaagaaattagctt-gacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctc--tctac 303  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  20622333 aggttacaagaaattagatttgacaa-gttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctac 20622430  T
Q  304 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622431 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20622492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 282
Target Start/End: Original strand, 13316349 - 13316521
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  |||||| |    
T  13316349 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--ccaaagagatacaaaa 13316445  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaag 282  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13316446 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 51765568 - 51765302
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac--aa 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  51765568 gattgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 51765471  T
Q  206 gaggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt- 295  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |    ||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||      |||||||||||||||||     
T  51765470 ggggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaagaacaagacactcaatgattt 51765372  T
Q  296 -ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
     | |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51765371 acactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 51765302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 278
Target Start/End: Original strand, 8550784 - 8550952
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||      
T  8550784 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaaggga-tacaaat 8550880  T
Q  208 g-gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 278  Q
    | |||||||||||||||||| |  | | |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8550881 gagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 8550952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20762843 - 20762582
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||   || ||  |||||| |    
T  20762843 gattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacgaagag--atacaaaa 20762747  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatga--t 294  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||       ||||| |||||||||  |    
T  20762746 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattt 20762649  T
Q  295 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    || |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20762648 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 20762582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3189501 - 3189330
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  3189501 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaag-atacaaaa 3189405  T
Q  208 g-gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    | |||||| ||||||||||| |  | |||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3189404 gagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3189330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3198318 - 3198147
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  3198318 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaag-atacaaaa 3198222  T
Q  208 g-gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    | |||||| ||||||||||| |  | |||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3198221 gagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3198147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3207157 - 3206986
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  3207157 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaaaag-atacaaaa 3207061  T
Q  208 g-gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    | |||||| ||||||||||| |  | |||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3207060 gagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3206986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37168462 - 37168297
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |  ||||    
T  37168462 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 37168367  T
Q  212 acaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37168366 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29136412 - 29136247
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||     
T  29136412 tcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatc-aatgagttc-ttac-aaagaaatacaaatgggttc 29136316  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29136315 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Original strand, 13547093 - 13547257
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  13547093 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 13547188  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||| |||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13547189 caagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 13549004 - 13549077
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13549004 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 13549077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 44455322 - 44455160
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gttaca 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  | ||||||    
T  44455322 acccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaaaaga-tacaaatgagttaca 44455227  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||| || |  | |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44455226 agaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44455160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 42297972 - 42298052
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42297972 gattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctt 42298052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Original strand, 47255343 - 47255508
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 212  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||    
T  47255343 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggtta 47255439  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  47255440 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Original strand, 7482234 - 7482399
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 211  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |  ||||    
T  7482234 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaatgggtt 7482329  T
Q  212 acaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||| |  | | |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482330 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11348862 - 11348789
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11348862 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 11348789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Original strand, 28220232 - 28220394
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  28220232 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 28220327  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28220328 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaa 28220394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 278
Target Start/End: Original strand, 834173 - 834332
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||  |||||||    
T  834173 acccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaatgggttaca 834268  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcac 278  Q
    |||||||||||| |  | | |||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  834269 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcac 834332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28242469 - 28242396
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28242469 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttctt 28242396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3157027 - 3156865
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  3157027 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 3156932  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  3156931 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 3156865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 226
Target Start/End: Original strand, 4552643 - 4552750
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  4552643 acccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttc-ttac-aaagggatacaaaggggttaca 4552738  T
Q  215 agaaattagctt 226  Q
    ||||||||||||    
T  4552739 agaaattagctt 4552750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 262
Target Start/End: Original strand, 28265560 - 28265702
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttaca 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||    
T  28265560 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttaca 28265655  T
Q  215 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 262  Q
    |||||||||||| |  | | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28265656 agaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 28265702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 31925711 - 31925784
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31925711 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 31925784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 47115337 - 47115171
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga--ggtt 211  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||  |||||| |  ||||    
T  47115337 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtt-tttac-aaagagatacaaaatgggtt 47115241  T
Q  212 acaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 281  Q
    ||||||||||||||| |  | | |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  47115240 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 193775 - 193711
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  193775 tcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaa 193711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 13659342 - 13659413
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13659342 acccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 13659413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 37033069 - 37033149
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37033069 gattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttctt 37033149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 49918508 - 49918350
Alignment:
Q  120 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaagaa 218  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||  |||||||||||    
T  49918508 agttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 49918413  T
Q  219 attagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    |||||||| |  | |||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  49918412 attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603668
Alignment:
Q  115 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatc-aatgagttctt 34603668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6378655 - 6378603
Alignment:
Q  209 gttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 262  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6378655 gttacaaaaaattagctt-acaatgttcaacatgaacaaaccctaatttctacc 6378603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 28223427 - 28223498
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28223427 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 28223498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 45644360 - 45644431
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45644360 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 45644431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46065080 - 46065009
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  46065080 acccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttctt 46065009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079371
Alignment:
Q  135 tgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga-ggttacaagaaattagctt 226  Q
    ||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatc-aatgagttctttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaattagctt 22079371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459961
Alignment:
Q  139 ctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagctt 226  Q
    ||||||| || ||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| || | ||||||||||||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaa-tgagttctttacaaa-gaaatataaaatgttacaagaaattagctt 5459961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31659400 - 31659338
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  31659400 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaa 31659338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 189
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555342
Alignment:
Q  131 aacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt 23555342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19754657 - 19754586
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19754657 acccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 19754586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Original strand, 37876770 - 37876834
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  37876770 tcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaa 37876834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6444 - 6177
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6444 gattggtcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagg 6345  T
Q  208 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 307  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6344 gcttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctacaagg 6246  T
Q  308 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6245 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 6177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 434703 - 434443
Alignment:
Q  109 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga- 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| |     
T  434703 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaaag 434607  T
Q  208 ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcac-------caagacactcaatga--tt 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||       |||||||||||||||  ||    
T  434606 ggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 434509  T
Q  296 ctctctacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    | |||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  434508 cactcaccaaggtatttaccatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 434443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 365
Target Start/End: Original strand, 11158 - 11423
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||||| |    
T  11158 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 11255  T
Q  208 -ggttacaagaaattag-cttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------caagacactcaatgatt-- 295  Q
     ||||||||||||||||  || |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||      |||||||||||||||||      
T  11256 gggttacaagaaattagattttacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattta 11353  T
Q  296 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 365  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11354 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accataaaccctagag 11423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 283
Target Start/End: Original strand, 8732 - 8907
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||||| |    
T  8732 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttc-ttacaaaagagatacaaaa 8829  T
Q  208 -ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaaga 283  Q
     |||||||||||||||| ||    | |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8830 gggttacaagaaattagattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 8907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1086 - 827
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    ||||  |||||| |    
T  1086 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttgtt---caaagagatacaaaa 991  T
Q  208 -ggttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac------caagacactcaatga--tt 295  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||      |||||||||||||||  ||    
T  990 gggttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttt 893  T
Q  296 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 362  Q
    | |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  892 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11728 - 11557
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||      
T  11728 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaat 11632  T
Q  208 g-gttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 281  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11631 gagttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 114773 - 114602
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 207  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| |    
T  114773 gattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaaa 114677  T
Q  208 g-gttacaagaaattagc-ttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 281  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  114676 gcgttacaagaaattagctttgacaa-gttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 262
Target Start/End: Original strand, 18007 - 18151
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagag-gtta 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||  | ||||    
T  18007 tcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagt--tttac-aaagagatacaaatgagtta 18102  T
Q  213 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacc 262  Q
    |||||||||||||| |  | | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18103 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 18151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10651 - 10589
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  10651 acccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaa 10589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 149103 - 149174
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  149103 acccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 149174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36 - 1
Alignment:
Q  108 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctact 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7491 - 7418
Alignment:
Q  114 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  7491 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttctt 7418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Original strand, 20421 - 20492
Alignment:
Q  116 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20421 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaa-gagttctt 20492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University